用于鉴定小麦面粉色泽相关基因的PCR体系.pdf

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摘要
申请专利号:

CN201310509511.1

申请日:

2013.10.24

公开号:

CN103525937A

公开日:

2014.01.22

当前法律状态:

终止

有效性:

无权

法律详情:

未缴年费专利权终止IPC(主分类):C12Q 1/68申请日:20131024授权公告日:20150422终止日期:20161024|||授权|||实质审查的生效IPC(主分类):C12Q 1/68申请日:20131024|||公开

IPC分类号:

C12Q1/68; C12N15/11

主分类号:

C12Q1/68

申请人:

新疆农垦科学院

发明人:

穆培源; 张晓科; 相吉山; 徐红军; 张钰玉; 桑伟; 韩新年; 聂迎彬; 崔凤娟; 邹波

地址:

832000 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市石河子乌伊公路221号

优先权:

专利代理机构:

北京纪凯知识产权代理有限公司 11245

代理人:

关畅

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内容摘要

本发明公开了一种用于鉴定或辅助鉴定面粉色泽相关基因的PCR体系及其应用。本发明所提供的PCR体系中的引物对组为如下任一:1)引物对组A、引物对组B和引物对组C;2)引物对组A和引物对组C;3)引物对组C;引物对组A由引物对1(序列1和序列2)、引物对2(序列3和序列4)和引物对3(序列5和序列6)组成;引物对组B由引物对4(序列7和序列8)和引物对5(序列9和序列10)组成;引物对组C由引物对6(序列11和序列12)、引物对7(序列13和序列14)和引物对8(序列15和序列16)组成。这些引物对组各引物间不存在抑制和错配,实现同一温度一次PCR完成一组基因的鉴别,且结果可靠、特异性强。本发明为小麦色泽品质育种提供参考。

权利要求书

权利要求书
1.  用于鉴定或辅助鉴定待测小麦面粉色泽相关基因的多重PCR引物对组,所述面粉色泽相关基因为Psy-B1基因、TaZds-A1基因、TaZds-D1基因、Ppo-A1基因、Psy-A1基因、TaLox-B1基因和Ppo-D1基因,其特征在于:所述多重PCR引物对组由引物对组A、引物对组B和引物对组C组成;所述引物对组A由特异于所述Psy-B1基因的两个引物对,和特异于所述TaZds-A1基因的一个引物对组成;所述引物对组B由特异于所述TaZds-D1基因的一个引物对,和特异于所述Ppo-A1基因的一个引物对组成;所述引物对组C由特异于所述Psy-A1基因的一个引物对、特异于所述TaLox-B1基因的一个引物对,和特异于所述Ppo-D1基因的一个引物对组成;
所述引物对组A中,所述特异于所述Psy-B1基因的两个引物对分别为序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA组成的引物对1,以及序列3和序列4所示的两条单链DNA组成的引物对2;所述特异于所述TaZds-A1基因的一个引物对为序列表中序列5和序列6所示的两条单链DNA组成的引物对3;
所述引物对组B中,所述特异于所述TaZds-D1基因的一个引物对为序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA组成的引物对4;所述特异于所述Ppo-A1基因的一个引物对为序列表中序列9和序列10所示的两条单链DNA组成的引物对5;
所述引物对组C中,所述特异于所述Psy-A1基因的一个引物对为序列表中序列11和序列12所示的两条单链DNA组成的引物对6;所述特异于所述TaLox-B1基因的一个引物对为序列表中序列13和序列14所示的两条单链DNA组成的引物对7;所述特异于所述Ppo-D1基因的一个引物对为序列表中序列15和序列16所示的两条单链DNA组成的引物对8。

2.  用于鉴定或辅助鉴定待测小麦面粉色泽相关基因的多重PCR引物对组,为下述1)或2):
1)由权利要求1中的所述引物对组A和所述引物对组C组成的引物对组;
2)为权利要求1中的所述引物对组C。

3.  根据权利要求1或2所述的引物对组,其特征在于:所述引物对组A中每个引物对的两条引物在PCR反应体系中等量使用,且所述引物对1,所述引物对2和所述引物对3在PCR反应体系中的摩尔比为6:6:5;所述特异引物对组B中每个引物对的两条引物在PCR反应体系中等量使用,且所述引物对4和所述引物对5在PCR反应体系中的摩尔比为12:6;所述引物对组C中每个引物对的两条引物在PCR反应体系中等量使用,且所述引物对6、所述引物对7和所述引物对8在PCR反应体系中的摩尔比为5:10:10。

4.  含有权利要求1-3中任一所述引物对组的试剂盒。

5.  权利要求1-3中任一所述引物对组的制备方法,其特征在于:所述制备方法包括将权利要求1-3中任一所述引物对组中各引物对的所述两条单链DNA分别单独包装的步骤。

6.  权利要求4所述试剂盒的制备方法,包括如下步骤:将权利要求1-3中任一所述的引物对组中各引物对的所述两条单链DNA分别单独包装后,与下述物质中的至少一种包装在同一试剂盒内:PCR反应缓冲液、DNA聚合酶和4种dNTP。

7.  下述a1)或a2)或a3)的方法:
a1)鉴定或辅助鉴定待测小麦含有Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c这三种基因中哪一种,含有TaZds-A1a和TaZds-A1b这两种基因中哪一种,含有TaZds-D1a和TaZds-D1b这两种基因中哪一种,含有Ppo-A1a基因和Ppo-A1b基因这两种基因中哪一种;含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是含有Psy-A1b基因,含有TaLox-B1a和TaLox-B1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-D1a和Ppo-D1b这两种基因中哪一种;
a2)鉴定或辅助鉴定待测小麦含有Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c这三种基因中哪一种,以及含有TaZds-A1a和TaZds-A1b这两种基因中哪一种;含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是含有Psy-A1b基因,含有TaLox-B1a和TaLox-B1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-D1a和Ppo-D1b这两种基因中哪一种;
a3)鉴定或辅助鉴定待测小麦含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是含有Psy-A1b基因,含有TaLox-B1a和TaLox-B1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-D1a和Ppo-D1b这两种基因中哪一种;
其特征在于:所述a1)的方法包括下述(1)和(2)的步骤:
所述(1)为如下b1)和b2):
b1)以待测小麦的基因组DNA为模板,用权利要求1-3中任一所述引物对组中的所述引物对组A进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为59℃;
b2)以待测小麦的基因组DNA为模板,用权利要求1或3所述引物对组中所述引物对组B进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为62℃;
b3)以待测小麦的基因组DNA为模板,用权利要求1-3中任一所述引物对组中所述引物对组C进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为64℃;
(2)检测步骤(1)得到的PCR产物的大小,按照如下方法根据PCR产物确定所述待测小麦含有Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c这三种基因中哪一种,含有TaZds-A1a和TaZds-A1b这两种基因中哪一种,含有TaZds-D1a和TaZds-D1b这两种基因中哪一种,含有Ppo-A1a基因和Ppo-A1b基因这两种基因中哪一种,含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是含有Psy-A1b基因,含有TaLox-B1a和TaLox-B1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-D1a和Ppo-D1b这两种基因中哪一种:
以所述引物对组A进行PCR反应的产物中,若含有大小为151bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-B1a基因或候选含有Psy-B1a基因;若含有大小为156bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-B1b基因或候选含有Psy-B1b基因;若含有大小为428bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-B1c基因或候选含有Psy-B1c基因;若含有大小为183bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaZds-A1a基因或候选含有TaZds-A1a基因;若含有大小为179bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaZds-A1b基因或候选含有TaZds-A1b基因;
以所述引物对组B的进行PCR反应的产物中,若不含有大小为981bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaZds-D1a基因或候选含有TaZds-D1a基因;若含有大小为981bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaZds-D1b基因或候选含有TaZds-D1b基因;若含有大小为685bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Ppo-A1a基因或候选含有Ppo-A1a基因;若含有大小为876bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Ppo-A1b基因或候选含有Ppo-A1b基因;
以所述引物对组C的进行PCR反应的产物中,若含有大小为194bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-A1a或Psy-A1c基因或候选含有Psy-A1a或Psy-A1c基因;若含有大小为231bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-A1b基因或候选含有Psy-A1b基因;若不含有大小为791bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaLox-B1a基因或候选含有TaLox-B1a基因;若含有大小为791bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaLox-B1b基因或候选含有TaLox-B1b基因;若含有大小为571bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Ppo-D1a基因或候选含有Ppo-D1a基因;若不含有大小为571bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Ppo-D1b基因或候选含有Ppo-D1b基因;
所述a2)的方法包括下述(3)和(4)的步骤:
所述(3)为如下c1)和c2):
c1)以待测小麦的基因组DNA为模板,用权利要求1-3中任一所述引物对组中的所述引物对组A进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为59℃;
c2)以待测小麦的基因组DNA为模板,用权利要求1-3中任一所述引物对组中所述引物对组C进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为64℃;
(4)检测步骤(3)得到的PCR产物的大小,所述检测步骤(3)得到的PCR产物的大小的方法同步骤(2);
所述a3)的方法包括下述(5)和(6)的步骤:
(5)以待测小麦的基因组DNA为模板,用所述引物对组中所述引物对组C进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为64℃;
(6)检测步骤(5)得到的PCR产物的大小,所述检测步骤(5)得到的PCR产 物的大小的方法同步骤(2)。

8.  根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述大小为151bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列17所示;所述大小为156bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列18所示;所述大小为428bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列19所示;所述大小为183bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列20所示;所述大小为179bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列21所示;所述大小为981bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列22所示;所述大小为685bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列23所示;所述大小为876bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列24所示;所述大小为194bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列25所示;所述大小为231bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列26所示;所述大小为791bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列27所示;所述大小为571bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列28所示。

9.  一种培育面粉白度提高的小麦品种的方法,包括采用通过权利要求7的方法鉴定得到的如下a)-g)中至少一种的小麦作为亲本进行育种的步骤:
a)含有或候选含有Psy-B1b基因;
b)含有或候选含有TaZds-A1a基因;
c)含有或候选含有TaZds-D1b基因;
d)含有或候选含有Ppo-A1b基因;
e)含有或候选含有Psy-A1b基因;
f)含有或候选含有TaLox-B1a基因;
g)含有或候选含有Ppo-D1a基因。

