CN201380042262.8
2013.08.09
CN104781250A
2015.07.15
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授权|||实质审查的生效IPC(主分类):C07D 401/06申请日:20130809|||公开
C07D401/06; C07D401/14; C07D405/14; C07D413/14; C07D471/04; C07D498/04; C07D498/14; C07D513/14; A61K31/55; A61K31/5513; A61P31/04
C07D401/06
爱尔兰詹森科学公司
J.E.G.贵勒蒙特; D.F.A.兰科伊斯; M.M.S.莫特; W.M.A.巴勒曼斯; A.考尔
爱尔兰科克郡
12180103.9 2012.08.10 EP
中国专利代理(香港)有限公司72001
孔青; 黄希贵
本发明涉及新颖的可以抑制FabI酶活性的具有化学式(I)的化合物,并且这些化合物对于治疗细菌感染是有用的。本发明进一步涉及包含这些化合物的药物组合物,以及用于制备这些化合物的化学方法。
1. 一种具有化学式(I)的化合物 其中 每个Zx独立地代表-[C(Rz8)(Rz9)]n-,其中n是1或2; Rz8和Rz9独立地代表氢或一个选自R3或R4的取代基; R1是氢、C1-4烷基或卤素; R2是氢、C1-4烷基或卤素; Rx代表: (i) 其中 Xx代表C(H)、C(Ry1)或N; Ry1代表一个至三个可任选的取代基,各自独立地选自氢、卤 素、-CN、-O-C1-6烷基或C1-6烷基(其中后面的两个烷基基团任选地 被一个或多个氟原子取代); Ry2和Ry3各自独立地代表氢或-Q1-R5; 每个Q1独立地代表一个直接键或-C(O)-; R5代表氢、C1-6烷基、杂环烷基(其中后面的两个基团各自任 选地被一个或多个取代基取代,这些取代基选自=O和Q2)、芳基或杂 芳基(其中后面的两个基团任选地被一个或多个取代基取代,这些取 代基选自Q3); Q2代表卤素、-CN、-OC1-6烷基(任选地被一个或多个氟原子 取代)、芳基或杂芳基(其中后面两个基团任选地被一个或多个取代 基取代,这些取代基选自卤素、-CN、C1-3烷基或-OC1-3烷基,后面的 两个烷基基团本身任选地被氟取代); Q3代表卤素、-CN、-O-C1-6烷基或C1-6烷基(其中后面的两个 烷基基团任选地被一个或多个氟取代基取代); (ii) 其中 Xx代表C(H)或N; Z1代表-X1-O-X1a-、-X2-N(Rz3)-X2a-或-X3-S-X3a-; X1、X2和X3独立地代表一个直接键、-C(O)-或-C(Rz4)(Rz5)-; X1a、X2a和X3a独立地代表一个直接键或-V1-C(Rz1)(Rz2)-; V1代表一个直接键或-C(O)-; Rz1、Rz2、Rz3、Rz4和Rz5独立地代表氢、C1-6烷基(任选地被 一个或多个取代基取代,这些取代基选自=O和卤素)或杂环烷基(任 选地被一个或多个取代基取代,这些取代基选自=O、卤素和C1-3烷 基); (iii) 其中 Xx代表C(H)或N; Z2代表-C(Rz6)(Rz7)-或-C(O)-; Z3代表一个直接键(由此形成一种7元环)或-CH2-(由此形 成一种8元环); 环A代表任选地包含一个、两个或三个双键(并且因此为芳香 族的或非-芳香族的)并且任选地包含另外的(除了必须的N外)一 个至三个杂原子(例如选自N和O)的5元或6元环,并且该环任选 地被一个或多个取代基取代,这些取代基各自独立地选自=O和Rz8; Rz6、Rz7和Rz8各自独立地代表氢或任选地被一个或多个取代基 取代的C1-6烷基,这些取代基选自=O、-OC1-4烷基和卤素; 每个R3独立地代表氢、卤素、-OR10或C1-6烷基(任选地被一个 或多个卤素(例如氟)原子取代); 每个R4独立地代表氢、卤素或-T1-R20; 每个T1独立地代表一个直接键、-O-、-C(O)-、-C(O)-O-、-O-C(O)-、 -C(O)-N(R21)-或-S(O)n1-; n1代表0、1或2; 每个R10和每个R20独立地代表C1-6烷基(任选地被一个或多个取 代基取代,这些取代基独立地选自=O和Y1)、芳基或杂芳基(其中 后面的两个基团任选地被一个或多个取代基取代,这些取代基独立地 选自Y2); R21代表氢或C1-6烷基; 每个Y1独立地代表卤素、-O-R30、-CN、芳基或杂芳基(其中后 面的两个基团任选地被一个或多个取代基取代,这些取代基选自卤 素、-O-C1-3烷基和C1-3烷基); 每个Y2独立地代表卤素、-OC1-6烷基或C1-6烷基(其中后面的两 个烷基基团任选地被一个或多个氟原子取代); 每个R30独立地代表氢、C1-6烷基(任选地被一个或多个氟原子取 代)、芳基或杂芳基(其中后面的两个基团任选地被一个或多个取代 基取代,这些取代基选自卤素、-O-C1-3烷基和C1-3烷基), 或其药学上可接受的盐。 2. 如权利要求1所述的化合物,其中包含Zx的环是: 3. 如权利要求1或2中任一项所述的化合物,其中R4代表以下 任选地经取代的基团之一: 4. 如权利要求1至3中任一项所述的化合物,其中Ry1和Ry2 中的一个代表氢并且另一个代表-Q1-R5。 5. 如权利要求1至4中任一项所述的化合物,其中Q1代表-C(O)-, 并且R5代表氢、-CH3、-CF3、-异丙基、叔丁基、异丁基 (-CH2-C(H)(CH3)2)、环戊基、-(环丙基)(甲基)、环己基或以下基团 之一: 其中如在此通过Q2或Q3(当适当时)所定义的,“浮动的”Q2或Q3取代基代表该环上一个或多个取代基。 6. 如权利要求1至3中任一项所述的化合物,其中当Rx代表选 项(ii)时,Rx代表: 7. 如权利要求1至3中任一项所述的化合物,其中当Rx代表选 项(iii)时,Rx代表: 8. 一种药物组合物,该药物组合物包括一种药学上可接受的载体 以及治疗活性量的如权利要求1至7中任一项所述的化合物。 9. 一种用于制备如权利要求8所述的药物组合物的方法,其中将 治疗活性量的如权利要求1至7中任一项所述的化合物与一种药学上 可接受的载体紧密混合。 10. 如权利要求1至7中任一项所定义的具有化学式(I)化合 物,用于用作一种药物。 11. 如权利要求1至7中任一项所定义的具有化学式(I)的化 合物,用于在治疗细菌感染中使用。 12. 如权利要求11所述的化合物,其中该细菌感染是由一种表 达FabI酶的细菌引起的。 13. 如权利要求1至7中任一项所定义的化合物,用于用作FabI 酶的抑制剂。 14. 一种用于制备具有化学式(I)的化合物的方法,该方法包 括: (i)一种具有化学式(II)的化合物, 其中Zx、R3和R4是如在权利要求1中所定义的,与一种具 有化学式(III)的化合物进行反应, 其中R1、R2和RX是如在权利要求1中所定义的; (ii)一种具有化学式(IV)的化合物, 其中Zx、R3、R4、R1和R2是如在权利要求1中所定义的, 与一种具有化学式(V)的化合物进行反应, Xa1-Rx (V) 其中Xa1代表一种适合的离去基团; (iii)既有的具有化学式(I)的化合物的修饰,例如通过标准官 能团的转换或转换为标准官能团。
新型抗细菌化合物 本发明涉及新颖的抑制FabI酶活性的具有化学式(I)化合物, 这些化合物因此对于治疗细菌感染是有用的。本发明进一步涉及包含 这些化合物的药物组合物,以及用于制备这些化合物的化学方法。 本发明的化合物是抑制FabI蛋白的抗细菌化合物,FabI蛋白是 一种在脂肪酸生物合成途径中的NADH依赖性烯酰-酰基载体蛋白 (ACP)还原酶。脂肪酸合酶(FAS)参与所有生物体中的饱和脂肪 酸的总生物合成途径,但是在它们中FAS的结构组织有很大的差别。 脊椎动物和酵母的FAS的显著特征是:所有的酶活性被编码在一条或 两条多肽链上,并且酰基载体蛋白(ACP)是以复合物的形式存在的。 相比之下,在细菌FAS中,各合成步骤是由一个独特的单功能酶催化 的,并且ACP是一种离散的蛋白。因此,有可能通过使用抑制剂阻断 合成步骤中的一个步骤来选择性地抑制细菌FAS。NADH依赖性烯酰 -ACP还原酶(Fab I)参与细菌脂肪酸生物合成的每一轮所涉及的四 个反应步骤中的最后一步。因此,FabI酶是在细菌脂肪酸生物合成的 总合成途径中的生物合成酶。 已经表明FabI酶构成了主要病原体(例如大肠杆菌)中的重要 靶标(希斯(Heath)等人,《物化学杂志》(J.Biol.Chem.)1995, 270,26538;伯格勒(Bergler)等人,《欧洲生物化学杂志》(Eur.J. Biochem.)2000,275,4654)。因此,抑制FabI的化合物作为抗细 菌剂可以是有用的。 在WO-01/26652、WO-01/26654、和WO-01/27103中已经披露了 具有FabI酶抑制活性的化合物。在WO-03/088897、WO-2007/043835 和WO-2008/098374中已经披露了具有FabI抑制活性的取代的萘啶酮 化合物。国际专利申请WO 2007/053131披露了用于潜在用作FabI抑 制剂的不同的化合物。国际专利申请号WO 2011/061214也公开了用 于潜在用作FabI抑制剂的不同化合物。然而,这些文件均没有披露直 接附接到羰基基团的含双键的氮基杂环烷基基团,该羰基基团是α至 烯烃。 本发明涉及一种具有化学式(I)的化合物 其中 每个Zx独立地代表-[C(Rz8)(Rz9)]n-,其中n是1或2; Rz8和Rz9独立地代表氢或一个选自R3或R4的取代基; R1是氢、C1-4烷基或卤素; R2是氢、C1-4烷基或卤素; Rx代表: 其中 Xx代表C(H)、C(Ry1)或N; Ry1代表一个至三个可任选的取代基,这些取代基各自独立地选 自氢、卤素、-CN、-O-C1-6烷基或C1-6烷基(其中后面的两个烷基基 团任选地被一个或多个氟原子取代); Ry2和Ry3各自独立地代表氢或-Q1-R5; 每个Q1独立地代表一个直接键或-C(O)-; R5代表氢、C1-6烷基、杂环烷基(其中后面的两个基团各自任选 地被一个或多个取代基取代,这些取代基选自=O和Q2)、芳基或杂 芳基(其中后面的两个基团任选地被一个或多个取代基取代,这些取 代基选自Q3); Q2代表卤素、-CN、-OC1-6烷基(任选地被一个或多个氟原子取 代)、芳基或杂芳基(其中后面两个基团任选地被一个或多个取代基 取代,这些取代基选自卤素、-CN、C1-3烷基或-OC1-3烷基,后面的两 个烷基基团本身任选地被氟取代); Q3代表卤素、-CN、-O-C1-6烷基或C1-6烷基(其中后面的两个烷 基基团任选地被一个或多个氟取代基取代); 其中 Xx代表C(H)或N; Z1代表-X1-O-X1a-、-X2-N(Rz3)-X2a-或-X3-S-X3a-; X1、X2和X3独立地代表一个直接键、-C(O)-或-C(Rz4)(Rz5)-; X1a、X2a和X3a独立地代表一个直接键或-V1-C(Rz1)(Rz2)-; V1代表一个直接键或-C(O)-; Rz1、Rz2、Rz3、Rz4和Rz5独立地代表氢、C1-6烷基(任选地被一 个或多个取代基取代,这些取代基选自=O和卤素)或杂环烷基(任 选地被一个或多个取代基取代,这些取代基选自=O、卤素和C1-3烷 基); 其中 Xx代表C(H)或N; Z2代表-C(Rz6)(Rz7)-或-C(O)-; Z3代表一个直接键(由此形成一种7元环)或-CH2-(由此形成 一种8元环); 环A代表任选地包含一个、两个或三个双键(并且因此为芳香族 的或非-芳香族的)并且任选地包含另外的(除了必须的N外)一个 至三个(例如一个或两个)杂原子(例如选自N和O)的5元或6元 环,并且该环任选地被一个或多个取代基取代,这些取代基各自独立 地选自=O和Rz8; Rz6、Rz7和Rz8各自独立地代表氢或任选地被一个或多个取代基 取代的C1-6烷基,这些取代基选自=O、-OC1-4烷基和卤素; 每个R3独立地代表氢、卤素、-OR10或C1-6烷基(任选地被一个 或多个卤素(例如氟)原子取代); 每个R4独立地代表氢、卤素或-T1-R20; 每个T1独立地代表一个直接键、-O-、-C(O)-、-C(O)-O-、-O-C(O)-、 -C(O)-N(R21)-或-S(O)n1-; n1代表0、1或2; 每个R10和每个R20独立地代表C1-6烷基(任选地被一个或多个 取代基取代,这些取代基独立地选自=O和Y1)、芳基或杂芳基(其 中后面的两个基团任选地被一个或多个取代基取代,这些取代基独立 地选自Y2); R21代表氢或C1-6烷基; 每个Y1独立地代表卤素、-O-R30、-CN、芳基或杂芳基(其中后 面的两个基团任选地被一个或多个取代基取代,这些取代基选自卤 素、-O-C1-3烷基和C1-3烷基); 每个Y2独立地代表卤素、-OC1-6烷基或C1-6烷基(其中后面的两 个烷基基团任选地被一个或多个氟原子取代); 每个R30独立地代表氢、C1-6烷基(任选地被一个或多个氟原子 取代)、芳基或杂芳基(其中后面的两个基团任选地被一个或多个取 代基取代,这些取代基选自卤素、-O-C1-3烷基和C1-3烷基), 或其药学上可接受的盐(例如酸加成盐)。 具有化学式(I)的上述化合物(或其盐)在此可以称作“本发明 的化合物”。 药学上可接受的盐包括酸加成盐和碱加成盐。可以通过常规手 段,例如,通过将具有化学式I的化合物的游离酸或游离碱形式与一 种适当的酸或碱的一个或多个当量、任选地在一种溶剂中或在一种该 盐不可溶于其中的介质中进行反应,随后使用标准技术(例如,在真 空中,通过冷冻干燥或通过过滤)去除所述溶剂或所述介质来形成此 类盐。还可以通过将处于盐的形式的本发明的化合物的一种平衡离子 与另一种平衡离子进行交换,例如,使用一种适合的离子交换树脂来 制备多种盐。 如上文所提及的药学上可接受的酸加成盐意欲包括式(I)化合 物所能形成的治疗活性的无毒酸加成盐形式。这些药学上可接受的酸 加成盐可以方便地通过用这种适当的酸来处理碱形式来获得。适当的 酸包括例如无机酸,例如氢卤酸(例如氢氯酸或氢溴酸)、硫酸、硝 酸、磷酸以及类似酸类;或有机酸,例如像乙酸、丙酸、羟基乙酸、 乳酸、丙酮酸、草酸(即乙二酸)、丙二酸、琥珀酸(即丁二酸)、 马来酸、富马酸、苹果酸、酒石酸、柠檬酸、甲磺酸、乙磺酸、苯磺 酸、对-甲苯磺酸、环己氨基磺酸、水杨酸、对-氨基水杨酸、双羟萘 酸以及类似酸类。 出于本发明的目的,本发明化合物的溶剂化物、前药、N-氧化物 和立体异构体也包括在本发明的范围内。 本发明的相关化合物的术语“前药”包括任何化合物,其在口服 或肠胃外给药后,在体内被代谢以形成实验上-可检测的量的化合物, 并且是在预定的时间(例如在6和24小时之间的给药间隔(每天一 次至四次))之内。为免生疑问,术语“肠胃外的”给药包括除了口 服给药外所有的给药形式。 能以一种方式来通过修饰存在于该化合物上的官能团来制备本 发明的化合物的前药,该方式使得当向哺乳动物受试者给予这样一种 前药时,这些修饰在体内被切割。典型地,通过合成具有前药取代基 的母体化合物来完成这些修饰。前药包括本发明的化合物,其中在本 发明的化合物中的羟基、氨基、硫氢基、羧基或羰基被结合到在体内 可以被切割的任何基团上以分别再生出游离的羟基、氨基、硫氢基、 羧基或羰基。 前药的实例包括但不局限于,羟基官能团的酯和氨基甲酸酯、羧 基官能团的酯基、N-酰基衍生物和N-曼尼希碱。有关前药的一般信息 可以例如在班德加德(Bundegaard,H.)“前药的设计”第1-92页,爱 思唯尔(Elesevier),纽约-牛津(1985)中找到。 本发明的化合物可以包含双键并且因此可以存在为关于每个双 键的E(异侧)和Z(同侧)几何异构体。位置异构体也可以被包括 在本发明的这些化合物中。所有此类异构体(例如,如果本发明的化 合物包含一个双键或稠环,则包括顺式和反式形式)及其混合物都包 括在本发明的范围之内(例如,单一的位置异构体和位置异构体的混 合物都可以包括在本发明的范围之内)。 本发明的化合物还可以展示出互变异构现象。所有的互变异构形 式(或互变异构体)及其混合物都包括在本发明的范围之内。术语“互 变异构体”或“互变异构形式”指的是具有不同能量的结构异构体, 这些异构体可经由低能量势垒相互转换。例如,质子互变异构体(也 称作质子移变互变异构体)包括经由质子移变产生的相互转换,诸如 酮-烯醇和亚胺-烯胺异构化。价互变异构体包括由一些成键电子的重 组产生的相互转换。 本发明的化合物还可以包含一个或多个不对称碳原子并且因此 可以展示出旋光和/或非对映异构现象。可以使用常规技术,例如,色 谱或分步结晶来分离非对映异构体。可以通过使用常规技术,例如, 分步结晶或HPLC(高效液相色谱法)对这些化合物的外消旋混合物 或其他混合物进行分离来分选不同的立体异构体。可替代地,所希望 的旋光异构体可以通过适当的旋光起始材料在不会引起外消旋作用 或差向异构作用(epimerisation)的条件(即一种‘手性池’(‘chiral pool’)方法)下的反应;通过衍生化作用(即,拆分,包括动态拆分) 适当的起始材料与一种可以在适合的阶段被去除的‘手性助剂’(例 如与一种纯手性酸)反应,随后通过常规手段(例如色谱)分离非对 映异构体衍生物;或者通过与一种适当的手性试剂或手性催化剂反应 来制备,所有都在本领域普通技术人员已知的条件下。 所有的立体异构体(包括但不局限于非对映异构体、对映异构体 和阻转异构体)及其混合物(例如,外消旋混合物)都包含在本发明 的范围之内。 在此示出的这些结构中,在任何具体的手性原子的立体化学都未 指明的情况下,那么所有的立体异构体都被认为是本发明的化合物并 且包括在本发明的化合物中。在立体化学通过代表一个具体构型的实 楔形线或虚线被指明的情况下,那么该立体异构体是所指明和定义 的。 本发明的这些化合物能以非溶剂化的形式连同与药学上可接受 的溶剂(诸如水、乙醇、以及类似物)的溶剂化的形式存在,并且意 在表明本发明包括溶剂化的以及非溶剂化的形式两者。 本发明还包括本发明的同位素标记的化合物,这些同位素标记的 化合物与在此列举的那些相同,但是事实上一个或多个原子由具有原 子质量或质量数不同于自然中通常发现(或自然中发现的最多的那一 个)的原子质量或质量数的原子所代替。在此指明的任何具体的原子 或元素的所有同位素都被认为是在本发明的这些化合物的范围之内。 