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1、(10)申请公布号 CN 103540651 A (43)申请公布日 2014.01.29 CN 103540651 A (21)申请号 201210241611.6 (22)申请日 2012.07.12 C12Q 1/68(2006.01) C12Q 1/44(2006.01) G01N 33/53(2006.01) A61K 45/00(2006.01) A61P 43/00(2006.01) (71)申请人 中国科学院上海应用物理研究所 地址 201800 上海市嘉定区嘉罗公路 2019 号 (72)发明人 樊春海 裴昊 黄庆 (74)专利代理机构 上海一平知识产权代理有限 公司 312。
2、66 代理人 祝莲君 赵向辉 (54) 发明名称 一种纳米金复合物及其制备和应用 (57) 摘要 本发明涉及一种纳米金复合物及其制备和应 用。 具体地, 本发明提供的纳米金复合物包括纳米 金颗粒和功能分子, 并且所述的功能分子通过富 含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区结 合于纳米金颗粒表面。所述的功能分子具有富含 腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区、 功 能区、 和位于结合区与功能区之间的过渡区。本 发明还提供了所述纳米金复合物的制备方法及应 用。 (51)Int.Cl. 权利要求书 3 页 说明书 21 页 序列表 4 页 附图 8 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12。
3、)发明专利申请 权利要求书3页 说明书21页 序列表4页 附图8页 (10)申请公布号 CN 103540651 A CN 103540651 A 1/3 页 2 1. 一种纳米金复合物, 其特征在于, 所述复合物包括纳米金颗粒和功能分子, 并且所述 的功能分子通过富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区结合于纳米金颗粒的表 面。 2. 如权利要求 1 所述的纳米金复合物, 其特征在于, 所述的功能分子具有式 I- 式 III 任一所示结构 : B-L-R I ; R-L-B-L-R II ; (B-L-R-L-B)m III ; 式中, B 表示富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区 。
4、; R 表示功能区 ; L 表示位于 B 和 R 之间的任选的过渡区 ; m 为选自 1-20 的整数 ; 或优选地, 所述的富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区具有选自下组的一个或多个 特征 : (i) 结合区的长度为 5-100 个碱基, 较佳地 5-40 个碱基, 更佳地 10-30 个碱基 ; (ii) 结合区含有一个或多个 poly(A)n 区段, 其中 n 为选自 1-100 的整数, 较佳地 n 为 选自 2-30 的整数, 更佳地 n 为选自 3-20 的整数 ; (iii) 结合区中 A 碱基的含量 70%, 较佳地 80%, 更佳地 90%, 最佳地 95%, 或为 。
5、100% ; (iv)结合区中T碱基和U碱基的总量20%, 较佳地10%, 更佳地5%, 最佳地0% ; 或较佳地, 所述的过渡区由选自下组的成分组成 : 寡核苷酸、 多肽、 高分子链、 小分子、 或其组合 ; 或优选地, 所述的功能区为修饰或未修饰的、 以及标记或未标记的选自下组的分子 (moiety) : 核 酸、 核酸适配体、 核酶 (DNAzyme 或 RNAzyme)、 蛋白质、 多肽、 抗体、 探针、 酶、 凝集素、 配体、 小 分子、 胆固醇。 3. 如权利要求 1 所述的纳米金复合物, 其特征在于, 所述的纳米金颗粒具有选自下组 的一个或多个特征 : (1) 纳米金颗粒的平均粒。
6、径为 1-150nm, 较佳地为 5-100nm, 更佳地 5-20nm ; (2) 在纳米金颗粒中, 80% 以上 ( 较佳地 90% 以上 ) 的纳米金颗粒的粒径在 1-150nm 范 围内, 较佳地在 5-100nm 范围内。 4. 如权利要求 1 所述的纳米金复合物, 其特征在于, 所述纳米金颗粒的表面上功能分 子的结合密度为 110551013个 /cm2, 较佳地为 110721013个 /cm2, 更佳佳地为 110921013个 /cm2, 更佳地为 1101121013个 /cm2, 最佳地为 1101221013个 /cm2。 5. 一种功能分子, 其特征在于, 所述的功能。
