脑炎病毒蛋白及其编码基因与应用.pdf

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摘要
申请专利号:

CN201010506163.9

申请日:

2010.10.09

公开号:

CN101967185A

公开日:

2011.02.09

当前法律状态:

授权

有效性:

有权

法律详情:

授权|||实质审查的生效IPC(主分类):C07K 14/18申请日:20101009|||公开

IPC分类号:

C07K14/18; C12N15/40; C12N15/63; C12N5/10; C12N1/15; C12N1/19; C12N1/21; C12N7/01; A61K39/39; A61K39/12; A61K48/00; A61P25/00; A61P31/14

主分类号:

C07K14/18

申请人:

中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所

发明人:

常国辉; 林磊; 吴晓燕; 柳洪涛; 李靖; 户义; 罗彦军; 张雨; 孙伟; 康晓平; 杨银辉; 祝庆余

地址:

100071 北京市丰台区东大街20号军医科院微生物流行病研究所

优先权:

专利代理机构:

北京纪凯知识产权代理有限公司 11245

代理人:

关畅;任凤华

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内容摘要

本发明公开了一种脑炎病毒蛋白及其编码基因与应用。本发明提供的蛋白是如下1)或2)的蛋白:1)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白;2)将序列2的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由1)衍生的蛋白。本发明的实验证明,本发明获得的重组腺病毒vAd-E2E3有希望成为脑炎基因工程疫苗的候选疫苗。

权利要求书

1: 一种蛋白, 是如下 1) 或 2) 的蛋白 : 1) 由序列表中序列 2 所示的氨基酸序列组成的蛋白 ; 2) 将序列 2 的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和 / 或缺失和 / 或添加且 具有相同功能的由 1) 衍生的蛋白。
2: 权利要求 1 所述蛋白的编码基因。
3: 根据权利要求 1 或 2 所述编码基因, 其特征在于 : 所述编码基因为如下 1)、 2) 或 3) 或 4) 所示的基因 : 1) 序列表中序列 1 所示的 DNA 分子 ; 2) 序列表中序列 1 自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸所示的 DNA 分子 ; 3) 在严格条件下与 1) 或 2) 限定的 DNA 分子杂交且具有相同功能的 DNA 分子 ; 4) 与 1) 或 2) 限定的 DNA 序列至少具有 90%同源性且具有相同功能的 DNA 分子。
4: 含有权利要求 2 或 3 所述编码基因的重组载体、 转基因细胞系、 重组菌、 表达盒或重 组病毒。
5: 根据权利要求 4 所述的重组载体, 其特征在于 : 所述重组载体为 pAdeasy-1 和 重组穿梭质粒经过同源重组得到的 ; 所述重组穿梭质粒是将所述编码基因插入到载体 pShuttle-CMV 的多克隆位点间得到的质粒。
6: 根据权利要求 4 所述的重组病毒, 其特征在于 : 所述重组病毒为重组腺病毒 ; 所述重组腺病毒为将所述重组载体转入宿主细胞后, 得 到的重组腺病毒。
7: 根据权利要求 4 或 6 所述的重组病毒, 其特征在于 : 所述宿主细胞为真核细胞, 优选 为离体的哺乳动物细胞, 尤其优选为 HEK-293 细胞。
8: 一种疫苗, 它的活性成分为如下任意一种 : 1) 权利要求 1 所述的蛋白质 ; 2) 权利要求 2 或 3 所述编码基因 ; 3) 权利要求 4 或 6 或 7 所述重组腺病毒。
9: 权利要求 4 或 6 或 7 所述重组腺病毒在制备疫苗中的应用, 所述疫苗为脑炎病毒疫 苗。
10: 权利要求 4 或 6 或 7 所述重组腺病毒在制备提高 IFN-γ 活性的增强剂中的应用。

