技术领域
本发明涉及分子生物学领域,尤其涉及一种快速提取全血基因组DNA的装 置及其方法。
背景技术
核酸是以核苷酸为基本单位的重要生物分子,广泛存在于所有动物、植物细 胞、微生物及生物体内。不同的核酸,其化学组成、核苷酸排列顺序等不同。根 据化学组成不同,核酸可分为核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)。核酸 是一切生物细胞的基本成分,也对生物体的生长、发育、繁殖、遗传及变异等重 大生命现象起主宰作用。核酸在实践应用方面有极重要的作用,现已发现许多遗 传性疾病、肿瘤的发生、病毒的感染、射线对机体的作用等都与核酸有关。因此, 对核酸结构、功能与调控的认识是人类在分子水平研究遗传、进化和疾病诊断的 基础。目前,核酸研究已成为生命科学中的与多学科广泛交叉、渗透的研究热点 及发展前沿。核酸抽提是许多临床、法医学应用及遗传学分析的前提,通过DNA 或RNA的提取及纯化过程,消除或减小其他杂质(蛋白质、多糖及脂肪等)对核 酸扩增反应的影响。传统的DNA提取方法是自1950年后相继发展起来的固相 萃取法(Solid-PhaseExtraction,SPE)和液-液萃取法(酚氯仿法)。这些方法 操作步骤繁琐,所使用的提取试剂具有毒害性,限制了其在临床上的推广应用。 目前普遍使用的硅胶膜离心柱法,虽简化了操作步骤,但大片段DNA强力结合 于膜上,难洗脱,导致离心过柱时DNA易断裂,影响下游实验包括测序、克隆、 PCR、转化、微注射、转染和微阵列分析。静脉血为目前普遍用于全血基因组 DNA提取的样本,静脉采血可能发生皮下出血或局部红肿、局部皮肤过敏反应、 误穿刺入动脉及采血失败等并发症。此外,婴幼儿静脉采血难度比较大,因此, 亟需开发一种快速、高效、适合于临床床旁检测的微量全血基因组的提取装置和 方法。微流控芯片技术是指操作微小网络通道中流体的科学技术。与常规的实验 技术相比,此技术极大降低了试剂的消耗量、降低成本同时产生极少的废液,而 且在微流体通道中,传热、传质速度比常规体系快,反应时间或分析时间都大大 缩短。目前,许多研究利用微流控技术实现了微量全血基因组DNA的提取,但 都需特殊辅助设备,仍采用静脉血作为检测样本,不能实现末梢全血基因组DNA 提取的POCT。
发明内容
本发明为解决现有技术中的上述问题提出的一种集末梢血采集,全血基因组 核酸提取及纯化的装置和相应方法,实现微量全血基因组DNA的快速、高效提 取。
为实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
一种快速提取全血基因组DNA的装置,包括有一体化成型的毛细采集管、 全血细胞裂解区、流体控制管,还包括有与所述流体控制管相配合的抽吸装置, 所述全血细胞裂解区由聚丙烯丝束填充。
为了进一步完善和优化上述的装置,本发明采取的技术措施还包括:
优选地,上述毛细采集管、全血细胞裂解区以及流体控制管均为玻璃材料制 作。
优选地,上述抽吸装置为橡胶滴头,即胶头滴管的滴头。
优选地,还包括能够密封毛细采集管的采集管封管器,以及能够密封流体控 制管的控制管封管器。
优选地,上述毛细采集管长2-6cm,管壁厚度为0.1-0.4mm,内径为 0.5-0.7mm;更优选地,上述毛细采集管长度为4cm,内径为0.5mm,外径为 0.7mm,管壁厚度为0.1mm。
优选地,上述流体控制管长1-3cm,管壁厚度为0.1-0.4mm,内径为 1-1.2mm;更优选地,上述流体控制管长2cm,内径为1mm,外径为1.2mm, 管壁厚度为0.1mm。
优选地,上述全血细胞裂解区管壁厚度为0.1-0.4mmm,容积为100-130μ l;更优选地,全血细胞裂解区为直径6mm的圆球形(以外壁计算),管壁厚度 为0.2mm。
另一方面,本发明还提供一种快速提取全血基因组DNA的方法,使用上述 装置进行,包括以下步骤:
步骤一,利用毛细采集管采集末梢血5-20μl,使用抽吸装置将采集的末梢 血吸入全血细胞裂解区中;
步骤二,利用抽吸装置将10-40μl裂解液吸入全血细胞裂解区中进行细胞 裂解,裂解温度为56℃,持续10分钟;
步骤三,利用抽吸装置将15-60μl无水乙醇吸入全血细胞裂解区中。
步骤四,利用抽吸装置将100-130μl的75%乙醇吸入全血细胞裂解区进行 漂洗,漂洗过程反复进行2-5次;
步骤五,利用抽吸装置将25-100μl去离子水吸入全血细胞裂解区将DNA 洗脱,获得全血基因组DNA;
其中,所述步骤二中裂解液中的组分和浓度为:10mMTris-Cl,15mMNaCl, 10mMEDTA,0.4%SDS,200μg/ml蛋白酶K。
为了进一步优化上述的方法,本发明所采取的技术措施还包括:
优选地,上述步骤一中采集末梢血为10μl,上述步骤二中利用抽吸装置将 20μl裂解液吸入全血细胞裂解区中进行细胞裂解。
优选地,上述步骤三中利用抽吸装置将30μl无水乙醇吸入全血细胞裂解区 中,上述步骤五中利用抽吸装置将50μl去离子水吸入全血细胞裂解区将DNA 洗脱,获得全血基因组DNA。
聚丙烯丝束具有无毒、无味,耐热、化学性能好,不吸水,常见的酸、碱等 有机溶剂对它几乎不起作用等特点。聚丙烯丝束具有多孔隙结构可作为滤材,广 泛作为香烟中滤嘴,对烟气中焦油、烟碱(俗称尼古丁)、一氧化碳等物质进行吸 附过滤。
一方面,本发明采用无水乙醇沉淀DNA,DNA溶液是DNA以水合状态稳 定存在,当加入乙醇时,乙醇夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚 合。另一方面,在pH为8的裂解液中,DNA分子带负电荷,一定浓度的NaCl 使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易 于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀。因此,乙醇沉淀DNA时,一定浓度NaCl 进一步促进了DNA聚合沉淀。DNA吸附在若干疏水性的聚丙烯丝束大孔隙里之 后再用75%乙醇漂洗,将盐、多糖、蛋白等杂质被去除,DNA仍然吸附在聚丙 烯丝束上。最后,用去离子水进行洗脱,溶于水的DNA从聚丙烯丝束上解离, 从而得到纯化的基因组DNA。
本发明采用上述技术方案,与现有技术相比,具有如下技术效果:
本发明首次使用聚丙烯丝束/毛细管实现了末梢血基因组DNA提取,本发明 的装置和方法操作简单、效率高,无需特殊仪器,实现了基于微流控芯片的全血 基因组DNA“样品进-结果出”的目的,所提取的基因组DNA适合于分子诊断 的测序、杂交、等温扩增等一系列实验。
附图说明
图1为本发明的一种快速提取全血基因组DNA的装置的结构示意图;
图2为本发明装置中全血细胞裂解区填充的聚丙烯丝束的单根丝束10微米 刻度下的扫描电镜结果;
图3为本发明装置中全血细胞裂解区填充的聚丙烯丝束的单根丝束0.2微米 刻度下的扫描电镜结果;
图4为琼脂糖凝胶电泳分析提取的基因组DNA结果图。
具体实施方式
图1为本发明的一种快速提取全血基因组DNA的装置的结构示意图,其中 的附图标记为毛细采集管1、全血细胞裂解区2、流体控制管3、抽吸装置4、 采集管封管器5、控制管封管器6。
本发明提供了一种快速提取全血基因组DNA的装置,包括有一体化成型的 毛细采集管1、全血细胞裂解区2、流体控制管3,还包括有与所述流体控制管 3相配合的抽吸装置4,所述全血细胞裂解区2由聚丙烯丝束填充。
本发明的装置主体毛细管采用玻璃材质,经毛细管拉针器制作而成。
聚丙烯丝束具有无毒、无味,耐热、化学性能好,不吸水,常见的酸、碱等 有机溶剂对它几乎不起作用等特点。聚丙烯丝束具有多孔隙结构可作为滤材,广 泛作为香烟中滤嘴,对烟气中焦油、烟碱(俗称尼古丁)、一氧化碳等物质进行吸 附过滤。本发明采用聚丙烯丝束结合毛细管提取末梢血基因组DNA。聚丙烯丝 束的扫描电镜结果见图2和图3(单根丝束表面的电镜结果),可见聚丙烯丝束 表面具有多孔隙结构,其极高的孔密度和孔隙率的特点,在一定的条件下可高效 吸附DNA。
