表位序列 【发明领域】
本发明通常涉及肽，和编码肽的核酸，所述肽是靶相关抗原的有效表位。更具体地，本发明涉及具有对I类MHC高亲和力和由靶特异性蛋白酶体产生的表位。
相关技术的描述
瘤形成与免疫系统
通常称为癌的肿瘤性疾病状态被认为是通常由一个生长不受控制的单细胞引起。不受控制的生长状态典型地由一个多级过程引起，其中一系列细胞系统衰竭，导致赘生性细胞的发生。产生的赘生性细胞迅速繁殖它自身，形成一种或多种肿瘤，最终可导致宿主的死亡。
由于赘生性细胞的先祖共享宿主的遗传物质，赘生性细胞大多不受宿主免疫系统攻击。在免疫监视期间，该过程中宿主免疫系统监视和定位外源物质，在宿主免疫监视机器看来赘生性细胞为“自身”细胞。
病毒与免疫系统
与癌细胞相反，病毒感染涉及明显非自身抗原的表达。结果，免疫系统以最小的临床后遗症成功对付了许多病毒感染。此外，对于导致严重疾病的那些感染中的许多已经可以开发有效疫苗。已经成功使用多种疫苗方法来抗击各种疾病。这些方法包括亚单位疫苗，其由通过重组DNA技术生产的单独蛋白质组成。尽管有了这些进展，用作病毒疫苗的最小表位的选择和有效给药仍然有问题。
除与表位选择有关的困难之外，存在已经进化逃避宿主免疫系统能力的病毒的问题。许多病毒，特别是建立持久感染的病毒，如疱疹和痘病毒家族的成员，产生免疫调制分子，其允许病毒逃避宿主免疫系统。这些免疫调制分子对抗原呈递地作用可以通过将用于给药的选择表位作为免疫原性组合物的目标来克服。为了更好理解赘生性细胞和病毒感染细胞与宿主免疫系统的相互作用，下面接着讨论系统组分。
免疫系统起将对于一种生物内源的分子(“自身”分子)从对于该生物外源或异质的物质(“非自身”分子)区别开来的作用。基于介导应答的组分，免疫系统具有两类针对外物的适应性应答：体液应答和细胞介导应答。体液应答是由抗体介导的，而细胞介导的应答涉及归类为淋巴细胞的细胞。近来的抗癌和抗病毒策略已集中在调动宿主免疫系统作为一种抗癌或抗病毒治疗或疗法的方法。
免疫系统在三个阶段中起作用来保护宿主免受外物伤害：识别阶段，活化阶段和效应阶段。在识别阶段，免疫系统识别并发出信号体内存在外源抗原或侵入物。外源抗原可以是例如来源于赘生性细胞的细胞表面标记或病毒蛋白。一旦系统察觉到侵入物，响应于侵入物触发的信号，免疫系统的抗原特异性细胞增殖并分化。最后阶段是效应阶段，其中免疫系统的效应细胞应答并中和检测的侵入物。
一系列效应细胞实施对侵入物的免疫应答。一类效应细胞，B细胞产生靶向宿主遇到的外源抗原的抗体。与补体系统结合，抗体指导携带靶抗原的细胞或生物的破坏。另一类效应细胞是天然杀伤细胞(NK细胞)，一类淋巴细胞，其具有同时识别和破坏多种病毒感染的细胞以及恶性细胞类型的能力。不大理解NK细胞识别靶细胞所使用的方法。
另一类效应细胞，T细胞，具有分类为三亚类的成员，每亚类在免疫应答中发挥不同作用。辅助T细胞分泌细胞因子，其刺激产生有效免疫应答所必需的其它细胞的增殖，而抑制性T细胞下调免疫应答。第三类T细胞，细胞毒性T细胞(CTL)，能够直接溶解在它表面呈递外源抗原的靶细胞。
主要组织相容性复合体和T细胞目标识别
T细胞是在对特异性抗原信号的应答中发挥作用的抗原特异性免疫细胞。B淋巴细胞和它们产生的抗体也是抗原特异性的实体。然而，不同于B淋巴细胞，T细胞对游离或可溶形式的抗原不应答。为了T细胞对抗原应答，需要将抗原加工成肽，其然后与主要组织相容性复合体(MHC)中编码的呈递结构结合。该要求称为“MHC限制性”并且这是T细胞从“非自身”细胞区分“自身”的机制。如果一种抗原不为可识别的MHC分子所展示，T细胞将不识别和作用于该抗原信号。与可识别MHC分子结合的肽的特异性T细胞与这些MHC-肽复合体结合，并进入免疫应答的下一阶段。
存在两类MHC，I类MHC和II类MHC。T辅助细胞(CD4+)主要与II类MHC蛋白质相互作用，而溶细胞的T细胞(CD8+)主要与I类MHC蛋白质相互作用。两类MHC蛋白质都是跨膜蛋白质，它们大部分结构在细胞外表面。此外，两类MHC蛋白质在它们的外部都具有肽结合裂缝(binding cleft)。内源或外源蛋白质的小片段被结合在该裂缝中并呈递于胞外环境中。
称为“专职抗原呈递细胞”(pAPCs)的细胞利用MHC蛋白质将抗原展示给T细胞，但另外表达各种共同刺激分子，其取决于pAPC的分化/激活的具体状态。当与可识别MHC蛋白质结合的肽的特异性T细胞与pAPCs上的这些MHC-肽复合体结合时，作用于T细胞的特异性共刺激分子指导T细胞所采取的分化/激活途径。即，共刺激分子影响在未来遭遇中当它进入免疫应答的下一阶段时T细胞将如何作用于抗原信号。
如上讨论，大多赘生性细胞被免疫系统忽略。大量努力正花在努力控制宿主免疫系统以帮助对抗宿主中赘生性细胞的存在。一个该研究领域涉及配制抗癌疫苗。
抗癌疫苗
患者的免疫系统是肿瘤学家抗癌的战斗中可利用的各种武器之一。在各种努力中已经进行工作以使免疫系统抗击癌症或肿瘤性疾病。不幸地，到此为止的结果大多是令人失望的。特别感兴趣的一个领域涉及生产和使用抗癌疫苗。
为了生产疫苗或其它免疫原性组合物，必需将针对其可产生免疫应答的抗原或表位引入受试者。尽管赘生性细胞是来源于正常细胞并因此在遗传水平上与正常细胞基本上相同，但已知许多赘生性细胞呈递肿瘤相关抗原(TuAAs)。理论上，受试者的免疫系统可以利用这些抗原来识别这些抗原并攻击赘生性细胞。然而，实际上赘生性细胞通常看来似乎为宿主的免疫系统所忽略。
已经开发许多不同策略试图生产具有抗赘生性细胞活性的疫苗。这些策略包括使用肿瘤相关抗原作为免疫原。例如，美国专利号5,993,828描述了一种通过对受试者给药有效剂量的一种组合物来产生针对尿肿瘤相关抗原(Urinary Tumor Associated Antigen)特定亚基的免疫应答的方法，所述组合物包含在细胞表面具有尿肿瘤相关抗原的灭活肿瘤细胞和至少一种选自GM-2，GD-2，胎儿抗原和黑素瘤相关抗原的肿瘤相关抗原。因此，本专利描述将完整的灭活肿瘤细胞用作抗癌疫苗中的免疫原。
使用抗癌疫苗的另一种策略涉及给药一种含有单独肿瘤抗原的组合物。在一种方法中，将MAGE-A1抗原性肽用作免疫原(参见Chaux，P，等，“Identification of Five MAGE-A1 Epitopes Recognized by Cytolytic TLymphocytes Obtained by In Vitro Stimulation with Dendritic CellsTransduced with MAGE-A1，”J.Immunol.，163(5)：2928-2936(1999))。已经有几个将MAGE-A1肽用于接种的治疗实验，尽管该接种疗法的效力有限。在Vose，J.M.，“Tumor Antigens Recognized by T Lymphocytes，”10th European Cancer Conference，Day 2，Sept.14，1999中讨论了这些试验中的一些的结果。
在另一个用作疫苗的肿瘤相关抗原的实例中，Scheinberg等使用5次注射I类相关的bcr-abl肽和辅助肽加上佐剂QS-21来治疗12位已经接受干扰素(IFN)或羟脲的慢性髓细胞性白血病(CML)患者。Scheinberg，D.A.，等，“BCR-ABL Breakpoint Derived Oncogene Fusion Peptide VaccinesGenerate Specific Immune Responses in Patients with Chronic MyelogenousLeukemia(CML)[摘要1665]，American Society of Clinical Oncology 35thAnnual Meeting，亚特兰大(1999)。引发了表示T-辅助细胞活性的增殖和迟发型超敏反应(DTH)T细胞应答，但在新鲜血样中未观测到溶细胞的杀伤T细胞活性。
在Cebon等和Scheibenbogen等的近来工作中看到尝试鉴定用作疫苗的TuAAs的另外实例。Cebon等使用皮内给药的MART-126-35肽和以增大剂量皮下或静脉内给予的IL-12免疫具有转移性黑素瘤的患者。最初的15位患者中，注意到1位完全缓解，1位部分缓解，和1位混合应答。对于T细胞产生的免疫测定包括DTH，其在使用或不使用IL-12的患者中发现。在有临床益处(clinical benefit)迹象的患者中发现阳性CTL测定，但在没有肿瘤退化的患者中未发现。Cebon等，“Phase I Studies ofImmunization with Melan-A and IL-12 in HLA A2+Positive Patients withStage III and IV Malignant Melanoma，”[摘要1671]，American Society ofClinical Oncology 35th Annual Meeting，亚特兰大1999)。
Scheibenbogen等用4种I类HLA限制性酪氨酸酶肽免疫18位患者，其中16位患者用转移性黑素瘤免疫和用佐剂免疫2位患者。Scheibenbogen等“Vaccination with Tyrosinase peptides and GM-CSF in MetastaticMelanoma：a Phase II Trial，”[摘要1680]，American Society of ClinicalOncology 35th Annual Meeting，亚特兰大(1999)。在4/15患者中，其中2位用佐剂免疫和2位有肿瘤退化迹象的患者中观测到增强的CTL活性。如在Cebon等的试验中，患有进行性疾病(progressive disease)的患者未显示增强的免疫性。尽管到此为止花了各种努力来产生有效的抗癌疫苗，仍未开发出该组合物。
抗病毒疫苗
保护免患病毒病的疫苗策略已经取得许多成功。或许这些中最显著的是对抗疾病天花已取得的进步，天花已经被灭绝。脊髓灰质炎疫苗的成功具有类似的重要性。
可将病毒疫苗分为三类：活减毒病毒疫苗，如对于天花的牛痘，萨宾脊髓灰质炎病毒疫苗，和麻疹流行性腮腺炎和风疹；完全杀死或灭活的病毒疫苗，如索尔克脊髓灰质炎病毒疫苗，甲型肝炎病毒疫苗和典型流感病毒疫苗；和亚单位疫苗，如乙型肝炎。由于它们缺乏完整的病毒基因组，亚单位疫苗比基于完整病毒的那些提供更大程度的安全性。
成功的亚单位疫苗的范例是基于病毒包膜蛋白的重组乙型肝炎疫苗。尽管许多学术者对将超越单个蛋白质的还原论者亚单位概念推至单独表位感兴趣，但该努力尚未产生许多成果。病毒疫苗研究也已集中在诱导抗体应答，尽管也发生细胞应答。然而，许多亚单位制剂在产生CTL应答方面特别差。
发明概述
引发专职抗原呈递细胞(pAPCs)展示靶细胞表位的先前方法已经简单依赖于使pAPCs表达靶相关抗原(TAAs)，或那些被认为具有对MHC I类分子高亲和力的抗原的表位。然而，这类抗原的蛋白酶体加工导致在pAPC上呈递的表位与靶细胞上的表位不相对应。
利用有效的细胞免疫应答要求pAPCs呈递相同的由靶细胞呈递的表位的知识，本发明提供具有对MHC I高亲和力，并且与在周围细胞中活跃的管家蛋白酶体的加工特异性相对应的表位。这些表位因此与在靶细胞上呈递的那些相对应。将这类表位用于疫苗中可以激活细胞免疫应答来识别正确加工的TAA并可导致去除呈递这类表位的靶细胞。在一些实施方案中，这里提供的管家表位可与免疫表位结合使用，产生细胞免疫应答，其在干扰素诱导之前和之后都能够攻击靶细胞。在其它实施方案中将该表位用于诊断和监测靶相关疾病和用于生产针对这类目的的免疫试剂。
本发明的实施方案涉及分离的(isolated)表位和包含表位的抗原或多肽。优选的实施方案包括含有表1中公开序列的表位或抗原。其它实施方案可包括一种包含源于表1的多肽的表位聚簇。此外，多个实施方案包括一种与已经提及的表位，多肽，抗原或聚簇基本类似的多肽。其它优选的实施方案包括一种与上述的任何一种功能相似的多肽。还有另外的实施方案涉及一种编码来自表1和这里提及的所述表位，聚簇，抗原和多肽中任何一种的多肽的核酸。为了下列总结的目的，当提到“表位”或“多种表位”时，本发明其它实施方案的讨论无限制地指的是所有前述形式的表位。
表位可以是免疫活性的。包含表位的多肽长度可以小于大约30个氨基酸，更优选地，例如，多肽长度为8-10个氨基酸。物质(substantial)或功能的相似性可包括例如增加至少一个氨基酸，和至少一个附加的氨基酸可以是在多肽的N-末端。物质或功能的相似性可以包括替代至少一个氨基酸。
表位，聚簇或包含它的多肽可具有对HLA-A2分子的亲和力。该亲和力可以通过结合试验，表位识别限制性试验，预测算法等测定。表位，聚簇或包含它的多肽可具有对HLA-B7，HLA-B51分子等的亲和力。
在优选的实施方案中，多肽可以是一种管家表位。该表位或多肽可对应于在肿瘤细胞上展示的表位，对应于在新脉管系统(neovasculature)细胞上展示的表位等。该表位或多肽可以是免疫表位。该表位，聚簇和/或多肽可以是核酸。
其它实施方案涉及药物组合物，其包含包括来源于表1的表位，聚簇，或包含它的多肽的多种多肽，和药用佐剂，载体，稀释剂，赋形剂等。所述佐剂可以是多核苷酸。该多核苷酸可包括二核苷酸，其例如可以是CpG。所述佐剂可以为一种多核苷酸所编码。该佐剂可以是一种细胞因子，所述细胞因子例如可以是GM-CSF。
药物组合物可另外包括一种专职抗原呈递细胞(pAPC)。pAPC例如可以是树突细胞。药物组合物可另外包括第二表位。第二表位可以是多肽，核酸，管家表位，免疫表位等。
还有另外的实施方案涉及药物组合物，其包括这里讨论的任何核酸，包括编码包含来自表1的表位或抗原的多肽的那些核酸。这类组合物可包括药用佐剂，载体，稀释剂，赋形剂等。
其它实施方案涉及包括如这里所描述的这种核酸的重组构建体，其包括编码包含来自表1的表位或抗原的多肽的那些核酸。构建体可另外包括质粒，病毒载体，人工染色体等。构建体可另外包括一种序列，其编码至少一种特征(feature)，例如，第二表位，IRES，ISS，NIS，遍在蛋白质等。
另外的实施方案涉及纯化的抗体，其与至少一种表1中的表位特异性结合。其它实施方案涉及与一种肽-MHC蛋白质复合体特异性结合的纯化抗体，所述肽-MHC蛋白质复合体包含一种表1中公开的表位或任何其它适当的表位。来源于任何实施方案的抗体可以是单克隆抗体或多克隆抗体。
还有其它实施方案涉及多聚体MHC-肽复合体，其包括一种表位，如，例如一种表1中公开的表位。同样，考虑对复合体特异性的抗体。
多种实施方案涉及表达对MHC-肽复合体特异性的T细胞受体的分离的T细胞。所述复合体可包括一种表位，如，例如表1中公开的表位。T细胞可以通过体外免疫生产并且可以从免疫动物中分离。多种实施方案涉及T细胞克隆，包括克隆的T细胞，如上面讨论的那些。多种实施方案还涉及T细胞的多克隆群体。该群体可包括例如如上所述的T细胞。
还有另外的实施方案涉及药物组合物，其包括例如如上所述的那些的T细胞和药用佐剂，载体，稀释剂，赋形剂等。
本发明的多种实施方案涉及分离的蛋白质分子，其包含对MHC-肽复合体特异性的T细胞受体的结合域。复合体可包括表1公开的表位。蛋白质可以是多价体。其它实施方案涉及编码该蛋白质的分离的核酸。还有另外的实施方案涉及包括该核酸的重组构建体。
本发明的其它实施方案涉及表达如在这里描述的重组构建体的宿主细胞，所述重组构建体包括编码例如在表1公开的表位，聚簇或包含它的多肽的构建体。宿主细胞可以是树突细胞，巨噬细胞，肿瘤细胞，肿瘤衍生的细胞，细菌，真菌，原生动物等。多种实施方案还涉及药物组合物，其包括一种宿主细胞，如在这里讨论的那些，和一种药用佐剂，载体，稀释剂，赋形剂等。
还有其它实施方案涉及疫苗或免疫治疗组合物，其包括至少一种组分，例如表1中公开或在这里另外描述的表位；包括该表位的聚簇，包括该表位的抗原或多肽；如上面和在这里描述的组合物；如上面和在这里描述的构建体，T细胞，或如上面和在这里描述的宿主细胞。
另外的实施方案涉及治疗动物的方法。方法可包括对动物给药一种药物组合物，例如一种疫苗或免疫治疗组合物，其包括如上面和在这里公开的那些。给药步骤可包括一种送递方式，如，例如，经皮的，结节内的(intranodal)，结节周围的(perinodal)，口服的，静脉内的，皮内的，肌内的，腹膜内的，粘膜的，气溶胶吸入，滴注等。该方法可另外包括一测定步骤以测定一种靶细胞或多种靶细胞状态的特征表现。方法可包括第一测定步骤和第二测定步骤，其中第一测定步骤在给药步骤之前，并且其中第二测定步骤在给药步骤之后。方法可另外包括一个比较第一测定步骤中测定的特性与第二测定步骤中测定的特性以获得一个结果的步骤。该结果可以是例如免疫应答的迹象，靶细胞数量的减小，包含靶细胞的肿瘤的质量或尺寸的减小，感染靶细胞的胞内寄生物数量和浓度的减小等。
多种实施方案涉及评估疫苗或免疫治疗组合物的免疫原性的方法。该方法可包括对动物给药一种疫苗或免疫治疗，如上面和在这里别处描述的那些，和基于动物一种特性评估免疫原性。动物可以是HLA-转基因的动物。
其它实施方案涉及评估免疫原性的方法，其包括用疫苗或免疫治疗组合物，如上面和在这里别处描述的那些，体外刺激T细胞，和基于T细胞的一种特性评估免疫原性。刺激可以是原发刺激(primary stimulation)。
还有另外的实施方案涉及进行被动/过继免疫治疗的方法。该方法可以包括将T细胞或宿主细胞，如上面和在这里别处描述的那些，与药用佐剂，载体，稀释剂，赋形剂等结合。
其它实施方案涉及测定特异性T细胞频率的方法，并可以包括将T细胞与MHC-肽复合体或包含含有这样一种表位的聚簇或抗原的复合体接触的步骤，所述MHC-肽复合体包含表1中公开的表位。接触步骤可包含至少一种特征，例如，免疫，再刺激(restimulation)，检测，计数等。该方法可另外包括ELISPOT分析，有限稀释分析，流式细胞计量术，原位杂交，聚合酶链反应，它们的任何组合等。
多种实施方案涉及评估免疫应答的方法。该方法可包括在免疫步骤之前和之后实行的测定特异性T细胞频率的上述方法。
其它实施方案涉及评估免疫应答的方法。该方法可包括在用MHC-肽复合体刺激之前和之后测定T细胞的频率，细胞因子产生量或溶细胞活性，所述MHC-肽复合体包含一种表位，例如来自表1的表位，包含该表位的聚簇或多肽。
另外的实施方案涉及诊断疾病的方法。方法包括将受试者组织与至少一种组分接触，所述组分包括，例如T细胞，宿主细胞，抗体，蛋白质，其包括上面和在这里别处描述的那些；和基于组织或组分的一种特征诊断疾病。接触步骤可以例如在体内或体外发生。
还有其它实施方案涉及生产疫苗的方法。方法可以包括将至少一种组分，表位，组合物，构建体，T细胞，宿主细胞；其包括上面和在这里别处描述的那些中的任何一种，与药用佐剂，载体，稀释剂，赋形剂等结合。
多种实施方案涉及其上已经记录SEQ ID NOS：1-602中任何一种序列的计算机可读介质，其是在一种具有计算含有所述序列的分子的物理，生物化学，免疫学，分子遗传特性的硬件或软件等的机器中。
还有其它实施方案涉及治疗动物的方法。方法可以包括结合治疗动物的方法，其包括对动物给药一种疫苗或免疫治疗组合物，例如上面和在这里别处所描述的，与至少一种治疗方式结合，所述治疗方式包括例如放射治疗，化学疗法，生物化学疗法(biochemotherapy)，外科手术等。
另外的实施方案涉及包括一种表位聚簇的分离的多肽。在优选的实施方案中，该聚簇可以是来自含有如表25-44任何一个中所公开的序列的靶相关抗原，其中氨基酸序列包括至多约80％的抗原氨基酸序列。
其它实施方案涉及疫苗或免疫治疗产品，其包括如上面和在这里别处描述的分离的肽。还有其它实施方案涉及一种分离的的多核苷酸，其编码如上面和在这里别处描述的多肽。其它实施方案涉及包括这些多核苷酸的疫苗或免疫治疗产品。该多核苷酸可以是DNA，RNA等。
还有其它的实施方案涉及包含一种递送装置的试剂盒和任何在上面和在这里别处提及的实施方案。所述递送装置可以是导管，注射器，内泵或外泵，贮器，吸入器，微量注射器，膜片(patch)和适合任何递送途径的任何其它类似装置。如上所述，除了递送装置之外试剂盒还包括在这里公开的实施方案中的任一种。例如，无限制地，试剂盒可以包括分离的表位，多肽，聚簇，核酸，抗原，包括前述任何一种的药用组合物，抗体，T细胞，T细胞受体，表位-MHC复合体，疫苗，免疫治疗剂等。试剂盒还可包括物品如详细的使用说明书和其它任何类似的物品。
附图简述
图1是NY-ESO-1与几个相似蛋白质序列的序列对比。
图2图示用于递送核酸编码的表位的质粒疫苗主链。
图3A和3B是显示酪氨酸酶207-215和酪氨酸酶208-216 HLA-A2结合试验结果的FACS曲线。
图3C显示通过体外免疫诱导的人CTL针对酪氨酸酶表位的溶细胞活性。
图4是由蛋白酶体切割SSX-231-68产生片段T＝120min时刻的质谱。
图5显示HLA-A2：SSX-241-49与对照的结合曲线。
图6显示来源于SSX-241-49免疫的HLA-A2转基因小鼠的CTL对SSX-241-49-脉冲目标的特异性溶解。
图7A，B和C显示T＝60min时刻PSMA163-192蛋白酶体消化的等分部分N-末端池测序(pool sequencing)的结果。
图8显示HLA-A2：PSMA168-177和HLA-A2：PSMA288-297与对照的结合曲线。
图9显示T＝60min时刻PSMA281-310蛋白酶体消化的等分部分N-末端池测序的结果。
图10显示HLA-A2：PSMA461-469，HLA-A2：PSMA460-469和HLA-A2：PSMA663-671与对照的结合曲线。
图11显示检测PSMA463-471-反应性HLA-A1+CD8+T细胞的基于γ-IFN的ELISPOT试验结果。
图12显示用抗-HLA-A1 mAb封闭在图10中使用的T细胞的活性，其显示HLA-A1-限制性识别。
图13显示HLA-A2：PSMA663-671与对照的结合曲线。
图14显示HLA-A2：PSMA662-671与对照的结合曲线。
图15.比较在用不同剂量DNA通过不同注射途径免疫后的抗-肽CTL应答。
图16.移植的gp33表达肿瘤在通过淋巴结内注射表达gp33表位的或对照，质粒而免疫的小鼠中的生长。
图17.分别在淋巴结内和肌内注射后的不同时间通过实时PCR检测的在注射或引流(draining)淋巴节中质粒DNA的量。
优选实施方案的详述
定义
除非另外从使用这里的术语的上下文中清楚得知，为了本描述的目的下面列出的术语应该通常具有指明的含义。
专职抗原呈递细胞(pAPC)——具有T细胞共刺激分子并能够诱导T细胞应答的细胞。完全表征的pAPCs包括树突细胞，B细胞和巨噬细胞。
周围细胞——不是pAPC的细胞。
管家蛋白酶体——通常在周围细胞中活跃的蛋白酶体，通常在pAPCs中不存在或没有强活性。
免疫蛋白酶体——通常在pAPCs中活跃的蛋白酶体；免疫蛋白酶体在感染组织的一些周围细胞中也是活跃的。
表位——能够刺激免疫应答的分子或物质。在优选的实施方案中，按照本定义的表位包括但不一定限于一种多肽和一种编码多肽的核酸，其中所述多肽能够刺激免疫应答。在其它优选的实施方案中，按照本定义的表位包括但不一定限于存在细胞表面的肽，所述肽非共价键地与I类MHC的结合裂缝结合，这样它们可以与T细胞受体相互作用。
MHC表位——对哺乳动物I类或II类主要组织相容性复合体(MHC)分子具有已知或预测结合亲和力的多肽。
管家表位——在一个优选的实施方案中，将管家表位定义为一种多肽片段，其是一种MHC表位，并且展示在其中管家蛋白酶体活性突出的细胞上。在另一个优选实施方案中，将管家表位定义为一种含有按照前述定义的管家表位的多肽，其侧邻一个至几个附加的氨基酸。在另一个优选实施方案中，将管家表位定义为一种编码按照前述定义的管家表位的核酸。
免疫表位——在一个优选实施方案中，将免疫表位定义为一种多肽片段，其是一种MHC表位，并且展示在其中管家蛋白酶体活性突出的细胞上。在另一个优选实施方案中，将免疫表位定义为一种含有按照前述定义的免疫表位的多肽，其侧邻一个至几个附加的氨基酸。在另一个优选实施方案中，将免疫表位定义为一种包括一个表位聚簇序列，含有至少两个对I类MHC具有已知或预测亲和力的多肽序列的多肽。在还有的另一个优选实施方案中，将免疫表位定义为一种编码按照上述定义中任何一种的免疫表位的核酸。
靶细胞——被疫苗和本发明方法所靶向的细胞。按照本定义的靶细胞的实例包括但不一定限于：赘生性细胞和含有胞内寄生物的细胞，例如病毒，细菌或原生动物。
靶相关抗原(TAA)——在靶细胞中存在的蛋白质或多肽。
肿瘤相关抗原(TuAA)——TAA，其中靶细胞是赘生性细胞。
HLA表位——对人I类或II类HLA复合体分子具有已知或预测结合亲和力的多肽。
抗体——多克隆或单克隆天然免疫球蛋白(Ig)，或任何完全或部分由Ig结合域组成的分子，不管生物化学衍生的或通过使用重组DNA得到。实施例包括，尤其是F(ab)，单链Fv和Ig可变区-噬菌体外被蛋白融合。
编码——可扩充的(open-ended)术语以致编码特定氨基酸序列的核酸可由确定那个(多)肽的密码子组成，但还可包含附加的序列，其是可译的或用于控制转录，翻译或复制，或便于操作一些宿主的核酸构建体。
物质相似性——该术语用来指如通过检查序列判断以间接的方式不同于参考序列的序列。尽管在简并位置的差异或在长度或任何非编码区组成上的适度差异，编码相同氨基酸序列的核酸序列基本上相似。只是通过保守置换或小的长度变化而相异的氨基酸序列基本上是相似的。另外，包含在N-末端侧翼残基数量不同的管家表位，或在任一末端侧翼残基数量不同的免疫表位和表位聚簇的氨基酸序列基本上是相似的。编码基本上相似的氨基酸序列的核酸它们自己也基本上相似。
功能相似性——该术语用于指如通过检测生物或生物化学特性判断以间接的方式不同于参考序列的序列，尽管序列可能不是基本上相似。例如，可将两种核酸用作针对相同序列但编码不同氨基酸序列的杂交探针。即使它们通过非保守氨基酸置换而相异(因此不符合物质相似性的定义)，诱导交叉反应性CTL应答的两种肽在功能上相似。识别相同表位的成对抗体或TCRs可以是在功能上彼此相似，尽管存在任何结构差异。在检验免疫原性的功能相似性中，通常用“改变的”抗原免疫个体并检验引发应答(Ab，CTL，细胞因子产生等)识别靶抗原的能力。因此，可以设计在某些方面不同而保持相同功能的两种序列。该设计的序列变体在本发明的实施方案中。
表1A.包括实施例1-7，13中的表位的SEQ ID NOS.*SEQ ID NO 身份 序列 1Tyr 207-216 FLPWHRLFLL 2酪氨酸酶蛋白 登记号**：P14679 登记号：NP_003138 登记号：NP_004467 登记号：NM_000372 登记号：NM_003147 登记号：NM_004476 3SSX-2蛋白 4PSMA蛋白 5酪氨酸酶cDNA 6SSX-2 cDNA 7PSMA cDNA 8Tyr 207-215FLPWHRLFL 9Tyr 208-216LPWHRLFLL 10SSX-2 31-68YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKLGFKATLP 11SSX-2 32-40FSKEEWEKM 12SSX-2 39-47KMKASEKIF 13SSX-2 40-48MKASEKIFY 14SSX-2 39-48KMKASEKIFY 15SSX-2 41-49KASEKIFYV 16SSX-2 40-49MKASEKIFYV 17SSX-2 41-50KASEIFYVY 18SSX-2 42-49ASEKIFYVY 19SSX-2 53-61RKYEAMTKL 20SSX-2 52-61KRKYEAMTKL 21SSX-2 54-63KYEAMTKLGF 22SSX-2 55-63YEAMTKLGF 23SSX-2 56-63EAMTKLGF 24HBV18-27FLPSDYFPSV 25HLA-B44结合物AEMGKYSFY 26SSX-1 41-49KYSEKISYV 27SSX-3 41-49KVSEKIVYV 28SSX-4 41-49KSSEKIVYV 29SSX-5 41-49KASEKIIYV 30PSMA163-192AFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDM 31PSMA 168-190GMPEGDLVYVNYARTEDFFKLER 32PSMA 169-177MPEGDLVYV 33PSMA 168-177GMPEGDLVYV 34PSMA 168-176GMPEGDLVY 35PSMA 167-176QGMPEGDLVY 36PSMA 169-176MPEGDLVY 37PSMA 171-179EGDLVYVNY 38PSMA 170-179PEGDLVYVNY 39PSMA 174-183LVYVNYARTE 40PSMA 177-185VNYARTEDF 41PSMA 176-185YVNYARTEDF 42PSMA 178-186NYARTEDFF 43PSMA 179-186YARTEDFF 44PSMA 181-189RTEDFFKLE 45PSMA 281-310RGLAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMG 46PSMA 283-307IAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLE 47PSMA 289-297LPSIPVHPI 48PSMA 288-297GLPSIPVHPI 49PSMA 297-305IGYYDAQKL 50PSMA 296-305PIGYYDAQKL 51PSMA 291-299SIPVHPIGY 52PSMA 290-299PSIPVHPIGY 53PSMA 292-299IPVHPIGY 54PSMA 299-307YYDAQKLLE 55PSMA 454-481SSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHLTKEL 56PSMA 456-464IEGNYTLRV 57PSMA 455-464SIEGNYTLRV 58PSMA 457-464EGNYTLRV 59PSMA 461-469TLRVDCTPL 60PSMA 460-469YTLRVDCTPL 61PSMA 462-470LRVDCTPLM 62PSMA 463-471RVDCTPLMY 63PSMA 462-471LRVDCTPLMY 64PSMA 653-687FDKSNPIVLRMMNDQLMFLERAFIDPLGLPDRPFY 65PSMA 660-681VLRMMNDQLMFLERAFIDPLGL 66PSMA 663-671MMNDQLMFL 67PSMA 662-671RMMNDQLMFL 68PSMA 662-670RMMNDQLMF 69Tyr 1-17MLLAVLYCLLWSFQTSA
表1B.包括实施例14和15中的表位的SEQ ID NOS.*SEQ ID NO身份 序列 70GP100蛋白**登记号 ：P40967 71MAGE-1蛋白 登记号 ：P43355 72MAGE-2蛋白 登记号 ：P43356 73MAGE-3蛋白 登记号 ：P43357 74NY-ESO-1蛋白 登记号 ：P78358 75LAGE-1a蛋白 登记号 ：CAA11116 76LAGE-1b蛋白 登记号 ：CAA11117 77PRAME蛋白 登记号 ：NP006106 78PSA蛋白 登记号 ：P07288 79PSCA蛋白 登记号 ：O43653 80GP100 cds 登记号 ：U20093 81MAGE-1 cds 登记号 ：M77481 82MAGE-2 cds 登记号 ：L18920 83MAGE-3 cds 登记号 ：U03735 84NY-ESO-1 cDNA 登记号 ：U87459 85PRAME cDNA 登记号 ：NM_006115 86PSA cDNA 登记号 ：NM_001648 87PSCA cDNA 登记号 ：AF043498 88GP100 630-638LPHSSSHWL 89GP100 629-638QLPHSSHWL 90GP100 614-622 LYRRRLMK 91GP100 613-622 SLIYRRRLMK 92GP100 615-622 IYRRRLMK 93GP100 630-638 LPHSSSHWL 94GP100 629-638 QLPHSSSHWL 95MAGE-1 95-102 ESLFRAVI 96MAGE-1 93-102 ILESLFRAVI 97MAGE-1 93-101 ILESLFRAV 98MAGE-1 92-101 CILESLFRAV 99MAGE-1 92-100 CILESLFRA 100MAGE-1 263-271 EFLWGPRAL 101MAGE-1 264-271 FLWGPRAL 102MAGE-1 264-273 FLWGPRALAE 103MAGE-1 265-274 LWGPRALAET 104MAGE-1 268-276 PRALAETSY 105MAGE-1 267-276 GPRALAETSY 106MAGE-1 269-277 RALAETSYV 107MAGE-1 271-279 LAETSYVKV 108MAGE-1 270-279 ALAETSYVKV 109MAGE-1 272-280 AETSYVKVL 110MAGE-1 271-280 LAETSYVKVL 111MAGE-1 274-282 TSYVKVLEY 112MAGE-1 273-282 ETSYVKVLEY 113MAGE-1 278-286 KVLEYVIKV 114MAGE-1 168-177 SYVLVTCLGL 115MAGE-1 169-177 YVLVTCLGL 116MAGE-1 170-177 VLVTCLGL 117MAGE-1 240-248 TQDLVQEKY 118MAGE-1 239-248 LTQDLVQEKY 119MAGE-1 232-240 YGEPRKLLT 120MAGE-1 243-251 LVQEKYLEY 121MAGE-1 242-251 DLVQEKYLEY 122MAGE-1 230-238 SAYGEPRKL 123MAGE-1 278-286 KVLEYVIKV 124MAGE-1 277-286 VKVLEYVIKV 125MAGE-1 276-284 YVKVLEYVI 126MAGE-1 274-282 TSYVKVLEY 127MAGE-1 273-282 ETSYVKVLEY 128MAGE-1 283-291 VIKVSARVR 129MAGE-1 282-291 YVIKVSARVR 130MAGE-2 115-122 ELVHFLLL 131MAGE-2 113-122 MVELVHFLLL 132MAGE-2 109-116ISRKMVEL 133MAGE-2 108-116AISRKMVEL 134MAGE-2 107-116AAISRKMVEL 135MAGE-2 112-120KMVELVHFL 136MAGE-2 109-117ISRKMVELV 137MAGE-2 108-117AISRKMVELV 138MAGE-2 116-124LVHFLLLKY 139MAGE-2 115-124ELVHFLLLKY 140MAGE-2 111-119RKMVELVHF 141MAGE-2 158-166LQLVFGIEV 142MAGE-2 157-166YLQLVFGIEV 143MAGE-2 159-167QLVFGIEVV 144MAGE-2 158-167LQLVFGIEVV 145MAGE-2 164-172IEVVEVVPI 146MAGE-2 163-172GIEVVEVVPI 147MAGE-2 162-170FGIEVVEVV 148MAGE-2 154-162ASEYLQLVF 149MAGE-2 153-162KASEYLQLVF 150MAGE-2 218-225EEKIWEEL 151MAGE-2 216-225APEEKIWEEL 152MAGE-2 216-223APEEKIWE 153MAGE-2 220-228KIWEELSML 154MAGE-2 219-228EKIWEELSML 155MAGE-2 271-278FLWGPRAL 156MAGE-2 271-279FLWGPRALI 157MAGE-2 278-286LIETSYVKV 158MAGE-2 277-286ALIETSYVKV 159MAGE-2 276-284RALIETSYV 160MAGE-2 279-287IETSYVKVL 161MAGE-2 278-287LIETSYVKVL 162MAGE-3 271-278FLWGPRAL 163MAGE-3 270-278EFLWGPRAL 164MAGE-3 271-279FLWGPRALV 165MAGE-3 276-284RALVETSYV 166MAGE-3 272-280LWGPRALVE 167MAGE-3 271-280FLWGPRALVE 168MAGE-3 272-281LWGPRALVET 169NY-ESO-1 82-90GPESRLLEF 170NY-ESO-1 83-91PESRLLEFY 171NY-ESO-1 82-91GPESRLLEFY 172NY-ESO-1 84-92ESRLLEFYL 173NY-ESO-1 86-94RLLEFYLAM 174NY-ESO-1 88-96LEFYLAMPF 175NY-ESO-1 87-96LLEFYLAMPF 176NY-ESO-1 93-102AMPFATPMEA 177NY-ESO-1 94-102MPFATPMEA 178NY-ESO-1 115-123PLPVPGVLL 179NY ESO-1 114-123PPLPVPGVLL 180NY-ESO-1 116-123LPVPGVLL 181NY-ESO-1 103-112ELARRSLAQD 182NY ESO-1 118-126VPGVLLKEF 183NY-ESO-1 117-126PVPGVLLKEF 184NY-ESO-1 116-123LPVPGVLL 185NY-ESO-1 127-135TVSGNILTI 186NY-ESO-1 126-135FTVSGNILTI 187NY-ESO-1 120-128GVLLKEFTV 188NY-ESO-1 121-130VLLKEFTVSG 189NY-ESO-1 122-130LLKEFTVSG 190NY-ESO-1 118-126VPGVLLKEF 191NY ESO-1 117-126PVPGVLLKEF 192NY-ESO-1 139-147AADHRQLQL 193NY-ESO-1 148-156SISSCLQQL 194NY-ESO-1 147-156LSISSCLQQL 195NY-ESO-1 138-147TAADHRQLQL 196NY ESO-1 161-169WTTQCFLPV 197NY-ESO-1 157-165SLLMWTTQC 198NY-ESO-1 150-158SSCLQQLSL 199NY ESO-1 154-162QQLSLLMWI 200NY-ESO-1 151-159SCLQQLSLL 201NY ESO-1 150-159SSCLQQLSLL 202NY-ESO-1 163-171TQCFLPVFL 203NY-ESO-1 162-171TTQCFLPVFL 204PRAME 219-227PMQDIKMIL 205PRAME 218-227MPMQDIKMIL 206PRAME 428-436QELIGLSNL 207PRAME 427-436LQHLIGLSNL 208PRAME 429-436HLIGLSNL 209PRAME 431-439IGLSNLTHV 210PRAME 430-439LIGLSNLTHV 211PSA 53-61VLVHPQWVL 212PSA 52-61GVLVHPQWVL 213PSA 52-60GVLVHPQWV 214PSA 59-67WVLTAAHCI 215PSA 54-63LVHPQWVLTA 216PSA 53-62VLVHPQWVLT 217PSA 54-62LVHPQWVLT 218PSA 66-73CIRNKSVI 219PSA 65-73HCIRNKSVI 220PSA 56-64HPQWVLTAA 221PSA 63-72AAHCIRNKSV 222PSCA 116-123LLWGPGQL 223PSCA 115-123LLLWGPGQL 224PSCA 114-123GLLLWGPGQL 225PSCA 99-107ALQPAAAIL 226PSCA 98-107HALQPAAAIL 227Tyr 128-137APEKDKFFAY 228Tyr 129-137PEKDKFFAY 229Tyr 130-138EKDKFFAYL 230Tyr 131-138KDKFFAYL 231Tyr 205-213PAFLPWHRL 232Tyr 204-213APAFLPWHRL 233Tyr 214-223FLLRWEQEIQ 234Tyr 212-220RLFLLRWEQ 235Tyr 191-200GSEIWRDIDF 236Tyr 192-200SEIWRDIDF 237Tyr 473-481RIWSWLLGA 238Tyr 476-484SWLLGAAMV 239Tyr 477-486WLLGAAMVGA 240Tyr 478-486LLGAAMVGA 241PSMA 4-12LLHETDSAV 242PSMA 13-21ATARRPRWL 243PSMA 53-61TPKHNMKAF 244PSMA 64-73ELKAENIKKF 245PSMA 69-77NIKKFLH1NF 246PSMA 68-77ENIKKFLH1NF 247PSMA 220-228AGAKGVILY 248PSMA 468-477PLMYSLVHNL 249PSMA 469-477LMYSLVHNL 250PSMA 463-471RVDCTPLMY 251PSMA 465-473DCTPLMYSL 252PSMA 507-515SGMPRISKL 253PSMA 506-515FSGMPRISKL 254NY-ESO-1 136-163RLTAADHRQLQLSISSCLQQLSLLMWIT 255NY-ESO-1 150-177SSCLQQLSLLMWITQCFLPVFLAQPPSG
1在SWISSPROT数据库中该H被报道为Y。
2取决于数据库，位点274的氨基酸可以是Pro或Leu。这里展示的具体分析使用Pro。
