一种ERK1/2蛋白抑制多肽、其制备方法及应用.pdf

上传人:1520****312 文档编号:8594815 上传时间:2020-09-13 格式:PDF 页数:16 大小:1.29MB
返回 下载 相关 举报
摘要
申请专利号:

CN201610202732.8

申请日:

20160331

公开号:

CN105734031A

公开日:

20160706

当前法律状态:

有效性:

审查中

法律详情:

IPC分类号:

C12N9/16,C12N15/55,C12N15/70,C12N1/21,C12R1/19

主分类号:

C12N9/16,C12N15/55,C12N15/70,C12N1/21,C12R1/19

申请人:

金鑫

发明人:

金鑫

地址:

430000 湖北省武汉市硚口区航空路13号

优先权:

CN201610202732A

专利代理机构:

北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙)

代理人:

李进

PDF下载: PDF下载
内容摘要

本发明涉及生物工程领域,具体而言,涉及一种ERK1/2蛋白抑制多肽,该多肽可竞争性抑制ERK1/2与IQGAP1的结合,进而抑制ERK1/2的磷酸化。ERK1/2蛋白抑制多肽仅有21个氨基酸,无论是人工合成该多肽还是运用宿主细胞表达制备均非常方便易行,利于大规模推广利用;且该多肽来源于生物体内固有的蛋白质,用于动物实验不会造成免疫排除,通常大多数抑制剂均为人工合成的化合物,相比之下本申请提供的蛋白多肽对细胞毒性更小,也更为特异。

权利要求书

1.一种ERK1/2蛋白抑制多肽,其特征在于,所述多肽的氨基酸序列如SEQIDNO:1所示。 2.如权利要1所述的ERK1/2蛋白抑制多肽,其特征在于,所述多肽的氨基酸序列为SEQIDNo:1所示的氨基酸序列经添加一个或几个氨基酸,得到的编码相同活性蛋白质的氨基酸序列。 3.如权利要求2所述的ERK1/2蛋白抑制多肽,其特征在于,所述多肽为FBP1蛋白的氨基酸序列。 4.编码权利要求1所述的ERK1/2蛋白抑制多肽的基因,其特征在于,所述基因的核苷酸序列如SEQIDNO:2所示。 5.编码权利要求4所述的基因,其特征在于,所述基因的氨基酸序列为SEQIDNo:2所示的核苷酸序列经取代、缺失和/或添加一个或几个核苷酸,编码相同活性蛋白质的核苷酸序列,得到的编码相同活性蛋白质的核苷酸序列。 6.含有权利要求4或5所述基因的重组质粒。 7.如权利要求6所述的重组质粒,其特征在于,所述重组质粒为将SEQIDNo:2所示的核苷酸插入到pcDNA3.1/V5-His-TOPO中得到。 8.含有权利要求6所述重组质粒的宿主细胞。 9.如权利要求8所述的宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞为大肠杆菌、PANC-1或MIAPaCa-2中的一种。 10.权利要求7所述的重组质粒在PANC-1细胞中表达制备ERK1/2蛋白抑制多肽的方法,其特征在于,包括以下步骤:将核苷酸序列为SEQIDNo:2的基因片段定向克隆到pcDNA3.1/V5-His-TOPO表达载体中,将得到的重组表达质粒转染PANC-1细胞并培养,表达重组蛋白;将表达后的蛋白经初步分离、纯化后制得重组蛋白。

说明书

技术领域

本发明涉及生物工程领域,具体而言,涉及一种ERK1/2蛋白 抑制多肽、其制备方法及应用。

背景技术

Ras蛋白是一种小G蛋白,RAS信号途径是一种很常见且重要 的细胞分子信号传导途径。其信号途径为:Ras→Raf(MAPKKK) →MAPKK(MEK)→MAPK(ERK1/2)→进入细胞核→转录因子 →基因表达。RAS通路与炎症,肿瘤等密切相关。因此成为治疗炎 症,肿瘤的作用靶点。

目前针对Ras通路的多个环节开发出了多种抑制剂。但是目前 尚没有特异性针对ERK1/2的抑制剂,因而目前仅能通过抑制其上 游蛋白——如MEK蛋白等——来间接实现抑制ERK1/2活性的目的。 由于细胞信号转导最重要的特征之一是构成复杂的信号网络系统, 具有高度的非线性特点,因而细胞内不同信号通路间普遍存在着信 号对答(cross-talking)的现象,而Ras信号通路作为细胞内部最重 要的信号通路之一,ERK1/2的上游蛋白通常也是其他信号通路的传 导节点,所以对其上游蛋白进行抑制会对细胞内部的活动造成广泛 的影响,进而无法特异性地针对ERK1/2蛋白进行研究,这大大地 限制了ERK1/2蛋白的相关研究。

有鉴于此,特提出本发明。

发明内容

本发明的目的在于提供一种ERK1/2蛋白抑制多肽,所述多肽 可特异性地抑制ERK1/2的磷酸化,从而发挥ERK1/2抑制剂的功 能。

为了实现本发明的上述目的,特采用以下技术方案:

一种ERK1/2蛋白抑制多肽,所述多肽的氨基酸序列如SEQID NO:1所示。

果糖-1,6-二磷酸酶(Fructose-1,6-bisphosphatase1,FBP1) 是糖异生中的关键限速酶之一,在糖代谢中起重要作用。哺乳动物 存在肝脏型和肌肉型两种果糖-1,6-二磷酸酶同工酶,分别由Fbp1 和Fbp2基因编码。

本申请中记载的ERK1/2蛋白抑制多肽为FBP1中的一部分序 列,该段序列在不同物种间高度保守,由27个氨基酸构成。

IQGAP1(IQmotifcontainingGTPaseactivatingproteins)是近 年来新发现的一个蛋白家族,其序列中含有类似于RasGAPs催化域 的广泛序列和位于N端的4个可与钙调蛋白相互作用的IQ模体, 在哺乳动物中有三个同源物IQGAP1~3。不同于IQGAP2和IQGAP3 限制性地表达于肝和肠道等器官,IQGAP1呈现出一种全身性地表 达。有研究表明,IQGAP1可通过其WW结构域调节ERK的磷酸 化(如图1所示)。发明人在实验中偶然发现FBP1能与ERK一样 结合IQGAP1的WW结构域,在进一步的研究中,发明人将FBP1 分成七段,发现只有第四段能与IQGAP1进而抑制ERK的磷酸化, 为了描述方便,发明人将这第四段多肽命名为FBPe4,其即为本申 请所述的ERK1/2蛋白抑制多肽。由于FBPe4具有上述特性,因而 可作为ERK1/2蛋白的竞争性抑制剂来使用。

