《鉴别花脸蘑原生质体单核体交配型的方法及其专用引物对SR-64.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《鉴别花脸蘑原生质体单核体交配型的方法及其专用引物对SR-64.pdf(15页珍藏版)》请在专利查询网上搜索。
1、(10)授权公告号 (45)授权公告日 (21)申请号 201310187634.8 (22)申请日 2013.05.20 C12Q 1/68(2006.01) C12N 15/11(2006.01) (73)专利权人 北京市农林科学院 地址 100097 北京市海淀区曙光中路 9 号 (72)发明人 许峰 刘宇 王守现 赵爽 王鹏 李登进 耿小丽 王兰青 (74)专利代理机构 北京纪凯知识产权代理有限 公司 11245 代理人 关畅 任凤华 许峰等.北京地区白色金针菇菌株的SRAP分 析 . 中国农学通报 .2010, 第 26 卷 ( 第 10 期 ), 张美彦.香菇135菌株特异SCAR。
2、标记的遗传 规律 .中国优秀硕士学位论文全文数据库农业 科技辑 .2008,( 第 5 期 ), 熊芳等 .SCAR 标记技术鉴别榆黄蘑品种 . 基 因组学与应用生物学 .2010, 第 29 卷 ( 第 3 期 ), (54) 发明名称 鉴别花脸蘑原生质体单核体交配型的方法及 其专用引物对 SR-64 (57) 摘要 本发明公开了鉴别花脸香蘑原生质体单核体 交配型的方法及其专用引物对 SR-64。该方法 包括分别以待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单 核体的基因组 DNA 为模板, 用由 SEQ ID No.1 和 SEQ ID No.2 所示的两条单链 DNA 组成的 PCR 引 物对进行 PC。
3、R 扩增, 检测所得到的 PCR 产物的大 小, 如果所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单 核体的 PCR 产物均含有或均不含有 500bp-800bp 的 DNA 片段, 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生 质体单核体的交配型相同 ; 如果其中的一株 含有 500bp-800bp 的 DNA 片段, 另一株不含有 500bp-800bp的DNA片段, 所述待鉴别的两株花脸 香蘑原生质体单核体的交配型不同。 (51)Int.Cl. (56)对比文件 审查员 赵重甲 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利 权利要求书1页 说明书10页 序列表2页 附图1页 (10)授权公告号 CN 10。
4、3305606 B (45)授权公告日 2015.03.11 CN 103305606 B 1/1 页 2 1. 鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配型的方法, 包括如下步骤 : 分别以待 鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的基因组 DNA 为模板, 用由 SEQ ID No.1 和 SEQ ID No.2所示的两条单链DNA组成的PCR引物对进行PCR扩增, 检测所得到的PCR产物的大小, 根据 PCR 扩增产物的大小按照下述方法确定所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体 的交配型 : 如果所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产物均含有 782bp 的 DNA 片 段, 所述。
5、待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的交配型相同或候选为交配型相同, 如果 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产物均不含有 782bp 的 DNA 片段, 所述 待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的交配型相同或候选为交配型相同 ; 如果所述待鉴 别的两株花脸香蘑原生质体单核体中的一株待鉴别的花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产 物含有 782bp 的 DNA 片段, 另一株待鉴别的花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产物不含有 782bp 的 DNA 片段, 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的交配型不同或候选为交 配型不同 ; 所述花脸香蘑在中国微生物菌种保藏管理委员会林业微。
