一种春兰梅瓣品种的分子特异标记及其获得方法.pdf

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摘要
申请专利号:

CN201010502030.4

申请日:

2010.10.01

公开号:

CN101955933A

公开日:

2011.01.26

当前法律状态:

授权

有效性:

有权

法律详情:

授权|||专利申请权的转移IPC(主分类):C12N 15/11变更事项:申请人变更前权利人:郑琪变更后权利人:孙叶芳变更事项:地址变更前权利人:312500 浙江省新昌县城关镇江南南路三弄1幢171室变更后权利人:312003 浙江省绍兴市越城区皋埠镇迎宾路133号变更事项:共同申请人变更前权利人:孙叶芳 赵虎 黄岳夫 林国梅 邢海变更后权利人:郑琪 赵虎 黄岳夫 林国梅 邢海登记生效日:20120605|||著录事项变更IPC(主分类):C12N 15/11变更事项:发明人变更前:郑琪 孙叶芳 赵虎 黄岳夫 林国梅 邢海变更后:孙叶芳 郑琪 赵虎 黄岳夫 林国梅 邢海|||实质审查的生效IPC(主分类):C12N 15/11申请日:20101001|||公开

IPC分类号:

C12N15/11; C12N15/10; C12Q1/68

主分类号:

C12N15/11

申请人:

郑琪; 孙叶芳; 赵虎; 黄岳夫; 林国梅; 邢海

发明人:

郑琪; 孙叶芳; 赵虎; 黄岳夫; 林国梅; 邢海

地址:

312500 浙江省新昌县城关镇江南南路三弄1幢171室

优先权:

专利代理机构:

绍兴市越兴专利事务所 33220

代理人:

张谦

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内容摘要

本发明涉及一种春兰梅瓣品种的分子特异标记及其获得方法,属于生物技术领域。春兰梅瓣的分子标记DNA片段大小为550kp,特异性PCR扩增引物序列为ACACACACACACACACCTT。方法包括步骤:梅瓣春兰资源的收集,基因组DNA的提取;特异PCR扩增引物的获得;ISSR-PCR扩增产物的获得;电泳检测。本发明的分子特异标记可应用于梅瓣春兰的快速鉴定。

权利要求书

1: 一种春兰梅瓣品种的分子特异标记, 其特征在于 : 采用特异性 ISSR-PCR 扩增引物对 春兰普通品种与梅瓣基因进行扩增, 得到大小为 550bp 的 DNA 片段即为所述的分子特异标 记。
2: 如权利要求 1 所述的一种春兰梅瓣品种的分子特异标记的获得方法, 其特征在于包 括如下步骤 : (1) 春兰梅瓣品种的资源收集和基因组 DNA 的提取 ; (2) 春兰梅瓣品种的特异 PCR 扩增引物的获得, 采用 ISSR-PCR 技术, 经过大量的筛选试 验, 获得特异 PCR 扩增引物为 ACACACACACACACACCTT ; (3)ISSR 分子标记的 PCR 扩增产物的获得 : 扩增总体积为 20uL, 10×PCR buffer( 含 2+ mg )2.0uL, 10mmol/L dNTP 0.4uL, 2.5U/uLTaqDNA 聚合酶 0.3uL, 10u mol/L 特异 PCR 扩增 引物 ACACACACACACACACCTT 2uL, 基因组 DNA 1uL, ddH2O 14.3uL ; PCR 反应条件 : 94℃ 3min ; 94℃ 45sec, 51℃ 45sec, 72℃ 90sec, 38 个循环 ; 72℃ 7min ; (4) 电泳检测 : 取上述 PCR 扩增产物 2uL, 与 1uL 上样缓冲液混匀, 点样于 1%的琼脂糖 凝胶上, 于 1×TBE 缓冲液中, 8V/cm 电压下电泳, 电泳结束后, 用 EB 染色, 然后在凝胶成像仪 上照相, 此时可见 550bp 大小的特异片段, 而其他普通春兰均未见特异性片段。
3: 如权利要求 2 所述的一种春兰梅瓣品种的分子特异标记的获得方法, 其特征在于 : 所述步骤 (1) 中, 用改良的 CTAB 法提取基因组 DNA, DNA 稀释至 20ng/uL, -20℃冰箱贮藏备 用。
4: 3uL ; PCR 反应条件 : 94℃ 3min ; 94℃ 45sec, 51℃ 45sec, 72℃ 90sec, 38 个循环 ; 72℃ 7min ; (4) 电泳检测 : 取上述 PCR 扩增产物 2uL, 与 1uL 上样缓冲液混匀, 点样于 1%的琼脂糖 凝胶上, 于 1×TBE 缓冲液中, 8V/cm 电压下电泳, 电泳结束后, 用 EB 染色, 然后在凝胶成像仪 上照相, 此时可见 550bp 大小的特异片段, 而其他普通春兰均未见特异性片段。 3. 如权利要求 2 所述的一种春兰梅瓣品种的分子特异标记的获得方法, 其特征在于 : 所述步骤 (1) 中, 用改良的 CTAB 法提取基因组 DNA, DNA 稀释至 20ng/uL, -20℃冰箱贮藏备 用。

