技术领域
本发明涉及生物工程领域,具体而言,涉及一种ERK1/2蛋白 抑制多肽、其制备方法及应用。
背景技术
Ras蛋白是一种小G蛋白,RAS信号途径是一种很常见且重要 的细胞分子信号传导途径。其信号途径为:Ras→Raf(MAPKKK) →MAPKK(MEK)→MAPK(ERK1/2)→进入细胞核→转录因子 →基因表达。RAS通路与炎症,肿瘤等密切相关。因此成为治疗炎 症,肿瘤的作用靶点。
目前针对Ras通路的多个环节开发出了多种抑制剂。但是目前 尚没有特异性针对ERK1/2的抑制剂,因而目前仅能通过抑制其上 游蛋白——如MEK蛋白等——来间接实现抑制ERK1/2活性的目的。 由于细胞信号转导最重要的特征之一是构成复杂的信号网络系统, 具有高度的非线性特点,因而细胞内不同信号通路间普遍存在着信 号对答(cross-talking)的现象,而Ras信号通路作为细胞内部最重 要的信号通路之一,ERK1/2的上游蛋白通常也是其他信号通路的传 导节点,所以对其上游蛋白进行抑制会对细胞内部的活动造成广泛 的影响,进而无法特异性地针对ERK1/2蛋白进行研究,这大大地 限制了ERK1/2蛋白的相关研究。
有鉴于此,特提出本发明。
发明内容
本发明的目的在于提供一种ERK1/2蛋白抑制多肽,所述多肽 可特异性地抑制ERK1/2的磷酸化,从而发挥ERK1/2抑制剂的功 能。
为了实现本发明的上述目的,特采用以下技术方案:
一种ERK1/2蛋白抑制多肽,所述多肽的氨基酸序列如SEQID NO:1所示。
果糖-1,6-二磷酸酶(Fructose-1,6-bisphosphatase1,FBP1) 是糖异生中的关键限速酶之一,在糖代谢中起重要作用。哺乳动物 存在肝脏型和肌肉型两种果糖-1,6-二磷酸酶同工酶,分别由Fbp1 和Fbp2基因编码。
本申请中记载的ERK1/2蛋白抑制多肽为FBP1中的一部分序 列,该段序列在不同物种间高度保守,由27个氨基酸构成。
IQGAP1(IQmotifcontainingGTPaseactivatingproteins)是近 年来新发现的一个蛋白家族,其序列中含有类似于RasGAPs催化域 的广泛序列和位于N端的4个可与钙调蛋白相互作用的IQ模体, 在哺乳动物中有三个同源物IQGAP1~3。不同于IQGAP2和IQGAP3 限制性地表达于肝和肠道等器官,IQGAP1呈现出一种全身性地表 达。有研究表明,IQGAP1可通过其WW结构域调节ERK的磷酸 化(如图1所示)。发明人在实验中偶然发现FBP1能与ERK一样 结合IQGAP1的WW结构域,在进一步的研究中,发明人将FBP1 分成七段,发现只有第四段能与IQGAP1进而抑制ERK的磷酸化, 为了描述方便,发明人将这第四段多肽命名为FBPe4,其即为本申 请所述的ERK1/2蛋白抑制多肽。由于FBPe4具有上述特性,因而 可作为ERK1/2蛋白的竞争性抑制剂来使用。
FBPe4可以特异性抑制ERK1/2的活性,可更精确地用于 ERK1/2功能的相关研究与应用。并且它来源于生物体内固有的蛋白 质,相比人工合成的化合物抑制剂更加安全。
优选的,如上所述的ERK1/2蛋白抑制多肽,所述多肽的氨基 酸序列为SEQIDNo:1所示的氨基酸序列经添加一个或几个氨基酸, 得到的编码相同活性蛋白质的氨基酸序列。
进一步优选的,所述多肽为FBP1蛋白的氨基酸序列。
本领域技术人员应可根据本发明公开ERK1/2蛋白抑制多肽序 列对其进行改造,将SEQIDNo:1所示的氨基酸序列经取代、缺失 和/或添加一个或几个氨基酸,得到的编码相同活性蛋白质的氨基酸 序列,如天然蛋白FBP1即为实例之一,通过过表达FBP1也可抑 制ERK1/2蛋白活性。
编码如上所述的ERK1/2蛋白抑制多肽的基因,所述基因的核 苷酸序列如SEQIDNO:2所示。
