一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用.pdf

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摘要
申请专利号:

CN201410347654.1

申请日:

2014.07.22

公开号:

CN104152462A

公开日:

2014.11.19

当前法律状态:

实审

有效性:

审中

法律详情:

实质审查的生效IPC(主分类):C12N 15/29申请日:20140722|||公开

IPC分类号:

C12N15/29; C07K14/415; C12N15/84; A01H5/00

主分类号:

C12N15/29

申请人:

浙江大学

发明人:

娄永根; 胡凌飞; 叶萌

地址:

310058 浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号

优先权:

专利代理机构:

杭州求是专利事务所有限公司 33200

代理人:

邱启旺

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内容摘要

本发明公开了一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用,该抗虫基因具有SEQIDNo.1的DNA序列。该序列由3385个核苷酸碱基组成,包含一个由3201个核苷酸构成的完整的编码框,编码1066个氨基酸残基的小分子量蛋白。研究发现该基因与水稻的抗虫性密切相关,降低该基因的表达水平能提高水稻对褐飞虱的抗性。本发明将在作物育种,特别是在水稻抗虫育种中得到广泛应用。

权利要求书

1.  一种水稻源抗虫相关基因,其特征在于,它具有SEQ ID No.1的DNA序列。

2.
  一种权利要求1所述的抗虫相关基因编码的蛋白,其特征在于,它可以包含SEQ ID No.2的氨基酸序列的蛋白质,或者是将SEQ ID No.2的氨基酸残基序列经过一个或多个氨基酸残基的取代、缺失或者添加且具有与SEQ ID No.2的氨基酸残基序列相同活性的由SEQ ID No.2衍生的蛋白质。