可以包含在本发明化合物中的示例性同位素包括氢、碳、氮、氧、磷、 硫、氟、氯和碘的同位素,诸如2H、3H、11C、13C、14C、13N、15O、 17O、18O、32P、33P、35S、18F、36Cl、123I、及125I。本发明的某些同位 素标记的化合物(例如,用3H和14C标记的那些)在化合物中是有用 的并且用于底物组织分布测定。氚化(3H)和碳-14(14C)同位素是有 用的,因为它们使得制备和可检测性变得容易。此外,用更重同位素 (诸如氘)(即,2H)取代可以提供由于更大的代谢稳定性而产生的 某些治疗优点(例如,增加的体内半衰期或降低的剂量需求)并且因 此在一些环境下可以是优选的。正电子发射同位素(诸如15O、13N、 11C和18F)对于正电子发射断层术(PET)研究是有用的以检查底物 受体的占用率。一般可以通过与在方案1和/或下文的实例中描述的那 些类似的以下方法、通过用同位素标记的试剂取代非同位素标记的试 剂来制备本发明的同位素标记的化合物。 除非另外指明,在此定义的C1-q烷基(其中q是该范围的上限) 可以是直链的,或者,当存在足够数目(即,如果适当的话,最少两 个或三个)的碳原子时,可以是支链的和/或环的(这样即形成C3-q- 环烷基)。此类环烷基可以是单环的或二环的并且可以进一步是桥接 的。此外,当存在足够数目(即,最少四个)的碳原子时,此类基团 还可以是部分环的。此类烷基还可以是饱和的,或者当存在足够数目 (即,最少两个)的碳原子时,可以是不饱和的(例如,形成C2-q烯 基或C2-q炔基)。 可以被特别提及的C3-q环烷基(其中q是该范围的上限)可以是 单环的或二环的烷基,该环烷基可以进一步是桥接的(这样即形成, 例如,稠环系统,诸如三个稠合的环烷基)。此类环烷基可以是饱和 的或包含一个或多个双键的不饱和的(例如,形成环烯基)。多个取 代基可以附接在该环烷基上的任何位点处。此外,在存在足够数目 (即,最少四个)的碳原子的情况下,此类环烷基还可以是部分环的。 术语“卤素”,当在此使用时,优选包含氟、氯、溴和碘。 可以被提及的杂环烷基包括非芳香族的单环和二环的杂环烷基, 其中在该环系统中的这些原子中的至少一个(例如,一至四个)是除 碳外(即一个杂原子),并且其中在该环系统中的原子的总数在3与 20之间(例如,在三和十之间,例如,在3和8之间,诸如5-至8-)。 此类杂环烷基还可以是桥接的。此外,此类杂环烷基可以是饱和的, 或包含一个或多个双键和/或三键的不饱和的,从而形成,例如,C2-q杂环烯基(其中q是该范围的上限)。可以被提及的C2-q杂环烷基包 括7-氮杂二环[2.2.1]庚基、6-氮杂二环[3.1.1]庚基、6-氮杂二环[3.2.1]- 辛基、8-氮杂二环-[3.2.1]辛基、吖丙啶基、氮杂环丁烷基、二氢吡喃 基、二氢吡啶基、二氢吡咯基(包括2,5-二氢吡咯基)、二氧戊环基 (包括1,3-二氧戊环基)、二噁烷基(包括1,3-二噁烷基和1,4-二噁 烷基)、二噻烷基(包括1,4-二噻烷基)、二硫戊环基(包括1,3-二 硫戊环基)、咪唑烷基、咪唑啉基、吗啉基、7-氧杂二环[2.2.1]庚基、 6-氧杂二环-[3.2.1]辛基、氧杂环丁烷基、环氧乙烷基、哌嗪基、哌啶 基、非芳香族的吡喃基、吡唑烷基、吡咯烷酮基、吡咯烷基、吡咯啉 基、奎宁环基、环丁砜基、3-丁二烯砜基、四氢吡喃基、四氢呋喃基、 四氢吡啶基(诸如1,2,3,4-四氢吡啶基和1,2,3,6-四氢吡啶基)、硫杂 环丁烷基、硫杂环丙烷基、硫杂环戊烷基、硫代吗啉基、三噻烷基(包 括1,3,5-三噻烷基)、托烷基以及类似基团。在适当的情况下,杂环 烷基上的取代基可以位于该环系统中的任何原子(包括杂原子)上。 杂环烷基的附接点可以是经由该环系统中的任何原子(在适当的情况 下),包括杂原子(诸如氮原子),或在可以作为该环系统的部分存 在的任何稠合的碳环上的原子。杂环烷基还可以处于N-或S-氧化的形 式。在此提及的杂环烷基可以被确切地指定为单环的或二环的。 可以被提及的芳基包括C6-20,诸如C6-12(例如,C6-10)芳基。此 类基团可以是单环的、二环的或三环的并且具有6与12(例如,6与 10)个之间的环碳原子,其中至少一个环是芳香族的。C6-10芳基包括 苯基、萘基以及类似基团,诸如1,2,3,4-四氢萘基。芳基的附接点可以 是经由该环系统的任何原子。例如,当该芳基是多环的时,该附接点 可以是经由原子,包括非芳香族环的原子。然而,当芳基是多环(例 如,二环或三环)的时,它们优选地是经由一个芳香族环连接到该分 子的其余部分上。在此可以被提及的最优选的芳基基团是“苯基”。 除非另外说明,术语“杂芳基”当在此使用时指的是包含一个或 多个杂原子(例如一个至四个杂原子)的芳香族基团,该一个或多个 杂原子优选地选自N、O和S。杂芳基包括具有5和20元之间(例如, 5和10元之间)的那些,并且可以是单环的、二环的或三环的,其条 件是这些环中至少一个是芳香族的(这样形成,例如,一个单-、二- 或三环的杂芳基)。当该杂芳基是多环的时,该附接点可以是经由任 何原子,包括非芳香族环的原子。然而,当杂芳基是多环(例如,二 环或三环)的时,它们优选地是经由一个芳香族环连接到该分子的其 余部分上。可以被提及的杂芳基包括3,4-二氢-1H-异喹啉基、1,3-二氢 异吲哚基、1,3-二氢异吲哚基(例如,3,4-二氢-1H-异喹啉-2-基、1,3- 二氢异吲哚-2-基、1,3-二氢异吲哚-2-基;即,经由一个非芳香族环连 接的杂芳基),或者,优选地是,吖啶基、苯并咪唑基、苯并二噁烷 基、苯并氧杂基、苯并间二氧杂环戊烯基(包括1,3-苯并间二氧杂 环戊烯基)、苯并呋喃基、苯并呋咱基、苯并噻二唑基(包括2,1,3- 苯并噻二唑基)、苯并噻唑基、苯并噁二唑基(包括2,1,3-苯并噁二 唑基)、苯并噁嗪基(包括3,4-二氢-2H-1,4-苯并噁嗪基)、苯并噁唑 基、苯并吗啉基、苯并硒杂二唑基(包括2,1,3-苯并硒杂二唑基)、 苯并噻吩基、咔唑基、色满基、噌啉基、呋喃基、咪唑基、咪唑并[1,2-a] 吡啶基、吲唑基、二氢吲哚基、吲哚基、异苯并呋喃基、异色满基、 异二氢吲哚基、异吲哚基、异喹啉基、异噻唑基、异硫代色满基 (isothiochromanyl)、异噁唑基、萘啶基(包括1,6-萘啶基或者,优 选地是,1,5-萘啶基和1,8-萘啶基)、噁二唑基(包括1,2,3-噁二唑基、 1,2,4-噁二唑基和1,3,4-噁二唑基)、噁唑基、吩嗪基、吩噻嗪基、酞 嗪基、蝶啶基、嘌呤基、吡喃基、吡嗪基、吡唑基、哒嗪基、吡啶基、 嘧啶基、吡咯基、喹唑啉基、喹啉基、喹嗪基、喹喔啉基、四氢异喹 啉基(包括1,2,3,4-四氢异喹啉基和5,6,7,8-四氢异喹啉基)、四氢喹 啉基(包括1,2,3,4-四氢喹啉基和5,6,7,8-四氢喹啉基)、四唑基、噻 二唑基(包括1,2,3-噻二唑基、1,2,4-噻二唑基和1,3,4-噻二唑基)、 噻唑基、硫代色满基、硫代乙氧苯基(thiophenetyl)、噻吩基、三唑 基(包括1,2,3-三唑基、1,2,4-三唑基和1,3,4-三唑基)以及类似基团。 在适当的情况下,杂芳基上的取代基位于该环系统中的任何原子(包 括杂原子)上。杂芳基的附接点可以是经由该环系统中的任何原子(在 适当的情况下),包括杂原子(诸如氮原子),或在可以作为该环系 统的部分存在的任何稠合的碳环上的原子。杂芳基还可以处于N-或 S-氧化的形式。在此提及的杂芳基可以被确切地指定为单环的或二环 的。当杂芳基是其中存在一个非芳香族环的多环时,那么该非芳香族 环可以由一个或多个=O基团取代。在此可以被提及的最优选的杂芳 基基团是包含1、2或3个杂原子(例如优先选自氮、氧和硫)的5- 或6-元芳香族基团。 可以特别指出地是,该杂芳基是单环的或二环的。在指定该杂芳 基为二环的情况下,那么它可以由与另一个五-、六-或七-元的环(例 如,一个单环的芳基或杂芳基环)稠合的一个五-、六-或七-元的单环 (例如,一个单环的杂芳基环)组成。 可以被提及的杂原子包括磷、硅、硼,并且优选地是氧、氮和硫。 为了避免产生疑惑,在此指出一个基团(例如,C1-6烷基)可以 由一个或多个取代基(例如,选自Y1)取代的情况下,那么这些取代 基(例如由Y1定义)是彼此独立的。即,此类基团可以由相同的取代 基(例如,由Y1定义)或不同的取代基(由Y1定义)取代。 在此提及的所有个体特性(例如,优选特征)可以独立地或与在 此提及的任何其他特征(包括优选特征)组合地采用(因此,优选特 征可以与其他优选特征结合或独立于它们地采用)。 技术人员将理解为本发明主题的本发明的化合物包括稳定的那 些。即,本发明的化合物包括足够鲁棒以承受从例如一种反应混合物 分离至一个有用纯度的那些。 术语“FabI”为本技术领域所认可的并指细菌酶,据认为该酶在 涉及细菌脂肪酸生物合成的各个循环的四个反应的最终步骤中起着 烯酰基-酰基载体蛋白(ACP)还原酶的功能。这种酶被认为是广泛分 布在细菌中的。 为免生疑,具有化学式(I)的以下化合物(给出的下位概念(Ia)、 (Ib)和(Ic))是在本发明的范围之内: 其中这些整数是如在上文所定义的。为免生疑,R3和R4取代基 是任选的(考虑到它们被描述为“浮动的”并且各自可以代表氢)。 当R3和R4基团代表一个除氢外的取代基时,然后各自可以被放置在 包含Zx的环上(包括在Zx本身上)的任何位置,然而优选R3/R4(例 如R4)基团被附接到必要的双键上。 本发明的优选化合物包括那些,其中: 当R1或R2代表卤素时,那么它们优选是F或Cl; 更优选地,R1代表氢或C1-4烷基。 更优选地,R2代表氢或C1-4烷基。 可以被提及的本发明的化合物包括那些,其中当Rx代表环(i)、 (ii)亦或(iii)时,然后那些环代表: 即全部都是这样的环,其中该单环或该二环或三环的第一个(芳 香族的)环(其附接到具有化学式I的化合物的其余部分)包含两个 氮原子(出于1,4-关系)并且其中其余的整数是如在此所定义的。然 而,在本发明的实施例(例如一个优选的实施例)中,可以被提及的 本发明的化合物包括那些,其中: 当Rx代表环(i)、(ii)亦或(iii)时,那么那些环代表 其中(在每一情况下),这些整数是如在此所定义的。因此,优 选的是这些环是其中Xx代表C的那些。 本发明的优选化合物包括那些,其中: 每个Zx独立地代表-[C(Rz8)(Rz9)]n-,其中n是1或2,但是优选的 是没有两个其中n是2的Zx基团(即优选的是包含Zx-的环是6-或7- 元的); 每个Zx代表-C(Rz8)(Rz9)-(这样形成一种6-元环)或一个Zx基团 代表-C(Rz8)(Rz9)-C(Rz8)(Rz9)-并且另一个代表-C(Rz8)(Rz9)-(这样形成一 种7-元环); 每个Zx代表-CH2-(这样形成一种6-元环)或一个Zx代表-CH2CH2- 并且另一个代表-CH2-(这样形成一种7-元环); R3代表氢、卤素、-OCH3、-OCF3或C1-2烷基(更优选R3代表氢, 即不存在); 每个R10代表C1-6烷基(例如C1-3烷基),其可以被一个或多个 卤素原子取代,但是其优选未被取代; 在包含Zx的环上存在有0或1(优选0)个R3取代基(即R3优 选代表氢); 在包含Zx的环上存在有1或2(优选1)个R4取代基,例如被附 接在必要的双键两端之一上。 因此,这些优选的包含Zx的环是: 最优选的包含Zx的环是: 在包含Zx的环中双键的存在可以帮助R4基团(如过存在的话) 取向,这样使得化合物大体上(例如考虑到R4取代基的取向)显示更 好/改进的对FabI细菌酶的结合性质。因此,在双键的存在可导致对 FabI酶的改进的结合/抑制的意义上,本发明的这些化合物可以是有利 的。因此,本发明的这些化合物因为可以必然导致更好的效价、疗效 等的这些特性而可以是有利的化合物(例如,与已知的化合物相比)。 本发明的优选化合物因此包括那些,其中: 当R4代表附接到必要的双键的任一端上的取代基时,那么R4优 选代表一个除氢外的取代基(即卤素或-T1-R20),例如在此上下文中 R4优选代表-T1-R4; 优选的是存在至少有一个代表-T1-R4(其附接到必要的双键任一 端上)的R4取代基,其中R4代表-T1-R4。 本发明的优选化合物包括那些,其中有一个被附接到该双键的任 一端的R4取代基存在,在此上下文中R4代表-T1-R20。在此上下文中, 优选的是: 每个Y1独立地代表代表卤素或-O-C1-3烷基(任选地被氟取代); 每个Y2独立地代表卤素、-O-C1-3烷基或C1-3烷基(其中后面两 个基团是任选地被氟取代); 每个R30独立地代表氢或C1-4(例如C1-3)烷基; 当Y1代表芳基或杂芳基时,那么这些基团优选地代表在上文中 所定义的那些(例如苯基或包含1、2或3个杂原子的5-或6-元芳香 基团),其中芳基或杂芳基基团是任选地被一个或多个取代基取代, 这些取代基选自卤素、-OCH3和CH3(但是其优选未被取代); T1代表-O-、-C(O)-或优选一个直接键; R20最优选代表芳基或杂芳基,两者均任选地被一个或多个取代 基取代,这些取代基选自Y2; 当R20代表芳基时,它优选代表任选经取代的苯基(例如未被取 代的或被取代的,其中这些任选的取代基选自卤素(例如氟)、-OC1-2烷基(例如-OCH3)); 当R20代表杂芳基,它优选代表包含1、2或3(例如一)个杂原 子(例如优选地选自氮、氧和硫)的5-或6-元单环芳香族基团。 优选的R20基团包括苯基和包含一个或四个杂原子(并且优选包 含一个或两个杂原子)的5-或6-元单环杂芳基基团,这样形成例如噻 吩基、吡啶基、噻唑基、噁唑基、异噁唑基、吡唑基或类似物。特别 优选的R20基团包括苯基、噻吩基、噻唑基、吡啶基和吡唑基,其如 在此所定义均是任选地被取代的。尤其优选的R20基团包括苯基(例 如未被取代的苯基、2-甲氧基-5-氟-苯基)和噻吩基(例如2-噻吩基)。 R4可以代表以下: 本发明另外的优选化合物包括那些,其中对于其中Rx代表选项(i) 的本发明的化合物: 没有Ry1基团存在(或有一个代表氢的Ry1基团存在)或有一个 代表-CN、-O-C1-6烷基(例如-O-C1-3烷基,诸如-OCH3)或C1-6烷基 (例如C1-3烷基,诸如甲基)的Ry1取代基存在; Ry2和Ry3两者均代表-Q1-R5或更优选Ry2和Ry3中的一个代表氢 并且另一个代表-Q1-R5; Q1代表一个直接键或优选-C(O)-; R5代表氢、C1-6烷基(任选地被一个或两个(例如一个)选自=O 和Q2的取代基取代)、一种5-或6-元杂环烷基基团(包含一个或两 个杂原子;任选地被一个或两个选自=O和Q2的取代基取代)或芳基 或杂芳基(其中后面两个基团任选地被一个或两个(例如一个)选自 Q3的取代基取代); 当R5代表C1-6烷基时,它优选是未被取代的(例如-CH3、异丙 基、叔丁基或异丁基)或被一个或多个Q2取代基取代(这样形成例如 -CF3)或它是一个任选支链的环烷基(例如被甲基取代的环丙基、或 未被取代的环戊基、环己基); 当R5代表任选经取代的杂环烷基时,那么它优选的是任选地经 取代的、包含一个或两个(例如一个)杂原子(优选选自氧、氮和硫) 的5-或6-元杂环烷基基团,这样形成例如四氢呋喃基团(例如2-或 3-四氢呋喃基基团); 当R5代表任选经取代的芳基时,那么它优选的是未被取代的苯 基; 当R5代表任选经取代的杂芳基时,那么它优选地是包含1、2或 3个(例如一个)杂原子(优选地选自氧、氮和硫)的5-或6-元芳香 族基团,这样形成例如吡啶基(诸如3-吡啶基、4-吡啶基或2-吡啶基)、 呋喃基(例如3-呋喃基)、吡唑基(例如4-吡唑基、5-吡唑基)、咪 唑基(例如4-咪唑基)、噁唑基(例如3-噁唑基)或吡嗪基(例如2- 吡嗪基); Q2代表卤素(例如氟)、-OC1-3烷基或任选经取代的芳基或任选 经取代的杂芳基(例如吡啶基,诸如4-吡啶基); Q3代表卤素(例如氯、氟、溴或碘)、C1-6(例如C1-3)烷基(例 如甲基)或-OC1-6烷基(例如-OC1-3烷基,诸如-OCH3)。 在本发明的一个特别优选的方面中,Ry2和Ry3的一个代表氢并且 另一个代表-Q1-R5,其中: (i)R5如在此所定义的可以代表氢、C1-6烷基。在本发明的这个 方面中,特别优选的是C1-6烷基基团被一个Q2基团取代,其中Q2代 表任选经取代的芳基或杂芳基,如在此所定义的; (ii)R5代表任选经取代的芳基或杂芳基,如在此所定义的。 -Q1-R5基团可以代表氢(并且因此-N(Ry2(Ry3)可以代表 -NH2)。然而,优选的-Q1-基团包括-C(O)-,并且优选的R5基团包括 氢、-CH3、-CF3、-异丙基、叔丁基、异丁基(-CH2-C(H)(CH3)2)、环 戊基、-(环丙基)(甲基)、环己基以及以下基团: 其中如在此通过Q2或Q3(当适当时)所定义的,“浮动的”Q2或Q3取代基代表该环上一个或多个取代基。 特别地,优选的-Q1-R5基团是包含芳香族环的那些。 本发明另外的优选化合物包括那些,其中对于其中Rx代表选项 (ii)的本发明的化合物: Z1代表-X3-S-X3a-或更优选的是-X1-O-X1a-或-X2-N(Rz3)-X2a-; X1代表-C(Rz4)(Rz5)-或一个直接键; X1a代表一个直接键或-C(Rz1)(Rz2)- X2代表一个直接键、-C(O)或-C(Rz4)(Rz5)-; X2a代表-C(Rz1)(Rz2)-或-C(O)-C(Rz1)(Rz2)-; Z1代表: (i)-X1-O-X1a-,其中X1之一代表-C(Rz4)(Rz5)-并且X1a代表一个 直接键,或X1代表一个直接键并且X1a代表-C(Rz1)(Rz2)-; (ii)-X1-O-X1a-或-X2-N(Rz3)-X2a-,其中X1和X2中的每个代表 -C(Rz4)(Rz5)-并且X1a和X2a中的每个代表-C(Rz1)(Rz2)-; (iii)-X2-N(Rz3)-X2a-,其中X2代表-C(O)-并且X2a代表 -C(Rz1)(Rz2)-;或 (iv)-X2-N(Rz3)-X2a-,其中X2代表一个直接键并且X2a代表 -C(O)-C(Rz1)(Rz2)-; Rz3代表氢、C1-4烷基(例如甲基)、-S(O)2C1-2烷基(例如 -S(O)2CH3)、-C(O)-C1-2烷基(例如-C(O)CH3); Rz1、Rz2、Rz4和Rz5各自独立地代表氢、C1-4烷基(例如甲基或 异丙基)或杂环烷基(例如包含一个或两个(例如一个)杂原子(优 选选自氮、氧和硫)的一种5-或6-元杂环烷基基团),并且其优选经 由一个碳原子被附接,例如未被取代的4-哌啶基); Z1优选代表-CH2-O-、-O-CH2-、-O-C(CH3)2-、-CH2-N(H)-CH2、 -CH2-O-CH2-、-CH2-N(CH3)-CH2、-O-C(H)(异丙基)-、-C(O)-N(H)-CH2、 -N(H)-C(O)-C(CH3)2-或-O-C(H)(4-哌啶基)。 