编码如上所述的ERK1/2蛋白抑制多肽的基因,所述基因的核 苷酸序列为SEQIDNo:2所示的核苷酸序列经取代、缺失和/或添加 一个或几个核苷酸,编码相同活性蛋白质的核苷酸序列,得到的编 码相同活性蛋白质的核苷酸序列。
应当理解,本领域人员可根据本发明公开的ERK1/2蛋白抑制 多肽的基因的核苷酸序列(SEQIDNO:2),在保证其活性的前提下, 取代、缺失和/或添加一个或几个核苷酸,得到该基因的突变序列。
例如简并密码子直接的互相替换:
aaagatgctctgcaaccaggccggaacctggtggcagccggctacgcact gtatggcagtgccaccatgctggtccttgcc也能编码出SEQIDNo:1所示蛋白。
SEQIDNO:2所示的核苷酸序列是由81个核苷酸组成的基因。
此外,可将FBP1全长序列中缺失SEQIDNO:2所示的核苷酸 序列得到缺失突变体,所述缺失突变体可用于FBP1的功能研究或 者基于FBP1功能的相关疾病的研究,特别是在FBP1与IQGAP1 相互作用研究中的应用。
含有如上所述基因的重组质粒。
进一步优选的,所述重组质粒为将SEQIDNo:2所示的核苷酸 序列插入到pcDNA3.1/V5-His-TOPO中得到。
含有如上所述重组质粒的宿主细胞。
进一步优选的,所述宿主细胞为大肠杆菌、PANC-1或MIA PaCa-2中的一种。
根据如上所述的重组质粒在PANC-1细胞中表达制备ERK1/2 蛋白抑制多肽的方法,包括以下步骤:
将核苷酸序列为SEQIDNo:2的基因片段定向克隆到 pcDNA3.1/V5-His-TOPO表达载体中,将得到的重组表达质粒转染 PANC-1细胞并培养,表达重组蛋白;将表达后的蛋白经初步分离、 纯化后制得重组蛋白。
与现有技术相比,本发明的有益效果为:
1)、本申请首次提供了一种ERK1/2蛋白特异性的竞争性抑制 剂。
2)、ERK1/2蛋白抑制多肽仅有21个氨基酸,无论是人工合成 该多肽还是运用宿主细胞表达制备均非常方便易行,利于大规模推 广利用。
3)、ERK1/2蛋白抑制多肽来源于生物体内固有的蛋白质,用 于动物实验不会造成免疫排除,通常大多数抑制剂均为人工合成的 化合物,相比之下本申请提供的蛋白多肽对细胞毒性更小,也更为 特异。
4)、由于为生物体内固有的蛋白质,还可通过慢病毒等手段将 编码该多肽的基因片段转染至细胞内进行稳定表达,操作方便,更 利于在体研究;更一步的,也可将包含该基因片段的病毒注射入实 验动物体内,并结合动物行为学等实验手段,在整体水平上对 ERK1/2及其所在信号通路进行更深入的研究,具有广阔的应用前景。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,以 下将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。
图1为FBPe4抑制ERK1/2的原理示意图:正常情况下, IQGAP1可通过其WW结构域协助MEK进行ERK1/2的磷酸化(图 左部分);在FBPe4存在时,会竞争性地与WW结构域结合进而抑 制ERK1/2的磷酸化;
图2~4为本申请实施例1中FBPe4与IQGAP1的相互作用验证 及初步功能验证;
图2为寻找IQGAP1与FBP1相结合的蛋白区段的GST试验 pulldown实验;A为IQGAP1结构域及IQGAP1的6段含有GST 标签的截断体的示意图;B为GSTpulldown实验验证IQGAP1WW 结构域可以与FBP1互相结合(IP:GST,IB:FBP1);