3.
  一种权利要求1所述水稻源抗虫相关基因在转基因植物中的应用。

4.
  一种权利要求1所述水稻源抗虫相关基因在作物育种中的应用。

说明书

一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用
技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用。
背景技术
世界有将近一半的人口以水稻(Oryza sativa L.)为食,作为最重要的粮食作物之一,每年却因虫害而造成水稻大量减产。日益严峻的粮食问题、因农药的泛滥使用而造成日益严重的环境问题等使得研究寻找抗虫新基因、培育抗虫新品种迫在眉睫。
褐飞虱(Nilaparvata lugens)属于半翅目Hemiptera,飞虱科Delphacidae,是我国水稻作物上的重要害虫。近几年来,褐飞虱接年大暴发,对我国的水稻粮食产量造成了严重损失。据统计,20世纪80年代以来,褐飞虱在我国的年发生面积大约为1330-2000万公顷,约占水稻种植面积的一半,年损失稻谷达10-15亿千克。2005年,褐飞虱再次在我国南方稻区爆发,引起水稻大面积“虱烧”,产量损失十分严重。浙江省农业厅调查发现,2005年浙江省第5代褐飞虱发生量每667平方米达30万头以上的有66.7万公顷,占水稻总种植面积的86%;每667平方米在100万头以上的有33.3万公顷,占42%;最高田块的发生量达到每667平方米1000万头以上;绝收的面积达5333公顷,造成水稻产量损失约120万吨。
在褐飞虱综合防治体系中,培育和种植水稻抗虫品种是防治褐飞虱最经济最有效的方法之一。然而,目前对水稻抗褐飞虱的基因还克隆鉴定得很少。至今,还只有BPH14一个基因得到鉴定与克隆。因此寻找和鉴定水稻中抗褐飞虱相关基因,对水稻抗虫品种的筛选和培育,实现褐飞虱无公害和可持续控制具有十分重要的意义。
发明内容
本发明的目的在于针对现有技术的不足,提供一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用。
本发明的目的是通过以下技术方案来实现的:一种水稻源抗虫相关基因OsHI-LRR1,它具有SEQ ID No.1的DNA序列。
一种水稻源抗虫相关基因OsHI-LRR1的编码蛋白,它包含SEQ ID No.2的氨基酸序列的蛋白质,或者是将SEQ ID No.2的氨基酸残基序列经过一个或多个氨基酸残基的取代、缺失或者添加且具有与SEQ ID No.2的氨基酸残基序列相同活性的由SEQ ID No.2衍生的蛋白质。
一种水稻源抗虫相关基因OsHI-LRR1在转基因植物中的应用。
一种水稻源抗虫相关基因OsHI-LRR1在作物育种中的应用。
本发明的有益效果是,利用SSH、RT-PCR和RACE技术分离并克隆了OsHI-LRR1基因;利用荧光定量PCR(qRT-PCR)方法分析了OsHI-LRR1基因在褐飞虱为害后的表达情况;利用转基因技术获得了OsHI-LRR1基因的RNAi沉默转基因植株,并发现了OsHI-LRR1基因在水稻对褐飞虱抗性中发挥着十分重要的作用。该基因的分离克隆,对作物的抗虫育种,尤其是抗褐飞虱的水稻品种的培育,具有十分重要的指导和促进作用。
附图说明
图1是 OsHI-LRR1基因PCR扩增产物凝胶电泳图;
图2 是褐飞虱为害后OsHI-LRR1基因的表达情况。Con:水稻茎秆套入空玻璃罩。柱形图为平均数±标准误(n=5);
图3是 OsHI-LRR1基因的RNAi沉默载体结构示意图;
图4是 OsHI-LRR1基因沉默效果图。本底情况下野生型植株(WT)、沉默品系LRR1-1和LRR1-2中OsHI-LRR1基因的表达量。图中数字为沉默品系与WT中OsHI-LRR1基因表达量的比例。柱形图为平均数±标准误(n=5);
图5是 OsHI-LRR1基因沉默后降低了褐飞虱雌成虫的取食和产卵嗜好性。(a),(b)褐飞虱怀卵雌成虫在野生型植株(WT)、沉默植株LRR1-1和LRR1-2上的取食头数和产卵率。“*”表示处理组与对照组存在显著差异(t-test,p<0.05),“**” 表示处理组与对照组存在极显著差异(t-test,p<0.01),柱形图和线形图均为平均数±标准误(n=10);
图6是 OsHI-LRR1基因沉默后降低了褐飞虱若虫的存活率。野生型植株(WT)、沉默品系LRR1-1和LRR1-2上褐飞虱若虫的存活率。“*”表示处理组与对照组存在显著差异(t-test,p<0.05),“**” 表示处理组与对照组存在极显著差异(t-test,p<0.01),线形图为平均数±标准误(n=10);
图7 OsHI-LRR1基因沉默后增加了水稻对褐飞虱的耐受性。15头雌成虫为害18 d后野生型植株(WT)、LRR1-1和LRR1-2沉默品系的耐害表型(n=20)。
具体实施方式
本发明利用SSH、RT-PCR和RACE技术,获得OsHI-LRR1的全长序列。首先从SSH克隆库中分析获得OsHI-LRR1基因片段,以此片段设计正向和反向引物,分别进行3’-RACE和5’-RACE获得该基因的5’端和3’端基因PCR片段,并测序拼接获得DNA序列。在拼接DNA序列的5’端和3’端非编码区设计引物OsHI-LRR1-F1和OsHI-LRR1-R1。提取的水稻茎杆的mRNA并反转录成cDNA。以cDNA为模板、OsHI-LRR1-F1和OsHI-LRR1-R1为引物进行PCR反应,即得到OsHI-LRR1全长序列并测序验证。其次,利用qRT-PCR研究OsHI-LRR1的表达情况,结果表明褐飞虱危害不诱导OsHI-LRR1的表达。再次,利用农杆菌转化法得到OsHI-LRR1的沉默植株,通过生物学测定证明OsHI-LRR1基因沉默后能够显著增加水稻对褐飞虱的抗性。该基因的分离和克隆以及生物学功能的分析,对于作物的抗虫育种,尤其对水稻抗褐飞虱育种将起到重要的促进作用。
实现本发明的具体技术步骤如下:
1、水稻OsHI-LRR1基因的分离和序列分析
首先从SSH克隆库中分析获得OsHI-LRR1基因片段,以此片段设计正向引物和反向引物,分别进行3’-RACE和5’-RACE获得该基因的5’端和3’端基因PCR片段,并测序拼接获得DNA序列。根据拼接的DNA序列,我们在其5’端和3’端非编码区设计引物OsHI-LRR1-F1和OsHI-LRR1-R1,以水稻茎杆mRNA反转录的cDNA为模板,进行PCR反应,获得OsHI-LRR1基因全长序列。OsHI-LRR1序列见SEQ ID No.1。根据该序列的开放阅读框(ORF),推算出该基因编码蛋白的氨基酸序列,见SEQ ID No.2。
2、褐飞虱为害后的OsHI-LRR1表达特征分析
水稻经褐飞虱为害0、0.5、1、2、4、8、24、48 h后,取其茎杆。利用SV Total RNA Isolation System(Promega)试剂盒提取8个水稻茎杆的total RNA,并利用RNA电泳和分光光度计(eppendorf)检测其浓度和纯度。用反转录试剂盒(PrimeScript? RT-PCR Kit,TaKaRa)将0.5 μg total RNA反转录成cDNA,具体操作参照产品说明书。
荧光定量PCR(qRT-PCR)检测使用SsoFastTM probes supermix(Bio-RAD)酶预混液配制反应体系,使用CFX96TM Real-Time system(Bio-RAD, California, USA)定量PCR仪检测荧光信号。以水稻OsACTIN基因(TIGR ID: LOC_Os03g50885)作为内参,对OsHI-LRR1的诱导表达特征进行分析(图2)。
3、OsHI-LRR1基因沉默水稻品系的获得及其对褐飞虱抗性的检测
构建RNAi沉默载体以电击法转化农杆菌,获得含有RNAi载体的工程农杆菌。以本实验室成熟的农杆菌转化法获得含有目的基因的愈伤组织,再分别经过预分化、分化、生根等,获得OsHI-LRR1基因沉默水稻植株。对转基因水稻品系整个生长周期进行观察,未发现生理缺陷,能获得正常世代。生物测定试验表明:与野生型植株相比,OsHI-LRR1基因沉默植株降低了褐飞虱雌成虫的取食和产卵嗜好(图5)和褐飞虱若虫的存活率(图6),提高了对褐飞虱的耐受性(图7)。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明范围。
实施例1、OsHI-LRR1基因的获得和序列分析
1)水稻茎杆RNA的提取、质量检测及总cDNA第一链合成
2)以总cDNA第一链为模板,进行PCR反应,获得OsHI-LRR1基因片段
OsHI-LRR1-F1:5'- tgcagcaggcgagttt-3';
OsHI-LRR1-R1:5'-ACAGAAGCTCATAACTG -3'
PCR扩增条件:95℃×3 min→(98℃×10 sec→68℃×1 min)×30循环→72℃×3.5 min,得到特异PCR扩增产物见图1。
3)OsHI-LRR1基因碱基分析
将获得的PCR产物送南京金斯瑞公司进行测序,测序结果为序列表中的序列SEQ ID No.1。我们将此基因命名为OsHI-LRR1
实施例2、褐飞虱为害后的OsHI-LRR1表达特征分析
1)褐飞虱的处理
在水稻的茎杆基部固定一个圆筒形玻璃罩(直径4 cm,高8 cm,筒壁均匀分布48个直径为 0.8 mm的透气小孔),在玻璃罩内接入15头褐飞虱雌成虫后,顶部以海绵密封。接入褐飞虱后在不同时间点剪取为害部位的外层叶鞘,立即浸入液氮,-80℃保存备用。以套入空玻璃罩的健康水稻叶鞘作为对照。
2)RNA的提取及表达特征分析
利用SV Total RNA Isolation System(Promega)试剂盒提取水稻茎杆的total RNA,并利用RNA电泳和分光光度计(eppendorf)检测其浓度和纯度。用反转录试剂盒(PrimeScript? RT-PCR Kit, TaKaRa)将0.5 μg total RNA反转录成cDNA,具体操作参照产品说明书。
荧光定量PCR(qRT-PCR)检测使用SsoFastTM probes supermix(Bio-RAD)酶预混液配制反应体系,使用CFX96TM Real-Time system(Bio-RAD, California,USA)定量PCR仪检测荧光信号。以水稻OsACTIN基因(TIGR ID:LOC_Os03g50885)作为内参,对OsHI-LRR1的诱导表达特征进行分析,具体反应体系及程序见产品说明书,定量PCR引物及探针如下:
OsACTIN-P:5’- CGTTTCCGCTGCCCTGAGGTCC -3’
OsACTIN-F:5’- GGACAGGTTATCACCATTGGT -3’
OsACTIN -R:5’- CCGCAGCTTCCATTCCTATG -3’
LRR1-P:5’- CCAAGGGCGCATCTCGCCA -3’
LRR1-F:5’- TCACAGATGTCTCGTTGGCTTC -3’
LRR1-R:5’- ACAGCCCAGTAAGATTGCCG -3’
实施例3、OsHI-LRR1转基因品系的获得
1)设计引物将OsHI-LRR1基因的298 bp的特异性区域扩出后,利用DNA亚克隆方法将其连入pCAMBIA-1301载体,获得RNAi沉默表达载体。并通过电击法,将RNAi载体转入农杆菌EHA105中,用于后续植物转化。RNAi区引物如下:
OsHI-LRR1 -F2:5’-TGAAGGTGCTTGATGTGGCTTGCAA-3’
OsHI-LRR1–R2:5’- CACAAAAAAGAGGGAAACTAAATAC -3’
2)用含有RNAi载体的农杆菌侵染水稻愈伤组织。将共侵染后的愈伤放在含有潮霉素的NBDS培养基上筛选培养20天左右,待新的抗性愈伤长出后,将抗性愈伤从母体上剥离,转入新的筛选培养基NBDS2继代扩繁。将扩繁后的抗性愈伤转入分化培养基MS-RG培养2-3周。待其长出嫩芽后,切除多余愈伤组织并将嫩芽转入MS-RT培养基生根,分化出完整的T0代植株。
3)T0代转基因植株获得的T1代种子,经含潮霉素的培养基筛选,去除未转入OsHI-LRR1基因的植株,并单株种植,收获T2代种子。对每个单株的种子进行鉴定。获得转OsHI-LRR1基因的纯合品系,用于后面的生物学功能分析。
实施例4、OsHI-LRR1转基因品系的抗虫功能研究
1)雌成虫取食选择性及产卵选择性测定:在小塑料杯中分别放入1株野生型和1株突变体水稻,苗间距1 cm,2株水稻茎秆基部固定一个圆筒形玻璃罩,在玻璃罩内接入15头褐飞虱怀卵雌成虫后,顶部以海绵密封。接虫后观察并记录两株苗的着虫数。48 h后,去除所有褐飞虱,统计每株苗上的产卵量。本试验重复10次。
2)初孵若虫存活率测定:在水稻茎秆基部固定圆筒形玻璃罩并密封顶部,玻璃罩内接入15头褐飞虱初孵若虫,每天观察并记录存活虫数。本试验重复10次。
3)选取生长状况一致的水稻,每株接入15头褐飞虱雌成虫,每个品系重复20次。每天观察水稻的生长情况并进行拍照。上述实验均在温室(26±2℃;光照14 h;湿度70%-75%)中进行。
实施例5、OsHI-LRR1基因在水稻抗虫育种中的应用
(1) 以实施例3获得的转OsHI-LRR1基因的纯合品系水稻为材料,分析OsHI-LRR1基因在水稻抗虫育种中的应用。
(2) 褐飞虱雌成虫分别危害转基因苗与对照苗,如图7所示,18天后对照水稻基本枯死,而含OsHI-LRR1基因水稻水稻仅外面的叶片枯黄。可见OsHI-LRR1基因可以很好的应用于抗稻飞虱的水稻抗虫育种。
                         SEQUENCE LISTING
 