FBPe4可以特异性抑制ERK1/2的活性,可更精确地用于 ERK1/2功能的相关研究与应用。并且它来源于生物体内固有的蛋白 质,相比人工合成的化合物抑制剂更加安全。

优选的,如上所述的ERK1/2蛋白抑制多肽,所述多肽的氨基 酸序列为SEQIDNo:1所示的氨基酸序列经添加一个或几个氨基酸, 得到的编码相同活性蛋白质的氨基酸序列。

进一步优选的,所述多肽为FBP1蛋白的氨基酸序列。

本领域技术人员应可根据本发明公开ERK1/2蛋白抑制多肽序 列对其进行改造,将SEQIDNo:1所示的氨基酸序列经取代、缺失 和/或添加一个或几个氨基酸,得到的编码相同活性蛋白质的氨基酸 序列,如天然蛋白FBP1即为实例之一,通过过表达FBP1也可抑 制ERK1/2蛋白活性。

编码如上所述的ERK1/2蛋白抑制多肽的基因,所述基因的核 苷酸序列如SEQIDNO:2所示。

编码如上所述的ERK1/2蛋白抑制多肽的基因,所述基因的核 苷酸序列为SEQIDNo:2所示的核苷酸序列经取代、缺失和/或添加 一个或几个核苷酸,编码相同活性蛋白质的核苷酸序列,得到的编 码相同活性蛋白质的核苷酸序列。

应当理解,本领域人员可根据本发明公开的ERK1/2蛋白抑制 多肽的基因的核苷酸序列(SEQIDNO:2),在保证其活性的前提下, 取代、缺失和/或添加一个或几个核苷酸,得到该基因的突变序列。

例如简并密码子直接的互相替换:

aaagatgctctgcaaccaggccggaacctggtggcagccggctacgcact gtatggcagtgccaccatgctggtccttgcc也能编码出SEQIDNo:1所示蛋白。

SEQIDNO:2所示的核苷酸序列是由81个核苷酸组成的基因。

此外,可将FBP1全长序列中缺失SEQIDNO:2所示的核苷酸 序列得到缺失突变体,所述缺失突变体可用于FBP1的功能研究或 者基于FBP1功能的相关疾病的研究,特别是在FBP1与IQGAP1 相互作用研究中的应用。

含有如上所述基因的重组质粒。

进一步优选的,所述重组质粒为将SEQIDNo:2所示的核苷酸 序列插入到pcDNA3.1/V5-His-TOPO中得到。

含有如上所述重组质粒的宿主细胞。

进一步优选的,所述宿主细胞为大肠杆菌、PANC-1或MIA PaCa-2中的一种。

根据如上所述的重组质粒在PANC-1细胞中表达制备ERK1/2 蛋白抑制多肽的方法,包括以下步骤:

将核苷酸序列为SEQIDNo:2的基因片段定向克隆到 pcDNA3.1/V5-His-TOPO表达载体中,将得到的重组表达质粒转染 PANC-1细胞并培养,表达重组蛋白;将表达后的蛋白经初步分离、 纯化后制得重组蛋白。

与现有技术相比,本发明的有益效果为:

1)、本申请首次提供了一种ERK1/2蛋白特异性的竞争性抑制 剂。

2)、ERK1/2蛋白抑制多肽仅有21个氨基酸,无论是人工合成 该多肽还是运用宿主细胞表达制备均非常方便易行,利于大规模推 广利用。

3)、ERK1/2蛋白抑制多肽来源于生物体内固有的蛋白质,用 于动物实验不会造成免疫排除,通常大多数抑制剂均为人工合成的 化合物,相比之下本申请提供的蛋白多肽对细胞毒性更小,也更为 特异。

4)、由于为生物体内固有的蛋白质,还可通过慢病毒等手段将 编码该多肽的基因片段转染至细胞内进行稳定表达,操作方便,更 利于在体研究;更一步的,也可将包含该基因片段的病毒注射入实 验动物体内,并结合动物行为学等实验手段,在整体水平上对 ERK1/2及其所在信号通路进行更深入的研究,具有广阔的应用前景。

附图说明

为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,以 下将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。

图1为FBPe4抑制ERK1/2的原理示意图:正常情况下, IQGAP1可通过其WW结构域协助MEK进行ERK1/2的磷酸化(图 左部分);在FBPe4存在时,会竞争性地与WW结构域结合进而抑 制ERK1/2的磷酸化;

图2~4为本申请实施例1中FBPe4与IQGAP1的相互作用验证 及初步功能验证;

图2为寻找IQGAP1与FBP1相结合的蛋白区段的GST试验 pulldown实验;A为IQGAP1结构域及IQGAP1的6段含有GST 标签的截断体的示意图;B为GSTpulldown实验验证IQGAP1WW 结构域可以与FBP1互相结合(IP:GST,IB:FBP1);

图3为寻找FBP1与IQGAP1相结合的蛋白区段的GST试验 pulldown实验;A为FBP1结构域及FBP1的7段含有GST标签的 截断体的示意图;B为GSTpulldown实验验证FBP1的e4结构域 可以与IQGAP1互相结合(IP:GST,IB:IQGAP1);

图4为FBPe4的初步功能验证;A为RNA干扰实验验证FBP1 特异性地干扰ERK2与IQGAP1的结合(shNT:乱序小干扰RNA, IP:IQGAP1);B为FBP1e4段蛋白在不同物种中的氨基酸序列;C 为免疫共沉淀实验验证FBPe4可特异性地干扰ERK2与IQGAP1的 互相结合;

