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1、10申请公布号CN104212817A43申请公布日20141217CN104212817A21申请号201410241067422申请日20140530201310215498920130531CNC12N15/29200601C07K14/415200601C12N15/82200601A01H5/0020060171申请人中国农业科学院生物技术研究所地址100081北京市海淀区中关村南大街12号72发明人陈茹梅陈景堂李素贞周晓今范云六74专利代理机构北京康思博达知识产权代理事务所普通合伙11426代理人余光军54发明名称玉米锌铁调控转运体ZMZIP5基因及其应用57摘要本发明公开了玉米锌。
2、铁调控转运体ZMZIP5基因及其应用。本发明从玉米中分离得到锌铁调控转运体ZMZIP5基因,其CDNA序列为SEQIDNO1所示。亚细胞定位表明,该锌铁调控转运体定位在细胞质膜及内质网上,在植物细胞中起到吸收、转运和储存锌铁以及参与锌铁离子的解毒等作用。定时定量RTPCR表达分析发现,ZMZIP5对于胚和胚乳的发育起到重要的调控作用。酵母互补实验表明,ZMZIP5具有转运锌铁的功能。本发明所分离的ZMZIP5基因对于调控植物吸收、转运和储存锌铁的能力,调控胚和胚乳的发育以及增加粮食作物籽粒中锌铁含量等方面具有重要的应用潜力。66本国优先权数据51INTCL权利要求书1页说明书12页序列表3页附。
3、图7页19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书1页说明书12页序列表3页附图7页10申请公布号CN104212817ACN104212817A1/1页21从玉米ZEAMAYS中分离的锌铁调控转运体ZMZIP5基因,其特征在于,其CDNA序列选自A、B或CA、SEQIDNO1所示的核苷酸序列;B、编码SEQIDNO2所示氨基酸的核苷酸序列;C、与SEQIDNO1的互补序列在严谨杂交条件能够进行杂交的核苷酸,该核苷酸所编码的蛋白质具有锌铁调控转运体的功能。2权利要求1所述的锌铁调控转运体ZMZIP5基因所编码的蛋白质。3按照权利要求2所述的蛋白质,其特征在于,所述蛋白质的氨基酸序。
4、列为A或B所示A、SEQIDNO2所示的氨基酸序列;B、将SEQIDNO2所示的氨基酸序列通过一个或多个氨基酸残基的替换、缺失或/和插入而衍生得到的仍具有锌铁调控转运体功能的蛋白变体。4含有权利要求1所述锌铁调控转运体ZMZIP5基因的重组表达载体;优选的,所述的重组表达载体是重组植物表达载体。5权利要求1所述锌铁调控转运体ZMZIP5基因在调控或改善植物吸收、转运或储存锌或铁能力中的应用。6权利要求1所述锌铁调控转运体ZMZIP5基因在调控或促进植物种子胚发育中的应用。7权利要求1所述锌铁调控转运体ZMZIP5基因在增加粮食作物种子锌或铁含量中的应用。8权利要求1所述锌铁调控转运体ZMZIP。
5、5基因在解除过量的锌或铁对植物毒害中的应用。9按照权利要求58任何一项所述的应用,其特征在于,包括将权利要求1所述锌铁调控转运体ZMZIP5基因可操作的与表达调控元件相连接,得到重组植物表达载体;将重组植物表达载体转化受体植物或植物细胞,培育得到转基因植物。10按照权利要求9所述的应用,其特征在于所述的受体植物是粮食作物;优选为玉米、水稻、小麦或高粱。权利要求书CN104212817A1/12页3玉米锌铁调控转运体ZMZIP5基因及其应用技术领域0001本发明涉及从植物中分离的金属离子转运体基因,尤其涉及从玉米中分离的与锌铁的吸收、转运或储存有关的调控转运体基因,本发明进一步涉及该调控转运体Z。
6、MZIP5基因在调控植物吸收、转运或储存锌或铁能力,解除过量的锌或铁对植物毒害以及增加粮食作物种子锌或铁含量中的应用,属于植物金属离子调控转运体基因的分离和应用领域。背景技术0002锌和铁是生物体所必需的微量元素,在植物的生长发育过程中有着重要作用WINTZH,FOXT,WUYY,ETALEXPRESSIONPROFILESOFARABIDOPSISTHALIANAINMINERALDECIENCIESREVEALNOVELTRANSPORTERSINVOLVEDINMETALHOMEOSTASISTHEJOURNALOFBIOLOGICALCHEMISTRY2003,278484764447。
