本发明涉及分离的特异性结合人HER3的抗体，使用这些抗体实施免疫组织化学的 方法，及生成它们的方法。
发明背景
人HER3(ErbB-3，ERBB3，c-erbB-3，c-erbB3，受体酪氨酸蛋白质激酶erbB-3，SEQ IDNO：17)编码受体酪氨酸激酶的表皮生长因子受体(EGFR)家族的一名成员，该家族还包 括HER1(也称作EGFR)，HER2，和HER4(Kraus，M.H.等，PNAS86(1989)9193-9197；Plowman， G.D.等，PNAS87(1990)4905-4909；Kraus，M.H.等，PNAS90(1993)2900-2904)。与原型表皮 生长因子受体一样，跨膜受体HER3由胞外配体结合域(ECD)，ECD内的二聚化域，跨膜域，胞 内蛋白质酪氨酸激酶域(TKD)和C端磷酸化域组成。此跨膜蛋白具有胞外域内的调蛋白 (HRG)结合域而非活性激酶域。因此，它能结合此配体，但是不能经由蛋白质磷酸化将信号 传送入细胞中。然而，它确实与确实具有激酶活性的其它HER家族成员形成异二聚体。异二 聚化导致受体介导的信号传导途径的激活及其胞内域的转磷酸化。HER家族成员间的二聚 体形成扩大HER3的信号传导潜力，并且是一种不仅用于信号多样化，而且用于信号放大的 手段。例如，HER2/HER3异二聚体在HER家族成员间经由PI3K和AKT途径诱导最重要的促有丝 分裂信号之一(Sliwkowski，M.X.等，J.Biol.Chem.269(1994)14661-14665；Alimandi，M. 等，Oncogene.10(1995)1813-1821；Hellyer，N.J.，J.Biol.Chem.276(2001)42153-4261； Singer，E.，J.Biol.Chem.276(2001)44266-44274；Schaefer，K.L.，Neoplasia8(2006) 613-622)。
已经在众多癌症(包括前列腺，膀胱，和乳腺肿瘤)中报告了此基因的扩增和/或其 蛋白质的过表达。已经表征了编码不同同等型的可变转录剪接变体。
一种同等型缺乏膜间区，并且分泌到细胞外。此形式作用为调控膜结合形式的活 性。还已经报告了别的剪接变体，但是它们尚未彻底表征。
尽管事实是知道人HER3已经超过二十年，但是在组织样品中检测蛋白质HER3甚至 在今天仍然是极度困难的。然而，在组织样品中检测HER3对于将给定样品的结构和形态及 HER3的定位，组织分布和/或浓度与生物学功能(特别是涉及众多癌症的病理生理背景)关 联起来是至关重要的。
虽然能从多家公司作为科研试剂获得数种抗HER3抗体，但是使用那些试剂看来不 可能获得令人满意的对组织样品的染色，尤其是已经福尔马林固定和石蜡包埋的组织样 品。特别地，需要在用于组织样品的自动化染色系统(诸如VentanaBenchmarkXT)中使用 时显示针对HER3的高结合特异性和灵敏度的抗体。
本发明的任务是鉴定特异性结合人HER3蛋白质且至少能部分克服本领域已知问 题的抗体。
发明概述
本发明涉及一种分离的结合人HER3的抗体或其抗原结合部分，其中该抗体包含重 链可变域和轻链可变域，所述重链可变域包含包含SEQIDNO：1的氨基酸序列的CDR1H区， 包含SEQIDNO：2或SEQIDNO：3的氨基酸序列的CDR2H区，和包含SEQIDNO：4的氨基酸序 列的CDR3H区，且所述轻链可变域包含包含SEQIDNO：5的氨基酸序列的CDR1L区，包含SEQ IDNO：6或SEQIDNO：7的氨基酸序列的CDR2L区，和包含SEQIDNO：8的氨基酸序列的 CDR3L区。
本发明进一步包含一种分离的结合人HER3的抗体或其抗原结合部分，其具有重链 可变域和轻链可变域，所述重链可变域包含SEQIDNO：9或SEQIDNO：10的氨基酸序列，且 所述轻链可变域包含SEQIDNO：11或SEQIDNO：12的氨基酸序列。
本发明还包含一种分离的结合人HER3的抗体或其抗原结合部分，其具有重链可变 域和轻链可变域，所述重链可变域包含包含自SEQIDNO：1通过一处或多处保守氨基酸替 代而修饰的氨基酸序列的CDR1H区，包含自SEQIDNO：2或SEQIDNO：3通过一处或多处保 守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的CDR2H区，和包含自SEQIDNO：4通过一处或多处保守 氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的CDR3H区，且所述轻链可变域包含包含自SEQIDNO：5通 过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的CDR1L区，包含自SEQIDNO：6或SEQ IDNO：7通过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的CDR2L区，和包含自SEQID NO：8通过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的CDR3L区。在本发明的一个实 施方案中，CDR1L区包含自SEQIDNO：5通过第5位处的保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序 列。在一个进一步的实施方案中，SEQIDNO：5第5位处的保守氨基酸替代为苏氨酸/丝氨酸 替代。在本发明的另一个实施方案中，CDR3L区包含自SEQIDNO：8通过第6位或第9位处的 保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列，或者CDR3L区包含自SEQIDNO：8通过第6位和第9位 处的保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列。在一个进一步的实施方案中，SEQIDNO：8第6 位处的保守氨基酸替代为缬氨酸/丙氨酸替代或SEQIDNO：8第9位处的保守氨基酸替代为 丙氨酸/苏氨酸替代。在另一个实施方案中，CDR3L区包含自SEQIDNO：8通过第6位和第9位 处的保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列，其中SEQIDNO：8第6位处的保守氨基酸替代为 缬氨酸/丙氨酸替代且SEQIDNO：8第9位处的保守氨基酸替代为丙氨酸/苏氨酸替代。
本发明的另一个方面提供一种分离的结合人HER3的抗体或其抗原结合部分，其中 该抗体包含重链可变域和轻链可变域，所述重链可变域包含与SEQIDNO：9或SEQIDNO： 10具有至少95％序列同一性的氨基酸序列，且所述轻链可变域包含与SEQIDNO：11或SEQ IDNO：12具有至少95％序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中，本发明的抗体是单克隆抗体。
在另一个实施方案中，本发明的抗体是IgG亚类的抗体。
令人惊讶地发现，本发明的任何上述抗体具有相当有益的特性，而且能克服至少 一些本领域已知问题。它们能以极大益处用于免疫组织学染色规程以检测人HER3蛋白质。 尤其令人惊讶且值得一提的是，依照本发明的抗体产生卓越的染色结果，甚至是对福尔马 林固定石蜡包埋组织(FFPET)样品。因此，依照本发明的抗体对于在自动化染色规程中加工 的FFPET样品中检测人HER3是特别有用的。
因而，本发明还涉及一种用于实施免疫组织化学的方法，该方法包括下述步骤：将 组织样品与依照本发明的抗体一起温育，由此发生所述抗体对所述组织中的人HER3的结 合，并对所述组织样品针对结合至该组织样品的抗HER3抗体进行染色。