图5为本申请实施例3中FBPe4的功能验证;A为FBP1G260R 及FBP1ΔFBPe4突变蛋白的结构示意图;B为免疫共沉淀实验验证 FBPe4特异性地抑制ERK1/2的磷酸化(IP:Flag)。

具体实施方式

下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述,但是本 领域技术人员将会理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视 为限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件 或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均 为可以通过市售购买获得的常规产品。

实施例1含有FBPe4与IQGAP1的相互作用验证及初步功能 验证

S11、主要实验材料:

1)、细胞

本试验选择胰腺癌细胞系PANC-1。胰腺癌细胞系为K-ras突变 型细胞系,能在正常情况下检测到pERK1/2,因此能观察到经过 FBPe4处理后,pERK1/2的变化情况,便于观察实验效果。

PANC-1购自ATCC(AmericanTypeCultureCollection, Manassay,VA,USA)公司。PANC-1细胞使用DMEM培养基 (CORNING,Manassa,VA,USA),含10%胎牛血清(Life Technologies)、100units/ml青霉素和100μg/ml链霉素(Life Technologies)。细胞培养箱中培养,培养条件为5%CO2,37℃,95% 湿度。

2)、质粒

Flag-FBP1,FBPe4和FBPΔE4装入pcDNA3.1/V5-His-TOPO (Invitrogen,460083)载体,该载体含有Flag标签。GST-FBP1, IQGAP1突变体装入pGEX-4T-1载体。

3)、抗体

FBP1(Abcam,ab109732,稀释浓度1:1000);

ERK2(SantaCruzBiotechnology,SC-1647,稀释浓度1:5000);

FLAGM2(Sigma-Aldrich,F-3165,稀释浓度1:3000);

IQGAP1(SantaCruzBiotechnology,H-109,稀释浓度1:5000)。

4)、shRNA序列购自Sigma-Aldrich(St.Lois,MO)公司:

5′-CCGGCCTTGATGGATCTTCCAACATCTCGAGATGTTGG AAGATCCATCAAGGTTTTTG-3′(shFBP1)

S21、IQGAP1蛋白的结构域如图2A所示,根据IQGAP1结构 域,将IQGAP1分成6段,并合成从P1到P6的6段含有GST标 签的截断体。

利用GSTpulldown实验,将IQGAP1的6段GST截断体与 FBP1蛋白共同孵育。

GSTpulldown实验步骤:PANC-1细胞使用细胞裂解缓冲液 (20mMTris-HCl(pH7.5),150mMNaCl,0.1%NonidetP40,1mM DTT(dithiothreitol),10%glycerol,1mMEDTA,2.5mMMgCl2及1μg/mlleupeptin)4℃裂解30分钟。GST融合蛋白结合到GST珠 子上(GEHealthcareLifescience)。细胞裂解产物与GST珠子4℃共 同敷育4h。珠子用细胞裂解缓冲液清洗5次,每次清洗后,离心, 去除上清。加入RIPA缓冲液与loadingbuffer(NOREX),DTT的 混合液60μL,100℃煮5分钟。然后利用10%SDS-polyacrylamide 胶电泳后分离蛋白,然后转入硝化纤维膜,与1抗4℃共同敷育过夜。 次日用1×TBST清洗后,与二抗室温敷育1小时。蛋白随后用化学 发法检测。

WesternBlotting法检测结果(图2B)显示P3段即IQGAP1WW 结构域可以与FBP1互相结合。

S22、对FBP1蛋白结构域进行分析(图3A)并设计7段含有 GST标签的截断体。同样利用GSTpulldown实验,将FBP1的7 段GST截断体与IQGAP1蛋白共同孵育。

WesternBlotting法检测结果(图3B)显示e4段结构域可以与 IQGAP1互相结合。

S23、利用RNA干扰技术敲除FBP1。使用Lipofectamine2000 (Invitrogen公司)转染进PANC-1细胞,48小时后收样并提取蛋 白,使用IQGAP抗体做作免疫共沉淀及WesternBlotting检测。

免疫共沉淀:回收细胞,使用细胞裂解缓冲液(50mMTris-HCl, pH7.5,150mMNaCl,1%NonidetP-40,0.5%sodiumdeoxycholate 和1%proteaseinhibitorcocktails,Sigma-Aldrich)裂解细胞。细胞 裂解产物离心,取上清,与protein-G珠子(LifeTechnologies)4℃ 共同敷育过夜。次日,珠子用细胞裂解缓冲液清洗5次,每次清洗 后,离心,去除上清。加入RIPA缓冲液与LoadingBuffer(NOREX), DTT的混合液60μL,100℃煮5分钟

WesternBlotting:细胞回收后,使用RIPA缓冲液[1×PBS, 1%NonidetP-40,0.1%sodiumdodecylsulfateandproteaseinhibitor cocktail(Sigma-Aldrich,St.Lous,MO)]裂解细胞。使用BCAassay (ThermoFisherScientific)检测裂解后得到蛋白的蛋白浓度。然后 加入LoadingBuffer(NOREX),DTT混合后100℃煮5分钟。将上 述煮后的样品,利用10%SDS-polyacrylamide凝胶电泳分离蛋白后, 然后转入硝化纤维膜,与1抗4℃共同敷育过夜。次日用1×TBST 清洗后,与二抗室温敷育1小时。蛋白随后用化学发法检测。

WesternBlotting结果显示,未敲除FBP1时,ERK2与IQGAP1 结合较弱(图4A第2泳道IP,IB:ERK2),而敲除FBP1后,ERK2 与IQGAP1结合增强(图4A第3泳道IP,IB:ERK2);但敲除FBP1 与否并不影响ERK2上游的C-Raf、MEK2与IQGAP1的结合(图 4A第2、3泳道IP,IB:C-Raf、IB:MEK2),因此可说明FBP1 特异性地干扰ERK2与IQGAP1的结合。进一步的,本申请比对了 不同物种中e4段蛋白的氨基酸序列,发现其序列高度保守(图4B)。

S24、利用氨基酸的保守序列,合成含有FBPe4的重组质粒 pcDNA3.1/V5-His-TOPO-FBPe4(见实施例2),利用该重组质粒表 达不含这段氨基酸序列的FBP1ΔFBPe4质粒:

FBP1ΔFBPe4(缺失E4段质粒)构建的引物:

上游引物:5’-GCCATCGGGGAGTTCATTTTGGT-3’;

下游引物:5’-CGGTAGCCCCTCAAGTAAAACCAC-3’。

将FBP1ΔFBPe4质粒转入细胞,使用IQGAP抗体做作免疫共 沉淀,结果显示,FBPe4蛋白能干扰ERK2结合,但是FBP1ΔFBPe4 不能干扰结合(图4C),这进一步验证了本申请提供的ERK1/2蛋 白抑制多肽FBPe4可抑制ERK与IQGAP1的结合。

实施例2含有FBPe4的重组质粒的构建及FBPe4的表达

根据SEQIDNo:2所示的碱基序列,将这段序列克隆到表达载 体pcDNA3.1/V5-His-TOPO(含Fag标签,可用Flag抗体检测)。

S21、PCR扩增目标DNA,电泳回收目标DNA

利用FBP1质粒(序列如SEQIDNo:3所示)为模板扩增得到 FBPe4的基因序列(即SEQIDNo:2),PCR扩增反应体系为:

其中,FBPe4上游引物为:

5-CGGATATCAAGGATGCTCTGCAACCAGGCCGG-3’;

FBPe4下游引物:

5’-CGCTCGAGGGCAAGGACCAGCATGGTGGCACT-3’。

PCR反应程序为:

完成后将扩增产物进行琼脂糖电泳,切取100bp左右的目标条 带,利用胶回收试剂盒回收DNA。

S22、选择酶切位点EcoRV和Xhol进行对目标条带和表达载 体pcDNA3.1/V5-His-TOPO进行双酶切

酶切体系为:

37℃水浴过夜。

其中,EcoRV和Xhol的酶切位点为:

EcoRV(GATATC);

Xhol(CTCGAG)。

S23、连接

酶切产物琼脂糖电泳,利用胶回收试剂盒回收DNA。

连接体系:

16℃连接过夜。

连接后得到pcDNA3.1/V5-His-TOPO-FBPe4重组质粒。

S24、Top10感受态细菌转化

-80℃取出Top10感受态细菌,置于冰上,加入连接产物(10μL)。 冰上放置30分钟,42℃孵育90秒,冰上放置10分钟,加入LB培 养基200μL。37℃摇床,180转/min,一小时后细菌涂氨苄西林LB 板。24小时后挑取单克隆,扩增后质粒回收试剂盒回收质粒。按S22 的酶切体系,酶切后琼脂糖电泳鉴定,选取阳性克隆(电泳可见 100bp条带)测序。

S25、细胞内表达

将已克隆的FBPe4质粒lipo2000转染PANC-1细胞,Western Blotting鉴定蛋白表达。将表达后的蛋白经初步分离、纯化后制得 重组蛋白。

实施例3FBPe4抑制ERK1/2的磷酸化

S31、利用pcDNA3.1/V5-His-TOPO-FBPe4重组质粒构建 FBP1G260R质粒。

FBP1G260R(第260位甘氨酸换为精氨酸)构建的引物:

上游引物:

5’-CATCGCACTCTGGTCTACAGAGGGATATTTCTGTAC-3’

下游引物:

5’-AACATCAGCCACCATGGAGCCCACATACCGGGCCC-3’

FBP1G260R失去了合成糖原的酶活性。

FBP1G260R及FBP1ΔFBPe4突变蛋白的结构如图3A所示。

S32、将FBP1G260R及FBP1ΔFBPe4质粒转入PANC-1细胞并 表达,收取细胞裂解液并用Flag抗体做免疫共沉淀实验 (FBP1G260R及FBP1ΔFBPe4质粒表达的重组蛋白均带有Flag标 签)。

实验结果显示,FBP1,FBP1G260R,FBPe4均能抑制ERK1/2 的磷酸化,但FBP1ΔFBPe4不能抑制,这说明FBPe4多肽片段具有 抑制ERK1/2的磷酸化的作用,且该作用的实现与FBP1的合成糖 原的酶活性无关。

尽管已用具体实施例来说明和描述了本发明,然而应意识到, 在不背离本发明的精神和范围的情况下可以作出许多其它的更改和 修改。因此,这意味着在所附权利要求中包括属于本发明范围内的 所有这些变化和修改。

一种ERK1/2蛋白抑制多肽、其制备方法及应用.pdf_第1页
第1页 / 共16页
一种ERK1/2蛋白抑制多肽、其制备方法及应用.pdf_第2页
第2页 / 共16页
一种ERK1/2蛋白抑制多肽、其制备方法及应用.pdf_第3页
第3页 / 共16页
点击查看更多>>
资源描述

《一种ERK1/2蛋白抑制多肽、其制备方法及应用.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《一种ERK1/2蛋白抑制多肽、其制备方法及应用.pdf(16页珍藏版)》请在专利查询网上搜索。

1、(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201610202732.8 (22)申请日 2016.03.31 (71)申请人 金鑫 地址 430000 湖北省武汉市硚口区航空路 13号 (72)发明人 金鑫 (74)专利代理机构 北京超凡志成知识产权代理 事务所(普通合伙) 11371 代理人 李进 (51)Int.Cl. C12N 9/16(2006.01) C12N 15/55(2006.01) C12N 15/70(2006.01) C12N 1/21(2006.01) C12R 1/19(2006.01) (54。

2、)发明名称 一种ERK1/2蛋白抑制多肽、 其制备方法及应 用 (57)摘要 本发明涉及生物工程领域, 具体而言, 涉及 一种ERK1/2蛋白抑制多肽, 该多肽可竞争性抑制 ERK1/2与IQGAP1的结合, 进而抑制ERK1/2的磷酸 化。 ERK1/2蛋白抑制多肽仅有21个氨基酸, 无论 是人工合成该多肽还是运用宿主细胞表达制备 均非常方便易行, 利于大规模推广利用; 且该多 肽来源于生物体内固有的蛋白质, 用于动物实验 不会造成免疫排除, 通常大多数抑制剂均为人工 合成的化合物, 相比之下本申请提供的蛋白多肽 对细胞毒性更小, 也更为特异。 权利要求书1页 说明书7页 序列表3页 附图4。