表1C.包括实施例14中的表位的SEQ ID NOS.*SEQ ID NO. 身份 序列 256 Mage-1 125-132 KAEMLESV 257 Mage-1 124-132 TKAEMLESV 258 Mage-1 123-132 VTKAEMLESV 259 Mage-1 128-136 MLESVIKNY 260 Mage-1 127-136 EMLESVIKNY 261 Mage-1 125-133 KAEMLESVI 262 Mage-1 146-153 KASESLQL 263 Mage-1 145-153 GKASESLQL 264 Mage-1 147-155 ASESLQLVF 265 Mage-1 153-161 LVFGIDVKE 266 Mage-11 14-121 LLKYRARE 267 Mage-1 106-113 VADLVGFL 268 Mage-1 105-113 KVADLVGFL 269 Mage-1 107-115 ADLVGFLLL 270 Mage-1 106-115 VADLVGFLLL 271 Mage-1 114-123 LLKYRAREPV 272 Mage-3 278-286 LVETSYVKV 273 Mage-3 277-286 ALVETSYVKV 274 Mage-3 285-293 KVLHHMVKI 275 Mage-3 283-291 YVKVLHHMV 276 Mage-3 275-283 PRALVETSY 277 Mage-3 274-283 GPRALVETSY 278 Mage-3 278-287 LVETSYVKVL 279 ED-B 4’-5 TIIPEVPQL 280 ED-B 5’-5 DTIIPEVPQL 281 ED-B 1-10 EVPQLTDLSF 282 ED-B 23-30 TPLNSSTI 283 ED-B 18-25 IGLRWTPL 284 ED-B 17-25 SIGLRWTPL 285 ED-B 25-33 LNSSTIIGY 286 ED-B 24-33 PLNSSTIIGY 287 ED-B 23-31 TPLNSSTII 288 ED-B 31-38 IGYRITVV 289 ED-B 30-38 IIGYRITVV 290 ED-B 29-38 TIIGYRITVV 291 ED-B 31-39 IGYRITVVA 292 ED-B 30-39 IIGYRITVVA 293 CEA 184-191 SLPVSPRL 294 CEA 183-191 QSLPVSPRL 295 CEA 186-193 PVSPRLQL 296 CEA 185-193 LPVSPRLQL 297 CEA 184-193 SLPVSPRLQL 298 CEA 185-192 LPVSPRLQ 299 CEA 192-200 QLSNGNRTL 300 CEA 191-200 LQLSNGNRTL 301 CEA 179-187 WVNNQSLPV 302 CEA 186-194 PVSPRLQLS 303 CEA 362-369 SLPVSPRL 304 CEA 361-369 QSLPVSPRL 305 CEA 364-371 PVSPRLQL 306 CEA 363-371 LPVSPRLQL 307 CEA 362-371 SLPVSPRLQL 308 CEA 363-370 LPVSPRLQ 309 CEA 370-378 QLSNDNRTL 310 CEA 369-378 LQLSNDNRTL 311 CEA 357-365 WVNNQSLPV 312 CEA 360-368 NQSLPVSPR 313 CEA 540-547 SLPVSPRL 314 CEA 539-547 QSLPVSPRL 315 CEA 542-549 PVSPRLQL 316 CEA 541-549 LPVSPRLQL 317 CEA 540-549 SLPVSPRLQL 318 CEA 541-548 LPVSPRLQ 319 CEA 548-556 QLSNGNRTL 320 CEA 547-556 LQLSNGNRTL 321 CEA 535-543 WVNGQSLPV 322 CEA 533-541 LWWVNGQSL 323 CEA 532-541 YLWWVNGQSL 324 CEA 538-546 GQSLPVSPR 325 Her-2 30-37 DMKLRLPA 326 Her-2 28-37 GTDMKLRLPA 327 Her-2 42-49 HLDMLRHL 328 Her-2 41-49 THLDMLRHL 329 Her-2 40-49 ETHLDMLRHL 330 Her-2 36-43 PASPETHL 331 Her-2 35-43 LPASPETHL 332 Her-2 34-43 RLPASPETHL 333 Her-2 38-46 SPETHLDML 334 Her-2 37-46 ASPETHLDML 335 Her-2 42-50 HLDMLRHLY 336 Her-2 41-50 THLDMLRHLY 337 Her-2 719-726 ELRKVKVL 338 Her-2 718-726 TELRKVKVL 339 Her-2 717-726 ETELRKVKVL 340 Her-2 715-723 LKETELRKV 341 Her-2 714-723 ILKETELRKV 342 Her-2 712-720 MRILKETEL 343 Her-2 711-720 QMRILKETEL 344 Her-2 717-725 ETELRKVKV 345 Her-2 716-725 KETELRKVKV 346 Her-2 706-714 MPNQAQMRI 347 Her-2 705-714 AMPNQAQMRI 348 Her-2 706-715 MPNQAQMRIL 349 HER-2 966-973 RPRFRELV 350 HER-2 965-973 CRPRFRELV 351 HER-2 968-976 RFRELVSEF 352 HER-2 967-976 PRFRELVSEF 353 HER-2 964-972 ECRPRFREL 354 NY-ESO-1 67-75 GAASGLNGC 355 NY-ESO-1 52-60 RASGPGGGA 356 NY-ESO-1 64-72 PHGGAASGL 357 NY-ESO-1 63-72 GPHGGAASGL 358 NY-ESO-1 60-69 APRGPHGGAA 359 PRAME 112-119 VRPRRWKL 360 PRAME 111-119 EVRPRRWKL 361 PRAME 113-121 RPRRWKLQV 362 PRAME 114-122 PRRWKLQVL 363 PRAME 113-122 RPRRWKLQVL 364 PRAME 116-124 RWKLQVLDL 365 PRAME 115-124 RRWKLQVLDL 366 PRAME 174-182 PVEVLVDLF 367 PRAME 199-206 VKRKKNVL 368 PRAME 198-206 KVKRKKNVL 369 PRAME 197-206 EKVKRKKNVL 370 PRAME 198-205 KVKRKKNV 371 PRAME 201-208 RKKNVLRL 372 PRAME 200-208 KRKKNVLRL 373 PRAME 199-208 VKRKKNVLRL 374 PRAME 189-196 DELFSYLI 375 PRAME 205-213 VLRLCCKKL 376 PRAME 204-213 NVLRLCCKKL 377 PRAME 194-202 YLIEKVKRK 378 PRAME 74-81 QAWPFTCL 379 PRAME 73-81 VQAWPFTCL 380 PRAME 72-81 MVQAWPFTCL 381 PRAME 81-88 LPLGVLMK 382 PRAME 80-88 CLPLGVLMK 383 PRAME 79-88 TCLPLGVLMK 384 PRAME 84-92 GVLMKGQHL 385 PRAME 81-89 LPLGVLMKG 386 PRAME 80-89 CLPLGVLMKG 387 PRAME 76-85 WPFTCLPLGV 388 PRAME 51-59 ELFPPLFMA 389 PRAME 49-57 PRELFPPLF 390 PRAME 48-57 LPRELFPPLF 391 PRAME 50-58 RELFPPLFM 392 PRAME 49-58 PRELFPPLFM 393 PSA 239-246 RPSLYTKV 394 PSA 238-246 ERPSLYTKV 395 PSA 236-243 LPERPSLY 396 PSA 235-243 ALPERPSLY 397 PSA 241-249 SLYTKVVHY 398 PSA 240-249 PSLYTKWHY 399 PSA 239-247 RPSLYTKVV 400 PSMA 211-218 GNKVKNAQ 401 PSMA 202-209 LARYGKVF 402 PSMA 217-225 AQLAGAKGV 403 PSMA 207-215 KVFRGNKVK 404 PSMA 211-219 GNKVKNAQL 405 PSMA 269-277 TPGYPANEY 406 PSMA 268-277 LTPGYPANEY 407 PSMA 271-279 GYPANEYAY 408 PSMA 270-279 PGYPANEYAY 409 PSMA 266-274 DPLTPGYPA 410 PSMA 492-500 SLYESWTKK 411 PSMA 491-500 KSLYESWTKK 412 PSMA 486-494 EGFEGKSLY 413 PSMA 485-494 DEGFEGKSLY 414 PSMA 498-506 TKKSPSPEF 415 PSMA 497-506 WTKKSPSPEF 416 PSMA 492-501 SLYESWTKKS 417 PSMA 725-732 WGEVKRQI 41 8 PSMA 724-732 AWGEVKRQI 419 PSMA 723-732 KAWGEVKRQI 420 PSMA 723-730 KAWGEVKR 421 PSMA 722-730 SKAWGEVKR 422 PSMA 731-739 QIYVAAFTV 423 PSMA 733-741 YVAAFTVQA 424 PSMA 725-733 WGEVKRQIY 425 PSMA 727-735 EVKRQIYVA 426 PSMA 738-746 TVQAAAETL 427 PSMA 737-746 FTVQAAAETL 428 PSMA 729-737 KRQIYVAAF 429 PSMA 721-729 PSKAWGEVK 430 PSMA 723-731 KAWGEVKRQ 431 PSMA 100-108 WKEFGLDSV 432 PSMA 99-108 QWKEFGLDSV 433 PSMA 102-111 EFGLDSVELA 434 SCP-1 126-134 ELRQKESKL 435 SCP-1 125-134 AELRQKESKL 436 SCP-1 133-141 KLQENRKII 437 SCP-1 298-305 QLEEKTKL 438 SCP-1 297-305 NQLEEKTKL 439 SCP-1 288-296 LLEESRDKV 440 SCP-1 287-296 FLLEESRDKV 441 SCP-1 291-299 ESRDKVNQL 442 SCP-1 290-299 EESRDKVNQL 443 SCP-1 475-483 EKEVHDLEY 444 SCP-1 474-483 REKEVHDLEY 445 SCP-1 480-488 DLEYSYCHY 446 SCP-1 477-485 EVHDLEYSY 447 SCP-1 477-486 EVHDLEYSYC 448 SCP-1 502-509 KLSSKREL 449 SCP-1 508-515 ELKNTEYF 450 SCP-1 507-515 RELKNTEYF 451 SCP-1 496-503 KRGQRPKL 452 SCP-1 494-503 LPKRGQRPKL 453 SCP-1 509-517 LKNTEYFTL 454 SCP-1 508-517 ELKNTEYFTL 455 SCP-1 506-514 KRELKNTEY 456 SCP-1 502-510 KLSSKRELK 457 SCP-1 498-506 GQRPKLSSK 458 SCP-1 497-506 RGQRPKLSSK 459 SCP-1 500-508 RPKLSSKRE 460 SCP-1 573-580 LEYVREEL 461 SCP-1 572-580 ELEYVREEL 462 SCP-1 571-580 NELEYVREEL 463 SCP-1 579-587 ELKQKREDEV 464 SCP-1 575-583 YVREELKQK 465 SCP-1 632-640 QLNVYEIKV 466 SCP-1 630-638 SKQLNVYEI 467 SCP-1 628-636 AESKQLNVY 468 SCP-1 627-636 TAESKQLNVY 469 SCP-1 638-645 IKVNKLEL 470 SCP-1 637-645 EIKVNKLEL 471 SCP-1 636-645 YEIKVNKLEL 472 SCP-1 642-650 KLELELESA 473 SCP-1 635-643 VYEIKVNKL 474 SCP-1 634-643 NVYEIKVNKL 475 SCP-1 646-654 ELESAKQKF 476 SCP-1 642-650 KLELELESA 477 SCP-1 646-654 ELESAKQKF 478 SCP-1 771-778 KEKLKREA 479 SCP-1 777-785 EAKENTATL 480 SCP-1 776-785 REAKENTATL 481 SCP-1 773-782 KLKREAKENT 482 SCP-1 112-119 EAEKIKKW 483 SCP-1 101-109 GLSRVYSKL 484 SCP-1 100-109 EGLSRVYSKL 485 SCP-1 108-116 KLYKEAEKI 486 SCP-1 98-106 NSEGLSRVY 487 SCP-1 97-106 ENSEGLSRVY 488 SCP-1 102-110 LSRVYSKLY 489 SCP-1 101-110 GLSRVYSKLY 490 SCP-1 96-105 LENSEGLSRV 491 SCP-1 108-117 KLYKEAEKIK 492 SCP-1 949-956 REDRWAVI 493 SCP-1 948-956 MREDRWAVI 494 SCP-1 947-956 KMREDRWAVI 495 SCP-1 947-955 KMREDRWAV 496 SCP-1 934-942 TTPGSTLKF 497 SCP-1 933-942 LTTPGSTLKF 498 SCP-1 937-945 GSTLKGAI 499 SCP-1 945-953 IRKMREDRW 500 SCP-1 236-243 RLEMHFKL 501 SCP-1 235-243 SRLEMHFKL 502 SCP-1 242-250 KLKEDYEKI 503 SCP-1 249-257 KIQHLEQEY 504 SCP-1 248-257 EKIQHLEQEY 505 SCP-1 233-242 ENSRLEMHF 506 SCP-1 236-245 RLEMHFKLKE 507 SCP-1 324-331 LEDIKVSL 508 SCP-1 323-331 ELEDIKVSL 509 SCP-1 322-331 KELEDIKVSL 510 SCP-1 320-327 LTKELEDI 511 SCP-1 319-327 HLTKELEDI 512 SCP-1 330-338 SLQRSVSTQ 513 SCP-1 321-329 TKELEDIKV 514 SCP-1 320-329 LTKELEDIKV 515 SCP-1 326-335 DIKVSLQRSV 516 SCP-1 281-288 KMKDLTFL 517 SCP-1 280-288 NKMKDLTFL 518 SCP-1 279-288 ENKMKDLTFL 519 SCP-1 288-296 LLEESRDKV 520 SCP-1 287-296 FLLEESRDKV 521 SCP-1 291-299 ESRDKVNQL 522 SCP-1 290-299 EESRDKVNQL 523 SCP-1 277-285 EKENKMKDL 524 SCP-1 276-285 TEKENKMKDL 525 SCP-1 279-287 ENKMKDLTF 526 SCP-1 218-225 IEKMITAF 527 SCP-1 217-225 NIEKMITAF 528 SCP-1 216-225 SNIEKMITAF 529 SCP-1 223-230 TAFEELRV 530 SCP-1 222-230 ITAFEELRV 531 SCP-1 221-230 MITAFEELRV 532 SCP-1 220-228 KMITAFEEL 533 SCP-1 219-228 EKMITTAFEEL 534 SCP-1 227-235 ELRVQAENS 535 SCP-1 213-222 DLNSNSNIEKMI 536 SCP-1 837-844 WTSAKNTL 537 SCP-1 846-854 TPLPKAYTV 538 SCP-1 845-854 STPLPKAYTV 539 SCP-1 844-852 LSTPLPKAY 540 SCP-1 843-852 TLSTPLPKAY 541 SCP-1 842-850 NTLSTPLPK 542 SCP-1 841-850 KNTLSTPLPK 543 SCP-1 828-835 ISKDKRDY 544 SCP-1 826-835 HGISKDKRDY 545 SCP-1 832-840 KRDYLWTSA 546 SCP-1 829-838 SKDKRDYLWT 547 SCP-1 279-286 ENKMKDLT 548 SCP-1 260-268 EINDKEKQV 549 SCP-1 274-282 QITEKENKM 550 SCP-1 269-277 SLLLIQITE 551 SCP-1 453-460 FEKIAEEL 552 SCP-1 452-460 QFEKIAEEL 553 SCP-1 451-460 KQFEKIAEEL 554 SCP-1 449-456 DNKQFEKI 555 SCP-1 448-456 YDNKQFEKI 556 SCP-1 447-456 LYDNKQFEKI 557 SCP-1 440-447 LGEKETLL 558 SCP-1 439-447 VLGEKETLL 559 SCP-1 438-447 KVLGEKETLL 560 SCP-1 390-398 LLRTEQQRL 561 SCP-1 389-398 ELLRTEQQRL 562 SCP-1 393-401 TEQQRLENY 563 SCP-1 392-401 RTEQQRLENY 564 SCP-1 402-410 EDQLIILTM 565 SCP-1 397-406 RLENYEDQLI 566 SCP-1 368-375 KARAAHSF 567 SCP-1 376-384 VVTEFETTV 568 SCP-1 375-384 FVVTEFETTV 569 SCP-1 377-385 VTEFETTVC 570 SCP-1 376-3 85 VVTEFETTVC 571 SCP-1 344-352 DLQIATNTI 572 SCP-1 347-355 IATNTICQL 573 SCP-1 346-355 QIATNTICQL 574 SSX4 57-65 VMTKLGFKY 575 SSX4 53-61 LNYEVMTKL 576 SSX4 52-61 KLNYEVMTKL 577 SSX4 66-74 TLPPFMRSK 578 SSX4 110-118 KIMPKKPAE 579 SSX4 103-112 SLQRIFPKIM 580 Tyr 463-471 YIKSYLEQA 581 Tyr 459-467 SFQDYIKSY 582 Tyr 458-467 DSFQDYIKSY 583 Tyr 507-514 LPEEKQPL 584 Tyr 506-514 QLPEEKQPL 585 Tyr 505-514 KQLPEEKQPL 586 Tyr 507-515 LPEEKQPLL 587 Tyr 506-515 QLPEEKQPLL 588 Tyr 497-505 SLLCRHKRK 589纤连蛋白的ED-B结构域 EVPQLTDLSFVDITDSSIGLRWTPLNSSTIIGYRI TVVAAGEGIPIFEDFVDSSVGYYTVTGLEPGID YDISVITLINGGESAPTTLTQQT 590含有来源于纤连蛋白的侧翼序列的纤连蛋白ED-B 结构域 CTFDNLSPGLEYNVSVYTVKDDKESVPISDTIIP EVPQLTDLSFVDITDSSIGLRWTPLNSSTIIGYRI TVVAAGEGIPIFEDFVDSSVGYYTVTGLEPGID YDISVTTLINGGESAPTTLTQQT AVPPPTDLRFTNIGPDTMRVTW 591 纤连蛋白cds 的ED-B结构域 登记号：X07717 592 CEA蛋白 登记号：P06731 593 CEAcDNA 登记号：NM_004363 594 Her2/Neu蛋白 登记号 ：P04626 595 Her2/Neu cDNA 登记号 ：M11730 596 SCP-1蛋白 登记号 ：Q15431 597 SCP-1 cDNA 登记号 ：X95654 598 SSX-4 蛋白 登记号 ：O60224 599 SSX-4 cDNA 登记号 ：NM_005636
*在本发明的各种实施方案的任一个中可将SEQ ID NOS.1，8，9，11-23，26-29，32-44，47-54，56-63，66-68，88-253，和256-588中的任一个用作表位。如在本发明的各种实施方案中所描述，可将SEQ ID NOS.10，30，31，45，46，55，64，65，69，254，和255用作含有表位或表位聚簇的序列。
**这里和从头到尾使用的所有登记号可以通过NCBI数据库访问，例如通过万维网上的Entrez搜索和检索系统。
注意下列讨论阐明发明人对本发明操作的理解。然而，不意图用本讨论将本专利限制于在后附权利要求中未阐明的任何具体操作理论。
在进行表位疫苗开发中，其他人已经产生基于MHC结合基序的预测表位列表。这类肽可以是免疫原性的，但可能不对应任何天然产生的抗原片段。因此，整个抗原将不引发类似的应答或使靶细胞对通过CTL的细胞溶解敏感。因此该列表不区分可以用作疫苗的那些序列和不可以用作疫苗的那些序列。测定这些预测表位中的哪些实际上是天然产生的努力已经经常依赖于筛选它们与肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)的反应性。然而，尽管肿瘤(和慢性感染细胞)将通常呈递管家表位，但TIL强烈偏向于识别免疫表位。因此，除非表位是由管家和免疫蛋白酶体两者生产，靶细胞将通常不为用TIL-鉴定的表位诱导的CTL所识别。相反，本发明的表位是通过特定蛋白酶体的作用产生，表明可以天然生产它们，并赋予它们适当的用途。在PCT出版物WO 01/82963A2中更充分地阐明了管家和免疫表位之间的差别对于疫苗设计的重要意义。
本发明的表位包括或编码TAAs的多肽片段，其是通过管家或免疫蛋白酶体进行蛋白酶体切割的前体或产物，并含有或包括对至少一个MHC I等位基因具有已知或预测亲和力的序列。在一些实施方案中，所述表位包括或编码长度约为6-25个氨基酸的多肽，其优选长度约为7-20个氨基酸，更优选长度约为8-15个氨基酸，还更优选长度约为9或10个氨基酸。然而，应当理解只要N-末端修剪可以产生MHC表位或它们不含有导致多肽被引导远离蛋白酶体或被蛋白酶体破坏的序列，所述多肽可以更大。对于免疫表位，如果更大的肽不含有这类序列，它们可以在pAPC中为免疫蛋白酶体所加工。如果通过免疫蛋白酶体作用序列适合于促进表位C-末端的释放，也可将管家表位内嵌于更长的序列中。上述讨论已经假定更长表位的加工通过pAPC免疫蛋白酶体的作用进行。然而，加工还可以通过设计一些其它机制来完成，如提供外源蛋白酶活性和适应的序列结果蛋白酶的作用释放MHC表位。可以对这些表位序列进行计算机分析以计算物理，生物化学，免疫学或分子遗传特性，如质量，等电点，预测电泳迁移率，预测与其它MHC分子的结合，核酸探针的解链温度，反向翻译，与其它序列的相似性或同源性等。
在构建编码本发明多肽表位的多核苷酸中，可以使用相关TAA的基因序列，或者多核苷酸可以由任何对应的密码子组装。对于10个氨基酸的表位，这可以组成大约106种不同序列，其取决于具体的氨基酸组成。尽管大，这是一种相异(distinct)的和容易定义的集合，其表示＞1018该长度可能的多核苷酸中的一个很小部分，因此在一些实施方案中，在这里公开的具体序列的等价物包括在列表序列上的这类相异的和容易定义的变异。在选择这些序列中的具体一个用于疫苗过程中，如对于本领域技术人员将是明显的，可以利用条件如密码子使用，自身互补性，限制位点，化学稳定性等。
本发明意图生产肽表位。具体地，这些表位来源于TAA序列，并对至少一个MHC I等位基因具有已知或预测的亲和力。这类表位典型地与在靶细胞或pAPCs上产生的那些相同。
包含活性表位的组合物
本发明的实施方案提供多肽组合物，其包括疫苗，治疗法，诊断学，药理学和药物组合物。各种组合物包括新鉴定的TAAs的表位以及这些表位的变体。本发明的其它实施方案提供编码本发明多肽表位的多核苷酸。本发明另外提供用于表达适于纯化的多肽表位的载体。另外，本发明提供用作抗肿瘤疫苗的在APC中表达多肽表位的载体。可以使用来源于表1的任何表位或抗原，或编码它的核酸。其它实施方案涉及生产和使用各种组合物的方法。
可以描述I类MHC-结合表位的总体结构，其在Madden，D.R.Annu.Rev.Immunol.13：587-622，1995中已经被更全面地综述。许多结合能产生于MHC分子中的保守残基与肽的N-和C-末端之间的主链接触。产生另外的主链接触但在MHC等位基因中不同。序列特异性是由所谓的锚定残基的侧链与又在MHC等位基因中变化的口袋接触所赋予的。可以将锚定残基分为主要的(primary)和次要的(secondary)。主要锚定位点显示强烈优选相对严格定义的氨基酸残基组。次要位点显示较弱和/或较少严格定义的优选残基，所述严格定义的优选可经常根据较少优选而不是较多优选来更好地描述。另外，一些次要锚定位点中的残基根本不是总被定位与MHC分子上的口袋接触。因此，存在一种肽亚型，其与特定的MHC分子结合并在正在讨论中的位点处存在侧链-口袋接触，并且存在另一种亚型，其显示与相同MHC分子的结合，所述结合不依赖于肽在MHC分子肽-结合沟中呈现的构象。C-末端残基(P；ω)优选是主要锚定残基。对于许多研究更好的HLA分子(例如A2，A68，B27，B7，B35和B53)第二位置(P2)也是一个锚定残基。然而，也已经观察到中央锚定残基，其包括HLA-B8中的P3和P5，以及分别在鼠MHC分子H-2Db和H-2Kb中的P5和P(ω)-3。因为更稳定的结合通常将改善免疫原性，不管它们的位置，在设计变体中优选锚定残基是保守的或最优化的。
由于锚定残基通常是位于表位末端附近，肽向上弯曲而到肽-结合沟以外，其允许长度上的一些变化。对于HLA-A68已经发现8-11个氨基酸的表位，对于HLA A2高达13个氨基酸。除锚定位置之间的长度变化之外，已经报道单个残基平截和延伸并且分别在N-和C-末端。在非锚定残基中，一些突出到沟以外，不与MHC分子发生接触但可以用来与TCR接触，对于HLA-A2最经常是P1，P4和P(ω)-1。其它非锚定残基可以变成插入肽结合沟上边缘和TCR之间，与两者接触。这些侧链残基的精确定位，和如此它们对结合，MHC精细构象和最终免疫原性的影响是高度依赖序列的。对于高度免疫原性的表位，它必须不仅促进对于发生激活稳定的足够的TCR结合，而且TCR还必须具有足够高的脱离速率(off-rate)以便多个TCR分子可以顺序与相同的肽-MHC复合体相互作用(Kalergis，A.M.等，Nature Immunol.2：229-234，2001)。因此，在没有关于三元复合体另外信息的情况下，当设计变体时，在这些位置的保守和非保守置换都值得考虑。
例如使用任何用于保守和非保守突变的技术和指南可以产生多肽表位变体。变体可以衍生于与天然序列比较的一个或多个氨基酸的置换，缺失或插入。氨基酸置换可以是用另一个具有相似结构和/或化学特性的氨基酸置换一个氨基酸的结果，例如用丝氨酸置换苏氨酸。该置换被称为保守氨基酸置换，并且所有适当的保守氨基酸置换被认为是一种发明的实施方案。插入或缺失可以任选为大约1-4，优选1-2个氨基酸。通常优选保持肽的“锚定位点”，其负责与正在讨论中的MHC分子结合。确实，在许多情形中通过在锚定位点置换更多的优选残基可以改善肽的免疫原性(Franco，等，Nature Immunology，1(2)：145-150，2000)。在保持与原表位充分的交叉反应性以构成有效疫苗的同时，通过用更大体积的氨基酸取代在非锚定位点发现的小氨基酸也经常可以改善肽的免疫原性。通过常规插入，缺失或置换序列中的氨基酸和检验产生的变体通过多肽表位显示的活性可以测定允许的变异。由于多肽表位经常是9个氨基酸，优选对最短的活性表位进行置换，例如9个氨基酸的表位。
还可以通过将任何序列加至多肽表位变体的N末端产生变体。这类N-末端增加可以是从1个氨基酸直至至少25个氨基酸。因为肽表位经常被pAPC中活泼的N-末端外肽酶修剪，必须理解所增加序列中的变异可以对表位活性没有影响。在优选实施方案中，末尾的上游蛋白酶体切割位点与MHC表位N-末端之间的氨基酸残基不包括脯氨酸残基。Serwold，T.等，Nature Immunol.2：644-651，2001。因此，可以从比优选9-链节(9-mer)I类基序更大的前体产生有效表位。
通常，就它们对应于在靶细胞或pACP表面上由MHC I实际展示的表位而言肽是有效的。单个的肽对不同MHC分子可具有不同亲和力，与一些结合良好，有些适当结合，还有些一点也不结合(表2)。传统上已将MHC等位基因按照血清学反应性分类，所述血清学反应性不反映在相同类型的等位基因中可以不同的肽-结合沟的结构。类似地，跨越类型(across type)可以共享结合特性；已经将基于共享结合特性的类群称为超类型(supertype)。在人种群中存在许多MHC I等位基因；基于患者的基因型可以选择对某些等位基因特异性的表位。
表2
酪氨酸酶207-216(SEQ ID NO.1)与各种MHC类型的预测结合 MHC I类型 *解离半衰期(min) A1 0.05 A*0201 1311. A*0205 50.4 A3 2.7 A*1101(部分A3超类型) 0.012 A24 6.0 B7 4.0 B8 8.0 B14(部分B27超类型) 60.0 B*2702 0.9 B*2705 30.0 B*3501(部分B7超类型) 2.0 B*4403 0.1 B*5101(部分B7超类型) 26.0 B*5102 55.0 B*5801 0.20 B60 0.40 B62 2.0
*HLA肽结合预测(万维网超文本传输协议“访问bimas.dcrt.nih.gov/molbio/hla_bin”)。
在本发明的另外实施方案中，可以将作为肽或编码多核苷酸的所述表位作为药物组合物给药，例如，疫苗或免疫原性组合物，单独或与各种佐剂，载体或赋形剂结合。应当指出，尽管术语疫苗可以贯穿这里的讨论中使用，该概念可以与包括在这里提及的那些的任何其它药物组合物一起施用或使用。特别有利的佐剂包括各种细胞因子和包含免疫刺激序列的寡核苷酸(如在这里参考的同时待审的申请中所更详细地阐明)。另外，可将编码表位的多核苷酸包含于病毒(例如牛痘或腺病毒)中或微生物宿主细胞(例如沙门氏菌属(Salmonella)或单核细胞增生利斯特氏菌(Listeria monocytogenes))中，其随后被用作多核苷酸的载体(Dietrich，G.等Nat.Biotech.16：181-185，1998)。备选地，可以离体转化pAPC以表达所述表位，或用肽表位脉冲以其自身作为疫苗给药。为了提高这些方法的效率，可以用病毒或细菌载体携带编码的表位，或者与pAPC上发现的受体的配体络合。类似地，肽表位可以与pAPC配体络合或偶联。一种疫苗可以包括多于一个单个表位。
在2000年4月28号提交的题为“EPITOPE SYNCHRONIZATION INANTIGEN PRESENTING CELLS，”的美国专利申请号09/560,465中公开了对于将表位和/或表位聚簇结合至疫苗或药物组合物中的特别有利的策略。在2000年4月28号提交的题为“EPITOPE CLUSTERS”的美国专利申请号09/561,571中公开了与本发明共同使用的表位聚簇。
本发明的优选实施方案是以使pAPC或pAPCs群体呈递对应于在特定靶细胞上展示的表位的管家表位的疫苗和方法为目标。例如可使用表1中的任何表位或抗原。在一个实施方案中，管家表位是由特定肿瘤类型的管家蛋白酶体加工的TuAA表位。在另一个实施方案中，管家表位是由感染病毒的细胞的管家蛋白酶体加工的病毒相关表位。这促进对靶细胞的特异性T细胞应答。因为它们展示管家表位或免疫表位，对应于不同诱导状态(攻击前或攻击后)pAPCs同时表达多种表位可以激发有效对抗靶细胞的CTL应答。
通过含有在pAPC上呈递的管家和免疫表位，本实施方案可以最优化对靶细胞的细胞毒性T细胞应答。通过双重表位表达，当肿瘤细胞在由IFN的诱导下从管家蛋白酶体转换至免疫蛋白酶体时，pAPCs可以继续维持对免疫类型表位的CTL应答，所述IFN例如可以通过肿瘤浸润CTLs产生。
在一个优选实施方案中，使用包括管家表位的疫苗免疫患者。许多优选的TAAs专门与一种靶细胞相关，特别是在感染细胞的情形中。在另一个实施方案中，许多优选的TAAs是在转化细胞中解除控制(deregulated)的基因表达的结果，但在睾丸，卵巢组织和胎儿中也发现。在另一个实施方案中，有效的TAAs在靶细胞中比在其它细胞中更高水平地表达。在其它实施方案中，与其它细胞相比TAAs在靶细胞中不差异表达，但还是有效的，因为它们与细胞的一种特定功能有关并将靶细胞从大多数其它周围细胞区别开来；在这些实施方案中，也显示TAA的健康细胞可能被诱导的T细胞应答并联攻击，但该附带损害被认为远比靶细胞导致的情形优选。
疫苗以导致pAPC或pAPCs群体展示管家表位的有效浓度包含一种管家表位。有利地，疫苗可包括多种管家表位或任选与一种或多种免疫表位结合的一种或多种管家表位。疫苗制剂以足以导致pAPCs呈递表位的浓度包含肽和/或核酸。制剂优选以大约1μg-1mg/100μl疫苗制剂的总浓度包含表位。本发明可使用适于肽疫苗和/或核酸疫苗的常规剂量和定量给药，该给药方法在本领域是被很好理解的。在一个实施方案中，对于成人的单剂量可便利地为大约1μl至大约5000μl的该组合物，一次或多次给药，例如间隔1周，2周，一个月或更长的2，3，4或更多剂量。参照结节内方法专利胰岛素泵(insulin pump)每小时送递1μl(最低频率)。
这里公开的本发明的组合物和方法还意图将佐剂结合至制剂中以增强疫苗的性能。具体地，设计将佐剂加入制剂以增强pAPCs的表位送递或摄取。本发明考虑的佐剂为本领域中的技术人员已知并包括例如GMCSF，GCSF，IL-2，IL-12，BCG，破伤风毒素，骨桥蛋白和ETA-1。
在本发明的一些实施方案中，疫苗可包括一种重组生物，如被遗传改造以在宿主中表达表位的病毒，细菌或寄生物。例如，单核细胞增生利斯特氏菌，一种革兰氏阳性，兼性胞内细菌，是一种将TuAAs靶向免疫系统的有效载体。在一个优选的实施方案中，可以改造该载体来表达一种管家表位以诱导治疗应答。该生物感染的正常途径是通过肠并且可以口服递送。在另一个实施方案中，可以使用一种编码针对TuAA的管家表位的腺病毒(Ad)载体来诱导抗病毒或抗肿瘤应答。可以使用病毒构建体转导衍生于骨髓的树突细胞并随后注射，或者可以直接通过皮下注射将病毒递送至动物中以诱导有效的T-细胞应答。另一个实施方案使用一种重组牛痘病毒，其被改造来编码相应于针对TAA的管家表位的氨基酸序列。携带小基因构建体形式的含有适当核苷酸置换的构建体的牛痘病毒可以指导管家表位的表达，导致针对表位的治疗性T细胞应答。
使用DNA免疫要求APCs摄取DNA并且表达编码的蛋白质或肽。可以在DNA上编码离散的I类肽。通过用该构建体免疫，可使APCs表达管家表位，其然后在细胞表面I类MHC上展示以刺激适当的CTL应答。在2000年4月28提交的题为EXPRESSION VECTORS ENCODINGEPITOPES OF TARGET-ASSOCIATED ANTIGENS的美国专利申请号09/561,572中已经描述了通常依赖于翻译终止或非蛋白酶体蛋白酶以产生适当的管家表位末端的构建体。
如所提及的，理想的是在更大的蛋白质前后序列中表达管家肽。即使当少量的氨基酸存在表位末端以外也能检测到加工。小肽激素是通常从经常尺寸大小约为60-120个氨基酸的较长的翻译产物蛋白水解加工而来。该事实导致一些人设想这是可以有效翻译的最小尺寸。在一些实施方案中，可将管家肽内嵌在至少约60个氨基酸的翻译产物中。在其它实施方案中可将管家肽内嵌在至少约50，30或15个氨基酸的翻译产物中。
由于有差别的蛋白酶体加工，pAPC的免疫蛋白酶体产生与由周围体细胞中的管家蛋白酶体产生的那些不同的肽。因此，在较大蛋白质的前后序列中表达管家肽过程中，优选在APC中在不同于它全长天然序列的前后序列中表达它，因为，作为管家表位，通常只能通过管家蛋白酶体从天然蛋白质有效加工，所述管家蛋白酶体在APC中不活跃。为了在编码较大蛋白质的DNA序列中编码管家表位，在编码表位的序列的任意一侧找到允许免疫蛋白酶体适当切割以释放管家表位的侧翼区域是有用的。改变所需管家表位N-末端和C-末端的侧翼氨基酸残基可以促进在APC中适当切割和产生管家表位。可以从新设计并筛选内嵌管家表位的序列以确定哪个可以被免疫蛋白酶体成功加工来释放管家表位。
备选地，另一种策略对于鉴定允许在APC中产生管家表位的序列是非常有效的。一种邻接氨基酸序列可以从一种或多种管家表位从头至尾的排列产生。使用表达该序列的构建体免疫动物，并评估产生的T细胞应答以确定它对排列中一种或多种表位的特异性。由定义，这些免疫应答显示在pAPC中被有效加工的管家表位。由此确定了该表位周围的必需的侧翼区域。使用期望肽任意一侧约4-6个氨基酸的侧翼区域可以提供促进通过免疫蛋白酶体的管家表位的蛋白酶体加工所必需的信息。因此，可以将保证表位同步化的约16-22个氨基酸的序列有效插入或融合至任何蛋白质序列以导致在APC中产生管家表位。在备选实施方案中，可以将整个头尾排列的表位，或只是紧邻着正确加工管家表位的表位类似地从测试构建体转移至疫苗载体。
在一个优选实施方案中，可以将管家表位内嵌在已知的免疫表位，或这样的区段之间，从而提供适于加工的前后序列。管家和免疫表位的接合点可以产生使免疫蛋白酶体释放管家表位所必需的前后序列，或优选包括正确C-末端的更大片段。筛选构建体以证实产生了所需表位是有用的。管家表位的结合点可以产生可以被免疫蛋白酶体切割的位点。本发明的一些实施方案使用已知表位侧邻测试底物中的管家表位；在其它实施方案中，使用如下所述的筛选来确定侧翼区域是任意序列还是天然侧翼序列的突变体，在设计底物中是否使用蛋白酶体切割优选的知识。
尽管有利，在成熟表位N-末端的切割是不必需的，因为在细胞中存在多种N-末端修剪活性，其能够在蛋白酶体加工之后产生成熟的表位N末端。优选该N-末端延伸小于大约25个氨基酸长度，并进一步优选该延伸含有很少或没有脯氨酸残基。优选地，在筛选中，不仅对在表位末端(或至少在它的C-末端)的切割给予考虑，而且对确保在表位内部的有限切割给予考虑。
可以将鸟枪法用于设计测试底物并可提高筛选效率。在一个实施方案中可以依次组合多种表位，单个表位可出现多次。可以筛选底物以确定可以产生哪种表位。在其中一种特定表位是所关心的情形中，可以设计其中它在多种不同前后序列中出现的底物。当将在多于一种前后序列中出现的单个表位从底物释放时，可以使用附加的第二测试底物来确定哪个是被释放和真正构成保证表位同时化的序列，所述第二测试底物中表位的特殊实例(individual instances)被去除，禁止或是唯一的。
存在几种容易实行的筛选。一种优选的体外筛选利用蛋白酶体消化分析，其使用纯化的免疫蛋白酶体，来确定所需的管家表位是否能从包含正在讨论中的该序列的合成肽中释放出来。可以通过技术如质谱，HPLC和N-末端池测序来测定获得切割的位置；如在题为METHOD OF EPITOPEDISCOVERY，EPITOPE SYNCHRONIZATION IN ANTIGENPRESENTING CELLS的美国专利申请，题为EPITOPE SEQUENCES的两项临时美国专利申请中更详细地描述。
备选地，可以使用体内筛选如免疫或目标敏化(target sensitization)。对于免疫使用可以表达正在讨论中的序列的核酸构建体。可以检验收获的CTL识别呈递正在讨论中的管家表位的靶细胞的能力。通过用含成熟管家表位的合成肽脉冲表达适当MHC分子的细胞极其容易获得这类靶细胞。备选地，可以使用已知表达管家蛋白酶体的细胞和抗原，从所述抗原可内源地或通过遗传工程衍生管家表位。为了将目标敏化用作筛子，可以使用识别管家表位的CTL，或优选CTL克隆。在该情形中，它是表达内嵌的管家表位的靶细胞(而不是在免疫期间的pAPC)并且它必须表达免疫蛋白酶体。通常，可以使用一种适当的核酸构建体转化靶细胞以赋予内嵌管家表位的表达。使用装载肽的脂质体或蛋白质转移试剂如BIOPORTERTM(Gene Therapy Systems，San Diego，CA)装载一种包含内嵌表位的合成肽代表一种备选方案。
在2000年4月28日提交的题为“EXPRESSION VECTORSENCODING EPITOPES OF TARGET-ASSOCIATED ANTIGENS”的美国专利申请号No.09/561,572中公开了关于用作依照本发明疫苗的核酸构建体的另外指导。此外，在11/7/2001提交的题为“EXPRESSION VECTORSENCODING EPITOPES OF TARGET-ASSOCIATED ANTIGENS ANDMETHODS FOR THEIR DESIGN”的美国专利申请号60/336,968(律师备案号(attorney docket number)CTLIMM.022PR)中公开了依照本发明有用的表达载体和关于它们设计的方法。
本发明的一个优选实施方案包括给药包括一种表位(或多种表位)的疫苗以诱导治疗性免疫应答的方法。将疫苗以与本领域已知的标准疫苗递送方案一致的方法对患者给药。给药TAAs表位的方法包括，不限于经皮的，结节内的，结节周围的，口服的，静脉内的，皮内的，肌内的，腹膜内的和粘膜给药，包括通过注射，滴注或吸入递送。在2002年1月17日颁发的澳大利亚专利号739189；标题都为“A METHOD OFINDUCING A CTL RESPONSE，”的1999年9月1日提交的美国专利申请号09/380,534；和在2001年2月2日提交的其部分继续申请美国专利申请号09/776,232中公开了一种递送疫苗以引发CTL应答的特别有用的方法。
试剂识别表位
在本发明的另一方面，考虑对表位和/或表位-MHC分子复合体具有结合特异性的蛋白质，以及通过其可以表达它们的分离的细胞。在一组实施方案中，这些试剂采取免疫球蛋白的方式：多克隆血清或单克隆抗体(mAb)，生产其的方法在本领域是众所周知的。产生对肽-MHC分子复合体具有特异性的mAb在本领域是已知的。参见例如Aharoni等，Nature351：147-150，1991；Andersen等Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93：1820-1824，1996；Dadaglio等Immunity 6：727-738，1997；Duc等Int.Immunol.5：427-431，1993；Eastman等Eur.J.Immunol. 26：385-393，1996；Engberg等Immunotechnology 4：273-278，1999；Porgdor等Immunity 6：715-726，1997；Puri等J.Immunol. 158：2471-2476，1997；和Polakova，K.，等J.Immunol.165 342-348，2000。
在其它实施方案中，可将所述组合物用来体内和体外诱导和产生对任何表位和/或表位-MHC复合体特异的T-细胞。在优选实施方案中，表位可以是例如在表1中列出的那些中的任何一种或多种。因此，实施方案还涉及和包括分离的T细胞，T细胞克隆，T细胞杂交瘤或含有衍生于克隆基因的T细胞受体(TCR)结合域的蛋白质，以及表达该蛋白质的重组细胞。该TCR衍生的蛋白质可以仅仅是TCR的胞外域，或与另外一种蛋白质的部分的融合以赋予所需的性质或功能。该融合的一个实例是将TCR结合域附着在抗体分子的恒定区以便产生二价分子。已经报道按照该常规模式的分子的构建和活性，例如Plaksin，D.等J.Immunol.158：2218-2227，1997和Lebowitz，M.S.等Cell Immunol.192：175-184，1999。在题为T CELL RECEPTORS AND THEIR USE IN THERAPEUTICAND DIAGNOSTIC METHODS的美国专利5,830,755中也讨论了这类分子更多的常规构建和使用。
通过标准免疫实验室动物可以容易地实现这类T细胞的生产，并且通过用人靶细胞免疫或通过用抗原/表位免疫HLA-转基因动物可以获得对人靶细胞的反应性。对于一些治疗方法，衍生于相同物种的T细胞是理想的。尽管该细胞可以通过例如将鼠TCR克隆于如上所考虑的人T细胞中产生，但体外免疫人细胞提供一种潜在地更快的选择。即使使用首次用于实验的供体(naive donors)，用于体外免疫的技术在本领域也是已知的，例如Stauss等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89：7871-7875，1992；Salgaller等Cancer Res.55：4972-4979，1995；Tsai等，J.Immunol.158：1796-1802，1997；和Chung等，J.Immunother.22：279-287，1999。
可以将这些分子的任一种与酶，放射化学试剂，荧光标签和毒素偶联，以便用于诊断(成象或其它检测)，监测和治疗与表位相关的致病疾病。因此可以给药毒素偶联物以杀死肿瘤细胞，放射化学试剂可以促进表位阳性肿瘤的成象，可将酶偶联物用于类似ELISA的试验来诊断癌症和证实在活体解剖组织中的表位表达。在另一个实施方案中，在通过用表位和/或细胞因子刺激完成扩增后，作为一种过继免疫治疗可以对患者给药如上阐明的这样的T细胞。
包含表位的试剂
本发明的另一方面提供分离的表位-MHC复合体。在本发明这方面的特别有利的实施方案中，复合体可以是可溶的，多亚基蛋白如在美国专利号5,635,363(四聚体)或美国专利号6,015,884(Ig-二聚体)中描述的那些。该试剂可用于检测和监测特异性的T细胞应答，和纯化这类T细胞。
还可将与表位肽络合的分离的MHC分子结合至平面脂双层或脂质体中。这类组合物可用来体外或在脂质体的情形中，体内刺激T细胞。可将共同刺激分子(例如B7，CD40，LFA-3)结合于相同组合物中，或者特别是对于体外操作，可以通过抗-共同-受体的抗体(例如抗-CD28，抗-CD154，抗-CD2)或细胞因子(例如IL-2，IL-12)来提供共同刺激。这样的T细胞刺激可以在免疫治疗中构成接种，驱动T细胞体外扩增以接下来融合，或构成T细胞功能测定中的一步。
表位，或更直接地它与MHC分子的复合体可以是在激活或读出步骤或两者中抗原特异性T细胞的功能测定的重要组分。在当前本领域中T细胞功能的许多种测定中(详细的方法可以在标准免疫学参考如CurrentProtocols in Immunology 1999 John Wiley & Sons Inc.，N.Y中发现)可以定义两大类，测量许多细胞应答的那些和测量单独细胞应答的那些。尽管前者传达应答强度的总体测量，但后者允许测定应答细胞的相对频率。测量总体应答的试验的实例是细胞毒性测定，ELISA和检测细胞因子分泌的增殖测定。测量单独细胞(或衍生于它们的小克隆)应答的测定包括有限稀释分析(LDA)，ELISPOT，未分泌细胞因子的流式细胞仪检测(在题为“METHOD FOR ASSESSMENT OF THE MONONUCLEARLEUKOCYTE IMMUNE SYSTEM”的美国专利号5,445,939和标题都为“METHOD FOR THE ASSESSMENT OF THE MONONUCLEARLEUKOCYTE IMMUNE SYSTEM，”的美国专利号5,656,446；和5,843,689中描述，试剂是由Becton，Dickinson & Company以商品名‘FASTIMMUNE’出售并且用如上说明和提及的四聚体或Ig-二聚体检测特异性的TCR。在Yee，C.等Current Opinion in Immunology，13：141-146，2001中综述这些技术的相对优点。如对于本领域的一名技术人员将是明显的，通过多种建立的基于核酸的技术，特别是原位和单细胞PCR技术可以完成另外的检测特异性TCR的重排或表达。
这些功能测定可用来评估免疫的内源水平，对免疫刺激(例如疫苗)的应答和监测贯穿疾病和治疗期间的免疫状态。除当测量免疫的内源水平时，这些测定的任何一种假定预先的免疫步骤，不管体内或体外，其取决于所论述问题的性质。使用上述本发明的各种实施方案或可以激发相似免疫的其它形式的免疫原(例如pAPC-肿瘤细胞融合)可以进行该免疫。除了能够检测关联TCR(cognate TCR)表达的PCR和四聚体/Ig-二聚体类型的分析以外，这些测定通常受益于一步体外抗原刺激，其可以方便地使用上述本发明的各种实施方案以便检测特定的功能活性(有时可以直接检测高度溶细胞应答)。最后，检测溶细胞活性需要展示表位的靶细胞，其可以使用本发明的各种实施方案产生。对于任何具体步骤选择的具体实施方案取决于所论述的问题，使用的简易，成本等，但对于任何具体一组情形一个实施方案对另一种的优势对于本领域的一名技术人员来说将是明显的。
在传统上已将在该部分描述的肽MHC复合体理解为是非共价结合。然而产生一个共价键是可能并且可以是有益的，例如通过编码作为单个蛋白的表位和MHC重链或表位，β2-微球蛋白，和MHC重链(Yu，Y.L.Y.，等，J.Immunol.168：3145-3149，2002；Mottez，E.，等，J.Exp.Med.181：493，1995；Dela Cruz，C.S.，等，Int.Immunol.12：1293，2000；Mage，M.G.，等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89：10658，1992；Toshitani，K.，等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93：236,1996；Lee，L.，等，Eur.J.Immunol.24：2633，1994；Chung，D.H.，等，J.Immunol.163：3699，1999；Uger，R.A.和B.H.Barber，J.Immunol.160：1598，1998；Uger，R.A.，等，J.Immunol.162：6024，1999；和White，J.，等，J.Immunol.162：2671，1999。这类构建体可具有优越的稳定性并且克服了在加工-呈递途径中的困难。它们可用于已经描述的疫苗，试剂和类似方式的测定中。
肿瘤相关抗原
本发明的表位是衍生于TuAAs酪氨酸酶(SEQ ID NO.2)，SSX-2，(SEQ ID NO.3)，PSMA(前列腺-特异性膜抗原)(SEQ ID NO.4)，GP100，(SEQ ID NO.70)，MAGE-1，(SEQ ID NO.71)，MAGE-2，(SEQ ID NO.72)，MAGE-3，(SEQ ID NO.73)，NY-ESO-1，(SEQ ID NO.74)，PRAME，(SEQID NO.77)，PSA，(SEQ ID NO.78)，PSCA，(SEQ ID NO.79)，纤连蛋白ED-B结构域(SEQ ID NOS 589和590)，CEA(癌胚抗原)(SEQ ID NO.592)，Her2/Neu(SEQ ID NO.594)，SCP-1(SEQ ID NO.596)和SSX-4(SEQ IDNO.598)。从它们的cDNA或完全编码(cds)序列，分别为SEQ ID NOS.5-7，80-87，591，593，595，597，和599可以确定这十一种蛋白质的天然编码序列，或它们内部的任何区段。
酪氨酸酶是一种黑色素生物合成酶，其被认为是黑色素细胞分化的最特异性的标记之一。酪氨酸酶在很少的几种细胞类型中表达，主要在黑色素细胞中表达，并且经常在黑素瘤中发现高水平。在题为“METHODFOR IDENTIFYING INDIVIDUALS SUFFERING FROM A CELLULARABNORMALITY SOME OF WHOSE ABNORMAL CELLS PRESENTCOMPLEXES OF HLA-A2/TYROSINASE DERIVED PEPTIDES，ANDMETHODS FOR TREATING SAID INDIVIDUALS”的美国专利5,747,271中教导了将酪氨酸酶用作TuAA。
GP100，也称为PMe117，也是一种在黑素瘤中高水平表达的黑色素生物合成蛋白质。在题为“MELANOMA ANTIGENS AND THEIR USE INDIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC METHODS，”的美国专利5,844,075中公开了作为一种TuAA的GP100。