在一个实施方案中，本发明涉及依照本发明的抗体在人HER3的免疫组织化学检测 中的用途，尤其是在甲醛固定石蜡包埋组织(FFPET)样品中。
本发明的另一个实施方案涉及对于方便实施人HER3的免疫组织化学检测有用的 试剂盒。在一个实施方案中，提供用于在甲醛固定石蜡包埋组织(FFPET)样品中检测人HER3 的试剂盒，所述试剂盒包含依照本发明的抗体或其抗原结合部分，和用于检测所述抗体或 其抗原结合部分的试剂。
本发明的另一个方面提供一种编码本文中提供的抗HER3抗体的重和轻链的核酸。
在一个实施方案中，所述核酸编码抗HER3抗体的重和轻链，其中重链可变域包含 包含SEQIDNO：1的氨基酸序列的CDR1H区，包含SEQIDNO：2或SEQIDNO：3的氨基酸序列 的CDR2H区，和包含SEQIDNO：4的氨基酸序列的CDR3H区，且轻链可变域包含包含SEQID NO：5的氨基酸序列的CDR1L区，包含SEQIDNO：6或SEQIDNO：7的氨基酸序列的CDR2L区， 和包含SEQIDNO：8的氨基酸序列的CDR3L区。
在另一个实施方案中，所述核酸编码抗HER3抗体的重和轻链，其中重链可变域包 含包含自SEQIDNO：1通过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的CDR1H区，包 含自SEQIDNO：2或SEQIDNO：3通过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的 CDR2H区，和包含自SEQIDNO：4通过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的 CDR3H区，且轻链可变域包含包含自SEQIDNO：5通过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的 氨基酸序列的CDR1L区，包含自SEQIDNO：6或SEQIDNO：7通过一处或多处保守氨基酸替 代而修饰的氨基酸序列的CDR2L区，和包含自SEQIDNO：8通过一处或多处保守氨基酸替代 而修饰的氨基酸序列的CDR3L区。
在又一个实施方案中，所述核酸编码抗HER3抗体的重和轻链，其中重链可变域包 含SEQIDNO：9或SEQIDNO：10的氨基酸序列，且轻链可变域包含SEQIDNO：11或SEQID NO：12的氨基酸序列。
在另一个实施方案中，所述核酸编码抗HER3抗体的重和轻链，其中重链可变域包 含与SEQIDNO：9或SEQIDNO：10具有至少95％序列同一性的氨基酸序列，且轻链可变域 包含与SEQIDNO：11或SEQIDNO：12具有至少95％序列同一性的氨基酸序列。
本发明进一步包括表达载体，其包含依照本发明的核酸，用于在原核或真核宿主 细胞中表达依照本发明的抗体。
本发明进一步包括包含依照本发明的载体的原核或真核宿主细胞。
本发明进一步包括一种用于生成依照本发明的重组抗体的方法，其特征在于在原 核或真核宿主细胞中表达依照本发明的核酸，并自所述细胞或细胞培养物上清液回收所述 抗体。
发明详述
本发明涉及一种分离的结合人HER3的抗体或其抗原结合部分，其特征在于：重链 可变域包含包含SEQIDNO：1的氨基酸序列的CDR1H区，包含SEQIDNO：2或SEQIDNO：3的 氨基酸序列的CDR2H区，和包含SEQIDNO：4的氨基酸序列的CDR3H区，且轻链可变域包含包 含SEQIDNO：5的氨基酸序列的CDR1L区，包含SEQIDNO：6或SEQIDNO：7的氨基酸序列的 CDR2L区，和包含SEQIDNO：8的氨基酸序列的CDR3L区。
本发明进一步包含一种分离的结合人HER3的抗体或其抗原结合部分，其特征在 于：重链可变域包含SEQIDNO：9或SEQIDNO：10的氨基酸序列，且所述轻链可变域包含 SEQIDNO：11或SEQIDNO：12的氨基酸序列。
本发明还包含一种分离的结合人HER3的抗体或其抗原结合部分，其特征在于：重 链可变域包含包含自SEQIDNO：1通过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的 CDR1H区，包含自SEQIDNO：2或SEQIDNO：3通过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的氨 基酸序列的CDR2H区，和包含自SEQIDNO：4通过一处或多处保守氨基酸替代而修饰的氨基 酸序列的CDR3H区，且轻链可变域包含包含自SEQIDNO：5通过一处或多处保守氨基酸替代 而修饰的氨基酸序列的CDR1L区，包含自SEQIDNO：6或SEQIDNO：7通过一处或多处保守 氨基酸替代而修饰的氨基酸序列的CDR2L区，和包含自SEQIDNO：8通过一处或多处保守氨 基酸替代而修饰的氨基酸序列的CDR3L区。
本发明的另一个方面提供一种分离的结合人HER3的抗体，其特征在于：重链可变 域包含与SEQIDNO：9或SEQIDNO：10具有至少95％序列同一性的氨基酸序列，且轻链可 变域包含与SEQIDNO：11或SEQIDNO：12具有至少95％序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中，依照本发明的抗体是单克隆的。
在另一个实施方案中，本发明的抗体是IgG亚类的抗体。
除非另有解释，本文中使用的所有技术和科学术语具有与本文中公开的发明所属 领域的普通技术人员的普遍理解相同的含义。
冠词“一个”和“一种”在本文中用于指一个/种或超过一个/种(即至少一个/种)该 冠词的语法对象。举例而言，“一种抗体”表示一种抗体或超过一种抗体。
如本文中使用的，术语“抗体”旨在指由通过二硫键互相连接的四条多肽链(两条 重(H)链和两条轻(L)链)构成的免疫球蛋白分子。每条重链由重链可变区(本文中缩写为 HCVR或VH)和重链恒定区构成。重链恒定区由三个域(CH1，CH2和CH3)构成。每条轻链由轻链 可变区(本文中缩写为LCVR或VL)和轻链恒定区构成。轻链恒定区由一个域(CL)构成。VH和 VL区可以进一步细分成高变的区域(称作互补决定区(CDR))，间插更加保守的区域(称作框 架区(FR))。每个VH和VL由三个CDR和四个FR构成，自氨基端至羧基端以如下次序排列：FR1， CDR1，FR2，CDR2，FR3，CDR3，FR4。
在本文中使用时，术语“抗体的抗原结合部分”指抗体中负责抗原结合的氨基酸残 基。抗体的抗原结合部分包含来自CDR的氨基酸残基。术语本发明的抗体的“抗原结合部分” 含有6个CDR，它们以不同程度促成结合位点对抗原的亲和力。存在着三个重链可变域CDR (CDR1H，CDR2H和CDR3H)和三个轻链可变域CDR(CDR1L，CDR2L和CDR3L)。术语“CDR1H”意指依 照Kabat计算的重链可变区的CDR1区。CDR2H，CDR3H，CDR1L，CDR2L和CDR3L表示来自重(H)或 轻(L)链的相应区。通过与氨基酸序列的汇编数据库比较来确定CDR和FR的范围，在所述数 据库中已经依照Kabat等，SequencesofProteinsofImmunologicalInterest，第5版， PublicHealthService，NationalInstitutesofHealth，Bethesda，Md.(1991)依照序 列间的可变性定义那些区域。