7、分子可通过富含腺嘌呤核苷酸或其类似物 的寡核苷酸结合区结合于纳米金颗粒表面, 并且所述的功能分子具有式I-式III任一所示 权 利 要 求 书 CN 103540651 A 2 2/3 页 3 结构 : B-L-R I ; R-L-B-L-R II ; (B-L-R-L-B)m III ; 式中, B 表示富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区 ; R 表示功能区 ; L 表示位于 B 和 R 之间的任选的过渡区 ; m 为选自 1-20 的整数 ; 或优选地, 所述的富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区具有选自下组的一个或多个 特征 : (i) 结合区的长度为 5-100 个碱基,。
8、 较佳地 5-40 个碱基, 更佳地 10-30 个碱基 ; (ii) 结合区含有一个或多个 poly(A)n 区段, 其中 n 为选自 1-100 的整数, 较佳地 n 为 选自 2-30 的整数, 更佳地 n 为选自 3-20 的整数 ; (iii) 结合区中 A 碱基的含量 70%, 较佳地 80%, 更佳地 90%, 最佳地 95%, 或为 100% ; (iv)结合区中T碱基和U碱基的总量20%, 较佳地10%, 更佳地5%, 最佳地0% ; 或较佳地, 所述的过渡区由选自下组的成分组成 : 寡核苷酸、 多肽、 高分子链、 小分子、 或其组合 ; 或优选地, 所述的功能区为修饰或未修。
9、饰的、 以及标记或未标记的选自下组的分子 (moiety) : 核 酸、 核酸适配体、 核酶 (DNAzyme 或 RNAzyme)、 蛋白质、 多肽、 抗体、 探针、 酶、 凝集素、 配体、 小 分子、 胆固醇。 6. 一种组合物, 其特征在于, 所述的组合物含有药学上可接受的载体或检测学上可接 受的载体, 以及权利要求 1 所述的纳米金复合物。 7. 一种权利要求 1 所述的纳米金复合物的制备方法, 其特征在于, 包括步骤 : 将功能分 子与纳米金颗粒接触, 使得功能分子通过富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区 结合于纳米金颗粒的表面, 从而形成纳米金复合物。 8. 权利要求 1 所。
10、述的纳米金复合物的用途, 其特征在于, 它被用于制备检测试剂或用 于制备调控基因表达或调节蛋白活性的药物组合物。 9. 一种检测产品, 其特征在于, 所述的产品含有权利要求 1 所述的纳米金复合物, 所述 复合物作为检测剂。 10. 一种检测试剂盒, 其特征在于, 所述的检测试剂盒包括权利要求 1 所述的纳米金复 合物或权利要求 9 所述的检测产品。 11. 一种检测方法, 其特征在于, 包括步骤 : 将权利要求 1 所述的纳米金复合物用作检 测剂, 进行检测 ; 或优选地, 纳米金复合物的功能分子的功能区为核酸, 用于检测序列与功能区核酸互补的目标多 权 利 要 求 书 CN 1035406。
11、51 A 3 3/3 页 4 核苷酸 ; 或较佳地, 纳米金复合物的功能分子的功能区为核酸适配体, 用于检测核酸适配体的底物 ; 或优选地, 纳米金复合物的功能分子的功能区为核酶, 用于检测金属离子 ; 或较佳地, 纳米金复合物的功能分子的功能区为抗体, 用于检测抗原。 12. 一种体外非治疗性的基因调控方法, 其特征在于, 包括步骤 : 在培养体系中加入权 利要求 1 所述的纳米金复合物, 并且所述的功能分子具有调控目标基因表达的核苷酸序 列。 权 利 要 求 书 CN 103540651 A 4 1/21 页 5 一种纳米金复合物及其制备和应用 技术领域 0001 本发明属于生物技术和生物。
12、检测领域, 具体地, 本发明涉及一种纳米金复合物及 其制备和应用。 背景技术 0002 纳米金复合物是一种常用的生物纳米材料, 它由功能分子通过一定的方式联接在 纳米金颗粒上, 在生物诊断等方面有广泛的应用。 0003 DNA-纳米金复合物是一种常见的纳米金复合物形式。 通常, 这种DNA-纳米金复合 物是由巯基修饰的DNA通过金硫键在金表面自组装作用得到的。 应用这种方法制备DNA-纳 米金复合物, 需要将 DNA 进行化学修饰, 操作过程十分复杂, 而且成本很高, 操作过程中还 可能形成不需要的双硫键, 或存在样品污染等问题。该方法常见的缺点是未完全功能化的 纳米金颗粒纳米金由于表面非特异。
