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1、(10)授权公告号 (45)授权公告日 (21)申请号 201110329289.8 (22)申请日 2011.10.26 C07K 14/52(2006.01) C07K 16/24(2006.01) C12N 15/19(2006.01) C12N 15/63(2006.01) C12N 1/21(2006.01) C12N 5/10(2006.01) A61K 38/19(2006.01) A61K 39/395(2006.01) A61K 48/00(2006.01) A61P 37/02(2006.01) A61P 35/00(2006.01) A61P 29/00(2006.01)。
2、 A61P 31/00(2006.01) A61P 37/08(2006.01) C12Q 1/68(2006.01) G01N 33/53(2006.01) (73)专利权人 北京大学 地址 100871 北京市海淀区颐和园路 5 号 (72)发明人 韩文玲 马大龙 张岩飞 付伟伟 王平章 刘绘绘 潘文 李婷 王文彦 石太平 (74)专利代理机构 北京泛华伟业知识产权代理 有限公司 11280 代理人 郭广迅 CN 1373211 A,2002.10.09, US 6083700 A,2000.07.04, Clark,H.F等.GenBank:NP_777558.1. GenBa nk .。
3、2011, (54) 发明名称 具有抗感染和抗肿瘤活性的潜在新细胞因子 LYG1 及其应用 (57) 摘要 本发明提供一种具有抗感染和抗肿瘤活性的 潜在新细胞因子 LYG1 及其应用, 所述 LYG1( 即成 熟的和发挥功能的潜在新细胞因子 LYG1) 的序列 为 SEQ ID NO : 1 所示的氨基酸序列, 所述应用为 LYG1 在制备用于预防和 / 或治疗免疫相关疾病 的药物及试剂盒中的应用, 所述治疗免疫相关疾 病的药物为抗肿瘤药物、 抗炎症药物、 抗感染性疾 病、 治疗过敏性疾病和 / 或治疗自身免疫疾病的 药物, 说明潜在新细胞因子 LYG1 在肿瘤、 感染性 疾病、 炎症、 过敏。
4、性疾病和自身免疫病方面可能发 挥重要作用, 具有潜在的临床价值。 (51)Int.Cl. (56)对比文件 审查员 刘新蕾 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利 权利要求书1页 说明书12页 序列表4页 附图12页 CN 103073632 B 2016.08.03 CN 103073632 B 1.一种潜在新细胞因子LYG1、 或编码所述的LYG1的核苷酸序列、 或含有编码所述的 LYG1的核苷酸序列的载体、 或由含有编码所述的LYG1的核苷酸序列的载体导入或转染到宿 主有机体产生的重组蛋白在制备用于预防和/或治疗免疫相关疾病的药物中的应用; 其中, 所述LYG1的序列为S。
5、EQIDNO:1所示的氨基酸序列; 其中, 所述治疗免疫相关疾病的药物为抗肿瘤药物; 其中, 所述肿瘤为通过促进Th1细胞分化、 促进细胞因子IFN-分泌和/或抑制补体调 节蛋白CD46、 CD55和CD59表达来抑制和/或治疗的肿瘤; 其中, 所述肿瘤为对免疫治疗敏感的肿瘤, 所述对免疫治疗敏感的肿瘤为黑色素肿瘤。 2.根据权利要求1所述的应用, 其特征在于, 所述编码权利要求1所述的LYG1的核苷酸 序列为SEQIDNO:3所示的核苷酸序列, 所述载体为pcDNA3.1/myc-His(-)B, 所述宿主有机 体为大肠杆菌、 HEK293T、 或293-6E细胞。 3.根据权利要求2所述的。
6、应用, 其中, 所述大肠杆菌为DH5 。 权利要求书 1/1 页 2 CN 103073632 B 2 具有抗感染和抗肿瘤活性的潜在新细胞因子LYG1及其应用 技术领域 0001 本发明涉及一种新的人类细胞因子及其应用, 尤其涉及一种具有抗感染和抗肿瘤 活性的潜在新细胞因子LYG1在抗炎症、 抗感染性疾病、 抗肿瘤和自身免疫疾病等方面的应 用。 背景技术 0002 人体免疫系统历经30亿年的进化, 形成复杂而精细的调控系统, 在机体具有至关 重要的作用。 它对外能够防御病原微生物的入侵, 对内则能清除衰老、 病变和死亡的细胞, 维持内环境的稳定。 免疫系统通过固有免疫应答和适应性免疫应答完成上。