“分离的”抗体指已经鉴定及自其天然环境的一种成分分开和/或回收的抗体。其 天然环境的污染性成分指会干扰该抗体的研究，诊断或治疗用途的物质，而且可以包括酶， 激素，和其它蛋白质性质或非蛋白质性质的溶质。如本文中使用的，“分离的抗体”还旨在指 基本上没有具有不同抗原特异性的其它抗体的抗体(例如，分离的特异性结合人HER3的抗 体基本上没有特异性结合除人HER3以外的抗原的抗体)。然而，分离的特异性结合人HER3的 抗体可以具有与其它抗原(诸如来自其它物种的HER3分子)的交叉反应性。在一些实施方案 中，将抗体纯化至抗体重量超过70％(根据例如Lowry法的测定)，而且在一些实施方案中， 重量超过80％，90，95％，96％，97％，98％或99％。在一个优选实施方案中，将依照本发明的 分离的抗体纯化至超过90％纯度(根据还原性条件下SDS-PAGE及蛋白质检测使用考马斯蓝 染色的测定)。
生成抗体(诸如单克隆或多克隆抗体)的方法是本领域完全建立的(例如参见 Harlow和Lane，Antibodies：ALaboratoryManual，ColdSpringHarborLaboratory，New York，1988)。例如，可以将缀合至载体分子的人HER3的肽片段(或编码此类表位或缀合RDP 的核酸)注射入非人哺乳动物(诸如小鼠或大鼠)中，继以强化注射，以引起抗体应答。可以 对自经免疫动物分离的血清分离其中含有的多克隆抗体，或者可以将来自经免疫动物的脾 用于生成杂交瘤和单克隆抗体。在一些例子中，在使用之前纯化抗体。
例如，结合人HER3的多克隆抗体可以使用亲和柱(含有此序列作为免疫吸附材料) 通过免疫吸附来获得。在分离的抗体是单克隆抗体的情况中，此类抗体在一些实施方案中 纯化至(1)抗体超过90％(根据例如Lowry法的测定)，而且在一些实施方案中，重量超过 95％，96％，97％，98％或99％，(2)足以通过使用例如转杯式测序仪获得至少15个残基的N 端或内部氨基酸序列的程度，或(3)达到同质(根据还原性或非还原性条件下的SDS-PAGE及 使用例如考马斯蓝或银染剂)。
在一个例子中，可以依照和Milstein(Nature，256：495，1975)的经典方法或其衍生方法自鼠杂交瘤制备结合人HER3的单克隆抗体。简言之，在几周的时段里给小鼠(诸如Balb/c)反复接种几微克人HER3肽片段或其载体缀合物。然后处死小鼠，并分离脾的抗体生成细胞。借助聚乙二醇将脾细胞与小鼠骨髓瘤细胞融合，并通过体系在包含氨基蝶呤的选择性培养基(HAT培养基)上的生长来破坏过量的未融合细胞。稀释成功融合的细胞，并将稀释液的等分试样置于微量滴定板的孔中，在那里继续培养物的生长。通过免疫测定法规程(诸如ELISA，最初由Engvall(Enzymol.，70：419，1980)记载，及其衍生方法)在孔的上清液中检测抗体来鉴定抗体生成克隆。可以扩充选定的阳性克隆，并收获它们的单克隆抗体产物供使用。
抗体是否结合人HER3容易通过适宜的免疫测定法来评估。在一种优选方式中，用 生物素在N或C端标记人HER3的肽。一种优选标记试剂使用Fmoc-Glu(生物素基-PEG)-OH，它 在生物素残基和肽链之间掺入柔性亲水性间隔物。将此生物素化肽结合至用生物素结合试 剂包被的固相，例如经由链霉亲合素。如果待分析的抗体含有针对该人HER3肽内的表位的 结合位点，那么此类抗体结合该肽且能通过任何适宜手段来检测。
依照本发明的结合人HER3的抗体优选至少具有107l/mol的对此分子的结合亲和 力。还优选它具有108l/mol或更好或109l/mol或更好的亲和力。
如本文中使用的，术语“结合人HER3”，“特异性结合人HER3”，或“抗HER3抗体”可互 换，而且指特异性结合人HER3抗原的抗体。正如技术人员会领会的，术语“特异性”或“特异 性结合”用于指示样品中存在的其它生物分子对(特异性)结合人HER3的抗体没有显著结 合。然而，特异性结合人HER3的抗体可以具有与来自其它物种的HER3分子的交叉反应性。优 选地，对含有人HER3的样品中除人HER3以外的生物分子的结合水平分别导致对人HER3的亲 和力的只有10％或更少，更优选只有5％或更少的结合亲和力。例如，特异性结合人HER3的 抗体不会结合人HER2或其它密切同系物，即所具有的对它的结合亲和力比对人HER3的结合 亲和力要差至少10倍或优选至少20倍。
人HER3(ErbB-3，ERBB3，c-erbB-3，c-erbB3，受体酪氨酸蛋白质激酶erbB-3，SEQ IDNO：17)编码受体酪氨酸激酶的表皮生长因子受体(EGFR)家族的一名成员，该家族还包 括HER1(也称作EGFR)，HER2，和HER4(Kraus，M.H.等，PNAS86(1989)9193-9197；Plowman， G.D.等，PNAS87(1990)4905-4909；Kraus，M.H.等，PNAS90(1993)2900-2904)。人HER3的氨 基酸序列以UniProtKB/Swiss-Prot数据库中参照序列号P21860下当前注释的氨基酸序列 出现。与原型表皮生长因子受体一样，跨膜受体HER3由胞外配体结合域(ECD)，ECD内的二聚 化域，跨膜域，胞内蛋白质酪氨酸激酶域(TKD)和C端磷酸化域组成。此膜结合蛋白具有胞外 域内的HER3调蛋白(HRG)结合域而非活性激酶域。因此，它能结合此配体，但是不能经由蛋 白质磷酸化将信号传送入细胞中。然而，它确实与确实具有激酶活性的其它HER家族成员形 成异二聚体。异二聚化导致受体介导的信号传导途径的激活及其胞内域的转磷酸化。HER家 族成员间的二聚体形成扩大HER3的信号传导潜力，并且是一种不仅用于信号多样化，而且 用于信号放大的手段。例如，HER2/HER3异二聚体在HER家族成员间经由PI3K和AKT途径诱导 最重要的促有丝分裂信号之一(Sliwkowski，M.X.等，J.Biol.Chem.269(1994)14661- 14665；Alimandi，M.等，Oncogene.10(1995)1813-1821；Hellyer，N.J.，J.Biol.Chem.276 (2001)42153-4261；Singer，E.，J.Biol.Chem.276(2001)44266-44274；Schaefer，K.L.， Neoplasia8(2006)613-622)。
已经在众多癌症(包括前列腺，膀胱，和乳腺肿瘤)中报告了此基因的扩增和/或其 蛋白质的过表达。已经表征了编码不同同等型的可变转录剪接变体。
一种同等型缺乏膜间区，并且分泌到细胞外。此形式作用为调控膜结合形式的活 性。还已经报告了别的剪接变体，但是它们尚未彻底表征。
依照本发明的抗体结合HER3的胞内区且因此只检测人HER3的膜结合同等型而非 分泌同等型。
如上所述，例如，可以使用人HER3的肽通过免疫吸附自经免疫动物的血清分离依 照本发明的(即结合人HER3的)抗体。
单克隆抗体可以以恒定质量和几乎不受限制的数量生成。在一个优选实施方案 中，依照本发明的抗体是单克隆抗体。
所生成的最好的单克隆抗体中的两种具有相似的CDR且令人惊讶地能用于组织样 品中人HER3的可靠检测，尤其是在用于FFPET样品的自动化染色系统中。
一方面，依照本发明的抗HER3抗体包含与SEQIDNO：9或SEQIDNO：10的氨基酸 序列具有至少90％，91％，92％，93％，94％，95％，96％，97％，98％，99％，或100％序列同一 性的重链可变域(VH)序列。在某些实施方案中，具有至少90％，91％，92％，93％，94％， 95％，96％，97％，98％，或99％同一性的VH序列相对于参照序列含有替代(例如保守替代)， 插入，或删除，但是包含该序列的抗HER3抗体保留结合HER3的能力。在某些实施方案中，已 经在SEQIDNO：9或SEQIDNO：10替代，插入和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方 案中，替代，插入，或删除发生在CDR以外的区域(即，在FR中)。任选地，抗HER3抗体包含SEQ IDNO：9或SEQIDNO：10中的VH序列，包括该序列的翻译后修饰。在一个特定实施方案中， VH包含1，2或3个选自下述的CDR：(a)包含氨基酸序列SEQIDNO：1的CDR1H，(b)包含氨基酸 序列SEQIDNO：2或SEQIDNO：3的CDR2H，和(c)包含氨基酸序列SEQIDNO：4的CDR3H。