说明书


一种春兰梅瓣品种的分子特异标记及其获得方法

    【技术领域】
     本发明涉及一种春兰梅瓣品种的分子特异标记及其获得方法, 属于生物技术领域。 背景技术
     二千三百年前就有越王勾践种兰渚山可谓全国最早, 三百多年来共选育出春兰品 种 400 多个可谓全国最多, 百余年来誉满神州的春兰 “四大天王” - 宋梅、 集圆、 龙字、 万字 均出自浙江。浙江自 1645 年以来, 共选育出春兰品种 600 多个, 仅绍兴地区选育和栽培的 春兰品种就有 430 多个 ; 品种之多为全国之最。改革开放后, 兰花在绍兴市, 特别在绍兴县 成了农民发家致富的一条捷径, 兰花产业不断发展壮大。 目前, 仅绍兴县兰花产业从业者达 2500 多人, 兰花种植面积 2000 多亩, 兰花产业年产值达 1 亿元以上。文人雅士玩赏的小小 兰花, 如今在浙江绍兴县却成了百万乃至千万富翁的 “生产线” 。在这个县有 1500 多农户长 年从事兰花的收集、 驯化和培育。目前, 至少有 20 多户农民因种植兰花而资产逾千万元。
     近几年来, 随着我省经济的长足发展, 人民生活水平的不断提高, 兰花交流营运也 得到不断升温。 如绍兴地区养兰户每年以 15%以上的速度递增。 目前我省已基本形成一个 普遍养兰的氛围。从 2000 年至 2006 年我省兰花交易形势上看, 兰花产业正成为我省人民 致富的一条捷径, 正成为我省可持续发展的特色优势产业。同时我省兰花产业也面临着诸 多被动因素, 严重影响着该产业的健康发展。
     兰花是大自然赋予我们的宝贵自然资源, 也是我省宝贵的自然资源和经济资源, 近年来, 由于兰花价格的持续上升, 一些地区对野生兰花的采挖比较混乱。 目前江浙两省每 年的下山兰草很少, 野生兰花资源已遭很大程度的破坏, 许多山区已经到了乱挖、 滥采的地 步, 目前已无下山草可挖, 所以兰展上已很难找到一些带有香味的浙江下山春兰。 我国为避 免此类现象的发生, 除利用法律、 法规措施禁止人为破坏和掠夺兰花野生资源, 更重要的是 利用现有的兰花资源, 加强新品种的培育和栽培管理技术的研究, 利用现有的种质资源以 兰养兰、 以兰扩兰, 既有效地保护兰花自然资源, 又满足养兰爱好者的需要。 发明内容
     本发明的目的是为了能对春兰梅瓣品种进行简便、 快速、 准确的鉴定和检测, 提供 了一种春兰梅瓣品种的分子特异标记及其获得方法。
     为了实现上述目的, 本发明所采用的技术方案为 :
     一种春兰梅瓣品种的分子特异标记, 采用特异性 ISSR-PCR 扩增引物对春兰普通 品种与梅瓣基因进行扩增, 得到大小为 550bp 的 DNA 片段即为所述的分子特异标记。
     一种春兰梅瓣品种的分子特异标记的获得方法, 包括如下步骤 :
     (1) 春兰梅瓣品种的资源收集和基因组 DNA 的提取 ;
     (2) 春兰梅瓣品种的特异 PCR 扩增引物的获得, 采用 ISSR-PCR 技术, 经过大量的筛 选试验, 获得特异 PCR 扩增引物为 ACACACACACACACACCTT ;(3)ISSR 分 子 标 记 的 PCR 扩 增 产 物 的 获 得 : 扩 增 总 体 积 为 20uL, 10×PCR 2+ buffer( 含 mg )2.0uL, 10mmol/L dNTP( 三磷酸脱氧核糖核苷 )0.4uL, 2.5U/uL TaqDNA 聚 合酶 0.3uL, 10u mol/L 特异 PCR 扩增引物 ACACACACACACACACCTT 2uL, 基因组 DNA 1uL, ddH2O( 重蒸水 )14.3uL ; PCR 反应条件 : 94 ℃ 3min ; 94 ℃ 45sec, 51 ℃ 45sec, 72 ℃ 90sec, 38 个循环 ; 72℃ 7min ;