6、生物中心的保藏编号为 CFCC 89562。 2. 根据权利要求 1 所述的方法, 其特征在于 : 所述 PCR 扩增采用的引物退火条件为 57退火 30s。 3. 根据权利要求 2 所述的方法, 其特征在于 : 所述 PCR 扩增中采用的 PCR 反应温度 程序 : 94预变性 5min ; 94变性 30s, 57退火 30s, 72延伸 40s, 30 个循环 ; 72延伸 7min。 4. 权利要求 1-3 中任一所述的方法在花脸香蘑育种中的应用, 其特征在于 : 所述花脸 香蘑在中国微生物菌种保藏管理委员会林业微生物中心的保藏编号为 CFCC89562。 5. 鉴别或辅助鉴别花脸香蘑。
7、原生质体单核体交配型的 PCR 引物对, 其特征在于 : 所述 引物对的名称为 SR-64, 由 SEQ ID No.1 和 SEQ ID No.2 所示的两条单链 DNA 组成 ; 所述 花脸香蘑在中国微生物菌种保藏管理委员会林业微生物中心的保藏编号为 CFCC 89562。 6.含有权利要求5所述的PCR引物对的鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配 型的试剂, 其特征在于 : 所述花脸香蘑在中国微生物菌种保藏管理委员会林业微生物中心 的保藏编号为 CFCC 89562。 7.含有权利要求5所述的PCR引物对的鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配 型的试剂盒, 其特征在于 : 所述花。
8、脸香蘑在中国微生物菌种保藏管理委员会林业微生物中 心的保藏编号为 CFCC 89562。 8. 权利要求 5 所述的 PCR 引物对、 权利要求 6 所述的试剂或权利要求 7 所述的试剂盒 在鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配型中的应用, 其特征在于 : 所述花脸香蘑 在中国微生物菌种保藏管理委员会林业微生物中心的保藏编号为 CFCC89562。 9. 权利要求 5 所述的 PCR 引物对、 权利要求 6 所述的试剂或权利要求 7 所述的试剂盒 在花脸香蘑育种中的应用, 其特征在于 : 所述花脸香蘑在中国微生物菌种保藏管理委员会 林业微生物中心的保藏编号为 CFCC 89562。 权 利。
9、 要 求 书 CN 103305606 B 2 1/10 页 3 鉴别花脸蘑原生质体单核体交配型的方法及其专用引物对 SR-64 技术领域 0001 本发明涉及鉴别花脸蘑原生质体单核体交配型的方法及其专用引物对 SR-64。 0002 背景技术 0003 营养不亲和系统是一种识别异己的遗传系统, 在多数真菌中, 该系统能引起遗传 上明显不同的个体在交接区产生特征性的体细胞不亲和性 (戚元成等, 中国栽培糙皮侧耳 品种体细胞不亲和性实验与 RAPD 分析结果的比较 . 菌物学报, 2010,29(3) ) 反应, 体细胞 不亲和性反应的强度因个体不同而异。在真菌中, 营养不亲和又称为体细胞不亲和。
10、或异核 体不亲和, 它的作用在于防止同一种内交配型不同的个体或营养不亲和位点上基因不同的 个体间的融合, 以保持个体遗传上的稳定性。交配型是根据交配因子的个体间能否完成交 配结合而确定的结合类型 (中国标准出版社第一编辑室, 中国农业标准汇编 (食用菌卷) . 中 国标准出版社, 2010) 。 在真菌的有性生殖和营养生长过程中都存在一个自己或异己识别的 机制或系统。有性生殖阶段靠交配型因子识别 ; 而营养生长阶段的识别是靠异核体不亲和 系统来进行的。异核体不亲和性是普遍存在于真菌中的一种生物学现象, 在子囊菌、 担子 菌、 接合菌等真菌中是一种普遍存在的现象。 在异核体形成过程中, 非己识别。
11、系统通过一系 列蛋白因子的相互作用最终导致遗传背景不同的核不能形成稳定的异核体 , 也就是所谓 的异核不亲和性。 异核体不亲和性是一个受基因调控的过程并且往往异核体不亲和性的菌 丝体会死亡。 0004 异核菌丝体在原生质体制备过程中出现单核原生质体的现象。 这些单核原生质体 经过再生培养和遗传筛选成为原生质体单核体, 由于原生质体单核体是直接来源于营养菌 丝, 没有经历过减数分裂的无性后代, 它为食用菌的遗传和育种研究提供了一种十分重要 的基础材料。 原生质体单核体的杂交育种方式是把两个分别来自双核亲本的原生质体单核 体两两接入同一 PDA 平板, 对峙培养进行杂交。在杂交过程中, 两个原生质。