另一方面，依照本发明的抗HER3抗体包含与SEQIDNO：11或SEQIDNO：12的氨基 酸序列具有至少90％，91％，92％，93％，94％，95％，96％，97％，98％，99％，或100％序列同 一性的轻链可变域(VL)。在某些实施方案中，具有至少90％，91％，92％，93％，94％，95％， 96％，97％，98％，或99％同一性的VL序列相对于参照序列含有替代(例如保守替代)，插入， 或删除，但是包含该序列的抗HER3抗体保留结合HER3的能力。在某些实施方案中，已经在 SEQIDNO：11或SEQIDNO：12中替代，插入和/或删除总共1至10个氨基酸。在某些实施方 案中，替代，插入，或删除发生在CDR以外的区域(即，在FR中)。任选地，抗HER3抗体包含SEQ IDNO：11或SEQIDNO：12中的VL序列，包括该序列的翻译后修饰。在一个特定实施方案中， VL包含1，2或3个选自下述的CDR：(a)包含氨基酸序列SEQIDNO：5的CDR1L，(b)包含氨基酸 序列SEQIDNO：6或SEQIDNO：7的CDR2L，和(c)包含氨基酸序列SEQIDNO：8的CDR3L。
另一方面，提供了一种抗HER3抗体，其中所述抗体包含如上文提供的任何实施方 案中的VH和如上文提供的任何实施方案中的VL。在一个实施方案中，抗体包含分别在SEQ IDNO：9或SEQIDNO：10及SEQIDNO：11或SEQIDNO：12中的VH和VL序列，包括那些序列 的翻译后修饰。
如本申请内所使用的，术语“氨基酸”意指天然发生羧基α-氨基酸的组，包括丙氨 酸(三字母代码：ala，单字母代码：A)，精氨酸(arg,R)，天冬酰胺(asn,N)，天冬氨酸(asp, D)，半胱氨酸(cys,C)，谷氨酰胺(gln,Q)，谷氨酸(glu,E)，甘氨酸(gly,G)，组氨酸(his,H)， 异亮氨酸(ile,I)，亮氨酸(leu,L)，赖氨酸(lys,K)，甲硫氨酸(met,M)，苯丙氨酸(phe,F)， 脯氨酸(pro,P)，丝氨酸(ser,S)，苏氨酸(thr,T)，色氨酸(trp,W)，酪氨酸(tyr,Y)，和缬氨 酸(val,V)。
另外，依照本发明的抗体包括具有“保守序列修饰”(变体抗体)(即不影响或改变 依照本发明的抗体的上文所述特征的核苷酸和氨基酸序列修饰)的此类抗体。可以通过本 领域中已知的标准技术，诸如定点诱变和PCR介导的诱变来引入修饰，或者可以通过从头合 成基因合成来引入突变。如本文中使用的，术语“保守氨基酸替代”，“保守替代”，或“保守序 列修饰”可互换，而且指氨基酸替代，其中一个氨基酸残基用具有相似侧链的另一个氨基酸 残基替换。本领域中已经定义了具有相似侧链的氨基酸残基的家族。这些家族包括具有碱 性侧链(例如，赖氨酸，精氨酸，组氨酸)，酸性侧链(例如，天冬氨酸，谷氨酸)，不带电荷的极 性侧链(例如，甘氨酸，天冬酰胺，谷氨酰胺，丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸，半胱氨酸，色氨酸)，非 极性侧链(例如，丙氨酸，缬氨酸，亮氨酸，异亮氨酸，脯氨酸，苯丙氨酸，甲硫氨酸)，β-分支 的侧链(例如，苏氨酸，缬氨酸，异亮氨酸)和芳香族侧链(例如，酪氨酸，苯丙氨酸，色氨酸， 组氨酸)的氨基酸。如此，优选地，可以将人抗HER3抗体中预测的非必需氨基酸残基用来自 相同侧链家族的另一种氨基酸残基替换。表1显示了例示性保守氨基酸替代。
表1：例示性保守氨基酸替代
因此，“变体”抗HER3抗体在本文中指在氨基酸序列中与“亲本”抗HER3抗体氨基酸 序列在亲本抗体的一个或多个可变区中相差多至10，优选约2至约5处添加，删除和/或替代 的分子。氨基酸替代可以基于分子建模通过诱变来实施，如Riechmann，L.等，Nature332 (1988)323-327和Queen，C.等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA86(1989)10029-10033描述的。
本发明的一个实施方案涉及分离的结合HER3的抗体或其抗原结合部分，其中 CDR1L区包含自SEQIDNO：5通过第5位处的保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列。在一个 进一步的实施方案中，SEQIDNO：5第5位处的保守氨基酸替代为苏氨酸/丝氨酸替代。如本 文中使用的，术语“苏氨酸/丝氨酸替代”表示抗HER3抗体的一种变体中的氨基酸苏氨酸用 丝氨酸替换，或反之，抗HER3抗体的一种变体中的丝氨酸用苏氨酸替换。同样适用于依照本 发明的“变体”抗HER3抗体中的其它特定氨基酸替代。例如，在分离的结合HER3的抗体或其 抗原结合部分的另一个实施方案中，CDR3L区包含自SEQIDNO：8通过第6位或第9位处的保 守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列，或者CDR3L包含自SEQIDNO：8通过第6位和第9位处的 保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列。在一个进一步的实施方案中，SEQIDNO：8第6位处 的保守氨基酸替代为缬氨酸/丙氨酸替代或SEQIDNO：8第9位处的保守氨基酸替代为丙氨 酸/苏氨酸替代。在还有另一个实施方案中，CDR3L区包含自SEQIDNO：8通过第6位和第9位 处的保守氨基酸替代而修饰的氨基酸序列，其中SEQIDNO：8第6位处的保守氨基酸替代为 缬氨酸/丙氨酸替代且SEQIDNO：8第9位处的保守氨基酸替代为丙氨酸/苏氨酸替代。
依照本发明的抗体已经证明在人HER3的免疫组织化学检测中极其有用。在一个实 施方案中，本发明涉及用于实施免疫组织化学(IHC)的方法，该方法包括下述步骤：a)将组 织样品与依照本发明的抗体一起温育，由此发生所述抗体对所述组织中的人HER3的结合， 并b)对所述组织样品针对步骤a)中结合的抗HER3抗体进行染色。
术语“染剂”或术语“染色试剂”指生物学或化学化合物，及含有此类化合物的组合 物，它们在应用于生物学样品中的靶定分子时，使得该分子可检测(例如在显微镜检查下)。 染剂包括但不限于可检测核酸探针，抗体，和组合或自身产生可检测最后产物的其它试剂。 术语“染剂”与术语“染料”可互换使用。术语“染色”表示使生物学样品与染色试剂，染剂，或 染料接触。
对于细胞或组织样品中的抗原的成功免疫染色，不得不达到至少三项标准：a)抗 原在它的原始部位处的保留，b)抗原的可及性和c)感兴趣抗原/表位的正确构象/保持。
非常令人惊讶的事实是依照本发明的抗体对已经用福尔马林固定且在石蜡中包 埋的组织样品也运作卓越。
在一个实施方案中，本发明涉及一种使用依照本发明的抗体检测人HER3的免疫组 织化学方法，其中对其实施免疫染色的组织样品是已经甲醛固定且石蜡包埋(FFPE)的组织 样品。
数种固定剂可得且常规用于临床病理学实验室，像戊二醛，甲醛和丙酮，或其它有 机溶剂。然而，绝大多数固定规程基于使用交联剂，像甲醛。固定溶液通常是含有磷酸钠的 甲醛水溶液，其设计成提供pH7.2-7.6的缓冲(添加少量强酸或碱后只有最小限度的pH变 化)和大致等张的溶液(它的渗透压与哺乳动物胞外液的渗透压相同，常常基于生理盐水)。 术语甲醛和福尔马林可互换使用。
如前所述，甲醛中的固定是临床病理学中最广泛使用的。主要原因最可能是通过 用甲醛固定，感兴趣抗原被束缚于它在活生物体中占据的部位。借助甲醛固定时引入的亚 甲基桥，细胞或组织样品的形态也得到较好保持。然而，这些积极效果付出了代价，即样品 的通透性和感兴趣抗原/表位的可及性和/或构象中固定引起的变化，核酸中的损害和酶活 性的灭活。