SSX-2，也称为Hom-Mel-40，是高度保守的癌-睾丸抗原家族的成员(Gure，A.O.等Int.J.Cancer 72：965-971，1997)。在题为“ISOLATEDNUCLEIC ACID MOLECULES WHICH ENCODE A MELANOMASPECIFIC ANTIGEN AND USES THEREOF，”的美国专利6,025,191中教导了将其鉴定为一种TuAA。在多种肿瘤中发现癌-睾丸抗原，但通常在除睾丸以外的正常成人组织中不存在。已经发现在肿瘤细胞系中SSX家族的不同成员的表达不同。由于在SSX家族成员之间高度的序列同一性，将产生来自多于一个家族成员的相似表位并且其可以与MHC分子结合，因此指向该家族一个成员的一些疫苗可以交叉反应和对该家族的其它成员有效(参见下面实施例3)。
MAGE-1，MAGE-2，和MAGE-3是最初在黑素瘤(MAGE是黑素瘤相关抗原的缩写)中发现但在许多肿瘤中发现的的另一个癌-睾丸抗原家族的成员。在题为NUCLEOTIDE SEQUENCE ENCODING THE TUMORREJECTION ANTIGEN PRECURSOR，MAGE-1的美国专利5,342,774和许多后来专利中教导了将MAGE蛋白鉴定为TuAAs。当前在SWISS蛋白质数据库中存在17条关于(人)MAGE的记录。在这些蛋白质中存在广泛的相似性因此在许多情形中，来源于一种的表位可诱导针对其它家族成员的交叉反应性应答。还未在肿瘤中观测到这些中的一些，最显著地MAGE-H1和MAGE-D1，其分别在睾丸和脑，和骨髓基质细胞中表达。由它们是在对其它MAGE蛋白质最小相似性之中的事实改善了在正常组织上交叉反应性的可能性。
NY-ESO-1，是一种在各种各样的肿瘤中发现的癌-睾丸抗原，也称为CTAG-1(癌-睾丸抗原-1)和CAG-3(癌抗原-3)。在题为ISOLATEDNUCLEIC ACID MOLECULE ENCODING AN ESOPHAGEAL CANCERASSOCIATED ANTIGEN，THE ANTIGEN ITSELF，AND USES THEREOF的美国专利5,804,381中公开了作为一种TuAA的NY-ESO-1。编码具有广泛序列同一性的抗原的共生同源基因座(paralogous locus)，LAGE-1a/s(SEQ ID NO.75)和LAGE-1b/L(SEQ ID NO.76)已经在公众可利用的人基因组集群(assemblies)中公开，并且已经被推断是通过可变剪接(alternatesplicing)产生的。另外，CT-2(或CTAG-2，癌-睾丸抗原-2)似乎是LAGE-1b/L的等位基因，突变体或测序差异。由于广泛的序列同一性，许多来源于NY-ESO-1的表位也可以诱导针对表达这些其它抗原的肿瘤的免疫性。参见图1。蛋白质直至氨基酸70实际上是相同的。从71-134NY-ESO-1和LAGE之间相同的最长长度是6个残基，但存在潜在交叉反应序列。从135-180，NY-ESO和LAGE-1a/s除单个残基以外是相同的，但由于可变剪接LAGE-1b/L是不相关的。CAMEL和LAGE-2抗原似乎是来源于LAGE-1mRNA，但是源于可变的读框(alternate reading frame)，因此产生不相关的蛋白质序列。新近，GenBank登记号AF277315.5，人染色体X克隆RP5-865E18，RP5-1087L19，完全序列，报道了在该区域中的三个独立的基因座，其标记为LAGE1(对应于基因组集群的CTAG-2)，加上LAGE2-A和LAGE2-B(两者对应于基因组集群的CTAG-1)。
PSMA(前列腺特异性膜抗原)，在题为“PROSTATE-SPECIFICMEMBRANES ANTIGEN”的美国专利5,538,866中描述的一种TuAA，是由正常前列腺上皮细胞表达，并且在前列腺癌中高水平表达。也已经发现它存在于非前列腺肿瘤的新脉管系统中。PSMA因此可以形成指向前列腺癌和其它肿瘤的新脉管系统两者的疫苗的基础。在2001年3月7日提交的题为“ANTI-NEOVASCULAR VACCINES FOR CANCER”的临时美国专利申请号60/274,063和在2002年3月7日提交的题为“ANTI-NEOVASCULAR PREPARATIONS FOR CANCER”的美国申请号10/094,699，律师备案号CTLIMM.01 5A中更充分地描述这一后者概念。简短地，当肿瘤生长时，它们吸收(recruit)新血管的向内生长物(ingrowth)。这被认为对于维持生长是必需的，因为未血管化的肿瘤中心通常坏死并且已经报道血管发生抑制剂导致肿瘤退化。这些新血管，或新脉管系统，表达在建立的血管中未发现的抗原，因此可以被特异性地瞄准。通过诱导针对新血管抗原的CTL可以使血管破裂，中断养分流向肿瘤(和从肿瘤去除废弃物)，导致退化。
如在题为“ISOLATED NUCLEIC ACID MOLECULE ENCODINGALTERNATIVELY SPLICED PROSTATE-SPECIFIC MEMBRANESANTIGEN AND USES THEREOF”的美国专利5,935,818中所述，PSMAmRNA的可变剪接还导致一种在Met58处含有明显起始的蛋白质，从而删除了假定的PSMA膜锚定区域。一种称为类PSMA蛋白的蛋白质，Genbank登记号AF261715，与PSMA的氨基酸309-750几乎相同并且具有不同的表达图谱(expression profile)。因此最优选的表位是含有位于氨基酸58-308的N-末端的那些。
PRAME，也称为MAPE，DAGE和OIP4，最初是被作为一种黑素瘤抗原观测。后来，它已被认为是一种CT抗原，但不像许多CT抗原(例如MAGE，GAGE，和BAGE)它在急性骨髓白血病中表达。PRAME是MAPE家族的一个成员，所述MAPE家族主要由假想蛋白质组成，PRAME与这些假想蛋白质共有有限的序列相似性。在题为“ISOLATED NUCLEICACID MOLECULES CODING FOR TUMOR REJECTION ANTIGENPRECURSOR DAGE AND USES THEREOF”的美国专利5,830,753中教导了将PRAME用作一种TuAA。
PSA，前列腺特异性抗原，是激肽释放酶家族的一种肽酶和前列腺的一种分化抗原。也已经报道在乳房组织中的表达。替代的名称包括γ-seminoprotein，激肽释放酶3，seminogelase，seminin和P-30抗原。PSA具有与各种可变剪接产物前列腺/腺激肽释放酶-1和-2以及激肽释放酶4的高度序列同一性，其也在前列腺和乳房组织中表达。其它激肽释放酶通常共享更小的序列同一性和具有不同的表达图谱。但是，在设计疫苗时应该考虑可能通过任何特定表位激发的交叉反应性，以及表位将通过在非靶组织中的加工(最通常由管家蛋白酶体加工)而被释放的可能性。
PSCA，前列腺干细胞抗原，也称为SCAH-2，是一种优选在前列腺上皮细胞中表达和在前列腺癌中过量表达的分化抗原。在包括消化道的神经内分泌细胞和肾的集合管的一些正常组织中发现低水平表达。在题为“HUMAN STEM CELL ANTIGENS”的美国专利5,856,136中描述了PSCA。
联会复合体蛋白1(SCP-1)，也称为HOM-TES-14，是一种减数分裂相关蛋白并且也是一种癌-睾丸抗原(Tureci，O.，等Proc.Natl.Acad.Sci.USA 95：5211-5216，1998)。作为一种癌抗原，它的表达不是受细胞周期调节并且经常在神经胶质瘤，乳房，肾细胞和卵巢癌中发现它。它具有与肌球蛋白的一些相似性，但具有足够小的同一性以致交叉反应表位不可直接寻找(immediate prospect)。
纤连蛋白的ED-B结构域也是一种潜在的目标。纤连蛋白进行受发育调节的可变剪接，主要在胎性癌组织中使用的单个外显子编码ED-B结构域(Matsuura，H.和S.Hakomori Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82：6517-6521，1985；Carnemolla，B.等J.Cell Biol.108：1139-1148，1989；LoridonRosa，B.等Cancer Res.50：1608-1612，1990；Nicolo，G.等Cell Differ.Dev.32：401-408，1990；Borsi，L.等Exp.Cell Res.199：98-105，1992；Oyama，F.等Cancer Res.53：2005-2011，1993；Mandel，U.等APMIS 102：695-702，1994；Farnoud，M.R.等Int.J.Cancer 61：27-34，1995；Pujuguet，P.等Am.J.Pathol.148：579-592，1996；Gabler，U.等Heart 75：358-362，1996；Chevalier，X.Br.J.Rheumatol.35：407-415，1996；Midulla，M.Cancer Res.60：164-169，2000)。
ED-B结构域也在新脉管系统的纤连蛋白中表达(Kaczmarek，J.等Int.J.Cancer 59：11-16，1994；Castellani，P.等Int.J.Cancer 59：612-618，1994；Neri，D.等Nat.Biotech.15：1271-1275，1997；Karelina，T.V.和A.Z.EisenCancer Detect.Prev.22：438444，1998；Tarli，L.等Blood 94：192-198；1999；Castellani，P.等Acta Neurochir.(Wien)142：277-282，2000)。作为一种胎性癌结构域，除被新脉管系统表达以外一般在由赘生性细胞表达的纤连蛋白中发现ED-B结构域。因此，靶向ED-B结构域的CTL诱导疫苗可显示两种作用机制：直接溶解肿瘤细胞和通过破坏肿瘤相关新脉管系统破坏肿瘤的血液供给。因为CTL活性在停用疫苗后迅速衰减，对正常血管发生的干扰可以最小。在题为“ANTI-NEOVASCULATURE VACCINESFOR CANCER”的临时美国专利申请号60/274,063和甚至在日期(2002年3月7日)与本申请一起提交的题为“ANTI-NEOVASCULATUREPREPARATIONS FOR CANCER”的美国专利申请号10/094,699，律师备案号CTLIMM.015A中描述了设计和检验靶向新脉管系统的疫苗。在题为“HLA-TRANSGENIC MURINE TUMOR CELL LINE，”律师备案号CTLIMM.028PR，2002年3月7日提交的临时美国专利申请号60/363,131中公开了一种肿瘤细胞系。
癌胚抗原(CEA)是一种典型的癌胚蛋白，其最初在1965年被首先描述(Gold和Freedman，J.Exp.Med.121：439-462，1965。更全的参考可以在Online Medelian Inheritance in Man；记录*114890中找到)。它已经正式改名为癌胚抗原相关细胞粘着分子5(CEACAM5)。它的表达与消化道和胎结肠中的上皮层(epithelial lining)的腺癌强烈相关。CEA是免疫球蛋白超基因家族的成员并且是CEA亚家族的定义成员(definingmember)。
HER2/NEU与表皮生长因子受体相关的癌基因(van de Vijver，等，New Eng.J.Med.319：1239-1245，1988)，并且显然与c-ERBB2癌基因相同(Di Fiore，等，Science 237：178-182，1987)。ERBB2的过量表达已经和前列腺癌的致瘤性转化牵连。作为HER2，它在其它肿瘤中的乳腺癌的25-30％中被扩增和过表达，所述其它肿瘤中表达水平与肿瘤的进攻性相关(Slamon，等，New Eng.J.Med.344：783-792，2001)。在Online MedelianInheritance in Man；记录*164870中可获得更详细的描述。
在2001年11月7日提交的题为“EPITOPE SYNCHRONIZATION INANTIGEN PRESENTING CELLS，”的美国专利申请号10/005,905(律师备案号CTLIMM.021CP1)和2000年12月7日提交的其继续申请，美国申请号__/__，律师备案号CTLIMM.21CP1C，标题也为“EPITOPESYNCHRONIZATION IN ANTIGEN PRESENTING CELLS”中发现与本发明实施方案相关的另外的公开内容。
如下列实施例中所描述鉴定和检验有效表位。然而这些实例是意图只是用作说明目的，而不应该解释为是以任何方式限制本发明的范围。
实施例
具体的优选表位序列
实施例1
表位的制备
A.表位的人工生产
使用FMOC或tBOC固相合成方法合成含有SEQ ID NO：1，8，9，11-23，26-29，32-44，47-54，56-63，66-68，88-253，或256-588中任一个的氨基酸序列的肽。合成后，在存在适当的保护清除剂的条件下，分别用三氟乙酸或氟化氢将肽从它们的载体上切开。在通过蒸发去除酸后，用醚萃取肽以去除清除剂，然后将粗制的沉淀的肽冻干。通过HPLC，序列分析，氨基酸分析，平衡离子含量分析和其它适当的方法测定粗制肽的纯度。如果粗制肽足够纯(大于或等于约90％纯度)，它们可以原样使用。如果要求纯化满足药物规范，使用下列各项的一种或组合来纯化肽：再沉淀；反相，离子交换，尺寸排阻或疏水相互作用色谱法；或逆流分布。
药品制剂
在肠胃外可接受的水，有机或水-有机缓冲液或溶剂系统中配制GMP-级的肽，其中它们保持物理和化学稳定以及生物有效性。通常，缓冲液或缓冲液的组合或缓冲液与有机溶剂的组合是适当的。pH值范围典型地为6-9。可以加入有机改性剂或其它赋形剂来帮助溶解和稳定肽。这些包括去污剂，脂类，共溶剂，抗氧化剂，螯合剂和还原剂。在冻干产品的情形中，可以加入蔗糖或甘露醇或其它冻干的酸类。通过膜过滤于它们最后的容器-密封系统之中将肽溶液灭菌并冻干以备临床中溶解或保存至使用。
B.构建用作核酸疫苗的表达载体
下面介绍三类表位表达载体的构建。在题为“EXPRESSIONVECTORS ENCODING EPITOPES OF TARGET-ASSOCIATEDANTIGENS，”的美国专利申请号09/561,572中阐明了这些设计的具体优势。
于是用质粒转染适当的大肠杆菌菌株并涂布在选择性培养基上。几个克隆在悬浮培养中生长并且通过限制酶图谱鉴定阳性克隆。然后培养阳性克隆，等分于储存小瓶中并储存在-70℃。
然后由这些细胞的样品进行质粒的小量制备(QIAprep Spin Mini-prep：Qiagen，Valencia，CA)并且使用自动荧光双脱氧测序分析证实构建体含有所需序列。
B.1构建pVAX-EP 1-IRES-EP2
综述：
该构建体的起始质粒是购自Invitrogen(Carlsbad，CA)的pVAX1。表位EP1和EP2是由GIBCO BRL(Rockville，MD)合成。IRES是从购自Clontech(Palo Alto，CA)的pIRES切断的。
步骤：
1用EcoRI和NotI消化pIRES。通过琼脂糖凝胶电泳分离消化片段，并且从切断条带纯化IRES片段。
2用EcoRI和NotI消化pVAX1，并凝胶纯化pVAX1片段。
3然后将纯化的pVAX1和IRES片段连接在一起。
4用连接混合物转化感受态的大肠杆菌菌株DH5α。
5从产生的4个菌落进行小量制备。
6对小量制备的DNA进行限制酶消化分析。将一个含有IRES插入片段的重组菌落用于进一步的EP1和EP2的插入。该中间构建体称为pVAX-IRES。
7合成编码EP1和EP2的寡核苷酸。
8将EP1亚克隆至pVAX-IRES的AfIII和EcoRI位点之间，以构造pVAX-EP 1-IRES；
9将EP2亚克隆至pVAX-EP1-IRES的SalI和NotI位点之间，以构造最后的构建体pVAX-EP1-IRES-EP2。
10通过DNA测序证实EP1-IRES-EP2插入片段的序列。
B2.构建pVAX-EP 1-IRES-EP2-IS S-NIS
综述：
该构建体的起始质粒是pVAX-EP1-IRES-EP2(实施例1)。引入该构建体的ISS(免疫刺激序列)是AACGTT，并且使用的NIS(代表核输入序列(nuclear import sequence))是SV40 72bp重复序列。ISS-NIS是由GIBCO BRL合成。参见图2。
步骤：
1用NruI消化pVAX-EP1-IRES-EP2；凝胶纯化线性化的质粒。
2合成ISS-NIS寡核苷酸。
3将纯化的线性化pVAX-EP1-IRES-EP2和合成的ISS-NIS连接在一起。
4用连接产物转化感受态的大肠杆菌菌株DH5α。
5从产生的菌落进行小量制备。
6进行小量制备的限制酶消化。
7将含有插入片段的质粒测序
B3.构建pVAX-EP2-UB-EP1
综述：
该构建体的起始质粒是pVAX1(Invitrogen)。EP2和EP1是由GIBCOBRL合成。从酵母克隆在构建体中编码76个氨基酸的野生型遍在蛋白质。步骤：
1使用酵母mRNA进行RT-PCR。设计引物来扩增酵母遍在蛋白质的完整编码序列。
2使用琼脂糖凝胶电泳分析RT-PCR产物。凝胶纯化具有预测大小的条带。
3将纯化的DNA条带在EcoRV位点亚克隆至pZERO1。将得到的克隆命名为pZERO-UB。
4在进一步操作之前将几个pZERO-UB克隆测序以证实遍在蛋白质序列。
5合成EP1和EP2。
6将EP2，遍在蛋白质和EP1连接并且将插入克隆至pVAX1的BamHI和EcoRI位点中间，使它在CMV启动子的控制之下。
7通过DNA测序证实插入片段EP2-UB-EP 1的序列。
实施例2
鉴定有效的表位变体
10-链节的FLPWHRLFLL(SEQ ID NO.1)被鉴定为一种有效表位。基于该序列，制备许多变体。将在HLA结合试验(参见实施例3，部分6)中显示活性的变体鉴定为有效，并随后结合于疫苗中。
已经评估FLPWHRLFLL长度变体的HLA-A2结合。蛋白酶体消化分析说明也产生9-链节FLPWHRLFL(SEQ ID NO.8)的C-末端。另外，9-链节LPWHRLFLL(SEQ ID NO.9)也可由10-链节的N-末端修剪产生。两者都被预测与HLA-A*0201分子结合，然而在这两个9-链节中，FLPWHRLFL显示更显著的结合并是优选的(参见图3A和B)。
体外蛋白酶体消化和N-末端池测序说明酪氨酸酶207-216(SEQ ID NO.1)比酪氨酸酶207-215(SEQ ID NO.8)被更普遍地生产，然而较后的肽显示优越的免疫原性，其在实现最佳疫苗设计中可能关注。将FLPWHRLFL，酪氨酸酶207-215(SEQID NO.8)用于HLA-A2+血液的体外免疫以产生CTL(参见下面CTL诱导培养)。在标准铬释放测定中将肽脉冲的T2细胞用作目标，发现由酪氨酸酶207-215(SEQ ID NO.8)诱导的CTL同样很好地识别酪氨酸酶207-216(SEQ ID NO.1)的目标(参见图3C)。这些CTL还识别HLA-A2+，酪氨酸酶+肿瘤细胞系624.38和HTB64，但不识别624.28，624.38的HLA-A2-衍生物(图3C)。因此体内产生的这两种表位的相对数量在疫苗设计中不成为一个问题。
CTL诱导培养
通过在Ficoll-Hypaque中离心从血沉棕黄层(buffy coat)纯化来源于正常供体的PBMCs。使用自身血浆(AP)进行所有的培养以避免暴露于可能的异源病原体和FBS肽的识别。为了促进体外产生肽-特异性的CTL，我们使用自身树突细胞(DC)作为APCs。如同所描述，产生DC并且用DC和来源于PBMCs的肽诱导CTL(Keogh等，2001)。简短地，用GM-CSF和IL-4培养富集单核细胞的细胞组分5天，并在含有2μg/mlCD40配体的培养基中另外培养2天以诱导成熟。在24孔平板中2ml补充有10％AP，10ng/ml IL-7和20 IU/ml IL-2的RPMI中共培养2×106富集CD8+的T淋巴细胞/孔和2×105肽脉冲的DC/孔。在第7和第14天用自身辐射的肽脉冲的DC再刺激培养物。
如下构建FLPWHRLFL的序列变体。与来源于NIH/BIMAS MHC结合预测程序(参见下面实施例3中的参考)的结合系数表(参见表3)一致，通过将位置9的L，一个锚定位置改变成V可以改善结合。尽管通常在更小程度上，通过在非锚定位置的改变也可改变结合。通常参照表3，通过使用具有相对较大系数的残基可以提高结合。与它们对结合MHC的影响无关，序列的改变还可改变免疫原性。因此如下可以改善结合和/或免疫原性：
通过用F，L，M，W，或Y替换位置3的P；这些都是体积较大的残基，其也可以改善免疫原性而与对结合的影响无关。具有胺和羟基的残基，分别为Q和N，S和T，也可激发较强的交叉反应性应答。
通过用D或E替换位置4的W以改善结合，这加入负电也可使表位更有免疫原性，而在一些情形中减小与天然表位的交叉反应性。备选地保守替换F或Y可以激发交叉反应性应答。
通过用F替换位置5的H改善结合。可以将H视为部分带电，因此在一些情形中电荷的损失可阻碍交叉反应性。替换在该位置充分带电残基R或K可增强免疫原性而不破坏依赖电荷的交叉反应性。
通过用I，L，M，V，F，W，或Y替换位置6的R。如位置5的相同告诫(caveats)和备选适用于这里。
通过用W或F替换位置7的L以改善结合。通过该模型(NIH算法)通常不预测在该位置V，I，S，T，Q，或N替换减少结合亲和力，然而如上所讨论可以是有利的。
Y和W，其是同等优选为位置1和8的Fs，可以激发有效的交叉反应性。最后虽然朝体积大的方向的替换通常是偏向于改善免疫原性，按照尺寸的对比，而不是本身体积大，是免疫原性的重要因素的理论，替换较小残基如位置3-7的A，S和C可以是有效的。C中巯基的反应性可以引入如在Chen，J.-L.，等J.Immunol.165：948-955，2000中所讨论的其它特性中。
表3.对于HLA-A*0201*的9-链节系数表 对于文件″A_0201_标样″的HLA系数表氨基酸类型 1st 2nd 3rd 4th 5th 6th 7th 8th 9th A 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 C 1.000 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 D 0.075 0.100 0.400 4.100 1.000 1.000 0.490 1.000 0.003 E 0.075 1.400 0.064 4.100 1.000 1.000 0.490 1.000 0.003 F 4.600 0.050 3.700 1.000 3.800 1.900 5.800 5.500 0.015 G 1.000 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 0.130 1.000 0.015 H 0.034 0.050 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.015 I 1.700 9.900 1.000 1.000 1.000 2.300 1.000 0.410 2.100 K 3.500 0.100 0.035 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.003 L 1.700 72.000 3.700 1.000 1.000 2.300 1.000 1.000 4.300 M 1.700 52.000 3.700 1.000 1.000 2.300 1.000 1.000 1.000 N 1.000 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.015 P 0.022 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.003 Q 1.000 7.300 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.003 R 1.000 0.010 0.076 1.000 1.000 1.000 0.200 1.000 0.003 S 1.000 0.470 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.015 T 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.500 V 1.700 6.300 1.000 1.000 1.000 2.300 1.000 0.410 14.000 W 4.600 0.010 8.300 1.000 1.000 1.700 7.500 5.500 0.015 Y 4.600 0.010 3.200 1.000 1.000 1.500 1.000 5.500 0.015
*将该表和公众可利用的其它可比较数据用于设计表位变体和确定一种特定变体是否是在物质上相似，或是在功能上相似。
实施例3
聚簇分析(SSX-231-68)
1.表位聚簇区域预测：
计算机算法：基于H.G.Rammensee，J.Bachmann和S.Stevanovic的书“MHC Ligands and Peptide Motifs”SYFPEITHI(因特网访问http：//syfpeithi.bmi-heidelberg.com/Scripts/MHCServer.dll/EpPredict.htm)；和在Parker，K.C.，等，J.Immunol.152：163，1994中描述的HLA肽结合预测(NIH)(因特网访问http：//bimas.dcrt.nih.gov/molbio/hla_bin)；用来分析SSX-2(GI：10337583)的蛋白质序列。如在2000年4月28日提交的题为“EPITOPE CLUSTERS，”的美国专利号09/561,571中所充分描述的那样定义表位聚簇(含有比具有高预测MHC亲和力的肽片段的平均密度高的区域)。使用表位密度比率的截止值(cutoff)为2，分别使用SYFPETHI和NIH算法定义5个和2个聚簇，并且肽记分截止值为16(SYFPETHI)和5(NIH)。使用NIH算法得分最高的肽，SSX-241-49，具有估计＞1000min的解离半衰期，在NIH分析中不重叠任何其它预测的表位但确实与SSX-257-65聚簇。
2.肽合成和表征：
通过MPS(Multiple Peptide Systems，San Diego，CA 92121)使用标准固相化学合成SSX-231-68，YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKLGFKATLP(SEQ ID NO.10)。按照提供的“分析证明书”，该肽的纯度为95％。
3.蛋白酶体消化：
使用在2000年4月28日提交的题为“METHOD OF EPITOPEDISCOVERY，”的美国专利申请号09/561,074中描述的蛋白酶体分离方案从人红细胞分离蛋白酶体。将SDS-PAGE，蛋白质印迹，和ELISA用作质量控制测定。蛋白酶体的最终浓度为4mg/ml，其是通过无干扰蛋白质测定法(Geno Technologies Inc.)测定的。将蛋白酶体-70℃保存在25μl等分试样中。
将SSX-231-68溶解在Milli-Q水中，制备2mM母液，并将20μl等分试样保存在-20℃。
从-70℃存储器取出1管蛋白酶体(25μl)并在冰上解冻。然后通过反复吸取(将样品保持在冰上)将它与12.5μL 2mM的肽彻底混合。在混合后立即取5μL样品并转移至含有1.25μL 10％TFA的试管中(TFA的终浓度为2％)；T＝0min样品。然后开始并在37℃程控热控制器中进行蛋白酶体消化反应。分别在15，30，60，120，180和240min取出另外的5μL样品，如以前通过将样品加入1.25μL 10％TFA中终止反应。将样品保持在冰上或冷冻直至通过MALDI-MS分析。为了HPLC分析和N-末端测序所有的样品被保留和储存在-20℃。将单独的肽(没有蛋白酶体)用作空白对照：2μL肽+4μL Tris缓冲液(20mM，pH 7.6)+1.5μLTFA。
4.MALDI-TOF MS测量：
对于每个时间点首先将0.3μL基质溶液(10mg/mlα-氰基-4-羟基肉桂酸的AcCN/H2O溶液(70∶30))施加于样品载玻片上，然后在载玻片上将等体积的消化样品与基质溶液轻轻混合。在获得质谱前使载玻片室温空气干燥3-5分钟。在用肽/蛋白质标样校准的Lasermat 2000 MALDI-TOF质谱仪上进行MS。为了改善测量的准确度，将肽底物的分子离子量(MH+)用作内校准标准物。在图4中显示T＝120min.消化样品的质谱。
5.MS数据分析和表位鉴定：
为了指定测量的质量峰，使用计算机程序MS-Product，一种来源于UCSF Mass Spectrometry Facility(可访问http：//prospector.ucsf.edu/ucsfhtml3.4/msprod.htm)的工具来产生所有可能的片段(N-和C-末端离子，和内部片段)和它们对应的分子量。由于质谱仪的灵敏度，使用平均分子量。如表4中总结，鉴定了在消化期间观测到的质量峰。
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个氨基酸长序列的共C末端片段来进一步研究。方法的消化和预测步骤可以以任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别设计来包括预测的HLA-A2.1结合序列，但是可事后检测实际的消化产物对其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表5中显不。
表4.SSX-231-68质量峰鉴定MS峰(测量) 肽序列计算质量(MH+) 988.23 31-37 YFSKEEW 989.08 1377.68±2.3 8 31-40 YFSKEEWEKM 1377.68 1662.45±1.3 0 31-43 YFSKEEWEKMKAS 1663.90 2181.72±0.8 5 31-47 YFSKEEWEKMKASEKIF 2181.52 2346.6 31-48 YFSKEEWEKMKASEKIFY 2344.71 1472.16±1.5 4 38-49 EKMKASEKIFYV 1473.77 2445.78±1.1 8 31-49* YFSKEEWEKMKASEKIFYV 2443.84 2607. 31-50 YFSKEEWEWEKMKASEKIFYVY 2607.02 1563.3 50-61 YMKRKYEAMTKL 1562.93 3989.9 31-61 YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKL 3987.77 1603.74±1.5 51-63 1603.98 3 MKRKYEAMTKLGF 1766.45±1.5 50-63 YMKRKYEAMTKLGF 1767.16 1866.32±1.2 2 49-63 VYMKRKYEAMTKLGF 1866.29 4192.6 31-63 YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKLG F 4192.00 4392.1 31-65** YFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKLG FKA 4391.25
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽。
*仅仅基于质量该峰也可指定为肽32-50，然而，蛋白酶体只去除N-末端氨基酸是不大可能的。N-末端测序(下面)证实确定为31-49。
**基于质量该片段也可能表示33-68。下面的N-末端测序与确定为31-65一致。
表5.预测通过蛋白酶体产生片段的HLA结合
未预测如表5所示，将真实序列(authentic sequence)附加在表位N-末端可产生针对相同或不同MHC限制性元件的表位。特别注意(K)RKYEAMTKL(SEQ ID NOS 19和(20))与HLA-B14的配对，其中10-链节具有比共-C-末端9-链节更长的预测解离半衰期。还注意10-链节KYEAMTKLGF(SEQ ID NO.21)的情形，通过依赖于N-末端修剪以产生针对HLA-B*4403和-B*08的表位其可用作对几种MHC类别有效的疫苗。
6.HLA-A0201结合测定：
使用Stauss等的方法(Proc Natl Acad Sci USA 89(17)：7871-5(1992))的变体测定候选表位KASEKIFYV，SSX-241-49，(SEQ ID NO.15)与HLA-A2.1的结合。具体地，在它们表面表达空的或不稳定MHC分子的T2细胞用Iscove的改进Dulbecco’s培养基(IMDM)洗涤两次，并于96孔平底平板中以3×105细胞/200μl/孔的浓度在补充有3μg/ml人β2-微球蛋白的无血清AIM-V培养基(Life Technologies，Inc.，Rockville，MD)中培养过夜，并加入800，400，200，100，50，25，12.5和6.25μg/ml的肽。在分配至平板前通过反复吸取将肽与细胞混合(备选地可将肽加入单独孔)，轻轻摇动平板2分钟。在37℃5％CO2的培养箱中温育。次日通过用无血清RPMI培养基洗涤两次去除未结合的肽并加入饱和量的抗-I类HLA单克隆抗体，异硫氰酸荧光素(FITC)-偶联的抗-HLA A2，A28(OneLambda，Canoga Park，CA)。在4℃温育30分钟后，用补充有0.5％BSA，0.05％(w/v)叠氮化钠，pH 7.4-7.6(染色缓冲液)的PBS洗涤细胞3次。(备选地可以将W6/32(Sigma)用作抗-I类HLA单克隆抗体，用染色缓冲液洗涤细胞，与偶联异硫氰酸荧光素(FITC)的羊F(ab’)抗鼠-IgG(Sigma)4℃温育30min并如上洗涤3次)。将细胞再悬浮于0.5ml染色缓冲液中。通过使用FACScan(Becton Dickinson，San Jose，CA)的流式细胞仪进行通过肽结合稳定的表面HLA-A2.1分子的分析。如果流式细胞计量术不是立即实行，可以通过加入四分之一体积的2％低聚甲醛并暗处保存在4℃来固定细胞。
实验的结果在图5中显示。发现SSX-241-49(SEQ ID NO.15)与HLA-A2.1结合，其结合程度与用作阳性对照的已知A2.1结合物FLPSDYFPSV(HBV18-27；SEQID NO：24)类似。将HLA-B44结合肽，AEMGKYSFY(SEQ ID NO：25)用作阴性对照。从阴性对照获得的荧光与当在测定中不使用肽时获得的信号类似。阳性和阴性对照肽是选自Current Protocols in Immunology p.18.3.2，John Wiley和Sons，New York，1998的表18.3.1。
7.免疫原性：
A小鼠体内免疫
麻醉并在尾底避开侧尾静脉，使用100μl含有100nmol的SSX-241-49(SEQ ID NO.15)和20μg用50μl IFA(不完全弗氏佐剂)乳化的PBS中的HTL表位肽皮下注射HHD1转基因A*0201小鼠(Pascolo，S.，等，J.Exp.Med.185：2043-2051，1997)。
B.制备刺激细胞(LPS胚细胞)
对于每组免疫小鼠使用来源于2只稚鼠(naive mice)的脾，处死未免疫小鼠并将尸体放置于酒精中。使用无菌工具，刺穿小鼠左侧(较低的中间部分)皮肤的上皮层，暴露腹膜。用乙醇饱和腹膜，无菌取出脾。将脾放置于含有无血清培养基的培养皿中。通过使用来自3ml注射器的无菌柱塞捣碎脾来分离脾细胞。漂洗皿孔，将脾细胞收集在50ml锥形管中的无血清培养基中。将细胞离心(12000rpm，7min)并用RPMI洗涤一次。在RPMI-10％FCS(胎牛血清)中再悬浮新鲜脾细胞至浓度为每ml 1×106细胞。加入25g/ml脂多糖和7μg/ml葡聚糖硫酸酯。在含有5％CO2的37℃T-75烧瓶中将细胞温育3天。将脾胚细胞收集在50ml试管中，离心(pellet)(12000rpm，7min)，并在RPMI中再悬浮至3×107/ml。用50μg/ml引发肽(priming peptide)室温脉冲胚细胞4小时，25μg/ml丝裂霉素C 37℃处理20min，并用DMEM洗涤三次。
C.体外刺激
在LPS刺激胚细胞3天后和肽加样的同一天，如上处死接触过抗原的小鼠(免疫后14天)以取出脾。将3×106脾细胞与1×106LPS胚细胞/孔在DMEM培养基的24孔平板中在5％CO2的条件下37℃共培养，所述DMEM培养基补充有10％FCS，5×10-5M β-巯基乙醇，100μg/ml链霉素和100 IU/ml青霉素。在第3天向培养物加入5％(vol/vol)ConA上清液并在第7天在51Cr-释放测定中测定溶细胞活性。
D.测量CTL活性的铬释放测定
为了评估肽特异性溶解，将2×106 T2细胞与100μCi铬酸钠加上50μg/ml肽一起37℃温育1小时。在温育期间，每15分钟将它们轻轻振荡。在标记和加样后，用10ml DMEM-10％FCS将细胞洗涤3次，在流出上清液后用新鲜的Kimwipe擦拭每个试管。将靶细胞再悬浮于DMEM-10％FBS浓度为1×105/ml。在DMEM-10％FCS中将效应细胞调整至1×107/ml并在U-底96孔平板中制备100μl系列3倍稀释度的效应物。每孔加100μl靶细胞。为了测定自发释放和最大释放，对于每个靶子准备含有100μl靶细胞的6个附加孔。通过将靶细胞与100μl培养基温育来显示自发释放；通过将靶细胞与100μl 2％SDS温育来显示最大释放。然后将平板600rpm离心5分钟并在5％CO2和80％湿度条件下37℃温育4小时。在温育后，然后将平板1200rpm离心5min。收获上清液并用γ计数器计数。如下测定特异性裂解：％特异性释放＝[(实验释放-自发释放)/(最大释放-自发释放)]×100。
在图6中显示证明肽脉冲的靶细胞特异性裂解的铬释放测定的结果。
8.与其它SSX蛋白质的交叉反应性：
SSX-241-49(SEQ ID NO.15)与其它SSX蛋白质的相同区域共享高度序列同一性。周围区域也通常已经十分保守。因此在所有5个序列中管家蛋白酶体可以在V49之后切割。此外，预测SSX-241-49与HLA-A*0201结合(参见表6)。通过用SSX-241-49免疫产生的CTL与表达其它SSX蛋白质的肿瘤细胞交叉反应。
表6.SSX41-49-A*0201预测结合 SEQ ID NO. 家族成员 序列 SYFPEITHI 得分 NIH 得分 15 SSX-2 KASEKIFYV 22 1017 26 SSX-1 KYSEKISYV 18 1.7 27 SSX-3 KVSEKIVYV 24 1105 28 SSX-4 KSSEKIVYV 20 82 29 SSX-5 KASEKIIYV 22 175
实施例4
聚簇分析(PSMA163-192)
在433A ABI肽合成仪上使用标准固相F-moc化学合成一种肽，AFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDM，PSMA163-192，(SEQ ID NO.30)，其含有来源于前列腺特异性膜抗原的A1表位聚簇，PSMA168-190(SEQID NO.31)。在侧链脱保护和从树脂切割后，在反相制备HPLC C4柱上以下列条件：流速为4ml/min的线性AB梯度(5％B/min)，其中洗脱剂A是0.1％TFA水溶液并且洗脱剂B是0.1％TFA的乙腈溶液，运行首先溶解在甲酸中，然后稀释在30％乙酸中的肽。将根据质谱分析，在时间16.642min处的含有期望肽的组分汇集和冻干。然后基本上如上所述将该肽进行蛋白酶体消化和质谱分析。在表7中总结来源于质谱的显著峰。
表7.PMSA163-192质量峰鉴定 肽 序列计算质量(MH+) 163-177 AFSPQGMPEGDLVYV 1610.0 178-189 NYARTEDFFKLE 1533.68 170-189 PEGDLVYVNYARTEDFFKLE 2406.66 178-191 NYARTEDFFKLERD 1804.95 170-191 PEGDLVYVNYARTEDFFKLERD 2677.93 178-192 NYARTEDFFKLERDM 1936.17 163-176 AFSPQGMPEGDLVY 1511.70 177-192 VNYARTEDFFKLERDM 2035.30 163-179 AFSPQGMPEGDLVYVNY 1888.12 180-192 ARTEDFFKLERDM 1658.89 163-183 AFSPQGMPEGDLVYVNYARTE 2345.61 184-192 DFFKLERDM 1201.40 176-192 YVNYARTEDFFKLERDM 2198.48 167-185 QGMPEGDLVYVNYARTEDF 2205.41 178-186 NYARTEDFF 1163.22
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽，参见表8。
N-末端池测序(pool sequence)分析
通过ABI 473A蛋白质测序仪(Applied Biosystems，Foster City，CA)将蛋白酶体消化一小时的一个等分试样(参见上述实施例3部分3)进行N-末端氨基酸序列分析。切割位点和效率的测定是基于测序循环(sequencecycle)，蛋白质测序仪的重复产率和在分析序列中唯一的氨基酸的相对产率的考虑。即如果唯一的(在分析序列中)残基X只出现在第n个循环中，在它N-末端方向n-1个残基之前存在一个切割位点。除帮助解析在将质量指定为序列中的任何错读，这些数据还提供一种比质谱更可靠的各种片段相对产率的指示法。
对于PSMA163-192(SEQ ID NO.30)该池测序支持在V177后单一的主要切割位点和几个次要切割位点，特别是在Y179后的一个。综述在图7A-C中表示的结果显示下列各项：
第3循环的S表明底物N-末端的存在。
第5循环的Q表明底物N-末端的存在。
第1循环的N表明在V177后的切割。
第3循环的N表明在V175后的切割。注意表7中的片段176-192。
第5循环的T表明在V177后的切割。
第1至第3循环的T表明在R181，A180和Y179后愈加普通的切割。
只有这些的最后一项对应通过质谱检测的峰；163-179和180-192，参见表7。缺少其它可表明它们是在比质谱中检测更小的片段上。
第4，第8，和第10循环的K表明分别在E183，Y179和V177后的切割，所有这些对应通过质谱观测到的片段。参见表7。
第1和第3循环的A分别表明底物N-末端的存在和在V177后的切割。
在第4和第8循环的P表明底物N-末端的存在。
第6和第10循环的G表明底物N-末端的存在。
第7循环的M表明底物N-末端的存在和/或在F185后的切割。
第15循环的M表明在V177后的切割。
第1循环可以表明在D191后的切割，参见表7。
第4和第13循环的R表明在V177后的切割。
第2和第11循环的R表明在Y179后的切割。
第2，第6和第13循环的V分别表明在V175，M169后的切割和底物N-末端的存在。注意表7中在176和170开始的片段。
第1，第2和第14循环的Y分别表明在V175，V177后的切割和底物N-末端的存在。
第11和第12循环的L分别表明在V177后的切割和底物N-末端的存在，是与其它数据最一致的解释。
与质谱结果相比我们发现第2，第5和第9循环的L分别与在F186，E183或M169，和Y179后的切割一致。参见表7。
表位鉴定
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个氨基酸长序列的共C-末端片段进一步分析。方法的消化和预测步骤可以以任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别设计来包括预测的HLA-A1结合序列，但是可事后检测实际的消化产物对其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表8中显示。
表8.通过蛋白酶体产生的片段预测HLA结合
未预测
HLA-A*0201结合测定：
基本上如实施例3中所述使用PSMA168-177，GMPEGDLVYV，(SEQID NO.33)进行HLA-A*0201结合研究。如图8所示，在即使比阳性对照肽更低的浓度下该表位也显示显著的结合。在该测定中(并贯穿本公开内容)用作对照的Melan-A肽，ELAGIGILTV实际上是天然序列(EAAGIGILTV)的一种变体并且在该测定中显示高亲和力。
实施例5
聚簇分析(PSMA281-310)
在433A ABI肽合成仪上使用标准固相F-moc化学合成另一种肽，RGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMG，PSMA281-310，(SEQ ID NO.45)，其含有来源于前列腺特异性膜抗原A1表位，PSMA283-307(SEQ ID NO.46)。在侧链脱保护和从树脂切割后，在反相制备HPLC C18柱上以下列条件：流速为4ml/min的线性AB梯度(5％B/min)，其中洗脱剂A是0.1％TFA水溶液并且洗脱剂B是0.1％TFA的乙腈溶液，运行去离子水(ddH2O)中的肽。将根据质谱分析，在时间17.061min处的含有期望肽的组分汇集和冻干。然后基本上如上所述将肽进行蛋白酶体消化和质谱分析。在
表9中总结来源于质谱的显著峰。
表9.PSMA281-310质量峰鉴定
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽，参见表10。
*只根据质量该峰也可以是296-310或288-303。
**只根据质量该峰也可以是298-307。HPLC与质谱的结合显示在一些较
后的时间点该峰是两种物质的混合物。
只根据质量该峰也可以是289-298。
只根据质量该峰也可以是281-295或294-306。
§只根据质量该峰也可以是297-303。
只根据质量该峰也可以是285-306。
#只根据质量该峰也可以是288-303。
N-末端池测序分析不支持任何这些备选的指定。
N-末端池测序分析
通过ABI 473A蛋白质测序仪(Applied Biosystems，Foster City，CA)将蛋白酶体消化一小时的一个等分试样(参见上述实施例3部分3)进行N-末端氨基酸序列分析。切割位点和效率的测定是基于测序循环(sequencecycle)，蛋白质测序仪的重复产率和在分析序列中唯一的氨基酸的相对产率的考虑。即如果唯一的(在分析序列中)残基X只出现在第n个循环中，在它N-末端方向n-1个残基之前存在一个切割位点。除帮助解析在将质量指定为序列中的任何错读，这些数据还提供一种比质谱更可靠的各种片段相对产率的指示法。
对于PSMA281-310(SEQ ID NO.45)该池测序支持在其它次要切割位点中的V287和I297后的两个主要切割位点。综述图9中表示的结果显示下列各项：
第4和第11循环的S分别表明在V287后的切割和底物N-末端的存在。
第8循环的H表明在V287后的切割。相对于在10至11存在的高度下降，在位置9和10处缺乏峰高的下降，而不是表示测序反应中潜伏状态的峰可提示在A286和E285后也切割。
第2，第4和第7循环的D分别表明在Y299，I297和V294后的切割。
在表10中的任何片段中或在下面注释的备选指定中未观测到这最后的切割。
第6循环的Q表明在I297后的切割。
第10和第12循环的M分别表明在Y299和I297后的切割。
表位鉴定
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个氨基酸长序列的共C-末端片段进一步分析。方法的消化和预测步骤可以以任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别设计来包括预测的HLA-A1结合序列，但是可事后检测实际的消化产物对其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表10中显示。
表10.