当Rx代表选项(ii)时,该优选的基团是 其中这些二环如在此所定义的可以被任选地取代。在一些结构 中,任选的取代基被描述(例如甲基、异丙基、哌啶基)并且因此以 上所描述的Rx基团优选的是那种确切的结构(即如果被描述为这样的 话是未被取代的或被如所指示的具体取代基取代的)。 当Rx代表选项(ii)时,特别优选的基团包括: 本发明另外的优选化合物包括那些,其中对于其中Rx代表选项 (iii)的本发明的化合物: Z2代表-C(Rz6)(Rz7)-或-C(O)-; Z3代表一个直接键或-CH2-; Z2和包含Z3的环是这样一种,其中: (i)Z2代表-C(Rz6)(Rz7)-并且Z3代表一个直接键; (ii)Z2代表-C(Rz6)(Rz7)-并且Z3代表-CH2-; (iii)Z2代表-C(O)-并且Z3代表一个直接键; Rz6和Rz7独立地代表氢; Rz8代表氢(即A环是另外未被取代的)或代表任选地被=O和 -O-C1-4烷基取代的C1-6(例如C1-4)烷基(例如乙基),这样形成例 如一个-C(O)-CH3基团、-C(O)-OCH2CH3基团或一个-C(O)O-叔丁基基 团; 该“A”环是这样一种,其优选地代表: (i)任选地包含一个另外的杂原子(例如氮、氧或硫)的一种 5-或6-元杂环烷基基团,这样形成例如吗啉基、硫代吗啉基、哌啶基 或哌嗪基; (ii)任选地包含一个或两个另外的杂原子(例如选自氮、氧和 硫)的一种5-或6-元杂芳基环,这样形成例如咪唑基、三唑基(例如 1,2,4-三唑基)或吡唑基。 当Rx代表选项(iii)时,该优选的基团是 其中这些三环如在此所定义的可以被任选地取代。然而,优选地, Rx基团是正如以上所描述的那些,即进一步未被取代的或如所描述 (例如通过Rz8)的具体取代基。 当Rx代表选项(ii)时,特别优选的基团包括: 具有化学式(I)的化合物可以通过以下项的反应来制备: (i)一种具有化学式(II)的化合物, 其中Zx、R3和R4是如在上文中所定义的,与一种具有化学式(III) 的化合物进行反应, 其中R1、R2和Rx是如在上文中所定义的,例如在偶联反应条件 下、例如在适合的偶联试剂(例如1,1’-羰基二咪唑、N,N’-二环己基碳 二亚胺、1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺(或其盐酸盐)、N,N’- 二琥珀酰亚胺碳酸酯、苯并三唑-1-基氧基三(二甲基氨基)鏻六氟-磷酸 酯、2-(1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓六-氟磷酸酯(即O-(1H- 苯并三唑-1-基)-N,N,N′,N′-四甲基脲鎓六氟磷酸酯)、苯并三唑-1-基氧 基三-吡咯烷基鏻六氟磷酸酯、溴-三-吡咯烷基鏻六氟磷酸酯、2-(1H- 苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲鎓四-氟碳酸酯、1-环己基碳二亚胺-3- 丙基氧基甲基聚苯乙烯、O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N′,N′-四甲基 脲鎓六氟磷酸酯、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸 酯)存在下,任选地在适合的碱(例如氢化钠、碳酸氢钠、碳酸钾、 吡啶、三乙胺、二甲基氨基吡啶、二异丙胺、氢氧化钠、叔丁醇钾和 /或二异丙基胺基锂(或其变体))及适当的溶剂(例如四氢呋喃、吡 啶、甲苯、二氯甲烷、氯仿、乙腈、二甲基甲酰胺、三氟甲基苯、二 噁烷或三乙胺)存在下。此类反应可以在一种另外的添加剂(诸如1- 羟基苯并三唑水合物)存在下进行。可替换地,羧酸基团可以在标准 条件下被转化为相应的酰氯(例如在SOCl2或草酰氯存在下),然后 例如在与上述那些相似的条件下,该酰氯与具有化学式(II)的化合物 反应。还可替代地,当羧酸酯基团被转化为羧酰胺时,该反应可以在 诸如三甲基铝的适合的试剂(以及相关的具有化学式(II)的化合物) 存在下进行; (ii)一种具有化学式(IV)的化合物, 其中Zx、R3、R4、R1和R2是如在上文中所定义的,与一种具有 化学式(V)的化合物进行反应, Xa1-Rx (V) 其中Xa1表示一个合适的离去基团,例如一个合适的卤素基团(例 如氯基、碘基并且尤其是溴基),在合适的反应条件下反应,例如在金 属催化剂偶联反应条件下(例如,贵金属偶联反应条件,其中该贵金 属是例如基于钯的),特别是在优选地使用以下基于钯的催化剂的赫 克(Heck)反应条件下:例如乙酸钯、四(三苯基膦)钯(0)、双(三苯基 膦)钯(II)二氯化物、[1,1’-双(二苯基膦基)二茂铁]钯(II)二氯化物、等 等(优选地该催化剂是醋酸钯),例如任选地在一种适当的溶剂(例 如乙腈、等等)、碱(例如胺碱,例如N,N-二异丙基胺、等等)以及 一种配体(例如,三苯基膦、三-O-甲苯基膦、等等)的存在下。该反 应可以在密封管中和/或在微波中进行; (iii)既有的具有化学式(I)的化合物的修饰,例如通过标准官 能团的转换或转换为标准官能团(例如-N(H)-基团通过酰化转化为 -N(-C(O)-烷基)-基团等等)。 具有化学式(II)的化合物(其中有一个附接到必要的双键的任 一端的芳香族的R4取代基)可以通过以下项的反应来制备:一种具有 化学式(VI)的化合物, 或其一种经保护的衍生物(例如经氨基-保护的衍生物,例如 -N-Boc衍生物),其中Xa2被附接到必要双键的任一端并且代表一种 适合的离去基团(诸如碘、溴、氯)或一种磺酸盐基团(例如 -OS(O)2CF3,一种全氟丁磺酸根或类似物),并且Zx、R3和R4是如 在上文中所定义的,与一种具有化学式(VII)的化合物进行反应, Ar-Xa3 (VII) 其中Ar代表一种R4可以代表的芳香族基团(芳基或杂芳基), 并且Xa3代表一种适合的基团,诸如-B(OH)2、-B(ORwx)2或-Sn(Rwx)3, 其中每个Rwx独立地代表C1-6烷基基团,或在-B(ORwx)2的情况下,各 Rwx基团可以被连接到一起以形成一种4-至6-元环基团(诸如4,4,5,5- 四甲基-1,3,2-二氧硼戊环-2-基基团),由此形成例如一个频哪醇硼酸 酯基团。该反应可以在一种适合的催化系统(例如一种金属(或一种 盐或其络合物),诸如Pd、CuI、Pd/C、PdCl2、Pd(OAc)2、Pd(Ph3P)2Cl2、 Pd(Ph3P)4(即四(三苯基膦)钯)、Pd2(dba)3和/或NiCl2(优选的催化剂 包括钯))并且任选一种配体(诸如PdCl2(dppf).DCM、t-Bu3P、 (C6H11)3P、Ph3P、AsPh3、P(o-Tol)3、1,2-双(二苯基膦基)乙烷、2,2′-双 (二-叔丁基膦基)-1,1′-二苯基、2,2′-双(二苯基膦基)-1,1′-二-萘基、1,1’- 双(二苯基-膦基-二茂铁)、1,3-双(二苯基膦基)丙烷、双二苯基膦或其 一种混合物)的存在下,与一种适合的碱(诸如、Na2CO3、K3PO4、 Cs2CO3、NaOH、KOH、K2CO3、CsF、Et3N、(i-Pr)2NEt、t-BuONa或 t-BuOK(或其混合物);优选的碱包括Na2CO3和K2CO3)一起,在 一种适合的溶剂(诸如二噁烷、甲苯、乙醇、二甲基甲酰胺、二甲氧 基乙烷、乙二醇二甲醚,水、二甲基亚砜、乙腈、二甲基乙酰胺、N- 甲基吡咯烷酮、四氢呋喃或其混合物(优选的溶剂包括二甲基甲酰胺 和二甲氧基乙烷))中进行。该反应可以例如在室温或以上(例如在 高温,诸如在溶剂系统的大约回流温度下)进行。该反应可以在闭合 的反应器或微波中在高温下进行。 具有化学式(II)的化合物(例如其中有一个附接到必要的双键 的任一端的芳香族的R4基团)还可以通过以下项的消去反应来制备: 一种具有化学式(VIIA)的化合物, 其中虚线表明-OH取代基被附接到包含氮的杂环烷基基团上的 两个位置中的任一个上,并且Zx、R3和R4是如在上文中所定义的(并 且优选地,有一个芳香族的R4被附接到-OH基团所附接的相同碳原子 上),例如在标准的条件下,例如在碱消除反应条件(例如使用K2CO3或类似物作为碱)下。 具有化学式(III)的化合物可以通过以下项的反应来制备:一种 具有化学式(VIII)的化合物, 或其一种衍生物(例如其酯,诸如-C(O)O-叔丁基),其中R1和 R2是如在上文中所定义的,与一种如在上文中所定义的具有化学式 (V)的化合物进行反应,例如在诸如在上文中描述的那些(制备具有 化学式(I)的化合物、加工步骤(ii))的反应条件下,例如DIPEA、 Pd(OAc)2、三-O-甲苯基膦。 具有化学式(IV)的化合物可以通过以下项的反应来制备:一种 如在上文中所定义的具有化学式(II)的化合物,与一种具有化学式 (IX)的化合物进行反应, 其中Xa4代表一种适合的离去基团,例如一种磺酸盐、氯、碘或 溴(尤其氯),在标准的反应条件下,诸如在一种适合的碱(例如胺 碱,诸如三乙胺)和一种适合的溶剂(例如二氯甲烷)存在下。 具有化学式V(其中Rx代表环(i)并且Xx代表N)的化合物可 以通过以下项的反应来制备:一种具有化学式(IXA)的化合物, 其中Ry2和Ry3是如在上文中所定义的(例如都代表氢)并且Ry1是如在上文中所定义的(例如有一个Ry1取代基是α至-N(Ry2)(Ry3)基 团,例如其中Ry1代表-COO-乙基),通过卤化作用,例如通过在一 种适合的卤化物源(例如溴离子源包括N-溴代琥珀酰亚胺(NBS)和 溴,碘离子源包括碘、二碘乙烷、二碘四氯乙烷或优选N-碘代丁二酰 亚胺,并且氯离子源包括N-氯代琥珀酰亚胺、氯及一氯化碘)存在下 反应,例如在一种诸如乙腈的适合的溶剂(例如在一种诸如乙腈的适 合的溶剂存在下的NBS)存在下。 具有化学式(V)(其中Rx代表选项(ii),即该二环如在上文中所 定义的)的化合物可以通过以下项的分子内环化作用来制备:一种具 有化学式(X)的化合物, 其中“Alk”代表烷基基团(例如C1-6烷基,诸如乙基),X代 表-O-或-N(Rz3)-、并且剩余的整数(Xx、Xa1、Rz1、Rz2、Rz3、Rz4和 Rz5是如在上文中所定义的),在例如多种反应条件下,比如在一种适 合的碱(例如NaH)和适合的溶剂(例如DMF)存在下。 具有化学式(V)的化合物(其中Rx代表选项(ii),即一个二环, 其中X1和X2代表一个直接键)可以通过以下项的反应来制备:一种 具有化学式(XI)的化合物, 其中这些整数是如在上文中所定义的,与一种具有化学式(XII) 的化合物进行反应, 其中Xa5代表一种适合的离去基团,诸如氯、碘或溴(尤其溴), 并且其他的整数(Rz1、Rz2和Alk)是如在上文中所定义的,例如在多 种反应条件下,比如在一种适合的碱(例如NaH)和适合的溶剂(例如 DMF)存在下。相应的具有化学式(V)的化合物(其中Xa1不存在(即 代表氢))还可以相应地被制备(从相应的具有化学式(XI)的化合 物,其中Xa1不存在,即代表氢)。 具有化学式(V)的化合物(其中Xa1代表卤素(例如溴))可以 通过一种化合物的反应来制备,该化合物对应于具有化学式(V)的化 合物,但是其中Xa1代表氢,在适当的反应条件下,例如包含卤化物(例 如溴)离子源的那些,例如提供一种碘离子源(包括碘、二碘乙烷、 二碘四氯乙烷或优选N-碘代琥珀酰亚胺)、一种溴离子源包括N-溴 代琥珀酰亚胺和溴)及一种氯离子源(包含N-氯代琥珀酰亚胺、氯和 一氯化碘)的亲电子试剂,例如在一种适合的溶剂的存在下。 具有化学式(V)的化合物(其中Rx是选项(iii),即一个三环(例 如其中Z3是一个直接键))可以通过以下项的分子内环化作用来制备: 一种具有化学式(XII)的化合物, 其中这些整数是如在上文中所定义的,例如在多种反应条件下, 比如在一种适合的碱(例如NaH)和适合的溶剂(例如DMF)存在 下。 具有化学式(VI)的化合物(其中Xa2代表-O-S(O)2CF3)可以通 过以下项的反应来制备:一种具有化学式(XIII)的化合物, 或其一种经保护的衍生物,例如通过在一种适合的碱(例如一种 胺碱,诸如LDA,或类似物)的存在下反应,其可以首先制备并且将 具有化学式(XIII)的化合物添加至其,在低温(例如在约-78℃)下、 在例如惰性溶剂(例如无水极性无质子溶剂,诸如无水THF)存在下, 随后添加N-苯基-三氟甲烷磺酰亚胺或类似物。 具有化学式(X)的化合物可以通过以下项的反应来制备:一种 具有化学式(XIV)的化合物, 其中Xa5代表一种适合的离去基团,诸如溴、氯或碘(尤其溴), 并且其他的整数是如在上文中所定义的,与一种具有化学式(XV)的 化合物进行反应, 其中这些整数是如在上文中所定义的,在例如存在一种合适的碱 (例如一种胺碱,诸如三乙胺)和一种适合的溶剂(例如DMF)的条 件下,该反应可以在高温下、例如在密封管中和/或在微波中进行。 具有化学式(XII)的化合物可以例如在与涉及制备具有化学式 (X)的化合物(即一种具有化学式(XIV)的化合物与一种具有化学式 (XV)的化合物的反应)所描述的那些相似的条件下来制备,但是其 中具有化学式(XV)的化合物的“-X-H”基团(例如氨基基团)与用 于制备具有化学式(XII)的化合物的“A”环的-N(H)-基团相对应。 具有化学式(XIII)的化合物可以通过相应烯酮的双键的还原作 用来制备。 某些中间体化合物可以是可商购的,可以在文献中是已知的,或 可以通过与在此所描述的程序类似或通过常规的合成程序、根据标准 的技术、使用适当的试剂和反应条件从可获得的起始材料中来获得。 在本发明的最终化合物或相关的中间体上/中的某些取代基可以 在以上所述的程序之后或过程中,通过那些本领域普通技术人员所熟 知的方法被修饰一次或多次。此类方法的实例包含取代、还原、氧化、 烷化、酰化、水解、酯化、醚化、卤化或硝化。 本发明的化合物可以使用常规技术(例如重结晶,适当时在标准 的条件下)从它们的反应混合物中分离。 本领域技术人员将理解,在上述和在下文程序中,可能需要通过 保护基对中间体化合物的官能团进行保护。 此类保护的需要将取决于远端官能度的性质和制备方法的条件 而变化(并且该需求可以由本领域的普通技术人员容易确定)。适合 的氨基-保护的基团包括乙酰基、三氟乙酰基、叔丁氧基羰基(BOC)、 苯甲氧基羰基(CBz)、9-芴基亚甲基氧基羰基(Fmoc)和2,4,4-三 甲基戊烷-2-基(其可以在酸存在下(例如在水/乙醇(例如MeOH) 中的HCl,或类似物),通过反应而脱保护)。这样的保护的需要容 易由本领域普通技术人员确定。例如-C(O)O-叔丁酯基团可以用作对于 -C(O)OH基团的保护基团,并且因此前者例如通过在一种弱酸(例如 TFA,或类似物)存在下反应可以被转化为后者。 官能团的保护和脱保护可以在上述方案中的反应步骤之前或之 后进行。 保护基团可以根据本领域普通技术人员所熟知的和如在下文中 所描述的技术而去除。例如,在此所描述的经保护的化合物/中间体可 以使用标准的脱保护技术被化学转化为未保护的化合物。 所涉及的化学类型将指示保护基团的需求和类型以及用于完成 合成的次序。 保护基团的使用被完全描述于“有机合成中的保护基团” (“Protective Groups in Organic Synthesis”),第3版,格林(T.W. Greene)&沃尔茨(P.G.M.Wutz),威力跨学科(Wiley-Interscience) (1999)。 如在上文所述的方法中制备的具有化学式(I)的化合物能够以 对映异构体的外消旋混合物的形式合成,这些对映异构体可以遵循领 域中已知的拆分规程而得以彼此分离。那些以外消旋形式获得的具有 化学式(I)的化合物可以通过与合适的手性酸发生反应而转化成相 应的非对映异构体盐的形式。所述非对映异构盐形式随后例如通过选 择性或分步结晶法分离,且通过碱使对映异构体从其中释出。将具有 化学式(I)的化合物的对映异构体形式进行分离的可替代的方式涉 及使用了手性固定相的液相色谱法。所述纯立体化学异构形式还可以 衍生自适当起始物质的相对应的纯立体化学异构形式,其条件是反应 立体特异性地进行。优选地,如果希望一个特定的立体异构体,所述 化合物将通过立体专一制备方法而合成。这些方法将有利地使用对映 异构体纯的起始材料。 在此描述的化合物是FabI酶的抑制剂,如在此通过实例所证明 的。鉴于这些FabI酶抑制特性,在此描述的这些化合物因此对于治疗 细菌感染可以是有用的。例如,这些化合物可用于治疗细菌感染,例 如上呼吸道感染(例如中耳炎、细菌性气管炎、急性会厌炎、甲状腺 炎)、下呼吸道(例如脓胸、肺脓肿)、心(例如感染性心内膜炎); 胃肠道(例如分泌性腹泻、脾脓肿、腹膜后脓肿)、CNS(例如脑脓 肿)、眼睛(例如眼睑炎、结膜炎、角膜炎、眼内炎、隔膜前和眼眶 蜂窝组织炎、泪囊炎)、肾及尿道(例如附睪炎、肾内和肾周围脓肿、 中毒性休克综合征)、皮肤(例如脓疱病、毛囊炎、皮肤脓肿、蜂窝 组织炎、伤口感染、细菌性肌炎),及骨骼和关节(例如败血性关节 炎、骨髓炎)。此外,与已知的抗生素组合的这些化合物可以是有用 的。 因此,本发明也涉及用作为药物,特别是用于治疗细菌感染,特 别是由表达FabI酶的细菌引起的细菌感染的本发明的化合物。因此, 本发明的化合物可用于制备治疗细菌感染的药物,特别是由表达FabI 酶的细菌引起的细菌感染。 此外,本发明提供了一种用于治疗细菌感染的方法,该方法包括 向对其有需要的受试者给予一种抑制FabI酶的本发明的化合物。 需要治疗的受试者具有细菌感染或者已经暴露于传染性细菌,其 症状可以通过给予一个治疗有效量的本发明的化合物来缓解。例如, 对于治疗有需要的受试者可以具有一种本发明的化合物可以作为一 种治疗剂给药的感染。在另一个实例中,对于治疗有需要的受试者可 以具有一种本发明的化合物可以作为预防药的开放性创伤或烧伤。典 型地,将治疗已存在生物感染的一位受试者。 受试者可以具有由以下细菌引起的细菌感染:炭疽杆菌、柠檬酸 杆菌属、大肠杆菌、土拉弗朗西斯菌、流感嗜血杆菌、单核细胞增多 性李斯特氏菌、卡他莫拉菌、结核分枝杆菌、脑膜炎奈瑟菌、奇异变 形杆菌、普通变形杆菌、沙门氏菌属、沙雷氏菌属、志贺氏菌属、嗜 麦芽寡养单胞菌、金黄色葡萄球菌或表皮葡萄球菌。优选地,对该受 试者治疗(预防性或治疗性地)由表达FabI酶的细菌所引起的细菌感 染。 