金黄杆菌及其羰基还原酶用于阿瑞匹坦手性中间体生产.pdf

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摘要
申请专利号:

CN201310399109.2

申请日:

2013.09.05

公开号:

CN103497911A

公开日:

2014.01.08

当前法律状态:

授权

有效性:

有权

法律详情:

授权|||实质审查的生效IPC(主分类):C12N 1/20申请日:20130905|||公开

IPC分类号:

C12N1/20; C12N15/53; C12N9/04; C12P7/22; C12R1/01(2006.01)N

主分类号:

C12N1/20

申请人:

中国科学院成都生物研究所

发明人:

吴中柳; 刘艳; 汤脱险; 裴小琼

地址:

610041 四川省成都市武侯区人民南路四段九号

优先权:

专利代理机构:

成都赛恩斯知识产权代理事务所(普通合伙) 51212

代理人:

张帆;肖国华

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内容摘要

本发明公开了一株金黄杆菌(Chryseobacterium sp.CA49,保藏号为CCTCC M2012484)及该菌基因组编码的一种羰基还原酶ChKRED20,并利用该菌原始菌株或该种羰基还原酶作为生物催化剂制备阿瑞匹坦手性醇中间体(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇。产物的对映体过量值大于99.9%。以ChKRED20粗酶粉可催化高达200g/L的底物,24h内获得99%以上转化率,且辅酶循环体系简单、廉价,产物分离提纯容易,回收率高,极具工业应用前景。

权利要求书

权利要求书
1.  一种保藏号为CCTCC M2012484的金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)。 

2.  一种从权利要求1所述的金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)中调取出来的羰基还原酶ChKRED20,其特征在于其核苷酸序列为如SEQ No.1所示,其氨基酸序列为如SEQ No.2所示。 

3.  权利要求1所述的金黄杆菌CA49作为生物催化剂在转化底物3,5-双三氟甲基苯乙酮生成(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇中的应用。 

4.  权利要求2所述的羰基还原酶ChKRED20作为生物催化剂在转化底物3,5-双三氟甲基苯乙酮生成(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇中的应用。 

