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本发明公开了一种含HSP70启动子和GFP的四膜虫转基因载体及制备方法和应用。利用质粒rDNA-GFP,通过酶切和PCR酶切位点突变等方法,构建质粒T-GFP;利用嗜热四膜虫基因组DNA,通过PCR扩增和克隆等方法,构建质粒T-HSP702;利用质粒T-GFP、T-HSP702和pD5H8,通过酶切和连接最终构建得到质粒HSP702-GFP-pD5H8。该载体含有HSP702启动子,能实现外源基因。