     (4) 电泳检测 : 取上述 PCR 扩增产物 2uL, 与 1uL 上样缓冲液 (6×loading buffer) 混匀, 点样于 1%的琼脂糖凝胶上, 于 1×TBE 缓冲液中, 8V/cm 电压下电泳, 电泳结束后, 用 EB( 溴化乙锭 ) 染色, 然后在凝胶成像仪上照相, 此时可见 550bp 大小的特异片段, 而其他普 通春兰均未见特异性片段。
     所述步骤 (1) 中, 用改良的 CTAB 法提取基因组 DNA, DNA 稀释至 20ng/uL, -20℃冰 箱贮藏备用。
     根据采用这一个特殊引物进行 PCR 扩增, 以能否产生 550bpDNA 片段作为对梅瓣春 兰进行鉴定和检测的依据。
     该检测方法与传统的辨别梅瓣春兰的方法相比, 具有更强的操作性, 传统的方法 须等开花之后通过花瓣的花型特征来判定, 而该检测方法在春兰幼苗时通过嫩叶即可进行 检测, 检测时间短, 准确性高。
     以下结合附图和具体实施方式对本发明作进一步说明。附图说明 图 1 为梅瓣春兰专用检测引物对春兰进行 ISSR-PCR 扩增结果。 图中梅瓣春兰 ( 天 兴, 万字, 瑞梅, 宋梅, 冠姚和贺梅 ) 均能扩增出分子量约为 550bp 的特殊 DNA 条带, 而普通 春兰 ( 普 1, 普 2 和普 3) 则没有。
     具体实施方式
     下面通过具体实施例对本发明作进一步说明, 但本发明并不受以下实施例所限 定。
     实施例 1
     (1) 春兰梅瓣品种的资源收集和基因组 DNA 的提取 ; 其中, 基因组 DNA 的提取具体 为: 用改良的 CTAB 法提取基因组 DNA, DNA 稀释至 20ng/uL, -20℃冰箱贮藏备用。
     (2) 春兰梅瓣品种的特异 PCR 扩增引物的获得, 采用 ISSR-PCR 技术, 经过大量的筛 选试验, 获得特异 PCR 扩增引物为 ACACACACACACACACCTT。
     (3)ISSR 分 子 标 记 的 PCR 扩 增 产 物 的 获 得 : 扩 增 总 体 积 为 20uL, 10×PCR 2+ buffer( 含 mg )2.0uL, 10mmol/L dNTP 0.4uL, 2.5U/uLTaqDNA 聚合酶 0.3uL, 10u mol/L 特 异 PCR 扩增引物 ACACACACACACACACCTT 2uL, 基因组 DNA 1uL, ddH2O 14.3uL ; PCR 反应条件 : 94℃ 3min ; 94℃ 45sec, 51℃ 45sec, 72℃ 90sec, 38 个循环 72℃ 7min。
     (4) 电泳检测 : 取上述 PCR 扩增产物 2uL, 与 1uL 上样缓冲液混匀, 点样于 1%的琼 脂糖凝胶上, 于 1×TBE 缓冲液中, 8V/cm 电压下电泳, 电泳结束后, 用 EB 染色, 然后在凝胶成 像仪上照相, 此时可见 550bp 大小的特异片段, 而其他普通春兰均未见特异性片段。
     (5) 对 9 个春兰品种进行 ISSR 扩增, 其中 3 个普通品种, 6 个梅瓣品种。6 个梅瓣品种均能扩增出专一的 ISSR 标记。
     上述实施例仅用于解释说明本发明的发明构思, 而非对本发明权利保护的限定, 凡利用此构思对本发明进行非实质性的改动, 均应落入本发明的保护范围。

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1、10申请公布号CN101955933A43申请公布日20110126CN101955933ACN101955933A21申请号201010502030422申请日20101001C12N15/11200601C12N15/10200601C12Q1/6820060171申请人郑琪地址312500浙江省新昌县城关镇江南南路三弄1幢171室申请人孙叶芳赵虎黄岳夫林国梅邢海72发明人郑琪孙叶芳赵虎黄岳夫林国梅邢海74专利代理机构绍兴市越兴专利事务所33220代理人张谦54发明名称一种春兰梅瓣品种的分子特异标记及其获得方法57摘要本发明涉及一种春兰梅瓣品种的分子特异标记及其获得方法,属于生物技术领域。。

