鉴定大豆Lox3特异性引物及其方法.pdf

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摘要
申请专利号:

CN201310055876.1

申请日:

20130221

公开号:

CN103146819B

公开日:

20140820

当前法律状态:

有效性:

失效

法律详情:

IPC分类号:

C12Q1/68,C12N15/11

主分类号:

C12Q1/68,C12N15/11

申请人:

安徽农业大学

发明人:

张文明,胡明建,王晓波,姚大年,郑文寅,司红起

地址:

230036 安徽省合肥市长江西路130号

优先权:

CN201310055876A

专利代理机构:

安徽汇朴律师事务所

代理人:

胡敏

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内容摘要

本发明公开了一种鉴定大豆Lox3缺失体的特异性引物,包括以下引物对:Lox3F:TAACCAGCGTTGGGGGAA?;Lox3R:CATTTATAGACGTGCGTGCA。本发明还公开了鉴定大豆Lox3缺失体的方法:以待测缺失体的大豆基因为DNA模板,将上述引物对上述DNA模板进行PCR扩增;若述PCR扩增产物中有474bp条带,则上述待测大豆基因含有Lox3,若无474bp条带,则上述待测大豆基因缺失Lox3。本发明的有益效果在于,不但节约时间和费用,而且鉴定结果准确可靠,可显著提高对Lox3缺失体材料的筛选效率。

权利要求书

1.一种鉴定大豆Lox3缺失体的特异性引物,其特征在于,包括以下引物对:Lox3F:TAACCAGCGTTGGGGGAA ;Lox3R:CATTTATAGACGTGCGTGCA。 2.一种使用权利要求1所述的特异性引物鉴定大豆Lox3缺失体的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)以待测缺失体的大豆基因为DNA模板,将所述引物对所述DNA模板进行PCR扩增;(2)若述PCR扩增产物中有474bp条带,则所述待测大豆基因含有Lox3,若无474bp条带,则所述待测大豆基因缺失Lox3。 3.根据权利要求2所述的鉴定大豆Lox1缺失体的方法,其特征在于,所述Lox1缺失体的大豆为五星1号、五星4号、鉴31中的任意一种。

说明书

技术领域

本发明涉及鉴定大豆Lox3缺失体的特异性引物及其方法,主要应用于 分子标记的技术领域。

背景技术

大豆脂肪氧化酶(Lox)是一种含非血红素铁、水溶性球蛋白质。Lox 通过催化不饱和脂肪酸中顺,顺1,4-戊二烯结构,形成过氧化氢衍生 物,再继续转化成低级的醛和酮等有害物质,从而产生豆腥味和其他 挥发性物质,阻碍了大豆在食品中的广泛应用。Lox催化产生的过氧化 氢物,能直接与食品中的营养成分结合,降低食品的食用品质和营养 价值。高温处理可减轻大豆豆醒味, 但会导致蛋白质变性, 使蛋白 质加工性能和利用率降低。此外,通过微波照射、改变介质pH、有机 溶剂萃取和醛水解酶水解等方法,也可以降低或消除大豆豆腥味。上 述方法都会不同程度增加大豆产品成本,且常常会导致大豆蛋白质溶 解度下降,降低食品营养价值。因此,通过遗传育种手段选育大豆Lo x缺失体材料,以降低或消除Lox活性的影响具有重要意义。王若兰等 (2008)研究认为,大豆Lox缺失体样品在储藏期间的品质变化比正常 品种缓慢,Lox缺失可在一定程度上提高大豆储藏品质的稳定性。王金 龙等(2000)研究认为,大豆Lox缺失对蛋白质、脂肪及脂肪酸含量没 有影响,但可能引起种子中脯氨酸含量降低, 而对其它氨基酸无影响 。脯氨酸不属于人体必需氨基酸,故Lox缺失不会引起大豆营养品质降 低。Julian等(2010)采用探针技术分别鉴定Lox2 和Lox3,但该技术存在技术复杂、费用较高等问题。通过分子标记技 术筛选大豆Lox缺失体,可以加快无腥大豆品种选育进程,进而从根本 上改善大豆产品豆腥味,提高大豆的储藏品质。对目前已有的LOX缺失 体中LOX基因进行测序分析,表明Lox1缺失体在其编码基因的第8个外 显子内缺失1个74bp的片段,导致Lox1蛋白翻译过早终止;Lox3缺失体 在其编码基因的第1个外显子内缺失1个单核苷酸“G”,从而导致移码 突变。 