7、述功能。 作为免 疫细胞之间的交流语言, 细胞因子对固有免疫应答和适应性免疫应答均具有重要的调控作 用。 0003 细胞因子是由机体各种细胞分泌的具有调控细胞生长分化、 调节免疫功能和生理 反应并参与病理反应的小分子蛋白质, 通过与受体结合发挥作用。 细胞因子主要包括白细 胞介素(Interleukin, IL)、 集落刺激因子(Colony-StimulatingFactor, CSF)、 干扰素 (Interferon, IFN)、 肿瘤坏死因子(Tumor-NecrosisFactor, TNF)等, 是免疫细胞之间的交 流语言, 对固有免疫应答和适应性免疫应答均具有重要调控作用。 00。
8、04 CD4+T细胞在适应性免疫应答中发挥关键作用, 它能够辅助B细胞产生抗体, 辅助 CD8+T细胞杀伤靶细胞。 根据分泌的细胞因子和功能的不同, CD4+T细胞可以分为Th1, Th2, Th17和Treg细胞, 以及新发现的Th9和Th22细胞等。 细胞因子在Th细胞的分化、 活化和功能 发挥中具有关键作用。 首先, 细胞因子能够决定初始CD4+T细胞的分化方向, 如IL-12、 IL-4 分别是决定Th1、 Th2分化所必需的细胞因子。 其次, 细胞因子对已分化的Th细胞具有调控作 用, IL-12与IL-18能够以TCR非依赖的方式协同促进Th1细胞分泌IFN-。 此外, 细胞因子还。
9、 是Th细胞发挥作用的主要方式。 Th1和Th2细胞是两类非常重要的CD4+T细胞亚群, 两者的平 衡是免疫调节的重要方面。 Th1细胞主要分泌IFN-、 TNF- 等, 通过细胞免疫应答在抗病 毒、 抗胞内病原体感染、 抗肿瘤、 迟发型超敏反应中发挥重要功能, 并参与类风湿性关节炎、 糖尿病等自身免疫病的发生、 发展; Th2细胞主要分泌IL-4、 IL-5、 IL-13等, 参与抗寄生虫感 染和过敏反应, 同时在异种移植物以及孕期胎儿的耐受方面起重要作用。 深入研究Th1、 Th2 细胞的分化、 生理和病理功能以及两者之间平衡的调控机制具有重要的理论意义和潜在的 应用价值。 0005 目前。
10、, 利用基因工程技术生产的重组细胞因子、 重组可溶性受体、 中和性抗体在治 疗肿瘤、 造血障碍、 自身免疫性疾病等方面收到良好疗效, 成为新一代药物。 重组细胞因子 作为药物具有很多优越之处, 如: 细胞因子为人体自身成分, 可调节机体的生理过程和提高 免疫功能, 很低剂量即可发挥作用, 因而疗效显著, 已成为某些疑难病症不可缺少的治疗手 段。 目前已批准生产的细胞因子药物包括IFN- 、 、 , Epo, GM-CSF, G-CSF, IL-2等。 据不完 全统计, 目前国际上至少已有26个通过基因组药物进入临床研究, 包括新的重组细胞因子、 重组可溶性受体和中和性抗体等。 同时, 细胞因子。
11、或者细胞表面受体检测也是判断机体免 说明书 1/12 页 3 CN 103073632 B 3 疫功能和免疫细胞分化的指标, 在许多疾病的诊断、 病程观察、 疗效判断及细胞因子治疗监 测等方面具有重要价值。 例如, IFN-及其重组蛋白已被用于治疗过敏性疾病、 治疗诸如类 风湿性关节炎和系统性硬皮病等自身免疫性疾病、 治疗细菌真菌感染疾病、 治疗病毒性感 染疾病、 抗寄生虫感染、 抗纤维化作用和治疗肿瘤。 发明内容 0006 因此, 本发明的目的是提供一种潜在新细胞因子LYG1及其在抗炎症、 抗感染性疾 病、 抗肿瘤和自身免疫疾病等方面的应用。 0007 针对上述目的, 本发明的技术方案如下:。
12、 0008 一方面, 本发明提供一种用于预防和/或治疗免疫相关疾病的潜在新细胞因子 LYG1(即成熟的和发挥功能的LYG1), 所述LYG1的序列为SEQIDNO: 1所示的氨基酸序列。 0009 优选地, 所述潜在新细胞因子LYG1为人类细胞因子LYG1或小鼠细胞因子LYG1。 0010 其中, 所述LYG1的前体序列为N端未切除信号肽的氨基酸序列, 所述信号肽的序列 为SEQIDNO: 2所示的氨基酸序列。 0011 另一方面, 本发明提供一种抗上述LYG1的抗体。 0012 再一方面, 本发明提供上述所述的潜在新细胞因子LYG1、 或上述所述的抗体、 或编 码上述所述的LYG1的核苷酸序。
