用于糖化植物细胞壁多糖的酶系统 【相关申请的交叉引用】
本申请是2005年5月4日提交的第11/121,154号美国申请的部分继续申请，并要求2004年5月4日提交的第60/567,971号美国临时申请的优先权，两个申请的内容通过引用整体并入本文。
关于联邦资助研究或开发的声明
本发明是在国家海洋和大气局(NOAA)授予的SA7528051E号政府资助以及国家科学基金会(NSF)授予的DEB0109869号政府资助下进行的。政府享有本发明的某些权利。
【序列表】
本发明包括一个很长的序列表，已经通过三张CD-R替代纸件形式提交了该序列表，并通过引用将该序列表整体并入本文。在2005年5月4日提交的第11/121,154号美国申请中，2005年9月14日登记的CD-R分别标有“CRF”、“Copy 1”和“Copy 2”，每张都仅含有一个相同的828KB的文件(18172121.APP)。
背景技术
1.技术领域
本申请主要涉及降解酶和降解系统。特别地，本发明涉及在Microbulbifer degradans中发现的植物细胞壁降解酶和相关蛋白，包含此类酶和/或蛋白的系统，以及利用所述系统获取乙醇的方法。
2.背景技术
纤维素酶和相关酶已经用于食品、啤酒、葡萄酒、动物饲料、纺织品生产和洗涤、制浆和造纸工业以及农业中。在M.K.Bhat的论文“Cellulases andrelated enzymes in biotechnology”(Biotechnical Advances 18(2000)355-383)中阐述了多种此类应用，其主题通过引用整体并入本文。
植物细胞壁由通过共价和非共价方式相互作用的复合多糖的多种混合物构成。高等植物细胞壁的复合多糖包括，例如纤维素(β-1，4葡聚糖)，其通常构成细胞壁成分中碳的35-50％。纤维素聚合物自身通过氢键、范德华相互作用和疏水相互作用而形成半晶状纤维素微纤维。这些微纤维还包含非晶状区(通常称为无定形纤维素)。纤维素微纤维嵌入由半纤维素(包括，例如木聚糖、阿拉伯聚糖和甘露聚糖)、果胶(例如，半乳糖醛酸聚糖和半乳聚糖)和其它种类的β-1，3葡聚糖和β-1，4葡聚糖形成的基质中。这些基质聚合物通常可以被例如阿拉伯糖、半乳糖和/或木糖残基取代，从而形成高度复合的阿拉伯木聚糖、阿拉伯半乳聚糖、半乳甘露聚糖和木葡聚糖。半纤维素基质反而被聚酚醛木质素(polyphenolic lignin)包围。
由于必须在木质素和半纤维素成分被降解后，酶才能作用于中心的纤维素微纤维，所以基质的复杂性使其难以被微生物降解。通常，需要不同微生物的聚生体(consortium)来降解细胞壁聚合物，从而释放单糖成分。为进行植物细胞壁的糖化，必须浸透木质素并除去半纤维素以使纤维素降解酶能够作用于其底物。对于细胞壁的工业糖化，向经加工的底料中加入大量主要为真菌纤维素酶的酶，所述底料已经在高温高压下用稀硫酸进行了处理以浸出(permeabilize)木质素并部分地糖化半纤维素成分。
Saccharophagus degradans 2-40菌株(在本文称为“S.degradans 2-40”或“2-40”)是降解复合多糖(CP)的一组新生海洋细菌的代表。S.degradans已经保存在美国标准生物品收藏中心(ATCC)，保存号为ATCC 43961。先前已知并在本文与Microbulbiferdegradans 2-40菌株(“M.degradans 2-40”)同义的S.degradans 2-40是分离自切萨皮克湾(Chesapeake Bay)流域腐烂的盐沼绳草(Sparina altemiflora)的海洋□-变形菌。与来自腐烂植物的分离物一致，S.degradans 2-40菌株能够降解包括纤维素、果胶、木聚糖和壳多糖在内的许多复合多糖，这些复合多糖是高等植物细胞壁的常见成分。S.degradans2-40菌株还能够解聚海藻细胞壁的成分，例如琼脂、琼脂糖和昆布多糖以及蛋白质、淀粉、支链淀粉和海藻酸。除了能降解这么多聚合物外，S.degradans2-40菌株还能够利用所述多糖的任一种作为唯一的碳源。因此，S.degradans2-40菌株不仅是微生物降解不溶性复合多糖(ICP)的优秀模型，还可用作完全代谢这些ICP的范例。ICP是用于形成和构建动物和植物的聚合糖。它们不溶于水，因此难以降解。
Microbulbifer degradans 2-40菌株的生长需要至少1％的海盐，并且可以耐受高达10％的盐浓度。它是厌氧、通常为杆状并且通过单根极生鞭毛方式运动的高多态性革兰氏阴性菌。之前的研究表明，2-40能够降解至少10种不同的糖类聚合物(CP)，包括琼脂、壳多糖、海藻酸、羧甲基纤维素(CMC)、β-葡聚糖、昆布多糖、果胶、支链淀粉、淀粉和木聚糖(Ensor，Stotz et al.1999)。另外，已经证明2-40可以合成真正的酪氨酸酶(Kelley，Coyne et al.1990)。16S rDNA分析表明，2-40是变形菌门(Proteobacteria)γ-亚纲中的一员，与Microbulbifer hydrolyticus(Gonzalez and Weiner 2000)和Teridinibacter sp.(Distel，Morrill et al.2002)相关，是与船蛆共生且分解纤维素的固氮菌。
已经广泛地对琼脂酶、壳多糖酶和海藻酸酶系统进行了表征。酶谱活性凝胶试验表明这三个系统都由多解聚酶构成，并且多条线索表明这些解聚酶中的至少一些与细胞表面结合(Stotz 1994；Whitehead 1997；Chakravorty1998)。活性试验表明，在CP上生长的对数生长过程中，2-40的酶活性多数存在于细胞部分，然而在稍后的生长阶段，发现多数活性存在于上清中而与细胞结合地活性急剧下降(Stotz 1994)。在CP上的生长还伴随着细胞形态的剧烈改变。2-40的葡萄糖生长培养物在细胞大小和形状上相对均一，通常具有光滑且没有特征的细胞表面。然而，当在琼脂糖、海藻酸盐或壳多糖上生长时，2-40细胞显示新的表面结构和特征。
这些细胞外结构(exo-cellular structures和extra-cellular structures，ES)包括小突起、好像将要从细胞释放出的较大泡样结构、纤细的伞毛或菌毛、以及纤维样附属物(可能是某种细管)网状物。免疫电镜的结果表明，琼脂酶、海藻酸酶和/或壳多糖酶至少位于2-40ES的一些种类中。2-40酶在表面突起的表面拓扑学和免疫定位模式与梭菌属的纤维素分解成员非常相似。
将木质纤维材料转化成糖类的方法的最早研究基于酸水解(参见，例如Grethlein，Chemical Breakdown Of Cellulosic Materials，J.APPL.CHEM.BIOTECHNOL.28：296-308(1978))。该过程可以包括使用浓酸或稀酸。例如，通过引用整体并入本文的美国专利第5,221,537号和第5,536,325号阐述了木质纤维材料酸水解生成葡萄糖的两步法。这些方法具有多个缺点，例如酸的回收、需要特定的构建材料、需要使系统中的水减至最少以及产出大量可抑制乙醇发酵的降解物。
为了克服酸水解方法的问题，目前正在开发利用酶促水解的纤维素转化方法。参见，例如通过引用整体并入本文的美国专利第5,916,780号，该专利公开了具有预处理步骤的酶促水解方法，该预处理步骤破坏纤维结构的完整性并使纤维素更易于在处理阶段中被纤维素酶酶类攻击。
通过引用整体并入本文的美国专利第6,333,181号公开了通过用超声波处理木质纤维素、纤维素和产乙醇微生物的混合物从而由木质纤维材料生产乙醇的方法。
目前需要鉴定以纤维素作为底物的酶系统，利用合适的载体表达编码这些蛋白的基因，鉴定并分离氨基酸产物(酶和非酶产物)，使用这些产物和含这些基因的微生物来达到目的，例如生产乙醇和Bhat的论文中阐述的应用。在本领域中还需要利用木质纤维材料来生产乙醇，开发出乙醇产量更高的更有效的处理方法。
【发明内容】
本发明的一个方面涉及植物细胞壁活性糖酶和相关蛋白质的系统。
本发明的再一方面涉及降解含纤维素物质的方法。该方法包括使含纤维素的物质与一种或多种从Saccharophagus degradans 2-40菌种获得的化合物相接触。
本发明的另一方面涉及催化含纤维素物质的反应的多组酶。
本发明的又一方面涉及编码具有纤维素降解活性或纤维素结合活性的多肽的多核苷酸。
本发明的再一方面涉及含有编码具有纤维素解聚酶活性的多肽的基因的嵌合基因和载体。
本发明的再一方面涉及编码多肽的核苷酸序列的鉴定方法，其中所述多肽具有来自S.degradans的以下活性中的任意一种：纤维素解聚酶活性或纤维素结合活性。可以在大肠杆菌中构建S.degradans的基因组文库，并筛选需要的活性。构建并分离具有特定活性的转化大肠杆菌细胞。
本发明的另一方面涉及由木质纤维材料生产乙醇的方法，该方法包括利用糖化有效量的图4-11列出的一种或多种化合物处理木质纤维材料以得到糖，并转化糖以产生乙醇。可以通过但不限于本领域技术人员已知的成熟方法实现糖向乙醇的转化和回收。例如，通过使用产乙醇微生物，例如发酵单孢菌(Zymomonas)、欧文氏菌(Erwinia)、克雷伯氏杆菌(Klebsiella)、黄单胞菌(Xanthomonas)和埃希氏菌(Escherichia)，优选大肠杆菌K011(Escherichia coli K011)和产酸克雷伯氏菌(Klebsiella oxytoca)P2。
本发明的再一方面涉及由木质纤维材料生产乙醇的方法，该方法包括使木质纤维材料与表达糖化有效量的图4-11列出的一种或多种化合物的微生物接触以得到糖，并转化糖以产生乙醇。
本发明的又一方面涉及由木质纤维材料生产乙醇的方法，该方法包括使木质纤维材料与表达糖化有效量的图4-11列出的一种或多种化合物的产乙醇微生物接触以产生乙醇。此类产乙醇微生物表达有效量的图4-11列出的一种或多种化合物以糖化木质纤维材料，以及表达有效量的一种或多种酶或酶系统，所述酶或酶系统催化(单独或协同催化)糖向乙醇的转化。
本发明的再一方面涉及纤维素降解物质在食品、啤酒、葡萄酒、动物饲料、纺织品生产和洗涤、制浆和造纸工业以及农业中的应用。
本发明植物细胞壁的糖化以及包括糖化的乙醇生产法的优势在于，在纤维素降解酶能够作用于其底物之前，无需浸出木质素和/或除去或部分糖化半纤维素或半纤维素组分。本发明还允许糖化和包含糖化的乙醇生产方法可在不用或使用减少量的真菌纤维素酶(fungal cellulases)、酸(例如硫酸)、高温和高压的情况下进行糖化。
本发明的其它方面、特征和优势将体现于以下详细描述中，以下详述与附图结合作为本公开的一部分，其通过实例的方式举例说明了本发明的原理。
【附图说明】
图1A显示纤维素的化学式。
图1B显示纤维素的物理结构。
图2A显示纤维素纤维的降解。
图2B显示纤维素降解成纤维二糖和葡萄糖的化学图解。
图3显示2-40培养上清的SDS-PAGE和酶谱分析。
图4列出了S.degradans 2-40的预测纤维素酶(根据在附录中出现的顺序，图4-10的序列分别为SEQ ID NOs.1-214)。
图5列出了M.degradans 2-40的预测木聚糖酶、木糖苷酶和相关附属酶。
图6列出了S.degradans 2-40的预测果胶酶和相关附属酶。
图7列出了S.degradans 2-40的阿拉伯聚糖酶和阿拉伯半乳聚糖酶。
图8列出了S.degradans 2-40的甘露聚糖酶。
图9列出了S.degradans 2-40的昆布多糖酶。
图10列出了所选的S.degradans 2-40的糖结合组件的蛋白(carbohydrate-binding module proteins)。
图11列出了S.degradans 2-40的重组蛋白以及其预测分子量和观察到的分子量的比较。
发明详述
S.degradans 2-40基因组序列分析表明其具有大量编码预期可降解植物源糖类的酶的基因。目前，2-40是唯一经测序的海洋细菌，其明显具有完整的纤维素酶以及木聚糖酶系统以及多个含有植物细胞壁活性糖酶的其它系统。
因此可以看出，2-40在海洋碳循环中具有重要作用，其作为“超级降解员(super-degrader)”介导降解来自各种海藻、植物和无脊椎动物的CP。显著的酶多样性、新颖的表面特征(ES)以及糖酶在ES的明显定位使S.degradans 2-40成为一个可在其中研究CP代谢细胞生物学以及表面酶结合的引人注意的生物体。
目前已经发现，2-40具有恰当定位的互补的完整酶系，用于降解植物细胞壁。该发现通过以下方法完成：a)2-40植物细胞壁活性酶系统的注解和基因组分析；b)鉴定含有可能参与表面酶展示的域或基序的酶和其它蛋白；c)基于鉴定的蛋白基序开发试验模型；以及d)克隆并表达所选的蛋白以制备抗体探针，从而利用免疫电镜检测所提出的表面酶展示模型。
这些成果已经很大程度上受益于近来的2-40基因组测序工作，从而可根据具有表面结合和/或锚定功能的组件或域的序列的同源性，鉴定编码具有潜在表面结合功能的蛋白的基因。
利用BLAST和其它氨基酸序列比对和分析工具鉴定具有引人注目的序列元件的酶ORF和非酶ORF。可以将感兴趣的基因克隆到大肠杆菌中，与编码框内的聚组氨酸亲和融合标签一起表达并通过镍离子色谱纯化，由此提供鉴定和生产用于研究和生产抗体探针的重组2-40蛋白的方法。
最近与Department of Energy′s Joint Genome Initiative(JGI)联合获得了2-40的基因组序列。在2005年1月19日完成的序列草图包含单个连续序列中的5.1Mbp。通过Oak Ridge国家实验室(Oak Ridge Oak Ridge NationalLaboratory，ORNL)的计算机基因组学小组完成了对开放读码框(ORF)的自动注解，该自动注解序列可以从互联网(http://genome.ornl.gov/microbial/mdeg)上获得。
最初的基因组注解揭示了多种糖酶，包括一些琼脂酶、海藻酸酶和壳多糖酶。引人注目的是，该基因组还包含许多预期在植物细胞壁聚合物的降解中起作用的酶，其包括与纤维素酶、木聚糖酶、果胶酶以及其它葡聚糖酶和葡糖苷酶具有同源性的多个ORF。总之，在所述基因组草图中鉴定了多于180个可能在糖代谢中起作用的开放读码框。
为了开始定义2-40的纤维素酶、木聚糖酶和果胶酶系统，首先通过BLAST同源性分析将基因归类，使其属于这些系统之一。尝试性地将不明确的ORF归入具有最佳已知命中组。用于改进该尝试性分类法的其它工具包括Pfam(蛋白家族比对数据库和HMMs；http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/)和SMART(简单组件构架搜索工具；http://smart.embl-heidelberg.de/)，其利用多重比对和隐藏的Markov模型(序列共有同源性的统计模型)来鉴定蛋白序列内的明确组件域。这些分析相对较为成功，然而，仅根据序列同源性仍难以对一些ORF进行分类。
已经通过底物特异性以及反应产物对一些酶进行了传统分类。在前基因组时代，多年来一直将功能视为最令人信服的(且可能是最有用的)酶比较的基础，并开发出各种酶活性检测方法，从而形成了常见的EC分类方案。将作用于两个糖之间(或糖与非糖之间，如硝基酚-糖苷衍生物中所出现的)的糖苷键的纤维素酶和其它O-糖基水解酶命名为EC 3.2.1.-，最后的数字表示所断裂的键的确切类型。根据这个方案，将内切作用纤维素酶(1，4-β-内切葡聚糖酶)命名为EC 3.2.1.4.。
随着全基因组测序计划的出现以及克隆基因核苷酸序列测定的简单化，数量不断增加的序列数据促进了相关基因和蛋白在前所未有的规模上的分析和比较。对于糖类尤其如此，如在E.C.命名方案中所显示的，根据反应特异性对此类酶进行的分类具有不能反映序列相似性的局限性。
糖酶序列和结构分析的主要启示之一是发现具有相关序列的酶家族，其含有可根据其氨基酸序列进行预测的保守性三维折叠。另外，已经表明具有相同三维折叠的酶具有相同的水解立体特异性，即便在催化不同反应时也是如此(Henrissat，Teeri et al.1998；Coutinho andHenrissat 1999)。
这些发现形成了基于序列对糖酶组件进行分类的基础，其可以网络数据库的形式获取，即糖类活性酶服务器(the Carbohydrate-Active enZYmeserver(CAZy)，http://afmb.cnrs-mrs.fr/CAZY/index.html)(CoutinhoandHenrissat 1999，Coutinho andHenrissat 1999)。
CAZy根据所催化的反应类型定义了四种主要类型的糖酶：糖基水解酶(GH’s)、糖基转移酶(GT’s)、多糖裂解酶(PL’s)和糖类酯酶(CE’s)。GH’s通过水解断裂糖苷键。这类酶包括许多常见的多糖酶，例如纤维素酶、木聚糖酶和琼脂酶。GT’s通常在多糖合成中发挥功能，通过将活化的载体分子(例如尿苷二磷酸UDP)上的糖分子转移到接受分子上从而催化新糖苷键的形成。尽管GT’s经常在生物合成中发挥作用，但在一些实例中其也将所述机制用于键的断裂，如纤维二糖和纤维糊精的磷酸解断裂(Lou，Dawson et al.1996)。PL’s利用β-消除机制介导键的断裂，并通常参与海藻酸盐(酯)和果胶的解聚。CE’s通过作为去乙酰化酶作用于O-取代多糖或N-取代多糖。常见的实例包括木聚糖去乙酰酶和壳多糖去乙酰酶。基于序列的家族通过每个种类内的数字来命名，例如GH5表示糖基水解酶家族5。GH5的成员利用双置换机制以保留的方式水解β-1，4键，从而保留了原有键的立体特异性。异头构型的保留或调换是特定GH家族的共有特征(Henrissat和Bairoch 1993；Coutinho和Henrissat 1999)。已经报道了属于GH5的内切纤维素酶、木聚糖酶和甘露聚糖酶的一些实例，举例说明了GH家族内可能具有的多种底物特异性。另外，GH5主要为内切水解酶，在聚合物内部随机位点对各自底物的链进行断裂。虽然对于GH5的确如此，但其它GH家族并不具有这种普遍性。除了糖酶，CAZy服务器还定义了多个糖类结合组件(CBM)家族。与催化组件相同，根据氨基酸序列的相似性和保守性三维折叠来命名CBM家族。
已经将CAZyme结构家族引入到由Bernard Henrissat及其同事开发的新的分类和命名方案中(Henrissat，Teeriet al.1998)。传统的基因/蛋白命名法用表示一般功能和发现顺序的首字母缩写词来表示，在这个方案中生物体的纤维素酶基因被命名为celA、celB等，而不考虑其对纤维素的实际作用机制。一些研究人员试图通过将纤维素酶命名为内切葡聚糖酶(engA、engB)或纤维二糖水解酶(cbhA、cbhB)来传递更多的信息，然而这种方法需要测定体外的功能，且仍然不能反映蛋白序列和结构之间的关联。CAZyme命名法保留了常见的首字母缩写词以表示基因所属的功能系统，并引入了家族号码命名法。家族号码后的大写字母表示在给定生物系统内的报道顺序。所提供的实例为Cellulomonas fimi的两种内切葡聚糖酶CenA和CenB。在老的命名法中，除了发现顺序外，从名称不能推导出任何信息。将其分别命名为Cel6A和Cel9A则可以立即知晓这两个纤维素酶在序列上不相关，由此属于不同的GH家族(其中Cel表示纤维素酶，9表示糖基水解酶家族9)。然而这个方案不能区分内切和外切活性，这些命名都不是绝对的，可用于相关酶(即纤维素二糖水解酶Cel6A，内切木聚糖酶Xyn10B)的讨论中。在糖酶的命名中优选采用催化组件；由于很多(乃至大多数)糖酶含有至少一个CBM，根据其催化组件对其进行命名。如果存在多于一个催化域，以从N末端至C末端的顺序对其进行命名，即cel9A-cel48A在氨基末端包含GH9，在羧基末端包含GH48。这两个域都作用于纤维素。然而，CBM组件的很多实例存在于不含预测糖酶组件的蛋白质中。在没有其它预测功能域(例如蛋白酶)的情况下，根据CBM组件家族对这些蛋白进行命名。如果存在多个CBM家族，那么命名也要从氨基端至羧基端进行，即cbm2D-cbm10A(Henrissat，Teeri等，1998)。这种命名法已经被广泛接受，并将用于可作为本研究一部分的所有2-40植物细胞壁活性糖酶和相关蛋白的命名。
高等植物细胞壁由多种糖类聚合物(CP)组分构成。这些CP通过共价和非共价方式相互作用，为植物提供形成坚硬的细胞壁并抵抗细胞膨胀压力所需要的结构完整性。在植物中发现的大部分CP为纤维素，其形成细胞壁的结构骨架。参见，图1A。在纤维素的生物合成中，聚-β-1，4-D-葡萄糖链自身通过氢键和疏水相互作用结合从而形成纤维素微纤维，微纤维进一步自结合以形成更大的纤维。生物素微纤维有些不规则，并含有结晶度不同的域。纤维素纤维的结晶程度与其组分纤维素链间的氢键的紧密排列度有关。键排列较不规则并由此更易于接近的葡萄糖链区域被称为无定形区域(图1B)。相对结晶度和纤维直径可表征纤维素的生物来源(Beguin and Aubert 1994；Tomme，Warren et al.1995；Lynd，Weimer et al.2002)。纤维素纤维的不规则性导致多种变化的键角，并产生空间效应从而阻碍酶接近和随后的降解。
纤维素解聚成葡萄糖的一般模型最少包括三种不同的酶活性(参见，图2A和图2B)。内切葡聚糖酶在内部断裂纤维素链从而形成较短的链，并增加外切葡聚糖酶作用的可接近末端的数量。这些外切葡聚糖酶特异于还原末端或非还原末端，并释放纤维二糖，即纤维素二聚体(纤维二糖水解酶)。通过纤维二糖酶(β-1，4-葡糖苷酶)将积累的纤维二糖断裂成葡萄糖。在很多系统中，还存在另一类型的酶：为β-1，4-葡糖苷酶的纤维糊精酶，其从纤维素低聚物而非纤维二糖断裂出葡萄糖单体。由于纤维素具有可变的结晶度和结构的复杂性，以及降解纤维素所需要的酶活性，所以具有“完整”纤维素酶系统的生物体要合成多种内切作用β-1，4-葡聚糖酶和/或外切作用β-1，4-葡聚糖酶。
例如，已经证明Cellulomonas fimi和褐色高温单胞菌(Thermomonospora fusca)可合成六种纤维素酶，而热纤梭菌(Clostridiumthermocellum)具有15种或更多种纤维素酶(Tomme，Warren等，1995)。推测这些纤维素酶的底物结合袋的形状和/或活性位点的改变可促进纤维素的完全降解(Warren 1996)。人们相信在介导纤维素降解的同时，具有完整纤维素酶系统的生物体能够高效地利用植物生物量作为碳源和能源。不完整纤维素系统的生态作用和进化作用较不清楚，虽然相信这些生物体中的很多作为聚生体的成员(例如瘤胃群落)发挥作用，共同完成全部的或几乎全部的纤维素水解(Ljungdahl和Eriksson 1985；Tomme，Warren等，1995)。
在植物细胞壁中，纤维素微纤维嵌入到半纤维素(包括木聚糖、阿拉伯聚糖和甘露聚糖)、果胶(例如，半乳糖醛酸聚糖和半乳聚糖)和各种β-1，3葡聚糖和β-1，4葡聚糖的基质中。这些基质聚合物通常可以被阿拉伯糖、半乳糖和/或木糖的残基取代，从而产生例如阿拉伯木聚糖、半乳甘露聚糖和木葡聚糖等(Tomme，Warren et al.1995；Warren 1996；Kosugi，Murashimaet al.2002；Lynd，Weimeret al.2002)。这些非纤维素CP具有的不同糖基键的复杂性和绝对数量需要通常酶数量和复杂性方面与纤维素酶系统相当的特异酶系统。由于其异质性，植物细胞壁降解通常需要多种微生物的聚生体(Ljungdahl和Eriksson 1985；Tomme，Warren等，1995)。
目标：S.degradans和M.degradans合成了降解植物细胞壁的主要结构聚合物的完整多酶系统。A)定义纤维素酶和木聚糖酶系统，测定不能通过序列同源性预测其功能的基因的活性；以及B)通过序列同源性对其它植物降解酶系统(即果胶酶、昆布多糖酶等)进行的鉴定和注解。
所有公开、专利和专利申请都以相同的程度通过引用将其全文清楚地并入本文，其中所述程度为特别地且分别指明地将各公开、专利和专利申请通过引入全文并入本文。
以下实施例用以说明，而非以任何方式限制本发明的范围。
试验结果
I：2-40植物细胞壁活性酶的基因组、蛋白质组和功能分析
通过ORNL注解可以知道，2-40基因组包含多种对植物细胞壁聚合物具有预期活性的酶。这特别令人惊讶，因为2-40是具有数个降解常见海洋多糖(例如琼脂、海藻酸盐(酯)和壳多糖)的复合酶系统的河口细菌。由于存在保守性差的域和/或域的新组合使得基于自动注解的多酶系统的定义复杂化。在2-40的植物细胞壁活性酶中有多个这种实例。因此，对糖酶ORF的ORNL注解进行以组件组分为重点的人工检查，然后根据它们可能涉及的底物(即纤维素或木聚糖降解)将其归为不同组。这些基因组序列分析形成大约25个潜在纤维素酶、11个木聚糖酶和17个果胶酶的库。
当序列同源性高度保守时，有可能获得高度准确的功能预测。因此，为了证实M.degradans中存在功能性纤维素酶和木聚糖酶系统，按照以下讨论进行酶谱和酶活性试验。另外，还尝试利用基于蛋白质组学的质谱来鉴定2-40培养上清中的酶。
接着，使用更完善的基因组分析来预测可能存在的功能，并鉴定纤维素酶和木聚糖酶系统中可能存在的任何需要功能表征以确定其作用的ORF。根据B.Henrissat的序列分析和功能预测对属于其它植物细胞壁活性酶系统的ORF进行尝试性分类。
为了了解2-40纤维素酶和木聚糖酶的诱导和表达，根据在本申请结尾试验方法部分中的讨论，通过二硝基水杨酸还原糖试验(DNSA试验)测定了微晶纤维素培养细胞、木聚糖培养细胞以及上清中纤维素酶和木聚糖酶的比活性。为了研究这两种在植物细胞壁中共同存在的底物可能具有的活性共诱导作用，测定了微晶纤维素生长培养物中的木聚糖酶活性，反之测定了木聚糖生长培养物中的纤维素酶活性。
在微晶纤维素或木聚糖上的培养均产生了针对两种底物的酶活性，这证明纤维素酶和木聚糖酶系统的共诱导作用。与其它2-40糖酶系统相同，最高水平的活性由同源底物诱导。所述结果还揭示了这两个系统在表达方面的一些关键差异。当生长在微晶纤维素上时，纤维素酶的活性在生长早期与细胞相关而在晚期上清中大量累积。细胞和上清部分在整个生长期内保持了基本相等的较低木聚糖酶活性。与之不同，在木聚糖上生长的培养物的大多数木聚糖酶活性和纤维素酶活性在整个生长周期中均存在于细胞部分。纤维素酶活性没有在上清中累积；木聚糖酶活性在上清中适当累积，但仍低于与细胞结合的活性。
对微晶纤维素和木聚糖培养的细胞团和培养上清的酶活性凝胶(酶谱)进行分析，以使表达的纤维素酶和木聚糖酶直观化并对其进行鉴定。木聚糖培养上清的酶谱显示5条木聚糖酶解条带(xylanolytic bands)(图3)，其中4条带很好地对应于所预测的木聚糖酶的计算MW(xyl/arb43G-xyn10D：129.6kDa，xynlOE：75.2kDa，xyniOC：42.3kDa，和xyn11A：30.4kDa；参见表2)。在微晶纤维素上生长的培养物显示8条活性条带，CMC酶谱中MW的范围为30-150kDa。CMC通常为检测内切纤维素活性的合适底物。这些酶谱清楚地证明，2-40在微晶纤维素上生长的过程中合成多个大小不同的内切纤维素酶，这是功能化多酶纤维素酶系统的标志。同时，CMC和木聚糖酶谱证实了基因组分析的结果以及多酶纤维素酶和木聚糖酶系统在M.degradans2-40中的可诱导表达。
为了鉴定在CP上生长的过程中产生的单个纤维素酶和木聚糖酶，利用偶联有串联质谱(MS/MS)的反相高效液相色谱(RP-HPLC)对培养上清进行蛋白质组分析。在电喷雾电离和MS/MS分析前利用RP-HPLC柱对肽进行分离，从而从复杂样本中鉴定多种蛋白质(Smith，Loo等，1990；Shevchenko，WiIm等，1996；Jonsson，Aissouni等，2001)。这些分析令人信服地鉴定了多于100种不同的非酶蛋白和多个糖酶，包括一种木聚糖酶、两种木糖苷酶、一种纤维素酶以及两种纤维糊精酶。在对琼脂糖培养上清进行的其他分析中，鉴定了琼脂酶。
在斯坦福大学质谱实验室进行凝胶切块的消化、提取以及MS/MS分析，结果从微晶纤维素培养上清样本中鉴定出两种经注解的纤维素酶。一种命名为cel5H，其具有预测的67kDa MW，并从具有75kDa表观MW的条带鉴定出来。另一种命名为cel9B，其具有预测的89kDa MW，但具有120kDa表观MW。cel9B预测MW和表观MW间的差异与某些经克隆并在大肠杆菌中表达的2-40蛋白的情况类似，其表观MW比其预测MW高30-40％。
在CAZy ModO(糖酶活性酶组件组织，Carbohydrase Active enZymeModular Organization)的服务器AFMB-CRNS上分析了2-40基因组草图中所有基因模型的氨基酸翻译。该分析鉴定了含有催化组件(GH、GT、PL或CE)和/或CBM的所有基因模型。该基因组总计包含了222个含CAZy域的基因模型，多数基因组模型具有组件结构。在这些基因组模型中，117个具有GH组件，39个具有GT，29个具有PL，17个具有CE。在这些基因组模型中，很多带有一个或多个来自各种家族的CBM。还有20个蛋白质包含CBM但不含预测的糖酶域。
2-40组件序列与ModO数据库中序列的详细比较允许对活性位点序列高度保守的组件的功能进行具体预测。例如，Cel9B(来自凝胶切块MS/MS)含有GH9组件(其预测具有内切纤维素酶功能)、CBM2和CBM10组件。
当催化组件序列不太保守时，仅可预测一般机制。gly5M即是如此，其含有预测为1，3-葡聚糖酶或1，4-葡聚糖酶的GH5，但序列分析不能确定是哪一个，所以首写字母缩写命名为表示葡聚糖酶的“gly”。
利用这种详细评估和分析的结果将基因归类为纤维素酶、木聚糖酶、果胶酶、昆布多糖酶、阿拉伯聚糖酶和甘露聚糖酶系统。每个系统还可以将相关附属酶归于其中，即纤维素二糖酶属于纤维素酶系统，木糖苷酶属于木聚糖酶系统。最可能作为纤维素酶、木聚糖酶或附属酶发挥作用的较不保守GH组件的基因也被鉴定并将其标为需要证明功能的基因。
已经将ORNL注解、随后的注解分析、蛋白质组分析(质谱)、CAZyme组件分析以及功能预测的结果并入图4-11，所述图还包含预测的植物细胞壁活性糖酶以及所选的仅含CBM的2-40基因的综述表。
选择用于克隆和功能分析的基因包括糖酶gly3C、gly5K、gly5M、gly9C和gly43M。由于gly5L的活性位点与gly5K高度同源，可根据gly5K获得的结果推断gly5L的活性。利用20个“仅含CBM”的蛋白质中的4个，即cbm2A、cbm2B、cbm2C和cbm2D-cbm10A进行活性试验以研究其是否如所预测的那样缺乏酶功能。这4个酶含有预测能够结合结晶纤维素的CBM2组件。这种预测的亲和性是其用于活性试验的原因；结合纤维素的那些蛋白最有可能含有序列分析没有检测到的纤维素酶或木聚糖酶组件。对于仅含CBM的蛋白质，缺乏所检测的酶活性将证实催化域(CD)的缺失。
为了对M.degradans的完整纤维素酶和木聚糖酶系统进行定义，将根据试验方法中的阐述，表达、纯化和检测那些可能属于某个系统但不能根据序列同源性确切分类的酶。目前，已经将gly3C、gly5K、glyδM、gly9C和gly43M，以及cbm2A、cbm2B、cbm2C和cbm2D-cbm 10A以pETBlue2(Novagen)构建体的形式克隆至表达菌株中。该载体在诱导型T7lac启动子的控制下进行表达，并在C末端引入6×组氨酸标签，以便通过镍离子亲和性对重组蛋白进行纯化。可通过蛋白印迹利用α-单克隆抗体(Novagen)证实这些蛋白的成功克隆与表达。除不稳定的Cbm2D-Cbm10A以外，所有表达的蛋白都具有接近或大于其预测MW的表观MW(表8)；两次单独尝试克隆并表达这个不稳定蛋白都形成含的条带，该条带在蛋白印迹中接近染料前端，证明该基因产物可能被蛋白水解降解。已经克隆并表达了另一个酶Cel5A，将其用作活性试验中的内切纤维素酶阳性对照。Cel5A具有预测的129KDa MW，含有两个GH5组件，并在HE纤维素酶谱中具有很高的活性。
对功能进行分类的主要标准是所作用的底物和所检测到的活性类型。因此，各种酶活性试验都将集中于提供功能的定性证明而非相应活性水平的严格定量。所需的试验由被测底物决定，并在试验方法中有更详细的讨论。对于纤维素，重要的是要区分β-1，4-内切葡聚糖酶(内切纤维素酶)、β-1，4-外切葡聚糖酶(纤维二糖水解酶)和β-1，4-葡糖苷酶(纤维二糖酶)的活性。这一点可利用检测内切纤维素酶的酶谱、针对纤维二糖水解酶的DNSA还原糖试验以及针对纤维二糖酶活性的对硝基苯酚-β-1，4-纤维二糖苷(pnp-纤维二糖苷)试验来实现。来自三个试验的合并结果可以对功能进行如下定义：阳性酶谱表示内切纤维素酶活性，阴性酶谱与阳性DNSA试验以及阴性pnp-纤维二糖试验表示外切纤维素酶，而阴性酶谱和阴性DNSA与阳性pnp-纤维二糖结果表示酶为纤维二糖酶。
将分别通过木聚糖酶谱、昆布多糖酶谱和大麦葡聚糖酶谱测定木聚糖酶(β-1，4-木聚糖酶)、昆布多糖酶(β-1，3-葡聚糖酶)以及混合的葡聚糖酶(β-1，3(4)-葡聚糖酶)的活性。与纤维素不同，没有任何“木聚二糖水解酶(xylobiohydrolases)”或其它能够从这些底物特异地断裂出二聚体的外切作用酶的报道。因此，酶谱将足以证明解聚酶(内切)活性，pnp-衍生物将检测单糖(外切)的断裂。在本研究中使用的pnp-衍生物包括pnp-α-L-阿拉伯呋喃糖苷、pnp-α-L-阿拉伯吡喃糖苷、pnp-β-L-阿拉伯吡喃糖苷、pnp-β-D-纤维二糖苷、pnp-α-D-吡喃木糖苷和pnp-β-D-吡喃木糖苷。根据未知域的可能活性选择这些底物。试验可以确定从木葡聚糖断裂α-连接木糖取代物的任何α-阿拉伯糖苷酶、β-阿拉伯糖苷酶、β-纤维二糖酶、β-木糖苷酶、双功能α-阿拉伯糖苷酶/β-木糖苷酶和α-木糖苷酶的功能。根据在试验方法中的讨论，利用对硝基苯酚浓度的标准曲线在96孔微孔板中进行pnp-衍生物的试验。
β-1，4-葡聚糖酶、β-1，3-葡聚糖酶和β-1，3(4)-葡聚糖酶活性以及β-1，4-木聚糖酶和各种外切-糖苷酶活性的组合试验可以明确地解析不确定糖酶的功能。具有所证明活性的蛋白将被分类到适当的酶系统中。
试验方法
酶谱
根据标准SDS-PAGE凝胶制备所有活性凝胶，并将适当的CP底物直接引入至分离凝胶中。用8％聚丙烯酰胺浓度形成酶谱，将底物溶解在dH2O和/或凝胶缓冲液中形成0.1％(HE-纤维素)、0.15％(大麦β-葡聚糖)或0.2％(木聚糖)的终浓度。除了在含有终浓度为2％SDS和100mM二硫苏糖醇(DTT)的样本缓冲液中于95℃处理8分钟外，其余根据Laemmli(Laemmli1970)方法在不连续条件下进行凝胶电泳。电泳后，凝胶在80ml复性缓冲液(含2.5％Triton X-100、2mM DTT和2.5mM CaCl2的20mM PIPES缓冲液，pH6.8)中室温孵育1小时。加入钙以帮助潜在的钙结合域(例如Lam16A的tsp3s)进行重折叠。
平衡1小时后，将凝胶置于80ml新制备的复性缓冲液中，并在4℃轻微摇动过夜。次日早晨，于室温下将凝胶在80ml 20mM PIPES(pH6.8)中平衡1小时，转移至干净的容器中，用最小量的PIPES缓冲液覆盖，并在37℃孵育4小时。孵育后，用含0.25％刚果红的dH2O溶液(HE-纤维素、β-葡聚糖和木聚糖)或含0.01％甲苯胺蓝的7％乙酸溶液将凝胶染色30分钟。用1MNaCl对刚果红染色的凝胶脱色，或用dH2O对甲苯胺蓝染色的凝胶脱色，直至在染色背景下能看到清晰的条带。
Nelson-Somogyi还原糖试验
利用50ul反应体积，通过适合96孔微孔板的改良Nelson-Somogyi还原糖方法检测纯化蛋白的活性(Green，Clausenet al.1989)。检测底物包括溶解在pH6.8的20mM PIPES中的微晶纤维素、CMC、磷酸溶胀纤维素(PASC)、大麦葡聚糖、昆布多糖和木聚糖(1％，大麦葡聚糖和昆布多糖为0.5％)。大麦葡聚糖、昆布多糖和木聚糖的试验在37℃下孵育2小时；微晶纤维素、CMC和PASC的试验在37℃下孵育36小时。样本以一式三份进行试验，与空白数值进行校正，并由标准曲线估算其水平。根据厂商说明利用Pierce BCA蛋白试验测量酶试验样本中的蛋白浓度，试验一式三份。计算酶活性，其中将1个单位(U)定义为每分钟释放1μM还原糖，以U/mg蛋白表示比活性。
外切糖苷酶活性试验：pnp-衍生物
检测纯化蛋白对pnp-衍生物pnp-α-L-阿拉伯呋喃糖苷、pnp-α-L-阿拉伯吡喃糖苷、pnp-β-L-阿拉伯吡喃糖苷、pnp-β-D-纤维二糖苷、pnp-α-D-葡糖吡喃糖苷、pnp-β-D-葡糖吡喃糖苷、pnp-α-D-木糖吡喃糖苷和pnp-β-D-木糖吡喃糖苷的活性。向125μl含5mM底物的20mM PIPES(pH6.8)溶液中加入25μl酶溶液，在37℃孵育30分钟，并测量A405。在用空白反应校正后，将读数与对硝基苯酚标准曲线比较，并用U/mg蛋白表示比活性，其中1个单位(U)定义为1μmol pnp/分钟。
质谱和蛋白质组分析
利用microcon或centricon装置(Millipore)通过离心超滤将微晶纤维素、CMC和木聚糖培养物的稳定期上清浓缩25倍。通过BCA蛋白试验测定样本的蛋白浓度。将样本置换至pH8.5的100mM Tris缓冲液中，该缓冲液也含有8M尿素和10mM DTT。在37℃振荡孵育样本2小时，从而使蛋白变性并还原二硫键。还原后，加入1M碘乙酸盐至终浓度为50mM，反应在25℃避光孵育30分钟。这个步骤使还原的半胱氨酸残基烷基化，由此抑制二硫键的重新形成。然后利用microcon装置将样本置换到含1mM CaCl2的50mMTris(pH8.5)中。利用蛋白质组级的胰蛋白酶(Promega)以酶(胰蛋白酶)和底物(上清)为1∶50的比例将变性、还原并烷基化的样本消化成肽片段。通常的消化反应为约150μl总体积。消化反应在37℃孵育过夜，通过加入99％的甲酸至终浓度为～1％使反应终止，并在UMCP大学生命科学CORE质谱实验室通过RPHPLC-MS/MS进行分析。
将肽片段上样至装配12cm微孔柱(包含作为吸附剂的C18)的Waters2960HPLC中，并用浓度线性梯度增加的乙腈(CH3CN)洗脱至电喷雾离子化设备中。电喷雾设备将肽离子化并注入到Finnagin LCQ串联质谱仪中。自动操作软件控制溶剂梯度并持续扫描所洗脱的肽。程序鉴定了检测扫描中含量最大的三种离子，在质谱离子阱中将其分离，并通过用氦分子诱导碰撞将其片段化。记录所产生的亚片段质谱，以利用肽分析软件包(例如SEQUEST和MASCOT)进行进一步的分析。完成三个亚扫描和碰撞循环后，将MS再次进行检测扫描，重复循环直至运行结束(通常约3小时)。通过分析软件利用原始MS读数产生肽片段序列，将此序列与2-40基因组草图中所有基因模型的氨基酸翻译序列进行比较。利用每个软件特定的可接受的统计学显著性阈值来评价肽鉴别匹配度。
2-40蛋白在大肠杆菌中的克隆和表达
基本克隆表达系统利用pETBlue2(Novagen)为载体，大肠杆菌DH5α(Invitrogen)为克隆菌株，大肠杆菌BL-21(DE3)细胞(Novagen)为蛋白表达菌株。因为该载体在T7lac启动子的控制下进行表达，而T7lac启动子在克隆菌株DH5α中缺乏，并由此可以在质粒筛选和传代过程中消除表达(乃至消除低水平的表达)，所以该系统可以克隆毒性或其它困难基因。蓝/白斑筛选后，纯化DH5α的质粒并将其转化到表达宿主(Tuners)中。Tuner菌株具有T7lac启动子，可以在IPTG诱导下表达载体编码的蛋白，并缺乏Lon和Omp蛋白酶。
从DOE JGI的Microbulbifer degradans基因组网站服务器获取基因模型的核苷酸序列，并将其输入到Integrated DNA Technologies网页(http://biotools.idtdna.com/Primerquest/)上提供的PrimerQuestTM设计工具。引物设计参数为：最佳Tm为60℃、最佳引物长度为20nt、最佳GC％为50％，选择产物的长度范围，以致在每个ORF的最初和最后100个核苷酸内选择引物，从而克隆理论上尽可能大的基因片段。克隆和表达载体pETBlue2在C末端提供融合的6×组氨酸，并提供蛋白表达的起始密码和终止密码。因此，在PCR引物上加入5’限制性位点时，需要格外关注载体的表达框和插入序列。所形成的“加尾引物”(tailed primer)的长度在26nt至30nt之间，并利用PDRAW软件包(http://www.acaclone.com)通过“虚拟克隆”分析验证其序列。该程序允许使用标准的限制性酶切割载体和插入DNA序列，并将其连接在一起。检验所产生序列的氨基酸翻译以检测由于引物设计中的错误造成的任何编码框移位。验证后，从Invitrogen(Frederick，MD)购买引物。
PCR反应的50μl反应体系中包含10pMol正向引物和反向引物，1μl10mM DNTPs，1.5μl 100mM MgCl2和1μlPfu聚合酶，以及作为模板的0.5μl 2-40基因组DNA。PCR条件使用了加尾引物和Pfu DNA聚合酶的标准参数。用QIAGEN QIAquick PCR Cleanup试剂盒纯化PCR产物，并在0.8％琼脂糖凝胶中观察。纯化和验证大小后，用适当的限制性酶消化PCR产物和pETBlue2，通常使用AscI和CIaI在37℃处理1-4小时，用QIAquick试剂盒纯化并在琼脂糖凝胶中观察。利用T4DNA连接酶将纯化的消化物在室温下避光连接至少2小时。然后通过电穿孔将连接物转化到大肠杆菌DH5α中。转化子在37℃非选择性培养基中孵育1小时，然后铺到含氨苄青霉素和X-gal的LB琼脂上。由于pETBlue2携带Ampr基因且插入物被克隆到lacZ ORF内，所以白色克隆含有插入序列。用牙签挑取白色克隆并在新的LB/Amp/X-gal平板上划线培养，所划线的克隆中有3个还用来接种至3ml过夜肉汤中。从肉汤中提取质粒，其与过夜生长后仍保持白色的划线克隆对应。然后用适当的限制性酶单独消化这些质粒制备物，通过琼脂糖电泳观察来验证大小。
然后将质粒通过热激转化到染色体上携带链霉素抗性基因(Cmr)的菌株中。转化子在非选择性挽救培养基中37℃孵育1小时，铺在含Amp和Cm的LB琼脂(Tuner培养基)上，37℃孵育过夜。由此选取的任何克隆都应含有载体和插入物。通过将3个克隆划线至Tuner培养基平板上并接种到相应的3ml过夜肉汤中对此进行确认。次日早晨将肉汤接种到25ml肉汤中，培养至OD600约为0.6(2-3小时)。此时从培养物中移出1ml样本，离心并重悬在1/10体积的1X SDS-PAGE处理缓冲液中。该诱导前样本在-20℃冷冻用于以后的蛋白印迹。然后在剩余样本中加入1mM IPTG并在37℃孵育4小时。每隔一小时收集诱导的样本团块。将这些样本和诱导前对照在标准SDS-PAGE凝胶中进行电泳，并电转印至PVDF膜上。然后按照蛋白印迹方法，利用1/5000稀释的小鼠α-单克隆一抗处理膜，接着用偶联HRP的山羊α-小鼠IgG二抗处理。利用BioRad的Opti-4CN底物试剂盒使条带在色度上可视。在诱导样本中存在His标记的条带，但在未诱导对照中没有该条带，这证明表达成功，利用各小时时间点条带的比较优化在后期更大量的纯化中的诱导参数。
重组蛋白的产生和纯化
表达菌株在500ml或1L tuner培养基肉汤中培养至OD600为0.6或0.8。此时收集未诱导的样本，通过加入100mM IPTG(终浓度为1mM)诱导剩余培养物。诱导在37℃进行4小时或者在25℃进行16小时。收集培养物团块并在-20℃冷冻过夜以用于贮存并有助于裂解细胞。然后将团块在冰上解冻10分钟，转移到预称重的falcon试管中并称重。然后以每克湿重团块使用4ml裂解缓冲液(8M尿素、100mM NaH2PO4、25mM Tris，pH 8.0)的方式在25℃摇动细胞1小时。裂解物以15,000g离心30分钟形成细胞碎片团块。将经净化的裂解物(上清)转移到干净的falcon试管中，每4ml净化裂解物加入1mlQIAGEN 50％镍-NTA树脂。将混合物在室温下轻柔摇动1小时，以促进树脂上的Ni+2离子和重组蛋白His标签的结合。结合后，将匀浆上样至一次性mini柱上，收集流过液(废裂解液)并保存用于后续评价。用pH调整为7.0的裂解缓冲液洗涤树脂两次，每次洗涤的裂解缓冲液体积与最初的净化裂解物的体积相同。保留两次洗涤的流过液用于后续的蛋白印迹分析，以评价纯化的效率。
此时柱子含有相对较纯的重组蛋白，该蛋白被其C末端的His标签固定。这是理想的重折叠条件，所以将柱子移到4℃的房间，使尿素浓度降低的一系列复性缓冲液流过柱子。所述复性缓冲液中含有溶于25mM Tris(含500mM NaCl和20％甘油，pH 7.4)的不同量尿素。将该缓冲液制备成含6M、4M、2M和1M尿素的储备液。可以很简便地通过混合这些储备液的等份试样以得到5M和3M尿素浓度，从而产生梯度为1M的一系列递减的尿素浓度。使1体积(最初裂解物的体积)的6M缓冲液流过柱子，然后是1体积5M缓冲液，一直延续至1M缓冲液，重复1次1M缓冲液以保证柱子在1M尿素下的平衡。此时利用含有250mM咪唑的25mM Tris(含1M尿素、500mMNaCl、20％甘油，pH 7.4)溶液将重折叠的蛋白洗脱到8个1/10初体积的部分中。用咪唑破坏镍离子-His标签间的相互作用，从而将蛋白从柱子上释放下来。
使用蛋白印记评价废裂解液、两份洗液和洗脱液(eluted fraction)中带His标签的蛋白的量。如果在废裂解液和/或洗液中具有大量重组蛋白，可以重复该过程并“回收”更多蛋白。收集含有感兴趣蛋白的洗脱液，然后浓缩并利用centricon离心超滤设备(Millipore)置换到贮存缓冲液(含10mM NaCl、10％甘油的20mM Tris溶液，pH为7.4)中。然后将酶制备物等分并冷藏在-80℃，用于活性试验。
在本发明的多种实施方案中，本发明的纤维素降解酶、相关蛋白和含有它们的系统，例如包括一种或多种酶或纤维素结合蛋白，具有多种用途。本发明纤维素酶的一些可能用途与M.K.Bhat的文章“Cellulases and relatedenzymes in biotechnology”(Biotechnical Advances 18(2000)355-383)中阐述的其它纤维素酶相同，该文章通过引用整体并入本文。例如，本发明的纤维素酶及其系统可用于食品、啤酒、葡萄酒、动物饲料、纺织品生产和洗涤、制浆和造纸工业，以及农业中。
在一个实施方案中，这些系统可以用于降解纤维素从而产生可用于医药的短链肽。
在其它实施方案中，使用这些系统降解纤维素，用于提取和/或净化水果和蔬菜汁，生产和保藏果茶和果酱，改变食物结构、风味和其它感知特征，提取橄榄油，提高烘焙产品的质量，酿造啤酒和制备葡萄酒，制备单胃和反刍动物饲料，用于纺织和洗涤技术(包括使斜纹布(denim)材料“褪色”)，溶解性纤维(lyocell)的去纤维化，洗涤衣物等，生产纸和纸浆产品，以及用于农业应用中。
在本发明的一些实施方案中，可以使用纤维素吸收环境污染物和废液。然后，可以通过本发明的纤维素酶系统降解纤维素。可以将能够代谢环境污染物并能够降解纤维素的细菌用在降解毒性物质的生物反应器中。此类生物反应器的优势在于不需要添加其它营养物来维持细菌(细菌将利用纤维素作为碳源)。
在本发明的一些实施方案中，纤维素降解系统可以以干燥形式存在，存在于缓冲液中，或以糊剂、涂料、胶束(micelles)的形式存在。纤维素降解系统还可以包含其它成分，例如金属离子、螯合剂、去污剂、有机离子、无机离子或一种或多种其他蛋白，例如生物素和白蛋白。
在本发明的一些实施方案中，本发明的纤维素降解系统可以直接用于纤维素材料。例如，包含图4-11列出的一种、多种或所有化合物的系统可直接用于植物或其他含纤维素的物品中，由此利用所述系统降解该植物或其他含纤维素的物品。又例如，2-40可以生长在植物或其它含纤维素的物品上，使2-40产生图4-11列出的化合物，从而在2-40生长时降解含有纤维素的物品。利用本发明2-40或系统的优势是，含纤维素植物或物品的降解可以在海洋环境(例如在水下)中进行。
本发明的一个方面是提供与图4-11列出的化合物的任意序列具有100％、99％、98％、97％、96％、95％、90％、85％、80％或75％的同源性。
本发明还包括用非天然或非标准核苷酸例如硫代磷酸酯、脱氧肌苷、脱氧尿嘧啶、异胞嘧啶、异鸟嘌呤、含2-O-甲基的核酸取代图4-11列出的化合物的任意序列的1-20个核苷酸，也包括用例如烷基链、芳基基团和蛋白核酸(PNA)取代磷酸二酯骨架。
另一个方面，本发明一些实施方案提供了在1×SSC、2×SSC、3×SSC1、4×SSC、5×SSC、6×SSC、7×SSC、8×SSC、9×SSC或10×SSC严谨条件下与图4-11列出的化合物的任一序列杂交的核苷酸序列。
本发明的范围包括图4-11列出的化合物的任一序列的天然和非天然等位序列。在本发明的一些实施方案中，图4-11列出的化合物的任一序列的天然和非天然等位序列可以包含用具有类似的电荷、形状、大小或定位的氨基酸取代1、2、3、4或5个天然存在的氨基酸(保守取代)。本发明还包括非天然或非标准氨基酸，例如硒代半胱氨酸、吡咯赖氨酸、4-羟基脯氨酸、5-羟基赖氨酸、磷酸丝氨酸、磷酸酪氨酸和20种标准氨基酸的D-异构体。
本发明的一些实施方案涉及由木质纤维材料生产乙醇的方法，其包括，用糖化有效量的图4-11列出的一种或多种化合物(优选图4列出的纤维素酶cel5A)处理木质纤维材料以获得糖，以及转化所述糖从而产生乙醇。所述处理可以在海洋环境中(例如水下)进行。图4-11列出的一种或多种化合物可以以干燥形式存在，存在于缓冲液中，或以糊剂、涂料或胶束形式存在。
糖向乙醇的转化和回收可以通过但不限于本领域技术人员已知的任何成熟方法实现。例如，通过使用产乙醇微生物，例如发酵单孢菌、欧文氏菌、克雷伯氏杆菌、黄单胞菌和埃希氏菌，优选大肠杆菌K011和产酸克雷伯氏菌P2。
在本发明的一些方面，用糖化有效量的图4-11列出的所有化合物处理木质纤维材料。
在本发明的一些方面，图4-11列出的一种或多种化合物来自Microbulbifer degradans 2-40。
在本发明的一些方面，图4-11列出的一种或多种化合物存在于主要由图4-11列出的一种或多种化合物组成的系统中，或存在于进一步含有金属离子、螯合剂、去污剂、有机离子、无机离子或一种或多种其他蛋白(例如生物素和/或白蛋白)的系统中。
本发明的一些实施方案涉及通过以下方法生产的乙醇：使用糖化有效量的图4-11列出的一种或多种化合物处理木质纤维材料从而获得糖，转化糖以产生乙醇。糖向乙醇的转化和回收可以通过但不限于本领域技术人员已知的任何成熟方法实现。例如，通过使用产乙醇微生物，例如发酵单孢菌(Zymomonas)、欧文氏菌(Erwinia)、克雷伯氏杆菌(Klebsiella)、黄单胞菌(Xanthomonas)和埃希氏菌(Escherichia)，优选大肠杆菌K011(Escherichia coliK001)和产酸克雷伯氏菌P2(Klebsiella oxytoca P2)。
本发明的其他实施方案涉及由木质纤维材料生产乙醇的方法，其包括，使木质纤维材料与表达糖化有效量的一种或多种图4-11列出的化合物(优选图4中列出的纤维素酶cel5A)的微生物接触，以获得糖；以及转化所述糖从而产生乙醇。所述接触可以在海洋环境中进行，例如在水下进行。微生物可以是Microbulbifer degradans2-40或含嵌合基因的重组微生物，其中所述嵌合基因包含编码含图4-11列出的至少一种化合物的氨基酸序列的多肽的至少一种多核苷酸；其中所述基因可操作地与允许微生物表达所述氨基酸序列的调控序列连接。重组微生物可以是细菌或酵母，例如大肠杆菌。在本发明的一些方面，重组微生物是产乙醇微生物，例如来自发酵单孢菌、欧文氏菌、克雷伯氏杆菌、黄单胞菌或埃希氏菌的微生物，优选大肠杆菌K011或产酸克雷伯氏菌P2。
本发明的一些方面涉及使表达糖化有效量的图4-11列出的一种或多种化合物的微生物与木质纤维材料接触以获得糖，以及转化所述糖从而产生乙醇。
本发明的一些方面涉及由木质纤维材料生产乙醇的方法，其包括，使木质纤维材料与表达糖化有效量的图4-11列出的一种或多种化合物的产乙醇微生物接触以产生乙醇。产乙醇微生物表达有效量的图4-11列出的一种或多种化合物以糖化木质纤维材料，并表达有效量的一种或多种酶或酶系统进而催化(单独或协同催化)糖(例如木糖和/或葡萄糖的糖)向乙醇的转化。产乙醇生物体的一种或多种酶或酶系统可以天然表达或通过但不限于本领域技术人员已知的任何方法表达。例如，可以通过使用超声获得一种或多种酶或酶系统的释放。在本发明的一些方面，转化产乙醇微生物，从而使其能够表达图4-11列出的一种或多种化合物。在本发明的一些方面，产乙醇微生物来自发酵单孢菌、欧文氏菌、克雷伯氏杆菌、黄单胞菌或埃希氏菌，优选大肠杆菌K011或产酸克雷伯氏菌P2。
本发明的另外一些实施方案涉及木质纤维材料图4-11列出的一种或多种化合物在由木质纤维材料产生乙醇中的应用。其它实施方案涉及表达糖化有效量的图4-11列出的一种或多种化合物的微生物或产乙醇微生物在由木质纤维材料生产乙醇中的应用。
可以理解，虽然以上已经利用具体实施方案阐述了本发明，但是说明书和实施例是为了举例说明本发明的结构性和功能性原理，而不是为了限制本发明的范围。相反，本发明意在涵盖所附权利要求书范围和精神内的所有修饰、改变和取代。
引用文献
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图4-10中化合物的氨基酸序列和相应的核苷酸序列的序列表(以出现顺序分别命名为SEQ ID NOs 1-214)
LOCUS(位置) NZ_AABI02000010 3504bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION(定义)Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_14，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION(登录号) NZ_AABI02000010 REGION(区域)：24249..27752
VERSION(版本) NZ_AABI02000010.1 GI：28878292
KEYWORDS(关键词)WGS.
