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1、10申请公布号CN104046558A43申请公布日20140917CN104046558A21申请号201410090342722申请日20140312201305068020130313JPC12M1/0020060171申请人精工爱普生株式会社地址日本东京都72发明人齐藤祐司高城富美男74专利代理机构北京集佳知识产权代理有限公司11227代理人金世煜苗堃54发明名称核酸扩增反应用筒57摘要本发明提供能够简便地进行核酸扩增反应的核酸扩增反应用筒。所述核酸扩增反应用筒,具备管、核酸扩增反应用容器以及柱塞,所述管在内部依次具备由第1油构成的第1塞子,由与油混合时相分离且清洗结合有核酸的核酸结合。
2、性固相载体的第2清洗液构成的第2塞子,由第2油构成的第3塞子,由与油混合时相分离且进行逆转录反应的逆转录反应液构成的第4塞子,由第3油构成的第5塞子,由与油混合时相分离且从核酸结合的核酸结合性固相载体溶出上述核酸的溶出液构成的第6塞子和由第4油构成的第7塞子;所述核酸扩增反应用容器与上述管的第7塞子侧连通且含有油;所述柱塞安装于上述管的第1塞子侧的开口部,从管的第7塞子侧向上述核酸扩增反应用容器推出液体。30优先权数据51INTCL权利要求书2页说明书27页附图20页19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书2页说明书27页附图20页10申请公布号CN104046558ACN1。
3、04046558A1/2页21一种核酸扩增反应用筒,具备管、核酸扩增反应用容器以及按压机构,所述管在内部依次具备由第1油构成的第1塞子,与油混合时相分离且清洗结合有核酸的核酸结合性固相载体的第2清洗液构成的第2塞子,由第2油构成的第3塞子,由与油混合时相分离且进行逆转录反应的逆转录反应液构成的第4塞子,由第3油构成的第5塞子,由与油混合时相分离且从结合有核酸的核酸结合性固相载体溶出所述核酸的溶出液构成的第6塞子,由第4油构成的第7塞子;所述核酸扩增反应用容器与所述管的第7塞子侧连通且含有油;所述按压机构安装于所述管的第1塞子侧的开口部,从所述管的所述第7塞子侧向所述核酸扩增反应用容器推出液体。。
4、2根据权利要求1所述的核酸扩增反应用筒,其中,所述管进一步在所述第5塞子与所述第6塞子之间,从第5塞子侧依次具备由与油混合时相分离且清洗结合有核酸的核酸结合性固相载体的第3清洗液构成的第10塞子,和由第6油构成的第11塞子。3根据权利要求1或2所述的核酸扩增反应用筒,其中,所述管进一步在所述第7塞子的核酸扩增反应用容器侧,从第7塞子侧依次具备与油混合时相分离且含有进行核酸扩增反应的试剂的核酸扩增反应液构成的第8塞子,由第5油构成的第9塞子。4根据权利要求1或2所述的核酸扩增反应用筒,其中,所述核酸扩增反应用容器包含由与油混合时相分离且含有进行核酸扩增反应的试剂的核酸扩增反应液构成的液滴。5根据。
5、权利要求1或2所述的核酸扩增反应用筒,其中,所述溶出液含有进行核酸扩增反应的试剂。6根据权利要求35中任1项所述的核酸扩增反应用筒,其中,所述用于进行核酸扩增反应的试剂包含DNA聚合酶、DNTP、引物。7根据权利要求16中任1项所述的核酸扩增反应用筒,其中,所述按压机构是柱塞,在所述柱塞的内部收容有油和与油混合时相分离且清洗结合有核酸的所述核酸结合性固相载体的第1清洗液。8根据权利要求17中任1项所述的核酸扩增反应用筒,其中,所述核酸扩增反应用容器具有固定所述管的密封形成部以及液滴移动的流路形成部。9根据权利要求8所述的核酸扩增反应用筒,其中,所述密封形成部具有接受从所述流路形成部溢出的油的油。
6、接受部。10根据权利要求19中任1项所述的核酸扩增反应用筒,进一步具备与所述管的第权利要求书CN104046558A2/2页31塞子侧连通的、向所述管导入所述核酸结合性固相载体的罐。11根据权利要求10所述的核酸扩增反应用筒,其中,所述罐与所述管介由所述柱塞结合。12一种核酸扩增反应用筒试剂盒,具备权利要求19所述的核酸扩增反应用筒和向所述管导入所述核酸结合性固相载体的罐。13根据权利要求12所述的核酸扩增反应用筒试剂盒,其中,所述罐包含提取核酸的溶解液和所述核酸结合性固相载体。14根据权利要求12或13所述的核酸扩增反应用筒试剂盒,其中,所述罐具有开口部,在所述开口部具有可拆的盖。15根据权。