7、653。锌是生物体300多种酶和重要蛋白质的结构辅助因子HAYDONMJ,COBBETTCSANOVELMAJORFACILITATORSUPERFAMILYPROTEINATTHETONOPLASTINFLUENCESZINCTOLERANCEANDACCUMULATIONINARABIDOPSISPLANTPHYSIOLOGY2007,143417051719。锌不仅参与机体的各种代谢,在生物膜稳定和基因表达调控等生理机能中也担负着重要的角色MATHEWSWR,WANGF,EIDEDJ,ETALDROSOPHILAFEAROFINTIMACYENCODESAZRT/IRTLIKEPROTE。
8、INZIPFAMILYZINCTRANSPORTERFUNCTIONALLYRELATEDTOMAMMALIANZIPPROTEINSTHEJOURNALOFBIOLOGICALCHEMISTRY2005,2801787795。锌的缺乏会导致叶绿素、脂质、蛋白和质膜的氧化破坏,适量增加植物体内锌的含量可提高作物产量,但是植物体内锌离子的过度积累又会对植物产生毒害。0003铁在细胞呼吸、光合作用和金属蛋白的催化反应过程中发挥重要作用,是重要的电子传递体,因此,铁元素在原核和真核生物的生命活动中具有不可替代的功能。另外,细胞内过高的FE3/FE2氧化还原势会导致超氧化合物的产生,对细胞造成伤害BR。
9、IATJF,LEBRUNMPLANTRESPONSESTOMETALTOXICITYCOMPTESRENDUSDELACADEMIEDESSCIENCESSERIEIII,SCIENCESDELAVIE1999,32214354。因此,严格控制植物体内金属离子的平衡是至关重要的。0004参与锌铁吸收的蛋白主要有三类,都是以蛋白家族形式存在的,包括ZIP,即锌调控转运体ZINCREGULATEDTRANSPORTER,ZRT和铁调控转运体IRONREGULATEDTRANSPORTER,IRT。酵母功能互补实验显示ZIP家族基因能够转运包括ZN2、FE2、CU2、CD2在内的多种金属离子COLA。
10、NGELOEP,GUERINOTMLPUTTHEMETALTOTHEPETALMETALUPTAKEANDTRANSPORTTHROUGHOUTPLANTSCURRENTOPINIONINPLANTBIOLOGY2006,93322330。ZIP一般由309476个氨基酸残基组成,有8个潜在的跨膜结构域和相似的拓扑结构,第3和第4跨膜区之间有一长的可变区,可变区位于胞内,其C、N末端位于胞外,该区富含组氨酸残基,可能与金属的结合、转运有关GUERINOTMLTHEZIPFAMILYOFMETALTRANSPORTERSBIOCHIMBIOPHYSACTA2000,146512190198。00。
11、05目前在拟南芥、水稻、蒺藜、苜蓿、大豆、野生型二粒小麦、葡萄等植物中鉴定出说明书CN104212817A2/12页4ZIP基因并对其功能进行了研究。在拟南芥中发现16个ZIP家族基因,ATIRT1是通过酵母互补实验分离得到的第一个ZIP功能基因,其主要在根部表达,且该基因的过表达可导致镍的过度积累EIDED,BRODERIUSM,FETTJ,ETALANOVELIRONREGULATEDMETALTRANSPORTERFROMPLANTSIDENTIEDBYFUNCTIONALEXPRESSIONINYEASTPROCEEDINGSOFTHENATIONALACADEMYOFSCIENCES。
12、OFTHEUNITEDSTATESOFAMERICA1996,931156245628;HENRIQUESR,JASIKJ,KLEINM,ETALKNOCKOUTOFARABIDOPSISMETALTRANSPORTERGENEIRT1RESULTSINIRONDECIENCYACCOMPANIEDBYCELLDIFFERENTIATIONDEFECTSPLANTMOLECULARBIOLOGY2002,5045587597;VAROTTOC,MAIWALDD,PESARESIP,ETALTHEMETALIONTRANSPORTERIRT1ISNECESSARYFORIRONHOMEOSTAS。