13、列、 或含有编码上述所述的LYG1的核苷酸序列的载体、 或由 含有编码上述所述的LYG1的核苷酸序列的载体导入或转染到宿主有机体产生的重组蛋白 在制备用于预防和/或治疗免疫相关疾病的药物中的应用。 0013 优选地, 所述治疗免疫相关疾病的药物为抗肿瘤药物、 抗炎症药物、 抗感染性疾 病、 治疗过敏性疾病和/或治疗自身免疫疾病的药物。 0014 优选地, 所述肿瘤为通过促进Th1细胞分化、 促进细胞因子IFN-分泌和/或抑制 补体调节蛋白CD46、 CD55和CD59表达来抑制和/或治疗的肿瘤。 0015 更为优选地, 所述肿瘤为黑色素瘤或对免疫治疗敏感的肿瘤。 0016 优选地, 所述炎症、。
14、 感染性疾病、 过敏性疾病和自身免疫疾病为通过促进Th1细胞 分化、 促进细胞因子IFN-分泌来抑制和/或治疗的炎症、 感染性疾病、 过敏性疾病和自身 免疫疾病。 0017 更为优选地, 所述炎症为炎性肠病。 0018 又一方面, 本发明提供上述所述的潜在新细胞因子LYG1、 或上述所述的抗体、 或编 码上述所述的LYG1的核苷酸序列、 或含有编码上述所述的LYG1的核苷酸序列的载体、 或由 含有编码上述所述的LYG1的核苷酸序列的载体导入或转染到宿主有机体产生的重组蛋白 在制备用于促进Th1细胞分化、 促进细胞因子IFN-分泌和/或抑制补体调节蛋白CD46、 CD55和CD59表达的药物中的。
15、应用。 0019 再一方面, 本发明提供一种用于诊断免疫相关疾病的试剂盒, 所述试剂盒包含上 述所述的抗体和/或用于在PCR中合成编码上述所述的LYG1核苷酸序列的DNA链和/或其 cDNA链的PCR引物, 所述抗体用于LYG1蛋白的定量检测、 相关疾病中的检测和辅助诊断; 所 述引物用于LYG1基因表达的定量检测。 0020 又一方面, 本发明提供一种上述试剂盒在制备用于诊断免疫相关疾病的药物中的 应用。 说明书 2/12 页 4 CN 103073632 B 4 0021 优选地, 所述免疫相关疾病为肿瘤、 炎症、 感染性疾病、 过敏性疾病和/或自身免疫 疾病。 0022 更为优选地, 所。
16、述免疫相关疾病为肿瘤或炎症。 0023 另一方面, 本发明还一种用于预防和/或治疗免疫相关疾病的药物组合物, 所述药 物组合物包括上述所述的潜在新细胞因子LYG1、 或上述所述的抗体、 或编码上述所述的 LYG1的核苷酸序列、 或含有编码上述所述的LYG1的核苷酸序列的载体、 或由含有编码权利 要求上述所述的LYG1的核苷酸序列的载体导入或转染到宿主有机体产生的重组蛋白, 以及 一种或多种药用赋形剂或药用载体。 0024 优选地, 所述编码权利要求1所述的LYG1的核苷酸序列为SEQIDNO: 3所示的核苷 酸序列, 所述载体为pcDNA3.1/myc-His(-)B, 所述宿主有机体为大肠杆。
17、菌、 HEK293T或293- 6E细胞, 更为优选地, 所述大肠杆菌为DH5 。 0025 本研究采用免疫基因组学策略, 利用分泌验证、 表达谱分析和系统性功能研究发 现人类新基因LYG1编码一个经典的分泌蛋白。 它在脂多糖(LPS)刺激的外周血单个核细胞 (PBMC, Peripheralbloodmononuclearcell)中、 在LPS刺激的小鼠巨噬细胞中和炎性肠 病病人的炎性肠组织中表达下调, 在IL-1 刺激的A549细胞中表达上调, 在PMA和LPS联合刺 激的THP1细胞中表达显著上调, 在单核细胞分化为树突状细胞后表达明显上调。 重组LYG1 蛋白能够下调前列腺癌细胞系D。
18、U145表面补体调节蛋白CD55和CD59在mRNA水平的表达, 下 调CD46和CD59在蛋白水平的表达。 此外, 重组LYG1蛋白还能够促进小鼠Th1细胞的体外和体 内分化, 在小鼠DTH模型中起保护性作用, 促进IFN-的分泌, 并能够抑制小鼠黑色素瘤B16 细胞肿瘤模型中肿瘤的生长。 而Th1细胞主要分泌IFN-, 通过细胞免疫应答在抗病毒、 抗 胞内病原体感染、 抗肿瘤、 迟发型超敏反应中发挥重要功能, 并参与类风湿性关节炎、 糖尿 病等自身免疫病的发生、 发展。 抑制补体调节蛋白的表达可以使补体系统发挥抗肿瘤作用。 以上结果都提示, LYG1是一个潜在的新细胞因子, 在炎症、 感染。
19、性疾病、 肿瘤、 过敏性疾病、 自身免疫病方面可能发挥重要作用, 具有潜在的临床应用价值。 附图说明 0026 以下, 结合附图来详细说明本发明的实施方案, 其中: 0027 图1为BFA抑制试验, 检测LYG1的分泌途径的结果, 图中pcDB为转染了空载体 pcDNA3.1/myc-His(-)B(以下缩写为pcDB)的阴性对照组, LYG1为转染了pcDNA3.1/LYG1- myc-His(-)B(以下缩写为pcDB-LYG1-myc-his)的实验组, 其中抗肌动蛋白(抗-actin)为内 参; 0028 图2为纯化LYG1蛋白并进行SDS-PAGE鉴定及N端测序的结果, 图A为SDS。