SOURCE(来源)Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM(生物体)Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(参照1)(碱基1-3504)
AUTHORS(作者)NCBI微生物基因组注解计划
TITLE(标题)直接提交
JOURNAL(期刊)2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology Information，NIH，
Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT(评注)2003年3月7日该序列取代gi：23028613。
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇(Clusters of Orthologous
Groups))命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES(特征) 位置/限定词
source(来源) 1..3504
/organism(生物体)＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type(分子类型)＝″基因组DNA″
/strain(菌株)＝″2-40″
/db_xref(相互参照数据库)＝″类名:203122″
Gene(基因) 1..3504
/gene(基因)＝″Mdeg2412″
CDS 1..3504
/gene(基因)＝″Mdeg2412″
/codon_start(起始密码)＝1
/transl_table(翻译密码表)＝11
/product(产物)＝″COG2730:内切葡聚糖酶″
/protein_id(蛋白ID)＝″ZP_00067013.1″
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QTSGNQILVGNQAKALGGHSLFWHNVPAAGSLYNADTVSRLKNDWNSKVIRAAIGVEV
PFNSENTYIGNKGSSLAAIDRVVNAAVANDMYVIIDFHTHHADQVENVAHDFFNEVSS
RYGHLNNVIYEVFNEPEWCGEHGRWASTIKPYAERVIQTIRNNDPDNLVIVGTTCFSQ
DVDVAAADPINDVNVAYTLHFYAATPAHQQPLRDKAQTALDRGAPLFVTEWGTTTFTG
DGFVDEAQTRTWINWLNERGISHVNWSASTQPESSAIWNGDMTYKHSGLLVGELVQQT
NGTTTPPTGEISGPCDLHFVPAKAEAESFCTAKGIQFETTTDTGGGQNMGWLDAGDWV
TFDVDVPASGQYLIDYRVASELGDGRERTEAANGTALGTISVPNTGGWQNWQTHTHTV
QLSQGTQTVKLVAETGGWNLNWFEVRAGEVCEGADCPCEGAECPCPDCNGTPVKFEAE
TFVAMQGVQLENTSDVGGGQNVGYIDSGDWITYNGALPASADNRYVVSYRVARQPSGN
AKFKIEQPGGAAVYGEISVPSTGGWQTWTTISHTITIPANANGFALAAIDGGWNINWI
EIKPATTQPPEPINPLKLQAEDYINFNDTTPGNEGGAHRSDDVDIQATTDTGGGFNVG
WVDAGEWLEYEFFLESPDFYAADVRVASDQTGGALQLQIDGQNVGQAITVGNTGGWQA
WTTKNTLIGDLSAGTHTLRVYAQSGPLNLNWVELKRTTPAPATSCFNIAEDRLNVHLD
AHCTAGSNLQYNWDFGDGNSATGVATSHSYYTSGTYTITLTVSDTRTTDTSSQQVTVD
FSAPAGPVDFYGELMVNGNRIHGEKTGEPAQVRGMSFFWSNTGWGQEKWWNASTVDRM
VDEFKVELVRGAMGTDEGGGYLHDASNKARLQAVVEQAIARNVYVIIDWHTHHAEDNI
AEAITFFSEMAQLYGHHDNVIFEIYNEPLNTTSWGTIKHYAEQVIPAIRAHSDNLIVV
GTRTWSQNVDEAAFDKINDSNTAYALHFYVGSHGNHVRNLAQTALNNGAAIFASEWGI
WPNNNYDGMNADDWMNFLDQNKISWANWAISDKVDPNTGQLEPPSMFNPDGSLSSNGQ
YVVNKLNEYAAQAPWREAIAN″
ORIGIN(原序列)
1 atgacaatta aacgttggcc gttcgaccga aaaggcccac ctaaaaaacc taacgctaaa
61 aaattactcg caagcttagc ggctgcacta agcttaaccg ccatgcaaag cactgcagcg
121 gtagagccat tacaaaccag cggcaatcaa attcttgttg gcaaccaagc caaagccctt
181 ggcggccaca gcttgttttg gcataacgtg ccggcagcag gcagcttata caatgcagat
241 acagtaagca ggcttaagaa tgattggaac tccaaggtta ttcgggccgc aattggggtt
301 gaagtacctt tcaattcaga aaacacctac ataggcaata agggcagctc gctggccgca
361 atagaccgcg tagttaatgc cgctgttgcc aacgatatgt atgtgattat cgattttcat
421 actcaccatg cagatcaagt agaaaacgtt gcccacgact ttttcaacga agtttctagc
481 cgttacggtc atttaaacaa tgttatttat gaagtattta acgagccaga atggtgtggc
541 gagcacggtc ggtgggcatc taccattaag ccctacgccg agcgcgttat ccaaaccatt
601 cgcaacaatg acccagacaa cctagtaata gtaggcacta cctgtttctc gcaagatgta
661 gatgtagccg cagccgaccc cattaacgat gtaaacgtgg cctatacgct acacttttac
721 gcagccaccc ctgcccacca gcaacccttg cgcgacaagg cccaaaccgc gctcgaccgc
781 ggcgcgccac tatttgtaac cgaatggggt acaaccacat ttacaggtga tggttttgta
841 gatgaggcgc aaacgcgcac atggattaac tggttaaacg aacgcggtat tagccacgtt
901 aactggtcgg cgtctaccca gccagaaagc tcagctatat ggaatggcga catgacctac
961 aagcattcgg gcttattggt tggcgaactg gtgcaacaaa caaatggcac aaccacgcca
1021 ccaaccggtg aaataagtgg cccgtgcgat ttacattttg tacctgccaa agccgaggct
1081 gaaagcttct gtaccgccaa aggcattcaa tttgaaacca ccaccgacac gggcggcggc
1141 caaaacatgg gctggctaga tgccggcgac tgggtaactt ttgatgtaga tgtacctgct
1201 agcggccaat atttaataga ttaccgcgta gcatcagagc taggtgatgg tcggttccgc
1261 accgaagccg ccaacggcac tgcccttggc acaatatctg tacccaatac cggcggctgg
1321 cagaattggc aaacgcacac acacacagtg caactctcgc aaggcacaca aaccgttaaa
1381 ctagttgccg aaactggtgg ctggaactta aattggtttg aagtgcgcgc aggtgaggtg
1441 tgcgaaggcg ctgactgccc atgtgaagga gccgaatgcc cttgcccaga ttgcaacggc
1501 acaccggtta agtttgaggc agaaacgttt gtggctatgc aaggcgtgca gctagaaaac
1561 acatccgatg tgggcggcgg ccaaaacgtt ggctacattg atagcggcga ctggataact
1621 tacaacgggg ccttgcccgc aagtgcagac aaccgctatg tagtgtctta tagagtagcg
1681 cgtcaaccta gcggcaatgc caaatttaaa atagaacagc caggtggagc agcggtatat
1741 ggcgaaattt cggtgcccag caccggcggc tggcaaacat ggacaaccat tagccacacc
1801 ataacaattc ccgctaacgc aaacggcttt gcactagcag caatagatgg cggttggaat
1861 ataaactgga tagaaataaa accggcgacc actcaaccac ccgagccaat caacccgtta
1921 aaacttcaag ctgaagatta catcaacttt aacgacacca cccccggtaa cgaaggcggt
1981 gcacacagaa gcgatgatgt agatattcaa gcaactaccg ataccggtgg cggttttaat
2041 gttggctggg tagacgctgg cgaatggcta gagtatgagt tctttttaga gtctcctgat
2101 ttttatgcag ctgatgtacg ggttgcttca gaccaaactg gcggcgcact gcaactacaa
2161 atagatggcc aaaacgttgg ccaagccatt accgttggca acaccggtgg ctggcaagcg
2221 tggacaacca aaaacacact cattggcgac ctaagtgcag gcacccacac gttgcgtgta
2281 tacgcgcaaa gcggcccatt aaatttaaac tgggtagagc taaagcgtac aacgcccgca
2341 ccagccactt cgtgttttaa tattgccgaa gaccgcttaa acgttcacct agatgcgcac
2401 tgtactgcag gcagcaacct gcaatacaat tgggattttg gtgacggcaa cagcgcaacc
2461 ggcgtagcca ctagccacag ctactacact agcggcactt acaccattac cttaaccgtt
2521 agtgataccc gcaccacaga cacctctagc caacaggtaa cggtagattt ttctgcccct
2581 gcaggccctg tggattttta cggcgaacta atggtgaatg gcaaccgcat tcacggcgaa
2641 aaaaccggcg aacccgcaca agtacgcggc atgagctttt tttggagcaa caccggttgg
2701 ggccaagaaa aatggtggaa cgccagcacc gtggaccgca tggttgatga gttcaaagta
2761 gaacttgtgc gcggcgcaat gggcactgat gaaggcggcg gttatttaca cgacgcgtct
2821 aataaggctc gcttacaagc agttgttgaa caagccattg cacgcaatgt gtatgtaatt
2881 atcgactggc acacccacca tgccgaagat aacattgccg aagccattac attctttagc
2941 gaaatggcgc agctttatgg ccaccacgac aacgtgattt tcgagattta caacgagcca
3001 ttaaacacca caagctgggg cactattaag cactacgctg aacaagttat tcctgctatt
3061 cgcgctcatt ccgataattt aattgttgtg ggcacgcgca cctggtcgca aaacgtagac
3121 gaagccgcgt tcgataaaat taacgacagc aacaccgcct acgccctgca cttttatgtt
3181 ggctcgcacg gcaaccacgt tcgcaaccta gcacaaaccg cactaaacaa cggcgcggct
3241 atttttgcta gcgaatgggg aatttggcca aacaacaact acgatggcat gaacgccgac
3301 gattggatga actttttaga ccaaaacaaa atatcttggg ctaactgggc catatccgac
3361 aaagtagacc ccaacacagg ccaactagaa ccacccagca tgttcaaccc agacggcagc
3421 ctaagcagta atggtcaata tgtagtgaac aaactaaatg aatacgcagc acaagcaccg
3481 tggagggagg caatcgctaa ttga
LOCUS NZ_AABI02000001 1701bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：互补链(complement)(279610..281310)
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(1-1701)
AUTHORS NCBI＝
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1701
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xre＝″类名:203122″
gene 互补链(1..＞341)
/gene＝″Mdeg0215″
CDS 互补链(1..＞341)
/gene＝″Mdeg0215″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00064854.1″
/db_xref＝″GI:23026368″
/translation＝″MVVSLADNSAGAISCWHAKASPPEELEELLDEELELDELELEEE
LEELVEELLEELLDELLLDELEDEPLAAPPSLPPPQAVSPAKQLISSADFKKVSFRVQ
LNAVRVKSKRNINHSRIFLFWLFSHFRSRRC″
gene 1..1701
/gene＝″Mdeg0214″
CDS 1..1701
/gene＝″Mdeg0214″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG2730:内切葡聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00064853.1″
/db_xref＝″GI:23026367″
/db_xref＝″COG:COG2730″
/translation＝″MFLLDFTRTAFSCTRKLTFLKSALLISCFAGLTACGGGSDGGAA
SGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSNSSSSSSGGDALACQHEM
APALLSASDTTMVQAEYYDTCASSALDNTTGNSGGELRTDDVDIVAIADGYAITDMQS
GEYVEYSLTVQTSGLFDISFAVQPHAANTAGLALSVDGAVLGTVDIAANDSTAFGEYT
LNGVYISDGAQVIRVTMAGEGAAIGLDSIAFNYTDNTVYTPENAVLGMGIGINLGNTL
DAFPNEGDWAPAAQEYYFKAYKDAGFRHVRIPATWDDHTADTAPYAVNAARMDRTEQI
VDWALAQGYFVILNAHHEHWLKENYGNQTYRDRFDAIWQQIAERFKNKSARLMFEILN
EPNGMTVADVDDLNPRILDIIRETNPTRLVVFSGNGYTPVDALLAAAIPNDDYLIGNF
HSYDPWQFGGQCVRSWGTEQDYTDLENIYKRANTWSEQHDIPVMVNEFGAAHYDFTAP
QNVCNQQARLAYLGAHATFAIQYGFGASVWDDGGSFEVYKRGENSWREAKDVLVAPNP
″
ORIGIN
1 atgtttcttt tagactttac ccgcactgcg tttagctgta cacgaaagct tacctttttg
61 aaatccgcgc tacttataag ctgctttgcc gggcttactg cctgtggtgg cgggagtgat
121 ggcggtgctg caagtggctc atcctctagc tcgtctagca gcagttcgtc tagtagctct
181 tcgagcagtt cttcaactag ttcctcaagc tcctcttcaa gctctagttc gtccagttcc
241 agctcttcgt ctaatagttc ctctagctcc tctggtggcg atgctttagc gtgccagcat
301 gaaatggcac cagcgctatt atctgcaagt gatactacca tggtgcaagc ggagtattac
361 gatacctgtg cttcttcggc attagataac accactggta acagtggcgg tgagttgcga
421 actgacgatg tagatatagt ggccattgcg gacggctatg ctattacgga tatgcagtca
481 ggcgagtacg tagaatattc actaacagtg caaacttccg gtttgtttga cattagtttt
541 gcggtacagc cgcacgcagc taatactgcc ggtttggcgc tgagtgtaga tggcgcagtg
601 ttaggcacag ttgatattgc cgctaatgac agcaccgcat ttggcgaata tacgcttaac
661 ggcgtgtaca taagcgatgg cgcgcaagta ataagggtaa ccatggccgg cgaaggcgct
721 gctattgggt tagattccat tgcctttaat tacaccgata ataccgttta caccccagaa
781 aacgccgtgt tgggtatggg aataggtatt aacctaggca ataccttaga tgccttcccc
841 aacgaaggtg actgggcacc ggctgcgcag gaatactatt ttaaagccta caaggatgca
901 ggtttccgcc atgtacgcat cccagcaact tgggatgatc acacggctga tacagccccc
961 tacgctgtaa atgcagcacg tatggatcgc actgagcaga ttgtagattg ggccttggcg
1021 cagggctatt tcgtaattct taatgcccac cacgaacact ggctaaaaga aaactacggc
1081 aatcaaacat accgcgatcg ctttgatgca atttggcagc aaattgccga acgctttaag
1141 aataagtcgg ctcgcttaat gtttgagata ctcaatgagc caaacggcat gacagtggcc
1201 gatgtggatg acctcaaccc acgtattctc gatattattc gcgaaaccaa tcccacgcga
1261 ttggtagtgt tctctggtaa tgggtatacc cctgtggatg ccttacttgc ggctgcaatc
1321 cctaatgatg attaccttat tggtaacttt cactcctacg acccttggca gtttggcggt
1381 cagtgcgtac gatcgtgggg tacagagcaa gattacaccg acctagagaa catatataag
1441 cgcgcaaata cttggtctga gcagcacgac atacccgtta tggtgaacga atttggcgct
1501 gcccattacg attttactgc accgcagaat gtatgtaacc agcaggctcg tttggcttat
1561 ttaggtgccc atgccacatt tgctattcag tacggctttg gcgcaagtgt atgggacgac
1621 ggtggatcat ttgaggtgta caagcgcggt gaaaatagct ggcgcgaagc taaagatgta
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LOCUS NZ_AABI02000019 1356bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_19，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000019REGION：互补链(10740..12095)
VERSION NZ_AABI02000019.1 GI：28878283
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1356)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代 gi：23029085.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1356
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1356
/gene＝″Mdeg2867″
CDS 1..1356
/gene＝″Mdeg2867″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG2730:内切葡聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00067454.1″
/db_xref＝″GI:23029093″
/db_xref＝″COG:COG2730″
/translation＝″MRIITAFAVMLLCITGCSGSGASDSPQASNSSSGSSSSSSSSSS
SSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSGGEALYPSYNTNPPAPDMTGMTSTATQ
LADRITVGWNIGNTLEAIGGETNWGNPLVTNELIQAVKASGFDSIRIPAAWDQYANQE
TAAIDINWLNRVKQVVQYSIDNDMVVVLNIHWDGGWLERNVEPSEQVAVNAKQKAYWE
QIATHLRDFDERLIFASANEPHVETEAQMAVLNVYHQTFVDTVRATGGKNAYRVLVLQ
GPKTDIETTSLLWTQMPQDSAVNKLMAELHFYTPYNFTLMNVDESWGNQFYYWGEGNH
STTDTGRNPTWGEEATVDSLLAITKQQFVDQGIPVIIGEYGAQRRDNLTGDELALHLQ
SRNYYLKYVTQKCVELGLKPFYWDTGGLDNNQSGLFNRSTYQVFDQNALDAIMEGARG
E″
ORIGIN
1 atgagaataa taacggcgtt tgcagttatg ctgctatgca taacaggctg tagcggatcg
61 ggcgcgagtg atagcccgca agcatccaat tcgtcttcgg gcagttcttc tagctctagc
121 agttcgtcaa gttcgagcag ttcctctagt tcgtcgtcta gctcttcaac aagctctagc
181 agctcatcta gctccagctc atcatcaagc tctagcagtt cttcgggcgg cgaagcgctt
241 tacccaagct acaatacaaa cccgccagcg ccagatatga ccggcatgac aagtactgcc
301 acacaactag cagatcgtat aaccgtgggc tggaatattg gtaacacgct agaggcaata
361 ggcggcgaaa ccaactgggg taacccgctg gttactaacg aattaattca agcggtaaaa
421 gccagtggct ttgattccat tcgtataccc gccgcgtggg atcaatacgc caaccaagaa
481 acggccgcaa tagatataaa ctggctaaac cgcgttaaac aagttgtgca atacagcata
541 gataacgaca tggtggtagt gctaaacatc cactgggatg gcggttggct agagcgcaat
601 gtagagccca gcgagcaagt agcagtaaat gcaaaacaaa aagcctattg ggaacaaatt
661 gccactcacc tgcgcgactt tgacgagcgc ctaatatttg ccagcgccaa cgaaccccat
721 gtagaaaccg aagcacaaat ggccgtacta aacgtatacc atcaaacgtt tgtagataca
781 gtgcgtgcaa ctggcggtaa aaatgcttac cgcgtactgg tattgcaggg gccaaaaaca
841 gatatagaaa ccacctcgct attgtggacc caaatgccgc aagatagcgc cgtaaataaa
901 cttatggcag agctacactt ctataccccg tacaacttta cgttaatgaa tgtagatgaa
961 agctggggca accagttcta ctactggggc gaaggtaatc attccactac cgacacaggc
1021 cgcaacccaa cctggggcga agaagcaaca gtagattcac tgctggcaat taccaaacaa
1081 cagtttgtgg accaaggtat acccgtaatt attggcgaat acggtgcaca acgccgcgat
1141 aaccttaccg gcgatgaatt ggccctgcac ttacaatcgc gcaactacta cttaaaatac
1201 gttactcaaa aatgtgtaga gctaggctta aaaccttttt attgggatac cggcggctta
1261 gacaacaatc aatctggcct gtttaatcgc agtacctacc aagtatttga tcaaaatgcc
1321 ctagatgcca ttatggaagg ggccagaggg gaataa
LOCUS NZ_AABI02000001 1866bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：互补链(472006..473871)
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1866)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jggi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1866
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
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/gene＝″Mdeg0348″
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/gene＝″Mdeg0348″
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GFTGAMKVTNNDSSPITGWRVEWAYSGNVNIVNSWNASVTKGSNYVAVDAGWNGNLQP
SQSTEFGLQGDGADRNVTIISCVAEGGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSST
SSSSSSTSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSGGNCVAMCNWYGENRPVCANQNTGWGWENNQ
SCIGANTCNDQWGDGGVVSSCGTSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSSTSSTSSSSSSSSS
SGGLSAVEFSQQMGLGWNLGNSLEAIGGETAWGNPMVTQQLINSIKAAGFDTIRIPVA
WSQFSDEANFVINSNWIARVEEVVNYALSADMYVVMNQHWDGGWMQPTYAQQEYVNNR
LQIMWTQIANHFKDYDSRLLFAGTNEVMVEGDYGTPTFEYYTVQNSFNQTFVDAVRAT
GGANASRYLVVQGFNTNIDHTVNFAVVPTDPATNRLMMEVHYYDPYNFTLNTNSNITQ
WGVIATDPSVTETWANESYVDATFQKMKTNFVDQGIAVILGEYGVVSRANVAGHETYR
EYWNQYITQSAVDHGMVPIYWDNGYSGDGGMALFDRASGNQLYPNIINAIINAGN″
gene 互补链(264..521)
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CDS 互补链(264..521)
/gene＝″Mdeg0350″
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/product＝″假设蛋白″
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DPPSATQLIMVTFLSAPSPCKPNSVDWLGCKLPFHPASTAT″
ORIGIN
1 atgttgaaac atcaattcag caaagcgctg cgtgcgctag gctttggtgg ggctgtgttt
61 gcggcatcgc taatggctag ccaagcaagt gcccttgagt gtgagcattc aatcagtaat
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241 gcctcagtaa caaaaggcag taattatgtt gccgtagatg ccggatggaa tggtaattta
301 cagccgagcc aatctaccga atttggctta cagggtgatg gcgccgatag aaatgtaacc
361 attattagtt gtgttgccga aggcggatca tcttctagtt catcaagttc ttccagctcc
421 tcaagtagtt cttcatctag ctcaagtact tcttcatcga gtagctcaag ttcctcgacg
481 agctcttctt ctagttcgac ttctagctct tcttcaagca cctcttctag ctcatcgtcc
541 agttcatcaa gctcttcttc gggcggcaac tgtgttgcaa tgtgtaattg gtacggtgaa
601 aaccgccctg tttgtgccaa tcaaaatact ggttgggggt gggaaaacaa ccaaagctgt
661 ataggtgcaa acacctgtaa cgatcaatgg ggcgacgggg gcgtggtgtc cagctgtggt
721 acgtctagct cttcatccag ttcttcgtcc agttcgtcta ccagttcatc ctcgtcttct
781 agctcgagca ccagctctac aagcagctca tcaagctcta gttcgtcgtc tggtgggtta
841 agcgcggtag agttttcgca gcaaatgggc ttggggtgga atcttggaaa ctccctagaa
901 gcgattggtg gcgaaaccgc gtggggcaac ccaatggtta cgcagcaatt aattaactcc
961 ataaaagctg ctgggttcga cactattcgc attccggttg cgtggagcca attctcggac
1021 gaagctaatt ttgttatcaa tagcaattgg attgcacgcg tagaagaagt agtgaactac
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1861 aactaa
LOCUS NZ_AABI02000006 2022bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_6，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000006 REGION：82200..84221
VERSION NZ_AABI02000006.1 GI：28878296
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2022)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027577.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2022
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
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CDS 1..2022
/gene＝″Mdeg1459″
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SSSSFAQSACDTQRIEAENYVAMSGIQTESTADTGGGLNVGWIDAGDWLSYQVNLPAA
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IGIGVPSGGFNINWLEFVPLDCSGPIDPPINPPSNCASIVFEAENYDQMSGIRTQTTS
DTGGGLNVGWIDAGDWLSYATVNIPSTQVYNFEYRVASPNGGSFNLQGSAGAENFDTA
TLPNTGGWQNWTTVTGSALLPAGNVNFGISAITGGWNINWFKATPESCDDINPPSTGI
TAKQAAAAMGKGFNLGQMFESTQHPRTFNAAKSKIDAYYNMGYRNVRIPITWTEAVGG
NRLVADANVGAVNRNHSRLAVITQVVDYALSLPGMYVVINAHHEGGLKTNNRWWVLET
LWADIADIFKDRDHRLLFEILNEPHLSDANKSPMPPANLRFMTGKAYNKIRAIDAQRI
VIIGGNQWFGAGEMANVWPNLNDVGGGSDAYVMATFHHYDPWSFSGDNQGDYADAWTL
SNVGNPMDIMQSWANGVGQGMPVYIGEWGVGWGSRYSAMQCNNIRYWYQLFDASYASA
KGQPTAVWDDGGWFKIFDHGTNSFNNNLAQCIGGNCAWDGADRFNSGCN″
ORIGIN
1 atgttgattg gtactgttac ggcttcagca ctggttggtc gaggccgtgg cacccctaaa
61 aaaataatca acaagggttc tattatgtgg caaatcaaca aatcggcttt agcggccgtg
121 gtattagtgt gttcctcatc tagctttgcg caatctgcat gtgacactca acgcattgaa
181 gccgaaaatt acgtggcaat gagtggtatt caaaccgaaa gcacggcaga cactggtggc
241 ggtttaaatg tgggctggat agacgccggc gactggctta gttaccaagt taacctacct
301 gctgcagggc agtacgaggt gcgctatcgc gttgccagta gaaatggcgg cggtgtactt
361 cggttagagg gcaatgccgg tcaaaccttg tatggaacta tgaatgtacc caacacgggt
421 ggctggcaaa attggcaaac cctttctcat tcagtgacat tagcggcagg agagcagtct
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541 gattgcagtg ggccaatcga cccgcccatt aacccacctt cgaactgcgc gagcattgta
601 ttcgaggccg aaaattacga tcaaatgagc ggcattagaa cgcaaaccac aagtgatacc
661 ggaggcggct taaatgtggg gtggatagat gctggcgact ggcttagcta tgccactgtg
721 aatatcccca gcacgcaggt gtacaatttt gaataccgtg tggctagccc taatggcggc
781 agttttaatt tgcagggttc ggctggcgca gagaattttg ataccgctac tttgcccaat
841 acgggtggtt ggcaaaattg gacaacggta acaggctcgg cgcttttacc tgctggcaat
901 gtgaatttcg gtattagtgc gattactggt ggctggaata taaactggtt taaagctaca
961 ccagagagct gtgatgatat aaaccctcca agtaccggta ttactgctaa gcaagcagcg
1021 gcagccatgg gcaaggggtt taatttgggg caaatgttcg aaagtacgca acacccaaga
1081 acatttaatg ctgcaaaaag taaaatagat gcttactaca atatgggcta cagaaatgtg
1141 cgcatcccta ttacttggac tgaagccgta ggcggaaaca ggcttgttgc agatgcaaat
1201 gtaggcgcag tcaatcgcaa ccactctcgc ttagctgtaa ttactcaagt agtagattac
1261 gcgctttcgc tacccggcat gtacgtggtt attaatgcgc atcacgaagg tggattaaaa
1321 accaataatc gctggtgggt gttagaaact ctgtgggcag atattgccga tatatttaaa
1381 gacagagatc accgtttgct atttgaaata ttaaacgagc cacacctaag cgatgccaat
1441 aagtcgccta tgccccccgc caatttgcgt tttatgacgg gcaaagccta taacaaaatt
1501 cgcgcgatag atgcgcagcg aatcgttatt attggtggca accagtggtt tggtgcaggt
1561 gaaatggcaa acgtatggcc aaaccttaat gatgttggcg gcggttccga tgcatatgta
1621 atggctactt ttcaccatta cgacccgtgg tcgtttagtg gcgataacca aggcgattac
1681 gccgatgctt ggacgctatc taacgtgggt aacccaatgg atataatgca aagctgggca
1741 aacggcgtag gccaaggtat gcctgtgtat attggcgagt ggggcgtagg ttggggcagc
1801 cgctacagcg ccatgcagtg caataatatt cgctattggt accagctgtt cgacgcgagc
1861 tatgcctcgg caaaaggcca gcctacggca gtgtgggatg acggcggttg gtttaaaata
1921 ttcgaccacg gtaccaacag cttcaataat aatttagccc aatgtattgg tggaaactgc
1981 gcttgggatg gcgccgatag atttaattct ggctgtaatt aa
LOCUS NZ_AABI02000011 1098bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_9，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000011 REGION：115594..116691
VERSION NZ_AABI02000011.1 GI：28878291
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1098)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028020.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1098
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1098
/gene＝″Mdeg1925″
CDS 1..1098
/gene＝″Mdeg1925″
/codon_start＝1
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/product＝″COG2730:内切葡聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00066536.1″
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/translation＝″MRTTKFLALALCLLASASALSANNSAPSNDWWDIPYPSQFDVKS
LKTQSFISVKGNKFIDDKGKTFTFRGVNIADTGKLLSQNQWQKSLFEELANNWGVNTI
RLPIHPVSWRKLGPDVYLGHIDEAVRWANDLGIYLILDWHSIGYLPTEQYQHPMYDTT
IKETRDFWRRITFRYKNVPTVAVYELFNEPTTMGNTLGERNWAEWKTLNESLIDMIYA
SDKTVIPLVAGFNWAYDLSPIKKAPIEREGIAYAAHPYPQKAKPEVKNDKNFFKLWDE
KWGFAADTYPVIATELGWVQPDGYGAHIPVKDDGSYGPRIVKYMQKKGVSYTVWVFDP
DWSPTMINDWDFTPSEQGAFFKQVMLEAKKR″
ORIGIN
1 atgcgcacaa ccaaatttct tgcgcttgca ctctgcttgc tggcctcagc cagtgcactg
61 agtgcaaata acagcgcccc atcaaacgac tggtgggata taccctaccc gagccaattc
121 gatgtaaaaa gccttaaaac gcaaagtttt atatcggtaa aaggtaacaa gttcattgat
181 gataagggca aaaccttcac ttttagaggg gtaaacattg ccgatacagg taagctactt
241 agccaaaatc aatggcaaaa atcgctgttt gaagagctgg ctaataactg gggggtaaat
301 actattcgcc tgcctattca ccctgtaagt tggcgtaaac ttgggccaga cgtttattta
361 ggccacatcg atgaggcggt acgctgggcg aatgatttag gtatttacct tattcttgat
421 tggcactcca ttggctattt gcccaccgag caataccaac accccatgta cgacaccacc
481 attaaagaaa cccgcgactt ttggcgcaga attacgttcc gctacaaaaa cgtgcccacc
541 gtagcggtat acgaattatt taatgagcca accaccatgg gtaacaccct aggcgaacgc
601 aactgggccg agtggaaaac cttaaatgaa agcctaattg atatgatata tgccagtgac
661 aaaaccgtca ttccgctggt tgcaggcttc aactgggcct atgatttatc gccaatcaaa
721 aaggcaccta tcgagcgtga aggcattgct tacgccgcac acccctaccc gcaaaaggcg
781 aaaccagagg ttaagaacga taaaaacttc ttcaaactgt gggacgaaaa gtggggcttt
841 gctgcagaca cctaccctgt aatagcaaca gagctaggct gggtacaacc cgatggttat
901 ggtgcccaca tacccgttaa agacgacggc agttacggcc cccgcatagt gaagtatatg
961 cagaaaaaag gcgtttctta cacggtatgg gtattcgacc ccgactggag cccaacaatg
1021 attaacgact gggattttac ccccagcgag caaggcgcgt tttttaaaca ggttatgcta
1081 gaagctaaaa aacgctaa
LOCUS NZ_AABI02000008 1917bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_7，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000008REGION：互补链(17943..19859)
VERSION NZ_AABI02000008.1 GI：28878294
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1917)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027735.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1917
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1917
/gene＝″Mdeg1560″
CDS 1..1917
/gene＝″Mdeg1560″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG2730:内切葡聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00066178.1″
/db_xref＝″GI:23027746″
/db_xref＝″COG:COG2730″
/translation＝″MTFTRMKSSHQGACRPRSSTLQRLIASSLTTACLLAASTFADVA
PLTVDGNRILSGGQEASFAGNSLFWSNNYWGGEKYYTAETVNWLKQDWGATLVRAAMG
VEDNGGYLDDKEGNKQKVKTVVDAAIANDMYVIIDWHSHHAEDHKSEAIAFFEDMART
YGNKKHVIYEIYNEPLQISWSNTIKPYAEDVIRAIRAIDPDNLIIVGTPTWSQDVDVA
SQDPITGYANIAYTLHFYAGTHKQSLRDKAQTALNNGIALFATEWGTVNANGDGAVNT
TETDKWMTFFKTNHISHANWALNDKSEGASALNPGASPNGNWSNADLTTSGKYVKNII
KNWNDGTPGGSSSSSSGGSTSSSSSSSSSNSSSGAGKVNLPARIEAENYNSAPVETTA
GNSGGSVSQCTYRGLNVDVQDASEGTCNIGWTAAGEKVTYNIGTANNTYNIALRTASL
DAGKRVSVYVGNTLADTISTQGGGWQNWKTQTIPNVYIPSNSVITVEFYDGRTNLNYL
NISAASGSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSGGGSCSSYIDIPWNTRTEVTLTSGACV
RFNQNLSGKTLQVWDSDANSSCDFRGTVTTVGGTGSLNVSSNYVSSKSLTGTKLTFNS
ASNNNCKYVKVRAY″
ORIGIN
1 atgactttca caagaatgaa atcatcacac caaggcgcgt gtcgaccaag gtcttccacc
61 ctacagcgac taatcgcctc atcacttacc accgcatgtt tgctagcagc gtctactttt
121 gccgacgtag cgccgttaac cgtagatggc aaccgcattc tcagcggtgg ccaagaggct
181 agctttgccg gtaacagttt gttttggagc aacaattatt ggggcggtga gaaatactac
241 acagccgaaa ctgttaactg gttaaaacaa gactggggcg caacactagt gcgcgcggcc
301 atgggtgtag aagataacgg cggctaccta gatgacaaag aaggcaacaa acaaaaggta
361 aaaaccgttg tagatgctgc tattgccaac gacatgtatg taattatcga ttggcacagc
421 caccacgccg aagaccacaa aagtgaagcc attgcttttt ttgaggatat ggcgcgcacc
481 tacggcaata aaaaacacgt tatttacgaa atttataacg agcctttaca aatttcgtgg
541 agcaacacaa ttaaacccta cgccgaagat gtaattagag ctattcgcgc gatagacccc
601 gacaacttaa ttattgttgg tacgccaacg tggtcgcaag atgtagacgt agcatcgcaa
661 gaccccatta ccggctacgc caatattgcc tacacattgc acttttacgc aggcacccac
721 aaacaatctt tacgagacaa agcgcaaacc gcacttaaca acggcatagc gcttttcgca
781 acagagtggg gaacagtaaa tgcaaacggt gatggcgctg taaacaccac cgaaacagac
841 aagtggatga cgttctttaa aaccaaccac ataagccacg caaactgggc gctaaacgac
901 aaatcagaag gcgcttctgc attaaacccc ggagccagcc ccaatggcaa ctggagcaac
961 gccgacttaa ccacatcggg taagtacgta aaaaacatta tcaaaaactg gaacgacggc
1021 acgccgggag gcagctcttc aagctcgtcc ggcggctcaa ccagttcctc ctcaagctca
1081 tctagctcta attccagctc tggtgctggc aaagtaaatt tacccgcacg cattgaagcc
1141 gaaaactata acagtgcacc ggtagaaaca actgcaggca atagtggcgg cagcgtttca
1201 caatgtacat acagagggct aaatgtagac gtacaagacg caagcgaagg cacttgtaat
1261 attggctgga cagcagcagg cgaaaaagtt acctacaaca taggcacagc aaataatact
1321 tacaatattg cacttcgcac cgcatcgctt gatgcaggca agcgcgtatc ggtatatgta
1381 ggcaacaccc tcgccgacac aataagcacc caaggtggcg gctggcaaaa ttggaagacg
1441 caaaccatcc ccaatgtata tattccatca aactcagtta ttaccgtgga attctacgat
1501 ggccgcacca accttaacta cttaaacatt agtgcagctt cggggtcttc ctcttcaagc
1561 tcctcatcta gctcgtcaac gtctagctct tcttcgagct catcttctag ctcttcaggt
1621 ggtggcagtt gtagcagcta tatagatata ccttggaata ctcgcaccga agttacccta
1681 acaagtggcg cctgcgttcg ctttaaccaa aacctttcgg gcaaaaccct acaagtgtgg
1741 gatagcgatg caaactcatc gtgcgatttc cggggcacag ttacaacagt aggcggcact
1801 ggcagtttaa atgtaagcag caactatgtt tcgtctaaga gcctaacagg aaccaaactt
1861 acatttaatt cagcaagtaa taacaattgt aagtacgtta aagttcgtgc ttattag
LOCUS NZ_AABI02000045 1893bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_45，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000045REGION：互补链(268..2160)
VERSION NZ_AABI02000045.1GI：28878257
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1893)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029974.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1893
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1893
/gene＝″Mdeg3677″
CDS 1..1893
/gene＝″Mdeg3677″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG2730:内切葡聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00068260.1″
/db_xref＝″GI:23029975″
/db_xref＝″COG:COG2730″
/translation＝″MKSATTNQSRARSSAFKNMLAASLAGLGLLSASAFADVAPLTVD
GNKILSGGQQASFAGNSLFWSNNGWGGEKYYTAGTVEWLKQDWGSNLVRAAMGVDENG
GYLEDPAGNKAKVTTVVDAAIANDMYVIIDWHSHHAEDYQNQAISFFQDMARTYGNNN
NVIYEIYNEPLQVSWSGTIKPYAEAVIGAIRAIDPDNLIIVGTPTWSQDVDVASRDPI
TQYSNIAYTIHFYAGTHKQSLRDKAQTALNNGIALFATEWGTVNANGDGGVDAAETDR
WMQFFKANHISHANWALNDKAEGSSALKPGSNANGGWSNSDLTASGTYVKNLIKTWND
GSPSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGGTNLPARIEAENYDSAPVETTAGN
SGSPTNCSYKGMGVDVENSTEGACNIGWTAAGEKVTYNIGNADGTYDIALRVASMDAG
KRISVHVNNSLADTVTTQGGGWQAWTTETISNVYIPSNSVITVEFYDSGSNLNFLNIT
ESSGTEPPVEPPVEPPVEPPVDNGNFPCNDGNSTLANNGASINLNQGACVKYNHGWGD
IRLGTWSGNGTIRYDVLDCNNNVMSDIAQKLNDFTAVDTATMNCAHYIYVKQAPSSYT
LQFGSW″
ORIGIN
1 atgaaatcag caaccacaaa tcaatcgagg gcacgcagta gcgcctttaa aaatatgttg
61 gcggcatcgc tcgcaggttt agggctacta tcagcttctg catttgccga tgtagccccg
121 ctaaccgtag acggcaataa aattcttagc ggtggccagc aagccagttt tgccggtaat
181 agcttatttt ggtctaacaa tggctggggc ggtgagaagt attacacggc cggtaccgtt
241 gaatggctaa agcaagactg gggcagtaat ttagttcgcg ccgcaatggg tgtcgatgaa
301 aacggcggct acttagaaga cccagcagga aacaaagcga aagtaacaac cgttgtagat
361 gcagccatcg ctaacgatat gtatgtaatt atcgattggc acagccacca cgccgaagac
421 taccaaaacc aagccattag ctttttccaa gatatggctc gcacctacgg taacaacaac
481 aacgttatat acgaaattta taacgagcca ttacaggttt cttggagcgg caccatcaag
541 ccttacgcag aagcggtaat tggcgcaatt cgcgcaatcg acccagataa ccttattatt
601 gtgggcacgc ctacttggtc gcaggatgta gacgtagcct cgcgcgaccc catcacgcag
661 tacagcaaca ttgcctacac tattcacttt tatgcgggca cccacaaaca atccctacgc
721 gataaagcac aaaccgcatt aaataatggt attgctttgt ttgctaccga atggggtaca
781 gtaaatgcca acggtgacgg cggtgtagac gcagccgaaa ctgatcgttg gatgcagttt
841 tttaaagcga atcatataag ccatgccaac tgggccttaa acgataaagc cgaaggctct
901 tctgcattaa agcctggctc taacgcaaac ggcggctgga gcaattccga cttaaccgcc
961 tctggtacct atgttaaaaa cttaattaaa acatggaacg acggctcacc gagcagcagc
1021 tcatctagca gcaccagttc ttcttcaagc agctcctcgt ctagtagctc atcatctagc
1081 agctcttcat ctagtagttc tggcggtacc aatttacccg cgcgcattga agcagaaaac
1141 tacgatagcg caccggtaga aaccactgca ggtaatagcg gctcacccac caattgttcg
1201 tataaaggta tgggcgtaga tgtagaaaac tctactgaag gtgcttgtaa tattggctgg
1261 actgcggcag gcgaaaaagt aacttacaac attggcaatg ccgatggcac ttacgatatt
1321 gcattgcgcg tagcctctat ggatgcgggc aaacgtatct ctgtgcatgt aaacaacagc
1381 ctagcagata ccgtaaccac acaaggtggc ggctggcagg catggactac cgaaaccatt
1441 tctaacgtgt atatcccatc aaactcggta attaccgttg agttttacga tagtggctct
1501 aacctaaact ttttaaacat taccgaaagc tcgggtaccg aaccacctgt agaaccaccc
1561 gttgagccgc cagtagaacc acccgtagac aacggtaact tcccatgtaa cgacggtaac
1621 tctacgcttg ccaacaacgg cgcctccatt aaccttaacc aaggagcgtg tgttaaatac
1681 aatcacggct ggggcgatat tcgtttaggc acctggagcg gcaacggtac cattcgatac
1741 gacgtactag actgcaataa caacgtaatg agtgatattg cacaaaaact taatgacttt
1801 actgctgtag acaccgcaac aatgaactgc gcacactaca tttatgtaaa acaagcccct
1861 agcagctaca ccctgcaatt tggtagctgg tag
LOCUS NZ_AABI02000017 2178bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_17，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000017 REGION：互补链(88284..90461)
VERSION NZ_AABI02000017.1 GI：28878285
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2178)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for BiotechnologY
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代 gi：23028916.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba-jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2178
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2178
/gene＝″Mdeg2776″
CDS 1..2178
/gene＝″Mdeg2776″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG2730:内切葡聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00067367.1″
/db_ref＝″GI:23028996″
/db_xref＝″COG:COG2730″
/translation＝″MKINTLFTPLRTVGAAVAIALSPVAFADVTCEVTNFNQWNSGYQ
ADVRVTNSGSAVSGWTVNLNFASAPQMTNGWNAALSTSGNTISASNISWNGNLGNGQS
TSFGFQGNSNGNLATPTCVGSGTGSSSSSSSSSTSSTSSSSTSSSSTSSTSSSSSSSG
GECVEMCKWYQDAPRPLCNNQDSGWGWENNQSCIGRTTCNSQSGNGGVINSCPSSSSS
SSSSSTSSTSSSSTSSTSSSSTSSTSSTSSSSTSSTSSSSTSSTSSSSSSGGGVFRVD
ATGNITKNGEVLPVRCGNWFGLEGQHEPSDAQNNPGGAPLELYVGNMWWVDSGRTIQQ
TMSEITAQGINMVRLPIAPQTLNPNDPQGVGDVRNGGVLKNHESVQQTNARQALEDFI
VQANENDIQVLIDIHSCSNYVGWRAGRLDAEPPYVDATRVGYDFTREDYSCGTNVGPG
VTVHEYNEEIWLNNLREIAGLSESLGVDNIIGIDIFNEPWDYTWEEWKALSESAYQAI
SEVNPDILIFVEGVAGGTGAGVDVPHGDESSNPNWGENFYPAQTAPLNIPKDRLVISP
HTYGPSVFVQRQFMDPNDPECVGLEGDEAAEAGCQIVIDYATLAAGWDEHFGFLREQG
FAMVVGEFGGNMDWPNGTRQAEKDMWSHITPGIDRQWQEAFVDYMVEKNIQACYWSIN
PESGDTGGWYGHEYDPVSNDAGWGRWLDFDSRKTNLLKELWGI″
gene 互补链(570..785)
/gene＝″Mdeg2777″
CDS 互补链(570..785)
/gene＝″Mdeg2777″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00067368.1″
/db_xref＝″GI:23028997″
/translation＝″MLEVELLLVELVELDEVLEVLLVELDEVLEVLDELVDEVLEELE
ELEELGQLLITPPLPDWLLQVVRPIQL″
ORIGIN
1 atgaaaatca acactctctt tacgcctttg cgtactgtgg gtgctgcagt tgcgatagct
61 ttatcgcctg tagcctttgc agacgtaacg tgcgaagtaa cgaactttaa ccagtggaat
121 agtggctacc aagccgatgt tcgtgttaca aacagcggta gcgctgttag tggctggacc
181 gtaaatttaa attttgcctc agccccgcaa atgacaaatg gctggaacgc agctttgagt
241 actagcggca atacaattag tgcatctaat attagttgga atggcaattt gggtaatggt
301 cagtccacca gctttggttt tcagggcaat tcaaatggta acttggcaac gccaacgtgt
361 gtaggtagcg gtacggggtc ttctagcagc tcttcatcca gctctacttc tagcacaagc
421 tcatcatcta caagttcttc tagcacgtct tctactagct ctagcagttc atcctctggt
481 ggtgaatgtg tagaaatgtg taagtggtat caagatgcac cgcgcccatt atgtaataat
541 caagacagtg gttggggttg ggaaaacaat caaagctgta ttggtcgcac tacttgtaac
601 agccaatctg gcaatggtgg tgtaattaat agttgcccaa gttcttcaag ttcttcaagt
661 tcttctagca cttcgtctac cagctcatct agtacttcaa gtacttcatc gagctcaaca
721 agtagtactt caagcacttc atcaagttcc acaagctcta ctagcagcag ctcaacctct
781 agcactagct cgtcgtcttc aagtggtggt ggagtattcc gcgtagatgc taccggtaat
841 attactaaaa atggtgaagt actgcctgtt cgttgtggta actggtttgg tctagagggc
901 cagcacgagc cttcagatgc gcaaaataac ccaggcggtg cgccgcttga attatatgtt
961 ggcaacatgt ggtgggtaga tagtggccgc actattcagc aaaccatgag cgaaattacc
1021 gcccaaggta tcaacatggt tcgcttgcct attgcaccgc aaacattaaa ccctaacgac
1081 cctcaaggtg tgggtgatgt gcgcaacggc ggcgtgctta aaaatcacga atctgtgcag
1141 caaaccaatg cacgtcaagc gttagaagac ttcattgttc aagctaacga aaatgacatt
1201 caagtgctaa ttgatattca ctcttgtagt aactacgtgg gttggcgtgc aggccgttta
1261 gatgcagagc ctccttatgt ggatgcaacg cgagtgggtt atgactttac ccgtgaagat
1321 tattcttgtg gcaccaatgt gggcccaggt gtaactgtgc acgagtacaa cgaggaaatt
1381 tggttaaaca acttgcgtga gattgctggt ttatctgaat ccttgggcgt tgataatatt
1441 atcggtatcg atatttttaa cgaaccatgg gattacactt gggaagagtg gaaagcactt
1501 tctgaaagcg cttatcaagc cattagcgaa gttaacccag atattctaat ctttgttgag
1561 ggtgttgcag gcggcacggg tgctggtgtt gatgtgccac atggagacga gtcttctaac
1621 cctaactggg gcgaaaactt ttatcctgcg caaactgctc cgcttaatat tccaaaagat
1681 cgtctagtta tttcaccgca tacctatggc ccatctgtat ttgttcagcg tcaatttatg
1741 gacccgaatg atccagagtg tgttggttta gaaggtgatg aggcggctga agctggctgt
1801 caaattgtta tcgattatgc aaccttagca gctggttggg atgagcattt cggcttctta
1861 cgtgagcaag gctttgccat ggtagtgggt gagtttggtg gcaacatgga ttggccaaat
1921 ggcacgcgcc aagcagaaaa agatatgtgg agccacatca cccctggaat cgacagacag
1981 tggcaagaag cgtttgttga ctacatggtt gagaaaaaca tccaagcttg ttactggtca
2041 attaacccag agtctggcga cactggcggt tggtatggtc acgagtacga ccctgtttct
2101 aacgatgcag gttgggggcg ttggttagac ttcgattctc gcaaaactaa cttacttaaa
2161 gagctttggg gtatttaa
LOCUS NZ_AABI02000001 1833bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：285915..287747
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1833)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代 gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1833
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1833
/gene＝″Mdeg0218″
CDS 1..1833
/gene＝″Mdeg0218″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG2730:内切葡聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00064857.1″
/db_xref＝″GI:23026371″
/db_xref＝″COG:COG2730″
/translation＝″MMYTNLFNLKKHLFQTSLKLLACATLIGGTLNAAADVPAMSVQG
NKVLVGGEVKSLGGMSYFWSNNGWGGEKYYNASTVSYFKQDWKASIVRAAMGVEDAGG
YFDDPQGSKQKVRTIVDAAIANDMYVIIDWHSHYANTHDWAAAVQFFQEMARDYGQYN
NVIYEVYNEPLDIPWGHIKSYAETVIDAIRAIDPDNVIVVGTPRWSQGVKEASWDPIN
RNNIAYTLHFYSGSHGQWLRNDAAEAMSNGIALFVTEWGSVNANGDGAVNEGETAAWM
NFMRDNGIHHANWSVNDKAEGASALNPGASATGGWGDGDLTWSGHVVRGYLRDWNQIG
SGNGNGNGTGCTEVSLPGTIEAEAYCAMDGIQTENTNDTNGGSNVGYIDAGDWMSYSV
NVANAGTYTVSYRVASLGGGGVLSIENAGGSPVYGTLNVPQTGGWQEWTTVSHDISLQ
AGQQNIGIAAIEGGFNINWIALTPAGTNPNPVQSITLQAEDYSFMSGVQVENTSDNGG
GMNVGWLDAGDWLAYHGVNIPTSGQYTITYRVASQSGGGSLQLEQAGGGVVYGNLNVP
STGGWQNWVDVSHTVTLNAGVQDFGLGITSGGFNINWIKVEAIH″
ORIGIN
1 atgatgtaca caaacctctt taatttaaaa aagcacctct ttcaaacctc acttaaacta
61 ctggcctgcg ccacattaat tggcggcacc ctaaacgcag ccgctgacgt gccagcaatg
121 tccgtacaag gcaataaagt actggtgggc ggtgaagtta aaagccttgg aggtatgagc
181 tatttttggt ctaacaacgg ctggggcggc gagaaatact acaacgcttc taccgttagt
241 tacttcaagc aagactggaa ggcatccatt gttcgagctg caatgggggt agaagatgcc
301 ggcggctact tcgatgaccc gcagggctct aagcaaaaag ttcgtacaat agtagatgcc
361 gccattgcga atgatatgta cgtcattatc gattggcact cacattacgc caacacccac
421 gactgggcag ccgctgtgca atttttccaa gaaatggcac gtgactatgg ccaatacaat
481 aatgtgattt atgaggtata caacgaacca ctggatatcc cttggggcca cataaaaagc
541 tacgccgaaa cggtaattga tgccattcgc gcaattgacc cagataacgt gatcgtagta
601 ggcactcctc gctggtcgca gggggtaaaa gaagcgtcat gggacccaat caaccgcaat
661 aatattgcct acacgctgca cttctattca ggtagtcatg gccaatggct gcgcaacgac
721 gcagcagaag ctatgagtaa tggtattgcc ttgtttgtta ctgaatgggg cagcgtaaat
781 gccaatggcg atggcgcagt caacgaaggc gaaaccgcag cgtggatgaa cttcatgcgc
841 gataacggta tccatcacgc aaactggtct gtaaacgaca aagcagaggg tgcatctgca
901 cttaaccctg gcgccagtgc cacaggtggt tggggcgacg gcgatttgac ttggtctggc
961 catgttgtgc gcggctacct gcgcgactgg aaccaaattg gttctggcaa tggtaacggc
1021 aacggcacag gctgcaccga ggttagccta ccaggcacga tagaagcgga agcctactgc
1081 gcaatggatg gtatccaaac cgaaaacacc aacgacacca acggcggcag taacgtgggc
1141 tacatagatg ctggcgactg gatgagctac agcgtaaacg ttgctaacgc aggcacttat
1201 accgtgtctt accgcgtggc tagccttggc ggcggcggtg ttctaagcat tgaaaatgcc
1261 ggcggctcgc ccgtttatgg cacgctgaat gtaccgcaaa ctggcggctg gcaagaatgg
1321 accactgtat ctcacgatat tagcttgcaa gccggccaac aaaacattgg catagcggca
1381 atagaaggtg gttttaacat caactggata gccctaaccc ctgctggcac caaccccaac
1441 ccagtgcaaa gtattacctt acaagcagaa gactactcct ttatgagtgg cgtgcaggta
1501 gaaaatacta gcgacaatgg cggcggtatg aacgtaggct ggttagatgc tggcgactgg
1561 cttgcctacc acggcgtaaa cattccaacc tctggccaat acaccataac ttaccgagta
1621 gccagccaaa gcggtggtgg aagcctgcag ctagaacaag caggtggcgg cgttgtttac
1681 ggtaacctga acgtaccaag cactggcggc tggcagaact gggtagacgt aagccatacc
1741 gttaccctta acgctggtgt acaagatttt gggttaggta ttactagtgg tggcttcaat
1801 attaactgga taaaagtcga ggcaattcac taa
LOCUS NZ_AABI02000001 2376bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：28883..31258
VERSION NZ_AABI02000001.1GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2376)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至N ational Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi，nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2376
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2376
/gene＝″Mdeg0020″
CDS 1..2376
/gene＝″Mdeg0020″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG5297:纤维二糖水解酶A(Cellobiohydrolase A)
(1，4-β-纤维二糖糖苷酶A(1，4-β-Cellobiosidase A)″
/protein_id＝″ZP_00064659.1″
/db_xref＝″GI:23026173″
/db_xref＝″COG:COG5297″
/translation＝″MLASNKNSKLANSEQHRPYKTRTARWLTGSGVIASSLLFSAQSF
AAQCEYIISNEWNSGFTGAVRITNNGTTPINGWDVSWQYAGDAVTSSWNANVSGSNPV
SATPLSWNANIQPGQSVEFGFQGSKAGSNAEIPTVTGAVCDSGSSSSSSSSSSSSSSS
SSSSSSTSSSSSSSSSTSSSSSSSGSSGTGGIACTVGNANIWGSGYQLDMQVVNNGTA
AVSSWDVTMAFGEAPQRTGGWNANFVESGNTIVASNISWNGNLAPGQSASFGIQGNHD
GSFGGVTCNGASSSGSSSSGSSTSSSSSSSSSSGSSTSSSSSSSSTGSTSSSSSSSTS
STSSSSSSSTSSTSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSTSGSGAGFDNPFIGGKWYVDP
VWSAKAAAEPNGSLIANYNTAVWMDRIGAIEGPEDGDGMGLEEHLDEALAQGADIFMF
VVYDLPNRDCAALASSGELLIAENGFERYQNEYIGPIVDILSKPAYSSLRIIAIIEVD
SLPNLVTNLNIQKCVEANGPGGYVDGIQHALNELNTLDNVYPYVDIAHSGWLGWSDNF
AGATKLIGDAIKGTNKGVNSIAGFVSNSSNYTPVTEPYLPNPTLQIGSNQVRSADFYE
WTMYFEELSFVQDWRQAMIQQGFPESIGMLIDTARNGWGGPDRPTGESTSTDLNTYVN
ESRIDRRQHRGNWCNQPGGVGFRPQAAPEPGVDAYVWVKPQGESDGISDPNFPIDPND
PAKQHDPMCDPNAPNRDNNAVGTGALDNAPHAGRWFPEAFQILIENAYPPL″
gene 互补链(369..566)
/gene＝″Mdeg0021″
CDS 互补链(369..566)
/gene＝″Mdeg0021″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00064660.1″
/db_xref＝″GI:23026174″
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PLSHTAPVTVGISALEPALLP″
gene 互补链(813..1151)
/gene＝″Mdeg0022″
CDS 互补链(813..1151)
/gene＝″Mdeg0022″
/codon_start＝1
/ttansl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00064661.1″
/db_xref＝″GI:23026175″
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ELEEVLEVEELLELEVEPVEELELELEVLEPDELDELLDELVLEPELDEPELEAPLQV
TPPKEPSWFP″
ORIGIN
1 atgttggctt ctaataaaaa tagtaagctg gcaaactctg agcaacaccg cccttataaa
61 acccgcacag cgcgctggtt aaccgggtct ggggttattg cttcaagttt gcttttttct
121 gcgcagagtt ttgcggcgca atgtgaatac atcattagca atgaatggaa cagcggcttt
181 actggcgcag ttcgcattac taataatggc actactccca tcaatggctg ggatgttagc
241 tggcagtatg ccggcgatgc agtcaccagc agctggaacg cgaatgtttc tggctcgaac
301 cccgtttctg ctacaccatt aagctggaat gccaacattc aacccggtca aagcgttgag
361 tttggttttc agggcagcaa agccggctcc aatgcagaaa ttccaaccgt taccggcgcg
421 gtatgtgata gcggctctag ctcttccagc tccagctcat catctagttc atcaagctct
481 tctagtagct caagcagcac tagcagctcc tcgtccagct cttcaagcac ctcttcgtct
541 agctcatcat ctggctccag tggcacaggt ggtattgcgt gtactgtagg caatgcgaat
601 atttggggct cgggctacca gctggacatg caagttgtta acaacggcac cgctgcagta
661 agcagttggg acgtaaccat ggcattcggc gaggcaccac agcgcaccgg tggctggaac
721 gcaaactttg tagagtcagg caataccatt gttgcgagca acattagctg gaacggcaac
781 ctcgcaccgg ggcaatcagc ttcgtttggt attcaaggga accacgacgg ctcttttggc
841 ggcgtaacct gtaacggcgc ttcaagctct ggctcgtcta gttctggctc tagcaccagc
901 tcatcaagta gctcatccag ttcgtctggc tctagcactt ctagctctag ctcaagctcc
961 tctactggtt ctacctctag ctctagtagc tcttcaactt ctagcacttc ttcaagttct
1021 agctctagca ccagctccac gagttctagc tccagttcta gctcgagtac atcgtctagt
1081 tccagctcat cttcctcaag ctctagctct tctacttcag gcagtggcgc aggttttgac
1141 aacccgttca ttggcggcaa gtggtatgta gacccagtat ggtcagcaaa agctgcagca
1201 gagccaaacg gttcacttat tgccaactac aacacggcag tttggatgga tcgcattggt
1261 gcgattgaag gcccagaaga tggcgatggt atgggcttag aagaacactt agatgaagct
1321 ttagcacaag gtgcagacat ctttatgttc gtggtatacg acctaccaaa ccgcgactgt
1381 gcagctttgg cctcaagtgg cgaactactc attgccgaga acggttttga gcgctatcaa
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1561 aaatgtgttg aagcgaatgg cccgggtggg tacgtagacg gtatccaaca tgcacttaac
1621 gagctaaaca cgcttgataa tgtgtaccca tacgtcgata ttgctcactc aggctggcta
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1801 actgaaccat acctacctaa ccctaccttg caaattggta gcaaccaagt tcgatctgcg
1861 gatttctacg agtggaccat gtacttcgaa gaacttagct ttgtacaaga ttggcgccaa
1921 gccatgattc agcaaggctt cccagaatca attggtatgc ttattgatac cgcacgtaat
1981 ggctggggtg gacctgaccg tccaactggt gagtctacat ctaccgacct caacacctat
2041 gtgaatgaat cgcgtataga ccgccgtcag catcgcggaa actggtgtaa ccagcccggt
2101 ggtgttggct tccgtccgca agcggcacca gaaccaggtg tagacgctta cgtttgggtt
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2221 ccagctaaac agcacgaccc aatgtgtgat ccaaacgcac ctaaccgcga taacaatgcg
2281 gttggcacag gcgcgctaga taacgctcca catgctggtc gctggttccc agaagcattc
2341 caaatactta tagaaaacgc ctacccaccg ctatag
LOCUS NZ_AABI02000004 1737bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：239646..241382
VERSION NZ_AABI02000004.1GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1737)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1737
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DN A″
/strain＝″2-40″
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/gene＝″Mdeg1139″
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/gene＝″Mdeg1139″
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LPAAKKLAVVPAVAAAKFDIIDVTSGKVAFTGSLSDVKSWSAMGDESFKLADFSALQA
EGSYRLVVQGVSDSYTFDISPSVYSQAHDGALKAYYYNRASTELTEQYAGVYARPAGH
PDTDVRIFDNAASAARPADTSFAAPKGWYDAGDYGKYIVNSGISTYTLMAAYEHFPSF
YKQRDIDIPESGDAVPDILDEVMWNLEWMQVMQDPNDGGVYHKLTTLNFSGAVMPHEA
TAQRYFIKKSTAATLDFAAVMATASRVYAPFEGAFPGKSAAYRQAAIAAWEWAQANPS
ETYSQTPLSKVQTGAYGDKKLNDEFAWAAAELFILTGEQKYWQAFNKQKVQAGESSWA
NVAGLGFISLANNARSLLNEAQYKTVTDSIVRAADSLLVTYKENAYQVPIGNKDFFWG
GNSGTLNRAWVLLEANKIKPQQEYIDAALAAVDYIYGRNPTNYSFVTGFGDNPAVGIH
HRPSYADGIKAPVPGWLAGGAHNGKQDGCEYPSDAPAKSYLDDWCSYSTNEIAINWNA
PLVYILAAVNNL″
ORIGIN
1 atgaacaaag ttaaagtttt agcgctgtgt gccagtgtgg ctgtaatgat aggttgcagt
61 gatgccgaca ctaaattagc taactcggcc aaggccgagg tgggctttac caaagtgaat
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301 caagccgaag ggagttaccg cttagttgtt cagggtgtga gtgattctta caccttcgat
361 attagcccaa gtgtatatag ccaagcgcac gatggagccc ttaaagccta ttactataat
421 cgagcgagca cagagttaac agaacagtac gccggggtgt atgcgcgacc tgcggggcac
481 ccagataccg acgtacgcat attcgataac gccgcctcag ccgcgcgccc agcagataca
541 agctttgctg caccaaaggg ttggtacgat gctggcgatt acggcaagta cattgttaac
601 agtggtattt ccacttacac cctaatggct gcgtacgagc atttcccgtc gttttacaag
661 caacgcgata tagatattcc cgaatctggc gatgccgtac cggatattct cgacgaggta
721 atgtggaacc ttgaatggat gcaggtcatg caagacccga acgacggcgg tgtgtaccac
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1141 aagcaaaaag tgcaggcggg tgagtctagc tgggcgaatg ttgcggggtt ggggtttatt
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1381 gttttgcttg aggccaataa aattaaaccg cagcaagaat acatcgatgc tgcacttgcc
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1561 gtgcctggtt ggcttgcggg cggtgcgcac aatggcaagc aagatggttg tgagtaccct
1621 tccgatgcac cggcaaaatc ctatctagac gactggtgca gttactccac caacgaaatt
1681 gctattaatt ggaatgcgcc gttagtttac atactggctg cggtaaataa tttgtag
LOCUS NZ_AABI02000004 2604bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：254535..257138
VERSION NZ_AABI02000004.1 GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2604)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2604
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2604
/gene＝″Mdeg1150″
CDS 1..2604
/gene＝″Mdeg1150″
/codon_start＝1
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/protein_id＝″ZP_00065776.1″
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VGYIPNGAKVASYVAPSNTAQTWQLLRNGSVVASGTTTPKGTDAASGDNIHHIDFSAV
SATGEGFSLLVGGDESYPFEISADAFTPVLYDSIRYFYHNRSGIAIETQYTGGGNGSY
AANAQWARPAGHINQNANQGDNAVPCWSGSGCNYALDVTKGWYDAGDHGKYVVNGGIS
VWKLLNMYERALHISGSQNKYADGTLNIPESGNGVADILDEARWQMEFLLAMQVPEGE
AKAGMVHHKMHDVGWTGLPLAPHEDNRERALVPPSVTATLNVAATGAQCARLFDEIDA
SFAASCLTAAERAWDAALQNPNDVYTGGYDNGGGGYGDEVADDEFFWAAAELYITTGD
SKYLSTINNYNVTRIDWGWPDTELPALMSLAVVPANHTANLRATARAKIVEIADTHVA
TSNAAGYLTPSSALDYYWGSNNGVANKIALLGLAYDFTGDDVYAKTVSKAVNYLFGNN
TLSFSYISGHGENALQQPHHRFWAGALNGSYPWLPPGALSGGPNAGLEDGVAAAALSA
CVSTPAKCYMDDIESWSTNEITINWNGALVWAMAFYDDYADSGSGSSSSSSSSSSSSS
SSSSSSTSSSSSSSSSSSSSGSSSSSSSSTSSSSSSSSSGGECVEMCKWYQDAPRPLC
NNQNSGWGWENQQSCIGRTTCESQSGNGGVINSCGTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSTSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSGGVAGVACAVTKMNHWGSGYQLDVTVSNNGAA
AVSGWSIELDFGESPQLTGSWNAAVSASGNTVSATNISWNGNLSAGQSTSFGMQGNSD
GSLSTPSCLVK″
gene 互补链(1812..1961)
/gene＝″Mdeg1151″
CDS 互补链(1812..1961)
/gene＝″Mdeg1151″
/codon_start＝1
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/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00131521.1″
/db_xref＝″GI:24762929″
/translation＝″MEELLEELEPLDEELLLEDDELEVELEELDEELDELEELDELEP
LPESA″
ORIGIN
1 atgaatctta cttcaatcat gtttgaacaa tcagtaaaaa aagtcgctaa gtcagccatt
61 gccgtggcag ttgcttcggc ggttacctta agtgcggcgc aggccgaggt gggtaaccca
121 cgtgttaacc aagtaggcta tatacccaat ggtgccaaag ttgccagtta tgttgcgcca
181 tcaaatacgg cacaaacgtg gcagttactg cgtaatggca gtgtggttgc aagtggcact
241 acaaccccaa agggtacaga tgcagcctcg ggtgacaata ttcaccatat cgatttttct
301 gcggtgagtg caaccggcga aggttttagt ttgcttgtgg gcggcgatga aagttacccc
361 tttgaaattt ctgccgacgc atttacaccg gttttatacg attccatccg ttacttttat
421 cacaaccgtt cgggtatcgc gattgaaacg cagtacaccg gtggcggtaa cggtagctac
481 gcggcgaatg ctcagtgggc taggcccgca ggtcacatta atcaaaatgc taaccaaggc
541 gataatgcgg tgccgtgttg gtcgggcagt ggttgcaact acgccttaga cgtaactaaa
601 ggttggtacg atgccggtga ccacggtaaa tatgttgtaa acggtggcat ttccgtatgg
661 aagctattaa acatgtacga gcgtgccttg cacattagtg gcagccaaaa taaatacgcc
721 gacggtacat taaatattcc tgaaagcggc aatggcgtgg cggatatttt ggatgaagct
781 cgctggcaaa tggagttttt attagccatg caagtgccag agggcgaagc gaaagctggc
841 atggtgcacc acaaaatgca cgatgtgggt tggacaggct tgccactagc accccatgaa
901 gataatcgcg agcgcgcgct tgtgccgcct tcggttactg caacccttaa cgttgcggcc
961 acaggcgcgc agtgtgcgcg tttatttgac gaaatagatg cgagttttgc agcaagttgt
1021 ttaactgccg cagagcgcgc atgggatgca gccctgcaaa accctaacga tgtttacact
1081 ggcggctacg ataatggcgg cggtggttac ggcgatgaag tggcggacga cgagtttttc
1141 tgggctgctg ctgagttata cattaccact ggcgatagca aatatctttc aaccattaac
1201 aactacaatg taacgcgcat tgattggggc tggccagata ccgagttgcc tgcgttgatg
1261 tcgttagcgg ttgtgcctgc taatcacacc gcaaatttgc gtgcgactgc tcgtgcaaaa
1321 attgtagaaa ttgcagatac ccatgtcgct accagtaatg ctgccggcta tttaacacca
1381 tcgtccgcgc tggattacta ctggggttct aacaatggcg tagccaataa aattgcgtta
1441 cttggtttgg catacgattt tactggcgat gacgtttacg cgaaaacggt gtcgaaagca
1501 gttaactatt tatttggtaa taatacctta tcgttttctt atatttctgg gcatggcgaa
1561 aatgctttgc aacagccgca tcaccgcttt tgggctgggg cattaaatgg aagttaccca
1621 tggttgccgc ctggtgcgct ttctggtggc cctaacgcag ggttagaaga tggcgttgcc
1681 gccgccgcgc taagtgcttg tgtttcaacg cctgccaaat gctatatgga tgatattgaa
1741 tcttggtcga ccaacgaaat tactattaac tggaatggtg cattggtttg ggcaatggcg
1801 ttttatgatg actacgccga ttcgggtagc ggttctagct cgtcaagttc ttctagctca
1861 tctagctctt cgtcaagttc ttccagttcg acttctagct cgtcgtcttc tagtagtagc
1921 tcttcgtcga gcggctcgag ttcttctagc agctcttcca catccagttc cagctcttcg
1981 agttcatcgg gtggggagtg tgtagaaatg tgtaagtggt atcaagatgc accgcgccct
2041 ctatgcaata accaaaacag cggttgggga tgggagaacc agcagagttg tattggtaga
2101 acaacttgcg aaagtcaaag tggcaatggt ggagtgatta attcgtgcgg cacgtctagc
2161 tcgagctctt catctagctc tagcagtagc tcttcgagtt catccagctc ttctagcagt
2221 tcttccacat caagctcgtc gagtagttcg tcttctagct cttctagttc gacttcaagt
2281 tcttcgtcga gcagttcagg gggcgttgca ggtgtggctt gtgcggtaac caaaatgaac
2341 cattggggca gcggatatca attagatgta acagtttcta ataatggtgc tgcagcggta
2401 agtggttgga gtattgaact cgattttggt gaatcgccac agcttactgg tagttggaat
2461 gctgctgtat cggcatctgg taatactgta tcggctacta acattagttg gaacggtaat
2521 ttaagcgctg ggcaatctac ctcttttggt atgcagggta attcagatgg ttcgctgagc
2581 acgccaagct gtttagttaa gtaa
LOCUS NZ_AABI020000013219bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001REGION：互补链(289745..292963)
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-3219)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..3219
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..3219
/gene＝″Mdeg0221″
CDS 1..3219
/gene＝″Mdeg0221″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG1472:β-葡糖苷酶相关的糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00064860.1″
/db_xref＝″GI:23026374″
/db_xref＝″COG:COG1472″
/translation＝″MKNTLSFKTSLLAGLVASSLLVAACQGVKQQTEATQTKHNITLW
PQASSPVIKSPDYEAEVEAKVEALLGQMTLEQKVGQILQPEIQSIKPHEVKEYHIGSV
LNGGGSMPNRIENAPPIEWVKLADAFYDASMDDSDGGIAIPIIWGTDAVHGHGNVTGA
TIFPHNIGLGAARNPALIEKIGEITAKEVRATGIEWIFGPTLAVAQNDLWGRTYESYS
EDPAIVADYASAMVVGMQGKVDDSDFLSTNRVVATAKHFLADGGTLGGNDQGDARISE
EELVQIHNAGYVPAIESGVQTVMASFSLWNGVKMHGNNYLLTQALKERMGFDGFIVGD
WNGHGQVPGCTNESCPQSLNAGLDMYMVPYDWKKLYRNLISQVQSGEIAPSRLDDAVR
RILRVKIRANLWAAKPSERINLATIDEVVGHANHREVARQAVRESLVLLKNKNSVLPI
AANKTVLVAGDGADNIGKQSGGWSVSWQGTGNTNASFPGGTSIYKGIADAVTQGGGKA
TLSVDGSYKTKPDVAIVVIGEDPYAEGQGDRNSLEFEPVNKKSLELLKKLKADGIPVV
TVFISGRPMWANPEINASDAFVAAWLPGSEGQGVADVLIGNANGKPRFDFKGTLSFSW
PKLPTQGLLNPTHPNYDPLFKLGYGLTYASSETGPEQLAEDVEGVDKGSTGDINFYVG
RTLEPWEVFVRTPESSQRLSGPFADLGNASVRTSDMQVQEDALTFTWGGSWMSILGIE
GGRGYDLSSQYKEGGVISFNFNSIDMAKGDLKVQMACGEGCTREVDITTIARDLEGKG
WQSLTVPLACFAHEGDDFTHITAPFNLFAGGKGQVAVANIRILRAGTQTVPCVLPKDV
SVTPEPLNASWAIDWWMPRHKEKLARIQQGNVDLLMIGDSITHGWEDAGKDVWAQYYA
HRNAVDLGFS GDRTENVLWRLQHGEADGIKPKVAVVMIGTNNAGHRHEPSHYTAKGVA
AVVAELQKRLPETKILLLGIFPRGETSEDPLRVLNAKTNTLLAKMADGEKVVYLNINK
TFLDENGVLPKDIMPDLLHPNEKGYALWAKAMEPTLKKMLGE ″
ORIGIN
1 atgaaaaata ctttatcctt taaaacatcc ttgcttgcgg gcttggtggc atccagttta
61 ctggttgcgg cctgtcaggg tgttaaacag caaacggaag ctactcagac aaagcacaat
121 attaccttat ggccgcaggc gtctagccct gtaataaagt cgccagatta cgaagcggaa
181 gtggaagcca aggtagaagc gttgttagga caaatgacgc tagagcaaaa agtagggcaa
241 atcctacagc cagaaattca atctattaag ccgcatgaag taaaagaata ccacattggc
301 tctgtactaa atggtggtgg ctctatgcct aaccgcatag aaaatgcgcc gcccattgaa
361 tgggtaaaat tggccgatgc cttttacgat gcctctatgg acgattctga cggtggaatc
421 gcaattccca ttatttgggg taccgatgcc gtacacggtc acggcaatgt aactggcgca
481 accatattcc cgcataacat aggccttggt gctgcacgca acccagcgct tatcgaaaaa
541 attggcgaaa taacggcaaa agaagtacgc gcaaccggca ttgaatggat atttggccca
601 actttggccg tagcgcaaaa cgatttatgg ggccgcactt acgaaagcta ctcggaagac
661 ccagccatag tggccgacta cgccagtgcc atggtggtag gtatgcaggg caaagtggac
721 gacagcgatt ttctgtccac taatcgcgta gttgccacag caaagcactt tttagctgac
781 ggcggtacct taggaggcaa cgatcaaggt gatgcgcgca taagcgaaga agagttggtg
841 caaattcata atgcgggcta tgtgcctgcc attgaatcgg gcgtgcaaac ggttatggcc
901 agtttctctt tgtggaatgg cgtaaaaatg catggtaaca actacctact tacccaagca
961 cttaaagagc gtatggggtt tgatggtttt atagtagggg attggaatgg ccacgggcag
1021 gtacctgggt gcaccaacga atcttgccct caatcgctaa acgccggttt agatatgtac
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LOCUS NZ_AABI02000040 2589bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_40，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AAB102000040REGION：互补链(12943..15531)
VERSION NZ_AABI02000040.1 GI：28878262
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2589)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029901.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
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/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
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/gene＝″Mdeg3627″
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/gene＝″Mdeg3627″
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/db_xref＝″COG:COG1472″
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DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_40，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000040REGION：互补链(12943..15531)
VERSION NZ_AABI02000040.1 GI：28878262
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2589)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029901.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
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ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
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microbes@cuba//jgi-psf.org.