图3为寻找FBP1与IQGAP1相结合的蛋白区段的GST试验 pulldown实验;A为FBP1结构域及FBP1的7段含有GST标签的 截断体的示意图;B为GSTpulldown实验验证FBP1的e4结构域 可以与IQGAP1互相结合(IP:GST,IB:IQGAP1);
图4为FBPe4的初步功能验证;A为RNA干扰实验验证FBP1 特异性地干扰ERK2与IQGAP1的结合(shNT:乱序小干扰RNA, IP:IQGAP1);B为FBP1e4段蛋白在不同物种中的氨基酸序列;C 为免疫共沉淀实验验证FBPe4可特异性地干扰ERK2与IQGAP1的 互相结合;
图5为本申请实施例3中FBPe4的功能验证;A为FBP1G260R 及FBP1ΔFBPe4突变蛋白的结构示意图;B为免疫共沉淀实验验证 FBPe4特异性地抑制ERK1/2的磷酸化(IP:Flag)。
具体实施方式
下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述,但是本 领域技术人员将会理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视 为限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件 或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均 为可以通过市售购买获得的常规产品。
实施例1含有FBPe4与IQGAP1的相互作用验证及初步功能 验证
S11、主要实验材料:
1)、细胞
本试验选择胰腺癌细胞系PANC-1。胰腺癌细胞系为K-ras突变 型细胞系,能在正常情况下检测到pERK1/2,因此能观察到经过 FBPe4处理后,pERK1/2的变化情况,便于观察实验效果。
PANC-1购自ATCC(AmericanTypeCultureCollection, Manassay,VA,USA)公司。PANC-1细胞使用DMEM培养基 (CORNING,Manassa,VA,USA),含10%胎牛血清(Life Technologies)、100units/ml青霉素和100μg/ml链霉素(Life Technologies)。细胞培养箱中培养,培养条件为5%CO2,37℃,95% 湿度。
2)、质粒
Flag-FBP1,FBPe4和FBPΔE4装入pcDNA3.1/V5-His-TOPO (Invitrogen,460083)载体,该载体含有Flag标签。GST-FBP1, IQGAP1突变体装入pGEX-4T-1载体。
3)、抗体
FBP1(Abcam,ab109732,稀释浓度1:1000);
ERK2(SantaCruzBiotechnology,SC-1647,稀释浓度1:5000);
FLAGM2(Sigma-Aldrich,F-3165,稀释浓度1:3000);
IQGAP1(SantaCruzBiotechnology,H-109,稀释浓度1:5000)。
4)、shRNA序列购自Sigma-Aldrich(St.Lois,MO)公司:
5′-CCGGCCTTGATGGATCTTCCAACATCTCGAGATGTTGG AAGATCCATCAAGGTTTTTG-3′(shFBP1)
S21、IQGAP1蛋白的结构域如图2A所示,根据IQGAP1结构 域,将IQGAP1分成6段,并合成从P1到P6的6段含有GST标 签的截断体。
利用GSTpulldown实验,将IQGAP1的6段GST截断体与 FBP1蛋白共同孵育。