7、利要求14所述的核酸扩增反应用筒试剂盒,其中,所述罐的开口部以可安装于所述管的第1塞子侧的开口部的方式构成。权利要求书CN104046558A1/27页4核酸扩增反应用筒技术领域0001本发明涉及核酸扩增反应用筒CARTRIDGE。背景技术0002BOOM等人报告了使用二氧化硅粒子等核酸结合性固相载体和离液剂从生物体材料更简便地提取核酸的方法(参照非专利文献1)。包括该BOOM等人的方法的使用二氧化硅等核酸结合性固相载体和离液剂使核酸吸附于载体而提取的方法主要由以下3个工序构成(1)在离液剂存在下,使核酸吸附于核酸结合性固相载体的工序(吸附工序),(2)为了除去非特异性结合的夹杂物和离液剂,用。
8、清洗液清洗吸附了核酸的载体的工序(清洗工序),以及(3)用水或低盐浓度缓冲液使核酸从载体溶出的工序(溶出工序)。0003然而,最近,除了以往的PCR装置以外,也开发有容易控制加热时间的热循环装置(参照专利文献1),但至今尚未开发出能够适用于这些装置的筒等。0004专利文献1日本特愿20102680900005非专利文献1JCLINMICROBIOL,VOL28NO3,P495503(1990)发明内容0006本发明的目的在于提供能够简便地进行核酸扩增反应的核酸扩增反应用筒。0007本发明的一个实施方式的核酸扩增反应用筒,具备管、核酸扩增反应用容器以及柱塞,所述管在内部依次具备由第1油构成的第1。
9、塞子(PLUG),由与油混合时相分离且清洗结合有核酸的核酸结合性固相载体的第2清洗液构成的第2塞子,由第2油构成的第3塞子,由与油混合时相分离且进行逆转录反应的逆转录反应液构成的第4塞子,由第3油构成的第5塞子,由与油混合时相分离且从核酸结合的核酸结合性固相载体溶出上述核酸的溶出液构成的第6塞子和由第4油构成的第7塞子;所述核酸扩增反应用容器,与上述管的第7塞子侧连通且含有油;所述柱塞安装于上述管的第1塞子侧的开口部,从管的第7塞子侧向上述核酸扩增反应用容器推出液体。该筒中,上述管也可以进一步在第5塞子与第6塞子之间,从第5塞子侧依次具备由与油混合时相分离且清洗结合有核酸的核酸结合性固相载体的。
10、第3清洗液构成的第10塞子和由第6的油构成的第11塞子。上述管还可以进一步在第7塞子的核酸扩增反应用容器侧,从第7塞子侧依次具备与油混合时相分离且含有进行核酸扩增反应的试剂的核酸扩增反应液构成的第8塞子和由第5油构成的第9塞子。上述核酸扩增反应用容器还可以含有由与油混合时相分离且含有进行核酸扩增反应的试剂的核酸扩增反应液构成的液滴。进行核酸扩增反应的试剂也可以不包含在上述溶出液。上述用于进行核酸扩增反应的试剂优选含有DNA聚合酶、DNTP、引物。0008上述任一筒中可以在上述柱塞的内部收容有油和与油混合时相分离且清洗结合有核酸的上述核酸结合性固相载体的第1清洗液。另外,上述核酸扩增反应用容器可。
11、以具有固定上述管的密封形成部和供液滴移动的流路形成部。优选上述密封形成部具有接受从上述流路形成部溢出的油的油接受部。说明书CN104046558A2/27页50009上述任一筒中可以进一步具备与上述管的第1塞子侧连通的、向上述管导入上述核酸结合性固相载体的罐。优选上述罐与上述管介由上述柱塞结合。0010本发明的一个实施方式的核酸扩增反应用筒试剂盒具备上述任一核酸扩增反应用筒和向上述管导入上述核酸结合性固相载体的罐。上述罐可以含有提取核酸的溶解液和上述核酸结合性固相载体。上述罐可以具有开口部,在上述开口部具有可拆的盖。上述罐的开口部可以构成为能够安装在上述管的第1塞子侧的开口部。0011根据本发。
12、明,能够提供简便地进行核酸扩增反应的核酸扩增反应用筒。附图说明0012图1的图1A图1C是本发明的一个实施方式中的筒1的说明图。0013图2的图2A图2C是本发明的一个实施方式中的筒1的动作说明图。0014图3的图3A图3D是本发明的一个实施方式中的罐3的说明图。0015图4是本发明的一个实施方式中的固定爪25以及导板26和安装部62的说明图。0016图5的图5A和图5B是本发明的一个实施方式中的PCR容器30的周边的说明图。0017图6的图6A是本发明的一个实施方式中的PCR装置100的内部构成的立体图。图6B是本发明的一个实施方式中的PCR装置100的主要构成的侧视图。0018图7是本发明。
