材料和方法
所有试剂和溶剂均获自商品来源。通过注射转移空气和湿度敏感性液体溶液。然后通过薄层色谱法(TLC)和/或液相色谱法-质谱法(LC-MS)监测反应过程。
使用安装了PFG ATB宽带探头的Varian Mercury Plus 400MHz光谱仪记录全部核磁共振谱。
使用安装了Waters Micromass ZQ(ES离子化)和Waters PDA2996的Waters 2795分离模块、使用Waters XTerra MS C18 3.5μm 2.1x50mm柱进行10分钟方法。
使用二元Gradient Module Waters 2525泵并且结合WatersMicromass ZQ(ES)或Waters 2487 DAD、使用Supelco Discovery HSC185.0μm 10x 21.2mm柱进行制备型HLPC。
使用0.1%甲酸/水和0.1%甲酸/乙腈以梯度5/95-95/5在所示运行时间内运行梯度。
使用硅胶柱isolute flash Si进行纯化,纯度高于95%。
使用硅胶(Merck 60 F254)进行全部TLC分析并且通过在254nmUV显影和KMnO4或茚三酮染色进行全部分析。
微波:Personal Chemistry,Emrys Optimizer,微波反应器,吸收设定在正常预先搅拌时间10s。
实施例1:(2-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌嗪-1-基}-乙基)-二甲基-胺
2-氯-5-[4-(2-二甲氨基-乙基)-哌嗪-1-基]-苯甲酸乙酯
方法A-步骤a-将5-溴-2-氯苯甲酸乙酯(0.80g,3.04mmol)、rac-2,2’-双(二苯基膦基)-1,1’-联萘(BINAP)(0.19g,0.30mmol)、三(二亚苄基丙酮)二钯(Pd2(dba)3)(0.28g,0.30mmol)和碳酸铯(Cs2CO3)(1.39g,4.26mmol)放入Schlenk管并且通过反复氮气/真空循环净化30分钟。然后加入干甲苯(6mL)和1-(2-二甲氨基乙基)哌嗪(0.55mL,3.65mmol)。将该反应混合物在室温搅拌10min,在85℃加热过夜,然后冷却至室温。用EtOAc(30mL)稀释该溶液,过滤出不溶物,用饱和盐水(15mL)洗涤滤液。用Na2SO4干燥有机相,过滤,减压浓缩,得到残余物,通过快速色谱法纯化(洗脱梯度:EtOAc,EtOAc∶MeOH/1∶1,EtOAc∶MeOH∶NH3的MeOH中溶液(2M)/1∶1∶0.2),得到0.30g标题化合物(30%)。1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.28(3H,t),2.12(6H,s),2.32-2.42(4H,m),2.47-2.51(4H,m),3.11-3.14(4H,m),4.27(2H,q),7.06-7.09(1H,m),7.18-7.19(1H,m),7.30-7.32(1H,m)。
2-氯-5-[4-(2-二甲氨基-乙基)-哌嗪-1-基]-苯甲酸
方法A-步骤b-将2-氯-5-[4-(2-二甲氨基-乙基)-哌嗪-1-基]-苯甲酸乙酯(0.46g,1.36mmol)在EtOH(6mL)和NaOH 10%(2mL)中的溶液在回流状态加热过夜,然后将该反应混合物冷却至室温,通过减压蒸发浓缩有机溶剂。通过滴加1N HCl中和得到的溶液,然后减压蒸发水。将得到的残余物溶于EtOH(10mL),过滤出不溶物,在室温减压浓缩滤液,得到0.24g标题化合物(58%),不再纯化。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ2.27(6H,s),2.46-2.55(8H,m),3.04-3.06(4H,m),7.76-7.79(1H,m),6.92-6.93(1H,m),7.07-7.09(1H,m)。
N-(2-氨基-苯基)-2-氯-5-[4-(2-二甲氨基-乙基)-哌嗪-1-基]-苯甲酰胺
方法A-步骤c-向2-氯-5-[4-(2-二甲氨基-乙基)-哌嗪-1-基]-苯甲酸(0.40g,1.29mmol)在干DMF(5mL)中的溶液中加入1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(EDC)(0.25g,1.29mmol),然后加入水合1-羟基苯并三唑(1-HOBt)(0.11g,0.77mmol)和二甲基-吡啶-4-基-胺(DMAP)(0.08g,0.64mmol)。在室温搅拌3h后,加入1,2-苯二胺(0.21g,1.93mmol),将得到的混合物在室温搅拌过夜。减压蒸发溶液,然后用二氯甲烷(20mL)稀释,用饱和Na2CO3溶液(2x 5mL)洗涤。用Na2SO4干燥有机层,过滤,减压蒸发。通过快速色谱法纯化得到的固体(洗脱液:二氯甲烷∶MeOH∶NH3的MeOH溶液(2M)/9∶0.5∶0.5),得到0.18g(35%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ2.13(6H,m),2.35-2.41(4H,m),2.48-2.53(4H,m),3.14-3.18(4H,m),4.91(2H,br s),6.54-6.59(1H,m),6.73-6.75(1H,m),6.92-7.00(2H,m),7.11-7.12(1H,m),7.23-7.25(1H,m),7.28-7.33(1H,m),9.62(1H,brs)。
(2-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌嗪-1-基}-乙基)-二甲基-胺
方法A-步骤d-将N-(2-氨基-苯基)-2-氯-5-[4-(2-二甲氨基-乙基)-哌嗪-1-基]-苯甲酰胺(0.35g,0.87mmol)在乙酸(15mL)中的溶液在85℃加热7h,然后减压除去溶剂,将残余物与Et2O一起研磨,得到0.25g(75%)的标题化合物,其为固体,不再纯化。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ2.12(6H,s),2.33-2.42(4H,m),2.49-2.57(4H,m),3.16-3.19(4H,m),7.07(1H,dd),7.18-7.23(2H,m),7.33(1H,d),7.38-7.41(1H,m),7.52(1H,d),7.65-7.67(1H,m),12.60(1H,s)。m/z 384(M+H)+,保留时间=0.68。
实施例2:4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯4-(3-羧基-苯基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯
方法B-步骤b-将4-(3-乙氧基羰基-苯基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(5.00g,14.95mmol)在EtOH(50mL)和NaOH 10%(20mL)中的溶液回流3h,然后将该反应混合物冷却至室温,减压蒸发有机溶剂。通过滴加1N HCl中和得到的溶液,用EtOAc(3x50mL)萃取水溶液。用Na2SO4干燥合并的有机层,过滤,减压浓缩,得到3.90g标题化合物(85%),不再纯化。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.40(9H,s),3.15-3.18(4H,m),3.47-3.49(4H,m),7.27-7.29(1H,m),7.32-7.37(1H,m),7.42-7.44(1H,m),7.54(1H,brs)。
4-[3-(2-氨基-苯基氨基甲酰基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯
方法B-步骤c-将4-(3-羧基-苯基)-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(5.80g,18.95mmol)和1,1-羰基二咪唑(CDI)(3.07g,18.95mmol)在乙腈(120mL)中的溶液在室温搅拌3h,然后加入1,2-苯二胺(2.25g,20.85mmol)。将得到的混悬液回流3h,然后冷却至室温,减压蒸发溶剂。用二氯甲烷(200mL)稀释得到的残余物,用水(3x40mL)洗涤,用Na2SO4干燥有机层,过滤,减压蒸发。使粗产物从EtOAc中重结晶,得到2.99g(40%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.40(9H,m),3.15-3.17(4H,m),3.45-3.47(4H,m),4.85(2H,br s),6.56-6.60(1H,m),6.75-6.77(1H,m),6.93-6.97(1H,m),7.11-7.14(2H,m),7.30-7.34(1H,m),7.38-7.40(1H,m),7.51(1H,brs),9.60(1H,brs)。
4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯
方法B-步骤d-将4-[3-(2-氨基-苯基氨基甲酰基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.20g,3.03mmol)在乙酸(12mL)中的溶液在55℃加热过夜,然后减压蒸发溶剂。将得到的固体与Et2O一起研磨,得到标题化合物,为白色固体(0.90g,79%),不再纯化。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.41(9H,m),3.19-3.21(4H,m),3.48-3.50(4H,m),7.05-7.08(1H,m),7.17-7.18(2H,m),7.35-7.40(1H,m),7.51-7.73(4H,m),12.80(1H,brs)。m/z 379(M+H)+;保留时间=2.58。
实施例3:2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑二盐酸盐
2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑二盐酸盐
方法B-步骤e-向4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.80g,4.76mmol)在MeOH(2mL)中的溶液中加入2M HCl的Et2O(8mL)溶液,将得到的混合物在室温搅拌6h。
然后减压除去溶剂,将得到的盐与Et2O一起研磨,得到1.66g(100%)的标题化合物,为二盐酸盐。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ3.34-3.37(4H,m),3.54-3.57(4H,m),7.34-7.37(1H,m),7.52-7.58(4H,m),7.74-7.77(3H,m)。m/z 279(M+H)+;保留时间=0.26。
实施例4:{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-(1-甲基-哌啶-4-基)-甲酮
{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-(1-甲基-哌啶-4-基)-甲酮
方法B-步骤f-向1-甲基哌啶-4-甲酸盐酸盐(0.13g,0.72mmol)和N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)(0.16mL,0.72mmol)在乙腈(8mL)中的溶液这加入CDI(0.12g,0.72mmol),将得到的混悬液在室温搅拌5h。然后加入2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑二盐酸盐(0.20g,0.57mmol),将得到的溶液在65℃加热过夜。然后将该溶液冷却至室温,除去溶剂。将粗产物再溶于二氯甲烷(15mL),在搅拌下加入饱和NaHCO3溶液(6mL)。然后过滤得到的沉淀,用水(3mL)和乙醚(5mL)洗涤,减压干燥,得到0.20g(87%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.80-1.84(4H,m),2.19-2.26(2H,m),2.35(3H,s),2.79-2.83(1H,m),2.99-3.02(2H,m),3.28-3.33(4H,m),3.78-3.79(4H,m),7.10-7.15(1H,m),7.24-7.27(2H,m),7.40-7.44(1H,m),7.55-7.59(3H,m),7.73-7.74(1H,m)。m/z 404(M+H)+;保留时间=1.10。
实施例5:2-{3-[4-(1-甲基-哌啶-4-基甲基)-哌嗪-1-基]-苯基}-1H-苯并咪唑甲酸酯
2-{3-[4-(1-甲基-哌啶-4-基甲基)-哌嗪-1-基]-苯基}-1H-苯并咪唑
方法B-步骤g-向{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-(1-甲基-哌啶-4-基)-甲酮(0.12g,0.35mmol)在干THF(4mL)中的溶液中加入硼烷-甲基硫复合物的THF溶液((CH3)2S.BH3)(0.07mL,0.74mmol),将得到的混悬液在60℃加热过夜。然后将反应冷却至室温,减压除去溶剂,向残余物中加入1N HCl(3mL),然后在100℃加热5h。然后将反应冷却至室温,用10%NaOH中和,用二氯甲烷(3x10mL)萃取。用Na2SO4干燥合并的有机层,过滤,减压浓缩,得到残余物,通过制备型HPLC纯化,得到0.08g(69%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.55-1.61(2H,m),2.01-2.06(3H,m),2.63-2.81(5H,m),2.94-3.00(2H,m),3.09-3.11(4H,m),3.43-3.48(6H,m),7.08-7.11(1H,m),7.26-7.28(2H,m),7.38-7.42(1H,m),7.57-7.63(3H,m),7.70-7.71(1H,m),8.36(3H,s)。m/z 390(M+H)+;保留时间=0.21。
实施例6:4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯
4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯
方法C-步骤a.-将4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.83g,2.20mmol)(如方法B所述制备)和NaH 60%油溶液(0.11g,4.39mmol)在THF(10mL)中的混合物在室温搅拌1h。加入碘甲烷(0.27mL,4.39mmol),将得到的溶液搅拌过夜。向反应混合物中加入水(15mL),然后用1N HCl中和该混悬液,用EtOAc(3x40mL)萃取。干燥合并的有机层(Na2SO4),过滤,减压浓缩。将残余物与Et2O一起研磨,过滤得到的固体,得到0.76g(88%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.40(9H,m),3.18-3.20(4H,m),3.45-3.48(4H,m),3.85(3H,br s),7.14-7.15(1H,m),7.22-7.29(3H,m),7.33(1H,brs),7.39-7.42(1H,m),7.60-7.62(1H,m),7.65-7.67(1H,m)。m/z 393(M+H)+;保留时间=2.56。
实施例7:1-甲基-2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑二盐酸盐
1-甲基-2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑二盐酸盐
方法C-步骤b-向4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.30g,3.32mmol)在MeOH(4mL)中的溶液中加入2MHCl的Et2O(9mL)溶液,将得到的溶液在室温搅拌6h。
然后减压除去溶剂,将得到的盐与Et2O一起研磨,得到1.21g(100%)的标题化合物,为二盐酸盐。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ3.42-3.44(m,4H),3.60-3.63(m,4H),4.13(s,3H),7.41-7.48(m,2H),7.53-7.55(m,1H),7.65-7.73(m,3H),7.85-7.88(m,1H),7.97-7.99(m,1H)。m/z 293(M+H)+;保留时间=0.30。
实施例8:环丙基-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-甲酮
环丙基-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-甲酮