说明书

说明书金黄杆菌及其羰基还原酶用于阿瑞匹坦手性中间体生产
技术领域
本发明属于应用微生物与酶工程领域,具体涉及一株金黄杆菌及其基因组编码的一种新型羰基还原酶,并利用该菌或者这种羰基还原酶作为生物催化剂生产阿瑞匹坦手性中间体。 
背景技术
光学活性(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇是Merk公司研发的药物阿瑞匹坦(Aprepitant,商品名“Emend”)的关键手性中间体。阿瑞匹坦的主要功能是预防和治疗化疗引起的急性或延迟性呕吐。 
目前制备该手性中间体的主流工艺是化学合成。近年来,随着生物催化技术的不断发展,研究者们积极探索采用酶催化前手性酮的方法生产该中间体,筛选到了一些对映体选择性>99%的微生物菌株,包括Lactobacillus Kefir、Aspergillus niger(Tetrahedron:Asymmetry,2006,17,2000-2005),Penicillium expansum(Tetrahedron:Asymmetry,2009,20,2759-2763),Leifsonia xyli HS0904(Appl Microbiol Biotechnol,2011,90,1897-1904),氧化微杆菌Microbacterium oxydans C3(专利号ZL201010271579.7),以及选择性稍差的热带假丝酵母菌Candida tropicalis20216(ee值>92%,Tetrahedron,2004,60,789-797)等。但是,这些报道都是以微生物菌株全细胞作为生物催化剂,可转化的底物浓度较低,目前仅有Leifsonia xyli HS0904转化的底物浓度较高,最高可转化 的底物浓度为51g/L,30h的转化率为91.8%(J.Microbiol.Biotechnol.2013,23(3),343-350)。考虑产物分离纯化成本问题,这些菌株的转化能力与实际应用还有较大的距离。 
为获得高效的前手性酮催化工艺,首先应解决高效高选择性酶源问题,从环境中筛选新型微生物菌株作为催化剂是常用的有效途径之一。然而原始菌株直接转化可能存在安全性、遗传稳定性问题,原始菌株可能继续利用醇产物导致产物产量低以及原始菌株内的其他酶可能对底物作用生成副产物等问题,因此将原始菌株的关键羰基还原酶基因克隆并异源表达,以重组菌或者酶用于生物转化则可避免上述问题,且这种催化体系较为简单,稳定,产物分离提纯容易,易于工业化。 
发明内容
本发明的目的是公开一种新筛选的金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49),及其所产高活力高对映选择性羰基还原酶ChKRED20,并利用该菌或者该酶还原底物3,5-双三氟甲基苯乙酮制备光学纯(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇,从而以生物催化的方法制备高光学纯度的阿瑞匹坦手性中间体。该菌从果园土壤中富集、分离并经过多轮筛选后获得。关于该菌的保藏信息是:保藏号为CCTCC M2012484;分类命名为金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49);于2012年11月27日在中国典型培养物保藏中心保藏,地址是湖北省武汉市武昌珞珈山武汉大学保藏中心。 
基于上述发明目的,本发明首先提供一种金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49),保藏编号为CCTCC M2012484)。 
本发明还提供了上述金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49) 的筛选方法,所述筛选方法为:于果园采集土样,以3,5-双三氟甲基苯乙酮为唯一碳源,经2轮富集筛选获得可能的产酶菌株。将初筛菌株培养后,以休止细胞为催化剂转化底物,测定产物生成量和产物对映体过量值,并将产物对映体过量值高的菌株进行进一步的鉴定,得到本发明涉及的金黄杆菌。 
本发明还提供一种上述金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)作为生物催化剂在转化底物3,5-双三氟甲基苯乙酮生成(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇中的应用。 
具体地,上述用途的操作方法为:将筛选的金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)培养后,收集菌体,以休止细胞作为催化剂,并添加异丙醇和葡萄糖作为辅酶循环底物,底物3,5-双三氟甲基苯乙酮经生物转化后得到(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇,产物的对映体过量值>99%。 
另外,本发明还提供一种羰基还原酶ChKRED20。该酶是从上述金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)中调取出来的。 
本发明还提供一种上述羰基还原酶ChKRED20作为生物催化剂在转化底物3,5-双三氟甲基苯乙酮生成(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇中的应用。 
其中,从上述金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)中关键羰基还原酶基因ChKRED20的调取和生物转化包括以下步骤: 
(1)基因chKRED20的调取和鉴定: 
将上述金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)全基因组测序(深圳华大基因公司完成),根据测序框架图预测的基因功能,调取出40余个可能具有羰基还原酶功能的基因,将这些基因用常规PCR方法克 隆,并连入pET28a(+)载体,转入大肠杆菌BL21(DE3)中以常规方法过量表达。将这些重组菌休止细胞作为催化剂转化3,5-双三氟甲基苯乙酮,获得R-型醇产物且ee值大于99%的酶有3个(ChKRED08、ChKRED19、ChKRED20)。在培养基中加入或者不加入3,5-双三氟甲基苯乙酮,以新鲜培养的菌提取总RNA,通过RT-PCR分析,两种情况下均只有ChKRED08和ChKRED20酶的基因表达(总RNA提取和RT-PCR方法均为常规方法)。同时,测定了ChKRED08和ChKRED20酶的活力,ChKRED20酶活是ChKRED08的7倍左右。因此,最后确定金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)中关键羰基还原酶基因为chKRED20。 
其中,上述步骤中涉及的chKRED20基因PCR扩增所用引物为:正向5′-GAATTCATGGGAATTTTAGACAACAAAGTAGC-3′(酶切位点EcoR I),反向5′-GTCGACTTAAACTGCCGTGTAGCCACC-3′(酶切位点Sal I); 
PCR条件为,95℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,30个循环,最后72℃延伸10min。PCR产物连入pMD19T载体构建TA克隆,而后将测序正确的质粒以EcoR I和Sal I酶切,将其连入以同样酶消化的pET28a(+)空载体中,构建重组质粒,并转入大肠杆菌BL21(DE3)中,构建重组菌。 
chKRED20基因碱基数为750bp,其序列为(SEQ No.1) 
ATGGGAATTTTAGACAACAAAGTAGCACTTGTTACAGGAGCAGGATCCGGAATCGGATTAGCTGTTGCTCATTCGTATGCAAAAGAAGGCGCCAAAGTTATTGTATCCGATATTAATGAAGATCACGGTAACAAAGCAGTCGAAGACATTAAAGCACAAGGCGGGGAAGCGTCTTTT GTAAAAGCAGATACTTCAAACCCTGAAGAAGTGGAAGCTTTAGTAAAAAGAACAGTAGAAATCTACGGAAGACTTGATATTGCATGTAATAATGCGGGAATCGGTGGCGAACAGGCGCTGGCAGGCGATTACGGTCTCGACAGCTGGCGAAAAGTATTAAGCATAAATCTTGATGGCGTATTCTACGGGTGCAAATATGAGTTAGAACAAATGGAAAAAAACGGGGGCGGCGTTATTGTGAATATGGCCTCTATTCATGGTATTGTTGCTGCACCGCTTTCCTCAGCCTACACTTCTGCAAAGCACGCAGTGGTAGGGCTTACTAAAAATATAGGAGCAGAATACGGACAGAAAAATATCCGTTGCAATGCGGTGGGGCCTGCTTATATTGAAACCCCGCTGTTGGAAAGCCTGACAAAGGAAATGAAGGAAGCACTGATTTCAAAACATCCGATGGGAAGACTGGGAAAACCTGAAGAAGTAGCAGAACTGGTGTTGTTCCTGAGTTCAGAAAAATCATCTTTTATGACGGGAGGCTATTATCTTGTAGATGGTGGCTACACGGCAGTTTAA; 
chKRED20基因编码249个氨基酸,序列为(SEQ No.2): 
MGILDNKVALVTGAGSGIGLAVAHSYAKEGAKVIVSDINEDHGNKAVEDIKAQGGEASFVKADTSNPEEVEALVKRTVEIYGRLDIACNNAGIGGEQALAGDYGLDSWRKVLSINLDGVFYGCKYELEQMEKNGGGVIVNMASIHGIVAAPLSSAYTSAKHAVVGLTKNIGAEYGQKNIRCNAVGPAYIETPLLESLTKEMKEALISKHPMGRLGKPEEVAELVLFLSSEKSSFMTGGYYLVDGGYTAV。 
(2)重组菌生物催化: 
挑取单克隆至LB(含卡那霉素50μg/ml)培养基中,37℃过夜培养,以1%的接种量转接至TB(含卡那霉素50μg/ml)培养基中,37℃培养3h, 加入0.5mM IPTG诱导后,30℃继续培养至20~36h。8000rpm,4℃离心收集菌体,用pH值为7.0、0.1M浓度的磷酸钾缓冲溶液洗涤2次,获得湿菌体。 
取上述新鲜培养的湿菌体重悬于上述缓冲液,加入底物3,5-双三氟甲基苯乙酮,加入1%~3%(w/v,占总转化体系的质量体积百分数)葡萄糖和/或5%异丙醇(v/v,占总转化体系的体积百分数)作为辅酶循环底物。转化体系中菌体浓度为50~150g/L,底物终浓度为1~150g/L,转化温度为30℃,转速为230rpm,转化时间为1~24h。 
(3)ChKRED20酶的辅酶依赖型和比活力测定 
ChKRED20酶的纯化采用镍柱亲和层析(Bio-Rad)。将上述步骤(2)诱导培养20~36h后的菌体以13,000rpm,4℃离心收集,重悬于Buffer A(50mM磷酸盐缓冲液,pH8.0,300mM NaCl,10mM咪唑),超声破碎(超声10s,间隔30s,30次),之后以13,000rpm,4℃离心20min,将上清液加入已用Buffer A平衡的柱料中,轻微混匀30min,用含有20mM咪唑的Buffer A漂洗杂蛋白,再用含250mM咪唑的Buffer A的缓冲液洗脱目的蛋白,最后电泳鉴定纯度,并用BCA Protein Assay kit测定蛋白浓度。 
辅酶依赖型的确定:磷酸钾缓冲液(0.1M,pH7.0),加有0.2mg/ml纯酶,10mM底物和20mM NADH或者NADPH,30℃反应2h。等体积乙酸乙酯萃取,测定产物的转化率。以NADH为辅酶时,转化率为76%;以NADPH为辅酶时,转化率为56%;两者的ee值均大于99.9%,因此该酶以NADH为辅酶时转化率更高。 
比活力测定反应条件:1ml磷酸钾缓冲液(0.1M,pH7.0)加有0.2mg 纯酶,10mM底物和40mM NADH,30℃反应1min。等体积乙酸乙酯萃取,测定产物的生成量。酶活力单位定义为:1min内催化生成1μmol产物所需的酶量。ChKRED20纯酶的比活力达到43U。 
(4)粗酶粉生物催化: 
表达ChKRED20酶的大肠杆菌重组菌的菌体培养、获得湿菌体的步骤同步骤(2)。 
取新鲜培养的湿菌体重悬于磷酸盐缓冲液(pH7.0,0.1M),湿菌体终浓度为50~150g/L,以超声破碎机破细胞,13,000rpm离心后取上清液冷冻于-80℃过夜,而后用冷冻干燥机干燥至粉状,制成粗酶粉。转化体系为:磷酸钾缓冲液(0.1M,pH7.0),粗酶粉,底物3,5-双三氟甲基苯乙酮,异丙醇(辅酶循环底物,用量为40%,v/v),Na-NAD(200mg/L);转化条件:30℃,100rpm,24h。 
粗酶粉用量为10g/L,底物3,5-双三氟甲基苯乙酮浓度为200g/L,转化24h可实现转化率>99%,ee值>99.9%。 
本发明涉及的金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)可高效转化3,5-双三氟甲基苯乙酮生成R-醇,其关键羰基还原酶基因chKRED20与NCBI数据库中其他基因的相似度最高70%,氨基酸序列的最高相似度为76%,与已报道的功能蛋白(NCBI登录号为:BAD99642)的最高相似度为51%,为(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇生物催化合成提供了可供选择的新型酶源。 
该蛋白在大肠杆菌中过量表达后制成粗酶粉,10g/L的酶量便可在24h内转化高达200g/L的底物,且转化率为99%以上,ee值大于99.9%。粗酶转化工艺简单,以廉价异丙醇和少量NAD+作为辅酶循环,产物易于分 离纯化,回收率高达90%以上,极具工业应用前景。 
凡是与ChKRED20氨基酸相似度高于51%且具有催化3,5-双三氟甲基苯乙酮生成(R)-1-[3,5-二(三氟甲基)苯基]乙醇功能的酶均属于本发明的保护范围。 
图1是ChKRED20蛋白纯化后SDS-PAGE图。 
附图说明
以下结合实施例详细地说明本发明。实施方案为便于更好的理解本发明,但并非对本发明的限制。 
具体实施方式
实施例1:菌株筛选 
于某果园采集土样,以3,5-双三氟甲基苯乙酮(2g/L)为唯一碳源并添加无机盐于30℃,230rpm培养7~10天。无机盐为:Na2HPO42g/L,KH2PO41g/L,NH4Cl0.4g/L,MgCl20.4g/L。从富集液中取出1%加入到上述相同培养基中再次富集培养7~10天。而后将培养液稀释104倍,并涂布至筛选平板上(上述无机盐+3,5-双三氟甲基苯乙酮1g/L+酵母粉0.5g/L+琼脂粉15g/L),30℃培养1~3天,每支平板上可见许多微生物单菌落,这些菌株为可能的产酶菌株。 
将富集平板中的单菌落用无菌牙签逐一接入24孔筛选板各孔(Costar,美国)进行培养(每孔装有发酵培养基1ml,发酵培养基组分:蛋白胨5g/L,牛肉膏1.5g/L,酵母粉1.5g/L,NaCl5g/L,葡萄糖10g/L),30℃,240rpm培养24h。6000rpm离心收集菌体,用磷酸钾缓冲液(pH7.0、0.1M)洗涤2次,再加入1ml缓冲液重悬菌体,而后加入底物3,5- 双三氟甲基苯乙酮5mg,30℃,270rpm进行生物催化筛选试验。转化36h后,以200μl乙酸乙酯萃取。以气相手性柱分析产物的对映体过量值,得到产(R)-醇菌株5株。其中1株为本发明涉及的金黄杆菌(Chryseobacterium sp.CA49),产物对映体过量值大于99%。 
实施例2:筛选菌株的鉴定 
为确定该菌株分类地位并详细了解其性能,对该菌株进行了初步鉴定。该菌株的菌落为圆型,光滑,随培养时间不同,菌落呈浅黄色到金黄色。 
16S rRNA鉴定:基因组DNA为模板,以细菌通用引物27f和1492r扩增16S rRNA序列,并将PCR产物直接送样测序,获得的部分序列(1381bp)如下(SEQ No.3): 
AGCTGAGCGGTAGAGTTTCTTCGGAGACTTGAGAGCGGCGTACGGGTGCGGAACACGTGTGCAACCTGCCTTTATCAGGGGGATAGCCTTTCGAAAGGAAGATTAATACCCCATAATATATAGAGTGGCATCACTTTATATTGAAAACTGAGGTGGATAAAGATGGGCACGCGCAAGATTAGATAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGTCGATGATCTTTAGGGGGCCTGAGAGGGTGATCCCCCACACTGGTACTGAGACACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAATATTGGACAATGGGTTAGCGCCTGATCCAGCCATCCCGCGTGAAGGACGACGGCCCTATGGGTTGTAAACTTCTTTTGTACAGGGATAAACCTATTTACGTGTAAATAGCTGAAGGTACTGTACGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTCCGTAGGCGGATCTGTAAGTCAGTGGTGAAATCTCACAGCTT AACTGTGAAACTGCCATTGATACTGCAGGTCTTGAGTAAGGTAGAAGTGGCTGGAATAAGTAGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATTACTTAGAACACCAATTGCGAAGGCAGGTCACTATGTCTTAACTGACGCTGATGGACGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGCTAACTCGTTTTTGGGCTTTCGGGTTCAGAGACTAAGCGAAAGTGATAAGTTAGCCACCTGGGGAGTACGAACGCAAGTTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGTTTAATTCGATGATACGCGAGGAACCTTACCAAGGCTTAAATGGGAATTGATCGGTTTAGAAATAGACCTTCCTTCGGGCAATTTTCAAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTAGGTTAAGTCCTGCAACGAGCGCAACCCCTGTTACTAGTTGCTACCATTAAGTTGAGGACTCTAGTAAGACTGCCTACGCAAGTAGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCACGGCCCTTACGCCTTGGGCCACACACGTAATACAATGGCCGGTACAGAGGGCAGCTACACAGCGATGTGATGCAAATCTCGAAAGCCGGTCTCAGTTCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCTATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGCATCAGCCATGGCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGAAGTCTGGGGTACCTGAAGTCGGTGACCGTAAAAGGAGCTGC 
经NCBI的blast比对,该菌与Chryseobacterium taiwanense,Chryseobacterium sp.MG-2011-139-ER、Chryseobacterium sp.HNR12等菌株的同源性大于99%,初步可确定为Chryseobacterium sp.金黄杆菌属,实验室自编号为Chryseobacterium sp.CA49,2012年11月27日在中国典型培 养物保藏中心保藏,保藏号为CCTCC M2012484。 
实施例3:金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)原始菌株生物催化 
菌株培养:将少量金黄杆菌CA49(Chryseobacterium sp.CA49)斜面种子接种于发酵培养基中(组分同实施例1),30℃,230rpm培养16~24h制备种子液,以0.5%~2%的接种量转接至发酵培养基中扩大培养,培养条件:30℃,230rpm,24~48h。 
休止细胞转化:将第1步培养的菌体以13,000rpm离心收集,用pH值为7.0、0.1M浓度的磷酸钾缓冲溶液洗涤2次。转化体系包括磷酸盐缓冲液(pH值7.0、0.1M)、菌体、底物和辅酶循环底物。辅酶底物为5%~10%(v/v)的异丙醇和2%~5%(v/w)的葡萄糖。菌体浓度为50~200g/L,底物终浓度为1~50g/L,转化温度为30℃,转速为230rpm,转化时间为5~24h。以下为几种原始菌株休止细胞转化的具体实施例: 
(1)取菌体0.5g重悬于10ml缓冲液,加入底物3,5-双三氟甲基苯乙酮10mg,并加入异丙醇0.5ml(5%)和葡萄糖0.2g(2%),30℃,230rpm转化5h。以10ml乙酸乙酯萃取,取有机相气相色谱(SGE,澳大利亚,AC-5,30m×0.22)测定转化率为95.6%,气相手性柱(CHIRASIL-DEX CB,瓦里安25m×0.25)测定产物ee值大于99%。 