术语“治疗(treating)”和“治疗(treatment)”,如在此使用 的,是指治愈性、缓和性以及预防性的治疗,包括逆转、减轻、抑制 进展,或预防该术语适用的疾病、失调或病症或者这种疾病、失调或 病症的一种或多种症状。 本发明的化合物的“治疗有效量”是指当给予需要治疗的受试者 时,改进受试者的预后(例如延迟与细菌感染相关的一种或多种受试 者症状的发作和/或降低其严重性)的量。有待给予受试者这种披露的 化合物的量将取决于具体的疾病、给药方式以及受试者的特征,如总 体健康、其他疾病、年龄、性别、基因型、体重以及药物耐受性。本 领域普通技术人员将能够取决于这些以及其他因素确定适当的剂量。 可以在几种生物测定法的一种测定中对这些化合物进行测试,以 确定具有给定药理作用所需要的化合物浓度。 另外,本发明提供包括至少一种药学上可接受的载体和治疗有效 量的本发明的化合物的药物组合物。 为了制备本发明的药物组合物,将有效量的碱或酸加成盐形式的 特定化合物(作为活性成分)与至少一种药学上可接受的载体紧密混 合,所述载体依照给药所需的制剂形式可采用广泛的各种形式。这些 药物组合物希望是处于单位剂型,优选适用于口服给药、直肠给药、 经皮给药或肠胃外注射。 例如,在制备处于口服剂型的这些组合物中,在口服液体制剂如 悬浮液、糖浆剂、酏剂以及溶液的情况下,可以使用任何常用的液体 药物载体,例如像水、二醇类、油类、醇类等;或者如在粉剂、丸剂、 胶囊和片剂的情况下,使用固体药物载体,例如淀粉、糖、高岭土、 润滑剂、粘合剂、崩解剂等。因为易于给药,片剂和胶囊代表最有利 的口服剂量单位形式,在这种情况下,显然使用固体药物载体。对于 肠胃外注射组合物,药物载体将主要包括无菌水,但可以包括其他成 分来用于改进活性成分的溶解性。可注射溶液可以例如通过使用一种 包括盐溶液、葡萄糖溶液或两者的混合物的药物载体来制备。也可通 过使用合适的液体载体、助悬剂等制备可注射悬浮液。在适用于经皮 给药的组合物中,药物载体可以任选地包括渗透增强剂和/或合适的润 湿剂,任选地与小比例的不会对皮肤造成显著有害影响的合适的添加 剂组合。可以选择所述添加剂以便促进活性成分的皮肤给药和/或有助 于制备所希望的组合物。这些局部用组合物可以按多种方式给予,例 如作为透皮贴剂,点涂剂或软膏。由于具有化学式(I)的化合物的加 成盐与相应的碱形式相比有增加的水溶性,显然更适合用在水性组合 物的制备中。 这点对于配制处于便于易于给药和剂量均匀的剂量单位形式的 本发明的药物组合物是尤其有利的。如在此所用的“剂量单位形式” 是指适用于作为单位剂量的物理离散单位,每个单位含有经计算可以 与所需的药物载体结合来产生希望的治疗效果的预定量的活性成分。 此类剂量单位形式的实例是片剂(包括刻痕或包衣片剂)、胶囊、丸 剂、粉剂包、糯米纸囊剂、可注射溶液或悬浮液、茶匙剂(teaspoonfuls)、 汤匙剂(tablespoonfuls)等以及其分隔的多个。 对于口服给药,本发明的药物组合物可以采取固体剂型的形式, 例如片剂(可吞咽及可咀嚼的形式)、胶囊或软胶囊,它们是由常规 手段制得的,采用药学上可接受的赋形剂和载体,如结合剂(如预胶 化玉米淀粉、聚乙烯吡咯烷酮、羟丙基甲基纤维素等)、填料(如乳 糖、微晶纤维素、磷酸钙等)、润滑剂(如硬脂酸镁、滑石粉、二氧 化硅等)、崩解剂(如马铃薯淀粉、淀粉乙醇酸钠等)、润湿剂(如 十二烷基硫酸钠)等。此类片剂还可通过本领域熟知的方法来进行包 衣。 用于口服给药的液体制剂可以采取例如溶液、糖浆或悬浮液的的 形式,或其可以被配制成一种在使用前与水和/或其他合适的液体载体 混合的干产品。这样的液体制剂可以常规的方法,任选用药学上可接 受的添加剂例如助悬剂(例如山梨醇糖浆、甲基纤维素、羟丙基甲基 纤维素或氢化食用油)、乳化剂(例如卵磷脂或阿拉伯胶)、非-水性 载体(例如杏仁油、油酯或乙醇)、甜味剂、调味剂、掩蔽剂和防腐 剂(例如对-羟基苯甲酸甲酯或对-羟基苯甲酸丙酯或山梨酸)来制备。 在本发明的药物组合物中有用的药学上可接受的甜味剂优选地 包括至少一种强烈的甜味剂,例如阿斯巴甜、乙酰磺胺酸钾、环拉酸 钠、阿力甜、双氢查耳酮甜味剂、莫内林、甜菊苷、三氯蔗糖(4,1′,6′- 三氯-4,1′,6′-三脱氧半乳蔗糖)或,优选地糖精、糖精钠或钙,以及任 选地至少一种填充型甜味剂,例如山梨糖醇、甘露醇、果糖、蔗糖、 麦芽糖、异麦芽酮糖醇、葡萄糖、氢化的葡萄糖浆、木糖醇、焦糖或 蜂蜜。强力甜味剂方便地以低浓度使用。例如,在糖精钠的情况下, 所述浓度的范围可以是从最终制剂的约0.04%至0.1%(重量/体积)。 该填充型甜味剂可以在较大的以下浓度范围内有效地使用:从约10% 至约35%,优选从约10%至15%(重量/体积)。 可以掩盖在低剂量制剂中的苦味成分的药学上可接受的调味剂 优选是果味调味剂,如樱桃、覆盆子、黑醋栗或草莓调味剂。两种调 味剂的组合可以产生非常好的效果。在高剂量制剂中,可以需要较强 的药学上可接受的调味剂,如焦糖巧克力、冰薄荷、迷幻剂(Fantasy) 等等。每种调味剂可以按范围为从约0.05%至1%(重量/体积)的浓 度存在于最终组合物中。可有利地使用所述强调味剂的组合。优选地, 使用在配制品的环境下不会出现任何味道和/或颜色的改变或丢失的 调味剂。 本发明的化合物可经配制供通过注射,方便地静脉内、肌肉内或 皮下注射,例如以大剂量推注或连续静脉内输注以经胃肠外给药。用 于注射的制剂可以单位剂型存在,例如以安瓿或包括添加的防腐剂的 多剂量容器存在。它们可采用在油性或水性媒介中的悬浮液、溶液或 乳液形式,并可含有配制剂例如等渗剂、助悬剂、稳定剂和/或分散剂。 作为选择,活性成分可以粉末的形式存在供在使用前与适合的媒介, 例如无菌、无热源水混合。 本发明的化合物也可配制成直肠组合物,例如栓剂或保留灌肠 剂,其例如含有常规的栓剂基质例如可可脂和/或其它甘油酯。 对与FabI酶的抑制有关的抗细菌疾病的治疗熟练的技术人员会 很容易地从下文呈现的测试结果中确定本发明的化合物的治疗有效 量。一般而言,预计治疗有效剂量应从约0.001mg/kg至约50mg/kg 所欲治疗的患者体重,更优选地从约0.01mg/kg至约10mg/kg体重。 可以适当地将治疗有效剂量以两个或更多个子剂量以适当的间隔在 一天内给药。所述子剂量可以被配制成单位剂型,例如每个单位剂型 含有的活性成分是从约0.1mg至约1000mg,更特别地是从约1至约 500mg。 如本领域技术人员所熟知的,给药的精确剂量和频率取决于所用 的特定本发明的化合物、所欲治疗的特定病症、所欲治疗的病症的严 重度、特定病患的年龄、体重及一般的身体状况以及病患可能服用的 其它医药而定。此外,所述“治疗有效量”可被降低或增加,这取决 于接受治疗的患者的反应和/或取决于开出本发明的化合物的医生的 评估。因此,上文提及的有效日剂量范围仅具有指导意义。 本发明的/具有化学式(I)的化合物,无论是用于上述适应症或其 它适应症可以具有比先有技术已知化合物更有效、毒性更低、作用时 间更长、更强效、产生更低副作用、更容易吸收,和/或具有更佳的药 物动力学特性(例如更高的口服生物利用度和/或更低的清除率)的优 点,和/或具有优于先有技术已知化合物的其它有用的药理、生理或化 学性质。这些化合物鉴于在包含Zx的环中的必要的双键,还可以展现 这样的优点。 例如,本发明的/具有化学式(I)的化合物可具有这样的优点,即 它们具有良好或改良的热动力学溶解度(例如相较于先有技术中已知 的化合物;及例如以已知的方法和/或本文中所述的方法来测定)。本 发明的/具有化学式(I)的化合物也可具有这样的优点,即它们具有广 谱的抗细菌活性(例如与先有技术中已知的化合物相比,具有更广谱 的抗细菌活性;及例如以已知的试验和/或本文中所述的试验来测定)。 本发明的/具有化学式(I)的化合物也可具有这样的优点,即它们具有 良好或改良的体内药物动力学及口服生物利用度。它们还可具有这样 的优点,即它们具有良好或改良的体内疗效。例如,本发明的化合物 可以适应于静脉内配制品/给药,并且因此当在静脉内给药时可以展现 出改进的体内疗效。这些化合物鉴于在包含Zx的环中的必要的双键, 还可以展现这样的优点。 实验部分 缩写 “DMF”定义为N,N-二甲基甲酰胺,“DCM”或“CH2Cl2”定 义为二氯甲烷,“MeOH”定义为甲醇,“EtOH”定义为乙醇,“MgSO4” 定义为硫酸镁,并且“THF”定义为四氢呋喃,“AcOE”或“EtOAc” 被定义为乙酸乙酯,“DIPEA”被定义为二异丙基乙胺,“EDCI”被 定义为N′-(乙基碳亚胺基)-N,N-二甲基-1,3-丙二胺一氢氯化物, “HOBT”被定义为1-羟基-1H-苯并三唑,“DIPA”被定义为二异丙 胺,“K2CO3”被定义为碳酸钾,“TFA”被定义为三氟乙酸,“NH4OH” 被定义为氢氧化铵,“NaHCO3”被定义为碳酸氢钠盐,“Et2O”被 定义为二乙醚,“Na2SO4”被定义为硫酸二钠盐,“CH3CN”被定义 为乙腈,“NaOH”被定义为氢氧化钠,“n-BuLi”被定义为正丁基 锂,“i-PrOH”被定义为异丙醇,“Pd(OAc)2”被定义为乙酸钯,“DMA” 被定义为二甲基乙酰胺,“Et3N”被定义为三乙胺,SFC被定义为超 临界流体色谱。 立体化学表述 具有化学式(I)的化合物具有至少两个不对称碳原子,例如Rx可以代表的稠环。该稠环系统可以仅作为‘顺式’形式而存在,因为由 于环张力,‘反式’形式可以不能被制备。 实例的合成 其中Rx代表环(i)的最终化合物的合成 最终化合物C的合成 实例A-制备中间体A 制备CAS[324784-95-4] a)Pd((OH)2)2、NEt3、EtOAc、室温、3巴;b)苯基镁、THF、5℃、 3h;c)HCl、回流、30分钟 制备4-Boc-六氢氮杂卓酮CAS[1889-75-88-4](中间体A1) 将1-苄基六氢-4H-氮杂卓-4-酮CAS[1208-75-9](34.0g,141.8 mmol)、二碳酸二叔丁酯(34.1g,156mmol)和皮尔曼(Pearlman) 催化剂CAS[12135-22-7](6.1g,42.5mmol)在EtOAc(750mL)和 三乙胺(23.7mL,170.2mmol)中的混合物在帕尔振荡器(Parr shaker) 中在3巴和室温下进行氢化过夜。 将反应混合物通过硅藻土短垫过滤,用EtOAc洗涤滤饼,将滤 液用水洗涤,然后用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干燥以给出 28.8g(95%)的4-Boc-六氢氮杂卓酮CAS[1889-75-88-4]。 制备中间体A2: 在N2气流下,在0℃,将氯化苯镁(1.8M,91.5mL,165mmol) 逐滴添加至4-Boc-六氢氮杂卓酮CAS[1889-75-88-4](29.3g,137 mmol;中间体A1)在THF(300ml)中的溶液里,然后将混合物在 5℃下搅拌3小时。添加NH4Cl 10%水溶液和EtOAc,分离有机层, 用水和盐水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干以给出37.8g(95%) 的醇中间体。 中间体A3-1H-氮杂卓,2,3,6,7-四氢-4-苯基CAS[324784-75-95-4] 将醇中间体(37.8g,129.7mmol;中间体A2)在35%HCl在水 中的水溶液(190mL)里的溶液在室温下搅拌1小时。将反应混合物 倾倒入冰水中,并且将K2CO3固体分部分加入(直至pH=9-10), 然后将其用DCM萃取两次。收集有机层,用水洗涤,干燥(MgSO4) 并蒸发。通过硅胶柱色谱(洗脱液:梯度从1%NH4OH、93%DCM、 7%MeOH至1%NH4OH、90%DCM、10%MeOH)将残余物(15.2g) 进行纯化。收集纯级分,蒸发溶剂,产生:7.1g、(32%)的1H-氮 杂卓,2,3,6,7-四氢-4-苯基CAS[324784-75-95-4](中间体A3a)和2.3g (10%)的1H-氮杂卓,2,3,4,7-四氢-5-苯基CAS[324784-75-93-2](中 间体A3b)。 实例A的另外中间体 在N2下反应。在-20℃下将BuLi(1.6M于己烷中)(8.28ml, 13.2mmol)滴加至DIPA(1.86ml,13.2mmol)在THF(20ml)中 的溶液里并且然后将该混合物在-20℃下搅拌20分钟。然后在-78℃ 下添加1-叔丁氧羰基-4-哌啶酮(2.2g,11.0mmol)在THF(20ml) 中的溶液并且将所得混合物在-78℃下搅拌30分钟。然后在-78℃下, 添加2-[N,N-双(三氟甲基磺酰基)-氨基]-5-氯吡啶(4.97g,12.1mmol) 在THF(10ml)中的溶液,然后允许将该混合物达到室温并且搅拌过 夜。将混合物浓缩并且通过快速色谱法在硅胶(硅胶30μm,80g, 庚烷/EtOAc 75/25)上进行残余物的纯化。收集所希望的产物并且将 溶剂蒸发,从而产生2.9g的中间体(A4)。 在N2下反应。将中间体(4)(0.3g,0.905mmol)和3,4-(亚甲二 氧基)苯基硼酸(0.18g,1.09mmol)在K2CO3(2M,0.905ml)和乙 二醇二甲醚(3ml)中的溶液用N2吹扫10分钟,然后添加四(三苯基 膦)钯(0)(0.105g,0.0905mmol)。将该混合物使用具有输出功率从 0到400W范围的单模微波(initiator 60)在80℃ 下加热20min,冷却至室温,添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗 涤,然后用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干。通过快速色谱 法在硅胶(硅胶10g,15-40μm,庚烷100至庚烷/EtOAc 90/10)上 进行残余物的纯化,收集纯的级分并且蒸发至干,从而产生0.17g的 中间体(A5)。 将中间体(A5)(0.17g,0.56mmol)在TFA(0.5ml)和DCM (3ml)中的溶液在室温下搅拌30分钟,添加K2CO3(10%水溶液) 和DCM,将有机层分离,用水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干, 从而产生0.11g的中间体(A6)。 在N2下反应。将中间体(A4)(0.3g,0.905mmol)和呋喃-2-硼 酸(0.122g,1.09mmol)在K2CO3(0.905ml)和乙二醇二甲醚(3ml) 中的溶液用N2吹扫10分钟,然后添加四(三苯基膦)-钯(0)(0.105g, 0.0905mmol)。将该混合物使用具有输出功率从0到400W范围的 单模微波(initiator 60)在80℃下加热20min, 冷却至室温,添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗涤,然后用盐水 洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干。通过快速色谱法在硅胶(10g, 15-40μm,庚烷100至庚烷/EtOAc 90/10)上进行残余物的纯化。收 集纯的级分并且蒸发至干,从而产生0.1g的中间体(A7)。 将中间体(A7)(0.1g,0.401mmol)在TFA(0.3ml)和DCM (2ml)中的溶液在室温下搅拌30分钟,添加K2CO3(10%水溶液) 和DCM,将有机层分离,用水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干, 从而产生0.046g的中间体(A8)。 在N2下反应。将中间体(A4)(0.28g,0.845mmol)和呋喃-3- 硼酸(0.104g,0.93mmol)在K2CO3(2M,0.845ml)和乙二醇二 甲醚(3ml)中的溶液用N2吹扫10分钟,然后添加四(三苯基膦)-钯 (0)(0.0977g,0.0845mmol)。将该混合物使用具有输出功率从0到 400W范围的单模微波(initiator 60)在80℃ 下加热20min,冷却至室温,添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗 涤,然后用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干。通过快速色谱 法在硅胶(10g,15-40μm,庚烷100至庚烷/EtOAc 90/10)上进行残 余物的纯化。收集纯的级分并且蒸发至干,从而产生0.146g的中间 体(9)。 将中间体(A9)(0.146g,0.586mmol)在TFA(0.5ml)和DCM (3ml)中的溶液在室温下搅拌30分钟,添加K2CO3(10%水溶液) 和DCM,将有机层分离,用水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干, 从而产生0.085g的中间体(A10)。 在N2下反应。将中间体(A4)(0.1g,0.302mmol)和2-甲氧基 苄基氯化锌(0.724ml,0.93mmol)在THF(0.5ml)中的溶液通过 N2鼓泡10分钟除气,然后添加1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁二氯钯(II) (0.022g,0.03mmol)。将该混合物使用具有输出功率从0到400W 范围的单模微波(拜泰齐initiator 60)在80℃下加热 20min,冷却至室温,添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗涤,然 后用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干,从而产生中间体(A11)。 将中间体(A11)(0.232g,0.765mmol)在TFA(0.6ml)和DCM (5ml)中的溶液在室温下搅拌45分钟,添加K2CO3(10%水溶液) 和DCM,将有机层分离,用水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干, 从而产生0.145g的中间体(A12)。 在N2下反应。将中间体(A4)(0.3g,0.905mmol)和苯并[b]呋 喃-2-硼酸(0.176g,1.09mmol)在K2CO3(2M,0.905ml)和乙二 醇二甲醚(3ml)中的溶液用N2吹扫10分钟,然后添加四(三苯基- 膦)钯(0)(0.105g,0.0905mmol)。