发明内容

本发明要解决的技术问题是提供鉴定大豆Lox3缺失体的特异性引物及 其方法。

本发明是通过以下技术方案来实现的。

一种鉴定大豆Lox3缺失体的特异性引物,包括以下两组引物对:

Lox3F:TAACCAGCGTTGGGGGAA ;

Lox3R:CATTTATAGACGTGCGTGCA。

一种上述的特异性引物鉴定大豆Lox3缺失体的方法,包括以下步骤:

(1)以待测缺失体的大豆基因为DNA模板,将上述两组引物对上述DN A模板进行PCR扩增;

(2)若述PCR扩增产物中有474bp条带,则上述待测大豆基因含有Lox 3,若无474bp条带,则上述待测大豆基因缺失Lox3。

进一步地,上述Lox3缺失体的大豆为五星1号、五星4号、鉴31中的任 意一种。

本发明的有益效果:

本发明提供的特异性引物及其鉴定技术,不但节约时间和费用,而且 鉴定结果准确可靠,可显著提高对Lox3缺失体材料的筛选效率。

附图说明

图1为实施案例1琼脂糖凝胶电泳的示意图。

具体实施方式

下面根据附图和实施例对本发明作进一步详细说明。

在下述的实施案例1中,一共选取七种大豆品种进行鉴定,这七种大豆 品种均由河北省农林科学院提供的常用品种。

1、五星1号

审定编号: 冀审豆2001002号 

品种来源: 河北省农林科学院粮油作物研究所1997年育成,亲本组合 为冀豆9/Century。 

2、五星2号

审定编号:国审豆2004005

选育单位:河北省农林科学院粮油作物研究所

品种来源:冀豆9号×Century

3、五星3号

选育单位:河北省农林科学院粮油作物研究所

品种来源:冀豆9号×Century

4、五星4号

审定(登记)编号: 冀审豆2009005号 

选育单位: 河北省农林科学院粮油作物研究所 

品种来源: 冀豆12×Suzuyutaka 

5、鉴31

由河北省农林科学院提供,为推广品种

6、中黄13

品种审定编号:国审豆2001008

品种来源:豫豆8号/中90052-76,为推广品种

选育单位:中国农业科学院作物育种栽培研究所

实施案例1:

1、DNA提取:(1)0.1g大豆粉加入0.7mLSDS提取液(0.1M Tris-HC l(PH=8.5),0.1M  NaCl,0.05M EDTA(PH=8.0),2% SDS)在6 5℃恒温下裂解45min,其间多次震荡。

(2)在4℃ 12000rpm条件下,离心10min。

(3)取上清液加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)上下颠倒 旋转至两相不很快分层。

(4)在4℃ 12000rpm条件下,离心10min。

(5)取上清液加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)上下颠倒 旋转数次。

(6)在4℃ 12000rpm条件下,离心10min。

(7)取上清液加入等体积的异丙醇于-20℃冰箱静置30min。

(8)在4℃ 12000rpm条件下,离心10min。

(9)用70%的乙醇洗涤两次。

(10)在4℃ 12000rpm条件下,离心10min。

(11)沉淀自然风干。

2、引物Lox1F:ATCTTAGCGTGCTTCACCCA  LOX1R:CATCAGCGGCATAAG GATAG。

引物均有Primer  Premier 5软件设计。

3、反应体系:2uL 2.5mM dNTP , 0.5uL 10uM上下游引物,2uL  10*Ex Tap Buffer, 1U TaKaRa Tap, 150ng DNA模板,用双 蒸馏水补齐到20uL。

4、PCR反应程序:变性:94℃5min,94℃45s, 退火:65℃每个循环 降0.4 ℃20个循环  50s,延伸:72℃45s,变性:94℃45s,退火 :61.5℃50s14循环,延伸:72 ℃45s,延伸: 72℃8min。

5、琼脂糖凝胶电泳:1.5%琼脂糖凝胶,缓冲体系为1×TAE溶液,在1 00V恒压下,电泳50min,溴化乙锭(EB)染色,凝胶成像系统扫描并保 存。若述PCR扩增产物中有474bp条带,则上述待测大豆基因含有Lox3 ,若无474bp条带,则上述待测大豆基因缺失Lox3。

图1为实施案例1琼脂糖凝胶电泳的示意图,参照图1,其中,M:mark er 1:五星1号(缺失Lox2、3)2:五星2号(缺失Lox2)3:五星3号 (缺失Lox2)4:五星4号(缺失Lox1、2、3)5:鉴31(缺失Lox1、2 、3)6:中黄13