3、页 CN 105734031 A 2016.07.06 CN 105734031 A 1.一种ERK1/2蛋白抑制多肽, 其特征在于, 所述多肽的氨基酸序列如SEQIDNO:1所 示。 2.如权利要1所述的ERK1/2蛋白抑制多肽, 其特征在于, 所述多肽的氨基酸序列为SEQ IDNo:1所示的氨基酸序列经添加一个或几个氨基酸, 得到的编码相同活性蛋白质的氨基 酸序列。 3.如权利要求2所述的ERK1/2蛋白抑制多肽, 其特征在于, 所述多肽为FBP1蛋白的氨基 酸序列。 4.编码权利要求1所述的ERK1/2蛋白抑制多肽的基因, 其特征在于, 所述基因的核苷酸 序列如SEQIDNO:2所示。 。

4、5.编码权利要求4所述的基因, 其特征在于, 所述基因的氨基酸序列为SEQIDNo:2所 示的核苷酸序列经取代、 缺失和/或添加一个或几个核苷酸, 编码相同活性蛋白质的核苷酸 序列, 得到的编码相同活性蛋白质的核苷酸序列。 6.含有权利要求4或5所述基因的重组质粒。 7.如权利要求6所述的重组质粒, 其特征在于, 所述重组质粒为将SEQIDNo:2所示的 核苷酸插入到pcDNA3.1/V5-His-TOPO中得到。 8.含有权利要求6所述重组质粒的宿主细胞。 9.如权利要求8所述的宿主细胞, 其特征在于, 所述宿主细胞为大肠杆菌、 PANC-1或MIA PaCa-2中的一种。 10.权利要求7。

5、所述的重组质粒在PANC-1细胞中表达制备ERK1/2蛋白抑制多肽的方法, 其特征在于, 包括以下步骤: 将核苷酸序列为SEQIDNo:2的基因片段定向克隆到pcDNA3.1/V5-His-TOPO表达载体 中, 将得到的重组表达质粒转染PANC-1细胞并培养, 表达重组蛋白; 将表达后的蛋白经初步 分离、 纯化后制得重组蛋白。 权利要求书 1/1 页 2 CN 105734031 A 2 一种ERK1/2蛋白抑制多肽、 其制备方法及应用 技术领域 0001 本发明涉及生物工程领域, 具体而言, 涉及一种ERK1/2蛋白抑制多肽、 其制备方法 及应用。 背景技术 0002 Ras蛋白是一种小G。

6、蛋白, RAS信号途径是一种很常见且重要的细胞分子信号传导 途径。 其信号途径为: RasRaf(MAPKKK)MAPKK(MEK)MAPK(ERK1/2)进入细胞核转 录因子基因表达。 RAS通路与炎症, 肿瘤等密切相关。 因此成为治疗炎症, 肿瘤的作用靶 点。 0003 目前针对Ras通路的多个环节开发出了多种抑制剂。 但是目前尚没有特异性针对 ERK1/2的抑制剂, 因而目前仅能通过抑制其上游蛋白如MEK蛋白等来间接实现抑 制ERK1/2活性的目的。 由于细胞信号转导最重要的特征之一是构成复杂的信号网络系统, 具有高度的非线性特点, 因而细胞内不同信号通路间普遍存在着信号对答(cross。

7、- talking)的现象, 而Ras信号通路作为细胞内部最重要的信号通路之一, ERK1/2的上游蛋白 通常也是其他信号通路的传导节点, 所以对其上游蛋白进行抑制会对细胞内部的活动造成 广泛的影响, 进而无法特异性地针对ERK1/2蛋白进行研究, 这大大地限制了ERK1/2蛋白的 相关研究。 0004 有鉴于此, 特提出本发明。 发明内容 0005 本发明的目的在于提供一种ERK1/2蛋白抑制多肽, 所述多肽可特异性地抑制 ERK1/2的磷酸化, 从而发挥ERK1/2抑制剂的功能。 0006 为了实现本发明的上述目的, 特采用以下技术方案: 0007 一种ERK1/2蛋白抑制多肽, 所述多肽。

8、的氨基酸序列如SEQIDNO:1所示。 0008 果糖-1, 6-二磷酸酶(Fructose-1, 6-bisphosphatase1, FBP1)是糖异生中的关键 限速酶之一, 在糖代谢中起重要作用。 哺乳动物存在肝脏型和肌肉型两种果糖-1, 6-二磷酸 酶同工酶, 分别由Fbp1和Fbp2基因编码。 0009 本申请中记载的ERK1/2蛋白抑制多肽为FBP1中的一部分序列, 该段序列在不同物 种间高度保守, 由27个氨基酸构成。 0010 IQGAP1(IQmotifcontainingGTPaseactivatingproteins)是近年来新发现 的一个蛋白家族, 其序列中含有类似于R。

9、asGAPs催化域的广泛序列和位于N端的4个可与钙 调蛋白相互作用的IQ模体, 在哺乳动物中有三个同源物IQGAP13。 不同于IQGAP2和IQGAP3 限制性地表达于肝和肠道等器官, IQGAP1呈现出一种全身性地表达。 有研究表明, IQGAP1可 通过其WW结构域调节ERK的磷酸化(如图1所示)。 发明人在实验中偶然发现FBP1能与ERK一 样结合IQGAP1的WW结构域, 在进一步的研究中, 发明人将FBP1分成七段, 发现只有第四段能 与IQGAP1进而抑制ERK的磷酸化, 为了描述方便, 发明人将这第四段多肽命名为FBPe4, 其即 说明书 1/7 页 3 CN 10573403。