12、体单核体的细胞 质进行重组, 形成一个异质异核的杂交后代。 这一方法的主要特点是, 根据亲本性状不易在 原生质体单核体中分散和稀释, 在育种程序中可以从一个比较小的变异范围内去选择具有 亲本性状的不育单核体, 有效地克服了传统育种过程中由孢子单核体遗传多样性所造成的 亲本性状分散和选材困难的障碍, 减少了筛选杂交后代的工作量。 同时, 由于原生质体单核 体是在实验室条件下获得的, 无季节性限制, 因此缩短了育种时间。 0005 花脸香蘑 (Lepista sordida) 属于担子菌亚门 (Basidiomycomycotina)、 层菌纲 (Hymenomycetes)、 伞菌目 (Agar。
13、icales)、 口蘑科 (Tricholomataceae)、 香蘑属 (Lepista)。 该菌营养丰富, 具有一定的药用功效。在中国主要分布于贵州、 黑龙江、 辽宁、 河北、 河南、 甘肃、 青海、 四川、 新疆、 山西、 内蒙古和福建等地 , 是一种名贵的食用菌和药用菌, 人工栽 培花脸香蘑还处于小规模试验阶段, 野生产量低且稀少, 其价格极其昂贵, 是一种很有开发 潜力的野生菌种。 但实际生产中存在产量低, 抗虫能力差, 适应温度范围窄, 子实体易碎, 不 易运输、 保存等亟待解决的难题。 这就要求花脸香蘑的遗传育种相关的基础研究加大力度, 为传统的遗传育种奠定坚实的理论基础和技术支。
14、持。 说 明 书 CN 103305606 B 3 2/10 页 4 发明内容 0006 本发明所要解决的技术问题是提供一种鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核 体交配型的方法及其专用引物对 SR-64。 0007 本发明所提供的鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配型的 PCR 引物对, 名称为 SR-64, 由 SEQ ID No.1 和 SEQ ID No.2 所示的两条单链 DNA 组成。 0008 其中, SEQ ID No.1 由 20 个脱氧核苷酸组成, SEQ ID No.2 由 21 个脱氧核苷酸组 成。 0009 含有PCR引物对SR-64的鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单。
15、核体交配型的试 剂或试剂盒也属于本发明的保护范围。 0010 所述试剂或试剂盒除 PCR 引物对 SR-64 外, 还含有进行 PCR 和 DNA 测序的其它 常规试剂。 0011 本发明的实验证明PCR引物对SR-64、 含有PCR引物对SR-64的试剂或试剂盒 可用于鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配型。 0012 本发明所提供的鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配型的方法, 包括如 下步骤 : 分别以待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的基因组 DNA 为模板, 用由 SEQ ID No.1 和 SEQ ID No.2 的两条单链 DNA 组成的 PCR 引物对 SR-64 进行。
16、 PCR 扩增, 检测所得 到的 PCR 产物的大小, 根据 PCR 扩增产物的大小按照下述方法确定所述待鉴别的两株花脸 香蘑原生质体单核体的交配型 : 0013 如果所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产物均含有 500bp-800bp 的 DNA 片段 (或所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产物均为 500bp-800bp 的 DNA 片段) , 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的交配型相同或候选为交配型 相同, 如果所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产物均不含有 500bp-800bp 的 DNA 片段 (或所述待鉴别的两株花脸香蘑原生。