13、ISANDEFCIENTPHOTOSYNTHESISINARABIDOPSISTHALIANATHEPLANTJOURNALFORCELLANDMOLECULARBIOLOGY2002,315589599;VERTG,GROTZN,DEDALDECHAMPF,ETALIRT1,ANARABIDOPSISTRANSPORTERESSENTIALFORIRONUPTAKEFROMTHESOILANDFORPLANTGROWTHPLANTCELL2002,14612231233;NISHIDAS,TSUZUKIC,KATOA,ETALATIRT1,THEPRIMARYIRONUPTAKETRANSP。
14、ORTERINTHEROOT,MEDIATESEXCESSNICKELACCUMULATIONINARABIDOPSISTHALIANAPLANTCELLPHYSIOLOGY2011,52814331442。ATIRT2主要在根部表达,定位在囊泡,推测具有细胞内过量金属元素的解毒功能VERTG,BRIATJF,CURIECARABIDOPSISIRT2GENEENCODESAROOTPERIPHERYIRONTRANSPORTERTHEPLANTJOURNALFORCELLANDMOLECULARBIOLOGY2001,262181189;VERTG,BARBERONM,ZELAZNYE,ET。
15、ALARABIDOPSISIRT2COOPERATESWITHTHEHIGHAFFINITYIRONUPTAKESYSTEMTOMAINTAINIRONHOMEOSTASISINROOTEPIDERMALCELLSPLANTA2009,22961171117914,15。ATIRT3能互补锌、铁转运双突变体,过表达ATIRT3会使锌在地上部、铁在地下部积累LINYF,LIANGHM,YANGSY,ETALARABIDOPSISIRT3ISAZINCREGULATEDANDPLASMAMEMBRANELOCALIZEDZINC/IRONTRANSPORTERTHENEWPHYTOLOGIST20。
16、09,1822392404。表达分析显示,ATZIP1、ATZIP5、ATZIP9、ATZIP12和ATIRT3受缺锌诱导,由此推测,这些基因在缺锌条件下可能增强锌的吸收能力KRAMERU,TALKEIN,HANIKENNEMTRANSITIONMETALTRANSPORTFEBSLETT2007,5811222632272。0006玉米ZEAMAYS是中国重要的粮食、饲料和经济作物,增加玉米籽粒中锌、铁等微量元素的含量,对提高饮食或饲料利用效率、促进经济的发展及人体健康尤为重要。目前,已知许多转运蛋白参与了植物体内锌铁离子平衡网络系统,其中ZIPZINCREGULATEDTRANSPORTE。
17、RS,IRONREGULATEDTRANSPORTERLIKEPROTEINS,ZIP基因家族对锌、铁等二价金属离子的吸收、运输和储存起着重要作用,在拟南芥、水稻、大麦、大豆上,已报道了一些有关ZIP家族基因的研究,但对ZIP家族基因在植物体内具体的作用机制尚未完全了解,而关于玉米的ZIP家族基因的研究报道较少。了解ZN2、FE2在玉米中的吸收、运输方式,分布规律和调节机制,将有助于改善玉米在锌、铁缺乏的环境中的生长发育,为进一步揭示玉米中ZIP家族基因的作用机理奠定基础,为玉米锌、铁高效转基因育种提供候选基因,也为人类锌铁营养提供良好的基础。发明内容说明书CN104212817A3/12页5。
18、0007本发明的目的之一是提供从玉米ZEAMAYS中分离的锌铁调控转运体基因;0008本发明的目的之二是提供锌铁调控转运体基因所编码的蛋白质;0009本发明的目的之三是将所述的锌铁调控转运体基因应用于调控植物对锌铁等金属离子的吸收、转运或储存、解除过量的锌铁对植物的毒害或者增加粮食作物籽粒中锌铁含量。0010本发明的上述目的是通过以下技术方案来实现的0011从玉米ZEAMAYS中分离的锌铁调控转运体基因,其CDNA序列为A、B或C所示0012A、SEQIDNO1所示的核苷酸;0013B、编码SEQIDNO2所示氨基酸的核苷酸;0014C、与SEQIDNO1的互补序列在严谨杂交条件能够进行杂交的。
19、核苷酸,该核苷酸所编码的蛋白质具有锌铁调控转运体的功能。0015所述“严谨杂交条件”意指在所属领域中已知的低离子强度和高温的条件。通常,在严谨条件下,探针与其靶序列杂交的可检测程度比与其它序列杂交的可检测程度更高例如超过本底至少2倍。严谨杂交条件是序列依赖性的,在不同的环境条件下将会不同,较长的序列在较高温度下特异性杂交。通过控制杂交的严谨性或洗涤条件可鉴定与探针100互补的靶序列。对于核酸杂交的详尽指导可参考有关文献TIJSSEN,TECHNIQUESINBIOCHEMISTRYANDMOLECULARBIOLOGYHYBRIDIZATIONWITHNUCLEICPROBES,“OVERVI。