10、1 A 3 为本申请所述的ERK1/2蛋白抑制多肽。 由于FBPe4具有上述特性, 因而可作为ERK1/2蛋白的 竞争性抑制剂来使用。 0011 FBPe4可以特异性抑制ERK1/2的活性, 可更精确地用于ERK1/2功能的相关研究与 应用。 并且它来源于生物体内固有的蛋白质, 相比人工合成的化合物抑制剂更加安全。 0012 优选的, 如上所述的ERK1/2蛋白抑制多肽, 所述多肽的氨基酸序列为SEQIDNo:1 所示的氨基酸序列经添加一个或几个氨基酸, 得到的编码相同活性蛋白质的氨基酸序列。 0013 进一步优选的, 所述多肽为FBP1蛋白的氨基酸序列。 0014 本领域技术人员应可根据本发。

11、明公开ERK1/2蛋白抑制多肽序列对其进行改造, 将 SEQIDNo:1所示的氨基酸序列经取代、 缺失和/或添加一个或几个氨基酸, 得到的编码相 同活性蛋白质的氨基酸序列, 如天然蛋白FBP1即为实例之一, 通过过表达FBP1也可抑制 ERK1/2蛋白活性。 0015 编码如上所述的ERK1/2蛋白抑制多肽的基因, 所述基因的核苷酸序列如SEQID NO:2所示。 0016 编码如上所述的ERK1/2蛋白抑制多肽的基因, 所述基因的核苷酸序列为SEQID No:2所示的核苷酸序列经取代、 缺失和/或添加一个或几个核苷酸, 编码相同活性蛋白质的 核苷酸序列, 得到的编码相同活性蛋白质的核苷酸序列。

12、。 0017 应当理解, 本领域人员可根据本发明公开的ERK1/2蛋白抑制多肽的基因的核苷酸 序列(SEQIDNO:2), 在保证其活性的前提下, 取代、 缺失和/或添加一个或几个核苷酸, 得 到该基因的突变序列。 0018 例如简并密码子直接的互相替换: 0019 aaagatgctctgcaaccaggccggaacctggtggcagccggctacgcactgtatggcagt gccaccatgctggtccttgcc也能编码出SEQIDNo:1所示蛋白。 0020 SEQIDNO:2所示的核苷酸序列是由81个核苷酸组成的基因。 0021 此外, 可将FBP1全长序列中缺失SEQID。

13、NO:2所示的核苷酸序列得到缺失突变体, 所述缺失突变体可用于FBP1的功能研究或者基于FBP1功能的相关疾病的研究, 特别是在 FBP1与IQGAP1相互作用研究中的应用。 0022 含有如上所述基因的重组质粒。 0023 进一步优选的, 所述重组质粒为将SEQIDNo:2所示的核苷酸序列插入到 pcDNA3.1/V5-His-TOPO中得到。 0024 含有如上所述重组质粒的宿主细胞。 0025 进一步优选的, 所述宿主细胞为大肠杆菌、 PANC-1或MIAPaCa-2中的一种。 0026 根据如上所述的重组质粒在PANC-1细胞中表达制备ERK1/2蛋白抑制多肽的方法, 包括以下步骤: 。

14、0027 将核苷酸序列为SEQIDNo:2的基因片段定向克隆到pcDNA3.1/V5-His-TOPO表达 载体中, 将得到的重组表达质粒转染PANC-1细胞并培养, 表达重组蛋白; 将表达后的蛋白经 初步分离、 纯化后制得重组蛋白。 0028 与现有技术相比, 本发明的有益效果为: 0029 1)、 本申请首次提供了一种ERK1/2蛋白特异性的竞争性抑制剂。 0030 2)、 ERK1/2蛋白抑制多肽仅有21个氨基酸, 无论是人工合成该多肽还是运用宿主 说明书 2/7 页 4 CN 105734031 A 4 细胞表达制备均非常方便易行, 利于大规模推广利用。 0031 3)、 ERK1/2。

15、蛋白抑制多肽来源于生物体内固有的蛋白质, 用于动物实验不会造成 免疫排除, 通常大多数抑制剂均为人工合成的化合物, 相比之下本申请提供的蛋白多肽对 细胞毒性更小, 也更为特异。 0032 4)、 由于为生物体内固有的蛋白质, 还可通过慢病毒等手段将编码该多肽的基因 片段转染至细胞内进行稳定表达, 操作方便, 更利于在体研究; 更一步的, 也可将包含该基 因片段的病毒注射入实验动物体内, 并结合动物行为学等实验手段, 在整体水平上对ERK1/ 2及其所在信号通路进行更深入的研究, 具有广阔的应用前景。 附图说明 0033 为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案, 以下将对实施例或现 。

16、有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。 0034 图1为FBPe4抑制ERK1/2的原理示意图: 正常情况下, IQGAP1可通过其WW结构域协 助MEK进行ERK1/2的磷酸化(图左部分); 在FBPe4存在时, 会竞争性地与WW结构域结合进而 抑制ERK1/2的磷酸化; 0035 图24为本申请实施例1中FBPe4与IQGAP1的相互作用验证及初步功能验证; 0036 图2为寻找IQGAP1与FBP1相结合的蛋白区段的GST试验pulldown实验; A为IQGAP1 结构域及IQGAP1的6段含有GST标签的截断体的示意图; B为GSTpulldown实验验证 IQGAP1WW结构域。

17、可以与FBP1互相结合(IP: GST, IB: FBP1); 0037 图3为寻找FBP1与IQGAP1相结合的蛋白区段的GST试验pulldown实验; A为FBP1结 构域及FBP1的7段含有GST标签的截断体的示意图; B为GSTpulldown实验验证FBP1的e4结 构域可以与IQGAP1互相结合(IP: GST, IB: IQGAP1); 0038 图4为FBPe4的初步功能验证; A为RNA干扰实验验证FBP1特异性地干扰ERK2与 IQGAP1的结合(shNT: 乱序小干扰RNA, IP: IQGAP1); B为FBP1e4段蛋白在不同物种中的氨基 酸序列; C为免疫共沉淀实。

18、验验证FBPe4可特异性地干扰ERK2与IQGAP1的互相结合; 0039 图5为本申请实施例3中FBPe4的功能验证; A为FBP1G260R及FBP1FBPe4突变蛋白 的结构示意图; B为免疫共沉淀实验验证FBPe4特异性地抑制ERK1/2的磷酸化(IP: Flag)。 具体实施方式 0040 下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述, 但是本领域技术人员将会 理解, 下列实施例仅用于说明本发明, 而不应视为限制本发明的范围。 实施例中未注明具体 条件者, 按照常规条件或制造商建议的条件进行。 所用试剂或仪器未注明生产厂商者, 均为 可以通过市售购买获得的常规产品。 0041 实施。