GSTpulldown实验步骤:PANC-1细胞使用细胞裂解缓冲液 (20mMTris-HCl(pH7.5),150mMNaCl,0.1%NonidetP40,1mM DTT(dithiothreitol),10%glycerol,1mMEDTA,2.5mMMgCl2及1μg/mlleupeptin)4℃裂解30分钟。GST融合蛋白结合到GST珠 子上(GEHealthcareLifescience)。细胞裂解产物与GST珠子4℃共 同敷育4h。珠子用细胞裂解缓冲液清洗5次,每次清洗后,离心, 去除上清。加入RIPA缓冲液与loadingbuffer(NOREX),DTT的 混合液60μL,100℃煮5分钟。然后利用10%SDS-polyacrylamide 胶电泳后分离蛋白,然后转入硝化纤维膜,与1抗4℃共同敷育过夜。 次日用1×TBST清洗后,与二抗室温敷育1小时。蛋白随后用化学 发法检测。
WesternBlotting法检测结果(图2B)显示P3段即IQGAP1WW 结构域可以与FBP1互相结合。
S22、对FBP1蛋白结构域进行分析(图3A)并设计7段含有 GST标签的截断体。同样利用GSTpulldown实验,将FBP1的7 段GST截断体与IQGAP1蛋白共同孵育。
WesternBlotting法检测结果(图3B)显示e4段结构域可以与 IQGAP1互相结合。
S23、利用RNA干扰技术敲除FBP1。使用Lipofectamine2000 (Invitrogen公司)转染进PANC-1细胞,48小时后收样并提取蛋 白,使用IQGAP抗体做作免疫共沉淀及WesternBlotting检测。
免疫共沉淀:回收细胞,使用细胞裂解缓冲液(50mMTris-HCl, pH7.5,150mMNaCl,1%NonidetP-40,0.5%sodiumdeoxycholate 和1%proteaseinhibitorcocktails,Sigma-Aldrich)裂解细胞。细胞 裂解产物离心,取上清,与protein-G珠子(LifeTechnologies)4℃ 共同敷育过夜。次日,珠子用细胞裂解缓冲液清洗5次,每次清洗 后,离心,去除上清。加入RIPA缓冲液与LoadingBuffer(NOREX), DTT的混合液60μL,100℃煮5分钟
WesternBlotting:细胞回收后,使用RIPA缓冲液[1×PBS, 1%NonidetP-40,0.1%sodiumdodecylsulfateandproteaseinhibitor cocktail(Sigma-Aldrich,St.Lous,MO)]裂解细胞。使用BCAassay (ThermoFisherScientific)检测裂解后得到蛋白的蛋白浓度。然后 加入LoadingBuffer(NOREX),DTT混合后100℃煮5分钟。将上 述煮后的样品,利用10%SDS-polyacrylamide凝胶电泳分离蛋白后, 然后转入硝化纤维膜,与1抗4℃共同敷育过夜。次日用1×TBST 清洗后,与二抗室温敷育1小时。蛋白随后用化学发法检测。
WesternBlotting结果显示,未敲除FBP1时,ERK2与IQGAP1 结合较弱(图4A第2泳道IP,IB:ERK2),而敲除FBP1后,ERK2 与IQGAP1结合增强(图4A第3泳道IP,IB:ERK2);但敲除FBP1 与否并不影响ERK2上游的C-Raf、MEK2与IQGAP1的结合(图 4A第2、3泳道IP,IB:C-Raf、IB:MEK2),因此可说明FBP1 特异性地干扰ERK2与IQGAP1的结合。进一步的,本申请比对了 不同物种中e4段蛋白的氨基酸序列,发现其序列高度保守(图4B)。
S24、利用氨基酸的保守序列,合成含有FBPe4的重组质粒 pcDNA3.1/V5-His-TOPO-FBPe4(见实施例2),利用该重组质粒表 达不含这段氨基酸序列的FBP1ΔFBPe4质粒:
FBP1ΔFBPe4(缺失E4段质粒)构建的引物:
上游引物:5’-GCCATCGGGGAGTTCATTTTGGT-3’;