13、性吸附, DNA 吸附在纳米金表面呈现倒伏状态 ; 此外, 这 种方法虽然携带的 DNA 密度很高, 但是在高度功能化的纳米金颗粒上, DNA 的高密度使得目 标检测分子不易接近, 影响检测效率。 0004 使用竞争性的小分子, 如巯基己醇 (MCH), 可以通过取代掉吸附在金表面的 DNA 并 迫使 DNA 序列保持直立状态来提高杂交效率, 但是该方法中使用的竞争性小分子数量和反 应的控制非常复杂, 并且竞争性小分子的引入会降低纳米金颗粒的稳定性。 0005 因此, 本领域迫切需要开发一种新型的制备纳米金复合物的方法, 能通过一种简 单有效的方法将功能分子连接到纳米金颗粒上, 并能有效调控纳。
14、米金粒子表面固定的功能 分子的密度、 方向以及构型, 从而提高纳米金纳米金复合物的检测效率。 发明内容 0006 本发明的目的就是提供一种新的纳米金 - 复合物及其制备和应用。 0007 在本发明的第一方面, 提供了一种纳米金复合物, 所述复合物包括纳米金颗粒和 功能分子, 并且所述的功能分子通过富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区结合 于纳米金颗粒的表面。 0008 在另一优选例中, 所述的功能分子具有式 I- 式 III 任一所示结构 : 0009 B-L-R I ; 0010 R-L-B-L-R II ; 0011 (B-L-R-L-B)m III ; 0012 式中, 0013 。
15、B 表示富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区 ; 0014 R 表示功能区 ; 0015 L 表示位于 B 和 R 之间的任选的过渡区 ; 0016 m 为选自 1-20 的整数。 0017 在另一优选例中, 所述的富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区具有选 说 明 书 CN 103540651 A 5 2/21 页 6 自下组的一个或多个特征 : 0018 (i) 结合区的长度为 5-100 个碱基, 较佳地 5-40 个碱基, 更佳地 10-30 个碱基 ; 0019 (ii) 结合区含有一个或多个 poly(A)n 区段, 其中 n 为选自 1-100 的整数, 较佳地 n 。
16、为选自 2-30 的整数, 更佳地 n 为选自 3-20 的整数 ; 0020 (iii) 结合区中 A 碱基的含量 70%, 较佳地 80%, 更佳地 90%, 最佳地 95%, 或为 100% ; 0021 (iv) 结合区中 T 碱基和 U 碱基的总量 20%, 较佳地 10%, 更佳地 5%, 最佳地 0%。 0022 在另一优选例中, poly(A)n 区段的个数为 1-3 个。 0023 在另一优选例中, 所述的结合区包括 DNA、 RNA、 和 / 或 PNA 构成的单链。 0024 在另一优选例中, 所述的过渡区由选自下组的成分组成 : 寡核苷酸、 多肽、 高分子 链、 小分子。
17、、 或其组合。 0025 在另一优选例中, 所述的过渡区是长度为 0-50 个 ( 较佳地 5-20 个 ) 碱基组成的 寡核苷酸。 0026 在另一优选例中, 所述的碱基为 T 或 U, 较佳地为 T。 0027 在另一优选例中, 所述的功能区为修饰或未修饰的、 以及标记或未标记的选自下 组的分子 (moiety) : 核酸、 核酸适配体、 核酶 (DNAzyme 或 RNAzyme)、 蛋白质、 多肽、 抗体、 探 针、 酶、 凝集素、 配体、 小分子、 胆固醇。 0028 在另一优选例中, 所述的小分子为胆固醇。 0029 在另一优选例中, 所述的修饰包括 : 生物素修饰、 亲和素修饰、。
18、 羧基修饰、 羟基修 饰、 氨基修饰、 糖基修饰、 荧光修饰。 0030 在另一优选例中, 所述的荧光修饰为荧光分子修饰或荧光团修饰。 0031 在另一优选例中, 所述的纳米金颗粒具有选自下组的一个或多个特征 : 0032 (1) 纳米金颗粒的平均粒径为 1-150nm, 较佳地为 5-100nm, 更佳地 5-20nm ; 0033 (2)在纳米金颗粒中, 80%以上(较佳地90%以上)的纳米金颗粒的粒径在1-150nm 范围内, 较佳地在 5-100nm 范围内。 0034 在另一优选例中, 所述纳米金颗粒的表面上功能分子的结合密度为 1105 51013个 /cm2, 较佳地为 1107。