对于长期贮藏，经过固定的细胞或组织样品通常不得不脱水且在适宜包埋介质中 包埋。石蜡包埋通常比塑料包埋或者用振动切片机或在低温恒温器中切割未包埋的标本优 选。
本公开文本提供用于在已经在固体表面(例如显微镜载片)上封固并处理(例如福 尔马林固定和石蜡包埋)的生物学样品(例如分离的细胞或组织)中检测人HER3的方法等 等。对FFPE细胞或组织样品实施免疫组织化学的好处之一是此类标本中的HER3实质性维持 其相对于其它成分的位置，例如它在细胞或组织样品内的定位。
如本文中使用的，术语“检测”表示测定药剂(例如核酸分子或蛋白质)或相互作用 (例如抗体和抗原之间，蛋白质和核酸之间，或两个核酸分子之间的结合)是否存在或缺失， 例如通过对样品进行测量。在一些例子中，这可以进一步包括量化。在特定例子中，检测来 自标记物的发射信号。检测可以是大量的，从而能同时观察宏观数目的分子。检测还可以包 括使用显微术和诸如全内反射等技术鉴定来自单分子的信号以降低背景噪声。
例如，使用对特定蛋白质(例如人HER3)特异性的抗体允许检测样品(诸如FFPE细 胞或组织样品)中的蛋白质或蛋白质-蛋白质相互作用。
依照本发明的抗体可以通过直接标记抗体自身来检测，例如用放射性标记物，发 荧光标记物，半抗原标记物(诸如生物素)，或酶(诸如辣根过氧化物酶或碱性磷酸酶)。或 者，未标记的抗HER3一抗与经标记的二抗(包括对一抗特异性的抗血清，多克隆抗血清或单 克隆抗体)联合使用。免疫组织化学(IHC)方案和试剂盒是本领域公知的且是商品化的。
任选地，可以用可检测模块直接标记特异性结合剂。有用的检测剂包括发荧光化 合物(包括荧光素，异硫氰酸荧光素，罗丹明，5-二甲基胺-1-萘磺酰氯，藻红蛋白，镧系元素 磷，或花青家族的染料(诸如Cy-3或Cy-5)等等)；生物发光化合物(诸如萤光素酶，绿色荧光 蛋白(GFP)，或黄色荧光蛋白)；能生成可检测反应产物的酶(诸如辣根过氧化物酶，β-半乳 糖苷酶，萤光素酶，碱性磷酸酶，或葡萄糖氧化酶等等)，或放射性标记物(诸如3H，14C，15N， 35S，90Y，99Tc，111In，125I，或131I)。
在所公开的方法中有用的生物学样品进行分离，体外分析，而且包括能在固体表 面上固定和封固的任何细胞制备物或组织制备物。例示性样品包括但不限于血涂片，细胞 离心制备物，细胞学涂片，核心活检，细针穿刺，和/或组织切片(例如低温恒温器组织切片 和/或石蜡包埋组织切片)。例示性生物学样品可以自正常细胞或组织，或者自赘生性细胞 或组织分离。赘生物指如下生物学疾患，其中一个或多个细胞经历特征性间变 (anaplasia)，即丧失分化，生长速率升高，周围组织侵入，而且细胞可以能够转移。例示性 赘生性细胞或组织可以自实体瘤分离，包括乳腺癌(例如小叶和导管癌)，肉瘤，肺癌(例如 非小细胞癌，大细胞癌，鳞癌，和腺癌)，肺的间皮瘤，结直肠腺癌，胃癌，前列腺腺癌，卵巢癌 (诸如浆液性囊腺癌和粘液性囊腺癌)，卵巢生殖细胞肿瘤，睾丸癌和生殖细胞肿瘤，胰腺腺 癌，胆腺癌，肝细胞癌，膀胱癌(包括例如移行细胞癌，腺癌，和鳞癌)，肾细胞腺癌，子宫内膜 癌(包括例如腺癌和混合型Mullerian肿瘤(癌肉瘤))，宫颈内膜，外宫颈，和阴道癌(诸如它 们每一项的腺癌和鳞癌)，皮肤肿瘤(例如鳞状细胞癌，基细胞癌，黑素瘤，和皮肤附件肿 瘤)，食道癌，鼻咽和口咽癌(包括它们的鳞癌和腺癌)，唾液腺癌，脑和中枢神经系统肿瘤 (包括例如神经胶质，神经元，和脑膜起源的肿瘤)，周围神经肿瘤，软组织肉瘤和骨和软骨 肉瘤。
在所公开的方法中有用的固体支持物只需要承载生物学样品，而且任选但有益的 是允许方便地检测样品中的成分(例如蛋白质和/或核酸序列)。例示性支持物包括显微镜 载片(例如玻璃显微镜载片或塑料显微镜载片)，盖片(例如玻璃盖片或塑料盖片)，组织培 养皿，多孔板，膜(例如硝酸纤维素或聚偏二氟乙烯(PVDF))或BIACORETM芯片。
甲醛固定所致交联通常有可能掩盖或破坏表位，导致假阴性免疫染色。已经发现 人HER3上受到依照本发明的抗体识别的表位能容易地修复，例如通过在BenchMark分析仪 (VentanaMedicalSystems，Inc.，Tucson，USA)上自动化实施的标准规程。在一个实施方 案中，本发明涉及使用本发明中公开的抗体检测甲醛固定石蜡包埋组织(FFPET)样品中的 HER3。
还涵盖对于方便如本文中公开的那样实施人HER3的免疫组织化学检测有用的试 剂盒。在一个实施方案中，提供用于在甲醛固定石蜡包埋组织样品中检测人HER3的试剂盒， 所述试剂盒包含依照本发明的抗体或其抗原结合部分和用于检测所述抗体或其抗原结合 部分的试剂。
在特定实例中，在分开的容器或管形瓶中包装依照本发明的抗体或其抗原结合部 分和用于检测所述抗体或其抗原结合部分的试剂。
在一些试剂盒实施方案中，可以直接标记抗体或其抗原结合部分，例如用荧光团， 生色团，或能够生成可检测产物的酶(诸如碱性磷酸酶，辣根过氧化物酶和本领域普遍知道 的其它酶)。
其它试剂盒实施方案会包括第二检测手段；诸如二抗(例如山羊抗家兔抗体，家兔抗小鼠抗体，抗半抗原抗体)或非抗体半抗原结合分子(例如亲合素或链霉亲合素)。在一些此类情况中，第二检测手段会用可检测模块直接标记。在其它情况中，二抗(或更高次序抗体)会缀合至半抗原(诸如生物素，DNP，和/或FITC)，该半抗原是通过可检测标记的关联半抗原结合分子(例如链霉亲合素(SA)辣根过氧化物酶，SA碱性磷酸酶，和/或SANanocrystalsTM)可检测的。一些试剂盒实施方案可以在合适容器中包括比色试剂(例如DAB和/或AEC)，它要与用酶标记的第一或第二(或更多次序)检测手段(例如抗体)合作使用进行此类比色试剂的显现。
在一些实施方案中，试剂盒包括阳性或阴性对照样品，诸如已知表达或不表达人 HER3的细胞系或组织。在特定例子中，对照样品为FFPET样品。例示性样品包括但不限于正 常(例如非癌性)细胞或组织。
在一些实施方案中，试剂盒包括记载例如使用特异性结合人HER3的抗体的手段的 指导性材料。指导性材料可以是书面的，电子形式的(例如计算机磁盘或高密度磁盘)，或者 可以是视觉的(例如视频文件)。试剂盒还可以包括另外的成分来方便试剂盒设计的特定应 用。如此，例如，试剂盒可以包括缓冲液和常规用于实施本文中公开的免疫组织化学检测的 其它试剂。此类试剂盒和适宜内容物是本领域技术人员公知的。
某些试剂盒实施方案可以包括载具手段，诸如盒，袋，包，塑料箱(诸如模制塑料或 其它透明包装)，包裹物(诸如密封的或可密封的塑料，纸，或金属包裹物)，或其它容器。在 一些例子中，试剂盒各个构件会封装在单个包装单元(诸如盒或其它容器)中，该包装单元 可以具有多个隔室，其中可以放置试剂盒的一种或多种构件。在其它例子中，试剂盒包括能 保留例如一份或多份要测试的生物学样品的一个或多个容器，例如管形瓶，管，等等。
其它试剂盒实施方案包括例如注射器，棉签，或乳胶手套，它们可用于操作，收集 和/或加工生物学样品。试剂盒还可以任选含有可用于将生物学样品自一处移动至另一处 的器械，包括例如滴管，注射器，等等。仍有其它试剂盒实施方案可包括用于丢弃使用过的 或不再需要的物品(诸如受试者样品，等)的处置手段。此类处置手段可以包括但不限于能 够容纳来自丢弃材料的渗漏的容器，诸如塑料，金属或其它不透袋，盒或容器。