方法C-步骤c-向环丙烷甲酸(0.06g,0.68mmol)在乙腈(8mL)中的溶液中加入CDI(0.11g,0.68mmol),将得到的混悬液在室温搅拌5h。加入1-甲基-2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑二盐酸盐(0.20g,0.55mmol),将得到的溶液在65℃加热过夜。然后将反应冷却至室温,减压除去溶剂。将粗产物再溶于二氯甲烷(15mL),用饱和NaHCO3溶液(2x3mL)洗涤。用Na2SO4干燥有机层,过滤,减压浓缩。通过快速色谱法纯化残余物(洗脱液:环己烷∶EtOAc,梯度100%环己烷-100%乙酸乙酯),得到0.17g(85%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ0.82-0.84(2H,m),0.89-0.91(2H,m),1.99-2.00(1H,m),3.24-3.28(2H,m),3.29-3.35(2H,m),3.67-3.78(2H,m),3.85(3H,brs),3.89-3.95(2H,m),7.16-7.22(1H,m),7.28-7.35(3H,m),7.44(1H,t),7.51-7.53(1H,m),7.66-7.68(1H,m)。m/z 361(M+H)+;保留时间=1.75。
实施例9:2-{3-[4-环丙基甲基-哌嗪-1-基]-苯基}-1-甲基-1H-苯并咪唑甲酸酯
2-{3-[4-环丙基甲基-哌嗪-1-基]-苯基}-1-甲基-1H-苯并咪唑
方法C-步骤d-向环丙基-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-甲酮(0.17g,0.47mmol)在干THF(3.50mL)中的溶液中加入(CH3)2S.BH3的THF溶液(0.11mL,1.18mmol),将得到的混悬液在65℃加热过夜。然后将反应溶液冷却至室温,减压除去溶剂,向残余物中加入1N HCl(3mL),然后在100℃加热6h。将该反应冷却至室温,然后通过滴加15%NaOH使呈碱性,用EtOAc(3x10mL)萃取。用Na2SO4干燥合并的有机层,过滤,减压浓缩,得到残余物,通过制备型HPLC纯化,得到0.05g(32%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ0.42-0.46(2H,m),0.74-0.78(2H,m),1.14-1.17(1H,m),3.06-3.08(2H,m),3.47(4H,brs),3.57(4H,brs),3.86(3H,s),7.21-7.38(5H,m),7.47-7.55(2H,m),7.68-7.70(1H,m),8.33(2H,s)。m/z347(M+H)+;保留时间=0.65。
实施例10:3-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-吗啉-4-甲酸叔丁酯
3-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-吗啉-4-甲酸叔丁酯
方法D、E-步骤a-向吗啉-3,4-二甲酸-4-叔丁酯(0.16g,0.71mmol)在乙腈(8mL)中的溶液中加入CDI(0.16g,0.71mmol),将得到的混悬液在室温搅拌过夜。加入1-甲基-2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑二盐酸盐(0.20g,0.55mmol)(如方法C所述制备)和DIPEA(0.19mL,1.10mmol),将得到的溶液在65℃加热过夜。然后将该反应冷却至室温,除去溶剂,将粗产物溶于二氯甲烷(15mL),用饱和NaHCO3溶液洗涤(2x3mL)。用Na2SO4干燥有机层,过滤,减压浓缩。通过快速色谱法纯化残余物(洗脱液:梯度从环己烷到环己烷∶EtOAc 2∶1),得到0.11g(40%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.44(9H,brs),3.30-3.89(16H,brm),4.02-4.18(2H,m),7.20-7.26(2H,m),7.30-7.37(3H,m),7.47(1H,t),7.55-7.57(1H,m),7.67-7.68(1H,m)。m/z 506(M+H)+;保留时间=2.24。
实施例11:{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-吗啉-3-基-甲酮盐酸盐
{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-吗啉-3-基-甲酮
方法D-步骤b-将3-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-吗啉-4-甲酸叔丁酯(0.15g,0.30mmol)在2M HCl的Et2O溶液(3mL)中的溶液在室温搅拌过夜。
过滤沉淀,用乙醚洗涤,将固体溶于水(15mL),用二氯甲烷(2x3mL)洗涤。然后用Na2SO4干燥有机层,过滤,减压浓缩,得到0.09g(79%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ2.81(2H,d),3.12-3.25(7H,m),3.54-3.65(4H,m),3.72(3H,brs),3.77-3.89(2H,m),7.04-7.10(2H,m),7.16-7.24(3H,m),7.32(1H,t),7.38-7.40(1H,d),7.56-7.58(1H,d)。m/z406(M+H)+;保留时间=0.52。
实施例12:{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-(4-甲基-吗啉-3-基)-甲酮
{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-(4-甲基-吗啉-3-基)-甲酮
方法D-步骤c-向{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-吗啉-3-基-甲酮(0.08g,0.20mmol)和三乙酰氧基硼氢化钠(NaB(OAc)3H)(0.17g,0.79mmol)在二氯乙烷(2mL)中的混悬液中加入甲醛37%(0.64mL,7.90mmol)。将该反应混合物在室温搅拌过夜,用饱和Na2CO3溶液(3mL)猝灭,然后用二氯甲烷(4x2mL)萃取。用Na2SO4干燥合并的有机层,过滤,减压浓缩,得到黄色油状物(0.08g,97%)。
1H-NMR(MHz,CD3OD):δ2.24(3H,s),2.33-2.39(1H,m),2.78-2.82(1H,m),3.25-3.28(2H,m),3.30-3.32(2H,m),3.34-3.37(1H,m),3.47-3.52(1H,m),3.62-3.68(1H,m),3.76-3.85(4H,m),3.87(3H,s),3.94-3.96(2H,m),7.18-7.24(2H,m),7.28-7.36(3H,m),7.44-7.48(1H,m),7.53-7.55(1H,m),7.66-7.69(1H,m)。m/z 420(M+H)+;保留时间=1.12。
实施例13:1-甲基-2-{3-[4-(4-甲基-吗啉-3-基甲基)-哌嗪-1-基]-苯基}-1H-苯并咪唑甲酸酯
1-甲基-2-{3-[4-(4-甲基-吗啉-3-基甲基)-哌嗪-1-基]-苯基}-1H-苯并咪唑
方法D-步骤d-在室温、在氮气气氛中向{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-(4-甲基-吗啉-3-基)-甲酮(0.06g,0.16mmol)在干THF(2mL)中的溶液中加入氢化铝锂(LiAlH4)(0.02g,0.47mmol)。将反应在回流状态下加热2h,再加入其它的LiAlH4(0.01g,0.24mmol)。30min后,将该溶液冷却至室温,用10%NaOH(3mL)猝灭,然后用二氯甲烷(3x 3mL)萃取。用Na2SO4干燥合并的有机层,过滤,减压浓缩。然后通过制备型HPLC纯化粗产物,得到0.03g(41%)的标题化合物。
1H-NMR(MHz,CD3OD):δ2.49-2.54(1H,m),2.66-2.77(4H,m),2.88-2.94(1H,m),2.96(3H,s),3.09-3.16(1H,s),3.57-3.63(1H,m),3.29-3.43(6H,m),3.78-3.86(1H,m),3.88(3H,s),3.92-3.97(1H,m),4.01-4.05(1H,m),7.16-7.18(2H,m),7.31-7.39(3H,m),7.38-7.46(1H,m),7.55-7.58(1H,m),7.67-7.70(1H,m),8.28(2H,s)。m/z 406(M+H)+;保留时间=0.92。
实施例14:3-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基甲基}-吗啉-4-甲酸叔丁酯甲酸酯
3-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基甲基}-吗啉-4-甲酸叔丁酯
方法E-步骤e-在室温、在氮气气氛中向3-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-吗啉-4-甲酸叔丁酯(0.21g,0.42mmol)在干THF(3mL)中的溶液中加入氢化铝锂(LiAlH4)(0.05g,1.27mmol)。将反应在回流状态下加热2h。然后将该溶液冷却至室温,用15%NaOH猝灭,然后用二氯甲烷(3x10mL)萃取。用Na2SO4干燥合并的有机层,过滤,减压浓缩。然后通过制备型HPLC纯化粗产物,得到0.09g(43%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.48(9H,s),3.02-3.25(6H,m),3.39-3.46(6H,m),3.55-3.59(1H,m),3.76-3.90(6H,m),4.15-4.35(1H,m),7.20-7.24(2H,m),7.64-7.41(3H,m),7.45-7.49(1H,m),7.58-7.60(1H,m),7.69-7.71(1H,m)。m/z 492(M+H)+;保留时间=1.45。
实施例15:1-甲基-2-[3-(4-吗啉-3-基甲基-哌嗪-1-基)-苯基]-1H-苯并咪唑
1-甲基-2-[3-(4-吗啉-3-基甲基-哌嗪-1-基)-苯基]-1H-苯并咪唑
方法E-步骤f-向3-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基甲基}-吗啉-4-甲酸叔丁酯(0.07g,0.15mmol)在二氯甲烷(1mL)中的溶液中加入2M HCl的Et2O溶液(3mL),将得到的溶液在室温搅拌7h。
过滤出的得到的沉淀,用乙醚洗涤,然后通过制备型-HPLC纯化,用K2CO3碱化级分以避免最终的甲酰化,然后减压除去溶剂。然后用二氯甲烷(15mL)回收粗产物,用(3x4mL)水洗涤有机层,用Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩,得到0.02g(37%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ2.11-2.24(2H,m),2.48-2.58(3H,m),2.71-2.76(2H,m),2.83-2.89(1H,m),2.98-3.06(1H,m),3.19-3.24(4H,m),3.28-3.38(2H,m),3.62-3.71(2H,m),3.86(3H,s),7.08-7.12(1H,m),7.17-7.30(4H,m),7.35-7.40(1H,m),7.58-7.67(2H,m)。m/z 392(M+H)+;保留时间=0.77。
实施例16:(2-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-2-氧代-乙基)-氨基甲酸叔丁酯
(2-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-2-氧代-乙基)-氨基甲酸叔丁酯
方法F-步骤a-向N-(叔丁氧羰基)-甘氨酸(0.13g,0.74mmol)在乙腈(8mL)中的溶液中加入CDI(0.12g,0.68mmol),将得到的混悬液在室温搅拌过夜。然后加入2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑二盐酸盐(0.20g,0.57mmol)(如方法B所述制备)和DIPEA(0.20mL,1.14mmol),将得到的溶液在65℃加热过夜。然后将该反应冷却至室温,除去溶剂,用二氯甲烷(15mL)回收粗产物,用饱和NaHCO3溶液(2x3mL)洗涤。用Na2SO4干燥有机层,过滤,减压浓缩。通过快速色谱法纯化残余物(洗脱液:环己烷∶EtOAc/2∶1),得到0.14g(56%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.46(9H,s),3.29-3.36(4H,m),3.69-3.71(2H,m),3.67-3.80(2H,m),4.00(2H,s),7.13-7.16(1H,m),7.24-7.27(2H,m),7.42(1H,t),7.56-7.62(3H,m),7.73-7.74(1H,m)。m/z436(M+H)+;保留时间=2.13。
实施例17:2-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基]-乙胺
2-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基]-乙胺
方法F-步骤b-向溶液(2-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-2-氧代-乙基)-氨基甲酸叔丁酯(0.12g,0.28mmol)在干THF(3.50mL)中的溶液中加入(CH3)2S.BH3的THF溶液(0.06mL,0.69mmol),将得到的混悬液在65℃加热过夜。然后将该反应冷却至室温,减压除去溶剂,将1N HCl(3mL)加入到残余物中,然后在100℃加热6h。将该反应冷却至室温,然后通过滴加15%NaOH使呈碱性,过滤得到的白色固体,用水和乙醚洗涤,得到0.06g(73%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ2.60-2.70(6H,m),2.98-3.01(2H,m),3.30-3.34(6H,m),7.10(1H,d),7.24-7.26(2H,m),7.39(1H,t),7.52(1H,d),7.53-7.60(2H,m),7.73(1H,br s)。m/z 322(M+H)+;保留时间=0.22。
实施例7:1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-醇
8-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-1,4-二氧杂-8-氮杂-螺[4.5]癸烷
使用与方法A所用相同的方法,以1,4-二氧杂-8-氮杂螺[4.5]癸烷盐酸盐为原料。
得到1.25g标题化合物(77%,最后步骤)。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.70(4H,br s),3.31-3.34(4H,m),3.90(4H,brs),7.09-7.12(1H,m),7.19-7.21(2H,m),7.37-7.40(2H,m),7.60(2H,brs),12.62(1H,s)。
1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-酮
方法G、H-步骤a-向8-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-1,4-二氧杂-8-氮杂-螺[4.5]癸烷(2.00g,5.42mmol)在水(50mL)中的混悬液中滴加H2SO4(2.50mL),将得到的溶液在室温搅拌72h。用Na2CO3中和该溶液,将得到的油状物在水中静置固化。过滤沉淀,干燥,得到1.60g(90%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ2.43(4H,t),3.68(4H,t),7.22-7.25(1H,m),7.33-7.36(2H,m),7.46-7.50(2H,m),7.69-7.71(2H,m)。
实施例18:1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-醇
1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-醇
方法G-步骤b-向1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-酮(0.05g,0.17mmol)在甲醇(50mL)中的混悬液中加入硼氢化钠(NaBH4)(0.01g,0.17mmol),将得到的混合物在室温搅拌1h,然后用几滴水猝灭。减压除去溶剂,将粗产物溶于EtOAc(5mL),过滤,然后减压蒸发有机相,得到0.02g(36%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.43-1.45(2H,m),1.78-1.80(2H,m),2.89-2.94(2H,m),3.56-3.64(3H,m),4.68(1H,d),7.06-7.08(1H,m),7.18-7.21(2H,m),7.33-7.40(2H,m),7.52(1H,d),7.66(1H,d),12.59(1H,s)。m/z 328(M+H)+;保留时间=1.55。