19、21013个 /cm2, 更佳佳地为 110921013个 /cm2, 更 佳地为 1101121013个 /cm2, 最佳地为 1101221013个 /cm2。 0035 在本发明的第二方面, 提供了一种功能分子, 所述的功能分子可通过富含腺嘌呤 核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区结合于纳米金颗粒表面, 并且所述的功能分子具有式 I- 式 III 任一所示结构 : 0036 B-L-R I ; 0037 R-L-B-L-R II ; 0038 (B-L-R-L-B)m III ; 0039 式中, 0040 B 表示富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区 ; 0041 R 表示功能区 ;。
20、 0042 L 表示位于 B 和 R 之间的任选的过渡区 ; 说 明 书 CN 103540651 A 6 3/21 页 7 0043 m 为选自 1-20 的整数。 0044 在另一优选例中, 所述功能分子的富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合 区具有选自下组的一个或多个特征 : 0045 (i) 结合区的长度为 5-100 个碱基, 较佳地 5-40 个碱基, 更佳地 10-30 个碱基 ; 0046 (ii) 结合区含有一个或多个 poly(A)n 区段, 其中 n 为选自 1-100 的整数, 较佳地 n 为选自 2-30 的整数, 更佳地 n 为选自 3-20 的整数 ; 004。
21、7 (iii) 结合区中 A 碱基的含量 70%, 较佳地 80%, 更佳地 90%, 最佳地 95%, 或为 100% ; 0048 (iv) 结合区中 T 碱基和 U 碱基的总量 20%, 较佳地 10%, 更佳地 5%, 最佳地 0%。 0049 在另一优选例中, poly(A)n 区段的个数为 1-3 个。 0050 在另一优选例中, 所述的结合区包括 DNA、 RNA、 和 / 或 PNA 构成的单链。 0051 在另一优选例中, 所述功能分子的过渡区由选自下组的成分组成 : 寡核苷酸、 多 肽、 高分子链、 小分子、 或其组合。 0052 在另一优选例中, 所述的过渡区是长度为 0。
22、-50 个 ( 较佳地 5-20 个 ) 碱基组成的 寡核苷酸。 0053 在另一优选例中, 所述的碱基为 T 或 U, 较佳地为 T。 0054 在另一优选例中, 所述功能分子的功能区为修饰或未修饰的、 以及标记或未标记 的选自下组的分子(moiety) : 核酸、 核酸适配体、 核酶(DNAzyme或RNAzyme)、 蛋白质、 多肽、 抗体、 探针、 酶、 凝集素、 配体、 小分子、 胆固醇。 0055 在另一优选例中, 所述的小分子为胆固醇。 0056 在另一优选例中, 所述的修饰包括 : 生物素修饰、 亲和素修饰、 羧基修饰、 羟基修 饰、 氨基修饰、 糖基修饰、 荧光修饰。 005。
23、7 在另一优选例中, 所述的荧光修饰为荧光分子修饰或荧光团修饰。 0058 在本发明的第三方面, 提供了一种组合物, 所述的组合物含有药学上可接受的载 体或检测学上可接受的载体, 以及本发明第一方面所述的纳米金复合物。 0059 在本发明的第四方面, 提供了本发明第一方面所述的纳米金复合物的制备方法, 包括步骤 : 将功能分子与纳米金颗粒接触, 使得功能分子通过富含腺嘌呤核苷酸或其类似 物的寡核苷酸结合区结合于纳米金颗粒的表面, 从而形成纳米金复合物。 0060 在另一优选例中, 所述方法包括步骤 : 0061 (a) 将功能分子与纳米金颗粒混合, 获得功能分子与纳米金颗粒的混合溶液 ; 00。
24、62 (b) 向步骤 (a) 的混合溶液中加入老化剂, 促进富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的 寡核苷酸结合区与纳米金颗粒的表面的连接, 获得含有第一方面所述的纳米金复合物的溶 液体系 ; 和 0063 (c) 从步骤 (b) 的溶液中分离所述的纳米金复合物。 0064 在另一优选例中, 所述方法还包括步骤 (d) : 对纳米金复合物进行洗涤和 / 或性能 验证。 0065 在另一优选例中, (b) 中所述的老化剂选自下组 : 氯化钠溶液、 氯化钾溶液、 氯化 镁溶液、 或其组合。 说 明 书 CN 103540651 A 7 4/21 页 8 0066 在本发明的第五方面, 提供了第一方面所述的纳。