<110>  浙江大学
 
<120>  一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用
 
<160>  2    
 
<170>  PatentIn version 3.3
 
<210>  1
<211>  3385
<212>  DNA
<213>  水稻
 
<400>  1
tgcagcaggc gagtttcatg agagaaccat gcagctgccc aatttgccat gcagcagcag     60
 
cagcagcacc accaccacca ccaccaccaa gttatctgtg gctttctttc ggcttcttgt    120
 
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cctcatcggc tttctagagg gtctcttgcc aggccacaac ggcagcctca gcacgtcatg    240
 
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cttcaatgtc agctttaaca ggttatctgg agaaatacca cagcagatat gcaacctcac   1860
 
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ggtctcctgc ctggacaatg ttgatgcaga cctgcaggtg cagatgtagt taaaggagaa   3240
 
cagatccata gacctggaga tgcagagatg attttgtact tacagactag gtgtgtaact   3300
 
tcagtagaaa gaagatttgc taacaaatat tacagtttga ttgtacatct gtgtaaagga   3360
 
atggctcgca gttatgagct tctgt                                         3385
 
 
<210>  2
<211>  1066
<212>  PRT
<213>  水稻
 
<400>  2
 
Met Gln Leu Pro Asn Leu Pro Cys Ser Ser Ser Ser Ser Thr Thr Thr
1               5                   10                  15     
 
 
Thr Thr Thr Thr Lys Leu Ser Val Ala Phe Phe Arg Leu Leu Val Ile
            20                  25                  30         
 
 
Leu Leu Leu Ser Phe Ala Ser Pro Thr Ser Ser Cys Thr Glu Gln Glu
        35                  40                  45             
 
 
Glu Ser Ser Leu Ile Gly Phe Leu Glu Gly Leu Leu Pro Gly His Asn
    50                  55                  60                 
 
 
Gly Ser Leu Ser Thr Ser Trp Val Lys Gly Ile Asp Cys Cys Lys Trp
65                  70                  75                  80 
 
 
Glu Gly Ile Asn Cys Ser Ser Asp Gly Thr Val Thr Asp Val Ser Leu
                85                  90                  95     
 
 
Ala Ser Lys Gly Leu Gln Gly Arg Ile Ser Pro Ser Leu Gly Asn Leu
            100                 105                 110        
 