实施例19:2-[5-(4-氮杂庚环-1-基-哌啶-1-基)-2-氯-苯基]-1H-苯并咪唑2-[5-(4-氮杂庚环-1-基-哌啶-1-基)-2-氯-苯基]-1H-苯并咪唑
方法H-步骤c-向1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-酮(0.10g,0.31mmol)在二氯甲烷(2mL)中的混悬液中加入氮杂庚环(0.05mL,0.46mmol)。在室温搅拌30min后,加入1滴乙酸,1h后,再加入等分部分的氮杂庚环(0.05mL,0.46mmol),然后加入三乙酰氧基硼氢化钠(NaB(OAc)3H)(0.10g,0.46mmol)。将该反应混合物在室温搅拌过夜,然后减压除去溶剂,将粗产物溶于二氯甲烷(10mL)。向该溶液中加入PS-异氰酸酯树脂(PS-NCO)(Argonaut,载量0.93mmol/g),然后将该混合物在室温振摇过夜,过滤。减压除去溶剂,得到固体残余物,用EtOAc和Et2O洗涤,然后干燥,得到所需的产物(0.07g,58%)。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.45-1.50(9H,m),1.74(2H,d),2.61-2.74(6H,m),3.31(2H,s),3.78(2H,d),7.06-7.08(1H,m),7.20-7.22(2H,m),7.33-7.38(2H,m),7.52(1H,d),7.66(1H,d),12.60(1H,s)。m/z409(M+H)+;保留时间=1.32。
实施例20:1-(4-{4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-[1,4]二氮杂庚环-1-基)-乙酮
2-(3-溴-苯基)-1H-苯并咪唑
方法I、J、K-步骤a将O-苯二胺(81.8g,756.6mmol)和草酸(3.40g,37.8mmol)完全溶于预先在80℃温热的乙醇/水1∶1(2L)中。然后向该溶液中滴加3-溴苯甲醛(44.1mL,378.3mmol)。将该反应混合物在70℃搅拌过夜,在户外开放空气下2天。过滤出固体,与(150mL)甲醇研磨,得到产物,为淡黄色固体(27.50g)。从母液中回收3.8g产物。总收率31.30g(30%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ7.24(2H,m),7.54(2H,m),7.70(m,2H),8.19(1H,m),8.37(1H,t),13.2(1H,s)。m/z 273(M+H)+;保留时间=8.60。
2-(3-溴-苯基)-1-二氟甲基-1H-苯并咪唑
方法I、J、K-步骤b-在高压釜中放入2-(3-溴-苯基)-1H-苯并咪唑(14.10g.51.6mmol)、50%NaOH水溶液(8.3mL,154.8mmol)、TEBAC(0.58g,2.5mmol)和THF(120mL)。将该混合物室温搅拌2h,然后使氯二氟甲烷发泡,直到原料完全转化(2巴,约3h)。用DCM(100mL)稀释该混合物,滗析有机相,用Na2SO4干燥。减压蒸发溶剂,得到深红色油状物,通过二氧化硅versaflash快速色谱法纯化(1g产物/30g二氧化硅)(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度从环己烷95∶AcOEt 5到环己烷7∶AcOEt 3),得到14.30g的标题化合物(86%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ7.45(2H,m),7.59(1H,t);7.75(1H,m),7.83(2H,m),7.95(1H,m),8.09(1H,s)。m/z 323(M+H)+;保留时间=8.60。
1-(4-{4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-[1,4]二氮杂庚环-1-基)-乙酮
方法J-步骤c-将2-(3-溴-苯基)-1-二氟甲基-1H-苯并咪唑(0.10g,0.31mmol)、碳酸铯(0,14g,0.43mmol)、rac-2,2’双(二苯基膦基)-1,1’-联萘(BINAP)(0.007g,0.01mmol)和三-(二亚苄基丙酮)-二钯(0)(0.004g)放入7mL密封小瓶,通过反复氮气/真空循环10分钟净化。加入干甲苯(0.6mL)和N-乙酰基高哌嗪(0.05mL,0.37mmol),将该反应混合物在85℃、在搅拌下加热24小时。
将反应冷却至室温,通过SCX柱(2g)过滤,(洗脱液:DCM/甲醇1∶1)。减压浓缩有机层,通过制备型HPLC纯化,得到58mg标题化合物(48%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.95-2.08(5H,m),3.48-3.55(2H,m),3.65-3.77(4H,m),3.80-3.84(2H,m),6.93-6.95(1H,m),7.04-7.11(2H,m),7.41-7.67(4H,m),7.73-7.82(2H,m)。m/z 385(M+H)+;保留时间=3.30。
实施例21:1-二氟甲基-2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑盐酸盐
4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基-)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯
方法K-步骤d-将2-(3-溴-苯基)-1-二氟甲基-1H-苯并咪唑(1,00g,3.10mmol)、哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0,75g,4.02mmol)和碳酸铯(5.04g,15.48mmol)放入干250mL圆底烧瓶,通过反复氮气/真空循环30分钟净化,加入干甲苯(50mL)。同时将乙酸钯(139mg,0.62mmol)和rac-2,2’双(二苯基膦基)-1,1’-联萘(BINAP)(0.58g,0.30mmol)放入干100mL圆底烧瓶,通过反复氮气/真空循环30分钟净化。
加入干甲苯(50mL),将该混悬液搅拌10分钟,然后加入第一个圆底烧瓶中。将该反应混合物在氮气气氛中回流过夜,冷却至室温。过滤该混合物,用EtOAC(3x20mL)洗涤不溶物。减压浓缩有机溶液,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度从100%环己烷到环己烷5∶AcOEt1),得到1.10g标题化合物(83%)。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.41(9H,s),3.19-3.22(4H,m),3.46-3.48(4H,m),7.08-7.10(1H,m),7.20-7.23(2H,m),7.37-7.46(3H,m),7.71-7.80(3H,m)。
m/z 429(M+H)+;保留时间=4.53。
1-二氟甲基-2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑
方法K-步骤e-向4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基-)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.10g,2.57mmol)在DCM(2mL)中的溶液中加入2M HCl的Et2O溶液(11mL),将得到的混悬液在室温搅拌过夜。过滤沉淀,将得到的盐与Et2O(3x20mL)一起研磨,得到1.02g(100%)的标题化合物,为盐酸盐。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ3.21(4H,bs),3.47-3.50(4H,m),7.11-7.20(1H,m),7.25-7.30(2H,m),7.41-7.51(3H,m),7.74-8.02(3H,m),9.35(2H,bs)。m/z 329(M+H)+;保留时间=1.77。
实施例22:1-{4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-2-甲基-丙-1-酮
1-{4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-2-甲基-丙-1-酮
方法K-步骤f-将CDI(0.05g,0.32mmol)加入到异丁酸(0.029g,0.32mmol)在乙腈(2.50mL)中的溶液中。将得到的溶液在室温搅拌5h。
加入1-二氟甲基-2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑(0.10g,0.27mmol)和N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)(0.05mL,0.27mmol),将反应在65℃加热过夜。将该反应冷却至室温,除去溶剂,加入DCM(3mL)。用水(2x2mL)和饱和Na2CO3溶液(2x2mL)洗涤有机溶液。减压浓缩有机层,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度100%环己烷-环己烷3∶AcOEt1),得到0.067g的标题化合物(61%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ1.09(6H,d),2.77(1H,七重峰),3.21-3.29(4H,m),3.64-3.75(4H,m),7.04-7.07(2H,m),7.10-7.41(5H,m),7.70-7.73(1H,m),7.77-7.81(1H,m)。m/z 399(M+H)+;保留时间=3.68。
实施例23:4-{4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯
4-{4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯
方法K-步骤g-将CDI(0.053mg,0.32mmol)加入到哌啶-1,4-二甲酸一-叔丁酯(0.074g,0.32mmol)在乙腈(2.50mL)中的溶液中。将得到的溶液在室温搅拌5小时。
加入1-二氟甲基-2-(3-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑(0.10g,0.27mmol)和N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)(0.05mL,0.27mmol),将反应在65℃加热过夜。将该反应冷却至室温,除去溶剂,加入DCM(3mL)。
用水(2x2mL)和饱和Na2CO3溶液(2x 2mL)洗涤有机溶液。减压浓缩有机层,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度100%环己烷-环己烷3∶AcOEt1),得到0.067g标题化合物(70%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ1.39(9H,s),1.60-1.74(4H,m),2.57-2.77(3H,m),3.21-3.26(4H,m),3.64-3.74(4H,m),4.10(2H,m),7.04-7.07(2H,m),7.11-7.41(5H,m),7.71-7.73(1H,m),7.78-7.82(1H,m)。m/z 540(M+H)+;保留时间=4.25。
实施例24:{4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-哌啶-4-基-甲酮
{4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-哌啶-4-基-甲酮
方法K-步骤h-向4-{4-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.075g,0.14mmol)在DCM(0.5mL)中的溶液中加入2M HCl的Et2O溶液(2.5mL),将得到的混悬液在室温搅拌6h。过滤沉淀,与Et2O(3x20mL)研磨。通过制备型HPLC纯化固体。用K2CO3中和HPLC级分并浓缩,加入浓DCM(5mL)和水(5mL),分离有机相,浓缩至得到44mg的标题化合物(72%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ1,82-2.15(4H,m),2.72-2.86(1H,m),3.09-3.34(6H,m),3.48-3.64(2H,m),3.63-3.83(4H,m),7.09-7.15(2H,m),7.29-7.30(2H,m),7.37-7.47(3H,m),7.75-7.78(1H,m),7.81-7.85(1H,m)。m/z 440(M+H)+;保留时间=2.03。
实施例25:1-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基-]哌啶-4-甲酸乙酯1-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基-]哌啶-4-甲酸乙酯
方法I-步骤i-与方法K步骤d所述方法相同,但使用原料哌啶-4-甲酸乙酯替代哌嗪-1-甲酸叔丁酯。定量收率。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.26(3H,t),1.77-1.87(2H,m),2.01-2.05(2H,m),2.50-2.57(1H,m),2.88-2.94(2H,m),3.76-3.81(2H,m),4.12-4.17(2H,q),7.09-7.11(1H,m),7.24-7.26(1H,m),7.29-7.30(1H,m),7.41-7.81(6H,m)。m/z 400(M+H)+;保留时间=4.25。
实施例26:{1-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-4-基}-(4-甲基-哌嗪-1-基)-甲酮
1-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基-]哌啶-4-甲酸
方法I-步骤l-将NaOH粉末(0.24g,6.02mmol)加入到1-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基-]哌啶-4-甲酸乙酯(1.20g,3.01mmol)在乙醇∶水3∶1中的溶液中,将该反应在80℃加热过夜。将反应冷却至室温,通过减压蒸发浓缩有机溶剂。通过滴加6N HCl中和得到的溶液。析出浅棕色沉淀,将其过滤,干燥,得到0.80g的标题化合物(72%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.83-1.93(2H,m),2.06-2.11(2H,m),2.52-2.59(1H,m),3.14-3.17(2H,m),3.71-3.76(2H,m),7.33-7.35(1H,m),7.40-7.42(2H,m),7.44-7.78(6H,m)。m/z 372(M+H)+;保留时间=3.25。
{1-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-4-基}-(4-甲基-哌嗪-1-基)-甲酮
方法I-步骤m-在室温将HATU(0.11g,0.30mmol)和二异丙基乙胺(DIPEA)(0.09mL,0.54mmol)加入到1-[3-(1-二氟甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基-]哌啶-4-甲酸(0.10g,0.27mmol)在二氯甲烷中的混悬液中。将反应在35℃加热过夜。将反应冷却至室温,用饱和Na2CO3溶液(2x4mL)和水(1x3mL)洗涤。减压浓缩有机层,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度环己烷1∶AcOEt 1-100%AcOEt,最终AcOEt∶2.0N氨的甲醇溶液5∶1),得到0.025g标题化合物(20%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.79-1.88(4H,m),2.31(3H,s),2.39-2.48(4H,m),2.80-2.92(3H,m),3.60-3.68(4H,m),3.85-3.88(2H,m),7.08-7.10(1H,m),7.20-7.25(1H,m),7.28-7.29(1H,m),7.40-7.81(6H,m)。m/z 454(M+H)+;保留时间=2.00。
实施例27:{4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-吡咯烷-1-基-甲酮