25、米金复合物的用途, 它被用于制 备检测试剂或用于制备调控基因表达或调节蛋白活性的药物组合物。 0067 在本发明的第六方面, 提供了一种检测产品, 所述的产品含有第一方面所述的纳 米金复合物, 所述复合物作为检测剂。 0068 在另一优选例中, 所述的检测产品包括测试片、 测试条、 侧流片等。 0069 在本发明的第七方面, 提供了一种检测试剂盒, 所述的检测试剂盒包括第一方面 所述的纳米金复合物或第六方面所述的检测产品。 0070 在本发明的第八方面, 提供了一种检测方法, 包括步骤 : 将第一方面所述的纳米金 复合物用作检测剂, 进行检测。 0071 在另一优选例中, 在检测时观察 / 检。
26、测所述检测剂与待测物形成的复合物。 0072 在另一优选例中, 在检测时观察 / 检测因所述检测剂与待测物的相互作用所导致 的变化, 所述变化包括 : 颜色变化或荧光变化。 0073 在另一优选例中, 在本发明第一方面所述的纳米金复合物中, 功能分子的功能区 为核酸、 核酸适配体、 核酶 (DNAzyme 或 RNAzyme)、 蛋白质、 多肽、 抗体、 凝集素、 胆固醇。 0074 在另一优选例中, 所述方法用于检测核酸、 小分子 ( 如 ATP)、 金属离子 ( 如铅、 汞、 铜、 银等 )、 蛋白、 多肽、 多糖等。 0075 在另一优选例中, 纳米金复合物的功能分子的功能区为核酸, 用。
27、于检测序列与功 能区核酸互补的目标多核苷酸。 0076 在另一优选例中, 2 种或 2 种以上的纳米金复合物同时与目标多核苷酸结合。 0077 在另一优选例中, 所述的目标多核苷酸为 DNA 或 RNA。 0078 在另一优选例中, 纳米金复合物的功能分子的功能区为核酸适配体, 用于检测核 酸适配体的底物。 0079 在另一优选例中, 所述的核酸适配体还包括核酸适配体的活性片段或其互补序 列。 0080 在另一优选例中, 纳米金复合物的功能分子的功能区为核酶, 用于检测金属离子。 0081 在另一优选例中, 所述的核酶为 DNAzyme 或 RNAzyme。 0082 在另一优选例中, 所述的。
28、核酶还包括核酶的活性片段, 以及核酶或其活性片段的 互补序列。 0083 在另一优选例中, 纳米金复合物的功能分子的功能区为抗体, 用于检测抗原。 0084 在本方面的第九方面, 提供了一种检测溶液中待测物的方法, 包括步骤 : 将第一方 面所述的纳米金复合物加入所述的溶液, 使得所述纳米金复合物上的功能分子与待测物结 合或作用, 并检测溶液的变化。 0085 在另一优选例中, 所述的溶液的变化为颜色变化或荧光变化。 0086 在另一优选例中, 所述的待测物质选自下组 : 核酸、 多肽、 ATP, 金属离子 ( 如铅、 汞、 铜、 银等 )。 0087 在本方面的第十方面, 提供了一种体外非治。
29、疗性的基因调控方法, 包括步骤 : 在培 养体系中加入第一方面所述的纳米金复合物, 并且所述的功能分子具有调控目标基因表达 的核苷酸序列。 0088 在另一优选例中, 所述的调控目标基因表达的核苷酸序列为 MicroRNA、 干扰 RNA、 说 明 书 CN 103540651 A 8 5/21 页 9 反义 RNA 等。 0089 在另一优选例中, 所述的功能分子还可以包括多肽分子 ( 如 TAT 多肽 ) 等。 0090 应理解, 在本发明范围内中, 本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具 体描述的各技术特征之间都可以互相组合, 从而构成新的或优选的技术方案。 限于篇幅, 在 此不。
30、再一一累述。 附图说明 0091 下列附图用于说明本发明的具体实施方案, 而不用于限定由权利要求书所界定的 本发明范围。 0092 图 1 显示了本发明一种优选的纳米金复合物的示意图 ; 结合于纳米金表面的功能 分子包括三部分 : 结合区、 过渡区和功能区 ; 结合区利用腺嘌呤与金之间的亲和作用力固 定到纳米金表面, 并且能通过改变结合区调控探针之间的距离 ; 过渡区位于结合区和功能 区之间, 起连接过渡作用 ; 功能区为实现具体功能所需的功能分子。 0093 图2显示不同体系的DNA-纳米金在不同离子强度下的电解质溶液中的稳定性, 图 2a 右侧为该体系在不同离子强度的电解质溶液中所呈现的颜。