2、春兰梅瓣的分子标记DNA片段大小为550KP,特异性PCR扩增引物序列为ACACACACACACACACCTT。方法包括步骤梅瓣春兰资源的收集,基因组DNA的提取;特异PCR扩增引物的获得;ISSRPCR扩增产物的获得;电泳检测。本发明的分子特异标记可应用于梅瓣春兰的快速鉴定。51INTCL19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书1页说明书3页附图1页CN101955933A1/1页21一种春兰梅瓣品种的分子特异标记,其特征在于采用特异性ISSRPCR扩增引物对春兰普通品种与梅瓣基因进行扩增,得到大小为550BP的DNA片段即为所述的分子特异标记。2如权利要求1所述的一种春兰。

3、梅瓣品种的分子特异标记的获得方法,其特征在于包括如下步骤1春兰梅瓣品种的资源收集和基因组DNA的提取;2春兰梅瓣品种的特异PCR扩增引物的获得,采用ISSRPCR技术,经过大量的筛选试验,获得特异PCR扩增引物为ACACACACACACACACCTT;3ISSR分子标记的PCR扩增产物的获得扩增总体积为20UL,10PCRBUFFER含MG220UL,10MMOL/LDNTP04UL,25U/ULTAQDNA聚合酶03UL,10UMOL/L特异PCR扩增引物ACACACACACACACACCTT2UL,基因组DNA1UL,DDH2O143UL;PCR反应条件943MIN;9445SEC,514。

4、5SEC,7290SEC,38个循环;727MIN;4电泳检测取上述PCR扩增产物2UL,与1UL上样缓冲液混匀,点样于1的琼脂糖凝胶上,于1TBE缓冲液中,8V/CM电压下电泳,电泳结束后,用EB染色,然后在凝胶成像仪上照相,此时可见550BP大小的特异片段,而其他普通春兰均未见特异性片段。3如权利要求2所述的一种春兰梅瓣品种的分子特异标记的获得方法,其特征在于所述步骤1中,用改良的CTAB法提取基因组DNA,DNA稀释至20NG/UL,20冰箱贮藏备用。权利要求书CN101955933A1/3页3一种春兰梅瓣品种的分子特异标记及其获得方法技术领域0001本发明涉及一种春兰梅瓣品种的分子特异。

5、标记及其获得方法,属于生物技术领域。背景技术0002二千三百年前就有越王勾践种兰渚山可谓全国最早,三百多年来共选育出春兰品种400多个可谓全国最多,百余年来誉满神州的春兰“四大天王”宋梅、集圆、龙字、万字均出自浙江。浙江自1645年以来,共选育出春兰品种600多个,仅绍兴地区选育和栽培的春兰品种就有430多个;品种之多为全国之最。改革开放后,兰花在绍兴市,特别在绍兴县成了农民发家致富的一条捷径,兰花产业不断发展壮大。目前,仅绍兴县兰花产业从业者达2500多人,兰花种植面积2000多亩,兰花产业年产值达1亿元以上。文人雅士玩赏的小小兰花,如今在浙江绍兴县却成了百万乃至千万富翁的“生产线”。在这个。

6、县有1500多农户长年从事兰花的收集、驯化和培育。目前,至少有20多户农民因种植兰花而资产逾千万元。0003近几年来,随着我省经济的长足发展,人民生活水平的不断提高,兰花交流营运也得到不断升温。如绍兴地区养兰户每年以15以上的速度递增。目前我省已基本形成一个普遍养兰的氛围。从2000年至2006年我省兰花交易形势上看,兰花产业正成为我省人民致富的一条捷径,正成为我省可持续发展的特色优势产业。同时我省兰花产业也面临着诸多被动因素,严重影响着该产业的健康发展。0004兰花是大自然赋予我们的宝贵自然资源,也是我省宝贵的自然资源和经济资源,近年来,由于兰花价格的持续上升,一些地区对野生兰花的采挖比较混。

7、乱。目前江浙两省每年的下山兰草很少,野生兰花资源已遭很大程度的破坏,许多山区已经到了乱挖、滥采的地步,目前已无下山草可挖,所以兰展上已很难找到一些带有香味的浙江下山春兰。我国为避免此类现象的发生,除利用法律、法规措施禁止人为破坏和掠夺兰花野生资源,更重要的是利用现有的兰花资源,加强新品种的培育和栽培管理技术的研究,利用现有的种质资源以兰养兰、以兰扩兰,既有效地保护兰花自然资源,又满足养兰爱好者的需要。发明内容0005本发明的目的是为了能对春兰梅瓣品种进行简便、快速、准确的鉴定和检测,提供了一种春兰梅瓣品种的分子特异标记及其获得方法。0006为了实现上述目的,本发明所采用的技术方案为0007一种。