如本文中使用的，术语“核酸”或“核酸分子”旨在包括DNA分子和RNA分子。核酸分 子可以是单链或双链，但是优选是双链DNA。在将核酸放置在与另一核酸的功能性关系中 时，它是“可操作连接的”。例如，若前序列或分泌前导的DNA以参与多肽分泌的前蛋白表达， 则它与多肽的DNA可操作连接；若启动子或增强子影响序列的转录，则它与编码序列可操作 连接；或者若核糖体结合位点定位为使得便于翻译，则它与编码序列可操作连接。一般而 言，“可操作连接的”表示所连接的DNA序列是共线的，并且在分泌前导的情况中，是连续的 且在读码框中。然而，增强子不必是连续的。通过在方便的限制性位点处的连接来实现连 接。若不存在此类位点，则依照常规实践使用合成的寡核苷酸衔接头或接头。
本发明的一个实施方案是编码依照本发明的抗体的重和轻链的核酸。
如本文中使用的，表述“细胞”，“细胞系”，和“细胞培养物”可互换使用，而且所有 此类名称包括后代。如此，词语“转化体”和“经转化的细胞”包括原代主题细胞和自其衍生 的培养物，不管传递的次数。还应当理解，由于有意或无意的突变，所有后代在DNA内容上可 能不是精确相同的。包括具有如在初始转化细胞中筛选的相同功能或生物学活性的变体后 代。
如本文中使用的，术语“载体”旨在指能够运输与其连接的另一核酸的核酸分子。 一类载体是“质粒”，指其中可连接另外的DNA区段的环状双链DNA环。另一类载体是病毒载 体，其中可将另外的DNA区段连接入病毒基因组中。某些载体能够在其所导入的宿主细胞中 自主复制(例如具有细菌复制起点的细菌载体和附加型哺乳动物载体)。其它载体(例如非 附加型哺乳动物载体)能在导入宿主细胞中后整合入宿主细胞的基因组中，由此随着宿主 基因组一起复制。此外，某些载体能够指导与其可操作连接的基因表达。此类载体在本文中 称作“重组表达载体”(或简称作“重组载体”)。通常，在重组DNA技术中有用的表达载体常常 是质粒形式。在本说明书中，“质粒”和“载体”可互换使用，因为质粒是载体的最常用形式。 然而，本发明旨在包括提供等同功能的此类其它形式的表达载体，诸如病毒载体(例如复制 缺陷型逆转录病毒，腺病毒和腺伴随病毒)。
如本文中使用的，术语“重组宿主细胞”(或仅是“宿主细胞”)旨在指其中已经导入 重组表达载体的细胞。应当理解，此类术语旨在不仅指特定的主题细胞，还指此类细胞的后 代。因为在后代中可能由于突变或环境影响而发生某些改变，所以此类后代可能事实上与 亲本细胞不同，但是仍然包括在如本文中使用的术语“宿主细胞”的范围内。
优选地，通过重组手段来生成依照本发明的抗体。此类方法是现有技术中普遍已 知的，而且包括原核和真核细胞中的蛋白质表达，随后分离抗体多肽，并且通常纯化至可接 受纯度。对于蛋白质表达，通过标准方法将编码轻和重链或其片段的核酸插入表达载体中。 在适宜原核或真核宿主细胞(诸如CHO细胞，NSO细胞，SP2/0细胞，HEK293细胞，COS细胞，酵 母，或大肠杆菌细胞)中实施表达，并且自细胞(自上清液或在细胞裂解后)回收抗体。抗体 的重组生成是现有技术中公知的，而且记载于例如综述文章Makrides，S.C.，Protein Expr.Purif.17(1999)183-202；Geisse，S.等，ProteinExpr.Purif.8(1996)271-282； Kaufman，R.J.，Mol.Biotechnol.16(2000)151-161；Werner，R.G.，DrugRes.48(1998)870- 880。抗体可以存在于整个细胞中，在细胞裂解物中，或者为部分纯化的或基本上纯的形式。 通过标准技术，包括柱层析和本领域中公知的其它技术(参见Ausubel，F.等编，Current ProtocolsinMolecularBiology，GreenePublishingandWileyInterscience，New York(1987))来实施纯化以消除其它细胞成分或其它污染物，例如其它细胞核酸或蛋白质。 NSO细胞中的表达由例如Barnes，L.M.等，Cytotechnology32(2000)109-123；Barnes，L.M. 等，Biotech.Bioeng.73(2001)261-270描述。瞬时表达由例如Durocher，Y.等， Nucl.Acids.Res.30(2002)E9描述。可变域的克隆由Orlandi，R.等， Proc.Natl.Acad.Sci.USA86(1989)3833-3837；Carter，P.等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89(1992)4285-4289；Norderhaug，L.等，J.Immunol.Methods204(1997)77-87描述。一种优 选的瞬时表达系统(HEK293)由Schlaeger，E.-J.和Christensen，K.，于Cytotechnology 30(1999)71-83，及由Schlaeger，E.-J.，于J.Immunol.Methods194(1996)191-199描述。通 过常规免疫球蛋白纯化规程，诸如例如蛋白A-Sepharose，羟磷灰石层析，凝胶电泳，透析， 或亲和层析自培养液适当地分离单克隆抗体。容易使用常规规程将编码单克隆抗体的DNA 和RNA分离并测序。杂交瘤细胞可以充当此类DNA和RNA的来源。一旦分离，可以将DNA插入表 达载体中，然后将所述表达载体转染入不另外生成免疫球蛋白蛋白质的宿主细胞(诸如HEK 293细胞，CHO细胞，或骨髓瘤细胞)中，以获得重组单克隆抗体在宿主细胞中的合成。自所述 细胞系可获得的抗体是本发明的优选实施方案。优选地，经由糖工程化改造制备无岩藻糖 基化的抗体，如上文所描述的。
通过将适宜核苷酸变化引入抗体编码DNA中，或者通过肽合成来制备抗HER3抗体 的氨基酸序列变体。然而，仅可以在非常有限的范围中实施此类修饰，例如如上文所描述 的。例如，修饰不改变上文所述抗体特征诸如IgG同种型和表位结合，但是可以改善重组生 成的产量，蛋白质稳定性，或者便于纯化。也可替代任何不涉及维持抗HER3抗体正确构象的 半胱氨酸残基，一般替代为丝氨酸，用以改善分子的氧化稳定性及防止异常交联。相反地， 可以对抗体添加半胱氨酸键以改善其稳定性(特别是在抗体是抗体片段，诸如Fv片段的情 况中)。抗体的另一类氨基酸变体改变抗体的初始糖基化样式。“改变”表示去除抗体中找到 的一个或多个碳水化合物模块和/或添加抗体中不存在的一个或多个糖基化位点。
抗体的糖基化通常是N连接的。N连接的指碳水化合物模块附着于天冬酰胺残基的 侧链。三肽序列天冬酰胺-X-丝氨酸和天冬酰胺-X-苏氨酸(其中X是除脯氨酸以外的任何氨 基酸)是碳水化合物模块酶促附着于天冬酰胺侧链的识别序列。如此，多肽中存在这些三肽 序列之任一创建潜在的糖基化位点。可以通过改变氨基酸序列，使得其含有一个或多个上 文所述三肽序列(例如N连接的糖基化位点)来方便地实现对抗体添加糖基化位点。
通过本领域中已知的多种方法来制备编码抗HER3抗体的氨基酸序列变体的核酸 分子。这些方法包括但不限于自天然来源分离(在天然发生氨基酸序列变体的情况中)或者 通过对较早制备的变体或非变体型式的人源化抗HER3抗体进行寡核苷酸介导的(或定点) 诱变，PCR诱变，和盒式诱变来制备。
抗体的另一类共价修饰包括以美国专利4,640,835；4,496,689；4,301,144；4, 670,417；4,791,192；4,179,337中所列方式将抗体与多种非蛋白质性质的聚合物(例如聚 乙二醇，聚丙二醇，或聚氧化烯)之一连接。
将依照本发明的重和轻链可变域与启动子，翻译起始，恒定区，3’非翻译区，多腺 苷酸化，和转录终止的序列组合以形成表达载体构建体。可以将重和轻链表达构建体组合 入单一载体中，共转染，连续转染，或分开转染入宿主细胞中，然后将所述宿主细胞融合以 形成表达这两条链的单一宿主细胞。
提供以下序列表，实施例和图以帮助理解本发明，其实际范围在所附权利要求书 中列出。应当理解，可以在不背离本发明的精神的前提下对所列规程做出修改。
序列表描述
附图说明
图1数种经转染对照细胞系的比较性Western印迹测定法