20、-PAGE检测 LYG1蛋白纯度的试验结果, 图中1为蛋白标记, 2为还原的LYG1蛋白, 3为非还原的LYG1蛋白; 图2B为N端测序分析的试验结果, 图2B-1为空白对照测序的结果; 图2B-2为标准品的测序结 果; 图2B-312分别为第一个氨基酸残基至第10个氨基酸残基测序结果; 0029 图3为LYG1多克隆抗体的鉴定结果, 用蛋白质印迹(Westernblot)的方法检测 LYG1多克隆抗体对超表达pcDB及LYG1的293T培养上清中蛋白的识别能力, 图中, 抗LYG1 (anti-LYG1)为LYG1蛋白免疫后的兔源血清(含LYG1多克隆抗体), 正常血清(normal ser。
21、um)为免疫之前的兔源血清、 抗myc(anti-myc)为阳性对照抗体、 抗兔IgG(anti-rabbit 说明书 3/12 页 5 CN 103073632 B 5 IgG)为直接孵育二抗检测细胞裂解液, 作为空白对照, pcDB为转染了空载体pcDB的阴性对 照组, LYG1为转染了pcDB-LYG1-myc-his的实验组; 0030 图4为LYG1(小鼠为Lyg1)的表达谱分析试验结果, 图4A表示LYG1在人正常各组织 中广谱表达, 图中1为脑, 2为心脏, 3为肾脏, 4为肝脏, 5为肺, 6为胰腺, 7为胎盘, 8为骨骼肌, 9为结肠, 10为卵巢, 11为前列腺, 12为小。
22、肠, 13为睾丸; 图4B表示LYG1在免疫系统中表达较 高, 图中1为白细胞, 2为骨髓, 3为淋巴结, 4为脾脏, 5为胸腺, 6为扁桃体, 7为胎肝; 图4C表示 Lyg1在小鼠正常组织中胸腺, 胃和大脑中较高水平表达, 图中1为胸腺, 2为淋巴结, 3为小 肠, 4为结肠, 5为脑, 6为肾脏, 7为肺, 8为脾脏, 9为肝脏, 10为心脏; 图4D表示LYG1在单核细 胞分化为树突状细胞(Dendriticcells, DC)的过程中表达上调, 图中1为PBMC, 2为单核细 胞, 3为未成熟树突状细胞(imDC), 4为酵母多糖(Zymosan)刺激成熟的DC细胞(mDC- zym。
23、osan)5为LPS刺激成熟的DC细胞(mDC-LPS); 图4E表示Lyg1在小鼠静息及活化的Th1, Th17和Treg细胞中的表达; 图4F表示实时定量PCR检测LYG1在炎性肠病病人肠组织中表达 下调, 图4G表示实时定量PCR检测TNF- 表达水平, 作为阳性对照; 0031 图5为LYG1(小鼠为Lyg1)在构建的以下4种炎性因子刺激下炎症模型中的表达变 化的试验结果, 图A为LPS(10ng/mL)刺激的PBMC; B为IL-1 刺激的A549细胞; C为PMA和LPS刺 激的THP1细胞; D为LPS刺激的小鼠巨噬细胞, 从以上细胞中提取mRNA, 并制备cDNA文库, 以 c。
24、DNA文库为模板, 检测LYG1(小鼠为Lyg1)的mRNA水平的表达情况。 其中IL-6、 IL-8、 IL-1 分 别为对应的阳性对照; 0032 图6为在前列腺癌细胞系DU145中加入重组人LYG1真核蛋白后用RT-PCR和流式检 测细胞膜表面CD46、 CD55及CD59的mRNA水平和蛋白水平的表达变化情况, 图6A表示LYG1下 调CD46及CD59的mRNA表达水平, 其中IL-1 为阳性对照, 图6B表示LYG1下调CD46及CD59的蛋 白表达水平, 其中CD59表达变化情况选用IFN-作为阳性对照; 0033 图7为重组人LYG1真核蛋白在小鼠Th1细胞体外分化中的作用, 。
25、图7A为用流式的方 法检测加入不同浓度重组人LYG1真核蛋白后Th1细胞(IFN-阳性比例来反应)百分比结 果; 图7B所示为用ELISA方法检测加入不同浓度重组人LYG1真核蛋白后Th1细胞IFN-的分 泌情况。 其中IL-18为阳性对照; 0034 图8为重组人LYG1真核蛋白在小鼠DTH模型中的作用, 其中, 图8A所示为mBSA激发 后24小时小鼠足垫肿胀情况, 图8B为用ELISA的方法检测小鼠血清中IFN-的水平, 图8C和 图8D为体外加入mBSA的小鼠LN细胞培养上清中IFN-和IL-17A的分泌情况(图8B、 8C、 8D中 横坐标代表小鼠编号, 例如PBS-1代表PBS组的。