8、春兰梅瓣品种的分子特异标记,采用特异性ISSRPCR扩增引物对春兰普通品种与梅瓣基因进行扩增,得到大小为550BP的DNA片段即为所述的分子特异标记。0008一种春兰梅瓣品种的分子特异标记的获得方法,包括如下步骤00091春兰梅瓣品种的资源收集和基因组DNA的提取;00102春兰梅瓣品种的特异PCR扩增引物的获得,采用ISSRPCR技术,经过大量的筛选试验,获得特异PCR扩增引物为ACACACACACACACACCTT;说明书CN101955933A2/3页400113ISSR分子标记的PCR扩增产物的获得扩增总体积为20UL,10PCRBUFFER含MG220UL,10MMOL/LDNTP三。

9、磷酸脱氧核糖核苷04UL,25U/ULTAQDNA聚合酶03UL,10UMOL/L特异PCR扩增引物ACACACACACACACACCTT2UL,基因组DNA1UL,DDH2O重蒸水143UL;PCR反应条件943MIN;9445SEC,5145SEC,7290SEC,38个循环;727MIN;00124电泳检测取上述PCR扩增产物2UL,与1UL上样缓冲液6LOADINGBUFFER混匀,点样于1的琼脂糖凝胶上,于1TBE缓冲液中,8V/CM电压下电泳,电泳结束后,用EB溴化乙锭染色,然后在凝胶成像仪上照相,此时可见550BP大小的特异片段,而其他普通春兰均未见特异性片段。0013所述步骤1。

10、中,用改良的CTAB法提取基因组DNA,DNA稀释至20NG/UL,20冰箱贮藏备用。0014根据采用这一个特殊引物进行PCR扩增,以能否产生550BPDNA片段作为对梅瓣春兰进行鉴定和检测的依据。0015该检测方法与传统的辨别梅瓣春兰的方法相比,具有更强的操作性,传统的方法须等开花之后通过花瓣的花型特征来判定,而该检测方法在春兰幼苗时通过嫩叶即可进行检测,检测时间短,准确性高。0016以下结合附图和具体实施方式对本发明作进一步说明。附图说明0017图1为梅瓣春兰专用检测引物对春兰进行ISSRPCR扩增结果。图中梅瓣春兰天兴,万字,瑞梅,宋梅,冠姚和贺梅均能扩增出分子量约为550BP的特殊DN。

11、A条带,而普通春兰普1,普2和普3则没有。具体实施方式0018下面通过具体实施例对本发明作进一步说明,但本发明并不受以下实施例所限定。0019实施例100201春兰梅瓣品种的资源收集和基因组DNA的提取;其中,基因组DNA的提取具体为用改良的CTAB法提取基因组DNA,DNA稀释至20NG/UL,20冰箱贮藏备用。00212春兰梅瓣品种的特异PCR扩增引物的获得,采用ISSRPCR技术,经过大量的筛选试验,获得特异PCR扩增引物为ACACACACACACACACCTT。00223ISSR分子标记的PCR扩增产物的获得扩增总体积为20UL,10PCRBUFFER含MG220UL,10MMOL/L。

12、DNTP04UL,25U/ULTAQDNA聚合酶03UL,10UMOL/L特异PCR扩增引物ACACACACACACACACCTT2UL,基因组DNA1UL,DDH2O143UL;PCR反应条件943MIN;9445SEC,5145SEC,7290SEC,38个循环727MIN。00234电泳检测取上述PCR扩增产物2UL,与1UL上样缓冲液混匀,点样于1的琼脂糖凝胶上,于1TBE缓冲液中,8V/CM电压下电泳,电泳结束后,用EB染色,然后在凝胶成像仪上照相,此时可见550BP大小的特异片段,而其他普通春兰均未见特异性片段。00245对9个春兰品种进行ISSR扩增,其中3个普通品种,6个梅瓣品种。6个梅瓣说明书CN101955933A3/3页5品种均能扩增出专一的ISSR标记。0025上述实施例仅用于解释说明本发明的发明构思,而非对本发明权利保护的限定,凡利用此构思对本发明进行非实质性的改动,均应落入本发明的保护范围。说明书CN101955933A1/1页6图1说明书附图。

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