N-(2-氨基-苯基)-5-溴-2-氟-苯甲酰胺
方法L、M-步骤a-将5-溴-2-氟-苯甲酸(4.96g,22.6mmol)、苯-1,2-二胺(4.90g,45.3mmol)、1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(EDC)(5.21g,27.2mmol)、水合1-羟基苯并三唑(1-HOBt)(3.67g,27.2mmol)和二甲基-吡啶-4-基-胺(DMAP)(0.03g,0.2mmol)放入100mL圆底烧瓶。加入干DMF(60mL),将反应在室温搅拌过夜。减压除去溶剂,然后用DCM(15mL)和0.4M Na2CO3溶液(15mL)稀释粗产物。白色沉淀形成,过滤出来,再用DCM(10mL)洗涤,干燥,得到4.96g标题化合物。收集溶液,使有机相与水相分离,减压浓缩:又形成沉淀,过滤出来,用DCM(3mL)洗涤,又得到0.68g所需的化合物。总收率81%。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ4.84-5.14(2H,m),6.54-6.59(1H,m),6.73-6.76(1H,m),6.93-6.97(1H,m),7.21-7.24(1H,m),7.31-7.35(1H,m),7.72-7.76(1H,m),9.62-9.64(1H,m)。m/z 308/310(M+H)+;保留时间=1.87。
2-(5-溴-2-氟-苯基)-1H-苯并咪唑
方法L、M-步骤b-将N-(2-氨基-苯基)-5-溴-2-氟-苯甲酰胺(5.64g,18.3mmol)在乙酸(20mL)中的混悬液在60℃加热。30min后,该混悬液变成溶液,静置过夜。减压除去溶剂,将残余物与DCM(10mL)一起研磨,过滤出来。用DCM(3x10mL)洗涤沉淀,干燥,得到4.76g标题化合物(89%)。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ7.24-7.27(2H,m),7.43-7.48(1H,m),7.63-7.66(2H,m),7.72-7.76(1H,m),8.33-8.35(1H,m)。m/z 290/292(M+H)+;保留时间=1.85。
2-(5-溴-2-氟-苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑
方法L-步骤c-将NaH60%的矿物油混悬液(0.61g,25.5mmol)加入到2-(5-溴-2-氟-苯基)-1H-苯并咪唑(3.70g,12,76mmol)在干THF(100mL)中的溶液中,将该反应在室温搅拌30分钟,然后加入碘甲烷(1.19mL,19.1mmol)。将反应保持搅拌2h,然后用水(20mL)使反应停止。浓缩溶液,然后加入AcOEt(30mL)。分离有机溶液,用盐水(10mL)洗涤,用Na2SO4干燥,减压浓缩,得到3.80g所需的化合物(97%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ3.76(3H,s),7.31-7.42(3H,m),7.59-7.61(1H,m),7.70-7.72(1H,m),7.78-7.82(1H,m),7.85-7.87(1H,m)。m/z 304/306(M+H)+;保留时间=1.80。
{4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基l-哌嗪-1-基}-吡咯烷-1-基-甲酮
方法L-步骤d-按照与方法J步骤c所述相同的方法,但以2-(5-溴-2-氟-苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑和哌嗪-1-基-吡咯烷-1-基-甲酮为原料。通过制备型HPLC纯化粗反应混合物,得到0.06g的标题化合物(44%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.82-1.89(4H,m),3.20-3.23(4H,m),3.40-3.42(4H,m),3.44-3.47(4H,m),3.77-3.78(3H,m),7.20-7.22(1H,m),7.24-7.26(2H,m),7.31-7.40(2H,m),7.57-7.59(1H,m),7.69-7.71(1H,m)。m/z 408(M+H)+;保留时间=2.32。
实施例28:4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯
4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯
方法L-步骤e-将2-(5-溴-2-氟-苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑(2.10g,6.9mmol)、哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.16g,8.3mmol)、碳酸铯(3.14g,9.6mmol)、rac-2,2’双(二苯基膦基)-1,1’-联萘(BINAP)(0.17g,0.28mmol)和三-(二亚苄基丙酮)二钯(0)(0.06g,0.07mmol)放入Schlenk管,通过反复氮气/真空循环10分钟净化。加入干甲苯(13mL),将该反应在85℃搅拌24h。将反应冷却至室温,用AcOEt(20mL)稀释,用水(10mL)洗涤。用Na2SO4干燥有机层,减压浓缩。通过快速色谱法纯化粗反应混合物(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度100%环己烷-环己烷2∶AcOEt1),得到1.14g原料和0.70g标题化合物(54%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.47(9H,s),3.14-3.17(4H,m),3.57-3.59(4H,m),7.20-7.26(3H,m),7.30-7.39(2H,m),7.56-7.58(1H,m),7.68-7.71(1H,m)。m/z 411(M+H)+;保留时间=1.90。
实施例29:2-二甲氨基-1-{4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-乙酮
2-(2-氟-5-哌嗪-1-基-苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑
方法L-步骤f-向4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.86g,1.71mmol)在DCM(2.0mL)中的溶液中加入2.0M HCl的Et2O溶液(10mL),将得到的混悬液在室温搅拌过夜。过滤出沉淀,与Et2O(3x15mL)研磨,得到标题化合物(定量收率)。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ3.22-3.25(4H,m),3.44-3.47(4H,m),3.94(3H,s),7.43-7.53(3H,m),7.60-7.67(2H,m),7.87-7.89(1H,m),8.01-8.03(1H,m),9.42(2H,m)。m/z 311(M+H)+;保留时间=分裂峰。
2-二甲氨基-1-{4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-乙酮
方法L-步骤g-与方法L-步骤h相同的方法。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ2.30(6H,s),3.18-3.25(6H,m),3.74-3.78(7H,m),7.21-7.28(3H,m),7.31-7.40(2H,m),7.57-7.59(1H,m),7.69-7.71(1H,m)。m/z 396(M+H)+;保留时间=分裂峰。
实施例30:(S)-2-{4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
(S)-2-{4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
方法L-步骤h-将CDI(0.05g,0.31mmol)加入到N-Boc-L-脯氨酸(0.07g,0.31mmol)在乙腈(2.50mL)中的溶液中。将得到的溶液在室温搅拌6小时。
加入2-(2-氟-5-哌嗪-1-基-苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑(0.10g,0.26mmol)和N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)(0.09mL,0.52mmol),将反应在65℃加热过夜。将该反应冷却至室温,减压除去溶剂,加入DCM(3mL)。用水(2x2mL)和饱和Na2CO3溶液(2x2mL)洗涤有机溶液。减压浓缩有机层,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度环己烷2∶AcOEt 1-100%AcOEt),得到0.067g的标题化合物(51%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.40-1.45(9H,m),1.82-1.97(3H,m),2.23-2.36(1H,m),3.15-3.29(4H,m),3.42-3.57(2H,m),3.69-3.85(7H,m),4.72-4.77(1H,m),7.22-7.29(3H,m),7.31-7.40(2H,m),7.57-7.59(1H,m),7.69-7.71(1H,m)。m/z 508(M+H)+;保留时间=2.63。
实施例31:{4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-(S)-吡咯烷-2-基-甲酮盐酸盐
{4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-基}-(S)-吡咯烷-2-基-甲酮
方法L-步骤i-向(S)-2-{4-[4-氟-3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌嗪-1-羰基}-吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(0.05g,0.10mmol)在DCM(0.5mL)中的溶液中加入2M HCl的Et2O溶液(2.0mL),将得到的混悬液在室温搅拌过夜。减压浓缩反应,然后加入水(4.0mL),再次浓缩该混合物,得到0.04g标题化合物,为盐酸盐(86%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.85-2.04(4H,m),2.42-2.51(1H,m),3.60-3.81(4H,m),3.98-3.99(3H,m),3.23-3.36(5H,m),4.60-4.69(1H,m),7.32-7.44(3H,m),7.62-7.68(2H,m),7.77-7.80(1H,m),7.89-7.93(1H,m)。m/z 408(M+H)+;保留时间=分裂峰。
实施例32:1-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氟-苯基]-哌嗪-1-基}-2-二甲氨基-乙酮
2-(5-溴-2-氟-苯基)-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯
方法M-步骤l-在氮气气氛中、在室温下将NaH60%的矿物油分散液(0.70g,17.34mmol)加入到2-(5-溴-2-氟-苯基)-1H-苯并咪唑(3.87g,13.3mmol)在干THF(140mL)的溶液中。10分钟后,加入二碳酸二叔丁酯(0.30g,13.3mmol)在干THF(50mL)中的溶液,将反应静置30h。加入水(40mL),减压浓缩反应。加入AcOEt(30mL),分离有机层。用AcOEt(2x10mL)洗涤水溶液。收集有机层,用Na2SO4干燥,减压浓缩。通过快速色谱法纯化粗反应混合物(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度100%环己烷-环己烷10∶AcOEt 1),得到4.7g的标题化合物(90%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.44(9H,s),7.23-7.27(1H,m),7.41-7.50(2H,m),7.73-7.77(2H,m),7.84-7.86(1H,m),8.10-8.12(1H,m)。m/z 392(M+H)+;保留时间=2.88。
2-[5-(4-叔丁氧羰基-哌嗪-1-基)-2-氟-苯基]-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯
方法M-步骤m-在氮气气氛中将2-(5-溴-2-氟-苯基)-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯(2.52g,6.5mmol)、哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.56g,8.40mmol)和碳酸铯(10.50g,32.20mmol)放入干500mL圆底烧瓶,加入干甲苯(140mL)。同时在氮气气氛中将乙酸钯(0.29g,1.30mmol)和BINAP(1.20g,1.93mmol)放入干250mL圆底烧瓶,加入干甲苯(140mL)。10分钟后,将包含BINAP和乙酸钯的混悬液加入到500mL圆底烧瓶中。将该反应混合物在85℃、在氮气气氛中加热过夜,冷却至室温。过滤该混合物,用EtOAC(3x20mL)洗涤不溶物。减压浓缩有机溶液,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度100%环己烷-环己烷4∶AcOEt 1),得到2.48g标题化合物(76%)。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.36(9H,s),3.08-3.10(4H,m),3.43-3.46(4H,m),7.12-7.18(1H,m),7.20-7.25(2H,m),7.38-7.47(2H,m),7.76-7.78(1H,m),7.97-7.99(1H,m)。m/z 497(M+H)+;保留时间=2.93。
2-(2-氟-5-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑
方法M-步骤n-向2-[5-(4-叔丁氧羰基-哌嗪-1-基)-2-氟-苯基]-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯(0.45g,0.91mmol)在DCM(1.0mL)中的溶液中加入2M HCl的Et2O溶液(8.0mL),将得到的混悬液在室温搅拌过夜。再加入2M HCl的Et2O溶液(5.0mL),将反应保持搅拌24h。过滤出沉淀,与Et2O(3x15mL)研磨,得到0.21g的标题化合物(55%)。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ3.26(4H,bs),3.49-3.51(4H,m),7.36-7.40(1H,m),7.45-7.53(3H,m),7.80-7.84(2H,m),7.91-7.93(1H,m),9.28(2H,bs)。m/z 297(M+H)+;保留时间=分裂峰。
1-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氟-苯基]-哌嗪-1-基}-2-二甲氨基-乙酮
方法M-步骤o-将CDI(0.052g,0.32mmol)加入到N,N-二甲基甘氨酸(0.033g,0.32mmol)在乙腈(2.50mL)中的溶液中。将得到的溶液在室温搅拌5小时。然后加入2-(2-氟-5-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑(0.10g,0.27mmol)和N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)(0.11mL,0.6mmol),将反应在65℃加热过夜。将反应冷却至室温,减压除去溶剂。将DCM(2mL)加入到粗产物中,用水(2x 4mL)和饱和Na2CO3溶液(2x4mL)洗涤有机溶液,浓缩。通过快速色谱法纯化粗反应混合物(洗脱液:MeOH∶AcOEt,梯度100%AcOEt-MeOH 0.6∶AcOEt4),得到0.049g的标题化合物(43%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ2.33(6H,s),3.22-3.29(4H,m),3.29(2H,s),3.77-3.79(4H,m),7.16-7.24(2H,m),7.26-7.31(2H,m),7.59-7.70(2H,bp),7.75-7.77(1H,m)。m/z 382(M+H)+;保留时间=分裂峰。