产物数据如下: 
无色液体,[α]D25=+21.6(c=1,乙腈); 
ee>99%(CHIRASIL-DEX CB,柱温:120℃,进样器:260℃,检测 器:280℃,t=8.403min); 
1H NMR(600MHz,CDCl3):δ7.84(s,2H,Ar-H),7.78(s,1H,Ar-H),5.04(q,J=6.54Hz,1H,-CH),1.99(br,1H,OH),1.55(d,J=6.54Hz,3H,-CH3) 
(2)取菌体1.0g重悬于10ml缓冲液中,加入底物100mg,葡萄糖和异丙醇添加量同上,转化条件和分析方法也同上。底物的转化率为91.5%,产物对映体过量值大于99%。 
(3)取菌体1.5g重悬于10ml缓冲液中,加入底物500mg,并加入异丙醇1.0ml(10%)和葡萄糖0.5g(5%),30℃,230rpm转化24h。以10ml乙酸乙酯萃取,经气相色谱分析,底物的转化率为90.8%,产物对映体过量值大于99%。 
实施例4:羰基还原酶ChKRED20重组菌全细胞生物催化 
羰基还原酶ChKRED20重组菌的培养方法和菌体收集方法见说明书发明内容部分。 
(1)取菌体0.5g,重悬于10ml磷酸盐缓冲液,加入底物10mg和0.1g葡萄糖,30℃,230rpm转化2h。以10ml乙酸乙酯萃取,经气相色谱分析,底物的转化率为30.1%,产物对映体过量值大于99.9%。 
(2)取菌体0.5g,重悬于10ml磷酸盐缓冲液,加入底物10mg,0.2g葡萄糖和0.5ml异丙醇,30℃,230rpm转化1h。以10ml乙酸乙酯萃取,经气相色谱分析,底物的转化率为29.5%,产物对映体过量值大于99.9%。 
(3)取菌体1.0g,重悬于10ml磷酸盐缓冲液,加入底物500mg和0.2g葡萄糖,30℃,230rpm转化24h。以10ml乙酸乙酯萃取,经气相色谱分析,底物的转化率为88.2%,产物对映体过量值大于99.9%。 
(4)取菌体1.0g,重悬于10ml磷酸盐缓冲液,加入底物500mg和0.5ml异丙醇,30℃,230rpm转化24h。以10ml乙酸乙酯萃取,经气相色谱分析,底物的转化率为79.1%,产物对映体过量值大于99.9%。 
(5)取菌体1.5g,重悬于10ml磷酸盐缓冲液,加入底物1500mg和0.5ml异丙醇,30℃,230rpm转化24h。以10ml乙酸乙酯萃取,经气相色谱分析,底物的转化率为46.1%,产物对映体过量值大于99.9%。 
实施例5:羰基还原酶ChKRED20纯酶生物催化 
转化体系:磷酸钾缓冲液(0.1M,pH7.0),纯酶浓度2g/L,底物3,5-双三氟甲基苯乙酮,异丙醇40%(v/v),Na-NAD200mg/L,30℃生物转化。反应结束后用等体积乙酸乙酯萃取,气相色谱分析转化率和ee值,结果见表1。 
表1羰基还原酶ChKRED20纯酶对不同浓度底物转化 