通过SDS-PAGE将自过表达HER1，HER2，HER3，HER4或经哺乳动物表达载体pRK5转染 (作为阴性对照)的经转染HEK293细胞系制备的细胞裂解物分开，并转移至硝酸纤维素膜。 封闭后，将膜与HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42或HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M- 7.3.8或来自Dako的单克隆现有技术抗HER3抗体DAK-H3-IC一起于RT或37℃温育。使用HRP 缀合的抗小鼠Fab作为二抗。
图2非小细胞肺癌(NSCLC)样品的比较性Western印迹测定法通过SDS-PAGE将自 新鲜冷冻的NSCLC样品制备的细胞裂解物分开，并转移至硝酸纤维素膜。封闭后，将膜与 HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42或来自Dako的单克隆现有技术抗HER3抗体DAK-H3- IC一起于37℃温育。使用HRP缀合的抗小鼠Fab作为二抗。
图3使用单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42和MAK<人HER3>M-7.3.8对细胞系对照 样品的免疫组织化学
在Ventana自动化载片染色仪BenchmarkXT仪器上分析过表达HER1，HER2，HER3或 HER4的福尔马林固定石蜡包埋HEK293细胞，使用标准细胞条件化1(CC1)试剂进行样品制 备，HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42或HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.3.8作为一 抗及ultraViewDAB作为检测系统。
图4FFPET非小细胞肺癌(NSCLC)样品的比较性免疫组织化学测定法
HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42较之来自Dako的现有技术抗HER3抗体DAK- H3-IC对常规福尔马林固定石蜡包埋NSCLC组织的染色特性和染色样式的比较。
A和B：VentanaBenchmarkXT系统上HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42的免 疫组织化学，使用标准细胞条件化1(CC1)试剂进行样品制备及ultraViewDAB作为检测系 统。
C：半自动化Dako自动染色仪平台上来自Dako的抗HER3抗体DAK-H3-IC的免疫组织 化学，使用UltraVisionLP检测系统和DAB。手工进行脱石蜡和抗原修复步骤的规程。来自 Dako的DAK-H3-IC抗体不能在VentanaBenchmarkXT系统上使用，因为它在此平台上没有 显示FFPET样品中的任何结合活性。
图5来自肺和结肠癌的人肿瘤组织样品的比较性免疫组织化学测定法
HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.3.8(左边；0.125μg/ml)较之来自SantaCruz的 现有技术抗HER3抗体C17(右边；0.125μg/ml)在常规福尔马林固定石蜡包埋组织样品上的 染色特性和染色样式的比较。在图5A至D每一幅中，左边和右边的图分别显示MAK<人HER3> M-7.3.8和C17的结合(放大：10倍(顶部)和20倍(底部))
A：人肿瘤组织样品结肠A1278-Tp6
B：人肿瘤组织样品结肠B594-Tp5
C：人肿瘤组织样品结肠CRC071147.1.1
D：人肿瘤组织样品肺p339-Tc16
实施例
实施例1：针对HER3的单克隆抗体的生成
为了生成单克隆抗体，给8周龄雌性Balb/c小鼠腹膜内免疫接种100μg在cFA中乳化的HER3抗原肽。抗原是先前采用自动化肽合成仪合成的，配备有合适的间隔物并N端偶联KLH(匙孔虫戚血蓝蛋白)。初次免疫接种在6周后继以三次iFA的进一步免疫接种，间隔一个月。取出脾前3天，给小鼠静脉内强化50μg抗原。用PEG融合脾细胞和P3X63Ag8.653骨髓瘤细胞，并在HAz选择培养基中培养。取出后，制备脾的单细胞制备物，并将脾细胞与骨髓瘤细胞融合，例如如和Milstein(1975)描述的。用ELISA对所得杂交瘤筛选针对生物素化筛选肽(其具有与所使用的免疫原对应的序列)的反应性。用生物素化HER3肽包被链霉亲合素包被的384孔MTP，并与未稀释的杂交瘤上清液一起温育。然后用HRP标记的绵羊抗鼠IgG-Fc特异性抗体探查板，并用ABTS显现。通过Biacore分析来测试选定杂交瘤的结合亲和力。使用FACSAriaIII通过单细胞沉积来克隆对它们相应免疫原序列具有高亲和力的杂交瘤。再次通过ELISA和Biacore分析来测试所得单克隆亚克隆。
实施例2：通过Biacore分析来测试杂交瘤培养物上清液
为了选择合适的抗体，对杂交瘤培养物上清液实施动力学筛选。测量是使用 BiacoreSPR技术进行的。将CM5系列S传感器芯片安装到A100仪器(GEHealthcare， Biacore)中，并依照制造商的说明书在HBSN缓冲液(10mMHEPESpH7.4，150mMNaCl)中流 体动力学寻址。系统缓冲液是HBS-ET(10mMHEPESpH7.4，150mMNaCl，0.05％TWEEN20)。 样品缓冲液是补充有1mg/mlCMD(羧甲基右旋糖苷，Sigma#86524)的系统缓冲液。于25℃驱 动系统。
在每个流动室上的敏感点1，2，4和5上，使用EDC/NHS化学依照制造商的说明书分 别在流动室FC1(抗小鼠亚类1F(c)伽马)，FC2，FC3和FC4固定化10000RU(相对单位) RAMIgGFC(相应小鼠免疫球蛋白G亚类的家兔抗小鼠F(c)伽马片段/Jackson Laboratories)。使用1M乙醇胺钝化点。
动力学测试抗体针对HER3肽的结合活性。通过以10μl/min注射在样品缓冲液中1: 3稀释的粗制杂交瘤上清液1分钟来捕捉抗体。小心地在链霉亲合素上单一嫁接生物素化 HER3肽以扩大复合物的分子量及提高系统的质量灵敏度。由于抗原复合物解离kd不依赖于 分析物注射浓度，因此这是一种提高系统灵敏度的合法方法。
以30μl/min注射相应肽嫁接物5分钟，并监测解离3分钟。传感器表面的酸再生使 用以30μl/min3次序贯注射10mM甘氨酸pH1.5。
使用BiaevaluationA100软件V.1.1依照制造商的说明书评估数据。计算晚期结 合(RU)，晚期稳定性(RU)，R最大，kd(1/s)和MR(摩尔比)。依照它们的抗原复合物稳定性和MR 对克隆打分。
使用Biaevaluation软件V.4.1依照制造商的说明书评估数据。计算解离速率常数 kd(1/s)，并计算t1/2解离。t1/2解离＝ln(2)/60*kd[min]。相应数据显示于表2。
表2：抗HER3单克隆抗体克隆的动力学参数
单克隆抗体 同种型 kd[1/s] t1/2解离[min] MAK<人HER3>M-1.1.1 IgG1K 4,26E-04 27 MAK<人HER3>M-1.2.2 IgG1K 4,18E-04 28 MAK<人HER3>M-1.1.4 IgG2aK 2,92E-04 40 MAK<人HER3>M-6.3.1 IgG1K 9,28E-04 12 MAK<人HER3>M-7.3.8 IgG2aK 2,66E-05 435 MAK<人HER3>M-7.2.42 IgG2aK 4,26E-05 271