 
Thr Gly Leu Leu His Leu Asn Leu Ser His Asn Leu Leu Asn Gly Tyr
        115                 120                 125            
 
 
Leu Pro Met Glu Leu Leu Phe Ser Arg Ser Ile Ile Val Leu Asp Val
    130                 135                 140                 
 
 
Ser Phe Asn Arg Leu Asp Gly Ser Leu Pro Glu Leu Glu Ser Pro Ser
145                 150                 155                 160
 
 
Gly Gly Ser Pro Leu Gln Val Leu Asn Ile Ser Ser Asn Ser Phe Thr
                165                 170                 175    
 
 
Gly Gln Phe Ser Ser Lys Gln Trp Glu Val Met Lys Asn Ile Val Ala
            180                 185                 190        
 
 
Leu Asn Val Ser Asn Asn Ser Phe Thr Gly Gln Ile Pro Pro Ser Ile
        195                 200                 205            
 
 
Cys Ile Asn Ser Pro Ser Phe Ala Ile Leu Asp Leu Cys Tyr Asn Gln
    210                 215                 220                
 
 
Phe Ser Gly Ser Ile Ser Ser Gly Leu Gly Asn Cys Ser Lys Met Arg
225                 230                 235                 240
 
 
Glu Phe Lys Ala Gly Tyr Asn Asn Phe Ser Gly Ala Leu Pro Glu Glu
                245                 250                 255    
 
 
Leu Phe Ser Ala Thr Ser Leu Glu His Leu Ser Leu Pro Asn Asn Asp
            260                 265                 270        
 
 
Leu Gln Gly Val Leu Asp Gly Ser His Ile Val Lys Leu Val Lys Leu
        275                 280                 285            
 
 
Thr Val Leu Asp Leu Gly Ser Thr Gly Leu Ser Gly Asn Ile Pro Asp
    290                 295                 300                
 
 
Ser Ile Gly Gln Leu Ser Thr Leu Glu Glu Leu Arg Leu Asp Asn Asn
305                 310                 315                 320
 
 
Asn Met Ser Gly Glu Leu Pro Ser Ala Leu Gly Asn Cys Thr Asn Leu
                325                 330                 335    
 
 
Arg Tyr Leu Ser Leu Arg Asn Asn Lys Phe Val Gly Asp Leu Ser Lys
            340                 345                 350        
 
 
Val Asn Phe Thr Trp Leu Asn Leu Arg Ile Ala Asp Phe Ser Ile Asn
        355                 360                 365            
 
 
Asn Phe Thr Gly Thr Val Pro Glu Ser Ile Phe Ser Cys Ser Asn Leu
    370                 375                 380                
 
 
Ile Ala Leu Arg Leu Ala Phe Asn Lys Phe His Gly Gln Leu Ser Pro
385                 390                 395                 400
 
 
Arg Met Gly Thr Leu Lys Ser Leu Ser Phe Phe Ser Ile Ser Asp Asn
                405                 410                 415    
 
 
His Phe Thr Asn Ile Thr Asn Ala Leu Gln Ile Leu Arg Ser Cys Lys
            420                 425                 430        
 
 
Asn Leu Thr Ser Leu Leu Ile Gly Thr Asn Phe Lys Gly Glu Thr Ile
        435                 440                 445            
 
 
Pro Gln Asp Glu Thr Val Asp Gly Phe Glu Asn Leu Arg Val Leu Thr
    450                 455                 460                
 
 
Ile Asp Ser Cys Gly Ala Met Gly Gln Ile Pro Pro Trp Ile Ser Lys
465                 470                 475                 480
 
 
Leu Lys Lys Leu Glu Val Leu Asp Leu Ser Asn Asn Met Leu Ile Gly
                485                 490                 495    
 
 
Glu Ile Pro Phe Trp Ile Arg Asp Met Pro Val Leu Phe Tyr Leu Asp
            500                 505                 510        
 
 
Ile Thr Asn Asn Ser Leu Thr Gly Asp Ile Pro Val Ala Leu Met Asn
        515                 520                 525            
 
 
Leu Pro Met Leu Gln Ser Gly Lys Asn Ala Ala Gln Leu Asp Pro Asn
    530                 535                 540                
 
 
Phe Leu Glu Leu Pro Val Tyr Trp Thr Pro Ser Arg Gln Tyr Arg Leu
545                 550                 555                 560
 
 
Leu Asn Ala Phe Pro Asn Ala Leu Asn Leu Gly Asn Asn Ser Phe Thr
                565                 570                 575    
 
 
Gly Val Ile Pro Pro Glu Ile Gly Gln Leu Lys Met Leu Asp Gly Phe
            580                 585                 590        
 
 
Asn Val Ser Phe Asn Arg Leu Ser Gly Glu Ile Pro Gln Gln Ile Cys
        595                 600                 605            
 
 
Asn Leu Thr Asn Leu Gln Leu Leu Asp Leu Ser Ser Asn Gln Leu Thr
    610                 615                 620                
 
 
Gly Glu Leu Pro Ala Ala Leu Thr Asn Leu His Phe Leu Ser Lys Phe
625                 630                 635                 640
 
 
Asn Val Ser Asn Asn Glu Leu Glu Gly Pro Val Pro Thr Gly Arg Gln
                645                 650                 655    
 
 
Phe Asp Thr Phe Leu Asn Ser Ser Tyr Ser Gly Asn Pro Lys Leu Cys
            660                 665                 670        
 
 
Gly Pro Met Leu Ser Asn Leu Cys Asp Ser Val Pro Thr His Ala Ser
        675                 680                 685            
 
 
Ser Met Lys Gln Arg Asn Lys Lys Ala Ile Ile Ala Leu Ala Leu Gly
    690                 695                 700                
 
 
Val Phe Phe Gly Gly Ile Ala Ile Leu Phe Leu Leu Gly Arg Phe Leu
705                 710                 715                 720
 
 
Ile Ser Ile Arg Arg Thr Ser Ser Val His Gln Asn Lys Ser Ser Asn
                725                 730                 735    
 
 
Asn Gly Asp Ile Glu Ala Ala Ser Leu Ser Ser Val Ser Glu His Leu
            740                 745                 750        
 
