技术领域
本发明涉及能够识别源自SAGE1抗原短肽的TCR，本发明还涉及转导上述TCR来获得的SAGE1特异性的T细胞，及他们在预防和治疗SAGE1相关疾病中的用途。
背景技术
SAGE1作为一种内源性肿瘤抗原，在细胞内生成后被降解成小分子多肽，并与MHC(主组织相容性复合体)分子结合形成复合物，被呈递到细胞表面。研究显示，VFSTVPPAFI是衍生自SAGE1的短肽。SAGE1抗原在黑色素瘤、膀胱癌、肝癌、表皮样癌、非小细胞肺癌和鳞状细胞癌等肿瘤组织中均有表达，而在除睾丸外的多数正常组织中不表达(Martelange V1,De Smet C,De Plaen E,Lurquin C,Boon T.Cancer Res.2000；60(14):3848-55；Atanackovic D,etal.,Cancer BiolTher.2006；5(9):1218-25)。对于上述疾病的治疗，可以采用化疗和放射性治疗等方法，但都会对自身的正常细胞造成损害。
T细胞过继免疫治疗是将对靶细胞抗原具有特异性的反应性T细胞转入病人体内，使其针对靶细胞发挥作用。T细胞受体(TCR)是T细胞表面的一种膜蛋白，其能够识别相应的靶细胞表面的抗原短肽。在免疫系统中，通过抗原短肽特异性的TCR与短肽-主组织相容性复合体(pMHC复合物)的结合引发T细胞与抗原呈递细胞(APC)直接的物理接触，然后T细胞及APC两者的其他细胞膜表面分子就发生相互作用，引起一系列后续的细胞信号传递和其他生理反应，从而使得不同抗原特异性的T细胞对其靶细胞发挥免疫效应。因此，本领域技术人员致力于分离出对SAGE1抗原短肽具有特异性的TCR，使其发挥作用，或者将该TCR转导T细胞来获得对SAGE1抗原短肽具有特异性的T细胞，从而使他们在细胞免疫治疗中发挥作用。
发明内容
本发明的目的在于提供一种识别SAGE1抗原短肽的T细胞受体。
本发明的第一方面，提供了一种T细胞受体(TCR)，所述TCR能够与VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物结合。
在另一优选例中，所述TCR包含TCRα链可变域和TCRβ链可变域，所述TCRα链可变域的CDR3的氨基酸序列为CAVSERARLMF(SEQ ID NO:12)；和/或所述TCRβ链可变域的CDR3的氨基酸序列为CASSLVGFTEAFF(SEQ ID NO:15)。
在另一优选例中，所述TCRα链可变域的3个互补决定区(CDR)为：
αCDR1-SSVPPY(SEQ ID NO:10)
αCDR2-YTSAATLV(SEQ ID NO:11)
αCDR3-CAVSERARLMF(SEQ ID NO:12)；和/或
所述TCRβ链可变域的3个互补决定区为：
βCDR1-SGHDT(SEQ ID NO:13)
βCDR2-YYEEEE(SEQ ID NO:14)
βCDR3-CASSLVGFTEAFF(SEQ ID NO:15)。
在另一优选例中，所述TCR包含TCRα链可变域和TCRβ链可变域，所述 TCRα链可变域为与SEQ ID NO:1具有至少90％序列相同性的氨基酸序列；和/或所述TCRβ链可变域为与SEQ ID NO：5具有至少90％序列相同性的氨基酸序列。
在另一优选例中，所述TCR包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。
在另一优选例中，所述TCR包含β链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:5。
在另一优选例中，所述TCR为αβ异质二聚体，其包含TCRα链恒定区TRAC*01和TCRβ链恒定区TRBC1*01或TRBC2*01。
在另一优选例中，所述TCR的α链氨基酸序列为SEQ ID NO：3和/或所述TCR的β链氨基酸序列为SEQ ID NO:7。
在另一优选例中，所述TCR是可溶的。
在另一优选例中，所述TCR为单链。
在另一优选例中，所述TCR是由α链可变域与β链可变域通过肽连接序列连接而成。
在另一优选例中，所述TCR在α链可变区氨基酸第11、13、19、21、53、76、89、91、或第94位，和/或α链J基因短肽氨基酸倒数第3位、倒数第5位或倒数第7位中具有一个或多个突变；和/或所述TCR在β链可变区氨基酸第11、13、19、21、53、76、89、91、或第94位，和/或β链J基因短肽氨基酸倒数第2位、倒数第4位或倒数第6位中具有一个或多个突变，其中氨基酸位置编号按IMGT(国际免疫遗传学信息系统)中列出的位置编号。
在另一优选例中，所述TCR包括(a)除跨膜结构域以外的全部或部分TCRα链；以及(b)除跨膜结构域以外的全部或部分TCRβ链；
并且(a)和(b)各自包含功能性可变结构域,或包含功能性可变结构域和所述TCR链恒定结构域的至少一部分。
在另一优选例中，半胱氨酸残基在所述TCR的α和β链恒定域之间形成人工二硫键。
在另一优选例中，在所述TCR中形成人工二硫键的半胱氨酸残基取代了选自下列的一组或多组位点：
TRAC*01外显子1的Thr48和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser57；
TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser77；
TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser17；
TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Asp59；
TRAC*01外显子1的Ser15和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu15；
TRAC*01外显子1的Arg53和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser54；
TRAC*01外显子1的Pro89和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ala19；和
TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu20。
在另一优选例中，所述TCR的α链氨基酸序列为SEQ ID NO:26和/或所述TCR的β链氨基酸序列为SEQ ID NO:28。
在另一优选例中，所述TCR的α链可变区与β链恒定区之间含有人工链间二硫键。
在另一优选例中，其特征在于，在所述TCR中形成人工链间二硫键的半胱氨酸残基取代了选自下列的一组或多组位点：
TRAV的第46位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第60位氨基酸；
TRAV的第47位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的61位氨基酸；
TRAV的第46位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第61位氨基酸；或
TRAV的第47位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第60位氨基酸。
在另一优选例中，所述TCR包含α链可变域和β链可变域以及除跨膜结构域以外的全部或部分β链恒定域，但其不包含α链恒定域，所述TCR的α链可变域与β链形成异质二聚体。
在另一优选例中，所述TCR的α链和/或β链的C-或N-末端结合有偶联物。
在另一优选例中，与所述T细胞受体结合的偶联物为可检测标记物、治疗剂、PK修饰部分或任何这些物质的组合。优选地，所述治疗剂为抗-CD3抗体。
本发明的第二方面，提供了一种多价TCR复合物，其包含至少两个TCR分子，并且其中的至少一个TCR分子为本发明第一方面所述的TCR。
本发明的第三方面，提供了一种核酸分子，所述核酸分子包含编码本发明第一方面所述的TCR分子的核酸序列或其互补序列。
在另一优选例中，所述核酸分子包含编码TCRα链可变域的核苷酸序列SEQ ID NO：2。
在另一优选例中，所述的核酸分子包含编码TCRβ链可变域的核苷酸序列SEQ ID NO：6。
在另一优选例中，所述核酸分子包含编码TCRα链的核苷酸序列SEQ ID NO：4和/或包含编码TCRβ链的核苷酸序列SEQ ID NO：8。
本发明的第四方面，提供了一种载体，所述的载体含有本发明第三方面所述的核酸分子；优选地，所述的载体为病毒载体；更优选地，所述的载体为慢病毒载体。
本发明的第五方面，提供了一种分离的宿主细胞，所述的宿主细胞中含有本发明第四方面所述的载体或基因组中整合有外源的本发明第三方面所述的核酸分子。
本发明的第六方面，提供了一种细胞，所述细胞转导本发明第三方面所述的核酸分子或本发明第四方面所述的载体；优选地，所述细胞为T细胞或干细胞。
本发明的第七方面，提供了一种药物组合物，所述组合物含有药学上可接受的载体以及本发明第一方面所述的TCR、本发明第二方面所述的TCR复合物、本发明第三方面所述的核酸分子、本发明第四方面所述的载体、或本发明第六方面所述的细胞。
本发明的第八方面，提供了本发明第一方面所述的T细胞受体、或本发明第二方面所述的TCR复合物、本发明第三方面所述的核酸分子、本发明第四方面所述的载体、或本发明第六方面所述的细胞的用途，用于制备治疗肿瘤或自身免疫疾病的药物。
本发明的第九方面，提供了一种治疗疾病的方法，包括给需要治疗的对象施用适量的本发明第一方面所述的T细胞受体、或本发明第二方面所述的TCR复合物、本发明第三方面所述的核酸分子、本发明第四方面所述的载体、或本发明第六方面所述的细胞、或本发明第七方面所述的药物组合物；
优选地，所述的疾病为肿瘤，优选地所述肿瘤包括黑色素瘤，以及其他实体肿瘤如胃癌、肺癌、食道癌、膀胱癌、头颈部鳞状细胞癌、前列腺癌、乳腺癌、结肠癌、卵巢癌、肝癌、表皮样癌、非小细胞肺癌和鳞状细胞癌等。
应理解，在本发明范围内中，本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合，从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅，在此不再一一累述。
附图说明
图1a、图1b、图1c、图1d、图1e和图1f分别为TCRα链可变域氨基酸序列、TCRα链可变域核苷酸序列、TCRα链氨基酸序列、TCRα链核苷酸序列、具有前导序列的TCRα链氨基酸序列以及具有前导序列的TCRα链核苷酸序列。
图2a、图2b、图2c、图2d、图2e和图2f分别为TCRβ链可变域氨基酸序列、TCRβ链可变域核苷酸序列、TCRβ链氨基酸序列、TCRβ链核苷酸序列、具有前导序列的TCRβ链氨基酸序列以及具有前导序列的TCRβ链核苷酸序列。
图3为单克隆细胞的CD8+及四聚体-PE双阳性染色结果。
图4a和图4b分别为可溶性TCRα链的氨基酸序列和核苷酸序列。
图5a和图5b分别为可溶性TCRβ链的氨基酸序列和核苷酸序列。
图6为纯化后得到的可溶性TCR的胶图。最左侧泳道为分子量标记(marker)，中间泳道为非还原胶，最右侧泳道为还原胶。
图7为本发明可溶性TCR与VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物结合的BIAcore动力学图谱。
图8显示转导本发明TCR的T细胞对负载其特异的短肽的靶细胞有很好的激活反应，对未负载相应短肽的靶细胞及负载非特异短肽的靶细胞没有激活反应。
图9显示，本发明TCR转导的T细胞对特异性靶细胞95D的杀伤作用明显；对非特异性靶细胞NCI-H1299、IM 9无杀伤作用。
具体实施方式
本发明人经过广泛而深入的研究，找到了与SAGE1抗原短肽VFSTVPPAFI(SEQ ID NO:9)能够特异性结合的TCR，所述抗原短肽VFSTVPPAFI可与HLA A2402形成复合物并一起被呈递到细胞表面。本发明还提供了编码所述TCR的核酸分子以及包含所述核酸分子的载体。另外，本发明还提供了转导本发明TCR的细胞。
术语
MHC分子是免疫球蛋白超家族的蛋白质，可以是Ⅰ类或Ⅱ类MHC分子。因此，其对于抗原的呈递具有特异性，不同的个体有不同的MHC，能呈递一种蛋白抗原中不同的短肽到各自的APC细胞表面。人类的MHC通常称为HLA基因或HLA复合体。
T细胞受体(TCR)，是呈递在主组织相容性复合体(MHC)上的特异性抗原肽的唯一受体。在免疫系统中，通过抗原特异性的TCR与pMHC复合物的结合引发T细胞与抗原呈递细胞(APC)直接的物理接触，然后T细胞及APC两者的其他细胞膜表面分子就发生相互作用，这就引起了一系列后续的细胞信号传递和 其他生理反应，从而使得不同抗原特异性的T细胞对其靶细胞发挥免疫效应。