13、的一个实施方式中的PCR装置100的框图。0019图8的图8A是本发明的一个实施方式中的旋转体61的说明图。图8B是本发明的一个实施方式中的在旋转体61的安装部62安装了筒1的状态的说明图。0020图9的图9A图9D是本发明的一个实施方式中的安装筒1时的PCR装置100的状态的说明图。0021图10是本发明的一个实施方式中使磁铁71向下方移动时的磁珠7的举动的概念图。0022图11的图11A图11C是本发明的一个实施方式中的核酸溶出处理的说明图。0023图12是本发明的一个实施方式中的使磁铁71摆动时的磁珠7的举动的概念图。0024图13是表示本发明的一个实施方式中的磁铁71有无摆动的表。00。
14、25图14的图14A图14C是本发明的一个实施方式中的液滴形成处理的说明图。0026图15的图15A和图15B是本发明的一个实施方式中的热循环处理的说明图。0027图16是本发明的一个实施例中的核酸提取用器具的构成的示意图。0028图17是本发明的一个实施例中的核酸提取用装置的构成的示意图。0029图18是表示本发明的一个实施例的核酸提取方法中矩形磁铁的使用方法的图。0030图19是本发明的一个实施例中,关于1阶段溶出用毛细管(1STEP)和2阶段溶出毛细管(2STEP),对使用各自得到的含核酸溶出液进行PCR时的检测灵敏度的经时变化进行比较示出的图。0031图20是本发明的一个实施例中,关于。
15、1阶段溶出用毛细管(1STEP)和2阶段溶出毛细管(2STEP),对使用各自得到的含核酸溶出液进行PCR时的检测灵敏度进行比较示出的图。0032图21是本发明的一个实施例的2阶段溶出毛细管(2STEP)中,关于逆转录反应液塞子之后,未进一步设置由清洗液构成的塞子的情况和设置的情况,对使用各自得到的说明书CN104046558A3/27页6核酸含有溶出液进行PCR时的检测灵敏度进行比较示出的图。具体实施方式0033以下,对本发明的实施方式进行详细说明。应予说明,本发明的目的、特征、优点以及其构思,根据本说明书的记载,对于本领域技术人员而言是清楚的,根据本说明书的记载,本领域技术人员能够容易地再现。
16、本发明。以下记载的发明的实施方式是表示本发明的优选的实施方式,是为了例示或说明而表示的,本发明不限定于此。对本领域技术人员来说清楚的是在本说明书中公开的本发明的意图以及范围内可以基于本说明书的记载进行各种改变以及修饰。0034首先,对安装于PCR装置100的筒进行说明,之后对本实施方式的PCR装置100的构成动作进行说明。0035筒0036图1A图1C是筒1的说明图。图2A图2C是筒1的动作说明图。图2A是筒1的初始状态的说明图。图2B是从图2A的状态按压柱塞10,密封12A接触下注射筒22时的侧视图。图2C是按压柱塞10后的筒1的说明图。0037筒1是进行从核酸结合的磁珠7溶出核酸到溶出液4。
17、9中的核酸溶出处理的容器,而且是对含有进行扩增的核酸和进行核酸扩增反应的试剂的混合液(以下,称为PCR溶液)进行聚合酶反应热循环处理的容器。0038核酸提取处理在罐3中进行,在通过管20期间进行精制。管20的材质没有特别限定,例如,可以为玻璃、塑料等树脂、金属等。特别是选择透明的玻璃、树脂作为管20的材质,则能够从管20的外部观察空腔内部,因而更优选。另外,如果选择使磁力透过的物质、非磁性体作为管20的材质,则使磁性粒子通过管20时,通过从管20的外部给予磁力而更容易进行核酸提取处理,因而优选。应予说明,管20的材质可以与罐的材质相同。0039管20具有第2清洗液塞子45、逆转录反应液塞子47。
18、、溶出液塞子49以及油塞子。由于结合有核酸的磁珠7被外部的磁铁吸引,所以通过使磁铁沿管20在外部移动,从而磁珠7在管20内移动,通过第2清洗液塞子45和逆转录反应液塞子47到达溶出液塞子49。与磁珠7结合的核酸在第2清洗液塞子45被清洗液清洗,在逆转录反应液塞子47被逆转录,在溶出液塞子49溶出。这里,“塞子”是指在管20内特定的液体占一分区时的液体。例如,图2A图2C中将在毛细管23内保持为柱状的液体叫作“塞子”。应予说明,油与其他的溶液混合时相分离,因此,由油构成的塞子具有防止其两侧的水溶性的塞子相互混合的功能。优选在塞子中、塞子间没有气泡、其他液体,但只要磁珠7能够通过塞子,也可以存在气。