通过蛋白酶体产生的片段：PSMA281-310预测HLA结合
未预测
如表10所示，将真实序列附加在表位N-末端经常可以产生对相同或不同MHC限制性元件仍然有效，甚至更好的表位。注意例如(G)LPSIPVHPI与HLA-A*0201的配对，其中通过依赖于N-末端修剪以产生针对HLA-B7，-B*5101，和Cw*0401的表位，可以将10-链节用作对几种MHC类型有效的疫苗。
HLA-A*0201结合测定：
基本上如上面实施例3和4中所述使用PSMA288-297，GLPSIPVHPI，(SEQ ID NO.48)进行HLA-A*0201结合研究。如图8所示，在即使比阳性对照肽更低的浓度下该表位也显示显著的结合。
实施例6
聚簇分析(PSMA454-481)
通过MPS(纯度＞95％)合成另一种肽，SSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHLTKEL，PSMA454-481，(SEQ ID NO.55)，其含有来源于前列腺特异性膜抗原的表位聚簇，如上所述将其进行蛋白酶体消化和质谱分析。在表11中总结来源于质谱的显著峰。
表11.PSMA454-484质量峰鉴定MS峰(测量) 肽 序列 计算质量(MH+) 1238.5 454-464 SSIEGNYTLRV 1239.78 1768.38±0.60 454-469 SSIEGNYTLRVDCTPL 1768.99 1899.8 454-470 SSIEGNYTLRVDCTPLM 1900.19 1097.63±0.91 463-471 RVDCTPLMY 1098.32 2062.87±0.68 454-471* SSIEGNYTLRVDCTPLMY 2063.36 1153 472-481** SLVHNLTKEL 1154.36 1449.93±1.79 470-481 MYSLVHNLTKEL 1448.73
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽，参见表12。
*只基于质量该峰同样可以充分指定为肽455-472，然而蛋白酶体只去除N-末端氨基酸是不大可能的。如果问题重要可以通过N-末端测序解决它。
**基于质量该片段也可表示455-464。
表位鉴定
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个氨基酸长序列的共C-末端片段进一步分析。方法的消化和预测步骤可以以任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别设计来包括预测的HLA-A2.1结合序列，但是可事后检测实际的消化产物对其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表12中显示。
表12.通过蛋白酶体产生的片段预测HLA结合
未预测
如表12所示，将真实序列附加在表位N-末端经常可以产生对相同或不同MHC限制性元件仍然有效，甚至更好的表位。注意例如(L)RVDCTPLMY(SEQ ID NOS 62和(63))与HLA-B*2702/5的配对，其中10-链节具有具体的(substantial)预测解离半衰期而共-C-末端9-链节没有。还注意SIEGNYTLRV(SEQ ID NO 57)，一种预测的HLA-A*0201表位的情形，通过依赖于N-末端修剪产生表位可以将其用作对HLA-B*5101有效的疫苗。
HLA-A*0201结合测定
基本上如上面实施例3中所述使用PSMA460-469，TLRVDCTPL，(SEQID NO.60)进行HLA-A*0201结合研究。如图10所示，发现该表位和HLA-A2.1以与用作阳性对照的已知A2.1结合物FLPSDYFPSV(HBV18-27；SEQ ID NO：24)类似程度的结合。此外，PSMA461-469，(SEQ ID NO.59)几乎也结合。
ELISPOT分析： PSMA463-471，(SEQ ID NO.62)
通过使用50μl/孔的4μg/ml在包被缓冲液(35mM碳酸氢钠，15mM碳酸钠，pH9.5)中的鼠抗人γ-IFN单克隆抗体在4℃温育过夜，用捕捉抗体将硝化纤维基底(nitrocellulose-backed)的微量滴定板的孔包被。通过用PBS洗涤4次5min去除未结合抗体。然后通过加入200μl/孔含有10％血清的RPMI培养基并在室温温育1小时封闭膜上的未结合位点。将抗原刺激的CD8+T细胞，以1∶3的系列稀释接种于微量滴定板的孔中，使用100μl/孔，从2×105细胞/孔开始。(先前的抗原刺激基本上是如Scheibenbogen，C.等Int.J.Cancer 71：932-936，1997中所述)。将PSMA462-471(SEQ ID NO.62)加至终浓度为10μg/ml，IL-2至100U/ml，并且在5％CO2，水饱和空气中37℃培养细胞40小时。在该温育后，用200μl/孔的含有0.05％吐温-20的PBS(PBS-吐温)洗涤6次。加入检测抗体，50μl/孔的2g/ml在PBS+10％胎牛血清中的生物素化的鼠抗人γ-IFN单克隆抗体，并将平板在室温温育2小时。通过用200μl PBS-吐温洗涤4次除去未结合的检测抗体。将100μl抗生物素蛋白偶联的辣根过氧化物酶(Pharmingen，San Diego，CA)加至每个孔，并在室温温育1小时。通过用200μl PBS-吐温洗涤6次去除未结合酶。通过将20mg 3-amino 9-ethylcoarbasole药片溶解在2.5ml N，N-二甲基甲酰胺并将那个溶液加至47.5ml 0.05M磷酸盐-柠檬酸盐缓冲液(pH 5.0)来制备底物。在将以100μl/孔分配底物并于室温温育平板之前立即将25μl 30％H2O2加入底物溶液中。在显色后(通常15-30min)，通过用水洗涤平板终止反应。风干平板并使用立体显微镜对斑点计数。
图11显示检测PSMA463-471(SEQ ID NO.62)-反应性HLA-A1+CD8+T细胞，其是先前在HLA-A1+CD8+T细胞与自身树突细胞加上肽的培养物中产生。从不含肽的培养物中未检测到反应性(数据未显示)。在该情形中可以看到肽反应性T细胞是以2.2×104分之一至6.7×104分之一的频率存在于培养物中。由抗-HLA-A1单克隆抗体阻断γ-IFN产生的能力证明这确实是一种HLA-A1-限制性应答；参见图12。
实施例7
聚簇分析(PSMA653-687)
通过MPS(纯度＞95％)合成另一种肽，FDKSNPIVLRMMNDQLMFLERAFIDPLGLPDRPFY PSMA653-687，(SEQ ID NO.64)，其含有来源于前列腺特异性膜抗原的A2表位聚簇，PSMA660-681(SEQ ID NO 65)，并如上所述进行蛋白酶体消化和质谱分析。在表13中总结来源于质谱的显著峰。
表13.PSMA653-687质量峰鉴定 MS峰(测量) 肽 序列 计算质量(MH+) 906.17±0.65 68 1-687** LPDRPFY 908.05 1287.73±0.76 677-687** DPLGLPDRPFY 1290.47 1400.3±1.79 676-687 IDPLGLPDRPFY 1403.63 1548.0±1.37 675-687 FIDPLGLPDRPFY 1550.80 1619.5±1.51 674-687** AFIDPLGLPDRPFY 1621.88 1775.48±1.32 673-687* RAFIDPLGLPDRPFY 1778.07 2440.2±1.3 653-672 FDKSNPIVLRMMNDQLMFLE 2442.93 1904.63±1.56 672-687* ERAFIDPLGLPDRPFY 1907.19 2310.6±2.5 653-671 FDKSNPIVLRMMNDQLMFL 2313.82 2017.4±1.94 671-687 LERAFIDPLGLPDRPFY 2020.35 2197.43±1.78 653-670 FDKSNPIVLRMMNDQLMF 2200.66
黑体序列对应于预测与MHC结合的肽，参见表13。
*仅仅基于质量该峰同样可以充分指定为在654开始的肽，然而蛋白酶体只去除N-末端氨基酸被认为不大可能。如果问题重要，可以通过N-末端测序解决它。
**仅仅基于质量这些峰可以已指定为内部片段，但考虑到消化的总体模式认为它不大可能。
表位鉴定
选择通过SYFPEITHI或NIH算法预测与HLA结合的具有8-10个氨基酸长序列的共C-末端片段进一步分析。方法的消化和预测步骤可以以任何顺序有效实行。尽管在此描述的蛋白酶体消化中使用的底物肽是特别设计来包括预测的HLA-A2.1结合序列，但是可事后检测实际的消化产物对其它MHC分子的实际或预测的结合。选择的结果在表12中显示。
表14.通过蛋白酶体产生的片段预测HLA结合
未预测
如表14所示，将真实序列附加在表位N-末端经常可以产生对相同或不同MHC限制性元件仍然有效，甚至更好的表位。注意例如(R)MMNDQLMFL(SEQ ID NOS.66和(67))与HLA-A*02的配对，其中10-链节保持显著的(substantial)预测结合潜力。
HLA-A*0201结合测定
基本上如上面实施例3所述，使用PSMA663-671(SEQ ID NO.66)和PSMA662-671，RMMNDQLMFL(SEQ NO.67)进行HLA-A*0201结合研究。如图10，13和14所示，在即使比阳性对照肽(FLPSDYFPSV(HBV18-27)；SEQ ID NO：24)低的浓度下该表位也显示显著的结合。尽管不是平行进行，与对照的比较提示PSMA662-671(其在亲和力方面接近Melan A肽)具有这两种PSMA肽的优越结合活性。
实施例8
用表位疫苗接种。
1.用肽疫苗接种：
A.结节内递送
使用为胰岛素递送开发的微型泵系统(MiniMed；Northridge，CA)将一种制剂，其包含在含有抗菌剂，抗氧化剂和免疫调制细胞因子的水性缓冲剂中的肽，连续几天注射于腹股沟淋巴结。为了模拟在自然感染中抗原呈递的动力学选择该灌输周期。
B.控释
使用本领域已知的可控PLGA微球体递送肽制剂，所述PLGA微球体改变肽的药物动力学和改善免疫原性。将该制剂注射或口服。
C.基因枪送递
制备一种肽制剂，其中将肽粘附在本领域已知的金微粒上。在基因枪中递送颗粒，其被高速加速以便穿透皮肤，将颗粒携带至包含pAPCs的皮肤组织中。
D.气溶胶送递
为了吸收于肺中适当的血管或淋巴组织之中将肽制剂作为一种本领域已知的气溶胶吸入。
2.用核酸疫苗接种
使用微型泵系统，如MiniMed胰岛素泵将核酸疫苗注射于淋巴结中。为了模拟在自然感染中抗原呈递的动力学，经几天的灌输周期递送一种核酸构建体，其是在含有抗菌剂，抗氧化剂和免疫调制细胞因子的水性缓冲剂中配制。
任选地，使用控释物质，如PLGA微球体或其它生物可降解物质递送核酸构建体。将这些物质注射或口服。使用口服送递给予核酸疫苗，通过吸收于GALT组织中引发免疫应答。备选地，使用基因枪递送核酸疫苗，其中将核酸疫苗粘附在微细金颗粒上。为了吸收于肺中适当的血管或淋巴组织之中，还可以将核酸构建体作为气溶胶吸入
实施例9
测定表位疫苗的效力
1.四聚体分析：
使用I类四聚体分析来测定给药管家表位之前和之后动物中的T细胞频率。对表位应答的T细胞克隆扩增表明表位由pAPCs呈递至T细胞。在对动物给药表位之前和之后测量针对管家表位的特异性T细胞频率，以确定表位是否呈递在pAPCs上。给药后表位特异性T细胞频率的增大表明表位是在pAPC上呈递。
2.增殖测定：
在用管家表位接种动物大约24小时后，使用为亲和纯化而固定在磁珠上的针对pAPCs上存在的特异性标记的单克隆抗体从PBMCs，脾细胞或淋巴结细胞收获pAPCs。使用该技术从粗血液或脾细胞制剂富集pAPCs。然后将富集的pAPCs用于针对T细胞克隆的增殖测定，所述T细胞克隆是已经产生并且对所关心管家表位是特异性的。将pAPCs与T细胞克隆共温育并通过测量T细胞放射性标记胸苷的掺入监测T细胞增殖活性。增殖表明对管家表位特异性的T细胞正被pAPCs上的表位所刺激。
3.铬释放测定：
使用管家表位免疫人类患者或被遗传改造而表达人I类MHC的非人类动物。将来源于免疫受试者的T细胞用于标准铬释放测定，其使用人肿瘤目标或改造来表达相同I类MHC的目标。T细胞杀死目标表明患者中T细胞的刺激将有效杀死表达相似TuAA的肿瘤。
实施例10
通过淋巴结内免疫用裸DNA诱导CTL应答是有效的。
为了定量比较由不同途径免疫诱导的CD8+CTL应答使用一种质粒DNA疫苗(pEGFPL33A)，其含有完全表征(well-characterized)的来源于LCMV-糖蛋白(G)(gp33；氨基酸33-41)(Oehen，S.，等.Immunology99，163-169 2000)的免疫显性CTL表位，因为该系统允许广泛评估抗病毒CTL应答。用滴定剂量(200-0.02μg)的pEGFPL33A DNA或对照质粒pEGFP-N3免疫几组2只C57BL/6小鼠，其被i.m.(肌内)，i.d.(皮内)，i.spl.(脾内)，或i.ln.(淋巴结内)给药。阳性对照小鼠i.v.(静脉内)接收500pfu LCMV。免疫10天后，分离脾细胞并在体外第二次再刺激之后测定gp33特异性CTL活性。如图15所示，当给药高剂量的pEFGPL33A DNA(200μg)时，i.m.或i.d.免疫诱导微弱的可检测的CTL应答。相反，仅使用2μg pEFGPL33A DNA i.spl.和使用少至0.2μg pEFGPL33A DNA i.ln.给予来免疫引发有效的gp33特异性CTL应答(图15；符号表示个体小鼠，并且显示了三个类似实验中的一个)。使用对照pEGFP-N3 DNA免疫未引发任何可检测的gp33特异性CTL应答(数据未显示)。
实施例11
淋巴结内DNA免疫引发抗肿瘤免疫性
为了检验在i.ln.免疫后引发的有效CTL应答是否能够赋予针对外周肿瘤的保护，使用10μg pEFGPL33A DNA或对照pEGFP-N3 DNA以6天的间隔免疫几组6只C57BL/6小鼠3次。在最后一次免疫5天后，将小块表达gp33表位(EL4-33)的实体瘤s.c.转移至两胁腹并且每3-4天测量肿瘤的生长。尽管在已经反复用对照pEGFP-N3 DNA免疫的小鼠中EL4-33肿瘤生长良好(图16)，用pEFGPL33A DNA i.ln.免疫的小鼠迅速铲除外周EL4-33肿瘤(图16)。
实施例12
淋巴结中DNA含量的差异反映在淋巴结内和肌内注射后CTL应答中的差异。
i.ln.或i.m.注射pEFGPL33A DNA，并在6，12，24，48小时和4和30天后通过实时PCR评估注射或引流淋巴结的质粒含量。i.m.注射后，在6，12和24小时，注射淋巴结的质粒DNA含量大约比引流淋巴结的质粒DNA含量大3个数量级。在随后的时间点在引流淋巴结中未检测到质粒DNA(图17)。这与i.ln.注射相比使用i.m.以取得相似水平的CTL活性需要大3个数量级的剂量一致。同样i.ln.注射CD8-/-剔除小鼠，其不发展针对该表位的CTL应答，显示从淋巴结清除DNA不是因为CD8+CTL在淋巴结中杀死细胞。该观察也支持i.ln.给药将不激发对淋巴结的免疫病理损伤的结论。
实施例13
对人给药针对黑素瘤的治疗疫苗DNA质粒制剂
在1％苯甲醇，1％乙醇，0.5mM EDTA，柠檬酸盐-磷酸盐，pH 7.6中配制SYNCHROTOPE TA2M，一种黑素瘤疫苗，其编码HLA-A2-限制性酪氨酸酶表位SEQ ID NO.1和表位聚簇SEQ ID NO.69。为了装载至MINIMED 407C灌输泵中，制备80，160和320μg DNA/ml的等分试样。将SILHOUETTE灌输装置的导管置于通过超声成像显现的腹股沟淋巴结中。泵和灌输装置装配最初是设计用于将胰岛素递送至糖尿病患者，对于本申请用31mm导管替换通常的17mm导管。将灌输装置保持开放4天(约96小时)，灌输速率为大约25μl/小时，导致大约2.4ml的总灌输体积。因此对于上述的3种浓度，每种灌输的总给药剂量分别是约200和400μg；并可以为800μg。开始后来的灌输之前给灌输的受试者10天的休息期。假定在给药后质粒DNA在淋巴结中持续滞留(如在实施例12中)和在抗原消失后CTL通常的应答动力学，该时间表将足以保持免疫CTL应答。
实施例14
附加表位
已经将上述，特别是实施例3-7中的方法用于另外的合成肽底物，其导致鉴定如在下面表15-36中更多的表位。这里使用的底物是设计来鉴定管家蛋白酶体加工的产物，其产生HLA-A*0201结合表位，但是，如上所述，可以预测另外的MHC-结合反应性。然而公开了许多这样的反应性，这些列表意欲是示范的，而不是详尽的和限制性的。也如上讨论的，可将分析物的单独组分以变化的组合和顺序使用。消化NY-ESO-1底物136-163和150-177(分别为SEQ ID NOS.254和255)产生在MALDI-TOF质谱中飞行不好的片段。然而它们非常适合于N-末端肽池测序，由此允许鉴定切割位点。并不是所有底物必定满足实施例3中引用的表位聚簇的正式定义。一些聚簇如此大，例如NY-ESO-186-171，以致使用只跨越该聚簇一部分的底物更方便。在其它情形中，底物延伸至满足正式定义的聚簇以外以包括相邻的预测表位。在一些情形中，在设计合成底物之前实际结合活性可能已经确定制备什么底物，例如这里报道的MAGE表位，其中测定HLA结合活性来选择具有预测亲和力的肽。
表15
GP100：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)
表16A
MAGE-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
表16B
MAGE-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。R表示SYFPEITHI分数。
表17A
MAGE-2：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。R表示SYFPEITHI分数。
表17B
MAGE-2：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。R表示SYFPEITHI分数。
表18
MAGE-3：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。R表示SYFPEITHI分数。
表19A
NY-ESO-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。
表19B
NY-ESO-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。R表示SYFPEITHI分数。
表20
PRAME：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。R表示SYFPEITHI分数。
表21
PSA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。R表示SYFPEITHI分数。
表22
PSCA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
*L123是天然蛋白的C-末端。
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。
表23
酪氨酸酶：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。
表24
PSMA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
1在SWISSPROT数据库中该H被报道为Y。
从上面提及的两个结合预测程序给出分数(参见实施例3)。
表25A
MAGE-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPETHI NIH Mage-1 119-146 125-132 KAEMLESV 256 B5101 19 n.a. 124-132 TKAEMLESV 257 A0201 20 ＜5 123-132 VTKAEMLESV 258 A0201 20 ＜5 128-136 MLESVIKNY 259 A1 28 45 A26 24 n.a. A3 17 5 127-136 EMLESVIKNY 260 A1 15 ＜1.0 A26 23 ＜1.0 125-133 KAEMLESVI 261 B5101 23 100 A24 N.A. 4 Mage-1 143-170 146-153 KASESLQL 262 B08 16 ＜1.0 B5101 17 N.A. 145-153 GKASESLQL 263 B2705 17 1 B2709 16 N.A. 147-155 ASESLQLVF 264 A1 22 68 153-161 LVFGIDVKE 265 A26 16 N.A. A3 16 ＜1.0
表25B
MAGE-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHMage-1 99-125 114-121 LLKYRARE 266 B8 25 ＜1.0 106-113 VADLVGFL 267 B8 16 ＜1.0 B5101 21 N.A. 105-113 KVADLVGFL 268 A0201 23 44 A26 25 N.A. A3 16 ＜5 B0702 14 20 B2705 14 30 107-115 ADLVGFLLL 269 A0201 17 ＜5 B0702 15 ＜5 B2705 16 1 106-115 VADLVGFLLL 270 A0201 16 ＜5 A1 22 3 114-123 LLKYRAREPV 271 A0201 20 2
表26
MAGE-3：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIH Mage-3 267-295 271-278 FLWGPRAL 162 B08 17 ＜5 270-278 EFLWGPRAL 163 A26 21 N.A. A24 N.A. 30 B1510 16 N.A. 271-279 FLWGPRALV 164 A0201 27 2655 A3 16 2 278-286 LVETSYVKV 272 A0201 19 ＜1.0 A26 17 N.A. 277-286 ALVETSYVKV 273 A0201 28 428 A26 16 ＜5 A3 18 ＜5 285-293 KVLHHMVKI 274 A0201 19 27 A3 19 ＜5 276-284 RALVETSYV 165 A0201 18 20 283-291 YVKVLHHMV 275 A0201 17 ＜1.0 275-283 PRALVETSY 276 A1 17 ＜1.0 274-283 GPRALVETSY 277 A1 15 ＜1.0 278-287 LVETSYVKVL 278 A0201 18 ＜1.0 272-281 LWGPRALVET 168 A0201 16 ＜1.0 271-280 FLWGPRALVE 167 A3 22 ＜5
表27A
纤连蛋白ED-B：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位
*该底物含有来源于纤连蛋白在N-末端一侧侧邻ED-B的14个氨基酸。
**这些肽跨越ED-B结构域的N-末端与纤连蛋白的剩余部分之间的接点。
体字表示在ED-B结构域外的序列。
表27B
纤连蛋白ED-B：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIH ED-B 8-35 23-30 TPLNSSTI 282 B5101 22 N.A. 18-25 IGLRWTPL 283 B5101 18 N.A. 17-25 SIGLRWTPL 284 A0201 20 5 A26 18 N.A. B08 25 ＜5 25-33 LNSSTIIGY 285 A1 19 ＜5 A26 16 ＜5 24-33 PLNSSTIIGY 286 A1 20 ＜5 A26 24 N.A. A3 16 ＜5 23-31 TPLNSSTII 287 B0702 17 8 B5101 25 440
表27C
纤连蛋白ED-B：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIH ED-B 20-49 31-38 IGYRITVV 288 B5101 25 N.A. 30-38 IIGYRITVV 289 A0201 23 15 A3 17 ＜1.0 B08 15 ＜1.0 B5101 15 3 29-38 TIIGYRITVV 290 A0201 26 9 A26 18 N.A. A3 18 ＜5 23-30 TPLNSSTI 282 B5101 22 N.A. 25-33 LNSSTIIGY 285 A1 19 ＜5 A26 16 N.A. 24-33 PLNSSTIIGY 286 A26 24 N.A. A3 16 ＜5 31-39 IGYRITVVA 291 A3 17 ＜5 30-39 IIGYRITVVA 292 A0201 15 ＜5 A3 18 ＜5 23-31 TPLNSSTII 287 B0702 17 8 B5101 25 440
表28A
CEA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHCEA 176-202 184-191 SLPVSPRL 293 B08 19 ＜5 183-191 QSLPVSPRL 294 A0201 15 ＜5 B1510 15 B2705 18 10 B2709 15 186-193 PVSPRLQL 295 B08 18 ＜5 185-193 LPVSPRLQL 296 B0702 26 180 B08 16 ＜5 B5101 19 130 184-193 SLPVSPRLQL 297 A0201 23 21 A26 18 N.A. A3 18 ＜5 185-192 LPVSPRLQ 298 B5101 17 N.A. 192-200 QLSNGNRTL 299 A0201 21 4 A26 16 N.A. A3 19 ＜5 B08 17 ＜5 B1510 15 191-200 LQLSNGNRTL 300 A0201 16 3 179-187 WVNNQSLPV 301 A0201 16 28 186-194 PVSPRLQLS 302 A26 17 N.A. A3 15 ＜5
表28B
CEA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHCEA 354-380 362-369 SLPVSPRL 303 B08 19 ＜1.0 361-369 QSLPVSPRL 304 A0201 15 ＜1.0 B2705 18 10 B2709 15 364-371 PVSPRLQL 305 B08 18 ＜1.0 363-371 LPVSPRLQL 306 B0702 26 180 B08 16 ＜1.0 B5101 19 130 362-371 SLPVSPRLQL 307 A0201 23 21 A26 18 N.A. A24 N.A. 6 A3 18 ＜5 363-370 LPVSPRLQ 308 B5101 17 N.A. 370-378 QLSNDNRTL 309 A0201 22 4 A26 16 N.A. A3 17 ＜1.0 B08 17 ＜1.0 369-378 LQLSNDNRTL 310 A0201 16 3 357-365 WVNNQSLPV 311 A0201 16 28 360-368 NQSLPVSPR 312 B2705 14 100
表28C
CEA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHCEA 532-558 540-547 SLPVSPRL 313 B08 19 ＜5 539-547 QSLPVSPRL 314 A0201 15 ＜5 B1510 15 ＜5 B2705 18 10 B2709 15 542-549 PVSPRLQL 315 B08 18 ＜5 541-549 LPVSPRLQL 316 B0702 26 180 B08 16 ＜1.0 B5101 19 130 540-549 SLPVSPRLQL 317 A0201 23 21 A26 18 N.A. A3 18 ＜5 541-548 LPVSPRLQ 318 B5101 17 N.A. 548-556 QLSNGNRTL 319 A0201 24 4 A26 16 N.A. A3 19 ＜1.0 B08 17 ＜1.0 B1510 15 547-556 LQLSNGNRTL 320 A0201 16 3 535-543 WVNGQSLPV 321 A0201 18 28 A3 15 ＜1.0 533-541 LWWVNGQSL 322 A0201 15 ＜5
表28D
CEA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHCEA 532-558(continued) 532-541 YLWWVNGQSL 323 A0201 25 816 A26 18 N.A. 538-546 GQSLPVSPR 324 B2705 17 100
表29A
HER2/NEU：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHHer-2 25-52 30-37 DMKLRLPA 325 B08 19 8 28-37 GTDMKLRLPA 326 A1 23 6 42-49 HLDMLRHL 327 B08 17 ＜5 41-49 THLDMLRHL 328 A0201 17 ＜5 B1510 24 N.A. 40-49 ETHLDMLRHL 329 A26 29 N.A. 36-43 PASPETHL 330 B5101 17 N.A. 35-43 LPASPETHL 331 A0201 15 ＜5 B5101 20 130 B5102 N.A. 100 34-43 RLPASPETHL 332 A0201 20 21 38-46 SPETHLDML 333 A0201 15 ＜5 B0702 20 24 B08 18 ＜5 B5101 18 110 37-46 ASPETHLDML 334 A0201 18 ＜5 42-50 HLDMLRHLY 335 A1 29 25 A26 20 N.A. A3 17 4 41-50 THLDMLRHLY 336 A1 18 ＜1.0
表29B
HER2/NEU：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHHer-2 705-732 719-726 ELRKVKVL 337 B08 24 16 718-726 TELRKVKVL 338 A0201 16 1 B08 22 ＜5 B5101 16 ＜5 717-726 ETELRKVKVL 339 A1 18 2 A26 28 6 715-723 LKETELRKV 340 A0201 17 ＜5 B5101 15 ＜5 714-723 ILKETELRKV 341 A0201 29 8 712-720 MRILKETEL 342 A0201 15 ＜5 B08 22 ＜5 B2705 27 2000 B2709 21 N.A.711-720 QMRILKETEL 343 A0201 20 2 B0702 13 40 717-725 ETELRKVKV 344 A1 18 5 A26 18 N.A.716-725 KETELRKVKV 345 A0201 16 19706-714 MPNQAQMRI 346 B0702 16 8 B5101 22 629705-714 AMPNQAQMRI 347 A0201 18 8706-715 MPNQAQMRIL 348 B0702 20 80
表29C
HER2/NEU：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHHer-2 954-982 966-973 RPRFRELV 349 B08 20 24 B5101 18 N.A. 965-973 CRPRFRELV 350 B2709 18 968-976 RFRELVSEF 351 A26 25 N.A. A24 N.A. 32 A3 15 ＜5 B08 16 ＜5 B2705 19 967-976 PRFRELVSEF 352 A26 18 N.A. 964-972 ECRPRFREL 353 A26 21 N.A. A24 N.A. 6 B0702 15 40 B8 27 640 B1510 16 ＜5
表30
NY-ESO-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHNY-ESO-1 51-77 67-75 GAASGLNGC 354 A0201 15 ＜5 52-60 RASGPGGGA 355 B0702 15 ＜5 64-72 PHGGAASGL 356 B1510 21 N.A. 63-72 GPHGGAASGL 357 B0702 22 80 60-69 APRGPHGGAA 358 B0702 23 60
表31A
PRAME：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHPRAME 103-135 112-119 VRPRRWKL 359 B08 19 111-119 EVRPRRWKL 360 A26 27 N.A. A24 N.A. 5 A3 19 N.A. B0702 15(B7)300.00 B08 26 160 113-121 RPRRWKLQV 361 B0702 21(B7)40.00 B5101 19 110 114-122 PRRWKLQVL 362 B08 26 ＜5 B2705 23 200 113-122 RPRRWKLQVL 363 B0702 24(B7)800.00 B8 N.A. 160 B5101 N.A. 61 B5102 N.A. 61 A24 N.A. 10 116-124 RWKLQVLDL 364 B08 22 ＜5 B2705 17 3 115-124 RRWKLQVLDL 365 A0201 16 ＜5PRAME 161-187 174-182 PVEVLVDLF 366 A26 25 N.A.
表31B
PRAME：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHPRAME 185-215 199-206 VKRKKNVL 367 B08 27 8 198-206 KVKRKKNVL 368 A0201 16 ＜1.0 A26 20 N.A. A3 22 ＜1.0 B08 30 40 B2705 16 197-206 EKVKRKKNVL 369 A26 15 N.A. 198-205 KVKRKKNV 370 B08 20 6 201-208 RKKNVLRL 371 B08 20 ＜5 200-208 KRKKNVLRL 372 A0201 15 ＜1.0 A26 15 N.A. B0702 15 ＜1.0 B08 21 ＜1.0 B2705 28 B2709 25 199-208 VKRKKNVLRL 373 A0201 16 ＜1.0 B0702 16 4 189-196 DELFSYLI 374 B5101 15 N.A. 205-213 VLRLCCKKL 375 A0201 22 3 A26 17 N.A. B08 25 8 204-213 NVLRLCCKKL 376 A0201 17 7 A26 19 N.A.
表31C
PRAME：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHPRAME 185-215 (续) 194-202 YLIEKVKRK 377 A0201 20 ＜1.0 A26 18 N.A. A3 25 68 B08 20 ＜1.0 B2705 17PRAME 71-98 74-81 QAWPFTCL 378 B5101 17 n.a. 73-81 VQAWPFTCL 379 A0201 14 7 A24 n.a. 5 B0702 16 6 72-81 MVQAWPFTCL 380 A26 22 n.a. A24 n.a. 7 B0702 13 30 81-88 LPLGVLMK 381 B5101 18 n.a. 80-88 CLPLGVLMK 382 A0201 17 ＜1.0 A3 27 120 79-88 TCLPLGVLMK 383 A1 12 10 A3 19 3 84-92 GVLMKGQHL 384 A0201 18 7 A26 21 n.a. B08 21 4 81-89 LPLGVLMKG 385 B5101 20 2 80-89 CLPLGVLMKG 386 A0201 16 ＜1.0 76-85 WPFTCLPLGV 387 B0702 18 4
表31D
PRAME：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHPRAME 39-65 51-59 ELFPPLFMA 388 A0201 19 18 A26 23 N.A. 49-57 PRELFPPLF 389 B2705 22 B2709 19 48-57 LPRELFPPLF 390 B0702 19 4 50-58 RELFPPLFM 391 B2705 16 B2705 15 49-58 PRELFPPLFM 392 A1 16 ＜1.0
表32
PSA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHPSA 232-258 239-246 RPSLYTKV 393 B5101 21 N.A. 238-246 ERPSLYTKV 394 B2705 15 60 236-243 LPERPSLY 395 B5101 18 N.A. 235-243 ALPERPSLY 396 A1 19 ＜1.0 A26 22 N.A. A3 26 6 B08 16 ＜1.0 B2705 11 15 B2709 19 N.A. 241-249 SLYTKVVHY 397 A0201 20 ＜1.0 A1 19 ＜1.0 A26 25 N.A. A3 26 60 B08 20 ＜1.0 B2705 13 75 240-249 PSLYTKVVHY 398 A1 20 ＜1.0 A26 16 N.A. 239-247 RPSLYTKVV 399 B0702 21 4 B5101 23 110
表33A
PSMA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHPSMA 202-228 211-218 GNKVKNAQ 400 B08 22 ＜5 202-209 IARYGKVF 401 B08 18 ＜5 217-225 AQLAGAKGV 402 A0201 16 26 207-215 KVFRGNKVK 403 A3 32 15 211-219 GNKVKNAQL 404 B8 33 80 B2705 17 20 PSMA 255-282 269-277 TPGYPANEY 405 A1 16 ＜5 268-277 LTPGYPANEY 406 A1 21 1 A26 24 N.A. 271-279 GYPANEYAY 407 A1 15 ＜5 270-279 PGYPANEYAY 408 A1 19 ＜5 266-274 DPLTPGYPA 409 B0702 21 3 B5101 17 20 PSMA 483-509 492-500 SLYESWTKK 410 A0201 17 ＜5 A3 27 150 B2705 18 150 491-500 KSLYESWTKK 411 A3 16 ＜5 486-494 EGFEGKSLY 412 A1 19 ＜5 A26 21 N.A. B2705 16 ＜5 485-494 DEGFEGKSLY 413 A1 17 ＜5 A26 17 N.A. 498-506 TKKSPSPEF 414 B08 17 ＜5
表33B
PSMA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHPSMA 483-509 (续) 497-506 WTKKSPSPEF 415 A26 24 N.A. 492-501 SLYESWTKKS 416 A0201 16 ＜5 A3 16 ＜5 PSMA 721-749 725-732 WGEVKRQI 417 B08 17 ＜5 B5101 17 N.A. 724-732 AWGEVKRQI 418 B5101 15 6 723-732 KAWGEVKRQI 419 A0201 16 ＜1.0 723-730 KAWGEVKR 420 B5101 15 N.A. 722-730 SKAWGEVKR 421 B2705 15 ＜5 731-739 QIYVAAFTV 422 A0201 21 177 A3 21 ＜1.0 B5101 15 5 733-741 YVAAFTVQA 423 A0201 17 6 A3 20 ＜1.0 725-733 WGEVKRQIY 424 A1 26 11 727-735 EVKRQIYVA 425 A26 22 N.A. A3 18 ＜1.0 738-746 TVQAAAETL 426 A26 18 N.A. A3 19 ＜1.0 737-746 FTVQAAAETL 427 A0201 17 ＜1.0 A26 19 N.A.
表33C
PSMA：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIH PSMA 721-749 (续) 729-737 KRQIYVAAF 428 A26 16 N.A. B2705 24 3000 B2709 21 N.A. 721-729 PSKAWGEVK 429 A3 20 ＜1.0 723-731 KAWGEVKRQ 430 B5101 16 ＜1.0 PSMA 95-122 100-108 WKEFGLDSV 431 A0201 16 ＜5 99-108 QWKEFGLDSV 432 A0201 17 ＜5 102-111 EFGLDSVELA 433 A26 16 N.A.
表34A
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIH SCP-1 117-143 126-134 ELRQKESKL 434 A0201 20 ＜5 A26 26 N.A. A3 17 ＜5 B0702 13 (B7)40.00 B8 34 320 125-134 AELRQKESKL 435 A0201 16 ＜5 133-141 KLQENRKII 436 A0201 20 61 SCP-1 281-308 298-305 QLEEKTKL 437 B08 28 2 297-305 NQLEEKTKL 438 A0201 16 33 B2705 19 200 288-296 LLEESRDKV 439 A0201 25 15 B5101 15 3 287-296 FLLEESRDKV 440 A0201 27 2378 291-299 ESRDKVNQL 441 A26 21 N.A. B08 29 240 290-299 EESRDKVNQL 442 A26 19 N.A. SCP-1 471-498 475-483 EKEVHDLEY 443 A1 31 11 A26 17 N.A. 474-483 REKEVHDLEY 444 A1 21 ＜1.0 480-488 DLEYSYCHY 445 A1 26 45 A26 30 N.A. A3 16 ＜5 477-485 EVHDLEYSY 446 A1 15 1
表34B
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHSCP-1 471-498 (续) 477-485 EVHDLEYSY A26 29 N.A. A3 19 ＜1.0 477-486 EVHDLEYSYC 447 A26 22 N.A.SCP-1 493-520 502-509 KLSSKREL 448 B08 26 4 508-515 ELKNTEYF 449 B08 24 ＜1.0 507-515 RELKNTEYF 450 B2705 18 45 B4403 N.A. 120 496-503 KRGQRPKL 451 B08 18 ＜1.0 494-503 LPKRGQRPKL 452 B0702 22 120 B8 N.A. 16 B5101 N.A. 130 B3501 N.A. 60 509-517 LKNTEYFTL 453 A0201 15 ＜5 508-517 ELKNTEYFTL 454 A0201 18 ＜1.0 A26 27 N.A. A3 16 ＜1.0 506-514 KRELKNTEY 455 A1 26 2 B2705 26 3000 502-510 KLSSKRELK 456 A3 25 60 498-506 GQRPKLSSK 457 A3 22 4 B2705 18 200 497-506 RGQRPKLSSK 458 A3 22 ＜1.0 500-508 RPKLSSKRE 459 B08 18 ＜1.0
表34C
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHSCP-1 570-596 573-580 LEYVREEL 460 B08 19 ＜5 572-580 ELEYVREEL 461 A0201 17 ＜1.0 A26 23 N.A. A24 N.A. 9 B08 20 N.A. 571-580 NELEYVREEL 462 A0201 16 4 579-587 ELKQKRDEV 463 A0201 19 ＜1.0 A26 18 N.A. B08 29 48 575-583 YVREELKQK 464 A26 17 N.A. A3 27 2SCP-1 618-645 632-640 QLNVYEIKV 465 A0201 24 70 630-638 SKQLNVYEI 466 A0201 17 ＜5 628-636 AESKQLNVY 467 A1 19 ＜5 A26 16 N.A. 627-636 TAESKQLNVY 468 A1 26 45 A26 15 N.A.
表34D
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHSCP-1 633-660 638-645 IKVNKLEL 469 B08 21 ＜1.0 637-645 EIKVNKLEL 470 A0201 17 ＜1.0 A26 26 N.A. B08 28 8 B1510 15 N.A. 636-645 YEIKVNKLEL 471 A0201 17 2 642-650 KLELELESA 472 A0201 20 1 A3 16 ＜1.0 635-643 VYEIKVNKL 473 A0201 18 ＜1.0 A24 N.A. 396 B08 22 ＜1.0 634-643 NVYEIKVNKL 474 A0201 24 56 A26 25 N.A. A24 N.A. 6 A3 15 ＜5 B0702 11 (B7)20 B08 N.A. 6 646-654 ELESAKQKF 475 A26 27 N.A.SCP-1 640-668 642-650 KLELELESA 476 A0201 20 1 A3 16 ＜1.0 646-654 ELESAKQKF 477 A26 27 N.A.
表34E
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIHSCP-1 768-796 771-778 KEKLKREA 478 B08 21 ＜5 777-785 EAKENTATL 479 A0201 18 ＜5 A26 18 N.A. A24 N.A. 5 B0702 13 12 B08 28 48 B5101 20 121 776-785 REAKENTATL 480 A0201 16 ＜5 773-782 KLKREAKENT 481 A3 17 ＜5 SCP-1 92-125 112-119 EAEKIKKW 482 B5101 17 N.A. 101-109 GLSRVYSKL 483 A0201 23 32 A26 22 N.A A24 N.A. 6 A3 17 3 B08 17 ＜1.0 100-109 EGLSRVYSKL 484 A26 21 N.A. A24 N.A. 9 108-116 KLYKEAEKI 485 A0201 22 57 A3 20 9 B5101 18 5 98-106 NSEGLSRVY 486 A1 31 68 97-106 ENSEGLSRVY 487 A26 18 N.A. 102-110 LSRVYSKLY 488 A1 22 ＜1.0
表34F
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHSCP-1 92-125 (续) 101-110 GLSRVYSKLY 489 A1 18 ＜1.0 A26 18 N.A. A3 19 1 8 96-105 LENSEGLSRV 490 A0201 17 5 108-117 KLYKEAEKIK 491 A3 27 150 SCP-1 931-958 949-956 REDRWAVI 492 B5101 15 N.A. 948-956 MREDRWAVI 493 B2705 18 600 B2709 18 N.A. B5101 15 1 947-956 KMREDRWAVI 494 A0201 21 6 B08 N.A. 15 947-955 KMREDRWAV 495 A0201 22 411 934-942 TTPGSTLKF 496 A26 25 N.A. 933-942 LTTPGSTLKF 497 A26 23 N.A. 937-945 GSTLKFGAI 498 B08 19 1 945-953 IRKMREDRW 499 B08 19 ＜5SCP-1 232-259 236-243 RLEMHFKL 500 B08 16 ＜5 235-243 SRLEMHFKL 501 A0201 18 ＜5 B2705 25 2000 B2709 22 242-250 KLKEDYEKI 502 A0201 22 4
表34G
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIH SCP-1 232-259 (续) A26 16 N.A. A3 15 3 B08 24 ＜5 B5101 14 2 249-257 KIQHLEQEY 503 A1 15 ＜5 A26 23 N.A. A3 17 ＜5 248-257 EKIQHLEQEY 504 A1 15 ＜5 A26 21 N.A. 233-242 ENSRLEMHF 505 A26 19 N.A. 236-245 RLEMHFKLKE 506 A1 19 ＜5 A3 17 ＜5SCP-1 310-340 324-331 LEDIKVSL 507 B08 20 ＜1.0 323-331 ELEDIKVSL 508 A0201 21 ＜1.0 A26 25 N.A. A24 N.A. 10 A3 17 ＜1.0 B08 19 ＜1.0 B1510 16 N.A. 322-331 KELEDIKVSL 509 A0201 19 22 320-327 LTKELEDI 500 B08 18 ＜5 319-327 HLTKELEDI 511 A0201 21 ＜1.0 330-338 SLQRSVSTQ 512 A0201 18 ＜1.0
表34H
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHSCP-1 310-340 (续) 321-329 TKELEDIKV 513 A1 16 ＜1.0 320-329 LTKELEDIKV 514 A0201 19 ＜1.0 326-335 DIKVSLQRSV 515 A26 18 N.A.SCP-1 272-305 281-288 KMKDLTFL 516 B08 20 3 280-288 NKMKDLTFL 517 A0201 15 1 279-288 ENKMKDLTFL 518 A26 19 N.A. 288-296 LLEESRDKV 519 A0201 25 15 B5101 15 3 287-296 FLLEESRDKV 520 A0201 27 2378 291-299 ESRDKVNQL 521 A26 21 N.A. B08 29 240 290-299 EESRDKVNQL 522 A26 19 N.A. 277-285 EKENKMKDL 523 A26 19 N.A. B08 23 ＜1.0 276-285 TEKENKMKDL 524 A26 15 N.A. 279-287 ENKMKDLTF 525 A26 18 N.A. B08 28 4SCP-1 211-239 218-225 IEKMITAF 526 B08 17 ＜5 217-225 NIEKMITAF 527 A26 26 N.A. 216-225 SNIEKMITAF 528 A26 19 N.A. 223-230 TAFEELRV 529 B5101 23 N.A. 222-230 ITAFEELRV 530 A0201 18 2 221-230 MITAFEELRV 531 A0201 18 16
表34I
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHSCP-1 211-239 (续) 220-228 KMITAFEEL 532 A0201 23 50 A26 15 N.A. A24 N.A. 16 219-228 EKMITAFEEL 533 A26 19 N.A. 227-235 ELRVQAENS 534 A3 16 ＜1.0 B08 15 ＜1.0 213-222 DLNSNIEKMI 535 A0201 17 ＜1.0 A26 16 N.A.SCP-1 836-863 837-844 WTSAKNTL 536 B08 20 4 846-854 TPLPKAYTV 537 A0201 18 2 B0702 17 4 B08 16 2 B5101 25 220 845-854 STPLPKAYTV 538 A0201 19 ＜5 844-852 LSTPLPKAY 539 A1 23 8 843-852 TLSTPLPKAY 540 A1 16 ＜1.0 A26 19 N.A. A3 18 2 842-850 NTLSTPLPK 541 A3 16 3 841-850 KNTLSTPLPK 542 A3 18 ＜1.0
表34J
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHSCP-1 819-845 828-835 ISKDKRDY 543 B08 21 3 A26 21 N.A. 826-835 HGISKDKRDY 544 A1 15 ＜5 832-840 KRDYLWTSA 545 B2705 16 600 829-838 SKDKRDYLWT 546 A1 18 ＜5SCP-1 260-288 279-286 ENKMKDLT 547 B08 22 8 260-268 EINDKEKQV 548 A0201 17 3 A26 19 N.A. B08 17 ＜5 274-282 QITEKENKM 549 A0201 17 3 A26 22 N.A. B08 16 ＜5 269-277 SLLLIQITE 550 A0201 16 ＜1.0 A3 18 ＜1.0SCP-1 437-464 453-460 FEKIAEEL 551 B08 21 ＜1.0 452-460 QFEKIAEEL 552 B2705 15 451-460 KQFEKIAEEL 553 A0201 16 56 449-456 DNKQFEKI 554 B08 16 2 B5101 16 N.A. 448-456 YDNKQFEKI 555 B5101 16 1 447-456 LYDNKQFEKI 556 A1 15 ＜1.0
表34K
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIH SCP-1 437-464 (续) 440-447 LGEKETLL 557 B5101 16 N.A. 439-447 VLGEKETLL 558 A0201 24 149 A26 19 N.A. B08 29 12 438-447 KVLGEKETLL 559 A0201 19 24 A26 20 N.A. A24 N.A. 12 A3 18 ＜1.0 B0702 14 20 SCP-1 383-412 390-398 LLRTEQQRL 560 A0201 22 3 A26 18 N.A. B08 22 1.6 B2705 15 30 389-398 ELLRTEQQRL 561 A0201 19 6 A26 24 N.A. A3 15 ＜1.0 393-401 TEQQRLENY 562 A1 15 ＜5 A26 16 N.A. 392-401 RTEQQRLENY 563 A1 31 113 A26 26 N.A. 402-410 EDQLIILTM 564 A26 18 N.A. 397-406 RLENYEDQLI 565 A0201 17 ＜1.0 A3 15 ＜1.0
表34L
SCP-1：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型SYFPEITHI NIH SCP-1 366-394 368-375 KARAAHSF 566 B08 16 ＜1.0 376-384 VVTEFETTV 567 A0201 19 161 A3 16 ＜1.0 375-384 FVVTEFETTV 568 A0201 17 106 377-385 VTEFETTVC 569 A1 18 2 376-385 VVTEFETTVC 570 A3 16 ＜5SCP-1 331-357 344-352 DLQIATNTI 571 A0201 22 ＜5 A3 15 ＜1.0 B5101 17 11 347-355 IATNTICQL 572 A0201 19 1 B08 16 ＜1.0 B5101 20 79 346-355 QIATNTICQL 573 A0201 24 7 A26 24 N.A.