说明书

说明书用于鉴定小麦面粉色泽相关基因的PCR体系
技术领域
本发明涉及一种用于鉴定或辅助鉴定面粉色泽相关基因的PCR体系及其应用,特别涉及一种用于鉴定或辅助鉴定待测新疆冬小麦的面粉色泽相关基因如Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1的多重PCR引物对组、试剂盒及其应用。
背景技术
小麦面制食品作为我国人民最重要的主食之一,为我国以面食为主地区的人民提供50-80%以上的能量来源。随着社会生活水平不断提高,人们对小麦面制品品质的要求越来越高,品质育种也越来越受到重视。中国作为小麦最大的生产国和消费国,每年仅用来生产面条的小麦量约占小麦总消费量的40%。而面条、馒头、饺子等我国传统的蒸煮类面制食品,色泽越白越受到我国消费者青睐。因此,在我国传统面制品的感官评价体系中,面制品的色泽占很大的比例,越白评分越高。然而,目前我国主栽小麦品种的面粉平均白度较低(74.8),不能满足市场和消费者对面粉白度(80.0以上)的要求。在2005年前,大多数面粉厂为满足消费者对面粉白度的要求,向面粉中添加过氧化苯甲酰(BPO)。但BPO会破坏营养物质且对人类健康构成威胁,在国家最新修订的小麦粉标准中,已明确规定禁止使用BPO。因此制订育种目标,选育出自然白的小麦具有重要意义。同时,亮黄色的面粉也有一定的消费量,如黄碱面条、乌冬面、意大利面等也很受欢迎。因此,根据不同的加工目的,分别需要选育适合加工高白度或亮黄色面粉的小麦新品种。
除了环境、增白剂、加工方式和栽培措施等外,小麦面粉及面制品颜色的形成主要受色素类物质和氧化还原酶类等遗传物质的影响。色素类物质主要包括黄色素(Yellow pigment,YP)和棕色素(Brown pigment),黄色素主要由类胡萝卜素(Carotenoid)和类黄酮(Flavonoid)组成,面粉中的氧化酶类主要包括多酚氧化酶(Polyphenol oxidase,PPO)、脂肪氧化酶(Lipoxygenase,LOX)和过氧化物酶(Peroxidase,POD)。YP含量、LOX及PPO活性对面粉及面制品的色泽有重要影响。YP含量与面团黄度的相关系数高达0.8-0.9;LOX可催化多不饱和脂肪酸加氧形成过氧化物,反应所释放的氧自由基进一步氧化色素分子,使面粉变白;PPO在氧分子的参与下可催化单酚类物质最终变为氧合醌,生成褐色物质,决定面粉及面制品加工和贮存过程中色泽褐变的50-70%。当需要自然白小麦时,应选择含低YP含量基因型、高LOX活性基因型及低PPO活性基因型的小麦品种(系)。
多重PCR是一种高效、低成本的检测方法,已成为研究的热点。虽然已经报道了数套与小麦面粉色泽基因相关的多重PCR体系,但仅涉及到PPO活性基因的Ppo-A1和Ppo-D1位点,或PSY活性基因的Psy-A1位点,还未见到检测PSY活性基因的Psy-B1位点、ZDS活性基因的TaZds-A1和TaZds-D1位点,以及LOX活性基因TaLox-B1位点的多重PCR体系的报道。
发明内容
本发明的目的是提供一种用于鉴定或辅助鉴定面粉色泽相关基因的PCR体系及其应用,特别涉及一种用于鉴定或辅助鉴定待测新疆冬小麦的面粉色泽相关基因如Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1的多重PCR引物对组、试剂盒及其应用。
本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定待测小麦拉面品质性状相关基因的多重PCR引物对组为如下a1)或a2)或a3)的引物对组:
a1)由引物对组A、引物对组B和引物对组C组成的引物对组;
a2)由引物对组A和引物对C组成的引物对组;
a3)引物对组C;
所述面粉色泽相关基因为Psy-B1基因、TaZds-A1基因、TaZds-D1基因、Ppo-A1基因、Psy-A1基因、TaLox-B1基因和Ppo-D1基因。
所述引物对组A由特异于所述Psy-B1基因的两个引物对,和特异于所述TaZds-A1基因的一个引物对组成;具体的,所述特异于所述Psy-B1基因的两个引物对分别为序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA组成的引物对1,以及序列3和序列4所示的两条单链DNA组成的引物对2;所述特异于所述TaZds-A1基因的一个引物对为序列表中序列5和序列6所示的两条单链DNA组成的引物对3;
所述引物对组B由特异于所述TaZds-D1基因的一个引物对,和特异于所述Ppo-A1基因的一个引物对组成;具体的,所述特异于所述TaZds-D1基因的一个引物对为序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA组成的引物对4;所述特异于所述Ppo-A1基因的一个引物对为序列表中序列9和序列10所示的两条单链DNA组成的引物对5;
所述引物对组C由特异于所述Psy-A1基因的一个引物对、特异于所述TaLox-B1基因的一个引物对,和特异于所述Ppo-D1基因的一个引物对组成;具体的,所述特异于所述Psy-A1基因的一个引物对为序列表中序列11和序列12所示的两条单链DNA组成的引物对6;所述特异于所述TaLox-B1基因的一个引物对为序列表中序列13和序列14所示的两条单链DNA组成的引物对7;所述特异于所述Ppo-D1基因的一个引物对为序列表中序列15和序列16所示的两条单链DNA组成的引物对8。
其中,序列1由21个核苷酸组成;序列2由20个核苷酸组成;序列3由21个核苷酸组成;序列4由20个核苷酸组成;序列5由21个核苷酸组成;序列6由24个核苷酸组成;序列7由21个核苷酸组成;序列8由23个核苷酸组成;序列9由21个核苷酸组成;序列10由20个核苷酸组成;序列11由20个核苷酸组成;序列12由22个核苷酸组成;序列13由23个核苷酸组成;序列14由16个核苷酸组成;序列15由18个核苷酸组成;序列16由20个核苷酸组成。
本发明中,所述Psy-B1基因涉及三个等位基因,分别是Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c;所述TaZds-A1基因涉及两个等位基因,分别是TaZds-A1a和TaZds-A1b;所述TaZds-D1基因涉及两个等位基因,分别是TaZds-D1a和TaZds-D1b;所述Ppo-A1基因涉及两个等位基因,分别是Ppo-A1a和Ppo-A1b;所述Psy-A1基因涉及三个等位基因,分别是Psy-A1a、Psy-A1b和Psy-A1c;所述TaLox-B1基因涉及两个等位基因,分别是TaLox-B1a和TaLox-B1b;所述Ppo-D1基因涉及两个等位基因,分别是Ppo-D1a和Ppo-D1b。
所述引物对组A中每个引物对的两条引物在PCR反应体系中等量使用,且所述引物对1,所述引物对2和所述引物对3在PCR反应体系中的摩尔比为6:6:5;所述引物对组B中每个引物对的两条引物在PCR反应体系中等量使用,且所述引物对4和所述引物对5在PCR反应体系中的摩尔比为12:6;所述引物对组C中每个引物对的两条引物在PCR反应体系中等量使用,且所述引物对6、所述引物对7和所述引物对8在PCR反应体系中的摩尔比为5:10:10。
具体的,所述引物对组A中,所述引物对1中的序列1和序列2所示的两条DNA单链在所述PCR反应体系中的终浓度均为0.3μM;所述引物对2中的序列3和序列4所示的两条DNA单链在所述PCR反应体系中的终浓度均为0.3μM;所述引物对3中的序列5和序列6 所示的两条DNA单链在所述PCR反应体系中的终浓度均为0.25μM。所述引物对组B中,所述引物对4中的序列7和序列8所示的两条DNA单链在所述PCR反应体系中的终浓度均为0.6μM;所述引物对5中的序列9和序列10所示的两条DNA单链在所述PCR反应体系中的终浓度均为0.3μM;所述引物对组C中,所述引物对6中的序列11和序列12所示的两条DNA单链在所述PCR反应体系中的终浓度均为0.25μM;所述引物对7中的序列13和序列14所示的两条DNA单链在所述PCR反应体系中的终浓度均为0.5μM;所述引物对8中的序列15和序列16所示的两条DNA单链在所述PCR反应体系中的终浓度均为0.5μM。
含有所述引物对组的试剂盒也属于本发明的保护范围。
所述引物对组的制备方法也属于本发明的保护范围。
所述引物对组的制备方法,具体可包括将所述引物对组中各引物对的所述两条单链DNA分别单独包装的步骤。
所述试剂盒的制备方法也属于本发明的保护范围。
所述试剂盒的制备方法,具体可包括如下步骤:将所述引物对组中各引物对的所述两条单链DNA分别单独包装后,与下述物质中的至少一种包装在同一试剂盒内:PCR反应缓冲液、DNA聚合酶和4种dNTP。
下述a1)或a2)或a3)的方法也属于本发明的保护范围:
a1)鉴定或辅助鉴定待测小麦含有Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c这三种基因中哪一种,含有TaZds-A1a和TaZds-A1b这两种基因中哪一种,含有TaZds-D1a和TaZds-D1b这两种基因中哪一种,含有Ppo-A1a基因和Ppo-A1b基因这两种基因中哪一种;含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是含有Psy-A1b基因,含有TaLox-B1a和TaLox-B1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-D1a和Ppo-D1b这两种基因中哪一种;
a2)鉴定或辅助鉴定待测小麦含有Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c这三种基因中哪一种,以及含有TaZds-A1a和TaZds-A1b这两种基因中哪一种;含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是含有Psy-A1b基因,含有TaLox-B1a和TaLox-B1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-D1a和Ppo-D1b这两种基因中哪一种;
a3)鉴定或辅助鉴定待测小麦含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是含有Psy-A1b基因,含有TaLox-B1a和TaLox-B1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-D1a和Ppo-D1b这两种基因中哪一种;
所述a1)的方法包括下述(1)和(2)的步骤:
所述(1)为如下b1)、b2)和b3):
b1)以待测小麦的基因组DNA为模板,用所述引物对组中的所述引物对组A进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为59℃;
在本发明中,所述PCR反应的程序具体为:95℃预变性5min;95℃变性45s,59℃退火45s,72℃延伸30s,扩增反应进行35个循环;72℃延伸10min;4℃,保温结束。
b2)以待测小麦的基因组DNA为模板,用所述引物对组中所述引物对组B进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为62℃;
在本发明中,所述PCR反应的程序具体为:95℃预变性5min;95℃变性30s,62℃退火30s,72℃延伸70s,扩增反应进行34个循环;72℃延伸5min;4℃,保温结束。
b3)以待测小麦的基因组DNA为模板,用所述引物对组中所述引物对组C进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为64℃;
在本发明中,所述PCR反应的程序具体为:95℃预变性5min;94℃变性1min,64℃退火1min,72℃延伸90s,扩增反应进行36个循环;72℃延伸8min;4℃,保温结束。
(2)检测步骤(1)得到的PCR产物的大小,按照如下方法根据PCR产物确定所述待测小麦含有Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c这三种基因中哪一种,含有TaZds-A1a和TaZds-A1b这两种基因中哪一种,含有TaZds-D1a和TaZds-D1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-A1a基因和Ppo-A1b基因这两种基因中哪一种,含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是含有Psy-A1b基因,含有TaLox-B1a和TaLox-B1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-D1a和Ppo-D1b这两种基因中哪一种:
以所述引物对组A进行PCR反应的产物中,若含有大小为151bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-B1a基因或候选含有Psy-B1a基因;若含有大小为156bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-B1b基因或候选含有Psy-B1b基因;若含有大小为428bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-B1c基因或候选含有Psy-B1c基因;若含有大小为183bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaZds-A1a基因或候选含有TaZds-A1a基因;若含有大小为179bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaZds-A1b基因或候选含有TaZds-A1b基因;
以所述引物对组B的进行PCR反应的产物中,若不含有大小为981bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaZds-D1a基因或候选含有TaZds-D1a基因;若含有大小为981bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaZds-D1b基因或候选含有TaZds-D1b基因;若含有大小为685bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Ppo-A1a基因或候选含有Ppo-A1a基因;若含有大小为876bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Ppo-A1b基因或候选含有Ppo-A1b基因;