实施例6:羰基还原酶ChKRED20粗酶粉生物催化 
粗酶粉的制备方法及转化体系见说明书发明内容部分,表1为添加不同的粗酶量和高浓度底物时得到的产物转化率和ee值。在未经优化的情况下,酶量为10g/L时,24h内可转化200g/L底物,转化效率99%以上; 酶量为2g/L时,转化效率也可达94%,且e均>99.9%。同时,将产物过硅胶柱纯化回收,在实验室条件下可实现90%以上的回收率。因此,该酶催化工艺极具经济效益,具备很强的工业应用潜力。粗酶粉对不同浓度底物转化情况见下表2。 
表2粗酶粉对不同浓度底物转化情况 


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1、(10)申请公布号 CN 103497911 A (43)申请公布日 2014.01.08 CN 103497911 A (21)申请号 201310399109.2 (22)申请日 2013.09.05 CCTCC M 2012484 2012.11.27 C12N 1/20(2006.01) C12N 15/53(2006.01) C12N 9/04(2006.01) C12P 7/22(2006.01) C12R 1/01(2006.01) (71)申请人 中国科学院成都生物研究所 地址 610041 四川省成都市武侯区人民南路 四段九号 (72)发明人 吴中柳 刘艳 汤脱险 裴小琼 (。

2、74)专利代理机构 成都赛恩斯知识产权代理事 务所 ( 普通合伙 ) 51212 代理人 张帆 肖国华 (54) 发明名称 金黄杆菌及其羰基还原酶用于阿瑞匹坦手性 中间体生产 (57) 摘要 本 发 明 公 开 了 一 株 金 黄 杆 菌 (Chryseobacterium sp.CA49, 保 藏 号 为 CCTCC M2012484) 及该菌基因组编码的一种羰基还原酶 ChKRED20, 并利用该菌原始菌株或该种羰基还原 酶作为生物催化剂制备阿瑞匹坦手性醇中间体 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 苯基 乙醇。产物 的对映体过量值大于 99.9%。以 ChKRED20 粗酶粉 可催。

3、化高达 200g/L 的底物, 24h 内获得 99% 以上 转化率, 且辅酶循环体系简单、 廉价, 产物分离提 纯容易, 回收率高, 极具工业应用前景。 (83)生物保藏信息 (51)Int.Cl. 权利要求书 1 页 说明书 7 页 序列表 2 页 附图 1 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 权利要求书1页 说明书7页 序列表2页 附图1页 (10)申请公布号 CN 103497911 A CN 103497911 A 1/1 页 2 1. 一种保藏号为 CCTCC M2012484 的金黄杆菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA49) 。。

4、 2. 一种从权利要求 1 所述的金黄杆菌 CA49 (Chryseobacterium sp.CA49) 中调取出来 的羰基还原酶 ChKRED20, 其特征在于其核苷酸序列为如 SEQ No.1 所示, 其氨基酸序列为如 SEQ No.2 所示。 3.权利要求1所述的金黄杆菌CA49作为生物催化剂在转化底物3,5-双三氟甲基苯乙 酮生成 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 苯基 乙醇中的应用。 4.权利要求2所述的羰基还原酶ChKRED20作为生物催化剂在转化底物3,5-双三氟甲 基苯乙酮生成 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 苯基 乙醇中的应用。 权 利 要 求 书 C。