19、泡、其他液体。0040油的种类没有特别限定,可以使用矿物油、硅油(2CS硅油等)、植物油等,通过设为更高粘度的油,从而在与上侧的塞子间的界面上,使核酸结合性固相载体移动时能够提高由油引起的“洗刷效果”。由此,从上侧的塞子向由油构成的塞子移动核酸结合性固相载体时,能够更不易将附着于核酸结合性固相载体的水溶性的成分带入油内。0041热循环处理在筒1的PCR容器30中进行。PCR容器30被油填满,PCR溶液40与该油混合时相分离,因此溶出液塞子49等被从管20推到油中时成为液滴状的PCR溶液40,另外,由于比重比油大,所以成为液滴状的PCR溶液40发生沉降。如果利用外部的加热器说明书CN104046。
20、558A4/27页7在PCR容器30形成高温区域36A和低温区域36B,使筒1整体与加热器一起反复上下翻转,则PCR溶液40在高温区域36A与低温区域36B之间交替移动,对PCR溶液40实施2阶段的温度处理。0042PCR容器30的材质没有特别限定,例如,可以为玻璃、塑料等树脂、金属等。另外,因为在其附近有高温侧加热器65B,所以优选PCR容器30的材质具有至少100以上的耐热性。如果PCR容器30的材质选择透明或者半透明的材质,则荧光测定(亮度测定)变得容易,因而优选。但是,无需使PCR容器30的全部的区域为透明或者半透明,至少使与荧光测定器55相对的部位(例如PCR容器30的底35A)为透。
21、明或者半透明即可。应予说明,管20的材质可以与罐3、柱塞10的材质相同。0043筒1由罐3和筒主体9构成。构成筒1的试剂盒中,与罐3和筒主体9一起预先准备有适配体ADAPTER5。通过介由适配体5连接罐3和筒主体9,从而组装筒1。其中,也可以以直接在筒主体9安装罐3的方式构成。0044在以下的筒1的构成要素的说明中,如图2A所示,以沿长条的筒1的方向为“长边方向”,以罐3侧为“上游侧”,以PCR容器30侧为“下游侧”。应予说明,有时将上游侧仅表示为“上”,将下游侧表示为“下”。0045(1)罐0046图3A图3D是罐3的说明图。0047在试剂盒预先准备的罐3收容有溶解液41和磁珠7。在罐3的开。
22、口安装有可拆的盖3A(参照图3A)。作为溶解液41,使用5M硫氰酸胍、2TRITONX100、50MMTRISHCL(PH72)。操作者取下盖3A打开罐3的开口(参照图3B),将附着病毒的棉棒浸入罐3内的溶解液41,采集病毒到溶解液41中(参照图3C)。搅拌罐3内的液体时,可以以图3C的状态振荡罐3,但这样溶解液41容易溢出,因此,如图3D所示,优选将带盖5A的适配体5安装在罐3的开口后振荡罐3。由此罐3内的物质被搅拌,因溶解液41病毒粒子溶解,核酸游离,同时涂覆于磁珠7的二氧化硅吸附核酸。其后,操作者取下安装于罐3的开口的适配体5的盖5A,介由适配体5将罐3安装于筒主体9(参照图2A)。00。
23、48罐3由具有挠性的树脂构成,罐3能够膨胀。柱塞10滑动从图2A的状态成为图2B的状态时,通过罐3膨胀,能够抑制管20内的液体的压力过度上升,抑制管20内的液体被推到下游侧。优选以罐3容易膨胀的方式在罐3形成变形部3B。0049应予说明,提取扩增核酸的试料并不局限于病毒,也可以是细胞。细胞的来源没有特别限定,可以是微生物,也可以是高等生物的组织切片、血液等。0050另外,溶解液只要含有离液物质就没有特别限定,出于破坏细胞膜或使细胞中含有的蛋白质变性的目的,可以含有表面活性剂。作为这种表面活性剂,只要是通常在从细胞等的核酸提取中使用的表面活性剂就没有特别限定,具体而言,可举出TRITONX等的T。
24、RITON系表面活性剂、TWEEN20等TWEEN系表面活性剂这样的非离子性表面活性剂,N月桂酰肌氨酸钠钠(SDS)等阴离子性表面活性剂,特别优选以成为012的范围的方式使用非离子性表面活性剂。并且,溶解液中优选含有2巯基乙醇或二硫苏糖醇等还原剂。溶解液也可以是缓冲液,优选为PH68的中性。考虑这些因素,具体而言,优选含有37M的胍盐、05的非离子性表面活性剂、002MM的EDTA、002M的还原剂等。0051离液物质只要是在水溶液中产生离液离子(离子半径大的1价的阴离子),具有增说明书CN104046558A5/27页8加疏水性分子的水溶性的作用,有助于核酸向固相载体的吸附,就没有特别限定。。
25、具体而言,可举出硫氰酸胍、盐酸胍、碘化钠、碘化钾、高氯酸钠等,其中,优选蛋白质变性作用强的硫氰酸胍或盐酸胍。这些离液物质的使用浓度根据各物质而有所不同,例如,使用硫氰酸胍时,优选以355M的范围使用,使用盐酸胍时,优选使用5M以上。0052另外,采集试料的器具没有特别限定,可以根据用途选择刮铲、棒、刮刀等代替棉棒。0053罐3的内容积没有特别限定,例如,可以为01ML100ML。罐3的材质没有特别限定,例如,可以为玻璃、塑料等树脂、金属等。特别是选择透明的玻璃、树脂作为罐的材质,则能够从罐3的外部观察内部,因而更优选。应予说明,罐3和各管20可以一体成形,也可以是能够装卸。如果利用橡胶、弹性体。