以所述引物对组C的进行PCR反应的产物中,若含有大小为194bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-A1a或Psy-A1c基因或候选含有Psy-A1a或Psy-A1c基因(Psy-A1c基因极少);若含有大小为231bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Psy-A1b基因或候选含有Psy-A1b基因;若不含有大小为791bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaLox-B1a基因或候选含有TaLox-B1a基因;若含有大小为791bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaLox-B1b基因或候选含有TaLox-B1b基因;若含有大小为571bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Ppo-D1a基因或候选含有Ppo-D1a基因;若不含有大小为571bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Ppo-D1b基因或候选含有Ppo-D1b基因。
所述a2)的方法包括下述(3)和(4)的步骤:
所述(3)为如下c1)和c2):
c1)以待测小麦的基因组DNA为模板,用所述引物对组中的所述引物对组A进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为59℃;
在本发明中,所述PCR反应的程序具体为:95℃预变性5min;95℃变性45s,59℃退火45s,72℃延伸30s,扩增反应进行35个循环;72℃延伸10min;4℃,保温结束。
c2)以待测小麦的基因组DNA为模板,用所述引物对组中所述引物对组C进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为64℃;
在本发明中,所述PCR反应的程序具体为:95℃预变性5min;94℃变性1min,64℃退火1min,72℃延伸90s,扩增反应进行36个循环;72℃延伸8min;4℃,保温结束;
(4)检测步骤(3)得到的PCR产物的大小,所述检测步骤(3)得到的PCR产物的大小的方法同步骤(2)。
所述a3)的方法包括下述(5)和(6)的步骤:
(5)以待测小麦的基因组DNA为模板,用所述引物对组中所述引物对组C进行PCR反应,所述PCR反应的退火温度为64℃;
在本发明中,所述PCR反应的程序具体为:95℃预变性5min;94℃变性1min,64℃退火1min,72℃延伸90s,扩增反应进行36个循环;72℃延伸8min;4℃,保温结束;
(6)检测步骤(5)得到的PCR产物的大小,所述检测步骤(5)得到的PCR产物的大小的方法同步骤(2)。
在上述方法中,所述大小为151bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列17所示;所述大小为156bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列18所示;所述大小为428bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列19所示;所述大小为183bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列20所示;所述大小为179bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列21所示;所述大小为981bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列22所示;所述大小为685bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列23所示;所述大小为876bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列24所示;所述大小为194bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列25所示;所述大小为231bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列26所示;所述大小为791bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列27所示;所述大小为571bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序列28所示。
在本发明的一个实施例中,用所述引物对组中的所述引物对组A进行PCR反应的反应体系中,作为模板的所述待测小麦的基因组DNA的量为100-200ng,dNTPs的终浓度为200μM,DNA聚合酶的量为1.5U。PCR反应程序具体为:95℃预变性5min;95℃变性45s,59℃退火45s,72℃延伸30s,扩增反应进行35个循环;72℃延伸10min;4℃,保温结束。
在本发明的一个实施例中,用所述引物对组中的所述引物对组B进行PCR反应的反应体系中,作为模板的所述待测小麦的基因组DNA的量为100-200ng,dNTPs的终浓度为200μM。PCR反应程序具体为:95℃预变性5min;95℃变性30s,62℃退火30s,72℃延伸70s,扩增反应进行34个循环;72℃延伸5min;4℃,保温结束。
在本发明的一个实施例中,用所述引物对组中的所述引物对组C进行PCR反应的反应体系中,作为模板的所述待测小麦的基因组DNA的量为100-200ng,dNTPs的终浓度为225μM,DNA聚合酶的量为1.5U。PCR反应程序具体为:95℃预变性5min;94℃变性1min,64℃退火1min,72℃延伸90s,扩增反应进行36个循环;72℃延伸8min;4℃,保温结束。
本发明的另一个目的是提供一种培育面粉白度提高的小麦品种的方法。
本发明所提供的培育面粉白度提高的小麦品种的方法,包括采用如下a)-g)中至少一种的小麦作为亲本进行育种的步骤:
a)含有或候选含有Psy-B1b基因;
b)含有或候选含有TaZds-A1a基因;
c)含有或候选含有TaZds-D1b基因;
d)含有或候选含有Ppo-A1b基因;
e)含有或候选含有Psy-A1b基因;
f)含有或候选含有TaLox-B1a基因;
g)含有或候选含有Ppo-D1a基因。
从众多小麦品种中选择满足a)-g)中至少一项的小麦的方法,即为上述“鉴定或辅助鉴 定待测小麦含有Psy-B1a、Psy-B1b和Psy-B1c这三种基因中哪一种,含有TaZds-A1a和TaZds-A1b这两种基因中哪一种,含有TaZds-D1a和TaZds-D1b这两种基因中哪一种,含有Ppo-A1a基因和Ppo-A1b基因这两种基因中哪一种;含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是含有Psy-A1b基因,含有TaLox-B1a和TaLox-B1b这两种基因中哪一种,以及含有Ppo-D1a和Ppo-D1b这两种基因中哪一种”的方法。所选择的小麦满足上述a)-g)七项中的项数越多,表示所选择的小麦越适合作为培育面粉白度提高的小麦品种时采用的亲本,并且在同等条件下,对于d)和g)优先选择含有或候选含有Ppo-A1b基因的小麦品种作为亲本。
在本发明中,所述待测小麦具体为如下小麦品种(系)中的至少一种:宁冬6号、周麦16、周麦17、西农979、西农88、陕354、小偃54、徐州25、西农6028、西农8727和西峰27。
本发明所提供的引物对组A或引物对组B或引物对组C的各引物对之间不存在相互抑制作用和错配,检测品种(系)的结果可靠、重复性好,成本低。本发明所提供的引物对组A或引物对组B或引物对组C均选用同样的退火温度,实现了相同温度一次PCR完成一组基因的鉴别,且特异性强,检测过程耗时短。本发明提供一种更全面的快速评价小麦色泽品质的方法,并为小麦色泽品质育种提供参考。
附图说明
图1为实施例1中11份小麦品种(系)面粉色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1的多重PCR扩增结果。其中,A1和A2(两次重复)为TaZds-A1基因的基因型单一PCR检测结果;B1和B2(两次重复)及B3和B4(两次重复)为Psy-B1基因的基因型单一PCR检测结果;C为多重PCR扩增结果。其中,1:宁冬6号;2:周麦16;3:周麦17;4:西农979;5:西农88;6:陕354;7:小偃54;8:徐州25;9:西农6028;10:西农8727;11:西峰27。
图2为实施例2中11份小麦品种(系)面粉色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1的多重PCR扩增结果。其中,A1和A2(两次重复)为TaZds-D1基因的基因型单一PCR检测结果;B1和B2(两次重复)为Ppo-A1基因的基因型单一PCR检测结果;C为多重PCR扩增结果。其中,M:标准分子量DL2000;1:宁冬6号;2:周麦16;3:周麦17;4:西农979;5:西农88;6:陕354;7:小偃54;8:徐州25;9:西农6028;10:西农8727;11:西峰27。
图3为实施例3中11份小麦品种(系)面粉色泽相关基因Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1的多重PCR扩增结果。其中,A1和A2(两次重复)为Psy-A1基因的基因型单一PCR检测结果;B1和B2(两次重复)为Ppo-D1基因的基因型单一PCR检测结果;C1和C2(两次重复)为TaLox-B1基因的基因型单一PCR检测结果;D为多重PCR扩增结果。其中,M:标准分子量DL2000;1:宁冬6号;2:周麦16;3:周麦17;4:西农979;5:西农88;6:陕354;7:小偃54;8:徐州25;9:西农6028;10:西农8727;11:西峰27。
图4为对比例1中7份已知基因型小麦品种(系)面粉色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1的多重PCR扩增结果。其中,1、8:周麦17;2:周麦16;3:宁冬6号;4:西农88;5:小偃54;6:西农979;7:西农6028。
图5为对比例2中7份已知基因型小麦品种(系)面粉色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1的多重PCR扩增结果。其中,1、3:宁冬6号;2:西农979;4:西农88;5:周麦16;6:周麦17;7:陕354;8、9:徐州25。
图6为对比例3中5份已知基因型小麦品种(系)面粉色泽相关基因Ppo-A1、TaLox-B1和Ppo-D1的多重PCR扩增结果。其中,1:宁冬6号;2:陕354;3:西峰27;4:西农6028; 5:西农979。
具体实施方式
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
实施例1、小麦面粉色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1的多重PCR检测
本实施例的多重PCR引物对组由特异于Psy-B1基因的两个引物对,和特异于TaZds-A1基因的一个引物对组成;其中,所述特异于Psy-B1基因的两个引物对分别为序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA组成的引物对1,以及序列3和序列4所示的两条单链DNA组成的引物对2;所述特异于TaZds-A1基因的一个引物对为序列表中序列5和序列6所示的两条单链DNA组成的引物对3。
本实施例的多重PCR引物对组可同时检测Psy-B1和TaZds-A1两个基因位点的5种基因型Psy-B1a、Psy-B1b、Psy-B1c、TaZds-A1a和TaZds-A1b。含有Psy-B1a基因的材料,PCR扩增出151bp(序列17)的一个条带;含有Psy-B1b基因的材料,PCR扩增出156bp(序列18)的一个条带;含有Psy-B1c基因的材料,PCR扩增出428bp(序列19)的一个条带;含有TaZds-A1a基因的材料,PCR扩增出183bp(序列20)的一条带;含有TaZds-A1b基因的材料,PCR扩增出179bp(序列21)的一个条带。
一、小麦基因组的制备
采用CTAB法对11份小麦品种(系)进行基因组DNA的提取,得到对应于11份小麦品种(系)的基因组DNA,作为拉面色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1多重PCR扩增的模板。其中,11份小麦品种(系)为宁冬6号、周麦16、周麦17、西农979、西农88、陕354、小偃54、徐州25、西农6028、西农8727和西峰27。这11个小麦品种(系)的Psy-B1和TaZds-A1基因的基因型详见表1。
其中,西农979、西农88、陕354、小偃54、徐州25、西农6028和西农8727的Psy-B1基因的基因型参见“叶石.陕西小麦籽粒PPO活性基因和YP含量基因的等位变异检测和分布分析.西北农林科技大学,2010年,硕士论文”一文;陕354、小偃54、徐州25的TaZds-A1基因的基因型参见“董长海.普通小麦籽粒黄色素含量相关基因的克隆与功能标记开发.河北农业大学,2011年,硕士论文”一文。
同时,本发明的发明人对以上11个小麦品种(系)的Psy-B1和TaZds-A1基因的基因型均经过至少两次各个位点的单一PCR鉴定,具体如下:
(1)以上11个小麦品种(系)的TaZds-A1基因的基因型检测参见“董长海.普通小麦籽粒黄色素含量相关基因的克隆与功能标记开发.河北农业大学,2011年,硕士论文”一文进行。以小麦基因组DNA为模板,采用YP2A-1标记引物(表2中序列5/序列6)进行单一PCR扩增。结果显示:小麦品种(系)宁冬6号、周麦16、西农88、徐州25、西农8727和西峰27经PCR扩增得到大小为179bp的目的条带,表明其TaZds-A1基因的基因型为TaZds-A1b;周麦17、西农979、陕354、小偃54和西农6028经PCR扩增得到大小为183bp的目的条带,表明其TaZds-A1基因的基因型为TaZds-A1a。实验重复至少两次,结果一致。见图1中A1和A2。
(2)以上11个小麦品种(系)的Psy-B1基因的基因型检测参见“叶石.陕西小麦籽粒PPO活性基因和YP含量基因的等位变异检测和分布分析.西北农林科技大学,2010年,硕士 论文”一文进行。以小麦基因组DNA为模板,分别采用YP7B-1标记引物(表2中序列1/序列2)、YP7B-2标记引物(表2中序列3/序列4)进行单一PCR扩增。结果显示:小麦品种(系)宁冬6号、周麦17、西农6028和西峰27采用序列1/序列2进行PCR扩增得到大小为151bp的目的条带,表明其Psy-B1基因的基因型为Psy-B1a;小麦品种(系)周麦16、西农979、西农88、小偃54和西农8727采用序列1/序列2进行PCR扩增得到大小为156bp的目的条带,表明其Psy-B1基因的基因型为Psy-B1b;小麦品种(系)陕354和徐州25采用序列3/序列4进行PCR扩增得到大小为428bp的目的条带,表明其Psy-B1基因的基因型为Psy-B1c。实验重复至少两次,结果一致。见图1中B1和B2及B3和B4。
表111份小麦品种(系)面粉色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1的基因型