实施例33:4-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氟-苯基]-哌嗪-1-基}-哌啶-4-基-甲酮
4-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氟-苯基]-哌嗪-1-羰基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯
方法M-步骤p-将CDI(0.047g,0.29mmol)加入到哌啶-1,4-二甲酸一-叔丁酯(0.07g,0.29mmol)在乙腈(2.50mL)的溶液中。将得到的溶液在室温搅拌5小时。加入2-(2-氟-5-哌嗪-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑(0.10g,0.27mmol)和DIPEA(0.05mL,0.26mmol),将反应在65℃加热过夜。将反应冷却至室温,减压除去溶剂。将DCM(2mL)加入到粗产物中,用水(2x4mL)和饱和Na2CO3溶液(2x4mL)洗涤有机溶液,浓缩。通过快速色谱法纯化粗反应混合物(洗脱液:环己烷∶AcOEt,梯度100%环己烷-100%AcOEt),得到0.08g标题化合物(60%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.45(9H,s),1.55-1.66(2H,m),1.72-1.76(2H,m),2.82-3.00(3H,m),3.21-3.31(4H,m),3.77-3.83(4H,m),4.07-4.17(2H,m),7.17-7.24(2H,m),7.26-7.31(2H,m),7.55-.7.72(2H,m),7.75-7.78(1H,m)。
4-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氟-苯基]-哌嗪-1-基}-哌啶-4-基-甲酮
方法M-步骤q-向4-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氟-苯基]-哌嗪-1-羰基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.08g,0.16mmol)在DCM(1mL)中的溶液中加入2M HCl的Et2O溶液(3.0mL),将得到的混悬液在室温搅拌3天。减压浓缩反应,加入水(8mL),减压浓缩溶液。通过制备型HPLC纯化固体。用K2CO3中和HPLC级分,浓缩。加入DCM(5mL)和水(5mL),分离有机相,浓缩至得到44mg的标题化合物(72%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.70-1.80(4H,m),2.73-2.80(2H,m),2.91-2.98(1H,m),3.13-3.17(2H,m),3.20-3.28(4H,m),7.15-7.32(2H,m),7.26-7.31(2H,m),7.62-7.65(2H,m),7.75-7.77(1H,m)。m/z 408(M+H)+;保留时间=分裂峰。
实施例34:2-乙氧基-N-{1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-4-基}-乙酰胺
2-(3-溴苯基)-1H-苯并咪唑
方法N-步骤a将O-苯二胺(81.8g,756.6mmol)和草酸(3.4g,37.8mmol)完全溶于预先在80℃温热的EtOH-H2O/1∶1(2L)中。然后将3-溴苯甲醛(44.10mL,378.30mmol)滴加到该溶液中。将该反应混合物在70℃搅拌过夜,对空气开放。过滤出固体后的当天,与MeOH(150mL)研磨,得到产物,为淡黄色固体(27.50g)。从母液中回收3.8g。总收率31.30g(30%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ7.24(2H,m),7.54(2H,m),7.70(m,2H),8.19(1H,m),8.37(1H,t),13.2(1H,s)。m/z 273(M+H)+;保留时间=8.60。
2-(3-溴-苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑
方法N-步骤b-将2-(3-溴苯基)-1H-苯并咪唑(7.8g,28.6mmol)完全溶于干THF(300ml),然后将NaH 60%m/m(1.49g,37.2mmol)逐步加入到澄清黄色溶液中。将浅棕色混悬液rt搅拌1h,然后滴加CH3I(2.5ml,40.0mmol)。将该反应混合物rt搅拌过夜。用H2O(300ml)使反应停止,用EtOAc(2x 450ml)萃取。用MgSO4干燥有机萃取物,过滤并蒸发,得到化合物,为棕-黄色固体(7.4g,70%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ3.90(3H,s),7.30(2H,m),7.55(1H,t),7.64(1H,d),7.70(1H,d),7.77(1H,m),7.88(1H,m),8.05(1H,m)。m/z=287[M+H]+,保留时间=7.70。
{1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-4-基}-氨基甲酸叔丁酯
方法N-步骤c-在Ar气气氛中将BINAP(5.85g,9.4mmol)和Pd(OAc)2(1.41g,6.3mmol)放入4-颈圆底烧瓶中。将该混合物在Ar气流中搅拌10分钟,然后加入300ml无水甲苯。同时向在Ar气气氛中干燥的另一4-颈圆底烧瓶中放入预先溶于300ml无水甲苯的2-(3-溴苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑(9.0g,31.3mmol)、4-N-BOC-氨基哌啶(8.18g,40.7mmol)和Cs2CO3(50.99g,156.5mmol)。将该混合物搅拌约10分钟,然后将第一个烧瓶的内含物加入到第二个烧瓶中。将反应在回流温度搅拌过夜。冷却至室温后,用具有硅藻土垫的gouch过滤该混悬液。减压蒸发澄清溶液,用MTBE研磨残余物,得到7.1g(55%)纯产物,为黄白色固体。
1H-NMR(DMSO):1.39(s,9H);1.49(m,2H);1.82(m,2H);2.83(m,2H);3.44(bs,1H);3.75(m,2H);3.87(s,3H);6.86(d,1H);7.11-7.67(m,8H)。m/z=407[M+H]+;保留时间=8.02。
{1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-4-基胺盐酸盐
方法N-步骤d向{1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-4-基}-氨基甲酸叔丁酯(2.00g,4.93mmol)在二氯甲烷(2mL)和甲醇(1mL)中的混合物中加入2M HCl的Et2O溶液(25mL),将得到的混合物在室温搅拌过夜。
过滤出固体,真空干燥,再溶于水(50mL),用二氯甲烷(3x10mL)洗涤。减压除去水,得到1.48g(89%)的标题化合物,为盐酸盐。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.67-1.77(2H,m),2.01-2.04(2H,m),2.95-3.00(2H,m),3.19-3.26(1H,m),3.89-3.95(2H,m),4.05(3H,s),7.36-7.44(2H,m),7.55-7.68(4H,m),7.86-7.89(1H,m),8.04-8.07(1H,m),8.41(3H,bs)。m/z=307[M+H]+;保留时间=0.17。
2-乙氧基-N-{1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-4-基}-乙酰胺
方法N-步骤e向乙氧基乙酸(0.05mL,0.49mmol)在乙腈(3mL)中的溶液中加入作为储备溶液的CDI(0.80g,0.49mmol),将得到的混悬液在室温搅拌3h。加入{1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-4-基胺盐酸盐(0.13g,0.41mmol)和DIPEA(0.07mL,0.41mmol),将得到的溶液在70℃加热过夜。然后将该反应冷却至室温,减压除去溶剂。将粗产物再溶于二氯甲烷(4mL),用饱和Na2CO3溶液(2mL)和水(2mL)洗涤。用Na2SO4干燥有机层,过滤和减压浓缩。通过快速色谱法纯化残余物(洗脱液:二氯甲烷∶MeOH,,梯度100%二氯甲烷-95%二氯甲烷∶5%MeOH),得到0.70g(44%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ1.17(3H,t),1.51-1.61(2H,m),1.96-2.00(2H,m),2.89-2.95(2H,m),3.50(2H,q),3.67-3.71(2H,m),3.81(3H,s),3.86(2H,s),3.91-4.01(1H,m),6.44-6.46(1H,m),6.99-7.01(1H,m),7.05-7.07(1H,m),7.23-7.35(5H,m),7.77-7.80(1H,m)。m/z=393[M+H]+;保留时间=1.67。
实施例35:4-氟-1’-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4’]联哌啶2-(3-溴苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑
方法O、Oa-步骤a-将2-(3-溴苯基)-1H-苯并咪唑(如方法N,步骤a所述制备)(7.8g,28.6mmol)完全溶于干THF(300mL)中,然后逐步加入NaH 60%m/m(1.49g,37.2mmol)到澄清黄色溶液中。将浅棕色混悬液在室温搅拌1h,然后滴加CH3I(2.5mL,40.0mmol)。将该反应混合物rt搅拌过夜。用H2O(300mL)使反应停止,用EtOAc(2x450mL)萃取。用MgSO4干燥有机萃取物,过滤,蒸发,得到7.4g的标题化合物,为棕黄色固体(70%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ3.90(3H,s),7.30(2H,m),7.55(1H,t),7.64(1H,d),7.70(1H,d),7.77(1H,m),7.88(1H,m),8.05(1H,m)。m/z 287(M+H)+;保留时间=7.70。
8-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-1,4-二氧杂-8-氮杂-螺[4,5]癸烷
方法O、Oa-步骤b-在安装了磁力搅拌器和在氩气气氛中干燥的4颈圆底烧瓶中放入BINAP(3.7g,5.9mmol,0.3eq)和Pd(OAc)2(0.9g,3.9mmol,0.2eq),在氩气流中静置15min。同时在安装了磁力搅拌器、回流冷凝器和在氩气气氛中干燥的4颈圆底烧瓶中将2-(3-溴苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑(5.6g,19.5mmol,1eq)溶于干甲苯(300mL),然后将1,4-二氧杂-8-氮杂螺[4.5]癸烷(3.3mL,25.4mmol,1.3eq)、Cs2CO3(31.8g,97.5mmol,5eq)和催化剂混悬液加入到该溶液中。将该反应混合物在回流温度下搅拌过夜,通过LC-MS检查转化率。使该混悬液冷却至r.t.,然后用具有硅藻土垫的gooch过滤。蒸发溶剂,得到16.0g红棕色油状物,通过二氧化硅versaflash自动快速色谱法、通过从Cy∶MTBE=85∶15到Cy∶MTBE=15∶85洗脱纯化(1产物g/30二氧化硅g),得到2.3g纯产物,为黄色油状物(34%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ1.70-1.73(4H,m),3.34-3.37(4H,m),3.84(3H,s),3.90(4H,m),7.11-7.39(6H,m),7.57-7.58/1H,m),7.64-7.65(1H,m)。m/z 350(M+H)+;保留时间=6.73。
1-[3-(1-甲基-1H-苯并[d]咪唑-2-基)苯基]哌啶-4-酮
方法O、Oa-步骤c-将8-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-1,4-二氧杂-8-氮杂-螺[4,5]癸烷(2.30g,6.60mmol)溶于120mL THF。在0℃用NaCl-冰浴冷却该溶液,然后加入HCl 6M(18mL,108mmol)。通过HPLC/MS监测反应进程,将该体系rt搅拌至完全转化。减压浓缩溶液,然后用NaOH 2M(80mL)中和,最后用EtOAc(3x150mL)萃取。共同收集有机萃取物,用MgSO4干燥,过滤,蒸发,得到2g澄清产物,为淡黄色固体(92%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ2.46(4H,t),3.70(4H,t),3.88(3H,s),7.20-76(8H,m)。m/z 306(M+H)+;保留时间=5.90。
2-(5-溴-2-氯苯基)-1H-苯并咪唑
方法O、Oa-步骤d
在安装了磁力搅拌器的单颈圆底烧瓶中放入5-溴-2-氯苯甲酸(70.0g,297.3mmol)、o-苯二胺(64.3g,594.6mmol)和甲磺酸(140mL),加热至170℃,以熔化固体。在该温度下将该系统搅拌5h,然后静置达到rt。用NaOH 35%(200mL)处理蓝色固体,得到紫色混悬液(pH 5),过滤,用NaOH 0.5M(2L)和H2O(2L)洗涤。真空(60℃)干燥产物,得到61.6g纯紫色固体(67%)。
m/z 307/309(M+H)+;保留时间=8.73。
2-(5-溴-2-氯苯基)-1H-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯
方法O、Oa-步骤e-在安装了磁力搅拌器的3颈圆底烧瓶中将2-(5-溴-2-氯苯基)-1H-苯并咪唑(30.7g,99.8mmol)混悬于THF(1L)中。然后加入50%NaOH(72.0g,598mmol)。将该混悬液在搅拌下保持在r.t.1h。将(BOC)2O(37.0g,169.7mmol)溶于THF(200mL),加入到反应混合物中。将该反应保持在搅拌下过夜。减压蒸发溶剂。用水(500mL)稀释得到的残余物,过滤,真空(60℃)干燥,得到39.8g的棕色固体(98%)。
m/z 407/409(M+H)+;保留时间=10.14。
2-[2-氯-5-(1,4-二氧杂-8-氮杂-螺[4.5]癸-8-基)-苯基]-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯
方法O、Oa-步骤f-在安装了磁力搅拌器和在氩气气氛中干燥的4颈圆底烧瓶中放入BINAP(13.8g,22.1mmol)和Pd(OAc)2(3.3g,14.7mmol),在氩气流中静置15min。同时在安装了磁力搅拌器、回流冷凝器和在氩气气氛中干燥的4颈圆底烧瓶中将2-(5-溴-2-氯苯基)-1H-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯(30.0g,73.6mmol)溶于干甲苯(1L),然后加入1,4-二氧杂-8-氮杂螺[4.5]癸烷(12.3mL,95.7mmol)、Cs2CO3(119.9g,368.0mmol)和催化剂混悬液加入到该溶液中。将该反应混合物在80℃搅拌30h,通过LC-MS检查转化率。使该混悬液冷却至r.t.,然后用具有硅藻土垫的gooch过滤。蒸发溶剂,得到64.5g棕色油状物,不经任何额外的纯化用于下一步。
m/z 471/473(M+H)+;保留时间=9.70。
1-[3-(1H-苯并[d]咪唑-2-基)-4-氯苯基]哌啶-4-酮
方法O、Oa-步骤g-在安装了磁力搅拌器的4颈圆底烧瓶中将2-[2-氯-5-(1,4-二氧杂-8-氮杂-螺[4,5]癸-8-基)-苯基]-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯(59.5g,93,9mmol,1eq)溶于THF(250mL),然后加入HCl 4M(1.2L,4695mmol)。将该系统在搅拌下在rt保持过夜。过滤棕色混悬液,用冷水(500mL)洗涤固体,该固体是来自上述步骤的催化剂。减压浓缩母液,以沉淀其它的固体,过滤出来。用冰-NaCl浴将酸水相(1.7L)冷却至0℃,用NaOH 4M(1.8L)使呈碱性。过滤固体,用水(600mL)洗涤,真空(60℃)干燥,得到纯的22.8g产物,为浅灰色固体(75%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ2.45(4H,t),3.70(4H,t),7.17-7.64(7H,m),12.85(1H,bs)。m/z 426/428(M+H)+;保留时间=6.97。
4-氟-1’-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4’]联哌啶