说明书


脑炎病毒蛋白及其编码基因与应用

    【技术领域】
     本发明涉及一种脑炎病毒蛋白及其编码基因与应用。背景技术 脑炎是由病毒直接侵犯或由病毒或其他异种蛋白引发的超敏反应所致的大脑急 性炎症性疾病。脑炎可以是病毒性感染原发的临床表现, 或者是继发的临床表现, 引起原 发的脑炎的病毒有脊髓灰质炎病毒, 埃可病毒、 柯萨奇病毒等流行性病毒, 或散发性的通过 蚊子、 蜱等节肢动物传播的黄病毒属的森林脑炎和批膜病毒科甲病毒属的东方马脑炎病毒 等。
     甲病毒为披膜病毒科 (Togaviridae) 甲病毒属 (Alphavirus) 成员, 以蚊蜱等吸血 昆虫为传播媒介, 可引起多种人畜共患传染病。 近年来, 国外已对多株甲病毒部分或全部序 列测序。国内对这类病毒的分子生物学研究亦取得一定的结果。已有的研究结果表明 : 该 病毒属中和抗体决定簇主要集中在结构蛋白 E1 和 E2 等糖蛋白上, 其中 E2 蛋白上所占比例 更高。加之近年来腺病毒载体因具有安全性好、 宿主范围广、 感染效率高等多种优点, 被广 泛用于基因治疗和基因工程疫苗研究, 为此我们分析比较了多株甲病毒核苷酸序列, 人工 合成了同源性较高的 3kb 的核苷酸, 利用腺病毒载体构建重组基因工程疫苗, 为预防和治 疗疾病奠定了基础。
     发明内容
     本发明的一个目的是提供一种与脑炎病毒疫苗相关蛋白及其编码基因。
     本发明提供的蛋白 E2E3, 人工合成, 是如下 1) 或 2) 的蛋白 :
     1) 由序列表中序列 2 所示的氨基酸序列组成的蛋白 ;
     2) 将序列 2 的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和 / 或缺失和 / 或添 加且具有相同功能的由 1) 衍生的蛋白质。
     序列表中的序列 2 由 529 个氨基酸残基组成, 所述一个或几个氨基酸残基的取代 和 / 或缺失和 / 或添加为不超过 10 个氨基酸残基的取代和 / 或缺失和 / 或添加。
     上述蛋白质 E2E3 的编码基因也是本发明保护的范围, 所述编码基因为如下 1)-4) 中任一所示的基因 :
     1) 序列表中序列 1 所示的 DNA 分子 ;
     2) 序列表中序列 1 自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸所示的 DNA 分子 ;
     3) 在严格条件下与 1) 或 2) 限定的 DNA 分子杂交且具有相同功能的 DNA 分子 ;
     4) 与 1) 或 2) 限定的 DNA 序列至少具有 90%同源性且具有相同功能的 DNA 分子。
     含有上述编码基因的重组载体、 转基因细胞系、 重组菌、 表达盒或重组病毒也是本 发明保护的范围。
     所述重组载体为 pAdeasy-1 和重组穿梭质粒经过同源重组得到的 ; 所述重组穿梭 质粒是在载体 pShuttle-CMV 的 KpNI 和 HindIII 酶切位点间插入所述编码基因得到的。所述重组病毒为重组腺病毒 ; 所述重组腺病毒为将上述蛋白的编码基因转染宿主 细胞获得的重组腺病毒。
     所述宿主细胞为真核细胞, 优选为离体的哺乳动物细胞, 尤其优选为 HEK-293 细 胞。
     本发明的另一个目的是提供一种疫苗。
     本发明提供的疫苗, 其活性成分为如下任意一种 :
     1) 所述的蛋白 ; 2) 所述编码基因 ; 3) 所述重组腺病毒。
     上述重组腺病毒在制备疫苗中的应用也是本发明保护的范围。
     所述疫苗为脑炎病毒疫苗。
     上述重组腺病毒在制备提高 IFN-γ 活性的增强剂中的应用也是本发明保护的范 围。
     本发明的实验证明, 人工合成 E2E3 通过转染 HEK-293 细胞而组装成携带有目标 抗原基因的重组腺病毒 vAd-E2E3。重组腺病毒 vAd-E2E3 感染 293 细胞能有效表达目的蛋 白; 通过滴鼻途径接种 BalB/C 小鼠, 利用间接免疫荧光技术检测特异性抗体水平, 结果表 明, 所构建的重组腺病毒虽然产生特异性抗体的时间和维持的水平有所不同, 但均产生了 较好体液免疫反应, 为进一步开展免疫保护实验提供了重要的数据支持。由于病毒在机体 内极微量的蛋白表达即可激起免疫反应, 因此构建的携带有脑炎病毒结构基因的重组腺病 毒 vAd-E2E3, 有希望成为脑炎基因工程疫苗的候选疫苗株。 附图说明
     图 1 为 pAd-E2E3 酶切鉴定图 图 2 为重组质粒 Pac I 酶切和 PCR 鉴定具体实施方式
     下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明, 均为常规方法。
     下述实施例中所用的材料、 试剂等, 如无特殊说明, 均可从商业途径得到。
     东部马脑炎病毒 (Eastern Equine Encephalomyelitis virus)(HE Jing ; CHANG GuoHui ; WU Jin Song ; LI ZhongDuo ; ZHU QingYu : Cloning and expression of E2 gene of eastern equine encephalomyelitis virus.Bulletin of The Academy of Military Medical Sciences.2002.02. 公众可从中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究 所获得。)
     HEK-293 细胞 (Invitrogen 公司产品, Cat.No.R750-07) ; 实验所需限制性内切 酶分别购自 TaKaRa 和 Biolabs 公司 ; 脂质体 Lipofectamin 2000 购自 Invitrogen 公司 ; Platinum pfx Taqase 购自 Invitrogen 公司。
     实施例 1、 重组腺病毒 (vAd-E2E3) 的获得
     1、 含有目的基因 pAdtrack-E2E3 的构建及鉴定
     根据东部马脑炎病毒 (Eastern Equine Encephalomyelitis virus)(NC-001547) 的基因组序列, 突变序列中的多个位点, 设计出序列表中的序列 1, 人工合成出序列 1。
     设计引物扩增编码 E2E3 蛋白的基因, 引物序列 ( 引物分别含有 KpNI 和 HindIII酶切位点 ) 见下 :
     E2E3-F : 5’ -ACGGggtaccATGTCACTAGTGACCACCATGTGTCT-3’
     E2E3-R : 5’ -ACCCaagcttACTAAAAAAGGCACGACACAG-3’
     以人工合成出序列 1 的 DNA 为模板, 利用 E2E3-F 和 E2E3-R 引物对进行 PCR 反应, 得到的 PCR 产物经 1%的琼脂糖凝胶电泳鉴定, 得到了预期大小一致的片段, 约为 1.5Kb。
     经测序, 该 PCR 产物具有序列表中的序列 1 自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸, 将该 PCR 产物的基因命名 E2E3, 其 OFR 为序列 1 的自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸, 该基因编码的 蛋白命名为 E2E3, 该蛋白的氨基酸序列为序列表中的序列 2, 序列 2 由 529 个氨基酸残基组 成。
     回收 PCR 产物, 对 PCR 产物进行加 “A” 处理, 处理后的 PCR 样品与 pMD-18T 载体 (TaKaRa 公司产品, Code : D101A.Lot CK3201A) 相连, 转化 DH5a 感受态细胞, 挑取阳性菌落 提取质粒后测序验证, 结果为该质粒为将序列表中序列 1 的自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸 插入 pMD-18T 得到的, 命名为 pTE2E3。
     用 KpNI 和 HindIII 双 酶 切 重 组 质 粒 pTE2E3 和 质 粒 pShuttle-CMV(Invitrogen 公司产品, Catalog#240007), 酶切产物分别用凝胶回收试剂盒切胶回收, 并在 T4DNA 连 接酶作用下于 16 ℃连接过夜, 连接产物转化大肠杆菌 DH10B(Invitrogen 公司产品, Cat. No.18290-015) 后挑选阳性克隆, 提取质粒进行测序, 结果为该质粒为将序列表中序列 1 的 自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸插入 pShuttle-CMV 的 KpnI 和 HindIII 酶切位点间得到的载 体, 命名为 pAdtrack-E2E3。
     2、 重组腺病毒载体的构建
     菌 BJ5183 购自上海杰美基因医药科技有限公司, 货号为 : GMS12223.2。
     将腺病毒骨架质粒 pAdeasy-1(Invitrogen 公司产品, Catalog#240005, 含有 GFP 报告基因 ) 经过 PacI( 购自 Biolabs 公司, 货号为 : R05647S) 酶切后, 转入宿主菌 BJ5183 中, 得到含有腺病毒骨架质粒 pAdeasy-1 的宿主菌 BJ5183。
     将上述 pAdtrack-E2E3 和穿梭质粒 pShuttle-CMV 用 PmeI( 购自 Biolabs 公司, 货 号为 : R0560S) 经 37℃充分消化, 使用 Gel Extraction kit 试剂盒 ( 购自 OMGEA 公司, 货号 为: D2500-01) 回收线性化的 pAdtrack-E2E3 和 pShuttle-CMV。
     将线性化的质粒 pAdtrack-E2E3 电转化到含有腺病毒骨架质粒 pAdeasy-1 的宿主 菌 BJ5183 感受态细胞中, 由于大肠杆菌 BJ5183 具有 Sm 抗性, pAdeasy-1 具有 Amp 抗性, 而 重组质粒 pAdtrack-E2E3 和穿梭载体质粒 pShuttle-CMV 具有 Kan 抗性, 在重组过程中穿梭 质粒上的 Kan 抗性取代了 pAdeasy-1 上的 Amp 抗性, 因此根据 Kan 和 Sm 双重抗性来筛选阳 性克隆, 得到的阳性克隆。
     提取转入线性化的质粒 pAdtrack-E2E3 的阳性克隆的质粒进行 PacI 酶切鉴定, 1 % DNA 凝胶电泳结果见图 1 所示 1 : pAdTrack-E2E32 : 阳性克隆质粒 3 : pShuttle-CMV4 : pAdeasy-15 : DL15000Marker, 从图中可以看出泳道 1 重组穿梭质粒 pAdTack-QE 经过 Pac I 酶切后, 产生 2 个片段, 其中一个含有目的基因 E2E3 约 7Kb, 另一个片段含有穿梭质粒 pShuttle-CMV 上的复制子和卡那霉素抗性基因大小约 3Kb, 泳道 2 经过 Pac I 酶切后, 产 生 2 个片段, 所产生的小片段的大小为 4.5Kb, 含有复制子和卡那霉素抗性基因, 大片度 为含有目的基因的 E2E3 的病毒骨架大小约为 35Kb( 病毒骨架大小约 33.5Kb 而目的基因E2E31.5Kb)。将该重组质粒命名为重组质粒 pAd-E2E3。
     提取转入线性化的质粒 pAdtrack-E2E3 的阳性克隆的质粒进行 PCR 鉴定, 引物 为 E2E3-F、 E2E3-R, 结果见图 2 所示, 1: pShuttle-CMV 2 : pAdTrack-E2E3 3 : pAd-E2E3 4 : pAdeasy-1 5 : DL15000Marker, 可以看出, 重组质粒 pAd-E2E3 可扩增出与预期的目的片 度 1.5Kb, 进一步说明说明已经成功构建携带有目的基因 E2E3 的重组腺病毒骨架质粒 pAd-E2E3。