将该混合物使用具有输出功率从 0到400W范围的单模微波(拜泰齐initiator 60)在80℃ 下加热20min,冷却至室温,添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗 涤,然后用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干。通过快速色谱 法在硅胶(10g,15-40μm,庚烷100至庚烷/EtOAc 90/10)上进行残 余物的纯化。收集纯的级分并且蒸发至干,从而产生0.217g的中间 体(A13)。 将中间体(A13)(0.217g,0.725mmol)在TFA(0.6ml)和DCM (4ml)中的溶液在室温下搅拌30分钟,添加K2CO3(10%水溶液) 和DCM,将有机层分离,用水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干。 在N2下反应。将中间体(A4)(0.752g,1.36mmol)和4-甲氧基 -3-吡啶基硼酸(0.25g,1.64mmol)在K2CO3(2M,1.36ml)和乙 二醇二甲醚(8ml)中的溶液用N2脱气10分钟,然后添加四(三苯基 膦)钯(0)(0.157g,0.0136mmol)。将该混合物使用具有输出功率从 0到400W范围的单模微波(拜泰齐initiator 60)在80℃ 下加热30min,冷却至室温,添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗 涤,然后用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干。通过快速色谱 法在硅胶(30g,15-40μm,梯度洗脱,从CH2Cl2至 CH2Cl2/MeOH/NH4OH:97/3/0.1)上进行残余物的纯化,收集纯的级 分并且蒸发至干,从而产生0.19g的中间体(A15)。 将中间体(A15)(0.2g,0.689mmol)和TFA(0.218ml)在DCM (2ml)中的混合物在室温下搅拌30分钟,添加K2CO3(10%水溶液) 和DCM,将有机层分离,用水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干, 从而产生0.11g的中间体(A16)。 在N2下反应。将BuLi(1.6M于THF中)(3.76ml,6.02mmol) 在-20℃下滴加至DIPA(0.846ml,6.02mmol)在THF(10ml)中 的溶液里并且然后将该混合物在-20℃下搅拌20分钟。然后在-78℃ 下添加1-N-Boc-3-哌啶酮(1.0g,5.02mmol)在THF(10ml)中的 溶液并且将所得混合物在-78℃下搅拌30分钟。在-78℃下,添加 2-[N,N-双(三氟甲基磺酰基)氨基]-5-氯吡啶(2.26g,5.52mmol)在THF (5ml)中的溶液,然后允许将该混合物达到室温并且搅拌过夜。将 反应混合物蒸发至干燥。将得到的残余物通过正相色谱(硅胶,450g, 20-45μm,流动相(90%庚烷,10%AcOEt))纯化。收集所希望的 级分并且将溶剂蒸发,从而产生0.32g的中间体(A17)。 在N2下反应。将中间体(A17)(0.32g,0.966mmol)和2-甲氧 基苯基硼酸(0.176g,1.16mmol)在K2CO3(2M,0.97ml)和乙二 醇二甲醚(3ml)中的溶液用N2吹扫10分钟,然后添加四(三苯基膦) 钯(0)(0.112g,0.097mmol)。将该混合物使用具有输出功率从0到 400W范围的单模微波(拜泰齐initiator 60)在80℃ 下加热20min,冷却至室温,添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗 涤,然后用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干。通过快速色谱 法在硅胶(10g,15-40μm,庚烷100至庚烷/EtOAc 80/20)上进行残 余物的纯化,收集纯的级分并且蒸发至干,从而产生0.22g的中间体 (A18)。 将中间体(18)(0.2g,0.76mmol)和TFA(0.6ml)在DCM(4 ml)中的混合物在室温下搅拌30分钟,添加K2CO3(10%水溶液)和 DCM,将有机层分离,用水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干,从 而产生0.13g的中间体(A19)。 将1-苄基-3-甲基-4-哌啶酮(2.0g,9.84mmol)、二碳酸二叔丁 酯(2.36g,10.8mmol)和皮尔曼催化剂(氢氧化钯(II))(0.35g, 2.46mmol)在EtOAc(50ml)中的混合物在帕尔振荡器(Parr shaker) 中氢化(3巴,室温)过夜。将反应混合物通过短硅藻土垫过滤,滤 饼用EtOAc洗涤,滤液用水然后用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸 发至干,从而产生2.2g中间体(A20)。 在N2下反应。将BuLi(1.6M于THF中)(3.52ml,5.63mmol) 在-20℃下滴加至DIPA(0.791ml,5.63mmol)在THF(8ml)中的 溶液里并且然后将该混合物在-20℃下搅拌20分钟。然后在-78℃下 添加中间体(A20)(1.0g,4.70mmol)在THF(10ml)中的溶液并 且将所得混合物在-78℃下搅拌30分钟。在-78℃下,添加N-苯基三 氟甲烷磺酰亚胺(1.92g,5.16mmol)在THF(6ml)中的溶液,然 后允许将该混合物达到室温并且搅拌过夜。将混合物浓缩并且通过正 相色谱(硅胶,450g,20-45μm,流动相(80%庚烷,20%AcOEt)) 纯化。收集所希望的级分并且将溶剂蒸发,从而产生1.7g的中间体 (A21)。 在N2下反应。将中间体(A21)(1.0g,1.45mmol)和苯基硼酸 (0.194g,1.59mmol)在K2CO3(2M,1.45ml)和乙二醇二甲醚(10 ml)中的溶液用N2吹扫10分钟,然后添加四(三苯基膦)-钯(0)(0.167 g,0.145mmol)。将该混合物使用具有输出功率从0到400W范围 的单模微波(拜泰齐initiator 60)在80℃下加热20min, 冷却至室温,添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗涤,然后用盐水 洗涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干,从而产生0.23g的中间体(A22)。 将中间体(A22)(0.23g,0.841mmol)和TFA(0.8ml)于DCM (5ml)中的混合物在室温下搅拌30分钟,然后将反应混合物倾倒入 K2CO3(10%水溶液)中并且用DCM萃取。分离有机层,用水洗涤, 干燥(MgSO4)并蒸发至干,产生0.143g中间体(A23)。 将N-苄基六氢氮杂卓-4-酮盐酸盐(25.0g,104.3mmol)、二碳 酸二叔丁酯(25.0g,114.7mmol)和皮尔曼催化剂(4.46g,31.3mmol) 在EtOAc(550ml)和三乙胺(17.4ml,125.13mmol)中的混合物在 在帕尔(Parr)振荡器中氢化(3巴,室温)过夜。将反应混合物通过 硅藻土短垫过滤,用EtOAc洗涤滤饼,将滤液用水洗涤,然后用盐 水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干,给出23.4g中间体(A24)。 在N2下反应。在0℃,将氯化苯镁(1.8M,93.8ml,169mmol) 逐滴添加至中间体(A24)(30g,141mmol)在THF(300ml)中的 溶液里,然后将混合物在5℃下搅拌3小时,添加NH4Cl的10%水溶 液和EtOAc,分离有机层,用水和盐水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发 至干,给出39.2g中间体(A25)。 将中间体(A25)(38.85g,133.3mmol)于HCl(在水中35%, 200ml)中的溶液在室温下搅拌1小时。将反应混合物倾倒入碎冰中, 并且将K2CO3固体分部分加入(直至pH=9-10),然后将其用DCM 萃取两次。收集有机层,用水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干。将 残余物用制备型液相色谱法纯化(硅胶20-45μm,1000g,流动相(1% NH4OH,93%DCM,7%MeOH))。收集纯的级分并蒸发溶剂,产 生中间体(A26)和中间体(A27)。 在N2下反应。在-20℃,将在己烷中的1.6M正丁基锂(6.35ml, 9.31mmol)逐滴添加至二异丙基胺(1.43ml,10.2mmol)在THF(15 ml)中的溶液里,然后将混合物在-20℃下搅拌20分钟。然后在-78℃ 下添加中间体(A24)(1.9g,8.46mmol)在THF(20ml)中的溶液 并且将所得混合物在-78℃下搅拌30分钟。在-78℃下,添加2-[N,N- 双(三氟甲基磺酰基)-氨基]-5-氯吡啶(3.8g,9.31mmol)在THF(10 ml)中的溶液,然后允许将该混合物达到室温并且搅拌过夜和浓缩。 将残余物通过正相柱色谱法(硅胶20-45μm,450g,流动相(80%庚 烷,20%乙酸乙酯))纯化。收集纯的级分并蒸发溶剂,给出1.34g 中间体(A28)。 在N2下反应。将在THF(2ml)中的中间体(A28)(0.24g,0.695 mmol)和在THF(0.5M,3.34ml,1.67mmol)中的苄基溴化锌的溶 液用氮气鼓泡除气10分钟,然后添加1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁二氯 -钯(II)(0.102g,0.139mmol)。将该混合物使用具有输出功率从0 到400W范围的单模微波(拜泰齐initiator 60)在80℃ 下加热20min,冷却至室温,添加水和乙酸乙酯,将混合物通过硅藻 土短垫过滤,分离有机层,用水洗涤,然后用盐水洗涤,干燥(MgSO4) 并蒸发至干。将残余物通过快速色谱法在短硅胶柱上用庚烷至庚烷 /EtOAc)(90/10)的混合物进行纯化。收集纯的级分并蒸发至干,产 生0.11g中间体(A29)。 将中间体(A29)(0.11g,0.383mmol)和TFA(0.3ml)于DCM (2ml)中的混合物在室温下搅拌30分钟,然后将反应混合物倾倒入 K2CO3(10%水溶液)中并用DCM萃取。分离有机层,用水洗涤,干 燥(MgSO4)并蒸发至干,产生0.058g中间体(A30)。 在N2下反应。在0℃,将3-氯苯基溴化镁(0.5M,100ml,50.0 mmol)逐滴添加至中间体(4)(8.9g,41.7mmol)在THF(90ml) 中的溶液里,然后将混合物在5℃搅拌3小时。添加NH4Cl(10%水 溶液)和EtOAc,分离有机层,用水和盐水洗涤,干燥(MgSO4)并 蒸发至干。将残余物在硅胶柱上[15-40μm,庚烷/EtOAc 80/20至庚烷 /EtOAc 60/40]通过快速色谱法进行处理。收集纯的级分并蒸发至干, 产生4.4g中间体(A31)。 将中间体(A31)(4.4g,13.5mmol)在HCl水中,(35%,22ml) 中的溶液在室温下搅拌1小时。将反应混合物倾倒入碎冰中,并且将 K2CO3固体分部分加入(直至pH=9-10),然后将其用DCM萃取两 次。收集有机层,用水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干。将水层蒸 发,吸收在DCM中,并过滤。将其与第一提取物一起收集,并蒸发 至干。将残余物通过快速色谱法在硅胶(15-40μm,90g,从DCM到 DCM/MeOH/NH4OH:90/10/0.5)上进行。收集有机层,并且蒸发至 干。将残余物通过制备型液相色谱法(硅胶15-45μm,300g,流动相 (0.5%NH4OH,90%DCM,10%MeOH))进行纯化。收集纯的级 分并蒸发溶剂,给出1g中间体(12)和0.4g中间体(A33)。 在N2下反应。在-78℃,将正丁基锂于己烷中的溶液(1.6M,3.52 ml,5.63mmol)逐滴添加至噻唑(0.366ml,5.16mmol)在二乙醚(5 ml)中的溶液里,并且将混合物搅拌30分钟。添加中间体(A24)(1.0 g,4.69mmol)于二乙醚(5ml)中的溶液,然后将混合物搅拌,并 允许其达到室温持续2小时。添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗 涤,然后用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干。通过制备型液相 色谱法(硅胶15-40μm,25g,流动相(70%庚烷,30%EtOAc)), 将残余物进行纯化,给出1.05g中间体(A34)。 将在乙腈(6mL)中的中间体(A34)(710mg,2.38mmol)和 浓HCl(2mL)在回流下搅拌2天。蒸发溶剂。添加水和DCM。添 加K2CO3粉末来碱化水层,并且除去有机层。用K2CO3将水层饱和之 后,再次用DCM萃取水层。将合并的有机层浓缩,并且将残余物通 过柱色谱法在硅胶(15-40μm,25g)上进行纯化和分离,产生137mg 中间体(A35)和65mg中间体(A36)。 在N2下反应。在0℃,将3-(三氟甲基)苯基溴化镁(0.5M在Et2O 中,5.6mmol,10ml)逐滴添加至中间体(4)(1g,4.69mmol)在 THF(15ml)中的溶液里,然后将混合物在5℃下搅拌3小时。添加 NH4Cl(10%水溶液)和EtOAc,分离有机层,用水和盐水洗涤,干 燥(MgSO4)并蒸发至干。通过快速色谱法在硅胶上(40g,庚烷/EtOAc 从85/15)进行纯化。收集纯的级分并浓缩,产生520mg中间体(A37)。 将中间体(A37)(400mg,1.13mmol)于HCl(在水中37%,15 ml)中的溶液在回流下搅拌30分钟,然后冷却至室温。将反应混合 物倾倒入碎冰中,并且将K2CO3固体分部分加入(直至pH=9-10), 然后将其用DCM萃取两次。收集有机层,用水洗涤,干燥(MgSO4) 并蒸发至干。通过制备型液相色谱法(硅胶5μm,150×30.0mm, 流动相(梯度是从0.2%NH4OH、98%DCM、2%MeOH至1.2% NH4OH、88%DCM、12%MeOH))将残余物进行纯化。收集纯的级 分并蒸发溶剂,产生140mg中间体(A38)和42mg中间体(A39)。 在N2下反应。在0℃,将3-氯-5-氟苯基溴化镁(5M在THF中) (14.1mL,7mmol)逐滴添加至中间体(A24)(1g,4.7mmol)在 THF(20ml)中的溶液里,然后将混合物在5℃下搅拌3小时,添加 NH4Cl(10%水溶液)和EtOAc,分离有机层,用水和盐水洗涤,干 燥(MgSO4)并蒸发至干。通过快速色谱法在硅胶上(40g,庚烷/EtOAc 从85/15)进行纯化。收集纯的级分并浓缩,产生900mg中间体(A40)。 将中间体(A40)(900mg,2.5mmol)于HCl(在水中37%,30ml) 中的溶液在回流下搅拌30分钟,然后冷却至室温。将反应混合物倾 倒入碎冰中,并且将K2CO3固体分部分加入(直至pH=9-10),然 后将其用DCM萃取两次。将有机层收集,并且用水洗涤,干燥 (MgSO4)并且蒸发至干。将残余物通过制备型液相色谱法(硅胶5 μm,150×30.0mm)进行纯化,流动相(梯度是从0.2%NH4OH、98% DCM、2%MeOH至1%NH4OH、90%DCM、10%MeOH)。收集两 种级分并蒸发溶剂,产生290mg中间体(A41)和80mg中间体 (A42)。 在N2下反应。在0℃,将3-氯-5-氟苯基溴化镁(0.5M,在THF 中,18.7ml,9.37mmol)逐滴添加至中间体(A4)(1g,4.7mmol) 在THF(20ml)中的溶液里,然后将混合物在5℃下搅拌3小时。 添加NH4Cl(10%水溶液)和EtOAc。收集有机层,用水和盐水洗涤, 干燥(MgSO4)并蒸发至干。通过快速色谱法在硅胶上(40g,庚烷 /EtOAc从85/15)进行纯化。收集纯的级分并蒸发溶剂,产生650mg 中间体(A43)。 将中间体(A43)(800mg,2.33mmol)于HCl(在水中37%,25 ml)中的溶液在回流下搅拌30分钟,并且然后冷却至室温。将反应 混合物倾倒入碎冰中,并且将K2CO3固体分部分加入(直至pH= 9-10),然后将其用DCM萃取两次。将有机层收集,用水洗涤,干 燥(MgSO4)并且蒸发至干。将粗产物通过制备型液相色谱法进行纯 化(硅胶5μm,150×30.0mm,流动相(梯度是从0.2%NH4OH、98% DCM、2%MeOH至1%NH4OH、90%DCM、10%MeOH))。收集 两种级分并蒸发溶剂,产生325mg中间体(A44)和90mg中间体 (A45)。 在N2下反应。在-78℃,将正丁基锂(1.6M,在己烷中,10.55ml, 16.88mmol)逐滴添加到2-溴噻吩(1.5ml,15.47mmol)在二乙醚(7.5 ml)中的溶液里,然后将混合物搅拌30分钟。添加中间体(A24)(3g, 14.07mmol)于二乙醚(7.5ml)中的溶液。将混合物搅拌并允许其达 到室温持续2小时。添加水和EtOAc,分离有机层,用水洗涤,然后 用盐水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干。通过制备型液相色谱法(硅 胶15-40μm,90g,流动相(80%庚烷,20%EtOAc))将残余物进行 纯化。收集纯的级分并蒸发溶剂,产生2.65g中间体(A46)。 将在乙酸(45mL)中的中间体(A46)(6.3g,21.18mmol)和 浓HCl(15mL)在回流下搅拌45分钟。蒸发溶剂。添加水和DCM。 添加K2CO3粉末来碱化,并且除去有机相。