方法O-步骤h-将三乙酰氧基硼氢化钠(0.10g,0.49mmol)加入到1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-4-酮(0.1g,0.33mmol)和4-氟哌啶盐酸盐(0.07g,0.49mmol)在二氯乙烷(2.50mL)中的混合物中。将反应保持在室温18h。用DCM(4mL)稀释反应,用Na2CO3饱和溶液(4mL)洗涤。浓缩有机层,通过SCX柱(2g)过滤(洗脱液:首先10mL DCM∶MeOH 1∶1,然后10mL 2.0N氨的MeOH溶液)。浓缩氨溶液,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:AcOEt∶2.0N氨的MeOH溶液,梯度100%AcOEt-AcOEt 10∶2.0N氨的MeOH溶液1),得到0.06g的标题化合物(48%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.67-1.73(2H,m),1.86-2.06(6H,m),2.61-2.71(3H,m),2.77-2.89(4H,m),3.89-3.93(5H,m),4.61-4.77(1H,m),7.17-7.19(2H,m),7.28-7.37,(3H,m),7.41-7.45(1H,m),7.54-7.56(1H,m),7.66-7.68(1H,m)。m/z 393(M+H)+;保留时间=分裂峰。
实施例36:1’[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4’]联哌啶
1’[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4’]联哌啶
方法Oa-步骤i-将1-[3-(1-甲基-1H-苯并[d]咪唑-2-基)苯基]哌啶-4-酮(0.06g,0.2mmol)和哌啶(0.034g,0.4mmol)与三乙胺(27μL,0.2mmol)和分子筛(0.5g)在甲醇(5ml)中加热至40℃16小时。加入氰基硼氢化钠(0.025g,0.4mmol)和氯化锌(0.027g,0.2mmol),将该反应再加热16小时,蒸发该反应混合物,使残余物分配在1N氢氧化钠(2ml)与二氯甲烷(4ml)之间。分离有机层,蒸发,通过制备型HPLC纯化。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.56(1H,bs),1.84-1.98(7H,m),2.20-2.23(2H,m),2.89-2.94(2H,m),3.04(2H,bs),3.36-3.43(1H,m),3.56(2H,bs),3.94(3H,s),4.02-4.05(2H,m),7.23-7.26(2H,m),7.37-7.45(3H,m),7.47-7.51(1H,m),7.64-7.66(1H,m),7.71-7-73(1H,m)。
m/z 375(M+H)+;保留时间=分裂峰。
实施例37:2-[3-(3-氟-4-吗啉-4-基-哌啶-1-基)-苯基]-1-甲基-1H-苯并咪唑
4-三甲基甲硅烷氧基-3.6-二氢-2H-吡啶-1-甲酸叔丁酯
方法P-步骤a-将氯三甲基硅烷(1.52mL,12.05mmol)和干三乙胺(3.42mL,24.6mmol)加入搅拌的4-氧代哌啶-1-甲酸叔丁酯(2.0g,10.04mmol)在干DMF(20mL)中的溶液中。将该反应在80℃加热16h,然后冷却至室温,用正己烷(120mL)稀释。用冷NaHCO3饱和溶液(60mL)洗涤有机溶液,用Na2SO4干燥,减压浓缩,得到2.56g的标题化合物(94%)。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ0.00(9H,s),1.23(9H,s),1.83-1.87(2H,m),3.24-3.27(2H,m),3.60-3.61(2H,m),4.63(1H,bs)。m/z 272(M+H)+;保留时间=2.78。
3-氟-4-氧代-哌啶-1-甲酸叔丁酯
方法P-步骤b-在室温、在氮气气氛中将Selectfluor(5.52g,15.59mmol)加入到搅拌的4-三甲基甲硅烷氧基-3,6-二氢-2H-吡啶-1-甲酸叔丁酯(3.84g,14.17mmol)在干乙腈(150mL)中的溶液中。75分钟后,用AcOEt(500mL)稀释反应,用NaCl(300mL)稀溶液、然后用(300mL)洗涤。用Na2SO4干燥有机层,减压浓缩。通过快速色谱法、通过中性氧化铝纯化粗反应混合物(洗脱液:环己烷∶AcOEt∶MeOH,梯度环己烷∶AcOEt 1∶1-环己烷∶AcOEt 1∶2-100%AcOEt,最终AcOEt∶MeOH95∶5),得到2.12g的标题化合物。
3-氟-4-吗啉-4-基-哌啶-1-甲酸叔丁酯
方法P-步骤c-在氮气气氛中将吗啉(0.71mL,8.11mmol)加入到搅拌的3-氟-4-氧代-哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.60g,7.37mmol)在二氯乙烷(2mL)中的溶液中。10分钟后,逐步加入三乙酰氧基硼氢化钠(2.35g,11.13mmol),将该反应静置3h。向该反应中加入Na2CO3饱和溶液(20mL)。分离有机相,用DCM(3x10mL)萃取水溶液。收集有机层,用Na2SO4干燥,减压浓缩。通过快速色谱法纯化粗反应混合物(洗脱液:环己烷∶AcOEt∶2.0N氨的MeOH溶液,梯度环己烷∶AcOEt 2∶1-100%AcOEt,最终AcOEt∶2.0N氨的MeOH溶液10∶1),得到1.28g的标题化合物。(57%)。
1H-NMR(400MHz CD3OD):δ1.45(9H,s),1.74-1.80(2H,m),2.38-2.51(1H,m),2.65-2.68(4H,m),2.71-3.04(2H,m),3.65-3.72(4H,m),4.18-4.21(1H,m),4.37-4.38(1H,m),4.91-5.03(1H,m)。m/z 289(M+H)+;保留时间=分裂峰。
4-(3-氟-哌啶-4-基)-吗啉
方法P-步骤d-将2.0N HCl的Et2O溶液(15mL)加入到3-氟-4-吗啉-4-基-哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.28g,4.44mmol)在DCM(2mL)中的溶液中,将得到的混悬液在室温搅拌4天。过滤出沉淀,与Et2O(2x5mL)研磨。加入Na2CO3饱和溶液(10mL),减压浓缩得到的溶液。加入EtOH(15mL),过滤出沉淀。
减压浓缩滤液,得到0.71g的标题化合物。(85%)。
1H-NMR(400MHz CD3OD):δ1.84-1.94(2H,m),2.47-2.60(1H,m),2.66-2.68(4H,m),2.78-2.86(1H,m),2.88-3.02(1H,m),3.23-3.28(1H,m),3.36-3.44(1H,m),3.68-3.71(4H,m),5.01-5.14(1H,m)。m/z 189(M+H)+;保留时间=0.17。
2-[3-(3-氟-4-吗啉-4-基-哌啶-1-基)-苯基]-1-甲基-1H-苯并咪唑
方法P-步骤e-在氮气气氛中将4-(3-氟-哌啶-4-基)-吗啉(0.085g,0.45mmol)、2-(3-溴-苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑(方法N,步骤a、b中所述)(0.10g,0.35mmol)和碳酸铯(10.50g,32.2mmol)放入干燥密封的7mL小瓶中,加入干甲苯(0.4mL)。同时在氮气气氛中将乙酸钯(0.016g,0.07mmol)和BINAP(0.065g,0.10mmol)放入另一个干燥密封的7mL小瓶,用干甲苯(0.8mL)稀释。约20分钟后,将得到的混悬液加入到包含原料的小瓶中。
将该反应混合物在85℃加热24h,然后冷却至室温,通过SCX过滤(洗脱液:首先10mL DCM∶MeOH 1∶1,然后10mL 2.0N氨的MeOH溶液)。减压浓缩氨溶液,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:MeOH∶AcOEt,梯度100%AcOEt-MeOH∶AcOEt 1∶4),得到0.08g的标题化合物。(58%)。
1H-NMR(400MHz CD3OD):δ1.91-1.95(1H,m),2.01-2.11(1H,m),2.41-2.54(1H,m),2.67-2.75(4H,m),2.84-3.04(2H,m),3.68-3.76(4H,m),3.88(3H,s),3.92-3.98(1H,m),4.09-4.16(1H,m),5.06-5.19(1H,m)。m/z 395(M+H)+;保留时间=0.27。
实施例38:{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-(1-甲基-哌啶-3-基-甲酮
4-(4-氯-3-乙氧基羰基-苯基)-[1,4]二氮杂庚环-1-甲酸叔丁酯
方法Q-步骤a-将[1,4]二氮杂庚环-1-甲酸叔丁酯(11.5g,0.057mmol)、5,溴-2-氯苯甲酸乙酯(12.5g,0.047mmol)、Pd(OAc)2(0.21g,1mmol)、rac-2,2’双(二苯基膦基)-1,1’-联萘(BINAP)(0.88g,1.4mmol)和碳酸铯(21.5g,66mmol)混悬于甲苯(200mL)中。将反应回流16h,然后冷却至20℃。将该反应混合物倾入水(200mL),用AcOEt(3x150mL)萃取。用盐水洗涤合并的萃取物,用MgSO4干燥,减压浓缩,得到棕色油状物,通过快速色谱法纯化(洗脱液:正己烷∶AcOEt,梯度正己烷∶AcOEt 4∶1-正己烷∶AcOEt 1∶1),得到17.2g的标题化合物。(96%)。
1H-NMR(400MHz CDCl3):δ1.37-1.48(12H,m),1.96-2.02(2H,m),3.22-3.35(2H,m),3.50-3.64(6H,m),4.39(2H,q),6.76-6.78(1H,m),7.10-7.11(1H,m),7.23-7.26(1H,m)。m/z 383(M+H)+;保留时间=7.70。
2-(2-氯-5-[1,4]二氮杂庚环-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑
方法Q-步骤b-向冷却至0℃的在氮气气氛中的三甲基铝(2.0M的甲苯溶液)(90mL,180mmol)在甲苯(300mL)中的溶液中逐步加入苯-1,2-二胺(6.5g,60mmol)。将该溶液在0℃搅拌30分钟,然后在15-20℃搅拌至甲烷停止放出。向得到的溶液中一次加入4-(4-氯-3-乙氧基羰基-苯基)-[1,4]二氮杂庚环-1-甲酸叔丁酯(15.2g,40mmol)。将该反应加热至回流24h,然后冷却至0℃。谨慎加入水(70mL),然后加入MeOH(700mL)。过滤固体沉淀,减压浓缩滤液。用热DCM∶MeOH 1∶1(400mL)、然后用AcOEt(200mL)洗涤沉淀。减压浓缩溶液。合并两次萃取物,通过快速色谱法纯化(洗脱液:AcOEt∶MeOH∶NH3,梯度100%AcOEt-AcOEt∶MeOH∶NH373∶25∶2),得到9.3g的2-(2-氯-5-[1,4]二氮杂庚环-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑和N-(2-氨基-苯基)-2-氯二氮杂庚环-1-基-苯甲酰胺的混合物。
m/z 345(M+H)+;保留时间=3.07;m/z 327(M+H)+;保留时间=4.1。
2-(2-氯-5-[1,4]二氮杂庚环-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑
方法Q-步骤c-将2-(2-氯-5-[1,4]二氮杂庚环-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑和N-(2-氨基-苯基)-2-氯二氮杂庚环-1-基-苯甲酰胺(10.1g)的3∶1混合物溶于乙酸(120mL),在55℃加热16h。将反应冷却至20℃,减压浓缩。将得到的棕色油状物与Et2O一起研磨,干燥。将乙酸盐溶于10%MeOH/DCM(100mL)和NaHCO3 0.1M水溶液(200mL)。沉淀形成,搅拌2h,然后过滤,在60℃干燥,得到7.92g标题化合物。(两步内61%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ2.11-2.17(2H,m),3.07-3.08(2H,m),3.26(2H,bs),3.60-3.63(2H,m),3.82-3.84(2H,m),7.12-7.15,(1H,m),7.40-7.41(1H,m),7.54-7.56(1H,m),7.60-7.64(2H,m),7.88-7.92(2H,m),9.40(2H,bs)。m/z 327(M+H)+;保留时间=4.1。
3-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-羰基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯
方法Q-步骤d-将2-(2-氯-5-[1,4]二氮杂庚环-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑(0.25g,0.76mmol)、HOBt(0.12g,0.86mmol)、NMM(0.5mL,3.9mmol)、哌啶-1,3-二甲酸1-叔丁酯(0.17g,0.76mmol)和EDC(0.22g,1.16mmol)溶于DCM(8.0mL),在20℃搅拌16h。加入水(6.0mL)。分离有机层,减压浓缩,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:100%AcOEt),得到0.25g标题化合物。(100%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ1.28-1.51(11H,m),1.56-1.89(3H,m),2.01(1H,m,),2.60-2.71(3H,m),3.41-3.76(7H,m),3.91-4.03(3H,m),6.90-6.95(1H,m),7.20-7.30(3H,m),7.34-7.37(1H,m),7.63(2H,bs)。m/z 536(M+H)+;保留时间=1.85。
{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-哌啶-3-基-甲酮
方法Q-步骤e-将3-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-羰基}-哌啶-1-甲酸叔丁酯(0.21g,0.39mmol)溶于异丙醇(4mL),加入乙酰氯(0.17mL,2.4mmol)。将反应在40℃加热16h,然后冷却至室温,减压浓缩,在60℃干燥,得到0.19g标题化合物,为二盐酸盐(94%)。
1H-NMR(400MHz CD3OD):δ1.56-2.07(6H,m),3.04-3.25(5H,m),3.42-3.54(1H,m),3.59-3.87(6H,m),3.91-4.08(1H,m),7.14-7.20(1H,m),7.25-7.31(1H,m),7.50-7.56(1H,m),7.66-7.71(2H,m),7.87-7.92(2H,m)。
m/z 438(M+H)+;保留时间=分裂峰。
{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-(1-甲基-哌啶-3-基-甲酮
方法Q-步骤f-将{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-哌啶-3-基-甲酮(0.18g,0.34mmol)混悬于DCM(8mL)中。加入三乙胺(0.5mL 3.5mmol),得到溶液,然后加入AcOH(0.5mL)和甲醛37%水溶液)(0.1mL)。加入三乙酰氧基硼氢化钠(0.14g,0.63mmol),将该反应在室温搅拌24h,然后在40℃搅拌4天。将反应混合物浓缩至4mL,然后再加入甲醛(0.1mL)、三乙胺(0.5mL,3.5mmol)、AcOH(0.5mL)和三乙酰氧基硼氢化钠(0.14g,0.63mmol),将该反应在100℃、在微波中加热20分钟。用NaOH 2.0N溶液(4mL)使反应停止,搅拌15分钟。分离有机层,减压下浓缩。通过快速色谱法纯化残余物(洗脱液:正己烷∶AcOEt∶MeOH∶NH3,梯度正己烷∶AcOEt 1∶1-AcOEt∶MeOH∶NH380∶18∶2),得到0.07g标题化合物,通过制备型HPLC进一步纯化,得到0.02g标题化合物。(13%)。
1H-NMR(400MHz CD3OD):δ1.37-1.94(4H,m),1.98-2.10(2H,m),2.56-2.62(3H,m),2.68-2.80(2H,m),2.98-3.06(2H,m),3.44-4.04(9H,m),6.90-6.98(1H,m),7.14-7.21(1H,m),7.28-7.40(3H,m),7.63-7.67(2H,m)。m/z 452(M+H)+;保留时间=分裂峰。
实施例39:4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-甲酸苯基酰胺