单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.3.8和MAK<人HER3>M-7.2.42显示足以在Ventana BenchmarkXT平台上应用的复合物稳定性t1/2解离。
尤其，相当低的解离对于使用自动化VentanaBenchmarkXT平台的IHC染色是至 关重要的。
根据表2显而易见的是，对由杂交瘤(克隆)MAK<人HER3>M-7.3.8和MAK<人HER3>M- 7.2.42生成的单克隆抗体观察到很低的解离，其中MAK<人HER3>M-7.3.8显示最慢的解离。
实施例3：Western印迹
使用新生成的HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42，MAK<人HER3>M-7.3.8和来 自Dako的单克隆抗体DAK-H3-IC实施比较性Western印迹分析。
a)数种经转染对照细胞系的比较性Western印迹测定法
自数种HEK293对照细胞系制备裂解物。用编码HER1，HER2，HER3或HER4的质粒瞬时 转染细胞。使用用哺乳动物表达载体pRK5转染的HEK293细胞作为阴性对照。为了Western印 迹，在4-12％NuPageSDS凝胶(Invitrogen)上每道加载10μg蛋白质裂解物。依照标准方案 用标准NuPage缓冲液和试剂(Invitrogen)实施Western印迹。封闭后，将膜与MAK<人HER3> M-7.2.42，MAK<人HER3>M-7.3.8或来自Dako的HER3单克隆抗体DAK-H3-IC一起温育。以1ng/ ml的浓度使用MAK<人HER3>M-7.2.42和MAK<人HER3>M-7.3.8。一抗温育于RT和37℃实施60 分钟。使用HRP缀合的抗小鼠Fab作为二抗。如制造商推荐的那样制备DAK-H3-IC抗体的稀释 液，并根据需要调整(检测)二抗的选择。将膜用ECL(Amersham)显现，并使x射线胶片曝光。
图1中给出各个印迹的结果。比较性Western印迹分析指示新开发的MAK<人HER3> M-7.2.42和MAK<人HER3>M-7.3.8特异性检测HER3且显示与HER1，HER2，HER4或其它蛋白没 有交叉反应。这些结合特征可见于RT和37℃，而来自Dako的HER3单克隆抗体DAK-H3-IC于37 ℃显示显著更弱的结合活性。因此，与来自Dako的现有技术单克隆抗HER3抗体DAK-H3-IC相 比，新开发的MAK<人HER3>M-7.2.42和MAK<人HER3>M-7.3.8在Western印迹测定法中显示卓 越的结合特征，特别是在自动化染色系统中使用的温度条件下。
b)非小细胞肺癌(NSCLC)样品的比较性Western印迹测定法
裂解具有0至高的不同HER3表达水平的新鲜冷冻的NSCLC样品，并于37℃用MAK<人 HER3>M-7.2.42或来自Dako的抗体DAK-H3-IC进行分析，与实施例3a)中描述的SDS-PAGE/ Western印迹规程类似。
图2中给出各个印迹的结果。比较性Western印迹分析指示来自Dako的现有技术单 克隆抗HER3抗体DAK-H3-IC相比，新开发的MAK<人HER3>M-7.2.42显示显著更高的针对HER3 的结合灵敏度。
实施例4：测序
为了获得选定杂交瘤克隆的DNA序列，进行5`RacePCR。为了RT-PCR，使用总RNA纯 化试剂盒(Qiagen)自5x106个细胞制备总RNA。使用5`primeRACEPCR试剂盒(Roche)进行 逆转录和PCR。通过凝胶电泳及随后的凝胶提取来纯化来自重和轻链的所得PCR片段。使用 TopoZero-Blunt克隆试剂盒(Invitrogen)克隆PCR片段，并转化入化学感受态细胞中。对 来自每个杂交瘤的数个克隆进行测序以获得选定克隆的共有序列。
实施例5：免疫组织化学
a)使用单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42和MAK<人HER3>M-7.3.8对细胞系对照样 品的免疫组织化学
使用FFPE细胞系对照显示新开发的HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42和MAK< 人HER3>M-7.3.8的合适性。因此，用4％PBS缓冲的甲醛固定HER1，HER2，HER3或HER4转染或 未转染HEK293细胞，并随后在石蜡中包埋。
在VentanaBenchmarkXT自动化IHC染色仪上实施所有染色规程，使用Ventana缓 冲液和试剂(即标准细胞条件化1(CC1)试剂等等)进行样品制备及ultraViewDAB作为检测 系统。
根据图3显而易见的是，新开发的HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42和MAK<人 HER3>M-7.3.8只对HER3转染细胞显示特异性膜染色。HER1，HER2和HER4转染细胞和对照细 胞呈阴性。HER3单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42和MAK<人HER3>M-7.3.8对HER3转染细胞 显示优秀的IHC染色，如果在VentanaBenchmarkXT分析仪上依照标准方案使用的话(见图 3，HER3标题下的细胞染色)。
b)FFPET非小细胞肺癌(NSCLC)样品的比较性免疫组织化学测定法
进一步评估单克隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42对于福尔马林固定石蜡包埋组织 (FFPET)样品的免疫组织化学染色的合适性，与来自Dako的单克隆现有技术抗体DAK-H3-IC 比较。在常规福尔马林固定石蜡包埋NSCLC组织样品上实施免疫组织化学测定法。在 VentanaBenchmarkXT平台上实施MAK<人HER3>M-7.2.42的染色，使用标准试剂和规程(即 标准细胞条件化1(CC1)试剂等等)进行样品制备及ultraViewDAB作为检测系统。在半自动 化Dako自动染色仪平台上实施Dako的DAK-H3-IC抗体对HER3的免疫组织化学测定法，使用 UltraVisionLP检测系统和DAB。手工进行脱石蜡和抗原修复步骤的规程。来自Dako的DAK- H3-IC抗体不能在VentanaBenchmarkXT系统上使用，因为它在这种平台上没有显示FFPET 样品中的任何结合活性。
根据图4A(它是图4B中显示的组织样品的放大部分)显而易见的是，新开发的单克 隆抗体MAK<人HER3>M-7.2.42显示肿瘤细胞上的强膜染色。染色强度比用Dako的针对HER3 的DAK-H3-IC现有技术抗体获得的染色强度显著更强。因此，单克隆抗体MAK<人HER3>M- 7.2.42显示针对FFPET样品中HER3的高结合特异性和灵敏度，并且在自动化系统中用于临 床人肿瘤样品的染色时提供HER3表达的可靠检测。
c)来自肺和结肠癌的人肿瘤组织样品的比较性免疫组织化学测定法
为了分析新抗HER3抗体的免疫组织化学的灵敏度，与商品化抗体比较，实施连续 切片的染色。制备来自肺和结肠癌的福尔马林固定石蜡包埋人肿瘤组织的3μm连续切片。在 Roche/VentanaBenchmarkXT仪器上实施所有染色。为了抗原修复，应用缓冲液CC1达60分 钟，继以不同一抗(MAK<人HER3>M-7.3.8和SantaCruzC17)染色。使用VentanaOptiView 试剂盒进行一抗检测。以125ng/ml的浓度使用这两种抗体。
如图5A至D所示，抗体MAK<人HER3>M-7.3.8能清楚地检测肿瘤组织内HER3的表达 和膜定位，甚至当HER3小量表达时。与新抗体7.3.8相比，商品化抗体C17对同一肿瘤案例的 染色检测不到。