     3、 组装成重组腺病毒
     将 HEK-293 细胞接种到 6 孔板中, 37 ℃培养, 细胞生长至 60 % -70 %, 用脂质体 Lipofectamin 2000( 购自 Invitrogen 公司 ) 介导重组腺病毒骨架质粒 pAd-E2E3 转染入细 胞中, 转染完成 7-10 天后, 收集细胞, 经 3 轮反复冻融, 离心收集上清液, 即为含有目的基因 的重组腺病毒 vAd-E2E3。转染实验按照说明书进行, 培养 7-10 天, 定期在荧光显微镜下检 测是否产生荧光, 判断转染是否成功, 由于该重组病毒上含有绿色荧光蛋白 (GFP) 的报告 基因。
     4、 重组腺病毒 vAd-E2E3 的扩增及目的蛋白的表达
     1) 重组腺病毒 vAd-E2E3 的扩增 将上述 3 获得的转染完成 7-10 天后, 收集细胞, 经 3 轮反复冻融, 离心收集上清 液, 即为重组腺病毒 vAd-E2E3, 进行下一代扩增, 连续扩增 3 代, 第二次收集上清液, 比第一 次数量增多。
     2) 目的蛋白的表达
     取 200ul 上述获得的第二次收集的上清液 ( 重组腺病毒 vAd-E2E3, 病毒的浓度为 6 LgTCID50/0.2ml = 8.0) 感染 5x10 的 HEK-293 细胞, 4 天后, 收集细胞。细胞经处理后进行 SDS-PAGE 电泳。结果为 : 经 SDS 电泳, 得到大小为 110KD 的蛋白 (E2E3 蛋白 ), 与预期蛋白 的大小一致。说明重组腺病毒有效的介导 E2E3 在细胞中表达。
     采用同样的方法将上述线性化的 pShuttle-CMV 和 pAdeasy-1 共同转入宿主菌 BJ5183 感受态细胞中, 得到重组腺病毒载体, 记作 pAd-GFP ; 将 pAd-GFP 转染 HEK-293 细胞, 获得阴性对照腺病毒 vAd-GFP。对照腺病毒 vAd-GFP 中无 E2E3 蛋白表达。
     实施例 2、 重组腺病毒 (vAd-E2E3) 的滴鼻接种中和抗体测定
     6-7 周龄的 BALB/c 小鼠随机分为 3 组, 分别为 vAd-GFP 对照组和 vAd-E2E3 免疫 组, 每组 20 只小鼠。
     vAd-GFP 对 照 组 : 拭 鼻 方 式 感 染 20ul 由 实 施 例 1 获 得 对 照 腺 病 毒 8 vAd-GFP(10 pfu)。
     vAd-E2E3 免疫组 : 拭鼻方式感染 20ul 由实施例 1 获得的重组腺病毒 (vAd-E2E3) 8 (10 pfu)。
     PBS 对照组 : 拭鼻方式感染 20ulPBS 溶液 (0.01M/L pH7.2)
     一、 血清和淋巴细胞检测
     将 3 个小组在第一次免疫后的第 4 周加强免疫一次。在免疫后每间隔一周时间通 过尾静脉采集小鼠血液, 离心后分别收集血清和淋巴细胞沉淀。
     1、 间接免疫荧光试验测定免疫小鼠血清中病毒的抗体反应
     用东部马脑炎病毒 (Eastern Equine Encephalomyelitis virus) 感染的 HEK-293
     制备抗原片, 制备的方法如下所述 :
     实验前准备 : 把抗原片摆放在抗原架上, 每个架上排放 2 排, 1 排 4 个, 完毕后用罩 子盖上防止灰尘的进入。之后按照下面步骤进行 :
     1) 待 75cm2 方瓶的 HEK-293 细胞生长至 80%左右的时候, 用东部马脑炎病毒 2ml 感染细胞 1 小时后, 吸出吸附液, 补加新鲜的细胞维持液, 放入培养箱中培养 ;
     2) 当细胞出现细胞病变的时候 ( 约 25% -50% ), 按照细胞传代的方法消化细胞, 用适量体积的培养液 ( 含有 10%胎牛血清的 DMEM 细胞生长液, 具体配方 : 向 500mlDMEM 液 体中加入 50ml 胎牛血清、 100X Antibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 100ulHEPES, 之后用 实验室配制的经过 0.22um 滤膜过滤除菌的 7.5% ( 质量百分含量 )NaHCO3 调节溶液的 pH 值至 7.0-7.2, 上述液体均为 GIBCO 公司产品 ) ; 3ml) 悬浮细胞, 每个抗原孔加入 40ul 细胞 悬液, 盖上盖子后放入培养箱中继续培养 8 小时 ;
     3) 取一烧杯内盛 PBS 溶液 (0.01mol/L pH = 7.2), 将吸附后的抗原片缓缓放入溶 液中, 浸泡 1min 左右, 取出放在工作台内晾干, 约需 30min ;
     4) 将抗原片放入盛有丙酮 ( 国药集团化学试剂有限公司分析纯浓度 99.5% ) 的 烧杯中, -20℃ 30min 或者过夜 ; 5) 取出晾干后保存于低温 (-40℃以下 ) 冰箱中备用。
     间接免疫荧光法 : 采集小鼠全血后放置于 37℃培养箱孵育 30min, 经 800rpm 离心 15min 后吸取上清得到血清。 之后将血清按照实验要求进行稀释后进行间接免疫荧光实验, 具体实验步骤如下 :
     1) 从冰箱中取出抗原片, 肉眼观察上面的细胞是否脱落, 如果有脱落孔, 放弃不 用;
     2) 在抗原片上用蜡笔在吸附有抗原的画圈周围划一圈, 防止所加样品溢流 ;
     3) 根据实验的需要稀释所检测的血清后加样, 每孔 20-25ul, 一般需要做复孔, 故 需要 50ul, 根据需要做倍比稀释 ;
     首浓度按照 1 ∶ 10, 故需要加入 10ul 血清 +90ul 抗体稀释液, 在漩涡混合器上充 分混匀后取出 50ul 1 ∶ 10 稀释液 +50ul 血清稀释液 (1 ∶ 20), 依此稀释下去, 一般稀释至 1 ∶ 160 ;
     4) 把已经加样的抗原片放入铺有塑料板的饭盒中, 放入 37℃、 5% CO2 培养箱中孵 育 30min ;
     5) 取出抗原片, 放入洗板槽内, 向里面加入洗涤液 (0.005M PBS+0.02% ( 体积百 分含量 )Tween 20), 在水平振荡器上洗涤 5min, 重复 3 次 ;
     6) 待抗原片完全风干后, 加入 1 ∶ 50 稀释的荧光抗体 25ul/ 孔, 放入饭盒后在 37℃、 5% CO2 培养箱中孵育 30min ;
     荧光抗体的稀释 : 取 出 针 对 所 加 入 血 清 来 源 的 适 量 荧 光 抗 体, 用 0.02 % ( 质 量 百 分 含 量 ) 伊 文 斯 兰 溶 液 按 照 1 ∶ 50 稀 释 抗 体, 该实验所使用的抗体为 FITC-conjugate-GoatAnti-Human IgG 购自 Sigma 公司。
     7) 重复步骤 5) ;
     8) 风干后, 滴加无菌水在荧光显微镜下观察荧光情况并记录结果。
     利用间接免疫荧光试验测, 结果显示在首次免疫 2 周后小鼠血清抗体水平开始升
     高, 效价达至 1 ∶ 80, 3 周后降至较低水平 ; 血清效价为 1 ∶ 30。加强免疫后, 抗体水平再 次迅速升高, 升高幅度比首次免疫整体要高。加免后 1 周达至达到 1 ∶ 160, 并持续至 4 周 左右, 而对照组 vAd-GFP 和 PBS 始终未检测出特异性抗体。
     2、 流式分析淋巴细胞中 CD4+、 CD8+ 数
     流式分析淋巴细胞中 CD4+、 CD8+ 数, 结果如下 :
     免疫小鼠中, vAd-E2E3 免疫 1 周后 CD4+ 淋巴细胞占总淋巴细胞的 8%, 2 周以后恢 + 复至正常水平约占 5%, 加强免疫后, vAd-E2E3 免疫组 CD4 淋巴细胞开始持续升高, 由占总 + 淋巴细胞的 5%上升至 25%, 而 PBS 对照组以及 vAd-GFP 组 CD4 淋巴细胞一直占总淋巴细 胞的 5%, 无明显的改变。
     免疫组小鼠中, vAd-E2E3 免疫 1 周后达至高峰, CD8+ 淋巴细胞占总淋巴细胞的 17%, 随后恢复至正常水平约占 2%, 在首免后 3 周 CD8+ 淋巴细胞数量再次升高占总淋巴细 胞的 3%; 加强免疫后, vAd-E2E3 免疫组 CD8+ 淋巴细胞开始持续升高, 在免疫 2 周后达至峰值 约占总淋巴细胞的 12%, 3 周后下降至正常水平 2%, 4 周后又缓慢升至较高水平约占 8%, + 而 PBS 对照组以及 vAd-GFP 组 CD8 淋巴细胞一直占总淋巴细胞的 7%。
     二、 利用酶联免疫斑点试验 (ELISPOT) 对细胞因子生成细胞进行定量 加 强 免 疫 4 周 后, 每 组 随 机 挑 选 4 只 小 鼠, 处 死 后 立 即 无 菌 采 取 脾 脏, 加入 10ml 含有 10 %胎牛血清的 1640 培养液 ( 含有 10 %胎牛血清的 1640 培养液 : 向 500ml RPMIMEDIUM1640 液体中加入 50ml 胎牛血清、 100X Antibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 100ul HEPES, 之后用实验室配置的经过过滤除菌的 7.5% NaHCO3( 质量百分比 ) 调节溶液 的 pH 值为 7.0-7.2 ; 上述 RPMI MEDIUM1640、 胎牛血清、 100XAntibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 HEPES 均为 GIBCO 公司产品 ; RPMI MEDIUM1640GIBC0 公司产品, LOT : 8109086), 将脾组 织通过 200 目铜网制成细胞悬液, 收集到无菌的离心管中, 15000rpm/min 离心 5min, 弃上清 7 液后用 1640 培养基离心洗涤细胞两次, 最后将脾细胞稀释成 2×10 个 /ml, 制成细胞悬液 7 备用。 以细胞培养的东部马脑炎病毒作为特异刺激因子 ( 将 2×10 个 /ml 个脾细胞 108pfu 的东部马脑炎病毒混合, 共同孵育 48 小时, 按照 ELISPOT 实验的操作, 脾细胞与特异的刺激 因子要分别加入到孔中, 之后在孔内反应, 不能在孔外混合后加入其内 ), 利用酶联免疫斑 点试验 (ELISPOT) 对细胞因子生成细胞进行定量。
     具体的实验步骤 :
     1.Coating antibody( 包被抗体 ) : 无菌条件下进行
     用 Coating buffer(1×PBS pH7.2) 稀释 capture 抗体 (200 倍 ), 终浓度 5ug/ml 包被板子, 每孔加 100ul 稀释的 capture 抗体 4℃过夜。
     2.Blocking( 封闭 ) : 无菌条件下进行
     吸干孔中包被液, 洗板子, 每孔加入 200ul Blocking 溶液, 洗孔一次。( 在灭菌吸 水纸上扣干 )
     3.Cell Activation( 刺激细胞 ) : 无菌条件下进行
     3.1 弃 Blocking 溶液, 准备刺激用的抗原, 用组织完全培养基稀释适宜浓度 50ug/ ml, 每孔加入 100ul ; ( 不要拍板子 )
     3.2 准备 1×106 个脾细胞悬液, 每孔加入 100ul ; (注: 避免震动 )
     3.3 盖上盖子, 板子放置 37℃, 5% CO2, 99%湿度的培养箱根据细胞情况培养 48 小
     时。 (注: 时刻避免碰撞 )
     4.Detection antibody( 检测抗体 ) :