 
His Asp Met Ile Lys Gly Thr Ile Leu Val Met Val Pro Gln Gly Lys
        755                 760                 765            
 
 
Gly Gly Ser Asn Asn Leu Lys Phe Lys Asp Ile Leu Lys Ala Thr Asn
    770                 775                 780                
 
 
Asn Phe Asp Gln Gln Asn Ile Ile Gly Cys Gly Gly Asn Gly Leu Val
785                 790                 795                 800
 
 
Tyr Lys Ala Glu Leu Pro Asn Gly Ser Lys Leu Ala Ile Lys Lys Leu
                805                 810                 815    
 
 
Asn Gly Glu Met Cys Leu Met Glu Arg Glu Phe Thr Ala Glu Val Glu
            820                 825                 830        
 
 
Ala Leu Ser Met Ala Gln His Asp Asn Leu Val Pro Leu Trp Gly Tyr
        835                 840                 845            
 
 
Cys Ile Gln Gly Asn Ser Arg Leu Leu Ile Tyr Ser Tyr Met Glu Asn
    850                 855                 860                
 
 
Gly Ser Leu Asp Asp Trp Leu His Asn Arg Asp Asn Gly Arg Pro Leu
865                 870                 875                 880
 
 
Leu Asp Trp Pro Thr Arg Leu Lys Ile Ala Gln Gly Ala Ser Arg Gly
                885                 890                 895    
 
 
Leu Ser Tyr Ile His Asn Ile Cys Lys Pro His Ile Val His Arg Asp
            900                 905                 910        
 
 
Ile Lys Ser Ser Asn Ile Leu Leu Asp Arg Glu Phe Arg Ala Cys Val
        915                 920                 925            
 
 
Ala Asp Phe Gly Leu Ala Arg Leu Ile Leu Pro Tyr Asp Thr His Val
    930                 935                 940                
 
 
Thr Thr Glu Leu Ile Gly Thr Leu Gly Tyr Ile Pro Pro Glu Tyr Ser
945                 950                 955                 960
 
 
Gln Ala Trp Val Ala Thr Leu Arg Gly Asp Ile Tyr Ser Phe Gly Val
                965                 970                 975    
 
 
Val Leu Leu Glu Leu Leu Thr Gly Lys Arg Pro Val Gln Val Leu Ser
            980                 985                 990        
 
 
Lys Ser Lys Glu Leu Val Gln Trp  Thr Arg Glu Met Arg  Ser His Gly
        995                 1000                 1005            
 
 
Lys Asp  Thr Glu Val Leu Asp  Pro Ala Leu Arg Gly  Arg Gly His
    1010                 1015                 1020            
 
 
Glu Glu  Gln Met Leu Lys Val  Leu Asp Val Ala Cys  Lys Cys Ile
    1025                 1030                 1035            
 
 
Ser His  Asn Pro Cys Lys Arg  Pro Thr Ile Gln Glu  Val Val Ser
    1040                 1045                 1050            
 
 
Cys Leu  Asp Asn Val Asp Ala  Asp Leu Gln Val Gln  Met
    1055                 1060                 1065    

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1、10申请公布号CN104152462A43申请公布日20141119CN104152462A21申请号201410347654122申请日20140722C12N15/29200601C07K14/415200601C12N15/84200601A01H5/0020060171申请人浙江大学地址310058浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号72发明人娄永根胡凌飞叶萌74专利代理机构杭州求是专利事务所有限公司33200代理人邱启旺54发明名称一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用57摘要本发明公开了一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用,该抗虫基因具有SEQIDNO1的DNA序列。该序列由3。

2、385个核苷酸碱基组成,包含一个由3201个核苷酸构成的完整的编码框,编码1066个氨基酸残基的小分子量蛋白。研究发现该基因与水稻的抗虫性密切相关,降低该基因的表达水平能提高水稻对褐飞虱的抗性。本发明将在作物育种,特别是在水稻抗虫育种中得到广泛应用。51INTCL权利要求书1页说明书5页序列表11页附图4页19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书1页说明书5页序列表11页附图4页10申请公布号CN104152462ACN104152462A1/1页21一种水稻源抗虫相关基因,其特征在于,它具有SEQIDNO1的DNA序列。2一种权利要求1所述的抗虫相关基因编码的蛋白,其特征在。

3、于,它可以包含SEQIDNO2的氨基酸序列的蛋白质,或者是将SEQIDNO2的氨基酸残基序列经过一个或多个氨基酸残基的取代、缺失或者添加且具有与SEQIDNO2的氨基酸残基序列相同活性的由SEQIDNO2衍生的蛋白质。3一种权利要求1所述水稻源抗虫相关基因在转基因植物中的应用。4一种权利要求1所述水稻源抗虫相关基因在作物育种中的应用。权利要求书CN104152462A1/5页3一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用技术领域0001本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用。背景技术0002世界有将近一半的人口以水稻(ORYZASATIVAL)为食,作为最重要的粮。

4、食作物之一,每年却因虫害而造成水稻大量减产。日益严峻的粮食问题、因农药的泛滥使用而造成日益严重的环境问题等使得研究寻找抗虫新基因、培育抗虫新品种迫在眉睫。0003褐飞虱(NILAPARVATALUGENS)属于半翅目HEMIPTERA,飞虱科DELPHACIDAE,是我国水稻作物上的重要害虫。近几年来,褐飞虱接年大暴发,对我国的水稻粮食产量造成了严重损失。据统计,20世纪80年代以来,褐飞虱在我国的年发生面积大约为13302000万公顷,约占水稻种植面积的一半,年损失稻谷达1015亿千克。2005年,褐飞虱再次在我国南方稻区爆发,引起水稻大面积“虱烧”,产量损失十分严重。浙江省农业厅调查发现,。