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source 1..1386
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ORIGIN
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1321 ggcaaacgca cacctaaaca gtctgcaatt tggtatagca cgttaattaa agatggtggg
1381 ttctag
LOCUS NZ_AABI02000013 1335bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_12，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000013 REGION：65269..66603
VERSION NZ_AABI02000013.1 GI：28878289
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1335)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028387.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1335
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1335
/gene＝″Mdeg2234″
CDS 1..1335
/gene＝″Mdeg2234″
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TFYKNILTKLREKNLKAYITLYHWDLPQHLEDAGGWLNRDTAYKFRDYVNLITQALDD
DVFCYTTLNEPFCSAYLGYEIGVHAPGIKDLASGRKAAHHLLLAHGLAMQVLRKNCPN
SLSGIVLNMSPCYAGSNAQADIDAAKRADDLLFQWYAQPLLTGCYPDAINSLPDNAKP
PICEGDMALISQPLDYLGLNYYTRAVFFADGNGGFTEQVPEGVELTDMGWEVYPQGLT
DLLIDLNQRYTLPPLLITENGAAMVDELVNGEVNDIARINYFQTHLQAVHNAIEQGVD
VRGYFAWSLMDNFEWALGYSKRFGITYVDYQTQKRTLKASGHAFAEFVSSRS″
ORIGIN
1 atgaatagac ttacactacc gccttcttct cgtttgcgca gcaaagagtt tacctttggt
61 gttgcaacgt cgtcttacca aattgaaggc ggcatagatt ctcgcctgcc ctgtaattgg
121 gatacgttct gtgagcagcc caataccatt attgataaca ccaacggcgc cattgcttgc
181 gaccacataa atagatggca agacgatata gaacttattg ccaacctagg ggtagatgcc
241 taccgctttt ctattgcgtg gggccgtgtt attaatttag acggcagcct caataatgaa
301 ggcgttacat tttacaaaaa tattttaact aagcttcgcg aaaagaattt aaaagcttat
361 ataacgctat accactggga cttgccacaa catttagaag atgctggcgg ctggcttaac
421 cgcgataccg cctacaagtt tcgcgactat gtaaacctta taacccaagc gcttgatgac
481 gatgtatttt gctacacaac gttaaacgag cccttttgca gtgcctacct tggctatgaa
541 attggtgtac acgcaccggg tataaaagac ttagccagtg ggcgcaaagc cgcacaccat
601 ttattacttg cccatggctt agctatgcaa gtgctgcgaa aaaactgccc caatagttta
661 agcggcatag tgttaaacat gagcccttgt tacgccggca gcaacgcaca agcagatata
721 gatgcagcaa aacgcgcgga cgatttatta tttcagtggt atgcacaacc gctacttact
781 ggctgctacc ctgatgcaat aaacagcctg ccagacaatg ccaaaccacc tatttgtgaa
841 ggcgacatgg cgttaataag ccaaccttta gattatttag gccttaacta ctatacccgc
901 gcagtatttt ttgccgacgg taatggcggt tttaccgaac aagtacctga gggtgtagag
961 ctaaccgata tgggctggga agtttacccg caaggcttaa ccgatttact aatagaccta
1021 aaccaacgct ataccctacc cccgttactt attaccgaaa acggcgcagc aatggtggac
1081 gaacttgtta acggcgaagt taacgatatt gcccgaataa attattttca aacccattta
1141 caagcggtac acaacgccat tgaacaaggt gttgatgtac gcggttattt tgcttggagc
1201 ctaatggata attttgagtg ggcactgggt tacagcaaac gattcggtat tacctatgta
1261 gattaccaaa cacaaaagcg aacgctaaaa gccagcggcc acgcatttgc tgagtttgtc
1321 tcgagtagga gctaa
LOCUS NZ_AABI02000009 2601bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_10，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000009 REGION：594..3194
VERSION NZ_AABI02000009.1 GI：28878293
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2601)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028157.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2601
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2601
/gene＝″Mdeg1959″
CDS 1..2601
/gene＝″Mdeg1959″
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DGVLMPIASDYVTSRHWTGTPAWNMVRYSDAARTQAIGDSAIVDSAYSSPAGTTKEYV
TMTATIKPLKSGEHTLKTSVMGDFELKINGKTTVKHSSTSGDVVTQKIALNGGETYSF
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LPNHQDPVISKVLAANPNTVVFLIAGSAVEMPWADKAKAIVWGWYGGMEAGNAYADML
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GHGLSYTQFKYNNIKLSSANIKGDQTVTVSATITNTGKVAGAEVVQLYLHDEQASVER
PAKELKGFOKVFLKPGESKAVNITLNKRALSFWDENSNDWLAETGKFNVLLGASVSDI
RLQTSFQYQQ″
ORIGIN
1 atgctgctaa gcttaaaaaa cactcaactc aaaagaagta tgaacatgaa ccttaaacac
61 ctctttctgg ttgctttggc gctaaatatt gctgcgtgca atgtaaaaga gcccgcggcg
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181 gccgaagttg aacgcctgct gccactatta acactagaag aaaaagcctc tttggttcat
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361 tggacagatg acaactccac ttacttacca ccgcttacta ccgtagccgc cagctggaac
421 cccgaaatag ctgcccttca cggcgatgta ctcggcgcag aagctcgcca ccgccgtaaa
481 gatgtaatat taggcccagg cgtaaactta gctcgcctgc cactttatgg tcgtaacttt
541 gaatatatgg gtgaagaccc cttcttggca tcacgtcttg ctgtggcaga aattaaagcc
601 attcaagaaa atgacgtggc cgcctgtatc aaacatttcg cgcttaacaa tcaagagctg
661 aatcgcaccg gcgtaaacgc caaacccgat gaacgcacat tacgcgaagt gtatttaccc
721 gccttcgaag ccgccgttaa agaagcgggc gtgcacacca taatgggggc ctacaatgaa
781 tttcgcggta ccaacgccaa ccaaagcaaa catttagtaa tggatattct aaaaggcgaa
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901 gctgttaacg gcctcgatat cgaaatgggt acaaatgtag atagctacga cgactacatg
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1021 gataaagttc gtcgcatact gcgcgtgcaa ctcagcatag gcatgatgga caaataccgc
1081 ttatctggtg agcgcaatac tgccaagcat cacgaagctg cacgcaaaat tgcatctgaa
1141 ggtattgtgc tactaaaaaa tgaaaacatt ctgccgctaa ataaaaacaa aattaaaaac
1201 gtattggtgc ttggccccaa cgcagacaaa gtgcacggtt taggcggtgg ctcgtcagaa
1261 gtgccagcac tttatgaaat aaccccgtta caagggttaa aacagaagct gggagataat
1321 gtaaacatta ccgttatgcg cgcacgctat gacggtgtgt taatgcctat cgccagtgat
1381 tatgttactt ctcgtcactg gaccggcaca cctgcatgga acatggtgcg ttactcggat
1441 gctgcgcgca cccaagctat tggcgactcc gccattgttg attcggctta ttcttcgcct
1501 gcaggcacga ctaaagaata cgtcaccatg accgccacaa ttaaaccgtt aaaatcgggc
1561 gagcacacac tcaaaacatc ggtgatgggc gatttcgaat taaaaattaa cggtaaaacc
1621 acagtaaaac atagcagcac tagcggcgat gtagtaaccc aaaaaatcgc cctcaacggc
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1801 gatgtagtgt tttactttgg cggcctaacc cacggcgacg accgcgaagc aattgaccgc
1861 cctcacatga agctgcctaa ccatcaagac ccagttatta gcaaagtatt agctgcaaac
1921 ccgaacacgg ttgtattttt aattgcaggc tctgctgtag aaatgccgtg ggccgataaa
1981 gctaaagcta ttgtgtgggg ctggtatggc ggtatggagg ccggtaacgc ctacgccgat
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2101 gaagatactg ctccaatcgc actgaatgat tacaaccctg ttgaatcact ctacaccgag
2161 ggcgtgttta ttggttaccg ctggttcgaa aaacaaaaca tcgagccgct attcccgttc
2221 ggtcatggtt tgtcttatac ccagtttaag tacaacaata taaagctctc tagcgcgaac
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2581 agcttccaat accagcagta a
LOCUS NZ_AABI02000028 2436bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_28，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000028 REGION：14441..16876
VERSION NZ_AABI02000028.1 GI：28878274
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2436)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029569.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2436
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2436
/gene＝″Mdeg3326″
CDS 1..2436
/gene＝″Mdeg3326″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3459:纤维二糖磷酸化酶″
/protein_id＝″ZP_00067911.1″
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MTNFQRNFSTGEVEVEDSVIYHKTEFKERRNHYAFYSVNAPIQGFDTDRDKWKGLYND
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QCMVTFNMSRSASFFESGIGRGMGFRDSNQDLIGFVHQVPERARERIIDIASTQFEDG
SAYHQYQPLTKRGNNAIGGNFNDDPLWLILSTTDYIKETGDFSILEEQVPYDNDASKA
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AESLMIAGLFVLYGNEFVKLCREIGQDGEAAEAQAHIDQMVEAVKKHGWDGEWFLRAY
DYYGKKVGSKENEEGKIFIESQGFCGMAGIGLEDGLVEKSMDSVKEWLDCDYGIVLQQ
PAFTKYYIEYGEISTYPAGYKENAGIFCHNNPWIMITETLLGRGDKAFEYYRKIAPAY
LEEISDLHKVEPYAYCQMIAGKDAYLPGEGKNSWLTGTASWNFAAITQYILGVKPDYS
GLAINPCIPSSWDGFKVTRKYRGATYNIIVTNPTHVSKGVKSLTLNGNAIDGYIVPPQ
QAGTVCNVEVTLG″
ORIGIN
1 atgaaatttg ggcactttga cgacaaagca cgcgagtatg taattaccga cccgaaaact
61 ccctacccgt ggataaacta cttaggcaac gaagacttct tcagcctagt atctaacact
121 gggggtggct acagttttta caaagatgca aagttccgtc gtttaacacg ctatagatac
181 aacaacgtac ccgtagacaa cggcggtaaa tatttttaca tcaatgatag tggcgatgta
241 tggagccccg gttggaagcc ggtaaaagca gagctagacg catacagctg cgctcacggc
301 cttagctaca cccgcattac cggcgaaaga aacggcattc aagcggaagt acttagcttt
361 atccctctcg gcacttgggc cgaaattcaa aaagttagcc ttaagaatac ctctggcgct
421 accaaaaaat ttaaactgtt ttctttcgcc gaatggtgcc tatggaacgc agaagatgac
481 atgaccaact tccaacgcaa cttctccacc ggtgaagtag aggtggaaga ctctgttatt
541 tatcacaaga cagaatttaa agagcgccgc aatcattacg cattctactc tgtaaacgca
601 ccaattcagg gcttcgacac cgacagagac aaatggaaag gcttgtacaa cgattttgat
661 aaacccgatg ccgtttttga aggcgagcct cgcaactccg aagcgcacgg ctggtcgcca
721 attgcatctc actatctaga agtggagctc gcaccaggcg aaagcaaaga cttaattttt
781 gtgcttggct atatagaagt tgccccagaa aacaaatggg aatcaaaggg cgttatcaac
841 aagtctccag ccaaagaact tattgcgcgt ttcgatagcg tagaaaaagt agatgccgag
901 ttaaccaagc tagccgatta ttgggcaaat ttgctttcta cttacagcgt agaaagtggc
961 gacgaaaagc tagaccgcat ggtaaatatt tggaaccaat accagtgtat ggtgacattt
1021 aatatgagtc gctctgcgtc tttcttcgaa tctggcattg gccgtggtat gggcttccgc
1081 gattccaatc aggatttgat aggctttgta caccaagtac ccgagcgcgc ccgcgaacgc
1141 ataattgata ttgcttctac tcagtttgaa gacggttcgg cctaccacca gtatcagcct
1201 ttaaccaaac gcggcaacaa cgcaattggc ggcaacttta acgatgaccc tctttggcta
1261 atcctttcta ccaccgatta cataaaagag actggcgatt tctctatttt agaagagcaa
1321 gtgccttacg ataatgatgc gagcaaagcc acaagtcatt ttgaacattt aaagcgctcg
1381 ttttatcaca cggttaataa tttaggccca catggcttgc cacttattgg tcgcgccgac
1441 tggaacgact gcctaaacct aaactgcttt agtgaagacc ctaacgaatc attccaaacc
1501 acgggcaaca aaaccggcag aacggctgag tcgttaatga ttgcaggttt atttgtttta
1561 tacggcaacg agtttgtaaa actgtgccgt gaaataggcc aagacggaga agcggcagaa
1621 gcccaagccc atattgacca aatggtagaa gctgtgaaaa agcacggctg ggatggcgag
1681 tggtttttgc gtgcttacga ctactacggt aaaaaagtag gcagtaaaga aaacgaagaa
1741 ggcaaaatat ttatcgaatc gcaaggtttc tgcggcatgg caggaatcgg cctagaagac
1801 ggccttgtcg aaaaatcgat ggattctgtt aaagaatggt tagattgcga ttacggtatt
1861 gtgttgcagc aaccggcgtt taccaagtac tacatagagt atggtgaaat ctccacctac
1921 cctgctggct acaaagagaa cgcaggtatc ttctgccaca acaacccgtg gattatgatc
1981 accgaaactt tgcttggccg cggtgacaaa gcctttgaat actaccgcaa aattgcacct
2041 gcatacctag aggaaattag cgatcttcac aaagtagagc cttacgccta ctgccagatg
2101 attgcaggta aagatgccta cttacctggc gagggtaaaa actcatggct aacagggacc
2161 gcttcgtgga acttcgctgc aattactcag tacattttag gcgtaaaacc agactatagc
2221 ggtttagcaa ttaacccttg cataccgtct agctgggatg gctttaaagt tacccgtaag
2281 tatcgcggcg caacctataa catcatcgta accaacccaa cccatgtaag caaaggcgta
2341 aaatcgctca ccctaaatgg caacgctatt gatggctaca tagtgccacc gcaacaagct
2401 ggcaccgtat gtaacgtaga agttacattg ggctaa
LOCUS NZ_AABI02000049 2367bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_48，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000049 REGION：互补链(7846..10212)
VERSION NZ_AABI02000049.1 GI：28878253
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifeifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2367)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029998.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2367
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2367
/gene＝″Mdeg3704″
CDS 1..2367
/gene＝″Mdeg3704″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3459:纤维二糖磷酸化酶″
/protein_id＝″ZP_00068287.1″
/db_xref＝″GI:23030008″
/db_xref＝″COG:COG3459″
/translation＝″MLKAINNGERYQLTSPTAMPQSASFLWNKKMMIQVNCRGYAVAQ
FMQPEPAKYAYAPNLEAKTFMQPEQPYYAHHPGRFFYIKDEETGEIFSAPYEPVRSQL
NNFSFNAGKSDISWHIAALGIEVELCLSLPVDDVVELWELKIKNGGAQPRKLSIYPYF
PVGYMSWMNQSGDYSQTAGGIIASCVTPYQKVADYFKNKDFKDKTFFLHETAPAAWEV
NQKNFEGEGGLHNPNAIQQETLGCGNALYETPTAVLQYRRELAAQEQQTFRFIFGPAF
DESEAIALRNKYLSAEGFAKAKSEYQTYITSGKGCLQINTPDPELNNFVNHWLPRQVF
YHGDVNRLTTDPQTRNYIQDNMGMSYIKPNITRQAFLHALSQQEESGAMPDGILLLEG
AELKYINQIPHTDHCVWLPVCMQAYLDETNDYALLDEIVPYASGEKRETVEQHMHHAM
RWLLQARDERGLSFIAQGDWCDPMNMVGYKGKGVSGWLSVATAYALNLWADVCEQRQQ
NSCANEFRQGAKDINAAVNKHIWDGEWFGRGITDDGVLFGTSKDKEGRIFLNPQSWAI
LGGAADEQKIPCLLDAVEQQLETPYGVMMLAPAFTAMRDDVGRVTQKFPGSAENGSVY
NHAAVFYIFSLLSIGESERAYKLLRQMLPGPDEADLLQRGQLPVFIPNYYRGAYYQHP
RTAGRSSQLFNTGTVSWVYRCLIEGVFGLKGSPQGLVVQPQLPVAWQTAEAVREFRGA
TFNVSYRKSSDIKEMEIQLNESVISGNTISDITAGATYQLTVLLPATH″
ORIGIN
1 atgttaaaag ccattaacaa cggcgaacgc tatcaactca ctagccctac cgctatgccg
61 caaagcgcat cgtttttatg gaataaaaaa atgatgatac aagtaaattg ccgcggctac
121 gccgttgcgc aatttatgca gccagaacca gccaaatacg cttacgcacc caatctggaa
181 gcaaaaacat ttatgcaacc agagcaaccc tattacgcgc atcaccccgg gcgctttttc
241 tatataaaag atgaagagac aggcgagatt ttttcggcac cctacgagcc tgtgcgcagc
301 cagctgaaca actttagctt taacgcaggc aagagcgata taagctggca tattgccgct
361 ttaggcattg aagtagagct atgtcttagc ctgccggtgg acgatgtagt agaattgtgg
421 gaactaaaaa taaaaaacgg cggcgcgcaa cctcgtaaac tcagtattta cccgtacttt
481 cctgtgggtt acatgtcgtg gatgaatcaa tctggtgact acagccaaac cgccggcggc
541 attattgcca gctgcgtaac gccttatcaa aaagtcgccg actactttaa gaataaagac
601 tttaaagata aaacgttctt tcttcacgaa accgccccag cagcatggga agtaaaccag
661 aaaaacttcg aaggcgaagg cgggttgcac aaccccaacg ccatacaaca agaaacgctg
721 ggctgcggca acgcattgta cgaaacgccc acagcggtat tgcaataccg ccgcgaactt
781 gcagcgcaag agcagcaaac ctttcgcttt atttttggcc cagcatttga cgagagcgaa
841 gccattgcac tgcgcaataa gtatttatct gccgaaggtt ttgccaaagc aaaaagcgaa
901 taccaaacct atataacgag cggcaaaggc tgcttgcaaa ttaacacccc agacccagaa
961 ctaaacaact ttgtaaacca ctggctaccg cgccaagtgt tttatcacgg cgatgtaaac
1021 cggttaacca ccgacccgca aacgcgcaat tatattcaag acaatatggg catgagctac
1081 attaagccca acattacgcg gcaggcgttt ttacatgcct taagccagca ggaagaaagc
1141 ggtgcaatgc ccgacggcat tttattgctt gaaggcgccg agcttaaata cataaaccaa
1201 ataccccata ccgatcactg cgtttggctg ccggtgtgta tgcaagccta tttggatgaa
1261 accaatgact acgccctatt agacgaaata gtaccctatg cgagtggcga gaagcgcgaa
1321 actgttgagc aacatatgca tcacgctatg cgctggcttt tgcaagcacg cgacgaacgc
1381 ggcctaagct ttatcgcaca gggcgactgg tgcgacccca tgaacatggt gggctacaag
1441 ggcaaagggg tatccggctg gctttcagtc gctaccgctt atgcattaaa cctgtgggca
1501 gatgtttgcg aacaacggca gcaaaacagt tgcgccaacg aatttagaca gggcgctaaa
1561 gatataaacg cggcggtaaa caagcatatt tgggatggcg aatggtttgg ccgcggcatt
1621 acagatgacg gcgtactgtt tggcaccagc aaagataaag aaggcagaat ttttctaaac
1681 ccacaaagct gggcaatact tggcggcgcc gccgacgaac aaaaaatccc atgcctgcta
1741 gacgcagtag agcaacaact ggaaacccct tacggcgtaa tgatgctggc ccccgcgttt
1801 accgccatgc gcgatgacgt aggccgagtt acccaaaaat tcccaggctc tgcagaaaac
1861 ggctctgttt ataatcacgc ggcggtgttt tatatattta gcttgttatc cattggcgag
1921 agcgaacgcg catataaact gctacgccaa atgctgcctg ggccagatga agccgatctt
1981 ttacagcgcg gccaactgcc agtattcata cctaactatt atcgcggcgc atactaccag
2041 cacccccgca ccgccggtcg ctctagccag ctctttaata cgggtacagt ctcgtgggtt
2101 taccgctgct taattgaagg ggtattcggc ttgaaaggct cgccacaagg cttagttgta
2161 caaccgcaac tgcctgtcgc ctggcaaaca gcagaagccg ttagggaatt tagaggcgca
2221 acgtttaacg tgagctaccg caaaagcagc gatataaaag aaatggaaat acagctaaat
2281 gaatcggtaa taagtggcaa caccatctcc gacatcaccg ccggcgcgac ctatcaatta
2341 accgttctat tacctgccac acactaa
LOCUS NZ_AABI02000007 1725bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_8，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000007 REGION：110169..111893
VERSION NZ_AABI02000007.1 GI：28878295
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1725)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代 gi：23027895.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1725
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1725
/gene＝″Mdeg1780″
CDS 1..1725
/gene＝″Mdeg1780″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3693:β-1，4-木聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00066395.1″
/db_xref＝″GI:23027970″
/db_xref＝″COG:COG3693″
/translation＝″MKKLIKPTLSWVAGVALSLGIAQGAGAQNVQFVGNITTNGSVRN
DFMDYWDQITPENEGKWGSVERSRDNYSWSGQDAAYNFARANGIPFKAHTLVWGSQYP
SWINNLSNAEKAAEIEEWIRDYCNRYPATDIIDVVNEATPGHAPANYARDAFGDNWII
KSFQLARQYCPNATLVLNDYNVLIWNTNDFIAMAQPVINAGVVDALGLQAHGLESLSA
SQLKSTLDRIANLGLPIYISEYDVRSTNDQEQLRIMRDQFPVFYNHPSVRGITLWGYM
VGATWREGTGLIRADGSHRPAMTWLMNYLENNRGGSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSS
SGGPSSLTVELESLSDSSNFSPFSVQSDSSAAGGQYVVWPNNGNQIVSSPSDSASGQI
QVHFTLSQSADVQFQIRADLANGNDDSFYYKLDSGSWNTQNNASTSGWGTLTPATFSN
VSTGSHTLHILRREDGAKLDKVTLNASVGQVSASTGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSG
AAVASCDGVNEYPSWTAKDWSGGDYNHANSGDYMSYQGVLYRANWYTATVPGSDSSWT
RVGDCNFV″
ORIGIN
1 atgaagaagt taattaagcc tacgctatcg tgggttgcag gagttgcttt gtcgctgggt
61 attgcccagg gagctggtgc tcaaaatgtg cagtttgttg gtaatatcac taccaatggt
121 agtgtgcgca acgacttcat ggactactgg gatcagatta ccccagagaa tgaaggcaag
181 tggggctcgg tggagcgcag tcgcgacaac tattcatgga gcggccaaga tgccgcctac
241 aattttgccc gtgccaacgg catcccattt aaagcacata ctttagtatg gggcagtcaa
301 tatcccagct ggataaacaa tttaagtaac gcggaaaaag ccgctgagat tgaagagtgg
361 attcgcgatt actgtaaccg ttacccagcc accgatatta tcgatgttgt caatgaagca
421 acgccgggcc acgcgccagc aaattatgct cgcgatgcat ttggcgacaa ctggataatc
481 aagtccttcc agctggcacg tcagtactgc cccaatgcca cgttagtgtt gaacgactac
541 aacgtactta tttggaacac caatgatttt atagcgatgg cccagccggt aattaacgcc
601 ggagtagtag atgctttggg tttgcaggcc cacggtctgg agagcctttc tgcgtcgcaa
661 ttaaaatcga ctctggatcg tatcgccaat ttgggtttgc caatttatat ctctgaatac
721 gatgttcgca gcaccaatga tcaggagcag ctgcgtatta tgcgtgatca attccctgta
781 ttttacaacc acccaagtgt acgtggcata actttgtggg gttatatggt gggggccacc
841 tggcgagaag gcacaggttt gattcgtgct gatggctccc atcgtccagc gatgacctgg
901 ttgatgaact atctggagaa caatcgtggc ggctcaacct cttcaagtag ttcatcctcc
961 tctagcagtt cgtcttccag tagttcttct tcgggaagtt cctctggtgg cccaagtagt
1021 ttgacggtag agctagaatc tttgtcggat agcagtaact tttcgccatt ctcggtacag
1081 agtgacagca gcgcagcggg cggccagtac gtggtatggc ctaacaacgg caatcagatt
1141 gtaagctcac cctccgatag cgccagcggg caaattcagg tgcactttac cctgtcgcaa
1201 tcggcggatg tgcaatttca gattcgtgca gacctagcta acggcaatga cgactctttt
1261 tattacaagc tggactcagg ctcttggaat actcagaaca acgcttccac gtctggttgg
1321 ggcaccttaa ccccagcaac tttctctaat gtatccacag gatcccatac cttacacatt
1381 ctccgcagag aagatggggc gaaactcgat aaggtaactc tgaatgcttc agttggtcag
1441 gtttccgcta gtacaggcag tagctccagc tcttccagca gctccagttc atccagcagt
1501 tctagttctt caagcagcag cggcgcggca gtcgcaagtt gtgacggtgt taatgaatac
1561 cccagctgga cagcaaaaga ttggtctggg ggtgactata accacgccaa tagcggtgac
1621 tacatgagct atcagggtgt tctatatcga gcaaactggt acaccgcaac tgttcctgga
1681 agtgattctt cctggactcg agttggcgat tgcaattttg tgtaa
LOCUS NZ_AABI02000006 1860bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_6，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000006 REGION：76803..78662
VERSION NZ_AABI02000006.1 GI：28878296
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1860)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027577.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1860
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1860
/gene＝″Mdeg1453″
CDS 1..1860
/gene＝″Mdeg1453″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3693:β-1，4-木聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00066073.1″
/db_xref＝″GI:23027635″
/db_xref＝″COG:COG3693″
/translation＝″MIKLRQSIHGALARTVGIISISTGLVLAAQTASAACEYTVTNSW
GSGFTASIRITNDTGSAVNGWAVNWQYANGNRVTNSWNATLSGNNPYSASNIGWNGGI
QPGQSVEFGFQGTANGAAETPAVTGAVCATGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSTSSSSSSSSSSSSGANCVEMCKWYQDAPRPLCNNQNSGWGWENNQSCIGRATCESQ
PSNAGGVVNSCPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSTSSTSSSSSSSS
GSAANLYTLADFPIGVAVTAGNESRSFLSIAAKEATVKKHFDQITAGNIMKMSYLHPS
ENSYTFSQAD MVNWANSNGVSVHGHTFIWHSDYQVPNWMNNYSGNFASMMDTHVTTI
ADHFEGRVVSWDVVNEAIDESQSSCYRNSLFYQRLGKAYIANAFRAARAADPSVELYY
NDYDTEGGNANKLNCLLQLVDDLQANNVPIDGVGFQMHVQIDWPSTSNIAAAFQAIVD
RGLKVKITELDVPINNPYGSGSFPQYSTYTSQAAALQKARYKSIVKTYLTVVPAHLRG
GLTVWGIWDGDSWLLDFDNRQGADDWPLLFSGPANGPYVEKEAFYGVAEALTE″
gene 互补链(336..488)
/gene＝″Mdeg1454″
CDS 互补链(336..488)
/gene＝″Mdeg1454″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066074.1″
/db_xref＝″GI:23027636″
/translation＝″MLDELLDELELLLELELLDEELELELEELDPVAHTAPVTAGVSA
APLAVP″
gene 互补链(558..869)
/gene＝″Mdeg1455″
CDS 互补链(558..869)
/gene＝″Mdeg1455″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066075.1″
/db_xref＝″GI:23027637″
/translation＝″MGKSAKVYKFAAEPLELELLEEVELVLDELELVDELELLDELEL
LDELELEELEELLELDGQLFTTPPALDGCDSHVARPIQLWLFSQPQPLFWLLHKGRGA
S″
ORIGIN
1 atgatcaagc tacgtcaatc tatccacggc gccttggcgc gtaccgtggg cataataagt
61 ataagcaccg gacttgtact cgcagcgcaa actgcaagtg cagcctgtga atacaccgta
121 accaattcgt ggggttcggg ttttaccgcg agtattcgca taacaaacga taccggtagc
181 gcagtaaacg gttgggcggt taactggcaa tacgctaatg gcaaccgtgt aacaaattca
241 tggaacgcta cgctgtctgg caataaccct tatagcgcca gcaatattgg ttggaacggc
301 ggtattcaac ctgggcagtc ggtggaattt ggttttcaag gcacggctaa tggcgcggca
361 gaaacaccag cggtaacggg ggctgtatgt gctacagggt ctagctcttc cagctcaagc
421 tctagttctt cgtctagcag ctctagttct agcagcagtt cgagttcatc gagtagctcg
481 tctagcactt caagctcgtc atctagcagc tcttccagtt catcgggcgc aaactgtgta
541 gaaatgtgta agtggtatca agatgcgcct cgccctttat gcaataacca aaatagtggt
601 tggggttggg aaaacaacca aagttgtatc ggccgagcaa cgtgcgaatc gcaaccgtct
661 aatgcgggtg gggtggtaaa tagttgtccg tctagttcta gcagctcttc aagttcctct
721 agttcgagct cgtctagcag ttcaagctcg tctagcagtt caagctcgtc tactagttct
781 agttcatcaa gcacaagttc tacttcttca agtagttcta gctctagcgg ttctgctgca
841 aacttatata ccttggcaga tttccccatt ggcgttgctg taactgcggg taatgagagc
901 cgtagctttt tatctattgc tgcgaaagag gcaactgtta aaaaacactt cgaccaaatt
961 acagccggta acattatgaa gatgagttac ttgcacccat ccgaaaatag ctacaccttt
1021 agtcaagcgg atgccatggt taactgggca aatagcaacg gcgtaagtgt gcacggccat
1081 acttttattt ggcattccga ttaccaagta ccaaattgga tgaataatta cagcggtaat
1141 tttgcgtcta tgatggatac ccacgtaacc actattgccg atcattttga aggccgagta
1201 gtaagctggg atgtggtaaa cgaagctatc gatgagagcc aatctagttg ttatcgcaac
1261 tctttgtttt accagcgttt aggtaaagct tatattgcca atgcgttccg cgcggcccga
1321 gcagcagacc ctagcgtaga gttgtattac aacgattacg ataccgaagg tggcaatgcc
1381 aataagttaa attgcttgtt gcaattagtc gatgacttgc aagcgaacaa tgtgcctatc
1441 gatggtgtgg gctttcaaat gcacgtgcaa attgattggc ccagcaccag caatattgct
1501 gcggctttcc aagctattgt ggatcgcggc ttaaaggtaa aaattactga gctggatgtg
1561 cctattaata acccttatgg cagtggttca ttcccgcaat attcaactta cacgtcacaa
1621 gccgctgcgt tgcaaaaggc gcgttataaa tccattgtaa aaacctactt gactgttgtg
1681 ccagcgcatt tgcgcggggg cttaaccgta tggggtatat gggatggtga tagctggttg
1741 ttagattttg ataatcgtca aggcgctgat gattggccgc tattatttag tggcccagct
1801 aatggcccct atgtagaaaa agaagcattc tatggcgtgg cagaggcgct tacagaatag
LOCUS NZ_AABI02000001 1413bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：互补链(468091..469503)
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1413)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至N ational Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1413
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1413
/gene＝″Mdeg0345″
CDS 1..1413
/gene＝″Mdeg0345″
/codon_start＝1
/transl_table＝ll
/product＝″COG3693:β-1，4-木聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00064983.1″
/db_xref＝″GI:23026497″
/db_xref＝″COG:COG3693″
/translation＝″MNCTRRNIVKAGLLGSAFVALPAVARALPGLATKFRDQFYVGTA
VSARSLNTPSGAFAATVAHQFNALTAENAMKPALLQPQMGEWRWQDADAIVRFAEQHQ
MLMHGHTLVWHSQTPDWFFQNKQGEPADKATLYRRQEEYINAVVGRYKGRVHSWDVVN
EAEDEGKGWRKSHWYNICGPEFMERAFRLAHAADPKAHLCYNDYNMHLPQKREFLVKL
FKDYIKRGVPIHGVGLQGHVGLDYPSLDELEKTIVAMADLGLKVHITELDVDVLPAPW
QLASADISTKFEYDKSLNPYVDGLXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXTMYKMRLPAKILA″
ORIGIN
1 gtgaattgta cgcgtaggaa tatagtaaaa gcaggccttc ttggctcggc attcgtcgcc
61 ctgcctgccg tggcgcgcgc gctgcctgga ttggccacga aatttcgcga tcagttttac
121 gtgggcactg cggttagtgc gcgctcactt aatacgccca gcggcgcgtt tgcagccact
181 gtcgcgcatc aattcaatgc actaaccgct gaaaacgcca tgaagcccgc cttacttcaa
241 ccacaaatgg gggagtggcg ctggcaggat gccgatgcca ttgtgagatt tgccgagcag
301 catcagatgc taatgcatgg tcacaccctt gtgtggcatt cgcaaacgcc agattggttc
361 ttccaaaaca agcagggcga accggcagac aaagcaaccc tataccgcag gcaagaggag
421 tatatcaatg ccgtagttgg gcgctataaa gggcgggtac actcgtggga tgtggtgaat
481 gaagcagaag atgagggtaa aggctggcgc aagagccact ggtataacat ttgtgggcca
541 gagtttatgg aacgagcctt tcgcttagct cacgcagcgg acccaaaagc acacttatgt
601 tacaacgatt acaatatgca cttgccgcaa aagcgcgaat ttttggttaa gttattcaaa
661 gactacatta agcgcggcgt gcctattcac ggcgtagggt tgcaggggca tgtgggctta
721 gactacccct cgctggacga gttggaaaaa accatcgtgg ccatggccga tttaggtcta
781 aaagtacaca ttacagaatt ggatgtagat gtattacccg cgccatggca actagctagc
841 gcagatataa gtactaaatt cgagtacgac aaaagcttaa acccgtacgt tgatggtttg
901 cnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn
961 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn
1021 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn
1081 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn
1141 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn
1201 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn
1261 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn
1321 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnt gactatgtac
1381 aaaatgcgct tgcccgcgaa aatattagct taa
LOCUS NZ_AABI02000016 3561bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbfer degradans 2-40Mdeg_16，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000016 REGION：34542..38102
VERSION NZ_AABI02000016.1 GI：28878286
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-3561)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028824.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..3561
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..3561
/gene＝″Mdeg2637″
CDS 1..3561
/gene＝″Mdeg2637″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3693:β-1，4-木聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00067229.1″
/db_xref＝″GI:23028853″
/db_xref＝″COG:COG3693″
/translation＝″MLRSTQSTPIVKRKISAYVGWGLCVLLSVCTASISWAGNPIVSH
VYTADPAARVINGRAYVMVTHDQDNQNDYGGLIDYYLFSSDDMVNWQDHGIVWNSRTD
SSWASLAYAPDFIERNGKYYLYFPNGANSIGVAVADSPEGPYTDPLGRPLVDRNTPNA
NVDWLFDPGVFIDDDGQAFLYFGGGADGTARVIRLNNDMISTSGAAISIDVPNFFEAL
YMHKRNGIYYLSYSTNPSAGMSIDYMTSNNPTSGFTHRGTILPNPWENNSNNNHQSII
EFNNEWYIFYHNRAVANTRGDSTFSRSINVDRLYYNSDGSIREVNASSIGVPAVRNVN
AFSINQAETFDQEGGIETEPSSEGTLNIQMGPGDWVKVANVDFGNGATQFNARVASAI
DNSKLEIILGSLSNTPHASLEITNTGGWQNWQTQSTSFNAITGVHDVYLRGTSGHNLN
WFEFEGENNGGSSQLTVELEDLASQSLFAPLSVRSDNMANNGAYIEWSNDGSNQILSV
ASEQSQGQISVPFTLSQASDVEFNVRVNLANGNDDSFYYKLNSNSWQTFNNQATTGWQ
VLTPNTFTGLSPGNHILTLLRREDGAKLDTLTLVASAGSIQTNNSSSSSTSSSSSTTS
SSSTSSSSSSGAAPTGNVTYSINVTNDWQSGYCAELTVTNNTNNALQWQASVSMSDSV
DSMWNASWSQSGNILNVSGVEWNNTLQAGQSQSGIGFCATRASSSSSSSTTSSTSGST
SSSSSSGGYTVPSNNFAVNGGVENNLQSWGATAGSVTRSTEQRYSGNASARITNRAEN
WHGLTFSVGELTQGNLYEVAVWVKLAAGSADTPITLTAKRQNDSDDSTYNEYTGIVTT
IANDSEWVLLHGQYTQTGTAFEHFIIESESDSVSFYADEFSIGGEVTPKNEVGFFVGN
ITTNGNVRNDFTQYWDQLTPENEGKWGSVERTRDVYDWSGLDRAYNYAKQNNIPFKQH
TMVWGS QQPNWID SLSPAEQAAEIEEWIRDYCARYPDTEMIDVVNEATLGHAPANYAA
SAFGNNWIIRSFELTRQYCPNSILILNDYNVLSWNTQEFIQMATPAVNAGVVDAIGLQ
AHGLADWSLSDLETKLNQVAALGLPIYISEYDIEKTNDQEQLRVMQTQFPLFYNHPSV
KGITIWGYVVGATWRDGTGLLHSNGTPRPALTWLMDYLNR″
ORIGIN
1 atgttgcgaa gcacccaatc aacacccatt gttaagcgaa agatttctgc ctatgtaggt
61 tggggtctgt gcgtgttact tagcgtctgc acggcctcga tctcttgggc aggtaaccct
121 attgtgtctc atgtatatac cgcagaccct gctgcacggg taataaacgg aagagcctat
181 gtaatggtta cccacgatca ggataaccaa aatgattacg gtggtttgat tgattactac
241 ctgttctcat cggacgatat ggttaattgg caagatcacg gtattgtgtg gaattctcga
301 acagacagta gttgggccag tcttgcttac gccccagatt ttatcgagcg caatggaaag
361 tactacctgt actttcccaa cggcgcaaac tctattggtg tcgctgtggc cgatagccct
421 gagggcccct atactgatcc actcggtagg ccgctggttg accgcaatac ccccaatgcc
481 aatgttgact ggctgttcga tcccggtgta tttattgatg acgacggaca agcctttttg
541 tactttggtg gaggcgctga tggaaccgcg cgcgttattc gtttaaataa cgacatgata
601 agtaccagtg gtgcagccat aagtattgac gtacctaact tctttgaagc gctatacatg
661 cataagcgca acggcattta ctacttatcc tactcgacca accccagcgc ggggatgagc
721 atagattaca tgacgagtaa taaccctacc tcagggttca cccatcgcgg caccattttg
781 cccaaccctt gggaaaataa ttccaataac aaccaccagt caattattga atttaataac
841 gaatggtaca ttttttacca caatagagct gtcgcaaata cgcggggcga tagtaccttt
901 tcccgctcta ttaacgtgga tcgtctttac tacaattccg acggcagtat tcgagaagta
961 aatgccagtt caataggtgt acccgcggta cgtaatgtta atgctttttc cataaaccaa
1021 gcagaaacat tcgatcaaga aggtggcata gaaactgagc cgtcttctga aggtaccttg
1081 aatattcaga tgggcccagg agattgggta aaagttgcta acgtcgattt tggtaacggc
1141 gccacacaat ttaacgctcg agttgctagc gcaatcgata attcaaagct ggaaattatt
1201 ttaggcagtc tcagtaatac cccgcatgcc tcgctcgaaa ttaccaacac aggcgggtgg
1261 caaaattggc aaacacaaag cacaagtttt aatgcaataa ctggtgttca cgatgtatac
1321 ctgcgcggta cttctgggca caacctaaat tggtttgaat ttgaaggcga aaataatgga
1381 ggaagcagtc agctaacggt tgagttggaa gacttggctt cgcaatctct ttttgctccc
1441 cttagcgtac gctccgataa catggctaat aacggcgctt acattgaatg gagtaatgat
1501 gggagcaatc agattctcag tgtggccagc gagcaatcgc aaggccaaat cagtgtccca
1561 tttactctat cgcaagcttc cgatgtcgaa tttaacgtac gcgtgaatct tgctaatggc
1621 aatgatgatt cgttttatta caagctaaac agtaatagct ggcagacttt taataatcaa
1681 gctaccactg gttggcaggt gctcacgccc aacaccttca ctggtcttag ccctgggaat
1741 cacattctta ctctacttcg gcgtgaagat ggcgccaaat tagataccct cacgttggta
1801 gcctccgcgg gcagtattca aaccaataac agctcatcaa gttctacctc cagcagtagt
1861 tcaacgacta gctcaagttc aaccagctcg agtagttcct ctggcgccgc gccaactggt
1921 aacgttactt actctataaa tgttactaac gactggcaaa gtggttattg tgcggagctt
1981 accgttacca ataacacgaa caacgctctg cagtggcaag ctagtgtttc tatgagcgat
2041 agtgtcgaca gtatgtggaa tgctagctgg tcgcagagcg ggaacatact taacgtaagc
2101 ggggtagagt ggaataatac gttgcaagca gggcaaagcc agagtggcat aggattttgt
2161 gctacacgtg ccagctcgtc ttcctccagc tctacaacaa gttctacttc cggttccaca
2221 tcaagctcta gttcatcggg aggctatacc gttccgagta ataatttcgc agtcaatggt
2281 ggtgtagaaa acaacctgca gagctggggc gcaacggcgg gttcagtaac acgttctact
2341 gaacaacgtt atagcggaaa cgcaagcgcg cgtataacaa atcgagcaga aaactggcac
2401 ggtttgacgt tcagtgttgg tgagcttacg caaggcaacc tgtacgaagt tgcggtgtgg
2461 gtaaaacttg cggcaggcag tgcggacaca cctattacgc ttaccgccaa acgacaaaat
2521 gatagcgacg attccactta taacgaatat accggcatag tcacgaccat tgctaacgat
2581 tctgaatggg tgctgctgca cgggcaatac actcaaactg gcacagcgtt tgagcatttt
2641 attatcgagt cagaaagcga tagcgtaagt ttttatgccg atgagttttc tattggtgga
2701 gaggtcacgc ccaaaaacga agtgggattt tttgtgggta acattaccac taatggcaat
2761 gtgcgcaatg attttactca gtactgggat caactaacac cagaaaatga aggaaagtgg
2821 ggttcggtag aacgcactcg tgatgtgtat gattggagtg gactagacag agcctataac
2881 tacgccaaac aaaataatat tccgtttaaa cagcatacta tggtgtgggg tagccaacag
2941 cccaactgga ttgattcgct cagcccagca gaacaggctg cagagataga ggagtggata
3001 agagattatt gtgcgcgcta tcctgatact gaaatgattg atgtggtaaa cgaagcaacg
3061 ctgggccatg ctcctgctaa ctacgcggcg agtgcgtttg gcaataattg gatcattcgt
3121 tcgttcgagc ttactcgtca atattgtcct aacagcattt taatattgaa cgattacaat
3181 gttttaagtt ggaacactca agagtttatc cagatggcta ctccggctgt caatgcaggc
3241 gttgtagatg caattggatt acaagcacac ggcttagcgg attggtcttt aagtgattta
3301 gaaaccaaac taaaccaggt tgcggcattg ggtttaccca tttatatatc cgaatacgat
3361 atagaaaaaa ctaacgacca agaacagctg cgcgtaatgc aaactcagtt cccgctgttt
3421 tataaccatc catcggtgaa aggcattact atttgggggt atgttgttgg ggctacttgg
3481 cgcgatggga cgggattgtt gcacagtaac ggaacaccca gaccggcact tacttggtta
3541 atggattact tgaatagata g
LOCUS NZ_AABI02000019 2013bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_19，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000019 REGION：互补链(13709..15721)
VERSION NZ_AABI02000019.1 GI：28878283
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2013)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029085.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2013
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2013
/gene＝″Mdeg2869″
CDS 1..2013
/gene＝″Mdeg2869″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3693:β-1，4-木聚糖酶″
/proteinid＝″ZP_00067456.1″
/db_xref＝″GI:23029095″
/db_xref＝″COG:COG3693″
/translation＝″MVIITMKAGLLLRILLTVLALNMLAACGGSSSNTKEPVTQPEPE
PEQQPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEMEPQPEPQAPPAGGVSIIDTNPNNAS
FWAGSNNGDVGSRAVIDVDHPEFSQATRITVSNPASDYWNGQLSFPLNASVAAGDVVL
VRLYMRSVENTYESGASFTTVFIEDNIDFTKFLNREITAAQDWVEYYLPAEITDNHAT
GEVGLRIGFGAGPRAQVFDIGGVELLHYTNTDISAMPSTRPSYEGREPDAAWRTAAAE
RIEQHRKGDFELTVVDDGNPIANATIDVDFQKHAYHFGSVTVGHLLMGTSEDSAIYRE
KVLELFNQSGPENDLKWGPWEGEWGNNFNQTQTLNGLQWLRDNGLYTRGHVMVWPSKR
NLPNLMQQYLPEGDPASANPEAKQVVLDHIDDIATATANYLDEWDVLNEPYDNHYLMD
AFGDSVMVDWFNRARTNLPAHGLYINDYSILSAGGRNFAHQEHYTNTIQYLVDNNAPI
TGIGLQSHFGDSPTAITRIYEIIDQYSTAFPQLDIRATEFDVSTTDEDLQADFTRDFL
TIFFSHPKTVGVQLWGFWANAHWYPNAALYDADWREKPNALAWKEQIFNEWWNDFDGT
TNAQGKFDERGFYGDYQVTVTVGEEQQIFTFSLVKGGEQNFSFEWQ″
ORIGIN
1 atggtcataa taactatgaa agccggttta cttctacgca tcctattaac tgtactcgcg
61 ctcaatatgc ttgccgcatg tggcggtagt tctagcaata ccaaagaacc cgttacccag
121 ccggaaccag agccagagca gcagccagaa ccagaaccag agccagagcc agagccagag
181 ccagaaccag agccagaacc agagccagaa ccagagccag agcctgaaat ggaaccgcag
241 ccagagccac aagcgccgcc tgcaggtggt gtatctatca ttgataccaa ccccaacaat
301 gcatcgtttt gggcaggctc aaacaatggt gatgtgggca gtagggctgt tatagatgtc
361 gatcaccccg aatttagcca agcgacgcgc ataaccgtaa gcaaccccgc tagcgactat
421 tggaatggtc agctctcctt cccgcttaat gcgagtgtgg cggcggggga tgtagtatta
481 gtgcgtttgt acatgcgctc ggtggagaat acttacgaat cgggtgctag ttttactacc
541 gtatttattg aagacaacat cgactttact aaatttttaa accgcgaaat aaccgccgcg
601 caagattggg tagagtatta cctacccgca gaaattaccg ataaccatgc aaccggtgaa
661 gtgggcttgc gcattggctt tggcgctggc cctagggcgc aggtgtttga tattggcggt
721 gtagagctat tgcattacac caatactgat ataagcgcta tgcctagtac acgcccaagt
781 tacgaaggcc gcgagccaga tgccgcatgg cgtacagcgg cggcagagcg aattgagcag
841 caccgcaaag gcgactttga gctaacagta gtggacgatg gcaaccctat cgccaatgcc
901 accatagatg tagattttca aaaacacgcc tatcattttg gctcggtaac tgttggccat
961 ctattgatgg gcaccagtga agatagcgcc atttaccgcg aaaaagtgct cgagctattt
1021 aaccaaagtg gcccagaaaa cgatttaaag tggggcccat gggaaggcga gtggggcaac
1081 aattttaacc aaactcaaac cctaaacggc ttgcagtggc tgcgcgataa cggcctgtac
1141 acacgtggcc atgtaatggt ttggccttct aagcgcaact tgccaaactt aatgcagcaa
1201 tatttaccag aaggcgaccc cgccagcgcc aacccagaag caaaacaagt ggtgctggat
1261 cacatcgatg atatagcaac cgcaacagct aattatttag atgagtggga tgtactaaac
1321 gagccttacg acaaccacta tttaatggat gcctttggcg atagtgtaat ggtggattgg
1381 tttaatcgcg cgcgtactaa cctgcctgcg cacggtttgt acataaacga ttacagtatt
1441 ttatctgcgg gcgggcgcaa ttttgctcac caagaacact acaccaacac gattcaatat
1501 ttggtcgata acaacgcacc catcaccggt ataggtttgc aaagtcactt tggcgactcg
1561 cctacagcca ttacgcgtat ttacgaaatt attgatcaat acagtaccgc gtttccgcag
1621 ttagatattc gcgcaacgga atttgacgta agtacaacag atgaagacct gcaggcagat
1681 tttacccgcg acttcttaac gatattcttt agccacccta aaacagtggg tgtgcagttg
1741 tggggttttt gggcaaatgc acattggtac cctaatgcag cgctttatga tgccgattgg
1801 cgagaaaagc ccaatgcact agcttggaaa gagcaaattt ttaacgagtg gtggaacgac
1861 tttgacggca cgaccaacgc acagggtaaa tttgatgaac gcggttttta cggcgattac
1921 caagtaactg taaccgtagg tgaagagcag caaattttta cctttagcct agttaaaggc
1981 ggcgaacaaa actttagttt tgagtggcaa tag
LOCUS NZ_AABI02000014 828bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbfer degradans 2-40Mdeg_13，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000014 REGION：互补链(14092..14919)
VERSION NZ_AABI02000014.1 GI：28878288
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-828)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028504.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..828
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..828
/gene＝″Mdeg2305″
CDS 1..828
/gene＝″Mdeg2305″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066908.1″
/db_xref＝″GI:23028515″
/translation＝″MNIKTFFPALIASVFLLINASTGYAASITKTLCNPADSDNGYGA
GTFNGKFYSWFELSQEDITDCDTKIGFYNETNRHFRVEWNVAQSWGEDAIGGMGWSSG
SRDRKIGYNVGQLTTNSSIQKALVAMYGWSCSTSGGNQISQEYYVVDTWDGGKFVPWD
ENANNGNGAPAQSVGTVSANGATYDVYKVRRNGAQYCFNGSSRSFDQFWSVRRTPRAI
NGNRNMDFRPHANRWDNSDLGFKVDGLSSGYQILAVEIFGDANLRHKGAADITLWPR″
ORIGIN
1 atgaacataa aaacattctt ccccgcactt attgcaagtg tatttttatt aattaacgcc
61 agcactggct atgcagcaag cattaccaaa acgctttgca acccagccga ttccgataac
121 ggctacggtg caggaacctt caatggcaaa ttttattctt ggtttgagtt aagccaagaa
181 gacattaccg attgcgatac aaaaattggt ttttacaacg aaaccaatcg acactttagg
241 gtggagtgga atgttgctca atcttgggga gaagatgcaa ttggtggaat gggttggagc
301 tctggctcga gagatagaaa aataggttac aacgttggcc aacttacaac taattcttct
361 attcaaaaag cattggttgc tatgtatggc tggtcttgct ctaccagtgg tggcaaccaa
421 atatcacaag aatattatgt agtggataca tgggacggcg gcaagtttgt gccttgggat
481 gaaaacgcaa ataatggcaa cggtgctcca gcacagagtg taggaacagt tagcgctaat
541 ggtgcaacat acgatgttta taaggttcgc cgcaacggtg cgcaatattg ttttaatggc
601 agcagccgct cgtttgatca gttttggagt gtgcgtagaa cgcctagagc gattaacggc
661 aaccgtaata tggattttcg cccgcacgcc aaccgctggg acaacagtga cctaggtttt
721 aaagttgacg ggttaagcag cggttaccaa attttagcgg ttgaaatatt tggtgatgcg
781 aacctaagac ataaaggtgc agcagatatt actttatggc cacgctaa
LOCUS NZ_AABI02000010 2304bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_14，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000010 REGION：110928..113231
VERSION NZ_AABI02000010.1GI：28878292
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2304)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028613.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2304
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2304
/gene＝″Mdeg2474″
CDS 1..2304
/gene＝″Mdeg2474″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG0726:预测的木聚糖酶/壳多糖去乙酰化酶″
/protein id＝″ZP_00067071.1″
/db_xref＝″GI:23028683″
/db_xref＝″COG:COG0726″
/translation＝″MKSINVCGRRLKQALAAIATAAATLWFTPVDAQTLTSNQTGTHG
GYYYSFWTDSAGTVSMTLGNGGNYSSSWSNTGNWVGGKGWQTGGRKTVNYSGTFNPSG
NGYLTLYGWTQNPLIEYYIIESWGTYRPGESGTYYGTVNTDGGTYDIYRTQRVNQPSI
EGTATFYQYWSVRQQKRVGGTITTGNHFDAWASHGLNLGTHNYMVMATEGYQSSGNSN
ITVSEGSGSSSTSSSSSSTGGPSGTNIVVRAQGVSGQEHINLIIGGNVVADWTLSTSM
QDYTYTGNAAGDLQVEYDNDASGRDVELDYVYVNGEIRQAEDMEYNTATYSGECGGGS
YSQTMHCSGVIGFGDTSDCFSGNCNGASSTSSSSSSSSTSSSTSSGGNNNSGITVRAR
GTNGDEHINLIVGGNIVGNWTLTTSNQNYVYNGNASGDVEVQFDNDANGRDVILDYVI
VNGETRQAEDMEYNTATYSGSCGGGSYSETMHCSGEIGFGHTDDCFSGNCTSSSGTTG
SSGGTSSNNGTSSCNGYVGITFDDGPGNNTATLINLLQQNNLTPVTWFNTGQNIAANT
GQFAQQKSVGEIQNHSYTHSHMLNWSYQQVRDELASTNQAIVNAGGATPTLFRPPYGE
TNSTINQAAQDLGLRVITWDVDSRDWDGASASALANSANQLQNGQVILMHDASYNNTN
GAISQFAANLRARGLCAGKIDPSTGRAVAPSTNTGGNTGSNTGNGGNGGMCNWYGTSI
PLCQTTNDGWGWENSQSCVSQNTCNSQ″
ORIGIN
1 atgaagtcaa tcaatgtatg cggcagacgc ctcaagcaag ccctcgcagc aatagcaacc
61 gctgcagcaa ctctctggtt tacgccagtg gatgcacaaa ccttaacctc aaaccaaact
121 ggtactcatg gtggttacta ctattccttc tggaccgaca gtgctggcac tgtttctatg
181 acactcggca atggcggcaa ttacagttca tcgtggagca ataccggtaa ctgggtggga
241 ggtaaaggct ggcaaacggg gggacgcaaa accgtaaact attccggtac gtttaacccc
301 tcgggcaatg gttatttaac cctctacggt tggacccaaa acccactcat tgaatactac
361 atcattgaaa gctggggcac ctatcgccca ggtgaaagcg gaacctacta cggcaccgtc
421 aacaccgatg gcggcactta cgatatttat cgcacccaac gcgttaacca accgtcaatt
481 gaaggcactg caacgtttta tcagtactgg agtgttaggc aacaaaaacg cgtaggcggc
541 accataacaa ccggcaacca ttttgatgcg tgggcgagtc atggccttaa cctaggcaca
601 cacaattaca tggtaatggc caccgaaggt tatcaaagta gcggcaactc caatattacc
661 gttagcgaag gcagcggttc gagcagtact agttcgagta gctctagcac cggtggccca
721 agtggtacca atattgttgt gcgcgcacaa ggtgtaagcg gccaagaaca tatcaattta
781 attattggcg gtaacgtagt ggcagactgg acgctttcaa ccagcatgca agattacacc
841 tacaccggta atgccgcagg cgacctgcaa gtagaatacg acaacgatgc tagtggtcgc
901 gatgtagagc tagactatgt gtatgtgaat ggcgaaattc gtcaagcaga agacatggaa
961 tacaacaccg caacttacag tggtgaatgt ggtggcggtt cctattcgca aaccatgcac
1021 tgcagcggtg taattggctt tggcgatacc agtgattgtt ttagcggcaa ctgtaatggt
1081 gcatcttcta caagttctag ttcgtctagt agctcaacca gctctagcac aagctctggc
1141 ggtaacaata acagcggcat tactgttcgc gcacgcggta ccaatggcga tgaacatatc
1201 aaccttattg ttggcggcaa tatagtaggc aattggacgc tcaccaccag caaccaaaat
1261 tatgtttaca acggcaatgc atctggtgat gtagaagtac aattcgacaa cgatgccaac
1321 ggtcgcgatg ttattctcga ttacgtaata gtaaatggcg aaactcgcca agcggaagat
1381 atggaataca acacggcgac ctacagcggt tcctgtggtg gtggctccta ttcggaaaca
1441 atgcactgca gcggcgaaat tggttttggt cacaccgacg attgctttag tggaaattgc
1501 actagcagca gcggcacaac cggtagctct ggaggaacat caagcaataa cggtacaagt
1561 agctgtaacg gttatgtagg tattaccttc gatgatggcc caggcaataa caccgctaca
1621 ttaataaact tactacaaca aaataactta accccagtaa cttggtttaa cacaggccaa
1681 aatattgctg ccaatacagg tcagtttgcc cagcaaaaaa gtgttggtga aattcaaaac
1741 cacagctaca cccattccca tatgcttaat tggagctatc aacaagttcg cgacgaactc
1801 gccagcacca atcaagctat tgtgaatgct gggggcgcaa cgccaactct attccgtccg
1861 ccttatggcg aaacaaactc caccattaat caagcggcac aagatttagg cctgcgcgta
1921 ataacctggg atgtagattc gcgcgattgg gatggcgcaa gcgcttcagc tattgccaac
1981 tcggctaatc agttgcaaaa cggccaagta attttgatgc acgatgccag ctacaacaat
2041 accaacggag ccatatcaca atttgcagcc aatctaagag caagagggct atgtgcaggt
2101 aaaatagacc caagcactgg ccgcgcagtt gcaccaagca caaataccgg cggcaacact
2161 ggcagcaata caggaaatgg cggtaatggc ggcatgtgta actggtacgg caccagcatt
2221 ccattatgcc aaactaccaa cgacggttgg ggctgggaaa actcacaaag ctgcgtttcg
2281 caaaatacct gtaactcaca ataa
LOCUS NZ_AABI02000001 1083bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：互补链(131880..132962)
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1083)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nln.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1083
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
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/strain＝″2-40″
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LISSALSKGKHSVEIYKRTEGEEGATLFKGLWLADDSYLLKPPKRPKRRIEIYGDSIT
SGMGNEGADNGADHLGSEKNNYLAYGAITARNLNAELHTISQSGIGVMVSWFPFIMPQ
FYNQLSAVGNNDSIWDFKQWTPHVVVINLMQNDSWLIDREKRLTPIPADAQRIAHYQA
FVQSIRAEYPKAQIICALGSMDATANEKWPNYVREAVKNMQDNGDNKIDTIFFEYIGY
GQHPRVAQHNANADKLTKFIKKKMKW″
ORIGIN
1 atgtgcctaa aaataaaccg gtgctgggtg tttgtttggt tgtgtatttg cgcaactact
61 gcccatagtg aaacctacgt acccgcagat aacgaccaat acctttatac cggccgtata
121 gattttagcg atataaaagc accctcgcta agctggcccg gcacaagtat aaaagccaac
181 tttaccggcg aacatttaga ggtagtgtta gacgatcaaa acggtaagaa tttttttaat
241 gtgattatcg acggtaacga tcgatttcct tatgtgctag aagctaaaca aggtgagcat
301 cgatatttaa tttcttctgc gctaagcaag ggcaagcaca gcgtagaaat ttataaacgt
361 acagaaggcg aagagggcgc aacgctattt aaagggcttt ggttagccga tgatagttat
421 ttattaaaac cccctaaacg cccaaaacgc agaatagaaa tttatggtga ctcaattaca
481 agcggtatgg gtaacgaagg cgcagataac ggcgccgacc atttgggctc cgaaaaaaat
541 aattaccttg cctatggggc tattaccgca cgcaatttaa acgccgagct acataccatt
601 tcgcaaagcg gtattggggt aatggtaagt tggtttccgt ttattatgcc gcagttttac
661 aaccagctaa gtgctgttgg taataatgat tccatatggg actttaaaca atggacgccc
721 catgtagttg taataaacct aatgcaaaac gatagctggc taatagatag agaaaagcgc
781 cttacgccaa ttcctgcaga tgcacaacgc atagcccatt atcaagcgtt tgtgcaaagc
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1081 tag
LOCUS NZ_AABI02000001 2922bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：互补链(296895..299816)
VERSION NZ_AABI02000001.1GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2922)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2922
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
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/gene＝″Mdeg0224″
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KGTEVYDSMVWYTKTRYRLMPYIYSLVGDAHHKDGTFMRALVMDFPSDLNVRDINDQY
MFGPALLVNPVSEFKARSRDVYLPAGADWYDFYTGVKHTGGKTIKADAPLAKMPIFVK