20、EWOFPRINCIPLESOFHYBRIDIZATIONANDTHESTRATEGYOFNUCLEICACIDASSAYS1993。更具体的,所述严谨条件通常被选择为低于特异序列在规定离子强度PH下的热熔点TM约510。TM为在平衡状态下50与目标互补的探针杂交到目标序列时所处的温度在指定离子强度、PH和核酸浓度下因为目标序列过量存在,所以在TM下在平衡状态下50的探针被占据。严谨条件可为以下条件其中在PH70到83下盐浓度低于约10M钠离子浓度,通常为约001到10M钠离子浓度或其它盐,并且温度对于短探针包括但不限于10到50个核苷酸而言为至少约30,而对于长探针包括但不限于大于50个核苷。
21、酸而言为至少约60。严谨条件也可通过加入诸如甲酰胺的去稳定剂来实现。对于选择性或特异性杂交而言,正信号可为至少两倍的背景杂交,视情况为10倍背景杂交。例示性严谨杂交条件可如下50甲酰胺,5SSC和1SDS,在42下培养;或5SSC,1SDS,在65下培养,在02SSC中洗涤和在65下于01SDS中洗涤。所述洗涤可进行5、15、30、60、120分钟或更长时间。0016优选的,本发明从玉米中所分离的锌铁调控转运体基因是ZMZIP5基因,其CDNA序列为SEQIDNO1所示。0017本发明目的之二是提供由上述锌铁调控转运体基因所编码的能够吸收、转运或储存锌铁的蛋白质,该蛋白质的氨基酸序列为A或B所。
22、示0018A、SEQIDNO2所示的氨基酸;0019B、将SEQIDNO2所示的氨基酸通过一个或多个氨基酸残基的替换、缺失或/和插入而衍生得到的仍具有锌铁调控转运体功能的蛋白变体;0020特别优选的,本发明所述的锌铁调控转运体的氨基酸序列为SEQIDNO2所示。0021所述的“多个”通常意味着28个,优选为24个,这取决于锌铁调控转运体三维说明书CN104212817A4/12页6结构中氨基酸残基的位置或氨基酸的种类;所述的“替换”是指分别用不同的氨基酸残基取代一个或多个氨基酸残基;所述的“缺失”是指氨基酸残基数量的减少,也即是分别缺少其中的一个或多个氨基酸残基;所述的“插入”是指氨基酸残基序。
23、列的改变,相对天然分子而言,所述改变导致添加一个或多个氨基酸残基。0022本发明所述的蛋白变体可由遗传多态性或人为操作产生,这些操作方法通常为本领域所了解。例如,可通过DNA的突变来制备锌铁调控转运体的氨基酸序列变体或片段,其中由于诱变或改变多核苷酸的方法为本领域所习知。其中,保守的取代是将一种氨基酸残基替换成具有相似性质的另一种氨基酸。因此,本发明所述的锌铁调控转运体及其编码基因包括天然存在的序列和变体两种形式。“变体”意指基本相似的序列,对于多核苷酸,变体包含天然多核苷酸中一个或多个位点处一个或多个核苷酸的缺失、插入或/和替换。对于多核苷酸,保守的变体包括由于遗传密码的简并性而不改变编码的。
24、氨基酸序列的那些变体。诸如此类天然存在的变体可通过现有的分子生物学技术来鉴定。变体多核苷酸还包括合成来源的多核苷酸,例如采用定点诱变所得到的仍编码SEQIDNO2所示的氨基酸的多核苷酸变体,或者是通过重组的方法例如DNA重排等。本领域技术人员可通过以下分子生物技术手段来筛选或评价变体多核苷酸所编码蛋白的功能或活性DNA结合活性,蛋白之间的相互作用,瞬时研究中基因表达的激活情况或转基因植物中表达的效应等。0023本发明从玉米中分离、克隆了锌铁调控转运体ZMZIP5基因,亚细胞定位的实验结果表明,该锌铁调控转运体定位在质膜与内质网,因此推测其与锌铁离子的解毒与储存有关,在植物细胞中起到吸收、转运和。
25、储存锌铁以及参与锌铁离子的解毒等功能。在亚细胞定位的基础上,本发明进一步对授粉后不同天数的玉米胚和胚乳进行了表达分析,结果发现,正常营养条件下,ZMZIP5在地上部的表达量比地下部高,缺锌诱导96H时,ZMZIP5在地上部表达上调,在高锌条件下,ZMZIP5在地上部的表达量随着时间的延长呈现逐渐降低的趋势,然而,在高铁条件下ZMZIP5在地上部与地下部的表达量是逐渐升高的。这些结果表明,ZMZIP5在幼苗时期对锌和铁的浓度比较敏感。在授粉后不同天数的胚和胚乳中的表达分析发现,ZMZIP5在授粉后17天的胚和胚乳中是表达上调的,在授粉后19天的胚乳中的表达量达到最高,ZMZIP5可能在胚和胚乳的。