下面通过具体实施例对本发明进行详细和具体的介绍,以使更好的理解本发 明,但是下述实施例并不限制本发明范围。
实施例一
操作人员采血员利用毛细采集管1刺入受试者皮肤采集末梢血5μl,使用抽 吸装置4将采集的末梢血全部吸入全血细胞裂解区2中;利用抽吸装置4将10 μl裂解液吸入全血细胞裂解区2中进行细胞裂解,使用采集管封管器5、控制 管封管器6分别密封毛细采集管1和流体控制管3,56℃持续10分钟;然后去 除封管器5及封管器6,利用抽吸装置4将15μl无水乙醇吸入全血细胞裂解区 2中;利用抽吸装置4将100μl的75%乙醇吸入全血细胞裂解区2进行漂洗, 漂洗过程反复进行2次;最后,利用抽吸装置4将25μl去离子水吸入全血细胞 裂解区2将DNA洗脱,收集洗脱液;利用获得的全血基因组DNA进行下一步 的测定。
裂解液pH为8,其中的组分和浓度为:10mMTris-Cl,15mMNaCl,10mM EDTA,0.4%SDS,200μg/ml蛋白酶K。
实施例二
操作人员采血员利用毛细采集管1刺入受试者皮肤采集末梢血10μl,使用 抽吸装置4将采集的末梢血全部吸入全血细胞裂解区2中;利用抽吸装置4将 20μl裂解液吸入全血细胞裂解区2中进行细胞裂解,使用采集管封管器5、控 制管封管器6分别密封毛细采集管1和流体控制管3,56℃持续10分钟,裂解 液pH为8,其中的组分和浓度为:10mMTris-Cl,15mMNaCl,10mMEDTA, 0.4%SDS,200μg/ml蛋白酶K;然后利用抽吸装置4将30μl无水乙醇吸入 全血细胞裂解区2中;利用抽吸装置4将110μl的75%乙醇吸入全血细胞裂解 区2进行漂洗,漂洗过程反复进行3次;最后,利用抽吸装置4将50μl去离子 水吸入全血细胞裂解区2将DNA洗脱,收集洗脱液;利用获得的全血基因组 DNA进行下一步的测定。
实施例三
操作人员采血员利用毛细采集管1刺入受试者皮肤采集末梢血20μl,使用 抽吸装置4将采集的末梢血全部吸入全血细胞裂解区2中;利用抽吸装置4将 40μl裂解液吸入全血细胞裂解区2中进行细胞裂解,使用采集管封管器5、控 制管封管器6分别密封毛细采集管1和流体控制管3,56℃持续10分钟,裂解 液pH为8,其中的组分和浓度为:10mMTris-Cl,15mMNaCl,10mMEDTA, 0.4%SDS,200μg/ml蛋白酶K;然后去除封管器5及封管器6,利用抽吸装 置4将60μl无水乙醇吸入全血细胞裂解区2中;利用抽吸装置4将110μl的 75%乙醇吸入全血细胞裂解区2进行漂洗,漂洗过程反复进行5次;最后,利用 抽吸装置4将100μl去离子水吸入全血细胞裂解区2将DNA洗脱,收集洗脱液; 利用获得的全血基因组DNA进行下一步的测定。
利用琼脂糖凝胶电泳分析上述实施例提取的基因组DNA结果见图4。M泳 道为λDNA/HindⅢ电泳结果;1泳道为λDNA的电泳结果(50kb);2,3, 4泳道分别对应于实施例一、实施例二和实施例三末梢血提取的DNA电泳结果。 利用本发明的装置和方法提取的基因组DNA为30-50kb的单一电泳条带,显示 了DNA的完整性。
本发明首次使用聚丙烯丝束/毛细管实现了末梢血基因组DNA提取,本发明 的装置和方法操作简单、效率高,无需特殊仪器,实现了基于微流控芯片的全血 基因组DNA“样品进-结果出”的目的,所提取的基因组DNA适合于分子诊断 的测序、杂交、等温扩增等一系列实验。
以上对本发明的具体实施例进行了详细描述,但其只是作为范例,本发明并 不限制于以上描述的具体实施例。对于本领域技术人员而言,任何对本发明进行 的等同修改和替代也都在本发明的范畴之中。因此,在不脱离本发明的精神和范 围下所作的均等变换和修改,都应涵盖在本发明的范围内。