31、色, 红色说明该纳米金在溶液 中分散良好, 紫色或蓝色说明纳米金发生聚合, 结果显示该体系的耐盐度很低, 在 NaCl 浓 度仅为 50mM 时溶液颜色即变紫, 离子强度更高时颜色即变为蓝色, 该体系在高离子强度的 电解质溶液中稳定性较差。图 2b 显示在含多聚腺嘌呤核苷酸结合区的 DNA 与金纳米粒子 的体系中, polyA 能够将寡聚核苷酸结合在纳米金上, 寡聚核苷酸表面的负电荷使纳米金在 高离子强度的电解质溶液中仍然能够良好地分散, 在离子浓度高达 0.3M 的 NaCl 电解质溶 液中仍十分稳定。图 2c 显示巯基修饰的寡聚核苷酸与金纳米粒子结合的体系中在高离子 强度的电解质溶液中也有。
32、很好的稳定性。 0094 图 3 显示三种纳米金寡聚核苷酸 - 纳米金样品溶液的紫外可见吸收光谱图 ; 图 3a 显示 DNA 中不含多聚腺嘌呤核苷酸组成的结合区 polyA 与金纳米粒子的体系在不同 NaCl 浓度下的紫外可见吸收光谱, 说明该体系在无盐时分散性良好, 在体系中含有 300mM NaCl 时纳米金即发生聚合 ; 图 3b 和图 3c 分别显示含有多聚腺嘌呤核苷酸组成的结合区的 DNApolyA 与金纳米粒子的体系和巯基修饰的寡聚核苷酸与金纳米粒子结合的体系在无盐 和 300mM NaCl 时体系的紫外可见吸收光谱图。 0095 图 4 显示含有多聚腺嘌呤核苷酸结合区的 DNA。
33、- 纳米金复合体系对其互补富 T 链的杂交解析作用具有良好的抵抗力 ; 所使用的含有多聚腺苷寡聚核苷酸一端标记有荧 光基团 FAM, 另一端为包含不同数目的腺嘌呤碱基的 polyA, 分别含有 10 个腺嘌呤核苷酸 (polyA10, 图 4a), 15 个腺嘌呤核苷酸 (polyA15, 图 4b), 20 个腺嘌呤核苷酸 (polyA20, 图 4c), 30个腺嘌呤核苷酸(polyA30, 图4d) ; 各图中blank线为不经处理的寡聚核苷酸-纳米 金体系的荧光光谱图, 各图中 (polyT10 或 polyT15 或 polyT20 或 polyT30) 线为用同样长 度的多聚胸腺嘧。
34、啶核苷酸与纳米金复合体系杂交处理后体系的荧光光谱图, 各图中 MCH 线 表示用巯基己醇 (MCH) 取代处理后的纳米金复合体系的荧光光谱图。 0096 图 5 显示通过改变 polyA 结合区的长度可以调控纳米金上 DNA 的组装密度 ; 图 5a 为随着寡聚核苷酸中 polyA 结合区长度的增加, 金纳米粒子表面所结合的 DNA 的密度逐渐 降低的理论示意图 ; 图 5b 为通过荧光光谱的检测和计算得到含有不同长度 polyA( 从左到 说 明 书 CN 103540651 A 9 6/21 页 10 右依次含有 polyA5、 polyA10、 polyA15、 polyA20、 pol。
35、yA30) 的 DNA 在纳米金上的组装密度, 纵坐标为纳米金粒子上连接的寡聚核苷酸的密度, 结果显示随着 polyA 长度的增加, 纳米 金粒子上组装的寡聚核苷酸密度逐渐降低, 与理论示意图5a一致 ; 图5c显示为通过计算得 到的纳米金粒子表面所吸附的脱氧腺嘌呤核苷酸的密度。 0097 图 6 显示为含有不同长度 polyA 结合区的 DNA- 纳米金复合物纳米金流体动力学 直径的动态光散射检测图。 图中, 从上到下依次为含有polyA5、 polyA10、 polyA15、 polyA20、 polyA30 的复合体系的流体动力学直径。 0098 图 7 显示含有 polyA 结合区的 。
36、DNA- 纳米金复合物的功能区部分采取了一种延伸 且直立的构型 ; 图中由上到下分别为巯基修饰的寡聚核苷酸-纳米金复合物、 含有polyA结 合区的 DNA- 纳米金复合物的流体动力学直径的动态光散射检测结果。 0099 图 8 显示通过 polyA 结合区组装的 DNA- 纳米金复合物的热动力学性质 ; 图 8a 为 通过 polyA 组装的寡聚核苷酸 - 纳米金与完全互补的目标杂交物的的热解曲线, 显示温度 转折点在 70左右 ; 图 8b 为通过 polyA 组装的寡聚核苷酸 - 纳米金复合结构在一系列温 度循环中的循环等离子振动变化 ; 当温度有序地在熔链点 ( 约 70 ) 上 (8。