二、多重PCR扩增小麦品种(系)面粉色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1
以上述步骤一制备的11份小麦品种(系)的基因组DNA分别为模板,利用表2中的引物对组合物进行多重PCR扩增。
PCR反应总体系为20μL,其中,DNA模板100-200ng,dNTPs在反应总体系中的终浓度为200μM,Taq DNA聚合酶1.5U,各引物在PCR反应总体系中的用量为:引物对1中的序列1和序列2所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的用量均为6pmol(在反应体系中的终浓度均为0.3μM);引物对2中的序列3和序列4所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的用量均为6pmol(在反应体系中的终浓度均为0.3μM);引物对3中的序列5和序列6所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的用量均为5pmol(在反应体系中的终浓度均为0.25μM)。
PCR反应程序为:95℃预变性5min;95℃变性45s,59℃退火45s,72℃延伸30s,扩增反应进行35个循环;72℃延伸10min;4℃,保温结束。
PCR扩增在6%的变性聚丙烯酰胺凝胶上进行,电泳时的电压为2000V,电泳时间为1h。
表2面粉色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1扩增引物序列信息


注:表型为低YP的基因型利于小麦面粉白度的提高。
结果判定方法:若PCR产物中含有大小为151bp的DNA片段(序列17),则所述待测小麦含有Psy-B1a基因;若PCR产物中含有大小为156bp的DNA片段(序列18),则所述待测小麦含有Psy-B1b基因;若PCR产物中含有大小为428bp的DNA片段(序列19),则所述待测小麦含有Psy-B1c基因;若PCR产物中含有大小为183bp的DNA片段(序列20),则所述待测小麦含有TaZds-A1a基因;若PCR产物中含有大小为179bp的DNA片段(序列21),则所述待测小麦含有TaZds-A1b基因。
三、小麦品种面粉色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1的多重PCR扩增结果
电泳结果如图1中C所示:
小麦品种(系)宁冬6号经上述多重PCR扩增后,得到大小为151bp和179bp的两条带,这说明小麦品种(系)宁冬6号含有Psy-B1a和TaZds-A1b基因;
小麦品种(系)周麦16经上述多重PCR扩增后,得到大小为156bp和179bp的两条带,这说明小麦品种(系)周麦16含有Psy-B1b和TaZds-A1b基因;
小麦品种(系)周麦17经上述多重PCR扩增后,得到大小为151bp和183bp的两条带,这说明小麦品种(系)周麦17含有Psy-B1a和TaZds-A1a基因;
小麦品种(系)西农979经上述多重PCR扩增后,得到大小为156bp和183bp的两条带,这说明小麦品种(系)西农979含有Psy-B1b和TaZds-A1a基因;
小麦品种(系)西农88经上述多重PCR扩增后,得到大小为156bp和179bp的两条带,这说明小麦品种(系)西农88含有Psy-B1b和TaZds-A1b基因;
小麦品种(系)陕354经上述多重PCR扩增后,得到大小为428bp和183bp的两条带,这说明小麦品种(系)陕354含有Psy-B1c和TaZds-A1a基因;
小麦品种(系)小偃54经上述多重PCR扩增后,得到大小为156bp和183bp的两条带,这说明小麦品种(系)小偃54含有Psy-B1b和TaZds-A1a基因;
小麦品种(系)徐州25经上述多重PCR扩增后,得到大小为428bp和179bp的两条带,这说明小麦品种(系)徐州25含有Psy-B1c和TaZds-A1b基因;
小麦品种(系)西农6028经上述多重PCR扩增后,得到大小为151bp和183bp的两条带,这说明小麦品种(系)西农6028含有Psy-B1a和TaZds-A1a基因;
小麦品种(系)西农8727经上述多重PCR扩增后,得到大小为156bp和179bp的两条带,这说明小麦品种(系)西农8727含有Psy-B1b和TaZds-A1b基因。
小麦品种(系)西峰27经上述多重PCR扩增后,得到大小为151bp和179bp的两条带,这说明小麦品种(系)西峰27含有Psy-B1a和TaZds-A1b基因。
上述结果与表1完全一致,本发明的发明人进一步将以上各小麦品种(系)的各扩增条带回收后测序,发现各小麦品种(系)扩增所得大小为151bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列17,扩增所得大小为156bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列18,扩增所得大小为428bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列19,扩增所得大小为183bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列20,扩增所得大小为179bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列21,这进一步 证实了上述多重PCR结果的准确性。这说明本实施例的多重PCR引物对组能够同时、快速、准确的检测小麦面粉色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1两个位点的5种基因型Psy-B1a、Psy-B1b、Psy-B1c、TaZds-A1a和TaZds-A1b。这将有利于遴选同时含有Psy-B1b和TaZds-A1a基因型的小麦品种或面粉,进行拉面色泽遗传改良或评价。
实施例2、小麦面粉色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1的多重PCR检测
本实施例的多重PCR引物对组由特异于TaZds-D1基因的一个引物对,和特异于Ppo-A1基因的一个引物对组成;其中,所述特异于TaZds-D1基因的一个引物对为序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA组成的引物对4;所述特异于Ppo-A1基因的一个引物对为序列表中序列9和序列10所示的两条单链DNA组成的引物对5。
本实施例的多重PCR引物对组可同时检测TaZds-D1和Ppo-A1两个基因位点的4种基因型TaZds-D1a、TaZds-D1b、Ppo-A1a和Ppo-A1b。含有TaZds-D1a基因的材料,PCR扩增不出981bp(序列22)的一个条带;含有TaZds-D1b基因的材料,PCR扩增出981bp(序列22)的一个条带;含有Ppo-A1a基因的材料,PCR扩增出685bp(序列23)的一个条带;含有Ppo-A1b基因的材料,PCR扩增出876bp(序列24)的一条带。
一、小麦基因组的制备
采用CTAB法对11份小麦品种(系)进行基因组DNA的提取,得到对应于11份小麦品种(系)的基因组DNA,作为拉面色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1多重PCR扩增的模板。其中,11份小麦品种(系)为宁冬6号、周麦16、周麦17、西农979、西农88、陕354、小偃54、徐州25、西农6028、西农8727和西峰27。这11个小麦品种(系)的TaZds-D1和Ppo-A1基因的基因型详见表3。
其中,西农979、西农88、陕354、小偃54、徐州25、西农6028和西农8727的Ppo-A1基因的基因型参见“叶石.陕西小麦籽粒PPO活性基因和YP含量基因的等位变异检测和分布分析.西北农林科技大学,2010年,硕士论文”一文。
同时,本发明的发明人对以上11个小麦品种(系)的TaZds-D1和Ppo-A1基因的基因型均经过至少两次各个位点的单一PCR鉴定,具体如下:
(1)以上11个小麦品种(系)的TaZds-D1基因的基因型检测参见“张彩英.小麦主要产量和品质性状的QTL鉴定及ZDS功能标记的开发.河北农业大学,2010年,博士论文”一文进行。以小麦基因组DNA为模板,采用YP2D-1标记引物(表4中序列7/序列8)进行单一PCR扩增。结果显示:小麦品种(系)周麦16、周麦17、西农979、西农88、陕354、小偃54、徐州25、西农6028和西农8727经PCR扩增均未得到大小为981bp的目的条带,表明其TaZds-D1基因的基因型为TaZds-D1a。小麦品种(系)宁冬6号和西峰27经PCR扩增得到大小为981bp的目的条带,表明其TaZds-D1基因的基因型为TaZds-D1b。实验重复至少两次,结果一致。见图2中A1和A2。
(2)以上11个小麦品种(系)的Ppo-A1基因的基因型检测参见“叶石.陕西小麦籽粒PPO活性基因和YP含量基因的等位变异检测和分布分析.西北农林科技大学,2010年,硕士论文”一文进行。以小麦基因组DNA为模板,采用PPO18标记引物(表4中序列9/序列10)进行单一PCR扩增。结果显示:小麦品种(系)宁冬6号、周麦16、周麦17、陕354和徐州25经PCR扩增得到大小为685bp的目的条带,表明其Ppo-A1基因的基因型为Ppo-A1a;小麦品种(系)西农979、西农88、小偃54、西农6028、西农8727和西峰27经PCR扩增 得到大小为876bp的目的条带,表明其Ppo-A1基因的基因型为Ppo-A1b。实验重复至少两次,结果一致。见图2中B1和B2。
表311份小麦品种(系)面粉色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1的基因型

二、多重PCR扩增小麦品种(系)面粉色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1
以上述步骤一制备的11份小麦品种(系)的基因组DNA分别为模板,利用表4中的引物对组合物进行多重PCR扩增。
PCR反应总体系为20μL,其中,DNA模板100-200ng,MasterMix(含有DNA聚合酶、PCR反应缓冲液、4种dNTP)(北京康为世纪生物科技有限公司)10μL(使得20μL的PCR反应体系中每种dNTP的浓度为200μM),各引物在PCR反应总体系中的用量为:引物对4中的序列7和序列8所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的用量均为12pmol(在反应体系中的终浓度均为0.6μM);引物对5中的序列9和序列10所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的用量均为6pmol(在反应体系中的终浓度均为0.3μM)。
PCR反应程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s,62℃退火30s,72℃延伸70s,扩增反应进行34个循环;72℃延伸5min;4℃,保温结束。
PCR扩增在2%的琼脂糖凝胶上进行,电泳时的电压为100V,电泳时间为1.5h。
表4面粉色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1扩增引物序列信息

注:表型为低YP的基因型利于小麦面粉白度的提高,表型为低PPO基因型利于小麦面粉白度的提高。
结果判定方法:若PCR产物中不含有大小为981bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaZds-D1a基因;若PCR产物中含有大小为981bp的DNA片段(序列22),则所述待测小麦含有TaZds-D1b基因;若PCR产物中含有大小为685bp的DNA片段(序列23),则所述 待测小麦含有Ppo-A1a基因;若PCR产物中含有大小为876bp的DNA片段(序列24),则所述待测小麦含有Ppo-A1b基因。
三、小麦品种面粉色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1的多重PCR扩增结果
电泳结果如图2中C所示:
小麦品种(系)宁冬6号经上述多重PCR扩增后,得到大小为981bp和685bp的两条带,这说明小麦品种(系)宁冬6号含有TaZds-D1b和Ppo-A1a基因;
小麦品种(系)周麦16经上述多重PCR扩增后,得到大小为685bp的一条带(没有得到大小为981bp的条带),这说明小麦品种(系)周麦16含有TaZds-D1a和Ppo-A1a基因;
小麦品种(系)周麦17经上述多重PCR扩增后,得到大小为685bp的一条带(没有得到大小为981bp的条带),这说明小麦品种(系)周麦17含有TaZds-D1a和Ppo-A1a基因;
小麦品种(系)西农979经上述多重PCR扩增后,得到大小为876bp的一条带(没有得到大小为981bp的条带),这说明小麦品种(系)西农979含有TaZds-D1a和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)西农88经上述多重PCR扩增后,得到大小为876bp的一条带(没有得到大小为981bp的条带),这说明小麦品种(系)西农88含有TaZds-D1a和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)陕354经上述多重PCR扩增后,得到大小为685bp的一条带(没有得到大小为981bp的条带),这说明小麦品种(系)陕354含有TaZds-D1a和Ppo-A1a基因;
小麦品种(系)小偃54经上述多重PCR扩增后,得到大小为876bp的一条带(没有得到大小为981bp的条带),这说明小麦品种(系)小偃54含有TaZds-D1a和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)徐州25经上述多重PCR扩增后,得到大小为685bp的一条带(没有得到大小为981bp的条带),这说明小麦品种(系)徐州25含有TaZds-D1a和Ppo-A1a基因;
小麦品种(系)西农6028经上述多重PCR扩增后,得到大小为876bp的一条带(没有得到大小为981bp的条带),这说明小麦品种(系)西农6028含有TaZds-D1a和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)西农8727经上述多重PCR扩增后,得到大小为876bp的一条带(没有得到大小为981bp的条带),这说明小麦品种(系)西农8727含有TaZds-D1a和Ppo-A1b基因。
小麦品种(系)西峰27经上述多重PCR扩增后,得到大小为981bp和876bp的两条带,这说明小麦品种(系)西峰27含有TaZds-D1b和Ppo-A1b基因。
上述结果与表3完全一致,本发明的发明人进一步将以上各小麦品种(系)的各扩增条带回收后测序,发现各小麦品种(系)扩增所得大小为981bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列22,扩增所得大小为685bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列23,扩增所得大小为876bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列24,这进一步证实了上述多重PCR结果的准确性。这说明本实施例的多重PCR引物对组能够同时、快速、准确的检测小麦面粉色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1两个位点的4种基因型TaZds-D1a、TaZds-D1b、Ppo-A1a和Ppo-A1b。这将有利于遴选同时含有TaZds-D1b和Ppo-A1b基因型的小麦品种或面粉,进行拉面色泽遗传改良或评价。
实施例3、小麦面粉色泽相关基因Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1的多重PCR检测
本实施例的多重PCR引物对组由特异于Psy-A1基因的一个引物对、特异于TaLox-B1基因的一个引物对,和特异于Ppo-D1基因的一个引物对组成;其中,所述特异于Psy-A1基因 的一个引物对为序列表中序列11和序列12所示的两条单链DNA组成的引物对6;所述特异于TaLox-B1基因的一个引物对为序列表中序列13和序列14所示的两条单链DNA组成的引物对7;所述特异于Ppo-D1基因的一个引物对为序列表中序列15和序列16所示的两条单链DNA组成的引物对8。
本实施例的多重PCR引物对组可同时检测Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1三个基因位点的6种基因型Psy-A1a或Psy-A1c(Psy-A1c极少)、Psy-A1b、TaLox-B1a、TaLox-B1b、Ppo-D1a和Ppo-D1b。含有Psy-A1a或Psy-A1c基因的材料,PCR扩增出194bp(序列25)的一个条带;含有Psy-A1b基因的材料,PCR扩增出231bp(序列26)的一个条带;含有TaLox-B1a基因的材料,PCR扩增不出791bp(序列27)的一个条带;含有TaLox-B1b基因的材料,PCR扩增出791bp(序列27)的一条带;含有Ppo-D1a基因的材料,PCR扩增出571bp(序列28)的一条带;含有Ppo-D1b基因的材料,PCR扩增不出571bp(序列28)的一个条带。
一、小麦基因组的制备
采用CTAB法对11份小麦品种(系)进行基因组DNA的提取,得到对应于11份小麦品种(系)的基因组DNA,作为拉面色泽相关基因Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1多重PCR扩增的模板。其中,11份小麦品种(系)为宁冬6号、周麦16、周麦17、西农979、西农88、陕354、小偃54、徐州25、西农6028、西农8727和西峰27。这11个小麦品种(系)的Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1基因的基因型详见表5。
其中,西农979、西农88、陕354、小偃54、徐州25、西农6028和西农8727的Psy-A1基因的基因型参见“叶石.陕西小麦籽粒PPO活性基因和YP含量基因的等位变异检测和分布分析.西北农林科技大学,2010年,硕士论文”一文。周麦16、西农979的TaLox-B1基因的基因型参见“耿洪伟.小麦脂肪氧化酶(LOX)活性QTL定位与功能标记开发.新疆农业大学,2010年,博士论文”一文。西农88、陕354、周麦16和周麦17的Ppo-D1基因的基因型参见“王晓波等.小麦2D染色体上多酚氧化酶(PPO)基因STS标记的开发与应用.中国农业科学,2008,41(6):1583-1590.”
同时,本发明的发明人对以上11个小麦品种(系)的Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1基因的基因型均经过至少两次各个位点的单一PCR鉴定,具体如下:
(1)以上11个小麦品种(系)的Psy-A1基因的基因型检测参见“叶石.陕西小麦籽粒PPO活性基因和YP含量基因的等位变异检测和分布分析.西北农林科技大学,2010年,硕士论文”一文进行。以小麦基因组DNA为模板,采用YP7A标记引物(表6中序列11/序列12)进行单一PCR扩增。结果显示:小麦品种(系)宁冬6号、周麦16、周麦17、陕354和西峰27经PCR扩增得到大小为194bp的目的条带,表明其Psy-A1基因的基因型为Psy-A1a或Psy-A1c;小麦品种(系)西农979、西农88、小偃54、徐州25、西农6028和西农8727经PCR扩增得到大小为231bp的目的条带,表明其Psy-A1基因的基因型为Psy-A1b。实验至少两次,结果一致。见图3中A1和A2。
(2)以上11个小麦品种(系)的Ppo-D1基因的基因型检测参见“王晓波,马传喜,何克勤等.小麦2D染色体上多酚氧化酶(PPO)基因STS标记的开发与应用.中国农业科学,2008,41(6):1583-1590”一文进行。以小麦基因组DNA为模板,采用STS01标记引物(表6中序列15/序列16)进行单一PCR扩增。结果显示:小麦品种(系)宁冬6号、周麦16、周麦17、西农6028和西峰27经PCR扩增得到大小为571bp的目的条带,表明其Ppo-D1基因的基因型为Ppo-D1a;小麦品种(系)西农979、西农88、陕354、小偃54、徐州25和西农 6028经PCR扩增未得到大小为571bp的目的条带,表明其Ppo-D1基因的基因型为Ppo-D1b。实验重复至少两次,结果一致。见图3中B1和B2。
(3)以上11个小麦品种(系)的TaLox-B1基因的基因型参见“耿洪伟.小麦脂肪氧化酶(LOX)活性QTL定位与功能标记开发.新疆农业大学,2010年,博士论文”一文进行。以小麦基因组DNA为模板,采用LOX18标记引物(表6中序列13/序列14)进行单一PCR扩增。结果显示:小麦品种(系)西农979和西峰27经PCR扩增均未得到大小为791bp的目的条带,表明其TaLox-B1基因的基因型为TaLox-B1a;小麦品种(系)宁冬6号、周麦16、周麦17、西农88、陕354、小偃54、徐州25、西农6028和西农8727经PCR扩增均得到大小为791bp的目的条带,表明其TaLox-B1基因的基因型为TaLox-B1b。实验重复至少两次,结果一致。见图3中C1和C2。
表511份小麦品种(系)面粉色泽相关基因Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1的基因型统计