26、发育过程中起到作用。0024酵母互补实验表明,本发明所分离的ZMZIP5基因与水稻和拟南芥中的ZIP基因相似,具有转运锌铁的功能。0025目前,已知许多转运蛋白参与了植物体内锌铁离子平衡网络系统,一些蛋白也被应用到植物的转基因研究中,比如在大麦中过表达ATZIP1基因能够增加锌和铁在种子中的含量RAMESHSA,CHOIMESS,SCHACHTMANDPOVEREXPRESSIONOFANARABIDOPSISZINCTRANSPORTERINHORDEUMVULGAREINCREASESSHORTTERMZINCUPTAKEAFTERZINCDEPRIVATIONANDSEEDZINCCON。
27、TENTPLANTMOLECULARBIOLOGY2004,543373385,同样,过表达OSIRT1基因,水稻中锌和铁的含量在地上部、地下部和种子中都有所提高LEES,ANGOVEREXPRESSIONOFOSIRT1LEADSTOINCREASEDIRONANDZINCACCUMULATIONSINRICEPLANT,CELLENVIRONMENT2009,324408416。然而,在水稻中过表达OSZIP4、OSZIP5、OSZIP8,OSZIP9结果导致过量的锌聚集于根部,降低了植株地上部分的锌含量LEES,KIMSA,LEEJ,ETALZINCDECIENCYINDUCIBLEOS。
28、ZIP8ENCODESAPLASMAMEMBRANELOCALIZEDZINCTRANSPORTERINRICEMOLECULESAND说明书CN104212817A5/12页7CELLS2010,296551558;LEES,JEONGHJ,KIMSA,ETALOSZIP5ISAPLASMAMEMBRANEZINCTRANSPORTERINRICEPLANTMOLECULARBIOLOGY2010,7345507517;ISHIMARUY,MASUDAH,SUZUKIM,ETALOVEREXPRESSIONOFTHEOSZIP4ZINCTRANSPORTERCONFERSDISARRANGE。
29、MENTOFZINCDISTRIBUTIONINRICEPLANTSJOURNALOFEXPERIMENTALBOTANY2007,581129092915没有达到在籽粒中增加锌含量的目的,因此,这些基因的过表达对水稻籽粒中锌的富集是不利的。这些结果表明,异位过表达对于锌铁的积累与分布可能会起到一定的作用。然而,有关锌铁转运蛋白在籽粒中的研究还很少。0026本发明通过ZMZIP5基因在胚和胚乳中的表达模式了解到ZMZIP5可以在胚或胚乳中表达,所以,将本发明的ZMZIP5基因在粮食作物种子中进行过表达能够增加籽粒中锌铁含量的积累。0027因此,本发明提供了一种调控植物吸收、转运或储存锌铁的能力。
30、,解除过量的锌铁对植物毒害,调控胚乳和胚的发育或增加粮食作物籽粒中锌铁含量的方法,包括将本发明ZMZIP5基因可操作的与表达调控元件相连接得到重组植物表达载体;将重组植物表达载体转化到植物中,在植物体中过表达ZMZIP5基因;特别的,将本发明ZMZIP5基因在粮食作物种子中进行特异性表达时,能够有效增加粮食作物种子中锌铁的含量或积累。0028本发明进一步提供了含有所述锌铁调控转运体基因的重组植物表达载体以及含有该重组植物表达载体的宿主细胞。0029将所述锌铁调控转运体基因可操作的与表达调控元件相连接,得到可以在植物中表达该锌铁调控转运体基因的重组植物表达载体。“可操作的连接”指两个或更多个元件。
31、之间功能性的连接,可操作的连接的元件可为邻接或非邻接的。例如,该重组植物表达载体可以由5端非编码区,SEQIDNO1所示的核苷酸和3非编码区组成,其中,所述的5端非编码区可以包括启动子序列、增强子序列或/和翻译增强序列;所述的启动子可以是组成性启动子、诱导型启动子、组织或器官特异性启动子;所述的3非编码区可以包含终止子序列、MRNA切割序列等。合适的终止子序列可取自根癌农杆菌的TI质粒,例如章鱼碱合成酶或胭脂碱合成酶终止区。例如,为了使本发明的锌铁调控转运体基因在粮食作物种子进行特异性表达,可以将锌铁调控转运体基因连接在种子特异性表达启动子的下方构建得到重组植物表达载体,将该重组植物表达载体转。