26、、高分子等具有挠性的材料作为罐3的材质,则在罐3安装有盖的状态下使罐3变形,从而能够对罐3的内部加压。由此,能够从管的前端侧将管20的内容物从管的内部向外部推出。0054(2)筒主体0055筒主体9具有柱塞10、管20和PCR容器30。0056(21)柱塞0057以下,参照图2A图2C对柱塞10进行说明。0058柱塞10是从作为注射筒发挥功能的管20的下游侧推出液体的可动式的推杆。柱塞10具有将管20内的规定量的液体从管20的末端向PCR容器30推出的功能。另外,柱塞10还具有介由适配体5安装罐3的功能。0059柱塞10具有筒状部11和棒状部12。筒状部11设置于罐3侧(上游侧),棒状部12设。
27、置于管20侧(下游侧)。棒状部12从筒状部11的下游侧的内壁被板状的2个凸缘13支撑。棒状部12的下游侧从筒状部11向下游侧突出。0060筒状部11在上游侧和下游侧开口,筒状部11的内壁成为液体的通路。在筒状部11的上游侧(罐3侧)的开口嵌合适配体5。在试剂盒预先准备的筒主体9的柱塞10上可以安装能够在筒状部11的上游侧的开口可拆的盖。筒状部11的下游侧的开口位于管20的上注射筒21的内部。从筒状部11的上游侧的开口导入的磁珠7通过筒状部11的内部,穿过凸缘13的表里从筒状部11的下游侧的开口出来,导入到管20的上注射筒21。0061筒状部11的下游侧嵌合于管20的上注射筒21的内壁。筒状部1。
28、1内接于管20的上注射筒21,并且相对于上注射筒21能够在长边方向滑动。0062在筒状部11的上游侧的开口的周围形成有安装适配体5的安装台11A。另外,安装台11A也是按压柱塞10时被按压的部位。通过按压安装台11A,从而柱塞10相对于管20滑动,从图2A的状态变为图2C的状态。柱塞10向下游侧移动时,安装台11A接触管20的上缘(参照图2C)。换言之,柱塞10的安装台11A与管20的上缘的间隔成为柱塞10的滑动长度。0063棒状部12在初始状态下位于管20的上注射筒21的内部,从下注射筒22分离(参照图2A)。如果柱塞10相对于管20滑动,则棒状部12插入到管20的下注射筒22,棒状部12内。
29、接于下注射筒22的同时相对于下注射筒22向下游方向滑动(参照图2B和图2C)。0064棒状部12的与长边方向正交的剖面的形状为圆形状。但是,棒状部12的剖面形状只要能够嵌合于管20的下注射筒22的内壁,则可以是圆、椭圆、多边形,没有特别限定。说明书CN104046558A6/27页90065在棒状部12的下游侧的端部形成有密封12A。密封12A嵌合于下注射筒22时,防止下游侧的管20内的液体向上注射筒21逆流。进而,柱塞10从图2B的状态被按压到图2C的状态时,其间与密封12A在下注射筒22内滑动的体积相当的管20内的液体从下游侧被推出。0066应予说明,密封12A在下注射筒22内滑动的体积(。
30、管20内的液体从下游侧被推出的量)比推出的塞子的总体积多。由此,能够以溶出液49不残留在管20的方式将管20内的液体推出。0067柱塞10的材质没有特别限定,例如,可以为玻璃、塑料等树脂、金属等。另外,柱塞10的筒状部11和棒状部12可以是以相同的材质一体地形成,也可以用不同的材质形成。这里,通过用树脂分别成型筒状部11和棒状部12,介由凸缘13接合筒状部11和棒状部12,从而形成柱塞10。0068在柱塞10的内部预先收容有构成第1塞子的油42和构成第2塞子的第1清洗液43。因为柱塞10内的油42的比重比第1清洗液43小,所以将罐3安装在筒主体9时使柱塞10的安装台11A为上方使筒主体9立起,。
31、则如图2A所示在罐3内的液体与筒主体9的第1清洗液43之间将会配置油42。作为油42,没有特别限定,优选使用2CS硅油。第1清洗液43没有特别限定,与构成第1塞子的油42和构成第3塞子的油44中的任一个混合时进行相分离的液体即可。第1清洗液43优选为水或者低盐浓度水溶液,低盐浓度水溶液时,优选为缓冲液。低盐浓度水溶液的盐浓度优选100MM以下,更优选50MM以下,最优选10MM以下。另外,低盐浓度水溶液的下限没有特别限定,优选为01MM以上,进一步优选为05MM以上,最优选为1MM以上。另外,该溶液可以含有TRITON、TWEEN、SDS等表面活性剂,PH没有特别限定。用于缓冲液的盐没有特别限。