TCR是由α链/β链或者γ链/δ链以异质二聚体形式存在的细胞膜表面的糖蛋白。在95％的T细胞中TCR异质二聚体由α和β链组成，而5％的T细胞具有由γ和δ链组成的TCR。天然αβ异质二聚TCR具有α链和β链，α链和β链构成αβ异源二聚TCR的亚单位。广义上讲，α和β各链包含可变区、连接区和恒定区，β链通常还在可变区和连接区之间含有短的多变区，但该多变区常视作连接区的一部分。各可变区包含嵌合在框架结构(framework regions)中的3个CDR(互补决定区)，CDR1、CDR2和CDR3。CDR区决定了TCR与pMHC复合物的结合，其中CDR3由可变区和连接区重组而成，被称为超变区。TCR的α和β链一般看作各有两个“结构域”即可变域和恒定域，可变域由连接的可变区和连接区构成。TCR恒定域的序列可以在国际免疫遗传学信息系统(IMGT)的公开数据库中找到，如TCR分子α链的恒定域序列为“TRAC*01”，TCR分子β链的恒定域序列为“TRBC1*01”或“TRBC2*01”。此外，TCR的α和β链还包含跨膜区和胞质区，胞质区很短。
在本发明中，术语“本发明多肽”、“本发明的TCR”、“本发明的T细胞受体”可互换使用。
天然链间二硫键与人工链间二硫键
在天然TCR的近膜区Cα与Cβ链间存在一组二硫键，本发明中称为“天然链间二硫键”。在本发明中，将人工引入的，位置与天然链间二硫键的位置不同的链间共价二硫键称为“人工链间二硫键”。
为方便描述二硫键的位置，本发明中TRAC*01与TRBC1*01或TRBC2*01氨基酸序列的位置编号按从N端到C端依次的顺序进行位置编号，如TRBC1*01或TRBC2*01中，按从N端到C端依次的顺序第60个氨基酸为P(脯氨酸)，则本发明中可将其描述为TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Pro60，也可将其表述为TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第60位氨基酸，又如TRBC1*01或TRBC2*01中，按从N端到C端依次的顺序第61个氨基酸为Q(谷氨酰胺)，则本发明中可将其描述为TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Gln61，也可将其表述为TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第61位氨基酸，其他以此类推。本发明中，可变区TRAV与TRBV的氨基酸序列的位置编号，按照IMGT中列出的位置编号。如TRAV中的某个氨基酸，IMGT中列出的位置编号为46，则本发明中将其描述为TRAV第46位氨基酸，其他以此类推。本发明中，其他氨基酸的序列位置编号有特殊说明的，则按特殊说明。
发明详述
TCR分子
在抗原加工过程中，抗原在细胞内被降解，然后通过MHC分子携带至细胞表面。T细胞受体能够识别抗原呈递细胞表面的肽-MHC复合物。因此，本发明的第一方面提供了一种能够结合VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物的TCR分子。优选地，所述TCR分子是分离的或纯化的。该TCR的α和β链各具有3个互补决定区(CDR)。
在本发明的一个优选地实施方式中，所述TCR的α链包含具有以下氨基酸序列的CDR：
αCDR1-SSVPPY(SEQ ID NO:10)
αCDR2-YTSAATLV(SEQ ID NO:11)
αCDR3-CAVSERARLMF(SEQ ID NO:12)；和/或
所述TCRβ链可变域的3个互补决定区为：
βCDR1-SGHDT(SEQ ID NO:13)
βCDR2-YYEEEE(SEQ ID NO:14)
βCDR3-CASSLVGFTEAFF(SEQ ID NO:15)。
可以将上述本发明的CDR区氨基酸序列嵌入到任何适合的框架结构中来制备嵌合TCR。只要框架结构与本发明的TCR的CDR区兼容，本领域技术人员根据本发明公开的CDR区就能够设计或合成出具有相应功能的TCR分子。因此，本发明TCR分子是指包含上述α和/或β链CDR区序列及任何适合的框架结构的TCR分子。本发明TCRα链可变域为与SEQ ID NO:1具有至少90％，优选地95％，更优选地98％序列相同性的氨基酸序列；和/或本发明TCRβ链可变域为与SEQ ID NO：5具有至少90％，优选地95％，更优选地98％序列相同性的氨基酸序列。
在本发明的一个优选例中，本发明的TCR分子是由α与β链构成的异质二聚体。具体地，一方面所述异质二聚TCR分子的α链包含可变域和恒定域，所述α链可变域氨基酸序列包含上述α链的CDR1(SEQ ID NO：10)、CDR2(SEQ ID NO：11)和CDR3(SEQ ID NO:12)。优选地，所述TCR分子包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。更优选地，所述TCR分子的α链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:1。另一方面，所述异质二聚TCR分子的β链包含可变域和恒定域，所述β链可变域氨基酸序列包含上述β链的CDR1(SEQ ID NO:13)、CDR2(SEQ ID NO：14)和CDR3(SEQ ID NO:15)。优选地，所述TCR分子包含β链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:5。更优选地，所述TCR分子的β链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:5。
在本发明的一个优选例中，本发明的TCR分子是由α链的部分或全部和/或β链的部分或全部组成的单链TCR分子。有关单链TCR分子的描述可以参考文献Chung et al(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91,12654-12658。根据文献中所述，本领域技术人员能够容易地构建包含本发明CDRs区的单链TCR分子。具体地，所述单链TCR分子包含Vα、Vβ和Cβ，优选地按照从N端到C端的顺序连接。
所述单链TCR分子的α链可变域氨基酸序列包含上述α链的CDR1(SEQ ID NO：10)、CDR2(SEQ ID NO：11)和CDR3(SEQ ID NO:12)。优选地，所述单链TCR分子包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。更优选地，所述单链TCR分子的α链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:1。所述单链TCR分子的β链可变域氨基酸序列包含上述β链的CDR1(SEQ ID NO：13)、CDR2(SEQ ID NO：14)和CDR3(SEQ ID NO：15)。优选地，所述单链TCR分子包含β链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:5。更优选地，所述单链TCR分子的β链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:5。
在本发明的一个优选例中，本发明的TCR分子的恒定域是人的恒定域。本领域技术人员知晓或可以通过查阅相关书籍或IMGT(国际免疫遗传学信息系统)的公开数据库来获得人的恒定域氨基酸序列。例如，本发明TCR分子α链的恒定域序列可以为“TRAC*01”，TCR分子β链的恒定域序列可以为“TRBC1*01”或“TRBC2*01”。IMGT的TRAC*01中给出的氨基酸序列的第53位为Arg，在此表示为：TRAC*01外显子1的Arg53，其他以此类推。优选地，本发明TCR分子α链的氨基酸序列为SEQ ID NO:3，和/或β链的氨基酸序列为SEQ ID NO:7。
天然存在的TCR是一种膜蛋白，通过其跨膜区得以稳定。如同免疫球蛋白(抗体)作为抗原识别分子一样，TCR也可以被开发应用于诊断和治疗，这时需 要获得可溶性的TCR分子。可溶性的TCR分子不包括其跨膜区。可溶性TCR有很广泛的用途，它不仅可用于研究TCR与pMHC的相互作用，也可用作检测感染的诊断工具或作为自身免疫病的标志物。类似地，可溶性TCR可以被用来将治疗剂(如细胞毒素化合物或免疫刺激性化合物)输送到呈递特异性抗原的细胞，另外，可溶性TCR还可与其他分子(如，抗-CD3抗体)结合来重新定向T细胞，从而使其靶向呈递特定抗原的细胞。本发明也获得了对SAGE1抗原短肽具有特异性的可溶性TCR。
为获得可溶性TCR，一方面，本发明TCR可以是在其α和β链恒定域的残基之间引入人工二硫键的TCR。半胱氨酸残基在所述TCR的α和β链恒定域间形成人工链间二硫键。半胱氨酸残基可以取代在天然TCR中合适位点的其他氨基酸残基以形成人工链间二硫键。例如，取代TRAC*01外显子1的Thr48和取代TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser57的半胱氨酸残基来形成二硫键。引入半胱氨酸残基以形成二硫键的其他位点还可以是：TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser77；TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser17；TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Asp59；TRAC*01外显子1的Ser15和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu15；TRAC*01外显子1的Arg53和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser54；TRAC*01外显子1的Pro89和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ala19；或TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu20。即半胱氨酸残基取代了上述α与β链恒定域中任一组位点。可在本发明TCR恒定域的一个或多个C末端截短最多50个、或最多30个、或最多15个、或最多10个、或最多8个或更少的氨基酸，以使其不包括半胱氨酸残基来达到缺失天然二硫键的目的，也可通过将形成天然二硫键的半胱氨酸残基突变为另一氨基酸来达到上述目的。
如上所述，本发明的TCR可以包含在其α和β链恒定域的残基间引入的人工二硫键。应注意，恒定域间含或不含上文所述的引入的人工二硫键，本发明的TCR均可含有TRAC恒定域序列和TRBC1或TRBC2恒定域序列。TCR的TRAC恒定域序列和TRBC1或TRBC2恒定域序列可通过存在于TCR中的天然二硫键连接。
为获得可溶性TCR，另一方面，本发明TCR还包括在其疏水芯区域发生突变的TCR，这些疏水芯区域的突变优选为能够使本发明可溶性TCR的稳定性提高的突变，如在公开号为WO2014/206304的专利文献中所述。这样的TCR可在其下列可变域疏水芯位置发生突变：(α和/或β链)可变区氨基酸第11，13，19，21，53，76，89，91，94位，和/或α链J基因(TRAJ)短肽氨基酸位置倒数第3,5,7位,和/或β链J基因(TRBJ)短肽氨基酸位置倒数第2,4,6位，其中氨基酸序列的位置编号按国际免疫遗传学信息系统(IMGT)中列出的位置编号。本领域技术人员知晓上述国际免疫遗传学信息系统，并可根据该数据库得到不同TCR的氨基酸残基在IMGT中的位置编号。
本发明中疏水芯区域发生突变的TCR可以是由一柔性肽链连接TCR的α与β链的可变域而构成的稳定性可溶单链TCR。应注意，本发明中柔性肽链可以是任何适合连接TCRα与β链可变域的肽链。
另外，对于稳定性而言，专利文献PCT/CN2016/077680还公开了在TCR的α链可变区与β链恒定区之间引入人工链间二硫键能够使TCR的稳定性显著提高。因此，本发明的高亲和力TCR的α链可变区与β链恒定区之间还可以含有人工链间二硫键。具体地，在所述TCR的α链可变区与β链恒定区之间形成人工链间二硫键的半胱氨酸残基取代了：TRAV的第46位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第60位氨基酸；TRAV的第47位氨基酸和TRBC1*01或 TRBC2*01外显子1的61位氨基酸；TRAV的第46位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第61位氨基酸；或TRAV的第47位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第60位氨基酸。优选地，这样的TCR可以包含(ⅰ)除其跨膜结构域以外的全部或部分TCRα链，和(ⅱ)除其跨膜结构域以外的全部或部分TCRβ链，其中(ⅰ)和(ⅱ)均包含TCR链的可变域和至少一部分恒定域，α链与β链形成异质二聚体。更优选地，这样的TCR可以包含α链可变域和β链可变域以及除跨膜结构域以外的全部或部分β链恒定域，但其不包含α链恒定域，所述TCR的α链可变域与β链形成异质二聚体。