AGSIIPTGVEIQHVYDKPDAPYTLNVYTGANGSFEIYEDDGKTYAYEQGAWARIPVSY
NDKTGELTIGDRVGSFEGMTKEREFRVRWISAKRDDAANFDTGVAKAVTYTGKAITIK
R″
ORIGIN
1 gtgaattatt atttaaacaa aaagcgactg gggcaattgc tcaccggcgc ggccattatt
61 cccgtgctat atgcatgtgg ctcacaggaa aaaaacgtag agcctgcaac ggttaattgg
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361 actggtgttg taagttttaa agatgagcac ggcaaggtgc ttacaacaga agttgatcgc
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601 ataccttatg ttgtatcaag caaagattac gcgctgctat ggaacaatac ctcaatttct
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961 ttgaatggcg agttagtgtt agatcgctgg cgtatgaact ggaacccttg gtatcacaac
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1081 ggtggttata tgcgcataaa acagcataaa ccactgccgg tagcagagca gggacgtttg
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1261 gtgtttggtt tttggcaaag ccgcgagcgc tataaaacac aagatgaaat tatcgacgcc
1321 ttgcaagaat accgcgatcg taaaattcct atcgataaca ttgtattaga ttggagttat
1381 tggcctcagg atgcatgggg tagtcatgat ttcgacgagc aatttttccc cgacccatct
1441 gcactagtag ataaagtaca cgagctaaac ggcaatatta tgatttccgt atggcctaag
1501 ttttacccta caaccgacaa ctacaaagcg ctaaacgcta aaggttgtat gtttaataaa
1561 aacatcgagc agaaaaacct cgattggatt ggcgagggtt acctaaatgg cttttacgat
1621 gcctataacc cagagtgccg tgaaatgttt tgggcgcaaa ttcgcgataa gatcaatgtg
1681 cacggtttcg atgcttggtg gttagatgcg gtagagccag atatccattc caacctttct
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1861 gacaagcgcg catttattct aacgcgttct gggtttgccg gtattcagcg caccggttcg
1921 gctatttgga gtggcgatgt ggtatcgcgc tggtccgact taaaagaaca aattgcagca
1981 ggtgtgggcg tgggcatttc tggtatgccg tattggacgt tcgatatcgg tggctttact
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2281 ccttatattt attcgttagt tggcgatgct caccacaaag acggcacctt tatgcgcgct
2341 ctggtgatgg atttccctag cgaccttaat gtgcgcgata ttaacgacca gtatatgttt
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2521 accattaagg ccgatgcacc gcttgccaaa atgcctattt ttgttaaggc cggctctatt
2581 attccaacag gtgtagaaat ccagcatgtg tacgataagc ccgatgctcc ttacaccctt
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2881 gccgttacct atacgggtaa ggcaataacc attaagcgct aa
LOCUS NZ_AABI02000024 2682bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_22，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000024 REGION：互补链(16977..19658)
VERSION NZ_AABI02000024.1GI：28878278
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2682)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029266.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2682
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2682
/gene＝″Mdeg3040″
CDS 1..2682
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/codon_start＝1
/transl_table＝11
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/protein_id＝″ZP_00067626.1″
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FRDPRWGRGQETYGEDPFLTGRMAINFVKGIQGENDNSDYLKAVATIKHYAVHSGPEK
TRHSDDYHPTRKDLFETYLPAFRMAIAETNVQSLMCAYNRVDGAPACGNNELMQEILR
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HYALQQGLITEDYIDIAVKRLFKARIKLGMFDEQDRVPYSEIGMDVVGSPKHLALTQE
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DTFSATPALNRIDADINFSWPVSPIDNSLDDEFSAVWTGILKPKKSGSYRFSGTVALA
INGKPVNGAVNLKAGESYNIKAIFGVQKWWPVNAIHPYGKLTWLDESRDLEEEALAAA
RKADVIIFMGGIDAHLEGEEMPLELDGFTHGDRTHINLPKVQTNLLKQLKATGKPVVM
VNFSGSAMALNWESEKLDAILQAFYPGEATGTALANILWGDVSPSGRLPVTFYKGVDD
LPAFNDYHMENRTYKFYRGEPLYAFGHGLGYVDFAYNNLVVANTAEAGKALPIAVSVT
NTGKMQAEDVAQVYISLLDAPANTPIRDLKAFKRTKLAAGESTELEFNLPARVLTYID
DNGKTQTYTGRVEVTVGSGQKGYVKENAIAVATINVQ″
ORIGIN
1 atgaataaac actttttagt aggtgtaatt acgttagggg taattctgca ggggctaact
61 gcatgtagca aaagcgctgc acctaatgcc aatcaaccgc aagataccgc agctagtacg
121 gctacctacc cgtttaggga tgcaagctta agtgtagatg cccgcgtaga cgacttggta
181 tcgcgtttaa ccacaaccga aaaaattgcc caaatgttta acgatacgcc cgcaatcgag
241 cgattgggta ttcccgccta caattggtgg aacgaatcgt tgcacggtgt ggcccgtgcg
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361 atgttgcgcg tggctacttc tatttctgat gaggggcgcg ctaagtatca cgacttccta
421 tcgaaagacg tgcgcaccat atacggcggg cttacctttt ggtcgccaaa tattaatatc
481 ttccgcgacc cgcgttgggg cagggggcaa gaaacctacg gtgaagaccc gttcttaacg
541 gggcgtatgg ccattaattt tgttaagggt attcaaggcg aaaacgacaa cagcgattac
601 ctaaaagccg tagcgacaat taagcactat gccgtacaca gcggccccga aaaaacgcgt
661 cattcggatg actaccatcc aacccgtaaa gatttattcg aaacctattt gcctgcattt
721 cgcatggcaa tagcagagac taacgtgcaa tcgttaatgt gtgcctacaa ccgtgtagat
781 ggggcacctg cctgtggcaa taatgaatta atgcaagaaa ttttgcgtgg cgatatgggc
841 tttaacggtt atgtcgtgtc tgactgtggc gccattgccg atttttacga gagtagatcg
901 caccacgtgg ttgactcacc tgcagaggct gcagcgtggg ccgttaaatc gggtaccgat
961 ttaaactgtg gcgattcaca tggcaatacc tacaccaacc tgcattacgc gttacagcaa
1021 ggtttaatta cagaagatta tattgatata gcggtaaagc gtttgtttaa agcgcgtatt
1081 aagcttggca tgtttgacga gcaagaccgc gtgccttaca gcgaaattgg tatggatgtt
1141 gtaggttcac ctaagcacct agcgctaacc caagaagcgg cagaaaaatc tattgtgctg
1201 ctaaaaaaca atggtgtatt gccattaaaa gcaggggtaa aggtagccgt aatagggcca
1261 aatgcagttg atgaagatgt attggtaggc aactaccacg gcgtaccagt gaaacctgtg
1321 ttgccgctag aggggattgt taatcgtgtt ggcgaggcca acgtatttta tgccccaggc
1381 agtgcacaaa tagccgatat atacagccac tacgaaccga taagtgcaga aaatttttat
1441 cataaagatg caaatggtaa tttagctgca ggcttaaaag cagagtatta cgccgattat
1501 tacaacgcag ctgaaattaa cgacgatacc tttagcgcaa ccccagcgtt aaatagaatt
1561 gatgcagata ttaatttctc ttggcctgta tcgcctattg ataattcgtt agatgatgaa
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1681 ggcacggttg cattagccat taacggcaaa cctgttaatg gggctgttaa cctaaaggca
1741 ggtgaaagct ataacataaa agctattttt ggcgtgcaaa aatggtggcc cgttaatgca
1801 atacacccgt acggaaaact tacttggcta gatgagtcgc gcgatttaga agaagaggca
1861 ttagctgctg cccgaaaagc cgatgtgatt atttttatgg gcggtataga tgcgcacctt
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2041 gtaatggtta actttagtgg tagtgccatg gctttaaatt gggaaagcga aaagctagac
2101 gcaatactgc aagcgtttta cccaggtgaa gcaaccggta cagcgttagc taatattttg
2161 tggggcgatg taagcccgag tggccgctta cctgtaacct tttacaaagg cgtagacgat
2221 ctaccagcat ttaatgatta ccacatggaa aaccgcacct ataaatttta ccgcggtgag
2281 cctttgtatg catttggcca cggtttaggt tacgttgatt ttgcttataa caatttagtc
2341 gtagcaaata ctgcagaagc gggcaaagcg ctacctatag ctgtaagcgt aaccaatacc
2401 ggtaaaatgc aagcagaaga cgttgcccaa gtttatataa gtttgctaga tgcccccgca
2461 aacacgccca tccgcgattt aaaagcgttt aaacgtacca agcttgcggc aggcgaaagc
2521 accgagcttg aatttaactt gccggcgaga gtgcttacct atatagacga taatggtaaa
2581 acccaaacct atactggcag ggtagaagtt actgttggct ctgggcaaaa gggatacgta
2641 aaagaaaatg cgatagctgt agcgactatt aacgttcagt ag
LOCUS NZ_AABI02000026 954bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_26，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000026 REGION：互补链(16626..17579)
VERSION NZ_AABI02000026.1GI：28878276
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-954)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029482.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..954
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..954
/gene＝″Mdeg3244″
CDS 1..954
/gene＝″Mdeg3244″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3507:β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00067829.1″
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REGMYYFTMPENNRSLAYYMAKSPFGPWEYKGIFMQEEGGNNHHSIVQFKGKWILFYH
RWLMGEGECKKKQRHTAAEYLHFNADGTIKEVKRTREGLTK″
ORIGIN
1 atgtacacat atgtatccgc catagcacta tttatatttt caattgcctc gtcgtgttgt
61 gttgcccaaa acccgctcga ctttggcagt aatattaaaa ccgcagatcc gtctggccat
121 atatgggctg atggcagaat gtacctttac acctcgcacg accaagaatg ccaagaagat
181 ttttatatga aggattggca taccttttcg tccagcgact taataaattg gactgcccac
241 ggcccaagtt tatctgtagc ggatattacg tgggcagata actacgcatg ggcgcccgac
301 gcggcctata aaaatgggaa gtactatttg ttctttccgg cgggaaccgg tgttaaagat
361 agagtaaacc ccgaaaaaag cactaagtgg atgggcattg gtgttgcagt aagcgatagc
421 cctacaggcc cctttaaaga tgcgattggc gcccccttgt ggaccgaccc ctatgccaac
481 gacccaagta tttttataga tgatgacggc aagggctact tatattttca cggtaaaggt
541 gcagactacc tagtagccga aatggcagac gatttactga gtgtaaaagg tgagtttcac
601 aaaatggata tgggcggtta cgagccaaaa atggagggcc cttgggtttt taagcgcgag
661 ggaatgtatt actttaccat gccagaaaac aatcgttcac ttgcttacta tatggcgaaa
721 tctccctttg ggccgtggga atacaagggc atttttatgc aagaagaagg cggtaacaac
781 caccattcta ttgtgcaatt taaaggcaag tggatattgt tttatcaccg ctggttaatg
841 ggcgaaggcg agtgtaaaaa gaagcaacgc cacaccgcag cggaatacct tcactttaat
901 gccgacggca caattaaaga agtaaaaaga acgcgcgagg ggttaactaa gtag
LOCUS NZ_AABI02000004 1734bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：互补链(182992..184725)
VERSION NZ_AABI02000004.1 GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1734)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG 分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1734
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
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/gene＝″Mdeg1098″
CDS 1..1734
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/protein_id＝″ZP_00065724.1″
/db_xref＝″GI:23027269″
/db_xref＝″COG:COG3507″
/translation＝″MKIKCLLLAVYAGLLAACALDAPLKTSSKPLAHFSWFEYQGNDE
IFKAPLASNQYQNPILAGYHPDPSIVRVGEDYYLVNSTFGFYPGIPVFHSRDLVNWTQ
LGNAIHRPEQLSFDGIHLGYNGVYAPAIEYRDGTFYVINTCVACGGNFIVTATNPAGP
WSDPIWLPEVIGIDPSLFFDEDGKTYIVHHRNPPVQKYPAHTALWVMEVDSKTFAPVS
DDVMLVDGGDEAPWHTEYIEGPHIYKIDGTYYLYAPGGGTGYFHGQLVYRSDNVFGPY
EANPNNPVLTQVGLPDDREHPVTATGHADLFQDTNGDWWTVFLGTRVYDLAKPPQDPG
NFATGRETFMLPVTWQNGWPHVLEKGEAVPYRVTKPKLPAGKPAPRAMTGNFTVREEF
TNASLAPHWLFVRTPRSKWWQTGNGELILEARADTIGAVNQPSFIGRRLAHMTASFAT
QLTFNPHTVGDEAGLLAVQNDEHFYAFGLGLNSKGQTVLRVRKKAGKNESIRGDTVAE
QVVKLKHGHPIYLRVNIGKAELNFAYSTNGKRYTTLLNQADANLLTTAKAGGFTGAVV
GMYAESTAQQN″
ORIGIN
1 atgaaaatta agtgcttact ccttgctgtt tacgcgggtc tacttgcggc ttgcgcgctg
61 gacgcgccgc tcaaaacctc aagtaaaccg ctagcgcatt tttcgtggtt tgaatatcaa
121 ggtaacgacg agatatttaa ggctccactc gcctcaaatc aataccaaaa ccccatactc
181 gccggctacc acccagaccc aagtattgtg cgagtaggcg aagattatta tttggtgaac
241 tccacctttg gcttctaccc tggcattcca gtatttcaca gccgtgactt agtgaattgg
301 acccaactgg gtaacgctat tcaccgccca gagcaacttt catttgatgg tattcactta
361 ggctacaacg gcgtttatgc accggcaatc gaataccgcg acgggacctt ttacgtaata
421 aatacctgcg tagcctgcgg aggaaatttt atcgttaccg ccaccaatcc cgcgggcccc
481 tggtcagacc caatatggct accagaggta attggcatag acccctcgct atttttcgac
541 gaggacggca aaacctatat cgtgcatcat cgtaatccac ctgtgcagaa ataccctgcc
601 cacacagccc tgtgggtaat ggaagttgac tccaaaacat ttgcgccggt atctgacgat
661 gtaatgcttg tggacggtgg cgacgaagcg ccatggcaca cagaatatat tgaagggccg
721 catatatata aaattgatgg cacctactac ctctatgccc ctggtggcgg cacgggatac
781 ttccacggcc aattggtgta tagatctgac aatgtatttg gaccctacga agccaacccc
841 aataaccctg tgttgactca agttggttta cccgacgaca gagaacaccc tgtaacggca
901 acgggtcatg cagatttatt tcaagatacc aacggcgact ggtggacggt atttctgggt
961 actcgcgttt acgatttagc taagccacca caagaccccg gcaattttgc caccggacgc
1021 gaaacattta tgttgccagt aacatggcaa aacggctggc cacacgtgct cgaaaaaggc
1081 gaggctgtgc cctaccgagt aaccaaaccc aaattacctg caggcaaacc cgccccgcgc
1141 gcaatgactg gaaactttac tgtgcgcgag gaatttacca acgcttcgct tgccccccac
1201 tggctatttg ttcgcacacc gcgttccaaa tggtggcaaa caggtaatgg cgaacttatt
1261 ttagaagcgc gcgccgatac cattggggca gttaaccagc cgtcgtttat tggccgacgg
1321 ctcgctcata tgacggcctc cttcgccacc caactaacct ttaacccaca caccgttggc
1381 gacgaagcag ggttactcgc cgtacaaaac gacgaacact tttacgcctt tggcctaggg
1441 ttaaacagta aagggcaaac cgttttgcgc gtgcgtaaaa aagcgggtaa aaatgaatcg
1501 ataaggggag atacggttgc cgagcaggtt gttaagctta agcacggcca ccctatttac
1561 ctgcgtgtaa atataggtaa agccgaatta aatttcgcgt atagcaccaa cggcaaacgc
1621 tacaccacct tgttgaacca agccgatgcc aacctactta ccacagctaa agcgggcggg
1681 tttactggcg cagtagtggg tatgtacgcc gaatccaccg cacaacaaaa ctaa
LOCUS NZ_AABI0200001 11701bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_9，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000011 REGION：31082..32782
VERSION NZ_AABI02000011.1 GI：28878291
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1701)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Inform ation，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028020.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1701
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1701
/gene＝″Mdeg1856″
CDS 1..1701
/gene＝″Mdeg1856″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3507:β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00066469.1″
/db_xref＝″GI:23028051″
/db_xref＝″COG:COG3507″
/translation＝″MRLLPILLVSLLPLLSSCTSAINGQQNSQTSPVFDWFEYAGSDA
LYNTVAPSKNAYTNPVIKGFYPDPSIVRVGADYYLVNSSFGYFPGVPIFHSTDLVNWV
QIGNILERPSQLQIPSGMGVSRGIFAPTLRHH GIFYMITTMVDGGGNFIVTAKNPAG
PWSDPVWLPEVGGIDPDLFFDDNGKAYILNNDAPIGEPLYDGHRAIWIREFDLATLKT
VGDAKLIVNGGVDITTKPVWIEGPHLFKNKGAYYLINAEGGTSVNHSQVVFKAQSPWG
PYIPWENNPILTQRHLPADRANPVTSVGHVDLVQTQHGDWWAVFLGCRPYKDNYYNTG
RETFLLPVDWSGEYPVILRGDAEVPYHHQRPQLGASQQPAIALSGNFIERDEFDSALK
LYWRKVRTPTNNFTDLTSQKGKLVLTANNTDLSDFGSPAFIARAQQHLTGSATTKLVY
TPPHVGDKAGIAAFQNDEYFYALTVTKNNSGLAIQLEKQLGKNKEIVAQYPLQEKTLR
NGLYLKIEFNNDKYDFSYSTNNTKWQSVGETQDGTILSTQSAGGFVGATLGIFAYTAH
″
ORIGIN
1 atgcgacttt tacctatctt actcgttagc ttacttccac tgctctcaag ctgcacaagc
61 gccataaacg ggcaacaaaa tagccaaacc tcgcctgtat ttgattggtt tgaatacgcg
121 ggaagcgatg ctttatacaa cacggttgcg ccaagtaaaa atgcctatac caacccagta
181 ataaaagggt tttatccaga tccaagcatt gtaagagtgg gagcagatta ctacctcgtg
241 aactcttcat ttggctactt ccctggcgtg ccgatatttc atagcacaga tttagtgaat
301 tgggttcaaa taggtaatat tctcgagcgc ccatcacaat tacaaatacc cagcggcatg
361 ggtgtgtcgc gaggtatatt cgccccaaca ctgcgccacc acaacggtat tttttacatg
421 attactacaa tggtagacgg tggcggcaat tttattgtta ctgcaaaaaa ccccgcaggc
481 ccttggtcgg acccagtatg gttacctgaa gtgggcggta tagacccaga tttatttttt
541 gatgacaacg gcaaagccta catacttaac aacgacgccc ccattggcga gccgctttac
601 gatggccacc gagccatttg gattcgcgaa ttcgacttag ccacattaaa aaccgttggc
661 gacgccaagt taatagtaaa cggcggtgta gatataacta ccaaacccgt ttggatagaa
721 ggcccacacc ttttcaaaaa taaaggcgct tactatttaa ttaatgcaga aggtggcacc
781 agcgtgaatc acagccaagt tgtatttaaa gcgcaaagcc cttgggggcc gtatattcct
841 tgggaaaaca atccaatttt aacacagcgc catttaccgg ctgatcgcgc caaccccgtc
901 acatccgttg gccatgtcga tttagtacaa actcaacatg gcgactggtg ggcggtattt
961 ttaggctgca ggccctataa agataactac tacaataccg gccgcgaaac atttttatta
1021 ccggtagatt ggtctggcga ataccccgtc attcttcgcg gcgatgccga ggtgccctat
1081 catcaccaac gcccccaatt gggagcatcc caacaaccag ccattgccct tagcggtaac
1141 tttattgagc gcgatgaatt tgactcagca cttaaacttt attggcgcaa ggttcgcacc
1201 cccacaaaca actttacaga tttaacctct caaaaaggca agcttgtttt aactgcaaac
1261 aatacagatt taagcgactt tggatcacca gcatttattg cgcgcgcaca gcagcaccta
1321 acaggcagcg caacaaccaa actggtttac acacccccac acgtgggcga caaagcgggt
1381 attgctgcct ttcaaaacga tgagtatttt tatgcgctta ccgttacaaa aaataatagc
1441 ggccttgcca tacaactaga aaaacaactt ggcaagaaca aagaaattgt tgcgcaatat
1501 ccactacaag aaaaaacgct tcgcaatggc ttatatttga aaatagaatt taataacgac
1561 aaatatgatt tcagctattc cacaaataac accaagtggc aatcggtagg cgaaacacaa
1621 gatggaacta tattaagcac gcaaagtgca ggcgggtttg taggtgccac gctaggtata
1681 tttgcatata ccgcgcacta a
LOCUS NZ_AABI02000014 960bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_13，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000014 REGION：125907..126866
VERSION NZ_AABI02000014.1 GI：28878288
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-960)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028504.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..960
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..960
/gene＝″Mdeg2391″
CDS 1..960
/gene＝″Mdeg2391″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3507:β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00066992.1″
/db_xref＝″GI:23028599″
/db_xref＝″COG:COG3507″
/translation＝″MSMFNKKTLAAGIVAACLTNVSASYAANPAITDTHTADPAALVH
GDTVYLYVGNDEAKDNRVFYDLKKWLVYSSKDMVNWTNHGSPLAATDFKWASGDAWAA
HTVEKDGKFYWYTTVRHATINGFAIGVAVSDSPTGPFKDALGKALISNDMTTDTDIDW
DDIDPAVFIDDDGQAYIFWGNTKPRWAKLKPNMIELDGPIHAIDIPHFTEALYVHKHG
EYYYLSYATGFPEKTAYAMSKSIEGPWEYKGILNELAGNSNTNHQSVIDFKGKSYFIY
HNGGLGQDGGSFRRSVCIDYLNYNADGTIKRIVMTSEGVDPVK″
ORIGIN
1 gtgagtatgt ttaataaaaa aacactagca gccggtattg tagctgcatg tttaactaac
61 gtaagtgcaa gctatgctgc caaccccgca attaccgata ctcacacggc cgatcccgct
121 gcgttagtgc acggcgatac cgtttatttg tacgtgggta acgatgaagc gaaggataac
181 cgcgtatttt acgatcttaa aaaatggttg gtgtattcat caaaagatat ggtgaactgg
241 accaatcacg gttcgccgtt agctgcaacg gattttaagt gggccagcgg cgatgcgtgg
301 gcggcgcaca cggtagaaaa agatggcaag ttttattggt ataccacggt gcgtcacgca
361 accattaatg gttttgccat tggcgttgca gtaagtgata gccctacagg gccattcaaa
421 gatgctttgg gtaaagcact aataagtaat gacatgacca ccgataccga tattgattgg
481 gacgatatag acccagcagt atttattgac gacgatggcc aagcgtatat tttttggggc
541 aacaccaaac cgcgctgggc caagttaaaa cccaatatga ttgaactaga tggacctatt
601 cacgcaatcg atattccaca ctttaccgaa gcgctatacg tgcacaaaca cggtgaatat
661 tactacttaa gctatgcgac aggctttcca gaaaaaacag cttacgctat gagcaaatct
721 atagaagggc cgtgggaata caaaggcatt cttaatgaat tggctggtaa ctcaaatact
781 aatcaccaat ctgtcatcga ttttaagggc aagtcatact ttatttatca caatggtggc
841 ttgggtcaag atggcggtag cttccgtcgc agtgtatgta tcgattattt gaactacaac
901 gcggatggta ctatcaagcg aattgtaatg acatcagaag gtgtagaccc agttaaataa
LOCUS NZ_AABI03000012 1158bp DNA 线性BCT 17-JUN-2004
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg03_12，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI03000012 REGION：互补链(71021..72178)
VERSION NZ_AABI03000012.1 GI：48861146
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌，γ-变形菌纲，异单胞菌目，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE1(碱基1-1158)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
FEATURES 位置/限定词
source 1..1158
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1158
/locus_tag＝″Mdeg02003585″
CDS 1..1158
/locus_tag＝″Mdeg02003585″
/codon_start＝1
/product＝″COG3507:β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00315109.1″
/db_xref＝″GI:48861205″
/db_xref＝″COG:COG3507″
/translation＝″MPEHTRKRLLSTLGLALSGTAITLTLVGCGKDNPATQTEGSHSA
GHTEVAAEQTHDIGGPGPEGKPINDPLVTHIYTADPSAHVFDGKLYIYPSHDVEAGIP
QNDNGDHFDMRDYHVLSMEEPGGKVTDHGVALAREDVAWAGRQLWAPDAAEKDGTYYL
YFPMKDKDDIFRIGVASGSTPYGPFKAEPEPMPGSYSIDPSVFQDGDDYYMYIGGIWG
GQLQRWTTGEYNPEDVYPADDEPALLPKMAKLSADMKSFAEPLRDIQILDENGELIKA
GDNDRRFFEAAWVHKYNGKYYLSYSTGDTHYIVYAIGDNPYGPFTYQGVVLNPVIGWT
NHHSIAEFKGKWYLFYHDSSLSGGVTHLRSVKMTELTHNPDGTIQTINAYK″
ORIGIN
1 atgccagaac atacgcgtaa gcgcttacta tcaaccttag gcctagcttt atcgggcaca
61 gctataaccc taacgcttgt ggggtgcggt aaagacaacc ccgcaactca aacagaaggc
121 agccacagcg ctggccatac agaagttgcc gcagaacaaa cacacgacat aggcggccca
181 ggccctgagg gcaagccaat taacgacccg cttgttaccc acatatacac cgcagaccct
241 tctgcccatg tgtttgacgg caaactttat atttacccat cgcacgatgt ggaagcgggt
301 attccgcaaa acgataacgg cgatcacttc gatatgcgcg attatcacgt gctttccatg
361 gaagagcctg gtggcaaagt caccgatcac ggcgtagccc ttgcgcgcga agatgtagct
421 tgggctggtc gccaactgtg ggcgcccgat gcggctgaaa aagacggcac ttactacctg
481 tatttcccca tgaaagataa ggatgacatc ttccgcattg gtgtcgccag tggcagtacc
541 ccttatggcc catttaaagc cgagccagag ccaatgcccg gcagctatag catagaccca
601 agcgtatttc aggatggcga cgactactac atgtacatag gtggtatttg gggcggccag
661 ttgcagcgtt ggacaaccgg tgagtacaac ccagaagatg tatacccagc ggatgacgag
721 cctgcgctat tacctaaaat ggccaagcta agtgcagata tgaaaagctt tgccgagcca
781 ttaagagaca ttcaaatttt ggatgaaaat ggcgagctaa ttaaagctgg cgataacgac
841 cgacgtttct tcgaagccgc gtgggtacac aaatataacg gcaagtatta cttgagctat
901 tcaaccggtg acacccacta tattgtgtat gccattggcg ataacccata cggcccgttt
961 acttaccagg gtgtagtgct caaccccgtt attggttgga ctaaccatca ctcaattgct
1021 gaatttaaag gtaagtggta tttgttctac cacgatagtt cgctttccgg tggtgtaaca
1081 catttgcgca gcgtgaaaat gacagagcta actcacaacc cagatggcac tatccaaacc
1141 attaatgcct ataagtaa
LOCUS NZ_AABI03000013 2217bp DNA 线性BCT 17-JUN-2004
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg03_13，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI03000013 REGION：互补链(100192..102408)
VERSION NZ_AABI03000013.1 GI：48861059
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌，γ-变形菌纲，异单胞菌目，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2217)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
FEATURES 位置/限定词
source 1..2217
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2217
/locus_tag＝″Mdeg02003703″
CDS 1..2217
/locus_tag＝″Mdeg02003703″
/codon_start＝1
/product＝″COG3661:α-葡糖醛酸糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00315039.1″
/db_xref＝″GI:48861134″
/db_xref＝″COG:COG3661″
/translation＝″MATLGVNAAKFAMFAAICLQFSVAEAAKSRDGYGLWLDYQPITN
TREREGYIKALSPWQVEGEAATADFIRQELTAALGAMLGVEAGPVGDYTHNSLAHPVA
RLLVATPEESAVIRSLALGDALTRVGQEGYLIKTTRYRDKPITIVTANTHAGLLYGTF
KLLQLLQTGQAVSNLAIESAPATKLRVLNHWDNLDRYVERGYAGESIWNWHKLPHYKS
QRYYDYARANASIGINGVVLNNVNADPLILTPQYLVKVKALADIFRPYGIKVYLSVKF
SSPNLIGGLPTSDPLDKNVQAWWQAKANEIYSLIPDFGGFLVKANSEGQPGPGDFGRS
HAQGANMLADALAPHGGNVMWRAFVYNVEANVERSKQAYNEFKPLDGTFRQNVLVQVK
NGPIDFQPREPFSPLFGAMPKTPLMMEFQITQEYLGFSTHLVYLGPLYEEVLKADTYA
KGAGSTVAKVVDGSLYGHGITGMAGVANIGSDRNWTGHIFGQANWYVFGQLAWNPEVS
TKQIADDWIRMTLTRDDKAVNTIRAMMMASRETAVNYMTPLGLHHIMGWGHHYGPAPW
IGEQKPDWMREDWTSVYYHSANATGLGKDRTASGSNVIAQYHAPLRQAYSDPKTTPTE
LLLWFHHLPWHYELANGNSLWHELVARYYLGAQAVAEMAKTWDGLEANIPPQLFKQVQ
MALAIQTQEAAWWRDACVLYFQSYSKQSLPEGFAKPKHSLEYYKGLSFPHAPGDGR″
ORIGIN
1 atggctactt tgggggtaaa tgccgctaag tttgccatgt ttgcagctat ttgcttgcag
61 tttagtgtcg ccgaagcggc taaaagccgc gatggatatg ggctgtggtt agattaccag
121 ccaattacca atacccgcga acgcgagggc tatataaaag cattaagccc atggcaggta
181 gaaggcgaag ctgcaactgc cgattttatt cggcaagagc ttactgcagc gttgggcgct
241 atgcttggcg ttgaggctgg tccagtgggt gattacaccc ataactccct cgctcaccct
301 gtggcgcggc tattggttgc aactccagaa gaaagcgctg ttattcgctc tttggcttta
361 ggcgatgctt taactcgagt agggcaagag gggtacctta ttaaaaccac gcgttaccgt
421 gacaagccta tcaccattgt taccgcgaac acgcatgcag gcctgctgta tggcacattc
481 aaactactgc agctgctgca aacagggcag gccgtttcta atttagctat tgagtccgcc
541 ccagcaacca aactgcgtgt gcttaaccac tgggataacc tcgatcgcta tgtggagcgc
601 ggctatgccg gtgagtctat ttggaactgg cacaagctgc cgcactacaa atcgcagcgc
661 tactacgatt acgctcgcgc taacgcgtcc attggtatta acggtgtggt actaaacaat
721 gttaacgccg accccttaat tcttaccccg cagtaccttg taaaagtaaa agcactggca
781 gatattttta ggccctacgg cattaaagtt tatctttcgg tgaagtttag ctcgccgaat
841 cttattggcg ggctgccaac atccgacccg ttagataaaa atgtgcaagc ttggtggcaa
901 gcgaaagcga atgaaattta ctcgctcatt cccgactttg gtggcttttt agtaaaagcg
961 aattcggaag ggcagcccgg cccaggggac tttggccgca gccatgcaca aggggcaaat
1021 atgttggccg atgcactggc accccatggc ggcaatgtaa tgtggcgcgc gtttgtatat
1081 aacgtagaag ccaatgtgga gcgatccaag caggcataca acgaatttaa gccattagac
1141 ggtaccttta ggcaaaacgt attggtgcaa gtaaaaaatg ggccaattga ttttcagcca
1201 cgtgaaccgt ttagcccgct gtttggtgct atgcccaaaa cgccgttaat gatggagttt
1261 caaattactc aggagtactt ggggtttagt actcaccttg tttacttggg gccgctgtac
1321 gaagaagtac ttaaggccga tacctatgcg aagggggcag ggtctactgt tgcgaaggtg
1381 gtcgatggct cgctctacgg gcacggtata acgggtatgg ctggggtagc taatattggc
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2041 gtacaaatgg cgctggctat tcaaacccaa gaagccgcgt ggtggcgcga tgcctgcgtg
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2161 tcgctcgaat actataaagg gttaagcttc ccgcatgcgc cgggtgacgg gcgttaa
LOCUS NZ_AABI02000026 3951bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_26，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000026 REGION：互补链(19875..23825)
VERSION NZ_AABI02000026.1 GI：28878276
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-3951)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029482.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST 可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..3951
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..3951
/gene＝″Mdeg3247″
CDS 1..3951
/gene＝″Mdeg3247″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3866:果胶酸酯裂解酶″
/protein_id＝″ZP_00067832.1″
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VWVDHCELEASGGESDGYDSLLDMKATTQYVTVSYTYYHDSGRGGLMGSSDSDDTNTF
VTFHHNYYENMDSRLPLLRHGTAHAFNNYYNGIAKSGMNPRIGGQIKAENNYFENAHN
PIGTFYTDDMGYWDLRGNIFGSNVTWASADDETPAGPNPTSTTSIHISYPYDLDDAAC
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SNGGSLVLGNNLSIGAGSDGSSKGAGSYGNVRDGDVSSYWAPSGSTGRVSIKWSGSQT
VNAIVIKEAAGYEGNISGWQVTDNDTGAVLAAGSSVGTITFDAVTTSKINFEITSSNG
TPTVAEFETYNATGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTGGTATLSTTVSGDQ
VTLNWSVNNATVTGQQIYRDVDSDPAGRVRIASGVTGNTYTDTGLANGTYYYWVKVTD
SNSATINSNYSEAQVNVYTTSTTTFEEDAGYCSVDGSVDSNNSGFAGSGFANTDNASG
NGVNYAVSVPVAGVYTLQVRFANGSSARPADVLVNYGNAGVFDLPSTGSWTSWSNSNE
ISVNLVAGNNIIRLEATTSGGLANIDSLSVTGVEPSAGDCNGSVGSSSSSSSSSSTSS
TSSSSTSSGGSSTSSSSTSSSSTSSTSSSSTSSSSTSSTSSSSGGGTASCEQLINDPS
VNWDESALASEQEIVACLAQSLGSPVGFGEGTTGGYDPSGGSNLVVIKKNIGISVEQQ
ILDAISTENHNWIVFDKDDFAARTAVAMYRLDCDNADVRSALGGASAAQCRDHIAWCS
ANGISDEHDCENEFFNNRLNDSDLPIRNQMIQSNTTIDGRGANAYFFFNGFSIGKDSS
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TLRRVPLMRRGQSHMFNNVFYGYRKDILSVRVGGRIAFEDNIILNKESSSTPGDGLKK
GDDMEYYVETLLRDFREGGLEISGSYVSFADSACNSYGASGDLTASHGATPDMFDDYS
SASKNTISANRFVAGDDLTDYVFATAGKGGKAPYVSTFTAGQNSLISQANPVCQ″
gene 互补链(1383..1664)
/gene＝″Mdeg3248″
CDS 互补链(1383..1664)
/gene＝″Mdeg3248″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
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ORIGIN
1 atgagaaata aattaggctc aatgttaaaa atgagcgcag ccattggcgg tttagttgca
61 gcgggttccg ctgttgcagg cccagttggt ttcgcaagtt taaacggcgg cactaccggc
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1141 tcgtcttcaa gctcttcctc ttcaagcagc tctagctcca atggcggcag cttagtatta
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1861 aaagtaaccg attcaaactc agctacaatt aattccaact actcagaagc gcaagtgaat
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LOCUS NZ_AABI02000026 1284bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_26，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000026 REGION：互补链(32631..33914)
VERSION NZ_AABI02000026.1 GI：28878276
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1284)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029482.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1284
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
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/gene＝″Mdeg3255″
CDS 1..1284
/gene＝″Mdeg3255″
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LGGTLPDGQSRIVRVTNLNASGEGSLAWALGLARPRVVVFEVGGVIDLAGQSITVTQP
FLTVAGQSAPAPGITLIRGGLNIRTHDVRVQHIRVRPGDNLQPKRSGWESDGISVAGE
NAKDVHIDHVSVSWAVDENLSASGNRYKGYGQTAERVTFSNNLIAEALDYASHKKGKH
SKGLLVHDYVRDVAVVRNLFVSNDRRNPYFKAHTIGFVANNIIYNAGNAAIQVNYIER
EWEGQSTGPANARVAVVNNQLVYGRDTYSDLALVSVRGDAYLTGNSVTNLMGEPMPIT
EGAVNSLASAPSWLTGYELWDADEMRELLVASVGATPWARDAIDTRIINGVATGKARI
IDSQQDVGGYPSYKQTNKKFDIPDDKIAEWLLGYL″
ORIGIN
1 atgaataaaa ataatgtaat tgcttatctg ctaatttcaa cttttctatt attttctgcg
61 actgtgttcg cggttaaacc cagcaacgct gaaacccgat attccgcaat gggtgcagat
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181 aatttaaatg caagtgggga gggctcgctc gcatgggcgc tgggtttagc tcgaccacgc
241 gtagtggtgt tcgaagttgg cggtgttata gatcttgctg ggcaaagtat taccgtcacg
301 cagccattcc ttactgttgc cggtcagtcg gcgccagcac cgggtattac attaattcgc
361 ggcggtttaa atatacgaac ccacgatgta agagtgcagc atattcgcgt gcggccggga
421 gataacttac aaccaaagcg ctccggctgg gaaagtgacg gtatatctgt ggccggtgaa
481 aatgccaaag atgtacatat agatcatgta tcggtaagtt gggcggtaga tgaaaacctc
541 tccgcttcgg ggaatcgtta caaaggttac ggtcaaaccg ctgagcgggt aacgtttagt
601 aataatctca ttgccgaagc gttagattat gccagccata aaaaaggcaa acactctaag
661 ggattattgg tacacgatta tgtgcgagat gttgccgtag ttagaaattt gtttgtgtct
721 aatgatcgtc gcaacccgta ctttaaagcg cacaccatag gttttgtagc aaataatatt
781 atttacaatg cgggtaatgc cgctatacag gttaactata ttgagcgtga gtgggagggc
841 cagagtacag gcccagctaa tgctagagta gcggtggtaa ataaccagtt agtttacggc
901 cgcgatacat actcagactt ggcgctagtg tctgtgcgtg gggatgctta tttgacgggt
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1081 gagctgctag tagccagtgt tggtgcaaca ccctgggcca gggatgcgat agatacccga
1141 ataattaatg gggtggcaac ggggaaggcg cgaataatag atagccagca agatgtgggt
1201 ggctacccga gctataagca aacaaataaa aaatttgata taccagacga caaaattgcc
1261 gaatggttac tgggttacct gtaa
LOCUS NZ_AABI02000026 2310bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_26，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000026 REGION：互补链(24098..26407)
VERSION NZ_AABI02000026.1GI：28878276
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2310)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029482.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2310
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2310
/gene＝″Mdeg3249″
CDS 1..2310
/gene＝″Mdeg3249″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3866:果胶酸酯裂解酶″
/protein_id＝″ZP_00067834.1″
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VVYANTGTQINEAMCNRPSHDTPLIIYVSGTINHGNTEKVSGNCDTTGDEIQFKKVKN
LSLIGTGNGAVFDQIGIHLRETSNIILQNLHIKNVKKSGSPTSNGGDAIGMESGVYNV
WVDHCELEASGGEKDGYDSLLDMKATTQYVTVSYTYYHDSGRGGLMGSSDSDDTNTYV
TFHHNYYKNMDSRLPLLRHGTAHAFNNYYDGITKSGMNPRIGGQIKAENNYFENAHNP
IGTFYTNDMGYWDLSGNIFGNNVTWASADDETPAGPNPQSTTSIHISYPYSLDDATCV
PKIVKATAGVGNGLAVSTGGSNCGTSSSSSSSSSSSSTSSTSSTSSSSSSSNSSSGGS
GVNLSIGAGSDGSSKGAGSYGDVRDGNMSTYWAPSGSTGRVSIKWSSATTVSSIVIKE
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TYSGTVGGTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSSSGGSANLGTSVSGDQVSLNWSTSNIDV
GSQQVYRDTDSNPSGRVRISAGVSGNSYTDYGLASGTYYYWIKITDQNGVVYNTNAAE
AVVGSQAPTTFTAQESAGFCSVNGSVDSNNAGYTGDGFVNTDNASGNAAVYAFNAPSA
GMYSLQVRYANGSSARPGDVLVNAGNIGTFDFSSTGSWTSWANSNELSAYFSAGNNTV
RIQATNSGGLPNLDSVSVTGNAPAAGNCN″
ORIGIN
1 atgagaaaca ctaaacacct actcaatagc ggtgccgtat tgctagctag cagtattgca
61 acagctgcga tggcggggcc tgtgggcttt gcatcgctta atggtggcac aacgggcggt
121 caaggcggtc aagttgtata cgccaacacc ggtacacaaa ttaacgaagc catgtgtaac
181 cgcccatctc acgatacgcc gttaattatt tatgtatccg gtaccattaa ccacggcaac
241 accgaaaagg tgtcgggtaa ttgcgataca accggcgacg agattcagtt taaaaaagtt
301 aaaaacctat cgttaattgg tactggtaac ggtgcggtgt ttgatcaaat aggtattcat
361 ttacgcgaaa cctccaatat tattctgcaa aaccttcata ttaaaaatgt taaaaaatcg
421 ggttctccaa cctccaatgg cggcgatgca attggaatgg agtctggcgt atacaatgtg
481 tgggtggatc actgtgagct agaagcatcc ggtggtgaaa aagatggtta cgattcattg
541 ctagatatga aagcaaccac gcagtatgta accgtttctt acacctatta ccacgattca
601 ggccgcggtg gtttaatggg gtcgagcgat agtgacgata ccaacaccta cgtgactttc
661 caccacaatt actacaaaaa tatggattca cgcttaccgc ttttacgcca cggtactgcg
721 catgccttta acaactatta cgatggcatt accaaatctg gtatgaaccc ccgtataggc
781 ggtcaaataa aagcagaaaa taactatttc gaaaacgcac acaacccaat aggtacgttt
841 tacacaaacg atatgggtta ctgggactta agcggcaata tatttggcaa caacgtaacg
901 tgggcgtctg cggatgatga aacccctgca gggccgaatc cacaatccac aacgtccatt
961 catatttctt acccctacag cttggatgac gcaacgtgcg tgccgaagat tgtaaaagct
1021 actgcgggtg tgggtaacgg tttggctgtg tctaccggtg gtagcaattg cggtacttct
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1141 agttcttcat catccaatag ttcttctggt ggctcaggtg taaacctttc aattggcgca
1201 ggttctgatg gtagcagtaa aggtgcgggc tcttatggcg atgtgcgcga tggcaatatg
1261 agcacctact gggcaccgag tggcagcact ggtcgcgtat ctattaagtg gagttcggca
1321 acgacggtaa gtagcattgt tattaaagaa gcggctggct ttgaaggtaa cattactggc
1381 tggcaagttg taaacaacga gaatggcgca gtattaaaaa gcggctctaa cgctggcgta
1441 atttcttttt ctccggtttc tactacgaag ttaaatttcg aaattacctc ttcgaacggc
1501 atgcccacgg ttgcagaatt tgaaacctat agcggcacgg ttggtggtac ttcgtcatcc
1561 agttcttcaa gtagttcgtc aagcagttct tcaagcagct caagttcaac gagcagctct
1621 ggtggttccg cgaatctagg tacctcggta agtggcgatc aggtttcact taattggtct
1681 acctcaaaca ttgatgtggg ttcgcagcaa gtttatcgcg ataccgattc aaacccatct
1741 ggtcgtgtgc gtatctctgc aggcgtttct ggtaattcgt ataccgatta cggcttagct
1801 agcggtactt attactactg gataaaaatt accgatcaaa acggtgttgt ttacaacaca
1861 aatgccgcag aagcggttgt aggcagccaa gcgccaacga cgtttactgc gcaagagtct
1921 gcgggtttct gctctgttaa cggttctgtt gattccaata acgctggcta cactggcgat
1981 ggttttgtaa ataccgataa cgccagtggc aatgcagcag tttatgcctt caatgcacct
2041 agtgcgggta tgtatagctt gcaggttcgc tacgcaaacg gttctagtgc acgcccaggt
2101 gatgtgctgg tcaacgctgg caatattgga acatttgatt tttccagtac cggttcttgg
2161 acatcttggg caaacagtaa tgagttaagt gcgtacttct ctgcgggtaa caatactgtt
2221 cgtattcaag ctactaactc tggcggctta cctaacttag atagtgtttc tgtaacgggt
2281 aatgcaccag cggcaggcaa ctgtaattaa
LOCUS NZ_AABI02000015 1785bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_15，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000015 REGION：互补链(111927..113711)
VERSION NZ_AABI02000015.1 GI：28878287
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1785)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028706.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
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/gene＝″Mdeg2589″
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EAEPEGEPEGEPEGEPEGEPEGEPEGETADATADAGFAGHNFNLTGGEGGTAYTVNNG
KDLQTVLDNAKSSNSPVIIYVDGTINSFNSANGNQPIQIKDMDNVSIIGYGAEATFDG
VGIAIRRANNIIIRNLTFKSVLTEGKDAISIEGDDDGSTTSNIWVDHNEFYSAPTADK
DFYDGLIDSKSGASNITISYNYLHDHWKASLHGHTENDEGAHNTDRKITFHHNRFENI
ESRLPLFRRGVGHLYNNYYKDVGSTAINSRIGAELLIENNVFEDSQNPIVSFYSDVIG
YWNTSGNLFTNVTWTTPGTGEVSAGATQTPTSDYVVPYSYTLMPAADVKAHVIASAGV
GKIDQTGLTIPDPVTPEGDLGEPEAPVQGDVSLPYTENFAATDAANFFSAAYRDITGS
AGTSTPMYHRVTGTVEINAQQLDMTGARVSIGNTTPSVSTTGADTTTTGVLDLSAPYT
VSFKVVSVGGTLTKKFQIYVDNNTSASGDSIHGGSSRFYSETLDSLVAGQTYTVTGFT
ATNSSFITLRTESSGQIVLDDLSIQAAE″
ORIGIN
1 atgaaaattt ttaaattgtt attaatgttt gtactcgccc acaacttagt tgcttgtggt
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1141 gatgtaaaag cccacgtcat tgcgagtgca ggcgttggca aaatagacca gacagggctt
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LOCUS NZ_AABI02000001 1278bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AAB102000001 REGION：互补链(71234..72511)
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1278)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1278
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
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/gene＝″Mdeg0054″
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PSPGITLIKGGLRIETHNVKVSHLMIRPGDAGYSKGQGWKPDGITIYGSKARHVVIDH
CSVTWAVDENIAVSGPADKGAEATAGKVLIRNSIIAEALSNASHPEGEHSKGILIHNN
VQHVSLVNNLLAHNRRRNPYFKAGTTGIVIGNIIYNPGKRAIHMSSGRADASLPTLSI
TGNLFIPAANTSPNLSLISNYGKIYSSGNLVQGESRPITDGKSISLTAPPLQQVGINL
TDTGTQNDFCQTLSNAGARPWDPDPIDIRIKTQLLAGEGRIIDSQSEVGGYPIHNVNN
KETAEAGSTQGDGMLQFDTELLRKIPNLCSGMM″
ORIGIN
1 atgtttaagt atgcgctata tgttgtggcc ttggtggctg gcgtagtggt tagcttagca
61 gcctgcagca agagagctac gcagcaagta gagactgaat tctacgagat taatgagcgg
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181 ttgcgctggg cgttggcgca gacaggtgct agaaaaataa ttttcgatgt agggggggtg
241 atagatctag aagaaaaatc gctcaagatt cgtgaagccc atgtgacaat cgctggagag
301 acggccccat caccgggtat cacccttatc aagggcggac taagaataga aacccacaat
361 gtcaaagttt cgcaccttat gattaggcct ggtgacgcag ggtactccaa aggtcaaggt
421 tggaaacccg acggcataac tatatatggc agcaaagcga ggcatgttgt tattgatcat
481 tgctcggtta catgggctgt cgacgaaaat atcgcagtat ctggcccagc agataagggg
541 gcagaggcta ccgcgggtaa ggttcttatt cgcaattcaa ttattgccga agcgctaagc
601 aatgcatccc acccagaggg ggagcattct aagggcatac tcatacacaa caatgtgcag
661 catgtaagct tggttaacaa tttgttggct cacaataggc gaagaaaccc ttattttaag
721 gcgggtacaa cgggaattgt aattggcaat ataatttata acccagggaa acgtgctatt
781 catatgtctt cgggccgtgc tgatgctagc ctgccaacac tgtcaattac agggaatttg
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961 tcattgactg cgccgccgct acagcaagta ggcataaatt taaccgatac aggtacacaa
1021 aacgactttt gccaaaccct aagcaacgca ggtgcccgcc cgtgggaccc cgacccgatt
1081 gatattagaa taaaaacaca acttttggct ggcgaaggac gaattattga tagccagagc
1141 gaggttggag gctacccaat acataacgtc aataacaaag aaaccgctga agcaggctct
1201 acgcaggggg atggtatgtt gcagtttgat actgagttat tgagaaaaat accaaacctg
1261 tgtagtggca tgatgtaa
LOCUS NZ_AABI02000001 2319bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：76773..79091
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2319)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2319
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2319
/gene＝″Mdeg0058″
CDS 1..2319
/gene＝″Mdeg0058″
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/transl_table＝11
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utilization or adhesion)″
/protein_id＝″ZP_00064697.1″
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/db_xref＝″COG:COG3210″
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NQWGSGFTGNVRITNSGNTPTNGWAVNWQYAGDNRISNSWGAQLSGSNPYSATAESWN
AVIQPSQSIEIGFQGTGDGNEIPTINGDVCQTSSGSTSSSSSSSTSSSSSSSSSTSSS
SNSSSSSSSSSSSSSSSGSTTGYIHIEENELGFCYVQGSIDSNNGGFTGTGFANTDNV
NGSQINWKVNVDFDGYYALEWRYANGSGTARTASVSANGAQSEISFPTTGSWDSWLLD
STTLFLKAGVNDVILSANTSSGLANIDSLTVHGDGVAAADCNTDGSSSSSSSSSSSSS
STSSSSSSSSSSSTSSSSGGPQILKAFPTAEGYGKITAGGRGGDVYIVTNLNDSGAGS
LRQAVEASGPRTVVFEVSGTITLNKPLTIKNNNITIAGQTAPGDGITLRKHNFSIQAD
DVIVRYIRVRFGDETLTDSDAISMRYQKNIILDHVSASWGDDETLSLYHGENITVQWS
MITETLNRGGEHAFAAIWGSPFSTFHHNLIAHNVARNVRFASGSGYTDYRNNVVYNWG
YSSTHGGEAQQVGNANFNFTTVNMVGNYYKPGPRTESGVRSRLLTPNTRNGDADLGSF
YVSGNHMVGSPNVTADNSIGVSNKNALISSPWNSMKIEGEQTAEQAYESVLAYAGASK
VRDSVDTRIIEEVRTGTATYGGNGIIESQNEVGGWPQLRSETPPQDSDRDGMPDDWER
ANNLNPFNAADRNTKDSIGYTMLERYINGLVD″
ORIGIN
1 atgagagata tcacgatgaa gaataataaa ttcaggtcgt cttttacatt aaaaaaactc
61 acaccgtttt ttgttgcggg caccatgctt ggcggttcca acgcctgggc tggctgcgac
121 tatacggtca ctaatcagtg gggctcaggc tttactggca acgttcgtat aactaatagc
181 ggtaacacgc caacaaatgg ttgggctgtt aactggcagt acgctggcga taatcgtatt
241 agtaatagct ggggagcaca gctttcaggg tcgaacccat actctgccac ggcagaaagc
301 tggaatgctg ttattcagcc tagtcagtcc atagaaattg ggtttcaagg taccggcgac
361 ggaaatgaaa taccaactat aaatggcgat gtttgccaga ctagcagcgg aagtacttca
421 tccagctcat cttcaagtac gtcttctagc agctcttcaa gctcgtccac tagcagctct
481 tcaaacagct cttctagctc tagctcgtcc agctcgtcta gctcctcctc tggctctaca
541 actggatata ttcatataga agagaatgaa cttggttttt gttatgtaca aggttccatt
601 gactccaaca acggtggctt taccggcaca ggctttgcca ataccgataa cgttaatggc
661 tcacagatta actggaaagt aaatgtcgac tttgatggat attatgcgct cgaatggcgc
721 tatgcgaatg gctccggcac cgcgcgcact gcaagcgtta gcgctaatgg agcacaaagc
781 gaaatttcct tccctacaac aggttcgtgg gatagctggt tattagacag cactacccta
841 tttttaaaag ctggcgtaaa cgacgtaata ttgagcgcaa atacaagcag tggcctagcg
901 aacatagatt cacttacagt gcacggtgat ggcgtagctg cggcagactg taatactgat
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1021 tcaagttcca gctcgtctag cacgtccagc tcttctggtg gcccgcaaat attaaaagca
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1201 ggccctagaa ccgttgtgtt cgaagtgtct ggaaccatca ctctaaataa accactcaca
1261 atcaaaaata ataacatcac aatagcagga caaactgcac caggcgatgg cattacactt
1321 agaaagcaca acttttctat ccaagctgat gatgtcatcg tacgttacat acgtgttcgc
1381 tttggtgatg aaaccctaac cgattctgat gcgatttcca tgaggtacca aaaaaatatt
1441 attttggatc atgtgagtgc tagctgggga gatgatgaaa ccttatctct ttatcacggc
1501 gaaaatatca ctgtgcaatg gagcatgatt acagagaccc tcaatcgtgg cggcgaacat
1561 gcattcgcag ctatatgggg ttcgcctttt agtaccttcc accacaattt aattgctcac
1621 aatgttgcga gaaacgttcg ctttgcgtcg ggttccggtt atacggatta tcgtaacaat
1681 gtcgtatata actggggcta tagcagcaca cacggaggcg aagctcaaca agttggcaac
1741 gctaatttta atttcaccac cgtcaatatg gtcggcaact attacaaacc tgggccgaga
1801 actgaatctg gcgttcgtag tcgactactt acacctaaca cgcgtaacgg cgatgcggac
1861 ttaggtagtt tttacgtttc tggtaaccac atggttggca gcccaaatgt aactgcagac
1921 aactcgattg gcgtatcgaa taaaaatgcc ttaataagta gcccttggaa ttcaatgaaa
1981 atagaaggcg aacaaacagc tgagcaagca tatgagtcag ttcttgctta cgcaggtgca
2041 tctaaagtac gcgactcggt agatactcgt attattgaag aagtacgtac aggcacagct
2101 acttatggtg gaaacggcat aattgaatcg cagaatgaag tgggtggttg gccacaactt
2161 agaagtgaaa cgcccccgca agacagtgat cgcgacggaa tgccagatga ctgggaacgc
2221 gcgaacaacc taaatccatt caacgcagcc gatagaaaca ctaaagacag tattggctac
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LOCUS NZ_AABI02000001 1536bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：73615..75150
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1536)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1536
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1536
/gene＝″Mdeg0055″
CDS 1..1536
/gene＝″Mdeg0055″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3210:参与利用或锚定血红素的大的外蛋白″
/protein_id＝″ZP_00064694.1″
/db_xref＝″GI:23026208″
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/translation＝″MLRIPKAWLALPLVLGSTNLYAQVTCSISNTNVWNNGYTVNVNV
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SASVVVNGSSVGSFSFPSTGSWTSWTVDSANVPLKGGNNIVRIVATNSSGLPNIDSLK
VIGTNPSAGSCSSNSSSTSSSSSSSSSSSNSGGKGSSCRSTGSQSVSSTIKVTSGTFD
GNCKTYNPTSALGDGSQSESQKPAFRVENGATLKNVILGNNGVDGIHVYNGGTLDNIR
WTNVGEDAMTVKSEGNVTVSNIEGYDGSDKFIQVNAVTNLKVSNCIVDKMGKFLRQNG
GKTFAMSVTVDNCDISNMGEGVFRSDSPNATARITNSRLKNAGDICIGKWKSCTSSNI
TSF″
ORIGIN
1 atgttgcgaa tccccaaggc ttggctggca cttccacttg tactgggaag taccaatcta
61 tacgctcaag taacttgcag tatctctaac accaatgttt ggaataacgg atacaccgtt
121 aatgttaatg taaccaacac aggctcttca caggttggtt cttggcaggt tcctattaat
181 ttttctgagc cacctcaagt aagcagcggc tggaatgcaa tattaagcac aaacggaaac
241 accgtaactg ccggcaatat tggttggaat ggtaatttaa atcccggcca aagcgcctcc
301 tttggttttc aaggtggcca cgatggcagc tttgtggagc ccacctgctc gggcggaggc
361 tctagcacta gctcaagcag ctctagtagt tctagctcaa caagttctac cagttcttca
421 tccacaagtt caagtagctc ttctagctcc ggcggctctg aacttttaat ccaagaaaat
481 gcatccggct tctgccgtgt ggacggatcg atagataaca ataactcagg ctataccggt
541 agtggctttg ccaacaccga gaaccaaaac ggttccgcag ttgaatacgc acttaacgtt
601 ccctctaatg ggaattatct cctcgacgct cgatatgcaa gcgctactac acgatcggct
661 agcgtggtag ttaatggatc ttcagtaggc agctttagtt ttccatctac gggttcgtgg
721 acaagctgga cagttgactc cgccaacgtt ccgttaaaag gcgggaataa tattgttcga
781 attgttgcaa ctaacagcag cggattacct aatattgatt cattaaaggt aataggcacc
841 aacccgtcag ccggcagttg ttcaagcaac tcgtcatcca ctagttcatc gtctagctca
901 agttcatcaa gcagtaactc cggtggcaaa ggctctagct gccgttctac aggcagtcaa
961 tctgtttcct ctactattaa agttactagc gggactttcg atgggaactg taaaacgtat
1021 aaccctacaa gtgcccttgg cgatggcagt caatcagaaa gccagaaacc ggcattccga
1081 gtggagaacg gcgcaacact caaaaacgtg attctaggca acaatggcgt agacggtatt
1141 catgtttata acggcggcac cttggataac atccgctgga ccaatgtggg tgaagatgca
1201 atgaccgtta aatctgaagg aaacgttacc gtttcaaata ttgagggtta tgacggttca
1261 gataaattta tacaagtaaa cgcagttacc aacctaaagg tttctaattg cattgtagat
1321 aaaatgggta aatttttacg tcagaatggc ggtaaaactt tcgctatgtc tgtaaccgta
1381 gataattgtg atatctcaaa tatgggtgaa ggtgttttcc gctcagacag cccaaatgca
1441 acagcgagaa tcacaaatag ccgattaaaa aatgcaggcg acatttgtat tggtaagtgg
1501 aaaagctgca catcttccaa cattaccagc ttctaa
LOCUS NZ_AABI02000004 1368bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：203603..204970
VERSION NZ_AABI02000004.1 GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1368)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1368
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1368
/gene＝″Mdeg1109″
CDS 1..1368
/gene＝″Mdeg1109″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00065735.1″
/db_xref＝″GI:23027280″
/translation＝″MIMMRNKILLALVLCGASASAFAASNRPSGYTTICKTDQTCSVS
SSTNVAFGAAGKFVYKVINGTFTCNTSTFGSDPNPAKSVKECSVPTNGSSSTSSTSSS