用K2CO3粉末将水相饱和, 并用DCM和甲醇(95/5)的溶剂混合物进行萃取。将两个有机相合 并,蒸发至干,并且将残余物通过柱色谱法在硅胶上(15-40μm,100 g)用DCM/甲醇/NH4OH(92/7/1)的溶剂混合物进行纯化,产生中间 体(A47)。 在N2下反应。在0℃,将溴(2,3-二氯苯基)-镁(0.75M在Et2O 中,15mmol,20ml)逐滴添加至中间体(A24)(2.1g,10mmol)在 THF(20ml)中的溶液里,然后将混合物在5℃下搅拌3小时。添加 NH4Cl(10%水溶液)和EtOAc,分离有机层,用水和盐水洗涤,干 燥(MgSO4)并且蒸发至干。将粗产物从庚烷/EtOAc 80/20中结晶, 并且风干,从而产生700mg中间体(A49)。 将中间体(A49)(700mg,1.694mmol)于HCl(在水中37%, 30ml)中的溶液在回流下搅拌30分钟,然后冷却至室温。将反应混 合物倾倒入碎冰中,并且将K2CO3固体分部分加入(直至pH=9-10), 然后将其用DCM萃取两次。将有机层收集,用水洗涤,干燥(MgSO4) 并且蒸发至干。将粗产物通过制备型液相色谱法(硅胶5μm,150× 30.0mm,流动相(梯度是从0.2%NH4OH、98%DCM、2%MeOH至 1.1%NH4OH、89%DCM、11%MeOH))进行纯化。收集纯的级分 并蒸发溶剂,产生中间体(A50)和第二级分。通过制备型液相色谱法 (硅胶5μm,150×30.0mm,流动相(梯度是从0.2%NH4OH、98% DCM、2%MeOH至1.1%NH4OH、89%DCM、11%MeOH))将第 二级分进行纯化。收集纯的级分并蒸发溶剂,产生中间体(A51)。 在N2下反应。在0℃,将溴[3-(三氟甲氧基)苯基]-镁(0.5M在 Et2O中,4.15mmol)逐滴添加至中间体(A24)(0.6g,2.77mmol) 在THF(10ml)中的溶液里,然后将混合物在5℃下搅拌3小时。 添加NH4Cl(10%水溶液)和EtOAc,分离有机层,用水和盐水洗涤, 干燥(MgSO4)并蒸发至干。通过快速色谱法在硅胶上(40g,庚烷 /EtOAc从80/20)进行纯化。收集纯的级分并浓缩,产生250mg中间 体(A52)。 将中间体(A52)(240mg,0.639mmol)于HCl(37%,在水中, 10ml)中的溶液在回流下搅拌30分钟,然后冷却至室温。将反应混 合物倾倒入碎冰中,并且将K2CO3固体分部分加入(直至pH=9-10), 然后将其用DCM萃取两次。收集有机层,用水洗涤,干燥(MgSO4) 并蒸发至干。通过柱色谱法在硅胶上(15-40μm,25g),用DCM/ 甲醇/乙腈(92/7/1)的溶剂混合物,将残余物(136mg)进行纯化, 给出86mg中间体(A53)和33mg中间体(A54)。 在N2下反应。在0℃,将溴[2-(三氟甲氧基)苯基]-镁(1M在Et2O 中,13.7mmol)逐滴添加至中间体(A24)(1.95g,9.1mmol)在THF (20ml)中的溶液里,然后将混合物在5℃下搅拌3小时。添加NH4Cl (10%水溶液)和EtOAc,分离有机层,用水和盐水洗涤,干燥(MgSO4) 并且蒸发至干。通过快速色谱法在硅胶上(40g,庚烷/EtOAc从80/20) 进行纯化。收集纯的级分并浓缩,产生550mg中间体(A55)。 将在乙酸(4.5mL)中的中间体(A55)(450mg,1.2mmol)和 浓HCl(1.5mL)在回流下搅拌过夜。蒸发溶剂。添加水和DCM。添 加K2CO3粉末来碱化。将有机层除去并蒸发,并且将粗产物通过制备 型液相色谱法(硅胶5μm,150×30.0mm,流动相(梯度是从0.2% NH4OH、98%DCM、2%MeOH至1.2%NH4OH、88%DCM、12% MeOH))进行纯化。收集两种级分并蒸发溶剂,产生140mg中间体 (A56)和63mg中间体(A57)。 将六氢-1-(苯甲基)-4H-氮杂卓-4-酮盐酸盐(56g,233mmol)添 加至Na2CO3(饱和水溶液,1000ml)和EtOAc(1000mL)中。将混 合物搅拌30分钟。分离有机层,将水层用EtOAc(1000mL)进行萃 取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并且将滤液的溶剂蒸发。 在室温下(0.4MPa)用Pd(OH)2(15g)作为催化剂,将在EtOAc(800 ml)中的残余物和二碳酸叔丁酯(66g,300mmol)进行氢化。在将 氢(1当量)吸收后,将催化剂滤出,并将滤液进行蒸发。通过柱色 谱法在硅胶上(洗脱液:石油醚/EtOAc 3/1)将该残余物进行纯化。 收集纯的级分并蒸发溶剂,产生49g中间体(A58)。 将Mg(0.34g,14mmol)、数滴1-溴-3-甲氧基-苯(1.1ml,9.28 mmol)于THF(5mL)中的溶液以及在THF(30mL)中的碘(0.01 g)引入到一个配备有氮气源、漏斗和回流冷凝器的无水三颈烧瓶中。 将混合物温和地加热,直到反应开始,然后以可保持回流的速率逐滴 添加1-溴-3-甲氧基-苯的剩余溶液。继续搅拌,直至碘完全消失(大 约1小时)。然后将该混合物冷却至0℃。将中间体(A58)(2.0g, 9.38mmol)在THF(10ml)中的溶液添加至该混合物里。将反应混 合物在冰浴中搅拌,然后加热至室温。将反应混合物用饱和NH4Cl(20 mL)淬灭,并在室温下搅拌过夜。将有机层分离,将水层用EtOAc (3x50mL)萃取。将合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤,并且将 滤液的溶剂进行蒸发。通过柱色谱法在硅胶上(洗脱液:石油醚/EtOAc 10/1)将该残余物进行纯化。收集产物级分并蒸发溶剂,产生2.3g中 间体(A59)。 在0℃,向中间体(A59)(2.0g,6.5mmol)在DCM(30mL) 中的溶液里逐滴添加TFA(20mL)。在添加之后,将该混合物在室 温下搅拌2小时。将反应混合物进行浓缩(<35℃)。将混合物用盐 水(20mL)、Na2CO3(5g)和EtOAc(20mL)分配,将水层用EtOAc (3×20mL)进行萃取。将合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤,并 将溶剂进行蒸发。通过柱色谱法在硅胶上(洗脱液:DCM/MeOH 30/1) 将残余物进行纯化。收集纯的级分并蒸发溶剂,产生0.2g中间体 (A60)。 以下化合物是用与以上实例相同的方法制成的,由此1-甲氧基-3- 甲基苯分别被1-溴-2-甲基-苯、2-溴-4-氟-1-甲氧基-苯、1-溴-4-氯-苯、 1-溴-2-甲氧基-苯、2-溴-4-氟-1-甲基-苯、1-溴-4-甲氧基-苯、1-溴-3- 甲氧基-苯、1-溴-3-氯-苯或1-溴-2-氯-苯替代。 将1-溴-2-氟-苯(1.48g,8.5mmol)于无水THF(50mL)中的 溶液在-78℃在氮气下搅拌30分钟,并且然后在-78℃经5-10分钟逐 滴添加正丁基锂(2.5M,在己烷中,3.5mL,10.1mmol),并且将 形成的混合物搅拌30分钟。然后通过注射器添加在THF(10mL)中 的中间体(A58)(1.5g,101mmol)。添加之后,将冷却浴移除。将 该反应混合物搅拌1小时,然后用1N HCl(200ml)进行淬灭,将该 混合物用DCM(3x100mL)萃取。将合并的有机层分离,并且用无 水Na2SO4干燥,然后过滤并在真空下浓缩。 通过柱色谱法在硅胶上(洗脱液:石油醚/EtOAc 10/1)将该残余 物进行纯化。收集纯的级分并蒸发溶剂,产生1.54g中间体(A73)。 在0℃,向中间体(A73)(1g,3.2mmol)在DCM(20mL)中 的溶液里逐滴添加TFA(15mL)。在添加之后,将该混合物在室温 下搅拌2小时。将反应混合物进行浓缩(<35℃)。将混合物用盐水 (5mL)、Na2CO3(5g)和EtOAc(50mL)分配,将水层用EtOAc (3×50mL)进行萃取。将合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤,并 且将溶剂进行蒸发。通过柱色谱法在硅胶上(洗脱液:DCM/MeOH 30/1)将残余物进行纯化。收集纯的级分并蒸发溶剂,产生0.6g中间 体(A74)。 以下化合物是用与以上实例相同的方法制成的,由此1-溴-2-氟- 苯分别被2-溴-1-氟-3-甲氧基-苯或2-溴-1,4-二甲基-苯替代。 在-78℃下,向中间体(A58)(5g,23mmol)在THF(100ml) 中的溶液里添加LDA(23ml,46mmol)。将该混合物在-50℃下搅 拌0.5小时。将碘甲烷(6.5g,46mmol)添加至该混合物并且在环境 温度下搅拌过夜。将该反应混合物用100ml盐水淬灭。将有机层分离, 并且将水层用EtOAc萃取。将这些有机层合并并且浓缩。通过柱色谱 法在硅胶上(洗脱液:石油醚/EtOAc 9/1)将粗产物进行纯化。收集 产物级分并蒸发溶剂,产生3g中间体(A77)。 在0℃下,向中间体(A77)(1.7g,7.5mmol)在THF(50ml) 中的溶液里添加溴苯基-镁(3M,3.7ml,11.2mmol)。将该混合物 在环境温度下搅拌过夜。将该反应混合物用50ml盐水淬灭。将有机 层分离,并且将水层用EtOAc萃取。将这些有机层合并并且浓缩。通 过柱色谱法在硅胶上(洗脱液:石油醚/EtOAc 1/1)将粗产物进行纯 化。收集产物级分并蒸发溶剂,产生0.5g中间体(A78)。 将中间体(A78)(0.5g,1.64mmol)于HCl(10ml,6mol/L, 在水中)中的混合物回流过夜。将溶剂在减压下去除。将残余物用20 ml水溶解。用K2CO3将形成的溶液碱化至pH 10。将所得的溶液用 EtOAc(4×50ml)萃取。将有机层合并并且浓缩,从而产生0.3g中 间体(A79)。 实例B-制备中间体B a)DIPEA,Pd(OAc)2,三-O-甲苯基膦,DMF,ACN,μW 180℃; b)HATU,DIPEA,DMF,70℃;c)TFA;HCl(在二噁烷中),DCM, RT 制备中间体(B3) 制备中间体B1 将2-氨基-5-溴吡啶(4g,23.12mmol)、叔丁基-丙烯酸酯(13.42 mL,92.48mmol)和N,N-二异丙基乙胺(7.64mL,46.24mmol)在 DMF(60mL)和ACN(20mL)中的溶液进行搅拌并且用N2脱气 10分钟。添加乙酸钯(0.52g,2.32mmol)和三-O-甲苯基膦(1.41g, 4.63mmol)并且将该溶液使用具有输出功率从0至400W范围的多 模腔微波MARS系统在180℃下加热30min。将该反应混合 物通过硅藻土短衬垫过滤并且用EtOAc洗涤。将有机层用水洗涤, 经MgSO4干燥,过滤并且蒸发至干。将残余物通过柱色谱在硅胶 (SiOH 20-45μm,450g,洗脱液:0.1%NH4OH,97%DCM,3% MeOH)上纯化。产生:中间体B1,一种淡黄色粉末3.55g(70%) 制备中间体B2 将中间体B1(0.8g,3.63mmol)、5-甲烟碱酸(0.9g,6.54mmol)、 O-(7-A氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N′,N′-四甲基脲鎓六氟-磷酸酯CAS [148893-10-1](2.49g,6.54mmol)和N,N-二异丙基乙胺(1.4mL, 7.99mmol)在无水DMF(16mL)中在70℃下搅拌过夜。将该混合 物倾倒入水中。将有机层用CH2Cl2进行萃取。将合并的有机层用盐水 洗涤,经MgSO4干燥,过滤并浓缩。将残余物从EtOH中结晶以获得 一种浅米色粉末,从而产生:(50140532-AAA)0.86g(70%)。 制备中间体B3 将三氟乙酸(4.9mL,63.35mmol)添加到中间体B2(0.86g, 2.53mmol)在CH2Cl2(9mL)中的溶液里。将该反应混合物在室温 下搅拌4小时,在减压下进行浓缩并且然后与Et2O研磨,滤出并且在 真空下干燥。然后将该残余物在氯化氢(4M在二噁烷中)(8.2mL, 32.94mmol)中研磨,将固体滤出,用Et2O洗涤并且在真空(70℃) 下干燥。产生:中间体B3白色粉末,0.878g,(99%)。 制备中间体B5 制备中间体B4 用与中间体B2相同的方式,从中间体B1和烟酸CAS[59-67-6] 起始来制备化合物中间体B4。产生:0.35g,29%。 制备中间体B5 用与中间体B3相同的方式,从中间体B4起始来制备化合物中 间体B5。产生:0.99g,99%。 制备中间体B7 制备中间体B6 用与中间体B2相同的方式,从中间体B1和5-甲氧基烟酸CAS [1044919-31-4]起始来制备化合物中间体B6。产生:0.74g,92%。 制备中间体B7 根据制备中间体B3的方法,从中间体B6起始来制备化合物中 间体B7。产生:0.75g,97%。 制备中间体B9 制备中间体B8 用与中间体B2相同的方式,从中间体B1和丁二酸单甲酯CAS [3878-55-5]起始来制备化合物中间体B8。产生:0.76g,65%。 制备中间体B9 用与中间体B3相同的方式,从中间体B8起始来制备化合物中 间体B9。产生:0.40g,99%。 制备中间体B11 制备中间体B10 用与中间体B2相同的方式,从中间体B1和3-糠酸CAS[488-93-7] 起始来制备化合物中间体B10。产生:0.35g,49%。 制备中间体B11 用与中间体B3相同的方式,从中间体B10起始来制备化合物中 间体B11。产生:0.38g,91%。 实例C(最终化合物) 最终化合物(化合物C)的合成 制备化合物C1 从1H-氮杂卓,2,3,6,7-四氢-4-苯基CAS[324784-75-95-4](中间 体A3)和中间体B5来制备化合物化合物C1。将约1∶1摩尔当量的 氮杂卓和中间体B5、1-羟基苯并三唑(约1.2摩尔当量,与中间体B5 相比)、偶联试剂(诸如1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸 盐(例如约1.2摩尔当量,与中间体B5相比))、碱(例如三乙胺, 例如与中间体B5相比约3摩尔当量)以及溶剂(例如二氯甲烷、THF 或其类似物或混合物)在室温下搅拌(例如过夜)。将混合物倾倒入 水中。将有机层用CH2Cl2进行萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经 MgSO4干燥,过滤并浓缩。如有可能,将该残余物(例如用乙醇或另 外的适合溶剂)结晶、滤出并且在真空下(任选在高温下)进行干燥。 产生:呈白色粉末0.027g的化合物C1,(21%)。m.p.186℃。 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ(ppm)11.27(s,1H),9.14(s,1H), 8.76(d,J=4.41Hz,1H),8.71(br.s.,1H),8.36(d,J=7.88Hz,1H),8.28 -8.33(m,1H),8.22-8.27(m,1H),7.51-7.59(m,2H),7.27-7.40(m,5H), 7.20-7.26(m,1H),5.97-6.07(m,1H),3.67-3.98(m,4H),2.72-2.83(m, 2H),2.51-2.60(m,2H)。 制备化合物C2 用与化合物C1相同的方式,从1H-氮杂卓,2,3,6,7-四氢-4-苯基 CAS[324784-75-95-4](中间体A3)和中间体B11起始来制备化合物 化合物C2。产生:呈白色粉末0.024g的化合物C2,(6%)。m.p.156℃。 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ(ppm)10.82(s,1H),8.67(br.s., 1H),8.57(s,1H),8.24-8.30(m,1H),8.18-8.24(m,1H),7.80(s,1H), 7.53(d,J=15.45Hz,1H),7.27-7.37(m,5H),7.20-7.26(m,1H),7.08(s, 1H),6.07-6.00(m,1H),3.66-3.97(m,4H),2.74-2.83(m,2H),2.54(m, 2H)。 其中Rx代表环(ii)的最终化合物的合成 最终化合物F的合成 制备中间体D 制备中间体D1 从2,3,6,7-四氢-4-(4-氟-2-甲氧基苯基)-氮杂卓(其根据在此所述 的方法制备;见例如以上制备中间体A)来制备的化合物中间体D1, 由此将丙烯酰氯(例如至少一当量,诸如约1.2当量)在溶剂(例如 DCM)中的溶液逐滴添加至在溶剂(例如DCM)中的起始材料(2,3,6,7- 四氢-4-(4-氟-2-甲氧基苯基)-氮杂卓;1当量)和碱(例如三乙胺,至 少1当量,诸如约1.2当量)里,可以将该混合物在室温下搅拌,在 搅拌之后,可以将该混合物进行后处理(例如通过添加水和DCM, 分离有机层,用水洗涤,用MgSO4干燥并且蒸发至干)并且根据标准 方法(例如色谱)分离该产物。产生:0.27g,65%。 制备中间体E 制备中间体E2 制备中间体E1 使用具有输出功率从0到400W范围的单模微波(拜泰齐()initiator EXP 60)在120℃下将甘胺酸甲酯盐酸盐(4.93 g,39.3mmol)、2-氨基-5-溴-3-溴乙基吡啶(10g,19.7mmol)和三 乙胺(13.7mL,98.3mmol)在DMF(100mL)中的混合物在密封管 中加热10min。添加CH2Cl2和最小量的水,分离有机层,干燥(MgSO4) 并且蒸发至干。将残余物(6g)通过快速色谱法在硅胶(120g,15-40 μm,流动相100%CH2Cl2)上进行纯化。收集纯的级分并浓缩以提供 3g的中间体E1。 制备中间体E2 在N2气流下,在5℃将NaH(0.8g,20.1mmol)分部分添加至 中间体E1(4.6g,16.8mmol)在DMF(50mL)中的溶液里,然后 将该混合物在室温下搅拌2小时。添加EtOAc和最小量的水,将有机 层分离,将水层用NaCl进行饱和并且用EtOAc萃取。将合并的有机层 干燥(MgSO4)并且蒸发至干。将残余物从EtOH中结晶,将沉淀滤 出并且在真空下干燥以给出1.5g(37%)的中间体E2。 