本发明的TCR也可以多价复合体的形式提供。本发明的多价TCR复合体包含两个、三个、四个或更多个本发明TCR相结合而形成的多聚物，如可以用p53的四聚结构域来产生四聚体，或多个本发明TCR与另一分子结合而形成的复合物。本发明的TCR复合物可用于体外或体内追踪或靶向呈递特定抗原的细胞，也可用于产生具有此类应用的其他多价TCR复合物的中间体。
本发明的TCR可以单独使用，也可与偶联物以共价或其他方式结合，优选以共价方式结合。所述偶联物包括可检测标记物(为诊断目的，其中所述TCR用于检测呈递VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物的细胞的存在)、治疗剂、PK(蛋白激酶)修饰部分或任何以上这些物质的组合结合或偶联。
用于诊断目的的可检测标记物包括但不限于：荧光或发光标记物、放射性标记物、MRI(磁共振成像)或CT(电子计算机X射线断层扫描技术)造影剂、或能够产生可检测产物的酶。
可与本发明TCR结合或偶联的治疗剂包括但不限于：1.放射性核素(Koppe等，2005，癌转移评论(Cancer metastasis reviews)24，539)；2.生物毒(Chaudhary等，1989，自然(Nature)339，394；Epel等，2002，癌症免疫学和免疫治疗(Cancer Immunology and Immunotherapy)51，565)；3.细胞因子如IL-2等(Gillies等，1992，美国国家科学院院刊(PNAS)89，1428；Card等，2004，癌症免疫学和免疫治疗(Cancer Immunology and Immunotherapy)53，345；Halin等，2003，癌症研究(Cancer Research)63，3202)；4.抗体Fc片段(Mosquera等，2005，免疫学杂志(The Journal Of Immunology)174，4381)；5.抗体scFv片段(Zhu等，1995，癌症国际期刊(International Journal of Cancer)62,319)；6.金纳米颗粒/纳米棒(Lapotko等，2005，癌症通信(Cancer letters)239，36；Huang等，2006，美国化学学会杂志(Journal of the American Chemical Society)128，2115)；7.病毒颗粒(Peng等，2004，基因治疗(Gene therapy)11，1234)；8.脂质体(Mamot等，2005，癌症研究(Cancer research)65，11631)；9.纳米磁粒；10.前药激活酶(例如，DT-心肌黄酶(DTD)或联苯基水解酶-样蛋白质(BPHL))；11.化疗剂(例如，顺铂)或任何形式的纳米颗粒等。
另外，本发明的TCR还可以是包含衍生自超过一种物种序列的杂合TCR。例如，有研究显示鼠科TCR在人T细胞中比人TCR能够更有效地表达。因此，本发明TCR可包含人可变域和鼠的恒定域。这一方法的缺陷是可能引发免疫应答。因此，在其用于过继性T细胞治疗时应当有调节方案来进行免疫抑制，以允许表达鼠科的T细胞的植入。
应理解，本文中氨基酸名称采用国际通用的单英文字母或三英文字母表示，氨基酸名称的单英文字母与三英文字母的对应关系如下：Ala(A)、Arg(R)、Asn(N)、Asp(D)、Cys(C)、Gln(Q)、Glu(E)、Gly(G)、His(H)、Ile(I)、Leu(L)、Lys(K)、Met(M)、Phe(F)、Pro(P)、Ser(S)、Thr(T)、Trp(W)、Tyr(Y)、Val(V)。
核酸分子
本发明的第二方面提供了编码本发明第一方面TCR分子或其部分的核酸分子，所述部分可以是一个或多个CDR，α和/或β链的可变域，以及α链和/或β链。
编码本发明第一方面TCR分子α链CDR区的核苷酸序列如下：
αCDR1-(SEQ ID NO:16)
αCDR2-(SEQ ID NO:17)
αCDR3-(SEQ ID NO:18)
编码本发明第一方面TCR分子β链CDR区的核苷酸序列如下：
βCDR1-(SEQ ID NO:19)
βCDR2-(SEQ ID NO:20)
βCDR3-(SEQ ID NO:21)
因此，编码本发明TCRα链的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:18，和/或编码本发明TCRβ链的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:21。
本发明核酸分子的核苷酸序列可以是单链或双链的，该核酸分子可以是RNA或DNA，并且可以包含或不包含内含子。优选地，本发明核酸分子的核苷酸序列不包含内含子但能够编码本发明多肽，例如编码本发明TCRα链可变域的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:2和/或编码本发明TCRβ链可变域的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:6。更优选地，本发明核酸分子的核苷酸序列包含SEQ ID NO:4和/或SEQ ID NO:8。
应理解，由于遗传密码的简并，不同的核苷酸序列可以编码相同的多肽。因此，编码本发明TCR的核酸序列可以与本发明附图中所示的核酸序列相同或是简并的变异体。以本发明中的其中一个例子来说明，“简并的变异体”是指编码具有SEQ ID NO:1的蛋白序列，但与SEQ ID NO:2的序列有差别的核酸序列。
核苷酸序列可以是经密码子优化的。不同的细胞在具体密码子的利用上是不同的，可以根据细胞的类型，改变序列中的密码子来增加表达量。哺乳动物细胞以及多种其他生物的密码子选择表是本领域技术人员公知的。
本发明的核酸分子全长序列或其片段通常可以用但不限于PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。目前，已经可以完全通过化学合成来得到编码本发明TCR(或其片段，或其衍生物)的DNA序列。然后可将该DNA序列引入本领域中已知的各种现有的DNA分子(或如载体)和细胞中。DNA可以是编码链或非编码链。
载体
本发明还涉及包含本发明的核酸分子的载体，包括表达载体，即能够在体内或体外表达的构建体。常用的载体包括细菌质粒、噬菌体和动植物病毒。
病毒递送系统包括但不限于腺病毒载体、腺相关病毒(AAV)载体、疱疹病毒载体、逆转录病毒载体、慢病毒载体、杆状病毒载体。
优选地，载体可以将本发明的核苷酸转移至细胞中，例如T细胞中，使得该细胞表达SAGE1抗原特异性的TCR。理想的情况下，该载体应当能够在T细胞中持续高水平地表达。
细胞
本发明还涉及用本发明的载体或编码序列经基因工程产生的宿主细胞。所述宿主细胞中含有本发明的载体或染色体中整合有本发明的核酸分子。宿主细 胞选自：原核细胞和真核细胞，例如大肠杆菌、酵母细胞、CHO细胞等。
另外，本发明还包括表达本发明的TCR的分离的细胞，特别是T细胞。该T细胞可衍生自从受试者分离的T细胞，或者可以是从受试者中分离的混合细胞群，诸如外周血淋巴细胞(PBL)群的一部分。如，该细胞可以分离自外周血单核细胞(PBMC)，可以是CD4+辅助T细胞或CD8+细胞毒性T细胞。该细胞可在CD4+辅助T细胞/CD8+细胞毒性T细胞的混合群中。一般地，该细胞可以用抗体(如，抗-CD3或抗-CD28的抗体)活化，以便使它们能够更容易接受转染，例如用包含编码本发明TCR分子的核苷酸序列的载体进行转染。
备选地，本发明的细胞还可以是或衍生自干细胞，如造血干细胞(HSC)。将基因转移至HSC不会导致在细胞表面表达TCR，因为干细胞表面不表达CD3分子。然而，当干细胞分化为迁移至胸腺的淋巴前体(lymphoid precursor)时，CD3分子的表达将启动在胸腺细胞的表面表达该引入的TCR分子。
有许多方法适合于用编码本发明TCR的DNA或RNA进行T细胞转染(如，Robbins等.，(2008)J.Immunol.180:6116-6131)。表达本发明TCR的T细胞可以用于过继免疫治疗。本领域技术人员能够知晓进行过继性治疗的许多合适方法(如，Rosenberg等.，(2008)Nat Rev Cancer8(4)：299-308)。
SAGE1抗原相关疾病
本发明还涉及在受试者中治疗和/或预防与SAGE1相关疾病的方法，其包括过继性转移SAGE1特异性T细胞至该受试者的步骤。该SAGE1特异性T细胞可识别VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物。
本发明的SAGE1特异性的T细胞可用于治疗任何呈递SAGE1抗原短肽VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物的SAGE1相关疾病。包括但不限于肿瘤，如黑色素瘤，以及其他实体肿瘤如膀胱癌、肝癌、表皮样癌、非小细胞肺癌和鳞状细胞癌等。
治疗方法
可以通过分离患有与SAGE1抗原相关疾病的病人或志愿者的T细胞，并将本发明的TCR导入上述T细胞中，随后将这些基因工程修饰的细胞回输到病人体内来进行治疗。因此，本发明提供了一种治疗SAGE1相关疾病的方法，包括将分离的表达本发明TCR的T细胞，优选地，该T细胞来源于病人本身，输入到病人体内。一般地，包括(1)分离病人的T细胞，(2)用本发明核酸分子或能够编码本发明TCR分子的核酸分子体外转导T细胞，(3)将基因工程修饰的T细胞输入到病人体内。分离、转染及回输的细胞的数量可以由医师决定。
本发明的主要优点在于：
(1)本发明的TCR能够与SAGE1抗原短肽复合物VFSTVPPAFI-HLA A2402结合，同时转导了本发明TCR的细胞能够被特异性激活并且对靶细胞具有很强的杀伤作用。
下面的具体实施例，进一步阐述本发明。应理解，这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件，例如(Sambrook和Russell等人，分子克隆：实验室手册(Molecular Cloning-A Laboratory Manual)(第三版)(2001)CSHL出版社)中所述的条件，或按照制造厂商所建议的条件。除非另外说明，否则百分比和份数按重量计算。除非另外说明，否则百分比和份数按重量计算。以下实施例中所用的实验材料和试剂如无特别说明均可从市售渠道获得。
实施例1克隆SAGE1特异性T细胞
利用合成短肽(北京赛百盛基因技术有限公司)VFSTVPPAFI(SEQ ID NO.9，本发明中命名为PX149)刺激来自于基因型为HLA-A2402的健康志愿者的外周血淋巴细胞(PBL)。将短肽与带有生物素标记的HLA-A*2402复性,制备pHLA单聚体。这些单聚体与用PE标记的链霉亲和素(BD公司)组合成PE标记的四聚体，分选该四聚体及抗CD8-APC双阳性细胞。扩增分选的细胞，并按上述方法进行二次分选，随后用有限稀释法进行单克隆培养。
由于整个实验流程耗时较长，影响因素极多，实验比较复杂，细胞的表现根本无法预测，即使经过层层的筛选与严格的检测，获得相应的T细胞单克隆的成功率也非常低。一般情况下仅经过几个批次的实验很难获得具有理想活性的TCR。
在本发明中，经过发明人深入的研究与大量的实验，最终得到了满足条件的双阳性单克隆细胞。单克隆细胞用四聚体染色，筛选到的双阳性克隆如图3所示。
即使成功地筛选获得了T细胞单克隆，由此而得到的TCR也不一定能够满足要求，因为很多情况下，得到的TCR不能够被成功复性，或者复性后与相应表位的亲和力很差，甚至无法结合。需要进一步地结合活性的验证。
实施例2获取SAGE1特异性T细胞克隆的TCR基因与载体的构建
用Quick-RNATM MiniPrep(ZYMO research)抽提实施例1中筛选到的VFSTVPPAFI特异性、HLA-A2402限制性的T细胞克隆的总RNA。cDNA的合成采用clontech的SMART RACE cDNA扩增试剂盒，采用的引物是设计在在人类TCR基因的C端保守区。将序列克隆至T载体(TAKARA)上进行测序。经测序，该双阳性克隆表达的TCR的α链和β链序列结构分别如图1a-图1f和图2a-图2f所示，图1a、图1b、图1c和图1d分别为TCRα链可变域氨基酸序列、TCRα链可变域核苷酸序列、TCRα链氨基酸序列和TCRα链核苷酸序列；图2a、图2b、图2c和图2d分别为TCRβ链可变域氨基酸序列、TCRβ链可变域核苷酸序列、TCRβ链氨基酸序列和TCRβ链核苷酸序列。
经鉴定，α链包含具有以下氨基酸序列的CDR：
αCDR1-SSVPPY(SEQ ID NO:10)
αCDR2-YTSAATLV(SEQ ID NO:11)
αCDR3-CAVSERARLMF(SEQ ID NO:12)
β链包含具有以下氨基酸序列的CDR：
βCDR1-SGHDT(SEQ ID NO:13)
βCDR2-YYEEEE(SEQ ID NO:14)
βCDR3-CASSLVGFTEAFF(SEQ ID NO:15)。