32、定,优选使用TRIS、HEPES、PIPES、磷酸等的盐。特别优选使用8M盐酸胍、07TRITONX100。并且,该第1清洗液优选含有不阻碍核酸向载体的吸附、逆转录反应、PCR反应等的量的乙醇。乙醇浓度没有特别限定,可以为70以下,可以为60以下,可以为50以下,可以为40以下,可以为30以下,可以为20以下,也可以为10以下,优选为5以下或者2以下,进一步优选为1以下或者05以下,最优选为02以下或者01以下。0069应予说明,第1清洗液43中可以含有离液剂。例如,第1清洗液43中含有盐酸胍时,能够维持或者强化吸附于粒子等的核酸的吸附的同时清洗粒子等。作为含有盐酸胍时的浓度,例如,可以为3M。
33、OL/L10MOL/L,优选为5MOL/L8MOL/L。如果盐酸胍的浓度是该范围,则能够使吸附于粒子等的核酸更稳定地吸附的同时清洗其他夹杂物等。0070(22)管0071以下,参照图1A图1C以及图2A图2C对管20进行说明。0072管20是能够使液体在长边方向流通的筒状的形状。管20具有上注射筒21、下注射筒22和毛细管23,各部的内径阶段性不同。0073上注射筒21是能够使液体在长边方向流通的筒状的形状。能在上注射筒21的内壁可滑动地内接柱塞10的筒状部11,上注射筒21作为相对于柱塞10的筒状部11的注射筒发挥功能。0074下注射筒22是能够使液体在长边方向流通的筒状的形状。在下注射筒2。
34、2的内壁上柱塞10的棒状部12的密封12A能够可滑动地嵌合,下注射筒22作为相对于柱塞10的说明书CN104046558A7/27页10棒状部12的注射筒发挥功能。0075毛细管23具有能够使液体在长边方向流通的细管状的形状。毛细管23的内径为液体可维持塞子的形状的大小,这里为10MM。在毛细管23的末端(管20的下游侧的端),与此相比内径变小,这里为05MM。毛细管23的末端的内径设定为比后述的液滴状的核酸扩增反应液的直径(1520MM)小。由此,含有进行扩增的核酸的塞子(例如,溶出液塞子49)、含有进行核酸扩增反应的试剂的塞子(例如,溶出液塞子49、核酸扩增反应液塞子50A)从毛细管23的。
35、末端被推出时,能够避免液滴状的核酸扩增反应液(例如PCR溶液40)附着在毛细管23的末端或逆流入毛细管内。0076应予说明,毛细管23只要具有在内部具有空腔、能够使液体在长边方向流通的筒状的形状即可,在长边方向可以是弯曲,但优选为直线状。对于管的内部的空腔,只要液体在管内能够维持塞子的形状,则对其大小、形状没有特别限定。另外,管内的空腔的大小、与长边方向垂直的剖面的形状可以沿管的长边方向变化。0077对管的外形的垂直于长边方向的剖面的形状也没有限定。另外,管的壁厚(从内部的空腔的侧面到外部的表面的长度)也没有特别限定。管为圆筒状时,其内径(与内部的空腔的长边方向垂直的剖面的圆的直径)例如可以为。
36、05MM2MM。如果管的内径为该范围,则可在广泛的范围的管的材质、液体的种类中容易形成液体的塞子。优选前端变细为锥状,可以为02MM1MM。而且,通过减小毛细管23的末端的内径(毛细管23的开口径),能够抑制在PCR容器30内液滴化了的PCR溶液40吸附于毛细管23的开口而不分离。但是,如果过度减小毛细管23的末端的内径,则形成许多小的液滴的PCR溶液40。应予说明,如果对毛细管23的末端以外的部分也与末端同样地进行细径化,则出于确保各塞子的体积的必要性,筒1将会变长,因而不优选。0078毛细管23在内部从上游侧依次具备第1油塞子44、第2清洗液塞子45、第2油塞子46、逆转录反应液塞子47、。
37、第3油塞子48、溶出液塞子49、第4油塞子50(图1A)。换言之,在水溶性的塞子(清洗液塞子45/48A、逆转录反应液塞子47、溶出液塞子49)的两侧配置油塞子。0079应予说明,在第1油塞子44的上游侧的上注射筒21和下注射筒22预先收容有油42和第1清洗液43(参照图2A)。上注射筒21和下注射筒22的内径比毛细管23的内径大,上注射筒21和下注射筒22中液体(油42和第1清洗液43)无法维持塞子那样的柱状,但第1油塞子44因毛细管23以塞子的形状被保持,因此抑制构成第1油塞子44的油向上游侧移动。0080第2清洗液塞子45可以由作为第2清洗液的5MMTRIS盐酸缓冲液形成,第2清洗液可以。