5、2005年浙江省第5代褐飞虱发生量每667平方米达30万头以上的有667万公顷,占水稻总种植面积的86;每667平方米在100万头以上的有333万公顷,占42;最高田块的发生量达到每667平方米1000万头以上;绝收的面积达5333公顷,造成水稻产量损失约120万吨。0004在褐飞虱综合防治体系中,培育和种植水稻抗虫品种是防治褐飞虱最经济最有效的方法之一。然而,目前对水稻抗褐飞虱的基因还克隆鉴定得很少。至今,还只有BPH14一个基因得到鉴定与克隆。因此寻找和鉴定水稻中抗褐飞虱相关基因,对水稻抗虫品种的筛选和培育,实现褐飞虱无公害和可持续控制具有十分重要的意义。发明内容0005本发明的目的在于针。

6、对现有技术的不足,提供一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用。0006本发明的目的是通过以下技术方案来实现的一种水稻源抗虫相关基因OSHILRR1,它具有SEQIDNO1的DNA序列。0007一种水稻源抗虫相关基因OSHILRR1的编码蛋白,它包含SEQIDNO2的氨基酸序列的蛋白质,或者是将SEQIDNO2的氨基酸残基序列经过一个或多个氨基酸残基的取代、缺失或者添加且具有与SEQIDNO2的氨基酸残基序列相同活性的由SEQIDNO2衍生的蛋白质。0008一种水稻源抗虫相关基因OSHILRR1在转基因植物中的应用。0009一种水稻源抗虫相关基因OSHILRR1在作物育种中的应用。0010本发。

7、明的有益效果是,利用SSH、RTPCR和RACE技术分离并克隆了OSHILRR1基因;利用荧光定量PCR(QRTPCR)方法分析了OSHILRR1基因在褐飞虱为害后的表达情况;利用转基因技术获得了OSHILRR1基因的RNAI沉默转基因植株,并发现了OSHILRR1基因在水稻对褐飞虱抗性中发挥着十分重要的作用。该基因的分离克隆,对作物的抗虫育种,尤说明书CN104152462A2/5页4其是抗褐飞虱的水稻品种的培育,具有十分重要的指导和促进作用。附图说明0011图1是OSHILRR1基因PCR扩增产物凝胶电泳图;图2是褐飞虱为害后OSHILRR1基因的表达情况。CON水稻茎秆套入空玻璃罩。柱形。

8、图为平均数标准误(N5);图3是OSHILRR1基因的RNAI沉默载体结构示意图;图4是OSHILRR1基因沉默效果图。本底情况下野生型植株(WT)、沉默品系LRR11和LRR12中OSHILRR1基因的表达量。图中数字为沉默品系与WT中OSHILRR1基因表达量的比例。柱形图为平均数标准误(N5);图5是OSHILRR1基因沉默后降低了褐飞虱雌成虫的取食和产卵嗜好性。(A),(B)褐飞虱怀卵雌成虫在野生型植株(WT)、沉默植株LRR11和LRR12上的取食头数和产卵率。“”表示处理组与对照组存在显著差异(TTEST,P浙江大学一种水稻源抗虫相关基因及其编码产物与应用2PATENTINVERS。

9、ION3313385DNA水稻1TGCAGCAGGCGAGTTTCATGAGAGAACCATGCAGCTGCCCAATTTGCCATGCAGCAGCAG60CAGCAGCACCACCACCACCACCACCACCAAGTTATCTGTGGCTTTCTTTCGGCTTCTTGT120TATCCTCCTGCTCTCGTTTGCCTCTCCGACCAGCTCCTGCACAGAGCAAGAGGAGAGCTC180CCTCATCGGCTTTCTAGAGGGTCTCTTGCCAGGCCACAACGGCAGCCTCAGCACGTCATG240GGTGAAGGGCATAGACTGCTGCAAATGGGAAGG。

10、CATCAACTGCAGCAGCGATGGCACGGT300CACAGATGTCTCGTTGGCTTCCAAGGGCCTCCAAGGGCGCATCTCGCCATCTCTCGGCAA360TCTTACTGGGCTGTTGCACCTCAACCTGTCTCACAACTTACTCAATGGCTACCTACCAAT420GGAATTGTTGTTCTCCAGAAGTATCATCGTTCTTGACGTCAGCTTCAACCGCCTGGATGG480TTCTCTGCCAGAGTTGGAGTCCCCTAGTGGTGGTTCTCCTCTCCAGGTACTGAATATCTC540GAGCAATTCATTTACAGG。

11、GCAGTTCTCATCGAAACAATGGGAAGTGATGAAGAATATTGT600CGCTCTTAATGTAAGCAACAACAGCTTTACAGGACAGATACCACCTTCTATATGCATCAA660序列表CN104152462A2/11页9CTCCCCATCATTTGCTATCCTTGACCTTTGTTACAACCAATTCAGTGGCAGTATTTCCTC720AGGGCTCGGAAATTGCTCCAAGATGAGAGAGTTCAAGGCTGGATACAACAACTTTAGTGG780AGCTCTCCCTGAAGAACTCTTCAGTGCTACCTCATTGGAGCACCT。

12、ATCTCTTCCTAATAA840TGATTTACAAGGAGTTCTTGATGGTTCCCACATAGTAAAACTCGTCAAGCTGACAGTCCT900TGATCTCGGATCGACTGGGCTCAGTGGCAACATCCCAGATTCTATTGGCCAACTAAGCAC960ATTGGAGGAGCTCCGGTTGGACAACAACAACATGTCTGGTGAGCTGCCATCAGCCCTAGG1020TAACTGCACAAATCTGAGATATCTCAGCCTCAGAAACAATAAATTTGTGGGAGATCTTAG1080CAAAGTCAATTTTACCTGGTTGAATTTG。

13、AGAATCGCAGATTTCTCAATTAATAACTTCAC1140TGGTACAGTTCCAGAAAGCATATTCTCATGCAGCAATCTAATTGCGTTGCGGCTGGCTTT1200CAACAAGTTTCATGGCCAGTTGTCACCAAGAATGGGTACTCTCAAGTCCCTGTCCTTCTT1260TTCAATAAGTGATAACCATTTCACAAATATCACAAATGCACTTCAGATACTCAGGAGCTG1320CAAGAACCTTACGTCACTGCTTATTGGAACCAATTTCAAGGGTGAAACCATACAACAAGA1380TGAAACAG。