26、第一只小鼠), 图8E为用流式的方法检测体外 加入mBSA的小鼠脾细胞培养72后的细胞比例情况, 分别给出了PBS和LYG1组代表性的两只 的结果, 图中分析了Th1(IFN-阳性比例)和Th17细胞(IL-17A阳性比例)所占CD4+细胞的 比例; 0035 图9为重组人LYG1真核蛋白在小鼠黑色素瘤模型中的作用, 用游标卡尺量取肿瘤 长径(a)和短径(b), 图9A为肿瘤大体观; 图9B为肿瘤生长曲线(接种肿瘤后每组每天肿瘤体 积平均值变化曲线); 图9C为肿瘤重量(每组肿瘤重量的平均值)。 具体实施方式 0036 在本发明中所使用的术语, 除非有另外说明, 一般具有本领域普通技术人员通常。
27、 说明书 4/12 页 6 CN 103073632 B 6 理解的含义。 除非有另外注明, 为了便于区别, 在本说明书中(而非权利要求书中)用全部字 母都大写的LYG1表示人类LYG1, 仅首字母大写的Lyg1表示小鼠Lyg1, LYG1蛋白均为重组人 LYG1真核蛋白。 0037 下面结合具体的制备实施例和应用实施例, 并参照数据进一步详细地描述本发 明。 这些实施例只是为了举例说明本发明, 而非以任何方式限制本发明的范围。 0038 以下实施例中的人肺腺癌细胞系A549细胞、 人单核细胞型淋巴瘤细胞系THP1细 胞、 人前列腺癌细胞系DU145均购自ATCC; 小鼠均为C57BL/6J小。
28、鼠(购于北京大学医学部实 验动物科学部)。 0039 实施例1LYG1基因的cDNA的克隆 0040 通过生物信息学分析, 发现UniGene: Hs.164589, 其对应基因为LYG1(序列为SEQ IDNO: 3: 0041 AGCAACTGGGGATGCTATGGAAACATCCAAAGCCTGGACACCCCTGGAGCATCTTGTGGGATTGGAAGACGTCACGG CCTGAACTACTGTGGAGTTCGTGCTTCTGAAAGGCTGGCTGAAATAGACATGCCATACCTCCTGAAATATCAACCCA TGATGCAAACCATTGGCCAAAAGTACTG。
29、CATGGATCCTGCCGTGATCGCTGGTGTCTTGTCCAGGAAGTCTCCCGGT GACAAAATTCTGGTCAACATGGGCGATAGGACTAGCATGGTGCAGGACCCTGGCTCTCAAGCTCCCACATCCTGGAT TAGTGAGTCTCAGGTTTCCCAGACAACTGAAGTTCTGACTACTAGAATCAAAGAAATCCAGAGGAGGTTTCCAACCT GGACCCCTGACCAGTACCTGAGAGGTGGACTCTGTGCCTACAGTGGGGGTGCTGGCTATGTCCGAAGCAGCCAGGAC CTGAGCTGTGACTTCT。
30、GCAATGATGTCCTTGCACGAGCCAAGTACCTCAAGAGACATGGCTTCTAA 斜体部分为LYG1非编码序列, 加 有边框的部分为编码前体LYG1的信号肽的核苷酸序列, 其余为LYG1编码序列), Ref: NM_ 1748982.2, GeneID: 149999339, 为一未知功能人类新基因, 利用Human_est数据库通过 BLASTn方法进行序列校正无误, 然后根据该序列设计LYG1基因全长阅读框架的特异引物, 并在上游引物中加入NotI酶切位点gcggccgc和kozak序列cacc, 下游引物加入KpnI酶切位 点序列ggtacc和补齐碱基gc: 0042。
31、 上游引物: gcggccgccaccatgtctgcattgtggctgctgc(SEQIDNO: 4) 0043 下游引物: ggtaccgcgaagccatgtctcttgaggtacttg(SEQIDNO: 5) 0044 用上述引物, 以人正常脾组织cDNA文库(Clontech: Cat.No.636743)、 人正常胎肝 组织cDNA文库(Clontech: Cat.No.636748)以及人正常粒细胞cDNA文库的混合模板进行PCR 扩增反应, 反应条件如下: 0045 反应体积50 L, 其中含有: 说明书 5/12 页 7 CN 103073632 B 7 0046 004。