表35
SSX-4：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHSSX4 45-7657-65VMTKLGFKV 574 A0201 21 49553-61LNYEVMTKL 575 A0201 17 752-61KLNYEVMTKL 576 A0201 23 172 A26 21 N.A. A24 N.A. 18 A3 14 4 B7 N.A. 466-74TLPPFMRSK 577 A26 16 N.A. A3 25 14SSX4 98-124110-118KIMPKKPAE 578 A0201 15 ＜5 A26 15 N.A. A3 16 ＜5103-112SLQRIFPKIM 579 A0201 15 8 A26 16 N.A. A3 15 ＜5
表36
酪氨酸酶：通过管家蛋白酶体消化显示的优选表位 底物 表位 序列 Seq.ID No. 结合预测 HLA类型 SYFPEITHI NIHTyr 445-474 463-471 YIKSYLEQA 580 A0201 18 ＜5 A26 17 N.A. 459-467 SFQDYIKSY 581 A1 18 ＜5 A26 22 N.A. 458-467 DSFQDYIKSY 582 A1 19 ＜5 A26 24 N.A.Tyr 490-518 507-514 LPEEKQPL 583 B08 28 5 B5101 18 N.A. 506-514 QLPEEKQPL 584 A0201 22 88 A26 20 N.A. A24 N.A. 9 B08 18 ＜5 505-514 KQLPEEKQPL 585 A0201 15 28 A24 N.A. 17 507-515 LPEEKQPLL 586 A0201 15 ＜5 B0702 21 24 B08 28 5 B5101 21 157 506-515 QLPEEKQPLL 587 A0201 23 88 A26 20 N.A. A24 N.A. 7 497-505 SLLCRHKRK 588 A3 25 15
实施例15
评估表位对非靶组织的交叉反应性
如上所提及，PSA是蛋白酶的激肽释放酶家族的一个成员，其自身是丝氨酸蛋白酶家族的一个亚型。虽然与PSA共享最大程度序列同一性的该家族成员也共享相似的表达图谱，但仍然可能具有显著不同表达图谱的蛋白质共享单独的表位序列。评估不希望有的交叉反应性的第一步是鉴定共享序列。完成这个的一种方法是使用“Search for short nearly exactmatches”选项对SWISSPROT或Entrez非冗余肽序列数据库进行BLAST搜索表位序列；可在万维网(http：//www)“ncbi.nlm.nih.gov/blast/index.html”上访问超文本传输协议。因此对SWISSPROT搜索SEQ ID NO.214，WVLTAAHCI(局限于人的记录)，发现四个精确匹配，包括PSA。其它3个是来源于激肽释放酶1(组织激肽释放酶)，和弹性蛋白酶2A和2B。虽然这9个氨基酸区段是相同的，但侧翼序列完全不同，特别是C-末端一侧，提示可进行不同加工并因此从这些其它的蛋白质可能不释放相同的表位。(请注意激肽释放酶命名是混乱的)。因此激肽释放酶1[登记号P06870]是与在关于肿瘤-相关抗原部分中上面关于PSA段落中提及的那种[登记号AAD13817]不同的一种蛋白质)。
可以以几种方法检验该可能性。可以将含有内嵌在这些蛋白质每一种的前后序列中的表位序列的合成肽进行如上所述的体外蛋白酶体消化和分析。备选地，为了确定表位是否被加工和呈递，在利用识别该表位的CD8+T细胞的细胞毒性(或类似的)测定中可以将通过天然或重组表达来表达这些其它蛋白质的细胞用作目标。
实施例16
表位聚簇
已知和预测的表位通常在蛋白质抗原序列中不均匀分布。如上所述，我们已经将含有比(已知或预测)表位平均密度更高的序列区段定义为表位聚簇。在表位聚簇的使用中是将它们的序列结合至在这里描述的蛋白酶体消化分析中使用的底物肽中。还可将表位聚簇用作疫苗组分。在题为EPITOPE CLUSTERS的美国专利申请No.09/561,571中发现表位聚簇定义和使用的更详尽的讨论。
下列各表(37-60)表示使用SYFPEITHI和NIH算法预测HLA-A2结合的9-链节表位和重叠表位区域的表位密度，以及表位在整个蛋白中的表位密度，和这两个密度的比率。(由上述定义该比率必须超过1以成为簇；要求更高的这个比率值反映优选实施方案)。通过得分排列和通过它们在完整蛋白序列中的第一个氨基位置鉴定单独的9-链节。编号来源于蛋白质的每个可能的簇。将簇包含的完整序列内氨基酸位置范围表示为组成它的单独预测表位的等级。
表37
gp 100的BIMAS-NIH/Parker算法结果 排序 起始 得分 排序 起始 得分 1 619 1493 2 602 413 3 162 226 4 18 118 5 178 118 6 273 117 7 601 81 8 243 63 9 606 60 10 373 50 11 544 36 12 291 29 13 592 29 14 268 29 15 47 27 16 585 26 17 576 21 18 465 21 19 570 20 20 9 19 21 416 19 22 25 18 23 566 17 24 603 15 25 384 14 26 13 14 27 290 12 28 637 10 29 639 9 30 485 9 31 453 8 32 102 8 33 399 8 34 456 7 35 113 7 36 622 7 37 69 7 38 604 6 39 350 6 40 583 5
表38
gp100的SYFPEITHI(Rammensee算法)结果 排序 起始 得分 排序 起始 得分 排序 起始 得分 1 606 30 2 162 29 3 456 28 4 18 28 5 602 27 6 598 27 7 601 26 8 597 26 9 13 26 10 585 25 11 449 25 12 4 25 13 603 24 14 576 24 15 453 24 16 178 24 17 171 24 18 11 24 19 619 23 20 280 23 21 268 23 22 592 22 23 544 22 24 465 22 25 399 22 26 373 22 27 273 22 28 243 22 29 566 21 30 563 21 31 485 21 32 384 21 33 350 21 34 9 21 35 463 20 36 397 20 37 291 20 38 269 20 39 2 20 40 610 19 41 594 19 42 591 19 43 583 19 44 570 19 45 488 19 46 446 19 47 322 19 48 267 19 49 250 19 50 205 19 51 180 19 52 169 19 53 88 19 54 47 19 55 10 19 56 648 18 57 605 18 58 604 18 59 595 18 60 571 18 61 569 18 62 450 18 63 409 18 64 400 18 65 371 18 66 343 18 67 298 18 68 209 18 69 102 18 70 97 18 71 76 18 72 69 18 73 60 18 74 17 18 75 613 17 76 599 17 77 572 17 78 557 17 79 556 17 80 512 17 81 406 17 82 324 17 83 290 17 84 101 17 85 95 17 86 635 16 87 588 16 88 584 16 89 577 16 90 559 16 91 539 16 92 494 16 93 482 16 94 468 16 95 442 16 96 413 16 97 408 16 98 402 16 99 286 16 100 234 16 101 217 16 102 211 16 103 176 16 104 107 16 105 96 16 106 80 16 107 16 16 108 14 16 109 7 16
表39
gp100的聚簇预测
总AAs：661
总9-链节：653
SYFPEITHI 16：109 9-链节
NIH 5：40 9-链节 表位/AA 聚簇# AAs 表位(按照排序) 聚簇 总蛋白 比率 SYFPEITHI 1 2to26 39，12，109，34，55，11，9， 0.440 0.165 2.668 108，107，74，4 2 69-115 72，71，106，53，85，105， 0.213 0.165 1.290 70，84，69，104 3 95-115 85，105，70，84，69 0.238 0.165 1.444 4 162-188 2，52，17，103，16，51 0.222 0.165 1.348 5 205-225 50，68，102，101， 0.190 0.165 1.155 6 243-258 28，49 0.125 0.165 0.758 7 267-306 48，21，38，27，20，99，83，37，67 0.225 0.165 1.364 8 322-332 47，82 0.182 0.165 1.103 9 343-358 66，33 0.125 0.165 0.758 10 371-381 65，26 0.182 0.165 1.103 11 397-421 36，25，64，98，81，97，63，96 0.320 0.165 1.941 12 442-476 95，46，11，62，15，3，35，24，94 0.257 0.165 1.559 13 482-502 93，31，45，93 0.190 0.165 1.155 14 539-552 91，23 0.143 0.165 0.866 15 556-627 79，78，90，30，29，61，44，60，77，14， 0.431 0.165 2.611 89，43，88，10，87，42，22，41，59，8， 6，76，7，5，13，58，57，1，40，75，19 NIH 1 9 to 33 20，26，4，22 0.160 0.061 2.644 2 268-281 14，6 0.143 0.061 2.361 3 290-299 27，12 0.200 0.061 3.305 4* 102-121 32，35 0.100 0.061 1.653 5* 373-392 10，25 0.100 0.061 1.653 6 453-473 31，34，18 0.143 0.061 2.361 7 566-600 23，19，17，40，16，13 0.171 0.061 2.833 8 601-614 7，2，24，38，9 0.357 0.061 5.902 9 619-630 1，36 0.17 0.061 2.754 10 637-647 28，29 0.18 0.061 3.005
*邻近但不重叠的表位
表40
PSMA的BIMAS-NIH/Parker算法结果 排序 起始 得分 1 663 1360 2 711 1055 3 4 485 4 27 400 5 26 375 6 668 261 7 707 251 8 469 193 9 731 177 10 35 67 11 33 64 12 554 59 13 427 50 14 115 47 15 20 40 16 217 26 17 583 24 18 415 19 19 193 14 20 240 12 21 627 11 22 260 10 23 130 10 24 741 9 25 3 9 26 733 8 27 726 7 28 286 6 29 174 5 30 700 5
表41
PSMA的SYFPEITHI(Rammensee算法)结果 排序 起始 得分 排序 起始 得分 排序 起始 得分 1 469 27 2 27 27 3 741 26 4 711 26 5 354 25 6 4 25 7 663 24 8 130 24 9 57 24 10 707 23 11 260 23 12 20 23 13 603 22 14 218 22 15 109 22 16 731 21 17 668 21 18 660 21 19 507 21 20 454 21 21 427 21 22 358 21 23 284 21 24 115 21 25 33 21 26 606 20 27 568 20 28 473 20 29 461 20 30 200 20 31 26 20 32 3 20 33 583 19 34 579 19 35 554 19 36 550 19 37 547 19 38 390 19 39 219 19 40 193 19 41 700 18 42 472 18 43 364 18 44 317 18 45 253 18 46 91 18 47 61 18 48 13 18 49 733 17 50 673 17 51 671 17 52 642 17 53 571 17 54 492 17 55 442 17 56 441 17 57 397 17 58 391 17 59 357 17 60 344 17 61 305 17 62 304 17 63 286 17 64 282 17 65 169 17 66 142 17 67 122 17 68 738 16 69 634 16 70 631 16 71 515 16 72 456 16 73 440 16 74 385 16 75 373 16 76 365 16 77 361 16 78 289 16 79 278 16 80 258 16 81 247 16 82 217 16 83 107 16 84 100 16 85 75 16 86 37 16 87 30 16 88 21 16
表42
前列腺特异性膜抗原(PSMA)的聚簇预测
总AAs：750
总9-链节：742
SYFPEITHI 16：88 9-链节
NIH 5：30 9-链节 聚簇# Aas 表位(按照排序) 聚簇 表位/AA 总蛋白 比率 SYFPEITHI 1 3 to 12 32，6 0.200 0.117 1.705 2 13-45 13，12，88，31，2，87，25，86 0.242 0.117 2.066 3 57-69 9，47 0.154 0.117 1.311 4 100-138 84，83，15，24，67，8 0.154 0.117 1.311 5 193-208 40，30 0.111 0.117 0.947 6 217-227 82，14，39 0.273 0.117 2.324 7 247-268 81，45，80，11 0.182 0 117 1.550 8 278-297 79，64，23，63，78 0.250 0.117 2.131 9 354-381 5，59，22，77，43，76，75 0.250 0.117 2.131 10 385-405 74，38，58，57 0.190 0.117 1.623 11 440-450 73，56，55 0.273 0.117 2.324 12 454-481 20，72，29，1，42，28 0.214 0.117 1.826 13 507-523 17，71 0.118 0.117 1.003 14 547-562 37，36，35 0.188 0.117 1.598 15 568-591 27，53，34，33 0.167 0.117 1.420 16 603-614 13，26 0.167 0.117 1.420 17 631-650 70，69，52 0.150 0.117 1.278 18 660-681 18，7，17，51，50 0.227 0.117 1.937 19 700-719 41，10，4 0.150 0.117 1.278 20 731-749 16，49，68，3 0.211 0.117 1.794 NIH 1 3 to 12 25，3 0.200 0.040 5.000 2 20-43 15，5，4，11，10 0.208 0.040 5.208 3* 415-435 18，13 0.095 0.040 2.381 4 663-676 1，6 0.143 0.040 3.571 5 700-715 30，7，3 0.188 0.040 4.688 6 726-749 27，9，26，24 0.167 0.040 4.167
*邻近但不重叠的表位
表43
PSA的BIMAS-NIH/Parker算法结果 排序 起始 得分 1 7 607 2 170 243 3 52 124 4 53 112 5 195 101 6 165 23 7 72 18 8 245 18 9 2 16 10 59 16 11 122 15 12 125 15 13 191 13 14 9 8 15 14 6 16 175 5 17 130 5
表44
PSA的SYFPEITHI(Rammensee算法)结果 排序 起始 得分 1 72 26 2 170 22 3 53 22 4 7 22 5 234 21 6 166 21 7 140 21 8 66 21 9 241 20 10 175 20 11 12 20 12 41 19 13 20 19 14 14 19 15 130 18 16 124 18 17 121 18 18 47 18 19 17 18 20 218 17 21 133 17 22 125 17 23 122 17 24 118 17 25 110 17 26 67 17 27 52 17 28 21 17 29 16 17 30 2 17 31 184 16 32 179 16 33 158 16 34 79 16 35 73 16 36 4 16
表45
前列腺特异性抗原(PSA)的聚簇预测
总AAs：261
总9-链节：253
SYFPEITHI 16：36 9-链节
NIH 5：17 9-链节 聚簇# AAs 表位(按照排序) 聚簇 表位/AA 总蛋白 比率SYFPEITHI 1 2to29 30，36，4，11，14，29，19，13，28 0.321 0.138 2.330 2 41-61 12，18，27，3 0.190 0.138 1.381 3 66-87 8，26，1，35，34 0.227 0.138 1.648 4 110-148 25，24，17，23，16，22，15，21，7 0.184 0.138 1.332 5 158-192 33，6，2，10，32，31 0.171 0.138 1.243 6 234-249 5，9 0.125 0.138 0.906 7* 118-133 24，17，23，16，22 0.313 0.138 2.266 8* 118-138 24，17，23，16，22，15 0.286 0.138 2.071 NIH 1 2-22 9，1，14，15 0.190 0.065 2.924 2 52-67 3，4，10 0.188 0.065 2.879 3 122-138 11，12，17 0.176 0.065 2.709 4 165-183 6，2，16 0.158 0.065 2.424 5 191-203 13，5 0.154 0.065 2.362 6** 52-80 3，4，10，7 0.138 0.065 2.118
*这些聚簇在较不优选的聚簇#4的内部。
**包含一个邻近但不重叠的表位。
表46
PSCA的BIMAS-NIH/Parker算法结果 排序 起始 得分 1 43 153 2 5 84 3 7 79 4 109 36 5 105 125 6 108 24 7 14 21 8 20 18 9 115 17 10 42 15 11 36 15 12 99 9 13 58 8
表47
PSCA的SYFPEITHI(Rammensee算法)结果 排序 起始 得分 排序 起始 得分 1 108 30 2 14 30 3 105 29 4 5 28 5 115 26 6 99 26 7 7 26 8 109 24 9 53 23 10 107 21 11 20 21 12 8 21 13 13 20 14 102 19 15 60 19 16 57 19 17 54 19 18 12 19 19 4 19 20 1 19 21 112 18 22 101 18 23 98 18 24 51 18 25 43 18 26 106 17 27 104 17 28 83 17 29 63 17 30 50 17 31 3 17 32 9 16 33 92 16
表48
前列腺干细胞抗原(PSCA)的聚簇预测
总AAS：123
总9-链节：115
SYFPEITHI 16：33；
SYFPEITHI 20：13
NIH 5：13 SYFPEITHI＞16聚簇# 1 2 3 AAs 1to28 43-71 92-123 表位(按照排序) 20，31，19，4，7，12，33，18，13，2，11 25，30，24，9，17，16，15，29 32，23，6，27，14，22，3，26，10， 1，8，21，5 聚簇 0.393 0.276 0.406 表位/AA 总蛋白 0.268 0 268 0.268 比率 1.464 1.028 1.514SYFPEITHI＞20 1 2 5to28 99-123 4，7，12，13，2，11 6，3，10，1，8，5 0.250 0.240 0106 0.106 2.365 2.271NIH 1 2 3 4* 5to28 36-51 99-123 105-116 2，3，7，8 11，10，1 12，5，6，4，9 5，6，4 0.167 0.188 0.200 0.250 0.106 0.106 0.106 0.106 1.577 1.774 1.892 2.365
*该聚簇是较不优选的聚簇#3的内部。
在表49-60中将对于每种算法的表位预测和聚簇分析数据一起展示在单个表中。
表49
MAGE-1聚簇预测(NIH算法)
总AAs：309
总9-链节：301
NIH 5：19 9-链节 聚簇# AAs表位排序 起始位置 NIH 得分 聚簇 表位/AA 总蛋白 比率 1 18-32 16 19 18 24 9 7 0.133 0.063 2.112 2 101-113 14 7 101 105 11 44 0.154 0.063 2.442 3 146-159 9 3 146 151 32 169 0.143 0.063 2.263 4 169-202 10 13 18 17 6 5 169 174 181 187 188 194 32 16 8 8 74 110 0.176 0.063 2.796 5 264-277 2 12 264 269 190 20 0.143 0.063 2.263 6 278-290 1 11 278 282 743 28 0.154 0.063 2.437
表50
MAGE-1的聚簇预测(SYFPEITHI算法)
总AAs：309
总9-链节：301
SYFPEITHI 16：46 9-链节 聚簇# Aas表位排序起始位置SYFPEITHI 得分 聚簇 表位/AA 总蛋白比率 1 7-49 22 9 27 16 28 29 33 30 2 17 7 15 18 20 22 24 31 35 38 41 19 22 18 20 18 18 17 18 26 20 0.233 0.1531.522 2 89-132 10 18 7 23 43 4 8 34 35 36 37 19 89 92 93 96 98 101 105 107 108 113 118 124 22 20 23 19 16 25 23 17 17 17 17 20 0.273 0.1531.783 3 167-203 44 20 12 24 6 31 25 38 1 13 167 169 174 181 187 188 191 192 194 195 16 20 21 19 24 18 19 17 27 21 0.270 0.1531.766 4 230-246 14 39 230 238 21 17 0.118 0.1530.769 5 264-297 15 32 40 26 46 3 21 41 264 269 270 271 275 278 282 289 21 18 17 19 16 26 20 17 0.235 0.1531.538
表51
MAGE-2的聚簇预测(NIH算法)
总AAs：314
总9-链节：308
NIH＞＝5：20 9-链节 聚簇# AAs表位排序 起始位置 NIH 得分 聚簇 表位/AA 总蛋白 比率 1 101-120 18 16 1 101 108 112 5.373 6.756 2800.697 0.150 0.065 2.310 2 153-167 8 4 7 153 158 159 31.883 168.552 32.138 0.200 0.065 3.080 3 169-211 14 19 6 11 15 12 5 10 17 169 174 176 181 188 195 200 201 203 8.535 5.346 49.993 15.701 7.536 12.809 88.783 16.725 5.609 0.209 0.065 3.223 4 271-284 3 9 271 276 398.324 19.658 0.143 0.065 2.200
表52
MAGE-2的聚簇预测(SYFPEITHI算法)
总AAs：314
总9-链节：308
SYFPEITHI 16：52 9-链节 聚簇# AAs表位排序起始位置SYFPEITHI 得分 聚簇 表位/AA 总蛋白 比率 1 15-32 13 29 43 30 21 15 18 20 22 24 21 18 16 18 19 0.278 0.169 1.645 2 37-56 31 16 44 14 22 37 40 44 45 48 18 20 16 21 19 0.250 0.169 1.481 3 96-133 36 46 6 47 2 37 38 17 96 01 08 09 12 20 25 31 17 16 25 16 27 17 17 20 0.211 0.169 1.247 4 153-216 12 39 7 23 24 48 49 32 50 4 9 51 15 25 18 33 19 3 1 40 10 52 53 58 59 61 62 64 67 70 71 74 76 77 81 88 94 95 98 200 201 202 203 208 22 17 25 19 19 16 16 18 16 26 24 16 21 19 20 18 20 27 28 17 23 16 0.344 0.169 2.036 5 237-254 26 27 34 237 245 246 19 19 18 0.167 0.169 0.987 6 271-299 8 35 41 11 28 20 42 271 276 277 278 283 285 291 25 18 17 23 19 20 17 0.241 0.169 1.430
表53
MAGE-3的聚簇预测(NIH算法)
总AAs：314
总9-链节：308
NIH 5：22 9-链节 聚簇# AAs 表位排序 起始位置 NIH 得分 聚簇 表位/AA 总蛋白 比率 1 101-120 15 21 8 2 101 105 108 112 11.002 6.488 49.134 339.313 0.200 0.071 2.800 2 153-167 18 6 22 153 158 159 7.776 51.77 5.599 0.200 0.071 2.800 3 174-209 17 7 13 19 14 5 12 174 176 181 188 195 200 201 8.832 49.993 15.701 7.536 12.809 88.783 16.725 0.194 0.071 2.722 4 237-251 16 4 20 237 238 243 10.868 148.896 6.88 0.200 0.071 2.800 5 271-284 1 11 271 276 2655.495 19.658 0.143 0.071 2.000
表54
MAGE-3的聚簇预测(SYFPEITHI算法)
总AAs：314
总9-链节：308
SYFPEITHI 16：47 9-链节 聚簇# AAs 表位排序起始位置SYFPEITHI 得分 聚簇表位/AA总蛋白 比率 1 15-32 12 26 37 27 18 15 18 20 22 24 21 18 16 18 19 0.278 0.153 1.820 2 38-56 38 15 39 13 19 38 40 44 45 48 16 20 16 21 19 0.263 0.153 1.725 3 101-142 28 40 1 6 31 32 16 41 101 105 108 112 120 125 131 134 18 16 31 25 17 17 20 16 0.190 0.153 1.248 4 153-216 20 29 33 21 34 42 43 10 8 14 22 44 11 23 45 17 3 2 35 46 153 156 158 159 161 164 167 174 176 181 188 193 194 195 197 198 200 201 202 208 19 18 17 19 17 16 16 22 23 21 19 16 22 19 16 20 27 28 17 16 0.313 0.153 2.048 5 220-230 5 47 220 222 26 16 0.182 0.153 1.191 6 237-246 7 9 237 238 25 23 0.200 0.153 1.311 7 271-293 4 30 24 36 25 271 276 278 283 285 27 18 19 17 19 0.217 0.153 1.425
表55
PRAME的聚簇预测(NIH算法)
总AAs：509
总9-链节：501
NIH 5：40 9-链节 聚簇# AAs 表位排序 起始位置 NIH 得分 聚簇 表位/AA 总蛋白 比率 1 33-47 20 17 33 39 18 21 0.133 0.080 1.670 2 71-81 9 32 71 73 50 7 0.2 0.07984 2.505 3 99-108 23 24 100 99 15 13 0.2 0.07984 2.505 4 126-135 38 35 126 127 5 6 0.2 0.07984 2.505 5 224-246 5 8 39 224 230 238 124 63 5 0.130 0.080 1.634 6 290-303 18 14 7 290 292 295 18 23 66 0.214 0.080 2.684 7 305-324 28 30 25 36 305 308 312 316 10 8 13 6 0.200 0.080 2.505 8 394-409 2 12 31 394 397 401 182 42 7 0.188 0.080 2.348 9 422-443 10 3 34 29 4 422 425 431 432 435 49 182 7 9 160 0.227 0.080 2.847 10 459-487 15 11 22 40 37 459 462 466 472 479 21 45 15 5 6 0.172 0.080 2.159
表56
PRAME的聚簇预测(SYFPEITHI算法)
总AAs：509
总9-链节：501
SYFPEITHI 17：80 9-链节 聚簇# AAs表位排序起始位置SYFPEITHI 得分 聚簇 表位/AA 总蛋白 比率 1 18-59 65 50 66 35 22 51 5 23 13 46 18 21 26 33 34 37 39 40 44 51 17 18 17 20 22 18 27 22 24 19 0.238 0.160 1.491 2 78-115 36 67 52 24 53 25 9 8 54 55 78 80 84 86 91 93 99 100 103 107 20 17 18 22 18 22 25 26 18 18 0.263 0.160 1.648 3 191-202 56 38 191 194 18 20 0.167 0.160 1.044 4 205-215 26 27 205 207 22 22 0.182 0.160 1.139 5 222-238 47 14 69 57 222 224 227 230 19 24 17 18 0.235 0.160 1.474 6 241-273 70 15 71 30 39 58 40 241 248 255 258 259 261 265 17 24 17 21 20 18 20 0.212 0.160 1.328 7 290-342 72 48 31 73 18 6 10 19 28 290 293 298 301 305 308 312 316 319 17 19 21 17 23 27 25 23 22 0.208 0.160 1.300
PRAME的聚簇预测(SYFPEITHI算法)
总AAs：509
总9-链节：501
SYFPEITHI 17：80 9-链节 聚簇# AAs 表位排序 起始位置SYFPEITHI 得分 聚簇 表位/AA 总蛋白 比率 41 74 326 334 20 17 8 343-363 59 60 75 20 76 343 348 351 353 355 18 18 17 23 17 0.238 0.160 1.491 9 364-447 49 32 11 61 77 21 78 1 42 62 33 43 34 7 2 79 63 64 12 16 80 364 371 372 375 382 390 391 394 397 403 410 418 419 422 425 426 428 431 432 435 439 19 21 25 18 17 23 17 30 20 18 21 20 21 27 29 17 18 18 25 24 17 0.250 0.160 1.566 10 455-474 29 17 4 3 455 459 462 466 22 24 28 29 0.200 0.160 1.253
表57
CEA的聚簇预测(NIH算法)
总AAs：702
总9-链节：694
NIH 5：30 9-链节 聚簇# AA 肽排序 起始位置 得分 聚簇 肽/AAs 总蛋白 比率 1 17-32 5 7 20 17 18 24 79.041 46.873 12.668 0.188 0.043 4.388 2 113-129 2 15 113 121 167.991 21.362 0.118 0.043 2.753 3 172-187 25 14 172 179 9.165 27.995 0.125 0.043 2.925 4 278-291 30 17 278 283 5.818 19.301 0.143 0.043 3.343 5 350-365 9 12 350 357 43.075 27.995 0.125 0.043 2.925 6 528-543 8 13 528 535 43.075 27.995 0.125 0.043 2.925 7 631-645 23 19 24 631 634 637 9.563 13.381 9.2.45 0.200 0.043 4.680 8 691-702 1 27 691 694 196.407 7.769 0.167 0.043 3.900表58
CEA的聚簇预测(SYFPEITHI算法)
总AAs：702
总9-链节：694
SYFPEITHI 16：81 9-链节 聚簇# AA 肽排序 起始位置 得分 聚簇 肽/AAs 总蛋白 比率 1 5-36 67 23 24 9 25 32 68 33 5 12 16 17 18 19 23 28 16 19 19 22 19 18 16 18 0.250 0.117 2.140 2 37-62 41 20 26 42 27 43 44 37 44 45 46 50 53 54 17 20 19 17 19 17 17 0.269 0.117 2.305 3 99-115 14 5 45 34 99 100 104 107 21 23 17 18 0.235 0.117 2.014 4 116-129 69 21 116 121 16 20 0.143 0.117 1.223 5 172-187 46 70 172 179 17 16 0.125 0.117 1.070 6 192-202 3 47 192 194 24 17 0.182 0.117 1.557 7 226-241 48 49 15 226 229 233 17 17 21 0.188 0.117 1.605 8 307-318 11 71 51 307 308 310 22 16 17 0.250 0.117 2.140 9 319-349 52 53 72 35 319 327 335 341 17 17 16 18 0.129 0.117 1.105 10 370-388 12 54 74 6 370 372 375 380 22 17 16 23 0.211 0.117 1.802 11 403-419 56 57 403 404 17 17 0.235 0.117 2.014 58 407 17 28 411 19 12 427-442 59 427 17 0.188 0.117 1.605 75 432 16 76 434 16 13 450-462 77 450 16 0.154 0.117 1.317 13 454 22 14 488-505 36 488 18 0.167 0.117 1.427 18 492 21 60 497 17 15 548-558 4 548 24 0.182 0.117 1.557 61 550 17 16 565-577 62 565 17 0.154 0.117 1.317 19 569 21 17 579-597 78 579 16 0.143 0.117 1.223 79 582 16 7 589 23 18 605-618 2 605 25 0.143 0.117 1.223 38 610 18 19 631-669 29 631 19 0.154 0.117 1.317 63 637 17 80 644 16 64 652 17 39 660 18 81 661 16 20 675-702 22 675 20 0.286 0.1 17 2.446 30 683 19 31 687 19 40 688 18 65 690 17 1 691 31 66 692 17 8 694 23
表59
SCP-1的聚簇预测(NIH算法)
总AAs：976
总9-链节：968
NIH 5：37 9-链节 聚簇# AA 肽排序 起始位置 得分 聚簇 肽/AAs 总蛋白 比率 1 101-116 15 13 101 108 40.589 57.255 0.125 0.038 3.270 2* 281-305 14 24 17 281 288 297 44.944 15.203 32.857 0.12 0.038 3.139 3 431-447 8 26 4 431 438 439 80.217 11.861 148.896 0.073 0.038 1.914 4 557-579 11 19 6 18 557 560 564 571 64.335 24.937 87.586 32.765 0.174 0.038 4.550 5 635-650 10 34 635 642 69.552 6.542 0.125 0.038 3.270 6 755-767 36 35 755 759 5.599 5.928 0.154 0.038 4.025 7 838-854 2 28 838 846 284.517 11.426 0.118 0.038 3.078
表60
SCP-1的聚簇预测
总AAs：976
总9-链节：968
Rammensee 16：118 9-链节 聚簇# AA 肽排序 起始位置 得分 聚簇 肽/AAs 总蛋白 比率 1 8-28 99 77 100 8 15 20 16 17 16 0.143 0.121 1.182 2 63-80 78 50 102 60 63 66 69 72 17 19 16 18 0.222 0.121 1.838 3 94-123 79 12 17 103 94 101 108 115 17 23 22 16 0.133 0.121 1.103 4 126-158 35 36 51 126 133 139 20 20 19 0.182 0.121 1.504 80 140 17 61 143 18 37 150 20 5 161-189 38 161 20 0.207 0.121 1.711 52 165 19 81 171 17 82 177 17 62 178 18 39 181 20 6 213-230 40 213 20 0.167 0.121 1.379 13 220 23 28 222 21 7 235-250 63 235 18 0.125 0.121 1.034 18 242 22 8 260-296 83 260 17 0.243 0.121 2.012 105 262 16 84 267 17 106 269 16 41 270 20 64 271 18 85 274 17 19 281 22 3 288 25 9 312-338 108 312 16 0.148 0.121 1.225 29 319 21 30 323 21 65 330 18 10 339-355 66 339 18 0.235 0.121 1.946 31 340 21 42 344 20 53 347 19 11 376-447 54 376 19 0.194 0.121 1.608 43 382 20 44 386 20 20 390 22 55 397 19 6 404 24 86 407 17 45 411 20 67 417 18 21 425 22 46 431 20 68 432 18 32 438 21 7 439 24 12 455-488 33 455 21 0.235 0.121 1.946 47 459 20 56 462 19 87 463 17 88 466 17 14 470 23 109 473 16 34 480 21 13 515-530 57 515 19 0.125 0.121 1.034 22 522 22 14 557-590 8 557 24 0.147 0.121 1.216 23 564 22 9 571 24 90 575 17 58 582 19 15 610-625 69 610 18 0.125 0.121 1.034 91 617 17 16 633-668 92 633 17 0.222 10 635 24 70 638 18 93 640 17 48 642 20 49 645 20 111 652 16 112 660 16 17 674-685 71 674 18 0.167 0.121 1.379 11 677 24 18 687-702 1 687 26 0.125 0.121 1.034 94 694 17 19 744-767 113 744 16 0.250 0.121 2.068 95 745 17 4 745 25 24 752 22 2 755 26 72 759 18 20 812-827 97 812 17 0.125 0.121 1.034 115 819 16 21 838-857 116 838 16 0.150 0.121 1.241 25 846 22 74 849 18 22 896-913 117 896 16 0.222 0.121 1.838 98 899 17 26 902 22 76 905 18
本发明的实施方案适用于并且考虑在这里提供的靶抗原序列中的变异，其包括在可以通过万维网访问的各种数据库中公开的那些。具体地对于在这里公开的具体序列，通过使用提供的登记号访问关于每种抗原的信息可以发现序列中的变异。
酪氨酸酶蛋白；SEQ ID NO 2
1 MLLAVLYCLL WSFQTSAGHF PRACVSSKNL MEKECCPPWS GDRSPCGQLS
GRGSCQNILL
61 SNAPLGPQFP FTGVDDRESW PSVFYNRTCQ CSGNFMGFNC GNCKFGFWGP
NCTERRLLVR
121 RNIFDLSAPE KDKFFAYLTL AKHTISSDYV IPIGTYGQMK NGSTPMFNDI
NIYDLFVWMH
181 YYVSMDALLG GSEIWRDIDF AHEAPAFLPW HRLFLLRWEQ EIQKLTGDEN
FTIPYWDWRD
241 AEKCDICTDE YMGGQHPTNP NLLSPASFFS SWQIVCSRLE EYNSHQSLCN
GTPEGPLRRN
301 PGNHDKSRTP RLPSSADVEF CLSLTQYESG SMDKAANFSF RNTLEGFASP
LTGIADASQS
361 SMHNALHIYM NGTMSQVQGS ANDPIFLLHH AFVDSIFEQW LRRHRPLQEV
YPEANAPIGH
421 NRESYMVPFI PLYRNGDFFI SSKDLGYDYS YLQDSDPDSF QDYIKSYLEQ
ASRIWSWLLG
481 AAMVGAVLTA LLAGLVSLLC RHKRKQLPEE KQPLLMEKED YHSLYQSHL
SSX-2蛋白；SEQ ID NO 3
1 MNGDDAFARR PTVGAQIPEK IQKAFDDIAK YFSKEEWEKM KASEKIFYVY
MKRKYEAMTK
61 LGFKATLPPF MCNKRAEDFQ GNDLDNDPNR GNQVERPQMT FGRLQGISPK
IMPKKPAEEG
121 NDSEEVPEAS GPQNDGKELC PPGKPTTSEK IHERSGPKRG EHAWTHRLRE
RKQLVIYEEI
181 SDPEEDDE
PSMA蛋白；SEQ ID NO 4
1 MWNLLHETDS AVATARRPRW LCAGALVLAG GFFLLGFLFG WFIKSSNEAT
NITPKHNMKA
61 FLDELKAENI KKFLYNFTQI PHLAGTEQNF QLAKQIQSQW KEFGLDSVEL
AHYDVLLSYP
121 NKTHPNYISI INEDGNEIFN TSLFEPPPPG YENVSDIVPP FSAFSPQGMP
EGDLVYVNYA
181 RTEDFFKLER DMKINCSGKI VIARYGKVFR GNKVKNAQLA GAKGVILYSD
PADYFAPGVK
241 SYPDGWNLPG GGVQRGNILN LNGAGDPLTP GYPANEYAYR RGIAEAVGLP
SIPVHPIGYY
301 DAQKLLEKMG GSAPPDSSWR GSLKVPYNVG PGFTGNFSTQ KVKMHIHSTN
EVTRIYNVIG
361 TLRGAVEPDR YVILGGHRDS WVFGGIDPQS GAAVVHEIVR SFGTLKKEGW
RPRRTILFAS
421 WDAEEFGLLG STEWAEENSR LLQERGVAYI NADSSIEGNY TLRVDCTPLM
YSLVHNLTKE
481 LKSPDEGFEG KSLYESWTKK SPSPEFSGMP RISKLGSGND FEVFFQRLGI
ASGRARYTKN
541 WETNKFSGYP LYHSVYETYE LVEKFYDPMF KYHLTVAQVR GGMVFELANS
IVLPFDCRDY
601 AVVLRKYADK IYSISMKHPQ EMKTYSVSFD SLFSAVKNFT EIASKFSERL
QDFDKSNPIV
661 LRMMNDQLMF LERAFIDPLG LPDRPFYRHV IYAPSSHNKY AGESFPGIYD
ALFDIESKVD
721 PSKAWGEVKR QIYVAAFTVQ AAAETLSEVA
人酪氨酸酶(眼皮白化病IA)(TYR)，mRNA.；
ACCESSION NM_000372
VERSION NM_000372.1 GI：4507752
SEQ ID NO 2
/翻译＝″MLLAVLYCLLWSFQTSAGHFPRACVSSKNLMEKECCPPWSGDRSPCGQLSGRGSCQNILLSNAPLGPQFPFTGVDDRESWPSVFYNRTCQCSGNFMGFNCGNCKFGFWGPNCTERRLLVRRNIFDLSAPEKDKFFAYLTLAKHTISSDYVIPIGTYGQMKNGSTPMFNDINIYDLFVWMHYYVSMDALLGGSEIWRDIDFAHEAPAFLPWHRLFLLRWEQEIQKLTGDENFTIPYWDWRDAEKCDICTDEYMGGQHPTNPNLLSPASFFSSWQIVCSRLEEYNSHQSLCNGTPEGPLRRNPGNHDKSRTPRLPSSADVEFCLSLTQYESGSMDKAANFSFRNTLEGFASPLTGIADASQSSMHNALHIYMNGTMSQVQGSANDPIFLLHHAFVDSIFEQWLRRHRPLQEVYPEANAPIGHNRESYMVPFIPLYRNGDFFISSKDLGYDYSYLQDSDPDSFQDYIKSYLEQASRIWSWLLGAAMVGAVLTALLAGLVSLLCRHKRKQLP
EEKQPLLMEKEDYHSLYQSHL″
SEQ ID NO 5
起始
1 atcactgtag tagtagctgg aaagagaaat ctgtgactcc aattagccag
ttcctgcaga
61 ccttgtgagg actagaggaa gaatgctcct ggctgttttg tactgcctgc
tgtggagttt
121 ccagacctcc gctggccatt tccctagagc ctgtgtctcc tctaagaacc
tgatggagaa
181 ggaatgctgt ccaccgtgga gcggggacag gagtccctgt ggccagcttt
caggcagagg
241 ttcctgtcag aatatccttc tgtccaatgc accacttggg cctcaatttc
ccttcacagg
301 ggtggatgac cgggagtcgt ggccttccgt cttttataat aggacctgcc
agtgctctgg
361 caacttcatg ggattcaact gtggaaactg caagtttggc ttttggggac
caaactgcac
421 agagagacga ctcttggtga gaagaaacat cttcgatttg agtgccccag
agaaggacaa
481 attttttgcc tacctcactt tagcaaagca taccatcagc tcagactatg
tcatccccat
541 agggacctat ggccaaatga aaaatggatc aacacccatg tttaacgaca
tcaatattta
601 tgacctcttt gtctggatgc attattatgt gtcaatggat gcactgcttg
ggggatctga
661 aatctggaga gacattgatt ttgcccatga agcaccagct tttctgcctt
ggcatagact
721 cttcttgttg cggtgggaac aagaaatcca gaagctgaca ggagatgaaa
acttcactat
781 tccatattgg gactggcggg atgcagaaaa gtgtgacatt tgcacagatg
agtacatggg
841 aggtcagcac cccacaaatc ctaacttact cagcccagca tcattcttct
cctcttggca
901 gattgtctgt agccgattgg aggagtacaa cagccatcag tctttatgca
atggaacgcc
961 cgagggacct ttacggcgta atcctggaaa ccatgacaaa tccagaaccc
caaggctccc
1021 ctcttcagct gatgtagaat tttgcctgag tttgacccaa tatgaatctg
gttccatgga
1081 taaagctgcc aatttcagct ttagaaatac actggaagga tttgctagtc
cacttactgg
1141 gatagcggat gcctctcaaa gcagcatgca caatgccttg cacatctata
tgaatggaac
1201 aatgtcccag gtacagggat ctgccaacga tcctatcttc cttcttcacc
atgcatttgt
1261 tgacagtatt tttgagcagt ggctccgaag gcaccgtcct cttcaagaag
tttatccaga
1321 agccaatgca cccattggac ataaccggga atcctacatg gttcctttta
taccactgta
1381 cagaaatggt gatttcttta tttcatccaa agatctgggc tatgactata
gctatctaca
1441 agattcagac ccagactctt ttcaagacta cattaagtcc tatttggaac
aagcgagtcg
1501 gatctggtca tggctccttg gggcggcgat ggtaggggcc gtcctcactg
ccctgctggc
1561 agggcttgtg agcttgctgt gtcgtcacaa gagaaagcag cttcctgaag
aaaagcagcc
1621 actcctcatg gagaaagagg attaccacag cttgtatcag agccatttat
aaaaggctta
1681 ggcaatagag tagggccaaa aagcctgacc tcactctaac tcaaagtaat
gtccaggttc
1741 ccagagaata tctgctggta tttttctgta aagaccattt gcaaaattgt
aacctaatac
1801 aaagtgtagc cttcttccaa ctcaggtaga acacacctgt ctttgtcttg
ctgttttcac
1861 tcagcccttt taacattttc ccctaagccc atatgtctaa ggaaaggatg
ctatttggta
1921 atgaggaact gttatttgta tgtgaattaa agtgctctta tttt
人滑膜肉瘤，X断裂点2(SSX2)，mRNA。
ACCESSION NM 003147
VERSION NM_003147.1 GI：10337582
SEQ ID NO 3
/翻译＝″MNGDDAFARRPTVGAQIPEKIQKAFDDIAKYFSKEEWEKMKASEKIFYVYMKRKYEAMTKLGFKATLPPFMCNKRAEDFQGNDLDNDPNRGNQVERPQMTFGRLQGISPKIMPKKPAEEGNDSEEVPEASGPQNDGKELCPPGKPTTSEKIHERSGPKRG
EHAWTHRLRERKQLVIYEEISDPEEDDE″
SEQ ID NO 6
起始
1 ctctctttcg attcttccat actcagagta cgcacggtct gattttctct
ttggattctt
61 ccaaaatcag agtcagactg ctcccggtgc catgaacgga gacgacgcct
ttgcaaggag
121 acccacggtt ggtgctcaaa taccagagaa gatccaaaag gccttcgatg
atattgccaa
181 atacttctct aaggaagagt gggaaaagat gaaagcctcg gagaaaatct
tctatgtgta
241 tatgaagaga aagtatgagg ctatgactaa actaggtttc aaggccaccc
tcccaccttt
301 catgtgtaat aaacgggccg aagacttcca ggggaatgat ttggataatg
accctaaccg
361 tgggaatcag gttgaacgtc ctcagatgac tttcggcagg ctccagggaa
tctccccgaa
421 gatcatgccc aagaagccag cagaggaagg aaatgattcg gaggaagtgc
cagaagcatc
481 tggcccacaa aatgatggga aagagctgtg ccccccggga aaaccaacta
cctctgagaa
541 gattcacgag agatctggac ccaaaagggg ggaacatgcc tggacccaca
gactgcgtga
601 gagaaaacag ctggtgattt atgaagagat cagcgaccct gaggaagatg
acgagtaact
661 cccctcaggg atacgacaca tgcccatgat gagaagcaga acgtggtgac
ctttcacgaa
721 catgggcatg gctgcggacc cctcgtcatc aggtgcatag caagtg
人叶酸水解酶(前列腺特异性膜抗原)1(FOLH1)，mRNA。
ACCESSION NM_004476
VERSION NM_004476.1 GI：4758397
/翻译＝″MWNLLHETDSAVATARRPRWLCAGALVLAGGFFLLGFLFGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLAGTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLFEPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIARYGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGAGDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLKVPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFGGIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLKKEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYESWTKKSPSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETYELVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQEMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSNPIVLRMMNDQLMFLERAFIDPLGLPDRPFYRHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDALFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQ
AAAETLSEVA″
SEQ ID NO 7
起始
1 ctcaaaaggg gccggatttc cttctcctgg aggcagatgt tgcctctctc
tctcgctcgg
61 attggttcag tgcactctag aaacactgct gtggtggaga aactggaccc
caggtctgga
121 gcgaattcca gcctgcaggg ctgataagcg aggcattagt gagattgaga
gagactttac
181 cccgccgtgg tggttggagg gcgcgcagta gagcagcagc acaggcgcgg
gtcccgggag
241 gccggctctg ctcgcgccga gatgtggaat ctccttcacg aaaccgactc
ggctgtggcc
301 accgcgcgcc gcccgcgctg gctgtgcgct ggggcgctgg tgctggcggg
tggcttcttt
361 ctcctcggct tcctcttcgg gtggtttata aaatcctcca atgaagctac
taacattact
421 ccaaagcata atatgaaagc atttttggat gaattgaaag ctgagaacat
caagaagttc
481 ttatataatt ttacacagat accacattta gcaggaacag aacaaaactt
tcagcttgca
541 aagcaaattc aatcccagtg gaaagaattt ggcctggatt ctgttgagct
agcacattat
601 gatgtcctgt tgtcctaccc aaataagact catcccaact acatctcaat
aattaatgaa
661 gatggaaatg agattttcaa cacatcatta tttgaaccac ctcctccagg
atatgaaaat
721 gtttcggata ttgtaccacc tttcagtgct ttctctcctc aaggaatgcc
agagggcgat
781 ctagtgtatg ttaactatgc acgaactgaa gacttcttta aattggaacg
ggacatgaaa
841 atcaattgct ctgggaaaat tgtaattgcc agatatggga aagttttcag
aggaaataag
901 gttaaaaatg cccagctggc aggggccaaa ggagtcattc tctactccga
ccctgctgac
961 tactttgctc ctggggtgaa gtcctatcca gatggttgga atcttcctgg
aggtggtgtc
1021 cagcgtggaa atatcctaaa tctgaatggt gcaggagacc ctctcacacc
aggttaccca
1081 gcaaatgaat atgcttatag gcgtggaatt gcagaggctg ttggtcttcc
aagtattcct
1141 gttcatccaa ttggatacta tgatgcacag aagctcctag aaaaaatggg
tggctcagca
1201 ccaccagata gcagctggag aggaagtctc aaagtgccct acaatgttgg
acctggcttt
1261 actggaaact tttctacaca aaaagtcaag atgcacatcc actctaccaa
tgaagtgaca
1321 agaatttaca atgtgatagg tactctcaga ggagcagtgg aaccagacag
atatgtcatt
1381 ctgggaggtc accgggactc atgggtgttt ggtggtattg accctcagag
tggagcagct
1441 gttgttcatg aaattgtgag gagctttgga acactgaaaa aggaagggtg
gagacctaga
1501 agaacaattt tgtttgcaag ctgggatgca gaagaatttg gtcttcttgg
ttctactgag
1561 tgggcagagg agaattcaag actccttcaa gagcgtggcg tggcttatat
taatgctgac
1621 tcatctatag aaggaaacta cactctgaga gttgattgta caccgctgat
gtacagcttg
1681 gtacacaacc taacaaaaga gctgaaaagc cctgatgaag gctttgaagg
caaatctctt
1741 tatgaaagtt ggactaaaaa aagtccttcc ccagagttca gtggcatgcc
caggataagc
1801 aaattgggat ctggaaatga ttttgaggtg ttcttccaac gacttggaat
tgcttcaggc
1861 agagcacggt atactaaaaa ttgggaaaca aacaaattca gcggctatcc
actgtatcac
1921 agtgtctatg aaacatatga gttggtggaa aagttttatg atccaatgtt
taaatatcac
1981 ctcactgtgg cccaggttcg aggagggatg gtgtttgagc tagccaattc
catagtgctc
2041 ccttttgatt gtcgagatta tgctgtagtt ttaagaaagt atgctgacaa
aatctacagt
2101 atttctatga aacatccaca ggaaatgaag acatacagtg tatcatttga
ttcacttttt
2161 tctgcagtaa agaattttac agaaattgct tccaagttca gtgagagact
ccaggacttt
2221 gacaaaagca acccaatagt attaagaatg atgaatgatc aactcatgtt
tctggaaaga
2281 gcatttattg atccattagg gttaccagac aggccttttt ataggcatgt
catctatgct
2341 ccaagcagcc acaacaagta tgcaggggag tcattcccag gaatttatga
tgctctgttt
2401 gatattgaaa gcaaagtgga cccttccaag gcctggggag aagtgaagag
acagatttat
2461 gttgcagcct tcacagtgca ggcagctgca gagactttga gtgaagtagc
ctaagaggat
2521 tctttagaga atccgtattg aatttgtgtg gtatgtcact cagaaagaat
cgtaatgggt
2581 atattgataa attttaaaat tggtatattt gaaataaagt tgaatattat
atataaaaaa
2641 aaaaaaaaaa aaa
人黑素细胞特异性(pmel 17)基因，外显子2-5，和全cds。
ACCESSION U2 0093
VERSION U2 0093.1 GI：1142634
SEQ ID NO 70
/翻译＝″MDLVLKRCLLHLAVIGALLAVGATKVPRNQDWLGVSRQLRTKAWNRQLYPEWTEAQRLDCWRGGQVSLKVSNDGPTLIGANASFSIALNFPGSQKVLPDGQVIWVNNTIINGSQVWGGQPVYPQETDDACIFPDGGPCPSGSWSQKRSFVYVWKTWGQYWQVLGGPVSGLSIGTGRAMLGTHTMEVTVYHRRGSRSYVPLAHSSSAFTITDQVPFSVSVSQLRALDGGNKHFLRNQPLTFALQLHDPSGYLAEADLSYTWDFGDSSGTLISRAPVVTHTYLEPGPVTAQVVLQAAIPLTSCGSSPVPGTTDGHRPTAEAPNTTAGQVPTTEVVGTTPGQAPTAEPSGTTSVQVPTTEVISTAPVQMPTAESTGMTPEKVPVSEVMGTTLAEMSTPEATGMTPAEVSIVVLSGTTAAQVTTTEWVETTARELPIPEPEGPDASSIMSTESITGSLGPLLDGTATLRLVKRQVPLDCVLYRYGSFSVTLDIVQGIESAEILQAVPSGEGDAFELTVSCQGGLPKEACMEISSPGCQPPAQRLCQPVLPSPACQLVLHQILKGGSGTYCLNVSLADTNSLAVVSTQLIMPGQEAGLGQVPLIVGILLVLMAVVLASLIYRRRLMKQDFSVPQLPHSSSHWLRLPRIFCSCPIGENSPLLSGQQV″
SEQ ID NO 80
起始
1 gtgctaaaaa gatgccttct tcatttggct gtgataggtg ctttgtggct
gtgggggcta
61 caaaagtacc cagaaaccag gactggcttg gtgtctcaag gcaactcaga
accaaagcct
121 ggaacaggca gctgtatcca gagtggacag aagcccagag acttgactgc
tggagaggtg
181 gtcaagtgtc cctcaaggtc agtaatgatg ggcctacact gattggtgca
aatgcctcct
241 tctctattgc cttgaacttc cctggaagcc aaaaggtatt gccagatggg
caggttatct
301 gggtcaacaa taccatcatc aatgggagcc aggtgtgggg aggacagcca
gtgtatcccc
361 aggaaactga cgatgcctgc atcttccctg atggtggacc ttgcccatct
ggctcttggt
421 ctcagaagag aagctttgtt tatgtctgga agacctgggg tgagggactc
ccttctcagc
481 ctatcatcca cacttgtgtt tacttctttc tacctgatca cctttctttt
ggccgcccct
541 tccaccttaa cttctgtgat tttctctaat cttcattttc ctcttagatc
ttttctcttt
601 cttagcacct agcccccttc aagctctatc ataattcttt ctggcaactc
ttggcctcaa
661 ttgtagtcct accccatgga atgcctcatt aggacccctt ccctgtcccc
ccatatcaca
721 gccttccaaa caccctcaga agtaatcata cttcctgacc tcccatctcc
agtgccgttt
781 cgaagcctgt ccctcagtcc cctttgacca gtaatctctt cttccttgct
tttcattcca
841 aaaatgcttc aggccaatac tggcaagttc tagggggccc agtgtctggg
ctgagcattg
901 ggacaggcag ggcaatgctg ggcacacaca ccatggaagt gactgtctac
catcgccggg
961 gatcccggag ctatgtgcct cttgctcatt ccagctcagc cttcaccatt
actggtaagg
1021 gttcaggaag ggcaaggcca gttgtagggc aaagagaagg cagggaggct
tggatggact
1081 gcaaaggaga aaggtgaaat gctgtgcaaa cttaaagtag aagggccagg
aagacctagg
1141 cagagaaatg tgaggcttag tgccagtgaa gggccagcca gtcagcttgg
agttggaggg
1201 tgtggctgtg aaaggagaag ctgtggctca ggcctggttc tcaccttttc
tggctccaat
1261 cccagaccag gtgcctttct ccgtgagcgt gtcccagttg cgggccttgg
atggagggaa
1321 caagcacttc ctgagaaatc agcctctgac ctttgccctc cagctccatg
accccagtgg
1381 ctatctggct gaagctgacc tctcctacac ctgggacttt ggagacagta
gtggaaccct
1441 gatctctcgg gcacctgtgg tcactcatac ttacctggag cctggcccag
tcactgccca
1501 ggtggtcctg caggctgcca ttcctctcac ctcctgtggc tcctccccag
ttccaggcac
1561 cacagatggg cacaggccaa ctgcagaggc ccctaacacc acagctggcc
aagtgcctac
1621 tacagaagtt gtgggtacta cacctggtca ggcgccaact gcagagccct
ctggaaccac
1681 atctgtgcag gtgccaacca ctgaagtcat aagcactgca cctgtgcaga
tgccaactgc
1741 agagagcaca ggtatgacac ctgagaaggt gccagtttca gaggtcatgg
gtaccacact
1801 ggcagagatg tcaactccag aggctacagg tatgacacct gcagaggtat
caattgtggt
1861 gctttctgga accacagctg cacaggtaac aactacagag tgggtggaga
ccacagctag
1921 agagctacct atccctgagc ctgaaggtcc agatgccagc tcaatcatgt
ctacggaaag
1981 tattacaggt tccctgggcc ccctgctgga tggtacagcc accttaaggc
tggtgaagag
2041 acaagtcccc ctggattgtg ttctgtatcg atatggttcc ttttccgtca
ccctggacat
2101 tgtccagggt attgaaagtg ccgagatcct gcaggctgtg ccgtccggtg
agggggatgc
2161 atttgagctg actgtgtcct gccaaggcgg gctgcccaag gaagcctgca
tggagatctc
2221 atcgccaggg tgccagcccc ctgcccagcg gctgtgccag cctgtgctac
ccagcccagc
2281 ctgccagctg gttctgcacc agatactgaa gggtggctcg gggacatact
gcctcaatgt
2341 gtctctggct gataccaaca gcctggcagt ggtcagcacc cagcttatca
tgcctggtag
2401 gtccttggac agagactaag tgaggaggga agtggataga ggggacagct
ggcaagcagc
2461 agacatgagt gaagcagtgc ctgggattct tctcacaggt caagaagcag
gccttgggca
2521 ggttccgctg atcgtgggca tcttgctggt gttgatggct gtggtccttg
catctctgat
2581 atataggcgc agacttatga agcaagactt ctccgtaccc cagttgccac
atagcagcag
2641 tcactggctg cgtctacccc gcatcttctg ctcttgtccc attggtgaga
atagccccct
2701 cctcagtggg cagcaggtct gagtactctc atatgatgct gtgattttcc
tggagttgac
2761 agaaacacct atatttcccc cagtcttccc tgggagacta ctattaactg
aaataaa
//
人激肽释放酶3，(前列腺特异性抗原)(KLK3)，mRNA。
ACCESSION NM_001648
VERSION NM_001648.1 GI：4502172
SEQ ID NO 78
/翻译＝″MWVPVVFLTLSVTWIGAAPLILSRIVGGWECEKHSQPWQVLVASRGRAVCGGVLVHPQWVLTAAHCIRNKSVILLGRHSLFHPEDTGQVFQVSHSFPHPLYDMSLLKNRFLRPGDDSSHDLMLLRLSEPAELTDAVKVMDLPTQEPALGTTCYASGWGSIEPEEFLTPKKLQCVDLHVISNDVCAQVHPQKVTKFMLCAGRWTGGKSTCSGDSGGPLVCNGVLQGITSWGSEPCALPERPSLYTKVVHYRKWIKDTIVANP″
SEQ ID NO 86
起始
1 agccccaagc ttaccacctg cacccggaga gctgtgtgtc accatgtggg
tcccggttgt
61 cttcctcacc ctgtccgtga cgtggattgg tgctgcaccc ctcatcctgt
ctcggattgt
121 gggaggctgg gagtgcgaga agcattccca accctggcag gtgcttgtgg
cctctcgtgg
181 cagggcagtc tgcggcggtg ttctggtgca cccccagtgg gtcctcacag
ctgcccactg