37、0 ) 下 (60 ) 循环时, 颜色会重复地在红色 ( 说明颗粒是分散的 ) 和蓝色 ( 说明颗粒是聚集的 ) 之间可 逆变化。 0100 图 9 显示基于 polyA 组装的寡聚核苷酸 - 纳米金体系具有非常快的杂交动力学, 图9a显示将两种通过polyA组装的DNA-纳米金纳米金复合物与互补DNA链混合后0min(a 曲线 ), 1min(b 曲线 ), 10min(c 曲线 ), 20min(d 曲线 )9, 40min(e 曲线 ) 反应过程的紫外可 见吸收光谱图 ; 图 9b 显示将两种通过巯基组装的 DNA- 纳米金与互补 DNA 链混合后 0min(a 曲线), 1min(b曲。
38、线), 10min(c曲线), 20min(d曲线), 40min(e曲线)时体系的紫外可见吸 收光谱图。上述结果显示基于 polyA 组装的体系紫外可见吸收峰在 40min 内红移了 80nm, 而巯基组装的体系在40min内仅移动了13nm, 表明基于polyA组装的体系由于杂交作用, 纳 米金较快发生了较大程度的聚集, 基于 polyA 组装的寡聚核苷酸 - 纳米金体系比基于巯基 的体系杂交动力学更快。 0101 图 10 显示基于 polyA 结合和基于巯基组装的寡聚核苷酸 - 纳米金体系纳米金的 杂交动力学对比 ; 图 10a 显示通过计算两种体系的与反应时间和聚合反应几何学有关的特。
39、 征时间 和与聚合生长的物理过程有关的 Avrami 指数 n 比较两种体系的反应动力学 ; 图 10b 显示为两种纳米结合体系在 10min 内检测不同浓度 (0.5, 1, 2, 4, 6, 8, 10nM) 物的目标 DNA 的 A650/A520 快速 (10min 内 ) 比值色检测的剂量反应曲线和相对应的体系颜色变化。 0102 图 11 显示基于含有 polyA 结合区的 DNA- 纳米金复合探针可以通过荧光检测, 实 现对目标 DNA 的定量分析。 0103 图 12 显示含有 polyA 结合区的 DNA- 纳米金复合探针可以实现对目标 DNA 的定量 分析 ; 图中的待测 。
40、DNA 浓度分别为 0.5nM, 1nM, 2nM, 4nM, 6nM, 8nM, 10nM。A650/A520 为各待 测 DNA 浓度下紫外可见吸收光谱图中 650nm 和 520nm 处吸光度信号强度的比值。 0104 图 13 显示含有 polyA 结合区的核酸适配体 - 纳米金复合探针可以实现对 ATP 分 子的定量分析 ; 图中目标 ATP 的浓度依次分别为 0.1mM, 0.5mM, 1.5mM, 1mM, 2mM ; A520 为各 待测 ATP 浓度下紫外可见吸收光谱图中 520nm 处吸光度信号强度。 0105 图 14 显示含有 polyA 结合区的寡聚核苷酸 - 纳米金。
41、复合探针可以实现对铅离子 说 明 书 CN 103540651 A 10 7/21 页 11 的定量分析 ; 图中显示铅离子浓度与紫外光谱信号的对应关系图。其中铅离子浓度依次分 别为 2M, 4M, 6M, 8M, 10M。A520 为各待测铅离子浓度下紫外可见吸收光谱图中 520nm 处吸光度信号强度。 0106 图15是显示含有polyA结合区的抗体-纳米金复合探针可以实现对蛋白质TNF-a 的定量分析 ; 图中显示蛋白质 TNF-a 浓度与紫外光谱信号的对应关系图。其中, 图中的 TNF-a浓度依次分别为1ng/mL, 2ng/mL, 4ng/mL, 6ng/mL。 A650/A520为。
42、各待测TNF-a浓度下 紫外可见吸收光谱图中 650nm 和 520nm 处吸光度信号强度的比值。 0107 图 16 显示通过 poly A 结合于金表面的 siRNA- 纳米金复合物对对细胞内目标基 因表达抑制效果图。 具体实施方式 0108 本发明人经过广泛而深入的研究, 首次意外地发现, 功能分子可以通过富含腺嘌 呤核苷酸 (A) 或其类似物的寡核苷酸结合区与纳米金颗粒的表面结合, 从而形成纳米金复 合物 ; 所述功能分子包括富含 A 的寡核苷酸结合区、 功能区和位于结合区和功能区之间过 渡区。本发明的纳米金复合物可实现纳米金表面上功能分子密度的自我调控 ; 在纳米尺度 上可以精确控制。