14、TTGATGGTTTTGAGAATCTTCGGGTACTGACCATAGACTCTTGTGGAGCAAT1440GGGGCAAATCCCTCCTTGGATATCAAAGCTCAAAAAACTGGAAGTGTTGGATTTATCAAA1500CAATATGCTCATCGGAGAAATACCATTTTGGATTAGAGATATGCCTGTTCTTTTCTATTT1560AGACATAACAAACAACAGTCTTACAGGGGATATCCCAGTTGCGTTGATGAACTTGCCGAT1620GCTACAATCAGGGAAGAATGCTGCCCAGTTGGACCCAAATTTTCTTGAATTG。

15、CCTGTTTA1680TTGGACACCATCACGTCAATACCGCTTGCTCAATGCTTTTCCTAACGCATTGAATCTAGG1740TAACAATAGTTTCACAGGAGTGATTCCCCCTGAGATTGGTCAGTTGAAAATGCTTGATGG1800CTTCAATGTCAGCTTTAACAGGTTATCTGGAGAAATACCACAGCAGATATGCAACCTCAC1860序列表CN104152462A3/11页10AAACCTGCAATTGCTAGATTTATCAAGCAATCAGCTCACAGGTGAACTACCGGCCGCACT1920GACTAATCTG。

16、CACTTCCTTTCTAAATTCAATGTTTCTAACAATGAACTAGAAGGGCCAGT1980TCCAACTGGAAGACAGTTTGATACATTTCTCAATTCTAGCTATAGTGGGAATCCAAAGCT2040ATGTGGCCCTATGCTCAGCAACCTGTGTGATTCAGTACCAACACATGCATCCTCCATGAA2100ACAGCGCAACAAGAAGGCCATTATTGCACTTGCATTAGGTGTGTTCTTTGGAGGGATTGC2160CATCCTTTTCTTGCTGGGACGTTTTCTTATATCCATCAGAAGAACAAGCTCTGT。

17、CCACCA2220AAACAAGAGCAGCAACAATGGGGACATAGAAGCAGCTTCATTGAGTTCTGTTTCAGAGCA2280CTTGCACGACATGATAAAAGGAACCATTTTGGTGATGGTACCTCAAGGCAAGGGAGGATC2340AAATAATCTCAAATTCAAGGATATCTTGAAGGCCACTAATAACTTTGACCAGCAGAACAT2400TATCGGATGTGGAGGTAATGGTCTAGTCTACAAGGCTGAGCTACCCAATGGATCCAAGCT2460TGCAATCAAGAAGCTCAACGGTGAAATGTGTCTG。

18、ATGGAGAGAGAATTTACCGCAGAGGT2520AGAAGCACTCTCTATGGCACAACATGACAATCTTGTGCCACTATGGGGTTACTGCATCCA2580AGGAAACTCAAGGCTCCTCATATATTCTTACATGGAGAACGGCAGTCTAGATGACTGGCT2640TCACAACAGAGACAATGGCAGGCCACTTCTCGACTGGCCAACAAGGCTCAAGATTGCACA2700AGGAGCAAGCCGGGGCCTTTCATATATCCATAATATCTGCAAGCCTCACATTGTTCACCG2760TGACATCAAATCCA。

19、GCAATATCCTTCTCGACAGAGAATTCAGAGCTTGTGTTGCGGATTT2820TGGCCTTGCCAGATTGATCCTTCCCTATGACACACATGTTACAACTGAATTAATTGGCAC2880TCTGGGATATATTCCACCTGAGTACAGCCAGGCATGGGTGGCTACACTAAGAGGCGATAT2940ATACAGTTTTGGAGTGGTGCTGCTTGAGCTGCTCACAGGGAAGAGGCCAGTCCAGGTCTT3000序列表CN104152462A104/11页11GTCCAAGTCGAAGGAACTTGTCCAATGGACCCGG。

20、GAGATGAGATCTCATGGAAAGGATAC3060TGAGGTGTTGGATCCAGCACTGAGAGGAAGAGGCCATGAAGAGCAAATGCTGAAGGTGCT3120TGATGTGGCTTGCAAGTGTATCAGCCATAATCCTTGCAAGAGGCCAACCATCCAAGAAGT3180GGTCTCCTGCCTGGACAATGTTGATGCAGACCTGCAGGTGCAGATGTAGTTAAAGGAGAA3240CAGATCCATAGACCTGGAGATGCAGAGATGATTTTGTACTTACAGACTAGGTGTGTAACT3300TCAGTAGAAAGAAG。

21、ATTTGCTAACAAATATTACAGTTTGATTGTACATCTGTGTAAAGGA3360ATGGCTCGCAGTTATGAGCTTCTGT338521066PRT水稻2METGLNLEUPROASNLEUPROCYSSERSERSERSERSERTHRTHRTHR151015THRTHRTHRTHRLYSLEUSERVALALAPHEPHEARGLEULEUVALILE202530LEULEULEUSERPHEALASERPROTHRSERSERCYSTHRGLUGLNGLU354045GLUSERSERLEUILEGLYPHELEUGLUGLYLEULEUPROGLYHISASN。

22、505560GLYSERLEUSERTHRSERTRPVALLYSGLYILEASPCYSCYSLYSTRP序列表CN104152462A115/11页1265707580GLUGLYILEASNCYSSERSERASPGLYTHRVALTHRASPVALSERLEU859095ALASERLYSGLYLEUGLNGLYARGILESERPROSERLEUGLYASNLEU100105110THRGLYLEULEUHISLEUASNLEUSERHISASNLEULEUASNGLYTYR115120125LEUPROMETGLULEULEUPHESERARGSERILEILEVALLEUASPV。

23、AL130135140SERPHEASNARGLEUASPGLYSERLEUPROGLULEUGLUSERPROSER145150155160GLYGLYSERPROLEUGLNVALLEUASNILESERSERASNSERPHETHR165170175GLYGLNPHESERSERLYSGLNTRPGLUVALMETLYSASNILEVALALA180185190LEUASNVALSERASNASNSERPHETHRGLYGLNILEPROPROSERILE195200205CYSILEASNSERPROSERPHEALAILELEUASPLEUCYSTYRASNGLN210215220序。