32、7 PCR反应条件: 94, 变性5分钟; 然后94变性30秒, 61-58退火30秒, 72延伸 30秒, 扩增10个循环; 94变性30秒, 58退火30秒, 72延伸30秒, 扩增20个循环; 最后在 72下延伸7分钟。 0048 扩增产物为3 有碱基A的3 突出粘端片段, 用QIAquick胶回收试剂盒(Qiagen, 28706)按产品说明书进行纯化, 然后与3 有碱基T的线性pGEM-TEASY载体(Promega, A1360)在16下连接8小时, 连接产物转化大肠杆菌DH5 , 转化物在含氨苄青霉素的LB平板 培养基上生长, 挑选克隆, 提取质粒, 使用AbIPRISM3700。
33、DNA分析仪(Perkin-Elmer/ AppliedBiosystem)测序。 0049 实施例2真核细胞表达质粒pcDB-LYG1-myc-his的构建 0050 为了检测LYG1的功能, 首先构建含有LYG1开放阅读框的真核表达质粒: pcDNA3.1/ LYG1-myc-His(-)B。 用NotI和KpnI酶切pGEM-T-LYG1, 同时用NotI和KpnI酶切真核表达 载体pcDNA3.1/myc-His(-)B(以下缩写为pcDB)(Invitrogen, V85520), 将酶切后的LYG1的 cDNA基因片段与载体在16下连接8小时, 转化大肠杆菌DH5 , 转化物在含氨。
34、苄青霉素的LB 平板培养基上生长, 挑选生长的菌落, 提取质粒, PCR鉴定, 挑选阳性克隆, 通过测序(使用 ABIPRISM3700DNA分析仪, 同上), 选出正确的插入序列的LYG1的cDNA基因质粒, 命名为 pcDB-LYG1-myc-his(带有c-myc和6XHis标签)。 0051 实施例3LYG1是一个经典途径的分泌蛋白 0052 1.细胞培养和转染 0053 HEK293T细胞(为日本的TadashiMatsuda教授馈赠), 本室传代培养, 用含10胎 牛血清(FBS)的DMEM培养基培养。 HEK293T细胞用Vigofect(威格拉斯)阳离子转染试剂, 根 据说明书。
35、进行操作, 转染质粒pcDB-LYG1-myc-his和pcDB。 转染6小时后用常温的1PBS洗 涤细胞一次, 更换新鲜的HEKG无血清培养基, 分别在细胞培养上清液中加入10 g/mLBFA (Brefeldin-A)和乙醇(用作阴性对照)。 0054 2.细胞培养上清及细胞总蛋白提取和蛋白质印迹(Westernblot)分析 0055 HEK293T细胞培养上清液的收集: 48小时后, 细胞融合率约达到90时, 收集各实 验组细胞及细胞培养上清液, 于4, 2000g离心10分钟, 弃沉淀, 再于4, 15000g离心15分 钟, 去除细胞碎片, 留取细胞培养上清液。 0056 HEK2。
36、93T细胞总蛋白的提取: 将留取上清液后的细胞置于冰上, 用冰预冷的1PBS 洗两遍, 用冰预冷的1PBS吹下细胞, 将细胞收集到1.5mL离心管中, 于4, 2000g离心5分 钟。 去除上清, 在沉淀中加入RIPA细胞裂解液(20mMTris-HCl, pH7.4, 150mMNaCl, 1mM EDTA, 1mMEGTA, 1TritonX-100, 蛋白酶抑制剂Cocktail), 冰上放置30分钟, 4, 15000g 离心15分钟, 上清液转入新管, 存于-80备用。 0057 蛋白定量: 细胞提取的蛋白按照BCATM蛋白检测试剂盒(BCATMProteinAssay 说明书 6/。
37、12 页 8 CN 103073632 B 8 Kit)(Pierce, 23227)说明书提供的方法进行蛋白定量。 0058 蛋白质印迹: 每组细胞裂解液取总蛋白30ug, 每组细胞培养上清液取40 L, 加入蛋 白上样缓冲液(北京宝赛生物技术有限公司), 于99煮10分钟。 12.5PAGE电泳, 100V电转 1.5小时, TBST液平衡, 用5牛奶室温封闭1小时, 加入相应的一抗, 4过夜, 用TBST充分洗 膜3次, 每次10分钟; 然后加入相应的IRDyeTM700/800标记的二抗(110000), 室温避光反 应1小时; 再用TBST充分洗膜3次, 每次10分钟; 最后使用双色。