通过重叠(overlap)PCR分别将TCRα链和β链的可变域各自与小鼠TCRα链和β链的保守域拼接成全长基因并连接至慢病毒表达载体pLenti(addgene)。具体为：用overlap PCR将TCRα链和TCRβ链的V区基因分别与小鼠TCRα链和TCRβ链的保守区C区进行连接得到TCRα-2A-TCRβ片段。将慢病毒表达载体及TCRα-2A-TCRβ酶切连接得到pLenti-SAGE1TRA-2A-TRB-IRES-NGFR质粒。作为对照用,同时也构建表达eGFP的慢病毒载体pLenti-eGFP。之后再用293T/17包装假病毒。
实施例3 SAGE1抗原短肽特异性可溶TCR的表达、重折叠和纯化
为获得可溶的TCR分子，本发明的TCR分子的α和β链可以分别只包含其可变域及部分恒定域，并且α和β链的恒定域中分别引入了一个半胱氨酸残基以形成人工链间二硫键，引入半胱氨酸残基的位置分别为TRAC*01外显子1的Thr48和TRBC2*01外显子1的Ser57；其α链的氨基酸序列与核苷酸序列分别如图4a和图4b所示，其β链的氨基酸序列与核苷酸序列分别如图5a和图5b所示，引入的半胱氨酸残基以加粗和加下划线字母表示。通过＜＜分子克隆实验室手册＞＞(Molecular Cloning a Laboratory Manual)(第三版，Sambrook和Russell)中描述的标准方法将上述TCRα和β链的目的基因序列经合成后分别插入到表达载体pET28a+(Novagene)，上下游的克隆位点分别是NcoI和NotI。插入片段经过测序确认无误。
将TCRα和β链的表达载体分别通过化学转化法转化进入表达细菌BL21(DE3),细菌用LB培养液生长，于OD600＝0.6时用终浓度0.5mM IPTG诱导，TCR的α和β链表达后形成的包涵体通过BugBuster Mix(Novagene)进行提取，并且经BugBuster溶液反复多次洗涤，包涵体最后溶解于6M盐酸胍,10mM二硫苏糖醇(DTT),10mM乙二胺四乙酸(EDTA),20mM Tris(pH 8.1)中。
溶解后的TCRα和β链以1：1的质量比快速混合于5M尿素,0.4M精氨酸,20mM Tris(pH 8.1),3.7mM cystamine,6.6mMβ-mercapoethylamine(4℃)中，终浓度为60mg/mL。混合后将溶液置于10倍体积的去离子水中透析(4℃)，12小时后将去离子水换成缓冲液(20mM Tris,pH 8.0)继续于4℃透析12小时。透析完成后的溶液经0.45μM的滤膜过滤后，通过阴离子交换柱(HiTrap Q HP,5ml,GE Healthcare)纯化。洗脱峰含有复性成功的α和β二聚体的TCR通过SDS-PAGE胶确认。TCR随后通过凝胶过滤层析(HiPrep 16/60，Sephacryl S-100HR，GE Healthcare)进一步纯化。纯化后的TCR纯度经过SDS-PAGE测定大于90％，浓度由BCA法确定。本发明得到的可溶性TCR的SDS-PAGE胶图如图6所示。
实施例4 结合表征
BIAcore分析
本实施例证明了可溶性的本发明TCR分子能够与VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物特异性结合。
使用BIAcore T200实时分析系统检测实施例3和实施例5中得到的TCR分子与VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物的结合活性。将抗链霉亲和素的抗体(GenScript)加入偶联缓冲液(10mM醋酸钠缓冲液，pH 4.77)，然后将抗体流过预先用EDC和NHS活化过的CM5芯片，使抗体固定在芯片表面，最后用乙醇胺的盐酸溶液封闭未反应的活化表面，完成偶联过程，偶联水平约为15，000RU。
使低浓度的链霉亲和素流过已包被抗体的芯片表面，然后将VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物流过检测通道，另一通道作为参比通道，再将0.05mM的生物素以10μL/min的流速流过芯片2min，封闭链霉亲和素剩余的结合位点。
上述VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物的制备过程如下：
a.纯化
收集100ml诱导表达重链或轻链的E.coli菌液，于4℃8000g离心10min后用10ml PBS洗涤菌体一次，之后用5ml BugBuster Master Mix Extraction Reagents(Merck)剧烈震荡重悬菌体，并于室温旋转孵育20min，之后于4℃，6000g离心15min，弃去上清，收集包涵体。
将上述包涵体重悬于5ml BugBuster Master Mix中，室温旋转孵育5min；加30ml稀释10倍的BugBuster，混匀，4℃6000g离心15min；弃去上清，加30ml稀释10倍的BugBuster重悬包涵体，混匀，4℃6000g离心15min， 重复两次，加30ml 20mM Tris-HCl pH 8.0重悬包涵体，混匀，4℃6000g离心15min，最后用20mM Tris-HCl 8M尿素溶解包涵体，SDS-PAGE检测包涵体纯度，BCA试剂盒测浓度。
b.复性
将合成的短肽VFSTVPPAFI(北京赛百盛基因技术有限公司)溶解于DMSO至20mg/ml的浓度。轻链和重链的包涵体用8M尿素、20mM Tris pH 8.0、10mM DTT来溶解，复性前加入3M盐酸胍、10mM醋酸钠、10mM EDTA进一步变性。将VFSTVPPAFI肽以25mg/L(终浓度)加入复性缓冲液(0.4M L-精氨酸、100mM Tris pH 8.3、2mM EDTA、0.5mM氧化性谷胱甘肽、5mM还原型谷胱甘肽、0.2mM PMSF，冷却至4℃)，然后依次加入20mg/L的轻链和90mg/L的重链(终浓度，重链分三次加入，8h/次)，复性在4℃进行至少3天至完成，SDS-PAGE检测能否复性成功。
c.复性后纯化
用10体积的20mM Tris pH 8.0作透析来更换复性缓冲液，至少更换缓冲液两次来充分降低溶液的离子强度。透析后用0.45μm醋酸纤维素滤膜过滤蛋白质溶液，然后加载到HiTrap Q HP(GE通用电气公司)阴离子交换柱上(5ml床体积)。利用Akta纯化仪(GE通用电气公司)，20mM Tris pH 8.0配制的0-400mM NaCl线性梯度液洗脱蛋白，pMHC约在250mM NaCl处洗脱，收集诸峰组分，SDS-PAGE检测纯度。
d.生物素化
用Millipore超滤管将纯化的pMHC分子浓缩，同时将缓冲液置换为20mM Tris pH 8.0，然后加入生物素化试剂0.05M Bicine pH 8.3、10mM ATP、10mM MgOAc、50μM D-Biotin、100μg/ml BirA酶(GST-BirA)，室温孵育混合物过夜，SDS-PAGE检测生物素化是否完全。
e.纯化生物素化后的复合物
用Millipore超滤管将生物素化标记后的pMHC分子浓缩至1ml，采用凝胶过滤层析纯化生物素化的pMHC，利用Akta纯化仪(GE通用电气公司)，用过滤过的PBS预平衡HiPrepTM16/60S200HR柱(GE通用电气公司)，加载1ml浓缩过的生物素化pMHC分子，然后用PBS以1ml/min流速洗脱。生物素化的pMHC分子在约55ml时作为单峰洗脱出现。合并含有蛋白质的组分，用Millipore超滤管浓缩，BCA法(Thermo)测定蛋白质浓度，加入蛋白酶抑制剂cocktail(Roche)将生物素化的pMHC分子分装保存在-80℃。
利用BIAcore Evaluation软件计算动力学参数，得到本发明可溶性的TCR分子与VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物结合的动力学图谱分别如图7所示。图谱显示，本发明得到的可溶性TCR分子能够与VFSTVPPAFI-HLA A2402复合物结合。同时，还利用上述方法检测了本发明可溶性的TCR分子与其他几种无关抗原短肽与HLA复合物的结合活性，结果显示本发明TCR分子与其他无关抗原均无结合。
实施例5 SAGE1特异性T细胞受体慢病毒包装与原代T细胞转染SAGE1TCR
(a)通过293T/17细胞的快速介导瞬时转染(Express-In-mediated transient transfection)制备慢病毒
利用第三代慢病毒包装系统包装含有编码所需TCR的基因的慢病毒。利用快速介导瞬时转染(Express-In-mediated transient transfection)(开放生物系统公司(Open Biosystems))用4种质粒(含有实施例2所述pLenti-SAGE1TRA-2A-TRB-IRES-NGFR的一种慢病毒载体，以及含有构建传染性 但非复制型慢病毒颗粒所必需的其他组分的3种质粒)转染293T/17细胞。
为进行转染，第0天种细胞，在15厘米培养皿，种上1.7×107个293T/17细胞，使细胞均匀分布在培养皿上，汇合度略高于50％。第1天转染质粒，包装pLenti-SAGE1TRA-2A-TRB-IRES-NGFR和pLenti-eGFP假病毒，将以上表达质粒与包装质粒pMDLg/pRRE,pRSV-REV和pMD.2G混匀，一个15厘米直径平皿的用量如下：22.5微克：15微克:15微克：7.5微克。转染试剂PEI-MAX与质粒的比例是2:1，每个平皿的使用量为114.75微克。具体操作为：把表达质粒与包装质粒加入1800微升OPTI-MEM((吉布可公司(Gibco)，目录号31985-070)培养基中混合均匀，室温静置5分钟成为DNA混合液；取相应量PEI与1800微升OPTI-MEM培养基混合均匀，室温静置5分钟成为PEI混合液。把DNA混合液和PEI混合液混合在一起并在室温静置30分钟，再添加3150微升OPTI-MEM培养基，混合均匀后加入到已经转换成11.25毫升OPTI-MEM的293T/17细胞中，轻轻晃动培养皿，使培养基混合均匀，37℃/5％CO2下培养。转染5-7小时，去除转染培养基，换成含有10％胎牛血清的DMEM((吉布可公司(Gibco)，目录号C11995500bt))完全培养基，37℃/5％CO2下培养。第3和第4天收集含有包装的慢病毒的培养基上清。为收获包装的慢病毒，把所收集到的培养上清3000g离心15分钟去除细胞碎片，再经0.22微米过滤器(默克密理博(Merck Millipore)，目录号SLGP033RB)过滤，最后用50KD截留量的浓缩管(默克密理博(Merck Millipore))，目录号UFC905096)进行浓缩，除去大部分上清液，最后浓缩到1毫升，等份分装后-80℃冻存。取假病毒样品进行病毒滴度测定，步骤参照p24ELISA(Clontech，目录号632200)试剂盒说明书。作为对照用，同时也包转pLenti-eGFP的假病毒。
(b)用含有SAGE1特异性T细胞受体基因的慢病毒转导原代T细胞
从健康志愿者的血液中分离到CD8+T细胞，再用包装的慢病毒转导。计数这些细胞，在48孔板中，在含有50IU/ml IL-2和10ng/ml IL-7的含10％FBS(吉布可公司(Gibco)，目录号C10010500BT)的1640(吉布可公司(Gibco)，目录号C11875500bt)培养基中以1×106个细胞/毫升(0.5毫升/孔)与预洗涤的抗CD3/CD28抗体-包被小珠(T细胞扩增物，lifetechnologies，目录号11452D)共孵育过夜刺激，细胞：珠＝3：1。
刺激过夜后，根据p24ELISA试剂盒所测到的病毒滴度，按MOI＝10的比例加入已浓缩的SAGE1特异性T细胞受体基因的慢病毒，32℃，900g离心感染1小时。感染完毕后去除慢病毒感染液，用加入30IU/ml IL-2的含10％FBS的1640培养基重悬细胞，37℃/5％CO2下培养3天。转导3天后计数细胞，稀释细胞至0.5×106个细胞/毫升。每两天计数一次细胞，替换或加入含有3IU/ml IL-2的新鲜培养基，维持细胞在0.5×106-1×106个细胞/毫升。从第3天开始通过流式细胞术分析细胞，从第5天开始用于功能试验(例如，IFN-γ释放的ELISPOT和非放射性细胞毒性检测)。从第10天开始或在细胞减缓分裂和尺寸变小之时，冷冻储存等分细胞，至少4×106个细胞/管(1×107个细胞/毫升，90％FBS/10％DMSO)。
实施例6 细胞激活功能验证
ELISPOT方案
进行以下试验以证明TCR-转导的T细胞对靶细胞特异性地起反应的激活。利用ELISPOT试验检测的IFN-γ产量作为T细胞激活的读出值。
试剂
试验培养基：10％FBS(吉布可公司(Gibco)，目录号16000-044)，RPMI1640(吉布可公司(Gibco)，目录号C11875500bt)
洗涤缓冲液：0.01M PBS/0.05％吐温20
PBS(吉布可公司(Gibco)，目录号C10010500BT)