38、是基本与在第1清洗液阐述的相同的构成,可以与第1清洗液相同也可以不同,优选事实上不含离液物质的溶液。这是为了不将离液物质带入其后的溶液。如上所述,该第2清洗液也优选含有不阻碍核酸向载体的吸附、逆转录反应、PCR反应等的量的乙醇。乙醇浓度没有特别限定,可以为70以下,可以为60以下,可以为50以下,可以为40以下,可以为30以下,可以为20以下,也可以为10以下,优选5以下或者2以下,进一步优选1以下或者05以下,最优选02以下或者01以下。0081第2清洗液塞子45可以由被油的塞子断开的多个塞子构成。第2清洗液塞子45由多个塞子构成时,各塞子的液体可以相同也可以不同。其中只要至少有1个第2清洗。
39、液说明书CN104046558A108/27页11的塞子,则对其他塞子的液体就没有特别限定,优选全部的塞子为第2清洗液。分割第2清洗液塞子45的数目,例如可以考虑管20的长度、清洗的对象等来适当地设定。0082逆转录反应液塞子47中含有的逆转录反应液含有逆转录酶、DNTP和逆转录酶用引物(寡核核苷酸)。溶剂没有特别限定,优选为水,逆转录反应液优选乙醇、异丙醇等有机溶剂和事实上不含离液物质的溶液。另外,优选以成为逆转录酶用缓冲液的方式含有盐。缓冲液中含有的盐只要不阻碍酶反应就没有特别限定,优选使用TRIS、HEPES、PIPES、磷酸等的盐。逆转录酶没有特别限定,例如,可以使用来自禽成髓细胞瘤病。
40、毒(AVIANMYELOBLASTVIRUS)、RAS相关病毒2型(RASASSOCIATEDVIRUS2型)、莫洛尼小鼠白血病病毒(MOUSEMOLONYMURINELEUKEMIAVIRUS)、人类免疫缺陷病毒1型(HUMANIMMUNODEFFICIENCYVIRUS1型)的逆转录酶等,但优选耐热性的酶。逆转录反应液中含有的DNTP、盐的浓度为适合于使用的逆转录酶的浓度即可,通常,DNTP可以为101000M,优选为100500M,可以使MG2为1100MM,优选为510MM,可以使CL为12000MM,优选为200700MM,总离子浓度没有特别限定,可以为高于50MM的浓度,优选高于1。
41、00MM的浓度,更优选高于120MM的浓度,进一步优选为高于150MM的浓度,再进一步优选高于200MM的浓度。上限优选500MM以下,更优选300MM以下,进一步优选200MM以下。引物用寡核苷酸,使用0110M,优选使用011M。作为载体,可以含有BSA或者明胶等,其浓度在1MG/ML以下时反应阻碍防止效果小,10MG/ML以上时,可能阻碍逆转录反应、其后的酶反应,因此优选110MG/ML。使用明胶时,作为其来源可例示牛皮、豚皮、牛骨,没有特别限定。明胶难以溶解时,可以加温溶解。0083逆转录反应液塞子47的体积没有特别限定,可以以吸附核酸的粒子等的量等作为指标适当地设定。例如,毛细管的内。
42、径为1MM、粒子等的体积为05L时,逆转录反应液塞子47的体积只要为06L以上就足够,优选08L5L,更优选1L3L。毛细管的内径更细时,逆转录反应液塞子47的体积可以比06L小。只要逆转录反应液塞子47的体积为这些范围,例如,即便核酸结合性固相载体的体积为05L,也能够充分进行逆转录反应。0084溶出液塞子49中含有的溶出液是指将吸附于核酸结合性固相载体的核酸从载体溶出到液中的液体。溶剂没有特别限定,优选水或者低盐浓度水溶液,更优选乙醇、异丙醇等有机溶剂和事实上不含离液物质的溶剂。低盐浓度水溶液时,优选为缓冲液。低盐浓度水溶液的盐浓度优选100MM以下,更优选50MM以下,最优选15MM以下。
43、。低盐浓度水溶液的下限没有特别限定,优选为01MM以上,进一步优选为1MM以上,最优选为10MM以上。用于缓冲液的盐没有特别限定,优选使用TRIS、HEPES、PIPES、磷酸等的盐,最优选TE(10MMTRIS盐酸缓冲液,1MMEDTA,PH80)。0085溶出液可以进一步含有进行核酸扩增反应的试剂。该试剂还可以含有DNA聚合酶、DNA聚合酶用引物(寡核苷酸)以及DNTP、TAQMAN探针、MOLECULARBEACON、循环探针等实时PCR用探针、SYBR绿等的嵌入剂用荧光色素。DNA聚合酶也没有特别限定,优选耐热性的酶、PCR用酶,例如有TAQ聚合酶、TFI聚合酶、TTH聚合酶或者它们的。