17、质体单核体的 PCR 产物均不为大小是 500bp-800bp 的 DNA 片段) , 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的交配型相同或 候选为交配型相同 ; 如果所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体中的一株待鉴别的 花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产物含有 500bp-800bp 的 DNA 片段 (或所述待鉴别的两 株花脸香蘑原生质体单核体中的一株待鉴别的花脸 香蘑原生质体单核体的 PCR 产物为 500bp-800bp 的 DNA 片段) , 另一株待鉴别的花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产物不含有 500bp-800bp 的 DNA 片段 (或另一株待鉴别的花脸香蘑原生质体单。
18、核体的 PCR 产物不为 500bp-800bp 的 DNA 片段) , 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的交配型不同或候 选为交配型不同。 0014 上述方法中, 所述 500bp-800bp 的 DNA 片段具体为 782bp 的 DNA 片段。 0015 在本发明的一个实施例中, 所述 PCR 扩增采用的引物退火条件为 57退火 30s。 所述 PCR 扩增中采用的 PCR 反应温度程序如下 : 94预变性 5min ; 94变性 30s, 57退火 30s, 72延伸 40s, 30 个循环 ; 72延伸 7min。 0016 上述方法中, 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体。
19、的交配型相同是指将所 述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体在一起培养, 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质 体单核体的菌丝之间不产生锁状联合 ; 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的交配 说 明 书 CN 103305606 B 4 3/10 页 5 型不同是指将所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体在一起培养, 所述待鉴别的两株 花脸香蘑原生质体单核体的菌丝之间产生锁状联合。 0017 上述方法中, 所述花脸香蘑具体可为花脸香蘑 (Lepista sordida) CFCC89562。 0018 实验证明, 本发明的特异性引物对 SR-64 对花脸香蘑原生质体单核体具有特异 性, 本发明利用。
20、 PCR 引物对 SR-64 鉴别花脸香蘑原生质体单核体间的交配型是否相同的 方法与现有的体细胞不亲和性实验方法鉴别花脸香蘑原生质体单核体间的交配型是否相 同的方法的一致性为100%。 本方法缩短了花脸香蘑原生质体单核体交配型的鉴别时间并简 化了交配型鉴别的步骤, 其准确性和可靠性高。通过原生质体单核化获得的单核体称为原 生质单核体, 与孢子单核体不同, 原生质体单核体是在原生质体制备过程中从花脸香蘑异 核菌丝体中直接得到的单核单倍体的无性后代 , 因此花脸香蘑的原生质单核体只有两种 形式的交配型 AxBx和 AyBy两对。在常规的杂交育种中, 只有交配型不同的单核菌株是杂交 可育的, 因此交。
21、配型的鉴定是杂交育种的前提和必要条件。本发明对研究花脸香蘑的遗传 育种及生产实践具有重要意义。本发明适用于食用菌生产、 菌种选育等相关专业领域对花 脸香蘑原生质体原生质单核体的鉴别及遗传育种等方面的研究。 附图说明 0019 图 1 为用本发明引物对 SR-64 对部分花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 扩增产物 电泳图。 0020 图中 1 至 12 号对应菌株依次为 : 110 号, 58 号, 99 号, 67 号, 55 号, 137 号, 179 号, 69 号, 104 号, 139 号, 100 号, 双核菌株 ;M : DNA Marker。 0021 图 2 为用引物 SRAP。