5、N 103497911 A 2 1/7 页 3 金黄杆菌及其羰基还原酶用于阿瑞匹坦手性中间体生产 技术领域 0001 本发明属于应用微生物与酶工程领域, 具体涉及一株金黄杆菌及其基因组编码的 一种新型羰基还原酶, 并利用该菌或者这种羰基还原酶作为生物催化剂生产阿瑞匹坦手性 中间体。 背景技术 0002 光学活性 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 苯基 乙醇是 Merk 公司研发的药物阿瑞 匹坦 (Aprepitant, 商品名 “Emend” ) 的关键手性中间体。阿瑞匹坦的主要功能是预防和治 疗化疗引起的急性或延迟性呕吐。 0003 目前制备该手性中间体的主流工艺是化学合成。近年来。

6、, 随着生物催化技术 的不断发展, 研究者们积极探索采用酶催化前手性酮的方法生产该中间体, 筛选到了一 些对映体选择性 99% 的微生物菌株, 包括 Lactobacillus Kefir、 Aspergillus niger (Tetrahedron : Asymmetry, 2006,17,2000-2005) , Penicillium expansum(Tetrahedron : Asymmetry, 2009,20,2759-2763) ,Leifsonia xyli HS0904(Appl Microbiol Biotechnol,2011,90,1897-1904) , 氧 化 。

7、微 杆 菌 Microbacterium oxydans C3(专 利 号 ZL201010271579.7) , 以及选择性稍差的热带假丝酵母菌 Candida tropicalis20216(ee 值 92%, Tetrahedron,2004,60,789-797)等。但是, 这些报道都是以微生物菌株全细胞 作为生物催化剂, 可转化的底物浓度较低, 目前仅有 Leifsonia xyli HS0904 转化的底 物浓度较高, 最高可转化 的底物浓度为 51g/L, 30h 的转化率为 91.8%(J.Microbiol. Biotechnol.2013,23(3),343-350) 。考。

8、虑产物分离纯化成本问题, 这些菌株的转化能力与 实际应用还有较大的距离。 0004 为获得高效的前手性酮催化工艺, 首先应解决高效高选择性酶源问题, 从环境中 筛选新型微生物菌株作为催化剂是常用的有效途径之一。 然而原始菌株直接转化可能存在 安全性、 遗传稳定性问题, 原始菌株可能继续利用醇产物导致产物产量低以及原始菌株内 的其他酶可能对底物作用生成副产物等问题, 因此将原始菌株的关键羰基还原酶基因克隆 并异源表达, 以重组菌或者酶用于生物转化则可避免上述问题, 且这种催化体系较为简单, 稳定, 产物分离提纯容易, 易于工业化。 发明内容 0005 本发明的目的是公开一种新筛选的金黄杆菌 CA。

9、49 (Chryseobacterium sp.CA49) , 及其所产高活力高对映选择性羰基还原酶 ChKRED20, 并利用该菌或者该酶还原底物 3,5- 双三氟甲基苯乙酮制备光学纯 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 苯基 乙醇, 从而以生物 催化的方法制备高光学纯度的阿瑞匹坦手性中间体。该菌从果园土壤中富集、 分离并经过 多轮筛选后获得。关于该菌的保藏信息是 : 保藏号为 CCTCC M2012484 ; 分类命名为金黄杆 菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA49) ; 于 2012 年 11 月 27 日在中国典型培养物保藏中心 保藏, 地址是湖北省武汉。

10、市武昌珞珈山武汉大学保藏中心。 说 明 书 CN 103497911 A 3 2/7 页 4 0006 基于上述发明目的, 本发明首先提供一种金黄杆菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA49) , 保藏编号为 CCTCC M2012484) 。 0007 本发明还提供了上述金黄杆菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA49) 的筛选方法, 所述筛选方法为 : 于果园采集土样, 以3,5-双三氟甲基苯乙酮为唯一碳源, 经2轮富集筛选 获得可能的产酶菌株。 将初筛菌株培养后, 以休止细胞为催化剂转化底物, 测定产物生成量 和产物对映体过量值, 并将产物对映体过。

11、量值高的菌株进行进一步的鉴定, 得到本发明涉 及的金黄杆菌。 0008 本发明还提供一种上述金黄杆菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA49) 作为生物催 化剂在转化底物 3,5- 双三氟甲基苯乙酮生成 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 苯基 乙醇中 的应用。 0009 具体地, 上述用途的操作方法为 : 将筛选的金黄杆菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA49) 培养后, 收集菌体, 以休止细胞作为催化剂, 并添加异丙醇和葡萄糖作为辅酶循环 底物, 底物 3,5- 双三氟甲基苯乙酮经生物转化后得到 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 。

12、苯基 乙醇, 产物的对映体过量值 99%。 0010 另外, 本发明还提供一种羰基还原酶 ChKRED20。该酶是从上述金黄杆菌 CA49 (Chryseobacterium sp.CA49) 中调取出来的。 0011 本发明还提供一种上述羰基还原酶ChKRED20作为生物催化剂在转化底物3,5-双 三氟甲基苯乙酮生成 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 苯基 乙醇中的应用。 0012 其中, 从上述金黄杆菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA49) 中关键羰基还原酶基 因 ChKRED20 的调取和生物转化包括以下步骤 : 0013 (1) 基因 chKRED20。

13、 的调取和鉴定 : 0014 将上述金黄杆菌 CA49 (Chryseobacterium sp.CA49) 全基因组测序 (深圳华大基因 公司完成) , 根据测序框架图预测的基因功能, 调取出40余个可能具有羰基还原酶功能的基 因, 将这些基因用常规 PCR 方法克 隆, 并连入 pET28a(+) 载体, 转入大肠杆菌 BL21(DE3) 中以常规方法过量表达。将这些重组菌休止细胞作为催化剂转化 3,5- 双三氟甲基苯乙酮, 获得 R- 型醇产物且 ee 值大于 99% 的酶有 3 个 (ChKRED08、 ChKRED19、 ChKRED20) 。在培养 基中加入或者不加入 3,5- 双。

14、三氟甲基苯乙酮, 以新鲜培养的菌提取总 RNA, 通过 RT-PCR 分 析, 两种情况下均只有 ChKRED08 和 ChKRED20 酶的基因表达 (总 RNA 提取和 RT-PCR 方法均 为常规方法) 。同时, 测定了 ChKRED08 和 ChKRED20 酶的活力, ChKRED20 酶活是 ChKRED08 的 7 倍左右。因此, 最后确定金黄杆菌 CA49 (Chryseobacterium sp.CA49) 中关键羰基还原酶 基因为 chKRED20。 0015 其中, 上述步骤中涉及的chKRED20基因PCR扩增所用引物为 : 正向5-GAATTCAT GGGAATTTT。