     4.1 在无菌条件下吸去细胞悬液, 用去离子水 ( 冰冷的去离子水, 低渗法裂解细 胞 ) 洗 2 遍, 每遍浸泡 3-5min, 以下实验操作可以拿到超净工作台外进行 ;
     4.2 每孔用 200ul wash buffer Ⅰ洗 3 遍, 弃 wash buffer Ⅰ ( 最后一遍后拍干 )
     4.3 稀释 Detection 抗体, 用稀释 buffer(1×PBS+10 % FBS)250 倍稀释, 终浓度 2ug/ml。每孔加入 100ul ;
     4.4 盖上盖子, 室温培养 2 小时。
     5. 加入酶连抗体 :
     5.1 弃 Detection 抗体溶液, 每孔用 200ul wash buffer Ⅰ洗 3 遍。( 最后一遍拍 干);
     5.2 用稀释 buffer 稀释 Streptavidin-HRP( 用稀释 buffer(1×PBS+10% FBS) 稀 释 100 倍。现用现配, 用完多余的弃之 ) 每孔加 100ul ;
     5.3 盖上盖子, 室温培养 1 小时。
     6. 结果检测 :
     6.1 弃 Streptavidin-HRP 溶液, 每孔用 200ul wash buffer Ⅰ洗 4 遍 ;
     6.2 每孔用 200ul wash buffer Ⅱ洗 2 遍 ( 最后一遍拍干 ) ;
     6.3 加入底物 AEC, 每孔加 100ul( 注意避光 )。控制斑点形成约需要 15min ;
     6.4 用去离子水 ( 洗 2 遍 ) 终止底物反应 ;
     6.5 室温避光空气吹干板子 2 小时 - 过夜, 至板子全干, 避光保存板子待检测。 注: 不要将板子放到烤箱中, 防止膜发脆、 破裂。)
     结果 : ELISPOT 的 结 果 是 通 过 最 后 的 板 子 出 斑 的 数 目 来 确 定, 通过肉眼看到 vAd-E2E3 免疫组出斑数目明显增加, 说明经东部马脑炎病毒的刺激后, vAd-E2E3 免疫组小 鼠脾细胞分泌 IFN-γ 活性明显增高, 抗原刺激后 vAd-QE 免疫组小鼠脾细胞分泌 IFN-γ 活 性是对照 vAd-GFP 组的 4 倍, 是 PBS 对照组的 11 倍 ( 根据出斑数目来统计倍数 )。
     三、 攻毒实验
     1、 发病和存活状况
     加强免疫 4 周后, vAd-GFP 对照组、 vAd-E2E3 免疫组和 PBS 对照组的每组处死后剩 余的小鼠在 BSL-3 实验室进行攻毒实验, 再将 8 只小鼠为一组, 分为两组 :
     vAd-GFP 对照组 A : 腹腔注射 215 个 LD50( 半数致死剂量 ) 东部马脑炎病毒
     vAd-GFP 对照组 B : 腹腔注射 21 个 LD50 东部马脑炎病毒
     vAd-E2E3 免疫组 A : 腹腔注射 215 个 LD50( 半数致死剂量 ) 东部马脑炎病毒
     vAd-E2E3 免疫组 B : 腹腔注射 21 个 LD50 东部马脑炎病毒
     PBS 对照组 A : 腹腔注射 215 个 LD50( 半数致死剂量 ) 东部马脑炎病毒
     PBS 对照组 B : 腹腔注射 21 个 LD50 东部马脑炎病毒
     持续 4 周观察小鼠发病和存活状况。
     结果为加强免疫 4 周后, 215 个 LD50 的东部马脑炎病毒攻击后, vAd-E2E3 免疫组 A 的保护效率为 0(8 只小鼠都死亡 ) ; 21 个 LD50 东部马脑炎病毒攻击时, vAd-E2E3 免疫组
     B 的保护率仅为 25% (8 只小鼠死亡 6 只 ) ; 对照组 (vAd-GFP 对照组 A、 vAd-GFP 对照组 B、 PBS 对照组 A、 PBS 对照组 B) 均无保护作用 (8 只小鼠都死亡 )。保护率是最后存活小鼠的 数量与其攻毒前小鼠的数量比值。
     2、 利用 BHK 细胞单层测定小鼠血清中和抗体
     收集上述攻毒后的各组小鼠的血清, 利用 BHK 细胞 (Invitrogen 公司产品, Cat. No.R760-07) 单层测定小鼠血清中和抗体。先将免疫小鼠血清适当稀释后, 置 56℃水浴中 处理 30min, 破坏其中的补体和其他不耐热的非特异性毒性因子, 然后以维持液 ( 含有 2% ( 体积百分比 ) 胎牛血清的细胞维持液的配置方法 : 向 500ml DMEM 液体中加入 10ml 胎牛血 清、 100X Antibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 100ul HEPES, 之后用实验室配置的经过过 滤除菌的 7.5% NaHCO3( 质量百分比 ) 调节溶液的 pH 值为 7.0-7.2 ; 上述 DMEM、 胎牛血清、 100X Antibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 HEPES 均为 GIBCO 公司产品 ) 在无菌离心管中 进行 2 倍连续稀释。取 100 个 TCID50 东部马脑炎病毒病毒液和等体积不同稀释度的血清, 充分混匀后置 37℃孵育 1h, 中间上下颠倒离心管混匀液体 1-2 次, 1 小时后取出 96 孔板, 其 内的 BHK 细胞已铺满单层, 吸去细胞单层上的培养基, 加入作用过的病毒 - 抗体混合液 ( 即 上述孵育过的混匀液体, 请核实 ), 培养板上同时设阳性和阴性对照孔 ( 阳性对照为用细胞 维持液稀释为 100 个 TCID50 的东部马脑炎病毒病毒液, 阴性对照为用细胞维持液稀释的不 同浓度的血清, 空白对照为细胞维持液 )。放入含有 5% CO2 的 37℃培养箱中培养, 每天观 察和记录细胞病变的情况。
     中和实验检测血清效价, 具体方法为 : 通过显微镜观察细胞的病变情况 ( 病变时 细胞膨大变圆聚集 ), 当孔内细胞病变达到 90%以上记为 ++++, 细胞病变达到 75%以上记 为 +++, 细胞病变达到 50%以上记为 ++, 细胞病变达到 25%以上记为 +, 无细胞病变记为一, 最后用 Reed-Muench 法计算血清的中和指数。
     结果 : 接种病毒前 vAd-E2E3 免疫组 A 和 vAd-E2E3 免疫组 B 小鼠血清效价均为 1 ∶ 80, 攻毒 4 周后, 接种 21 个 LD50 的东部马脑炎病毒攻击后的 vAd-E2E3 免疫组 B 存活 小鼠的血清效价为 1 ∶ 300, 215 个 LD50 东部马脑炎病毒攻击后的 vAd-E2E3 免疫组 A 的存 活小鼠血清效价则为 1 ∶ 30。而对照组 (vAd-GFP 对照组 A、 vAd-GFP 对照组 B、 PBS 对照组 A、 PBS 对照组 B) 均无特异性抗体的产生。
     本发明涉及一种脑炎病毒蛋白及其编码基因与应用。背景技术 脑炎是由病毒直接侵犯或由病毒或其他异种蛋白引发的超敏反应所致的大脑急 性炎症性疾病。脑炎可以是病毒性感染原发的临床表现, 或者是继发的临床表现, 引起原 发的脑炎的病毒有脊髓灰质炎病毒, 埃可病毒、 柯萨奇病毒等流行性病毒, 或散发性的通过 蚊子、 蜱等节肢动物传播的黄病毒属的森林脑炎和批膜病毒科甲病毒属的东方马脑炎病毒 等。
     甲病毒为披膜病毒科 (Togaviridae) 甲病毒属 (Alphavirus) 成员, 以蚊蜱等吸血 昆虫为传播媒介, 可引起多种人畜共患传染病。 近年来, 国外已对多株甲病毒部分或全部序 列测序。国内对这类病毒的分子生物学研究亦取得一定的结果。已有的研究结果表明 : 该 病毒属中和抗体决定簇主要集中在结构蛋白 E1 和 E2 等糖蛋白上, 其中 E2 蛋白上所占比例 更高。加之近年来腺病毒载体因具有安全性好、 宿主范围广、 感染效率高等多种优点, 被广 泛用于基因治疗和基因工程疫苗研究, 为此我们分析比较了多株甲病毒核苷酸序列, 人工 合成了同源性较高的 3kb 的核苷酸, 利用腺病毒载体构建重组基因工程疫苗, 为预防和治 疗疾病奠定了基础。
     甲病毒为披膜病毒科 (Togaviridae) 甲病毒属 (Alphavirus) 成员, 以蚊蜱等吸血 昆虫为传播媒介, 可引起多种人畜共患传染病。 近年来, 国外已对多株甲病毒部分或全部序 列测序。国内对这类病毒的分子生物学研究亦取得一定的结果。已有的研究结果表明 : 该 病毒属中和抗体决定簇主要集中在结构蛋白 E1 和 E2 等糖蛋白上, 其中 E2 蛋白上所占比例 更高。加之近年来腺病毒载体因具有安全性好、 宿主范围广、 感染效率高等多种优点, 被广 泛用于基因治疗和基因工程疫苗研究, 为此我们分析比较了多株甲病毒核苷酸序列, 人工 合成了同源性较高的 3kb 的核苷酸, 利用腺病毒载体构建重组基因工程疫苗, 为预防和治 疗疾病奠定了基础。
    【发明内容】
     本发明的一个目的是提供一种与脑炎病毒疫苗相关蛋白及其编码基因。
     本发明提供的蛋白 E2E3, 人工合成, 是如下 1) 或 2) 的蛋白 :
     1) 由序列表中序列 2 所示的氨基酸序列组成的蛋白 ;
     2) 将序列 2 的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和 / 或缺失和 / 或添 加且具有相同功能的由 1) 衍生的蛋白质。
     序列表中的序列 2 由 529 个氨基酸残基组成, 所述一个或几个氨基酸残基的取代 和 / 或缺失和 / 或添加为不超过 10 个氨基酸残基的取代和 / 或缺失和 / 或添加。
     上述蛋白质 E2E3 的编码基因也是本发明保护的范围, 所述编码基因为如下 1)-4) 中任一所示的基因 :
     1) 序列表中序列 1 所示的 DNA 分子 ;
     2) 序列表中序列 1 自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸所示的 DNA 分子 ;
     3) 在严格条件下与 1) 或 2) 限定的 DNA 分子杂交且具有相同功能的 DNA 分子 ;
     4) 与 1) 或 2) 限定的 DNA 序列至少具有 90%同源性且具有相同功能的 DNA 分子。
     含有上述编码基因的重组载体、 转基因细胞系、 重组菌、 表达盒或重组病毒也是本 发明保护的范围。
     所述重组载体为 pAdeasy-1 和重组穿梭质粒经过同源重组得到的 ; 所述重组穿梭 质粒是在载体 pShuttle-CMV 的 KpNI 和 HindIII 酶切位点间插入所述编码基因得到的。所述重组病毒为重组腺病毒 ; 所述重组腺病毒为将上述蛋白的编码基因转染宿主 细胞获得的重组腺病毒。
     所述宿主细胞为真核细胞, 优选为离体的哺乳动物细胞, 尤其优选为 HEK-293 细 胞。
     本发明的另一个目的是提供一种疫苗。
     本发明提供的疫苗, 其活性成分为如下任意一种 :
     1) 所述的蛋白 ; 2) 所述编码基因 ; 3) 所述重组腺病毒。
     上述重组腺病毒在制备疫苗中的应用也是本发明保护的范围。
     所述疫苗为脑炎病毒疫苗。
     上述重组腺病毒在制备提高 IFN-γ 活性的增强剂中的应用也是本发明保护的范 围。
     本发明的实验证明, 人工合成 E2E3 通过转染 HEK-293 细胞而组装成携带有目标 抗原基因的重组腺病毒 vAd-E2E3。重组腺病毒 vAd-E2E3 感染 293 细胞能有效表达目的蛋 白; 通过滴鼻途径接种 BalB/C 小鼠, 利用间接免疫荧光技术检测特异性抗体水平, 结果表 明, 所构建的重组腺病毒虽然产生特异性抗体的时间和维持的水平有所不同, 但均产生了 较好体液免疫反应, 为进一步开展免疫保护实验提供了重要的数据支持。由于病毒在机体 内极微量的蛋白表达即可激起免疫反应, 因此构建的携带有脑炎病毒结构基因的重组腺病 毒 vAd-E2E3, 有希望成为脑炎基因工程疫苗的候选疫苗株。 附图说明
    