22、-me6 和 SRAP-em4 对花脸香蘑原生质体单核体进行 PCR 的电泳 图。 0022 图中, 1 至 12 对应的菌株依次为 : 110 号, 58 号, 99 号, 67 号, 55 号, 137 号, 179 号, 69 号, 104 号, 139 号, 100 号, 双核菌株的基因组 DNA ; M : DNA Marker。 0023 图 3 为交配型不同的两株花脸香蘑原生质体单核体的菌丝之间产生的锁状联合 照片。 0024 图中箭头示锁状联合。 具体实施方式 0025 以下的实施例便于更好地理解本发明, 但并不限定本发明。下述实施例中的实验 方法, 如无特殊说明, 均为常规方。
23、法。 0026 下述实施例中所用的材料、 试剂等, 如无特殊说明, 均可从商业途径得到。 0027 下述实施例中的花脸香蘑均为花脸香蘑 (Lepista sordida) CFCC89562, 公众 可从中国微生物菌种保藏管理委员会林业微生物中心 (中国林业微生物菌种保藏管理中 心 ,China Forestry Culture Collection Center 英文缩写 CFCC, 简称林业微生物中心) 获得。在下文中, 均简称花脸香蘑。 0028 1、 下述实施例中的花脸香蘑原生质体单核体均通过原生质体单核化获得, 具体方 法如下 : 0029 1.1 培养基 说 明 书 CN 1033。
24、05606 B 5 4/10 页 6 0030 MM 缓冲液由溶质和溶剂组成 ; 所述溶剂为 50mM 马来酸缓冲液 (pH5.5) ; 所述溶质 及其在 MM 缓冲液中的浓度如下 : 0.5M 甘露醇。 0031 液体MCM培养基 : 将酵母提取物2g、 胰蛋白胨2g、 葡萄糖20g、 硫酸镁0.5g、 磷酸二 氢钾 0.5g 和磷酸氢二钾 1g 溶于水并用水定容至 1L。 0032 固体 MCM 平板 : 在液体 MCM 培养基中添加琼脂, 使其浓度为 20g/L。 0033 固体再生平板 (RM) 的制备方法 : 在液体 MCM 培养基中添加山梨醇和琼脂, 使其浓 度分别为 1M 和 2。
25、0g/L。 0034 1.2 原生质体制备 0035 1) 取花脸香蘑菌丝于液体 MCM 培养基中, 160rpm、 25培养 4 天 (3-5 天均可) , 用 3 层无菌擦镜纸过滤并收集菌丝, 然后用 0.6M 甘露醇水溶液洗涤 2-3 次。 0036 2) 将步骤 1) 的花脸香蘑菌丝 (约 1g) 悬浮于 1.5% 溶壁酶溶液 (将 1.5g 溶壁酶用 0.6M 甘露醇水溶液溶解并定容至 100mL ; 溶壁酶购自广东碧德生物科技有限公司, 产品目 录号 : Bd_8110001023) , 在水浴摇床 (32、 60rpm) 中温浴 2 小时, 用 3 层无菌擦镜纸过滤并 收集滤液。。
26、 0037 3) 将步骤 2) 的滤液 3000rpm 离心 10min 并收集沉淀。 0038 4)将步骤3)的沉淀用MM缓冲液洗涤三次后, 悬浮于100l MM缓冲液中, 即为原 生质体溶液。 0039 1.3 原生质单核体的获得 0040 将获得的原生质体用 MM 缓冲液稀释至浓度为 103-104个 /mL, 均匀涂布于 RM 上, 28静置培养10-14天 ; 待生长出来单菌落后用无菌接种针转接至固体MCM培养基上, 28 培养 5-7 天。 0041 将获得的原生质单核体依次编号, 并在放大 1000 倍的显微镜 (Olympus BX51) 下 观察, 如果没有发现锁状联合, 则。
27、该菌株为花脸香蘑原生质体单核体。共得到 30 株花脸香 蘑原生质体单核体, 它们的编号分别为 36、 42、 50、 53、 55、 58、 61、 65、 66、 67、 69、 71、 72、 75、 81、 82、 86、 87、 88、 99、 100、 104、 110、 111、 113、 117、 119、 137、 139、 179。 0042 2、 鉴别花脸香蘑原生质体单核体的交配型是否相同 0043 待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的交配型相同是指将待鉴别的两株花脸 香蘑原生质体单核体在一起培养, 该待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的菌丝之间不 产生锁状联合 ; 待鉴别。