PVDF ELISPOT 96孔板(默克密理博(Merck Millipore)，目录号MSIPS4510)
人IFN-γELISPOT PVDF-酶试剂盒(BD)装有所需的所有其他试剂(捕捉和检测抗体，链霉亲和素-碱性磷酸酶和BCIP/NBT溶液)
方法
靶细胞制备
本实施例的靶细胞为Epstein-Barr病毒(EBV)转化的永生化淋巴母细胞系(LCLs)。B95-8细胞经十四酰乙酸佛波醇酯(TPA)诱导生产含有EBV的培养基上清，4℃/600g离心10分钟去除杂质，然后过0.22微米过滤器，等分分装-70℃保存。从基因型为HLA-A11/A02/A24(包括纯合子和杂合子)的健康志愿者的外周血淋巴细胞(PBL),取10毫升浓度为2×107/毫升的PBL悬浮液于25平方厘米的培养瓶中，加入环孢霉素后在37℃/CO2培养箱中孵育1小时，快速解冻一份EBV，按1/10稀释加入到上述细胞中，轻轻摇匀并把培养瓶直立置于37℃/CO2培养箱中培养。培养12天后添加10毫升培养基继续培养，约30天后进一步扩大培养并进行流式检测，其中CD19+CD23hiCD58+为永生化淋巴母细胞系(LCL)。本ELISPOT试验以HLA-A24为特异性靶细胞。
效应细胞制备
本试验的效应细胞(T细胞)是实施例3中经流式细胞术分析表达SAGE1特异性TCR的CD8+T细胞，并以同一志愿者的CD8+T作为阴性对照效应细胞。用抗CD3/CD28包被珠(T细胞扩增物，LifeTechnologies)刺激T细胞，用携带SAGE1特异性TCR基因的慢病毒转导(依据实施例3)，在含有30IU/ml IL-2的含10％FBS的1640培养基扩增直至转导后9-12天，然后将这些细胞置于试验培养基中，300g常温离心10分钟进行洗涤。然后将细胞以2×所需终浓度重悬在试验培养基中。同样处理阴性对照效应细胞。
ELISPOT
按照生产商提供的说明书，如下所述准备孔板：以每块板10毫升无菌PBS按1：200稀释抗人IFN-γ捕捉抗体，然后将100微升的稀释捕捉抗体等分加入各孔。4℃下孵育孔板过夜。孵育后，洗涤孔板以除去多余的捕捉抗体。加入100微升/孔含有10％FBS的RPMI 1640培养基并在室温下温育孔板2小时以封闭孔板。然后从孔板中洗去培养基，通过在纸上轻弹和轻拍ELISPOT孔板以除去任何残余的洗涤缓冲液。
SAGE1CD8+T细胞(本发明TCR转导的T细胞，即效应细胞，在本发明中也命名为“VF6CD8+TCELL”)、CD8+T细胞(阴性对照效应细胞)和LCL-A24/A11(靶细胞)依据实施例3所述制备，并在相应实验组加入对应短肽，其中PX149为SAGE1PX149 597-606VFSTVPPAFI短肽，其余为非SAGE1TCR特异结合短肽。
然后采用以下顺序将试验的诸组分加入ELISPOT孔板：
130微升靶细胞77000个细胞/毫升(得到总共约10000个靶细胞/孔)。
50微升效应细胞(1000个SAGE1TCR双阳性T细胞)。
20微升10-5摩尔/升的SAGE1PX149 597-606VFSTVPPAFI/非特异性短肽溶液(终浓度为10-6摩尔/升)。
所有孔一式三份制备添加。
然后温育孔板过夜(37℃/5％CO2)第二天，弃培养基，用双蒸水洗涤孔板2次，再用洗涤缓冲液洗涤3次，在纸巾上轻拍以除去残余的洗涤缓冲液。然后用含有10％FBS的PBS稀释检测一抗，按100微升/孔加入各孔。室温下温育孔板2小时，再用洗涤缓冲液洗涤3次，在纸巾上轻拍孔板以除去过量的洗涤 缓冲液。
用含有10％FBS的PBS按1：100稀释链霉亲和素-碱性磷酸酶，将100微升稀释的链霉亲和素-碱性磷酸酶加入各孔并在室温下温育孔板1小时。然后用洗涤缓冲液洗涤3次PBS洗涤2次，在纸巾上轻拍孔板以除去过量的洗涤缓冲液和PBS。洗涤完毕后加入试剂盒提供的BCIP/NBT溶液100微升/孔进行显影。在显影期间用锡箔纸覆盖孔板避光，静置5-15分钟。在此期间常规检测显影孔板的斑点，确定终止反应的最佳时间。去除BCIP/NBT溶液并用双蒸水冲洗孔板以中止显影反应，甩干，然后将孔板底部去除，在室温下干燥孔板直至每个孔完全干燥，再利用免疫斑点平板计数计(CTL，细胞技术有限公司(Cellular Technology Limited))计数孔板内底膜形成的斑点。
结果
通过ELISPOT试验(如上所述)检验SAGE1TCR转导的T细胞对负载SAGE1PX149 597-606VFSTVPPAFI短肽的靶细胞和非特异性短肽的靶细胞起反应的IFN-γ释放。利用graphpad prism6绘制各孔中观察到的ELSPOT斑点数量。
实验结果如图8所示，单独的SAGE1CD8+T细胞(效应细胞)或LCL细胞(靶细胞)添加相应短肽时释放IFN-γ很少。
SAGE1CD8+T细胞(效应细胞)能与添加PX149的LCL-A24/A11细胞起反应释放出较多IFN-γ。
SAGE1CD8+T细胞(效应细胞)添加非特异性短肽的LCL细胞时IFN-γ释放很少。
CD8+T细胞(阴性对照效应细胞)添加PX149的LCL-A24/A11细胞时IFN-γ释放很少。
综上，转导本发明TCR的T细胞对负载其特异的短肽的靶细胞有很好的激活反应，对未负载相应短肽的靶细胞及负载非特异短肽的靶细胞没有激活反应。
实施例7 细胞杀伤功能验证
该试验是51Cr释放细胞毒性试验的比色替代试验，定量测定细胞裂解后释放的乳酸脱氢酶(LDH)。采用30分钟偶联的酶反应来检测释放在培养基中的LDH，在酶反应中LDH可使一种四唑盐(INT)转化为红色的甲臜(formazan)。生成的红色产物的量与裂解的细胞数成正比。可以用标准的96孔读板计收集490nm可见光吸光值数据。
材料
CytoTox非放射性细胞毒性检测(普罗迈格公司，G1780)含有底物混合物、试验缓冲液、裂解溶液和终止缓冲液。
试验培养基：10％FBS(热灭活的，吉布可公司，目录号16000-044)，含酚红的90％RPMI 1640(吉布可公司(Gibco)，目录号C11875500bt)，1％青霉素/链霉素(吉布可公司，目录号15070-063)。
微孔圆底96孔组织培养板(纽克公司(Nunc)，目录号163320)
96孔免疫平板Maxisorb(纽克公司(Nunc)，目录号442404)
方法
靶细胞制备
本试验采用95D，NCI-H1299和IM 9三株肿瘤细胞系为靶细胞。在试验培养基中制备靶细胞：靶细胞浓度调至3×105个/毫升，每孔取50微升从而得1.5×104个细胞/孔。
效应细胞制备
本试验的效应细胞(T细胞)是实施例3中经流式细胞术分析的CD8+T细胞。 效应细胞与靶细胞之比采用10：1,5：1,2.5：1,1.25:1(如10：1则稀释成3×106个/毫升，每孔取50微升从而得1.5×105个细胞/孔)。设同源CD8+T细胞加靶细胞对照组(10:1)。
SAGE1特异性TCR转导的CD8+T细胞特异性杀伤肿瘤细胞试验
试验准备
采用以下顺序将试验的诸组分加入微孔圆底96孔组织培养板：
-45ul靶细胞(如上所述制备)加入各孔
-45ul效应细胞(如上所述制备)加入各孔
如下所述制备对照组：
-效应细胞自发释放：仅有45ul效应细胞。
-靶细胞自发释放：仅有45ul靶细胞。
-靶细胞最大释放：仅有45ul靶细胞。
-培养基对照：仅有90ul培养基。
所有孔一式三份制备，终体积为90ul(不够的用培养基补足)。
37℃温育24小时。收集所有孔上清前，将靶细胞最大释放对照孔在-70℃放置细胞大约30分钟，再在37℃融化15分钟，以使靶细胞全部裂解。
在250g离心平板4分钟。将试验平板各孔的50ul上清液转移至96孔免疫平板Maxisorb板的相应孔。利用试验缓冲液(12ml)重建底物混合物，然后加50ul至平板各孔。平板盖上盖子后在阴暗处室温温育30分钟。将50ul终止溶液加入平板各孔以终止反应。加入终止溶液后1小时内计数记录490nm的吸光度。
计算结果
从实验组、靶细胞自发释放组和效应细胞自释放组的所有吸光度值中扣除培养基背景的吸光度值。
将上述中获得的经过校正的值带入下面公式，计算每个效靶比所产生的细胞毒性百分比。
％细胞毒性＝100×(实验-效应细胞自发-靶细胞自发)/(靶细胞最大-靶细胞自发)
结果
通过非放射性细胞毒性检测(如上所述)检验SAGE1TCR转导的T细胞对特异性靶细胞起反应的LDH释放。利用graphpad prism6绘制各孔中490nm可见光吸光值。
实验数据统计结果如图9所示，在效靶比例为10：1时，本发明TCR转导的T细胞对特异性靶细胞95D的杀伤作用明显；对非特异性靶细胞NCI-H1299、IM 9无杀伤作用。同源CD8+T细胞对靶细胞95D杀伤作用很弱。
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考，就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解，在阅读了本发明的上述讲授内容之后，本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改，这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
序列表
<110> 中国科学院广州生物医药与健康研究院
<120> 一种识别SAGE1抗原的T细胞受体及编码该受体的核酸
<130> P2017-1271
<160> 29
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 111
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TCRα链可变域
<400> 1
Ala Gln Ser Val Thr Gln Leu Gly Ser His Val Ser Val Ser Glu Gly
1 5 10 15
Ala Leu Val Leu Leu Arg Cys Asn Tyr Ser Ser Ser Val Pro Pro Tyr
20 25 30
Leu Phe Trp Tyr Val Gln Tyr Pro Asn Gln Gly Leu Gln Leu Leu Leu
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Lys Tyr Thr Ser Ala Ala Thr Leu Val Lys Gly Ile Asn Gly Phe Glu
50 55 60
Ala Glu Phe Lys Lys Ser Glu Thr Ser Phe His Leu Thr Lys Pro Ser
65 70 75 80
Ala His Met Ser Asp Ala Ala Glu Tyr Phe Cys Ala Val Ser Glu Arg
85 90 95
Ala Arg Leu Met Phe Gly Asp Gly Thr Gln Leu Val Val Lys Pro
100 105 110
<210> 2
<211> 333
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> TCRα链可变域
<400> 2
gcccagtcgg tgacccagct tggcagccac gtctctgtct ctgagggagc cctggttctg 60
ctgaggtgca actactcatc gtctgttcca ccatatctct tctggtatgt gcaatacccc 120
aaccaaggac tccagcttct cctgaagtac acatcagcgg ccaccctggt taaaggcatc 180
aacggttttg aggctgaatt taagaagagt gaaacctcct tccacctgac gaaaccctca 240
gcccatatga gcgacgcggc tgagtacttc tgtgctgtga gtgaaagagc cagactcatg 300
tttggagatg gaactcagct ggtggtgaag ccc 333
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<211> 252
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TCRα链
<400> 3
Ala Gln Ser Val Thr Gln Leu Gly Ser His Val Ser Val Ser Glu Gly
1 5 10 15
Ala Leu Val Leu Leu Arg Cys Asn Tyr Ser Ser Ser Val Pro Pro Tyr
20 25 30
Leu Phe Trp Tyr Val Gln Tyr Pro Asn Gln Gly Leu Gln Leu Leu Leu
35 40 45
Lys Tyr Thr Ser Ala Ala Thr Leu Val Lys Gly Ile Asn Gly Phe Glu
50 55 60