    图 1 为 pAd-E2E3 酶切鉴定图 图 2 为重组质粒 Pac I 酶切和 PCR 鉴定具体实施方式
     下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明, 均为常规方法。
     下述实施例中所用的材料、 试剂等, 如无特殊说明, 均可从商业途径得到。
     东部马脑炎病毒 (Eastern Equine Encephalomyelitis virus)(HE Jing ; CHANG GuoHui ; WU Jin Song ; LI ZhongDuo ; ZHU QingYu : Cloning and expression of E2 gene of eastern equine encephalomyelitis virus.Bulletin of The Academy of Military Medical Sciences.2002.02. 公众可从中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究 所获得。)
     HEK-293 细胞 (Invitrogen 公司产品, Cat.No.R750-07) ; 实验所需限制性内切 酶分别购自 TaKaRa 和 Biolabs 公司 ; 脂质体 Lipofectamin 2000 购自 Invitrogen 公司 ; Platinum pfx Taqase 购自 Invitrogen 公司。
     实施例 1、 重组腺病毒 (vAd-E2E3) 的获得
     1、 含有目的基因 pAdtrack-E2E3 的构建及鉴定
     根据东部马脑炎病毒 (Eastern Equine Encephalomyelitis virus)(NC-001547) 的基因组序列, 突变序列中的多个位点, 设计出序列表中的序列 1, 人工合成出序列 1。
     设计引物扩增编码 E2E3 蛋白的基因, 引物序列 ( 引物分别含有 KpNI 和 HindIII酶切位点 ) 见下 :
     E2E3-F : 5’ -ACGGggtaccATGTCACTAGTGACCACCATGTGTCT-3’
     E2E3-R : 5’ -ACCCaagcttACTAAAAAAGGCACGACACAG-3’
     以人工合成出序列 1 的 DNA 为模板, 利用 E2E3-F 和 E2E3-R 引物对进行 PCR 反应, 得到的 PCR 产物经 1%的琼脂糖凝胶电泳鉴定, 得到了预期大小一致的片段, 约为 1.5Kb。
     经测序, 该 PCR 产物具有序列表中的序列 1 自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸, 将该 PCR 产物的基因命名 E2E3, 其 OFR 为序列 1 的自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸, 该基因编码的 蛋白命名为 E2E3, 该蛋白的氨基酸序列为序列表中的序列 2, 序列 2 由 529 个氨基酸残基组 成。
     回收 PCR 产物, 对 PCR 产物进行加 “A” 处理, 处理后的 PCR 样品与 pMD-18T 载体 (TaKaRa 公司产品, Code : D101A.Lot CK3201A) 相连, 转化 DH5a 感受态细胞, 挑取阳性菌落 提取质粒后测序验证, 结果为该质粒为将序列表中序列 1 的自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸 插入 pMD-18T 得到的, 命名为 pTE2E3。
     用 KpNI 和 HindIII 双 酶 切 重 组 质 粒 pTE2E3 和 质 粒 pShuttle-CMV(Invitrogen 公司产品, Catalog#240007), 酶切产物分别用凝胶回收试剂盒切胶回收, 并在 T4DNA 连 接酶作用下于 16 ℃连接过夜, 连接产物转化大肠杆菌 DH10B(Invitrogen 公司产品, Cat. No.18290-015) 后挑选阳性克隆, 提取质粒进行测序, 结果为该质粒为将序列表中序列 1 的 自 5’ 末端第 1-1589 位核苷酸插入 pShuttle-CMV 的 KpnI 和 HindIII 酶切位点间得到的载 体, 命名为 pAdtrack-E2E3。
     2、 重组腺病毒载体的构建
     菌 BJ5183 购自上海杰美基因医药科技有限公司, 货号为 : GMS12223.2。
     将腺病毒骨架质粒 pAdeasy-1(Invitrogen 公司产品, Catalog#240005, 含有 GFP 报告基因 ) 经过 PacI( 购自 Biolabs 公司, 货号为 : R05647S) 酶切后, 转入宿主菌 BJ5183 中, 得到含有腺病毒骨架质粒 pAdeasy-1 的宿主菌 BJ5183。
     将上述 pAdtrack-E2E3 和穿梭质粒 pShuttle-CMV 用 PmeI( 购自 Biolabs 公司, 货 号为 : R0560S) 经 37℃充分消化, 使用 Gel Extraction kit 试剂盒 ( 购自 OMGEA 公司, 货号 为: D2500-01) 回收线性化的 pAdtrack-E2E3 和 pShuttle-CMV。
     将线性化的质粒 pAdtrack-E2E3 电转化到含有腺病毒骨架质粒 pAdeasy-1 的宿主 菌 BJ5183 感受态细胞中, 由于大肠杆菌 BJ5183 具有 Sm 抗性, pAdeasy-1 具有 Amp 抗性, 而 重组质粒 pAdtrack-E2E3 和穿梭载体质粒 pShuttle-CMV 具有 Kan 抗性, 在重组过程中穿梭 质粒上的 Kan 抗性取代了 pAdeasy-1 上的 Amp 抗性, 因此根据 Kan 和 Sm 双重抗性来筛选阳 性克隆, 得到的阳性克隆。
     提取转入线性化的质粒 pAdtrack-E2E3 的阳性克隆的质粒进行 PacI 酶切鉴定, 1 % DNA 凝胶电泳结果见图 1 所示 1 : pAdTrack-E2E32 : 阳性克隆质粒 3 : pShuttle-CMV4 : pAdeasy-15 : DL15000Marker, 从图中可以看出泳道 1 重组穿梭质粒 pAdTack-QE 经过 Pac I 酶切后, 产生 2 个片段, 其中一个含有目的基因 E2E3 约 7Kb, 另一个片段含有穿梭质粒 pShuttle-CMV 上的复制子和卡那霉素抗性基因大小约 3Kb, 泳道 2 经过 Pac I 酶切后, 产 生 2 个片段, 所产生的小片段的大小为 4.5Kb, 含有复制子和卡那霉素抗性基因, 大片度 为含有目的基因的 E2E3 的病毒骨架大小约为 35Kb( 病毒骨架大小约 33.5Kb 而目的基因E2E31.5Kb)。将该重组质粒命名为重组质粒 pAd-E2E3。
     提取转入线性化的质粒 pAdtrack-E2E3 的阳性克隆的质粒进行 PCR 鉴定, 引物 为 E2E3-F、 E2E3-R, 结果见图 2 所示, 1: pShuttle-CMV 2 : pAdTrack-E2E3 3 : pAd-E2E3 4 : pAdeasy-1 5 : DL15000Marker, 可以看出, 重组质粒 pAd-E2E3 可扩增出与预期的目的片 度 1.5Kb, 进一步说明说明已经成功构建携带有目的基因 E2E3 的重组腺病毒骨架质粒 pAd-E2E3。
     3、 组装成重组腺病毒
     将 HEK-293 细胞接种到 6 孔板中, 37 ℃培养, 细胞生长至 60 % -70 %, 用脂质体 Lipofectamin 2000( 购自 Invitrogen 公司 ) 介导重组腺病毒骨架质粒 pAd-E2E3 转染入细 胞中, 转染完成 7-10 天后, 收集细胞, 经 3 轮反复冻融, 离心收集上清液, 即为含有目的基因 的重组腺病毒 vAd-E2E3。转染实验按照说明书进行, 培养 7-10 天, 定期在荧光显微镜下检 测是否产生荧光, 判断转染是否成功, 由于该重组病毒上含有绿色荧光蛋白 (GFP) 的报告 基因。
     4、 重组腺病毒 vAd-E2E3 的扩增及目的蛋白的表达
     1) 重组腺病毒 vAd-E2E3 的扩增 将上述 3 获得的转染完成 7-10 天后, 收集细胞, 经 3 轮反复冻融, 离心收集上清 液, 即为重组腺病毒 vAd-E2E3, 进行下一代扩增, 连续扩增 3 代, 第二次收集上清液, 比第一 次数量增多。
     2) 目的蛋白的表达
     取 200ul 上述获得的第二次收集的上清液 ( 重组腺病毒 vAd-E2E3, 病毒的浓度为 6 LgTCID50/0.2ml = 8.0) 感染 5x10 的 HEK-293 细胞, 4 天后, 收集细胞。细胞经处理后进行 SDS-PAGE 电泳。结果为 : 经 SDS 电泳, 得到大小为 110KD 的蛋白 (E2E3 蛋白 ), 与预期蛋白 的大小一致。说明重组腺病毒有效的介导 E2E3 在细胞中表达。
     采用同样的方法将上述线性化的 pShuttle-CMV 和 pAdeasy-1 共同转入宿主菌 BJ5183 感受态细胞中, 得到重组腺病毒载体, 记作 pAd-GFP ; 将 pAd-GFP 转染 HEK-293 细胞, 获得阴性对照腺病毒 vAd-GFP。对照腺病毒 vAd-GFP 中无 E2E3 蛋白表达。
     实施例 2、 重组腺病毒 (vAd-E2E3) 的滴鼻接种中和抗体测定
     6-7 周龄的 BALB/c 小鼠随机分为 3 组, 分别为 vAd-GFP 对照组和 vAd-E2E3 免疫 组, 每组 20 只小鼠。
     vAd-GFP 对 照 组 : 拭 鼻 方 式 感 染 20ul 由 实 施 例 1 获 得 对 照 腺 病 毒 8 vAd-GFP(10 pfu)。
     vAd-E2E3 免疫组 : 拭鼻方式感染 20ul 由实施例 1 获得的重组腺病毒 (vAd-E2E3) 8 (10 pfu)。
     PBS 对照组 : 拭鼻方式感染 20ulPBS 溶液 (0.01M/L pH7.2)
     一、 血清和淋巴细胞检测
     将 3 个小组在第一次免疫后的第 4 周加强免疫一次。在免疫后每间隔一周时间通 过尾静脉采集小鼠血液, 离心后分别收集血清和淋巴细胞沉淀。
     1、 间接免疫荧光试验测定免疫小鼠血清中病毒的抗体反应
     用东部马脑炎病毒 (Eastern Equine Encephalomyelitis virus) 感染的 HEK-293
     制备抗原片, 制备的方法如下所述 :
     实验前准备 : 把抗原片摆放在抗原架上, 每个架上排放 2 排, 1 排 4 个, 完毕后用罩 子盖上防止灰尘的进入。之后按照下面步骤进行 :
     1) 待 75cm2 方瓶的 HEK-293 细胞生长至 80%左右的时候, 用东部马脑炎病毒 2ml 感染细胞 1 小时后, 吸出吸附液, 补加新鲜的细胞维持液, 放入培养箱中培养 ;
     2) 当细胞出现细胞病变的时候 ( 约 25% -50% ), 按照细胞传代的方法消化细胞, 用适量体积的培养液 ( 含有 10%胎牛血清的 DMEM 细胞生长液, 具体配方 : 向 500mlDMEM 液 体中加入 50ml 胎牛血清、 100X Antibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 100ulHEPES, 之后用 实验室配制的经过 0.22um 滤膜过滤除菌的 7.5% ( 质量百分含量 )NaHCO3 调节溶液的 pH 值至 7.0-7.2, 上述液体均为 GIBCO 公司产品 ) ; 3ml) 悬浮细胞, 每个抗原孔加入 40ul 细胞 悬液, 盖上盖子后放入培养箱中继续培养 8 小时 ;
     3) 取一烧杯内盛 PBS 溶液 (0.01mol/L pH = 7.2), 将吸附后的抗原片缓缓放入溶 液中, 浸泡 1min 左右, 取出放在工作台内晾干, 约需 30min ;
     4) 将抗原片放入盛有丙酮 ( 国药集团化学试剂有限公司分析纯浓度 99.5% ) 的 烧杯中, -20℃ 30min 或者过夜 ; 5) 取出晾干后保存于低温 (-40℃以下 ) 冰箱中备用。
     间接免疫荧光法 : 采集小鼠全血后放置于 37℃培养箱孵育 30min, 经 800rpm 离心 15min 后吸取上清得到血清。 之后将血清按照实验要求进行稀释后进行间接免疫荧光实验, 具体实验步骤如下 :
     1) 从冰箱中取出抗原片, 肉眼观察上面的细胞是否脱落, 如果有脱落孔, 放弃不 用;
     2) 在抗原片上用蜡笔在吸附有抗原的画圈周围划一圈, 防止所加样品溢流 ;
     3) 根据实验的需要稀释所检测的血清后加样, 每孔 20-25ul, 一般需要做复孔, 故 需要 50ul, 根据需要做倍比稀释 ;
     首浓度按照 1 ∶ 10, 故需要加入 10ul 血清 +90ul 抗体稀释液, 在漩涡混合器上充 分混匀后取出 50ul 1 ∶ 10 稀释液 +50ul 血清稀释液 (1 ∶ 20), 依此稀释下去, 一般稀释至 1 ∶ 160 ;