SSSSSSSSSGSSSSCGTGGGATVCLSAGGGSNDIDLTWTVSGSISSAQVYRDTDSNPS
GRTRIAQLGGDARSYSDTNVSAGKQYYYWIKFGANGSNYNSNAASATYSGSSSSSSSS
SSSSSSSGGSAECKAGATISGKTVDCGGKEIGLSCSGDSETQPPVLTLKNATIKNLVI
SAKGGSDGIHCTGNCTMENVVWKDICEDAATNKTDGITMTIIGGSAYNSTSGYGGKPD
KVFQHNSKNSTTVIKGGFTLTGEHGKLWRSCGNCTNNGGPRNVTIDNVKVDAKIGSIV
GVNRNYGDKATIKNLKIKDYKSGSPKVCEEYKGVQKGSGESSKYGEYWDTANCDVSKS
DVSAL″
gene 互补链(174..356)
/gene＝″Mdeg1110″
CDS 互补链(174..356)
/gene＝″Mdeg1110″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00065736.1″
/db_xref＝″GI:23027281″
/translation＝″MPHELLEPDELLELELEELLVLLVLEEPLVGTEHSFTDLAGLGS
LPKVDVLQVKVPLITL″
ORIGIN
1 gtgataatga tgcgtaataa aatcctattg gcgcttgtat tgtgtggagc ttctgcctct
61 gcctttgcgg ctagtaatcg tcctagtggt tacacaacta tctgtaaaac cgatcaaact
121 tgttctgtaa gctcgtctac caacgttgcg ttcggcgctg ctggtaagtt tgtttacaaa
181 gtaattaacg gtacctttac ttgtaataca tctacttttg gcagcgatcc taaccctgct
241 aaatctgtaa aagaatgttc tgtacctact aatggttctt ctagcactag cagcaccagt
301 agttcttcta gctctagttc aagtagctca tcgggttcaa gcagctcatg tggcactggt
361 ggcggcgcaa ctgtatgttt aagtgcaggt ggcggcagta acgatatcga tttaacttgg
421 acagtatctg gttctatttc tagcgctcag gtttaccgcg acacagattc taaccctagt
481 ggtcgcacac gtattgctca attaggtggc gatgcaagaa gctatagcga tacgaatgtt
541 agtgctggta agcagtacta ctactggatt aagtttggcg ccaacggctc taactacaat
601 tcgaatgcgg cttctgctac ctatagtggt tcaagtagct catcgagttc ttcaagctct
661 tctagttcct catctggcgg ctcggctgaa tgtaaagctg gcgctactat ttctggtaaa
721 accgtagatt gcggtggtaa agaaattggc ttgtcgtgct cgggtgatag tgaaactcaa
781 ccaccagtat taacgcttaa aaatgccacc attaaaaact tggtaatttc tgctaaaggt
841 gggtccgacg gtattcactg tactggcaac tgcaccatgg aaaatgttgt ttggaaagat
901 atctgtgaag atgctgctac caacaaaacc gacggtatta ccatgaccat tattggtggt
961 agtgcgtata actctacaag cggttacggc ggcaagccag ataaggtttt ccaacataac
1021 tctaaaaaca gtactactgt aattaaaggc ggctttacat taacaggtga gcacggcaaa
1081 ttgtggcgtt catgtggtaa ctgtactaat aacggcggcc cacgtaatgt gactatcgac
1141 aacgttaaag tagacgcgaa aataggcagt attgttggcg ttaaccgcaa ctatggcgat
1201 aaggcaacaa tcaaaaactt aaagattaaa gactacaaat ctggtagccc caaagtgtgt
1261 gaagaataca agggtgtaca aaagggtagt ggcgagtctt ctaagtatgg cgaatactgg
1321 gatactgcaa actgcgatgt aagtaaatca gatgtgtctg ctctttaa
LOCUS NZ_AABI020000101275bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_14，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000010 REGION：互补链(30476..31750)
VERSION NZ_AABI02000010.1 GI：28878292
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1275)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028613.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1275
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1275
/gene＝″Mdeg2416″
CDS 1..1275
/gene＝″Mdeg2416″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG5295:自转运体粘附素(Autotransporter adhesin)″
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/db_xref＝″COG:COG5295″
/translation＝″MFNKILVAVGLLAASLSVHAATNRPSGYTTICKVGETCSVSQST
NVAFGASGQFVYKVLNGSFSCSVSTFGSDPIPSKSVKECSIPSNGSSSSGSSSSSSSS
SSGSSSGGGCGSGGGSTVCLSASGSSNGINLSWSVSGSISSVQLYRDTDSNPSGRTRI
ASVSSSTTSFSDTGAASGTTYYYWVKYYVNGTAYNSGVASAVRGSSSSSSSSSSSTSS
SSGGKGSSCSSTGSQSVSSTIKVTSGTYDGGCKTFNPTSALGDGSQSESQKPAFRVEN
GATLKNVIIGNNGVDGIHVYNGGTLNNILWTNVGEDAMTVKSEGNVTVTNVEGYDGED
KFIQVNAVTNLKVSNCIVNKMGKFLRQNGGKTFAMSVSVDNCDISNMGEGIFRSDSPN
ATAVITNSRLRNAGDICIGAWKSCKSSNISSF″
ORIGIN
1 atgtttaaca agatactcgt tgcagtagga ttacttgcgg ctagcctttc tgtgcacgcc
61 gcaacaaacc gcccaagtgg ttatacaaca atttgtaagg ttggtgaaac atgctcggta
121 agtcagtcta cgaatgtagc ctttggcgcg tctgggcagt ttgtgtataa agtattaaac
181 ggtagctttt cttgtagtgt ttctacgttt ggtagtgacc ctattccttc taaatctgta
241 aaagaatgtt caatcccatc aaacggctct agctcttctg gctcgtcttc atcttcgtct
301 agcagctctt ccggtagctc ttctggtggt ggctgtggca gcggtggtgg ttctacggtg
361 tgcttatcgg cctcgggttc tagcaatggt atcaatttaa gttggtctgt atctggttct
421 atatcttccg tgcagcttta tcgcgatacc gattcaaacc caagcggtcg cacgcgtatt
481 gctagtgtat ctagctctac tactagcttt agtgataccg gcgcggcatc gggcaccact
541 tattactact gggttaaata ttatgtaaat ggtactgctt acaactcggg tgttgcttct
601 gcggtgcgcg gttcttctag ctctagtagt tcaagttctt ccagcacttc tagcagttct
661 ggtggaaaag gttctagttg tagctctact ggtagccaat ctgtgtcttc tactattaag
721 gtaaccagcg gtacttacga tggtggttgt aaaacattta accctaccag tgctttgggt
781 gatggtagcc aatctgaaag ccaaaaacct gctttccgtg tagaaaacgg tgcaacgtta
841 aagaatgtaa ttattggcaa taacggtgtg gatggtattc acgtttacaa cggcggtacg
901 ttaaataata ttctttggac taacgtaggt gaagatgcca tgaccgttaa gtctgaaggt
961 aacgtgacgg taaccaatgt tgaaggctat gacggcgaag ataagtttat tcaggtaaac
1021 gcagtgacta acttaaaagt ttctaactgt attgtgaata aaatgggtaa gtttcttcgt
1081 cagaatggtg gtaaaacatt tgccatgtcg gtaagtgtag ataactgcga tatatctaat
1141 atgggtgaag gtatcttccg ttcagacagc ccgaacgcta cagcggttat tactaacagc
1201 cgtttacgca acgctgggga tatttgtatt ggggcttgga aaagttgtaa atcttccaat
1261 atcagcagct tttaa
LOCUS NZ_AABI02000027 1179bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_27，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000027 REGION：互补链(32448..33626)
VERSION NZ_AABI02000027.1 GI：28878275
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1179)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029524.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1179
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1179
/gene＝″Mdeg3302″
CDS 1..1179
/gene＝″Mdeg3302″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00067887.1″
/db_xref＝″GI:23029557″
/translation＝″MKKLILMVALLAFSVSSFAALSSGRYIIVSKLNGNALDVDSFST
ADGANVMQWFALGGVNQQFDVAVLSDGSYSIRPVHSGKSLDVYAWNADDGAELRQWAY
TGADNQRWYIDNQSGDYYSITSKFSGRALDVWGMSMYTGADVRLYSYWGGAGQLWTFQ
KVGSSSECYAGATLTNRFVDCGGKTIGLSCVGDSETQGAVLTLKNSSIRNVKLAANGG
ADGIHCTSGNCTLADVVWNDICEDAATNKSEGGTLTIVGGSAYNSTGGYGGTPDKIFQ
HNSKNSTTIVAGGFTAYGTHGKLWRSCGNCTNNGGPRNLLVYSVNIDASIGAIAGVNR
NYGDRATIRDLKIKNYSSGSPHVCDEYQGVQKGNSSTKYGEYWNTASCDVSRSDVSGL
″
ORIGIN
1 atgaaaaaac ttatccttat ggtggcgctg ttggctttta gtgttagttc ttttgctgca
61 ctgtcttcag gccgctacat tattgtttct aaacttaatg gcaacgcgtt agatgtagat
121 agctttagca ccgcagatgg cgccaatgtt atgcagtggt ttgctttggg tggtgtgaac
181 cagcagtttg acgtggcagt gcttagcgat ggcagttact ccatacgacc agtgcacagc
241 ggtaagtcat tagatgtata tgcgtggaac gcagacgatg gtgcggaact tcgtcagtgg
301 gcatacacag gcgcagataa ccaacgttgg tatatcgata atcaaagtgg cgattactat
361 tcaattacgt ctaaatttag cgggcgcgca ttggatgtat ggggtatgag tatgtacacc
421 ggcgcagatg tccgccttta ttcatattgg ggcggcgcgg ggcagctgtg gaccttccaa
481 aaggtaggta gctcaagtga gtgttacgca ggtgctacgt taacaaaccg ctttgtggat
541 tgtggcggca aaacaatagg ccttagttgt gtaggcgata gtgaaactca aggcgcggtg
601 ctaaccctta aaaactcgtc cattcgcaat gttaagttgg ctgcaaacgg tggtgcggat
661 ggcattcact gcactagtgg caactgcaca ttagccgacg ttgtttggaa cgatatttgt
721 gaagatgctg ccacgaataa gtctgaaggt ggcaccctga ctattgtggg tggttcggcg
781 tataactcta ctggcgggta tggtggtaca ccggataaaa tttttcagca caactcgaaa
841 aacagcacaa caattgttgc cggcggcttc actgcatatg gtacccacgg taagttgtgg
901 cgctcgtgtg gtaactgtac aaacaacggc ggtccgcgta atttactggt ttatagcgtg
961 aatattgacg caagtattgg cgcaattgct ggtgttaacc gcaattacgg cgatagagcg
1021 accattcgcg acctaaaaat aaagaattat tcttctggca gcccgcatgt gtgtgacgaa
1081 tatcaaggcg tacagaaggg caattcttct acaaaatatg gcgagtactg gaataccgca
1141 agttgtgatg tttcgcggtc agatgtaagt gggctttaa
LOCUS NZ_AABI02000006 2202bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_6，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000006 REGION：58091..60292
VERSION NZ_AABI02000006.1 GI：28878296
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2202)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027577.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http//www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2202
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2202
/gene＝″Mdeg1441″
CDS 1..2202
/gene＝″Mdeg1441″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066061.1″
/db_xref＝″GI:23027623″
/translation＝″MFRYILTAFALVAAASCAQAATNRPSGYTTICKTNQTCSVSSPT
NVAFGASGKFTFKVLNGSFVCSVATFGSDPNPAKSAKECSIPSDGSSSTSSTSSTSSS
SSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGSSQAGCGSGGGATVCLSATDTASAIN
LNWTVSGSLSSVQVYRDTDPNPSGRTRLTSLSPSVTSYTDNNAQAGTTYYYWIKFGAN
GSNYNSGAASAVIANTGNDDEGCGSDVCLTATANIGSIGLSWGSSAALTSVQIYRDTD
SNPSGRTRIASLSTSATSFTDSTTAVGTTYYYWVKYGLNGSQLNSNVASATALQNNTG
NASCPGETSGETAATVYYVTPNGSASASGNSFASAMDIDTALSIVGAGQMILMQPGTY
TVAYSAGNKNTKVLSRSGAAGAPIKMVAANCGRAVFDFSFPEREWVQDSYGFFLTGDY
WYFKGIEITRAGYQGVYVTGAHNTFENCAFYYNRNTGLEINKGGSYTTVINSDAYRNY
DPKKNGSMADGFGPKQTQGPGNKFIGCRAWENSDDGFDLYDSPEEVTIENSWAFRNGV
DVWGYGGFAGNGNGFKLGGNHVAANNRITNSVAFGNPVKGFDQNNNAGGITVLNCTAY
ANGTNYGFGNNLNSGEQHYFRNNVSVSGAVNISNADNKYNSWNGGVTASTADFENVDL
SKATAARNIDGSLPNNGLFRLKSGSDLIDAGVEVGLPSNGSAPDMGAFEAN″
ORIGIN
1 atgtttcgat acatccttac tgctttcgca ttggtggcag cggcttcctg cgcgcaagca
61 gctaccaatc gccctagcgg ttacaccacc atatgtaaaa ccaatcaaac ctgctctgtt
121 tcaagcccta ccaatgtggc gtttggcgca tcgggtaaat ttacctttaa agtgcttaat
181 ggctcttttg tttgtagcgt agccactttt ggctccgacc ctaacccggc taaaagtgct
241 aaagagtgct ctattccgtc ggatggctct tccagcacct ctagtacttc gagcacatcg
301 tctagttcta gtagttcatc tagcagcaca agttcaagca gcagctctag cagttcttct
361 agctcttcgt cttccagtag ctcaagttct agttcaagtg gctcttcgca agctggctgc
421 ggtagtggcg ggggagcaac ggtttgttta tcggcaaccg atacagctag tgctatcaat
481 ttaaattgga cagtgagtgg ctcgctgtcg agcgtgcagg tgtatcgcga taccgatccc
541 aacccaagtg gacgtacgcg gttaacgtcg ttaagccctt cggtaacaag ctacaccgac
601 aacaacgcac aggccggtac aacctactat tactggatta aattcggcgc aaacggcagc
661 aactataatt ccggtgctgc gtcggctgta atagccaata ccggtaacga tgatgaaggt
721 tgtggtagtg atgtgtgctt gacggcaacc gctaatattg gctctatagg cttaagctgg
781 ggctcttctg ccgctttaac cagcgtacaa atttatcgcg atacagattc aaacccaagt
841 gggcgtacac gtattgcatc gcttagcact tctgcaacca gctttaccga ttcaaccact
901 gcagtaggca caacgtatta ttactgggtt aaatacggct taaacggcag ccagctaaac
961 tctaatgttg catctgccac tgctttgcaa aataacactg gcaacgcaag ttgccccggt
1021 gaaacaagtg gcgaaactgc agcaaccgtg tattacgtaa caccaaacgg ttcggctagt
1081 gcaagcggca atagctttgc atctgcaatg gatatagaca cagcactttc aattgtaggc
1141 gcggggcaaa tgatattaat gcagcctggt acctacaccg ttgcctatag tgcgggtaat
1201 aaaaatacca aagtgctttc gcgctcgggt gccgctggtg cacctatcaa aatggtggca
1261 gccaattgcg gtcgtgcagt gtttgatttt tcgttcccag aacgtgagtg ggtgcaagat
1321 tcttacggct ttttcttaac tggcgattac tggtatttta aaggaataga aattacccgt
1381 gcaggctacc aaggtgtgta tgtaacgggt gcgcacaaca catttgaaaa ttgcgccttt
1441 tattacaacc gcaatacagg tttagaaatt aacaaaggcg ggtcttacac caccgtcatt
1501 aattcagatg cctatcgcaa ttacgatccc aagaaaaacg gcagcatggc cgatggcttt
1561 ggccctaaac aaacccaagg cccaggcaat aaatttattg gttgccgcgc gtgggaaaac
1621 tccgacgatg gatttgacct gtacgatagc ccagaagaag taactattga aaatagctgg
1681 gcatttcgca acggtgtaga tgtatggggt tacggtggtt ttgcgggtaa tggcaacggc
1741 tttaaattgg gcggtaacca cgtggctgca aacaatcgta ttaccaactc ggttgcgttc
1801 ggcaaccccg taaaaggttt tgatcaaaac aataatgccg gcggtattac agtgcttaat
1861 tgcacagcct acgccaacgg cactaactac ggctttggca acaacttaaa ctcgggtgag
1921 caacactact tccgcaataa tgtttctgta tctggcgctg tgaatattag caatgccgac
1981 aacaaataca attcgtggaa cggcggagta acagcatcca cggcagattt tgaaaacgta
2041 gatttatcca aagccaccgc tgcacgtaac atagatggca gcctgccaaa caacggccta
2101 ttccgcttaa aaagcggcag cgatttaata gacgccggtg tagaggtagg tttaccaagt
2161 aacggcagcg cgcccgatat gggagcgttc gaagctaact ag
LOCUS NZ_AABI02000042 2103bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_42，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000042 REGION：7251..9353
VERSION NZ_AABI02000042.1 GI：28878260
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2103)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029937.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2103
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2103
/gene＝″Mdeg3649″
CDS 1..2103
/gene＝″Mdeg3649″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00068232.1″
/db_xref＝″GI:23029941″
/translation＝″MKNVFNTQKTKRHCNYAYNAKAAKPFSQKALVQKCAAAALSVGL
LGAVGNAYAISCSATADTWGGGYVLNVTVTNDTNNAISNWALALNYDQAAAITNSWNA
SVSANGNVVNATNIGWNGNLAAGQSTSFGLQGTYTGNFSLPVCVGQGQSSSSSSSTSS
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSSTGGSSELTIQEDNSGFCGV
DGSIDSNNSGFTGSGFANTDNATGKSVDWSVSVPYSGNYLLEWRYANGSGNNRAGAIE
VNGNARGNQSFPTTGAWTSWTTASANVSLDAGTNLISLVASTGEGLGNIDSLTVIGND
IQTGACDSTGSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSTSSSSSGAPMLPQAGNPINGKFGKYK
SWQKGSLSADKQFADILLSHQYTNGGFPKNQAYDSMGSGGNSAGTIDNDATT TELLFL
ADVYQRTGETKYRDGARKALDFLLDMQYSSGGWPQYYPVRSGYYEHVTFNDDAMARVL
IVLDKAKQGVAPLNGDLLTSNQRARLSSAVNKGVDYILKSQWRQNGTLTVWCAQHGKD
DYLPKKARAYELESLSGSESVLVVAFLMSQPQTPEIKTAVKAAINWFRSPNTYLAGYT
YDSSRKGDGNSPIVAKSGSKMWYRFYDLNTNRGFFSDRDSRKVYDILDISTERKDGYR
WGGDYGSGIISYAESVGY″
gene 互补链(405..623)
/gene＝″Mdeg3650″
CDS 互补链(405..623)
/gene＝″Mdeg3650″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00068233.1″
/db_xref＝″GI:23029942″
/translation＝″MVNSLLPPVELVDEDDELEDEELLELLEELLEELEDELLDELEE
LDELLLVLLLEEELWPWPTQTGKLKLPV″
ORIGIN
1 atgaaaaacg tatttaatac acaaaaaacc aagcggcatt gcaactatgc ctataacgcg
61 aaagctgcca aacccttcag ccaaaaagca ctggtacaaa agtgtgcggc tgcggcattg
121 tctgttggct tactgggggc cgtgggtaat gcgtatgcaa tatcctgttc ggcaactgct
181 gatacctggg gtggtggcta tgtgctaaat gtgaccgtta ctaacgacac aaataatgca
241 attagcaatt gggcgctagc tttaaattac gatcaagctg cagccataac taattcgtgg
301 aacgcgagtg tgtctgcaaa tggcaatgtg gttaatgcta ccaacattgg ttggaatggc
361 aatttagcgg ctggccaaag tacaagtttt ggtttgcaag gcacctatac cggcaacttt
421 agtttacctg tctgtgttgg ccagggccaa agctcttcct ctagtagcag tactagtagt
481 agttcgtcca gctcttcgag ttcatccagc agttcatctt ccagctcttc aagtagttct
541 tcaagcagct ctagtagttc ttcatcttct agctcatcgt cttcgtccac cagttcaact
601 ggtggaagta gtgagttaac cattcaagaa gataatagcg gcttttgcgg ggttgatggt
661 tcaatcgatt ccaataattc aggctttacc ggaagcggct tcgccaatac cgataacgcg
721 acaggcaaaa gcgtagattg gagtgtgagc gttccttata gtggcaacta tttgcttgaa
781 tggcgttacg caaatggttc cggtaataac cgtgctggcg cgattgaagt aaatggtaac
841 gctcgtggta atcaaagctt tcctactaca ggggcctgga ctagctggac aacggcaagt
901 gctaacgtaa gtttggatgc aggtacaaac ttaattagct tggttgcatc tacgggcgaa
961 ggcttaggga atattgattc acttactgtc attggtaacg atattcagac cggcgcttgt
1021 gattctacag ggtctagctc ttccagtagc tctagttcct ccagtacttc tagctcaagt
1081 tccagctcca gttcaagtac cagtagttct agcagcggtg cgcccatgtt acctcaagct
1141 gggaacccca ttaatggcaa gtttggcaaa tataaatctt ggcaaaaagg aagcttgtct
1201 gccgataagc aatttgcaga catccttcta tcgcaccaat ataccaatgg cggatttccc
1261 aaaaaccaag cctacgacag tatgggtagc ggtggtaaca gtgcgggcac aatcgacaac
1321 gatgccacaa caacagagtt gttattctta gctgatgtgt accagcgtac tggtgaaacc
1381 aaataccgag acggtgcgcg taaagcgtta gatttccttt tggatatgca gtattcatcg
1441 ggcggctggc cgcaatacta ccctgtgcgc agtggctact acgagcatgt aacatttaac
1501 gacgatgcaa tggcgcgagt gctaattgtt ttagataaag cgaaacaagg tgtggcgccg
1561 ctaaatggcg atctattaac atctaaccag cgtgcgcgtt taagcagtgc ggttaataag
1621 ggcgtggatt acattcttaa atcgcagtgg cgtcaaaacg gaaccttaac tgtttggtgt
1681 gcgcaacatg gtaaagatga ttatctacct aaaaaggcgc gtgcttacga gctggaatcg
1741 ttgagtggta gcgaatcggt attggtagtt gcattcctta tgtctcaacc tcaaacccct
1801 gaaattaaaa cggcggttaa ggctgctatc aattggttta gaagccccaa tacttactta
1861 gctggttaca cttacgattc atctagaaaa ggcgacggca acagccccat cgtcgcgaaa
1921 agcggtagta aaatgtggta tcgcttctac gacctaaata ctaaccgtgg cttcttcagt
1981 gatagagata gcagaaaagt ttacgatatt ttagatattt ctacagagcg taaagatggc
2041 tatcgttggg gcggtgatta tggctccggc atcattagtt acgcggaaag cgttggttac
2101 taa
LOCUS NZ_AABI02000006 1725bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_6，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000006 REGION：互补链(56047..57771)
VERSION NZ_AABI02000006.1 GI：28878296
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1725)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027577.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1725
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
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/gene＝″Mdeg1440″
CDS 互补链(1..＞248)
/gene＝″Mdeg1440″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
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ELEELVEAFISLAGPELPPPOALNSVAASASVIRRRKFIIVALYVFILRAHK″
gene 1..1725
/gene＝″Mdeg1439″
CDS 1..1725
/gene＝″Mdeg1439″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066059.1″
/db_xref＝″GI:23027621″
/translation＝″MNFLRLITLALAATLLSACGGGSSGPAKEINASTSSSSSSSSTS
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGGSAGTLTIQESEKGFCTVNGEIVNNH
EGYSGTGFVDTANAEGASITWKVDVDGGNYDVSVRFANGSTARGATLSSNEINTTYGF
ATTGDWATWADETHTVSLAAGENTIQLSALTAGGLPNVDAITIAGAGVLAADCATEHT
GPMLSQTGNPIYTELNNYKSWLTGSGTTAAKLAADKTIADNMITWQMPHGGFYKYGVS
KYSSAWNGSDARSGWTGANGVELGTIDNDATVSELLFLADVYKRSGETKYRDAARSAL
EFLLTMQYSTGGWPQVYPARTGTSY SNHVTFNDNAMARVLILLDKAARLEAPLDGDIF
TTDQHTRITTAINGGIDFILNAQIVQGDVKTVWCAQHDPYTYEAKAARSYELASKSGK
ESVLVVAFLMTRPQSEAIENAVKAALAWYRNPNVQVANTEYVKRTNNDDNYNPIQTKA
GSTMWYRFYD LDQDVGFFSGRSASDNPAGNGKQYDIMLIEPERRYGYEWGGNYGKKII
DYANSVGY″
ORIGIN
1 atgaattttc tacgccttat tacactcgca ctcgccgcaa cactattaag tgcctgcggt
61 ggaggtagtt ctggcccagc caaagagata aacgcttcca ccagttcctc tagctctagc
121 agctccacga gttctagcag ctcatccagc tctagtagtt cgtctagctc aagcagctcg
181 tcttccagtt ccagcagctc atcctctagc tctagcagct cttctggtgg tagcgccggc
241 acactcacta ttcaggaaag cgaaaaaggc ttttgcactg ttaacggtga gattgtgaat
301 aatcacgagg ggtatagcgg tacaggtttt gtagacaccg ccaatgccga aggcgccagc
361 attacttgga aggtagatgt cgatggcggc aattatgatg taagtgtgcg attcgcaaac
421 ggttccactg cacgcggcgc aacgcttagc agtaacgaaa taaataccac ctatggtttt
481 gctaccactg gcgactgggc cacatgggca gacgaaaccc acaccgtttc gttagccgca
541 ggcgaaaaca ccatccagct aagtgcactt accgcgggtg gcttacccaa tgtagacgct
601 attactattg caggtgcagg tgtactcgca gcagactgcg ccacagagca tactgggcca
661 atgctttcgc aaacaggcaa ccctatttat accgagttaa ataattacaa gtcctggcta
721 acgggtagcg gcacaacagc agccaaatta gccgcagata aaacaattgc cgacaatatg
781 attacctggc aaatgcctca cggtggtttt tataaatacg gcgtatctaa atacagctcg
841 gcttggaacg gtagcgatgc ccgctctggc tggactgggg ccaacggcgt tgagcttggc
901 acaattgata atgatgcaac cgttagcgaa ttattatttt tagcggacgt atataaacgc
961 agcggtgaaa ctaaatatag agatgccgca agaagcgcgt tggaattttt acttaccatg
1021 caatattcca ctggcggttg gccacaggtt taccctgcgc gcactggcac cagttactcc
1081 aatcacgtta cgtttaacga taacgccatg gctcgtgtac ttattttatt ggataaagcc
1141 gcgcgattag aagcaccact cgatggcgac atttttacca cagaccagca cacgcgtatt
1201 actaccgcaa taaatggcgg catcgatttt attttgaatg cgcaaatagt acagggcgac
1261 gtgaaaaccg tttggtgtgc gcaacacgac ccttatacct acgaggcaaa agcagctcgc
1321 tcttatgagt tggcctctaa aagcggtaaa gaatctgtat tggttgtagc gtttttaatg
1381 acacgcccgc aaagcgaagc catagaaaat gccgtgaaag cagcccttgc ttggtaccgc
1441 aacccaaatg ttcaagtcgc caacaccgag tatgtaaaac gcacaaataa cgatgacaac
1501 tacaacccga tacaaacgaa agcaggtagc actatgtggt accgctttta cgatttagac
1561 caagacgttg gattctttag cggccgctct gcaagtgaca acccagcagg taacggtaag
1621 caatacgaca ttatgcttat tgaacccgag cgcaggtatg gctatgaatg gggtggcaat
1681 tacggcaaaa aaataatcga ttacgctaat tcggtagggt attaa
LOCUS NZ_AABI02000026 1392bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_26，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000026 REGION：5430..6821
VERSION NZ_AABI02000026.1 GI：28878276
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1392)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029482.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1392
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1392
/gene＝″Mdeg3237″
CDS 1..1392
/gene＝″Mdeg3237″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00067822.1″
/db_xref＝″GI:23029488″
/translation＝″MYKISRRTTLKGLGLTCLAGCTTSLPTLEQDPWAFAQNIADNTT
IPTFPNKEFNLLEFGGKEGSDNTLAFKKAIAACSKAGGGKVVVPAGRFETGAIHLESN
VNLHISEGATIAFFTDPKYYLPAVFTRWEGMECMGYSPLIYAYGKTNIAITGKGTLDG
QADPTHWWAWKGNKEWGVEGYPSQKESRNQLFAQAEAGDPVRERVYADGHYLRPSFVQ
PYKCENVLIEDITIINAPFWLLHPTLSQNVTVRGVHLESLGPNSDGCDPESCKNVVIE
NCFFNTGDDCIAIKSGRNNDGRRLATPTENVIIRNCKMEAGHGGVVIGSEISGGVRNV
FAENNVMSSPDLEKGIRIKTNSVRGGLLENIYVRNCTIGEVQQAIVINFQYEEGDAGK
FDPTVRNVEIRNLVCQHALQVFNIRGFERAPIQNFRIIDSTFVRGDNPGVIEHTTGLV
IDNVQVNGKAFNI″
ORIGIN
1 atgtataaaa tttcacgccg cacaacactc aaaggcttag gcctaacttg cctagccggc
61 tgcaccacca gcctacccac actagagcaa gacccatggg cttttgcaca aaacatagcg
121 gacaacacca ccatccccac attcccaaac aaagaattta atttactcga attcggcggc
181 aaagaaggga gcgacaacac cctcgccttc aaaaaagcga ttgcagcatg cagcaaagca
241 ggtggcggca aggtggtagt acccgcagga cgatttgaga caggcgccat ccacttagag
301 tcgaacgtta accttcatat tagcgaaggc gctaccatcg ccttttttac cgaccccaaa
361 tattacctgc ctgcggtttt cactcgctgg gaaggcatgg agtgcatggg ctactcaccc
421 cttatatacg cctacggcaa aaccaacata gccattaccg gtaaaggcac cctcgacggt
481 caagccgacc caacgcactg gtgggcatgg aaaggcaaca aagaatgggg cgtagagggc
541 tacccaagcc aaaaggaaag ccgcaaccaa ctatttgccc aagcagaagc tggcgacccc
601 gttagagagc gcgtgtatgc agacggccac tacctgcgcc cctcgtttgt gcaaccctac
661 aagtgcgaaa acgtgctgat agaagacata actattatca acgctccctt ctggttgcta
721 caccccaccc tttcacaaaa cgtcactgta cgcggtgttc acctagaaag cctaggcccc
781 aactcggatg gctgcgatcc tgaaagctgt aagaatgtag ttatcgaaaa ctgctttttt
841 aataccggtg acgactgtat cgctattaaa tctggccgca acaacgatgg ccgcaggctt
901 gccacaccta ccgagaacgt gattattcgc aactgtaaaa tggaagcggg tcacggtggc
961 gtagttatag gctcagaaat ttctggcggc gtgcgcaatg tgtttgccga aaataacgta
1021 atgagcagcc ccgatttaga gaaaggcatt cgcattaaaa ccaactctgt gcgcggcgga
1081 ctgctagaga acatctatgt gcgcaactgc accataggcg aagtacaaca agccattgtt
1141 attaacttcc aatacgaaga aggcgatgcg ggtaaatttg accccaccgt gcgcaatgta
1201 gaaatacgca atttggtctg ccagcacgcc ttacaagtgt ttaacatccg cggttttgag
1261 cgcgccccca ttcaaaactt taggataatc gacagcacct ttgtgcgtgg tgacaaccca
1321 ggcgtaattg aacataccac agggttagtt atcgacaacg tccaagtcaa cggcaaagcg
1381 tttaacatct ag
LOCUS NZ_AABI020000153255bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_15，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000015 REGION：互补链(113840..117094)
VERSION NZ_AABI02000015.1 GI：28878287
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-3255)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028706.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http:///www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..3255
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..3255
/gene＝″Mdeg2590″
CDS 1..3255
/gene＝″Mdeg2590″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG4677:果胶甲酯酶″
/protein_id＝″ZP_00067183.1″
/db_xref＝″GI:23028801″
/db_xref＝″COG:COG4677″
/translation＝″MLDMTKRTLSALLALCATLTACGGGDITSGGDAIPAVNQPAPVQ
EPEPEPEPQPEPEPEPEPEPEPEGAWTCPETGFYFCDDFEDGTFDDKWDDLIATYDLP
SPGVFDILDEASGKSLRFTAGTRGGDLADGELIVVKDTAFENVTNADYSLEYRIRPRN
NGNTGNKYLHAMSRYEGPKEYYFGGLSMQGSTASTQVEAGFVLPENTTSISNRLVQAK
YPLELGTTGMSDGYWYEVRFDMIGNTGTIYLDGEPQGSFTDADGLYPLTGKIGFMTYN
RSFEIDWVRVGDPAIKPVQLSLDYASPLWEAAADQDPLNVTVTAIQSDGVTADTFTAV
SSDTNVVTTSIANNVVTITPVAQGSATVTFTAGSDANRVKTIDVEIARAFVMSTTDYG
DIASKVTPTVGMTDANPDAHLSITFDSAPTLSGVGSIRIYNAADDSEVDVIRLTDESD
ALGYAGQANKRELNTTPVYLDGNTLHVSPHSNALAYGQDYYVAIGDNVLTGATLNTIA
FDGLGKNAGWTFSTKASAPTGNTVTVDDDASADFSTVQGALNYAMANTTDDSITINIA
NGNYYEPLYLAERNNVTLKGESRDGVVIHYNNHEAMNGGSTGRANFYVANSDMLTLET
LTLKNGHQRTGGGDQAETIYFNSSSNTDRLIAKGAAFISEQDTLLLKGYNWFYNSLVV
GNVDFIWGYSAVTLFEETEIRSIADSKPGAGDSGGYILQARTPLETDLGFVFLNSELT
KATGVNGNEIGDGKTYLARSGGSTGYFDNISFINTKMGSHIADIGFAYADINGQPAPN
PAVATADAGWREFGSMDSAGTALDVSARCGDSGSCIQLTQAQVDAQYCNRAQIFASWN
DWTGWDPLPEDTSDDACADPVIPGAVTWTGIAMSLGGSTTSVSGNITEQTDSNITFTA
DGGKFESSKLSTYFAYQELTGDFVISAKAKTIGLLRENGSYQFPTGILMCVCDAAAAT
TGLMGHASLNDITVDTTVNLVATYGHIQTTAGS WNKTGTTDVTAGDNLYIQLERAGNS
YTARYSTDGGATYSNIGGS SFTDTLPDTLKVGFFATPNNTGEQTFVYEDIQITQ″
ORIGIN
1 atgctcgata tgacaaaacg aactctatct gcgttgttag ccctgtgcgc aacattaacg
61 gcttgcggtg gtggcgatat aaccagcggc ggcgatgcta taccggcagt aaaccaaccc
121 gccccagtac aagagcctga acctgaacct gaaccacaac cggaacccga acccgaaccc
181 gagcccgagc cagaaccaga gggcgcgtgg acctgcccag aaacaggctt ctacttctgt
241 gacgactttg aagacggcac gtttgatgac aagtgggacg atctcattgc cacatacgac
301 ctaccaagcc ctggtgtatt cgacatatta gacgaagcaa gcggcaaatc tttgcgcttt
361 acagcaggca cccgtggcgg tgacttagca gatggcgaac ttattgttgt aaaagataca
421 gcattcgaaa atgtaaccaa cgcagattac tccttagagt accgtattcg cccgcgcaac
481 aacggcaaca caggcaacaa gtacctgcac gctatgtcgc gctacgaagg ccctaaagaa
541 tattactttg gcggtttaag catgcaaggc tctactgcaa gtacgcaagt agaagcaggt
601 ttcgtattgc cagaaaacac cactagcatt agcaaccgct tggtgcaggc caagtacccg
661 ttagagctag gtacaacagg catgagcgac ggctactggt acgaagtacg cttcgatatg
721 ataggcaata caggcaccat ttacctagat ggcgaaccac aaggcagctt taccgatgcc
781 gatggccttt acccattaac aggtaaaatt ggctttatga cttacaaccg ctcattcgaa
841 attgattggg tgcgagtagg cgacccagct attaagcctg tacaactttc actggattac
901 gccagcccgc tatgggaagc agcggcagac caagacccgc taaacgtaac agttactgcc
961 atacaaagcg atggcgtaac agcagatacc tttaccgcag ttagcagcga taccaatgta
1021 gtaaccacaa gtattgcaaa taacgtagta accattaccc ctgtagctca aggtagtgcc
1081 accgtgacct ttaccgctgg ttcagatgct aatcgcgtta aaacaattga tgtagaaatt
1141 gcacgcgcgt ttgttatgtc tactaccgac tacggcgata tagcttctaa ggtaacacca
1201 actgttggta tgactgacgc caacccagac gcacatttaa gcattacatt cgatagcgca
1261 cctaccctaa gcggtgttgg ctctatacgt atatacaatg cagcagacga tagcgaagta
1321 gatgttattc gccttaccga cgaaagtgat gcattgggtt acgccggcca agccaacaag
1381 cgtgaattaa ataccacacc ggtttacttg gatggcaaca ccctacacgt tagcccacac
1441 agtaacgcac ttgcctacgg ccaagactac tacgttgcca ttggcgataa cgtacttacc
1501 ggcgcaacac taaacaccat tgcgtttgat ggtttaggta aaaacgcggg ttggactttc
1561 tctaccaaag cctctgcccc taccggcaac accgtaactg tagacgacga tgcaagtgca
1621 gatttcagca cagtacaagg tgcgttgaac tatgctatgg caaataccac ggacgattca
1681 atcaccatta acattgctaa cggcaactac tacgagccgc tatatctagc agagcgcaac
1741 aacgtaacgc taaaaggtga aagccgcgac ggcgttgtta ttcattacaa caaccacgaa
1801 gccatgaacg gtggcagcac tggccgcgca aacttctatg ttgccaactc agacatgcta
1861 accctagaaa cgctaaccct taaaaacggt catcagcgca ctggtggtgg cgaccaagca
1921 gaaactatct acttcaatag cagcagcaat accgatcgct taattgccaa aggcgctgct
1981 tttattagtg aacaagatac gctgttactt aaaggctaca actggttcta caactcgctt
2041 gtggtaggta acgtagactt tatttggggc tacagcgcag taaccttgtt tgaagaaaca
2101 gaaattcgat ctattgccga ctctaaacca ggtgcgggcg actcgggtgg ctatattctg
2161 caagcgcgta cgccactaga aacagacctt ggctttgttt tcttaaatag cgaattaaca
2221 aaagctaccg gcgtaaacgg taacgaaatt ggcgatggca aaacctacct tgcgcgcagc
2281 ggcggcagca cgggttactt cgataatatt tcgtttatta acaccaaaat gggtagccat
2341 attgccgaca taggcttcgc ctacgccgac attaacggtc aacctgcccc taacccagcg
2401 gtagctactg ctgacgcagg ctggcgtgaa tttggcagca tggattctgc aggcacggct
2461 ctagatgtat ctgcacgctg cggtgatagc ggcagctgta tccaacttac gcaagcacaa
2521 gtagatgcgc agtactgtaa ccgcgcgcaa atttttgcta gctggaacga ttggacaggc
2581 tgggacccgt tgccagaaga tacctctgac gatgcctgtg ctgaccccgt tatacctggt
2641 gcagtaacgt ggactggcat tgcaatgagc cttgggggtt ctacaacatc tgtttccggc
2701 aacattaccg agcaaacaga cagcaatatt acattcactg cagacggcgg taagtttgaa
2761 tcgagcaaac tttcaactta cttcgcttat caagaattga ctggcgactt tgtaattagc
2821 gccaaagcta aaaccattgg cttactgcgc gaaaacggca gctaccagtt ccctacaggc
2881 atattgatgt gtgtttgcga tgcggcagcg gcaacaactg gcttaatggg ccacgccagc
2941 ctcaatgaca ttacagttga tactactgtg aatttagttg ccacctacgg ccacattcaa
3001 accacagctg gtagctggaa taaaactgga acgactgacg taaccgctgg cgacaacctg
3061 tatatacagc tagagcgcgc aggtaatagt tataccgcac gctactcgac tgatggcggt
3121 gccacctata gcaacattgg tggcagctca tttacagaca cccttccaga cacacttaaa
3181 gtgggtttct tcgctacgcc taacaacacc ggtgagcaaa ctttcgttta cgaagatata
3241 caaatcactc agtaa
LOCUS NZ_AABI02000026 1176bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_26，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000026 REGION：互补链(18555..19730)
VERSION NZ_AABI02000026.1 GI：28878276
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1176)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029482.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1176
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1176
/gene＝″Mdeg3246″
CDS 1..1176
/gene＝″Mdeg3246″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG4677:果胶甲酯酶″
/protein_id＝″ZP_00067831.1″
/db_xref＝″GI:23029497″
/db_xref＝″COG:COG4677″
/translation＝″MGMGTKINFLLLGFILSACSLSGCADKIKRNTPLTETALPSKKI
LYVQTEVCDPPSQLTGSCYNSLQRAIDVAHTVPSATHVTIEMAAGHYHERIVLSRGNI
DIVGAGKNKTYVQYNLNAEQGKAYHRDGWGTPGSATFTINASEVNVSDLTIENTFDFL
RNDSKDKTDPSKVRASQGVALLLDEHSDKVALYRVGLYGYQDTLFANGKRAFIYQSDI
AGNVDFIFGAGQVVIENSRVISRPRGKAIASNEIAGYITAPSTMTDAFGLVFINSRL
EREQGVADASVTLGRPWHPTTNFSDGRYADPNAIGHALFFNCFMDAHIHPARWSSMKG
TAKDGSKTLVFTPEQSRFFEVQSFGPSGNDEVTTSYHSLSADSLREQALGDWNVSIN″
ORIGIN
1 gtgggtatgg gtacaaaaat taattttttg ctattaggtt ttattttgtc tgcatgttca
61 ttaagtggct gcgccgacaa aataaagcgc aatacgcctt taaccgaaac ggcattgccg
121 agtaaaaaaa tactctatgt acaaaccgaa gtatgtgacc cgccttcgca attaacgggt
181 agttgctaca acagcttgca gcgagctatt gacgtggcgc acacagtgcc gtctgctacc
241 catgtaacca ttgaaatggc tgcggggcat taccacgaac gcattgtgct tagccgtggc
301 aatatcgata ttgttggtgc aggtaaaaat aaaacctatg ttcaatacaa cctgaatgcc
361 gagcagggta aagcttatca ccgcgacggt tggggtactc ctggctcagc tacatttacc
421 attaatgcca gtgaagtaaa tgttagcgat ttaactatcg aaaatacttt cgacttttta
481 agaaatgatt caaaagataa aaccgaccct tcaaaagtga gggcatcgca aggcgttgca
541 ttattattgg atgaacacag cgataaggtt gcgctgtatc gagtaggcct atacggatac
601 caagacaccc tatttgcaaa tggaaagcgt gcatttatct accaatcaga tattgcaggc
661 aatgttgatt ttatttttgg cgctggccaa gtggttatag aaaatagtcg tgttatttct
721 aggccgcgcg gcaaagccat tgcttccaat gaaattgccg gctatatcac agcgccatcc
781 accaatatta cggacgcctt tggtctggtt tttattaata gtcgattaga acgtgagcaa
841 ggcgtggcag atgcgtcggt caccttgggt cgcccttggc accctacaac caatttcagc
901 gatggccgat atgccgaccc aaacgcgatt ggccatgcgc tattttttaa ctgctttatg
961 gatgcgcata ttcaccccgc gagatggtct agcatgaaag gcaccgctaa agacggcagt
1021 aaaacgctag tgtttacgcc cgagcaatcg cgtttttttg aagttcagtc ctttggcccc
1081 agcggcaacg atgaagtaac cacctcgtat cattcgttaa gcgccgactc attacgcgaa
1141 caagcgctcg gcgattggaa tgtatcaatt aactaa
LOCUS NZ_AABI02000011 2745bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_9，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000011 REGION：36905..39649
VERSION NZ_AABI02000011.1 GI：28878291
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2745)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028020.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2745
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2745
/gene＝″Mdeg1862″
CDS 1..2745
/gene＝″Mdeg1862″
/codon_start＝1
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/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066475.1″
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/translation＝″MSALTRPKFGAHTKLFHAIKHALTPVIFLGAAAFPLAAHSQYNM
ENLDRGLVAIDRKDGSVLVSWRWLGQEPDNTSFNVYRNGTLLTSSPLTNKTNFVDTSG
NPNANYAVEAIVNGASQSLATTHVWSDIYRTIPLQRPPGGTTPDGVAYTYSPNDISAA
DLDGDGGYELIVKWDPSNAKDNSQSGYTGNVYLDAYEISGEFMWRIDLGRNIRAGAHY
TQFLAFDFDSDGKAEVAVKTADATKDSQGVVIGDSNADYRNSAGYVLSGPEYLTMFEG
QTGRALNTVNYVPARGSVSSWGDNYGNRVDRFLGGVAYLDGQNPSLIMSRGYYTRTVV
AAWDWRNGQLSQRWVFDSNTSGNSSYAGQGAHSLTIGDVDADGKQEIVFGAMTIDDNG
TGLNNTRLGHGDALHLSDMDPSNPGLEVFMVHECPSCYGEHGIEMHDAATGQILWSHP
GDYIDIGRGVAMDIDPRYAGYEAWASRGGLYSAKGETISSTRPSQINFAAWWDGDLLR
EILDNNYINKWNYTASSTTRLLSAGNYGAASNNGTKATPGLSADILGDWREEVVWRNS
NNQELMVFTTPHESEYRLRTLMHDPQYRTAIAWQNVGYNQPPHPSYFLGAGMTTPNQP
HITIVGEGTVQPPAPTGDAIQENATGFCGYEGTIDSNHSGYTGAGFTNTTNATGAGIN
WNLHASTAGTYRLSMRYANGSTARGAVLNVETTGNSYPMAFAPTSTWTNWQEEYVDAH
LNAGYNSIRLEANQAAGLPNLDAIYLADGLTAAACGQTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSSSSSSSSSSSSGGTTAGLACANGSTDTWGTGFVLNGFQVENEGQQATNNWQVTLQF
DQPVNITNAWGVNVETTGTTVVATSVGYNSHLNPGQSASFGMQGTSATAVSNPLCSAQ
″
gene 互补链(2292..2540)
/gene＝″Mdeg1863″
CDS 互补链(2292..2540)
/gene＝″Mdeg1863″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066476.1″
/db_xref＝″GI:23028058″
/translation＝″MACWPSFSTWKPFNTNPVPHVSVLPLAQARPAVVPPDELLLELL
LELLLELEELLEELEELLEDELLLDVWPHAAAVRPSAR″
ORIGIN
1 atgtcggcac tcactcgtcc caaatttggt gcacacacca aactgttcca cgctataaag
61 catgcgttaa cccccgttat atttttaggt gctgctgctt tcccacttgc cgctcacagc
121 caatacaaca tggaaaacct cgaccgcggg ttggtggcca tagatcgcaa agacggcagc
181 gtattagtaa gctggcgctg gttggggcaa gagccagata acaccagctt caacgtatat
241 agaaacggca cactattaac cagctccccc cttaccaata aaacaaactt tgtagatacc
301 agcggcaacc caaacgctaa ttacgcggta gaagccatag taaacggcgc gagccaatca
361 ctagccacca cacatgtatg gagcgatata taccgcacta ttccgctgca aagaccacca
421 ggtggcacca cccccgacgg agtggcatac acctatagcc ccaacgatat aagcgcagcc
481 gatttagacg gcgatggcgg ttacgagcta atcgtaaaat gggacccctc caacgcaaaa
541 gacaactcgc aaagtggcta caccggcaat gtgtatctcg acgcttacga aatatctggc
601 gagtttatgt ggcgcataga cctaggccgc aatattcgag caggcgccca ctacacgcaa
661 tttttagcat tcgattttga tagcgatggc aaagcagaag ttgcagttaa aaccgcagac
721 gccaccaaag acagccaagg agtagtaata ggagacagca atgccgatta ccgcaacagt
781 gcaggctatg ttttatctgg ccccgaatac ctcaccatgt ttgaaggcca aaccggtaga
841 gcgctaaata ccgttaacta cgtacccgcg cgcggcagtg tttctagctg gggcgacaac
901 tacggcaacc gtgttgatag atttttaggt ggcgtagcct acttagatgg ccaaaaccca
961 agtttgatta tgtcgcgcgg gtactacacc cgcaccgtgg tagcagcatg ggactggcgc
1021 aatgggcagc ttagccaacg ctgggtattt gattccaaca ccagtggcaa cagcagctat
1081 gcaggccaag gcgcgcacag ccttaccatt ggcgatgtag atgcagacgg aaaacaagaa
1141 attgtatttg gcgccatgac catagatgac aacggcaccg gcttgaacaa tacccgccta
1201 ggtcacggcg atgcactgca cctatccgac atggacccaa gcaacccagg cttagaagtg
1261 tttatggtgc acgaatgccc ctcttgctat ggcgagcacg gaatagaaat gcacgatgcc
1321 gccaccggcc aaatactatg gagccaccca ggcgactaca tagacatagg ccgaggtgta
1381 gccatggata tagacccacg ttatgccggc tacgaagctt gggcttcgcg cggtggttta
1441 tacagtgcaa aaggcgaaac aatatcgagc acgcgcccgt cgcaaataaa ctttgccgct
1501 tggtgggatg gcgacttact gcgcgaaata ctcgataaca attacataaa caaatggaac
1561 tacaccgcca gctctaccac gcgcttgcta agcgcaggta actacggtgc agcatcgaac
1621 aacggcacca aggctacacc agggctttcg gccgatattc ttggtgactg gcgcgaagaa
1681 gtggtatggc gcaacagcaa caaccaagaa cttatggtgt ttaccacccc acacgaaagt
1741 gaataccgct taagaaccct aatgcacgac ccgcaatacc gcacagccat agcttggcaa
1801 aacgtgggct acaaccaacc acctcacccc tcttactttt tgggtgcggg tatgactacc
1861 cccaaccaac cacacataac catagttggc gaaggcacag tgcagcctcc agcccctaca
1921 ggcgacgcaa tacaagaaaa cgccaccggc ttttgcggct acgaaggcac tatagatagc
1981 aaccactctg gctatacagg cgcgggcttt actaacacta ccaacgcaac aggtgcaggc
2041 attaactgga acctacatgc gtccaccgcc ggtacatacc gcctaagcat gcgttacgcg
2101 aatggcagta cggcacgagg tgctgtgcta aacgtagaaa caaccggtaa tagctacccc
2161 atggcatttg caccaacaag cacatggaca aactggcaag aagaatatgt agacgcccac
2221 ctaaacgccg gctacaacag cattcggctt gaagcaaacc aagcggcagg tttgcccaac
2281 ctcgatgcca tctacctagc cgatggtctt acggcggcag cgtgcggcca aacatctagc
2341 agcagctcgt cctccagtag ctcctctagt tcttccagca gctcttcaag ctctagtagc
2401 agttccagta gtagctcgag cagcagctca tccggcggta caacagcagg cctagcttgc
2461 gccaacggca gtacagatac atggggaacg gggtttgtgt taaacggctt ccaagtagaa
2521 aacgaaggcc agcaagccac caataactgg caagtgacac ttcaattcga ccagcccgta
2581 aacataacca acgcatgggg tgtaaacgta gaaacaacag gcacaaccgt tgtagcaaca
2641 agcgtaggct acaacagcca cctaaacccg gggcaaagtg ctagctttgg aatgcaagga
2701 acatcggcaa cggcggtaag caacccgcta tgcagtgccc agtaa
LOCUS NZ_AABI02000009 2370bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_10，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000009 REGION：151580..153949
VERSION NZ_AABI02000009.1 GI：28878293
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2370)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURN AL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028157.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2370
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2370
/gene＝″Mdeg2067″
CDS 1..2370
/gene＝″Mdeg2067″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3507:β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00066674.1″
/db_xref＝″GI:23028263″
/db_xref＝″COG:COG3507″
/translation＝″MRSLAPIKIREKIRETLMFNIRAWQLDLPLALLAFSSTSYAIDN
GTYTIQSKHSGKVVEVAAGSVDDAANVAQWPSNGHPTQQWIITQISGDDYSVINVNSG
KAMEVYDFGTTDGGNIVQYPYWGGAPQLWTITDQGGYYSLINKHSGKALDLLNWDTTD
GANIGQWAWWGGDAQLWALNTVQPSTVTFTLEENQAGFCSVDGSIDSNHTGYTGSGFA
NTTNANGQGVNWSVNVATAGTYTFTWRYAGTSNRPANLLIDGSTQVSGIALNSTGAWA
TWANSAEISVWLDTGVHSLRLQATTSAGLPNIDSLSITGQSAAAGNCSGAIEPITFAT
PSFTNIAVHDPSVIEANHQYYVFGSHLSVAKTPDLKNWSRVADGVTTNNPLFNDVTSE
LAEALAWAETTTLWAPDVTYVNGRYLMYYNACRGDSPLSAMGIASSNNIEGPYTNDGI
FLKSGMWGQTSEDGTVYDATVHPNAVDPVIFSDANNRMWMTYGSYSGGIFIMELNPST
GFPYAGQGYGKHLMGGNHARIEGAYTIYSPETGYYYMYVSYGGLGADGGYNVRVARAT
SPDGPYYDANGTNMANVKSNPSLPLFDDASIAPHGVKLMGNHVFSGTNNVLGYVSPGH
NSAYRDATTGQTFLLFHTRFPGRGEEHEVRVHEVFYNDAGWPVIAPLRYAQKVDANNP
NRSASELNAVYASELPGSYQLINHGKDISATIKNSVNITLNSNGSISGELSGSWTYNA
NTRNTVITVAGVAYRGVVSRQWNQARNRFEVTFSALSADGTAIWGVNSD″
ORIGIN
1 gtgcgcagtc tagcccccat aaaaataaga gagaaaataa gagagacact catgtttaat
61 atacgcgctt ggcaacttga cttgcccttg gcgttattgg cgttttcgtc tacaagttac
121 gctatcgata acggcactta cacaattcaa tctaaacaca gtggcaaggt tgtagaagtg
181 gccgcaggca gtgtagatga tgctgcaaat gtggcccaat ggcccagtaa tggccatcct
241 acccagcagt ggataattac ccaaattagc ggcgatgatt actcggtaat aaatgtaaat
301 agcggcaaag ctatggaggt atacgacttc ggcaccacgg acggcggcaa catagtgcaa
361 tacccctact ggggaggcgc cccccagttg tggacaatta cagatcaagg cggttattac
421 agcttaataa acaaacacag tggtaaagct ttagatttgt taaattggga taccacagac
481 ggcgccaata taggccagtg ggcttggtgg ggcggcgatg cgcaactgtg ggcactgaac
541 acagtgcaac ccagcacagt caccttcaca cttgaagaaa accaagcggg tttttgcagc
601 gtagatggca gcatagatag caatcatacg ggctataccg gcagcgggtt tgccaataca
661 accaatgcaa atggccaagg agttaattgg tcggtaaatg tagccacagc tggtacctat
721 acgtttacat ggcgctatgc gggcactagc aaccgcccag ccaacttgct aatagatggc
781 agcacacagg tttcgggcat tgctttaaat tcaaccggcg catgggcaac ttgggctaat
841 agtgcagaaa taagtgtttg gcttgacaca ggtgtgcact cacttcggct gcaagccaca
901 accagcgcgg gcttacctaa tatagattcg cttagcataa ccggccaaag cgcagcagcg
961 ggcaactgca gcggcgcaat tgaacctatc acttttgcca caccaagctt taccaatata
1021 gcggtgcacg acccctcggt aatagaagca aaccatcaat actacgtatt tggctcccac
1081 ctttctgtgg ctaaaacgcc cgacctaaaa aactggtcgc gcgtggcgga tggtgtaacc
1141 accaataacc cattgtttaa cgatgtaacc agcgaacttg cagaagcatt agcttgggca
1201 gaaaccacta ccctgtgggc gccagatgtt acctatgtaa atggtcggta tttgatgtat
1261 tacaacgcct gccgtggcga ctcaccactg tcggctatgg gtattgcttc ttcgaacaac
1321 atagaaggcc cttacactaa cgatggtata ttccttaaat ctggaatgtg gggccaaacc
1381 agcgaagatg gcactgtgta cgacgcaacc gtgcacccca atgctgtgga ccccgttatt
1441 tttagcgacg caaataatcg catgtggatg acctacggtt cgtattcggg tggtattttt
1501 attatggagt taaacccatc cacggggttc ccttacgcgg ggcaaggtta tggtaaacat
1561 ttaatgggtg gcaaccacgc gcgcattgaa ggcgcttaca ccatctacag cccagaaacg
1621 ggctactact atatgtatgt aagctacggt ggcctaggcg cagatggcgg ctataacgtt
1681 cgtgtggccc gagcaactag cccagacggc ccctactatg atgccaacgg caccaatatg
1741 gccaacgtaa aaagcaaccc aagcttgcca ctgttcgacg acgccagcat agcaccccac
1801 ggtgtaaaac ttatgggtaa ccacgtgttt agcggcacta acaatgtact tggttacgta
1861 tcaccagggc acaactctgc ataccgtgac gccactaccg gccaaacatt tttactattc
1921 cacacacgct tccctgggcg cggcgaagag catgaagtgc gagtgcatga agtgttctac
1981 aacgatgcag gctggccggt aatagcacca ttgcgctatg cccaaaaagt agatgccaac
2041 aacccaaata gaagtgcgag cgagctaaat gcagtgtacg caagcgaact gccaggtagc
2101 tatcagctaa ttaaccacgg caaagacata agcgcgacaa ttaaaaattc cgttaacatc
2161 acgctaaaca gcaacggcag tatctctggc gagctatctg gcagctggac atacaacgcc
2221 aacacccgca ataccgtaat caccgttgcc ggtgtggcct accgcggcgt ggtatctcgc
2281 caatggaacc aagcacgcaa ccgcttcgaa gtcaccttca gcgccctatc tgcagacggc
2341 acagcaatat ggggggtgaa cagcgactaa
LOCUS NZ_AABI02000014 1089bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_13，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000014 REGION：123595..124683
VERSION NZ_AABI02000014.1 GI：28878288
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1089)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028504.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1089
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1089
/gene＝″Mdeg2389″
CDS 1..1089
/gene＝″Mdeg2389″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3940:预测的β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00066990.1″
/db_xref＝″GI:23028597″
/db_xref＝″COG:COG3940″
/translation＝″MSSFIMDKSQLQSGFAFKTSGFNVLIVVTFLALLAALVGCSSAK
LAPVASPSLPQPLVAQRADPWVHKHSDGYYYFIATVPAYDRLEMRRATTIAGLRSAPA
VVVWQRNTIGGMSANIWAPELHFIDGKWYIYVAAATDHNKPWTIRMHTLSNASANPMQ
GEWQEEGRFHTPLDTFSLDATTFEHRGKRYLVWAQQNEARTYNSALLIAQMDSPTSIT
GPIVTLSEPTLPWEIIGHKVNEGAAVIKHGKRIFISYSASATDHNYAMGLLWADENAD
LLDAASWTKSPEPVFYSNEQLKRFGPGHNCFVKAEDGVTDLMVYHARDYKEIDGEPLR
DPNRHTRVRKVYWDEQGMPDFRQHEADL″
ORIGIN
1 atgagtagct tcataatgga taaaagccag ctacaaagtg gttttgcgtt taaaacaagt
61 ggttttaacg tgctgattgt tgtcacattt ttggcattgc ttgcagcgct tgttggctgc
121 agcagcgcca agctcgcacc cgtcgcctct cctagtttac cgcagccatt agtggcccaa
181 cgggcagacc cttgggtgca caagcacagc gatggttatt actactttat agcaacggta
241 ccagcatacg accgcttaga aatgcgtagg gccacaacca tagcaggctt acgtagcgcg
301 cccgctgtag tggtatggca gcgcaatact attggaggta tgagcgcgaa tatttgggcg
361 cccgagctgc attttattga tggtaaatgg tacatctatg tagcggctgc caccgatcac
421 aacaagccgt ggacaattcg tatgcacacg ctttccaatg catcggccaa ccctatgcaa
481 ggtgagtggc aagaagaggg gcgctttcat acaccgctag atactttctc gctagatgcc
541 acaacctttg agcacagggg taaacgctat ttagtatggg cgcaacagaa tgaagcccgt
601 acttataact cggcgttact tatagcgcaa atggatagcc ctacaagtat tactggcccc
661 attgttacct taagtgaacc gacattaccg tgggaaatta ttggccataa ggttaatgag
721 ggtgcggcag taattaaaca cggtaagcgt atttttataa gttattccgc cagtgcgacc
781 gatcataact atgcgatggg tttgttatgg gcagacgaaa acgctgattt gctcgacgca
841 gcaagctgga ccaagtcacc cgagcctgta ttttactcaa acgaacaatt aaagcgcttt
901 ggccctggcc ataattgttt tgttaaagct gaagatggtg ttaccgattt aatggtgtac
961 cacgcgcgtg attataaaga gatagatggt gagccattgc gagacccaaa ccgccacacg
1021 cgggtgcgca aagtgtattg ggatgaacag ggcatgccgg attttcgtca acatgaagca
1081 gacctatag
LOCUS NZ_AABI02000014 945bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_13，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000014 REGION：109190..110134
VERSION NZ_AABI02000014.1 GI：28878288
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-945)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028504.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..945
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..945
/gene＝″Mdeg2380″
CDS 1..945
/gene＝″Mdeg2380″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3940:预测的β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00066981.1″
/db_xref＝″GI:23028588″
/db_xref＝″COG:COG3940″
/translation＝″MKKLSPLIEQRADPYIYKHTDGYYYFTASVPAYDGIELRRAKTI
QALATAETVMVWRKPSEGDYSELIWAPEIHFNMGAWYVYFAAAPSREIKFDLFQHRMY
AISCSDANPLTGEWIFEGKIDSGIDAFCLDATTFTHSNELYYVWAQKELDVRGNSNLM
IAKMETPTKLATKPVRLSKPEYDWEIQGFWVNEGPSIVKHGSRIFISYSGSATDERYA
MGILWAEQSADLLDPASWTKSVEPVLVSEPSEKVFGPGHNSFTVDEEGNDMLVYHARN
YTEIEGDPLWDPNRHTYVKKLRWDETGMPIFGSPAFEE″
ORIGIN
1 gtgaaaaaat tatcgcctct tatagagcaa cgtgcagacc cttatattta taaacacacc
61 gacggctact attattttac ggcttcggtg cccgcctatg atggcataga actgcgtcgc
121 gcaaaaacta tacaagcgtt agccaccgca gaaaccgtta tggtgtggcg caagccaagc
181 gaaggtgatt atagtgagct tatttgggcg ccagaaatac actttaatat gggggcttgg
241 tatgtatatt ttgctgcggc tccatcacgt gaaattaagt tcgatttatt tcaacaccgc