19、例1含有FBPe4与IQGAP1的相互作用验证及初步功能验证 0042 S11、 主要实验材料: 0043 1)、 细胞 0044 本试验选择胰腺癌细胞系PANC-1。 胰腺癌细胞系为K-ras突变型细胞系, 能在正常 情况下检测到pERK1/2, 因此能观察到经过FBPe4处理后, pERK1/2的变化情况, 便于观察实 验效果。 说明书 3/7 页 5 CN 105734031 A 5 0045 PANC-1购自ATCC(AmericanTypeCultureCollection, Manassay, VA, USA)公司。 PANC-1细胞使用DMEM培养基(CORNING, Manas。

20、sa, VA, USA), 含10胎牛血清(Life Technologies)、 100units/ml青霉素和100 g/ml链霉素(LifeTechnologies)。 细胞培养箱 中培养, 培养条件为5CO2, 37, 95湿度。 0046 2)、 质粒 0047 Flag-FBP1, FBPe4和FBPE4装入pcDNA3.1/V5-His-TOPO(Invitrogen,460083)载 体, 该载体含有Flag标签。 GST-FBP1, IQGAP1突变体装入pGEX-4T-1载体。 0048 3)、 抗体 0049 FBP1(Abcam, ab109732, 稀释浓度1:100。

21、0); 0050 ERK2(SantaCruzBiotechnology, SC-1647, 稀释浓度1:5000); 0051 FLAGM2(Sigma-Aldrich, F-3165, 稀释浓度1:3000); 0052 IQGAP1(SantaCruzBiotechnology, H-109, 稀释浓度1:5000)。 0053 4)、 shRNA序列购自Sigma-Aldrich(St.Lois, MO)公司: 0054 5 -CCGGCCTTGATGGATCTTCCAACATCTCGAGATGTTGGAAGATCCATCAAGGTTTTTG-3 (shFBP1) 0055 S21、 。

22、IQGAP1蛋白的结构域如图2A所示, 根据IQGAP1结构域, 将IQGAP1分成6段, 并 合成从P1到P6的6段含有GST标签的截断体。 0056 利用GSTpulldown实验, 将IQGAP1的6段GST截断体与FBP1蛋白共同孵育。 0057 GSTpulldown实验步骤: PANC-1细胞使用细胞裂解缓冲液(20mMTris-HCl(pH 7.5), 150mMNaCl, 0.1NonidetP40, 1mMDTT(dithiothreitol), 10glycerol, 1mM EDTA, 2.5mMMgCl2及1 g/mlleupeptin)4裂解30分钟。 GST融合蛋白。

23、结合到GST珠子上 (GEHealthcareLifescience)。 细胞裂解产物与GST珠子4共同敷育4h。 珠子用细胞裂解 缓冲液清洗5次, 每次清洗后, 离心, 去除上清。 加入RIPA缓冲液与loadingbuffer(NOREX), DTT的混合液60 L, 100煮5分钟。 然后利用10SDS-polyacrylamide胶电泳后分离蛋白, 然后转入硝化纤维膜, 与1抗4共同敷育过夜。 次日用1TBST清洗后, 与二抗室温敷育1小 时。 蛋白随后用化学发法检测。 0058 WesternBlotting法检测结果(图2B)显示P3段即IQGAP1WW结构域可以与FBP1互 相结。

24、合。 0059 S22、 对FBP1蛋白结构域进行分析(图3A)并设计7段含有GST标签的截断体。 同样利 用GSTpulldown实验, 将FBP1的7段GST截断体与IQGAP1蛋白共同孵育。 0060 WesternBlotting法检测结果(图3B)显示e4段结构域可以与IQGAP1互相结合。 0061 S23、 利用RNA干扰技术敲除FBP1。 使用Lipofectamine2000(Invitrogen公司)转 染进PANC-1细胞, 48小时后收样并提取蛋白, 使用IQGAP抗体做作免疫共沉淀及Western Blotting检测。 0062 免疫共沉淀: 回收细胞, 使用细胞裂。

25、解缓冲液(50mMTris-HCl, pH7.5, 150mM NaCl, 1NonidetP-40, 0 .5sodiumdeoxycholate和1proteaseinhibitor cocktails, Sigma-Aldrich)裂解细胞。 细胞裂解产物离心, 取上清, 与protein-G珠子(Life Technologies)4共同敷育过夜。 次日, 珠子用细胞裂解缓冲液清洗5次, 每次清洗后, 离 心, 去除上清。 加入RIPA缓冲液与LoadingBuffer(NOREX), DTT的混合液60 L, 100煮5分 说明书 4/7 页 6 CN 105734031 A 6 钟。

26、 0063 WesternBlotting: 细胞回收后, 使用RIPA缓冲液1PBS, 1NonidetP-40, 0.1sodiumdodecylsulfateandproteaseinhibitorcocktail(Sigma-Aldrich, St.Lous, MO)裂解细胞。 使用BCAassay(ThermoFisherScientific)检测裂解后得到蛋 白的蛋白浓度。 然后加入LoadingBuffer(NOREX), DTT混合后100煮5分钟。 将上述煮后的 样品, 利用10SDS-polyacrylamide凝胶电泳分离蛋白后, 然后转入硝化纤维膜, 与1抗4 共同敷育。

27、过夜。 次日用1TBST清洗后, 与二抗室温敷育1小时。 蛋白随后用化学发法检测。 0064 WesternBlotting结果显示, 未敲除FBP1时, ERK2与IQGAP1结合较弱(图4A第2泳 道IP, IB: ERK2), 而敲除FBP1后, ERK2与IQGAP1结合增强(图4A第3泳道IP, IB: ERK2); 但敲除 FBP1与否并不影响ERK2上游的C-Raf、 MEK2与IQGAP1的结合(图4A第2、 3泳道IP, IB: C-Raf、 IB: MEK2), 因此可说明FBP1特异性地干扰ERK2与IQGAP1的结合。 进一步的, 本申请比对了不 同物种中e4段蛋白的氨。