43、功能分子之间的距离, 充分保证功能区的识别活性, 促进功能区对目标分 子的检测能力。在此基础上完成了本发明。 0109 术语 0110 纳米金 0111 如本文所用, 术语 “纳米金” 或 “纳米金颗粒” 可以互换使用, 都是指一种微小的, 其平均粒径为 1-150nm。纳米金颗粒具有高电子密度、 介电特性和催化作用, 能与多种生物 分子结合, 且不影响其生物活性。 0112 在本发明中, 优选的纳米金颗粒为 5-100nm, 更佳地为 5-20nm。在纳米金颗粒的群 体中, 80%以上(较佳地90%以上)的纳米金颗粒的粒径在1-150nm范围内, 优选在5-100nm 范围内。 0113 本。
44、领域的普通技术人员可以商业购买途径 ( 如向 Sigma-Aldrich 公司购买 ) 或常 规方法制备获得。 0114 功能分子 0115 本申请提供了一种新的功能分子, 该功能分子可通过富含腺嘌呤核苷酸或其类似 物的寡核苷酸结合区结合于纳米金颗粒表面。 0116 本发明的的功能分子具有式 I- 式 III 任一所示结构 : 0117 B-L-R I ; 0118 R-L-B-L-R II ; 0119 (B-L-R-L-B)m III ; 0120 式中, B表示富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区 ; R表示功能区 ; L表 示位于 B 和 R 之间的任选的过渡区 ; m 为选自 。
45、1-20 的整数。 0121 在本发明中, 富含腺嘌呤核苷酸或其类似物的寡核苷酸结合区具有选自下组的一 个或多个特征 : (i) 结合区的长度为 5-100 个碱基, 较佳地 5-40 个碱基, 更佳地 10-30 个碱 基 ; (ii) 结合区含有一个或多个 poly(A)n 区段, 其中 n 为选自 1-100 的整数, 较佳地 n 为 说 明 书 CN 103540651 A 11 8/21 页 12 选自 2-30 的整数, 更佳地 n 为选自 3-20 的整数 ; (iii) 结合区中 A 碱基的含量 70%, 较 佳地 80%, 更佳地 90%, 最佳地 95%, 或为 100% 。
46、; (iv) 结合区中 T 碱基和 U 碱基的总量 20%, 较佳地 10%, 更佳地 5%, 最佳地 0%。本发明优选 poly(A)n 区段的个数为 1-3 个。更优选地, 结合区包括 DNA、 RNA、 和 / 或 PNA 构成的单链。 0122 在本发明中, 过渡区由选自下组的成分组成 : 寡核苷酸、 多肽、 高分子链、 小分子、 或其组合。过渡区优选为长度为 0-50 个 ( 较佳地 5-20 个 ) 碱基组成的寡核苷酸 ; 所述的 碱基为 T 或 U, 较佳地为 T。 0123 在本发明中, 功能区为修饰或未修饰的、 以及标记或未标记的选自下组的分子 (moiety) : 核酸、 。
47、核酸适配体、 核酶 (DNAzyme 或 RNAzyme)、 蛋白质、 多肽、 抗体、 探针、 酶、 凝 集素、 配体、 小分子、 胆固醇。所述的小分子也可以为胆固醇。所述的修饰包括 : 生物素修 饰、 亲和素修饰、 羧基修饰、 羟基修饰、 氨基修饰、 糖基修饰、 荧光修饰。 荧光修饰为荧光分子 修饰或荧光团修饰。 0124 如本文所用, 术语 “核酸适配体” 或 “Apatmer” 可以互换使用, 都是指一段 DNA 或 RNA 序列, 该序列能够与多种目标物质高特异性高敏感性高选择性的结合, 当核酸适配体与 特定的目标物质发生结合时, 核酸适配体自身的结构发生变化, 这种变化可以进行检测。。
48、 本 领域的普通技术人员使用常规方法(如体外筛选技术等)可以对核酸适配体的序列进行选 择 ; 使用全人工化学方法制备所述的核酸适配体。 此外, 所述的核酸适配体还包括核酸适配 体的活性片段或其互补序列。 0125 如本文所用, 术语 “核酶” 是指具有催化活性的核酸序列 , 其化学本质虽然是核 酸 , 却具有酶的催化功能。核酶的作用底物可以是不同的分子 , 有些作用底物就是分子中 的特定部位。核酶包括 DNAzyme 或 RNAzyme 等, 所述的核酶还包括核酶的活性片段, 以及核 酶或其活性片段的互补序列。一种优选的 DNAzyme 底物链 (substrate strand) 序列如下 : 0126 5 -ACTCATCTGTGAACTCACTATGGAAGAGATGTGTCAACTCGTG-3 0127 其中, rA 代表组成 RNA 的腺嘌呤核糖核苷酸, 其他的都代表组成 DNA 的脱氧核糖 核苷酸, 形成了切割位点 (cleavage site)。 0128 纳米金复合物 0129 如本文所用, 术语 “纳米金复合物” 、“纳米金复合” 、“纳米金 - 功能分子复合物” 或 “纳米金 - 功能分子复合体” 可以互换使用,。