301 atgtatgcca ttagctgtag cgatgccaac ccgctaacag gtgaatggat atttgaaggt
361 aaaatagata gcggcataga tgcattctgt ttagatgcca ccacctttac tcacagcaat
421 gagctctact atgtttgggc gcaaaaagaa ttagatgttc gcggcaactc taatttgatg
481 atcgcaaaaa tggaaacgcc caccaagctt gccaccaagc ccgtgcgttt atctaaaccc
541 gaatacgact gggagattca gggtttttgg gttaacgaag gcccatccat tgttaagcac
601 ggctcacgta tttttatttc ttattctggc tctgctaccg atgagcgcta cgcaatgggt
661 attttgtggg cagaacaaag cgcagactta ctagacccag caagttggac caagtcggta
721 gagcctgtat tagtttctga accctctgaa aaagtatttg gcccaggcca caatagtttt
781 actgtggatg aagagggtaa cgatatgttg gtgtatcatg ctcgcaatta taccgaaatt
841 gaaggcgacc cgctgtggga cccaaatcgt catacttacg ttaaaaaatt gcgctgggat
901 gaaacaggca tgcctatttt tggcagccct gcgtttgaag agtag
LOCUS NZ_AABI020000381053bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_38，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000038 REGION：＜3..1055
VERSION NZ_AABI02000038.1 GI：28878264
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1053)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029863.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1053
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene ＜1..1053
/gene＝″Mdeg3581″
CDS ＜1..1053
/gene＝″Mdeg3581″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3507:β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00068164.1″
/db_xref＝″GI:23029864″
/db_xref＝″COG:COG3507″
/translation＝″NGYYAVLNKHSGKALDLYGFDTSNGANIAQWAFWGGDPQQWQFT
KIANVGAPPVDTSTT NGATNHWSLTGNLVTHDPTMAYENGSWWLYQTGEGIYGKYSAN
GLAWDGLPSVFPNGLSWWKTYVPGQSNNDVWAPDVRTYNGRVYLYYSISTFGSRVSAI
GLASASSLAASDWQDHGLVINTTSSSDWNAIDPDLVVDEHGNPWLTMGSWNSGIKVMR
LNPITMKPIGTLYSIAQKGGGIEAPSIVYRRGYYYLFVSIGKCCAGVDSTYQIAYGRS
TSITGPYLDKNGNDMMSGGGSILDAGNNVWVGPGGQDIINTDVIVRHAYDATDAGTPK
MIISTLNWDANGWPKY″
ORIGIN
1 aatggctatt atgccgtgct aaataaacac agcggcaaag cgttagattt gtatggtttt
61 gatacgtcta acggcgcgaa tattgcgcaa tgggcctttt ggggcgggga cccgcagcag
121 tggcaattta ccaaaatcgc caatgtaggt gcgccgccag tagatacatc taccaccaac
181 ggtgcaacca accactggtc cttaaccggt aatctagtga ctcacgaccc cacaatggcc
241 tacgaaaacg gctcatggtg gttgtatcaa accggcgagg gaatttacgg taagtattca
301 gccaatggtt tggcgtggga tggcttacct tctgtgtttc ccaatggttt aagttggtgg
361 aagacctatg tacccggcca gtcgaacaac gatgtatggg cgcctgatgt acgcacttat
421 aatgggcggg tttatttgta ctattccatc tctacttttg gctcgcgtgt atctgccatt
481 ggtttggcgt cggcatcgag tttggctgcg agtgattggc aggaccacgg cttagtaatt
541 aataccacct catctagcga ttggaatgcg atcgacccag atttagtggt cgatgagcat
601 ggcaaccctt ggttaacaat gggaagttgg aacagcggta ttaaagtgat gcgcttgaac
661 cccattacca tgaagccaat tggcacactt tattctattg cgcaaaaggg cggcggtatt
721 gaagcgcctt ctattgtgta tcgccgtggg tattactatt tatttgtttc tatcggcaaa
781 tgctgtgcgg gcgtagatag cacctatcaa attgcttacg ggcgctctac aagtattacc
841 ggcccttatt tggataagaa cggcaacgat atgatgagtg gtggtggcag tattttagat
901 gcgggcaaca acgtgtgggt tggccctggt gggcaagata ttattaacac cgatgtcatt
961 gtgcgccacg cgtacgatgc cacagatgca ggcacaccta agatgattat tagtaccttg
1021 aattgggatg ctaatggatg gccgaaatac tag
LOCUS NZ_AABI02000014 1041bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_13，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000014 REGION：互补链(121237..122277)
VERSION NZ_AABI02000014.1 GI：28878288
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1041)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028504.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1041
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1041
/gene＝″Mdeg2388″
CDS 1..1041
/gene＝″Mdeg2388″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3507:β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00066989.1″
/db_xref＝″GI:23028596″
/db_xref＝″COG:COG3507″
/translation＝″MLNKNKRPITFALVVSLLALLALAGCSEAKQVSIHDPVMIKEGD
TYYLFSTGPGITMYSSSDMKNWRREGEVFNQAPSWASNAVPYFKGHLWAPDIIEKDGL
FYLYYSVSAFGKNTSGIGVTVSPTLNPRAPNYGWQDKGMVLRSVPERDEWNAIDPNIV
VDNNGTAWMAFGSFWQSLKMVALDSSWTKIAEPQQWHTIAALPKGSMPTGDAVKDGEI
EAPFIFKKNDDYFLFVSWGKCCRKDESTYRLAMGRSKNTTGPFLDKNGKDLAQGGGTL
LISGNKNWPGLGHNSAYTFDGKDWLVLHAYESADNGLQKLKILEINWDKDGWPTVDTK
ELDEFVSIELTQ″
ORIGIN
1 atgcttaaca aaaacaaacg cccaattaca ttcgctttag tcgttagcct cttagccctg
61 cttgcccttg caggctgcag cgaggcaaaa caagtaagca tccacgaccc agtaatgatt
121 aaagaaggtg acacctacta cttgtttagc actggccccg gcataacaat gtatagctct
181 agcgatatga aaaactggcg ccgcgaaggc gaagtattta atcaagcccc tagttgggcc
241 tccaacgccg taccctattt taaaggccac ctgtgggcac ccgacatcat tgaaaaagat
301 ggtctgtttt acctctacta ttctgtgtct gcttttggaa agaacacatc cggcattggc
361 gttaccgtat cgcccacgct taacccacgc gcgcccaatt acggttggca agataaaggc
421 atggtattgc gcagcgtgcc tgagcgcgac gagtggaacg ctatcgaccc caatattgtg
481 gtagataaca acggcaccgc atggatggct tttggctcct tttggcaaag cttaaaaatg
541 gtggcactag acagcagctg gacaaaaata gctgagcctc aacagtggca taccatagca
601 gccttaccca aaggcagtat gcccacaggc gacgcagtaa aggacggcga aatagaagct
661 ccttttattt ttaaaaagaa cgacgattac tttttgtttg taagttgggg taaatgctgc
721 cgcaaagatg aaagcaccta ccgcctagca atgggccgca gcaaaaatac taccggtcca
781 ttcttagata aaaacggcaa agacctcgcc caaggtggtg gcaccctatt aataagtggc
841 aacaaaaact ggcccggctt aggccacaac agcgcctaca ccttcgacgg caaagattgg
901 cttgtgctac acgcctatga atctgcagat aacggtttac aaaaactaaa aatattagaa
961 ataaactggg ataaagacgg ctggccaact gtagatacca aagaactgga tgagtttgtt
102 1agtattgaat taactcaata a
LOCUS NZ_AABI02000014 1860bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_13，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000014 REGION：129042..130901
VERSION NZ_AABI02000014.1 GI：28878288
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1860)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028504.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1860
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene ＜1
/gene＝″Mdeg2392″
CDS ＜1
/gene＝″Mdeg2392″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066993.1″
/db_xref＝″GI:23028600″
/translation＝″MDNIMKMIIKLALAVTLAVWVAGCTNQAGLNAENKNIERQTINS
PDKSLKVRLSLDESGKVFYSISRNGEQVMLPSQLGVELNSQAFTDGLTITDVDAGKVN
DSYTLLHGKQRDITYNANEKIYSLKNKQGDKLIIAFRVSNDGVAFQYRFPNTAKQLLA
VKKEITSFAFEHTTKAWLQPIAVAQTGWANTNPSYEEHYQMNIPVDTVSPSPAGWVFP
ALFKANKHWLLITEAGMNGDYHASRLHAESPNGEYSLGIPMAAEVFEQDGNKGALLAQ
SNTAFHSPWRVILVGGLDTIIASTLGTDLADPAIAKMDFVKPGTASWSWALLKDESVN
YETSLEFIDYAAEMGWDYTLVDADWDRRIGYERTAQLAAYAQSKNVGLLVWYNSSGDW
NTTEYSPKSALLDRDKRRAEFARLQNMGVKGVKIDFFPGDGKSVMAYYNDLAKDAADY
NLLVNYHGSSLPRGLHRTYPNIMTMESVHGFEMITFMQPSADKAATHMAILPFTRNAF
DPMDFTPTTFSDIPNIERRTSNGFELALPVLFLSGLQHIAETAQGMATNAPDYVKAYM
RDIPVLWDESKLIDGMPGEHVVIARKHGERWFVAGINATNEAINLEMNFDFALGKQGT
LITDSNINTKGVESFTSHTITATKNNALTVKANGGFVIVFN″
gene 1..1860
/gene＝″Mdeg2393″
CDS 1..1860
/gene＝″Mdeg2393″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3940:预测的β-木糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00066994.1″
/db_xref＝″GI:23028601″
/db_xref＝″COG:COG3940″
/translation＝″MAAGQIISLEVKVKKIEEIMKHTARTIALGATGAALLTGLIACN
GTNVNTNGDTQQASIKKAPEGMFANPLFANGADPWLEYYDGNYYLTTTTWTSQLVMRK
SPTLDGLSTALPVNVWSDSDLTRCCNFWAFEFHRLNGPNGWRWYLMYTSGQHGTLDHQ
HLSVLESVGDDPMGPYTYKGEMMPNTWNIDGSYLEHNGQLYLLWSEWVGDEQQNFISK
MTTPWSIEGPRALLTRPEAEWEKSGRKVNEGPEILKKDGRTFLIYSASYCDTPDYKLA
MKELTGDDPMNSEHWTKYDKPVFERGNGVFAPGHNGFFKSPDGTEDWIVYHGNSKEEH
GCGATRSVRAQKFTWNTDGTPNFGEPIPEGQFLPLPSGENGPLVTALQGARIQLRNGE
SCLLAEGKELKQGSCQAEASLWVMDNTADNHYRFGNVASNLFLTADEGLSQSAWVNTA
SQRWALNAGEGNFVAFTNKYTGDALMQNNWQILPVGKVAISSIQSGRVLQACDKNSAN
VNQGGWQGRACQAWQFNPASEGHVQIKTGNQCLTVENKSIVPGTNVIAGECESTSSQW
LYQLDKEGRATFTNRESKQRLDLANCGLADGTNFAQAPALDTICQAFQVRYLP″
ORIGIN
1 gtggccgcag gccaaataat ttcactggag gttaaagtga aaaagataga agaaataatg
61 aaacacacag cgcgcactat agcgctaggt gcaacaggtg ccgccttgct aacggggtta
121 attgcctgta acggtaccaa tgtgaataca aacggggata cccaacaagc aagcattaaa
181 aaagcgccag aaggcatgtt tgccaacccg ttgttcgcca atggcgcaga cccttggtta
241 gagtattacg atggcaatta ctacctcact accaccacat ggacatcgca acttgttatg
301 cgtaaatcac ccacgttgga tggtttgtct actgcgctgc cggtgaatgt atggtccgat
361 tcagatttaa cccgctgctg taacttttgg gcgtttgaat tccatcgctt aaacggccct
421 aacggctggc gttggtattt aatgtacacc tcgggccagc acggcacttt agatcaccaa
481 cacttaagcg tattagaaag tgtgggtgac gaccctatgg ggccatacac ctacaaaggt
541 gaaatgatgc ccaatacatg gaatatagac ggcagttatt tagagcataa tggccaatta
601 tatttgttgt ggtctgaatg ggtaggtgac gagcagcaaa actttatatc taaaatgacc
661 accccatgga gcattgaagg cccgcgagca ctgttaactc ggccggaagc agagtgggaa
721 aaaagcggtc gcaaagttaa cgaaggccca gagattctaa aaaaagatgg tcgtaccttt
781 ttgatttact cggcgagcta ttgcgatacg ccagattata aactggcaat gaaagagcta
841 acgggcgacg acccaatgaa ctccgagcac tggactaaat acgataagcc cgtgtttgaa
901 agagggaacg gtgtgtttgc cccaggccac aatggtttct tcaaatcgcc cgatggcaca
961 gaagattgga ttgtgtacca cggaaattcg aaagaagagc acggctgcgg tgcaacgcgc
1021 tctgtgcgcg cacagaaatt tacttggaac acagacggca ccccaaattt tggtgagcca
1081 ataccagaag gccaattttt gcccttacct tctggcgaaa acggtccttt agtgactgca
1141 ctgcaaggtg cacgtattca gttgcgcaat ggcgaaagct gtttattagc cgaaggtaaa
1201 gagctgaagc agggcagttg ccaagcagaa gccagtttat gggtaatgga taacacggca
1261 gataatcact accgctttgg caatgtagcc agcaatttat ttttaacggc agacgaaggc
1321 cttagtcaga gtgcctgggt taatactgca agccagcgct gggcacttaa tgcaggcgaa
1381 ggtaactttg ttgcgtttac aaacaagtac accggcgatg cgcttatgca aaataattgg
1441 caaatactac cggttggcaa agtggcaatt agcagcattc aaagtggccg cgtattacag
1501 gcgtgcgata aaaacagcgc gaatgtaaac caaggcggct ggcagggtag ggcttgtcaa
1561 gcatggcaat ttaacccagc aagtgaaggc catgtgcaaa ttaaaacggg caaccaatgt
1621 ttaaccgttg agaataaatc catagtgcct ggcaccaatg ttattgccgg cgagtgtgaa
1681 tcaactagca gccaatggct ttatcaatta gataaagaag gccgcgcaac cttcacaaac
1741 cgcgaaagca aacagcgttt agatttagca aactgcggcc tagccgacgg caccaacttc
1801 gcacaagccc ctgcgttaga tactatttgc caagcattcc aagtgcgtta tttaccgtaa
LOCUS NZ_AABI03000006 1605bp DNA 线性BCT 17-JUN-2004
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg03_6，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI03000006 REGION：149813..151417
VERSION NZ_AABI03000006.1 GI：48861946
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌，γ-变形菌纲，异单胞菌目，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1605)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
FEATURES 位置/限定词
source 1..1605
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1605
/locus_tag＝″Mdeg02002711″
CDS 1..1605
/locus_tag＝″Mdeg02002711″
/codon_start＝1
/product＝″COG3534:α-L-阿拉伯呋喃糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00315975.1″
/db_xref＝″GI:48862077″
/db_xref＝″COG:COG3534″
/translation＝″MNPASTLSVKTTNKTTNHLKKVALTVAAIVAPLTSWADVKVSLN
PQNTGETISKYIYGQFAEHLGSGIYGGIWVGEDSPIPNKNGFRNDVIKALQELQVPVI
RWPGGCFADEYRWRDGIGPREQRPIRVNTHWGGVEEPNTFGTHEFFELVELLNTEAYV
AGNLGTGSPQEMAEWLEYIVSNSNSTVVAERKKNGREEPWEVAFWGVGNESWGCGGNL
TPEYYTNLYRHFSTFVKATGAKRPKLVASGSYDDDETWTTPLSKLKNNIDGISHHYYT
LPTSDWSIKGAATGFDEKEWILTLERTLKIDSYLATQTGILKKNNPEGNIGLYLDEWG
TWYDAEPGTNPGFLYQQNTVRDAIVAAVNLNIFHNYADRLHMANIAQMVNVLQAMILT
DNEKMLLTPTYHVFKMYIPFQDATHIPLDIKGQRDYSAHKTTVPGFSASAAKTPNGNI
VVSLVN NPNEAEEVSIALQGIKVKTITGELLTSQKMDAHNTFDKPNNVQPRALNQSD
YSISKNGKTLTVKLPAKAVVVLQLNK″
ORIGIN
1 atgaacccag cttcaaccct aagtgtgaaa acaactaata aaacaacaaa ccacctcaaa
61 aaagttgccc ttaccgtagc cgctatagtt gccccgctaa caagctgggc cgatgtgaaa
121 gttagcctaa acccacaaaa cacaggcgaa accataagta aatatatcta cggccaattc
181 gcagagcacc ttggcagcgg catatacggc ggcatatggg tgggcgaaga ctccccaata
241 cccaacaaaa acggctttcg taacgatgta atcaaagccc tgcaagagct acaagtacct
301 gttataagat ggcccggtgg ctgctttgcc gacgaatatc gctggcgtga tggcattggc
361 ccacgtgagc aacgccctat ccgcgtaaat acccactggg gcggtgtgga agaacccaat
421 acctttggta ctcacgaatt cttcgaatta gttgagctac ttaataccga agcctatgtg
481 gcaggtaacc taggcactgg ctcaccacaa gaaatggccg aatggctgga atatattgtt
541 tccaactcca actctactgt agtggcagag cgcaaaaaaa atggccgcga agagccttgg
601 gaagtggcct tttggggtgt gggtaatgaa tcttggggtt gcggtggcaa cttaacgccc
661 gagtactaca ccaatttata tcgtcatttt tccacttttg ttaaagccac tggcgctaag
721 cgcccgaagt tagttgcaag cggctcgtat gatgatgacg aaacttggac aacgccacta
781 agtaagctca aaaataatat agatggtata agccaccact actacacctt acccaccagc
841 gactggagca taaaaggtgc ggctacaggc tttgatgaaa aagaatggat tcttaccctt
901 gagcgcacat tgaaaataga cagctacctt gcaactcaaa cgggtattct taaaaagaat
961 aaccccgaag gcaatatagg gttgtattta gatgaatggg gtacgtggta cgatgcagag
1021 cccggtacaa accccggctt tttataccaa caaaataccg tgcgcgacgc catagtagca
1081 gcagtaaact taaatatatt ccacaactat gccgaccgct tacacatggc gaacatcgcc
1141 caaatggtaa acgtactaca ggcaatgata ctgaccgaca acgaaaaaat gttgctcaca
1201 cccacgtatc acgtttttaa gatgtacata ccatttcaag atgctaccca tataccgtta
1261 gatataaaag gccagcgcga ctacagcgca cataaaacta ccgtaccagg gttctcggcc
1321 tcggcagcta aaaccccaaa tggcaatatt gtagtttcac ttgttaacct taacccaaac
1381 gaagcggaag aagtgagcat tgcactacaa ggcatcaagg taaaaaccat tactggtgaa
1441 ttacttacca gccaaaaaat ggatgcgcat aacaccttcg acaagccaaa caatgtgcag
1501 ccacgcgcac ttaaccaaag cgactacagc attagcaaaa acggcaaaac ccttaccgtt
1561 aagctacccg ctaaagccgt agttgtttta cagcttaata aataa
LOCUS NZ_AABI020000361 194bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_35，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000036 REGION：4764..5957
VERSION NZ_AABI02000036.1 GI：28878266
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1194)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029800.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1194
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DN A″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1194
/gene＝″Mdeg3529″
CDS 1..1194
/gene＝″Mdeg3529″
/codon_start＝1
/tansl_table＝11
/product＝″COG3867:阿拉伯半乳聚糖内切-1，4-β-半乳糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00068112.1″
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/translation＝″MLLAQLPVKKYFVLLAIFSFMLGCNSAGVQQSAKSIQVAGTHSK
PARFFAGADLSYVNEMEDCGATYRVNGVTTDPYQAFADAGANLVRVRLWHNPTWTEYS
DFADVKKTIRKAKQNNQTVLLDFHYSDTWADPEKQFVPAAWEHMVDDTPALAQALAQY
TTDVLEKLQAENLLPDMVQVGNETNAEVLQLEAHMKHGEIDWQRNAALLNSGLAAVAE
FNQNNNTYIERVLHIAQPENALWWFDDAAQAGITDFEIIGLSYYAKWSTYKLDSIGEA
IRALRTAFNKDVLVVETSYPWTMQNFDQANNVLDATSLQQGYPATAEGQKKYMMDLAK
QIMYAGGIGIAYWEPAWVSTPCKTLWGTGSHWENAVFFDSGNNNEALPALSFYTDIMA
LFKQD″
ORIGIN
1 atgttattag ctcaattgcc agttaaaaaa tattttgtct tattagctat tttctcgttt
61 atgctggggt gtaatagtgc tggcgtacaa caaagtgcta aatcaattca ggttgctggc
121 acgcacagta aacccgctcg tttttttgct ggtgccgacc tttcttacgt aaacgaaatg
181 gaagattgcg gagcaacata ccgcgtaaac ggtgtaacta ccgaccctta ccaagccttt
241 gccgatgccg gcgcaaattt agtgcgcgtg cgcttatggc acaaccctac ttggacagaa
301 tattccgact ttgccgacgt taaaaaaact atccgcaaag ccaaacaaaa taatcaaacg
361 gtattgttag attttcatta ttcagatacc tgggccgacc cagaaaaaca atttgttcca
421 gccgcttggg aacatatggt ggatgacacc ccagcactag cgcaagcctt agcgcaatac
481 acaaccgatg tattagaaaa gctgcaagca gaaaacctat tgccagatat ggtgcaagta
541 ggtaacgaaa caaacgcaga agtcttacag ctagaagcgc acatgaaaca cggcgaaata
601 gattggcagc gcaatgcagc gctactaaac agtgggttag cagccgttgc tgaatttaac
661 caaaacaaca acacctatat tgaacgcgta ttacatatcg cccagccaga aaatgctttg
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781 tactatgcca aatggtcaac gtataaatta gattccatcg gcgaagctat acgcgccttg
841 cgaaccgcat tcaataaaga tgtgttggtg gtagaaacct catacccctg gactatgcaa
901 aatttcgatc aagccaataa cgtgctcgat gctaccagct tgcagcaggg ctaccctgca
961 acggccgaag gccaaaaaaa atacatgatg gatttagcta aacaaattat gtacgccggt
1021 ggaattggta ttgcctactg ggaaccagct tgggtaagca ccccttgcaa aactctatgg
1081 ggtacaggtt ctcactggga aaatgccgtg ttttttgact ctggcaacaa caacgaagcg
1141 ctacccgcgc ttagtttcta cacagacata atggctcttt ttaagcaaga ttaa
LOCUS NZ_AABI02000005 1263bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_5，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000005 REGION：互补链(76912..78174)
VERSION NZ_AABI02000005.1 GI：28878297
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1263)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027361.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1263
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
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/gene＝″Mdeg1250″
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/gene＝″Mdeg1250″
/codon_start＝1
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/product＝″COG3867:阿拉伯半乳聚糖内切-1，4-β-半乳糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00065874.1″
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RIMIDFHYSDSWADPGKQYKPAAWTNYTLDGLMSAVWWHTYDSLVALKNAGITPEWVQ
VGNETNNGMLWEEGRASANMQNYAWLVNSGYDAVKEVFPNTKAVVHLANCHDNANFRW
IFDGLQANGGKWDVIGASIYPTNASGYSWSQANSLCEANLNDMQSRYGSEVLIAEVGA
PWDHPEAKAIVSDVIAKAQNAGATGVFYWEPQASNWQGYTLGAWNPNTMRPTEALDAF
IDGSSNVTTARLQSRNSNRCIDVNGRSTADGADIIQWSCHSNANQQWTFEDMGNNYVR
LRVGHSNKCLDVLGAGTADGDNVVQWACHNNANQQWLKEDMGDGYFRLKSRASGKCVD
VNAGGANNGDSIIQWSCHTGWNQQWMVY″
ORIGIN
1 gtgctgcaaa ttctaaaaga tcacggtatg gattccatcc gtctgcgcgt gtgggtaaac
61 cccgccggtg gatggtatag cagcattaat gacgtaatag aaaaagctca gcgcgccaaa
121 gctgcgggca tgcgtattat gatcgatttt cactacagcg actcttgggc tgacccaggc
181 aagcaataca agcccgccgc gtggaccaac tataccttag acggtttaat gtctgcggtg
241 tggtggcaca cctacgattc cctcgtggcc ctaaagaatg cgggtattac ccctgaatgg
301 gtgcaagtgg gcaacgaaac aaacaacggt atgttatggg aagaggggcg cgcatccgcc
361 aatatgcaaa actatgcgtg gttggtgaat agtggctacg atgccgttaa agaagtgttc
421 cctaatacca aggcagtggt gcacttggca aactgccacg acaacgcaaa cttccgctgg
481 atatttgacg gcttacaagc caatggtggt aagtgggatg taataggtgc ctctatttac
541 cctaccaacg caagcggtta tagctggagc caagccaaca gtttgtgcga ggcaaactta
601 aacgatatgc aatcgcgcta tgggtccgag gtgctaattg ccgaggttgg tgcgccgtgg
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781 gcatggaacc caaacaccat gcgccccacc gaagcattag acgcgtttat tgacggcagc
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1021 aataagtgct tagatgtact gggtgcaggc actgccgatg gcgataacgt agtgcagtgg
1081 gcatgccaca ataacgccaa tcagcaatgg ctaaaagaag acatgggcga tggctacttc
1141 cgcttaaaat ctcgcgccag cggtaaatgc gtagatgtaa acgcaggcgg tgctaacaac
1201 ggtgattcta ttattcaatg gagttgccac actggttgga accagcaatg gatggtttat
1261 tag
LOCUS NZ_AABI02000044 1770bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_43，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000044 REGION：＜2..1771
VERSION NZ_AABI02000044.1 GI：28878258
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1770)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029947.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG 分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1770
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene ＜1..1770
/gene＝″Mdeg3654″
CDS ＜1..1770
/gene＝″Mdeg3654″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3867:阿拉伯半乳聚糖内切-1，4-β-半乳糖苷酶″
/protein_id＝″ZP_00068237.1″
/db_xref＝″GI:23029948″
/db_xref＝″COG:COG3867″
/translation＝″NDLSYVNEMEDCGAVYKDAGSVVDPYEVIANHGGNLVRVRHWND
PYWQALITQPESVAANWKANYSGLEDVTETIRRSKAAGMEVLLDFHFSDIWADPGRQT
TPRAWENDFGDEDAMAAHIYDYVTSVLTGLNDEGLMPELIQIGNESNSGMMTTQNLII
EMNDAGTGLNVSKGGQTNYSDQYVARMYNSAISAVRDISEGMTNAPRIAIHVAGADKA
VAFFDKLKSIGVTDIDIAGFSFYYGWEQAPIEDVASMIATLKERHPNLDPLMLETGYL
WDEENIDSLGNIIGIADPAYLPVSKQNQLKYLTDLSQAVADAGGIGVVFWEPSWVSTE
CRTPWGQGSSHEHVAYFDHRDGLNFHIGGQWMEVTKLSETPEAGLATTFRVDMTGQDT
SAGVFIRGAFTEDTLQPMLYEGENIYSYTTHIQAAQSGSYHYAIGLKNGTRETVPSEC
ANPEDTLNRLYTVGENGEQLVTAVWASCDVFDPQAAGPTTLTLNVDMTGVDVSGGVYV
AGDLNAWTITELTQVGASAIYTISYDLAVGAEGGYYFLNGSDWGDRETIPEECVGYYD
ADRGFLVEEQSPQVLDLVWSSCQ″
ORIGIN
1 aacgaccttt cctacgtaaa cgaaatggaa gactgcggcg cagtgtataa agatgcaggc
61 agtgtagtag acccctacga agtgatcgcc aatcacggcg gcaaccttgt gcgcgtgcgt
121 cactggaacg acccctactg gcaggcgctt attacccagc cagaatctgt agcggcaaat
181 tggaaagcta attacagtgg gcttgaagat gtaacagaaa caattcgacg atcaaaagcc
241 gccggtatgg aagtgctgct cgactttcat ttctcagata tttgggcaga ccccggcagg
301 caaacaacgc cgcgcgcatg ggaaaatgac tttggcgatg aagacgccat ggctgcgcat
361 atatacgatt acgtaacatc agtactcaca gggttaaacg acgaaggttt aatgcccgag
421 cttattcaaa ttggtaacga atctaactcc ggcatgatga cgactcaaaa cctcattata
481 gaaatgaatg atgcgggtac ggggttaaat gtgagtaaag gcgggcaaac aaattactca
541 gatcaatatg ttgcgcgtat gtataactct gcgatttctg ctgtgcgcga tattagtgaa
601 gggatgacca acgctccgcg tattgctatc cacgtggcag gtgcagataa agccgtcgca
661 ttttttgata agttaaaaag catcggagta acggatattg atatcgcggg cttctcgttt
721 tattacggtt gggagcaagc accaatagaa gacgttgcaa gcatgattgc aaccttaaag
781 gaacgtcacc ctaatttaga cccgttaatg cttgaaacag gctacctgtg ggatgaagaa
841 aacatcgata gcttaggcaa tattattggc attgccgacc ccgcatattt acctgtgagc
901 aaacagaacc aacttaaata tcttaccgat ttatcgcaag cggttgctga tgctggtggt
961 attggagtgg tgttttggga gccatcttgg gtatcaaccg aatgtcgcac accttggggg
1021 cagggctcat ctcacgagca tgttgcttac ttcgatcacc gcgacggctt aaactttcat
1081 attggtggcc aatggatgga ggttaccaag ttaagcgaaa ccccagaagc ggggctagct
1141 actaccttta gagtggatat gactggccaa gacaccagcg caggggtatt tattcgcggg
1201 gcgtttaccg aagacacatt gcagcccatg ctatatgaag gcgaaaacat ttatagttac
1261 accacgcata tccaagcagc gcaaagcgga agctaccact atgcgattgg cttaaaaaat
1321 ggtacgcgcg aaacggttcc tagcgaatgt gcaaacccag aagatacgtt aaatcgttta
1381 tatacggtgg gcgaaaatgg ggagcagtta gttaccgcag tttgggcaag ctgtgatgtt
1441 ttcgatccgc aagcggctgg gccaacaacc ttaacgctta atgtagatat gactggtgta
1501 gatgtaagtg gtggtgtgta tgttgcaggc gacttaaatg cttggacaat caccgagctt
1561 acacaagttg gcgctagcgc aatttatacc attagttacg atttagccgt aggtgcagaa
1621 ggtggctact acttcttgaa tggcagcgat tggggcgata gggaaacaat accagaagaa
1681 tgtgtgggct actatgatgc agaccgcggc tttttggtgg aagagcaaag cccacaggta
1741 ttggatttag tgtggagtag ttgtcaataa
LOCUS NZ_AABI02000005 1020bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_5，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000005 REGION：56447..57466
VERSION NZ_AABI02000005.1 GI：28878297
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1020)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027361.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1020
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1020
/gene＝″Mdeg1232″
CDS 1..1020
/gene＝″Mdeg1232″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG4124:β-甘露聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00065857.1″
/db_xref＝″GI:23027411″
/db_xref＝″COG:COG4124″
/translation＝″MERTQTAMSDTPVNPNANTTTKAVYTYLKQQWGSKMLTGQMDLT
WKDSIDEYQRVINDTGKAPAIMGYDYMNYGIESSFISGLEQTEEAIVHWQRGGLVTFA
WHWRDPNVSGSNIGEFYTADTSFQIPIANGQLDESSQSFINMQADIDMIAAELQKLED
AGAVVLWRPLHEASGGWFWWGRTRTDSVSAAYAQVLLWRHMYTRLTDHHGLDNLLWVW
NGQNSAWYPGDEYADIVSHDIYDGAKNYESQLAVYNDTKNTPMQTKMVALSENSNIPD
PDAMQADGAWWLWFMVWNDSDTAEGVTHENNFWTGEYYNSNAHKQHVYNHELVITLDE
LPSFD″
ORIGIN
1 atggagcgca ctcaaacggc catgagcgat acgccggtaa accctaacgc caataccacc
61 accaaggctg tttacactta ccttaagcag caatggggca gcaaaatgct aaccgggcag
121 atggatttga cctggaagga cagcattgat gagtaccagc gcgtaattaa cgataccggc
181 aaagcccccg caattatggg ctacgactat atgaattacg gtattgagag cagttttatt
241 agtggccttg agcaaacaga agaagctatt gtccactggc agcgcggcgg cttagtgact
301 tttgcttggc actggcgaga cccgaacgta agcggtagta acattggcga gttttatacg
361 gctgatacga gctttcaaat cccaattgcc aatggtcaac tggatgaaag cagtcagagc
421 tttataaata tgcaggccga tatcgatatg atagcggcag agctgcaaaa gctagaagat
481 gccggcgctg tggtgctgtg gcgccccttg cacgaagctt ctggcggttg gttctggtgg
541 ggccgtacgc gtaccgattc ggtatctgcc gcttatgcac aagtgctgtt gtggcgccac
601 atgtacaccc gccttactga tcatcacggt ttagataatt tactttgggt gtggaacggg
661 caaaacagcg cttggtaccc aggcgatgaa tatgccgata ttgtaagtca cgacatttac
721 gacggcgcga aaaattacga gtcgcaatta gccgtatata acgatacgaa aaacaccccc
781 atgcaaacca aaatggtggc gctaagcgag aacagtaata ttcccgaccc agatgccatg
841 caggccgatg gcgcttggtg gttgtggttt atggtgtgga acgactcgga taccgcggaa
901 ggcgtaaccc acgaaaacaa cttttggaca ggtgaatatt acaactctaa cgcccataag
961 cagcatgttt acaatcatga gctggttatt acgctggatg agttacctag ctttgactag
LOCUS NZ_AABI02000003 1686bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_3，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000003 REGION：276126..277811
VERSION NZ_AABI02000003.1 GI：28878299
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1686)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026886.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi nlm.nih gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1686
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1686
/gene＝″Mdeg0943″
CDS 1..1686
/gene＝″Mdeg0943″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG2730:内切葡聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00065570.1″
/db_xref＝″GI:23027107″
/db_xref＝″COG:COG2730″
/translation＝″MFNKISTPALSGWSKAARYLCHTATGALMLAASTVNAGFSVSGT
QLLDDNGQAFIMRGVNHPHAWYANQTSSFADIASVGANTVRVVLSDGQQWTRNSASDV
ANVISLCKANKLVCVLEVHDVTGSGEASAAGTLANAAQYWVDIANVLKGQEDYVIINI
ANEPFGNNVPASNWINQHKAAIQTLRAAGLTHTLMIDAANWGQDWQQVMLNNASEVAQ
ADSLSNTMFSVHMYQVYNNLSTVENYVSTFLSSHNLPLIVGEFGADHQGEEVDEDAIL
SVAEQYGIGYLGWSWSGNGSCCGTLDITNNFNVNSLTSWGNRLINGTNGIKATSVIAS
VYGGSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSTSSSSSSSGSSGGAQQCNWYGSVYPLCNNQASG
WGWENQQSCIGRTTCESQSGNGGVIGGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSSSSSSSSSSGGSGATCEHIITNSWNSGFQGAVRITNNGSSAINGWQVSWSYSDGTT
IGSVWNANQSGSNPYTASNLGWNATVNPGQSVEFGFTANGGGAASAVTGSVCN″
gene 互补链(1227..1412)
/gene＝″Mdeg0944″
CDS 互补链(1227..1412)
/gene＝″Mdeg0944″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00065571.1″
/db_xref＝″GI:23027108″
/translation＝″MCSQVAPLPPDELLEEEELEDDELLLDELELLLDELLEELLDEL
LEELLDEDPPITPPLPD″
ORIGIN
1 atgtttaaca agatatctac acccgcgtta agcggttgga gcaaggctgc gcgctattta
61 tgccatacgg ctactggcgc attaatgttg gctgcaagta cggtaaatgc ggggtttagc
121 gtttcgggta cgcagctgtt agatgataac ggccaagcgt ttattatgcg cggtgttaat
181 catccgcatg cgtggtacgc caatcaaacc agctcgtttg ctgatatagc ttcagtaggt
241 gctaatacgg ttcgagtggt actaagcgat ggccagcaat ggacgcgcaa cagcgcatct
301 gatgtggcga atgttatctc gctatgtaaa gcaaacaagt tagtgtgtgt tcttgaggta
361 cacgatgtaa ccggttcagg cgaggccagt gcggcgggta ccttggcaaa tgcggcccag
421 tattgggtag atattgccaa cgtgcttaag gggcaagaag attacgtaat aatcaatatt
481 gccaacgaac cgttcggcaa caatgtgcct gccagtaatt ggattaacca gcacaaagcg
541 gctattcaaa cgctgcgagc ggccggttta acccacacgc taatgataga tgcggcaaac
601 tgggggcaag attggcaaca agtaatgcta aacaatgctt cagaggtggc acaggccgat
661 agcctaagta acaccatgtt tagcgtgcat atgtatcagg tttacaacaa cttaagcacc
721 gtagaaaact atgtgtctac gtttttaagt agccataact tgccgttaat agtgggggag
781 tttggtgcag atcaccaagg tgaagaggtt gatgaagatg caattttatc tgtggcagag
841 cagtatggca ttggctactt aggctggagt tggtcgggca atggcagttg ttgcggcacc
901 ttagatataa ccaacaactt taacgttaac agtttaacca gttggggtaa ccgcctaata
961 aacggtacca atggtattaa agcaacctcg gtaattgcat ctgtatacgg tggctcgtcg
1021 agcagttcta gttcatctag tagctcttca actagctcta gcagttccag ttcttctacc
1081 agttcatcca gcagttcgtc cggttctagt ggtggtgcgc aacagtgtaa ttggtacggc
1141 tcggtttacc cattgtgtaa taatcaagcc agtggttggg gctgggaaaa tcagcaaagc
1201 tgtattggcc gtactacctg cgaaagtcag tctggtaatg gcggagttat tggcgggtct
1261 tcgtcgagca gttcttctag tagttcatca agcagttctt ctagcagctc atccagtagc
1321 agttctagct catctagcag cagctcgtcg tcctcaagtt cttcttcttc tagtagttca
1381 tcgggcggca gtggtgcaac ttgcgaacac ataattacaa atagttggaa cagcggtttt
1441 caaggggcgg tgcgcattac caataatggc agcagtgcca ttaacggctg gcaagtaagt
1501 tggagctaca gtgatggcac aaccattggc agtgtatgga atgccaatca aagcggtagc
1561 aacccttaca cagccagcaa tttagggtgg aacgccacgg ttaaccctgg gcagtcggta
1621 gagtttggtt ttactgccaa cggcggcggt gctgcatcag cagtgacggg gtcggtttgt
1681 aactaa
LOCUS NZ_AABI02000004 1545bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：268515..270059
VERSION NZ_AABI02000004.1 GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1545)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1545
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1545
/gene＝″Mdeg1159″
CDS 1..1545
/gene＝″Mdeg1159″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00065784.1″
/db_xref＝″GI:23027329″
/translation＝″MNNEEVNMRIFSIALALCAVLCAGQSLAGLSIQGTRLVDGNGST
VVLRGVNHPHAWYAGETAAAIPKIAATGANSVRVVMAMGTKWSRTSAAEIQTIIDLCK
QNNMIAVLEFHDGTGWGEESGTAHISDIADYWVSSDVMAVVKGEEDYVIINIANEPFG
NGVSASTYTNDTIAAIQKLRNAGYTHTLMVDAANWGQDWQNLMRDNAQTIFNGDSLNN
TMFSVHMYQVYNTSAKVQSYMQAFSDKGLALVVGEFAADHFSEDVAEAAIMQYAEQFG
FGYMGWSWTGNSSDLASLDIVKSFSDNTYTTWGNRLINGSNGIATTSRIASVYTGTSS
GGSSSSSSSSNSSSSGGTSACSTGGSCDWSGTSFPLCENGNTNDWGYENGQSCVGVGL
CDSNPDATTHCGTSSGGGSTSCGTTSDGHPVCCDAASDPDGDGWGWENEASCVVESGS
SSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSGGSSATCNWYGTQYPMCTSTSSGWGWENNQSCISP
STCSGQ″
gene 互补链(912..1070)
/gene＝″Mdeg1160″
CDS 互补链(912..1070)
/gene＝″Mdeg1160″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00065785.1″
/db_xref＝″GI:23027330″
/translation＝″MEHADVPPLLLELDDDEELELPPLDVPVYTLAIREVVAIPLLPF
IKRLPQVV″
ORIGIN
1 atgaataacg aggaagtcaa catgagaata ttttctatag cgcttgcgct atgcgccgtg
61 ctttgcgcgg gtcaatcttt agctgggtta tctattcagg gtacgcgact tgtggatggc
121 aatggcagca cggttgtgct gcgcggcgtg aaccatcccc atgcgtggta tgccggtgaa
181 acggcggcgg ctatccctaa aattgctgca acaggtgcta actcggtacg ggtagtgatg
241 gctatgggca ctaagtggag ccgcaccagt gccgcagaga ttcaaaccat tattgacctg
301 tgcaaacaaa acaacatgat tgctgtactg gaatttcacg atggcactgg ctggggggaa
361 gagagcggta ctgcgcatat atctgatatt gccgattact gggtgagcag tgatgtaatg
421 gcggtagtta agggtgagga agactacgta attataaata ttgccaacga accctttggc
481 aacggtgtat cggcaagcac ctacaccaac gacacgattg cggctattca aaaactgcgc
541 aacgccggtt atacccacac ccttatggtt gatgcggcaa attgggggca agattggcag
601 aacctaatgc gtgataacgc acaaaccatt tttaatggcg actcacttaa caacactatg
661 tttagcgtgc atatgtatca ggtgtataac acctcggcaa aagtgcaaag ctacatgcaa
721 gcctttagcg acaaaggttt agcgttagtt gtaggcgaat tcgcagcaga tcattttagt
781 gaagatgttg cagaagcagc cattatgcaa tacgccgagc aattcggttt tggttacatg
841 ggttggagtt ggacgggtaa tagctcggat ttagcatcgc tagacatagt aaaaagcttt
901 agcgataaca cctatacaac ctggggcaac cgcttaataa acggcagcaa cggtattgcg
961 accacttcgc gtatagccag tgtgtacaca ggaacgtcta gcggcggcag ctctagttct
1021 tcgtcatcgt ctaattcaag tagcagtggc ggtacatcag cgtgttccac tggcggaagt
1081 tgtgattgga gtggtacaag ctttccattg tgtgaaaacg gtaatactaa cgactggggt
1141 tacgagaatg gccaaagttg tgtaggtgta ggtttatgcg attctaaccc cgatgctacc
1201 actcactgcg gtacttcttc tggcggcggt tctacaagtt gcggcactac cagcgacggc
1261 caccctgttt gctgtgatgc agcctcagac ccagatggcg atggctgggg ttgggagaac
1321 gaagccagtt gtgtcgttga aagcggtagc tcttcgagtt catcaagttc tagctctacg
1381 tctagttcaa gttcgtcgag ctcttcaagc agctcaagtg gcggtagcag cgccacgtgt
1441 aattggtatg gcactcaata cccaatgtgt acttctacca gtagcggctg ggggtgggag
1501 aataaccaaa gttgtatttc gccttctacg tgtagtgggc aatga
LOCUS NZ_AABI02000004 1374bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbfer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：56484..57857
VERSION NZ_AABI02000004.1 GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1374)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1374
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1374
/gene＝″Mdeg1015″
CDS 1..1374
/gene＝″Mdeg1015″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3934:内切-β-甘露聚糖酶″
/protein_id＝″ZP_00065642.1″
/db_xref＝″GI:23027187″
/db_xref＝″COG:COG3934″
/translation＝″MVNYLKRAALCMLALVAVACAKSQPETKVEELPATKTAANAGVA
ATEFVQVNGGRFTLRGQDYAYIGTNMWFAAYIGSTNPEYGDRERLIKELDLLKSLGVT
NLRILGASEKSPLRDSMKPAISERGEINQHDILEGLDFALAEMAKRDMKAVIFLNNFW
EWSGGMATYLSWVNGGEIVDMADPTKPWPAFALFSAGFYSNEEAKQLFNNYLTKVVSR
RNTITGELYANDPTIMSWQLANEPRPGNGDVSKSNLPAYYDWISKTTQLIKSIAPKQL
VSIGSEGTMGCLELDECVITAHKETGIDYVTFHMWLKNWGWFDVQNAEQTYDSAVATA
DKYIDHHIKLANELNMPVVLEEFGMERDGGEFSPESAVTYRDKFYAYVFDRQIKSIRS
GGPFVGSNFWAWGGYGKAMHDDAVWRKGDKTFVGDPPQEPQGLNAVFASDTSTLEVLK
QAADAIR″
ORIGIN
1 atggtgaact acttaaagcg cgctgccctg tgcatgcttg cgctcgttgc tgtggcttgc
61 gccaaatcgc agccagaaac aaaagttgaa gagctgcctg ccaccaaaac tgcggcaaat
121 gccggtgtgg cagcgacaga gtttgtgcaa gtaaatggtg gccgctttac attgcgcggg
181 caggactacg cctacatagg cactaatatg tggtttgccg cgtatattgg ttctaccaac
241 cctgaatacg gcgatcgcga gcgcctaatt aaagaactcg atttattaaa atccttgggt
301 gtgaccaacc tgcgtatttt aggagcatcc gaaaaatctc cattgcgcga ttccatgaaa
361 ccggcaatta gtgagcgcgg tgaaattaac cagcacgata ttttagaggg cttagatttt
421 gcgttagctg aaatggctaa gcgcgatatg aaagccgtga tatttctgaa taacttttgg
481 gaatggtccg gcggtatggc gacttaccta agctgggtta acggtggcga aattgttgat
541 atggcagacc ccaccaaacc atggccagct tttgcacttt tttcagcggg gttttactct
601 aatgaagagg cgaaacaact attcaataat taccttacaa aagttgtaag ccgccgcaat
661 accattaccg gcgagttgta cgctaacgac cccactatta tgtcttggca gctcgctaac
721 gagccgcgcc caggtaacgg cgatgtgagc aagtctaact tacccgccta ttacgattgg
781 ataagtaaaa ccactcagct aattaaaagc attgccccta agcagttggt gtcgattggt
841 agcgaaggta ccatgggctg cttagagttg gatgagtgcg ttattaccgc ccacaaagaa
901 acaggtatcg actacgttac attccatatg tggcttaaaa actggggctg gttcgatgtg
961 caaaacgcag agcaaaccta cgacagcgca gttgctactg cagataaata tatcgatcac
1021 cacattaaac tggctaacga gttaaatatg ccggtggtgc tggaagagtt tggtatggag
1081 cgcgacggag gtgaattctc cccagaaagc gcggtaacct atcgcgataa attctatgcc
1141 tatgtgttcg atcgccaaat taaaagtatt cgctctggcg ggccgtttgt agggtccaac
1201 ttttgggcgt ggggcggtta tggcaaagcc atgcacgatg atgctgtatg gcgcaaaggc
1261 gataaaacct ttgttggtga cccgccgcag gagccgcaag gtttaaatgc ggtatttgct
1321 tccgatactt caacgctgga agtgttgaag caagcggcgg acgctattcg gtaa
LOCUS NZ_AABI02000001 2553bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_1，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000001 REGION：互补链(355661..358213)
VERSION NZ_AABI02000001.1 GI：28878301
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2553)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026153.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2553
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2553
/gene＝″Mdeg0255″
CDS 1..2553
/gene＝″Mdeg0255″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00064894.1″
/db_xref＝″GI:23026408″
/translation＝″MNTKIKLLSFLASAMLLQACGGDMLGTSDSEDYKLIPEEVTEDP
TKARPSENAPVLKTSGTTIQLPDGTPVLLRGINLQFGDNPIEQIDGIQAIRETGSNVV
RIQLLADTSTANLEAVLNKVVEHNLIAVLSLYDEALHCKEDDEAFTDAVKQVWLTDFL
PIIAQDRYQANIMINIASGWGPEAIFDGYSVGYKTYTDNYKAAIRQFRKAGFNVPLVI
DAPGCGADFNAFLSNRGKELMAADDKDNLVLSVHGYGSQWNTATKVTDAISQLAAQNI
PVLMSEFGGSGVGEKPVKHMAILDKGAGDYAAEIILPWASATDKVAMNVPFSAPINLT
NTDVSFDVKLDEAYVTDGQMGVVMYLRDVNGEYANLAWHSASEFPAGEWATKSYAIQN
NASFGWASEAFDITAVAKVGVELVANGKLAEVAGSVVIDNLRVAEGSGAVELYSQSFD
DDIAGWGVPWTGTVAAHADGALSLTHDNGEIIAQLDGLGGVVDFAQPVVISGRFFVPA
DYAGSWMYAKFFNNGEAWTEVGITGLTPGEWTEISVETEFPAAATSVGIQIGNIGIAD
GATITDSTEPFLLDDFAISGVAANDSFELGTQYMASFDESEDGWAYLSWGASATVEAI
DGALNFYPNANDAVRIVLYKTDLSAIDDLDLQDPFTIKTRVLIPDSYTGQAFEYQLFL
QDANWQNHFAAKIWNQDELIPGEWMDLVVEVEFPAEFDRAGIPQYLGFDLSSEVALPQ
DPILIDEIVFEGMVPVEKEVVIIDQVDFFYTNHFTDFAIDYIEGEILEDDILELAYIH
QRSEPFSWIAWSWYGNDIENSDWDMTTIVGDATALTERGEDIVNGKGGIAGN″
ORIGIN
1 atgaacacaa aaataaaatt actttcattt cttgcgagtg caatgctgtt gcaggcatgt
61 ggtggtgaca tgctgggcac ctctgacagc gaagactata aattgattcc agaagaagta
121 acggaagatc caactaaagc taggccgtct gaaaatgccc ccgtgttaaa aacgagtggt
181 actactatac agctaccaga tggtacacca gtgctgctgc gaggtattaa ccttcaattt
241 ggcgacaatc ctattgagca aatagatggc atacaggcta ttcgcgaaac aggttcaaac
301 gttgtgcgaa ttcaattgtt agcagataca tctacagcaa atttagaggc ggtgctaaat
361 aaagttgttg agcataattt aatagctgta cttagtctct acgacgaagc tttacattgt
421 aaagaagatg atgaggcatt tacggatgca gttaagcaag tatggcttac cgattttctt
481 ccaattattg ctcaagatcg ttatcaagca aatattatga ttaacatcgc aagtggctgg
541 gggcctgaag ccatttttga tgggtatagt gtaggttaca aaacgtatac cgataactat
601 aaagcagcta ttcgtcagtt ccgaaaggct gggtttaatg tgcctttggt aattgatgcc
661 cctggatgtg gtgctgactt taacgctttt ttaagtaatc gcggtaaaga gcttatggct
721 gcggatgata aagacaatct tgtgttgtcc gtgcacggtt atggttcgca gtggaacacg
781 gctactaaag ttacggatgc aattagccag cttgctgcgc aaaatatccc tgtgctaatg
841 agcgagtttg gtggctctgg tgtcggtgaa aagcctgtta aacatatggc gatccttgat
901 aaaggtgcag gagattacgc cgcagaaatt attctgccat gggcgagcgc tacagataaa
961 gtggctatga atgtgccatt ctcagcacct atcaatctga caaacactga tgtgagcttt
1021 gacgttaagc tggatgaagc atatgtcacg gatggtcaaa tgggggttgt aatgtacctc
1081 cgagatgtaa atggagaata tgcaaactta gcttggcact ctgcctctga atttccggct
1141 ggtgaatggg ctactaaatc ttatgcgatt cagaataatg catctttcgg ctgggcaagt
1201 gaggcgtttg atattactgc cgtcgctaaa gttggtgttg agttggttgc aaatggcaag
1261 ctcgccgagg ttgctggcag cgttgttatc gacaaccttc gagtggctga aggtagtggt
1321 gcagtcgagt tatacagtca aagctttgat gatgatattg caggttgggg cgtgccttgg
1381 actggcacag ttgctgcgca cgctgacggt gctttatcgc taacccatga caatggagaa
1441 attattgccc agctggacgg gcttggtggt gtagttgatt ttgcccagcc ggttgttatt
1501 agtggcaggt tttttgtgcc tgcggattat gctggttcat ggatgtacgc taaatttttc
1561 aataacggcg aggcatggac agaggttgga attactgggc ttactcctgg agagtggaca
1621 gaaatttccg tcgaaaccga atttcctgca gctgctacca gtgtaggcat tcagattggc
1681 aacataggta ttgctgatgg ggcaaccatt acagattcca cagagccttt tttgctggac
1741 gactttgcta taagtggcgt agcagctaat gactcgttcg aacttggtac gcagtatatg
1801 gcgtcgttcg atgaatctga agatggctgg gcttacttga gttggggggc gtctgctact
1861 gtagaggcca ttgatggcgc tttgaatttc tatccaaatg ccaatgatgc ggtgagaata
1921 gtactttata aaaccgactt aagtgctata gacgacttgg atttgcagga cccgttcacc
1981 attaaaacgc gagtattgat tccagatagc tacacaggac aggcgttcga gtatcagctg
2041 tttctacaag atgctaactg gcaaaatcat tttgcagcga aaatttggaa ccaagatgag
2101 cttatccctg gtgagtggat ggacttggtg gttgaggttg agtttcctgc tgaattcgat
2161 cgggctggaa ttcctcaata cctcggtttt gacctgtcct ccgaagttgc tttaccacaa
2221 gacccaatac taattgatga aatagttttt gaaggcatgg ttccagtaga aaaagaagtt
2281 gtgatcattg atcaggtaga tttcttctac actaaccact ttacagattt tgctatcgac
2341 tatattgagg gtgaaatatt agaggacgac attctggagc ttgcttatat tcatcagcgc
2401 agcgagccat tctcttggat agcttggtct tggtacggaa atgatatcga aaattctgac
2461 tgggatatga ccaccatagt tggcgacgca acagccttga ctgaacgtgg tgaagatatc
2521 gtaaatggta aaggtgggat tgcaggtaac tag
LOCUS NZ_AABI02000011 1227bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_9，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000011 REGION：互补链(88053..89279)
VERSION NZ_AABI02000011.1 GI：28878291
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1227)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028020.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1227
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1227
/gene＝″Mdeg1904″
CDS 1..1227
/gene＝″Mdeg1904″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066516.1″
/db_xref＝″GI:23028098″
/translation＝″MQKITRLAALVVAGLCLLGTQAQAKKFEHLAQTPPMGWNSWNNF
GCDVDEKLIKETADYMVSSGMKDAGYEYVNIDDCWHGERDANGFIQADPERFPSGIKA
LADYVHSKGLKFGIYSDAGWTTCGGKPGSRGYEFQDAQMYAKWGVDYLKYDWCATDGL
KAEGAYQTMREAIH KAGRPMVFSICEWGDNQPWEWAKPIGHLWRTTGDIYNCFDCEYD
HGTWSSWGVLQILDMQDDLRQYAGPGHWNDPDMMEVGNGMTEAEDRSHFSMWAMLAAP
LIAGNDIRNMSEATRKILTNKAVIAVDQDELGVQGFKYSSKNGVEVWFKPLANDEWAM
AVLNRNKGEVKFEFKWRNEVVKDELTHRTITFNEQKFDWQDLWNKSNKGHTKKFLKTK
IAGHDTLMFRLTPAKN″
ORIGIN
1 atgcaaaaaa ttacacgttt agcggcgtta gtcgtcgctg gcttgtgcct gctaggtacg
61 caggcgcagg cgaaaaagtt tgaacactta gcccaaaccc cgcctatggg gtggaatagc
121 tggaacaatt ttggctgtga tgtagatgaa aagctcatca aggaaacggc tgattatatg
181 gtttcttccg gcatgaaaga cgcgggatat gagtatgtaa acatagacga ttgctggcat
241 ggtgagcgcg atgctaatgg ttttattcag gcagaccccg agcggtttcc ttccggtatt
301 aaagcgcttg ccgactatgt tcattcgaag gggctgaagt ttggtattta ttctgacgcg
361 ggttggacca cctgcggcgg taaaccgggc agtcgtgggt acgagtttca agatgcacaa
421 atgtatgcga aatggggcgt ggattatctt aaatacgatt ggtgcgctac agatggctta
481 aaggccgaag gcgcatatca aacaatgcgt gaagccattc ataaagccgg tagaccaatg
541 gtatttagca tttgcgagtg gggcgacaac cagccttggg agtgggccaa acctattggg
601 catctatggc gtaccacggg tgatatctac aactgtttcg attgcgaata tgaccacggt
661 acttggtctt cctggggtgt attgcaaatt ttggatatgc aagacgacct aaggcagtac
721 gctgggccag gccattggaa cgaccccgat atgatggagg tgggcaatgg catgactgaa
781 gctgaagacc gttcgcattt ttcaatgtgg gctatgttgg cagcgcccct tattgctggt
841 aacgatatac gcaatatgtc ggaagctacc agaaaaattc tcaccaataa ggccgtgata
901 gcagtcgatc aggacgagct aggcgtacag ggctttaaat attccagtaa aaatggcgta
961 gaggtttggt ttaaaccgtt ggcgaatgat gagtgggcaa tggctgtact caaccgaaat
1021 aaaggtgaag ttaaattcga gtttaagtgg cgtaatgaag tggttaaaga tgagctgacg
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LOCUS NZ_AABI02000013 5202bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_12，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000013 REGION：互补链(66951..72152)
VERSION NZ_AABI02000013.1 GI：28878289
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-5202)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028387.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
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LAFLNSL″
ORIGIN
1 gtgagttgta caccctgtat tagatcaaaa gcttcatcac ttaacttcga taataaactt
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LOCUS NZ_AABI02000006 4326bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_6，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000006 REGION：86580..90905
VERSION NZ_AABI02000006.1 GI：28878296
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-4326)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027577.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http//www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG 分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..4326
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
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EIYAD″
ORIGIN
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1261 gatttcgaaa ccatcaaaac tttcttcagc atgtctggcc caggccaagc agaagcattc
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1441 ggtgtagaag gtgatttatt tctttgggct gataccttag agctattgcc aggcgaagtg
1501 gttgaaggca atgcatcact gcatttgaaa tcaaccggtc aaggttggtt cggtatgggc
1561 ttaacggctc gcgaaggctt taacctttct gcgtttgata acgccgatgc gaaattacac
1621 ctctcaatga aaaccacaga tcaaactgat ttccaagtgg gcattaagag cggcagcgta
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3481 ccagagccag agccagagcc agagcctgag cctgagccag agccagaagt agacccaact
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LOCUS NZ_AABI02000013 3624bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifeifer degradans 2-40Mdeg_12，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000013 REGION：互补链(2677..6300)
VERSION NZ_AABI02000013.1 GI：28878289
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-3624)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至Natioaal Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028387.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
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ITDDTTFTYGKFEARLKMPPARNGEFPAWWLLGNFPDVGWTACQELDIMEFTGNNGMN
IPQTYWTAPYAVHGGTTVGLAGLGITNPQEQYVTYGIIKTPSKVEWYINGVLTNTFSR
DNQGDDQPWPYVTPMRMILNHAITHVEWPDVGNYNAYSPDANRPSATGWSYVDNNGVT
QYEYIDVDAMNANIGRAGTDFVVDYVAHWPLPTSDAEHKYVDDSKSSFFRESGNTKGF
YNLKGWLAPVSVTADGFDQPGWDTDVRDNGADNAADGYVGSKWATPNDDGIHWVEVDY
GQDKQINYLWLEWAWNLPADYDIYGKSSTGAWEFITSSQQEVATWATHVFDVNRTYRY
LKLVTKGRIDKSSPIWLLELMAFEDVPNMYPKPAGTTMPNRSVNVLNNGNFSQGLDSW
GTEAFDGANPTYNVQNGAAVIALTNDGGLSGSVQLHTSGFGLKRDYRYHISFDARADV
ARNLMVRLAENNLNPSAAGTYHVETVAVGTSFNTYSFTYDYTGQGEPARLAFLLGGMG
TATTYIDNVVIREGDFIGSGEPLVAAISSTNFVSASNGWETEWWGAPARAVDGNLGNK
ASGNDGEAEGMDLDITVRIDEHYDVRAVLVAGDNSPERSLDQFRVEFGNGTPLMGWTD
STTEGVYEEFANFNNTPAAGERDFKFFFRPPAGQLVEVADVQLLAVDLMPHRISAIAL
DEGGTISPAGTTRYSRNNTDDATYTFTAPQGQSVSNVIVDGVSMGPLNSYTFTDINAD
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DGSASNSVNHIRIYGVERSAGNNWGYSIFNVEVWGEAGDTSMEEEVEIEPVSAAASSD
FQAAANAIDADAGSRWESAHADATAHLTLDLASTYKLVSVAIDWEAANAGAYTLEGSS