32、化受体植物后,锌铁调控转运体基因可以在受体植物的种子里进行特异性表达,达到增加种子锌铁含量或调控胚发育的效果。0030另外,本领域技术人员可以将SEQIDNO1所示的核苷酸序列进行优化以增强其在植物中的表达。例如。可采用目标植物的偏爱密码子进行优化来合成多核苷酸以增强该基因在目标植物中的表达水平,这些方法均为本领域技术人员所习知。0031此外,该重组植物表达载体还可含有用于选择转化细胞的选择性标记基因。选择性标记基因用于选择经转化的细胞或组织。所述的选择性标记基因包括编码抗生素抗性的基因以及赋予除草化合物抗性的基因等。此外,所述的标记基因还包括表型标记,例如半乳糖苷酶和荧光蛋白等。0032所述。
33、的“转化”指将基因导入到植物细胞内部这样的方式将多核苷酸或多肽遗传转化到植物中。将所述多核苷酸或多肽引入到植物中的方法为本领域所习知,包括但不限于稳定转化法、瞬时转化法和病毒介导法等。“稳定转化”指被引入的多核苷酸构建体整合至植物细胞的基因组中并能通过其子代遗传;“瞬时转化”指多核苷酸被引入到植物中但只说明书CN104212817A6/12页8能在植物中暂时性表达或存在。0033转化方案以及将所述多核苷酸引入植物的方案可视用于转化的植物单子叶植物或双子叶植物或植物细胞的类型而变化。将所述多核苷酸转化植物细胞的合适方法包括显微注射、电穿孔、农杆菌介导的转化、直接基因转移以及高速弹道轰击等。在特定。
34、的实施方案中,可利用多种瞬时转化法将本发明的ZMZIP5基因提供给植物。在其它实施方案中,本发明的ZMZIP5基因可通过将植物与病毒或病毒核酸接触来引入到植物中,通常,这样的方法涉及将本发明的ZMZIP5基因构建体引入病毒DNA或RNA分子中。0034利用常规方法可使已转化的细胞再生稳定转化植株MCCORMICKETALPLANTCELLREPORTS198658184。本发明可用于转化任何植物种类,包括但不限于单子叶植物或双子叶植物;优选的,所述的目标植物包括粮食作物、蔬菜或果树等,更优选为粮食作物,例如,可以是玉米、水稻、大麦小麦、高粱、大豆、马铃薯等粮食作物。0035本发明所涉及到的术语。
35、定义0036除非另外定义,否则本文所用的所有技术及科学术语都具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所了解相同的含义。虽然在本发明的实践或测试中可使用与本文所述者类似或等效的任何方法、装置和材料,但现在描述优选方法、装置和材料。0037术语“重组宿主细胞株”或“宿主细胞”意指包含本发明多核苷酸的细胞,而不管使用何种方法进行插入以产生重组宿主细胞,例如直接摄取、转导、F配对或所属领域中已知的其它方法。外源性多核苷酸可保持为例如质粒的非整合载体或者可整合入宿主基因组中。宿主细胞可为原核细胞或真核细胞,宿主细胞还可为单子叶或双子叶植物细胞。0038术语“核苷酸”意指单股或双股形式的脱氧核糖核苷酸、脱氧。
36、核糖核苷、核糖核苷或核糖核苷酸及其聚合物。除非特定限制,否则所述术语涵盖含有天然核苷酸的已知类似物的核酸,所述类似物具有类似于参考核酸的结合特性并以类似于天然产生的核苷酸的方式进行代谢。除非另外特定限制,否则所述术语也意指寡核苷酸类似物,其包括PNA肽核酸、在反义技术中所用的DNA类似物硫代磷酸酯、磷酰胺酸酯等等。除非另外指定,否则特定核酸序列也隐含地涵盖其保守修饰的变异体包括但不限于简并密码子取代和互补序列以及明确指定的序列。特定而言,可通过产生其中一个或一个以上所选或所有密码子的第3位经混合碱基和/或脱氧肌苷残基取代的序列来实现简并密码子取代BATZER等人,NUCLEICACIDRES1。
37、950811991;OHTSUKA等人,JBIOLCHEM260260526081985;和CASSOL等人,1992;ROSSOLINI等人,MOLCELLPROBES891981994。0039术语“多肽”、“肽”和“蛋白质”在本文中互换使用以意指氨基酸残基的聚合物。即,针对多肽的描述同样适用于描述肽和描述蛋白,且反之亦然。所述术语适用于天然产生氨基酸聚合物以及其中一个或一个以上氨基酸残基为非天然编码氨基酸的氨基酸聚合物。如本文中所使用,所述术语涵盖任何长度的氨基酸链,其包括全长蛋白即抗原,其中氨基酸残基经由共价肽键连接。附图说明0040图1酵母表达载体PFL61的示意图。0041图2标准。