Ala Glu Phe Lys Lys Ser Glu Thr Ser Phe His Leu Thr Lys Pro Ser
65 70 75 80
Ala His Met Ser Asp Ala Ala Glu Tyr Phe Cys Ala Val Ser Glu Arg
85 90 95
Ala Arg Leu Met Phe Gly Asp Gly Thr Gln Leu Val Val Lys Pro Asn
100 105 110
Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser
115 120 125
Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn
130 135 140
Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp Lys Thr Val
145 150 155 160
Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp
165 170 175
Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile
180 185 190
Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser Cys Asp Val
195 200 205
Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu Asn Phe Gln
210 215 220
Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly
225 230 235 240
Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
245 250
<210> 4
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<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> TCRα链
<400> 4
gcccagtcgg tgacccagct tggcagccac gtctctgtct ctgagggagc cctggttctg 60
ctgaggtgca actactcatc gtctgttcca ccatatctct tctggtatgt gcaatacccc 120
aaccaaggac tccagcttct cctgaagtac acatcagcgg ccaccctggt taaaggcatc 180
aacggttttg aggctgaatt taagaagagt gaaacctcct tccacctgac gaaaccctca 240
gcccatatga gcgacgcggc tgagtacttc tgtgctgtga gtgaaagagc cagactcatg 300
tttggagatg gaactcagct ggtggtgaag cccaacatcc agaaccctga ccctgccgtg 360
taccagctga gagactctaa atccagtgac aagtctgtct gcctattcac cgattttgat 420
tctcaaacaa atgtgtcaca aagtaaggat tctgatgtgt atatcacaga caaaactgtg 480
ctagacatga ggtctatgga cttcaagagc aacagtgctg tggcctggag caacaaatct 540
gactttgcat gtgcaaacgc cttcaacaac agcattattc cagaagacac cttcttcccc 600
agcccagaaa gttcctgtga tgtcaagctg gtcgagaaaa gctttgaaac agatacgaac 660
ctaaactttc aaaacctgtc agtgattggg ttccgaatcc tcctcctgaa agtggccggg 720
tttaatctgc tcatgacgct gcggctgtgg tccagc 756
<210> 5
<211> 112
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TCRβ链可变域
<400> 5
Asp Ala Gly Val Thr Gln Ser Pro Thr His Leu Ile Lys Thr Arg Gly
1 5 10 15
Gln Gln Val Thr Leu Arg Cys Ser Pro Lys Ser Gly His Asp Thr Val
20 25 30
Ser Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe Ile Phe Gln
35 40 45
Tyr Tyr Glu Glu Glu Glu Arg Gln Arg Gly Asn Phe Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly His Gln Phe Pro Asn Tyr Ser Ser Glu Leu Asn Val Asn Ala
65 70 75 80
Leu Leu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Val
85 90 95
Gly Phe Thr Glu Ala Phe Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Thr Val Val
100 105 110
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<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> TCRβ链可变域
<400> 6
gacgctggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct ctcctaagtc tgggcatgac actgtgtcct ggtaccaaca ggccctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat gaggaggaag agagacagag aggcaacttc 180
cctgatcgat tctcaggtca ccagttccct aactatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttgttgctgg gggactcggc cctctatctc tgtgccagca gcttggtagg gttcactgaa 300
gctttctttg gacaaggcac cagactcaca gttgta 336
<210> 7
<211> 289
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TCRβ链
<400> 7
Asp Ala Gly Val Thr Gln Ser Pro Thr His Leu Ile Lys Thr Arg Gly
1 5 10 15
Gln Gln Val Thr Leu Arg Cys Ser Pro Lys Ser Gly His Asp Thr Val
20 25 30
Ser Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe Ile Phe Gln
35 40 45
Tyr Tyr Glu Glu Glu Glu Arg Gln Arg Gly Asn Phe Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly His Gln Phe Pro Asn Tyr Ser Ser Glu Leu Asn Val Asn Ala
65 70 75 80
Leu Leu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Val
85 90 95
Gly Phe Thr Glu Ala Phe Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Thr Val Val
100 105 110
Glu Asp Leu Asn Lys Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro
115 120 125
Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu
130 135 140
Ala Thr Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn
145 150 155 160
Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys
165 170 175
Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu
180 185 190
Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys
195 200 205
Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp
210 215 220
Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg
225 230 235 240
Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Val Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser
245 250 255
Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala
260 265 270
Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp
275 280 285
Phe
<210> 8
<211> 867
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> TCRβ链
<400> 8
gacgctggag tcacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct ctcctaagtc tgggcatgac actgtgtcct ggtaccaaca ggccctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat gaggaggaag agagacagag aggcaacttc 180
cctgatcgat tctcaggtca ccagttccct aactatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttgttgctgg gggactcggc cctctatctc tgtgccagca gcttggtagg gttcactgaa 300
gctttctttg gacaaggcac cagactcaca gttgtagagg acctgaacaa ggtgttccca 360
cccgaggtcg ctgtgtttga gccatcagaa gcagagatct cccacaccca aaaggccaca 420
ctggtgtgcc tggccacagg cttcttcccc gaccacgtgg agctgagctg gtgggtgaat 480
gggaaggagg tgcacagtgg ggtcagcacg gacccgcagc ccctcaagga gcagcccgcc 540
ctcaatgact ccagatactg cctgagcagc cgcctgaggg tctcggccac cttctggcag 600
aacccccgca accacttccg ctgtcaagtc cagttctacg ggctctcgga gaatgacgag 660
tggacccagg atagggccaa acccgtcacc cagatcgtca gcgccgaggc ctggggtaga 720
gcagactgtg gctttacctc ggtgtcctac cagcaagggg tcctgtctgc caccatcctc 780