DGVNWTTIASFTGGAFGNRTDTLTVSGSHRFVRINCTEKSAGNNWGYSIYDVRLTALL
PTP″
ORIGIN
1 atgcaaccgt ctgcgtacgg tttgtattgt gctgcgtgtt attcacaaaa atcaaagtgt
61 gagtttatca tgattaaaaa taacctaatt aaatatgccg ttagatgtgc agccttaggc
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3301 ggtagtcgct gggaaagcgc gcacgcagat gctaccgcac acttaacatt ggatttagca
3361 tcaacctata aactcgtgtc agtcgctata gattgggaag ctgccaatgc tggagcttac
3421 accctagaag gttctagcga tggtgtaaat tggacaacca ttgcaagctt caccggcggt
3481 gctttcggca atagaaccga tactttaacg gtgagtggca gccatagatt tgtacgcatt
3541 aactgtacag aaaaaagtgc aggcaacaat tggggctatt ccatttatga cgtacgtcta
3601 actgcattat tacctacgcc ttaa
LOCUS NZ_AABI02000010 2124bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_14，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000010 REGION：互补链(50649..52772)
VERSION NZ_AABI02000010.1 GI：28878292
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2124)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Inform ation，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028613.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2124
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
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/gene＝″Mdeg2431″
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KQEFLYGRIESRIRFHNLEGGTWPAFWMLENRISETPRKYDDDYEQWPNPGAGEIDVW
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SCDETTPAALQGEPSTSWVLSTVNATATLANAAQNSXXXXXXXXXXXXXXXXXKL″
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/gene＝″Mdeg2429″
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/product＝″COG2273:β-葡聚糖酶/β-葡聚糖合成酶″
/protein_id＝″ZP_00067027.1″
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SANKNYDVSDGTLKIIARKQSVECAGLGGQNKTWTSGRLNSKDKQEFLYGRIESRIRF
HNLEGGTWPAFWMLENRISETPRKYDDDYEQWPNPGAGEIDVWEWFSNGPNIYIINFF
NANNCGDRHDYVYPNGGSDVLNWHNYAMEWDANNISFFIDGSLITSFDVSSCPQYKEK
MFVLLNLAVGGNLGGTIDPNLSLATLEVDYVGYCTATNANDYASCDETTPAALQGEPS
TSWVLSTVNATATLANAAQNSGAIAFETSAFGENASDPMIYQAGQNITAGKEYTLAFD
VRSNTAGRAFRAFVAASAEASQGILDQEVVVANADAWQFVSLNFTSEQTFNDAVIAFQ
SGTAALGNGELLFKNIVLTEHSTLYSTTVVTNAGGSINPPGPTVKTVSGYSSHFTITA
NVTHAIGDVFIDGVSVGPVAEYTFDNIQGDHEIEVQFVALPPPEGTEILTPVAATASS
SLSVASRAIDGDYATRWESRHGIEATWLELDLGTAVDLHSILINWEAANAKAYTLEGS
NDGENWTVLASVTNGTFGDRADELSLTGSYSHLRINATERSAGNDWGYSIWDIVLYAY
TQDQNASSSSSSSSNSTTSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSSGGSEPASSGSGRMD
GVVFLFLMVLFGLVTQRVVLAKLVS″
ORIGIN
1 atgctaccgc cacgcttgcc aatgcagcgc aaaatagcgn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn
61 nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnna aattataaca acgaagtgca gtgttatacc
121 gcagatgaaa catccgctaa taaaaactac gacgtatctg acggtacgct aaaaataata
181 gcaagaaagc aatccgtcga gtgtgcaggc ctaggtggcc aaaacaaaac atggacatca
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421 gaaatagatg tgtgggagtg gttttcgaac ggccctaata tttacatcat aaacttcttt
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781 gcaagctgtg atgaaacaac acccgctgca ttgcaaggtg agcccagcac atcgtgggtg
841 ttaagcacag taaatgctac cgccacgctt gccaatgcag cgcaaaatag cggagccatt
901 gcgtttgaaa caagcgcttt cggcgaaaat gcatcagacc ctatgattta ccaagcaggg
961 caaaacatca cagccggtaa agaatatacc ttagcgtttg atgtgcgatc caatactgcc
1021 ggccgcgcct ttcgtgcatt tgtggcggct agtgccgaag cctcgcaggg tatattagat
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1261 gttgttacca atgctggtgg ttcaataaac cctcctgggc ctacagtaaa aaccgtaagc
1321 ggttacagta gccactttac aattactgca aatgtaaccc atgctattgg cgatgtgttt
1381 atcgatggcg taagcgttgg ccctgttgcc gaatatacgt tcgacaatat acaaggcgac
1441 cacgaaatag aagtgcagtt tgttgcactg ccgccccccg aaggtaccga gatacttacc
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1621 ggcacagccg tagatttgca ctccatactc ataaactggg aagccgcaaa cgcaaaagcg
1681 tacaccctag aaggctctaa cgatggcgaa aattggacag tactcgcaag cgtaacgaat
1741 ggcacctttg gcgaccgcgc cgatgagcta tcactcactg gcagctactc acacctgcga
1801 ataaacgcaa ccgaaagaag cgcgggtaat gattggggct attccatttg ggatatagtg
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1981 agttcatctt caagttctag ctctggcggc agtgaacctg cttcgagcgg tagcggcaga
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LOCUS NZ_AABI02000004 1722bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：互补链(261777..263498)
VERSION NZ_AABI02000004.1 GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1722)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Centerfor Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1722
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1722
/gene＝″Mdeg1155″
CDS 1..1722
/gene＝″Mdeg1155″
/codon_start＝1
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/product＝″COG2273:β-葡聚糖酶/β-葡聚糖合成酶″
/protein_id＝″ZP_00065780.1″
/db_xref＝″GI:23027325″
/db_xref＝″COG:COG2273″
/translation＝″MEATMIKTCKTTPAKWAAALSLGCALLLPSGVNAATFQAEDYSA
FYDTTAGNTGGAYRNDNVDIEATNDNGGGYNVGWIDANEWLVYPGVNITTTGDYVINV
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GWNFNWIEVTPVNNGGGNGGGSATFFQAEDYSNYSDTTPENIGGAYRNDGVDIETTSD
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IPATGGWQNWQTVELSTNINAGTYTLGAFVSTSGFNLNWIEVVAGGDGGNNGGGGGNI
TWRDEFDTINRDVWNFETGGGGWGNNELQYYTDGQNASIQFDPQAGSNVLVIEARKET
GGQCWWGGNCGYTSSRMNTRFKKSFQYGRIEARMKLPRTQGIWPAFWMLGDNFNNVGW
PQGGELDIMEHVGTNNITSGALHGPGYSGNTPITGHLEHGASIDSGYRVYAVEWDTNG
IRWFVDGTNFYSVEKWQVQQYGEWVYDQPFWILLNLAVGGNWPGDPDHANFTTQRFYI
DYVRVIQ″
ORIGIN
1 atggaggcta caatgataaa aacatgcaaa accacaccag ccaagtgggc agcagccctt
61 agcttaggct gcgccctact tttaccctca ggcgtcaatg ctgccacctt ccaagcagaa
121 gattacagcg ccttctacga caccaccgcg ggtaacactg gcggcgccta ccgcaatgat
181 aacgtcgata tagaagccac caatgataac ggcggcggct ataacgtggg ctggatagat
241 gccaacgaat ggctggtata cccaggcgta aatatcacca ccaccggcga ctatgtaatt
301 aatgtacgcg tggcgagcgc aagcggcggt gcactttctg tcgactttaa tgcaggctct
361 attccactgg gtcagttcga tattcccaac actggcggtt ggcaaaactg ggtaaccgtt
421 tcaaaaacag ttactttaac tgccggcacc tacgatatgg gcgtattcgc ctctaccggc
481 ggctggaact ttaactggat agaagtcaca cccgttaata acggtggtgg caatggcggc
541 ggttcagcca cgttctttca agcggaagac tacagcaact actccgacac cacacccgaa
601 aacattggcg gcgcctatcg caatgacggt gtagatatag aaaccacaag cgatgccaac
661 ggcggccaca atataggctg gatggaaaac ggcgaatggc ttgcctacga aggtttatct
721 attcccagta acggcaacta catcattaaa gcgcgtgtag ctagccccaa cggcggcgca
781 ctatcgtttg atttaaacgg cggcggccaa gtgcttggca caatgaacat acccgctact
841 ggcggttggc aaaattggca aaccgtagaa ttgagcacca acattaatgc cggaacctat
901 acgctcggcg cctttgttag tactagtggc tttaacctaa attggataga agtcgttgcc
961 ggtggcgacg gcggcaataa tggtggcggt ggtggcaaca tcacttggcg cgatgaattc
1021 gacacaatca accgcgatgt ttggaatttt gaaaccggtg gcggcggctg gggtaacaac
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1141 agtaatgtgt tagttatcga agcccgcaaa gaaaccggtg gccaatgttg gtggggcggc
1201 aattgcggtt acacctctag ccgcatgaac acgcggttta aaaaatcgtt ccaatacggc
1261 cgtatagaag cacgtatgaa gctgccgcgt acccaaggta tttggccagc gttttggatg
1321 ctaggtgaca actttaataa tgtaggctgg cctcaaggtg gcgaactaga cattatggag
1381 cacgtaggca ccaacaatat cacatcgggt gcattgcacg gcccaggcta cagcggtaat
1441 acgcccatta ccggccattt ggagcacggt gcaagcattg attctggcta ccgtgtttac
1501 gcagtagaat gggataccaa tggtattcgc tggtttgttg acggcaccaa cttctacagc
1561 gtagaaaaat ggcaagtgca acagtacggc gaatgggttt acgaccaacc tttctggata
1621 ctgctaaacc tagcggtggg aggcaactgg cccggcgacc cagaccacgc caactttact
1681 acccaacgtt tttacattga ctatgtgcgg gtgattcagt aa
LOCUS NZ_AABI02000008 2229bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_7，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000008 REGION：137194..139422
VERSION NZ_AABI02000008.1 GI：28878294
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2229)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027735.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2229
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
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/gene＝″Mdeg1670″
CDS 1..2229
/gene＝″Mdeg1670″
/codon_start＝1
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PESEPESEPESEPEPENAWQLLWEDNFDSEISASNWGFEVNCTGGGNNEKQCYTDRAD
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RVEIRAQIPGGQGSWPALWMLPSDKVYGGWPASGEIDIMEAVNLDTDAANAVHGTLHY
GLQWPQWSTIGASYETNDDFTGEFHTYAIEWEADQIRWFVDGVHTQTQVSDNWYNFVW
GGQESGFAVANPRAPYDQEFHLIMNVAIGGNWPGDPDTGWASDREMLVDYVRVYQCDS
EADDGTGCANATDAVDIAISPTADVGAPSQVEYDLYSDGLQTPAFTNAGVTLAANVWQ
ETEGNVVTTTGNLGDDHGDAWEITFNGTGNVSIAIAEQDGVESYVRLNGGTAWSNYGV
LAFDMYVDSVDAETGFVVKMDSVYPNVGAVDIATPAAGEWTRVHVKVADILANPIAGG
GGLNVAQAVNLFVLEPTGTKTAHVYVDNISISCAYNSTAKSWQGDKTCDVAAVPTADT
SGIDLSGNELVIFDEQEPDFWGFGQFSAGGAEVAMSFLADPEDASHGNVLGFSYPDSQ
NVAYLQSATPLNLSDWAGGTIQFDMYVISEPANVNWMMKVDCVHPCSSGDIPLTTNID
GVVPAVGVWQTYRFNLDALVAGNPGLDLTKVDTPLVIFPAWDNQTGANFRIDNIKFVR
AN″
ORIGIN
1 atgaaaaaac taaagcttct agaactttcg ctggtggtgt tggtagccct agggctagcg
61 agctgcggcg gttctgacga caaaaaaacg ccagacccag tagaagaacc cgtgggtgaa
121 ccagaatcag agcctgaatc agagccagaa tctgaacccg aatctgagcc agaaccagaa
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241 ggcttcgaag ttaactgcac cggcgggggt aacaacgaga aacagtgtta taccgataga
301 gccgacaacg cttatgtaga tgaggcaggc atactgcaca tagttgccaa agaggaagca
361 tttagcggac ccgctattca ggatgatgac cccaactaca accccgatga cacatcggct
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601 gcggttaatt tagatactga tgcggccaat gccgtgcatg gtactttgca ctacggttta
661 cagtggccac aatggtcgac gataggcgct tcttacgaaa caaatgatga tttcaccggt
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781 gtacacactc aaacacaggt gtccgataac tggtacaact ttgtatgggg cgggcaagag
841 tccggctttg ctgtggctaa cccgcgtgca ccttacgatc aagagtttca tttaatcatg
901 aacgtcgcta taggcggcaa ctggccgggt gacccggaca cgggttgggc atctgatcgc
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1201 accactggca acttgggcga cgaccatggc gatgcttggg aaattacctt taatggtact
1261 ggtaatgtat ctattgctat tgccgagcaa gacggcgtgg aaagctatgt gcgattaaat
1321 ggcggaacag cttggagtaa ctacggcgta ctagcgtttg atatgtatgt agatagcgtg
1381 gatgccgaaa ctggctttgt tgttaaaatg gacagtgttt accccaatgt aggtgctgta
1441 gatattgcta cacctgccgc aggtgagtgg acgcgagtgc acgtaaaagt ggctgatatt
1501 ttagctaacc caattgcagg tggcggtggc cttaacgttg cgcaagcggt taacttgttt
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2221 gctaactag
LOCUS NZ_AABI02000048 2646bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_49，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AAB I02000048 REGION：1591..4236
VERSION NZ_AABI02000048.1 GI：28878254
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2646)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23030011.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2646
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2646
/gene＝″Mdeg3707″
CDS 1..2646
/gene＝″Mdeg3707″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00068290.1″
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KNALMAIESANNKATAGGHWGIGLVNGVEINEPTNAVVRAEFHTYAIEWNESLIRWYI
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KVYECDTSVTDQIESCAFAADENVDKLASNRIESVGEIVTPLFTDELTSLSWHYSDAE
EAVTFVTEQESAVPTHRGIVSQPDVMEPVAEVAPVDPVEEGEEGYEEYQAYLAYVDYL
NYLETLAFLDTVDPSRERGAVIRYQSDASTWSNFSLNTPSLGLVGKDSALQFDMYIDS
ASTTTETIEIRMETGWPFLGTVLLNVADLQLDTWVTYNIPVSDFLANPFITPDWAVGQ
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YKFQYRLASGLESASEFDVSIDDMLIDGQSLPGTGGWQVWTTLESGEFDLTAGEHAIV
FNFAGGMNFNWFAIVPPPIAIFIEAEDYSSMAGVQLEDTADEGGGQNVGYIDAGDFLQ
YNVEVPADGTYFIELRVASSGGSDGFTITSNGITTSTIPVADTGGWQNWTTQTVEMQL
SAGQQTLRFDFIGGAINFNWINVTN″
ORIGIN
1 atggggttaa caatggttaa gaataaattg tatctagcgc tatctatagc ggctgctaca
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301 tctggtaaag actcctttac ctatgtggcc acccacaccg catcgggcga tacagccagt
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541 agcaccgctg cactggggca ggctgggcgt attgaggcga gcattcagtt gcccgatggt
601 aaaagcttgt actctggctt tggcttaatg ccaatggccg acatgttcga tggtaaaaat
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841 attcataccg tagataccct taatacctgg tcatacaatt taagcggcga taccgtggtt
901 gccgatacta ccactaagcc gtttagccaa gacctgcaaa taatgatgga gttaacggca
961 gcaagttcag gtttgccaaa tgcaatgctg gtagattttg taaaggttta tgagtgtgac
1021 acgtctgtta ccgatcaaat agaaagctgc gcattcgcgg ctgacgaaaa tgtggataag
1081 cttgcttcca accgtattga gtcggttggt gaaattgtta ccccattgtt cacagatgag
1141 cttacatcgt taagctggca ttactctgat gccgaagaag ctgttacttt tgttacagag
1201 caagaaagcg ctgtgcctac tcatagaggt attgtttctc agcccgacgt tatggagcct
1261 gtagcagaag ttgcaccagt ggaccctgta gaagaaggtg aagagggcta cgaggaatat
1321 caagcttact tagcttatgt ggactacctg aactatttag aaactctcgc atttttagat
1381 acagtggacc caagccgcga acgtggcgct gttattcggt atcaatcgga tgcaagcaca
1441 tggtctaatt ttagtttgaa tactccgagc ttaggcttag ttggaaaaga ttccgcgctg
1501 cagtttgata tgtatatcga tagcgcatct acaactaccg aaaccatcga aatacgcatg
1561 gaaaccggtt ggccattcct tggcactgtt ctgctaaacg ttgcagactt gcagctagat
1621 acttgggtga cgtacaacat tcccgttagc gactttttag ccaatccatt tattacaccc
1681 gattgggcag tgggccaaga ctggttcttg ggcggtaacg gtgttgaagg gcagcctctc
1741 tatttagata ccaattcaat tactaaagcc attgtggttc agctagcagc accagggcat
1801 ttagttttcg ataacgttgc aattacttgt gtttcgaatg aaagctgctt ccaggggcca
1861 ttagccaaac agcccatcgt aaaggccggt cctgctccca ttatttacga agcagaagct
1921 tacacggcgg taacgggtga agtgcaaacg gaagataccc aagacgcggg cggcggccaa
1981 aacgttggct atatcgacgc aggtgaagca ttggaataca ccattgttgc acctatcgac
2041 ggtacctata aattccaata tcgcttggca agtggcttag aaagcgcttc tgagtttgat
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2161 gtgtggacca cattggagtc tggtgagttt gatctaactg ctggtgaaca cgctattgtg
2221 tttaattttg ctggcggtat gaactttaac tggtttgcaa ttgttccgcc ccctattgcg
2281 atttttatcg aagctgaaga ttactcgtca atggctggtg ttcagcttga agacaccgca
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2641 aactaa
LOCUS NZ_AABI02000054 3558bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_54，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000054 REGION：互补链(＜2..3559)
VERSION NZ_AABI02000054.1 GI：28878248
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-3558)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23030054.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..3558
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene ＜1..3558
/gene＝″Mdeg3739″
CDS ＜1..3558
/gene＝″Mdeg3739″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG3979:含有3型壳多糖结合域的未表征蛋白质″
/protein_id＝″ZP_00068322.1″
/db_xref＝″GI:23030055″
/db_xref＝″COG:COG3979″
/translation＝″MILRLIRAAIYIVAFVSLIACGGSSTSKPAQPDIPDTDLPDTGT
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LTGTPQQAHAGNAEVVLSYSDGNVTLQQQFTIAVSASYTEEPPTPMSRPTVNAADTST
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QGNQFIYSVPDPFSEVFDGIAVANSEYANLEAYLKSYSDGTATVQWQSGNLPVMQATF
VHGSPYVFFKAYRGNMVLRTKAADGGEKGTFYNENNSLGIWTSVAGNKNDFLITGEGE
TVFNNIETDTITLTNAANEFTLTLLPTAGAGTPSSTVIQAFEDSARAVVAKVDIQYSV
DRTNNMVTVTHTYKNESNTPVQTLAGLLPMHWKYSDTALSGYKTRSARGMVQFAHIDS
FSYTIPYVGVLPYLPSSVGDFDSSVLAGLVQAFVAEGPENWNPHTDTYWSGKAFNKVA
ELSAIARSVGMTSEADTLLNWLKAELQDWFSANTNGSLDEKKYFVYDAEWNTLLGLEE
SFAAHQQLNDHHFHYGYFVRAAAEICRVDASWCGADQYGPMVELLIRDYAGAKDDTMF
PYVRNFDPANGFSWASGSANFVLGNNNESTSEAANAYGAIILYGLITGDNELVERGMY
LHASSSVAYWEYWNNIDRYLGADADRDNFPSGYDKLTTSIIWGHGGVFSTWFSGAYAH
ILGIQGLPTNPLIFHVGLHPEYMEDYVALGLSESSNNKPSGLIDDQWRDIWWNLWALT
DAEAAIADYNTVGSNYAPEFGETKAHTYHWLHTWNALGHLKTGTGELTVNDPAALVFE
KDGIKTYVAYNFSGTPKTILASDGFEFIAQPNDFTVVTTADNNPDDTQPPTLPANLQA
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QVKAKDRSGNETAWVSITVTTPSETDDLLPTLDGGVYSANVGPNSADLSWAAATDDRG
IASYTIEVQVGGAVFVTETVFDTSYALSGLTEATEYNVAVYATDTGGQQSATISGIVN
TTSNPFGSGCELICASATSSSSVTFTVHQAGAVDIHYLVN″
ORIGIN
1 atgatactgc gactgatacg tgccgcaatt tacattgtgg cgtttgtttc tcttatcgcc
61 tgtgggggct caagcacatc caagcccgcg caaccggata ttcccgatac ggatctgcct
121 gacacgggaa cacccgaacc cgaaaacagc gatccagttg ttcaatctac gccggctaca
181 gccattgcgg cgggcaacgt gtatagctat caaataatgg ctagcgacgc agacgaatcg
241 gatgtcatta gctatgcggc ggttactttg cctagctggc tggcgttcga cccagatacc
301 ggaatactta ccggcacgcc ccagcaagct catgctggta atgctgaagt ggtgcttagc
361 tatagtgacg gcaacgtaac cctgcagcag caatttacaa ttgcagttag cgcgagctac
421 accgaagagc caccaacacc gatgagtcgc ccaaccgtaa atgcggcgga taccagtact
481 tacactatta ctgcctacgg cgcgggcagt attgcggatg cgattaaccc tgctagctat
541 ggctgtgtgt acgattacgg taattggatt tataacgccg gcgttgtgga gccaggagta
601 agcggctgtg accctatagg cgcaccaacc taccgtacac cgcaggtggt tggggaagcg
661 gcaagcgtgc caaccccaac gcataaatgg tggggctcgg tttctttttt aggtgaaatg
721 aaaataggtg acccggcagg cgcaggttac ataacgccag acccaataac tgcacgtatc
781 tcgaataaag gcgtgcgtat tatgggcata cccaacggct tgggcgcgca aggcaaccag
841 tttatttact ctgtacccga cccttttagc gaggtattcg atggaatagc ggtagcgaat
901 agcgaatatg ccaacctaga agcgtattta aaatcctaca gcgatggcac cgctaccgtg
961 caatggcaga gtggcaacct gccggttatg caggccacat ttgtacacgg ctccccctat
1021 gtgtttttta aagcctatcg cggcaacatg gtgttgcgca ccaaagctgc agacggcggt
1081 gaaaaaggca cgttttataa tgaaaataat agtttaggta tttggaccag tgtagcgggt
1141 aacaaaaatg actttttaat taccggtgaa ggcgaaacgg tttttaacaa tatcgaaacc
1201 gataccatta cgttaaccaa tgcagcgaac gaatttacct taacgttatt acctacagcg
1261 ggcgccggta caccttcaag tactgttatt caggcgtttg aagatagcgc ccgtgcagtg
1321 gttgccaaag tagatattca atactcggta gaccgtacca ataacatggt aacggttact
1381 catacctata aaaatgaaag caatacgcca gtgcaaaccc tcgcggggtt actgcccatg
1441 cattggaagt attccgatac agcattaagc ggctacaaaa cccgaagtgc gcgcgggatg
1501 gtgcaatttg cccatattga ttcgtttagc tacaccattc cttatgtggg agtattaccg
1561 tatttaccgt catcggtagg ggatttcgat tcctctgtgc tcgcaggctt agtgcaggcg
1621 tttgtagctg aagggccaga aaattggaac ccgcacaccg atacctattg gtcgggcaaa
1681 gcgtttaata aagttgccga gttatcggca atagcgcgct cggtaggtat gacaagcgaa
1741 gcagatacgc tgttaaattg gcttaaagcc gaactgcaag attggtttag cgccaacacc
1801 aacggcagtt tggatgagaa aaaatacttt gtgtacgatg ccgagtggaa taccttgctt
1861 ggcctagaag aatcttttgc tgcacaccaa caactaaacg atcaccactt tcactacggc
1921 tattttgtac gcgccgctgc agaaatatgc cgagtagatg caagctggtg tggcgcagac
1981 cagtatggtc ccatggtgga actgcttatt cgcgattacg ccggtgccaa agacgatact
2041 atgttccctt acgtgcgtaa cttcgacccc gccaatggct tttcttgggc atcgggtagt
2101 gccaactttg tgctgggtaa caacaacgaa tccacatccg aagcggccaa tgcctatggt
2161 gcaattattc tgtacgggtt aataactggc gataatgagt tagtggagcg cggtatgtat
2221 ttgcacgcgt cttcgtcggt ggcctactgg gaatattgga acaacatcga ccgctacttg
2281 ggggccgatg ccgaccgcga taattttcca tcgggttacg acaaactaac tacctctatt
2341 atttgggggc atggcggcgt gttctctacc tggttcagtg gcgcttacgc tcatattctt
2401 ggtattcaag ggctgcctac caacccgctt atttttcatg tgggcttaca ccccgagtat
2461 atggaagact atgtggcact gggtttaagt gaatcgagca acaataaacc ttcggggtta
2521 atcgacgatc agtggcgcga tatttggtgg aacctatggg ccttgactga tgcagaagcg
2581 gccatcgccg attacaacac ggtaggcagt aactatgcgc cagagtttgg tgaaaccaag
2641 gcgcacacct accactggtt gcacacgtgg aatgcgctcg gccatttaaa aaccggcact
2701 ggcgagctaa cggtaaacga ccccgctgca ttagtgtttg aaaaggacgg aataaaaacc
2761 tacgtagcgt ataactttag cggtacacca aaaactattt tggctagcga tggctttgag
2821 tttattgcgc agcccaatga ttttaccgtg gtgaccaccg ccgataacaa ccccgacgac
2881 acgcaaccgc ctacactacc ggcaaacttg caagcgctta accttaccca aacgagcttg
2941 gatgttaaat gggatgcatc taccgataac taccgtatgg caggttatgt agtgcaggta
3001 ttacaagccg atacattaat agaagaaacg tcttctatag ccagcatcgc ctcgtttaat
3061 aacttaacgg ccagcacaag ttacaccatt caagttaaag ctaaggatcg ctctggcaat
3121 gaaaccgcat gggtaagcat tacggtaacc acgcccagcg aaaccgacga tttactacca
3181 acacttgatg gcggtgtata tagcgcaaac gtggggccta actctgcgga tttaagctgg
3241 gcggcagcaa cagatgatcg cggtatagca agttacacca tagaggtgca ggttggcggc
3301 gcagtatttg taactgaaac agtgtttgat acttcgtatg cgcttagcgg attgaccgaa
3361 gcaaccgaat acaatgtggc ggtttatgct acagataccg gcggtcaaca atctgccact
3421 attagcggta ttgttaatac caccagcaat ccatttggca gcggttgcga attgatttgt
3481 gccagcgcta cctctagctc atctgttacg tttactgtgc atcaagcggg cgcggtagat
3541 attcactact tagtgaac
LOCUS NZ_AABI02000023 1116bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_24，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000023 REGION：互补链(49214..50329)
VERSION NZ_AABI02000023.1 GI：28878279
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1116)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029379.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1116
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
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/gene＝″Mdeg3181″
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/gene＝″Mdeg3181″
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QSTCSVDYRVESDWGAGATHKVLVTNTGAPINGWQMSWTFSGNEQITNLWNGMFTQSS
QSVIVDSLSWNAQLNTGATAEVGFNINSPSGQLPDVYLNGVNCSNPGEPEPEPEPEPE
PEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPEPELAYSLDATASFLNFVSSKKT
HVLETHRFDVLSGGISTAGEAQLVIDLNSVNTGIDVRNGRMRDYLFETATYSVATVTV
PVDLAAVAGLAVGEDMLVDVSATLDLHGVPGVIDTQLNVQRLSATRIMVQNQSPLLIK
AADYSLEAGIETLRNLASLNVISTTVPVDFVLFYEAP″
ORIGIN
1 atgggaagca gttttctcac ctgttataaa cctagcaaag aggtaataac cgtgaagcga
61 gcagcaataa acttggtgct gatacccggg ctagccgtaa gtatggggac gttgtcgtct
121 tctgcttttg cacaaagcac ttgtagtgtg gactatcgag tagagtccga ctggggtgca
181 ggggctacgc acaaagtatt agttactaac actggagccc ccataaacgg gtggcaaatg
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301 agctctcaaa gtgtgattgt tgatagtctg tcgtggaatg cccagctaaa taccggtgcc
361 accgcagaag tggggtttaa tattaactct ccttcagggc agttgccgga tgtgtatttg
421 aacggcgtaa attgtagtaa ccctggtgag ccagagccag agccagagcc agagccagag
481 ccagagccag agccagagcc agagccagaa cctgagcctg agccagaacc tgagccagaa
541 cctgagccag aacctgagcc agaacctgag ccagagccag agccagagcc agaattggcc
601 tattcattag atgcgactgc atctttctta aactttgtta gctcaaagaa aactcacgtt
661 cttgaaacac accgttttga cgtgctttct ggcggtatta gtactgcggg tgaggcacaa
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961 actcgcatta tggttcagaa ccaatctcca ctattaataa aggcagccga ttattcgctt
1021 gaggcgggta tcgagacatt gcgtaatctc gcgagcctaa atgttattag caccacggtg
1081 ccagtggatt ttgttttgtt ctacgaagcg ccttaa
LOCUS NZ_AABI02000023 3129bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_24，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000023 REGION：互补链(46057..49185)
VERSION NZ_AABI02000023.1 GI：28878279
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-3129)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029379.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..3129
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
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/gene＝″Mdeg3180″
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EHVAEVQTFTAYNATVDSDGVATLAIDLNSAETNIDIRNERFRNVLFETAFLPTLYYS
VQLDMASLSALAVGDAQTQTLGGTLTLHGVQAVVEAEVLVVKTSATDLTVSTSKPILI
KAADFDLVSGVESLRALASLSSIGQTVPVYFRLDFDAADPQVTNAVAVPATPAAPTSL
TADFTESSGIAALNWNDASNNETEFLVRRREASTGYWSRLTEVNANSTLLDDLLLEED
TYDYKVIALNNGVPSAPSPVATVVATTNPNPEPLTGEEHYQAKCASCHGDDASGGVVG
VALNTERDLTVMLNTIVTRMPPGEADNCDQECAEAIGGYIQTTFWNGGEPEPELACDT
VTYGARQLKLLTKAEYQRSVEDLVGIDYNVASGLAEDNIIGYFVNNTTKVVVPTVYDQ
YLTVAEEIAQWSADRNFAGALTCGTNFNQTCANQFVNNFAPKVFRRALSSDEAAAYLA
IANGSATNGDVKAGIQLAMEGLFSSPQFVYRHELGEANPNNNAIDSDAFELTSYEMAT
WLSYTYAGTTPDAIAMQKAANNQLRTDAEIRAEAQRLLEGAGAKQKMGDFVASWLGTD
HIANAPKDASVWPGFDALIPHLQTEIREMFSYVMLEPTESFASVYNANYTFVNGPLAQ
HYGINGVSGNEFQKVTTTDRGGILANGAFMARWGESVESSPIRRSVRVRRRMLCQDQP
DPPGNVNIGRENAADEFHEALADPTTTNRERYELLTSGETCATCHQEWINPLGFGMED
FTAVGTRRVTDLNGNTIDASGQLYAPENLNDKDVFINFNGTQGLGALLTTLPSAQSCL
PQNLFRY SVGVGVEGLDDNPEGNELVPAERDGYACEVKNLTSTMLEQSPRAMLEGMGS
MQAVRYRKAWAR″
ORIGIN
1 atgaaaaaaa tattcaagat ttcagcgctc tcgctaggtt tctcaattgc tggcgctgca
61 tctgcagctg atttgtgcaa tgtaacctac gaagcggtaa atagctgggg ctccggtgcc
121 cagcaagcgg taaccgttgt aaataacggc cctgctttaa atgcctggca gttaagctgg
181 acatttaacg gcagcgaaaa tatagacaac ctatgggatg gcgtgctttc gcaaactggt
241 gcgaatgtta ccgttaacaa tgctggctat aacggcagtg ttggtactgg cggtcaattt
301 agcttcggtt ttaccgtaag cggttggagc gaaaactttc ccacagagtt ttacctaaat
361 ggtgaagcgt gtagtggagc tgttgaccct aatcccaatc ctaacccaga gccaactgat
421 ggcgctgtgt gggagttaaa ctcagccgat tcagtgttta gctttgtaac tgttaaaaaa
481 gagcacgttg ccgaagttca aacgtttact gcctacaacg caacagttga tagcgatggc
541 gttgcaacgc ttgctataga cttaaacagt gcagaaacga acattgatat acgcaacgag
601 cgcttccgca atgtattgtt tgaaacagct ttccttccta ctctgtacta cagtgttcag
661 ctagatatgg cttcactgtc tgcattggcg gttggcgatg ctcaaacgca aacgcttggt
721 ggcacgctaa cactacacgg tgtacaagca gtggttgagg ctgaagtgtt ggttgttaaa
781 actagcgcta ccgacttaac cgtatcaacg tctaagccta ttttaattaa ggctgccgat
841 tttgatttgg taagcggtgt agagtctttg cgagccttgg ctagtctttc aagtattggt
901 cagacggtac ctgtttactt ccgtttagac ttcgatgctg cagacccgca agtaactaat
961 gcggttgctg ttcctgctac tcctgcggcg ccaacgtctc taactgcaga cttcacagaa
1021 agcagtggta ttgccgcgtt gaactggaat gatgcaagca ataacgaaac cgagtttttg
1081 gttcgtcgtc gtgaagcgtc aaccggttac tggtcaagac tgaccgaagt taacgcgaac
1141 agtactttgt tagatgatct tctgttagaa gaagacacct acgactacaa agtgattgca
1201 ttgaacaacg gtgtgccttc tgcgccatcg ccagttgcaa ctgttgtagc tactaccaac
1261 cctaacccag aaccattgac tggcgaagag cactatcaag ctaagtgcgc aagctgtcac
1321 ggtgatgacg ctagcggtgg tgtagttggt gttgctttga atactgagcg cgatttaacc
1381 gttatgctga acaccattgt tactcgcatg cctccaggcg aagcggataa ctgtgatcaa
1441 gagtgtgcgg aagcaattgg tggttatatt caaactactt tctggaacgg cggtgagcca
1501 gagccagaat tagcttgtga cactgttact tacggtgctc gtcagttgaa gctacttacc
1561 aaagctgagt atcaacgttc tgttgaagac ttagttggta ttgattacaa cgtagcaagc
1621 ggcttagcag aagataacat tattggttac ttcgttaata acaccaccaa agtggttgtg
1681 ccaacggttt acgatcagta tctcacagta gctgaagaaa tcgcgcagtg gtctgctgac
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1801 tttgttaaca acttcgctcc aaaagtattc cgacgcgcgc tttctagcga tgaagctgcg
1861 gcttacttgg cgattgctaa cggcagcgct accaacggtg atgttaaagc gggtattcaa
1921 cttgcgatgg aaggcttgtt ctcttctccg caatttgtat atagacacga gcttggtgaa
1981 gccaatccaa ataacaatgc tatcgactct gacgcgtttg aattaacgtc ttatgaaatg
2041 gctacttggt tgtcttacac ttatgccggt accacaccag atgcaattgc tatgcaaaaa
2101 gctgcaaaca atcagttgcg cacagacgcg gaaattcgcg ccgaagctca acgtttgtta
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2221 cacattgcaa acgcacctaa agatgcttct gtatggcctg gttttgatgc gttaattccg
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2461 attttggcga acggtgcgtt tatggcgcgc tggggtgaaa gtgtagagtc ttcaccaatt
2521 cgtcgttctg tgcgcgtacg ccgtcgtatg ctttgtcagg atcaaccaga tccccctggc
2581 aacgtaaaca tcggtcgtga aaacgctgca gacgaattcc acgaggcgtt ggcagatcct
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2881 ttactgacta ccttgccaag tgcgcagtct tgtttgccac aaaacttgtt ccgttattcc
2941 gtgggcgttg gtgtagaagg gttggatgat aatccagaag gcaacgagct agttcctgca
3001 gaacgggatg gctatgcctg tgaagttaaa aacctgacga gcactatgtt agagcaaagt
3061 ccgcgagcaa tgctggaagg catgggttcc atgcaagcgg tacgttaccg caaagcgtgg
3121 gcgcgttaa
LOCUS NZ_AABI02000007 2802bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_8，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000007 REGION：111940..114741
VERSION NZ_AABI02000007.1 GI：28878295
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2802)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027895.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http//www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2802
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2802
/gene＝″Mdeg1781″
CDS 1..2802
/gene＝″Mdeg1781″
/codon_start＝1
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/protein_id＝″ZP_00066396.1″
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/db_xref＝″COG:COG4625″
/translation＝″MYPLPFNSKIVISLGAMTLALATQQAQALSCTVSADSWNSGYTA
NVTVVNDSSYSINSWDVTLGFNQPPSVSAGWNANVSTVGTTVMASNVGYNGNLSPGQS
TSFGFQGAHNGNFELPSCAGGMTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSSNSSSSSSSSSSSSTSSSSGSGGANTVTIELENLSGQNGFSPFSVQNDSSASGGQY
IVWPNNGDQLLSGASDGQSGTLAVSFELSQTANVSFDIRASLANGNDDSFYYKLDSGV
WSTQNNTSTSGFETLSPTTFNGVSAGVHTLYIQRREDGAKLDSLSLTASVGNIISSHA
NSSSSSSSSGSSSSSSSSSSSGGNELVIAINAGGGATSLDGVNFVADVHSLGGSTGST
TDSIAGATSSTLYQTERYGSYSYAVPVTNATYSLKLHFAEIYHTEAGARSFNLAVEGQ
QEMASVDLYSLSGHDGAYTYEVNDFPVDDGEVTISLESLTDNGTLSGFELSSSDGGEY
VEPTPIPTPEPGEGGRYRVIHTTDMGADPDDEQSLVRQLVMANEYDLEGIITTTGCWK
KSTSNTAYVDRILNAYSQAYPNLSKHAEGFPTPAYLDSINVMGQRGYGMGDVGSGKDS
AGSNLIIAAVDKDDPRPVWATCWGGCNTIAQAVWKVQNTRSQAQLDAFISKLRVYDIL
GQDNAGTWLAKNFPNLIYIRARSVYSWQPSDSYLDNHIQSHGALGAVYPNRRYATEGD
TPAFLHMANPGLNDPSVVSMGGWGGRFPSKQAGVRGMSCMSGEDAVYDTYYMYTENGE
SIKRWSTAIHNDFQARMDWAIESNYSAANHHPVPVVNNDANEAVMYLNASAGSTVSLD
ASGSSDPDGDSLNYSWSHYGEADSYSGSVSISNSSSASANVQIPSNAGGKDIHILLTL
RDNGSPNLYAYRRVVINVQ″
gene 互补链(330..656)
/gene＝″Mdeg1782″
CDS 互补链(330..656)
/gene＝″Mdeg1782″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066397.1″
/db_xref＝″GI:23027972″
/translation＝″MYWPPLALLSFCTLNGEKPFWPLKFSSSIVTVLAPPLPEEELVL
ELDELLLELEELEELEELEELEELEELEELEELEELEELEELEELEEDDEVIPPAQEG
NSKLPL″
ORIGIN
1 atgtatccct tgccatttaa ttcaaagata gttatttcgc ttggtgcaat gacgctcgcg
61 ctggcgacgc agcaagctca ggcgcttagt tgtacggttt cggccgacag ctggaatagc
121 ggttatacgg ccaatgtaac agttgtcaac gatagtagtt acagtattaa tagttgggac
181 gttacgcttg gttttaatca gccgccaagc gtgagcgccg gttggaatgc gaatgtgtct
241 actgttggca ccacagtcat ggccagcaac gtgggttaca atggaaactt gtcgcccggg
301 cagtctacat cctttggttt tcagggggct cacaacggca attttgaatt gccttcttgc
361 gctggaggta tgacttcatc atcctcttct agttcttcta gttcttctag ttcttctagt
421 tcttctagtt cttctagttc ttctagttct tctagttctt ctagttcttc tagttcttct
481 agttcttcta attcttctag ctcgagcagc agctcgtcga gttctagtac cagctcttct
541 tccggcagcg ggggcgctaa tacagtgact attgagctag agaatttgag cggccagaat
601 ggcttttcac catttagcgt gcagaatgac agtagtgcca gtggcggcca gtacatcgtt
661 tggcccaata atggtgacca actgctaagc ggagcctccg atggccaatc tggtactttg
721 gcagtgtcgt ttgaattgtc gcaaacggca aatgtgtcct tcgatataag agcgagcttg
781 gcaaatggca atgatgattc gttttattac aaacttgact ctggtgtttg gagtacccag
841 aacaacactt ctaccagcgg ttttgaaact ctctcgccaa ctacctttaa cggagtgtct
901 gctggtgttc atactcttta tattcagcgc cgagaagatg gagctaagct cgatagtctg
961 agcctgactg cctctgtggg caatattatc agcagccatg ctaatagcag ttctagttct
1021 tcttccagcg gctcaagttc gtctagctct tcttccagtt caagtggtgg taatgagcta
1081 gtaattgcta taaacgctgg gggcggtgcc acatctctag atggtgtgaa ttttgtagct
1141 gatgttcatt cattgggcgg ctccaccggt tccaccaccg acagcatcgc aggcgctact
1201 agcagtactt tgtatcaaac agagcgctac ggcagctaca gctacgctgt tcccgtaact
1261 aatgccactt attcgttaaa gctgcatttt gctgagattt accatactga agcgggggcc
1321 cgctcgttta atcttgctgt ggaaggtcaa caggagatgg ctagtgtaga tctgtattca
1381 ctgtcagggc acgatggtgc ttatacctac gaggtgaatg atttcccggt ggatgatggc
1441 gaggttacga tttcgcttga atcacttacc gataacggca cgcttagtgg tttcgagctt
1501 tcctcctctg acggtggtga atatgtggaa ccaacaccta tacctacgcc agagccgggt
1561 gaaggcggtc gttaccgagt gattcacacc acggatatgg gggcagaccc agacgatgag
1621 cagtcgttgg ttcgccagtt ggtaatggcc aacgagtatg acctagaggg cattattacg
1681 acaacaggtt gttggaaaaa atccaccagt aacacggcct atgttgacag gatcctcaac
1741 gcctacagcc aggcatatcc caatttgagc aagcatgcgg aaggattccc aactccggcg
1801 tatctggatt ccattaatgt gatggggcag cgtggctacg gtatgggtga tgtcggctct
1861 ggcaaagact ctgccgggtc caacctgatt attgctgcag tggataaaga tgatccacgt
1921 cctgtatggg caacttgttg gggtggatgt aatactattg ctcaggcagt gtggaaagtg
1981 caaaacacgc gctcgcaagc gcaattggat gcttttatca gcaagttacg tgtatacgat
2041 attctcgggc aagacaatgc gggcacttgg ctggctaaaa actttccaaa ccttatctac
2101 attcgcgcgc gatctgttta cagctggcaa ccctctgata gttatctgga taatcacatt
2161 cagagtcacg gtgcactggg tgctgtatac ccaaatcgtc gatatgcaac agagggggat
2221 acaccagcat ttctgcatat ggctaatccg ggattgaacg acccatcagt ggtttccatg
2281 gggggctggg gtgggcgttt ccctagcaaa caagctggtg tacgtggtat gtcgtgcatg
2341 agtggtgaag atgccgtcta cgatacctac tacatgtata ctgagaatgg cgaatccatt
2401 aagcggtgga gcactgcaat tcacaacgac tttcaggcac gtatggattg ggccattgag
2461 agtaactatt ctgcagcgaa ccaccaccca gtacccgttg ttaataatga tgctaacgag
2521 gcagtaatgt atctcaatgc gtctgcgggt tcgacagttt cgctggatgc tagcggctcg
2581 agtgacccgg atggagatag ccttaattat tcgtggtctc actacggcga agcggattct
2641 tacagtggtt ccgtgagcat tagtaatagt agttcagcca gcgccaatgt tcagattccg
2701 tcgaatgctg gtgggaagga tatccacatt ttgctaaccc tgcgtgataa cggttcccct
2761 aacctctatg cctaccgccg cgtggttatt aacgtgcaat aa
LOCUS NZ_AABI02000004 1755bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：257640..259394
VERSION NZ_AABI02000004.1 GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1755)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1755
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1755
/gene＝″Mdeg1152″
CDS 1..1755
/gene＝″Mdeg1152″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG0724:RNA-结合蛋白(RRM域)″
/protein_id＝″ZP_00065777.1″
/db_xref＝″GI:23027322″
/db_xref＝″COG:COG0724″
/translation＝″MRCVLVKNYQIIKLKNYSHHVCWRKFMSTQGKPCLKKLWPALAL
AAAVASPNAFSACEYVVSNQWDSGYSATIKIHNDTNSTINGWNVNWQYSGDNRVTNLW
NAAYVGSNPYSASNLSWNSTVGAGQTIEFGFQGAKNGGSAEVPVVTGDVCSGGGSSSG
SSSSSSSSSSTGSSTSSSSSSSSSSSTGGSTSSSSSSSSTGGNGGAQQCNWYGEIRPL
CNNQDSGWGWENQQSCIGRDTCSNQSGNGGIIGGSSSSSSSSSTGSSSSSSSSSSSSS
SSSSSTSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSSSSSSSSSSSTSSSSSSSS
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSGGGVIFSADFESDSDSTQPAGWDNFIGWRQNGPNPNGST
FALVESGRAHSGNNAVHFSGGASPAMIARALPADLDTLYVRAWVYMTRQLGMNPGDNH
ETLIALRGSAGNANNEVRFGEIKGVIGTNEVPSDNIAPTMASWGGGPAYASDTWHCIE
VAFLSQPAYDTVNAWVNDALVHTIDEGSDWNNGALEADWLSNKYVELAFGWHSFSGND
VDVWMDDIVVSTTPIGCD″
gene 互补链(378..572)
/gene＝″Mdeg1153″
CDS 互补链(378..572)
/gene＝″Mdeg1153″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00065778.1″
/db_xref＝″GI:23027323″
/translation＝″MEPPVELLEELLEELLVELPVELLDEELDDEPEELPPPLHTSPV
TTGTSALPPFLAPWKPNSIV″
ORIGIN
1 gtgcggtgtg tattagtaaa aaattatcaa ataataaaat taaaaaatta tagccatcat
61 gtttgctgga gaaagtttat gtcaacccaa ggtaaacctt gtttaaaaaa attgtggccg
121 gcgttagcgc ttgctgctgc tgtagctagt ccgaacgcat tttctgcgtg tgagtatgtt
181 gtatccaatc aatgggattc agggtattcg gcgactatta aaattcataa cgatacaaat
241 tcaaccatta atggttggaa tgtgaattgg caatatagcg gcgataaccg cgtaaccaat
301 ttatggaatg cggcgtatgt aggtagtaac ccatactctg caagtaacct ttcgtggaat
361 agcaccgttg gtgccggtca aactatcgag tttggtttcc agggggccaa aaacggcggc
421 agtgccgaag tgcccgttgt tacgggtgat gtgtgtagtg gtggtggcag ttcttctggt
481 tcatcatcta gctcttcatc gagtagctct acaggtagtt ctacaagcag ttcttcaagt
541 agctcttcaa gtagttccac aggcggttcc acaagcagtt catcaagctc gtcttctacc
601 ggtggcaatg gtggtgcaca gcaatgcaat tggtacggtg aaattcgccc actgtgtaac
661 aatcaagata gcggctgggg ttgggaaaat cagcaaagct gtatcggtcg cgacacctgt
721 tccaaccaaa gtggcaatgg cggtataatt ggcggtagtt cttctagctc gtccagttct
781 tcaaccggtt catcgagcag ctcttcgagt tcttcgtcaa gctcatccag ctcttctagt
841 tcaacgtcaa gctcatccag ctcttctagt tcaacgtctt caagttcttc gtcgagttca
901 tcatctagct cttcaagttc tacaagtagc tcgtcgtctt cgtctagctc atcgagtagt
961 tcttcaagca gttcgacgtc tagcagtagt tcttcatctt cgagctctag cagttcatct
1021 agctcttcaa gcagttcttc tagtagctct tcttcaagtg gtggcggtgt tatttttagc
1081 gcagacttcg aaagcgatag cgatagtaca cagccagcag gttgggataa ttttattggc
1141 tggcgtcaaa acgggccaaa cccaaatggt tcgacatttg cgttggtgga atcaggtcgc
1201 gcacacagtg gtaacaacgc tgtgcacttc agtggtggcg caagcccagc tatgattgct
1261 cgcgctttgc ctgcagattt agatacttta tatgtgcgtg cttgggtgta tatgactcgc
1321 caattgggta tgaaccccgg tgataaccat gaaacgctca tcgccttgcg tggctctgct
1381 ggcaatgcaa acaacgaagt gcgttttggt gaaattaaag gggtaattgg tactaacgaa
1441 gtaccgagcg ataacattgc acctactatg gcaagctggg gtggtggccc tgcctatgca
1501 tcagatactt ggcattgtat cgaagtggca tttttatcgc agccagcgta cgacactgta
1561 aatgcatggg ttaacgacgc gcttgtacat actattgatg aaggctctga ctggaacaat
1621 ggtgccttag aggcggattg gttaagtaat aaatacgtag agctagcctt cggctggcac
1681 agctttagcg gcaacgatgt agatgtatgg atggatgata tcgttgtatc cacaacccca
1741 atcggttgcg actaa
LOCUS NZ_AABI02000004 2367bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：互补链(138007..140373)
VERSION NZ_AABI02000004.1 GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2367)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2367
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2367
/gene＝″Mdeg1069″
CDS 1..2367
/gene＝″Mdeg1069″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00065695.1″
/db_xref＝″GI:23027240″
/translation＝″MFTRITFMLINKARGRLAAAMLATAASAWGSTALAECSYQVTNN
WGSGFTAAIRITNTQTSSINDWQVSWTYENNTLVNAWNANVSGNYTATNMGWNGSLTS
GQSVEFGLQGTTTGGVVEIPLLTGNVCNSNTSSSSSSSTSSASSSSSSSGAAAVNLAG
IANASTSYVSAWETLAAVNDGNTPANSNDKSNGAYGNWNNPNSIQWVQYDWPQNYTLS
STQIYWFDDNGGVLVPDVAYIEYWSNGTWVKVGDVPRQENTFNTLNLNNIVTNRLRVS
ISNTLQSTGILEWRVEGTEPSGSSSSSSSSSSSSSTSSSSGGPEQCDAYVWPEYEPNL
NYDFRQDYADINPEEFEVFLGCDPSQVAGVKTSGWYAFIWGHNRNPAITDEDIDRVLA
NLNEDMAYARGEMGWPPDKLPQEGYYSNVYLYGSGLCTDNAANTERGGWQSSIAGYPM
VLLSYYPVITPSERGGITHEAIHTIMASMGNKAAWFNEGGNTWLQMNMEASRVGDYGV
GFLDGAPFLAPHMPIENYSGWLQDGSFGGPNAEGVHRELNGQQIATWRDYLGGHQYNS
VFSHFLAQYVSSGANAWIWKNGPYNHILASLAAGLGDDQTRHLIMQYRARQAMVDFGP
WTNGFKQPINNNWQRTIGAEETAAGKWMEPEPHQLTFYAATSQEGNTLIPAQNTLPGW
SGANQIPLQVTGNKVRVDFEPFGNNMRLQLAYRAQDGSAVYSQPIESGEACLTLEKTP
KNGVVVAIVSNTDYTYAGDETRKQKYDYRVHIQEGVSGTASLYSKHYE″
ORIGIN
1 atgtttacga ggattacctt tatgttaatt aacaaagcga gaggtcgctt agctgcagca
61 atgttagcca cagcagcctc agcttggggt agcacggctc tagccgagtg cagctatcaa
121 gtcacaaata attggggcag cggatttact gccgccattc gcatcactaa tacccaaacg
181 agtagtatta atgactggca agttagctgg acgtacgaaa ataatacact tgtaaatgct
241 tggaacgcga atgttagcgg caattacacc gctacaaaca tgggctggaa tggctcactt
301 acctcgggcc aatctgtcga gtttggcctg caaggcacca caactggcgg tgtggttgaa
361 atcccccttt taaccggtaa tgtgtgcaac tcaaatacaa gtagtagctc ttctagtagt
421 acaagttcag cctcaagttc aagttcgagt tccggcgctg ccgcagtaaa tctcgctggt
481 atagccaatg cgagcacttc ctatgtttct gcatgggaaa cattggcagc agtgaatgat
541 ggtaacaccc cggccaattc caacgacaag tccaacggag cttacggcaa ctggaacaat
601 ccaaattcga tacagtgggt acagtacgat tggccacaaa actatacgtt atcctcaacg
661 caaatatatt ggtttgatga taatggcggc gtactggtac ccgatgttgc ttacattgaa
721 tattggagca atggcacatg ggtaaaagta ggtgatgtac cgcggcaaga aaatacattt
781 aacacgctaa atttaaacaa tattgttaca aaccgcctac gtgtttctat aagcaacaca
841 ttgcaatcta caggcatact ggagtggcgc gtagagggaa cagagccaag cggcagctca
901 tctagcagca gctcaagctc atcatccagc tcaacgtcta gtagtagtgg cggaccagaa
961 cagtgtgatg cgtatgtgtg gcccgaatac gagccgaatt taaattacga ctttagacag
1021 gactacgcag atataaaccc cgaagaattt gaggtatttt taggttgcga cccaagccaa
1081 gttgcaggtg ttaaaacttc tggctggtac gcgtttattt gggggcataa tcgcaacccc
1141 gcaattaccg atgaagatat agatagagta ttggccaatt taaatgaaga tatggcatac
1201 gctcgcggcg aaatgggctg gccacccgat aagcttcctc aggaaggcta ctacagcaat
1261 gtgtatttgt acggctctgg tttatgtacc gataacgcag ccaataccga gcgaggtggc
1321 tggcaaagta gcattgccgg ctaccccatg gtactgcttt cgtattaccc agtaataaca
1381 cctagcgagc gcggtggtat aacccacgaa gctatccaca ctattatggc ttcgatggga
1441 aacaaagctg catggtttaa cgaaggcggc aacacttggc tacaaatgaa tatggaggca
1501 tctcgcgttg gggattatgg cgttggcttt ttagatggtg cccccttttt agcgccgcac
1561 atgccaatcg aaaattacag tggttggcta caagatggct ccttcggtgg gccgaatgct
1621 gaaggcgtac accgggaatt aaatggtcag caaatagcaa cttggcgaga ttacttaggc
1681 ggccatcaat acaactctgt gttttctcac tttttagcgc aatatgtttc tagcggtgca
1741 aatgcgtgga tatggaaaaa cgggccatat aaccatattc tcgcctcgct agcagcgggc
1801 ttgggcgacg accaaactcg ccacttaatt atgcaatacc gcgcacggca agcaatggtt
1861 gattttggcc cttggacgaa tggatttaaa caaccaatca ataacaattg gcaacgcacc
1921 attggtgcag aagaaaccgc tgctggcaaa tggatggagc ctgaacccca tcaattaacg
1981 ttttatgctg caacaagcca ggaaggtaat actttgatac cagcacaaaa tacattgccg
2041 ggctggtctg gtgccaatca aataccatta caagtaaccg gcaacaaagt gcgtgttgat
2101 tttgaaccat tcggcaacaa tatgcgcttg caattagcct atcgcgcaca agacggttca
2161 gcggtataca gccagcctat agaaagtggc gaagcgtgct taacactaga aaaaacaccc
2221 aaaaatggcg tagtggtggc aattgtatcc aacaccgatt acacctacgc aggggatgaa
2281 actcgcaaac aaaaatacga ttacagagtg catattcaag aaggcgtaag cggtacggca
2341 tcactttata gcaagcacta tgaatag
LOCUS NZ_AABI02000006 2364bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_6，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000006 REGION：67047..69410
VERSION NZ_AABI02000006.1 GI：28878296
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2364)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027577.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2364
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_tyPe＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2364
/gene＝″Mdeg1448″
CDS 1..2364
/gene＝″Mdeg1448″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″COG4880：含C-末端β-螺旋桨结构域的分泌蛋白，该结构域与WD-40重复有远缘关系
(Secreted protein containing C-terminal beta-propeller domain distantly related to WD-40repeats)″
/protein_id＝″ZP_00066068.1″
/db_xref＝″GI:23027630″
/db_xref＝″COG:COG4880″
/translation＝″MLRKLNFILAPLGMVLGVNTYADVSCAVSGSVWNNGYVANVAVT
NAGESLQEGWSVALLFDNTPTINNSWSAELAVDGNVLTASNVAWNANLAAGQSAHFGF
VGSYSGEFELPECFVGALDDDTALEDYLKQGVHNHLNLRIANSASGSSSSSSSSGASS
SSSSSSASSASSTSSGSPVAEPDTQPDDITNTQEDGVDEADIIESDGNHFFVVRSSLY
FTGTSSSTSGSSSSSASSSGSGGYGDYTQGVLIEAYSKDSAAGTTQHVGQVTLPYEEN
YLHVSGAYFRKTPQGNRLAIVSNTRESQPYYWSYGYGYYPYYQISNKVAISVANIDTP
ELMDEAERITFDGDLVSSRRIGSKLYIASRYSPNLNRLGFDFSSSASNEENAQRLDEA
PLADLLPHVYDENGVGTPLVTAADCTVPEWPESVDVYAGSLLVITQIDLDNNLAISSR
CLPASATEIYSSADAIYAFSNAFYAGVKVHKFTLKNDAQESEISYKGSVKLPGFIACS
NQSYCFGEQDGALRVLYRVSNYSDATPYRIAVIKQSPSSAEGLDIIATLPNAERPASI
GKPGEIVYAMRSFGDHAYVVTFDRIDPLYAIDFSNPADPYIAGELEVTGVSDYLHPVG
ENLLLGVGRDAIFDEARNLTWFQGVKVELFDVSDPTNLRSLGSEVIGKRESSTTLSFD
ARGIAFSHDENGIRFAIPVKMHDKPIGPANTDALNQYYSWTHTGLYVYQIETQPNTDA
SLSRLGILKTDIGEASVRYDRGVIDGDAVYYLHNYHMFSSLINYLAQ″
ORIGIN
1 atgttacgga aattaaattt tattttagcg ccgcttggta tggtgttagg cgttaacacc
61 tatgcggatg tgtcgtgcgc tgtttctggc agcgtgtgga acaatggcta tgtagctaat
121 gttgcagtta ctaacgcggg tgaatctctg caagagggtt ggagtgttgc tttgttgttc
181 gataacactc caactataaa caatagttgg agtgcggagc ttgctgtaga cggtaatgtg
241 ctaaccgcga gtaatgtggc ttggaacgct aatttggcag cggggcaatc tgctcatttt
301 ggttttgttg gctcatattc aggtgagttt gaattgcctg aatgtttcgt tggcgcacta
361 gatgatgaca ctgcactcga agattattta aaacagggcg tgcataatca tttaaattta
421 cgcattgcaa attcggcgtc tggttcatct agctcttcga gctcttccgg tgcgtccagt
481 tcttccagtt catccagtgc ttctagcgca tcgagtacat cttctggttc gcccgtggcc
541 gagcccgata ctcagcctga tgatattacc aatacccaag aagatggcgt ggatgaggcg
601 gatataattg aatccgacgg taaccacttc tttgtggtgc gttcttcttt atattttacc
661 ggcactagct catcaacctc tggctctagt tctagttcgg cttcatctag cggttcaggt
721 gggtatggcg attacacaca gggagtgttg attgaagcct acagtaaaga ttcagcagcc
781 ggaacaactc aacatgtggg gcaggtgacg ttgccctatg aagaaaatta tcttcacgtt
841 tctggtgctt actttcgcaa aacaccgcaa ggcaatagat tagctattgt aagtaacacc
901 agagaatcac agccttatta ttggagctat gggtatggtt attaccccta ttatcaaatt
961 tctaataagg tagctatttc tgttgctaat attgataccc ctgaattaat ggacgaggca
1021 gagcgaatta cttttgatgg tgatttagta tcgagcagac gtattggtag caaattatat
1081 attgccagcc gttatagccc gaacctaaat cgtttagggt ttgatttttc tagcagcgcg
1141 agcaatgagg aaaatgcaca gcgtttagat gaagcgcccc ttgcggattt attgccacat
1201 gtttacgacg aaaatggcgt aggtacgcct ttggttactg ctgctgactg caccgtaccg
1261 gagtggccag aaagcgtgga tgtatatgcc gggtcactgt tggttattac tcaaattgac
1321 ttggataata acttagcaat tagctcgcgt tgtttacctg cttcggcaac agaaatatac
1381 agttctgcgg atgcaattta tgctttctcc aatgcatttt atgctggggt aaaagtgcat
1441 aaattcacat taaaaaatga tgcccaagaa agtgaaatta gctataaggg tagtgttaag
1501 ttgccgggtt ttatagcttg cagtaatcaa tcttattgct ttggcgagca agacggggca
1561 ttgcgcgttt tgtatagagt gtccaattac agtgatgcta ctccctatcg tattgcggta