图1清楚地说明了这七种不同品种的五星1号、五星4号、鉴31中为Lox 1缺失体。

具体实验结果参照图1所示的琼脂糖凝胶电泳的示意图。

本发明,提供的特异性引物及其鉴定技术,不但节约时间和费用,而 且鉴定结果准确可靠,可显著提高对Lox1缺失体材料的筛选效率。

上述实施例只为说明本发明的技术构思及特点,其目的在于让熟悉此 领域技术的人士能够了解本发明内容并加以实施,并不能以此限制本 发明的保护范围。凡根据本发明精神实质所作的等效变化或修饰,都 应涵盖在本发明的保护范围内。

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1、(10)授权公告号 CN 103146819 B (45)授权公告日 2014.08.20 CN 103146819 B (21)申请号 201310055876.1 (22)申请日 2013.02.21 C12Q 1/68(2006.01) C12N 15/11(2006.01) (73)专利权人 安徽农业大学 地址 230036 安徽省合肥市长江西路 130 号 (72)发明人 张文明 胡明建 王晓波 姚大年 郑文寅 司红起 (74)专利代理机构 安徽汇朴律师事务所 34116 代理人 胡敏 LIU Nan-nan et al.Role of LOX3 Gene in Alleviatin。

2、g Adverse Effects of Drought and Pathogens in Rice.Rice Science .2008, 第 15 卷 ( 第 4 期 ), 第 276 282 页 . (54) 发明名称 鉴定大豆 Lox3 特异性引物及其方法 (57) 摘要 本 发 明 公 开 了 一 种 鉴 定 大 豆 Lox3 缺 失 体 的 特 异 性 引 物,包 括 以 下 引 物 对 : Lox3F : TAACCAGCGTTGGGGGAA ; Lox3R : CATTTATAGACGTGCGTGCA。本发明还公开了鉴定大 豆 Lox3 缺失体的方法 : 以待测缺失体的大豆基 。

3、因为 DNA 模板, 将上述引物对上述 DNA 模板进行 PCR 扩增 ; 若述 PCR 扩增产物中有 474bp 条带, 则 上述待测大豆基因含有Lox3, 若无474bp条带, 则 上述待测大豆基因缺失 Lox3。本发明的有益效果 在于, 不但节约时间和费用, 而且鉴定结果准确可 靠, 可显著提高对 Lox3 缺失体材料的筛选效率。 (51)Int.Cl. (56)对比文件 审查员 黄琦 权利要求书 1 页 说明书 3 页 序列表 4 页 附图 1 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利 权利要求书1页 说明书3页 序列表4页 附图1页 (10)授权公告号 CN 103。

4、146819 B CN 103146819 B 1/1 页 2 1. 一种鉴定大豆 Lox3 缺失体的特异性引物, 其特征在于, 包括以下引物对 : Lox3F : TAACCAGCGTTGGGGGAA ; Lox3R : CATTTATAGACGTGCGTGCA。 2. 一种使用权利要求 1 所述的特异性引物鉴定大豆 Lox3 缺失体的方法, 其特征在于, 包括以下步骤 : (1) 以待测缺失体的大豆基因为 DNA 模板, 将所述引物对所述 DNA 模板进行 PCR 扩增 ; (2) 若述 PCR 扩增产物中有 474bp 条带, 则所述待测大豆基因含有 Lox3, 若无 474bp 条 带。

5、, 则所述待测大豆基因缺失 Lox3。 3.根据权利要求2所述的鉴定大豆Lox1缺失体的方法, 其特征在于, 所述Lox1缺失体 的大豆为五星 1 号、 五星 4 号、 鉴 31 中的任意一种。 权 利 要 求 书 CN 103146819 B 2 1/3 页 3 鉴定大豆 Lox3 特异性引物及其方法 技术领域 0001 本发明涉及鉴定大豆 Lox3 缺失体的特异性引物及其方法, 主要应用于分子标记 的技术领域。 背景技术 0002 大豆脂肪氧化酶 (Lox) 是一种含非血红素铁、 水溶性球蛋白质。Lox 通过催化不饱 和脂肪酸中顺, 顺 1,4- 戊二烯结构, 形成过氧化氢衍生物, 再继续。