241 catcaggaac aaaagcgtga tcttgctggg tcggcacagc ctgtttcatc
ctgaagacac
301 aggccaggta tttcaggtca gccacagctt cccacacccg ctctacgata
tgagcctcct
361 gaagaatcga ttcctcaggc caggtgatga ctccagccac gacctcatgc
tgctccgcct
421 gtcagagcct gccgagctca cggatgctgt gaaggtcatg gacctgccca
cccaggagcc
481 agcactgggg accacctgct acgcctcagg ctggggcagc attgaaccag
aggagttctt
541 gaccccaaag aaacttcagt gtgtggacct ccatgttatt tccaatgacg
tgtgtgcgca
601 agttcaccct cagaaggtga ccaagttcat gctgtgtgct ggacgctgga
cagggggcaa
661 aagcacctgc tcgggtgatt ctgggggccc acttgtctgt aatggtgtgc
ttcaaggtat
721 cacgtcatgg ggcagtgaac catgtgccct gcccgaaagg ccttccctgt
acaccaaggt
781 ggtgcattac cggaagtgga tcaaggacac catcgtggcc aacccctgag
cacccctatc
841 aaccccctat tgtagtaaac ttggaacctt ggaaatgacc aggccaagac
tcaagcctcc
901 ccagttctac tgacctttgt ccttaggtgt gaggtccagg gttgctagga
aaagaaatca
961 gcagacacag gtgtagacca gagtgtttct taaatggtgt aattttgtcc
tctctgtgtc
1021 ctggggaata ctggccatgc ctggagacat atcactcaat ttctctgagg
acacagatag
1081 gatggggtgt ctgtgttatt tgtggggtac agagatgaaa gaggggtggg
atccacactg
1141 agagagtgga gagtgacatg tgctggacac tgtccatgaa gcactgagca
gaagctggag
1201 gcacaacgca ccagacactc acagcaagga tggagctgaa aacataaccc
actctgtcct
1261 ggaggcactg ggaagcctag agaaggctgt gagccaagga gggagggtct
tcctttggca
1321 tgggatgggg atgaagtaag gagagggact ggaccccctg gaagctgatt
cactatgggg
1381 ggaggtgtat tgaagtcctc cagacaaccc tcagatttga tgatttccta
gtagaactca
1441 cagaaataaa gagctgttat actgtg
//
人自身免疫原性癌/睾丸抗原NY-ESO-1 mRNA，全cds
ACCESSION U87459
VERSION U87459.1 GI：1890098
SEQ ID NO 74
/翻译＝″MQAEGRGTGGSTGDADGPGGPGIPDGPGGNAGGPGEAGATGGRGPRGAGAARASGPGGGAPRGPHGGAASGLNGCCRCGARGPESRLLEFYLAMPFATPMEAELARRSLAQDAPPLPVPGVLLKEFTVSGNILTIRLTAADHRQLQLSISSCLQQLSLLMWITQCFLPVFLAQPPSGQRR″
SEQ ID NO 84
起始
1 atcctcgtgg gccctgacct tctctctgag agccgggcag aggctccgga
gccatgcagg
61 ccgaaggccg gggcacaggg ggttcgacgg gcgatgctga tggcccagga
ggccctggca
121 ttcctgatgg cccagggggc aatgctggcg gcccaggaga ggcgggtgcc
acgggcggca
181 gaggtccccg gggcgcaggg gcagcaaggg cctcggggcc gggaggaggc
gccccgcggg
241 gtccgcatgg cggcgcggct tcagggctga atggatgctg cagatgcggg
gccagggggc
301 cggagagccg cctgcttgag ttctacctcg ccatgccttt cgcgacaccc
atggaagcag
361 agctggcccg caggagcctg gcccaggatg ccccaccgct tcccgtgcca
ggggtgcttc
421 tgaaggagtt cactgtgtcc ggcaacatac tgactatccg actgactgct
gcagaccacc
481 gccaactgca gctctccatc agctcctgtc tccagcagct ttccctgttg
atgtggat ca
541 cgcagtgctt tctgcccgtg tttttggctc agcctccctc agggcagagg
cgctaagccc
601 agcctggcgc cccttcctag gtcatgcctc ctcccctagg gaatggtccc
agcacgagtg
661 gccagttcat tgtgggggcc tgattgtttg tcgctggagg aggacggctt
acatgtttgt
721 ttctgtagaa aataaaactg agctacgaaa aa
//
LAGE-1a蛋白(人)
ACCESSION CAA11116
PID g3255959
VERSION CAA11116.1 GI：3255959
SEQ ID NO 75
起始
1 mqaegrgtgg stgdadgpgg pgipdgpggn aggpgeagat ggrgprgaga
arasgprgga
61 prgphggaas aqdgrcpcga rrpdsrllel hitmpfsspm eaelvrrils
rdaaplprpg
121 avlkdftvsg nllfirltaa dhrqlqlsis sclqqlsllm witqcflpvf
laqapsgqrr
181
//
LAGE-1b蛋白(人)
ACCESSION CAA11117
PID g3255960
VERSION CAA11117.1 GI：3255960
SEQ ID NO 76
起始
1 mqaegrgtgg stgdadgpgg pgipdgpggn aggpgeagat ggrgprgaga
arasgprgga
61 prgphggaas aqdgrcpcga rrpdsrllel hitmpfsspm eaelvrrils
rdaaplprpg
121 avlkdftvsg nllfmsvwdq dregagrmrv vgwglgsasp egqkardlrt
pkhkvseqrp
181 gtpgppppeg aqgdgcrgva fnvmfsaphi
//
人抗原(MAGE-1)基因，全cds，
ACCESSION M77481
VERSION M77481.1 GI：416114
SEQ ID NO 71
/翻译＝″MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQAATSSSSPLVLGTLEEVPTAGSTDPPQSPQGASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGFLLLKYRAREPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLVTCLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAYGEPRKLLTQDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRFFFPSLREAALREEEEGV″
SEQ ID NO 81
起始
1 ggatccaggc cctgccagga aaaatataag ggccctgcgt gagaacagag
ggggtcatcc
61 actgcatgag agtggggatg tcacagagtc cagcccaccc tcctggtagc
actgagaagc
121 cagggctgtg cttgcggtct gcaccctgag ggcccgtgga ttcctcttcc
tggagctcca
181 ggaaccaggc agtgaggcct tggtctgaga cagtatcctc aggtcacaga
gcagaggatg
241 cacagggtgt gccagcagtg aatgtttgcc ctgaatgcac accaagggcc
ccacctgcca
301 caggacacat aggactccac agagtctggc ctcacctccc tactgtcagt
cctgtagaat
361 cgacctctgc tggccggctg taccctgagt accctctcac ttcctccttc
aggttttcag
421 gggacaggcc aacccagagg acaggattcc ctggaggcca cagaggagca
ccaaggagaa
481 gatctgtaag taggcctttg ttagagtctc caaggttcag ttctcagctg
aggcctctca
541 cacactccct ctctccccag gcctgtgggt cttcattgcc cagctcctgc
ccacactcct
601 gcctgctgcc ctgacgagag tcatcatgtc tcttgagcag aggagtctgc
actgcaagcc
661 tgaggaagcc cttgaggccc aacaagaggc cctgggcctg gtgtgtgtgc
aggctgccac
721 ctcctcctcc tctcctctgg tcctgggcac cctggaggag gtgcccactg
ctgggtcaac
781 agatcctccc cagagtcctc agggagcctc cgcctttccc actaccatca
acttcactcg
841 acagaggcaa cccagtgagg gttccagcag ccgtgaagag gaggggccaa
gcacctcttg
901 tatcctggag tccttgttcc gagcagtaat cactaagaag gtggctgatt
tggttggttt
961 tctgctcctc aaatatcgag ccagggagcc agtcacaaag gcagaaatgc
tggagagtgt
1021 catcaaaaat tacaagcact gttttcctga gatcttcggc aaagcctctg
agtccttgca
1081 gctggtcttt ggcattgacg tgaaggaagc agaccccacc ggccactcct
atgtccttgt
1141 cacctgccta ggtctctcct atgatggcct gctgggtgat aatcagatca
tgcccaagac
1201 aggcttcctg ataattgtcc tggtcatgat tgcaatggag ggcggccatg
ctcctgagga
1261 ggaaatctgg gaggagctga gtgtgatgga ggtgtatgat gggagggagc
acagtgccta
1321 tggggagccc aggaagctgc tcacccaaga tttggtgcag gaaaagtacc
tggagtaccg
1381 gcaggtgccg gacagtgatc ccgcacgcta tgagttcctg tggggtccaa
gggccctcgc
1441 tgaaaccagc tatgtgaaag tccttgagta tgtgatcaag gtcagtgcaa
gagttcgctt
1501 tttcttccca tccctgcgtg aagcagcttt gagagaggag gaagagggag
tctgagcatg
1561 agttgcagcc aaggccagtg ggagggggac tgggccagtg caccttccag
ggccgcgtcc
1621 agcagcttcc cctgcctcgt gtgacatgag gcccattctt cactctgaag
agagcggtca
1681 gtgttctcag tagtaggttt ctgttctatt gggtgacttg gagatttatc
tttgttctct
1741 tttggaattg ttcaaatgtt tttttttaag ggatggttga atgaacttca
gcatccaagt
1801 ttatgaatga cagcagtcac acagttctgt gtatatagtt taagggtaag
agtcttgtgt
1861 tttattcaga ttgggaaatc cattctattt tgtgaattgg gataataaca
gcagtggaat
1921 aagtacttag aaatgtgaaa aatgagcagt aaaatagatg agataaagaa
ctaaagaaat
1981 taagagatag tcaattcttg ccttatacct cagtctattc tgtaaaattt
ttaaagatat
2041 atgcatacct ggatttcctt ggcttctttg agaatgtaag agaaattaaa
tctgaataaa
2101 gaattcttcc tgttcactgg ctcttttctt ctccatgcac tgagcatctg
ctttttggaa
2161 ggccctgggt tagtagtgga gatgctaagg taagccagac tcatacccac
ccatagggtc
2221 gtagagtcta ggagctgcag tcacgtaatc gaggtggcaa gatgtcctct
aaagatgtag
2281 ggaaaagtga gagaggggtg agggtgtggg gctccgggtg agagtggtgg
agtgtcaatg
2341 ccctgagctg gggcattttg ggctttggga aactgcagtt ccttctgggg
gagctgattg
2401 taatgatctt gggtggatcc
//
人MAGE-2基因外显子1-4，全cds
ACCESSION L18920
VERSION L18920.1 GI：436180
SEQ ID NO 72
/翻译＝″MPLEQRSQHcKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQQTASSSSTLVEVTLGEVPAADSPSPPHSPQGASSFSTTINYTLWRQSDEGSSNQEEEGPRMFPDLESEFQAAISRKMVELVHFLLLKYRAREPVTKAEMLESVLRNCQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVPISHLYILVTCLGLSYDGLLGDNQVMPKTGLLIIVLAIIAIEGDCAPEEKIWEELSMLEVFEGREDSVFAHPRKLLMQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALIETSYVKVLHHTLKIGGEPHISYPPLHERALREGEE″SEQ ID NO 82
起始
1 attccttcat caaacagcca ggagtgagga agaggaccct cctgagtgag
gactgaggat
61 ccaccctcac cacatagtgg gaccacagaa tccagctcag cccctcttgt
cagccctggt
121 acacactggc aatgatctca ccccgagcac acccctcccc ccaatgccac
ttcgggccga
181 ctcagagtca gagacttggt ctgaggggag cagacacaat cggcagagga
tggcggtcca
241 ggctcagtct ggcatccaag tcaggacctt gagggatgac caaaggcccc
tcccaccccc
301 aactcccccg accccaccag gatctacagc ctcaggatcc ccgtcccaat
ccctacccct
361 acaccaacac catcttcatg cttaccccca cccccccatc cagatcccca
tccgggcaga
421 atccggttcc acccttgccg tgaacccagg gaagtcacgg gcccggatgt
gacgccactg
481 acttgcacat tggaggtcag aggacagcga gattctcgcc ctgagcaacg
gcctgacgtc
541 ggcggaggga agcaggcgca ggctccgtga ggaggcaagg taagacgccg
agggaggact
601 gaggcgggcc tcaccccaga cagagggccc ccaataatcc agcgctgcct
ctgctgccgg
661 gcctggacca ccctgcaggg gaagacttct caggctcagt cgccaccacc
tcaccccgcc
721 accccccgcc gctttaaccg cagggaactc tggcgtaaga gctttgtgtg
accagggcag
781 ggctggttag aagtgctcag ggcccagact cagccaggaa tcaaggtcag
gaccccaaga
841 ggggactgag ggcaacccac cccctaccct cactaccaat cccatccccc
aacaccaacc
901 ccacccccat ccctcaaaca ccaaccccac ccccaaaccc cattcccatc
tcctccccca
961 ccaccatcct ggcagaatcc ggctttgccc ctgcaatcaa cccacggaag
ctccgggaat
1021 ggcggccaag cacgcggatc ctgacgttca catgtacggc taagggaggg
aaggggttgg
1081 gtctcgtgag tatggccttt gggatgcaga ggaagggccc aggcctcctg
gaagacagtg
1141 gagtccttag gggacccagc atgccaggac agggggccca ctgtacccct
gtctcaaact
1201 gagccacctt ttcattcagc cgagggaatc ctagggatgc agacccactt
cagcaggggg
1261 ttggggccca gcctgcgagg agtcaagggg aggaagaaga gggaggactg
aggggacctt
1321 ggagtccaga tcagtggcaa ccttgggctg ggggatcctg ggcacagtgg
ccgaatgtgc
1381 cccgtgctca ttgcaccttc agggtgacag agagttgagg gctgtggtct
gagggctggg
1441 acttcaggtc agcagaggga ggaatcccag gatctgccgg acccaaggtg
tgcccccttc
1501 atgaggactg gggatacccc cggcccagaa agaagggatg ccacagagtc
tggaagtccc
1561 ttgttcttag ctctggggga acctgatcag ggatggccct aagtgacaat
ctcatttgta
1621 ccacaggcag gaggttgggg aaccctcagg gagataaggt gttggtgtaa
agaggagctg
1681 tctgctcatt tcagggggtt gggggttgag aaagggcagt ccctggcagg
agtaaagatg
1741 agtaacccac aggaggccat cataacgttc accctagaac caaaggggtc
agccctggac
1801 aacgcacgtg ggggtaacag gatgtggccc ctcctcactt gtctttccag
atctcaggga
1861 gttgatgacc ttgttttcag aaggtgactc aggtcaacac aggggcccca
tctggtcgac
1921 agatgcagtg gttctaggat ctgccaagca tccaggtgga gagcctgagg
taggattgag
1981 ggtacccctg ggccagaatg cagcaagggg gccccataga aatctgccct
gcccctgcgg
2041 ttacttcaga gaccctgggc agggctgtca gctgaagtcc ctccattatc
ctgggatctt
2101 tgatgtcagg gaaggggagg ccttggtctg aaggggctgg agtcaggtca
gtagagggag
2161 ggtctcaggc cctgccagga gtggacgtga ggaccaagcg gactcgtcac
ccaggacacc
2221 tggactccaa tgaatttgga catctctcgt tgtccttcgc gggaggacct
ggtcacgtat
2281 ggccagatgt gggtcccctc atatccttct gtaccatatc agggatgtga
gttcttgaca
2341 tgagagattc tcaagccagc aaaagggtgg gattaggccc tacaaggaga
aaggtgaggg
2401 ccctgagtga gcacagaggg gaccctccac ccaagtagag tggggacctc
acggagtctg
2461 gccaaccctg ctgagacttc tgggaatccg tggctgtgct tgcagtctgc
acactgaagg
2521 cccgtgcatt cctctcccag gaatcaggag ctccaggaac caggcagtga
ggccttggtc
2581 tgagtcagtg tcctcaggtc acagagcaga ggggacgcag acagtgccaa
cactgaaggt
2641 ttgcctggaa tgcacaccaa gggccccacc cgcccagaac aaatgggact
ccagagggcc
2701 tggcctcacc ctccctattc tcagtcctgc agcctgagca tgtgctggcc
ggctgtaccc
2761 tgaggtgccc tcccacttcc tccttcaggt tctgaggggg acaggctgac
aagtaggacc
2821 cgaggcactg gaggagcatt gaaggagaag atctgtaagt aagcctttgt
cagagcctcc
2881 aaggttcagt tcagttctca cctaaggcct cacacacgct ccttctctcc
ccaggcctgt
2941 gggtcttcat tgcccagctc ctgcccgcac tcctgcctgc tgccctgacc
agagtcatca
3001 tgcctcttga gcagaggagt cagcactgca agcctgaaga aggccttgag
gcccgaggag
3061 aggccctggg cctggtgggt gcgcaggctc ctgctactga ggagcagcag
accgcttctt
3121 cctcttctac tctagtggaa gttaccctgg gggaggtgcc tgctgccgac
tcaccgagtc
3181 ctccccacag tcctcaggga gcctccagct tctcgactac catcaactac
actctttgga
3241 gacaatccga tgagggctcc agcaaccaag aagaggaggg gccaagaatg
tttcccgacc
3301 tggagtccga gttccaagca gcaatcagta ggaagatggt tgagttggtt
cattttctgc
3361 tcctcaagta tcgagccagg gagccggtca caaaggcaga aatgctggag
agtgtcctca
3421 gaaattgcca ggacttcttt cccgtgatct tcagcaaagc ctccgagtac
ttgcagctgg
3481 tctttggcat cgaggtggtg gaagtggtcc ccatcagcca cttgtacatc
cttgtcacct
3541 gcctgggcct ctcctacgat ggcctgctgg gcgacaatca ggtcatgccc
aagacaggcc
3601 tcctgataat cgtcctggcc ataatcgcaa tagagggcga ctgtgcccct
gaggagaaaa
3661 tctgggagga gctgagtatg ttggaggtgt ttgaggggag ggaggacagt
gtcttcgcac
3721 atcccaggaa gctgctcatg caagatctgg tgcaggaaaa ctacctggag
taccggcagg
3781 tgcccggcag tgatcctgca tgctacgagt tcctgtgggg tccaagggcc
ctcattgaaa
3841 ccagctatgt gaaagtcctg caccatacac taaagatcgg tggagaacct
cacatttcct
3901 acccacccct gcatgaacgg gctttgagag agggagaaga gtgagtctca
gcacatgttg
3961 cagccagggc cagtgggagg gggtctgggc cagtgcacct tccagggccc
catccattag
4021 cttccactgc ctcgtgtgat atgaggccca ttcctgcctc tttgaagaga
gcagtcagca
4081 ttcttagcag tgagtttctg ttctgttgga tgactttgag atttatcttt
ctttcctgtt
4141 ggaattgttc aaatgttcct tttaacaaat ggttggatga acttcagcat
ccaagtttat
4201 gaatgacagt agtcacacat agtgctgttt atatagttta ggggtaagag
tcctgttttt
4261 tattcagatt gggaaatcca ttccattttg tgagttgtca cataataaca
gcagtggaat
4321 atgtatttgc ctatattgtg aacgaattag cagtaaaata catgatacaa
ggaactcaaa
4381 agatagttaa ttcttgcctt atacctcagt ctattatgta aaattaaaaa
tatgtgtatg
4441 tttttgcttc tttgagaatg caaaagaaat taaatctgaa taaattcttc
ctgttcactg
4501 gctcatttct ttaccattca ctcagcatct gctctgtgga aggccctggt
agtagtggg
//
人MAGE-3抗原(MAGE-3)基因，全cds
ACCESSION U03735
VERSION U03735.1 GI：468825
SEQ ID NO 73
/翻译＝″MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPDPPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAELVHFLLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYIFATCLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSILGDPKKLLTQHFVQENYLEYRRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHISYPPLHEWVLREGEE″
SEQ ID NO 83
起始
1 acgcaggcag tgatgtcacc cagaccacac cccttccccc aatgccactt
cagggggtac
61 tcagagtcag agacttggtc tgaggggagc agaagcaatc tgcagaggat
ggcggtccag
121 gctcagccag gcatcaactt caggaccctg agggatgacc gaaggccccg
cccacccacc
181 cccaactccc ccgaccccac caggatctac agcctcagga cccccgtccc
aatccttacc
241 ccttgcccca tcaccatctt catgcttacc tccaccccca tccgatcccc
atccaggcag
301 aatccagttc cacccctgcc cggaacccag ggtagtaccg ttgccaggat
gtgacgccac
361 tgacttgcgc attggaggtc agaagaccgc gagattctcg ccctgagcaa
cgagcgacgg
421 cctgacgtcg gcggagggaa gccggcccag gctcggtgag gaggcaaggt
aagacgctga
481 gggaggactg aggcgggcct cacctcagac agagggcctc aaataatcca
gtgctgcctc
541 tgctgccggg cctgggccac cccgcagggg aagacttcca ggctgggtcg
ccactacctc
601 accccgccga cccccgccgc tttagccacg gggaactctg gggacagagc
ttaatgtggc
661 cagggcaggg ctggttagaa gaggtcaggg cccacgctgt ggcaggaatc
aaggtcagga
721 ccccgagagg gaactgaggg cagcctaacc accaccctca ccaccattcc
cgtcccccaa
781 cacccaaccc cacccccatc ccccattccc atccccaccc ccacccctat
cctggcagaa
841 tccgggcttt gcccctggta tcaagtcacg gaaggtccgg gaatggcggc
caggcacgtg
901 agtcctgagg ttcacatcta cggctaaggg agggaagggg ttcggtatcg
cgagtatggc
961 cgttgggagg cagcgaaagg gcccaggcct cctggaagac agtggagtcc
tgaggggacc
1021 cagcatgcca ggacaggggg cccactgtac ccctgtctca aaccgaggca
ccttttcatt
1081 cggctacggg aatcctaggg atgcagaccc acttcagcag ggggttgggg
cccagccctg
1141 cgaggagtca tggggaggaa gaagagggag gactgagggg accttggagt
ccagatcagt
1201 ggcaaccttg ggctggggga tgctgggcac agtggccaaa tgtgctctgt
gctcattgcg
1261 ccttcagggt gaccagagag ttgagggctg tggtctgaag agtgggactt
caggtcagca
1321 gagggaggaa tcccaggatc tgcagggccc aaggtgtacc cccaaggggc
ccctatgtgg
1381 tggacagatg cagtggtcct aggatctgcc aagcatccag gtgaagagac
tgagggagga
1441 ttgagggtac ccctgggaca gaatgcggac tgggggcccc ataaaaatct
gccctgctcc
1501 tgctgttacc tcagagagcc tgggcagggc tgtcagctga ggtccctcca
ttatcctagg
1561 atcactgatg tcagggaagg ggaagccttg gtctgagggg gctgcactca
gggcagtaga
1621 gggaggctct cagaccctac taggagtgga ggtgaggacc aagcagtctc
ctcacccagg
1681 gtacatggac ttcaataaat ttggacatct ctcgttgtcc tttccgggag
gacctgggaa
1741 tgtatggcca gatgtgggtc ccctcatgtt tttctgtacc atatcaggta
tgtgagttct
1801 tgacatgaga gattctcagg ccagcagaag ggagggatta ggccctataa
ggagaaaggt
1861 gagggccctg agtgagcaca gaggggatcc tccaccccag tagagtgggg
acctcacaga
1921 gtctggccaa ccctcctgac agttctggga atccgtggct gcgtttgctg
tctgcacatt
1981 gggggcccgt ggattcctct cccaggaatc aggagctcca ggaacaaggc
agtgaggact
2041 tggtctgagg cagtgtcctc aggtcacaga gtagaggggg ctcagatagt
gccaacggtg
2101 aaggtttgcc ttggattcaa accaagggcc ccacctgccc cagaacacat
ggactccaga
2161 gcgcctggcc tcaccctcaa tactttcagt cctgcagcct cagcatgcgc
tggccggatg
2221 taccctgagg tgccctctca cttcctcctt caggttctga ggggacaggc
tgacctggag
2281 gaccagaggc ccccggagga gcactgaagg agaagatctg taagtaagcc
tttgttagag
2341 cctccaaggt tccattcagt actcagctga ggtctctcac atgctccctc
tctccccagg
2401 ccagtgggtc tccattgccc agctcctgcc cacactcccg cctgttgccc
tgaccagagt
2461 catcatgcct cttgagcaga ggagtcagca ctgcaagcct gaagaaggcc
ttgaggcccg
2521 aggagaggcc ctgggcctgg tgggtgcgca ggctcctgct actgaggagc
aggaggctgc
2581 ctcctcctct tctactctag ttgaagtcac cctgggggag gtgcctgctg
ccgagtcacc
2641 agatcctccc cagagtcctc agggagcctc cagcctcccc actaccatga
actaccctct
2701 ctggagccaa tcctatgagg actccagcaa ccaagaagag gaggggccaa
gcaccttccc
2761 tgacctggag tccgagttcc aagcagcact cagtaggaag gtggccgagt
tggttcattt
2821 tctgctcctc aagtatcgag ccagggagcc ggtcacaaag gcagaaatgc
tggggagtgt
2881 cgtcggaaat tggcagtatt tctttcctgt gatcttcagc aaagcttcca
gttccttgca
2941 gctggtcttt ggcatcgagc tgatggaagt ggaccccatc ggccacttgt
acatctttgc
3001 cacctgcctg ggcctctcct acgatggcct gctgggtgac aatcagatca
tgcccaaggc
3061 aggcctcctg ataatcgtcc tggccataat cgcaagagag ggcgactgtg
cccctgagga
3121 gaaaatctgg gaggagctga gtgtgttaga ggtgtttgag gggagggaag
acagtatctt
3181 gggggatccc aagaagctgc tcacccaaca tttcgtgcag gaaaactacc
tggagtaccg
3241 gcaggtcccc ggcagtgatc ctgcatgtta tgaattcctg tggggtccaa
gggccctcgt
3301 tgaaaccagc tatgtgaaag tcctgcacca tatggtaaag atcagtggag
gacctcacat
3361 ttcctaccca cccctgcatg agtgggtttt gagagagggg gaagagtgag
tctgagcacg
3421 agttgcagcc agggccagtg ggagggggtc tgggccagtg caccttccgg
ggccgcatcc
3481 cttagtttcc actgcctcct gtgacgtgag gcccattctt cactctttga
agcgagcagt
3541 cagcattctt agtagtgggt ttctgttctg ttggatgact ttgagattat
tctttgtttc
3601 ctgttggagt tgttcaaatg ttccttttaa cggatggttg aatgagcgtc
agcatccagg
3661 tttatgaatg acagtagtca cacatagtgc tgtttatata gtttaggagt
aagagtcttg
3721 ttttttactc aaattgggaa atccattcca ttttgtgaat tgtgacataa
taatagcagt
3781 ggtaaaagta tttgcttaaa attgtgagcg aattagcaat aacatacatg
agataactca
3841 agaaatcaaa agatagttga ttcttgcctt gcacctcaat ctattctgta
aaattaaaca
3901 aatatgcaaa ccaggatttc cttgacttct ttgagaatgc aagcgaaatt
aaatctgaat
3961 aaataattct tcctcttcac tggctcgttt cttttccgtt cactcagcat
ctgctctgtg
4021 ggaggccctg ggttagtagt ggggatgcta aggtaagcca gactcacgcc
tacccatagg
4081 gctgtagagc ctaggacctg cagtcatata attaaggtgg tgagaagtcc
tgtaagatgt
4141 agaggaaatg taagagaggg gtgagggtgt ggcgctccgg gtgagagtag
tggagtgtca
4201 gtgc
//
人前列腺干细胞抗原(PSCA)mRNA，全cds
ACCESSION AF043498
VERSION AF043498.1 GI：2909843
SEQ ID NO 79
/翻译＝″MKAVLLALLMAGLALQPGTALLCYSCKAQVSNEDCLQVENCTQLGEQCWTARIRAVGLLTVISKGCSLNCVDDSQDYYVGKKNITCCDTDLCNASGAHALQPAAAILALLPALGLLLWGPGQL″
SEQ ID NO 87
起始
1 agggagaggc agtgaccatg aaggctgtgc tgcttgccct gttgatggca
ggcttggccc
61 tgcagccagg cactgccctg ctgtgctact cctgcaaagc ccaggtgagc
aacgaggact
121 gcctgcaggt ggagaactgc acccagctgg gggagcagtg ctggaccgcg
cgcatccgcg
181 cagttggcct cctgaccgtc atcagcaaag gctgcagctt gaactgcgtg
gatgactcac
241 aggactacta cgtgggcaag aagaacatca cgtgctgtga caccgacttg
tgcaacgcca
301 gcggggccca tgccctgcag ccggctgccg ccatccttgc gctgctccct
gcactcggcc
361 tgctgctctg gggacccggc cagctatagg ctctgggggg ccccgctgca
gcccacactg
421 ggtgtggtgc cccaggcctt tgtgccactc ctcacagaac ctggcccagt
gggagcctgt
481 cctggttcct gaggcacatc ctaacgcaag tttgaccatg tatgtttgca
ccccttttcc
541 ccnaaccctg accttcccat gggccttttc caggattccn accnggcaga
tcagttttag
601 tganacanat ccgcntgcag atggcccctc caaccntttn tgttgntgtt
tccatggccc
661 agcattttcc acccttaacc ctgtgttcag gcacttnttc ccccaggaag
ccttccctgc
721 ccaccccatt tatgaattga gccaggtttg gtccgtggtg tcccccgcac
ccagcagggg
781 acaggcaatc aggagggccc agtaaaggct gagatgaagt ggactgagta
gaactggagg
841 acaagagttg acgtgagttc ctgggagttt ccagagatgg ggcctggagg
cctggaggaa
901 ggggccaggc ctcacatttg tggggntccc gaatggcagc ctgagcacag
cgtaggccct
961 taataaacac ctgttggata agccaaaaaa
//
腺激肽释放酶1前体(组织激肽释放酶)(肾/胰腺/唾液腺激肽释放酶)
ACCESSION P06870
PID g125170
VERSION P06870 GI：125170
SEQ ID NO 600
起始
1 mwflvlclal slggtgaapp iqsrivggwe ceqhsqpwqa alyhfstfqc
ggilvhrqwv
61 ltaahcisdn yqlwlgrhnl fddentaqfv hvsesfphpg fnmsllenht
rqadedyshd
121 lmllrltepa dtitdavkvv elptqepevg stclasgwgs iepenfsfpd
dlqcvdlkil
181 pndecekahv qkvtdfmlcv ghleggkdtc vgdsggplmc dgvlqgvtsw
gyvpcgtpnk
241 psvavrvlsy vkwiedtiae ns
//
弹性蛋白酶2A前体
ACCESSION P08217
pID g119255
VERSION P08217 GI：119255
SEQ ID NO 601
起始
1 mirtlllstl vagalscgdp typpyvtrvv ggeearpnsw pwqvslqyss
ngkwyhtcgg
61 slianswvlt aahcisssrt yrvglgrhnl yvaesgslav svskivvhkd
wnsnqiskgn
121 diallklanp vsltdkiqla clppagtilp nnypcyvtgw grlqtngavp
dvlqqgrllv
181 vdyatcsssa wwgssvktsm icaggdgvis scngdsggpl ncqasdgrwq
vhgivsfgsr
241 lgcnyyhkps vftrvsnyid winsviann
//
胰弹性蛋白酶IIB[人]
ACCESSION NP_056933
PID g7705648
VERSION NP_056933.1 GI：7705648
SEQ ID NO 602
起始
1 mirtlllstl vagalscgvs tyapdmsrml ggeearpnsw pwqvslqyss
ngqwyhtcgg
61 slianswvlt aahcisssri yrvmlgqhnl yvaesgslav svskivvhkd
wnsnqvskgn
121 diallklanp vsltdkiqla clppagtilp nnypcyvtgw grlqtngalp
ddlkqgrllv
181 vdyatcsssg wwgstvktnm icaggdgvic tcngdsggpl ncqasdgrwe
vhgigsltsv
241 lgcnYYYkps iftrvsnynd winsviann
//
PRAME人黑素瘤中优选表达的抗原
ACCESSION NM_006115
VERSION NM_006115.1 GI：5174640
SEQ ID NO 77
/翻译＝″MERRRLWGSIQSRYISMSVWTSPRRLVELAGQSLLKDEALAIAALELLPRELFPPLFMAAFDGRHSQTLKAMVQAWPFTCLPLGVLMKGQHLHLETFKAVLDGLDVLLAQEVRPRRWKLQVLDLRKNSHQDFWTVWSGNRASLYSFPEPEAAQPMTKKRKVDGLSTEAEQPFIPVEVLVDLFLKEGACDELFSYLIEKVKRKKNVLRLCCKKLKIFAMPMQDIKMILKMVQLDSIEDLEVTCTWKLPTLAKFSPYLGQMINLRRLLLSHIHASSYISPEKEEQYIAQFTSQFLSLQCLQALYVDSLFFLRGRLDQLLRHVMNPLETLSITNCRLSEGDVMHLSQSPSVSQLSVLSLSGVMLTDVSPEPLQALLERASATLQDLVFDECGITDDQLLALLPSLSHCSQLTTLSFYGNSISISALQSLLQHLIGLSNLTHVLYPVPLESYEDIHGTLHLERLAYLHARLRELLCELGRPSMVWLSANPCPHCGDRTFYDPEPILCPCFMPN″
SEQ ID NO 85
起始
1 gcttcagggt acagctcccc cgcagccaga agccgggcct gcagcccctc
agcaccgctc
61 cgggacaccc cacccgcttc ccaggcgtga cctgtcaaca gcaacttcgc
ggtgtggtga
121 actctctgag gaaaaaccat tttgattatt actctcagac gtgcgtggca
acaagtgact
181 gagacctaga aatccaagcg ttggaggtcc tgaggccagc ctaagtcgct
tcaaaatgga
241 acgaaggcgt ttgtggggtt ccattcagag ccgatacatc agcatgagtg
tgtggacaag
301 cccacggaga cttgtggagc tggcagggca gagcctgctg aaggatgagg
ccctggccat
361 tgccgccctg gagttgctgc ccagggagct cttcccgcca ctcttcatgg
cagcctttga
421 cgggagacac agccagaccc tgaaggcaat ggtgcaggcc tggcccttca
cctgcctccc
481 tctgggagtg ctgatgaagg gacaacatct tcacctggag accttcaaag
ctgtgcttga
541 tggacttgat gtgctccttg cccaggaggt tcgccccagg aggtggaaac
ttcaagtgct
601 ggatttacgg aagaactctc atcaggactt ctggactgta tggtctggaa
acagggccag
661 tctgtactca tttccagagc cagaagcagc tcagcccatg acaaagaagc
gaaaagtaga
721 tggtttgagc acagaggcag agcagccctt cattccagta gaggtgctcg
tagacctgtt
781 cctcaaggaa ggtgcctgtg atgaattgtt ctcctacctc attgagaaag
tgaagcgaaa
841 gaaaaatgta ctacgcctgt gctgtaagaa gctgaagatt tttgcaatgc
ccatgcagga
901 tatcaagatg atcctgaaaa tggtgcagct ggactctatt gaagatttgg
aagtgacttg
961 tacctggaag ctacccacct tggcgaaatt ttctccttac ctgggccaga
tgattaatct
1021 gcgtagactc ctcctctccc acatccatgc atcttcctac atttccccgg
agaaggaaga
1081 gcagtatatc gcccagttca cctctcagtt cctcagtctg cagtgcctgc
aggctctcta
1141 tgtggactct ttatttttcc ttagaggccg cctggatcag ttgctcaggc
acgtgatgaa
1201 ccccttggaa accctctcaa taactaactg ccggctttcg gaaggggatg
tgatgcatct
1261 gtcccagagt cccagcgtca gtcagctaag tgtcctgagt ctaagtgggg
tcatgctgac
1321 cgatgtaagt cccgagcccc tccaagctct gctggagaga gcctctgcca
ccctccagga
1381 cctggtcttt gatgagtgtg ggatcacgga tgatcagctc cttgccctcc
tgccttccct
1441 gagccactgc tcccagctta caaccttaag cttctacggg aattccatct
ccatatctgc
1501 cttgcagagt ctcctgcagc acctcatcgg gctgagcaat ctgacccacg
tgctgtatcc
1561 tgtccccctg gagagttatg aggacatcca tggtaccctc cacctggaga
ggcttgccta
1621 tctgcatgcc aggctcaggg agttgctgtg tgagttgggg cggcccagca
tggtctggct
1681 tagtgccaac ccctgtcctc actgtgggga cagaaccttc tatgacccgg
agcccatcct
1741 gtgcccctgt ttcatgccta actagctggg tgcacatatc aaatgcttca
ttctgcatac
1801 ttggacacta aagccaggat gtgcatgcat cttgaagcaa caaagcagcc
acagtttcag
1861 acaaatgttc agtgtgagtg aggaaaacat gttcagtgag gaaaaaacat
tcagacaaat
1921 gttcagtgag gaaaaaaagg ggaagttggg gataggcaga tgttgacttg
aggagttaat
1981 gtgatctttg gggagataca tcttatagag ttagaaatag aatctgaatt
tctaaaggga
2041 gattctggct tgggaagtac atgtaggagt taatccctgt gtagactgtt
gtaaagaaac
2101 tgttgaaaat aaagagaagc aatgtgaagc aaaaaaaaaa aaaaaaaa
纤连蛋白的ED-B结构域
人纤连蛋白基因ED-B结构域
ACCESSION X07717
VERSION X07717.1 GI：31406
SEQ ID NO 590
/翻译＝″CTFDNLSPGLEYNVSVYTVKDDKESVPISDTIIPEVPQLTDLSFVDITDSSIGLRWTPLNSSTIIGYRITVVAAGEGIPIFEDFVDSSVGYYTVTGLEPGIDYDISVITLINGGESAPTTLTQQTAVPPPTDLRFTNIGPDTMRVTW″
SEQ ID NO 5 91
起始
1 ctgcactttt gataacctga gtcccggcct ggagtacaat gtcagtgttt
acactgtcaa
61 ggatgacaag gaaagtgtcc ctatctctga taccatcatc ccaggtaata
gaaaataagc
121 tgctatcctg agagtgacat tccaataaga gtggggatta gcatcttaat
ccccagatgc
181 ttaagggtgt caactatatt tgggatttaa ttccgatctc ccagctgcac
tttccaaaac
241 caagaagtca aagcagcgat ttggacaaaa tgcttgctgt taacactgct
ttactgtctg
301 tgcttcactg ggatgctgtg tgttgcagcg agtatgtaat ggagtggcag
ccatggcttt
361 aactctgtat tgtctgctca catggaagta tgactaaaac actgtcacgt
gtctgtactc
421 agtactgata ggctcaaagt aatatggtaa atgcatccca tcagtacatt
tctgcccgat
481 tttacaatcc atatcaattt ccaacagctg cctatttcat cttgcagttt
caaatccttc
541 tttttgaaaa ttggatttta aaaaaaagtt aagtaaaagt cacaccttca
gggttgttct
601 ttcttgtggc cttgaaagac aacattgcaa aggcctgtcc taaggatagg
cttgtttgtc
661 cattgggtta taacataatg aaagcattgg acagatcgtg tccccctttg
gactcttcag
721 tagaatgctt ttactaacgc taattacatg ttttgattat gaatgaacct
aaaatagtgg
781 caatggcctt aacctaggcc tgtctttcct cagcctgaat gtgcttttga
atggcacatt
841 tcacaccata cattcataat gcattagcgt tatggccatg atgttgtcat
gagttttgta
901 tgggagaaaa aaaatcaatt tatcacccat ttattatttt ttccggttgt
tcatgcaagc
961 ttattttcta ctaaaacagt tttggaatta ttaaaagcat tgctgatact
tacttcagat
1021 attatgtcta ggctctaaga atggtttcga catcctaaac agccatatga
tttttaggaa
1081 tctgaacagt tcaaattgta ccctttaagg atgttttcaa aatgtaaaaa
atatatatat
1141 atatatatat tccctaaaag aatattcctg tttattcttc tagggaagca
aactgttcat
1201 gatgcttagg aagtcttttc agagaattta aaacagattg catattacca
tcattgcttt
1261 aacattccac caattttact actagtaacc tgatatacac tgctttattt
tttcctcttt
1321 ttttccctct attttccttt tgcctccccc tccctttgct ttgtaactca
atagaggtgc
1381 cccaactcac tgacctaagc tttgttgata taaccgattc aagcatcggc
ctgaggtgga
1441 ccccgctaaa ctcttccacc attattgggt accgcatcac agtagttgcg
gcaggagaag
1501 gtatccctat ttttgaagat tttgtggact cctcagtagg atactacaca
gtcacagggc
1561 tggagccggg cattgactat gatatcagcg ttatcactct cattaatggc
ggcgagagtg
1621 cccctactac actgacacaa caaacgggtg aattttgaaa acttctgcgt
ttgagacata
1681 gatggtgttg catgctgcca ccagttactc cggttaaata tggatgtttc
atgggggaag
1741 tcagcaattg gccaaagatt cagataggtg gaattggggg gataaggaat
caaatgcatc
1801 tgctaaactg attggagaaa aacacatgca atatcttcag tacactctca
tttaaaccac
1861 aagtagatat aaagcctaga gaaatacaga tgtctgctct gttaaatata
aaatagcaaa
1921 tgttcattca atttgaagac ctagaatttt tcttcttaaa taccaaacac
gaataccaaa
1981 ttgcgtaagt accaattgat aagaatatat caccaaaatg taccatcatg
ctcttccttc
2041 taccctttga taaactctac catgctcctt ctttgtagct aaaaacccat
caaaatttag
2101 ggtagagtgg atgggcattg ttttgaggta ggagaaaagt aaacttggga
ccattctagg
2161 ttttgttgct gtcactaggt aaagaaacac ctctttaacc acagtctggg
gacaagcatg
2221 caacatttta aaggttctct gctgtgcatg ggaaaagaaa catgctgaga
accaatttgc
2281 atgaacatgt tcacttgtaa gtagaattca ctgaatggaa ctgtagctct
agatatctca
2341 catgggggga agtttaggac cctcttgtct ttttgtctgt gtgcatgtat
ttctttgtaa
2401 agtactgcta tgtttctctt tgctgtgtgg caacttaagc ctcttcggcc
tgggataaaa
2461 taatctgcag tggtattaat aatgtacata aagtcaacat atttgaaagt
agattaaaat
2521 cttttttaaa tatatcaatg atggcaaaaa ggttaaaggg ggcctaacag
tactgtgtgt
2581 agtgttttat ttttaacagt agtacactat aacttaaaat agacttagat
tagactgttt
2641 gcatgattat gattctgttt cctttatgca tgaaatattg attttacctt
tccagctact
2701 tcgttagctt taattttaaa atacattaac tgagtcttcc ttcttgttcg
aaaccagctg
2761 ttcctcctcc cactgacctg cgattcacca acattggtcc agacaccatg
cgtgtcacct
2821 ggg
//
CEA人癌胚抗原相关细胞粘附分子5(CEACAM5)，mRNA。
ACCESSION NM_004363
VERSION NM_004363.1 GI：11386170
SEQ ID NO 592
/翻译＝″MESPSAPPHRWCIPWQRLLLTASLLTFWNPPTTAKLTIESTPFNVAEGKEVLLLVHNLPQHLFGYSWYKGERVDGNRQIIGYVIGTQQATPGPAYSGREIIYPNASLLIQNIIQNDTGFYTLHVIKSDLVNEEATGQFRVYPELPKPSISSNNSKPVEDKDAVAFTCEPETQDATYLWWVNNQSLPVSPRLQLSNGNRTLTLFNVTRNDTASYKCETQNPVSARRSDSVILNVLYGPDAPTISPLNTSYRSGENLNLSCHAASNPPAQYSWFVNGTFQQSTQELFIPNITVNNSGSYTCQAHNSDTGLNRTTVTTITVYAEPPKPFITSNNSNPVEDEDAVALTCEPEIQNTTYLWWVNNQSLPVSPRLQLSNDNRTLTLLSVTRNDVGPYECGIQNELSVDHSDPVILNVLYGPDDPTISPSYTYYRPGVNLSLSCHAASNPPAQYSWLIDGNIQQHTQELFISNITEKNSGLYTCQANNSASGHSRTTVKTITVSAELPKPSISSNNSKPVEDKDAVAFTCEPEAQNTTYLWWVNGQSLPVSPRLQLSNGNRTLTLFNVTRNDARAYVCGIQNSVSANRSDPVTLDVLYGPDTPIISPPDSSYLSGANLNLSCHSASNPSPQYSWRINGIPQQHTQVLFIAKITPNNNGTYACFVSNLATGRNNSIVKSITVSASGTSPGLSAGATVGIMIGVLVGVALI″
SEQ ID NO 593
起始
1 ctcagggcag agggaggaag gacagcagac cagacagtca cagcagcctt
gacaaaacgt
61 tcctggaact caagctcttc tccacagagg aggacagagc agacagcaga
gaccatggag
121 tctccctcgg cccctcccca cagatggtgc atcccctggc agaggctcct
gctcacagcc
181 tcacttctaa ccttctggaa cccgcccacc actgccaagc tcactattga
atccacgccg
241 ttcaatgtcg cagaggggaa ggaggtgctt ctacttgtcc acaatctgcc
ccagcatctt
301 tttggctaca gctggtacaa aggtgaaaga gtggatggca accgtcaaat
tataggatat
361 gtaataggaa ctcaacaagc taccccaggg cccgcataca gtggtcgaga
gataatatac
421 cccaatgcat ccctgctgat ccagaacatc atccagaatg acacaggatt
ctacacccta
481 cacgtcataa agtcagatct tgtgaatgaa gaagcaactg gccagttccg
ggtatacccg
541 gagctgccca agccctccat ctccagcaac aactccaaac ccgtggagga
caaggatgct
601 gtggccttca cctgtgaacc tgagactcag gacgcaacct acctgtggtg
ggtaaacaat
661 cagagcctcc cggtcagtcc caggctgcag ctgtccaatg gcaacaggac
cctcactcta
721 ttcaatgtca caagaaatga cacagcaagc tacaaatgtg aaacccagaa
cccagtgagt
781 gccaggcgca gtgattcagt catcctgaat gtcctctatg gcccggatgc
ccccaccatt
841 tcccctctaa acacatctta cagatcaggg gaaaatctga acctctcctg
ccacgcagcc
901 tctaacccac ctgcacagta ctcttggttt gtcaatggga ctttccagca
atccacccaa
961 gagctcttta tccccaacat cactgtgaat aatagtggat cctatacgtg
ccaagcccat
1021 aactcagaca ctggcctcaa taggaccaca gtcacgacga tcacagtcta
tgcagagcca
1081 cccaaaccct tcatcaccag caacaactcc aaccccgtgg aggatgagga
tgctgtagcc
1141 ttaacctgtg aacctgagat tcagaacaca acctacctgt ggtgggtaaa
taatcagagc
1201 ctcccggtca gtcccaggct gcagctgtcc aatgacaaca ggaccctcac
tctactcagt
1261 gtcacaagga atgatgtagg accctatgag tgtggaatcc agaacgaatt
aagtgttgac
1321 cacagcgacc cagtcatcct gaatgtcctc tatggcccag acgaccccac
catttccccc
1381 tcatacacct attaccgtcc aggggtgaac ctcagcctct cctgccatgc
agcctctaac
1441 ccacctgcac agtattcttg gctgattgat gggaacatcc agcaacacac
acaagagctc
1501 tttatctcca acatcactga gaagaacagc ggactctata cctgccaggc
caataactca
1561 gccagtggcc acagcaggac tacagtcaag acaatcacag tctctgcgga
gctgcccaag
1621 ccctccatct ccagcaacaa ctccaaaccc gtggaggaca aggatgctgt
ggccttcacc
1681 tgtgaacctg aggctcagaa cacaacctac ctgtggtggg taaatggtca
gagcctccca
1741 gtcagtccca ggctgcagct gtccaatggc aacaggaccc tcactctatt
caatgtcaca
1801 agaaatgacg caagagccta tgtatgtgga atccagaact cagtgagtgc
aaaccgcagt
1861 gacccagtca ccctggatgt cctctatggg ccggacaccc ccatcatttc
ccccccagac
1921 tcgtcttacc tttcgggagc gaacctcaac ctctcctgcc actcggcctc
taacccatcc
1981 ccgcagtatt cttggcgtat caatgggata ccgcagcaac acacacaagt
tctctttatc
2041 gccaaaatca cgccaaataa taacgggacc tatgcctgtt ttgtctctaa
cttggctact
2101 ggccgcaata attccatagt caagagcatc acagtctctg catctggaac
ttctcctggt
2161 ctctcagctg gggccactgt cggcatcatg attggagtgc tggttggggt
tgctctgata
2221 tagcagccct ggtgtagttt cttcatttca ggaagactga cagttgtttt
gcttcttcct
2281 taaagcattt gcaacagcta cagtctaaaa ttgcttcttt accaaggata
tttacagaaa
2341 agactctgac cagagatcga gaccatccta gccaacatcg tgaaacccca
tctctactaa
2401 aaatacaaaa atgagctggg cttggtggcg cgcacctgta gtcccagtta
ctcgggaggc
2461 tgaggcagga gaatcgcttg aacccgggag gtggagattg cagtgagccc
agatcgcacc
2521 actgcactcc agtctggcaa cagagcaaga ctccatctca aaaagaaaag
aaaagaagac
2581 tctgacctgt actcttgaat acaagtttct gataccactg cactgtctga
gaatttccaa
2641 aactttaatg aactaactga cagcttcatg aaactgtcca ccaagatcaa
gcagagaaaa
2701 taattaattt catgggacta aatgaactaa tgaggattgc tgattcttta
aatgtcttgt
2761 ttcccagatt tcaggaaact ttttttcttt taagctatcc actcttacag
caatttgata
2821 aaatatactt ttgtgaacaa aaattgagac atttacattt tctccctatg
tggtcgctcc
2881 agacttggga aactattcat gaatatttat attgtatggt aatatagtta
ttgcacaagt
2941 tcaataaaaa tctgctcttt gtataacaga aaaa
//
Her2/Neu人酪氨酸激酶型受体(HER2)mRNA，全cds
ACCESSION M11730
VERSION M11730.1 GI：183986
SEQ ID NO 594
/翻译＝″MELAALCRWGLLLALLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIVSAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPyVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSP NHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLEPSEEEAPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERAKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPTAENPEYLGLDVPV″
SEQ ID NO 595
来源 染色体17q21-q22。
1 aattctcgag ctcgtcgacc ggtcgacgag ctcgagggtc gacgagctcg
agggcgcgcg
61 cccggccccc acccctcgca gcaccccgcg ccccgcgccc tcccagccgg
gtccagccgg
121 agccatgggg ccggagccgc agtgagcacc atggagctgg cggccttgtg
ccgctggggg
181 ctcctcdtcg ccctcttgcc ccccggagcc gcgagcaccc aagtgtgcac
cggcacagac
241 atgaagctgc ggctccctgc cagtcccgag acccacctgg acatgctccg
ccacctctac
301 cagggctgcc aggtggtgca gggaaacctg gaactcacct acctgcccac
caatgccagc
361 ctgtccttcc tgcaggatat ccaggaggtg cagggctacg tgctcatcgc
tcacaaccaa
421 gtgaggcagg tcccactgca gaggctgcgg attgtgcgag gcacccagct
ctttgaggac
481 aactatgccc tggccgtgct agacaatgga gacccgctga acaataccac
ccctgtcaca
541 ggggcctccc caggaggcct gcgggagctg cagcttcgaa gcctcacaga
gatcttgaaa
601 ggaggggtct tgatccagcg gaacccccag ctctgctacc aggacacgat
tttgtggaag
661 gacatcttcc acaagaacaa ccagctggct ctcacactga tagacaccaa
ccgctctcgg
721 gcctgccacc cctgttctcc gatgtgtaag ggctcccgct gctggggaga
gagttctgag
781 gattgtcaga gcctgacgcg cactgtctgt gccggtggct gtgcccgctg
caaggggcca
841 ctgcccactg actgctgcca tgagcagtgt gctgccggct gcacgggccc
caagcactct
901 gactgcctgg cctgcctcca cttcaaccac agtggcatct gtgagctgca
ctgcccagcc
961 ctggtcacct acaacacaga cacgtttgag tccatgccca atcccgaggg
ccggtataca
1021 ttcggcgcca gctgtgtgac tgcctgtccc tacaactacc tttctacgga
cgtgggatcc
1081 tgcaccctcg tctgccccct gcacaaccaa gaggtgacag cagaggatgg
aacacagcgg
1141 tgtgagaagt gcagcaagcc ctgtgcccga gtgtgctatg gtctgggcat
ggagcacttg
1201 cgagaggtga gggcagttac cagtgccaat atccaggagt ttgctggctg
caagaagatc
1261 tttgggagcc tggcatttct gccggagagc tttgatgggg acccagcctc
caacactgcc
1321 ccgctccagc cagagcagct ccaagtgttt gagactctgg aagagatcac
aggttaccta
1381 tacatctcag catggccgga cagcctgcct gacctcagcg tcttccagaa
cctgcaagta
1441 atccggggac gaattctgca caatggcgcc tactcgctga ccctgcagg
gctgggcatc
1501 agctggctgg ggctgcgctc actgagggaa ctgggcagtg gactggccct
catccaccat
1561 aacacccacc tctgcttcgt gcacacggtg ccctgggacc agctctttcg
gaacccgcac
1621 caagctctgc tccacactgc caaccggcca gaggacgagt gtgtgggcga
gggcctggcc
1681 tgccaccagc tgtgcgcccg agggcactgc tggggtccag ggcccaccca