4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-甲酸苯基酰胺
方法R-向2-(2-氯-5-[1,4]二氮杂庚环-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑(方法Q,步骤a、b、c)(0.10g,0.30mmol)在二氯甲烷(4mL)中的溶液中加入异氰酸苯酯(0.03mL,0.30mmol),将得到的混悬液在室温搅拌16h。过滤沉淀,然后通过快速色谱法纯化(洗脱液:EtOAc∶己烷,1∶4),得到0.06g(45%)的标题化合物。
1H-NMR (400MHz,DMSO):δ1.89-1.95(2H,m),3.39-3.42(2H,m),3.56-3.59(2H,m),3.64(4H,bs),6.88-6.93(2H,m),7.16-7.24(5H,m),7.33-7.35(1H,m),7.38-7.41(2H,m),7.52-7.54(1H,m),7.67-7.69(1H,m),12.56(1H,s)。m/z=446[M+H]+;保留时间=5.87。
实施例40:4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-甲酸(2-二甲氨基-乙基)-酰胺
4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-甲酸(2-二甲氨基-乙基)-酰胺
方法S-向N,N-二甲基-乙-1,2-二胺(0.85g,0.96mmol)和三乙胺(0.50mL,3.84mmol)在二噁烷中的溶液中滴加异丙基氯甲酸酯(0.10mL,0.96mmol),在室温搅拌1h后,加入2-(2-氯-5-[1,4]二氮杂庚环-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑(方法Q,步骤a、b、c)(0.21g,0.64mmol)。将得到的混合物在150℃在微波下加热1h。然后减压除去溶剂,使粗产物分配在二氯甲烷(8mL)与水(2mL)之间,分离有机层,上硅胶柱进行纯化(洗脱液:EtOAc∶MeOH∶NH3,,梯度80∶18∶2-70∶28∶2),得到279mg的标题化合物,具有定量收率。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.97-2.00(2H,m),2.85(6H,s),2.92-2.95(1H,m),3.12-3.15(1H,m),3.41-3.46(4H,m),3.65-3.74(6H,m),6.97-7.00(1H,m),7.21-7.22(1H,m),7.38-7.41(3H,m),7.69-7.72(2H,m)。
m/z=441[M+H]+;保留时间=4.12。
实施例41:1-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-2-二甲氨基-乙酮
1-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-2-二甲氨基-乙酮
方法T-步骤a-将二甲基甘氨酸(0.78g,0.76mmol)、N,N-二异丙基乙胺(0.20mL,1.14mmol)和o-苯并三唑-N,N,N’,N’-四甲基-脲-六氟-磷酸盐(HBTU)(0.32g,0.84mmol)在二氯甲烷(20mL)中的溶液在室温搅拌15min,然后加入2-(2-氯-5-[1,4]二氮杂庚环-1-基-苯基)-1H-苯并咪唑(方法Q,步骤a、b、c)(0.25g,0.76mmol)。在室温16h搅拌后,除去溶剂,通过快速色谱法纯化粗产物(洗脱液:梯度EtOAc∶己烷/50∶50-EtOAc∶己烷∶NH3/80∶18∶2),得到0.16g的标题化合物(50%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.93-2.04(2H,m),2.15(3H,s),2.21(3H,s),3.07-3.21(2H,m),3.45-3.51(1H,m),3.54-3.57(1H,m),3.63-3.70(3H,m),3.76-3.84(3H,m),6.90-6.95(1H,m),7.20-7.31(3H,m),7.33-7.37(1H,m),7.64(2H,bs)。m/z=412[M+H]+;保留时间=4.24。
实施例42:(2-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-乙基)-二甲基-胺
(2-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-乙基)-二甲基-胺
方法T-步骤b-向1-{4-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-2-二甲氨基-乙酮(0.13g,0.31mmol)在四氢呋喃(4mL)中的溶液中加入1M LiAlH4(0.31mL,0.31mmol),将得到的混合物在室温搅拌72h,然后用水(20mL)和2N NaOH(20mL)猝灭。然后使该反应混合物通过短塞(Na2SO4),减压除去溶剂,通过制备型HPLC纯化粗产物,得到0.03g(25%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.98-2.04(2H,m),2.29(6H,s),2.53-2.56(2H,m),2.66-2.70(4H,m),2.85-2.88(2H,m),3.55-3.58(2H,m),3.61-3.63(2H,m),6.86-6.89(1H,m),7.16-7.17(1H,m),7.26-7.30(2H,m),7.32-7.35(1H,m),7.63(2H,bs)。
m/z=398[M+H]+;保留时间=4.53。
实施例43:N,N-二甲基-2-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-乙酰胺
4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基-[1,4]二氮杂庚环-1-甲酸叔丁酯
方法U、V、W、Ab-步骤a在Ar气氛中将BINAP(5.85g,9.4mmol)和Pd(OAc)2(1.41g,6.3mmol)放入4颈圆底烧瓶。将该混合物在Ar气流中搅拌10分钟,然后加入300ml无水甲苯。同时在Ar气氛中干燥的另一4-颈圆底烧瓶中放入预先溶于300ml无水甲苯的2-(3-溴苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑(方法O、Oa步骤a所述)(9.0g,31.3mmol)、1-BOC-高哌嗪(8.0ml,40.7mmol)和Cs2CO3(50.99g,156.5mmol)。将该混合物搅拌约10分钟,然后将第一个烧瓶的内含物加入到第二个烧瓶中。将该反应在回流温度搅拌过夜。冷却至室温后,用具有硅藻土垫的gouch过滤该混悬液。减压蒸发澄清溶液,通过二氧化硅versaflsh自动快速色谱法(1产物g/30二氧化硅g)纯化残余物(25.0g),从Cy∶EtOAc=9∶1到Cy∶EtOAc=1∶9洗脱,得到纯的产物,为棕色泡沫(5.2g,41%)。
1H-NMR(d6DMSO):1.26(d,9H);1.84(m,2H);3.25(m,2H);3.61(m,4H);3.86(s,3H);6.91(dd,1H)7.00(t,1H);7.10(s,1H);7.27(m,3H);7.59(d,1H);7.67(d,1H)。m/z=407[M+H]+;保留时间=8.20min。
2-(3-[1,4]二氮杂庚环-1-基苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑二盐酸盐
方法U、V、W、Ab-步骤b向4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基-[1,4]二氮杂庚环-1-甲酸叔丁酯(2.20g,5.61mmol)在甲醇(3mL)中的混合物中加入2M HCl的Et2O溶液(10mL),将得到的混合物在室温搅拌6h。然后减压除去溶剂,将得到的盐与Et2O研磨,减压过滤,真空干燥,得到1.60g(93%)的标题化合物,为盐酸盐。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ2.13-2.19(2H,m),3.07-3.08(2H,m),3.24(2H,bs),3.61-3.64(2H,m),3.84-3.87(2H,m),4.06(3H,s),7.14-7.22(2H,m),7.33(1H,bs),7.49-7.53(1H,m),7.62-7.68(2H,m),7.86-7.90(1H,m),8.04-8.08(1H,m),9.54(2H,bs)。m/z=307[M+H]+;保留时间=分裂峰。
N,N-二甲基-2-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-乙酰胺
方法U-步骤c-将2-(3-[1,4]二氮杂庚环-1-基苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑(0.30g,0.79mmol)、2-氯-N,N-二甲基-乙酰胺(0.14g,1.18mmol)和三乙胺(0.44mL,3.20mmol)在二噁烷(8mL)中的混合物在80℃加热16h。然后将该反应冷却至室温,过滤出沉淀,减压蒸发有机相。通过快速色谱法纯化残余物(洗脱液:EtOAc 100%-EtOAc∶MeOH∶NH389∶10∶1),得到0.11g(34%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ1.93-2.04(2H,m),2.15(3H,s),2.21(3H,s),3.07-3.21(2H,m),3.45-3.51(1H,m),3.54-3.57(1H,m),3.63-3.70(3H,m),3.76-3.84(3H,m),6.90-6.95(1H,m),7.20-7.31(3H,m),7.33-7.37(1H,m),7.64(2H,bs)。m/z=392[M+H]+;保留时间=4.87min。
实施例44:2-[3-(4-甲磺酰基-[1,4]二氮杂庚环-1-基)-苯基]-1-甲基-1H-苯并咪唑
2-[3-(4-甲磺酰基-[1,4]二氮杂庚环-1-基)-苯基]-1-甲基-1H-苯并咪唑
方法V-步骤d-向2-(3-[1,4]二氮杂庚环-1-基苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑(0.18g,0.46mmol)和三乙胺(0.32mL,2.30mmol)在二氯甲烷(4mL)中的溶液中加入甲磺酰氯(0.04mL,0.55mmol)。在室温16h搅拌后,加入水(1mL),用Na2SO4干燥有机层,过滤,减压蒸发。通过快速色谱法纯化得到的粗产物(洗脱液:EtOAc),得到0.10g(54%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.87-1.91(2H,m),2.81(3H,s),3.19-3.22(2H,m),3.42-3.45(2H,m),3.63-3.66(2H,m),3.69-3.71(2H,m),3.84(3H,s),6.91-6.94(1H,m),7.00-7.02(1H,m),7.09-7.10(1H,m),7.20-7.29(2H,m),7.32-7.36(1H,m),7.57-7.59(1H,m),7.65-7.66(1H,m)。m/z=385[M+H]+;保留时间=5.49min。
实施例45:{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-(4-甲基-哌嗪-1-基)-甲酮
{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-(4-甲基-哌嗪-1-基)-甲酮
方法W-步骤e-向三光气(0.41g,0.13mmol)在二氯甲烷(2mL)中的溶液中加入在二氯甲烷(2mL)中的2-(3-[1,4]二氮杂庚环-1-基苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑二盐酸盐(0.14g,0.37mmol)和DIPEA(0.11mL,0.66mmol)。在室温15分钟搅拌后,加入N-甲基-哌嗪(0.04mL,0.44mmol)和DIPEA(0.04mL,0.22mmol)在二氯甲烷(1.5mL)中的溶液。将得到的混悬液在室温搅拌10min。将该混合物倾倒在饱和NaHCO3溶液(25mL)和二氯甲烷(25mL)的混合物中,用Na2SO4干燥有机层,过滤,减压浓缩,得到残余物,通过制备型HPLC纯化,得到20mg(13%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):δ2.02-2.13(2H,m),2.89(3H,s),3.02-3.58(10H,m),3.67-3.72(4H,m),3.84-3.86(2H,m),4.10(3H,s),7.08-7.20(3H,m),7.51-7.55(1H,m),7.63-7.69(2H,m),7.82-7.93(2H,m)。
m/z=433[M+H]+;保留时间=4.75min。
实施例46:1-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-2-哌啶-1-基-乙酮
1-{4-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-[1,4]二氮杂庚环-1-基}-2-哌啶-1-基-乙酮
方法Ab-步骤f-将哌啶-1-基-乙酸(0.12g,0.86mmol)和1,1-羰基二咪唑(0.14g,0.86mmol)在乙腈(3mL)中的溶液在室温搅拌4h,然后加入2-(3-[1,4]二氮杂庚环-1-基苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑二盐酸盐(0.26g,0.86mmol)和三乙胺(0.24mL,1.71mmol)在乙腈(2mL)中的溶液。将得到的混悬液在70℃加热过夜,然后冷却至室温,减压除去溶剂。用二氯甲烷(10mL)稀释得到的残余物,用水(2x3mL)洗涤,用Na2SO4干燥有机层,过滤,减压蒸发。通过快速色谱法纯化残余物(洗脱液:二氯甲烷∶MeOH,梯度100%二氯甲烷-95%二氯甲烷∶5%MeOH),得到0.12g(32%)的标题化合物。
1H-NMR(400MHz,DMSO):δ1.21-1.46(7H,m),1.83-1.97(2H,m),2.21-2.31(4H,m),2.95-3.02(2H,m),3.27-3.30(2H,m),3.48-3.70(5H,m),3.84-3.85(3H,m),6.88-7.01(2H,m),7.06-7.11(1H,m),7.20-7.35(3H,m),7.57-7.61(1H,m),7.63-7.66(1H,m)。m/z=432[M+H]+;保留时间=4.64min。
实施例47:{1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-3-基}-(4-甲基-哌嗪-1-基)-甲酮
1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-3-甲酸乙酯
方法X-步骤a-将3-哌啶甲酸乙酯(0.55g,3.48mmol)、2-(3-溴苯基)-1-甲基-1H-苯并咪唑(方法O、Oa步骤a所述)(0.50g,1.74mmol)、Pd(OAc)2(0.008g,0.035mmol)、rac-2,2’双(二苯基膦基)-1,1’-联萘(BINAP)(0.78g,0.052mmol)和碳酸铯(0.78g,2.08mmol)混悬于甲苯(20mL)中,用N2脱气。将反应在150℃、在微波中加热30分钟。将反应倾入水(200mL)中,用AcOEt(100mL)萃取。收集有机层,减压浓缩。通过快速色谱法纯化粗反应混合物(洗脱液:正己烷∶AcOEt,梯度100%正己烷-正己烷∶AcOEt 7∶3),得到0.4g标题化合物。(63%)。
1H-NMR(400MHz CDCl3):δ1.28(3H,s),1.66-1.77(2H,m),1.81-1.89(1H,m),2.04-2.07(1H,m),2.66-2.73(1H,m),2.89-2.96(1H,m),3.10-3.16(1H,m),3.58-3.62(1H,m),3.80-3.84(1H,m),3.88(3H,s),4.15-4.21(2H,m),7.09-7.12(2H,m),7.31-7.42(5H,m),7.83-7.86(1H,m)。
1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-3-甲酸
方法X-步骤b-将1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-3-甲酸乙酯(2.0g,5.51mmol)溶于MeOH∶水5∶2(35mL)中。加入NaOH(0.44g,11mmol),将反应在40℃加热3h。减压浓缩反应混合物,溶于水(30mL),用AcOEt(30mL)洗涤。用浓HCl将水层酸化至pH 5.5。过滤出白色固体,与水(20mL)和正己烷(20mL)研磨,得到1.60g的标题化合物。(87%)。