二、多重PCR扩增小麦品种(系)面粉色泽相关基因Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1
以上述步骤一制备的11份小麦品种(系)的基因组DNA分别为模板,利用表6中的引物对组合物进行多重PCR扩增。
PCR反应总体系为20μL,其中,DNA模板100-200ng,dNTPs在反应总体系中的终浓度为225μM,Taq DNA聚合酶1.5U,各引物在PCR反应总体系中的用量为:引物对6中的序列11和序列12所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的用量均为5pmol(在反应体系中的终浓度均为0.25μM);引物对7中的序列13和序列14所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的用量均为10pmol(在反应体系中的终浓度均为0.5μM);引物对8中的序列15和序列16所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的用量均为10pmol(在反应体系中的终浓度均为0.5μM)。
PCR反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性1min,64℃退火1min,72℃延伸90s,扩增反应进行36个循环;72℃延伸8min;4℃,保温结束。
PCR扩增在2%的琼脂糖凝胶上进行,电泳时的电压为100V,电泳时间为1.5h。
表6面粉色泽相关基因Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1扩增引物序列信息


注:表型为低YP的基因型利于小麦面粉白度的提高,表型为低PPO基因型利于小麦面粉白度的提高,表型为高LOX的基因型利于小麦面粉白度的提高。
结果判定方法:若PCR产物中含有大小为194bp的DNA片段(序列25),则所述待测小麦含有Psy-A1a或Psy-A1c基因;若PCR产物中含有大小为231bp的DNA片段(序列26),则所述待测小麦含有Psy-A1b基因;若PCR产物中不含有大小为791bp的DNA片段,则所述待测小麦含有TaLox-B1a基因;若PCR产物中含有大小为791bp的DNA片段(序列27),则所述待测小麦含有TaLox-B1b基因;若PCR产物中含有大小为571bp的DNA片段(序列28),则所述待测小麦含有Ppo-D1a基因;若PCR产物中不含有大小为571bp的DNA片段,则所述待测小麦含有Ppo-D1b基因。
三、已知基因型小麦品种面粉色泽相关基因Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1的多重PCR扩增结果
电泳结果如图3中D所示:
小麦品种(系)宁冬6号经上述多重PCR扩增后,得到大小为194bp、791bp和571bp的三条带,这说明小麦品种(系)宁冬6号含有Psy-A1a(或Psy-A1c)、TaLox-B1b和Ppo-A1a基因;
小麦品种(系)周麦16经上述多重PCR扩增后,得到大小为194bp、791bp和571bp的三条带,这说明小麦品种(系)周麦16含有Psy-A1a(或Psy-A1c)、TaLox-B1b和Ppo-A1a基因;
小麦品种(系)周麦17经上述多重PCR扩增后,得到大小为194bp、791bp和571bp的三条带,这说明小麦品种(系)周麦17含有Psy-A1a(或Psy-A1c)、TaLox-B1b和Ppo-A1a基因;
小麦品种(系)西农979经上述多重PCR扩增后,得到大小为231bp的一条带(没有得到大小为791bp或571bp的条带),这说明小麦品种(系)西农979含有Psy-A1b、TaLox-B1a和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)西农88经上述多重PCR扩增后,得到大小为231bp和791bp的两条带(没有得到大小为571bp的条带),这说明小麦品种(系)西农88含有Psy-A1b、TaLox-B1b和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)陕354经上述多重PCR扩增后,得到大小为194bp和791bp的两条带(没有得到大小为571bp的条带),这说明小麦品种(系)陕354含有Psy-A1a(或Psy-A1c)、TaLox-B1b和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)小偃54经上述多重PCR扩增后,得到大小为231bp和791bp的两条带(没有得到大小为571bp的条带),这说明小麦品种(系)小偃54含有Psy-A1b、TaLox-B1b和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)徐州25经上述多重PCR扩增后,得到大小为231bp和791bp的两条带 (没有得到大小为571bp的条带),这说明小麦品种(系)徐州25含有Psy-A1b、TaLox-B1b和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)西农6028经上述多重PCR扩增后,得到大小为231bp、791bp和571bp的三条带,这说明小麦品种(系)西农6028含有Psy-A1b、TaLox-B1b和Ppo-A1a基因;
小麦品种(系)西农8727经上述多重PCR扩增后,得到大小为231bp和791bp的两条带(没有得到大小为571bp的条带),这说明小麦品种(系)西农8727含有Psy-A1b、TaLox-B1b和Ppo-A1b基因;
小麦品种(系)西峰27经上述多重PCR扩增后,得到大小为194bp和571bp的两条带(没有得到大小为791bp的条带),这说明小麦品种(系)西峰27含有Psy-A1a(或Psy-A1c)、TaLox-B1a和Ppo-A1a基因。
上述结果与表5完全一致,本发明的发明人进一步将以上各小麦品种(系)的各扩增条带回收后测序,发现各小麦品种(系)扩增所得大小为194bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列25,扩增所得大小为231bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列26,扩增所得大小为791bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列27,扩增所得大小为571bp的DNA片段的核苷酸序列均为序列28,这进一步证实了上述多重PCR结果的准确性。这说明本实施例的多重PCR引物对组能够同时、快速、准确的检测小麦面粉色泽相关基因Psy-A1、TaLox-B1和Ppo-D1三个位点的6种基因型Psy-A1a或Psy-A1c(Psy-A1c极少)、Psy-A1b、TaLox-B1a、TaLox-B1b、Ppo-D1a和Ppo-D1b。这将有利于遴选同时含有Psy-A1b、TaLox-B1a和Ppo-D1a基因型的小麦品种或面粉,进行拉面色泽遗传改良或评价。
对比例1、小麦面粉色泽相关基因Psy-B1和TaZds-A1的多重PCR检测
在本对比例中,以表1中所示的其中7份已知基因型的小麦品种(周麦17、周麦16、宁冬6号、西农88、小偃54、西农979和西农6028)的基因组DNA分别为模板,利用由YP7B-1和YP2A-1标记对应的两个引物对(见表2,即引物对1和引物对3)组成的引物对组进行多重PCR扩增。
PCR反应总体系为20μL,其中,DNA模板100-200ng,dNTPs在反应总体系中的终浓度为160μM,Taq DNA聚合酶1.5U,各引物在PCR反应总体系中的用量为:引物对1中的序列1和序列2所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的含量均为8pmol(在反应体系中的终浓度均为0.4μM);引物对3中的序列5和序列6所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的含量均为8pmol(在反应体系中的终浓度均为0.4μM)。
PCR反应程序为:95℃预变性5min;95℃变性45s,61℃退火45s,72℃延伸30s,扩增反应进行37个循环;72℃延伸10min;4℃,保温结束。
PCR扩增在6%的变性聚丙烯酰胺凝胶上进行,电泳时的电压为2000V,电泳时间为1h。
电泳结果如图4所示,利用上述方法可一次检测出Psy-B1和TaZds-A1两个基因位点的4种基因型Psy-B1a、Psy-B1b、TaZds-A1a和TaZds-A1b,各品种出带结果与单一PCR结果一致,但条带较弱,结果不理想,需进一步对体系进行调试。
对比例2、小麦面粉色泽相关基因TaZds-D1和Ppo-A1的多重PCR检测
在本对比例中,以表3中所示的其中7份已知基因型的小麦品种(宁冬6号、西农979、西农88、周麦16、周麦17、陕354和徐州25)的基因组DNA分别为模板,利用由YP2D-1 和PPO18标记对应的两个引物对(见表4,即引物对4和引物对5)组成的引物对组进行多重PCR扩增。
PCR反应总体系为20μL,其中,DNA模板100-200ng,MasterMix(含有DNA聚合酶、PCR反应缓冲液、4种dNTP)(北京康为世纪生物科技有限公司)10μL(使得20μL的PCR反应体系中每种dNTP的浓度为200μM),各引物在PCR反应总体系中的用量为:引物对4中的序列7和序列8所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的含量均为8pmol(在反应体系中的终浓度均为0.4μM);引物对5中的序列9和序列10所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的含量均为8pmol(在反应体系中的终浓度均为0.4μM)。
PCR反应程序为:95℃预变性5min;95℃变性30s,64℃退火30s,72℃延伸30s,扩增反应进行32个循环;72℃延伸5min;4℃,保温结束。
PCR扩增在2%的琼脂糖凝胶上进行,电泳时的电压为100V,电泳时间为1.5h。
电泳结果如图5所示,对于含有TaZds-D1b基因的小麦品种(系),其扩增出的981bp的目的条带仅隐约可见(图5中白色箭头处),结果不理想,需进一步调试。
对比例3、小麦面粉色泽相关基因Ppo-A1、TaLox-B1和Ppo-D1的多重PCR检测
在本对比例中,以表3和表5中所示的其中5份已知基因型的小麦品种宁冬6号、陕354、西峰27、西农6028、西农979)的基因组DNA分别为模板,利用由STS01、PPO18和LOX18标记对应的三个引物对(见表4和表6,即引物对5、引物对7和引物对8)组成的引物对组进行多重PCR扩增。
PCR反应总体系为20μL,其中,DNA模板100-200ng,dNTPs在反应总体系中的终浓度为225μM,Taq DNA聚合酶1.5U,各引物在PCR反应总体系中的用量为:引物对5中的序列9和序列10所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的含量均为10pmol(在反应体系中的终浓度均为0.5μM);引物对7中的序列13和序列14所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的含量均为10pmol(在反应体系中的终浓度均为0.5μM);引物对8中的序列15和序列16所示的两条DNA单链在PCR反应总体系中的含量均为10pmol(在反应体系中的终浓度均为0.5μM)。
PCR反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性1min,68℃退火1min,每个循环减0.3度,扩增反应进行36个循环;72℃延伸8min;4℃,保温结束。
PCR扩增在2%的琼脂糖凝胶上进行,电泳时的电压为100V,电泳时间为1.5h。
电泳结果如图6所示,对于含有Ppo-A1a基因的小麦品种(系),其扩增出的685bp的目的条带较淡,不易辨出(图6中白色箭头处);另外,在每个品种中都能扩出表示含有Ppo-A1b基因的876bp目的条带(图6中白色箭头处)。分析其原因可能在于PPO18标记与其余标记间有相互作用,故需重新进行引物组合。