15、AGACAACAAAGTAGC-3 (酶切位点 EcoR I) , 反向 5 -GTCGACTTAAACTGCCGTGTAGC CACC-3(酶切位点 Sal I) ; 0016 PCR 条件为, 95预变性 5min, 94变性 30s, 55退火 30s, 72延伸 1min, 30 个 循环, 最后 72延伸 10min。PCR 产物连入 pMD19T 载体构建 TA 克隆, 而后将测序正确的质 粒以 EcoR I 和 Sal I 酶切, 将其连入以同样酶消化的 pET28a (+) 空载体中, 构建重组质粒, 并转入大肠杆菌 BL21(DE3) 中, 构建重组菌。 0017 chKRE。

16、D20 基因碱基数为 750bp, 其序列为 (SEQ No.1) 说 明 书 CN 103497911 A 4 3/7 页 5 0018 ATGGGAATTTTAGACAACAAAGTAGCACTTGTTACAGGAGCAGGATCCGGAATCGGATTAGCTGTTGCT CATTCGTATGCAAAAGAAGGCGCCAAAGTTATTGTATCCGATATTAATGAAGATCACGGTAACAAAGCAGTCGAAGA CATTAAAGCACAAGGCGGGGAAGCGTCTTTT GTAAAAGCAGATACTTCAAACCCTGAAGAAGTGGAAGCTTTAGTA AAAA。

17、GAACAGTAGAAATCTACGGAAGACTTGATATTGCATGTAATAATGCGGGAATCGGTGGCGAACAGGCGCTGGC AGGCGATTACGGTCTCGACAGCTGGCGAAAAGTATTAAGCATAAATCTTGATGGCGTATTCTACGGGTGCAAATATG AGTTAGAACAAATGGAAAAAAACGGGGGCGGCGTTATTGTGAATATGGCCTCTATTCATGGTATTGTTGCTGCACCG CTTTCCTCAGCCTACACTTCTGCAAAGCACGCAGTGGTAGGGCTTACTAAAAATATAGGAGCAGAATACG。

18、GACAGAA AAATATCCGTTGCAATGCGGTGGGGCCTGCTTATATTGAAACCCCGCTGTTGGAAAGCCTGACAAAGGAAATGAAGG AAGCACTGATTTCAAAACATCCGATGGGAAGACTGGGAAAACCTGAAGAAGTAGCAGAACTGGTGTTGTTCCTGAGT TCAGAAAAATCATCTTTTATGACGGGAGGCTATTATCTTGTAGATGGTGGCTACACGGCAGTTTAA ; 0019 chKRED20 基因编码 249 个氨基酸, 序列为 (SEQ No.2) : 0020 MGILDNKVALVTGAGS。

19、GIGLAVAHSYAKEGAKVIVSDINEDHGNKAVEDIKAQGGEASFVKADTSNPEE VEALVKRTVEIYGRLDIACNNAGIGGEQALAGDYGLDSWRKVLSINLDGVFYGCKYELEQMEKNGGGVIVNMASIHG IVAAPLSSAYTSAKHAVVGLTKNIGAEYGQKNIRCNAVGPAYIETPLLESLTKEMKEALISKHPMGRLGKPEEVAELV LFLSSEKSSFMTGGYYLVDGGYTAV。 0021 (2) 重组菌生物催化 : 0022 挑取单克隆至 LB (含卡那霉素 50g/ml) 培养基中, 37过夜培养,。

20、 以 1% 的接种量 转接至 TB(含卡那霉素 50g/ml) 培养基中, 37培养 3h, 加入 0.5mM IPTG 诱导后, 30 继续培养至 20 36h。8000rpm, 4离心收集菌体, 用 pH 值为 7.0、 0.1M 浓度的磷酸钾缓冲 溶液洗涤 2 次, 获得湿菌体。 0023 取上述新鲜培养的湿菌体重悬于上述缓冲液, 加入底物 3,5- 双三氟甲基苯乙酮, 加入 1% 3%(w/v, 占总转化体系的质量体积百分数) 葡萄糖和 / 或 5% 异丙醇 (v/v, 占总 转化体系的体积百分数) 作为辅酶循环底物。转化体系中菌体浓度为 50 150g/L, 底物终 浓度为 1 15。

21、0g/L, 转化温度为 30, 转速为 230rpm, 转化时间为 1 24h。 0024 (3) ChKRED20 酶的辅酶依赖型和比活力测定 0025 ChKRED20 酶的纯化采用镍柱亲和层析 (Bio-Rad) 。将上述步骤 (2) 诱导培养 20 36h 后的菌体以 13,000rpm, 4离心收集, 重悬于 Buffer A(50mM 磷酸盐缓冲液, pH8.0, 300mM NaCl, 10mM 咪唑) , 超声破碎 (超声 10s, 间隔 30s, 30 次) , 之后以 13,000rpm, 4离心 20min, 将上清液加入已用 Buffer A 平衡的柱料中, 轻微混匀 。

22、30min, 用含有 20mM 咪唑的 Buffer A 漂洗杂蛋白, 再用含 250mM 咪唑的 Buffer A 的缓冲液洗脱目的蛋白, 最后电泳鉴 定纯度, 并用 BCA Protein Assay kit 测定蛋白浓度。 0026 辅酶依赖型的确定 : 磷酸钾缓冲液 (0.1M, pH7.0) , 加有 0.2mg/ml 纯酶, 10mM 底物 和 20mM NADH 或者 NADPH, 30反应 2h。等体积乙酸乙酯萃取, 测定产物的转化率。以 NADH 为辅酶时, 转化率为 76% ; 以 NADPH 为辅酶时, 转化率为 56% ; 两者的 ee 值均大于 99.9%, 因 此该。

23、酶以 NADH 为辅酶时转化率更高。 0027 比活力测定反应条件 : 1ml 磷酸钾缓冲液 (0.1M, pH7.0) 加有 0.2mg 纯酶, 10mM 底 物和 40mM NADH, 30反应 1min。等体积乙酸乙酯萃取, 测定产物的生成量。酶活力单位定 义为 : 1min 内催化生成 1mol 产物所需的酶量。ChKRED20 纯酶的比活力达到 43U。 0028 (4) 粗酶粉生物催化 : 说 明 书 CN 103497911 A 5 4/7 页 6 0029 表达 ChKRED20 酶的大肠杆菌重组菌的菌体培养、 获得湿菌体的步骤同步骤 (2) 。 0030 取新鲜培养的湿菌体重。

24、悬于磷酸盐缓冲液 (pH7.0, 0.1M) , 湿菌体终浓度为 50 150g/L, 以超声破碎机破细胞, 13,000rpm 离心后取上清液冷冻于 -80过夜, 而后用冷冻 干燥机干燥至粉状, 制成粗酶粉。转化体系为 : 磷酸钾缓冲液 (0.1M, pH7.0), 粗酶粉, 底物 3,5- 双三氟甲基苯乙酮, 异丙醇 (辅酶循环底物, 用量为 40%, v/v) , Na-NAD(200mg/L) ; 转 化条件 : 30, 100rpm, 24h。 0031 粗酶粉用量为 10g/L, 底物 3,5- 双三氟甲基苯乙酮浓度为 200g/L, 转化 24h 可实 现转化率 99%, ee 。