制备中间体E4 制备中间体E3 用与中间体E1相同的方式,从2-氨基-5-溴-3-溴乙基吡啶和乙醇 酸乙酯起始来制备中间体E3。产生:1.2g,22%。 制备中间体E4 用与中间体E2相同的方式,从化合物4起始来制备中间体E4。 产生:1.2g,27%。 最终化合物F的合成 制备化合物F1 用如在上文中所述的相同方式,从中间体E2和中间体D1起始 来制备化合物化合物F1。将中间体D1(1.5当量)和中间体E2(1 当量)在适合的溶剂(例如乙腈和DMF,或类似物)中搅拌并且用 N2脱气10分钟。将乙酸钯(催化剂)和三-O-甲苯基膦添加入密封管 中。使用具有输出功率从0到400W范围的单模微波(拜泰齐()initiator EXP 60)、在180℃下将该溶液加热30min。 将该反应混合物进行后处理并且分离所希望的产物(例如通过色谱)。 产生:化合物F10.170g,(32%)。m.p.192℃。 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.72(br.s.,1H),8.42(s,1H),7.97 (br.s.,1H),7.50(d,J=15.2Hz,1H),7.22(d,J=15.2Hz,1H),6.85 -7.07(m,3H),5.73-5.80(m,1H),3.60-3.98(m,11H),2.97(br.s.,1H), 2.59(br.s.,2H),2.44(br.s.,2H)。 实例G a)HOBT,EDCI,NEt3,DCM,THF,RT,18h;b)氯甲酸氯 乙酯,DCE,MeOH,50℃,1h;c)NaH,DMF,RT,3h。 制备化合物G1 将CAS[709649-93-4](3.37g,5.80mmol)、CAS[324784-95-4] (1.21g,6.96mmol;中间体A3)、N′(乙基碳亚胺基)-N,N-二甲基-1,3- 丙二胺(1.33g,6.96mmol)、1-羟基苯并三唑(0.94g,6.96mmol) 和三乙胺(1.93mL,13.9mmol)在CH2Cl2(70mL)和THF(70mL) 中的混合物在室温下搅拌过夜。添加水和CH2Cl2,分离有机层,用水 洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干。将残余物(3.13g)吸收在EtOH 中,滤出并且干燥(真空,60℃)以给出2.56g(87%)的化合物G1。 制备化合物G2 将1-氯甲酸氯乙酯(0.064mL,0.59mmol)添加至化合物G1(250 mg,0.49mmol)在MeOH(5mL)中的溶液里,然后将该混合物在 80℃下搅拌1小时并且蒸发至干。然后,将二氯乙烷(5mL)添加至 所得沉淀里并且将该混合物搅拌至50℃持续1小时。将所得混合物 蒸发至干。然后,将剩余的沉淀用K2CO3(10%)和EtOAc吸收,分 离有机层,用水和盐水洗涤,干燥(MgSO4),并且蒸发至干。将残 余物(0.3g)通过快速色谱法在硅胶(15-40μm 10g,流动相梯度从 100%CH2Cl2至96%CH2Cl2,4%CH3OH,0.1%NH4OH)上进行纯化。 收集纯的级分,并且蒸发至干。将残余物(0.080g)从EtOH中结晶, 将沉淀滤出并且干燥以提供0.050g(26%)的448162946-AAA(化合 物G2)。m.p.216℃。 制备化合物G3 将乙酰氯(14.6μL,0.21mmol)添加至化合物G2(50mg,0.13 mmol)在三乙胺(21.5μL,0.15mmol)和CH2Cl2(2mL)中的溶液 里。将该混合物在室温下搅拌过夜。添加水和CH2Cl2,分离有机层, 用水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干以给出0.053g的化合物G3。 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.88(br.s.,1H),8.49(br.s.,1H), 8.10(s,1H),7.49(d,J=15.5Hz,1H),7.19-7.37(m,6H),5.99-6.05(m, 1H),4.71(br.s.,2H),4.44(s,2H),3.76-3.92(m,4H),2.77-2.84(m,2H), 2.52-2.58(m,2H),2.05(s,3H)。 制备化合物G4 用与化合物化合物G3相同的方式,从化合物G2和甲磺酰氯起 始来制备化合物化合物G4。产生:0.030g,(50%)。 1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.28(br.s.,1H),8.56(s,1H), 8.20(s,1H),7.50(d,J=16Hz 1H),7.19-7.37(m,6H),6.02(m,1H), 4.55(s,2H),4.15(s,2H),3.72-3.96(m,4H),2.98(s,3H),2.80(m,2H), 2.54(m,2H)。 实例H 制备化合物H1 将CAS[709649-77-4](2.2g,4.57mmol)、CAS[324784-95-4] (0.95g,5.48mmol;中间体A3)、N′(乙基碳亚胺基)-N,N-二甲基-1,3 丙二胺(1.05g,5.48mmol)、1-羟基苯并三唑(0.74g,5.48mmol) 和三乙胺(2.2mL,15.9mmol)在CH2Cl2(40mL)和THF(40mL) 中的混合物在室温下搅拌48小时。添加水和CH2Cl2,分离有机层, 用水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发至干。将残余物(3.13g)吸收在 EtOH中,滤出并且干燥(真空,60℃)以给出1.42g(77%)的化合 物H1。m.p.201℃。 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ10.37(s,1H),8.52(s,1H),8.17 (br.s.,1H),7.47-7.53(m,1H),7.20-7.37(m,6H),5.99-6.07(m,1H), 3.67-3.96(m,6H),3.42(s,2H),2.74-2.82(m,2H),2.52-2.48(m,2H), 2.37(s,3H)。 制备化合物H2 用如化合物化合物H1相同的方式,从CAS[709649-77-4]和中间 体A47(其根据在此所述的方法来制备;见制备中间体A)起始来制 备化合物化合物H2。产生:化合物H2,0.06g(7.5%)。 实例I 中间体I 从中间体I(例如I4)制备最终化合物 制备中间体I4 a)NaH,DMF,80℃;b)Br2,DMF,RT;c)DIPEA,Pd(OAc)2, 三-O-甲苯基膦,DMF,ACN,μW,180℃;d)TFA,HCl(在二噁烷 中),DCM,RT 制备中间体I1 在室温下,经10分钟的一段时间向NaH(0.77g,19.23mmol) 在DMF(15mL)中的悬浮液里逐滴添加2-氨基-3-羟基吡啶(3g, 27.24mmol)在DMF(15mL)中的溶液,并且将该混合物在室温下 搅拌20分钟。经20分钟的一段时间向该混合物里逐滴添加乙基-2- 溴异戊酸酯CAS[609-12-1](2.63mL,16.03mmol),将该反应混合 物在室温下搅拌1小时并且在80℃下搅拌2小时。在冷却之后,添 加冷水,并且将该混合物用EtOAc萃取。将有机层依次用水和盐水洗 涤,经MgSO4干燥并且在减压下进行浓缩。将残余物通过快速色谱法 在硅胶(80g,流动相梯度从85/15至70/30的庚烷/EtOAc)上进行纯 化。收集纯的级分并且将溶剂去除。产生:呈白色粉末的中间体I1, 1.14g,(37%)。 制备中间体I2 向中间体I1(1.14g,3.26mmol)在DMF(24mL)中的溶液里 逐滴添加溴(0.23mL,4.57mmol)。将该反应混合物在室温下搅拌 过夜。将该反应混合物在剧烈搅拌下倾入水中。添加EtOAc,分离有 机层,用MgSO4干燥,滤出并且蒸发。将该残余物从EtOH中结晶并 且干燥。产生:中间体I2,0.66g,(75%)。 制备中间体I3 根据制备中间体B1的方法(在上文中所描述),从中间体I2和 叔丁基-丙烯酸酯起始来制备化合物中间体I3。产生:白色粉末0.31g (40%)。 制备中间体I4 根据制备中间体B3的方法(如在上文中所描述),从中间体I3 起始来制备化合物中间体I4。产生:白色粉末0.29g(89%)。 其中Rx代表环(iii)的最终化合物的合成: 中间体实例J和最终实例K 制备中间体A 如在上文中所描述的来制备这些。 制备中间体J a)Et3N,DMF,μW;b)NaH,DMF,RT;c)DIPEA,Pd(OAc)2, 三-O-甲苯基膦,DMF,ACN,μW;d)TFA,HCl,DCM,RT 制备中间体J4 制备中间体J1 2-氨基-5-溴-3-(溴甲基)吡啶(15.2g,30.3mmol)、3-吗啉甲酸 甲酯盐酸盐(5.5g,30.3mmol)和三乙胺(21mL,151mmol)在 DMF(150mL)中的溶液,并且使用具有输出功率从0至400W范 围(50%)的多模腔微波MARS系统将该溶液在开放容器中在 120℃下加热10min。添加水和EtOAc,分离有机层,用水、盐水洗 涤,经MgSO4干燥,过滤并且蒸发至干,产生:中间体J1 11.2g(定 量)。 制备中间体J2 在室温下,将NaH分部分地添加至中间体J1(13.3g,40.3mmol) 在DMF(100mL)中的溶液里,然后将该混合物搅拌5小时。添加 水和EtOAc,将沉淀滤出。将有机层分离,用水洗涤,然后用盐水洗 涤,干燥(MgSO4)并且蒸发至干。收集残余物和沉淀,并且从EtOH 中结晶。产生:中间体J2 5g(42%)。 制备中间体J3 将中间体J2(4g,13.42mmol)、叔丁基-丙烯酸酯(7.8mL, 53.7mmol)和N,N-二异丙基乙胺(4.4mL,26.83mmol)在DMF(30 mL)和ACN(80mL)中的溶液进行搅拌并且用N2脱气10分钟。添 加乙酸钯(0.3g,1.34mmol)和三-O-甲苯基膦(0.82g,2.68mmol) 并且将该溶液使用具有输出功率从0至400W范围的多模腔微波 MARS系统在180℃下加热30min。将该反应混合物通过短衬垫过滤并且用EtOAc洗涤。将有机层用水洗涤,经MgSO4干燥,过滤并且蒸发至干。将残余物吸收(EtOH),过滤并干燥(真 空),产生中间体J3 3.1g(67%) 制备中间体J4 将三氟乙酸(17.5mL,227.25mmol)添加到中间体J3(3.1g, 8.97mmol)在CH2Cl2(30mL)中的溶液里。将该反应混合物在室温 下搅拌30分钟,在减压下进行浓缩并且然后与Et2O研磨,滤出并且 在真空下干燥。产生:中间体J4 3.6g(99%)。 制备中间体J8 制备中间体J5 用与中间体J1相同的方式,从2-氨基-5-溴-3-(溴甲基)吡啶CAS [769109-93-5]和硫代吗啉-3-甲酸乙酯盐酸盐[159381-07-4]起始来制备 中间体J5。产生:2g,定量。 制备中间体J6 用与中间体J2相同的方式,从中间体J5起始来制备化合物中间 体J6。产生:0.65g,46%。 制备中间体J7 用与中间体J3相同的方式,从中间体J6起始来制备化合物中间 体J7。产生:0.57g,76%。 制备中间体J8 用与中间体J4相同的方式,从中间体J7起始来制备化合物中间 体J8。产生:0.66g,99%。 制备中间体J14 制备中间体J9 用与中间体J1相同的方式,从2-氨基-5-溴-3-(溴甲基)吡啶CAS [769109-93-5]和1-(1,1-二甲基乙基)-3-甲酯-1,3-哌嗪二甲酸 [129799-08-2]起始来制备中间体J9。产生:呈棕色胶状物36g,定量。 制备中间体J10 用与中间体J2相同的方式,从中间体J9起始来制备中间体J10。 产生:呈白色粉末的中间体J10,13.8g,60%。 制备中间体J11 将三氟乙酸(15.5mL,201mmol)添加到中间体J10(8.00g, 20.1mmol)在DCM(90mL)中的悬浮液里。将该混合物在室温下 搅拌20小时并且在减压下进行浓缩。将残余物溶解在二氯甲烷(200 mL)中并且用饱和NaHCO3水溶液(200mL)进行洗涤。将水层用 二氯甲烷(20x50ml)萃取。将合并的有机层干燥(Na2SO4),过滤 并且在减压下进行浓缩。产生:呈黄色固体的中间体J11,6g,100%。 制备中间体J12 在0℃下,将乙酰氯(1.86mL,26.0mmol)添加到中间体J11 (5.95g,20.0mmol)和三乙胺(3.91mL,28.0mmol)在DCM(100 mL)中的溶液里。允许将该混合物达到室温并且搅拌3天。将该反应 混合物用二氯甲烷(150mL)稀释,并且用水(250mL)进行洗涤。 将有机层干燥(Na2SO4),过滤并且在减压下进行浓缩。将残余物在 乙醇(30mL)中研磨并且真空干燥。产生:呈白色固体的中间体J12, 1.14g,21%。 制备中间体J13 用与中间体J3相同的方式,从中间体J12起始来制备中间体J13。 产生:呈橙色泡沫的中间体J13,1.38g,86%。 制备中间体J14 用与中间体J4相同的方式,从中间体J13起始来制备中间体J14。 产生:呈白色产物的中间体J14,1g,94%。 制备中间体J16 制备中间体J15 将中间体J10(4.30g,10.8mmol)悬浮在DMF(20mL)和乙 腈(60mL)的混合物中。添加丙烯酸甲酯(2.92mL,32.5mmol)、 二异丙基乙胺(3.96mL,22.7mmol)和三-o-甲苯基膦(0.659g,2.16 mmol)。将所得混合物用氩进行吹扫并且添加乙酸钯(0.243g,1.08 mmol)。将该混合物用氩再次吹扫并且在回流(油浴110℃)下搅拌 19小时。将该反应混合物在减压下进行浓缩。将残余物溶解在乙酸乙 酯(500mL)中并且用饱和NaHCO3水溶液(300mL)洗涤,然后用 盐水(300mL)洗涤。将有机层干燥(Na2SO4)、过滤并且进行浓缩。 将残余物(6.15g)通过柱色谱在硅胶(流动相梯度乙酸乙酯/甲醇100/0 至95/5)上进行纯化。收集产物级分并且蒸发溶剂。将该残余物在乙 醇(30ml)中研磨并且真空干燥(40℃,1h)。产生:呈白色固体 的中间体J15,3.37g,(77%)。 制备中间体J16 将氢氧化钠(0.670g,16.7mmol)和水(8mL)添加到中间体 J15(3.37g,8.38mmol)在THF(32mL)中的溶液里。将该混合物 在室温下搅拌20小时并且然后在减压下进行浓缩。将残余物溶解在 水(30mL)中并且添加浓HCl(约1.4mL)直至pH约5-6。将沉淀 在玻璃料上滤出,用水(15mL)洗涤并且真空干燥。产生:呈白色 固体2.45g,(75%)。 制备中间体J20 中间体J17 用与中间体J1相同的方式,从2-氨基-5-溴-3-(溴甲基)吡啶CAS [769109-93-5]和1H-咪唑-5-甲酸甲酯[17325-26-7]起始来制备中间体 J17。产生:1.42g,11%。 中间体J18 用与中间体J2相同的方式,从中间体J17起始来制备中间体J18。 产生:0.54g,49%。 中间体J19 用与中间体J3相同的方式,从中间体J18起始来制备中间体J19。 产生:0.17g,29%。 中间体J20 用与中间体J4相同的方式,从中间体J19起始来制备中间体J20。 产生:0.23g,66%。 最终化合物K的合成 制备化合物K1 从1H-氮杂卓2,3,6,7-四氢-4-苯基CAS[324784-75-95-4](中间体 A3)和中间体J8起始来制备化合物化合物K1。产生:化合物K1, 0.160g,(66%)。m.p.224℃。 1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ10.55(br.s.,1H),8.59-8.62(m, 1H),8.12-8.19(m,1H),7.50-7.56(m,1H),7.27-7.37(m,5H),7.19 -7.26(m,1H),5.99-6.06(m,1H),3.58-4.00(m,6H),2.51-3.18(m, 11H)。 实例L-制备化合物,其中R x =(iii)并且包含Z 2 的环是8元的 通用:对于用以上方案合成的所有实验都是使用无水溶剂在氩气 氛下进行。 步骤1:中间体L2的制备是通过在中间体L1、SOCl2(例如4 当量)和MeOH(例如在回流下)存在下的反应来完成的。 步骤2:制备中间体L3 将中间体L2(1.47g,9.35mmol)、3-溴-5-溴甲基-6-氨基-吡啶 的HBr盐(3.24g,9.35mmol)和N-乙基二异丙基胺(6.50ml,37.3 mmol)在乙腈(40ml)中的混合物在回流下搅拌3h,然后在减压下 进行浓缩。将残余物吸收在水性饱和碳酸氢钠(70ml)中并且用二氯 甲烷(3x70ml)萃取。将合并的有机层用水性饱和的碳酸氢钠(2x 100ml)进行洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并且然后在减压下进行浓缩。 将粗化合物通过柱色谱在硅胶(洗脱液∶氯仿)上进行纯化并且真空 干燥以产生呈浅黄色油的中间体L3(2.67g,83%)。 步骤3:制备中间体L4 将氢化钠(在矿物油中的60%分散体,0.437g,10.9mmol)添 加到在DMF(85mL)中的中间体L3(2.67g,7.80mmol)的溶液里。 将所得混合物在室温下搅拌3h,然后通过添加水(10ml)淬灭并且 在减压下进行浓缩。将残余物吸收在水(80ml)中并且用二氯甲烷/ 甲醇(9/1,5x80ml)萃取。将合并的有机层在减压下进行浓缩。将 残余物吸收在二氯甲烷(100ml)中,用饱和盐水(5x80ml)进行 洗涤,经硫酸钠干燥并且在减压下进行浓缩。将获得的产物与二乙醚 (10ml)研磨,通过在玻璃料上过滤进行收集,用二乙醚(10ml) 漂洗并且真空干燥以产生呈浅黄色固体的中间体L4(1.25g,52%)。 熔点:216.1℃-225.6℃(在分解下)(步琦(Buchi)M-560, 1℃/min)。 步骤4:制备中间体L5: 将中间体L4(0.270g,0.870mmol)悬浮在DMF(3mL)和乙 腈(10mL)的混合物中。