28、的两株花脸香蘑原生质体单核体的交配型不同是指将待鉴别的两株 花脸香蘑原生质体单核体在一起培养, 该待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体的菌丝之 间产生锁状联合。 1.3中的30株花脸香蘑原生质体单核体间的交配型按照下述体细胞不亲 和性实验方法鉴别 : 0044 PDA 培养基 : 200g 马铃薯, 洗净去皮切成小块, 加水 1000ml 煮沸半个小时, 纱布过 滤, 取滤液再加 20g 葡萄糖和 20g 琼脂, 121灭菌 20 分钟。 0045 将两株待鉴别交配型的花脸香蘑原生质体单核体一起接种到 PDA 培养基上, 两者 之间间开 2cm, 25培养 10 天进行观察。如果肉眼观察两株待鉴。
29、别交配型的花脸香蘑原生 质体单核体的菌丝长在一起, 通过显微镜观察进一步确认交接处的菌丝没有锁状联合, 该 两株待鉴别交配型的花脸香蘑原生质体单核体的交配型相同。 如果肉眼观察两株待鉴别交 配型的花脸香蘑原生质体单核体的菌丝交汇的地方有拮抗线, 则挑取拮抗线上的菌丝, 接 说 明 书 CN 103305606 B 6 5/10 页 7 种至 PDA 培养基上 25培养 5 天后, 再通过显微镜观察是否有锁状联合, 若无锁状联合, 该 两株待鉴别交配型的花脸香蘑原生质体单核体的交配型相同 ; 若有锁状联合, 该两株待鉴 别交配型的花脸香蘑原生质体单核体的交配型不同。图 3 显示了交配型不同的两株。
30、花脸香 蘑原生质体单核体的菌丝之间产生的锁状联合。 0046 按照该方法鉴别 1.3 得到的 30 株花脸香蘑原生质体单核体的交配型, 结果如表 1 和 2 所示。表 1 和表 2 中,“” 表示两个菌株之间体细胞不亲和性实验结果表明两个菌株 的交配型不同 ;“” 表示两个菌株之间体细胞不亲和性实验结果表明两个菌株的交配型 相同。 0047 表 1. 体细胞不亲和性实验方法鉴别花脸香蘑原生质体单核体间的交配型是否相 同的结果 0048 36 42 50 53 55 58 61 65 66 67 69 71 72 75 81 36 42 50 53 55 58 61 65 66 67 69 71。
31、 72 75 81 82 86 87 88 99 100 104 110 111 113 117 119 137 139 179 0049 表 2. 体细胞不亲和性实验方法鉴别花脸香蘑原生质体单核体间的交配型是否相 同的结果 0050 82 86 87 88 99 100 104 110 111 113 117 119 137 139 179 36 42 说 明 书 CN 103305606 B 7 6/10 页 8 50 53 55 58 61 65 66 67 69 71 72 75 81 82 86 87 88 99 100 104 110 111 113 117 119 137 139。
32、 179 0051 实施例 1、 利用 PCR 引物对 SR-64 鉴别花脸香蘑原生质体单核体的交配型 0052 1、 鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配型的 PCR 试剂 0053 本实施例的鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配型的试剂由 PCR 引物 对 SR-64、 10Taq 缓冲液, dNTP mix, Taq DNA 聚合酶和 ddH2O 组成。 0054 其中, PCR 引物对 SR-64 由 SR-64-F 和 SR-64-R 这两条单链 DNA 组成, 其序 列如下 : 0055 SR-64-F:5 -AACCGGTAGGCAGTTACTTT-3 (SEQ ID N。
33、o.1) , 0056 SR-64-R:5 -AGAGCAAGCCTTTCATACAGT-3 (SEQ ID No.2) 。 0057 10Taq 缓冲液, dNTP mix 和 Taq DNA 聚合酶均购自北京盛旭百川公司 (CNS) 。 0058 2、 鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体单核体交配型 0059 将上述 1.3 得到的 30 株花脸香蘑原生质体单核体分别接种到 PDA 培养基上, 25 培养7-10天, 刮取PDA培养基上的菌丝约0.1g, 用QIAGEN的DNeasy Plant Mini Kit提取 DNA。 0060 用吸光光度计测定所得 DNA 溶液的浓度, 稀释原液, 。
34、使其 OD 值为 1, 浓度为 50ng/ L。 0061 每株花脸香蘑原生质体单核体均采用如下 PCR 体系和如下 PCR 条件, 分别以花脸 香蘑原生质体单核体基因组 DNA 为模板, 利用步骤 1 的鉴别或辅助鉴别花脸香蘑原生质体 单核体交配型的试剂进行 PCR 扩增。PCR 反应体系如表 3 所示 : 说 明 书 CN 103305606 B 8 7/10 页 9 0062 表 3、 20L 的 PCR 反应体系 0063 0064 PCR反应温度程序 : 94预变性5min ; 94变性30s, 57退火30s, 72延伸40s, 30 个循环 ; 72延伸 7min, 12保存。 。