44、改进型等非常大量的市售品。并且,作为反应阻碍防止剂,含有优选BSA(牛血清白蛋白)或者明胶。0086溶出液中含有的DNTP、盐的浓度为适于使用的DNA聚合酶的浓度即可,通常,使DNTP为101000M,优选为100500M,使MG2为1100MM,优选为510MM,使说明书CN104046558A119/27页12CL为12000MM,优选为200700MM即可,总离子浓度没有特别限定,可以为高于50MM的浓度,优选为高于100MM的浓度,更优选为高于120MM的浓度,进一步优选为高于150MM的浓度,再进一步优选为高于200MM的浓度。上限优选500MM以下,更优选300MM以下,进一步优选。
45、200MM以下。引物用寡核苷酸分别使用0110M,优选使用011M。作为载体,可以含有BSA或者明胶等,其浓度为1MG/ML以下时,反应阻碍防止效果小,10MG/ML以上时,可能阻碍聚合反应、其后的酶反应,因此优选110MG/ML。使用明胶时,作为其来源可以例示牛皮、豚皮、牛骨,没有特别限定。明胶难以溶解时,可以加温溶解。0087溶出液塞子49的体积没有特别限定,以吸附核酸的粒子等的量等作为指标适当地设定。例如,毛细管的内径为1MM、粒子等的体积为05L时,溶出液塞子49的体积只要是06L以上就足够,优选08L5L,更优选1L3L。毛细管的内径更细时,逆转录反应液塞子47的体积比06L小。如果。
46、溶出液塞子49的体积为这些范围,例如,即便核酸结合性固相载体的体积为05L,能够充分进行逆转录反应。0088溶出液不含进行核酸扩增反应的试剂时,优选在第4油塞子50的核酸扩增反应用容器侧,从第4油塞子50依次设置包含含有进行核酸扩增反应的试剂的核酸扩增反应液的核酸扩增反应液塞子50A,以及第5油塞子50B(图1C)。或者,PCR容器30也可以含有由进行核酸扩增反应的试剂的核酸扩增反应液构成的液滴来代替设置核酸扩增反应液塞子50A、第5油塞子50B。0089这里,核酸扩增反应液的溶剂没有特别限定,优选水或者低盐浓度水溶液,更优选乙醇、异丙醇等有机溶剂以及事实上不含离液物质的溶剂。为低盐浓度水溶液。
47、时,优选为缓冲液。低盐浓度水溶液的盐浓度,优选100MM以下,更优选50MM以下,最优选15MM以下。低盐浓度水溶液的下限没有特别限定,优选为01MM以上,进一步优选为1MM以上,最优选为10MM以上。用于缓冲液的盐没有特别限定,优选使用TRIS、HEPES、PIPES、磷酸等的盐,最优选TE(10MMTRIS盐酸缓冲液,1MMEDTA,PH80)。0090进行核酸扩增反应的试剂可以含有DNA聚合酶、DNA聚合酶用引物(寡核苷酸)以及DNTP,TAQMAN探针、MOLECULARBEACON、循环探针等实时PCR用探针、SYBR绿等嵌入剂用荧光色素。DNA聚合酶没有特别限定,优选耐热性的酶、P。
48、CR用酶,例如有TAQ聚合酶、TFI聚合酶、TTH聚合酶、或者它们的改进型等非常大量的市售品。并且,作为反应阻碍防止剂,优选含有BSA(牛血清白蛋白)或者明胶。0091核酸扩增反应液中含有的DNTP、盐的浓度为对于使用的DNA聚合酶适当的浓度即可,通常,使DNTP为101000M,优选为100500M,使MG2为1100MM,优选为510MM,使CL为12000MM,优选为200700MM即可,总离子浓度没有特别限定,可以为高于50MM的浓度,优选为高于100MM的浓度,更优选为高于120MM的浓度,进一步优选为高于150MM的浓度,再进一步优选为高于200MM的浓度。上限优选500MM以下,。
49、更优选300MM以下,进一步优选200MM以下。引物用寡核苷酸分别使用0110M,优选使用011M。作为载体,可以含有BSA或者明胶等,其浓度为1MG/ML以下时,反应阻碍防止效果小,为10MG/ML以上时,可能阻碍聚合反应、其后的酶反应,因此优选110MG/ML。使用明胶时,作为其来源可以例示牛皮、豚皮、牛骨,没有特别限定。明胶难以溶解时,可以加温溶解。0092核酸扩增反应液塞子50A的体积没有特别限定,可以以吸附核酸的粒子等的量等说明书CN104046558A1210/27页13为指标适当地设定。例如,毛细管的内径为1MM、粒子等的体积为05L时,核酸扩增反应液塞子50A的体积只要为06L以上就足够,优选为08L5L,更优选为1L3L以下。毛细管的内径更细时,逆转录反应液塞子47的体积可以比06L小。0093另外,在第3油塞子48与溶出液塞子49之间,可以进一步从第3油塞子48侧依次具备由与油混合时相分离且清洗结合有核酸的核酸结合性固相载体的第3清洗液构成的第3清洗液塞子48A,以及由第6油构成的第6油塞子。