38、红外荧光扫描成像系统 (OdysseyInfraredImager, 美国LI-CORBioscience公司)检测信号。 0059 如图1所示, 结果表明, 加入BFA后, LYG1分泌明显减少, 证明LYG1为通过经典途径 (内质网高尔基体途径)分泌的分泌蛋白。 0060 实施例4重组人LYG1真核蛋白的纯化及N端序列分析 0061 为了进行潜在新细胞因子LYG1的功能研究, 我们在293-6E细胞中表达与纯化了 LYG1重组蛋白。 293-6E细胞购于加拿大国家研究委员会(nationalresearchcouncilof canada)。 将293-6E细胞用含10胎牛血清的DMEM(。
39、Dulbecco smodifiedEagle s medium)培养基, 在5CO2、 37的培养箱中培养24小时。 使用PEI阳离子转染法转染pcDB- LYG1-myc-his真核表达质粒。 0062 转染16小时后用常温的1PBS洗涤细胞一次, 更换新鲜的HEKG无血清培养基, 在 5CO2, 37的培养箱中培养。 48小时后收集细胞培养上清液, 于4, 2000g离心10分钟, 去 除培养上清液的细胞, 弃沉淀, 再于4, 18000g离心20分钟, 去除上清中的小颗粒物质, 留 取处理后的细胞培养上清用于后续纯化。 0063 用Ni2+柱料纯化上述处理后的细胞培养上清液: 先将上清。
40、液经过0.45 m滤器过滤 后, 在上清液中加入咪唑(10mM)/NaCl(200mM), 再与柱料结合, 流速控制在10滴每分钟, 再 用平衡缓冲液 【咪唑(20mM)/NaCl(200mM)in1PBS(pH7.4)】 冲洗柱料, 以洗去未结合的杂 蛋白, 至分光值回至基线后, 用洗脱液 【咪唑(500mM)/NaCl(200mM)in1PBS(PH7.4)】 洗脱 结合蛋白直至分光值不再下降, 收集洗脱液于超滤管中, 用预冷的1PBS(pH7.4)12mL, 4 离心2次, 浓缩至500 L, 吸出蛋白, 于4, 18000g离心20分钟除菌, 分装保存于-80待用。 0064 取5 L。
41、蛋白用BCA方法对其进行蛋白定量, 取部分样品加入蛋白上样缓冲液, 于100 水浴煮5分钟, 进行SDS-PAGE以及蛋白质印迹检测, 鉴定LYG1蛋白纯化的纯度, 结果如图 2A所示, 蛋白的纯度较高, 大于90, 内毒素残留小于1EU/mg, 可能存在糖基化修饰, 而 ExPASy数据库分析预测LYG1含有O糖基化修饰位点, 这与之相符。 样品中未加 -巯基乙醇为 非还原的LYG1蛋白, 加入 -巯基乙醇为还原的LYG1蛋白。 SDS-PAGE电泳检测的分子量是蛋 白质的表观分子量, 并非真正的分子量大小。 在还原条件下, 链内二硫键完全打开, 蛋白 SDS-PAGE电泳时呈现长条状; 在。
42、非还原条件下, 蛋白由于链内二硫键的存在, 比还原条件下 相对而言更接近于球形。 所以, 非还原条件下, 蛋白表观分子量就更小一些。 0065 另外, 取部分样品进行SDS-PAGE, 并将蛋白转移至PVDF膜上, 染色并脱色后, 用于 蛋白质N端序列分析。 结果如图2B所示, 检测了N端10个氨基酸, 分别为S/A, N, W, G, /, Y, G, N, I, Q, 说明前体LYG1的N端19个氨基酸为信号肽序列。 其中每个图中都有一个较高的峰, 此为 系统分泌的副产物dptu, 为相对内参。 所以通过我们实验验证, LYG1成熟蛋白(即发挥功能 的蛋白, 即潜在新细胞因子LYG1)的氨。
43、基酸序列是切除了前体LYG1N端前19个氨基酸后的序 列, 以下所有的实施例用到的重组人LYG1真核蛋白都符合这个要求。 说明书 7/12 页 9 CN 103073632 B 9 0066 实施例5LYG1多克隆抗体的制备及鉴定 0067 抗体可用于检测、 诊断及治疗疾病, 于是我们制备了LYG1的抗体。 用纯化的LYG1蛋 白免疫动物。 选用成年雄性新西兰兔(购买于北京大学医学部实验动物科学部), 初次免疫 将300 g的抗原用PBS稀释至1mL后与等体积的弗氏完全佐剂充分混合, 于两足部各0.25mL 皮下注射, 其余后背部皮下多点(6点)注射。 之后每3周加强免疫一次, 用量同前, 全。
44、部后背 部皮下多点(8点)注射。 第三次加强免疫后10天取兔耳缘静脉血样检测效价, 至效价达1 105以上后, 将家兔处死心脏取血, 获取血清。 进行初步的蛋白质印迹鉴定。 如图3所示, 抗 LYG1组(anti-LYG1组)(免疫后血清, 11000稀释, 实验组), 抗myc组(anti-myc)(阳性对 照), 免疫前的对照血清(normalserum, 11000稀释), 抗兔IgG(anti-rabbitIgG)(二抗对 照), 抗LYG1的多克隆抗体(anti-LYG1)能够特异识别细胞培养上清液中的LYG1蛋白和纯化 的LYG1重组蛋白, 可用于LYG1相关疾病的检测和诊断。 蛋。