24、列表CN104152462A126/11页13PHESERGLYSERILESERSERGLYLEUGLYASNCYSSERLYSMETARG225230235240GLUPHELYSALAGLYTYRASNASNPHESERGLYALALEUPROGLUGLU245250255LEUPHESERALATHRSERLEUGLUHISLEUSERLEUPROASNASNASP260265270LEUGLNGLYVALLEUASPGLYSERHISILEVALLYSLEUVALLYSLEU275280285THRVALLEUASPLEUGLYSERTHRGLYLEUSERGLYASNILEPROA。

25、SP290295300SERILEGLYGLNLEUSERTHRLEUGLUGLULEUARGLEUASPASNASN305310315320ASNMETSERGLYGLULEUPROSERALALEUGLYASNCYSTHRASNLEU325330335ARGTYRLEUSERLEUARGASNASNLYSPHEVALGLYASPLEUSERLYS340345350VALASNPHETHRTRPLEUASNLEUARGILEALAASPPHESERILEASN355360365ASNPHETHRGLYTHRVALPROGLUSERILEPHESERCYSSERASNLEU370375380序。

26、列表CN104152462A137/11页14ILEALALEUARGLEUALAPHEASNLYSPHEHISGLYGLNLEUSERPRO385390395400ARGMETGLYTHRLEULYSSERLEUSERPHEPHESERILESERASPASN405410415HISPHETHRASNILETHRASNALALEUGLNILELEUARGSERCYSLYS420425430ASNLEUTHRSERLEULEUILEGLYTHRASNPHELYSGLYGLUTHRILE435440445PROGLNASPGLUTHRVALASPGLYPHEGLUASNLEUARGVALLEUT。

27、HR450455460ILEASPSERCYSGLYALAMETGLYGLNILEPROPROTRPILESERLYS465470475480LEULYSLYSLEUGLUVALLEUASPLEUSERASNASNMETLEUILEGLY485490495GLUILEPROPHETRPILEARGASPMETPROVALLEUPHETYRLEUASP500505510ILETHRASNASNSERLEUTHRGLYASPILEPROVALALALEUMETASN515520525LEUPROMETLEUGLNSERGLYLYSASNALAALAGLNLEUASPPROASN530535540序。

28、列表CN104152462A148/11页15PHELEUGLULEUPROVALTYRTRPTHRPROSERARGGLNTYRARGLEU545550555560LEUASNALAPHEPROASNALALEUASNLEUGLYASNASNSERPHETHR565570575GLYVALILEPROPROGLUILEGLYGLNLEULYSMETLEUASPGLYPHE580585590ASNVALSERPHEASNARGLEUSERGLYGLUILEPROGLNGLNILECYS595600605ASNLEUTHRASNLEUGLNLEULEUASPLEUSERSERASNGLNLEUT。

29、HR610615620GLYGLULEUPROALAALALEUTHRASNLEUHISPHELEUSERLYSPHE625630635640ASNVALSERASNASNGLULEUGLUGLYPROVALPROTHRGLYARGGLN645650655PHEASPTHRPHELEUASNSERSERTYRSERGLYASNPROLYSLEUCYS660665670GLYPROMETLEUSERASNLEUCYSASPSERVALPROTHRHISALASER675680685SERMETLYSGLNARGASNLYSLYSALAILEILEALALEUALALEUGLY序列表CN10415。

30、2462A159/11页16690695700VALPHEPHEGLYGLYILEALAILELEUPHELEULEUGLYARGPHELEU705710715720ILESERILEARGARGTHRSERSERVALHISGLNASNLYSSERSERASN725730735ASNGLYASPILEGLUALAALASERLEUSERSERVALSERGLUHISLEU740745750HISASPMETILELYSGLYTHRILELEUVALMETVALPROGLNGLYLYS755760765GLYGLYSERASNASNLEULYSPHELYSASPILELEULYSALATHRA。

31、SN770775780ASNPHEASPGLNGLNASNILEILEGLYCYSGLYGLYASNGLYLEUVAL785790795800TYRLYSALAGLULEUPROASNGLYSERLYSLEUALAILELYSLYSLEU805810815ASNGLYGLUMETCYSLEUMETGLUARGGLUPHETHRALAGLUVALGLU820825830ALALEUSERMETALAGLNHISASPASNLEUVALPROLEUTRPGLYTYR835840845序列表CN104152462A1610/11页17CYSILEGLNGLYASNSERARGLEULEUILETYR。

32、SERTYRMETGLUASN850855860GLYSERLEUASPASPTRPLEUHISASNARGASPASNGLYARGPROLEU865870875880LEUASPTRPPROTHRARGLEULYSILEALAGLNGLYALASERARGGLY885890895LEUSERTYRILEHISASNILECYSLYSPROHISILEVALHISARGASP900905910ILELYSSERSERASNILELEULEUASPARGGLUPHEARGALACYSVAL915920925ALAASPPHEGLYLEUALAARGLEUILELEUPROTYRASPTHRHIS。

33、VAL930935940THRTHRGLULEUILEGLYTHRLEUGLYTYRILEPROPROGLUTYRSER945950955960GLNALATRPVALALATHRLEUARGGLYASPILETYRSERPHEGLYVAL965970975VALLEULEUGLULEULEUTHRGLYLYSARGPROVALGLNVALLEUSER980985990LYSSERLYSGLULEUVALGLNTRPTHRARGGLUMETARGSERHISGLY99510001005序列表CN104152462A1711/11页18LYSASPTHRGLUVALLEUASPPROALALEU。

34、ARGGLYARGGLYHIS101010151020GLUGLUGLNMETLEULYSVALLEUASPVALALACYSLYSCYSILE102510301035SERHISASNPROCYSLYSARGPROTHRILEGLNGLUVALVALSER104010451050CYSLEUASPASNVALASPALAASPLEUGLNVALGLNMET105510601065序列表CN104152462A181/4页19图1图2说明书附图CN104152462A192/4页20图3说明书附图CN104152462A203/4页21图4图5说明书附图CN104152462A214/4页22图6图7说明书附图CN104152462A22。

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