tatgagatcc tgctagggaa ggccaccctg tatgctgtgc tggtcagcgc ccttgtgttg 840
atggccatgg tcaagagaaa ggatttc 867
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<212> PRT
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<220>
<223> 抗原短肽
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Val Phe Ser Thr Val Pro Pro Ala Phe Ile
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<220>
<223> α CDR1
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Ser Ser Val Pro Pro Tyr
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Tyr Thr Ser Ala Ala Thr Leu Val
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<212> PRT
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Cys Ala Val Ser Glu Arg Ala Arg Leu Met Phe
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Ser Gly His Asp Thr
1 5
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<212> PRT
<213> artificial sequence
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<223> β CDR2
<400> 14
Tyr Tyr Glu Glu Glu Glu
1 5
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<211> 13
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> β CDR3
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Cys Ala Ser Ser Leu Val Gly Phe Thr Glu Ala Phe Phe
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<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> α CDR1
<400> 16
tcgtctgttc caccatat 18
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<211> 24
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> α CDR2
<400> 17
tacacatcag cggccaccct ggtt 24
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<211> 33
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> α CDR3
<400> 18
tgtgctgtga gtgaaagagc cagactcatg ttt 33
<210> 19
<211> 15
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> β CDR1
<400> 19
tctgggcatg acact 15
<210> 20
<211> 18
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> β CDR2
<400> 20
tattatgagg aggaagag 18
<210> 21
<211> 39
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> β CDR3
<400> 21
tgtgccagca gcttggtagg gttcactgaa gctttcttt 39
<210> 22
<211> 271
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> 具有前导序列的TCRα链
<400> 22
Met Leu Leu Leu Leu Val Pro Val Leu Glu Val Ile Phe Thr Leu Gly
1 5 10 15
Gly Thr Arg Ala Gln Ser Val Thr Gln Leu Gly Ser His Val Ser Val
20 25 30
Ser Glu Gly Ala Leu Val Leu Leu Arg Cys Asn Tyr Ser Ser Ser Val
35 40 45
Pro Pro Tyr Leu Phe Trp Tyr Val Gln Tyr Pro Asn Gln Gly Leu Gln
50 55 60
Leu Leu Leu Lys Tyr Thr Ser Ala Ala Thr Leu Val Lys Gly Ile Asn
65 70 75 80
Gly Phe Glu Ala Glu Phe Lys Lys Ser Glu Thr Ser Phe His Leu Thr
85 90 95
Lys Pro Ser Ala His Met Ser Asp Ala Ala Glu Tyr Phe Cys Ala Val
100 105 110
Ser Glu Arg Ala Arg Leu Met Phe Gly Asp Gly Thr Gln Leu Val Val
115 120 125
Lys Pro Asn Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp
130 135 140
Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser
145 150 155 160
Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp
165 170 175
Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala
180 185 190
Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn
195 200 205
Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser
210 215 220
Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu
225 230 235 240
Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys
245 250 255
Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
260 265 270
<210> 23
<211> 813
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 具有前导序列的TCRα链
<400> 23
atgctcctgc tgctcgtccc agtgctcgag gtgattttta ccctgggagg aaccagagcc 60
cagtcggtga cccagcttgg cagccacgtc tctgtctctg agggagccct ggttctgctg 120
aggtgcaact actcatcgtc tgttccacca tatctcttct ggtatgtgca ataccccaac 180
caaggactcc agcttctcct gaagtacaca tcagcggcca ccctggttaa aggcatcaac 240
ggttttgagg ctgaatttaa gaagagtgaa acctccttcc acctgacgaa accctcagcc 300
catatgagcg acgcggctga gtacttctgt gctgtgagtg aaagagccag actcatgttt 360
ggagatggaa ctcagctggt ggtgaagccc aacatccaga accctgaccc tgccgtgtac 420
cagctgagag actctaaatc cagtgacaag tctgtctgcc tattcaccga ttttgattct 480
caaacaaatg tgtcacaaag taaggattct gatgtgtata tcacagacaa aactgtgcta 540
gacatgaggt ctatggactt caagagcaac agtgctgtgg cctggagcaa caaatctgac 600
tttgcatgtg caaacgcctt caacaacagc attattccag aagacacctt cttccccagc 660
ccagaaagtt cctgtgatgt caagctggtc gagaaaagct ttgaaacaga tacgaaccta 720
aactttcaaa acctgtcagt gattgggttc cgaatcctcc tcctgaaagt ggccgggttt 780
aatctgctca tgacgctgcg gctgtggtcc agc 813
<210> 24
<211> 308
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> 具有前导序列的TCRβ链
<400> 24
Met Gly Pro Gly Leu Leu Cys Trp Ala Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15
Gly Leu Val Asp Ala Gly Val Thr Gln Ser Pro Thr His Leu Ile Lys
20 25 30
Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu Arg Cys Ser Pro Lys Ser Gly His
35 40 45
Asp Thr Val Ser Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe
50 55 60
Ile Phe Gln Tyr Tyr Glu Glu Glu Glu Arg Gln Arg Gly Asn Phe Pro
65 70 75 80
Asp Arg Phe Ser Gly His Gln Phe Pro Asn Tyr Ser Ser Glu Leu Asn
85 90 95
Val Asn Ala Leu Leu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110
Ser Leu Val Gly Phe Thr Glu Ala Phe Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu
115 120 125
Thr Val Val Glu Asp Leu Asn Lys Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val
130 135 140
Phe Glu Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu
145 150 155 160
Val Cys Leu Ala Thr Gly Phe Phe Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp
165 170 175
Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln
180 185 190
Pro Leu Lys Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser
195 200 205
Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His
210 215 220
Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp
225 230 235 240
Thr Gln Asp Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala
245 250 255
Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Val Ser Tyr Gln Gln Gly
260 265 270
Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr
275 280 285
Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys
290 295 300
Arg Lys Asp Phe
305
<210> 25
<211> 924
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 具有前导序列的TCRβ链
<400> 25
atgggccccg ggctcctctg ctgggcactg ctttgtctcc tgggagcagg cttagtggac 60
gctggagtca cccaaagtcc cacacacctg atcaaaacga gaggacagca agtgactctg 120
agatgctctc ctaagtctgg gcatgacact gtgtcctggt accaacaggc cctgggtcag 180
gggccccagt ttatctttca gtattatgag gaggaagaga gacagagagg caacttccct 240
gatcgattct caggtcacca gttccctaac tatagctctg agctgaatgt gaacgccttg 300
ttgctggggg actcggccct ctatctctgt gccagcagct tggtagggtt cactgaagct 360
ttctttggac aaggcaccag actcacagtt gtagaggacc tgaacaaggt gttcccaccc 420
gaggtcgctg tgtttgagcc atcagaagca gagatctccc acacccaaaa ggccacactg 480
gtgtgcctgg ccacaggctt cttccccgac cacgtggagc tgagctggtg ggtgaatggg 540
aaggaggtgc acagtggggt cagcacggac ccgcagcccc tcaaggagca gcccgccctc 600
aatgactcca gatactgcct gagcagccgc ctgagggtct cggccacctt ctggcagaac 660
ccccgcaacc acttccgctg tcaagtccag ttctacgggc tctcggagaa tgacgagtgg 720
acccaggata gggccaaacc cgtcacccag atcgtcagcg ccgaggcctg gggtagagca 780
gactgtggct ttacctcggt gtcctaccag caaggggtcc tgtctgccac catcctctat 840
gagatcctgc tagggaaggc caccctgtat gctgtgctgg tcagcgccct tgtgttgatg 900
gccatggtca agagaaagga tttc 924
<210> 26
<211> 197
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> 可溶性TCRα链
<400> 26
Ala Gln Ser Val Thr Gln Leu Gly Ser His Val Ser Val Ser Glu Gly
1 5 10 15
Ala Leu Val Leu Leu Arg Cys Asn Tyr Ser Ser Ser Val Pro Pro Tyr
20 25 30
Leu Phe Trp Tyr Val Gln Tyr Pro Asn Gln Gly Leu Gln Leu Leu Leu
35 40 45
Lys Tyr Thr Ser Ala Ala Thr Leu Val Lys Gly Ile Asn Gly Phe Glu
50 55 60
Ala Glu Phe Lys Lys Ser Glu Thr Ser Phe His Leu Thr Lys Pro Ser
65 70 75 80
Ala His Met Ser Asp Ala Ala Glu Tyr Phe Cys Ala Val Ser Glu Arg
85 90 95
Ala Arg Leu Met Phe Gly Asp Gly Thr Gln Leu Val Val Lys Pro Tyr
100 105 110
Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser
115 120 125
Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn
130 135 140
Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp Lys Cys Val
145 150 155 160
Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp
165 170 175
Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile
180 185 190
Ile Pro Glu Asp Thr
195
<210> 27
<211> 591
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 可溶性TCRα链
<400> 27
gcacagtctg tgacccagct tggcagccac gtctctgtct ctgagggagc cctggttctg 60
ctgaggtgca actactcatc gtctgttcca ccatatctct tctggtatgt gcaatacccc 120
aaccaaggac tccagcttct cctgaagtac acatcagcgg ccaccctggt taaaggcatc 180
aacggttttg aggctgaatt taagaagagt gaaacctcct tccacctgac gaaaccctca 240
gcccatatga gcgacgcggc tgagtacttc tgtgctgtga gtgaaagagc cagactcatg 300
tttggagatg gaactcagct ggtggtgaag ccctatatcc agaatccgga cccggccgtt 360
tatcagctgc gtgatagcaa aagcagcgat aaaagcgtgt gcctgttcac cgattttgat 420
agccagacca acgtgagcca gagcaaagat agcgatgtgt acatcaccga taaatgcgtg 480
ctggatatgc gcagcatgga tttcaaaagc aatagcgcgg ttgcgtggag caacaaaagc 540
gattttgcgt gcgcgaacgc gtttaacaac agcatcatcc cggaagatac g 591
<210> 28
<211> 242
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> 可溶性TCRβ链
<400> 28
Asp Ala Gly Val Thr Gln Ser Pro Thr His Leu Ile Lys Thr Arg Gly
1 5 10 15
Gln Gln Val Thr Leu Arg Cys Ser Pro Lys Ser Gly His Asp Thr Val
20 25 30
Ser Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe Ile Phe Gln
35 40 45
Tyr Tyr Glu Glu Glu Glu Arg Gln Arg Gly Asn Phe Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly His Gln Phe Pro Asn Tyr Ser Ser Glu Leu Asn Val Asn Ala
65 70 75 80
Leu Leu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Leu Val
85 90 95
Gly Phe Thr Glu Ala Phe Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Thr Val Val
100 105 110
Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro
115 120 125
Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu
130 135 140
Ala Thr Gly Phe Tyr Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn
145 150 155 160
Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys
165 170 175
Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Ala Leu Ser Ser Arg Leu
180 185 190
Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asp Pro Arg Asn His Phe Arg Cys
195 200 205
Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp
210 215 220
Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg
225 230 235 240
Ala Asp
<210> 29
<211> 726
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> 可溶性TCRβ链
<400> 29
gatgcaggtg ttacccaaag tcccacacac ctgatcaaaa cgagaggaca gcaagtgact 60
ctgagatgct ctcctaagtc tgggcatgac actgtgtcct ggtaccaaca ggccctgggt 120
caggggcccc agtttatctt tcagtattat gaggaggaag agagacagag aggcaacttc 180
cctgatcgat tctcaggtca ccagttccct aactatagct ctgagctgaa tgtgaacgcc 240
ttgttgctgg gggactcggc cctctatctc tgtgccagca gcttggtagg gttcactgaa 300
gctttctttg gacaaggcac cagactcaca gttgtagaag atctgaaaaa tgtgtttccg 360
ccggaagtcg cggtgttcga accgtcggaa gccgaaatta gccataccca gaaagcaacg 420
ctggtgtgcc tggctaccgg cttttatccg gatcatgtgg aactgtcctg gtgggttaac 480
ggcaaagaag tgcactcagg tgtttgtacg gatccgcagc cgctgaaaga acaaccggca 540
ctgaatgact cgcgttatgc tctgagttcc cgtctgcgcg ttagcgccac cttctggcag 600
gatccgcgta accactttcg ctgtcaggtc caattctacg gcctgtccga aaatgatgaa 660
tggacccagg accgtgcaaa accggtcacg caaatcgtgt cagcagaagc ttggggtcgt 720
gcagat 726