28、基酸序列, 发现其序列高度保守(图4B)。 0065 S24、 利用氨基酸的保守序列, 合成含有FBPe4的重组质粒pcDNA3.1/V5-His-TOPO- FBPe4(见实施例2), 利用该重组质粒表达不含这段氨基酸序列的FBP1FBPe4质粒: 0066 FBP1FBPe4(缺失E4段质粒)构建的引物: 0067 上游引物: 5 -GCCATCGGGGAGTTCATTTTGGT-3 ; 0068 下游引物: 5 -CGGTAGCCCCTCAAGTAAAACCAC-3 。 0069 将FBP1FBPe4质粒转入细胞, 使用IQGAP抗体做作免疫共沉淀, 结果显示, FBPe4 蛋白能干扰E。

29、RK2结合, 但是FBP1FBPe4不能干扰结合(图4C), 这进一步验证了本申请提供 的ERK1/2蛋白抑制多肽FBPe4可抑制ERK与IQGAP1的结合。 0070 实施例2含有FBPe4的重组质粒的构建及FBPe4的表达 0071 根据SEQIDNo:2所示的碱基序列, 将这段序列克隆到表达载体pcDNA3.1/V5- His-TOPO(含Fag标签, 可用Flag抗体检测)。 0072 S21、 PCR扩增目标DNA, 电泳回收目标DNA 0073 利用FBP1质粒(序列如SEQIDNo:3所示)为模板扩增得到FBPe4的基因序列(即 SEQIDNo:2), PCR扩增反应体系为: 0。

30、074 说明书 5/7 页 7 CN 105734031 A 7 0075 其中, FBPe4上游引物为: 0076 5-CGGATATCAAGGATGCTCTGCAACCAGGCCGG-3 ; 0077 FBPe4下游引物: 0078 5 -CGCTCGAGGGCAAGGACCAGCATGGTGGCACT-3 。 0079 PCR反应程序为: 0080 0081 完成后将扩增产物进行琼脂糖电泳, 切取100bp左右的目标条带, 利用胶回收试剂 盒回收DNA。 0082 S22、 选择酶切位点EcoRV和Xhol进行对目标条带和表达载体pcDNA3.1/V5-His- TOPO进行双酶切 00。

31、83 酶切体系为: 0084 0085 0086 37水浴过夜。 0087 其中, EcoRV和Xhol的酶切位点为: 0088 EcoRV(GATATC); 0089 Xhol(CTCGAG)。 0090 S23、 连接 说明书 6/7 页 8 CN 105734031 A 8 0091 酶切产物琼脂糖电泳, 利用胶回收试剂盒回收DNA。 0092 连接体系: 0093 0094 0095 16连接过夜。 0096 连接后得到pcDNA3.1/V5-His-TOPO-FBPe4重组质粒。 0097 S24、 Top10感受态细菌转化 0098 -80取出Top10感受态细菌, 置于冰上, 加。

32、入连接产物(10 L)。 冰上放置30分钟, 42孵育90秒, 冰上放置10分钟, 加入LB培养基200 L。 37摇床, 180转/min, 一小时后细菌 涂氨苄西林LB板。 24小时后挑取单克隆, 扩增后质粒回收试剂盒回收质粒。 按S22的酶切体 系, 酶切后琼脂糖电泳鉴定, 选取阳性克隆(电泳可见100bp条带)测序。 0099 S25、 细胞内表达 0100 将已克隆的FBPe4质粒lipo2000转染PANC-1细胞, WesternBlotting鉴定蛋白表 达。 将表达后的蛋白经初步分离、 纯化后制得重组蛋白。 0101 实施例3FBPe4抑制ERK1/2的磷酸化 0102 S3。

33、1、 利用pcDNA3.1/V5-His-TOPO-FBPe4重组质粒构建FBP1G260R质粒。 0103 FBP1G260R(第260位甘氨酸换为精氨酸)构建的引物: 0104 上游引物: 0105 5 -CATCGCACTCTGGTCTACAGAGGGATATTTCTGTAC-3 0106 下游引物: 0107 5 -AACATCAGCCACCATGGAGCCCACATACCGGGCCC-3 0108 FBP1G260R失去了合成糖原的酶活性。 0109 FBP1G260R及FBP1FBPe4突变蛋白的结构如图3A所示。 0110 S32、 将FBP1G260R及FBP1FBPe4质粒转。

34、入PANC-1细胞并表达, 收取细胞裂解液并 用Flag抗体做免疫共沉淀实验(FBP1G260R及FBP1FBPe4质粒表达的重组蛋白均带有Flag 标签)。 0111 实验结果显示, FBP1, FBP1G260R, FBPe4均能抑制ERK1/2的磷酸化, 但FBP1FBPe4 不能抑制, 这说明FBPe4多肽片段具有抑制ERK1/2的磷酸化的作用, 且该作用的实现与FBP1 的合成糖原的酶活性无关。 0112 尽管已用具体实施例来说明和描述了本发明, 然而应意识到, 在不背离本发明的 精神和范围的情况下可以作出许多其它的更改和修改。 因此, 这意味着在所附权利要求中 包括属于本发明范围内的所有这些变化和修改。 说明书 7/7 页 9 CN 105734031 A 9 0001 序列表 1/3 页 10 CN 105734031 A 10 0002 序列表 2/3 页 11 CN 105734031 A 11 0003 序列表 3/3 页 12 CN 105734031 A 12 图1 图2 说明书附图 1/4 页 13 CN 105734031 A 13 图3 说明书附图 2/4 页 14 CN 105734031 A 14 图4 说明书附图 3/4 页 15 CN 105734031 A 15 图5 说明书附图 4/4 页 16 CN 105734031 A 16 。

展开阅读全文
相关资源
猜你喜欢
相关搜索

当前位置:首页 >


copyright@ 2017-2020 zhuanlichaxun.net网站版权所有
经营许可证编号:粤ICP备2021068784号-1