下游引物:5’-CGGTAGCCCCTCAAGTAAAACCAC-3’。
将FBP1ΔFBPe4质粒转入细胞,使用IQGAP抗体做作免疫共 沉淀,结果显示,FBPe4蛋白能干扰ERK2结合,但是FBP1ΔFBPe4 不能干扰结合(图4C),这进一步验证了本申请提供的ERK1/2蛋 白抑制多肽FBPe4可抑制ERK与IQGAP1的结合。
实施例2含有FBPe4的重组质粒的构建及FBPe4的表达
根据SEQIDNo:2所示的碱基序列,将这段序列克隆到表达载 体pcDNA3.1/V5-His-TOPO(含Fag标签,可用Flag抗体检测)。
S21、PCR扩增目标DNA,电泳回收目标DNA
利用FBP1质粒(序列如SEQIDNo:3所示)为模板扩增得到 FBPe4的基因序列(即SEQIDNo:2),PCR扩增反应体系为:
其中,FBPe4上游引物为:
5-CGGATATCAAGGATGCTCTGCAACCAGGCCGG-3’;
FBPe4下游引物:
5’-CGCTCGAGGGCAAGGACCAGCATGGTGGCACT-3’。
PCR反应程序为:
完成后将扩增产物进行琼脂糖电泳,切取100bp左右的目标条 带,利用胶回收试剂盒回收DNA。
S22、选择酶切位点EcoRV和Xhol进行对目标条带和表达载 体pcDNA3.1/V5-His-TOPO进行双酶切
酶切体系为:
37℃水浴过夜。
其中,EcoRV和Xhol的酶切位点为:
EcoRV(GATATC);
Xhol(CTCGAG)。
S23、连接
酶切产物琼脂糖电泳,利用胶回收试剂盒回收DNA。
连接体系:
16℃连接过夜。
连接后得到pcDNA3.1/V5-His-TOPO-FBPe4重组质粒。
S24、Top10感受态细菌转化
-80℃取出Top10感受态细菌,置于冰上,加入连接产物(10μL)。 冰上放置30分钟,42℃孵育90秒,冰上放置10分钟,加入LB培 养基200μL。37℃摇床,180转/min,一小时后细菌涂氨苄西林LB 板。24小时后挑取单克隆,扩增后质粒回收试剂盒回收质粒。按S22 的酶切体系,酶切后琼脂糖电泳鉴定,选取阳性克隆(电泳可见 100bp条带)测序。
S25、细胞内表达
将已克隆的FBPe4质粒lipo2000转染PANC-1细胞,Western Blotting鉴定蛋白表达。将表达后的蛋白经初步分离、纯化后制得 重组蛋白。
实施例3FBPe4抑制ERK1/2的磷酸化
S31、利用pcDNA3.1/V5-His-TOPO-FBPe4重组质粒构建 FBP1G260R质粒。
FBP1G260R(第260位甘氨酸换为精氨酸)构建的引物:
上游引物:
5’-CATCGCACTCTGGTCTACAGAGGGATATTTCTGTAC-3’
下游引物:
5’-AACATCAGCCACCATGGAGCCCACATACCGGGCCC-3’
FBP1G260R失去了合成糖原的酶活性。
FBP1G260R及FBP1ΔFBPe4突变蛋白的结构如图3A所示。
S32、将FBP1G260R及FBP1ΔFBPe4质粒转入PANC-1细胞并 表达,收取细胞裂解液并用Flag抗体做免疫共沉淀实验 (FBP1G260R及FBP1ΔFBPe4质粒表达的重组蛋白均带有Flag标 签)。
实验结果显示,FBP1,FBP1G260R,FBPe4均能抑制ERK1/2 的磷酸化,但FBP1ΔFBPe4不能抑制,这说明FBPe4多肽片段具有 抑制ERK1/2的磷酸化的作用,且该作用的实现与FBP1的合成糖 原的酶活性无关。
尽管已用具体实施例来说明和描述了本发明,然而应意识到, 在不背离本发明的精神和范围的情况下可以作出许多其它的更改和 修改。因此,这意味着在所附权利要求中包括属于本发明范围内的 所有这些变化和修改。