25、值 99.9%。 0032 本发明涉及的金黄杆菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA49) 可高效转化 3,5- 双 三氟甲基苯乙酮生成 R- 醇, 其关键羰基还原酶基因 chKRED20 与 NCBI 数据库中其他基因 的相似度最高 70%, 氨基酸序列的最高相似度为 76%, 与已报道的功能蛋白 (NCBI 登录号为 : BAD99642) 的最高相似度为 51%, 为 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 苯基 乙醇生物催化合成 提供了可供选择的新型酶源。 0033 该蛋白在大肠杆菌中过量表达后制成粗酶粉, 10g/L 的酶量便可在 24h 内转化高 达 200。

26、g/L 的底物, 且转化率为 99% 以上, ee 值大于 99.9%。粗酶转化工艺简单, 以廉价异丙 醇和少量 NAD+作为辅酶循环, 产物易于分 离纯化, 回收率高达 90% 以上, 极具工业应用前 景。 0034 凡是与 ChKRED20 氨基酸相似度高于 51% 且具有催化 3,5- 双三氟甲基苯乙酮生成 (R)-1-3,5- 二 ( 三氟甲基 ) 苯基 乙醇功能的酶均属于本发明的保护范围。 0035 图 1 是 ChKRED20 蛋白纯化后 SDS-PAGE 图。 附图说明 0036 以下结合实施例详细地说明本发明。实施方案为便于更好的理解本发明, 但并非 对本发明的限制。 具体实施。

27、方式 0037 实施例 1 : 菌株筛选 0038 于某果园采集土样, 以 3,5- 双三氟甲基苯乙酮 (2g/L)为唯一碳源并添加无机 盐于 30, 230rpm 培养 7 10 天。无机盐为 : Na2HPO42g/L, KH2PO41g/L, NH4Cl0.4g/L, MgCl20.4g/L。从富集液中取出 1% 加入到上述相同培养基中再次富集培养 7 10 天。而后 将培养液稀释 104倍, 并涂布至筛选平板上 (上述无机盐 +3,5- 双三氟甲基苯乙酮 1g/L 酵母粉0.5g/L琼脂粉15g/L) , 30培养13天, 每支平板上可见许多微生物单菌落, 这 些菌株为可能的产酶菌株。。

28、 0039 将富集平板中的单菌落用无菌牙签逐一接入 24 孔筛选板各孔 (Costar, 美国) 进 行培养 (每孔装有发酵培养基 1ml, 发酵培养基组分 : 蛋白胨 5g/L, 牛肉膏 1.5g/L, 酵母粉 1.5g/L, NaCl5g/L, 葡萄糖 10g/L) , 30, 240rpm 培养 24h。6000rpm 离心收集菌体, 用磷酸 钾缓冲液 (pH7.0、 0.1M) 洗涤 2 次, 再加入 1ml 缓冲液重悬菌体, 而后加入底物 3,5- 双三氟 甲基苯乙酮 5mg, 30, 270rpm 进行生物催化筛选试验。转化 36h 后, 以 200l 乙酸乙酯萃 取。以气相手性柱。

29、分析产物的对映体过量值, 得到产 (R)- 醇菌株 5 株。其中 1 株为本发明 说 明 书 CN 103497911 A 6 5/7 页 7 涉及的金黄杆菌 (Chryseobacterium sp.CA49) , 产物对映体过量值大于 99%。 0040 实施例 2 : 筛选菌株的鉴定 0041 为确定该菌株分类地位并详细了解其性能, 对该菌株进行了初步鉴定。该菌株的 菌落为圆型, 光滑, 随培养时间不同, 菌落呈浅黄色到金黄色。 0042 16S rRNA 鉴定 : 基因组 DNA 为模板, 以细菌通用引物 27f 和 1492r 扩增 16S rRNA 序列, 并将 PCR 产物直接送。

30、样测序, 获得的部分序列 (1381bp) 如下 (SEQ No.3) : 0043 AGCTGAGCGGTAGAGTTTCTTCGGAGACTTGAGAGCGGCGTACGGGTGCGGAACACGTGTGCAACCTGC CTTTATCAGGGGGATAGCCTTTCGAAAGGAAGATTAATACCCCATAATATATAGAGTGGCATCACTTTATATTGAAA ACTGAGGTGGATAAAGATGGGCACGCGCAAGATTAGATAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGTCGATGATCTTTA GGGGGCCTGAGAGGGTGATCCCCCACACTGG。

31、TACTGAGACACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAAT ATTGGACAATGGGTTAGCGCCTGATCCAGCCATCCCGCGTGAAGGACGACGGCCCTATGGGTTGTAAACTTCTTTTG TACAGGGATAAACCTATTTACGTGTAAATAGCTGAAGGTACTGTACGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAG CCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGTTTAAAGGGTCCGTAGGCGGATCTGTAAGTCAG TGGTGAAATCTCACAGCTT。

32、 AACTGTGAAACTGCCATTGATACTGCAGGTCTTGAGTAAGGTAGAAGTGGCTGGAAT AAGTAGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATATTACTTAGAACACCAATTGCGAAGGCAGGTCACTATGTCTTAACTGAC GCTGATGGACGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGCTAACTCGTT TTTGGGCTTTCGGGTTCAGAGACTAAGCGAAAGTGATAAGTTAGCCACCTGGGGAGTACGAACGCAAGTTTGAAACT CAAAGGA。

33、ATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGATTATGTGGTTTAATTCGATGATACGCGAGGAACCTTACCAAG GCTTAAATGGGAATTGATCGGTTTAGAAATAGACCTTCCTTCGGGCAATTTTCAAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAG CTCGTGCCGTGAGGTGTTAGGTTAAGTCCTGCAACGAGCGCAACCCCTGTTACTAGTTGCTACCATTAAGTTGAGGA CTCTAGTAAGACTGCCTACGCAAGTAGAGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCACGGCCCTTACGCCTT。

34、GGGC CACACACGTAATACAATGGCCGGTACAGAGGGCAGCTACACAGCGATGTGATGCAAATCTCGAAAGCCGGTCTCAGT TCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCTATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGCATCAGCCATGGCGCGGTGAATA CGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGAAGTCTGGGGTACCTGAAGTCGGTGACCGTAAAAGGAG CTGC 0044 经NCBI的blast比对, 该菌与Chryseobacterium taiwanense, Chry。