gtgtgtcaac
1741 tgcagccagt tccttcgggg ccaggagtgc gtggaggaat gccgagtact
gcaggggctc
1801 cccagggagt atgtgaatgc caggcactgt ttgccgtgcc accctgagtg
tcagccccag
1861 aatggctcag tgacctgttt tggaccggag gctgaccagt gtgtggcctg
tgcccactat
1921 aaggaccctc ccttctgcgt ggcccgctgc cccagcggtg tgaaacctga
cctctcctac
1981 atgcccatct ggaagtttcc agatgaggag ggcgcatgcc agccttgccc
catcaactgc
2041 acccactcct gtgtggacct ggatgacaag ggctgccccg ccgagcagag
agccagccct
2101 ctgacgtcca tcgtctctgc ggtggttggc attctgctgg tcgtggtctt
gggggtggtc
2161 tttgggatcc tcatcaagcg acggcagcag aagatccgga agtacacgat
gcggagactg
2221 ctgcaggaaa cggagctggt ggagccgctg acacctagcg gagcgatgcc
caaccaggcg
2281 cagatgcgga tcctgaaaga gacggagctg aggaaggtga aggtgcttgg
atctggcgct
2341 tttggcacag tctacaaggg catctggatc cctgatgggg agaatgtgaa
aattccagtg
2401 gccatcaaag tgttgaggga aaacacatcc cccaaagcca acaaagaaat
cttagacgaa
2461 gcatacgtga tggctggtgt gggctcccca tatgtctccc gccttctggg
catctgcctg
2521 acatccacgg tgcagctggt gacacagctt atgccctatg gctgcctctt
agaccatgtc
2581 cgggaaaacc gcggacgcct gggctcccag gacctgctga actggtgtat
gcagattgcc
2641 aaggggatga gctacctgga ggatgtgcgg ctcgtacaca gggacttggc
cgctcggaac
2701 gtgctggtca agagtcccaa ccatgtcaaa attacagact tcgggctggc
tcggctgctg
2761 gacattgacg agacagagta ccatgcagat gggggcaagg tgcccatcaa
gtggatggcg
2821 ctggagtcca ttctccgccg gcggttcacc caccagagtg atgtgtggag
ttatggtgtg
2881 actgtgtggg agctgatgac ttttggggcc aaaccttacg atgggatccc
agcccgggag
2941 atccctgacc tgctggaaaa gggggagcgg ctgccccagc cccccatctg
caccattgat
3001 gtctacatga tcatggtcaa atgttggatg attgactctg aatgtcggcc
aagattccgg
3061 gagttggtgt ctgaattctc ccgcatggcc agggaccccc agcgctttgt
ggtcatccag
3121 aatgaggact tgggcccagc cagtcccttg gacagcacct tctaccgctc
actgctggag
3181 gacgatgaca tgggggacct ggtggatgct gaggagtatc tggtacccca
gcagggcttc
3241 ttctgtccag accctgcccc gggcgctggg ggcatggtcc accacaggca
ccgcagctca
3301 tctaccagga gtggcggtgg ggacctgaca ctagggctgg agccctctga
agaggaggcc
3361 cccaggtctc cactggcacc ctccgaaggg gctggctccg atgtatttga
tggtgacctg
3421 ggaatggggg cagccaaggg gctgcaaagc ctccccacac atgaccccag
ccctctacag
3481 cggtacagtg aggaccccac agtacccctg ccctctgaga ctgatggcta
cgttgccccc
3541 ctgacctgca gcccccagcc tgaatatgtg aaccagccag atgttcggcc
ccagccccct
3601 tcgccccgag agggccctct gcctgctgcc cgacctgctg gtgccactct
ggaaagggcc
3661 aagactctct ccccagggaa gaatggggtc gtcaaagacg tttttgcctt
tgggggtgcc
3721 gtggagaacc ccgagtactt gacaccccag ggaggagctg cccctcagcc
ccaccctcct
3781 cctgccttca gcccagcctt cgacaacctc tattactggg accaggaccc
accagagcgg
3841 ggggctccac ccagcacctt caaagggaca cctacggcag agaacccaga
gtacctgggt
3901 ctggacgtgc cagtgtgaac cagaaggcca agtccgcaga agccctgatg
tgtcctcagg
3961 gagcagggaa ggcctgactt ctgctggcat caagaggtgg gagggcgctc
cgaccacttc
4021 caggggaacc tgccatgcca ggaacctgtc ctaaggaacc ttccttcctg
cttgagttcc
4081 cagatggctg gaaggggtcc agcctcgttg gaagaggaac agcactgggg
agtctttgtg
4141 gattctgagg ccctgcccaa tgagactcta gggtccagtg gatgccacag
cccagcttgg
4201 ccctttcctt ccagatcctg ggtactgaaa gccttaggga agctggcctg
agaggggaag
4261 cggccctaag ggagtgtcta agaacaaaag cgacccattc agagactgtc
cctgaaacct
4321 agtactgccc cccatgagga aggaacagca atggtgtcag tatccaggct
ttgtacagag
4381 tgcttttctg tttagttttt actttttttg ttttgttttt ttaaagacga
aataaagacc
4441 caggggagaa tgggtgttgt atggggaggc aagtgtgggg ggtccttctc
cacacccact
4501 ttgtccattt gcaaatatat tttggaaaac
//
人SCP1蛋白mRNA
ACCESSION X95654
VERSION X95654.1 GI：1212982
SEQID NO 596
/翻译＝″MEKQKPFALFVPPRSSSSQVSAVKPQTLGGDSTFFKSFNKCTEDDLEFPFAKTNLSKNGENIDSDPALQKVNFLPVLEQVGNSDCHYQEGLKDSDLENSEGLSRVFSKLYKEAEKIKKWKVSTEAELRQKESKLQENRKIIEAQRKAIQELQFGNEKVSLKLEEGIQENKDLIKENNATRHLCNLLKETCARSAEKTKKYEYEREETRQVYMDLNNNIEKMITAHGELRVQAENSRLEMHFKLKEDYEKIQHLEQEYKKEINDKEKQVSLLLIQITEKENKMKDLTFLLEESRDKVNQLEEKTKLQSENLKQSIEKQHHLTKELEDIKVSLQRSVSTQKALEEDLQIATKTICQLTEEKETQMEESNKARAAHSFVVTEFETTVCSLEELLRTEQQRLEKNEDQLKILTMELQKKSSELEEMTKLTNNKEVELEELKKVLGEKETLLYENKQFEKIAEELKGTEQELIGLLQAREKEVHDLEIQLTAITTSEQYYSKEVKDLKTELENEKLKNTELTSHCNKLSLENKELTQETSDMTLELKNQQEDINNNKKQEERMLKQIENLQETETQLRNELEYVREELKQKRDEVKCKLDKSEENCNNLRKQVENKNKYIEELQQENKALKKKGTAESKQLNVYEIKVNKLELELESAKQKFGEITDTYQKEIEDKKISEENLLEEVEKAKVIADEAVKLQKEIDKRCQHKIAEMVALMEKHKHQYDKIIEERDSELGLYKSKEQEQSSLRASLEIELSNLKAELLSVKKQLEIEREEKEKLKREAKENTATLKEKKDKKTQTFLLETPEIYWKLDSKAVPSQTVSRNFTSVDHGISKDKRDYLWTSAKNTLSTPLPKAYTVKTPTKPKLQQRENLNIPIEESKKKRKMAFEFDINSDSSETTDLLSMVSEEETLKTLYRNNNPPASHLCVKTPKKAPSSLTTPGPTLKFGAIRKMREDRWAVIAKMDRKKKLKEAEKLFV″
SEQ ID NO 597
起始
1 gccctcatag accgtttgtt gtagttcgcg tgggaacagc aacccacggt
ttcccgatag
61 ttcttcaaag atatttacaa ccgtaacaga gaaaatggaa aagcaaaagc
cctttgcatt
121 gttcgtacca ccgagatcaa gcagcagtca ggtgtctgcg gtgaaacctc
agaccctggg
181 aggcgattcc actttcttca agagtttcaa caaatgtact gaagatgatt
tggagtttcc
241 atttgcaaag actaatctct ccaaaaatgg ggaaaacatt gattcagatc
ctgctttaca
301 aaaagttaat ttcttgcccg tgcttgagca ggttggtaat tctgactgtc
actatcagga
361 aggactaaaa gactctgatt tggagaattc agagggattg agcagagtgt
tttcaaaact
421 gtataaggag gctgaaaaga taaaaaaatg gaaagtaagt acagaagctg
aactgagaca
481 gaaagaaagt aagttgcaag aaaacagaaa gataattgaa gcacagcgaa
aagccattca
541 ggaactgcaa tttggaaatg aaaaagtaag tttgaaatta gaagaaggaa
tacaagaaaa
601 taaagattta ataaaagaga ataatgccac aaggcattta tgtaatctac
tcaaagaaac
661 ctgtgctaga tctgcagaaa agacaaagaa atatgaatat gaacgggaag
aaaccaggca
721 agtttatatg gatctaaata ataacattga gaaaatgata acagctcatg
gggaacttcg
781 tgtgcaagct gagaattcca gactggaaat gcattttaag ttaaaggaag
attatgaaaa
841 aatccaacac cttgaacaag aatacaagaa ggaaataaat gacaaggaaa
agcaggtatc
901 actactattg atccaaatca ctgagaaaga aaataaaatg aaagatttaa
catttctgct
961 agaggaatcc agagataaag ttaatcaatt agaggaaaag acaaaattac
agagtgaaaa
1021 cttaaaacaa tcaattgaga aacagcatca tttgactaaa gaactagaag
atattaaagt
1081 gtcattacaa agaagtgtga gtactcaaaa ggctttagag gaagatttac
agatagcaac
1141 aaaaacaatt tgtcagctaa ctgaagaaaa agaaactcaa atggaagaat
ctaataaagc
1201 tagagctgct cattcgtttg tggttactga atttgaaact actgtctgca
gcttggaaga
1261 attattgaga acagaacagc aaagattgga aaaaaatgaa gatcaattga
aaatacttac
1321 catggagctt caaaagaaat caagtgagct ggaagagatg actaagctta
caaataacaa
1381 agaagtagaa cttgaagaat tgaaaaaagt cttgggagaa aaggaaacac
ttttatatga
1441 aaataaacaa tttgagaaga ttgctgaaga attaaaagga acagaacaag
aactaattgg
1501 tcttctccaa gccagagaga aagaagtaca tgatttggaa atacagttaa
ctgccattac
1561 cacaagtgaa cagtattatt caaaagaggt taaagatcta aaaactgagc
ttgaaaacga
1621 gaagcttaag aatactgaat taacttcaca ctgcaacaag ctttcactag
aaaacaaaga
1681 gctcacacag gaaacaagtg atatgaccct agaactcaag aatcagcaag
aagatattaa
1741 taataacaaa aagcaagaag aaaggatgtt gaaacaaata gaaaatcttc
aagaaacaga
1801 aacccaatta agaaatgaac tagaatatgt gagagaagag ctaaaacaga
aaagagatga
1861 agttaaatgt aaattggaca agagtgaaga aaattgtaac aatttaagga
aacaagttga
1921 aaataaaaac aagtatattg aagaacttca gcaggagaat aaggccttga
aaaaaaaagg
1981 tacagcagaa agcaagcaac tgaatgttta tgagataaag gtcaataaat
tagagttaga
2041 actagaaagt gccaaacaga aatttggaga aatcacagac acctatcaga
aagaaattga
2101 ggacaaaaag atatcagaag aaaatctttt ggaagaggtt gagaaagcaa
aagtaatagc
2161 tgatgaagca gtaaaattac agaaagaaat tgataagcga tgtcaacata
aaatagctga
2221 aatggtagca cttatggaaa aacataagca ccaatatgat aagatcattg
aagaaagaga
2281 ctcagaatta ggactttata agagcaaaga acaagaacag tcatcactga
gagcatcttt
2341 ggagattgaa ctatccaatc tcaaagctga acttttgtct gttaagaagc
aacttgaaat
2401 agaaagagaa gagaaggaaa aactcaaaag agaggcaaaa gaaaacacag
ctactcttaa
2461 agaaaaaaaa gacaagaaaa cacaaacatt tttattggaa acacctgaaa
tttattggaa
2521 attggattct aaagcagttc cttcacaaac tgtatctcga aatttcacat
cagttgatca
2581 tggcatatcc aaagataaaa gagactatct gtggacatct gccaaaaata
ctttatctac
2641 accattgcca aaggcatata cagtgaagac accaacaaaa ccaaaactac
agcaaagaga
2701 aaacttgaat atacccattg aagaaagtaa aaaaaagag aaaaatggcct
ttgaatttga
2761 tattaattca gatagttcag aaactactga tcttttgagc atggtttcag
aagaagagac
2821 attgaaaaca ctgtatagga acaataatcc accagcttct catctttgtg
tcaaaacacc
2881 aaaaaaggcc ccttcatctc taacaacccc tggacctaca ctgaagtttg
gagctataag
2941 aaaaatgcgg gaggaccgtt gggctgtaat tgctaaaatg gatagaaaaa
aaaaactaaa
3001 agaagctgaa aagttatttg tttaatttca gagaatcagt gtagttaagg
agcctaataa
3061 cgtgaaactt atagttaata ttttgttctt atttgccaga gccacatttt
atctggaagt
3121 tgagacttaa aaaatacttg catgaatgat ttgtgtttct ttatattttt
agcctaaatg
3181 ttaactacat attgtctgga aacctgtcat tgtattcaga taattagatg
attatatatt
3241 gttgttactt tttcttgtat tcatgaaaac tgtttttact aagttttcaa
atttgtaaag
3301 ttagcctttg aatgctagga atgcattatt gagggtcatt ctttattctt
tactattaaa
3361 atattttgga tgcaaaaaaa aaaaaaaaaa aaa
//
人滑膜肉瘤，X断裂点4(SSX4)，mRNA。
ACCESSION NM_005636
VERSION NM_005636.1 GI：5032122
SEQ ID NO 598
/翻译＝″MNGDDAFARRPRDDAQISEKLRKAFDDIAKYFSKKEWEKMKSSEKIVYVYMKLNYEVMTKLGFKVTLPPFMRSKRAADFHGNDFGNDRNHRNQVERPQMTFGSLQRIFPKIMPKKPAEEENGLKEVPEASGPQNDGKQLCPPGNPSTLEKINKTSGPKRGKHAWTHRLRERKQLVVYEEISDPEEDDE″
SEQ ID NO 599
起始
1 atgaacggag acgacgcctt tgcaaggaga cccagggatg atgctcaaat
atcagagaag
61 ttacgaaagg ccttcgatga tattgccaaa tacttctcta agaaagagtg
ggaaaagatg
121 aaatcctcgg agaaaatcgt ctatgtgtat atgaagctaa actatgaggt
catgactaaa
181 ctaggtttca aggtcaccct cccacctttc atgcgtagta aacgggctgc
agacttccac
241 gggaatgatt ttggtaacga tcgaaaccac aggaatcagg ttgaacgtcc
tcagatgact
301 ttcggcagcc tccagagaat cttcccgaag atcatgccca agaagccagc
agaggaagaa
361 aatggtttga aggaagtgcc agaggcatct ggcccacaaa atgatgggaa
acagctgtgc
421 cccccgggaa atccaagtac cttggagaag attaacaaga catctggacc
caaaaggggg
481 aaacatgcct ggacccacag actgcgtgag agaaagcagc tggtggttta
tgaagagatc
541 agcgaccctg aggaagatga cgagtaactc ccctcg
所有在说明书中提及的专利和出版物表现出本发明所属本领域的那些技术人员的水平。
可以缺乏在这里未具体公开的任何要素或多种要素，限制或多种限制实行在这里例证性适当描述的本发明。已经使用的术语和表述是用作描述术语而不是限制术语，没有打算在使用该术语和表述中表示排除显示和描述的特征的同等物或其部分。应当认识到在要求保护的本发明的范围内各种修饰是可能的。因此，应当理解尽管已经通过优选实施方案和任选的特征具体地公开了本发明，在这里公开的概念的修饰和改变可被本领域那些技术人员所利用，这类修饰和改变被认为是在由后附权利要求所限定的本发明的范围内。
序列表
PC030722.seq
<110>麦康公司
约翰·J·L·西马德
戴维·C·戴蒙德
刘利平
谢志东
<120>表位序列
<130>CTLIMM.027QPC
<150>US 60/282,211
<151>2001-04-06
<150>US 60/337,017
<151>2001-11-07
<150>US 60/363,210
<151>2002-07-03
<160>602
<170>FastSEQ for Windows Version 4.0
<210>1
<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>1
Phe Leu Pro Trp His Arg Leu Phe Leu Leu
1 5 10
<210>2
<211>529
<212>PRT
<213>人
<400> 2
Met Leu Leu Ala Val Leu Tyr Cys Leu Leu Trp Ser Phe Gln Thr Ser
1 5 10 15
Ala Gly His Phe Pro Arg Ala Cys Val Ser Ser Lys Asn Leu Met Glu
20 25 30
Lys Glu Cys Cys Pro Pro Trp Ser Gly Asp Arg Ser Pro Cys Gly Gln
35 40 45
Leu Ser Gly Arg Gly Ser Cys Gln Asn Ile Leu Leu Ser Asn Ala Pro
50 55 60
Leu Gly Pro Gln Phe Pro Phe Thr Gly Val Asp Asp Arg Glu Ser Trp
65 70 75 80
Pro Ser Val Phe Tyr Asn Arg Thr Cys Gln Cys Ser Gly Asn Phe Met
85 90 95
Gly Phe Asn Cys Gly Asn Cys Lys Phe Gly Phe Trp Gly Pro Asn Cys
100 105 110
Thr Glu Arg Arg Leu Leu Val Arg Arg Asn Ile Phe Asp Leu Ser Ala
115 120 125
Pro Glu Lys Asp Lys Phe Phe Ala Tyr Leu Thr Leu Ala Lys His Thr
130 135 140
Ile Ser Ser Asp Tyr Val Ile Pro Ile Gly Thr Tyr Gly Gln Met Lys
145 150 155 160
Asn Gly Ser Thr Pro Met Phe Asn Asp Ile Asn Ile Tyr Asp Leu Phe
165 170 175
Val Trp Met His Tyr Tyr Val Ser Met Asp Ala Leu Leu Gly Gly Ser
180 185 190
Glu Ile Trp Arg Asp Ile Asp Phe Ala His Glu Ala Pro Ala Phe Leu
195 200 205
Pro Trp His Arg Leu Phe Leu Leu Arg Trp Glu Gln Glu Ile Gln Lys
210 215 220
Leu Thr Gly Asp Glu Asn Phe Thr Ile Pro Tyr Trp Asp Trp Arg Asp
225 230 235 240
Ala Glu Lys Cys Asp Ile Cys Thr Asp Glu Tyr Met Gly Gly Gln His
245 250 255
PC030722. seq
Pro Thr Asn Pro Asn Leu Leu Ser Pro Ala Ser Phe Phe Ser Ser Trp
260 265 270
Gln Ile Val Cys Ser Arg Leu Glu Glu Tyr Asn Ser His Gln Ser Leu
275 280 285
Cys Asn Gly Thr Pro Glu Gly Pro Leu Arg Arg Asn Pro Gly Asn His
290 295 300
Asp Lys Ser Arg Thr Pro Arg Leu Pro Ser Ser Ala Asp Val Glu Phe
305 310 315 320
Cys Leu Ser Leu Thr Gln Tyr Glu Ser Gly Ser Met Asp Lys Ala Ala
325 330 335
Asn Phe Ser Phe Arg Asn Thr Leu Glu Gly Phe Ala Ser Pro Leu Thr
340 345 350
Gly Ile Ala Asp Ala Ser Gln Ser Ser Met His Asn Ala Leu His Ile
355 360 365
Tyr Met Asn Gly Thr Met Ser Gln Val Gln Gly Ser Ala Asn Asp Pro
370 375 380
Ile Phe Leu Leu His His Ala Phe Val Asp Ser Ile Phe Glu Gln Trp
385 390 395 400
Leu Arg Arg His Arg Pro Leu Gln Glu Val Tyr Pro Glu Ala Asn Ala
405 410 415
Pro Ile Gly His Asn Arg Glu Ser Tyr Met Val Pro Phe Ile Pro Leu
420 425 430
Tyr Arg Asn Gly Asp Phe Phe Ile Ser Ser Lys Asp Leu Gly Tyr Asp
435 440 445
Tyr Ser Tyr Leu Gln Asp Ser Asp Pro Asp Ser Phe Gln Asp Tyr Ile
450 455 460
Lys Ser Tyr Leu Glu Gln Ala Ser Arg Ile Trp Ser Trp Leu Leu Gly
465 470 475 480
Ala Ala Met Val Gly Ala Val Leu Thr Ala Leu Leu Ala Gly Leu Val
485 490 495
Ser Leu Leu Cys Arg His Lys Arg Lys Gln Leu Pro Glu Glu Lys Gln
500 505 510
Pro Leu Leu Met Glu Lys Glu Asp Tyr His Ser Leu Tyr Gln Ser His
515 520 525
Leu
<210>3
<211>188
<212>PRT
<213>人
<400>3
Met Asn Gly Asp Asp Ala Phe Ala Arg Arg Pro Thr Val Gly Ala Gln
1 5 10 15
Ile Pro Glu Lys Ile Gln Lys Ala Phe Asp Asp Ile Ala Lys Tyr Phe
20 25 30
Ser Lys Glu Glu Trp Glu Lys Met Lys Ala Ser Glu Lys Ile Phe Tyr
35 40 45
Val Tyr Met Lys Arg Lys Tyr Glu Ala Met Thr Lys Leu Gly Phe Lys
50 55 60
Ala Thr Leu Pro Pro Phe Met Cys Asn Lys Arg Ala Glu Asp Phe Gln
65 70 75 80
Gly Asn Asp Leu Asp Asn Asp Pro Asn Arg Gly Asn Gln Val Glu Arg
85 90 95
Pro Gln Met Thr Phe Gly Arg Leu Gln Gly Ile Ser Pro Lys Ile Met
100 105 110
Pro Lys Lys Pro Ala Glu Glu Gly Asn Asp Ser Glu Glu Val Pro Glu
115 120 125
Ala Ser Gly Pro Gln Asn Asp Gly Lys Glu Leu Cys Pro Pro Gly Lys
130 135 140
Pro Thr Thr Ser Glu Lys Ile His Glu Arg Ser Gly Pro Lys Arg Gly
145 150 155 160
Glu His Ala Trp Thr His Arg Leu Arg Glu Arg Lys Gln Leu Val Ile
165 170 175
Tyr Glu Glu Ile Ser Asp Pro Glu Glu Asp Asp Glu
180 185
<210>4
<211>750
<212>PRT
<213>人
PC030722. seq
<400>4
Met Trp Asn Leu Leu His Glu Thr Asp Ser Ala Val Ala Thr Ala Arg
1 5 10 15
Arg Pro Arg Trp Leu Cys Ala Gly Ala Leu Val Leu Ala Gly Gly Phe
20 25 30
Phe Leu Leu Gly Phe Leu Phe Gly Trp Phe Ile Lys Ser Ser Asn Glu
35 40 45
Ala Thr Asn Ile Thr Pro Lys His Asn Met Lys Ala Phe Leu Asp Glu
50 55 60
Leu Lys Ala Glu Asn Ile Lys Lys Phe Leu Tyr Asn Phe Thr Gln Ile
65 70 75 80
Pro His Leu Ala Gly Thr Glu Gln Asn Phe Gln Leu Ala Lys Gln Ile
85 90 95
Gln Ser Gln Trp Lys Glu Phe Gly Leu Asp Ser Val Glu Leu Ala His
100 105 110
Tyr Asp Val Leu Leu Ser Tyr Pro Asn Lys Thr His Pro Asn Tyr Ile
115 120 125
Ser Ile Ile Asn Glu Asp Gly Asn Glu Ile Phe Asn Thr Ser Leu Phe
130 135 140
Glu Pro Pro Pro Pro Gly Tyr Glu Asn Val Ser Asp Ile Val Pro Pro
145 150 155 160
Phe Ser Ala Phe Ser Pro Gln Gly Met Pro Glu Gly Asp Leu Val Tyr
165 170 175
Val Asn Tyr Ala Arg Thr Glu Asp Phe Phe Lys Leu Glu Arg Asp Met
180 185 190
Lys Ile Asn Cys Ser Gly Lys Ile Val Ile Ala Arg Tyr Gly Lys Val
195 200 205
Phe Arg Gly Asn Lys Val Lys Asn Ala Gln Leu Ala Gly Ala Lys Gly
210 215 220
Val Ile Leu Tyr Ser Asp Pro Ala Asp Tyr Phe Ala Pro Gly Val Lys
225 230 235 240
Ser Tyr Pro Asp Gly Trp Asn Leu Pro Gly Gly Gly Val Gln Arg Gly
245 250 255
Asn Ile Leu Asn Leu Asn Gly Ala Gly Asp Pro Leu Thr Pro Gly Tyr
260 265 270
Pro Ala Asn Glu Tyr Ala Tyr Arg Arg Gly Ile Ala Glu Ala Val Gly
275 280 285
Leu Pro Ser Ile Pro Val His Pro Ile Gly Tyr Tyr Asp Ala Gln Lys
290 295 300
Leu Leu Glu Lys Met Gly Gly Ser Ala Pro Pro Asp Ser Ser Trp Arg
305 310 315 320
Gly Ser Leu Lys Val Pro Tyr Asn Val Gly Pro Gly Phe Thr Gly Asn
325 330 335
Phe Ser Thr Gln Lys Val Lys Met His Ile His Ser Thr Asn Glu Val
340 345 350
Thr Arg Ile Tyr Asn Val Ile Gly Thr Leu Arg Gly Ala Val Glu Pro
355 360 365
Asp Arg Tyr Val Ile Leu Gly Gly His Arg Asp Ser Trp Val Phe Gly
370 375 380
Gly Ile Asp Pro Gln Ser Gly Ala Ala Val Val His Glu Ile Val Arg
385 390 395 400
Ser Phe Gly Thr Leu Lys Lys Glu Gly Trp Arg Pro Arg Arg Thr Ile
405 410 415
Leu Phe Ala Ser Trp Asp Ala Glu Glu Phe Gly Leu Leu Gly Ser Thr
420 425 430
Glu Trp Ala Glu Glu Asn Ser Arg Leu Leu Gln Glu Arg Gly Val Ala
435 440 445
Tyr Ile Asn Ala Asp Ser Ser Ile Glu Gly Asn Tyr Thr Leu Arg Val
450 455 460
Asp Cys Thr Pro Leu Met Tyr Ser Leu Val His Asn Leu Thr Lys Glu
465 470 475 480
Leu Lys Ser Pro Asp Glu Gly Phe Glu Gly Lys Ser Leu Tyr Glu Ser
485 490 495
Trp Thr Lys Lys Ser Pro Ser Pro Glu Phe Ser Gly Met Pro Arg Ile
500 505 510
Ser Lys Leu Gly Ser Gly Asn Asp Phe Glu Val Phe Phe Gln Arg Leu
515 520 525
Gly Ile Ala Ser Gly Arg Ala Arg Tyr Thr Lys Asn Trp Glu Thr Asn
530 535 540
Lys Phe Ser Gly Tyr Pro Leu Tyr His Ser Val Tyr Glu Thr Tyr Glu
545 550 555 560
Leu Val Glu Lys Phe Tyr Asp Pro Met Phe Lys Tyr His Leu Thr Val
565 570 575
Ala Gln Val Arg Gly Gly Met Val Phe Glu Leu Ala Asn Ser Ile Val
580 585 590
PC030722.seq
Leu Pro Phe Asp Cys Arg Asp Tyr Ala Val Val Leu Arg Lys Tyr Ala
595 600 605
Asp Lys Ile Tyr Ser Ile Ser Met Lys His Pro Gln Glu Met Lys Thr
610 615 620
Tyr Ser Val Ser Phe Asp Ser Leu Phe Ser Ala Val Lys Asn Phe Thr
625 630 635 640
Glu Ile Ala Ser Lys Phe Ser Glu Arg Leu Gln Asp Phe Asp Lys Ser
645 650 655
Asn Pro Ile Val Leu Arg Met Met Asn Asp Gln Leu Met Phe Leu Glu
660 665 670
Arg Ala Phe Ile Asp Pro Leu Gly Leu Pro Asp Arg Pro Phe Tyr Arg
675 680 685
His Val Ile Tyr Ala Pro Ser Ser His Asn Lys Tyr Ala Gly Glu Ser
690 695 700
Phe Pro Gly Ile Tyr Asp Ala Leu Phe Asp Ile Glu Ser Lys Val Asp
705 710 715 720
Pro Ser Lys Ala Trp Gly Glu Val Lys Arg Gln Ile Tyr Val Ala Ala
725 730 735
Phe Thr Val Gln Ala Ala Ala Glu Thr Leu Ser Glu Val Ala
740 745 750
<210>5
<211>1964
<212>DNA
<213>人
<400>5
atcactgtag tagtagctgg aaagagaaat ctgtgactcc aattagccag ttcctgcaga 60
ccttgtgagg actagaggaa gaatgctcct ggctgttttg tactgcctgc tgtggagttt 120
ccagacctcc gctggccatt tccctagagc ctgtgtctcc tctaagaacc tgatggagaa 180
ggaatgctgt ccaccgtgga gcggggacag gagtccctgt ggccagcttt caggcagagg 240
ttcctgtcag aatatccttc tgtccaatgc accacttggg cctcaatttc ccttcacagg 300
ggtggatgac cgggagtcgt ggccttccgt cttttataat aggacctgcc agtgctctgg 360
caacttcatg ggattcaact gtggaaactg caagtttggc ttttggggac caaactgcac 420
agagagacga ctcttggtga gaagaaacat cttcgatttg agtgccccag agaaggacaa 480
attttttgcc tacctcactt tagcaaagca taccatcagc tcagactatg tcatccccat 540
agggacctat ggccaaatga aaaatggatc aacacccatg tttaacgaca tcaatattta 600
tgacctcttt gtctggatgc attattatgt gtcaatggat gcactgcttg ggggatctga 660
aatctggaga gacattgatt ttgcccatga agcaccagct tttctgcctt ggcatagact 720
cttcttgttg cggtgggaac aagaaatcca gaagctgaca ggagatgaaa acttcactat 780
tccatattgg gactggcggg atgcagaaaa gtgtgacatt tgcacagatg agtacatggg 840
aggtcagcac cccacaaatc ctaacttact cagcccagca tcattcttct cctcttggca 900
gattgtctgt agccgattgg aggagtacaa cagccatcag tctttatgca atggaacgcc 960
cgagggacct ttacggcgta atcctggaaa ccatgacaaa tccagaaccc caaggctccc 1020
ctcttcagct gatgtagaat tttgcctgag tttgacccaa tatgaatctg gttccatgga 1080
taaagctgcc aatttcagct ttagaaatac actggaagga tttgctagtc cacttactgg 1140
gatagcggat gcctctcaaa gcagcatgca caatgccttg cacatctata tgaatggaac 1200
aatgtcccag gtacagggat ctgccaacga tcctatcttc cttcttcacc atgcatttgt 1260
tgacagtatt tttgagcagt ggctccgaag gcaccgtcct cttcaagaag tttatccaga 1320
agccaatgca cccattggac ataaccggga atcctacatg gttcctttta taccactgta 1380
cagaaatggt gatttcttta tttcatccaa agatctgggc tatgactata gctatctaca 1440
agattcagac ccagactctt ttcaagacta cattaagtcc tatttggaac aagcgagtcg 1500
gatctggtca tggctccttg gggcggcgat ggtaggggcc gtcctcactg ccctgctggc 1560
agggcttgtg agcttgctgt gtcgtcacaa gagaaagcag cttcctgaag aaaagcagcc 1620
actcctcatg gagaaagagg attaccacag cttgtatcag agccatttat aaaaggctta 1680
ggcaatagag tagggccaaa aagcctgacc tcactctaac tcaaagtaat gtccaggttc 1740
ccagagaata tctgctggta tttttctgta aagaccattt gcaaaattgt aacctaatac 1800
aaagtgtagc cttcttccaa ctcaggtaga acacacctgt ctttgtcttg ctgttttcac 1860
tcagcccttt taacattttc ccctaagccc atatgtctaa ggaaaggatg ctatttggta 1920
atgaggaact gttatttgta tgtgaattaa agtgctctta tttt 1964
<210>6
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<212>DNA
<213>人
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ctctctttcg attcttccat actcagagta cgcacggtct gattttctct ttggattctt 60
ccaaaatcag agtcagactg ctcccggtgc catgaacgga gacgacgcct ttgcaaggag 120
acccacggtt ggtgctcaaa taccagagaa gatccaaaag gccttcgatg atattgccaa 180
atacttctct aaggaagagt gggaaaagat gaaagcctcg gagaaaatct tctatgtgta 240
tatgaagaga aagtatgagg ctatgactaa actaggtttc aaggccaccc tcccaccttt 300
catgtgtaat aaacgggccg aagacttcca ggggaatgat ttggataatg accctaaccg 360
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PC030722.seq
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gagaaaacag ctggtgattt atgaagagat cagcgaccct gaggaagatg acgagtaact 660
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gatggaaatg agattttcaa cacatcatta tttgaaccac ctcctccagg atatgaaaat 720
gtttcggata ttgtaccacc tttcagtgct ttctctcctc aaggaatgcc agagggcgat 780
ctagtgtatg ttaactatgc acgaactgaa gacttcttta aattggaacg ggacatgaaa 840
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cagcgtggaa atatcctaaa tctgaatggt gcaggagacc ctctcacacc aggttaccca 1080
gcaaatgaat atgcttatag gcgtggaatt gcagaggctg ttggtcttcc aagtattcct 1140
gttcatccaa ttggatacta tgatgcacag aagctcctag aaaaaatggg tggctcagca 1200
ccaccagata gcagctggag aggaagtctc aaagtgccct acaatgttgg acctggcttt 1260
actggaaact tttctacaca aaaagtcaag atgcacatcc actctaccaa tgaagtgaca 1320
agaatttaca atgtgatagg tactctcaga ggagcagtgg aaccagacag atatgtcatt 1380
ctgggaggtc accgggactc atgggtgttt ggtggtattg accctcagag tggagcagct 1440
gttgttcatg aaattgtgag gagctttgga acactgaaaa aggaagggtg gagacctaga 1500
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aaaaaaaaaa aaa 2653
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Leu Pro Trp His Arg Leu Phe Leu Leu
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Met Lys Ala Ser Glu Lys Ile Phe Tyr
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Gly Met Pro Glu Gly Asp Leu Val Tyr Val Asn Tyr Ala Arg Thr Glu
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Gly Met Pro Glu Gly Asp Leu Val Tyr Val
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Tyr Val Asn Tyr Ala Arg Thr Glu Asp Phe
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Asn Tyr Ala Arg Thr Glu Asp Phe Phe
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Pro Ile Gly Tyr Tyr Asp Ala Gln Lys Leu
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Ile Glu Gly Asn Tyr Thr Leu Arg Val
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Ser Ile Glu Gly Asn Tyr Thr Leu Arg Val
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Glu Gly Asn Tyr Thr Leu Arg Val
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Thr Leu Arg Val Asp Cys Thr Pro Leu
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Phe Asp Lys Ser Asn Pro Ile Val Leu Arg Met Met Asn Asp Gln Leu
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Met Asp Leu Val Leu Lys Arg Cys Leu Leu His Leu Ala Val Ile Gly
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Ala Leu Leu Ala Val Gly Ala Thr Lys Val Pro Arg Asn Gln Asp Trp
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Leu Gly Val Ser Arg Gln Leu Arg Thr Lys Ala Trp Asn Arg Gln Leu
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Tyr Pro Glu Trp Thr Glu Ala Gln Arg Leu Asp Cys Trp Arg Gly Gly
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Asn Ala Ser Phe Ser Ile Ala Leu Asn Phe Pro Gly Ser Gln Lys Val
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Leu Pro Asp Gly Gln Val Ile Trp Val Asn Asn Thr Ile Ile Asn Gly
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Ser Gln Val Trp Gly Gly Gln Pro Val Tyr Pro Gln Glu Thr Asp Asp
115 120 125
Ala Cys Ile Phe Pro Asp Gly Gly Pro Cys Pro Ser Gly Ser Trp Ser
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Gln Lys Arg Ser Phe Val Tyr Val Trp Lys Thr Trp Gly Gln Tyr Trp
145 150 155 160
Gln Val Leu Gly Gly Pro Val Ser Gly Leu Ser Ile Gly Thr Gly Arg
165 170 175
Ala Met Leu Gly Thr His Thr Met Glu Val Thr Val Tyr His Arg Arg
180 185 190
Gly Ser Arg Ser Tyr Val Pro Leu Ala His Ser Ser Ser Ala Phe Thr
195 200 205
Ile Thr Asp Gln Val Pro Phe Ser Val Ser Val Ser Gln Leu Arg Ala
210 215 220
Leu Asp Gly Gly Asn Lys His Phe Leu Arg Asn Gln Pro Leu Thr Phe
225 230 235 240
Ala Leu Gln Leu His Asp Pro Ser Gly Tyr Leu Ala Glu Ala Asp Leu
245 250 255
Ser Tyr Thr Trp Asp Phe Gly Asp Ser Ser Gly Thr Leu Ile Ser Arg
260 265 270
Ala Pro Val Val Thr His Thr Tyr Leu Glu Pro Gly Pro Val Thr Ala
275 280 285
Gln Val Val Leu Gln Ala Ala Ile Pro Leu Thr Ser Cys Gly Ser Ser
290 295 300
Pro Val Pro Gly Thr Thr Asp Gly His Arg Pro Thr Ala Glu Ala Pro
305 310 315 320
Asn Thr Thr Ala Gly Gln Val Pro Thr Thr Glu Val Val Gly Thr Thr
325 330 335
Pro Gly Gln Ala Pro Thr Ala Glu Pro Ser Gly Thr Thr Ser Val Gln
PC030722.seq
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Val Pro Thr Thr Glu Val Ile Ser Thr Ala Pro Val Gln Met Pro Thr
355 360 365
Ala Glu Ser Thr Gly Met Thr Pro Glu Lys Val Pro Val Ser Glu Val
370 375 380
Met Gly Thr Thr Leu Ala Glu Met Ser Thr Pro Glu Ala Thr Gly Met
385 390 395 400
Thr Pro Ala Glu Val Ser Ile Val Val Leu Ser Gly Thr Thr Ala Ala
405 410 415
Gln Val Thr Thr Thr Glu Trp Val Glu Thr Thr Ala Arg Glu Leu Pro
420 425 430
Ile Pro Glu Pro Glu Gly Pro Asp Ala Ser Ser Ile Met Ser Thr Glu
435 440 445
Ser Ile Thr Gly Ser Leu Gly Pro Leu Leu Asp Gly Thr Ala Thr Leu
450 455 460
Arg Leu Val Lys Arg Gln Val Pro Leu Asp Cys Val Leu Tyr Arg Tyr
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Gly Ser Phe Ser Val Thr Leu Asp Ile Val Gln Gly Ile Glu Ser Ala
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Glu Ile Leu Gln Ala Val Pro Ser Gly Glu Gly Asp Ala Phe Glu Leu
500 505 510
Thr Val Ser Cys Gln Gly Gly Leu Pro Lys Glu Ala Cys Met Glu Ile
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Ser Ser Pro Gly Cys Gln Pro Pro Ala Gln Arg Leu Cys Gln Pro Val
530 535 540
Leu Pro Ser Pro Ala Cys Gln Leu Val Leu His Gln Ile Leu Lys Gly
545 550 555 560
Gly Ser Gly Thr Tyr Cys Leu Asn Val Ser Leu Ala Asp Thr Asn Ser
565 570 575
Leu Ala Val Val Ser Thr Gln Leu Ile Met Pro Gly Gln Glu Ala Gly
580 585 590
Leu Gly Gln Val Pro Leu Ile Val Gly Ile Leu Leu Val Leu Met Ala
595 600 605
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Phe Ser Val Pro Gln Leu Pro His Ser Ser Ser His Trp Leu Arg Leu
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Pro Arg Ile Phe Cys Ser Cys Pro Ile Gly Glu Asn Ser Pro Leu Leu
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660
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<212>PRT
<213>人
<400>71
Met Ser Leu Glu Gln Arg Ser Leu His Cys Lys Pro Glu Glu Ala Leu
1 5 10 15
Glu Ala Gln Gln Glu Ala Leu Gly Leu Val Cys Val Gln Ala Ala Thr
20 25 30
Ser Ser Ser Ser Pro Leu Val Leu Gly Thr Leu Glu Glu Val Pro Thr
35 40 45
Ala Gly Ser Thr Asp Pro Pro Gln Ser Pro Gln Gly Ala Ser Ala Phe
50 55 60
Pro Thr Thr Ile Asn Phe Thr Arg Gln Arg Gln Pro Ser Glu Gly Ser
65 70 75 80
Ser Ser Arg Glu Glu Glu Gly Pro Ser Thr Ser Cys Ile Leu Glu Ser
85 90 95
Leu Phe Arg Ala Val Ile Thr Lys Lys Val Ala Asp Leu Val Gly Phe
100 105 110
Leu Leu Leu Lys Tyr Arg Ala Arg Glu Pro Val Thr Lys Ala Glu Met
115 120 125
Leu Glu Ser Val Ile Lys Asn Tyr Lys His Cys Phe Pro Glu Ile Phe
130 135 140
Gly Lys Ala Ser Glu Ser Leu Gln Leu Val Phe Gly Ile Asp Val Lys
145 150 155 160
Glu Ala Asp Pro Thr Gly His Ser Tyr Val Leu Val Thr Cys Leu Gly
165 170 175
Leu Ser Tyr Asp Gly Leu Leu Gly Asp Asn Gln Ile Met Pro Lys Thr
180 185 190
Gly Phe Leu Ile Ile Val Leu Val Met Ile Ala Met Glu Gly Gly His
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PC030722.seq
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Asp Gly Arg Glu His Ser Ala Tyr Gly Glu Pro Arg Lys Leu Leu Thr
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Gln Asp Leu Val Gln Glu Lys Tyr Leu Glu Tyr Arg Gln Val Pro Asp
245 250 255
Ser Asp Pro Ala Arg Tyr Glu Phe Leu Trp Gly Pro Arg Ala Leu Ala
260 265 270
Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val Leu Glu Tyr ValIle Lys Val Ser Ala
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Arg Val Arg Phe Phe Phe Pro Ser Leu Arg Glu Ala Ala Leu Arg Glu
290 295 300
Glu Glu Glu Gly Val
305
<210>72
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<212>PRT
<213>人
<400>72
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1 5 10 15
Glu Ala Arg Gly Glu Ala Leu Gly Leu Val Gly Ala Gln Ala Pro Ala
20 25 30
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35 40 45
Thr Leu Gly Glu Val Pro Ala Ala Asp Ser Pro Ser Pro Pro His Ser
50 55 60
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65 70 75 80
Arg Gln Ser Asp Glu Gly Ser Ser Asn Gln Glu Glu Glu Gly Pro Arg
85 90 95
Met Phe Pro Asp Leu Glu Ser Glu Phe Gln Ala Ala Ile Ser Arg Lys
100 105 110
Met Val Glu Leu Val His Phe Leu Leu Leu Lys Tyr Arg Ala Arg Glu
115 120 125
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130 135 140
Asp Phe Phe Pro Val Ile Phe Ser Lys Ala Ser Glu Tyr Leu Gln Leu
145 150 155 160
Val Phe Gly Ile Glu Val Val Glu Val Val Pro Ile Ser His Leu Tyr
165 170 175
Ile Leu Val Thr Cys Leu Gly Leu Ser Tyr Asp Gly Leu Leu Gly Asp
180 185 190
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195 200 205
Ile Ala Ile Glu Gly Asp Cys Ala Pro Glu Glu Lys Ile Trp Glu Glu
210 215 220
Leu Ser Met Leu Glu Val Phe Glu Gly Arg Glu Asp Ser Val Phe Ala
225 230 235 240
His Pro Arg Lys Leu Leu Met Gln Asp Leu Val Gln Glu Asn Tyr Leu
245 250 255
Glu Tyr Arg Gln Val Pro Gly Ser Asp Pro Ala Cys Tyr Glu Phe Leu
260 265 270
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275 280 285
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290 295 300
His Glu Arg Ala Leu Arg Glu Gly Glu Glu
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<211>314
<212>PRT
<213>人
<400>73
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1 5 10 15
Glu Ala Arg Gly Glu Ala Leu Gly Leu Val Gly Ala Gln Ala Pro Ala
20 25 30
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PC030722. seq
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165 170 175
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180 185 190
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Ile Ala Arg Glu Gly Asp Cys Ala Pro Glu Glu Lys Ile Trp Glu Glu
210 215 220
Leu Ser Val Leu Glu Val Phe Glu Gly Arg Glu Asp Ser Ile Leu Gly
225 230 235 240
Asp Pro Lys Lys Leu Leu Thr Gln His Phe Val Gln Glu Asn Tyr Leu
245 250 255
Glu Tyr Arg Gln Val Pro Gly Ser Asp Pro Ala Cys Tyr Glu Phe Leu
260 265 270
Trp Gly Pro Arg Ala Leu Val Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val Leu His
275 280 285
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290 295 300
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Gly Pro Gly Glu Ala Gly Ala Thr Gly Gly Arg Gly Pro Arg Gly Ala
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Gly Ala Ala Arg Ala Ser Gly Pro Gly Gly Gly Ala Pro Arg Gly Pro
50 55 60
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65 70 75 80
Arg Gly Pro Glu Ser Arg Leu Leu Glu Phe Tyr Leu Ala Met Pro Phe
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<211>180
<212>PRT
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Gly Gln Arg Arg
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Thr Cys Thr Trp Lys Leu Pro Thr Leu Ala Lys Phe Ser Pro Tyr Leu
245 250 255
Gly Gln Met Ile Asn Leu Arg Arg Leu Leu Leu Ser His Ile His Ala
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Ser Ser Tyr Ile Ser Pro Glu Lys Glu Glu Gln Tyr Ile Ala Gln Phe
275 280 285
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<211>2817
<212>DNA
<213>人
<400> 80
gtgctaaaaa gatgccttct tcatttggct gtgataggtg ctttgtggct gtgggggcta 60
caaaagtacc cagaaaccag gactggcttg gtgtctcaag gcaactcaga accaaagcct 120
ggaacaggca gctgtatcca gagtggacag aagcccagag acttgactgc tggagaggtg 180
gtcaagtgtc cctcaaggtc agtaatgatg ggcctacact gattggtgca aatgcctcct 240
tctctattgc cttgaacttc cctggaagcc aaaaggtatt gccagatggg caggttatct 300
gggtcaacaa taccatcatc aatgggagcc aggtgtgggg aggacagcca gtgtatcccc 360
aggaaactga cgatgcctgc atcttccctg atggtggacc ttgcccatct ggctcttggt 420
ctcagaagag aagctttgtt tatgtctgga agacctgggg tgagggactc ccttctcagc 480
ctatcatcca cacttgtgtt tacttctttc tacctgatca cctttctttt ggccgcccct 540
tccaccttaa cttctgtgat tttctctaat cttcattttc ctcttagatc ttttctcttt 600
cttagcacct agcccccttc aagctctatc ataattcttt ctggcaactc ttggcctcaa 660
ttgtagtcct accccatgga atgcctcatt aggacccctt ccctgtcccc ccatatcaca 720
gccttccaaa caccctcaga agtaatcata cttcctgacc tcccatctcc agtgccgttt 780
cgaagcctgt ccctcagtcc cctttgacca gtaatctctt cttccttgct tttcattcca 840
aaaatgcttc aggccaatac tggcaagttc tagggggccc agtgtctggg ctgagcattg 900
ggacaggcag ggcaatgctg ggcacacaca ccatggaagt gactgtctac catcgccggg 960
gatcccggag ctatgtgcct cttgctcatt ccagctcagc cttcaccatt actggtaagg 1020
gttcaggaag ggcaaggcca gttgtagggc aaagagaagg cagggaggct tggatggact 1080
gcaaaggaga aaggtgaaat gctgtgcaaa cttaaagtag aagggccagg aagacctagg 1140
PC030722.seq
cagagaaatg tgaggcttag tgccagtgaa gggccagcca gtcagcttgg agttggaggg 1200
tgtggctgtg aaaggagaag ctgtggctca ggcctggttc tcaccttttc tggctccaat 1260
cccagaccag gtgcctttct ccgtgagcgt gtcccagttg cgggccttgg atggagggaa 1320
caagcacttc ctgagaaatc agcctctgac ctttgccctc cagctccatg accccagtgg 1380
ctatctggct gaagctgacc tctcctacac ctgggacttt ggagacagta gtggaaccct 1440
gatctctcgg gcacctgtgg tcactcatac ttacctggag cctggcccag tcactgccca 1500
ggtggtcctg caggctgcca ttcctctcac ctcctgtggc tcctccccag ttccaggcac 1560
cacagatggg cacaggccaa ctgcagaggc ccctaacacc acagctggcc aagtgcctac 1620
tacagaagtt gtgggtacta cacctggtca ggcgccaact gcagagccct ctggaaccac 1680
atctgtgcag gtgccaacca ctgaagtcat aagcactgca cctgtgcaga tgccaactgc 1740
agagagcaca ggtatgacac ctgagaaggt gccagtttca gaggtcatgg gtaccacact 1800
ggcagagatg tcaactccag aggctacagg tatgacacct gcagaggtat caattgtggt 1860
gctttctgga accacagctg cacaggtaac aactacagag tgggtggaga ccacagctag 1920
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tattacaggt tccctgggcc ccctgctgga tggtacagcc accttaaggc tggtgaagag 2040
acaagtcccc ctggattgtg ttctgtatcg atatggttcc ttttccgtca ccctggacat 2100
tgtccagggt attgaaagtg ccgagatcct gcaggctgtg ccgtccggtg agggggatgc 2160
atttgagctg actgtgtcct gccaaggcgg gctgcccaag gaagcctgca tggagatctc 2220
atcgccaggg tgccagcccc ctgcccagcg gctgtgccag cctgtgctac ccagcccagc 2280
ctgccagctg gttctgcacc agatactgaa gggtggctcg gggacatact gcctcaatgt 2340
gtctctggct gataccaaca gcctggcagt ggtcagcacc cagcttatca tgcctggtag 2400
gtccttggac agagactaag tgaggaggga agtggataga ggggacagct ggcaagcagc 2460
agacatgagt gaagcagtgc ctgggattct tctcacaggt caagaagcag gccttgggca 2520