6、转化成低级的醛和酮等 有害物质, 从而产生豆腥味和其他挥发性物质, 阻碍了大豆在食品中的广泛应用。Lox 催化 产生的过氧化氢物, 能直接与食品中的营养成分结合, 降低食品的食用品质和营养价值。 高 温处理可减轻大豆豆醒味 , 但会导致蛋白质变性 , 使蛋白质加工性能和利用率降低。此 外, 通过微波照射、 改变介质 pH、 有机溶剂萃取和醛水解酶水解等方法, 也可以降低或消除 大豆豆腥味。上述方法都会不同程度增加大豆产品成本, 且常常会导致大豆蛋白质溶解度 下降, 降低食品营养价值。因此, 通过遗传育种手段选育大豆 Lox 缺失体材料, 以降低或消 除 Lox 活性的影响具有重要意义。王若兰等。

7、 (2008) 研究认为, 大豆 Lox 缺失体样品在储藏 期间的品质变化比正常品种缓慢, Lox缺失可在一定程度上提高大豆储藏品质的稳定性。 王 金龙等 (2000) 研究认为, 大豆 Lox 缺失对蛋白质、 脂肪及脂肪酸含量没有影响, 但可能引起 种子中脯氨酸含量降低 , 而对其它氨基酸无影响。脯氨酸不属于人体必需氨基酸, 故 Lox 缺失不会引起大豆营养品质降低。Julian 等 (2010) 采用探针技术分别鉴定 Lox2 和 Lox3, 但该技术存在技术复杂、 费用较高等问题。通过分子标记技术筛选大豆 Lox 缺失体, 可以加 快无腥大豆品种选育进程, 进而从根本上改善大豆产品豆腥味。

8、, 提高大豆的储藏品质。 对目 前已有的 LOX 缺失体中 LOX 基因进行测序分析, 表明 Lox1 缺失体在其编码基因的第 8 个外 显子内缺失 1 个 74bp 的片段, 导致 Lox1 蛋白翻译过早终止 ; Lox3 缺失体在其编码基因的 第 1 个外显子内缺失 1 个单核苷酸 “G” , 从而导致移码突变。 发明内容 0003 本发明要解决的技术问题是提供鉴定大豆 Lox3 缺失体的特异性引物及其方法。 0004 本发明是通过以下技术方案来实现的。 0005 一种鉴定大豆 Lox3 缺失体的特异性引物, 包括以下两组引物对 : 0006 Lox3F : TAACCAGCGTTGGGG。

9、GAA ; 0007 Lox3R : CATTTATAGACGTGCGTGCA。 0008 一种上述的特异性引物鉴定大豆 Lox3 缺失体的方法, 包括以下步骤 : 0009 (1) 以待测缺失体的大豆基因为 DNA 模板, 将上述两组引物对上述 DNA 模板进行 PCR 扩增 ; 0010 (2)若述 PCR 扩增产物中有 474bp 条带, 则上述待测大豆基因含有 Lox3, 若无 474bp 条带, 则上述待测大豆基因缺失 Lox3。 0011 进一步地, 上述 Lox3 缺失体的大豆为五星 1 号、 五星 4 号、 鉴 31 中的任意一种。 说 明 书 CN 103146819 B 3。

10、 2/3 页 4 0012 本发明的有益效果 : 0013 本发明提供的特异性引物及其鉴定技术, 不但节约时间和费用, 而且鉴定结果准 确可靠, 可显著提高对 Lox3 缺失体材料的筛选效率。 附图说明 0014 图 1 为实施案例 1 琼脂糖凝胶电泳的示意图。 具体实施方式 0015 下面根据附图和实施例对本发明作进一步详细说明。 0016 在下述的实施案例 1 中, 一共选取七种大豆品种进行鉴定, 这七种大豆品种均由 河北省农林科学院提供的常用品种。 0017 1、 五星 1 号 0018 审定编号 : 冀审豆 2001002 号 0019 品种来源 : 河北省农林科学院粮油作物研究所 1。

11、997 年育成, 亲本组合为冀豆 9/ Century。 0020 2、 五星 2 号 0021 审定编号 : 国审豆 2004005 0022 选育单位 : 河北省农林科学院粮油作物研究所 0023 品种来源 : 冀豆 9 号 Century 0024 3、 五星 3 号 0025 选育单位 : 河北省农林科学院粮油作物研究所 0026 品种来源 : 冀豆 9 号 Century 0027 4、 五星 4 号 0028 审定 ( 登记 ) 编号 : 冀审豆 2009005 号 0029 选育单位 : 河北省农林科学院粮油作物研究所 0030 品种来源 : 冀豆 12Suzuyutaka 00。