1H-NMR(400MHz CD3OD):δ1.68-1.77(2H,m),1.83-1.88(1H,m),2.01-2.06(1H,m),2.64-2.71(1H,m),2.92-2.99(1H,m),3.12-3.17(1H,m),3.57-3.60(1H,m),3.77-3.81(1H,m),3.90(3H,s),7.18-7.21(2H,m),7.29-7.38(3H,m),7.42-7.46(1H,m),7.56-7.58(1H,m),7.67-7.69(1H,m)。m/z 336(M+H)+;保留时间=3.65。
{1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-3-基}-(4-甲基-哌嗪-1-基)-甲酮
方法X-步骤c-将1-[3-(1-甲基-1H-苯并咪唑-2-基)-苯基]-哌啶-3-甲酸(0.10g,0.30mmol)加入到搅拌的二异丙基乙胺(DIPEA)(89μL,0.36mmol)、HBTU(0.12g,0.33mmol)和N-甲基-哌嗪(0.04g,0.36mmol)在二氯甲烷(4mL)中的溶液中。将该反应在35℃搅拌过夜,减压浓缩。通过快速色谱法、通过NH2柱纯化粗反应混合物(洗脱液:正己烷∶AcOEt,梯度100%正己烷100%AcOEt),得到0.055g的标题化合物。(44%)。
1H-NMR(400MHz CD3OD):δ1.59-1.69(1H,m),1.74-1.86(2H,m),1.93-1.96(1H,m),2.35(3H,s),2.40-2.61(4H,m),2.79-2.86(1H,m),2.94-3.06(2H,m),3.60-3.66(4H,m),3.80-3.85(2H,m),3.89(s,3H),7.16-7.19(2H,m),7.28-7.36(3H,m),7.42-7.46(1H,m),7.54-7.57(1H,m),7.66-7.68(1H,m)。m/z 418(M+H)+;保留时间=4.75。
实施例48:{1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-基}-(4-甲基-哌嗪-1-基)-甲酮
2-[2-氯-5-(4-乙氧基羰基-哌啶-1-基)-苯基]-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯
方法Y、Z-步骤a-将异3-哌啶甲酸乙酯(1.54g,9.8mmol)、2-(5-溴-2-氯苯基)-1H-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯(方法O、OA、步骤d、e所述)(2.0g,4.9mmol)、Pd(OAc)2(0.22g,0.98mmol)、rac-2,2’双(二苯基膦基)-1,1’-联萘(BINAP)(0.90g,1.47mmol)和碳酸铯(8.0g,24.5mmol)混悬于甲苯(40mL)中,用N2脱气。将反应回流至原料完全耗尽。过滤出反应混合物,用水(200mL)洗涤。用AcOEt(100mL)萃取有机层,减压浓缩。通过快速色谱法纯化粗反应混合物(洗脱液:正己烷∶AcOEt,梯度100%正己烷-正己烷∶AcOEt 1∶1),得到1.6g标题化合物。(67%)。
1H-NMR(400MHz CDCl3):δ1.28(3H,t),1.40(9H,s),1.83-1.94(2H,m),2.01-2.09(2H,m),2.42-2.49(1H,m),2.82-2.88(2H,m),3.63-3.68(2H,m),4.16(2H,q),7.00(1H,bs),7.11(1H,bs),7.29-7.33(1H,m),7.37-7.45(2H,m),7.80-7.82(1H,m),8.11-8.13(1H,m)。m/z 484(M+H)+;保留时间=8.69。
1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-甲酸乙酯
方法Y、Z-步骤b-将2-[2-氯-5-(4-乙氧基羰基-哌啶-1-基)-苯基]-苯并咪唑-1-甲酸叔丁酯(1.98g,4.1mmol)溶于异丙醇(50mL)。滴加乙酰氯(2.1g,28.7mmol),将该反应混合物在40℃加热至无原料保留。减压浓缩反应,得到2.0g的标题化合物。(100%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ1.18(3H,t),1.60-1.70(2H,m),1.89-1.93(2H,m),2.53-2.63(1H,m),2.92-2.98(2H,m),3.79-3.82(2H,m),4.07(2H,q),7.29-7.32(1H,m),7.53-7.64(4H,m),7.86-7.91(2H,m)。m/z 384(M+H)+;保留时间=6.59。
1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-甲酸
方法Y、Z-步骤c-将1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-甲酸乙酯(2.0g,5.2mmol)溶于MeOH∶水3∶2(50mL),加入NaOH(0.41g,10.3mmol)。将该反应在40℃搅拌至原料完全耗尽。减压浓缩反应混合物,溶于水(30mL),用AcOEt(30mL)洗涤。用浓HCl中和水层,过滤出白色固体,用水(20mL)和Et2O(20mL)洗涤,得到1.2g的标题化合物。(82%)。
1H-NMR(400MHz DMSO):δ1.59-1.69(2H,m),1.88-1.92(2H,m),2.36-2.43(1H,m),2.81-2.87(2H,m),3.69-3.72(2H,m),7.07-7.10(1H,m),7.19-7.23(2H,m),7.37-7.40(2H,m),7.61(2H,bs)。m/z 356(M+H)+;保留时间=3.66。
{1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-基}-(4-甲基-哌嗪-1-基)-甲酮
方法Y-步骤d-如方法X-步骤c,以1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-甲酸(0.1g,0.28mmol)和1-甲基-哌嗪(37μL,0.34mmol)为原料合成。得到30mg(24%)。
1H-NMR(400MHz CD3OD):δ1.78-1.90(4H,m),2.32(3H,s),2.41-2.50(4H,m),2.82-2.89(3H,m),3.61-3.66(4H,m),3.82-3.85(2H,m),7.09-7.12(1H,m),7.26-7.30(2H,m),7.39-7.41(2H,m),7.62-7.64(2H,m)。
m/z 438(M+H)+;保留时间=4.74。
实施例49:{1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-基}-哌嗪-1-基-甲酮盐酸盐
4-{1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-羰基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯
方法Z-步骤e-如方法X-步骤c所述,以1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-甲酸(0.1g,0.28mmol)和哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.06g,0.34mmol)为原料合成。(72%)
1H-NMR(400MHz CD3OD):δ1.47(9H,s),1.90-1.91(4H,m),2.84-2.90(3H,m),3.41-3.63(8H,m),3.83-3.88(2H,m),7.10-7.13(1H,m),7.26-7.31(2H,m),7.39-7.41(2H,m),7.63(2H,bs)。m/z 524(M+H)+;保留时间=6.32。
{1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-基}-哌嗪-1-基-甲酮
方法Z-步骤f-将4-{1-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯-苯基]-哌啶-4-羰基}-哌嗪-1-甲酸叔丁酯(0.05g,0.11mmol)混悬于异丙醇(4mL)中。滴加乙酰氯(55μL,0.77mmol),将该反应混合物加热至40℃,直到无原料保留。减压浓缩反应,得到0.05g标题化合物。(100%)。
m/z 424(M+H)+;保留时间=4.10。
表1显示了根据表第3栏所示和上述详细讨论在实施例1-49合成中的方法制备的合成化合物的选择。
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生物活性
Smo的克隆和表达稳定重组Smo的细胞系的生成
通过PCR、使用标准条件扩增人Smo编码序列。模板是来自Origene(目录号TC122724)的pcMV6-XL5-Smo。如下命名引物:
正向(5’GATCGGTACCGGGCTTTTGCTGAGTT 3’)具有KpnI限制位点;
反向(5’GATCGCGGCCGCCTACTTATCGTCGTCATCCTTGTAATCGAAGTCCGAGTCTGC 3’)具有NotI限制位点,终止密码子和5’端上的FLAG-编码序列。
得到的扩增子是2424bp长度并且包含完全Smo-编码序列、FLAG-标记和两个限制位点,一端一个。用KpnI和NotI限制酶和为克隆选择的pcDNA5/FRT质粒(Invitrogen)双重消化该扩增子。Smo-FLAG编码序列连接和克隆入pcDNA5/FRT 质粒产生命名为pcDNA5/FRT Smo-FLAG和7432bp长度的质粒。
FlpIN技术(Invitrogen)用于使用FlpIN293细胞系(Invitrogen,RT50-07)生成稳定表达Smo-FLAG的细胞系。这是一种通过用pFRT/lacZeo质粒稳定转染生成博莱霉素-抗性FlpIN293宿主细胞系而来源于HEK293细胞的品系。FlpIN293细胞适合于生成包含整合的Flp重组靶(FRT)位点的稳定哺乳动物细胞系(Invitrogen)。
同时进行pcDNA5/FRT Smo-FLAG质粒转染(或就模拟转染的细胞而言,用空质粒转染)与携带Flp重组酶的pOG44质粒转染,所述Flp重组酶催化宿主细胞中FRT位点分别与pcDNA5/FRT Smo-FLAG表达载体或pcDNA5/FRT空载体之间的同源组成重组。表达Smo-FLAG的细胞和模拟转染细胞具有潮霉素B抗性并且对β-gal染色呈阴性。还通过蛋白质印迹检查了Smo和FLAG抗原表达。生成的两种细胞系命名为显示模拟转染的293FlpIN/克隆E-3和显示Smo-FLAG转染细胞系的293FlpIN/克隆3-5。
细胞培养条件
将细胞维持在包含10%胎牛血清(均来自Invitrogen)、添加剂了0.25mg/ml潮霉素B(Invitrogen)的DMEM中。将细胞维持在37℃、95%空气-5%二氧化碳完全加湿的环境中,融化后至多22-25个循环使用。
结合测定研发
通过替代结合测定、使用Smo受体配体(Bodipy-Cyclopamine,Toronto Research Chemical Inc,cat#B674800)作为替代的标记配体测试化合物与Smo受体的相互作用。
为了测定荧光配体的Kd(其中达到50%最大结合的配体浓度)和Bmax(抗原特异性结合生物制品中的受体的配体最大量),通过从总体结合(TB)中扣除非特异性结合(NSB)计算特异性结合(SB)。通过添加增加浓度的Bodipy-环杷明到细胞中测定TB,同时通过添加增加浓度的Bodipy-环杷明与饱和浓度的充分描述的拮抗剂(就此而言是N-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯苯基]-3,5-二甲氧基-苯甲酰胺(Rubin等人WO2003011219)在选择的10μM下)的混合物到细胞中测定NSB。就Bodipy-环杷明的各浓度而言,通过从TB中扣除NSB值计算SB。从SB曲线计算Bmax和Kd。在该情况中,发现稳定模拟转染的细胞系克隆E-3具有115nM的Kd,同时发现稳定Smo-FLAG转染的细胞系克隆3-5具有44.3nM的Kd。Ki是抑制50%标记配体特异性结合(SB)的未标记配体的浓度,并且对标记配体的有效使用浓度校准。根据Cheng-Prusoff方程计算Ki,Ki=IC50/[1+[bodipy-环杷明]/Kd)]。
测试化合物的结合测定
使用Burker室计数293FlpIN/克隆E-3和293FlpIN/克隆3-5细胞,并且在两个96孔培养板(U bottom,Sigma Aldrich,cat#M8185-100EA)中转染100000个细胞/100μl DMEM 1%FBS。293FlpIN/克隆E-3细胞用作及时检查超表达Smo的293FlpIN/克隆3-5细胞的荧光(FLU)变化内标对照。
用DMEM 1%FBS制备对照品和化合物并且将100μl加入到细胞中。将全部对照品和化合物与终浓度的5nM Bodipy-环杷明一起孵育。
将化合物溶于DMSO(储备溶液10mM),并且首次在10μM测试(单一浓度测定);将每种化合物至少重复两次(在两个不同培养板上)。当Bodipy-环杷明被高于30%阈值替代时,使用浓度-响应测定与8种化合物通过量/培养板再测试化合物,且浓度范围是:100、10、1、0.5、0.1、0.01、0.05、0.001和0.0001μM。
作为阴性对照,使用293FlpIN/克隆3-5细胞,其中对单一浓度测定而言加入DMSO按1∶1000稀释,就浓度响应测定而言按1∶100稀释。
作为替代Bodipy-环杷明结合的阳性对照,使用10μM浓度的N-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯苯基]-3,5-二甲氧基-苯甲酰胺(Rubin等人WO2003011219)。
将两个培养板在室温、避光的振摇平台上孵育4小时。孵育后,以1600rpm离心培养板5min,用包含2%FBS的PBS洗涤两次。最终将细胞重新混悬于170μl洗涤缓冲液中并且用FACScalibur HTS系统(Beeton Dickinson)获取荧光信号。
将仪器获取参数设定在每个使用未处理的未标记的293FlpIN/克隆E-3细胞的培养板的读数开始状态。使用的HTS获取程序是BDTM PlateManager(BD Bioscience)且使用BD CellQuestTM Pro软件(BDBioscience)进行数据分析。
通过重叠阳性和阴性对照的FL1-H直方图和在两曲线之间交叉处设定标记进行定量。仅定量荧光多于设定标记的情况。然后根据阴性对照(0%Bodipy-环杷明替代)和阳性对照(100%Bodipy-环杷明替代)对各值进行归一化。
来自实施例1-449的化合物在上述条件下测试时均展示出83pM-31μM范围的Ki值。
使用碱性磷酸酶测定的测试化合物
已经在体外小鼠间充质细胞系C3H10T1/2中证实了Shh诱导碱性磷酸酶(AP),即成骨细胞分化标记(Katsuura等人,1999;Kinto等人,1997;Murone等人,1999;Nakamura等人,1997,Wu等人2004。因此,为了分析小分子与Hedgehog-Gli信号传到之间的干扰,应用基于小鼠细胞系中AP活化的功能测定。
试剂盒的底物(Cat S1000,Promega)用于检测溶液中的AP。简言之,使用下列方法。
给聚赖氨酸-包被的澄清平底96-孔培养板(Corning,Cat.3667)充满100μl细胞培养液中10.000个细胞/孔。细胞培养基由DMEM(Cat21969-035)与1%Glutamax(Cat 35050-038)、1%青霉素/链霉素(Cat15140-122)和1%Hepes(15630-056)组成。全部试剂均获自Invitrogen。将培养板在37℃与5%二氧化碳中孵育过夜。然后除去培养基,将包含化合物或参比拮抗剂(N-[3-(1H-苯并咪唑-2-基)-4-氯苯基]-3,5-二甲氧基-苯甲酰胺(Rubin等人WO2003011219))的100μl新鲜培养基加入到各孔中。全部化合物和参比溶液均包含2μM浓度的激动剂purmorphamine(Sinha等人Nature Chem.Biol.2,29-30(2005))。一式三份在100pM-50μM范围的10个浓度下测试化合物。将每一样品的DMSO终浓度调整至在培养基中1%。将细胞与化合物溶液在37℃、在5%二氧化碳的存在下孵育72小时。从培养板中除去细胞培养基,向各孔中加入40μl 1∶5稀释的裂解溶液(Cat E194A,Promega)。然后在黑暗中振荡器上孵育培养板20分钟。最终将40μl再溶解的AttoPhos底物溶液加入到各孔中,然后在振荡器上再孵育15分钟期限。根据供应商的说明书再溶解AttoPhos底物,但将底物溶液始终贮存在-80℃。Safire2培养板读出器(Tecan)用于测定样品中的荧光强度改变,其中使用激发波长430nm和发射波长560nm。
来自实施例1-449的化合物在上述条件下测试时均展示出26pM-42μM范围的IC50值。