ggttccgctg atcgtgggca tcttgctggt gttgatggct gtggtccttg catctctgat 2580
atataggcgc agacttatga agcaagactt ctccgtaccc cagttgccac atagcagcag 2640
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agaaacacct atatttcccc cagtcttccc tgggagacta ctattaactg aaataaa 2817
<210>81
<211>2420
<212>DNA
<213>人
<400>81
ggatccaggc cctgccagga aaaatataag ggccctgcgt gagaacagag ggggtcatcc 60
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cagggctgtg cttgcggtct gcaccctgag ggcccgtgga ttcctcttcc tggagctcca 180
ggaaccaggc agtgaggcct tggtctgaga cagtatcctc aggtcacaga gcagaggatg 240
cacagggtgt gccagcagtg aatgtttgcc ctgaatgcac accaagggcc ccacctgcca 300
caggacacat aggactccac agagtctggc ctcacctccc tactgtcagt cctgtagaat 360
cgacctctgc tggccggctg taccctgagt accctctcac ttcctccttc aggttttcag 420
gggacaggcc aacccagagg acaggattcc ctggaggcca cagaggagca ccaaggagaa 480
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cacactccct ctctccccag gcctgtgggt cttcattgcc cagctcctgc ccacactcct 600
gcctgctgcc ctgacgagag tcatcatgtc tcttgagcag aggagtctgc actgcaagcc 660
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tttggaattg ttcaaatgtt tttttttaag ggatggttga atgaacttca gcatccaagt 1800
ttatgaatga cagcagtcac acagttctgt gtatatagtt taagggtaag agtcttgtgt 1860
tttattcaga ttgggaaatc cattctattt tgtgaattgg gataataaca gcagtggaat 1920
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tgctgctctg gggacccggc cagctatagg ctctgggggg ccccgctgca gcccacactg 420
ggtgtggtgc cccaggcctt tgtgccactc ctcacagaac ctggcccagt gggagcctgt 480
cctggttcct gaggcacatc ctaacgcaag tttgaccatg tatgtttgca ccccttttcc 540
ccnaaccctg accttcccat gggccttttc caggattccn accnggcaga tcagttttag 600
tganacanat ccgcntgcag atggcccctc caaccntttn tgttgntgtt tccatggccc 660
agcattttcc acccttaacc ctgtgttcag gcacttnttc ccccaggaag ccttccctgc 720
ccaccccatt tatgaattga gccaggtttg gtccgtggtg tcccccgcac ccagcagggg 780
acaggcaatc aggagggccc agtaaaggct gagatgaagt ggactgagta gaactggagg 840
acaagagttg acgtgagttc ctgggagttt ccagagatgg ggcctggagg cctggaggaa 900
ggggccaggc ctcacatttg tggggntccc gaatggcagc ctgagcacag cgtaggccct 960
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His Leu Ile Gly Leu Ser Asn Leu
1 5
PC030722.seq
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<212>PRT
<213>人
<400>209
Ile Gly Leu Ser Asn Leu Thr His Val
1 5
<210>210
<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>210
Leu Ile Gly Leu Ser Asn Leu Thr His Val
1 5 10
<210>211
<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>211
Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>212
Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu
1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>213
Gly Val Leu Val His Pro Gln Trp Val
1 5
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<212>PRT
<213>人
<400>214
Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Ile
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>215
Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala
1 5 10
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<211>10
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Val Leu VaL His Pro Gln Trp Val Leu Thr
1 5 10
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<213>人
<400>217
Leu Val His Pro Gln Trp Val Leu Thr
1 5
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<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>218
Cys Ile Arg Asn Lys Ser Val Ile
1 5
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<212>PRT
<213>人
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His Cys Ile Arg Asn Lys Ser Val Ile
1 5
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>220
His Pro Gln Trp Val Leu Thr Ala Ala
1 5
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<211>10
<212>PRT
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<400>221
Ala Ala His Cys Ile Arg Asn Lys Ser Val
1 5 10
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<212>PRT
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<400>222
Leu Leu Trp Gly Pro Gly Gln Leu
1 5
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Leu Leu Leu Trp Gly Pro Gly Gln Leu
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Gly Leu Leu Leu Trp Gly Pro Gly Gln Leu
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Ala Leu Gln Pro Ala Ala Ala Ile Leu
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His Ala Leu Gln Pro Ala Ala Ala Ile Leu
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Ala Pro Glu Lys Asp Lys Phe Phe Ala Tyr
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Pro Glu Lys Asp Lys Phe Phe Ala Tyr
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Glu Lys Asp Lys Phe Phe Ala Tyr Leu
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Lys Asp Lys Phe Phe Ala Tyr Leu
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Ala Pro Ala Phe Leu Pro Trp His Arg Leu
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Phe Leu Leu Arg Trp Glu Gln Glu Ile Gln
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<212>PRT
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<220>
<221>变体
<222>(8)...(8)
<223>Xaa＝His或Tyr
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Glu Asn Ile Lys Lys Phe Leu Xaa Asn Phe
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<213>人
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<213>人
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Ser Ser Cys Leu Gln Gln Leu Ser Leu Leu Met Trp Ile Thr Gln Cys
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20 25
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<211>8
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<213>人
<400>256
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Lys Ala Ser Glu Ser Leu Gln Leu
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Gly Lys Ala Ser Glu Ser Leu Gln Leu
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Ala Ser Glu Ser Leu Gln Leu Val Phe
1 5
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<213>人
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Leu Val Phe Gly Ile Asp Val Lys Glu
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<211>8
<212>PRT
<213>人
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Leu Leu Lys Tyr Arg Ala Arg Glu
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<213>人
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Val Ala Asp Leu Val Gly Phe Leu
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<400>268
Lys Val Ala Asp Leu Val Gly Phe Leu
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<211>9
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<213>人
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Ala Asp Leu Val Gly Phe Leu Leu Leu
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
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Val Ala Asp Leu Val Gly Phe Leu Leu Leu
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>271
Leu Leu Lys Tyr Arg Ala Arg Glu Pro Val
1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>272
Leu Val Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val
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<212>PRT
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<400>273
Ala Leu Val Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val
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Lys Val Leu His His Met Val Lys Ile
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Tyr Val Lys Val Leu His His Met Val
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<211>9
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<400>276
Pro Arg Ala Leu Val Glu Thr Ser Tyr
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>277
Gly Pro Arg Ala Leu Val Glu Thr Ser Tyr
1 5 10
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<211>10
<212>PRT
<213>人
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Leu Val Glu Thr Ser Tyr Val Lys Val Leu
1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
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Thr Ile Ile Pro Glu Val Pro Gln Leu
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>280
Asp Thr Ile Ile Pro Glu Val Pro Gln Leu
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>281
Glu Val Pro Gln Leu Thr Asp Leu Ser Phe
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<212>PRT
<213>人
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Thr Pro Leu Asn Ser Ser Thr Ile
1 5
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<211>8
<212>PRT
<213>人
<400> 283
Ile Gly Leu Arg Trp Thr Pro Leu
1 5
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>284
Ser Ile Gly Leu Arg Trp Thr Pro Leu
1 5
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>285
Leu Asn Ser Ser Thr Ile Ile Gly Tyr
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>286
Pro Leu Asn Ser Ser Thr Ile Ile Gly Tyr
1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>287
Thr Pro Leu Asn Ser Ser Thr Ile Ile
1 5
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<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>288
Ile Gly Tyr Arg Ile Thr Val Val
1 5
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>289
Ile Ile Gly Tyr Arg Ile Thr Val Val
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>290
Thr Ile Ile Gly Tyr Arg Ile Thr Val Val
1 5 10
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<211>9
<212>PRT
<213>人
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Ile Gly Tyr Arg Ile Thr Val Val Ala
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>292
Ile Ile Gly Tyr Arg Ile Thr Val Val Ala
1 5 10
<210>293
<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>293
Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu
1 5
<210>294
<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>294
Gln Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu
1 5
<210>295
<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>295
Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu
1 5
<210>296
<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>296
Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
PC030722.seq
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Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu
1 5 10
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<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>298
Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln
1 5
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>299
Gln Leu Ser Asn Gly Asn Arg Thr Leu
1 5
<210>300
<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>300
Leu Gln Leu Ser Asn Gly Asn Arg Thr Leu
1 5 10
<210>301
<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>301
Trp Val Asn Asn Gln Ser Leu Pro Val
1 5
<210>302
<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>302
Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu Ser
1 5
<210>303
<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>303
Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu
1 5
<210>304
<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>304
Gln Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu
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<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>305
Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu
1 5
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<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>306
Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>307
Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu
1 5 10
<210>308
<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>308
Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln
1 5
<210>309
<211>9
<212>PRT
<213>人
<400>309
Gln Leu Ser Asn Asp Asn Arg Thr Leu
1 5
<210>310
<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>310
Leu Gln Leu Ser Asn Asp Asn Arg Thr Leu
1 5 10
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<212>PRT
<213>人
<400>311
Trp Val Asn Asn Gln Ser Leu Pro Val
1 5
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<213>人
PC030722.seq
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Asn Gln Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg
1 5
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<213>人
<400>313
Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu
1 5
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<212>PRT
<213>人
<400>314
Gln Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu
1 5
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<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>315
Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu
1 5
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<212>PRT
<213>人
<400>316
Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu
1 5
<210>317
<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>317
Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg Leu Gln Leu
1 5 10
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<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>318
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1 5
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<213>人
<400>319
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1 5
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<212>PRT
<213>人
<400>320
Leu Gln Leu Ser Asn Gly Asn Arg Thr Leu
1 5 10
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<212>PRT
<213>人
<400>321
Trp Val Asn Gly Gln Ser Leu Pro Val
1 5
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<212>PRT
<213>人
<400>322
Leu Trp Trp Val Asn Gly Gln Ser Leu
1 5
<210>323
<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>323
Tyr Leu Trp Trp Val Asn Gly Gln Ser Leu
1 5 10
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<212>PRT
<213>人
<400>324
Gly Gln Ser Leu Pro Val Ser Pro Arg
1 5
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<212>PRT
<213>人
<400>325
Asp Met Lys Leu Arg Leu Pro Ala
1 5
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<211>10
<212>PRT
<213>人
<400>326
Gly Thr Asp Met Lys Leu Arg Leu Pro Ala
1 5 10
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<213>人
PC030722.seq
<400>327
His Leu Asp Met Leu Arg His Leu
1 5
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<213>人
<400>328
Thr His Leu Asp Met Leu Arg His Leu
1 5
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<212>PRT
<213>人
<400>329
Glu Thr His Leu Asp Met Leu Arg His Leu
1 5 10
<210>330
<211>8
<212>PRT
<213>人
<400>330
Pro Ala Ser Pro Glu Thr His Leu
1 5
<210>331
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<213>人
<400>331
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1 5
<210>332
<211>10
<212>PRT
<213>人
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Arg Leu Pro Ala Ser Pro Glu Thr His Leu
1 5 10
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<212>PRT
<213>人
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Ser Pro Glu Thr His Leu Asp Met Leu
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Ala Glu Leu Arg Gln Lys Glu Ser Lys Leu
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<213>人
<400>589
Glu Val Pro Gln Leu Thr Asp Leu Ser Phe Val Asp Ile Thr Asp Ser
1 5 10 15
Ser Ile Gly Leu Arg Trp Thr Pro Leu Asn Ser Ser Thr Ile Ile Gly
PC030722.seq
20 25 30
Tyr Arg Ile Thr Val Val Ala Ala Gly Glu Gly Ile Pro Ile Phe Glu
35 40 45
Asp Phe Val Asp Ser Ser Val Gly Tyr Tyr Thr Val Thr Gly Leu Glu
50 55 60
Pro Gly Ase Asp Tyr Asp Ile Ser Val Ile Thr Leu Ile Asn Gly Gly
65 70 75 80
Glu Ser Ala Pro Thr Thr Leu Thr Gln Gln Thr
85 90
<210>590
<211>147
<212>PRT
<213>人
<400>590
Cys Thr Phe Asp Asn Leu Ser Pro Gly Leu Glu Tyr Asn Val Ser Val
1 5 10 15
Tyr Thr Val Lys Asp Asp Lys Glu Ser Val Pro Ile Ser Asp Thr Ile
20 25 30
Ile Pro Glu Val Pro Gln Leu Thr Asp Leu Ser Phe Val Asp Ile Thr
35 40 45
Asp Ser Ser Ile Gly Leu Arg Trp Thr Pro Leu Asn Ser Ser Thr Ile
50 55 60
Ile Gly Tyr Arg Ile Thr Val Val Ala Ala Gly Glu Gly Ile Pro Ile
65 70 75 80
Phe Glu Asp Phe Val Asp Ser Ser Val Gly Tyr Tyr Thr Val Thr Gly
85 90 95
Leu Glu Pro Gly Ile Asp Tyr Asp Ile Ser Val Ile Thr Leu Ile Asn
100 105 110
Gly Gly Glu Ser Ala Pro Thr Thr Leu Thr Gln Gln Thr Ala Val Pro
115 120 125
Pro Pro Thr Asp Leu Arg Phe Thr Asn Ile Gly Pro Asp Thr Met Arg
130 135 140
Val Thr Trp
145
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<211>2823
<212>DNA
<213>人
<400>591
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caagaagtca aagcagcgat ttggacaaaa tgcttgctgt taacactgct ttactgtctg 300
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tttacaatcc atatcaattt ccaacagctg cctatttcat cttgcagttt caaatccttc 540
tttttgaaaa ttggatttta aaaaaaagtt aagtaaaagt cacaccttca gggttgttct 600
ttcttgtggc cttgaaagac aacattgcaa aggcctgtcc taaggatagg cttgtttgtc 660
cattgggtta taacataatg aaagcattgg acagatcgtg tccccctttg gactcttcag 720
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caatggcctt aacctaggcc tgtctttcct cagcctgaat gtgcttttga atggcacatt 840
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tgggagaaaa aaaatcaatt tatcacccat ttattatttt ttccggttgt tcatgcaagc 960
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aacattccac caattttact actagtaacc tgatatacac tgctttattt tttcctcttt 1320
ttttccctct attttccttt tgcctccccc tccctttgct ttgtaactca atagaggtgc 1380
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PC030722.seq
tgctaaactg attggagaaa aacacatgca atatcttcag tacactctca tttaaaccac 1860
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tgttcattca atttgaagac ctagaatttt tcttcttaaa taccaaacac gaataccaaa 1980
ttgcgtaagt accaattgat aagaatatat caccaaaatg taccatcatg ctcttccttc 2040
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ggtagagtgg atgggcattg ttttgaggta ggagaaaagt aaacttggga ccattctagg 2160
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ggg 2823
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<213>人
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Arg Leu Leu Leu Thr Ala Ser Leu Leu Thr Phe Trp Asn Pro Pro Thr
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Gly Tyr Val Ile Gly Thr Gln Gln Ala Thr Pro Gly Pro Ala Tyr Ser
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Leu Val Asn Glu Glu Ala Thr Gly Gln Phe Arg Val Tyr Pro Glu Leu
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Arg Ser Asp Ser Val Ile Leu Asn Val Leu Tyr Gly Pro Asp Ala Pro
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Thr Ile Ser Pro Leu Asn Thr Ser Tyr Arg Ser Gly Glu Asn Leu Asn
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Ile Thr Val Asn Asn Ser Gly Ser Tyr Thr Cys Gln Ala His Asn Ser
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Glu Pro Pro Lys Pro Phe Ile Thr Ser Asn Asn Ser Asn Pro Val Glu
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Leu Gln Leu Ser Asn Asp Asn Arg Thr Leu Thr Leu Leu Ser Val Thr
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Arg Asn Asp Val Gly Pro Tyr Glu Cys Gly Ile Gln Asn Glu Leu Ser
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Val Asp His Ser Asp Pro Val Ile Leu Asn Val Leu Tyr Gly Pro Asp
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Leu Ser Leu Ser Cys His Ala Ala Ser Asn Pro Pro Ala Gln Tyr Ser
435 440 445
Trp Leu Ile Asp Gly Asn Ile Gln Gln His Thr Gln Glu Leu Phe Ile
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Ser Asn Ile Thr Glu Lys Asn Ser Gly Leu Tyr Thr Cys Gln Ala Asn
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Asn Ser Ala Ser Gly His Ser Arg Thr Thr Val Lys Thr Ile Thr Val
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Ser Ala Glu Leu Pro Lys Pro Ser Ile Ser Ser Asn Asn Ser Lys Pro
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Val Thr Arg Asn Asp Ala Arg Ala Tyr Val Cys Gly Ile Gln Asn Ser
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Val Gly Ile Met Ile Gly Val Leu Val Gly Val Ala Leu Ile
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<212>DNA
<213>人
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<213>人
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Leu Pro Thr Asn Ala Ser Leu Ser Phe Leu Gln Asp Ile Gln Glu Val
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Gln Arg Leu Arg Ile Val Arg Gly Thr Gln Leu Phe Glu Asp Asn Tyr
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Ala Leu Ala Val Leu Asp Asn Gly Asp Pro Leu Asn Asn Thr Thr Pro
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Leu Thr Glu Ile Leu Lys Gly Gly Val Leu Ile Gln Arg Asn Pro Gln
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Leu Cys Tyr Gln Asp Thr Ile Leu Trp Lys Asp Ile Phe His Lys Asn
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Ser Glu Asp Cys Gln Ser Leu Thr Arg Thr Val Cys Ala Gly Gly Cys
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Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro Lys His Ser Asp Cys Leu Ala Cys Leu
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Glu Val Thr Ala Glu Asp Gly Thr Gln Arg Cys Glu Lys Cys Ser Lys
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Pro Ala Ser Asn Thr Ala Pro Leu Gln Pro Glu Gln Leu Gln Val Phe
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Glu Thr Leu Glu Glu Ile Thr Gly Tyr Leu Tyr Ile Ser Ala Trp Pro
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<212>DNA
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aattctcgag ctcgtcgacc ggtcgacgag ctcgagggtc gacgagctcg agggcgcgcg 60
cccggccccc acccctcgca gcaccccgcg ccccgcgccc tcccagccgg gtccagccgg 120
agccatgggg ccggagccgc agtgagcacc atggagctgg cggccttgtg ccgctggggg 180
ctcctcctcg ccctcttgcc ccccggagcc gcgagcaccc aagtgtgcac cggcacagac 240
atgaagctgc ggctccctgc cagtcccgag acccacctgg acatgctccg ccacctctac 300
cagggctgcc aggtggtgca gggaaacctg gaactcacct acctgcccac caatgccagc 360
ctgtccttcc tgcaggatat ccaggaggtg cagggctacg tgctcatcgc tcacaaccaa 420
gtgaggcagg tcccactgca gaggctgcgg attgtgcgag gcacccagct ctttgaggac 480
aactatgccc tggccgtgct agacaatgga gacccgctga acaataccac ccctgtcaca 540
ggggcctccc caggaggcct gcgggagctg cagcttcgaa gcctcacaga gatcttgaaa 600
ggaggggtct tgatccagcg gaacccccag ctctgctacc aggacacgat tttgtggaag 660
gacatcttcc acaagaacaa ccagctggct ctcacactga tagacaccaa ccgctctcgg 720
gcctgccacc cctgttctcc gatgtgtaag ggctcccgct gctggggaga gagttctgag 780
gattgtcaga gcctgacgcg cactgtctgt gccggtggct gtgcccgctg caaggggcca 840
ctgcccactg actgctgcca tgagcagtgt gctgccggct gcacgggccc caagcactct 900
gactgcctgg cctgcctcca cttcaaccac agtggcatct gtgagctgca ctgcccagcc 960
ctggtcacct acaacacaga cacgtttgag tccatgccca atcccgaggg ccggtataca 1020
ttcggcgcca gctgtgtgac tgcctgtccc tacaactacc tttctacgga cgtgggatcc 1080
tgcaccctcg tctgccccct gcacaaccaa gaggtgacag cagaggatgg aacacagcgg 1140
tgtgagaagt gcagcaagcc ctgtgcccga gtgtgctatg gtctgggcat ggagcacttg 1200
cgagaggtga gggcagttac cagtgccaat atccaggagt ttgctggctg caagaagatc 1260
tttgggagcc tggcatttct gccggagagc tttgatgggg acccagcctc caacactgcc 1320
ccgctccagc cagagcagct ccaagtgttt gagactctgg aagagatcac aggttaccta 1380
tacatctcag catggccgga cagcctgcct gacctcagcg tcttccagaa cctgcaagta 1440
atccggggac gaattctgca caatggcgcc tactcgctga ccctgcaagg gctgggcatc 1500
agctggctgg ggctgcgctc actgagggaa ctgggcagtg gactggccct catccaccat 1560
aacacccacc tctgcttcgt gcacacggtg ccctgggacc agctctttcg gaacccgcac 1620
caagctctgc tccacactgc caaccggcca gaggacgagt gtgtgggcga gggcctggcc 1680
tgccaccagc tgtgcgcccg agggcactgc tggggtccag ggcccaccca gtgtgtcaac 1740
tgcagccagt tccttcgggg ccaggagtgc gtggaggaat gccgagtact gcaggggctc 1800
cccagggagt atgtgaatgc caggcactgt ttgccgtgcc accctgagtg tcagccccag 1860
PC030722.seq
aatggctcag tgacctgttt tggaccggag gctgaccagt gtgtggcctg tgcccactat 1920
aaggaccctc ccttctgcgt ggcccgctgc cccagcggtg tgaaacctga cctctcctac 1980
atgcccatct ggaagtttcc agatgaggag ggcgcatgcc agccttgccc catcaactgc 2040
acccactcct gtgtggacct ggatgacaag ggctgccccg ccgagcagag agccagccct 2l00
ctgacgtcca tcgtctctgc ggtggttggc attctgctgg tcgtggtctt gggggtggtc 2160
tttgggatcc tcatcaagcg acggcagcag aagatccgga agtacacgat gcggagactg 2220
ctgcaggaaa cggagctggt ggagccgctg acacctagcg gagcgatgcc caaccaggcg 2280
cagatgcgga tcctgaaaga gacggagctg aggaaggtga aggtgcttgg atctggcgct 2340
tttggcacag tctacaaggg catctggatc cctgatgggg agaatgtgaa aattccagtg 2400
gccatcaaag tgttgaggga aaacacatcc cccaaagcca acaaagaaat cttagacgaa 2460
gcatacgtga tggctggtgt gggctcccca tatgtctccc gccttctggg catctgcctg 2520
acatccacgg tgcagctggt gacacagctt atgccctatg gctgcctctt agaccatgtc 2580
cgggaaaacc gcggacgcct gggctcccag gacctgctga actggtgtat gcagattgcc 2640
aaggggatga gctacctgga ggatgtgcgg ctcgtacaca gggacttggc cgctcggaac 2700
gtgctggtca agagtcccaa ccatgtcaaa attacagact tcgggctggc tcggctgctg 2760
gacattgacg agacagagta ccatgcagat gggggcaagg tgcccatcaa gtggatggcg 2820
ctggagtcca ttctccgccg gcggttcacc caccagagtg atgtgtggag ttatggtgtg 2880
actgtgtggg agctgatgac ttttggggcc aaaccttacg atgggatccc agcccgggag 2940
atccctgacc tgctggaaaa gggggagcgg ctgccccagc cccccatctg caccattgat 3000
gtctacatga tcatggtcaa atgttggatg attgactctg aatgtcggcc aagattccgg 3060
gagttggtgt ctgaattctc ccgcatggcc agggaccccc agcgctttgt ggtcatccag 3120
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ttctgtccag accctgcccc gggcgctggg ggcatggtcc accacaggca ccgcagctca 3300
tctaccagga gtggcggtgg ggacctgaca ctagggctgg agccctctga agaggaggcc 3360
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ctgacctgca gcccccagcc tgaatatgtg aaccagccag atgttcggcc ccagccccct 3600
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caggggaacc tgccatgcca ggaacctgtc ctaaggaacc ttccttcctg cttgagttcc 4080
cagatggctg gaaggggtcc agcctcgttg gaagaggaac agcactgggg agtctttgtg 4140
gattctgagg ccctgcccaa tgagactcta gggtccagtg gatgccacag cccagcttgg 4200
ccctttcctt ccagatcctg ggtactgaaa gccttaggga agctggcctg agaggggaag 4260
cggccctaag ggagtgtcta agaacaaaag cgacccattc agagactgtc cctgaaacct 4320
agtactgccc cccatgagga aggaacagca atggtgtcag tatccaggct ttgtacagag 4380
tgcttttctg tttagttttt actttttttg ttttgttttt ttaaagacga aataaagacc 4440
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ttgtccattt gcaaatatat tttggaaaac 4530
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<21l>976
<212>PRT
<213>人
<400>596
Met Glu Lys Gln Lys Pro Phe Ala Leu Phe Val Pro Pro Arg Ser Ser
1 5 10 15
Ser Ser Gln Val Ser Ala Val Lys Pro Gln Thr Leu Gly Gly Asp Ser
20 25 30
Thr Phe Phe Lys Ser Phe Asn Lys Cys Thr Glu Asp Asp Leu Glu Phe
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Pro Phe Ala Lys Thr Asn Leu Ser Lys Asn Gly Glu Asn Ile Asp Ser
50 55 60
Asp Pro Ala Leu Gln Lys Val Asn Phe Leu Pro Val Leu Glu Gln Val
65 70 75 80
Gly Asn Ser Asp Cys His Tyr Gln Glu Gly Leu Lys Asp Ser Asp Leu
85 90 95
Glu Asn Ser Glu Gly Leu Ser Arg Val Phe Ser Lys Leu Tyr Lys Glu
100 105 110
Ala Glu Lys Ile Lys Lys Trp Lys Val Ser Thr Glu Ala Glu Leu Arg
115 120 125
Glr Lys Glu Ser Lys Leu Gln Glu Asn Arg Lys Ile Ile Glu Ala Gln
130 135 140
Arg Lys Ala Ile Gln Glu Leu Gln Phe Gly Asn Glu Lys Val Ser Leu
145 150 155 160
Lys Leu Glu Glu Gly Ile Glp Glu Asn Lys Asp Leu Ile Lys Glu Asn
165 170 175
Asn Ala Thr Arg His Leu Cys Asn Leu Leu Lys Glu Thr Cys Ala Arg
PC030722. seq
180 185 190
Ser Ala Glu Lys Thr Lys Lys Tyr Glu Tyr Glu Arg Glu Glu Thr Arg
195 200 205
Gln Val Tyr Met Asp Leu Asn Asn Asn Ile Glu Lys Met Ile Thr Ala
210 215 220
His Gly Glu Leu Arg Val Gln Ala Glu Asn Ser Arg Leu Glu Met His
225 230 235 240
Phe Lys Leu Lys Glu Asp Tyr Glu Lys Ile Gln His Leu Glu Gln Glu
245 250 255
Tyr Lys Lys Glu Ile Asn Asp Lys Glu Lys Gln Val Ser Leu Leu Leu
260 265 270
Ile Gln Ile Thr Glu Lys Glu Asn Lys Met Lys Asp Leu Thr Phe Leu
275 280 285
Leu Glu Glu Ser Arg Asp Lys Val Asn Gln Leu Glu Glu Lys Thr Lys
290 295 300
Leu Gln Ser Glu Asn Leu Lys Gln Ser Ile Glu Lys Gln His His Leu
305 310 315 320
Thr Lys Glu Leu Glu Asp Ile Lys Val Ser Leu Gln Arg Ser Val Ser
325 330 335
Thr Gln Lys Ala Leu Glu Glu Asp Leu Gln Ile Ala Thr Lys Thr Ile
340 345 350
Cys Gln Leu Thr Glu Glu Lys Glu Thr Gln Met Glu Glu Ser Asn Lys
355 360 365
Ala Arg Ala Ala His Ser Phe Val Val Thr Glu Phe Glu Thr Thr Val
370 375 380
Cys Ser Leu Glu Glu Leu Leu Arg Thr Glu Gln Gln Arg Leu Glu Lys
385 390 395 400
Asn Glu Asp Gln Leu Lys Ile Leu Thr Met Glu Leu Gln Lys Lys Ser
405 410 415
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420 425 430
Leu Glu Glu Leu Lys Lys Val Leu Gly Glu Lys Glu Thr Leu Leu Tyr
435 440 445
Glu Asn Lys Gln Phe Glu Lys Ile Ala Glu Glu Leu Lys Gly Thr Glu
450 455 460
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465 470 475 480
Leu Glu Ile Gln Leu Thr Ala Ile Thr Thr Ser Glu Gln Tyr Tyr Ser
485 490 495
Lys Glu Val Lys Asp Leu Lys Thr Glu Leu Glu Asn Glu Lys Leu Lys
500 505 510
Asn Thr Glu Leu Thr Ser His Cys Asn Lys Leu Ser Leu Glu Asn Lys
515 520 525
Glu Leu Thr Gln Glu Thr Ser Asp Met Thr Leu Glu Leu Lys Asn Gln
530 535 540
Gln Glu Asp Ile Asn Asn Asn Lys Lys Gln Glu Glu Arg Met Leu Lys
545 550 555 560
Gln Ile Glu Asn Leu Gln Glu Thr Glu Thr Gln Leu Arg Ash Glu Leu
565 570 575
Glu Tyr Val Arg Glu Glu Leu Lys Gln Lys Arg Asp Glu Val Lys Cys
580 585 590
Lys Leu Asp Lys Ser Glu Glu Asn Cys Asn Asn Leu Arg Lys Gln Val
595 600 605
Glu Asn Lys Asn Lys Tyr Ile Glu Glu Leu Gln Gln Glu Asn Lys Ala
610 615 620
Leu Lys Lys Lys Gly Thr Ala Glu Ser Lys Gln Leu Asn Val Tyr Glu
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Ile Lys Val Asn Lys Leu Glu Leu Glu Leu Glu Ser Ala Lys Gln Lys
645 650 655
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660 665 670
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675 680 685
Ala Asp Glu Ala Val Lys Leu Gln Lys Glu Ile Asp Lys Arg Cys Gln
690 695 700
His Lys Ile Ala Glu Met Val Ala Leu Met Glu Lys His Lys His Gln
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725 730 735
Ser Lys Glu Gln Glu Gln Ser Ser Leu Arg Ala Ser Leu Glu Ile Glu
740 745 750
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755 760 765
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PC030722. seq
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805 810 815
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820 825 830
Lys Asp Lys Arg Asp Tyr Leu Trp Thr Ser Ala Lys Asn Thr Leu Ser
835 840 845
Thr Pro Leu Pro Lys Ala Tyr Thr Val Lys Thr Pro Thr Lys Pro Lys
850 855 860
Leu Gln Gln Arg Glu Asn Leu Asn Ile Pro Ile Glu Glu Ser Lys Lys
865 870 875 880
Lys Arg Lys Met Ala Phe Glu Phe Asp Ile Asn Ser Asp Ser Ser Glu
885 890 895
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900 905 910
Leu Tyr Arg Asn Asn Asn Pro Pro Ala Ser His Leu Cys Val Lys Thr
915 920 925
Pro Lys Lys Ala Pro Ser Ser Leu Thr Thr Pro Gly Pro Thr Leu Lys
930 935 940
Phe Gly Ala Ile Arg Lys Met Arg Glu Asp Arg Trp Ala Val Ile Ala
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Lys Met Asp Arg Lys Lys Lys Leu Lys Glu Ala Glu Lys Leu Phe Val
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<213>人
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aggcgattcc actttcttca agagtttcaa caaatgtact gaagatgatt tggagtttcc 240
atttgcaaag actaatctct ccaaaaatgg ggaaaacatt gattcagatc ctgctttaca 300
aaaagttaat ttcttgcccg tgcttgagca ggttggtaat tctgactgtc actatcagga 360
aggactaaaa gactctgatt tggagaattc agagggattg agcagagtgt tttcaaaact 420
gtataaggag gctgaaaaga taaaaaaatg gaaagtaagt acagaagctg aactgagaca 480
gaaagaaagt aagttgcaag aaaacagaaa gataattgaa gcacagcgaa aagccattca 540
ggaactgcaa tttggaaatg aaaaagtaag tttgaaatta gaagaaggaa tacaagaaaa 600
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ctgtgctaga tctgcagaaa agacaaagaa atatgaatat gaacgggaag aaaccaggca 720
agtttatatg gatctaaata ataacattga gaaaatgata acagctcatg gggaacttcg 780
tgtgcaagct gagaattcca gactggaaat gcattttaag ttaaaggaag attatgaaaa 840
aatccaacac cttgaacaag aatacaagaa ggaaataaat gacaaggaaa agcaggtatc 900
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cttaaaacaa tcaattgaga aacagcatca tttgactaaa gaactagaag atattaaagt 1080
gtcattacaa agaagtgtga gtactcaaaa ggctttagag gaagatttac agatagcaac 1140
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aaataaacaa tttgagaaga ttgctgaaga attaaaagga acagaacaag aactaattgg 1500
tcttctccaa gccagagaga aagaagtaca tgatttggaa atacagttaa ctgccattac 1560
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aaataaaaac aagtatattg aagaacttca gcaggagaat aaggccttga aaaaaaaagg 1980
tacagcagaa agcaagcaac tgaatgttta tgagataaag gtcaataaat tagagttaga 2040
actagaaagt gccaaacaga aatttggaga aatcacagac acctatcaga aagaaattga 2100
ggacaaaaag atatcagaag aaaatctttt ggaagaggtt gagaaagcaa aagtaatagc 2160
tgatgaagca gtaaaattac agaaagaaat tgataagcga tgtcaacata aaatagctga 2220
aatggtagca cttatggaaa aacataagca ccaatatgat aagatcattg aagaaagaga 2280
ctcagaatta ggactttata agagcaaaga acaagaacag tcatcactga gagcatcttt 2340
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attggattct aaagcagttc cttcacaaac tgtatctcga aatttcacat cagttgatca 2580
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tggcatatcc aaagataaaa gagactatct gtggacatct gccaaaaata ctttatctac 2640
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aaaaatgcgg gaggaccgtt gggctgtaat tgctaaaatg gatagaaaaa aaaaactaaa 3000
agaagctgaa aagttatttg tttaatttca gagaatcagt gtagttaagg agcctaataa 3060
cgtgaaactt atagttaata ttttgttctt atttgccaga gccacatttt atctggaagt 3120
tgagacttaa aaaatacttg catgaatgat ttgtgtttct ttatattttt agcctaaatg 3180
ttaactacat attgtctgga aacctgtcat tgtattcaga taattagatg attatatatt 3240
gttgttactt tttcttgtat tcatgaaaac tgtttttact aagttttcaa atttgtaaag 3300
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atattttgga tgcaaaaaaa aaaaaaaaaa aaa 3393
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Ile Ser Glu Lys Leu Arg Lys Ala Phe Asp Asp Ile Ala Lys Tyr Phe
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Ser Lys Lys Glu Trp Glu Lys Met Lys Ser Ser Glu Lys Ile Val Tyr
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Val Thr Leu Pro Pro Phe Met Arg Ser Lys Arg Ala Ala Asp Phe His
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Pro Lys Lys Pro Ala Glu Glu Glu Asn Gly Leu Lys Glu Val Pro Glu
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ctaggtttca aggtcaccct cccacctttc atgcgtagta aacgggctgc agacttccac 240
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ttcggcagcc tccagagaat cttcccgaag atcatgccca agaagccagc agaggaagaa 360
aatggtttga aggaagtgcc agaggcatct ggcccacaaa atgatgggaa acagctgtgc 420
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<212>PRT
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Pro Ser Val Ala Val Arg Val Leu Ser Tyr Val Lys Trp Ile Glu Asp
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<213>人
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