45、白有两条带, 均为特异性, 提示 LYG1蛋白可能存在修饰。 0068 实施例6LYG1在组织和细胞中的表达谱分析(RNA提取、 RT-PCR和Real-timePCR) 0069 为了分析LYG1在正常组织中、 免疫细胞不同分化阶段及不同细胞炎症模型中的表 达变化, 我们使用购买的Clontech公司的人正常组织cDNA文库, 实验室制备的小鼠正常组 织cDNA文库和人及小鼠的细胞文库, 采用巢式PCR对LYG1进行扩增。 细胞文库包括制备如 下: 收集不同分化阶段的DC细胞、 小鼠静息及活化的Th细胞、 未刺激及炎性因子LPS(100ng/ mL)刺激6h的PBMC(浓缩白细胞由北京市红十。
46、字血液中心提供, 采用淋巴细胞分层液(购自 上海华精生物科技有限公司)密度梯度离心法得到)、 未刺激及炎性因子佛波酯(PMA, Phorbol-12-myristate-13-acetate)(10ng/mL, 24小时)后用LPS(100ng/mL)刺激3h、 6h、 12h的THP1、 未刺激及炎性因子IL-1 (10ng/mL)刺激3h、 6h、 15h、 24h的A549细胞、 未刺激及 炎性因子LPS刺激2h、 4h、 6h的小鼠巨噬细胞(每只小鼠腹腔注射3硫代乙醇酸钠2ml, 48小 时后断颈处死固定, 向腹腔内注射5mlPBS, 轻柔腹腔后打开腹腔回收PBS, 2000rpm, 。
47、4离心 获取腹腔巨噬细胞), 使用TRIzol提取总RNA。 每个样品取2 g, 用反转录试剂盒 【Reverse transcriptTMkit(Invitrogen)】 逆转录合成单链cDNA文库。 扩增GAPDH作为内参。 实时定 量PCR采用SYBRGreen方法和荧光定量PCR仪(LightCycler仪器, ABI7500)进行。 0070 人LYG1的扩增: 使用外侧上游引物5 -tttcaggagccgtagagcc(SEQIDNO: 6), 外侧 下游引物5 -tgatcatggtcttgggttt(SEQIDNO: 7), 内侧上游引物5 -gcggccgccacc atg。
48、tctgcattgtggctgctgc( SEQIDNO : 8 ), 内侧下游引物5 -ggtaccgc gaagccatgtctcttgaggtacttg(SEQIDNO: 9)进行巢式扩增。 一扩条件为: 94(5分钟)94 (30秒), 56(30秒), 72(30秒), 扩增30个循环72(7分钟)。 一扩产物稀释50倍作为 二扩模板, 94(5分钟)94(30秒), 58(30秒), 72(30秒), 扩增30个循环72(7分 钟)。 0071 小鼠Lyg1的扩增: 使用外侧上游引物: 5 -agagtctccaggaggcaactatgtg(SEQID NO: 10), 外侧下游。
49、引物5 -ccatggtccttgaagtatttggct(SEQIDNO: 11); 内侧上游引物5 - aacattggcagtggacttggga(SEQIDNO: 12), 内侧下游引物5 -gcgcaaggacgtcattgcag(SEQ IDNO: 13)进行巢式扩增, 扩增GAPDH作为内参。 扩增条件为一扩: 94(5分钟)94(30 秒), 56(30秒), 72(30秒), 扩增30个循环72(7分钟)。 一扩产物稀释50倍作为二扩 模板, 94(5分钟)94(30秒), 58(30秒), 72(30秒), 扩增30个循环72(7分钟)。 说明书 8/12 页 10 CN 103073632 B 10 0072 结果表明, 如图4A所示, LYG1在多种组织中具有低水平表达, 如肾脏, 肝脏、 肺脏、 胰腺, 胎盘, 骨骼肌, 结肠、 卵巢、 前列腺、 小肠和睾丸; 如图4B所示, 在免疫系统中表达稍高, 尤其是骨髓, 胸腺和扁桃体。 此外, 我们制备了小鼠正常组织cDNA文库, 与人正常组织表达 谱一致, Lyg1在胸腺中表达稍高, 且在胃和大脑中也有较高水平表达, 在结肠, 肾脏和肺中 低水平表达(如图4C所示)。 我们还检测了在单核细胞分化为DC细胞过程中LYG。