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1、(10)申请公布号 CN 103525937 A (43)申请公布日 2014.01.22 CN 103525937 A (21)申请号 201310509511.1 (22)申请日 2013.10.24 C12Q 1/68(2006.01) C12N 15/11(2006.01) (71)申请人 新疆农垦科学院 地址 832000 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市 石河子乌伊公路 221 号 (72)发明人 穆培源 张晓科 相吉山 徐红军 张钰玉 桑伟 韩新年 聂迎彬 崔凤娟 邹波 (74)专利代理机构 北京纪凯知识产权代理有限 公司 11245 代理人 关畅 (54) 发明名称 用于鉴定小麦面粉。

2、色泽相关基因的 PCR 体系 (57) 摘要 本发明公开了一种用于鉴定或辅助鉴定面粉 色泽相关基因的 PCR 体系及其应用。本发明所提 供的 PCR 体系中的引物对组为如下任一 : 1) 引物 对组 A、 引物对组 B 和引物对组 C ; 2) 引物对组 A 和引物对组 C ; 3) 引物对组 C ; 引物对组 A 由引物 对 1(序列 1 和序列 2) 、 引物对 2(序列 3 和序列 4) 和引物对 3(序列 5 和序列 6) 组成 ; 引物对组 B 由引物对 4(序列 7 和序列 8) 和引物对 5(序列 9 和序列 10) 组成 ; 引物对组 C 由引物对 6(序列 11 和序列 12。

3、) 、 引物对 7(序列 13 和序列 14) 和 引物对 8(序列 15 和序列 16) 组成。这些引物对 组各引物间不存在抑制和错配, 实现同一温度一 次 PCR 完成一组基因的鉴别, 且结果可靠、 特异性 强。本发明为小麦色泽品质育种提供参考。 (51)Int.Cl. 权利要求书 3 页 说明书 18 页 序列表 10 页 附图 4 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 权利要求书3页 说明书18页 序列表10页 附图4页 (10)申请公布号 CN 103525937 A CN 103525937 A 1/3 页 2 1. 用于鉴定或辅助鉴定待测小麦面粉色泽相关。

4、基因的多重 PCR 引物对组, 所述面粉 色泽相关基因为 Psy-B1 基因、 TaZds-A1 基因、 TaZds-D1 基因、 Ppo-A1 基因、 Psy-A1 基因、 TaLox-B1 基因和 Ppo-D1 基因, 其特征在于 : 所述多重 PCR 引物对组由引物对组 A、 引物对 组 B 和引物对组 C 组成 ; 所述引物对组 A 由特异于所述 Psy-B1 基因的两个引物对, 和特异 于所述 TaZds-A1 基因的一个引物对组成 ; 所述引物对组 B 由特异于所述 TaZds-D1 基因的 一个引物对, 和特异于所述 Ppo-A1 基因的一个引物对组成 ; 所述引物对组 C 由特。

5、异于所述 Psy-A1基因的一个引物对、 特异于所述TaLox-B1基因的一个引物对, 和特异于所述Ppo-D1 基因的一个引物对组成 ; 所述引物对组 A 中, 所述特异于所述 Psy-B1 基因的两个引物对分别为序列表中序列 1 和序列 2 所示的两条单链 DNA 组成的引物对 1, 以及序列 3 和序列 4 所示的两条单链 DNA 组 成的引物对 2 ; 所述特异于所述 TaZds-A1 基因的一个引物对为序列表中序列 5 和序列 6 所 示的两条单链 DNA 组成的引物对 3 ; 所述引物对组 B 中, 所述特异于所述 TaZds-D1 基因的一个引物对为序列表中序列 7 和 序列 8。

6、 所示的两条单链 DNA 组成的引物对 4 ; 所述特异于所述 Ppo-A1 基因的一个引物对为 序列表中序列 9 和序列 10 所示的两条单链 DNA 组成的引物对 5 ; 所述引物对组 C 中, 所述特异于所述 Psy-A1 基因的一个引物对为序列表中序列 11 和 序列12所示的两条单链DNA组成的引物对6 ; 所述特异于所述TaLox-B1基因的一个引物对 为序列表中序列13和序列14所示的两条单链DNA组成的引物对7 ; 所述特异于所述Ppo-D1 基因的一个引物对为序列表中序列 15 和序列 16 所示的两条单链 DNA 组成的引物对 8。 2.用于鉴定或辅助鉴定待测小麦面粉色泽相。

7、关基因的多重PCR引物对组, 为下述1) 或 2) : 1) 由权利要求 1 中的所述引物对组 A 和所述引物对组 C 组成的引物对组 ; 2) 为权利要求 1 中的所述引物对组 C。 3. 根据权利要求 1 或 2 所述的引物对组, 其特征在于 : 所述引物对组 A 中每个引物对 的两条引物在 PCR 反应体系中等量使用, 且所述引物对 1, 所述引物对 2 和所述引物对 3 在 PCR反应体系中的摩尔比为6:6:5 ; 所述特异引物对组B中每个引物对的两条引物在PCR反 应体系中等量使用, 且所述引物对 4 和所述引物对 5 在 PCR 反应体系中的摩尔比为 12:6 ; 所述引物对组 C。

8、 中每个引物对的两条引物在 PCR 反应体系中等量使用, 且所述引物对 6、 所 述引物对 7 和所述引物对 8 在 PCR 反应体系中的摩尔比为 5:10:10。 4. 含有权利要求 1-3 中任一所述引物对组的试剂盒。 5. 权利要求 1-3 中任一所述引物对组的制备方法, 其特征在于 : 所述制备方法包括将 权利要求 1-3 中任一所述引物对组中各引物对的所述两条单链 DNA 分别单独包装的步骤。 6. 权利要求 4 所述试剂盒的制备方法, 包括如下步骤 : 将权利要求 1-3 中任一所述的 引物对组中各引物对的所述两条单链 DNA 分别单独包装后, 与下述物质中的至少一种包装 在同一试。

9、剂盒内 : PCR 反应缓冲液、 DNA 聚合酶和 4 种 dNTP。 7. 下述 a1) 或 a2) 或 a3) 的方法 : a1) 鉴定或辅助鉴定待测小麦含有Psy-B1a、 Psy-B1b和Psy-B1c这三种基因中哪一种, 含有 TaZds-A1a 和 TaZds-A1b 这两种基因中哪一种, 含有 TaZds-D1a 和 TaZds-D1b 这两种 基因中哪一种, 含有 Ppo-A1a 基因和 Ppo-A1b 基因这两种基因中哪一种 ; 含有 Psy-A1a 或 权 利 要 求 书 CN 103525937 A 2 2/3 页 3 Psy-A1c 基因还是含有 Psy-A1b 基因,。

10、 含有 TaLox-B1a 和 TaLox-B1b 这两种基因中哪一种, 以及含有 Ppo-D1a 和 Ppo-D1b 这两种基因中哪一种 ; a2) 鉴定或辅助鉴定待测小麦含有Psy-B1a、 Psy-B1b和Psy-B1c这三种基因中哪一种, 以及含有TaZds-A1a和TaZds-A1b这两种基因中哪一种 ; 含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是 含有 Psy-A1b 基因, 含有 TaLox-B1a 和 TaLox-B1b 这两种基因中哪一种, 以及含有 Ppo-D1a 和 Ppo-D1b 这两种基因中哪一种 ; a3) 鉴定或辅助鉴定待测小麦含有 Psy-A1a 或 Psy-A。

11、1c 基因还是含有 Psy-A1b 基因, 含 有 TaLox-B1a 和 TaLox-B1b 这两种基因中哪一种, 以及含有 Ppo-D1a 和 Ppo-D1b 这两种基 因中哪一种 ; 其特征在于 : 所述 a1) 的方法包括下述 (1) 和 (2) 的步骤 : 所述 (1) 为如下 b1) 和 b2) : b1) 以待测小麦的基因组DNA为模板, 用权利要求1-3中任一所述引物对组中的所述引 物对组 A 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 59 ; b2) 以待测小麦的基因组 DNA 为模板, 用权利要求 1 或 3 所述引物对组中所述引物对组 B 进行 PCR 反应,。

12、 所述 PCR 反应的退火温度为 62 ; b3) 以待测小麦的基因组DNA为模板, 用权利要求1-3中任一所述引物对组中所述引物 对组 C 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 64 ; (2) 检测步骤 (1) 得到的 PCR 产物的大小, 按照如下方法根据 PCR 产物确定所述待测小 麦含有 Psy-B1a、 Psy-B1b 和 Psy-B1c 这三种基因中哪一种, 含有 TaZds-A1a 和 TaZds-A1b 这两种基因中哪一种, 含有 TaZds-D1a 和 TaZds-D1b 这两种基因中哪一种, 含有 Ppo-A1a 基 因和 Ppo-A1b 基因这两种基因中。

13、哪一种, 含有 Psy-A1a 或 Psy-A1c 基因还是含有 Psy-A1b 基因, 含有 TaLox-B1a 和 TaLox-B1b 这两种基因中哪一种, 以及含有 Ppo-D1a 和 Ppo-D1b 这 两种基因中哪一种 : 以所述引物对组 A 进行 PCR 反应的产物中, 若含有大小为 151bp 的 DNA 片段, 则所述待 测小麦含有 Psy-B1a 基因或候选含有 Psy-B1a 基因 ; 若含有大小为 156bp 的 DNA 片段, 则所 述待测小麦含有 Psy-B1b 基因或候选含有 Psy-B1b 基因 ; 若含有大小为 428bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有。

14、Psy-B1c基因或候选含有Psy-B1c基因 ; 若含有大小为183bp的DNA片 段, 则所述待测小麦含有 TaZds-A1a 基因或候选含有 TaZds-A1a 基因 ; 若含有大小为 179bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 TaZds-A1b 基因或候选含有 TaZds-A1b 基因 ; 以所述引物对组 B 的进行 PCR 反应的产物中, 若不含有大小为 981bp 的 DNA 片段, 则所 述待测小麦含有TaZds-D1a基因或候选含有TaZds-D1a基因 ; 若含有大小为981bp的DNA片 段, 则所述待测小麦含有 TaZds-D1b 基因或候选含有 TaZds-D。

15、1b 基因 ; 若含有大小为 685bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 Ppo-A1a 基因或候选含有 Ppo-A1a 基因 ; 若含有大小为 876bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 Ppo-A1b 基因或候选含有 Ppo-A1b 基因 ; 以所述引物对组 C 的进行 PCR 反应的产物中, 若含有大小为 194bp 的 DNA 片段, 则所述 待测小麦含有 Psy-A1a 或 Psy-A1c 基因或候选含有 Psy-A1a 或 Psy-A1c 基因 ; 若含有大小 为 231bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 Psy-A1b 基因或候选含有 Psy-A1b 基。