35、0065 将每株花脸香蘑原生质体单核体的PCR扩增产物在1.3%的琼脂糖凝胶上电泳, 凝 胶成像, 结果表明 50、 53、 61、 65、 66、 69、 71、 72、 75、 88、 100、 104、 111、 139、 179 号花脸香蘑 原生质体单核体的 PCR 产物均为一个 500bp-800bp 的 DNA 条带 (DNA 片段) ; 36、 42、 55、 58、 67、 81、 82、 86、 87、 99、 110、 113、 117、 119、 137 号花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 产物中没有 DNA 条带。图 1 显示了部分花脸香蘑原生质体单核体的 PCR 扩增。
36、产物。 0066 分别回收每株花脸香蘑原生质体单核体的 500bp-800bp 的 DNA 条带 (DNA 片段) , 进行测序, 结果表明所有的15株花脸香蘑原生质体单核体的500bp-800bp的DNA条带 (DNA 片段) 的大小均为 782bp。 0067 根据 PCR 扩增产物的大小按照下述方法确定上述 1.3 得到的 30 株花脸香蘑原生 质体单核体的每两株菌株之间的交配型是否相同 : 如果待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单 核体的 PCR 产物均含有 500bp-800bp 的 DNA 片段, 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单 核体为交配型相同的菌株, 如果待鉴别的两株花脸香蘑原生。
37、质体单核体的 PCR 产物均不含 有 500bp-800bp 的 DNA 片段, 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体为交配型相同的 菌株 ; 如果待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体中的一株待鉴别的花脸香蘑原生质体单 核体的 PCR 产物含有 500bp-800bp 的 DNA 片段, 另一株待鉴别的花脸香蘑原生质体单核体 的 PCR 产物不含有 500bp-800bp 的 DNA 片段, 所述待鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体 为交配型不同的菌株。 0068 本发明利用PCR引物对SR-64鉴别每两株花脸香蘑原生质体单核体的交配型是 否相同的结果如表 4 和 5 所示。表明本发明利用 PC。
38、R 引物对 SR-64 鉴别每两株花脸香蘑 原生质体单核体的交配型是否相同的方法与现有的体细胞不亲和性实验方法鉴别花脸香 蘑原生质体单核体间的交配型是否相同的方法 (表 1 和表 2) 的一致性为 100%。表 4 和表 5 中,“” 表示本发明利用 PCR 引物对 SR-64 鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体间的交 配型不同,“” 表示本发明利用 PCR 引物对 SR-64 鉴别的两株花脸香蘑原生质体单核体 间的交配型相同。 0069 表4、 本发明利用PCR引物对SR-64鉴别花脸香蘑原生质体单核体间的交配型是 说 明 书 CN 103305606 B 9 8/10 页 10 否相同的结果。
39、。 0070 36 42 50 53 55 58 61 65 66 67 69 71 72 75 81 36 42 50 53 55 58 61 65 66 67 69 71 72 75 81 82 86 87 88 99 100 104 110 111 113 117 119 137 139 179 0071 表5、 本发明利用PCR引物对SR-64鉴别花脸香蘑原生质体单核体间的交配型是 否相同的结果。 0072 82 86 87 88 99 100 104 110 111 113 117 119 137 139 179 36 42 50 53 55 58 61 65 66 67 69 71。