12、31 5、 鉴 31 0032 由河北省农林科学院提供, 为推广品种 0033 6、 中黄 13 0034 品种审定编号 : 国审豆 2001008 0035 品种来源 : 豫豆 8 号 / 中 90052 76, 为推广品种 0036 选育单位 : 中国农业科学院作物育种栽培研究所 0037 实施案例 1 : 0038 1、 DNA 提取 :(1) 0.1g 大豆粉加入 0.7mLSDS 提取液 (0.1M Tris-HCl(PH=8.5) , 0.1M NaCl, 0.05M EDTA(PH=8.0), 2% SDS) 在 65恒温下裂解 45min, 其间多次震荡。 0039 (2) 在。

13、 4 12000rpm 条件下, 离心 10min。 0040 (3) 取上清液加入等体积的酚 : 氯仿 : 异戊醇 (25:24:1) 上下颠倒旋转至两相不很 快分层。 0041 (4) 在 4 12000rpm 条件下, 离心 10min。 说 明 书 CN 103146819 B 4 3/3 页 5 0042 (5) 取上清液加入等体积的酚 : 氯仿 : 异戊醇 (25:24:1) 上下颠倒旋转数次。 0043 (6) 在 4 12000rpm 条件下, 离心 10min。 0044 (7) 取上清液加入等体积的异丙醇于 -20冰箱静置 30min。 0045 (8) 在 4 12000。

14、rpm 条件下, 离心 10min。 0046 (9) 用 70% 的乙醇洗涤两次。 0047 (10) 在 4 12000rpm 条件下, 离心 10min。 0048 (11) 沉淀自然风干。 0049 2、 引物 Lox1F : ATCTTAGCGTGCTTCACCCA LOX1R : CATCAGCGGCATAAGGATAG。 0050 引物均有 Primer Premier 5 软件设计。 0051 3、 反 应 体 系 : 2uL 2.5mM dNTP , 0.5uL 10uM 上 下 游 引 物, 2uL 10*Ex Tap Buffer, 1U TaKaRa Tap, 150n。

15、g DNA 模板, 用双蒸馏水补齐到 20uL。 0052 4、 PCR 反应程序 : 变性 : 94 5min, 94 45s, 退火 : 65每个循环降 0.4 20 个 循环 50s, 延伸 : 72 45s, 变性 : 94 45s, 退火 : 61.5 50s14 循环, 延伸 : 72 45s, 延 伸 : 72 8min。 0053 5、 琼脂糖凝胶电泳 : 1.5% 琼脂糖凝胶, 缓冲体系为 1TAE 溶液, 在 100V 恒压下, 电泳 50min, 溴化乙锭 (EB) 染色, 凝胶成像系统扫描并保存。若述 PCR 扩增产物中有 474bp 条带, 则上述待测大豆基因含有 L。

16、ox3, 若无 474bp 条带, 则上述待测大豆基因缺失 Lox3。 0054 图 1 为实施案例 1 琼脂糖凝胶电泳的示意图, 参照图 1, 其中, M : marker 1 : 五星 1 号 (缺失 Lox2、 3) 2 : 五星 2 号 (缺失 Lox2) 3 : 五星 3 号 (缺失 Lox2) 4 : 五星 4 号 (缺失 Lox1、 2、 3) 5 : 鉴 31(缺失 Lox1、 2、 3) 6 : 中黄 13 0055 图1清楚地说明了这七种不同品种的五星1号、 五星4号、 鉴31中为Lox1缺失体。 0056 具体实验结果参照图 1 所示的琼脂糖凝胶电泳的示意图。 0057 。

17、本发明, 提供的特异性引物及其鉴定技术, 不但节约时间和费用, 而且鉴定结果准 确可靠, 可显著提高对 Lox1 缺失体材料的筛选效率。 0058 上述实施例只为说明本发明的技术构思及特点, 其目的在于让熟悉此领域技术的 人士能够了解本发明内容并加以实施, 并不能以此限制本发明的保护范围。凡根据本发明 精神实质所作的等效变化或修饰, 都应涵盖在本发明的保护范围内。 说 明 书 CN 103146819 B 5 1/4 页 6 0001 0002 序 列 表 CN 103146819 B 6 2/4 页 7 0003 序 列 表 CN 103146819 B 7 3/4 页 8 0004 序 列 表 CN 103146819 B 8 4/4 页 9 序 列 表 CN 103146819 B 9 1/1 页 10 图 1 说 明 书 附 图 CN 103146819 B 10 。

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