38、HOAGLAND培养基条件下ZMZIP5的表达模式;SSHOOT,RROOT。说明书CN104212817A7/12页90042图3ZMZIP5基因在各种处理条件下的表达模式。0043图4ZMZIP5基因在玉米胚和胚乳发育过程中的表达模式。0044图5不同物种的ZIP成员的系统发生树分析。0045图6PRTL2NGFPZMZIP5重组载体酶切鉴定。0046图7PRTL2NGFPZMZIP5载体构建流程图。0047图8ZMZIP5洋葱表皮细胞中的亚细胞定位;GFP为PRTL2NGFP空载体定位情况;ZMZIP5为PRTL2NGFPZMZIP5的亚细胞定位情况。0048图9ZMZIP5拟南芥叶肉原。
39、生质体中的亚细胞定位;GFP为PRTL2NGFP空载体定位情况;ZMZIP5为PRTL2NGFPZMZIP5的亚细胞定位情况。0049图10PFL61ZMZIP5及PFL61OSZIP5、PFL61OSZIP8、PFL61OSIRT1正向连接重组载体酶切鉴定;M为1KB的MARKER;14依次为PFL61ZMZIP5、PFL61OSZIP5、PFL61OSZIP8、PFL61OSIRT1双酶切结果。0050图11PFL61ZMZIP5载体构建流程图。0051图12ZMZIP5酵母互补实验结果。0052图13PBI121ZMZIP5植物表达载体示意图。0053图14ZMZIP5基因在拟南芥中过表。
40、达提高拟南芥中锌铁含量的实验结果;ZMZIP5为转ZMZIP5基因拟南芥种子中铁和锌含量测定的结果;WT为野生型哥伦比亚种子中铁和锌含量测定的结果。具体实施方式0054下面结合具体实施例来进一步描述本发明,本发明的优点和特点将会随着描述而更为清楚。但这些实施例仅是范例性的,并不对本发明的范围构成任何限制。本领域技术人员应该理解的是,在不偏离本发明的精神和范围下可以对本发明技术方案的细节和形式进行修改或替换,但这些修改和替换均落入本发明的保护范围内。0055实验材料005611植物材料0057玉米自交系X178由河北农业大学农学院/国家玉米改良中心河北分中心实验室提供,水稻自交系日本晴由北京师范。
41、大学生命科学院惠赠。005812菌株与载体0059大肠杆菌ECOLI菌株MACH1T1和农杆菌ATUMEFACTERIUM菌株EHA105、GV3101均由本实验室保存。PGEMTEASY载体购自PROMEGA公司。酵母表达载体PFL61示意图见图1、酵母菌株ZRT1ZRT2ZHY3MATADE6CAN1HIS3LEU2TRP1URA3ZRT1LEU2ZRT2HIS3,FET3FET4DEY1453MATA/MATAADE2/CAN1/CAN1HIS3/HIS3LEU2/LEU2TRP1/TRP1URA3/URA3FET32HIS3/FET32HIS3FET41LEU2/FET41LEU2,D。
42、Y1455MATAADE6CAN1HIS3LEU2TRP1URA3由南京农业大学张红生教授友情惠赠。0060实施例1玉米锌铁调控转运体ZMZIP5基因的克隆00611、植物材料的处理0062先把蛭石用HOAGLAND营养液浸透,将玉米自交系X178种子点播于育苗盘中,上面说明书CN104212817A8/12页10覆盖上一层干蛭石,在温室16H光照/8H黑暗,26中培养,12天幼苗长至2叶一心时移入标准HOAGLAND营养液中生长6天至3叶一心每3天换一次营养液,3叶一心的玉米幼苗在标准营养液和不加锌、铁、铜、锰,高锌、铁的条件下处理0、6、12、24、48、96H后,分别收取幼苗地上部和根,。
43、液氮速冻后于80保存用于总RNA提取。00632、玉米总RNA的提取0064采用TRIZOL提取试剂盒提取玉米总RNA。00653、CDNA的合成00661、去除DNA,按下述配制反应体系总RNA1G/L10L,DNASEI10U/L10L,10DNASEIBUFFER10L,DEPCH2O70L,总计100L;3730分钟,加入1L25MMEDTA,655MIN终止反应。00672、加入1LOLIGODT18,655分钟;00683、以上共12L,再加入以下组分得到反转录体系5反应缓冲液40L,RIRT20U/L10L,RERT200U/L10L,10MMDNTPMIX20L,总计200L;。