1621 attaagcaat cgccaagctc tgcagaaggt ttagacatta tagctacctt gccaaatgct
1681 gaacgcccag cctctattgg taagccgggc gagattgttt atgccatgcg tagttttggt
1741 gatcacgctt acgtcgttac tttcgataga attgacccgt tatatgctat tgatttctct
1801 aacccagcag acccttacat tgccggtgag cttgaggtta ctggtgtgtc tgattactta
1861 catccagtgg gggagaattt attgttgggc gtgggccgag atgcaatatt cgacgaagcg
1921 cgcaatttaa cttggtttca gggtgttaaa gtggagctgt ttgatgtgag tgaccctaca
1981 aacctgcgca gcttaggcag tgaagtaata ggtaagcgcg agtcgtcaac gacacttagt
2041 tttgatgccc gtggtattgc atttagccat gatgaaaacg gtattcgttt tgctattcct
2101 gtgaaaatgc atgataagcc aattggaccg gcaaataccg atgcgttaaa ccaatattat
2161 agttggaccc atacggggtt gtatgtttac caaatagaaa cgcagccaaa caccgatgct
2221 agtttgtctc gcttaggtat actaaaaact gatatcggcg aggccagtgt gcgctatgat
2281 cgtggcgtaa ttgatggtga tgctgtttac tatttgcata attaccacat gttttcgagc
2341 ttaatcaatt atttggcgca atag
LOCUS NZ_AABI02000040 2046bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_40，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000040 REGION：9019..11064
VERSION NZ_AABI02000040.1 GI：28878262
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2046)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029901.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2046
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2046
/gene＝″Mdeg3624″
CDS 1..2046
/gene＝″Mdeg3624″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00068207.1″
/db_xref＝″GI:23029911″
/translation＝″MRISTAITQFLIVIATLILAACSGSGGGANSGGSNPGASSSSSS
SSSSSNSSSSSTSSSSSSGGSSGAAVSLPSTIAAMDFVAAYDTDNANSGDCGNGPVDM
QTSTDTQGAACTVGWTKAGEWLAYDVSVAVTQKMDIVFRVATNQNSRALKVQLNNKTL
GVLNVSGTAFDEWQTVSLKDIEIPAGTHQLKLVWMTGAINVNTLSFTAHSAYGQTTNL
WGSNGAEHDPSGVLSDWSYAGYHWGEEEPPVKSPTINVVTDHGAIADDDSDDSAAFIA
ALTAANNGDVVYVPEGRFILTQVLSIPNGVVLQGAGSELTTLYIPTNLNEATGIDPSF
TGGFIEMKGSSSDGSKLSTITAAAARGSNQITVESVAGLTVGDWVQIQQTDVNGNFLL
EALYAGYTAGLSDYSNLVNDAELEFFSRITNISGNTLTLERPLPITVSPNYMAELHSV
SVAYGEVGFEGMTLEFPETTYPGHFNELGYNGIDMRAQHSWVRDVVVKNIDYGINLRG
SHFVSILDFTVINTNDRSGHHGISVGSSTDCLIRGFDIQAELVHDLTVEWYAYGNVFT
QGRGKNITLDHHRAAAYANLFTQIDLGEATRAWKTGGRSDRGYKTAVYSTFWNMTAEQ
AIDWPANDFGPRMVFMGLTMDGSHSSVLDWVVEDISADDIYPPNLWLSQREKRLGRQ″
gene 互补链(24..224)
/gene＝″Mdeg3625″
CDS 互补链(24..224)
/gene＝″Mdeg3625″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00068208.1″
/db_xref＝″GI:23029912″
/translation＝″MLGSDTAAPDEPPLEDDELVLLELLLDEEDEELELELAPGLEPP
EFAPPPEPLQAARISVAITIRN″
ORIGIN
1 atgcgtattt ctactgctat cactcaattc ctaattgtaa ttgctacact tattctagct
61 gcctgcagtg gctcgggcgg aggggcgaat tctggtggct ctaatcctgg tgctagttct
121 agctccagtt cttcgtcttc ttcatctaat agcagttcga gtagcactag ttcgtcgtcc
181 tctagtggtg gttcatccgg tgccgcggta tcgctcccaa gcactattgc cgcaatggat
241 tttgtcgcag cttacgatac agacaacgca aattcaggtg attgtggtaa tggccctgtc
301 gatatgcaaa cgtcaaccga tacgcaaggt gcggcctgca cggtaggttg gacaaaagct
361 ggcgagtggt tggcttatga tgtgagtgtt gctgttaccc aaaaaatgga tattgtgttt
421 cgtgttgcta ctaaccaaaa ctcacgtgcc ttaaaagtac agctaaataa caaaacattg
481 ggtgtgttaa atgtttctgg tacagcgttt gatgaatggc aaactgtatc gctaaaagac
541 atagaaattc ctgcaggcac gcatcaatta aaactcgtgt ggatgaccgg ggcaataaac
601 gtcaataccc ttagttttac cgcgcacagc gcctacggcc aaactaccaa tttgtggggc
661 agtaacggtg ccgaacacga cccgagcggc gtgttatctg attggtctta tgctggttat
721 cactggggtg aagaagagcc gccggtaaaa tcgccaacca ttaatgtggt taccgatcac
781 ggtgcgatag ccgatgacga tagcgacgat agcgctgcgt ttattgctgc attaaccgca
841 gcaaataatg gtgatgtagt ttacgtaccc gaggggcgtt ttattcttac gcaggtgcta
901 agcataccga atggtgttgt gttgcagggc gcaggcagcg aattaactac tttatatatt
961 cccaccaact taaatgaagc aacgggtata gatccatctt ttactggtgg gtttattgaa
1021 atgaaaggtt cgtcgagtga cggcagtaaa ctttctacta ttactgcagc ggcggcacga
1081 ggcagtaatc aaataacagt agaaagtgtt gcaggtttaa ccgtaggcga ttgggtgcaa
1141 atacaacaaa ccgatgtgaa cggtaacttt ttattagagg ccttgtatgc agggtacacc
1201 gcaggcttaa gtgattacag taatttggtt aacgatgcag agttagagtt tttcagccgc
1261 ataacaaata ttagtggcaa cacacttacc ctagagcgac cgctacccat taccgtaagc
1321 cctaactata tggcggaatt acacagcgta tcggttgcct acggcgaggt gggtttcgaa
1381 ggaatgactt tagagtttcc agaaacaacc tacccaggtc acttcaatga gttagggtac
1441 aacggcatag atatgcgcgc tcagcactct tgggtgcgag atgttgtagt aaaaaatata
1501 gattatggta ttaatttaag aggctcgcac tttgtaagca ttttagattt tactgtaatt
1561 aacacaaatg atcgcagtgg ccaccacggg ataagtgtgg ggtcgtccac cgattgttta
1621 attcgcggtt tcgatattca agccgaacta gtccacgatt taactgttga atggtatgcg
1681 tatggcaatg tatttacgca agggcgaggc aaaaatatta ccctcgatca tcaccgcgca
1741 gcagcctacg ccaacttatt tacccaaatt gatttaggtg aagcaacacg cgcatggaaa
1801 acaggtggcc gaagcgatcg cggatacaaa accgcggtat acagtacgtt ttggaacatg
1861 accgccgaac aggcgatcga ttggcccgcc aatgatttcg gcccacgtat ggtgtttatg
1921 gggttaacca tggacggcag tcacagctct gttttagatt gggtggtaga agatatttct
1981 gcagatgata tatatccacc aaacctttgg ttgtcgcaaa gagaaaaaag attggggcgg
2041 cagtag
LOCUS NZ_AABI02000007 1965bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_8，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000007 REGION：160746..162710
VERSION NZ_AABI02000007.1 GI：28878295
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1965)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027895.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1965
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1965
/gene＝″Mdeg1805″
CDS 1..1965
/gene＝″Mdeg1805″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066418.1″
/db_xref＝″GI:23027993″
/translation＝″MRFQYALCTDSGGTIKNNQSWVSIMLRIHLAMPNMAFSLLQHYL
LNTFSGVSIWVLCGLLMGAYVNAATQEINGNQLQVTCQSETFCDIHYRLNNGRELNIA
MASLGNGEYAHTISNLISGDVIVYYLTYQQNGLAYDSERLTHIYGGASSSAGADPYLG
FRAPIPGTILAVNYDTGGEGIAFHDATIGNSGGQYRDESVDIESASIGGFNVGWVASG
EWLQYSVDVARAGSFDIVAQIASPNSGGSLHYEITGATNVQSDAVQFANTGGWQVWAH
TAAAKVQLNAGAHTIRLVFESAGFNIHSLLVSEASSSFGKVEAESFDSMSGVVSEATS
VGYFDRGDWMKYSAVSFGNLAKSITLSVAGEYNNGIAELRLDSVSGPVIGTYSMESTG
GWASFKPKSFNIVHTLGVHDLYIVGKNGSGIFNLDYFQLSADVVEETNPATAVKAMSL
NIYGWATMPQNADKYAALIRSRGVDVVGIQEGVEDWLIGPGFPTNYSKADALGAALGA
CWQQRYQIFINICEGNSFVSNRRFDMTDGPNATRTGESARINKNGFEYAVLTVHWDHQ
SGAAKVANAHETAAEVNYYGALPTVVVGDFNTGCTSHEVNTLMHEAGMVLIGNAGIDC
ILAKRFNGTAQTFDAAPSDHPGLDASLSTN″
ORIGIN
1 gtgcgttttc agtatgcgtt gtgcacagac agtggcggta caattaaaaa taatcaaagt
61 tgggtatcta ttatgttgcg aattcatcta gccatgccaa atatggcctt ttcactatta
121 cagcactatc ttttaaacac attttctggg gtatccatat gggtactttg tggtttattg
181 atgggggcat acgttaatgc cgccacacaa gagatcaacg gcaaccagtt acaagtgaca
241 tgccaaagcg aaaccttttg cgatattcat tatcgtttga ataatggcag agaattaaat
301 atagcgatgg cgtcgttagg taatggtgag tacgcacata cgatttctaa tcttatttct
361 ggcgatgtga ttgtttacta ccttacgtac caacaaaacg gtttggccta tgactctgag
421 cgcctgacgc acatatatgg gggggctagc tccagcgctg gcgcagatcc ctatttgggg
481 tttagagcac ctattccagg gactattctc gctgtgaact acgatactgg aggcgaaggc
541 atcgcttttc atgatgccac aataggaaac tctggtggtc aataccgcga cgaaagtgtg
601 gatatagaga gcgcttcgat tggtggcttt aatgtggggt gggttgcttc cggcgagtgg
661 ctgcaatact ccgtggatgt ggcgagagct ggcagtttcg atattgttgc gcaaatcgcc
721 tctcctaatt ctgggggcag ccttcattat gaaattacag gggcaaccaa tgttcaatct
781 gacgcggtgc aatttgcgaa tacaggtggt tggcaggttt gggcacacac agcggctgcg
841 aaggtacagc tgaatgcagg tgctcatacc attcggttag tgtttgaatc agcagggttt
901 aatattcatt ctctgctggt aagcgaagcg agctctagtt tcgggaaagt tgaggcagaa
961 agttttgatt ccatgagtgg cgtagtgtcg gaggcgacaa gcgtaggcta ttttgatcgc
1021 ggtgattgga tgaaatacag cgcggtcagc tttggtaatc ttgccaagag cataacgtta
1081 tccgtcgctg gtgaatacaa taatggtata gcagaactta gattagacag tgtcagtggg
1141 ccggtgattg gcacctactc aatggaatcg acaggtggtt gggctagttt taagccaaag
1201 agttttaata tcgttcatac cttgggagtg catgatcttt atattgttgg taaaaatggc
1261 agtggcattt ttaatttaga ctattttcaa ttatctgcag atgtcgtaga agagaccaac
1321 cctgctacag cggtaaaagc gatgtcgctg aatatatatg ggtgggcaac aatgcctcaa
1381 aatgctgata agtatgcagc gcttattcgt tctcggggtg ttgatgttgt gggtattcaa
1441 gagggggtag aagattggct tattgggccg ggttttccca caaattactc caaagcagat
1501 gctcttggtg ctgccttagg agcttgttgg cagcagcgct atcaaatttt tattaatatt
1561 tgtgaaggaa atagcttcgt gtcgaatcgt cgattcgaca tgaccgatgg gcctaatgca
1621 acgcgcacag gcgagtctgc acgaataaac aaaaatgggt tcgaatacgc agtcttaacg
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1741 gaggttaatt actacggtgc attgcctacc gttgttgtgg gcgatttcaa cactggctgt
1801 acaagccatg aagtaaatac acttatgcat gaagctggaa tggttttgat tggtaacgcc
1861 ggcattgatt gcattttagc taagcgattc aatggtacgg cacaaacatt tgatgctgca
1921 ccatctgatc accctggctt ggatgcgtca ctcagtacca actag
LOCUS NZ_AABI02000003 1653bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_3，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000003 REGION：51474..53126
VERSION NZ_AABI02000003.1 GI：28878299
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1653)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026886.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1653
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1653
/gene＝″Mdeg0757″
CDS 1..1653
/gene＝″Mdeg0757″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00065386.1″
/db_xref＝″GI:23026923″
/translation＝″MKSCCIKFFTTLCTAVYVLGCGALAHAQTGPAGYNYAAAENETV
YLNGTTNVAYGANGSFYYAYNQTGSVNCSNQTFGDPIFGVRKACYTQQVASNNPPSVS
FASPTGNLTVDEGYALSVTVNASDSDGSIASVELFINNQLVRQELYAPYEWGAAAEPD
ELNGLPVGTHTIKAVATDNDGDTKQASFKLTVRGAAVDVPGLVQAEDYTGFYDTTNGN
TGGAYRNDNVDVETTSDSNGGYDVGWFAANEWLEYPINVTEAGNYVLEARVASAVGGG
MFTAEINGNNSSTFSIGNTGGWQNWQTLNNNIGNLSTGKKTLRIQAQSGNFNLNWLRL
KRATTSVCTLNTPAENIPTPFNLFTVIDTDLNRYEFCKASKWFEESNGKQVFKLFTGD
NLADNVPGARVHARTEAGQGLKFKAGSTWHTFEARMKPSKKLDYTYTIAQLFAGCCGP
QLRIEVKSNGRIHMGSRGNGNIRISDDQDYANGSRSFKIKIRTNGDQFEVYFNSSKKF
SGRTDEAKNGNTSALYHFRWGVYSNEVMSEDLSNTVTEIIRN″
ORIGIN
1 atgaaatcat gttgtatcaa gttttttacc acactctgta ctgctgttta tgtactgggt
61 tgtggcgcgt tagcgcatgc gcaaactggc ccggcgggtt ataactacgc tgctgccgaa
121 aacgaaacgg tgtatttaaa cggaaccacc aacgttgcct acggcgcgaa tggctcgttt
181 tattacgctt acaatcaaac cggttcggtt aattgctcta atcaaacctt tggcgaccct
241 atttttgggg tgcgcaaagc gtgttacacc cagcaagtgg cgagcaataa cccgccgtcg
301 gtttcgtttg ctagcccaac gggcaaccta acagtcgacg aaggttatgc tctttctgta
361 accgtgaacg ccagcgatag cgacggcagc attgccagtg tagagctgtt tattaacaac
421 caattagtac gacaagagct ttacgcacct tacgagtggg gcgcagctgc tgagccagac
481 gaattaaatg gcctacccgt tggtacacac acaataaaag cggtagccac cgataacgac
541 ggcgacacca aacaagctag ctttaagcta acggtacgcg gtgcggcggt agatgttcct
601 ggcttggtac aagcggagga ttacacaggc ttttacgaca caaccaatgg caacactggt
661 ggtgcgtatc gcaacgacaa tgtagacgta gaaaccacaa gcgatagtaa cggtggttac
721 gacgtaggtt ggtttgcggc aaacgaatgg ctggaatacc ccattaacgt taccgaagcg
781 ggcaattatg tattagaagc acgcgtcgca tctgctgtag gcggtggtat gtttaccgca
841 gaaataaatg gcaacaacag cagtacattt agcataggca ataccggcgg ctggcaaaat
901 tggcaaaccc tgaataacaa tattggcaat ttaagcaccg gtaaaaaaac gttacgcatt
961 caagcgcaaa gcggaaactt taatttaaac tggctgcgcc tcaagcgtgc cacaacctct
1021 gtgtgcacac ttaatactcc tgccgaaaac attccaacgc catttaattt atttaccgtt
1081 atcgatacag atttaaaccg ctacgaattc tgtaaagcgt ctaaatggtt tgaggaatct
1141 aacggtaaac aagtgtttaa attatttacc ggcgacaacc tagcagataa cgtacctggc
1201 gcccgcgtac atgctcgcac agaagctggc caagggctta agtttaaagc aggctccaca
1261 tggcacacct ttgaagccag aatgaaaccc agcaaaaagt tagactacac ttacaccatt
1321 gctcaattgt ttgccggctg ttgcgggccg cagttgcgca ttgaagtaaa atctaacgga
1381 cgcatccaca tggggtcgcg cggtaacggc aatattcgta ttagtgacga ccaagattac
1441 gccaacggct ctagatcgtt caaaattaaa attcgcacca atggcgatca gttcgaagtg
1501 tattttaaca gcagcaaaaa gttcagcggc cgcacagacg aagccaagaa cggcaatacc
1561 agtgcgcttt accacttccg ctggggtgta tattccaacg aagtaatgag cgaagattta
1621 tctaacactg ttacagaaat tattcgaaat taa
LOCUS NZ_AABI02000037 1503bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_37，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000037 REGION：互补链(7812..9314)
VERSION NZ_AABI02000037.1 GI：28878265
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1503)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029842.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1503
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1503
/gene＝″Mdeg3569″
CDS 1..1503
/gene＝″Mdeg3569″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00068152.1″
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PHGYAQDQCNTTLECKILHGDTATDCKNSRSDNSICMCGSTECAVDNPQPEPSNSAAV
PGLIQAEDFTDYYDVTAANHGGAYRSTGVDIQVTTDTNGGYNVGWIAANEWLEYNINV
LQAGNYTANIRVASNNGVGMYSLAVDGVTVSGTNTVNGTGGWQVWITQTANLGYLTQG
EHTLRIAVQAGNFNINWLELLLAGTQQPDMLGVFNKSRDLLLANFDSRPDPDDIHSVA
ALATMLKDSRFSNVQYHAVSGAYGIQGGDYIEATHLFNLAFGAGNWSNAHTNRDVALT
TVYNKVAATLTNGGDIWVQEAGQSDFSADLVRRIKQQLPAINTQTRIHIVQHSNWNQD
KTTPADLTYVKNQTDYKKIADGNSTGNGTPGFNSSSSANWNRALNHAQVGAIWQEAKR
IADNAIANHQGWQNPNIRDGGMDFSDAVEDCWIFGFNSLTNINSFFDEFL″
ORIGIN
1 atgtttgcta gcaacctcga agaccctact tactatataa aatataaagg tgtttacatg
61 aatactaata ggaaacaagt caaccaaaac ctcatcgcgc tattgggctt aatgttgcta
121 atgctattta cacctcatgg ctatgcgcaa gaccaatgca acaccacgct tgagtgcaaa
181 atactccacg gcgatacagc cacggattgt aaaaatagtc gctcagataa cagtatttgc
241 atgtgtggaa gtactgaatg tgcagtagat aatccacaac ccgaacctag caattccgcc
301 gcagtaccgg gcctaataca agcagaagac tttaccgatt actacgatgt aacggcggct
361 aatcacggcg gcgcttaccg ctccacaggcgt agacattc aagttaccac agacaccaat
421 ggcgggtaca acgtaggctg gatagccgct aatgaatggc tagagtacaa cataaacgta
481 ctgcaagctg gtaactacac cgcgaatatt cgtgttgcat ctaataatgg tgttggcatg
541 tatagcttgg cggtagatgg tgtaacggta agtggcacca acaccgttaa tggcacgggt
601 ggctggcaag tttggattac ccaaaccgca aaccttggct acttaaccca aggcgagcat
661 acgttgcgta tagcagtaca ggctggcaat tttaatatta actggttaga gctgctgcta
721 gcgggtactc agcaaccaga tatgcttggt gtatttaata aaagccgcga cctgttgtta
781 gcaaatttcg atagccgccc agacccagac gatattcatt cagtagcggc cctggcaaca
841 atgctaaaag attcccgttt tagcaatgtg caataccacg cagtatcggg tgcttacggt
901 atacaaggtg gtgattacat tgaagctaca catttgttta acttagcctt tggtgccggt
961 aattggtcca acgcgcacac caatagagat gtggcgctta caactgttta caacaaagtt
1021 gccgcaacgt taaccaatgg tggtgatatt tgggttcaag aggccggtca atccgacttt
1081 agcgccgatt tggtacgcag aatcaaacaa cagttacccg ctattaatac gcaaacgcga
1141 attcatatag tgcagcatag taactggaac caagacaaaa ccactccagc cgatttaacc
1201 tatgtaaaaa accaaaccga ctacaaaaaa attgctgatg gcaattccac aggcaacggc
1261 acgcctgggt ttaactcatc cagcagcgcc aactggaacc gcgcactaaa ccacgcgcaa
1321 gtaggcgcaa tttggcaaga agcaaaacgc atagccgaca atgccatcgc caaccaccaa
1381 ggctggcaaa accccaatat tcgagacggc ggtatggact tctcggatgc agtcgaagac
1441 tgctggatat tcggcttcaa ctcactcaca aatataaaca gcttttttga tgagttttta
1501 tag
LOCUS NZ_AABI02000013 1422bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_12，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000013 REGION：互补链(886..2307)
VERSION NZ_AABI02000013.1 GI：28878289
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1422)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028387.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1422
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..1422
/gene＝″Mdeg2182″
CDS 1..1422
/gene＝″Mdeg2182″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066788.1″
/db_xref＝″GI:23028389″
/translation＝″MQLIQLLKTMGISRLCIFLFGAVLASTMLAGCGGSSSSEKSSGQ
VVTEPESEPESEPESEPESEPESEPESEPESEPDPAPDTAQDMRSEKRGLAYGYHSEN
DLKAMQGKVKWWYNWDTQADANVKENYASYGYDFVPMAWDENFNEEALRSFLDNHPDV
KYLLGWNEPNFMEQANLTPAEAAAHWPVLEAIAQDYNLKLVAPAVNYSPGNVDIPGTD
DDYDPWLYLDAFFEACEGCQVDYIAVHCYMKYESAFSWYVGEFERYNKPIWVTEWAGW
DDGGPANMGEQMNFLSDTVRWMESNDNIYRYSWFLGRSSEGYDQFPYLDVLLADGELT
PLGSVYTSIPSNDFRYKIPARIEAEGAHSLTGFKHLATTDTTGLAKLIAASNEVAEYK
LNVEEGGDYTLALRLASSANSDIAIRVDGLLVYTFEDINTGGVEAWMTFSSTPISLTA
GDHILRVESKSSRFGFNWLELTN″
ORIGIN
1 atgcagttaa ttcagctact aaagacgatg ggtattagtc ggctatgtat ttttttattt
61 ggtgccgtac tcgctagcac aatgctagct ggttgcggtg gttcttcaag ttcagaaaag
121 tcctcaggcc aagtggtgac tgagcccgaa tctgaaccag agtcagaacc agagtcagaa
181 ccagagtcgg agccagaatc tgaaccagag tcggagccag aatccgagcc ggacccagcg
241 cccgacacag cgcaagatat gcgcagcgaa aaacgcggct tagcctatgg ctaccacagt
301 gaaaacgacc tcaaagctat gcagggtaaa gtgaagtggt ggtacaactg ggatacccaa
361 gcggacgcga acgtaaaaga gaattacgcc agttatggct acgattttgt tcctatggcg
421 tgggacgaaa actttaacga agaagcgctg cgcagctttt tagataatca ccccgatgtg
481 aaatacctgc tgggctggaa tgaaccaaac ttcatggaac aggccaacct cacaccagcg
541 gaagccgcag cccattggcc cgtgctagag gccatcgcgc aggattacaa cctaaaatta
601 gtcgcccctg cggtgaacta cagccccggt aatgttgata ttccaggtac cgatgatgat
661 tacgaccctt ggctatacct cgatgccttc tttgaagcgt gtgaaggttg ccaagtagat
721 tacattgccg tgcattgcta tatgaaatac gaaagcgctt tcagttggta tgtgggtgaa
781 tttgagcgct acaacaaacc tatttgggta accgagtggg cagggtggga cgatggcggc
841 ccagcgaata tgggtgagca aatgaacttc ttgtccgata ctgtgcgctg gatggagagc
901 aacgataata tatatcgcta ttcttggttt ttggggcgca gtagtgaagg ctacgatcag
961 ttcccatacc tagatgtttt actggccgat ggcgaactaa caccgttggg tagtgtgtat
1021 acctctattc cgtccaacga ttttcgctac aaaatacccg cgcgtattga ggccgaaggc
1081 gcccatagct taacgggctt caaacactta gccacaaccg atactacagg tttagctaag
1141 ttaatagccg cgtctaacga agtagcagag tacaaattaa acgtggaaga ggggggcgat
1201 tacaccttag ctttacgttt ggcttcatct gcaaacagtg atattgccat ccgtgtggat
1261 ggcttattgg tgtacacctt cgaagatatt aataccggcg gtgttgaggc gtggatgacc
1321 tttagctcaa cccctattag tttaaccgcg ggtgatcaca tattacgtgt agagtctaaa
1381 tcgtcgcgtt ttggctttaa ttggttagag cttactaatt ag
LOCUS NZ_AABI02000003 1398bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_3，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000003 REGION：85570..86967
VERSION NZ_AABI02000003.1 GI：28878299
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1398)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23026886.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1398
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/dbxref＝″类名:203122″
gene 1..1398
/gene＝″Mdeg0792″
CDS 1..1398
/gene＝″Mdeg0792″
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LMNRGLVNDDLSSLQVDAGYRVEMFQHDNFTGNVVTRTGSDDCLVDEGMNDDISSLRI
TRVSGGFSQTIQAENFFANNGVQLENTTDSGGGQNVGWIDANDWMAFSNITIPTTGNY
RIEYRVAGFGGTLSLDLNGGAIVLGQINLPNTNGWQNWQTASHTVHINAGTYNFGIFA
NAPGWNINWFRIVQL″
ORIGIN
1 atgaaattac tctcaatcac tcacacacta aagcgggcaa ttgcgagcgc agtttttgtc
61 gcgtccgctg ctaccgcctc tatagccaat gcagtaacgg tagatattct tgtgctttac
121 gataattatt cggcaaatta ttttggcggc gacccgcaga cggccatgaa cggttgggct
181 aacgatatga actctgcgtt aasagccagc caaattgata tgaagttccg cattgttggt
241 gtgcgtcatc acgaagaaga tggcgcgggc atgggcgacg tacttggtaa tttgcgcgtt
301 gacggtggcg caatagccct gcgcgatcaa cttggtgcag atatggtgtc acaactccac
361 gaaaagggtg cctgtggcgt ggggtatgtt gccgtagata aaaattacac atggaacgtt
421 actcacccag gctgcgggcc aatggtaatg ctgcatgaat ttggccataa catgggggtt
481 actcactcgc gtaaacaggg tgatcaaggt ggtacccgct atcgctatgg cgtaggttat
541 ggtgtgcagg atgttttcgt cgatatcatg gcttacgaag gcgtttttaa caccagccgc
601 gttaatgtat tttctaaccc taacctcaat tgcagaggcc ttccgtgtgg taaacccgtt
661 ggcgattccg aagaagccca cgcttcactc gctattcaca atgtgcgtaa cgaacttgcc
721 aattttcgca ataccgtaaa ttctggtgga ccggttcgat tgtttgaaca ctgttattac
781 acgggttata cagttggctt aggcgaaggt agctatcgct tagccgattt gatgaaccgc
841 ggtttggtaa acgacgattt gtcatcgttg caagttgatg caggctatag agtggaaatg
901 tttcaacacg acaactttac cggcaatgtt gtaacgcgca ccggcagcga cgattgttta
961 gtcgatgaag gcatgaacga cgatataagt tcactgcgta taacacgagt aagtggcggg
1021 tttagtcaaa ctatccaagc agagaatttt ttcgctaaca acggcgtgca actagagaat
1081 acaaccgata gcggtggcgg ccaaaacgta ggttggattg atgctaacga ttggatggct
1141 ttcagcaaca ttaccattcc aaccaccggt aactaccgta tcgaataccg cgttgcaggt
1201 tttggtggca cgctttcgct cgacttaaat ggcggcgcta tagtgctagg ccaaattaat
1261 ttacccaata ccaatggctg gcagaattgg caaaccgcat cgcacactgt acacattaat
1321 gctggcactt ataatttcgg tatttttgct aacgcacccg gctggaatat caattggttc
1381 cgtatagtac agctttaa
LOCUS NZ_AABI02000007 3075bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_8，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000007 REGION：24366..27440
VERSION NZ_AABI02000007.1 GI：28878295
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-3075)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027895.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..3075
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..3075
/gene＝″Mdeg1720″
CDS 1..3075
/gene＝″Mdeg1720″
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GPEVGQGAYIEYAAGLPNINWTGGTVFYYGDKPGGGWLAWRETIVSHTQTRINIDLSK
KNPAWVRTAHDPASGGEFYLMGVKGALDYQNEWYFDSNTRELFVQLPNGARPQNGDIQ
FRKRLQTINLANRSHIHIKNIAVFGGAIEITNNANSNLLSGVSSFYGNATLGVHTGFS
APSYSVKIQGSDNRIENSEIAYGSGTGIYDSGTRSQIVNNYIHDFNTLGDYNAPVNAR
GGSNTLVKNNRISRGGRDTIQAFNRDSEWSYNDVSHSNLIADDCGLFYTVGGPHNVEI
HHNWFHDAYSHGNKNKAAGIYLDNDARGFKVHHNVVWNTEWTGIQINWNGTDIDVFNN
TLWNNSAAMGAWHKAGTAFSDVRVWNNLSNSNKWEEQANKQNNLTGTGDPFVNSQAGD
FRLKANTAPIDYGRTIAGTTEGHSGANPDAGAYEYGATAWKAGVTWDITKGAANRCYQ
LPGEVCFDDTDTGGDIGELPGKVEAENYAHYYDTTPGNIGGAYRNQDVDIQPTTDTLG
GYNVGWINAGEWLEYDIDVTQAGRYDAELRVASKLGAGQVAIAIDGVARGEALTIQST
GDWQNWATLTTQLGYLEAGLHTLRVSAMSGGFNLNWYNFTKQVSFGETAVGFTNTPPT
RIPATRHQSFSVDYVANEPRELFLLFFNPDWSWVASTKTTVEPGKASTTLQLNLPFVP
TAVQAFNVKLENRPIGANWDNPNNVEAHAAVTTQAAPLQHNGGFENGGTSGWNGYGSH
ALSTEAHSGSYAGKVTGGPSAFSQTIPNLTPNTTYSLSAFVKARAGHTGFLGVKEYGG
QETSLIVNSTHYQKKTITFTTGPNAS SAKIYLYVRDNNHVAFIDELVIVKVY″
ORIGIN
1 atgaaaaaac cacctagccg ttacagtacg ctggccataa ccctgtgtat gagtttatcg
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121 tcgtttagca gcccctatca aacgctggcg aaagcggcac aaaccgcaca agctggtgat
181 gtcgtttacc tgcgcgaagg cacctatcag gaaacgcttc gcccagcgaa ttcaggcaca
241 gccagtcacc ccattgtgtt tcaatcctat cagaatgaaa aagtgatcat cagtgcaatg
301 gaagccttaa gcggctggca gcaagacacc tcaaatattt ataaaaccac ggtgaactgg
361 gatctaggcc aagaaaattt tgtgatgcat aaatctacag cactggattt agcccgctgg
421 ccaaacaata ccgatgcaga ccccttcacg ttaaattcta aaagaaacac agggggaagt
481 ggccccgagg taggccaagg tgcttatata gaatacgcag caggattgcc caatattaat
541 tggactgggg gtaccgtatt ttattatggc gataaacccg gtggcggttg gctagcgtgg
601 cgcgagacga ttgtaagcca cactcaaacc cgtataaata tagacctttc taaaaagaat
661 cccgcgtggg tacgcaccgc acacgacccg gcaagcggcg gagaattcta tttaatgggc
721 gtaaaaggtg ctttagatta tcagaacgaa tggtacttcg attcaaatac gcgagagctt
781 tttgtccaac tgcccaacgg cgcgcgccca caaaatggcg atattcaatt tagaaaacgc
841 ctgcagacca ttaacttggc aaatagaagc cacatacaca ttaaaaacat tgctgttttt
901 ggtggcgcta tagaaataac caataacgct aattctaacc tgctttctgg ggtatccagt
961 ttttatggca atgctacgct cggtgtacac accggatttt cggcgccaag ctacagcgta
1021 aaaattcaag gcagcgataa ccgtatagaa aacagtgaaa ttgcctacgg ctccggtact
1081 gggatatacg acagcggcac ccgcagccaa attgtgaata actacattca cgattttaat
1141 acccttggcg actacaacgc gccggttaac gcgcgcggcg gaagtaatac gttagtaaaa
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1261 tggtcgtata acgatgtttc ccacagtaat ttaatagccg atgactgcgg cttgttttac
1321 accgttggcg gaccacacaa tgtggaaatc catcacaact ggtttcacga cgcatattca
1381 cacggcaaca aaaacaaagc cgctggtatt tatttagata acgatgcccg aggttttaaa
1441 gtacaccaca acgtggtgtg gaacaccgag tggacaggca ttcaaataaa ttggaacggc
1501 acggacatag acgtatttaa caacacatta tggaacaaca gtgccgctat gggagcatgg
1561 cacaaagccg ggactgcgtt ttcggatgtt cgagtttgga acaacctctc caacagtaat
1621 aagtgggagg agcaagccaa taagcaaaac aaccttacgg gaacaggcga tccgtttgtg
1681 aacagccaag ccggagattt tagattaaaa gccaatacgg cccctatcga ctatggccgc
1741 actatagcgg gtacaaccga ggggcacagt ggcgccaacc cagatgctgg tgcgtatgaa
1801 tacggcgcaa ccgcttggaa agcaggcgtc acatgggata taaccaaagg cgcagccaac
1861 cgctgctatc aacttcccgg tgaggtttgc tttgatgaca ccgataccgg cggagacatt
1921 ggtgagctac ccggtaaagt agaagccgaa aactacgccc actactacga caccaccccc
1981 ggtaatattg gcggcgccta ccgcaaccaa gatgtagata ttcagcccac caccgataca
2041 ctaggtggct acaacgtagg ctggattaac gctggcgagt ggttagaata cgacatcgat
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2161 caagtagcca tagccataga tggggtcgct agaggcgaag cgttaacgat tcagtcgacg
2221 ggcgattggc aaaattgggc aaccctaaca actcaactag ggtatttaga agcagggcta
2281 catacgctgc gggtatccgc tatgagcggt ggcttcaatc taaattggta taacttcact
2341 aaacaagtaa gctttgggga aaccgccgta ggcttcacca acactcctcc tacacgtata
2401 ccagctacaa ggcatcagag cttttctgtg gattatgttg ccaacgagcc gcgagaactg
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3061 gtgaaagtgt actag
LOCUS NZ_AABI02000009 2739bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_10，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000009 REGION：互补链(131625..134363)
VERSION NZ_AABI02000009.1 GI：28878293
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2739)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23028157.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2739
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2739
/gene＝″Mdeg2055″
CDS 1..2739
/gene＝″Mdeg2055″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00066663.1″
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/translation＝″MKKILFLALGLLISQASFAQQTISSLAEFIALQDGSNQNIKMAP
GTYHISSSSKSLFPGGDWRANVEGNWPGLFKFSGNNNTFDLTGVTFTFDSTILLEMPN
LVHANLMEFGGSGNVWKGLNIQEKPNSKGEYGAFIHTSGGTIAVFTGDNHKVSDFTLK
TRFSRPYGLGSLYGKTGNSSSTLPGVRLSKKTAMFLISLDDSYFENVLIDHSGFGHTL
AFNGVDNVVFNTVEIIAESRSTDDLYANGIGGTDRNGVPFNVLFNGDELIGTNFADAD
YFLNLFDTDNFNQCQNMSGGVQYSPIRKGYQYSLTEDSFRGYYSAGSLGNIEIYNATV
TGSRAGVVMEYASEGMIVDGMTVRGIAGHGVPACDGAWNSANGGEGDASAYGPPSNSV
LKRAKADAAYSTVLEIPNFVDNVTADIEVLDPLNGYNRPSASNALALIKGDDHDIRLW
KRDNQALTRDLVVKVSDADNLLLCNMTKQGVTVASSVTNSTIYSVGSISNSSGSSNTV
VKLSSAADEPAICKALETNEVITDCGDFDAFAGIQAEAYCDMAGVEIESSSDDGGEQV
GYINNNEWIAFNDVDFGNGASGFEARVSSATSGGNIELRLDSQTGALIGTCSVNGTGS
WTTYETVSCDIGGVSGVQDLYLVFTGNSGYLMNVNWFNFTQAATNCSLPWSDSDFSVE
KEIVNYSSGAIDISCASNVEISMNLEGVGAMEDADYLNVYYRVDGGAQQVISENVNAF
SEKTVSVSGINGSSLEIIANVYTSYGAEIYTISDMSVKADSQTAYSLEVVSVLASADD
GNVPANTRDGDLGTRWSANGDSQWITYDLGSSKTVTDVGIAFFRGDQRTAFISIETST
NNSTWQTVYSDEQSSSTTEIQNFDVTDSNARYVRIIGYGNSVNNWNSFTEVEIIGR″
ORIGIN
1 atgaaaaaaa tcctgttttt ggccttaggc cttttaataa gtcaggcttc gtttgcccag
61 cagacgattt caagccttgc cgagtttatt gctcttcaag atggcagcaa tcaaaacata
121 aaaatggccc ccggcaccta tcatatatca tcatcgtcta aatcactgtt ccccggtggg
181 gattggcggg cgaacgtcga aggtaattgg ccgggcctgt ttaagtttag tggcaacaat
241 aatacgtttg acctgaccgg cgttaccttc accttcgact ccacgatctt gttagaaatg
301 cctaatcttg ttcacgcaaa cctcatggag tttgggggtt ccggtaacgt ttggaagggg
361 ctgaatattc aggagaagcc caacagtaag ggcgagtacg gcgcttttat tcatacctct
421 ggcggcacca tcgctgtatt cactggggat aatcacaaag tttctgattt tactttaaag
481 acacgttttt ctcggcccta tggtttaggt tctctctatg gaaaaacggg taactcgtct
541 agcacgctgc ccggcgttcg cctgtccaag aaaacggcca tgtttcttat tagtttagat
601 gatagttact ttgaaaatgt tctgattgat cacagtggct ttggtcatac gcttgccttt
661 aacggtgtcg ataacgtggt attcaatacc gttgaaatca tcgcagaatc tcgctctacc
721 gatgatttgt atgctaacgg cattggcgga acagaccgca atggtgtgcc ttttaacgtc
781 ctctttaatg gcgatgaact cataggaacg aattttgccg atgccgatta ctttcttaac
841 ctgtttgata cggataactt caatcagtgt caaaacatga gcggtggcgt gcaatattcg
901 cccatccgaa aaggttacca atatagcctg actgaagatt cgtttcgcgg gtactacagt
961 gctggttccc ttggcaatat cgagatttat aacgccaccg ttacgggttc aagagcgggc
1021 gtcgtcatgg aatatgcgag cgagggtatg attgtagacg gtatgacggt tagaggtatt
1081 gccgggcatg gcgtgccagc gtgcgacggc gcgtggaatt cagctaacgg tggtgaaggc
1141 gatgcttccg cctatggtcc tccatcaaac agtgtactta agcgtgcgaa agccgatgcc
1201 gcctattcca ctgttttaga aatccccaat tttgtcgata acgtgacggc cgatattgaa
1261 gtgttggacc cgttaaacgg ttacaaccgt ccttcggcat caaacgcttt ggcgcttatt
1321 aaaggtgatg atcacgatat tcgactttgg aaacgtgata accaagcctt aacccgtgac
1381 ttggtggtta aggtgagtga tgcggataat ctattgctct gtaacatgac aaaacaaggc
1441 gtgactgtcg ccagcagcgt gaccaactcc accatttatt ctgttggtag catcagtaat
1501 tcaagtggca gttctaacac ggtggtaaaa ctgtcaagcg cagctgacga gccagcgata
1561 tgtaaagctc ttgagactaa cgaagttata acggattgcg gtgattttga tgcattcgcc
1621 ggtatccaag ccgaagccta ctgcgatatg gctggcgttg aaattgaatc ctccagcgat
1681 gacggtggcg aacaggttgg ttacattaac aacaacgaat ggattgcatt caacgatgtt
1741 gattttggca atggcgcaag cggttttgaa gcgcgcgtta gtagtgctac ctccggtggc
1801 aatattgagc ttcgtttaga cagccaaaca ggcgcgttaa ttggcacgtg ctctgttaat
1861 ggaacgggca gttggacgac ctatgaaacg gtttcttgcg atatcggtgg cgtcagcggc
1921 gtgcaggatt tgtacctcgt gtttaccgga aatagtggct atttaatgaa tgttaattgg
1981 tttaacttca cgcaagctgc aacgaattgt tctctgcctt ggagtgacag tgacttcagc
2041 gttgaaaaag aaatagttaa ctacagttcc ggtgctattg atatttcatg tgcttccaac
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2161 gtttattacc gcgttgatgg cggtgcccaa caagtgatat ctgaaaatgt gaatgcgttt
2221 tctgaaaaaa ccgtatcggt atcaggtatc aatggcagta gcttagaaat tatcgccaat
2281 gtttatacca gctatggcgc agagatttat acgatttctg atatgagtgt taaagctgat
2341 tcgcaaacag cttattctct agaggttgtt tctgtcttag ccagtgcgga cgatggcaat
2401 gtgcctgcca atacccgtga tggcgacctg ggtacacgct ggtcggctaa tggtgattcg
2461 cagtggatta cctatgatct tggcagcagt aaaactgtga ccgatgtggg catcgccttt
2521 tttagaggcg accaacgcac ggcatttatc agcatcgaaa cctcaaccaa taatagtacc
2581 tggcaaaccg tttattctga tgagcagtca agcagcacaa cagagattca aaattttgat
2641 gtgaccgata gcaatgctcg ctatgtaaga attattggct acggaaatag cgtaaataac
2701 tggaacagtt ttacggaggt cgagattatt ggtcgttaa
LOCUS NZ_AABI02000051 1626bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_51，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000051 REGION：互补链(8184..＞9809)
VERSION NZ_AABI02000051.1 GI：28878251
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1626)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23030027.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.j-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1626
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..＞1626
/gene＝″Mdeg3723″
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/gene＝″Mdeg3723″
/codon_start＝1
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PLVDPYTLEFVPLEARVTTPNGNGWRHEYKIASSERTAMTATYEDFSATIKVDLSTGG
KTIVAQHHAGDTGTIMKLYVSDTSESGFFDSVAANGIFDVYVRIRNTSGVEEKKPLGT
IRSGDSFSFHVLNNYGVVKVSAFGKNLETEVEDDSASYLKFGNYLQSQYPQGSKDCGS
HGDSDSFRACYEDIGITEAKITMTNVSYTRITK″
ORIGIN
1 ctcgcgctta gtgcatcttt aacacaggct gcgaccattt ctaactcagg cttcgaaagt
61 ggctttgacg gttggacaga cactgaccct tcggcacttt ctagcgatgc aaataacggc
121 agccgatctg ccaaaattac tggctccgcc ggccgtgtag atcaagacgt tgcggtaacc
181 ccaaacacca actaccagtt aactgcatat gtacttggca gtggacgcgtgggtgttaac
241 accggcactg cagtttatga cgaagccgta aacacaagca gctggagcaa agtaactgtt
301 aactttaact ctggctctgc aaactctgta gaagtgtttg gtaagtacaa tagtggtact
361 ggccgctttg acgatttcag cttagttgag acgggaacac cgactcctac gccaacacct
421 actcctacgc ccacgcctac accagcgggc tgtaacagct taaataccat cgacattagc
481 tctgctaccg atgatggctc tcacgatggt cacggcccac acctagctgt ggacggcgat
541 ttatcagctg attcacgctg gtcttctaaa ggcgacggca aagcgattac tttagactta
601 ggcgccgaag ccacagttcg tcaactaaaa acggcttggt acaaaggtga ctcacgtacc
661 gcttacttcg atgtagaaac gtctaccgat aagagcaact ggtctaccgc tttaagcaac
721 gtgcagtcac aaggtagcac tggccttaaa tcaaacagca ttgacgacgt aacagcgcgt
781 tacgtacgta ttgttggtca cggtaactcg tcgaatactt ggaacagctt gattgaagca
841 caagtattgg gttgtgctgg cactgtaacg ccaacaccta ctcctacgcc tacaccaact
901 ccgaccccaa cgcctactcc tacgccaact ccatctggct caaaaattcc tgaaagcatt
961 acaaacagcg atgtttggga tttggaaggc gagaacccac acccattggt agacccttac
1021 acgttggaat tcgtacctct tgaagcacgc gtaacgactc caaacggtaa cggctggcgc
1081 cacgagtaca aaatcgcttc tagcgagcgt actgcgatga ctgctaccta cgaagatttc
1141 tctgcaacta ttaaagtaga cctatctact ggcggtaaga caattgttgc acagcatcac
1201 gcaggcgaca ctggcaccat catgaaacta tacgtttccg acacaagcga atctggcttt
1261 ttcgatagcg tagcggcaaa cggcattttc gacgtgtatg ttcgtattcg taacaccagc
1321 ggtgttgaag agaagaaacc attgggcaca atccgctctg gcgactcttt cagcttccac
1381 gtacttaaca actacggcgt tgtaaaagta tctgcctttg gtaaaaacct agagacagaa
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1501 caaggtagca aagattgtgg ttcacatggc gactccgatt cgttccgtgc ctgctacgaa
1561 gatataggca ttaccgaagc gaaaatcacc atgactaacg tttcttacac gcgtatcact
1621 aagtaa
LOCUS NZ_AABI02000004 3102bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_4，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000004 REGION：20681..23782
VERSION NZ_AABI02000004.1 GI：28878298
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-3102)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027141.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..3102
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
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/gene＝″Mdeg0984″
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/gene＝″Mdeg0984″
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GYSIWELEVHGTEVTEPPVVEPPTEPGENLAIYGTATASSGNADVAIDNNAGTRWESD
HGIDPSSFTLDLGATYSLNQVVIDWEAANAKVYAIQGSNDGTNFTTLANYSGGEFGTR
TDTLNIAGDYRYVRLLGTERSDGNAWGYSIWEFKVYGGGKTEPPVTEPPVTEPPVVEP
PIFTDLNYQPLFNNTHSPDTAQEWYTKPDGTVVTIASGRARSRHESEDIFYTFPTHYF
EHRTFEIEIHDHTPKGQNLVEVFYHPEYANYVPPGCRSSYSNVWRADFNNNAGMDEKL
QTATPDGKGERWVCRIQRDAHNGDDGILDVGSWMEFELQQFLGLYEGDPNVRGQAVYY
TDTYRFKLGQPGIYIVGDEAMEEKIRAGGRATAPYVKGGDSVPVNEVISVNGDNTLTY
KVMANGKWTQKDNPNGTVVTFPIRDGIEVYDNYVVASGVADWTTYFREALNIQWDTHN
AFMQGRRVFHTRMDTGVHEEVGNPDFPELANIADGLMVKNSCLGCHVNNGRGIAPQNG
ALLDTLVVKVGSGAFDNLGQPQPHSYYGGVLQNLSLDAAVPAEGSVRVTYTAQNGTFN
DGTGYSLQVPTYSLEMNDTNGGAIQHISPRMPQNITGLGLLEALPENEILAWHDPDDS
NGDGISGRANVVTSPETGQQFIGRFGWKASSASLRDFAATALSGDMGVNTSVLPNADC
GAQQTACIQNSGQGVELSDLRLNELVVYLQALGAPSRRPETVDQPMVVAGEQRFTDIG
CASCHRPEMNTGHKHDLAELRGNVIRPYTDMLLHDMGPGLAD SLTQAPELNREWRTAP
LWGLGMNLAVNGHDNLLHDGRARSIEEAILWHGGEAQASNNAYKALSAQQRAELIAFL
RSL″
ORIGIN
1 gtgggagaag cacctgtgaa aaaacaagct tatacaacta caccagttaa accaaatgcg
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LOCUS NZ_AABI02000005 1674bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_5，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000005 REGION：互补链(228218..229891)
VERSION NZ_ AABI02000005.1 GI：28878297
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-1674)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027361.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..1674
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
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/gene＝″Mdeg1383″
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/gene＝″Mdeg1383″
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/protein_id＝″ZP_00066007.1″
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VNGVCYCNSSNYDHGLSAKTAPTPIGELNVVDICTDIKAVLGEGATNGRIPFNDIQCG
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ISSNGSDWGVPVVTGAGNGSTTTIELDTVTTRYLRILQTGSSSNRWWSIHEFNIFNSG
PIPPEPEYPALDRSDWTVSASVNGAEAEFAIDSSPNTRWDTAQSQRAGQSFEVDLGEL
NTLAAIELDSAGSANDYPRGYAVYVSNDGSNWGSAIASGAAVSASTTIEFTPVSARFV
KIEQTGGDGHYWWSIHNLNIFGEPSDNPQPTIELLDSTPWSLAANRRNSAAGNAIDNN
QSTRWTTGQTQRDGQTFEIDLSTVQTFSRIVLDSAASDDDHPRNYELYVSNDGSNWGS
PVATGAGDSSGVTVIDFPSVTARYVLIAQAGSDSSHWWSIHELSIYNVQ″
ORIGIN
1 atgctacaca tctctgttca accaaatctt acccgctcta tttctgggtt cttgttgggc
61 ctagcgggcg ttgtctcggg ctcggcttac gcgcagtgga acccagcacc caactgggag
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541 caatcgccag gtcagtattt tgatattgat tttcaagacg cgctaacttt cgattcaata
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1441 gttttagatt ccgcagcgag tgacgatgat caccctcgca attatgaact ttatgtctct
1501 aacgatggtt ctaattgggg cagcccagtg gcaaccggtg caggagatag tagcggagta
1561 acggtaatag atttccccag cgtgaccgct cgctatgtac ttatagctca ggctggctcg
1621 gatagctcac actggtggtc cattcacgag ttgagtattt acaacgtaca ataa
LOCUS NZ_AABI02000025 2025bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_25，全基因组鸟枪测序序列.
ACCESSION NZ_AABI02000025 REGION：互补链(50063..52087)
VERSION NZ_AABI02000025.1 GI：28878277
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2025)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23029437.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2025
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2025
/gene＝″Mdeg3228″
CDS 1..2025
/gene＝″Mdeg3228″
/codon_start＝1
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/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00067813.1″
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/translation＝″MKIIRLLVLCLGVVSSVVAVASSSEPHDEGNALESALWDTLTIP
VCWENPEAFPVEEQAWVRKAVERTWEQESLVRFTGWGECGANDDGIRILVDDVGPHVK
QLGSRLDGYVNGMVLNHTFQNWGTSCSYRRQYCAEVIAVHEFGHALGFAHEQNRDDTD
DMCAAEAQGTDGDIYVGAWDLDSVLNYCNPEWNGAGNLSDTDIEMVQLFYGQPIETSG
NEPVAICSVSASSSDGNIAENTLDGDYATRWSANGDGEWIQFNLCESQVADRVELAWY
KGDTRSSTFSIEYITTDGYVWYTTPVRRYSSGASLGLESASFTAAEIQSLRITGYGNS
SNTWNSITEAVIYTPSAGLDYPNLVAPTDVAATVTGQSQITISWADTNSEEESYFVEA
RIGGNDFFAIGLTEANATSYTHTDLIAEGLYEYRVTAVSGIIRSNFAAASVYFQPAGG
SQANLVRPENFTVTANAQGQIALSWVDVSEGEEGYTLEYKLSSEAEFTVIELAANADS
AIVSDLAAGSYYFRVSSYFGNNASEYSELLVTVFASEATIVPVDVYASSDDGNVASNV
FDNDYSTRWSAFGVGENLTIALGDNYLVTDMRIAWYKGDQRQTRFQVEVSDDNQTWVQ
VFDGINSGESLSLETTFGGDYRASYIRIIGLGNEFNNWNSITEVSIKGHL″
ORIGIN
1 gtgaaaatca tacggttgct tgttttgtgt ttgggggtag taagttctgt ggttgcggta
61 gctagtagct cagagccaca tgatgaaggt aatgcattag agagtgcatt gtgggatacg
121 ttaactattc ctgtgtgctg ggagaatcca gaggcttttc ctgtagaaga gcaagcttgg
181 gtaagaaaag cggttgagcg tacttgggag caggagtcat tagtccgctt caccggttgg
241 ggcgagtgtg gggcgaacga tgatgggata cgtattttag tggatgatgt tgggccgcat
301 gttaagcagc taggctcgcg tttggatggc tatgttaatg gcatggtact aaaccataca
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781 aatttgtgtg aaagccaagt cgcggatcgt gtcgagttag cttggtataa gggagatact
841 cgctcaagta ccttctctat tgagtatata actaccgatg gttacgtttg gtataccacg
901 cctgttcgtc gatattcttc cggtgcttcg ctaggcttgg aatctgcgtc atttactgca
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1021 attaccgaag cggtaattta tactccaagc gctgggctag attaccctaa cttagttgca
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1261 ggcctttacg agtatcgtgt aactgccgta agcggcatta ttcgctcaaa ctttgcagct
1321 gcaagtgtat attttcaacc tgcaggcggc tcgcaggcta atcttgtgcg cccagaaaac
1381 ttcactgtaa cagctaatgc gcaagggcaa atagcactaa gttgggtgga tgtaagtgaa
1441 ggcgaagagg gttatacctt agagtataag cttagtagtg aagctgaatt tactgtaatt
1501 gagctagctg cgaatgccga ttctgcaatt gttagcgatt tggctgcggg tagttactat
1561 tttcgtgtaa gcagttattt cggcaacaat gcttctgaat acagcgagct tttggttact
1621 gtgtttgcat cagaagcgac tattgtgccg gttgatgttt atgcatctag tgatgatggc
1681 aatgtggcaa gcaatgtttt tgataatgat tactctacgc gatggtcggc ttttggtgta
1741 ggtgagaatt taaccattgc gctgggggat aattatctcg ttaccgatat gcgcatagcg
1801 tggtacaaag gtgatcaacg tcaaacccgc tttcaggtag aggtgagtga tgataaccaa
1861 acctgggtgc aagtgtttga tgggattaac tcgggtgagt cgttaagttt agagacgacg
1921 tttggcggtg attatcgcgc aagctatatt cgaattatcg gtttgggtaa tgagtttaat
1981 aactggaaca gtattactga ggtaagcatt aaagggcacc tctag
LOCUS NZ_AABI02000005 2457bp DNA 线性BCT 23-SEP-2003
DEFINITION Microbulbifer degradans 2-40Mdeg_5，全基因组鸟枪测序序列
ACCESSION NZ_AABI02000005 REGION：互补链(73784..76240)
VERSION NZ_AABI02000005.1 GI：28878297
KEYWORDS WGS.
SOURCE Microbulbifer degradans 2-40
ORGANISM Microbulbifer degradans 2-40
细菌，变形菌门，γ-亚纲，异单胞菌科，产微球茎菌属
REFERENCE 1(碱基1-2457)
AUTHORS NCBI微生物基因组注解计划
TITLE 直接提交
JOURNAL 2004年6月17日提交至National Center for Biotechnology
Information，NIH，Bethesda，MD 20894，USA
COMMENT 2003年3月7日该序列取代gi：23027361.
利用GeneMark程序(M.Borodovsky惠赠)预测编码蛋白的基因。
根据CDD(保守域数据库)和COG(直系同源簇)命名进行功能注解，
该注解目前还没有进行人工评审。
通过BLAST可以从以下网址得到DAN序列和预测蛋白
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/genom_table.cgi.
URL--http://www.jgi.doe.gov
联系人：Paul Richardson
microbes@cuba.jgi-psf.org.
COG分类在2003年9月23日自动更新
FEATURES 位置/限定词
source 1..2457
/organism＝″Microbulbifer degradans 2-40″
/mol_type＝″基因组DNA″
/strain＝″2-40″
/db_xref＝″类名:203122″
gene 1..2457
/gene＝″Mdeg1249″
CDS 1..2457
/gene＝″Mdeg1249″
/codon_start＝1
/transl_table＝11
/product＝″假设蛋白″
/protein_id＝″ZP_00065873.1″
/db_xref＝″GI:23027427″
/translation＝″MIKLSHLKHCRKFCISLLCALGMANAHAALNVTASADDGNVPAN
TLDDNIDTRWSANGSGQWIEYDLGATHTVDAVQIAFFRGDVRDATIDIQVSNDGGNWQ
TLFSGTPPTRTLAQQHFELDDTSARYVRIVGYGNSQNNWNSITEFDVVTLASGENIAL
GKATSQSSTGYEGVSSRAVDGNTNGNWNQGSITHTNNEYQPWWQVDLGSVRSIDQVNL
WNRTNCCSSRLSAFYVLVSDVPFTSQTLSGALSQAGVSAYYFNDTAGSPTEINIDRTG
RYVRVQLSGTNPLSLAEVEVIEGSEIVPPAPTGPDASWTYCAAEREQCAFSNIKEVAY
GAGDSWNYSVELDGVTCNNTNLGDPVRGTVKSCWVRNAQQNYVAVRNLAELQNAISNS
NQHIRMKRGVYEATALMSDNTTVFRFDGANNVLDFTGVTIQVPTKLLNSMSTQPIHSQ
VTYDVMGDNITFLNGTFENTYPNGQHDVTDFTAHNKNPDYWPARQMTEFRVWGNGVQF
LNNTITVRGSYPYGYGDMLGKGAGSAVYLRKHAGVQISGDNVLIDGMKLTVLAFGHGI
FMQGADNTVIKNSVVQGRMRLGADMYNDGPDSLMGPFNFEQQYPDHFVGLPIVRDLMY
NLTEDGIRAYTQGTKLDGSVVRTGAITVEDTKVINMRGCITTPLASKPSYIKNVEIQG
CSVGYALANNSDVINSRGDAGYGPLLHSTYDTRNNANVEITVTNIPSTGSHAFAYIAG
SGHNITFLSDGSNPDVPREIRVGDTGDRWAGDPSYQDAANILLINETNQPVVLTETSR
NITGESVGEVTDNGTGNSLK″
ORIGIN
1 atgataaaac tatctcacct caaacactgc aggaaatttt gtatttcttt gctttgcgcg
61 ctgggcatgg ctaatgctca cgccgcatta aatgtaactg catctgcgga tgacggcaat
121 gtgcccgcga ataccttaga tgacaatata gatacgcgct ggtcggcgaa tggatctggg
181 cagtggattg aatatgattt gggcgcgaca cacactgtgg atgctgtgca aatagcattt
241 tttcgcggag atgtgcgcga tgcaaccatc gacattcaag tgtcgaacga tggcggcaat
301 tggcaaacac ttttttcggg tacgccacca acccgaacct tagcgcagca acattttgag
361 ttggatgata cttctgcgcg ctatgtgcgt attgtaggtt atggtaacag ccaaaataat
421 tggaacagta ttaccgagtt cgatgtggtt acgcttgcaa gtggagaaaa tattgctctt
481 ggtaaagcta catcccaatc atccactggc tatgagggtg tatctagccg tgcggtagat
541 ggcaacacca atggtaactg gaatcaaggc tcgattaccc acaccaataa cgagtatcaa
601 ccttggtggc aagtggatct aggctcagtt agatctatcg accaagttaa cttgtggaat
661 cgtaccaact gctgcagctc gcgtttatcg gcgttttatg tgttggtgtc cgatgtgccc
721 tttacatcgc aaaccttaag cggtgcgctt agtcaagcgg gtgtaagtgc ttattatttt
781 aatgatactg cgggcagccc aaccgaaata aatatagatc gcacaggtcg ctatgtgcgt
841 gtacaacttt ctggcacaaa cccattaagc ctagcggaag ttgaagttat tgaaggcagc
901 gaaattgttc caccagcacc aaccggccca gatgcatcat ggacttattg tgccgccgag
961 cgcgagcaat gtgcattttc taatataaaa gaagtggcct acggcgctgg cgatagctgg
1021 aactactctg tcgagctaga cggcgtaact tgtaataata ctaacttggg tgaccccgtt
1081 cgcggcacgg ttaaatcgtg ctgggtacgc aacgcacaac aaaattatgt ggcggtgcga
1141 aaccttgctg aattgcaaaa tgctatttcc aatagcaatc aacacattcg catgaagcgc
1201 ggtgtgtatg aagctacagc gttaatgtct gataacacca ccgtatttcg attcgacggt
1261 gcgaataatg tattggattt taccggtgta accattcagg tacccactaa actcttaaac
1321 agtatgagta cccagcctat tcactcgcaa gtaacctacg atgtgatggg cgataacatt
1381 acttttttaa acggtacttt cgaaaatacc tatccgaatg gccagcacga tgtaacagat
1441 tttaccgccc ataataaaaa cccagactat tggcccgcgc gtcaaatgac ggagtttaga
1501 gtgtggggga acggcgtaca gtttttaaat aacaccatta ctgtgcgcgg ttcatacccg
1561 tatggctacg gtgatatgtt aggtaagggc gccggttctg cagtgtattt acgcaaacat
1621 gctggtgtac aaatttctgg cgacaatgta ttaattgacg gcatgaaatt aaccgtactt
1681 gcattcggcc acggcatttt tatgcagggt gcagataaca cagtaattaa aaactctgtt
1741 gtacaagggc gtatgcgctt aggcgccgat atgtataacg acgggccaga ctccttaatg
1801 gggccgttta attttgagca gcaataccca gatcactttg tgggcctgcc aattgtgcgc
1861 gacctaatgt acaaccttac cgaagatggc atacgcgctt atacacaagg caccaaatta
1921 gatggtagtg tggtgcgtac tggtgcaatt actgtagaag acaccaaagt aattaatatg
1981 cgcggttgta ttactacgcc attggcttct aagccaagtt atataaaaaa tgtagaaatt
2041 caaggttgta gtgtgggtta cgcgctggcg aataatagcg atgtaatcaa ttcgcgcggt
2101 gatgcaggct acggtccgct attgcactct acgtacgata cgcgcaacaa cgccaatgtc
2161 gaaataaccg ttaccaatat tccatctacc ggctcacacg cttttgcgta tattgcaggc
2221 tctggtcata acattacctt cctaagtgat ggcagcaacc cagatgtgcc gcgcgaaata
2281 cgcgtaggcg atactggcga ccgctgggct ggcgacccaa gctatcaaga tgcagcaaat
2341 atattactca taaacgaaac caaccaaccg gtggtgttaa ctgaaaccag tagaaatatt
2401 actggtgaaa gtgtgggtga ggtgactgat aatgggacgg gaaatagctt gaaatag