16、因 ; 若不含 有大小为 791bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 TaLox-B1a 基因或候选含有 TaLox-B1a 基因 ; 若含有大小为 791bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 TaLox-B1b 基因或候选含有 权 利 要 求 书 CN 103525937 A 3 3/3 页 4 TaLox-B1b 基因 ; 若含有大小为 571bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 Ppo-D1a 基因或候 选含有 Ppo-D1a 基因 ; 若不含有大小为 571bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 Ppo-D1b 基 因或候选含有 Ppo-D1b 基因 ; 。

17、所述 a2) 的方法包括下述 (3) 和 (4) 的步骤 : 所述 (3) 为如下 c1) 和 c2) : c1) 以待测小麦的基因组DNA为模板, 用权利要求1-3中任一所述引物对组中的所述引 物对组 A 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 59 ; c2) 以待测小麦的基因组DNA为模板, 用权利要求1-3中任一所述引物对组中所述引物 对组 C 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 64 ; (4) 检测步骤 (3) 得到的 PCR 产物的大小, 所述检测步骤 (3) 得到的 PCR 产物的大小的 方法同步骤 (2) ; 所述 a3) 的方法包括下述 (5。

18、) 和 (6) 的步骤 : (5) 以待测小麦的基因组 DNA 为模板, 用所述引物对组中所述引物对组 C 进行 PCR 反 应, 所述 PCR 反应的退火温度为 64 ; (6) 检测步骤 (5) 得到的 PCR 产物的大小, 所述检测步骤 (5) 得到的 PCR 产物的大小的 方法同步骤 (2) 。 8. 根据权利要求 7 所述的方法, 其特征在于 : 所述大小为 151bp 的 DNA 片段的核苷酸 序列如序列表中序列17所示 ; 所述大小为156bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列 18 所示 ; 所述大小为 428bp 的 DNA 片段的核苷酸序列如序列表中序列 19 所示 ;。

19、 所述大小为 183bp 的 DNA 片段的核苷酸序列如序列表中序列 20 所示 ; 所述大小为 179bp 的 DNA 片段的 核苷酸序列如序列表中序列21所示 ; 所述大小为981bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表 中序列22所示 ; 所述大小为685bp的DNA片段的核苷酸序列如序列表中序列23所示 ; 所述 大小为 876bp 的 DNA 片段的核苷酸序列如序列表中序列 24 所示 ; 所述大小为 194bp 的 DNA 片段的核苷酸序列如序列表中序列25所示 ; 所述大小为231bp的DNA片段的核苷酸序列如 序列表中序列 26 所示 ; 所述大小为 791bp 的 DNA 片段的。

20、核苷酸序列如序列表中序列 27 所 示 ; 所述大小为 571bp 的 DNA 片段的核苷酸序列如序列表中序列 28 所示。 9. 一种培育面粉白度提高的小麦品种的方法, 包括采用通过权利要求 7 的方法鉴定得 到的如下 a) -g) 中至少一种的小麦作为亲本进行育种的步骤 : a) 含有或候选含有 Psy-B1b 基因 ; b) 含有或候选含有 TaZds-A1a 基因 ; c) 含有或候选含有 TaZds-D1b 基因 ; d) 含有或候选含有 Ppo-A1b 基因 ; e) 含有或候选含有 Psy-A1b 基因 ; f) 含有或候选含有 TaLox-B1a 基因 ; g) 含有或候选含有。

21、 Ppo-D1a 基因。 权 利 要 求 书 CN 103525937 A 4 1/18 页 5 用于鉴定小麦面粉色泽相关基因的 PCR 体系 技术领域 0001 本发明涉及一种用于鉴定或辅助鉴定面粉色泽相关基因的 PCR 体系及其应用, 特 别涉及一种用于鉴定或辅助鉴定待测新疆冬小麦的面粉色泽相关基因如 Psy-A1、 TaLox-B1 和 Ppo-D1 的多重 PCR 引物对组、 试剂盒及其应用。 背景技术 0002 小麦面制食品作为我国人民最重要的主食之一, 为我国以面食为主地区的人民提 供 50-80% 以上的能量来源。随着社会生活水平不断提高, 人们对小麦面制品品质的要求越 来越高,。

22、 品质育种也越来越受到重视。 中国作为小麦最大的生产国和消费国, 每年仅用来生 产面条的小麦量约占小麦总消费量的 40%。而面条、 馒头、 饺子等我国传统的蒸煮类面制食 品, 色泽越白越受到我国消费者青睐。因此, 在我国传统面制品的感官评价体系中, 面制品 的色泽占很大的比例, 越白评分越高。然而, 目前我国主栽小麦品种的面粉平均白度较低 (74.8) , 不能满足市场和消费者对面粉白度 (80.0 以上) 的要求。在 2005 年前, 大多数面粉 厂为满足消费者对面粉白度的要求, 向面粉中添加过氧化苯甲酰 (BPO) 。 但BPO会破坏营养 物质且对人类健康构成威胁, 在国家最新修订的小麦粉。

23、标准中, 已明确规定禁止使用 BPO。 因此制订育种目标, 选育出自然白的小麦具有重要意义。 同时, 亮黄色的面粉也有一定的消 费量, 如黄碱面条、 乌冬面、 意大利面等也很受欢迎。因此, 根据不同的加工目的, 分别需要 选育适合加工高白度或亮黄色面粉的小麦新品种。 0003 除了环境、 增白剂、 加工方式和栽培措施等外, 小麦面粉及面制品颜色的形成主要 受色素类物质和氧化还原酶类等遗传物质的影响。色素类物质主要包括黄色素 (Yellow pigment, YP) 和棕色素 (Brown pigment) , 黄色素主要由类胡萝卜素 (Carotenoid) 和类黄 酮 (Flavonoid)。

24、 组成, 面粉中的氧化酶类主要包括多酚氧化酶 (Polyphenol oxidase, PPO) 、 脂肪氧化酶 (Lipoxygenase, LOX) 和过氧化物酶 (Peroxidase, POD) 。YP 含量、 LOX 及 PPO 活性对面粉及面制品的色泽有重要影响。 YP含量与面团黄度的相关系数高达0.8-0.9 ; LOX 可催化多不饱和脂肪酸加氧形成过氧化物, 反应所释放的氧自由基进一步氧化色素分子, 使面粉变白 ; PPO 在氧分子的参与下可催化单酚类物质最终变为氧合醌, 生成褐色物质, 决 定面粉及面制品加工和贮存过程中色泽褐变的 50-70%。当需要自然白小麦时, 应选择含。

25、低 YP 含量基因型、 高 LOX 活性基因型及低 PPO 活性基因型的小麦品种 (系) 。 0004 多重 PCR 是一种高效、 低成本的检测方法, 已成为研究的热点。虽然已经报道了数 套与小麦面粉色泽基因相关的多重PCR体系, 但仅涉及到PPO活性基因的Ppo-A1和Ppo-D1 位点, 或 PSY 活性基因的 Psy-A1 位点, 还未见到检测 PSY 活性基因的 Psy-B1 位点、 ZDS 活 性基因的 TaZds-A1 和 TaZds-D1 位点, 以及 LOX 活性基因 TaLox-B1 位点的多重 PCR 体系的 报道。 发明内容 0005 本发明的目的是提供一种用于鉴定或辅助。

26、鉴定面粉色泽相关基因的 PCR 体系 说 明 书 CN 103525937 A 5 2/18 页 6 及其应用, 特别涉及一种用于鉴定或辅助鉴定待测新疆冬小麦的面粉色泽相关基因如 Psy-A1、 TaLox-B1 和 Ppo-D1 的多重 PCR 引物对组、 试剂盒及其应用。 0006 本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定待测小麦拉面品质性状相关基因的多重 PCR 引物对组为如下 a1) 或 a2) 或 a3) 的引物对组 : 0007 a1) 由引物对组 A、 引物对组 B 和引物对组 C 组成的引物对组 ; 0008 a2) 由引物对组 A 和引物对 C 组成的引物对组 ; 0009 a3) 。

27、引物对组 C ; 0010 所述面粉色泽相关基因为 Psy-B1 基因、 TaZds-A1 基因、 TaZds-D1 基因、 Ppo-A1 基 因、 Psy-A1 基因、 TaLox-B1 基因和 Ppo-D1 基因。 0011 所述引物对组A由特异于所述Psy-B1基因的两个引物对, 和特异于所述TaZds-A1 基因的一个引物对组成 ; 具体的, 所述特异于所述 Psy-B1 基因的两个引物对分别为序列表 中序列 1 和序列 2 所示的两条单链 DNA 组成的引物对 1, 以及序列 3 和序列 4 所示的两条单 链 DNA 组成的引物对 2 ; 所述特异于所述 TaZds-A1 基因的一个。

28、引物对为序列表中序列 5 和 序列 6 所示的两条单链 DNA 组成的引物对 3 ; 0012 所述引物对组B由特异于所述TaZds-D1基因的一个引物对, 和特异于所述Ppo-A1 基因的一个引物对组成 ; 具体的, 所述特异于所述 TaZds-D1 基因的一个引物对为序列表中 序列 7 和序列 8 所示的两条单链 DNA 组成的引物对 4 ; 所述特异于所述 Ppo-A1 基因的一个 引物对为序列表中序列 9 和序列 10 所示的两条单链 DNA 组成的引物对 5 ; 0013 所述引物对组 C 由特异于所述 Psy-A1 基因的一个引物对、 特异于所述 TaLox-B1 基因的一个引物对。

29、, 和特异于所述 Ppo-D1 基因的一个引物对组成 ; 具体的, 所述特异于所 述 Psy-A1 基因的一个引物对为序列表中序列 11 和序列 12 所示的两条单链 DNA 组成的引 物对 6 ; 所述特异于所述 TaLox-B1 基因的一个引物对为序列表中序列 13 和序列 14 所示的 两条单链 DNA 组成的引物对 7 ; 所述特异于所述 Ppo-D1 基因的一个引物对为序列表中序列 15 和序列 16 所示的两条单链 DNA 组成的引物对 8。 0014 其中, 序列 1 由 21 个核苷酸组成 ; 序列 2 由 20 个核苷酸组成 ; 序列 3 由 21 个核苷 酸组成 ; 序列 。

30、4 由 20 个核苷酸组成 ; 序列 5 由 21 个核苷酸组成 ; 序列 6 由 24 个核苷酸组 成 ; 序列 7 由 21 个核苷酸组成 ; 序列 8 由 23 个核苷酸组成 ; 序列 9 由 21 个核苷酸组成 ; 序 列 10 由 20 个核苷酸组成 ; 序列 11 由 20 个核苷酸组成 ; 序列 12 由 22 个核苷酸组成 ; 序列 13 由 23 个核苷酸组成 ; 序列 14 由 16 个核苷酸组成 ; 序列 15 由 18 个核苷酸组成 ; 序列 16 由 20 个核苷酸组成。 0015 本发明中, 所述 Psy-B1 基因涉及三个等位基因, 分别是 Psy-B1a、 Ps。

31、y-B1b 和 Psy-B1c ; 所述 TaZds-A1 基因涉及两个等位基因, 分别是 TaZds-A1a 和 TaZds-A1b ; 所述 TaZds-D1 基因涉及两个等位基因, 分别是 TaZds-D1a 和 TaZds-D1b ; 所述 Ppo-A1 基因涉及 两个等位基因, 分别是 Ppo-A1a 和 Ppo-A1b ; 所述 Psy-A1 基因涉及三个等位基因, 分别是 Psy-A1a、 Psy-A1b和Psy-A1c ; 所述TaLox-B1基因涉及两个等位基因, 分别是TaLox-B1a和 TaLox-B1b ; 所述 Ppo-D1 基因涉及两个等位基因, 分别是 Ppo-。

32、D1a 和 Ppo-D1b。 0016 所述引物对组 A 中每个引物对的两条引物在 PCR 反应体系中等量使用, 且所述引 物对 1, 所述引物对 2 和所述引物对 3 在 PCR 反应体系中的摩尔比为 6:6:5 ; 所述引物对组 B中每个引物对的两条引物在PCR反应体系中等量使用, 且所述引物对4和所述引物对5在 说 明 书 CN 103525937 A 6 3/18 页 7 PCR 反应体系中的摩尔比为 12:6 ; 所述引物对组 C 中每个引物对的两条引物在 PCR 反应体 系中等量使用, 且所述引物对 6、 所述引物对 7 和所述引物对 8 在 PCR 反应体系中的摩尔比 为 5:1。