35、seobacterium sp.MG-2011-139-ER、 Chryseobacterium sp.HNR12等菌株的同源性大于99%, 初步可确定为 Chryseobacterium sp. 金黄杆菌属, 实验室自编号为 Chryseobacterium sp.CA49, 2012 年 11 月 27 日在中国典型培 养物保藏中心保藏, 保藏号为 CCTCC M2012484。 0045 实施例 3 : 金黄杆菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA49) 原始菌株生物催化 0046 菌株培养 : 将少量金黄杆菌 CA49(Chryseobacterium sp.CA4。

36、9) 斜面种子接种于 发酵培养基中 (组分同实施例 1) , 30, 230rpm 培养 16 24h 制备种子液, 以 0.5% 2% 的 接种量转接至发酵培养基中扩大培养, 培养条件 : 30, 230rpm, 24 48h。 0047 休止细胞转化 : 将第 1 步培养的菌体以 13,000rpm 离心收集, 用 pH 值为 7.0、 0.1M 浓度的磷酸钾缓冲溶液洗涤 2 次。转化体系包括磷酸盐缓冲液 (pH 值 7.0、 0.1M) 、 菌体、 底 物和辅酶循环底物。辅酶底物为 5% 10%(v/v) 的异丙醇和 2% 5%(v/w) 的葡萄糖。菌 体浓度为 50 200g/L, 底。

37、物终浓度为 1 50g/L, 转化温度为 30, 转速为 230rpm, 转化时 间为 5 24h。以下为几种原始菌株休止细胞转化的具体实施例 : 0048 (1) 取菌体 0.5g 重悬于 10ml 缓冲液, 加入底物 3,5- 双三氟甲基苯乙酮 10mg, 并 说 明 书 CN 103497911 A 7 6/7 页 8 加入异丙醇 0.5ml(5%) 和葡萄糖 0.2g(2%) , 30, 230rpm 转化 5h。以 10ml 乙酸乙酯萃 取, 取有机相气相色谱 (SGE, 澳大利亚, AC-5, 30m0.22) 测定转化率为 95.6%, 气相手性柱 (CHIRASIL-DEX C。

38、B, 瓦里安 25m0.25) 测定产物 ee 值大于 99%。 0049 0050 产物数据如下 : 0051 无色液体, D25=+21.6(c=1, 乙腈 ); 0052 ee99%(CHIRASIL-DEX CB, 柱 温 :120 ,进 样 器 : 260 ,检 测 器 : 280 , t=8.403min); 0053 1H NMR(600MHz,CDCl3):7.84(s,2H,Ar-H),7.78(s,1H,Ar-H),5.04(q,J=6.54Hz ,1H,-CH),1.99(br,1H,OH),1.55(d,J=6.54Hz,3H,-CH3) 0054 (2) 取菌体 1.。

39、0g 重悬于 10ml 缓冲液中, 加入底物 100mg, 葡萄糖和异丙醇添加量 同上, 转化条件和分析方法也同上。底物的转化率为 91.5%, 产物对映体过量值大于 99%。 0055 (3)取菌体 1.5g 重悬于 10ml 缓冲液中, 加入底物 500mg, 并加入异丙醇 1.0ml (10%) 和葡萄糖 0.5g(5%) , 30, 230rpm 转化 24h。以 10ml 乙酸乙酯萃取, 经气相色谱分 析, 底物的转化率为 90.8%, 产物对映体过量值大于 99%。 0056 实施例 4 : 羰基还原酶 ChKRED20 重组菌全细胞生物催化 0057 羰基还原酶 ChKRED20。

40、 重组菌的培养方法和菌体收集方法见说明书发明内容部 分。 0058 (1) 取菌体0.5g, 重悬于10ml磷酸盐缓冲液, 加入底物10mg和0.1g葡萄糖, 30, 230rpm转化2h。 以10ml乙酸乙酯萃取, 经气相色谱分析, 底物的转化率为30.1%, 产物对映 体过量值大于 99.9%。 0059 (2) 取菌体 0.5g, 重悬于 10ml 磷酸盐缓冲液, 加入底物 10mg, 0.2g 葡萄糖和 0.5ml 异丙醇, 30, 230rpm 转化 1h。以 10ml 乙酸乙酯萃取, 经气相色谱分析, 底物的转化率为 29.5%, 产物对映体过量值大于 99.9%。 0060 (3。

41、)取菌体 1.0g, 重悬于 10ml 磷酸盐缓冲液, 加入底物 500mg 和 0.2g 葡萄糖, 30, 230rpm转化24h。 以10ml乙酸乙酯萃取, 经气相色谱分析, 底物的转化率为88.2%, 产 物对映体过量值大于 99.9%。 0061 (4) 取菌体 1.0g, 重悬于 10ml 磷酸盐缓冲液, 加入底物 500mg 和 0.5ml 异丙醇, 30, 230rpm转化24h。 以10ml乙酸乙酯萃取, 经气相色谱分析, 底物的转化率为79.1%, 产 物对映体过量值大于 99.9%。 0062 (5) 取菌体 1.5g, 重悬于 10ml 磷酸盐缓冲液, 加入底物 1500。

42、mg 和 0.5ml 异丙醇, 30, 230rpm转化24h。 以10ml乙酸乙酯萃取, 经气相色谱分析, 底物的转化率为46.1%, 产 物对映体过量值大于 99.9%。 0063 实施例 5 : 羰基还原酶 ChKRED20 纯酶生物催化 0064 转化体系 : 磷酸钾缓冲液 (0.1M, pH7.0) , 纯酶浓度 2g/L, 底物 3,5- 双三氟甲基苯 乙酮, 异丙醇 40%(v/v) , Na-NAD200mg/L, 30生物转化。反应结束后用等体积乙酸乙酯萃 说 明 书 CN 103497911 A 8 7/7 页 9 取, 气相色谱分析转化率和 ee 值, 结果见表 1。 0。

43、065 表 1 羰基还原酶 ChKRED20 纯酶对不同浓度底物转化 0066 0067 实施例 6 : 羰基还原酶 ChKRED20 粗酶粉生物催化 0068 粗酶粉的制备方法及转化体系见说明书发明内容部分, 表 1 为添加不同的粗酶量 和高浓度底物时得到的产物转化率和 ee 值。在未经优化的情况下, 酶量为 10g/L 时, 24h 内可转化 200g/L 底物, 转化效率 99% 以上 ; 酶量为 2g/L 时, 转化效率也可达 94%, 且 e 均 99.9%。 同时, 将产物过硅胶柱纯化回收, 在实验室条件下可实现90%以上的回收率。 因此, 该酶催化工艺极具经济效益, 具备很强的工业应用潜力。粗酶粉对不同浓度底物转化情况 见下表 2。 0069 表 2 粗酶粉对不同浓度底物转化情况 0070 说 明 书 CN 103497911 A 9 1/2 页 10 0001 0002 序 列 表 CN 103497911 A 10 2/2 页 11 序 列 表 CN 103497911 A 11 1/1 页 12 图 1 说 明 书 附 图 CN 103497911 A 12 。

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