44、4260MIN,705分钟,终止反应。00694、目的基因的克隆00701、根据目的基因的ORF框设计引物0071ZMZIP5F5GAATTCATGCCGCTCCTCGAGGAGAT3ECORI0072ZMZIP5R5GCGGCCGCGAGCTCCTAAGCCCAGATGGCTAGAGATGCC3NOTI,SACI0073以上述步骤3玉米叶片的CDNA为模板,选用EXTAQ酶,2GCIBUFFER进行PCR扩增,PCR程序为95预变性4MIN;94变性1MIN,60退火1MIN,72延伸1MIN,33个循环;72延伸10MIN;00742、将克隆得到的片段克隆到PGEMT载体中,转化MACH1。
45、T1菌株;00753、经酶切鉴定获得阳性的重组质粒,命名为PGEMZMZIP5,测序得到正确克隆。将所克隆的基因命名为ZMZIP5,该基因的CDNA序列为SEQIDNO1所示,所推导的氨基酸序列为SEQIDNO2所示。0076实施例2ZMZIP5在幼苗、胚和胚乳中的表达模式0077将实施例1步骤3中反转录的CDNA稀释10倍作为PCR反应的模板,PCR反应体系如下0078CDNA20L,EXTAQ01L,2GCI缓冲液100L,10MMDNTPMIX08L,上游引物RTZMZIP5F10M/L10L,下游引物RTZMZIP5R10M/L10L,DDH2O51L,总计200L;0079RTZMZ。
46、IP5F5GCACATAGGCATAGCCACGC30080RTZMZIP5R5ACGCCCAAAGATAGCCCGAT30081PCR反应条件94预变性4MIN;30个循环,每个循环94变性45SEC,60退火1MIN,72延伸1MIN;最后再延伸7210MIN,降温至16,取出PCR产物放入4保存。0082目的基因表达量的检测实施例1步骤3中反转录的CDNA稀释20倍作为REALTIMEPCR反应的模板,ACTIN为内参照,反应体系如下0083CDNA50L,SYBRGREENI100L,ROX04L,上游引物ZMACTIN1F10M/L04L,下游引物ZMACTIN1R10M/L04L,。
47、DDH2O38L,总计100L;说明书CN104212817A109/12页110084ZMACTIN1F5ATGTTTCCTGGGATTGCCGAT30085ZMACTIN1R5CCAGTTTCGTCATACTCTCCCTTG30086所用程序952MIN,9515SEC,6034SEC,40个循环,通过CT法计算表达量。0087通过REALTIMERTPCR表达分析发现,正常营养条件下,ZMZIP5在地上部的表达量比地下部高图2,缺锌诱导96H时,ZMZIP5在地上部表达上调,在高锌条件下,ZMZIP5在地上部的表达量随着时间的延长呈现逐渐降低的趋势,然而,在高铁条件下ZMZIP5在地上部。
48、与地下部的表达量是逐渐升高的图3。这些结果表明,ZMZIP5在幼苗时期对锌和铁的浓度比较敏感。在授粉后不同天数的胚和胚乳中的表达分析发现,ZMZIP5在授粉后17天的胚和胚乳中是表达上调的,在授粉后19天的胚乳中的表达量达到最高图4。推测ZMZIP5可能在胚和胚乳的发育过程中起到一定的作用。0088实施例3ZMZIP5的生物信息学分析0089生物信息学分析表明,锌铁调控转运体ZMZIP5定位在玉米的第6染色体上,由5个外显子和4个内含子组成。锌铁调控转运体ZMZIP5蛋白编码409个氨基酸,通过对玉米ZIP蛋白的氨基酸序列比对发现,ZMZIP5蛋白含有6个跨膜结构域,在第3与第4跨膜区之间有一。
49、富含组氨酸的可变区,可能和金属离子的结合转运有关。进化树分析显示,ZMZIP5与ATIRT3、ATZIP4、ATZIP9处于一个分支上,进化关系较近图5,ATIRT3是转运锌铁的锌转运体,所以ZMZIP5可能是一个锌铁转运体。0090实施例4锌铁调控转运体ZMZIP5的亚细胞定位00911、融合表达载体的构建0092根据ZMZIP5基因的序列设计引物,引物序列如下0093ZMZIP5GF5GAATTCATGCCGCTCCTCGAGGAGAT3ECORI0094ZMZIP5GR5TCTAGAAGCCCAGATGGCTAGAGATGCC3XBAI0095加入合适的酶切位点,并且基因3端去除终止密码子,以克隆基因时连接到PGEMT载体上测序正确的质粒为模板,选用EXTAQ酶与2GCIBUFFER进行PCR扩增,PCR程序为95预变性4MIN;94变性1MIN,60退火1MIN,72延伸1MIN,33个循环;72延伸10MIN。扩增片段经1琼脂糖凝胶电泳回收后克隆到PGEMT载体中,转化大肠杆菌菌株MACH1T1,经LB培养基IPTG、XGAL、AMP得到阳性克隆,提。