33、0:10。 0017 具体的, 所述引物对组 A 中, 所述引物对 1 中的序列 1 和序列 2 所示的两条 DNA 单 链在所述 PCR 反应体系中的终浓度均为 0.3M ; 所述引物对 2 中的序列 3 和序列 4 所示的 两条 DNA 单链在所述 PCR 反应体系中的终浓度均为 0.3M ; 所述引物对 3 中的序列 5 和序 列 6 所示的两条 DNA 单链在所述 PCR 反应体系中的终浓度均为 0.25M。所述引物对组 B 中, 所述引物对 4 中的序列 7 和序列 8 所示的两条 DNA 单链在所述 PCR 反应体系中的终浓 度均为0.6M ; 所述引物对5中的序列9和序列10所示。

34、的两条DNA单链在所述PCR反应体 系中的终浓度均为 0.3M ; 所述引物对组 C 中, 所述引物对 6 中的序列 11 和序列 12 所示 的两条 DNA 单链在所述 PCR 反应体系中的终浓度均为 0.25M ; 所述引物对 7 中的序列 13 和序列 14 所示的两条 DNA 单链在所述 PCR 反应体系中的终浓度均为 0.5M ; 所述引物对 8 中的序列 15 和序列 16 所示的两条 DNA 单链在所述 PCR 反应体系中的终浓度均为 0.5M。 0018 含有所述引物对组的试剂盒也属于本发明的保护范围。 0019 所述引物对组的制备方法也属于本发明的保护范围。 0020 所述引。

35、物对组的制备方法, 具体可包括将所述引物对组中各引物对的所述两条单 链 DNA 分别单独包装的步骤。 0021 所述试剂盒的制备方法也属于本发明的保护范围。 0022 所述试剂盒的制备方法, 具体可包括如下步骤 : 将所述引物对组中各引物对的所 述两条单链 DNA 分别单独包装后, 与下述物质中的至少一种包装在同一试剂盒内 : PCR 反应 缓冲液、 DNA 聚合酶和 4 种 dNTP。 0023 下述 a1) 或 a2) 或 a3) 的方法也属于本发明的保护范围 : 0024 a1) 鉴定或辅助鉴定待测小麦含有 Psy-B1a、 Psy-B1b 和 Psy-B1c 这三种基因中哪 一种, 含。

36、有 TaZds-A1a 和 TaZds-A1b 这两种基因中哪一种, 含有 TaZds-D1a 和 TaZds-D1b 这 两种基因中哪一种, 含有 Ppo-A1a 基因和 Ppo-A1b 基因这两种基因中哪一种 ; 含有 Psy-A1a 或 Psy-A1c 基因还是含有 Psy-A1b 基因, 含有 TaLox-B1a 和 TaLox-B1b 这两种基因中哪一 种, 以及含有 Ppo-D1a 和 Ppo-D1b 这两种基因中哪一种 ; 0025 a2) 鉴定或辅助鉴定待测小麦含有 Psy-B1a、 Psy-B1b 和 Psy-B1c 这三种基因中哪 一种, 以及含有 TaZds-A1a 和 。

37、TaZds-A1b 这两种基因中哪一种 ; 含有 Psy-A1a 或 Psy-A1c 基 因还是含有 Psy-A1b 基因, 含有 TaLox-B1a 和 TaLox-B1b 这两种基因中哪一种, 以及含有 Ppo-D1a 和 Ppo-D1b 这两种基因中哪一种 ; 0026 a3) 鉴定或辅助鉴定待测小麦含有 Psy-A1a 或 Psy-A1c 基因还是含有 Psy-A1b 基 因, 含有 TaLox-B1a 和 TaLox-B1b 这两种基因中哪一种, 以及含有 Ppo-D1a 和 Ppo-D1b 这两 种基因中哪一种 ; 0027 所述 a1) 的方法包括下述 (1) 和 (2) 的步骤。

38、 : 0028 所述 (1) 为如下 b1) 、 b2) 和 b3) : 0029 b1) 以待测小麦的基因组 DNA 为模板, 用所述引物对组中的所述引物对组 A 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 59 ; 0030 在本发明中, 所述 PCR 反应的程序具体为 : 95预变性 5min ; 95变性 45s, 59 说 明 书 CN 103525937 A 7 4/18 页 8 退火 45s, 72延伸 30s, 扩增反应进行 35 个循环 ; 72延伸 10min ; 4, 保温结束。 0031 b2) 以待测小麦的基因组 DNA 为模板, 用所述引物对组中所述引物对。

39、组 B 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 62 ; 0032 在本发明中, 所述 PCR 反应的程序具体为 : 95预变性 5min ; 95变性 30s, 62 退火 30s, 72延伸 70s, 扩增反应进行 34 个循环 ; 72延伸 5min ; 4, 保温结束。 0033 b3) 以待测小麦的基因组 DNA 为模板, 用所述引物对组中所述引物对组 C 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 64 ; 0034 在本发明中, 所述 PCR 反应的程序具体为 : 95预变性 5min ; 94变性 1min, 64 退火 1min, 72延伸 90s, 。

40、扩增反应进行 36 个循环 ; 72延伸 8min ; 4, 保温结束。 0035 (2)检测步骤 (1)得到的 PCR 产物的大小, 按照如下方法根据 PCR 产物确定所 述待测小麦含有 Psy-B1a、 Psy-B1b 和 Psy-B1c 这三种基因中哪一种, 含有 TaZds-A1a 和 TaZds-A1b 这两种基因中哪一种, 含有 TaZds-D1a 和 TaZds-D1b 这两种基因中哪一种, 以及 含有Ppo-A1a基因和Ppo-A1b基因这两种基因中哪一种, 含有Psy-A1a或Psy-A1c基因还是 含有 Psy-A1b 基因, 含有 TaLox-B1a 和 TaLox-B1。

41、b 这两种基因中哪一种, 以及含有 Ppo-D1a 和 Ppo-D1b 这两种基因中哪一种 : 0036 以所述引物对组 A 进行 PCR 反应的产物中, 若含有大小为 151bp 的 DNA 片段, 则所 述待测小麦含有 Psy-B1a 基因或候选含有 Psy-B1a 基因 ; 若含有大小为 156bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 Psy-B1b 基因或候选含有 Psy-B1b 基因 ; 若含有大小为 428bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有Psy-B1c基因或候选含有Psy-B1c基因 ; 若含有大小为183bp的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 TaZds-A1。

42、a 基因或候选含有 TaZds-A1a 基因 ; 若含有大小为 179bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 TaZds-A1b 基因或候选含有 TaZds-A1b 基因 ; 0037 以所述引物对组 B 的进行 PCR 反应的产物中, 若不含有大小为 981bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 TaZds-D1a 基因或候选含有 TaZds-D1a 基因 ; 若含有大小为 981bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 TaZds-D1b 基因或候选含有 TaZds-D1b 基因 ; 若含有大小为 685bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 Ppo-A1a 基因或候。

43、选含有 Ppo-A1a 基因 ; 若含有大 小为 876bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 Ppo-A1b 基因或候选含有 Ppo-A1b 基因 ; 0038 以所述引物对组 C 的进行 PCR 反应的产物中, 若含有大小为 194bp 的 DNA 片段, 则 所述待测小麦含有 Psy-A1a 或 Psy-A1c 基因或候选含有 Psy-A1a 或 Psy-A1c 基因 (Psy-A1c 基因极少) ; 若含有大小为 231bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 Psy-A1b 基因或候选 含有 Psy-A1b 基因 ; 若不含有大小为 791bp 的 DNA 片段, 则所述待。

44、测小麦含有 TaLox-B1a 基因或候选含有 TaLox-B1a 基因 ; 若含有大小为 791bp 的 DNA 片段, 则所述待测小麦含有 TaLox-B1b 基因或候选含有 TaLox-B1b 基因 ; 若含有大小为 571bp 的 DNA 片段, 则所述待测 小麦含有 Ppo-D1a 基因或候选含有 Ppo-D1a 基因 ; 若不含有大小为 571bp 的 DNA 片段, 则所 述待测小麦含有 Ppo-D1b 基因或候选含有 Ppo-D1b 基因。 0039 所述 a2) 的方法包括下述 (3) 和 (4) 的步骤 : 0040 所述 (3) 为如下 c1) 和 c2) : 0041 。

45、c1) 以待测小麦的基因组 DNA 为模板, 用所述引物对组中的所述引物对组 A 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 59 ; 0042 在本发明中, 所述 PCR 反应的程序具体为 : 95预变性 5min ; 95变性 45s, 59 说 明 书 CN 103525937 A 8 5/18 页 9 退火 45s, 72延伸 30s, 扩增反应进行 35 个循环 ; 72延伸 10min ; 4, 保温结束。 0043 c2) 以待测小麦的基因组 DNA 为模板, 用所述引物对组中所述引物对组 C 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 64 ; 0044 在。

46、本发明中, 所述 PCR 反应的程序具体为 : 95预变性 5min ; 94变性 1min, 64 退火 1min, 72延伸 90s, 扩增反应进行 36 个循环 ; 72延伸 8min ; 4, 保温结束 ; 0045 (4) 检测步骤 (3) 得到的 PCR 产物的大小, 所述检测步骤 (3) 得到的 PCR 产物的大 小的方法同步骤 (2) 。 0046 所述 a3) 的方法包括下述 (5) 和 (6) 的步骤 : 0047 (5) 以待测小麦的基因组 DNA 为模板, 用所述引物对组中所述引物对组 C 进行 PCR 反应, 所述 PCR 反应的退火温度为 64 ; 0048 在本发。

47、明中, 所述 PCR 反应的程序具体为 : 95预变性 5min ; 94变性 1min, 64 退火 1min, 72延伸 90s, 扩增反应进行 36 个循环 ; 72延伸 8min ; 4, 保温结束 ; 0049 (6) 检测步骤 (5) 得到的 PCR 产物的大小, 所述检测步骤 (5) 得到的 PCR 产物的大 小的方法同步骤 (2) 。 0050 在上述方法中, 所述大小为 151bp 的 DNA 片段的核苷酸序列具体如序列表中序列 17 所示 ; 所述大小为 156bp 的 DNA 片段的核苷酸序列具体如序列表中序列 18 所示 ; 所述大 小为 428bp 的 DNA 片段的。

48、核苷酸序列具体如序列表中序列 19 所示 ; 所述大小为 183bp 的 DNA 片段的核苷酸序列具体如序列表中序列 20 所示 ; 所述大小为 179bp 的 DNA 片段的核苷 酸序列具体如序列表中序列21所示 ; 所述大小为981bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序 列表中序列 22 所示 ; 所述大小为 685bp 的 DNA 片段的核苷酸序列具体如序列表中序列 23 所示 ; 所述大小为 876bp 的 DNA 片段的核苷酸序列具体如序列表中序列 24 所示 ; 所述大小 为 194bp 的 DNA 片段的核苷酸序列具体如序列表中序列 25 所示 ; 所述大小为 231bp 的 DN。

49、A 片段的核苷酸序列如序列表中序列26所示 ; 所述大小为791bp的DNA片段的核苷酸序列具 体如序列表中序列27所示 ; 所述大小为571bp的DNA片段的核苷酸序列具体如序列表中序 列 28 所示。 0051 在本发明的一个实施例中, 用所述引物对组中的所述引物对组 A 进行 PCR 反应的 反应体系中, 作为模板的所述待测小麦的基因组 DNA 的量为 100-200ng, dNTPs 的终浓度为 200M, DNA 聚合酶的量为 1.5U。PCR 反应程序具体为 : 95预变性 5min ; 95变性 45s, 59退火 45s, 72延伸 30s, 扩增反应进行 35 个循环 ; 72延伸 10min ; 4, 保温结束。 0052 在本发明的一个实施例中, 用所述引物对组中的所述引物对组 B 进行 PCR 反应的 反应体系中, 作为模板的所述待测小麦的基因组 DNA 的量为 100-200ng, dNTPs 的终浓度为 200M。PCR 反。

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