添加丙烯酸叔丁酯(0.510ml,3.48mmol)、 N-乙基二异丙基胺(0.320ml,1.84mmol)和三(o-甲苯基)膦(0.0530 g,0.174mmol)。将所得混合物用氩进行吹扫并且添加乙酸钯(0.0195 g,0.0870mmol)。将该混合物用氩再次吹扫,在回流下搅拌过夜并 且在室温下搅拌2天,然后在减压下进行浓缩。将残余物吸收在水性 饱和碳酸氢钠(20ml)中并且用二氯甲烷(3x20ml)萃取。将合并 的有机层经硫酸钠干燥,过滤并且在减压下进行浓缩。将粗残余物通 过柱色谱在硅胶(洗脱液:二氯甲烷/甲醇98/2)上进行纯化。将获 得的产物吸收在二氯甲烷(10ml)中,用盐水(3x20ml)进行洗涤, 经硫酸钠干燥,过滤并且在减压下进行浓缩以产生呈淡黄色胶的中间 体(0.253g,81%)。 步骤5:制备中间体L6: 将中间体L5(0.253g,0.708mmol)和4M氯化氢在1,4-二噁烷 (7.00ml,28.0mmol)中的混合物在室温下搅拌过夜并且在40℃下 搅拌25h。将沉淀在玻璃料上进行过滤,用(2x2ml)二噁烷和二乙 醚(3x2ml)进行洗涤并且在真空下干燥以产生呈淡黄色固体盐酸盐 (根据氯滴定1.8当量HCl)的中间体L6(0.174g,67%)。 步骤6:制备最终化合物: 酰胺偶联反应可以使用偶联试剂(诸如1-(3-二甲基氨基丙基)-3- 乙基碳二亚胺盐酸盐)和其他试剂/反应物/溶剂(诸如1-羟基苯并三 唑一水化物、N-乙基二异丙基胺和DMF/DMSO)、用适当的胺和中 间体L6来进行。 实例M 其中Xx代表N的中间体的合成 条件: a)NBS,ACN,回流,3h,70%;b)LiAlH4 1M在THF中,THF, 5℃至RT,o.n.,20%;c)PBr3,DCM,RT,o.n.,90%;d)肌氨酸 乙酯,Et3N,DMF,μw,120℃,20min,53%;e)NaH,DMF,RT, 3h,25%;f)DIEA,Pd(OAc)2,三-O-甲苯基膦,ACN,DMF,μw, 180℃,25min。 因此,中间体化合物(以及因此最终化合物)(其中Rx环代表 单环、二环或三环,其中Xx代表N)可以根据在这个实例M中所描 述的方法来制备。 剩余的化合物根据在此披露的方法来制备。 X.化合物鉴定 X1.LCMS 对于本发明的化合物的LCMS表征,使用了以下方法。 通用稈序A 使用UPLC(超高效液相色谱法)Acquity(沃特斯公司)系统进 行LC测量,该系统包括带有除气器的二元泵、自动进样器、二极管 阵列检测器(DAD)以及如在以下各个方法中指定的柱,将该柱的温 度保持在40℃。来自该柱的流被引至MS探测器。MS检测器被配置 有一个电喷雾电离源。毛细管针电压是3kV,并且Quattro(沃特斯 公司(Waters)的三重四极质谱仪)上的源温度维持在130℃。使用 氮气作为雾化器气体。用沃特斯-质谱质量莱纳斯-开放性莱纳斯 (Waters-Micromass MassLynx-Openlynx)数据系统进行数据采集。 通用稈序B 使用Alliance HT 2795(沃特斯公司)系统进行HPLC测量,该 系统包括一个具有除气器的四元泵、一个自动进样器、一个二极管阵 列检测器(DAD)以及一个如以下各个方法中详细说明的柱,该柱被 保持在30℃的温度。来自该柱的流被分流到MS光谱仪。MS检测器 被配置有一个电喷雾电离源。毛细管针电压是3kV并且源温度在LCT (来自沃特斯公司的飞行时间ZsprayTM(Time of Flight ZsprayTM)质谱 仪)上保持在100℃。使用氮气作为雾化器气体。用沃特斯-质谱质量 莱纳斯-开放性莱纳斯(Waters-Micromass MassLynx-Openlynx)数据 系统进行数据采集。 方法1 除了通用方法A之外:在沃特斯的Acquity BEH(桥接乙基硅氧 烷/二氧化硅杂化体)C18柱(1.7μm,2.1×100mm)上进行反相UPLC, 流速是0.35ml/min。采用两种流动相(流动相A:95% 7mM乙酸铵 /5%乙腈;流动相B:100%乙腈),运行梯度条件:从90%A和10% B(保持0.5分钟)在3.5分钟内到8%A和92%B,保持2分钟,并 且在0.5分钟内回至起始条件,保持1.5分钟。使用2μl的注入体积。 对于正电离和负电离模式,锥孔电压是20V。通过使用0.1秒的内扫 描延迟在0.2秒内从100至1000进行扫描来采集质谱。 方法2 除了通用方法A之外:在沃特斯的Acquity BEH(桥接乙基硅氧 烷/二氧化硅杂化体)C18柱(1.7μm,2.1×100mm)上进行反相UPLC, 流速是0.343ml/min。采用两种流动相(流动相A:95% 7mM乙酸铵 /5%乙腈;流动相B:100%乙腈),运行梯度条件:从84.2%A和15.8% B(保持0.49分钟)在2.18分钟内到10.5%A和89.5%B,保持1.94 分钟,并且在0.73分钟内回至起始条件,保持0.73分钟。使用2μl 的注入体积。对于正电离和负电离模式,锥孔电压是20V。通过使用 0.1秒的内扫描延迟在0.2秒内从100至1000进行扫描来采集质谱。 方法3 除通用方法B之外:在一个沃特斯X-terra MS C18柱(3.5μm, 4.6x100mm)上,使用0.8ml/min的流速进行反相HPLC。采用两个 流动相(流动相A:100% 7mM乙酸铵;流动相B:100%乙腈)来 运行梯度条件:在4.5分钟内从80%A和20%B(持续0.5分钟)至 90%B,90%B持续4分钟并且用初始条件再平衡3分钟。使用5μl 的注入体积。对于正电离和负电离模式,锥孔电压是20V。通过使用 0.3秒的内扫描延迟在0.4秒内从100至1000进行扫描来采集质谱。 方法4 除通用方法B之外:在一个沃斯特Atlantis C18柱(5μm,3.9x 100mm)上,使用0.8ml/min的流速进行反相HPLC。采用三个流动 相(流动相A:100%7mM乙酸铵;流动相B:100%乙腈;流动相C: 0.2%甲酸+99.8%超纯水)来运行梯度条件:在4.5分钟内从50%A 和50%C(持续1.5分钟)至10%A、80%B和10%C,持续4分钟 并且用初始条件再平衡3分钟。使用5μl的注入体积。对于正电离和 负电离模式,锥孔电压是20V。通过使用0.3秒的内扫描延迟在0.4 秒内从100至1000进行扫描来采集质谱。 方法5 使用HPLC 1100/1200(安捷伦科技有限公司(Agilent))系统 进行HPLC测量,该系统包括一个具有除气器的四元泵、一个自动进 样器、一个二极管-阵列检测器(DAD)以及一个在下面各个方法中 详细说明的柱,将该柱保持在室温。该MS检测器(MS-安捷伦单相 四极(MS-Agilent simple quadripole))被配置为具有一个电喷雾-APCI 电离源。使用氮气作为雾化器气体。使用Chemstation数据系统进行 数据采集。 在一个Nucleosil C18柱(3μm,3x150mm)上以0.42ml/min 的流速进行反相HPLC。采用两个流动相(流动相A:水/TFA(0.1%); 流动相B:100%乙腈)来运行一个梯度状态:从98%A持续3分钟, 在12分钟内至100%B,100%B持续5分钟,然后在2分钟内回到 98%A,并且用98%A再次平衡持续6分钟。使用2μl的注入体积。 毛细管电压是2kV,电晕放电保持在1μA并且源温度维持在250℃。 将可变电压用于碰撞电压。在电喷雾电离作用和APCI阳性模式中, 通过从100到1100amu的扫描来获得质谱。 方法6 这个方法采用以下参数: 安捷伦1200LC 6100MS 柱:HALO C18(4.6*50mm 2.7μm) 流速:1.8ml/min A:H2O(0.05%FA)B:CH3CN(0.05%FA) X2.熔点 对于许多化合物,熔点是用科夫勒热台(Kofler hot bench)获得 的,科夫勒热台由一个具有线性温度梯度的加热板、一个滑动指针以 及一个单位是摄氏度的温度标组成。 对于多种化合物,熔点是用差示扫描量热法(DSC)来确定的。 使用在25℃起始、10℃/分钟的温度梯度来测量熔点。最高温度是 350℃。 对于多种化合物,熔点是用步琦(Büchi)熔点测定仪B-560来 获得的。加热介质是金属块。通过放大镜和大的光对比肉眼观察到样 品的熔融。用3℃/分钟亦或10℃/分钟的温度梯度来测量熔点。最高 温度是300℃。 剩余的熔点是用开放毛细管来确定的。 表X-LC/MS数据和熔点 对于其中Rx是环(i)的化合物 其中Rx是(ii)(即二环)的化合物的表 其中Rx是(iii)(即三环)的化合物的表 Y.药理学实例 Y.1FabI酶抑制:金黄色葡萄球菌FabI酶抑制测定。 采用半区384孔微量滴定板进行FabI酶抑制测定。化合物在40-μl 的测定混合物中评估,该混合物包含100mM NaADA(pH 6.5)(ADA =N-[2-乙酰胺基]-2亚氨基二乙酸)、250μM巴豆酰-CoA、625μM NADH以及50μg/ml金黄色葡萄球菌ATCC 29213 FabI。抑制剂典型 地在50至0.39μM的范围内变化。将反应混合物在室温下孵育30分 钟,并且通过添加200mM Tris缓冲液(pH 9.0)使pH变动而使反应 停止。通过测量在340nm的吸光度的变化来监测NADH的消耗量。 通过将样品读数与阴性对照(无化合物)和阳性对照组(无酶)的读 数进行比较,确定这些化合物对酶活性的抑制百分比。通过最小二乘 法对最佳拟合曲线进行拟合。由此,获得导致50%的酶活性抑制的IC50值(以μg/ml表示)。 结果在以下一个或多个表(FabI活性)中描述。 Y.2用于测试化合物针对不同细菌菌株的的抗细菌活性的体外方 法 用于敏感性测试的细菌悬浮液的制备 使用了以下细菌:金黄色葡萄球菌ATCC 29213、耐甲氧西林金 黄色葡萄球菌(MRSA)ATCC 700788以及大肠杆菌ATCC 35218。 将在这项研究中使用的细菌在37℃在烧瓶中震荡下生长过夜,该烧瓶 包含的在去离子水中100ml米勒-海顿(Mueller-Hinton)肉汤(Difco 目录号0757-17)。将母液储存在-70℃直至使用。 在35℃、在需氧条件(第一代)中,将细菌在包含5%绵羊血液 (贝迪公司(Becton Dickinson)目录号254053)的胰蛋白酶大豆琼脂 平板上孵育18-24小时。对于第二代,在新鲜的米勒-海顿肉汤中接种 5-10个菌落,并使其在35℃下生长过夜直至在有氧条件下达到混浊 (达到对数期)。然后将细菌悬浮液调整至0.5麦氏(McFarland)密 度,并进一步在米勒-海顿肉汤培养基中以1∶100稀释。这可用作接 种物。 将一个或多个结果在以下表(对于STA ATCC 29213)中描述。 抗细菌敏感性测试:IC90的确定 MIC测定是通过肉汤微量稀释法,在96孔规格(平底微量滴定 板)中,采用终体积是0.1ml的含有两倍连续稀释的化合物并接种有 5×105CFU/ml细菌(根据CLSI指南的标准接种量)的米勒-海顿肉 汤进行的。抑制剂典型地在63至0.49μM的范围内变化。在测定中的 最终DMSO浓度是1.25%(最大耐受DMSO浓度=6%)。在测试人 血清对于化合物对抗金黄色葡萄球菌的活性的影响的测定中,以10% 的终浓度添加人血清。将板在35℃下孵育16-20小时。在孵育结束时, 对细菌生长进行荧光计定量检测。为此,将刃天青添加至所有孔中, 并将板再孵育。孵育时间取决于细菌的种类。从蓝色到粉色的颜色变 化指示细菌的生长。在计算机控制的荧光计(Fluoroskan Ascent FL, Labsystems)中,在540nm的激发波长和590nm的发射波长下读取 荧光。根据标准方法来计算由化合物实现的生长抑制%。IC90(以μg/ml 表示)被定义为是细菌生长的90%抑制浓度。同时测试一组参比化合 物来用于QC认可。 将结果在以下一个或多个表(STA+10%HS)中描述。 细胞毒性测定 使用MTT测定来对化合物的细胞毒性进行评估。将在96孔板中 生长的人类HelaM细胞暴露于测试化合物的连续稀释物(最终体积是 0.2ml)中,并在37℃以及5%CO2下孵育72小时。抑制剂典型地在 25至0.8μM的范围内变化。在测定中的最终DMSO浓度是0.5%。添 加MTT(3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯四唑鎓溴化物,一种四唑) 并且其仅在活细胞中被还原为紫色甲月替。通过添加100μl 2-丙醇实 现甲月替晶体的溶解。通过测量还原的甲臜(在540nm和690nm处 给出紫色颜色)的吸光度来确定细胞活力。从在540nm处测定的吸 光度自动减去在690nm处的吸光度,从而消除非特异性吸收的影响。 根据标准方法来计算由化合物实现的细胞毒性百分比。细胞毒性报告 为CC50,这是造成细胞活力降低50%的浓度。 结果在以下一个或多个表(HELAM)中描述。 生物测试 将本发明/实例的化合物在以上所描述的测定中进行测试,并且被 发现展现如在以下表中所描述的某种抑制。 其中Rx是(i)(即单环)的化合物的表 其中Rx是(ii)(即二环)的化合物的表 其中Rx是(iii)(即三环)的化合物的表 实例Z Z.1热力学溶解度 pH溶解度特征曲线绘制在环境温度下进行持续4天。进行饱和 溶解度的研究以确定在一种特定的缓冲液溶液中的最大溶解度。将化 合物添加到各个的缓冲液溶液中直至达到饱和点。这之后接着将烧瓶 在环境温度下摇动4天。4天之后,将溶液过滤并且注射到UPLC上 并且使用通用的HPLC法确定浓度。 结果 本发明/实例的化合物被发现显示良好的热力学溶解度,例如当在 以上测试中采用以下缓冲液溶液时,这些化合物可以显示良好的浓 度:缓冲液pH 2,10%HP-β-CD缓冲液pH 2,20%HP-β-CD缓冲液 pH 2,缓冲液pH 4,10%HP-β-CD缓冲液pH 4,20%HP-β-CD缓冲 液pH 4,缓冲液pH 7.4,10%HP-β-CD缓冲液pH 7.4以及20% HP-β-CD缓冲液pH 7.4。 Z.2抗微生物活性谱 根据临床和实验室标准协会(Clinical and Laboratory Standards Institute)(CLSI)针对需氧细菌的方法(CLSI M07-A8),通过肉汤 微量稀释法确定最小抑制浓度(MIC)(参见临床和实验室标准协会, 2009,用于需氧生长的细菌的稀释抗微生物敏感性试验的方法 (Methods for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically),CLSI文件M07-A8,第29卷,第2期),该肉汤 微量稀释法使用用于除了流感嗜血杆菌(其中使用嗜血杆菌试验培养 基(HTM)肉汤)外的大多数生物的阳离子调节的米勒-海顿肉汤 (Mueller-Hinton broth)(CA-MHB)培养基。各个生物的说明可以 在表中找到。适当时,对ATCC标准菌株进行测试。 将用于敏感性测试的接种物密度进行标准化以给出大约5x105CFU/mL的最终接种物。将肉汤MIC确定为在35℃-37℃下孵育16-24 小时(取决于物种)之后防止可见生长的最低药物浓度。 表:对测试的各个生物的描述 在DMSO中以1mg/mL的浓度制备化合物的母液。在DMSO中 以2mg/mL的浓度制备利奈唑胺。将所有化合物的母液稀释到 CA-MHB以给出二倍稀释的范围,取决于被测试生物的敏感性。 结果 本发明/实例的化合物被发现展现抗细菌活性的更宽的谱,例如化 合物可以被发现抗以下项多种细菌菌株是有活性的,例如金黄色葡萄 球菌ATCC 29213、金黄色葡萄球菌NRS119、金黄色葡萄球菌 NRS120、金黄色葡萄球菌NRS121、大肠杆菌tolC突变体、大肠杆菌 ATCC 25922、流感嗜血杆菌ATCC 49247、卡他莫拉菌ATCC 8176。 E.3体内药物代谢动力学和口服生物利用度 这些实例的化合物的体内药物代谢动力学和口服生物利用度在 雄性瑞士小鼠(饲养的)中在单一静脉内(i.v.)团注以及口服(p.o.) 给药后进行研究。对于i.v.和p.o.溶液配制品,将化合物溶解在20% HP-β-CD溶液中。配制品的pH值是约pH 4。所有的i.v.配制品均是 等渗的。 结果 本发明/实例的化合物被发现展现良好的体内药物代谢动力学和/ 或口服生物利用度特性,例如化合物可以被发现展现如通过以下药物 代谢动力学参数所测量的良好特性,诸如针对i.v.形式的血浆清除率 CI、VDz、AUC和半衰期,以及针对p.o.形式的Cmax、Tmax、AUC、 半衰期和口服生物利用率%。 E.4体内疗效 通过对腹腔内感染的小鼠进行治疗来研究一种抗细菌化合物的 体内效力的概念是在1911年针对奥普托欣对抗肺炎双球菌而引入的 (Morgenroth(莫根罗特)和Levy(莱维),1911年)。该模型的普 及来自于其易于使用,同时具有短持续时间的实验、可重现的感染以 及简单的终点。 方法 使用甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌菌株ATCC 29213来感染雌 性瑞士白化小鼠。将脑心浸液(BHI)肉汤细菌培养物在感染前一天 进行接种,在37℃培养过夜,并且在新鲜的BHI肉汤中稀释至所希 望的浓度。在腹部的任意侧下象限中进行腹膜内(i.p.)注射大约5x109菌落形成单位(CFU)。接种之后,将小鼠关在它们的笼子里,每日 观察感染或死亡的征象的发展。对于小鼠的治疗,p.o.和i.v.途径两者 均可以使用,并且每个小鼠是通过强饲法或i.v.注射来单独治疗。在 此模型中对溶液以及悬浮液两者均进行测试。用于监测感染过程和治 疗效果的参数是感染后3天内动物的死亡或存活率。因为死亡也可能 是由于毒副作用,包括了用最高剂量的测试化合物治疗的未感染对照 组的3只小鼠。 结果 本发明/实例的化合物显示了良好的体内疗效特性,例如这些化合 物可展现出测量为存活%(按照以上测试)的此类特性。
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本发明涉及新颖的可以抑制FabI酶活性的具有化学式(I)的化合物,并且这些化合物对于治疗细菌感染是有用的。本发明进一步涉及包含这些化合物的药物组合物,以及用于制备这些化合物的化学方法。。
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