     4) 把已经加样的抗原片放入铺有塑料板的饭盒中, 放入 37℃、 5% CO2 培养箱中孵 育 30min ;
     5) 取出抗原片, 放入洗板槽内, 向里面加入洗涤液 (0.005M PBS+0.02% ( 体积百 分含量 )Tween 20), 在水平振荡器上洗涤 5min, 重复 3 次 ;
     6) 待抗原片完全风干后, 加入 1 ∶ 50 稀释的荧光抗体 25ul/ 孔, 放入饭盒后在 37℃、 5% CO2 培养箱中孵育 30min ;
     荧光抗体的稀释 : 取 出 针 对 所 加 入 血 清 来 源 的 适 量 荧 光 抗 体, 用 0.02 % ( 质 量 百 分 含 量 ) 伊 文 斯 兰 溶 液 按 照 1 ∶ 50 稀 释 抗 体, 该实验所使用的抗体为 FITC-conjugate-GoatAnti-Human IgG 购自 Sigma 公司。
     7) 重复步骤 5) ;
     8) 风干后, 滴加无菌水在荧光显微镜下观察荧光情况并记录结果。
     利用间接免疫荧光试验测, 结果显示在首次免疫 2 周后小鼠血清抗体水平开始升
     高, 效价达至 1 ∶ 80, 3 周后降至较低水平 ; 血清效价为 1 ∶ 30。加强免疫后, 抗体水平再 次迅速升高, 升高幅度比首次免疫整体要高。加免后 1 周达至达到 1 ∶ 160, 并持续至 4 周 左右, 而对照组 vAd-GFP 和 PBS 始终未检测出特异性抗体。
     2、 流式分析淋巴细胞中 CD4+、 CD8+ 数
     流式分析淋巴细胞中 CD4+、 CD8+ 数, 结果如下 :
     免疫小鼠中, vAd-E2E3 免疫 1 周后 CD4+ 淋巴细胞占总淋巴细胞的 8%, 2 周以后恢 + 复至正常水平约占 5%, 加强免疫后, vAd-E2E3 免疫组 CD4 淋巴细胞开始持续升高, 由占总 + 淋巴细胞的 5%上升至 25%, 而 PBS 对照组以及 vAd-GFP 组 CD4 淋巴细胞一直占总淋巴细 胞的 5%, 无明显的改变。
     免疫组小鼠中, vAd-E2E3 免疫 1 周后达至高峰, CD8+ 淋巴细胞占总淋巴细胞的 17%, 随后恢复至正常水平约占 2%, 在首免后 3 周 CD8+ 淋巴细胞数量再次升高占总淋巴细 胞的 3%; 加强免疫后, vAd-E2E3 免疫组 CD8+ 淋巴细胞开始持续升高, 在免疫 2 周后达至峰值 约占总淋巴细胞的 12%, 3 周后下降至正常水平 2%, 4 周后又缓慢升至较高水平约占 8%, + 而 PBS 对照组以及 vAd-GFP 组 CD8 淋巴细胞一直占总淋巴细胞的 7%。
     二、 利用酶联免疫斑点试验 (ELISPOT) 对细胞因子生成细胞进行定量 加 强 免 疫 4 周 后, 每 组 随 机 挑 选 4 只 小 鼠, 处 死 后 立 即 无 菌 采 取 脾 脏, 加入 10ml 含有 10 %胎牛血清的 1640 培养液 ( 含有 10 %胎牛血清的 1640 培养液 : 向 500ml RPMIMEDIUM1640 液体中加入 50ml 胎牛血清、 100X Antibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 100ul HEPES, 之后用实验室配置的经过过滤除菌的 7.5% NaHCO3( 质量百分比 ) 调节溶液 的 pH 值为 7.0-7.2 ; 上述 RPMI MEDIUM1640、 胎牛血清、 100XAntibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 HEPES 均为 GIBCO 公司产品 ; RPMI MEDIUM1640GIBC0 公司产品, LOT : 8109086), 将脾组 织通过 200 目铜网制成细胞悬液, 收集到无菌的离心管中, 15000rpm/min 离心 5min, 弃上清 7 液后用 1640 培养基离心洗涤细胞两次, 最后将脾细胞稀释成 2×10 个 /ml, 制成细胞悬液 7 备用。 以细胞培养的东部马脑炎病毒作为特异刺激因子 ( 将 2×10 个 /ml 个脾细胞 108pfu 的东部马脑炎病毒混合, 共同孵育 48 小时, 按照 ELISPOT 实验的操作, 脾细胞与特异的刺激 因子要分别加入到孔中, 之后在孔内反应, 不能在孔外混合后加入其内 ), 利用酶联免疫斑 点试验 (ELISPOT) 对细胞因子生成细胞进行定量。
     具体的实验步骤 :
     1.Coating antibody( 包被抗体 ) : 无菌条件下进行
     用 Coating buffer(1×PBS pH7.2) 稀释 capture 抗体 (200 倍 ), 终浓度 5ug/ml 包被板子, 每孔加 100ul 稀释的 capture 抗体 4℃过夜。
     2.Blocking( 封闭 ) : 无菌条件下进行
     吸干孔中包被液, 洗板子, 每孔加入 200ul Blocking 溶液, 洗孔一次。( 在灭菌吸 水纸上扣干 )
     3.Cell Activation( 刺激细胞 ) : 无菌条件下进行
     3.1 弃 Blocking 溶液, 准备刺激用的抗原, 用组织完全培养基稀释适宜浓度 50ug/ ml, 每孔加入 100ul ; ( 不要拍板子 )
     3.2 准备 1×106 个脾细胞悬液, 每孔加入 100ul ; (注: 避免震动 )
     3.3 盖上盖子, 板子放置 37℃, 5% CO2, 99%湿度的培养箱根据细胞情况培养 48 小
     时。 (注: 时刻避免碰撞 )
     4.Detection antibody( 检测抗体 ) :
     4.1 在无菌条件下吸去细胞悬液, 用去离子水 ( 冰冷的去离子水, 低渗法裂解细 胞 ) 洗 2 遍, 每遍浸泡 3-5min, 以下实验操作可以拿到超净工作台外进行 ;
     4.2 每孔用 200ul wash buffer Ⅰ洗 3 遍, 弃 wash buffer Ⅰ ( 最后一遍后拍干 )
     4.3 稀释 Detection 抗体, 用稀释 buffer(1×PBS+10 % FBS)250 倍稀释, 终浓度 2ug/ml。每孔加入 100ul ;
     4.4 盖上盖子, 室温培养 2 小时。
     5. 加入酶连抗体 :
     5.1 弃 Detection 抗体溶液, 每孔用 200ul wash buffer Ⅰ洗 3 遍。( 最后一遍拍 干);
     5.2 用稀释 buffer 稀释 Streptavidin-HRP( 用稀释 buffer(1×PBS+10% FBS) 稀 释 100 倍。现用现配, 用完多余的弃之 ) 每孔加 100ul ;
     5.3 盖上盖子, 室温培养 1 小时。
     6. 结果检测 :
     6.1 弃 Streptavidin-HRP 溶液, 每孔用 200ul wash buffer Ⅰ洗 4 遍 ;
     6.2 每孔用 200ul wash buffer Ⅱ洗 2 遍 ( 最后一遍拍干 ) ;
     6.3 加入底物 AEC, 每孔加 100ul( 注意避光 )。控制斑点形成约需要 15min ;
     6.4 用去离子水 ( 洗 2 遍 ) 终止底物反应 ;
     6.5 室温避光空气吹干板子 2 小时 - 过夜, 至板子全干, 避光保存板子待检测。 注: 不要将板子放到烤箱中, 防止膜发脆、 破裂。)
     结果 : ELISPOT 的 结 果 是 通 过 最 后 的 板 子 出 斑 的 数 目 来 确 定, 通过肉眼看到 vAd-E2E3 免疫组出斑数目明显增加, 说明经东部马脑炎病毒的刺激后, vAd-E2E3 免疫组小 鼠脾细胞分泌 IFN-γ 活性明显增高, 抗原刺激后 vAd-QE 免疫组小鼠脾细胞分泌 IFN-γ 活 性是对照 vAd-GFP 组的 4 倍, 是 PBS 对照组的 11 倍 ( 根据出斑数目来统计倍数 )。
     三、 攻毒实验
     1、 发病和存活状况
     加强免疫 4 周后, vAd-GFP 对照组、 vAd-E2E3 免疫组和 PBS 对照组的每组处死后剩 余的小鼠在 BSL-3 实验室进行攻毒实验, 再将 8 只小鼠为一组, 分为两组 :
     vAd-GFP 对照组 A : 腹腔注射 215 个 LD50( 半数致死剂量 ) 东部马脑炎病毒
     vAd-GFP 对照组 B : 腹腔注射 21 个 LD50 东部马脑炎病毒
     vAd-E2E3 免疫组 A : 腹腔注射 215 个 LD50( 半数致死剂量 ) 东部马脑炎病毒
     vAd-E2E3 免疫组 B : 腹腔注射 21 个 LD50 东部马脑炎病毒
     PBS 对照组 A : 腹腔注射 215 个 LD50( 半数致死剂量 ) 东部马脑炎病毒
     PBS 对照组 B : 腹腔注射 21 个 LD50 东部马脑炎病毒
     持续 4 周观察小鼠发病和存活状况。
     结果为加强免疫 4 周后, 215 个 LD50 的东部马脑炎病毒攻击后, vAd-E2E3 免疫组 A 的保护效率为 0(8 只小鼠都死亡 ) ; 21 个 LD50 东部马脑炎病毒攻击时, vAd-E2E3 免疫组
     B 的保护率仅为 25% (8 只小鼠死亡 6 只 ) ; 对照组 (vAd-GFP 对照组 A、 vAd-GFP 对照组 B、 PBS 对照组 A、 PBS 对照组 B) 均无保护作用 (8 只小鼠都死亡 )。保护率是最后存活小鼠的 数量与其攻毒前小鼠的数量比值。
     2、 利用 BHK 细胞单层测定小鼠血清中和抗体
     收集上述攻毒后的各组小鼠的血清, 利用 BHK 细胞 (Invitrogen 公司产品, Cat. No.R760-07) 单层测定小鼠血清中和抗体。先将免疫小鼠血清适当稀释后, 置 56℃水浴中 处理 30min, 破坏其中的补体和其他不耐热的非特异性毒性因子, 然后以维持液 ( 含有 2% ( 体积百分比 ) 胎牛血清的细胞维持液的配置方法 : 向 500ml DMEM 液体中加入 10ml 胎牛血 清、 100X Antibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 100ul HEPES, 之后用实验室配置的经过过 滤除菌的 7.5% NaHCO3( 质量百分比 ) 调节溶液的 pH 值为 7.0-7.2 ; 上述 DMEM、 胎牛血清、 100X Antibiotic-Antimycotic、 100X NEAA、 HEPES 均为 GIBCO 公司产品 ) 在无菌离心管中 进行 2 倍连续稀释。取 100 个 TCID50 东部马脑炎病毒病毒液和等体积不同稀释度的血清, 充分混匀后置 37℃孵育 1h, 中间上下颠倒离心管混匀液体 1-2 次, 1 小时后取出 96 孔板, 其 内的 BHK 细胞已铺满单层, 吸去细胞单层上的培养基, 加入作用过的病毒 - 抗体混合液 ( 即 上述孵育过的混匀液体, 请核实 ), 培养板上同时设阳性和阴性对照孔 ( 阳性对照为用细胞 维持液稀释为 100 个 TCID50 的东部马脑炎病毒病毒液, 阴性对照为用细胞维持液稀释的不 同浓度的血清, 空白对照为细胞维持液 )。放入含有 5% CO2 的 37℃培养箱中培养, 每天观 察和记录细胞病变的情况。
     中和实验检测血清效价, 具体方法为 : 通过显微镜观察细胞的病变情况 ( 病变时 细胞膨大变圆聚集 ), 当孔内细胞病变达到 90%以上记为 ++++, 细胞病变达到 75%以上记 为 +++, 细胞病变达到 50%以上记为 ++, 细胞病变达到 25%以上记为 +, 无细胞病变记为一, 最后用 Reed-Muench 法计算血清的中和指数。
     结果 : 接种病毒前 vAd-E2E3 免疫组 A 和 vAd-E2E3 免疫组 B 小鼠血清效价均为 1 ∶ 80, 攻毒 4 周后, 接种 21 个 LD50 的东部马脑炎病毒攻击后的 vAd-E2E3 免疫组 B 存活 小鼠的血清效价为 1 ∶ 300, 215 个 LD50 东部马脑炎病毒攻击后的 vAd-E2E3 免疫组 A 的存 活小鼠血清效价则为 1 ∶ 30。而对照组 (vAd-GFP 对照组 A、 vAd-GFP 对照组 B、 PBS 对照组 A、 PBS 对照组 B) 均无特异性抗体的产生。
     结果表明, 所构建的重组腺病毒 vAd-E2E3 产生了较好体液免疫反应, 为进一步开 展免疫保护实验提供了重要的数据支持。10CN 101967185 A
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1、10申请公布号CN101967185A43申请公布日20110209CN101967185ACN101967185A21申请号201010506163922申请日20101009C07K14/18200601C12N15/40200601C12N15/63200601C12N5/10200601C12N1/15200601C12N1/19200601C12N1/21200601C12N7/01200601A61K39/39200601A61K39/12200601A61K48/00200601A61P25/00200601A61P31/1420060171申请人中国人民解放军军事医学科学院微生。

