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本发明公开了一种模块化禽畜粪便处理方法及设备。其方法特征在于禽畜粪便通过添加发酵菌剂和木屑以后混合均匀通过搅笼输送到降解发酵单元。降解发酵单元为微生物创造最适宜的代谢环境。筛选的优势微生物迅速增值快速降解进入的禽畜粪便。每个降解单元在禽畜粪便等量连续投加的情况下都有一个固定的降解周期,一般3-5天。对于一般禽畜粪便采用本方法降解完全一般需要7-10天,所以正常情况下需要两级降解单元就能实现连续处理。