40、 72 75 说 明 书 CN 103305606 B 10 9/10 页 11 81 82 86 87 88 99 100 104 110 111 113 117 119 137 139 179 0073 其中, PCR 引物对 SR-64 按照下述方法筛选得到的 : 0074 1. 分子标记实验 0075 将上述 1.3 得到的 30 株花脸香蘑原生质体单核体, 及花脸香蘑的双核菌株, 共 31 株菌株, 接种到PDA培养基上, 25培养。 一段时间后, 刮取PDA培养基上的菌丝约0.1g, 用 QIAGEN 的 DNeasy Plant Mini Kit 提取 DNA。 0076 用吸光。
41、光度计测定所得 DNA 溶液的浓度, 稀释原液, 使其 OD 值为 1, 浓度约为 50ng/L。PCR 反应体系如表 4 所示 : 0077 表 4 : 20L 的 PCR 反应体系 0078 0079 其中, 上游引物为 SRAP-me6 : 5 -tgagtccaaaccggtag-3 , 0080 下游引物为 SRAP-em4 : 5 -gactgcgtacgaatttga-3 。 0081 PCR 反应温度程序为 : 94预变性 5min ; 94变性 1min, 35退火 1min, 72延伸 1min, 5个循环 ; 94变性1min, 50退火1min, 72延伸1min, 3。
42、5个循环 ; 72延伸10min, 12保存。 0082 将上述扩增产物, 在 1.3% 的琼脂糖凝胶上电泳, 凝胶成像, 分析交配型特异性条 带。经分析发现 : 用引物 SRAP-me6 和 SRAP-em4 扩增获得的片段中, 一部分原生质单核体有 一个长度在 800bp 左右的片段, 另一部分原生质单核体无该条带 (图 2) 。 说 明 书 CN 103305606 B 11 10/10 页 12 0083 2. 特异性条带的回收及克隆测序 0084 2.1 获得目的条带 : 切胶回收 179 号原生质单核体的特异性条带800bp 左右。 切胶回收所用试剂盒为中科瑞泰所提供的琼脂糖凝胶 。
43、DNA 回收试剂盒。按试剂盒中的说明 书操作, 回收特异性片段的 DNA, 用于连接反应, 构建重组载体。 0085 2.2 连接 : 连接体系为 4L DNA 回收液, 4L 的 ddH2O, 0.5L pMD19-T Vector (TaKaRa) , 1L T4DNA 连 接 酶 缓 冲 液 (New England BioLabs), 0.5L T4DNA 连 接 酶 (BioLabs)。在冰上配置该体系后, 将其置于 16的水浴中, 过夜。 0086 2.3 转化 : 将 -70保存的大肠杆菌 TOP10 感受态细胞 (Tiangen) 置于 4解冻。 取 5L 连接液与 50L 的。
44、感受态细胞混合均匀, 冰上放置 30min, 然后 42水浴 90s 后冰 浴 2min, 加入 1mL 的液体 LB 培养基 (氯化钠, 10g/L ; 蛋白胨, 10g/L ; 酵母粉, 5g/L) , 37, 90rpm 条件下复壮 1 小时。 0087 2.4 蓝白斑筛选 : 将复壮好的培养液均匀涂布在添加终浓度为 0.1mg/mL 的氨苄青 霉素钠、 0.024mg/mL的IPTG和0.04mg/mL的固体LB培养基 (液体LB培养基上添加20g/L的 琼脂粉) 上, 涂布均匀后, 37的恒温培养 12-16 小时。待平板中长出蓝白斑之后, 用 10L 的移液器吸取白斑, 接种至含有。
45、终浓度为 0.1mg/mL 氨苄青霉素钠的 LB 液体培养基中, 在 37, 180rpm 培养 12-16 小时。 0088 2.5PCR 验证转化效果并送样测序 : 用引物对 RV-M(5 -GAGCGGATAACAATTTCACACAG G-3 )与M13-47(5 -CGCCAG GGTTTTCCCAGTCACGAC-3 ), 以培养好的菌液做PCR, PCR体系按 表2配制。 反应程序为 : 95预变性5min ; 95变性50s, 57.8退火1min, 72延伸2min, 30 个循环 ; 72延伸 7min, PCR 反应结束后, 用 1% 的琼脂糖凝胶进行电泳, 紫外成像。将具 有目的条带的阳性克隆的菌液委托中美泰和生物技术 (北京) 有限公司进行序列测定。 0089 该 800bp 左右特异性条带的序列测定结果如 SEQ ID No.3, 其大小为 832bp。根据 SEQ ID No.3设计出由SR-64-F和SR-64-R这两条单链DNA组成的PCR引物对SR-64, 其序列如下 : 0090 SR-64-F:5 -AACCGGTAGGCAGTTACTTT-3 (SEQ ID No.1)。