2、物流行病研究所地址100071北京市丰台区东大街20号军医科院微生物流行病研究所72发明人常国辉林磊吴晓燕柳洪涛李靖户义罗彦军张雨孙伟康晓平杨银辉祝庆余74专利代理机构北京纪凯知识产权代理有限公司11245代理人关畅任凤华54发明名称脑炎病毒蛋白及其编码基因与应用57摘要本发明公开了一种脑炎病毒蛋白及其编码基因与应用。本发明提供的蛋白是如下1或2的蛋白1由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白;2将序列2的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由1衍生的蛋白。本发明的实验证明,本发明获得的重组腺病毒VADE2E3有希望成为脑炎基因工程疫苗的候选疫苗。51。

3、INTCL19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书1页说明书8页序列表8页附图1页CN101967185A1/1页21一种蛋白,是如下1或2的蛋白1由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白;2将序列2的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由1衍生的蛋白。2权利要求1所述蛋白的编码基因。3根据权利要求1或2所述编码基因,其特征在于所述编码基因为如下1、2或3或4所示的基因1序列表中序列1所示的DNA分子;2序列表中序列1自5末端第11589位核苷酸所示的DNA分子;3在严格条件下与1或2限定的DNA分子杂交且具有相同功能的DNA分子;4。

4、与1或2限定的DNA序列至少具有90同源性且具有相同功能的DNA分子。4含有权利要求2或3所述编码基因的重组载体、转基因细胞系、重组菌、表达盒或重组病毒。5根据权利要求4所述的重组载体,其特征在于所述重组载体为PADEASY1和重组穿梭质粒经过同源重组得到的;所述重组穿梭质粒是将所述编码基因插入到载体PSHUTTLECMV的多克隆位点间得到的质粒。6根据权利要求4所述的重组病毒,其特征在于所述重组病毒为重组腺病毒;所述重组腺病毒为将所述重组载体转入宿主细胞后,得到的重组腺病毒。7根据权利要求4或6所述的重组病毒,其特征在于所述宿主细胞为真核细胞,优选为离体的哺乳动物细胞,尤其优选为HEK293。

5、细胞。8一种疫苗,它的活性成分为如下任意一种1权利要求1所述的蛋白质;2权利要求2或3所述编码基因;3权利要求4或6或7所述重组腺病毒。9权利要求4或6或7所述重组腺病毒在制备疫苗中的应用,所述疫苗为脑炎病毒疫苗。10权利要求4或6或7所述重组腺病毒在制备提高IFN活性的增强剂中的应用。权利要求书CN101967185A1/8页3脑炎病毒蛋白及其编码基因与应用技术领域0001本发明涉及一种脑炎病毒蛋白及其编码基因与应用。背景技术0002脑炎是由病毒直接侵犯或由病毒或其他异种蛋白引发的超敏反应所致的大脑急性炎症性疾病。脑炎可以是病毒性感染原发的临床表现,或者是继发的临床表现,引起原发的脑炎的病毒。

6、有脊髓灰质炎病毒,埃可病毒、柯萨奇病毒等流行性病毒,或散发性的通过蚊子、蜱等节肢动物传播的黄病毒属的森林脑炎和批膜病毒科甲病毒属的东方马脑炎病毒等。0003甲病毒为披膜病毒科TOGAVIRIDAE甲病毒属ALPHAVIRUS成员,以蚊蜱等吸血昆虫为传播媒介,可引起多种人畜共患传染病。近年来,国外已对多株甲病毒部分或全部序列测序。国内对这类病毒的分子生物学研究亦取得一定的结果。已有的研究结果表明该病毒属中和抗体决定簇主要集中在结构蛋白E1和E2等糖蛋白上,其中E2蛋白上所占比例更高。加之近年来腺病毒载体因具有安全性好、宿主范围广、感染效率高等多种优点,被广泛用于基因治疗和基因工程疫苗研究,为此我。

7、们分析比较了多株甲病毒核苷酸序列,人工合成了同源性较高的3KB的核苷酸,利用腺病毒载体构建重组基因工程疫苗,为预防和治疗疾病奠定了基础。发明内容0004本发明的一个目的是提供一种与脑炎病毒疫苗相关蛋白及其编码基因。0005本发明提供的蛋白E2E3,人工合成,是如下1或2的蛋白00061由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白;00072将序列2的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由1衍生的蛋白质。0008序列表中的序列2由529个氨基酸残基组成,所述一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加为不超过10个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加。00。

8、09上述蛋白质E2E3的编码基因也是本发明保护的范围,所述编码基因为如下14中任一所示的基因00101序列表中序列1所示的DNA分子;00112序列表中序列1自5末端第11589位核苷酸所示的DNA分子;00123在严格条件下与1或2限定的DNA分子杂交且具有相同功能的DNA分子;00134与1或2限定的DNA序列至少具有90同源性且具有相同功能的DNA分子。0014含有上述编码基因的重组载体、转基因细胞系、重组菌、表达盒或重组病毒也是本发明保护的范围。0015所述重组载体为PADEASY1和重组穿梭质粒经过同源重组得到的;所述重组穿梭质粒是在载体PSHUTTLECMV的KPNI和HINDII。

9、I酶切位点间插入所述编码基因得到的。说明书CN101967185A2/8页40016所述重组病毒为重组腺病毒;所述重组腺病毒为将上述蛋白的编码基因转染宿主细胞获得的重组腺病毒。0017所述宿主细胞为真核细胞,优选为离体的哺乳动物细胞,尤其优选为HEK293细胞。0018本发明的另一个目的是提供一种疫苗。0019本发明提供的疫苗,其活性成分为如下任意一种00201所述的蛋白;2所述编码基因;3所述重组腺病毒。0021上述重组腺病毒在制备疫苗中的应用也是本发明保护的范围。0022所述疫苗为脑炎病毒疫苗。0023上述重组腺病毒在制备提高IFN活性的增强剂中的应用也是本发明保护的范围。0024本发明的。

10、实验证明,人工合成E2E3通过转染HEK293细胞而组装成携带有目标抗原基因的重组腺病毒VADE2E3。重组腺病毒VADE2E3感染293细胞能有效表达目的蛋白;通过滴鼻途径接种BALB/C小鼠,利用间接免疫荧光技术检测特异性抗体水平,结果表明,所构建的重组腺病毒虽然产生特异性抗体的时间和维持的水平有所不同,但均产生了较好体液免疫反应,为进一步开展免疫保护实验提供了重要的数据支持。由于病毒在机体内极微量的蛋白表达即可激起免疫反应,因此构建的携带有脑炎病毒结构基因的重组腺病毒VADE2E3,有希望成为脑炎基因工程疫苗的候选疫苗株。附图说明0025图1为PADE2E3酶切鉴定图0026图2为重组质。

11、粒PACI酶切和PCR鉴定具体实施方式0027下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。0028下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。0029东部马脑炎病毒EASTERNEQUINEENCEPHALOMYELITISVIRUSHEJING;CHANGGUOHUI;WUJINSONG;LIZHONGDUO;ZHUQINGYUCLONINGANDEXPRESSIONOFE2GENEOFEASTERNEQUINEENCEPHALOMYELITISVIRUSBULLETINOFTHEACADEMYOFMILITARYMEDICALSCIENCES200202公。

12、众可从中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所获得。0030HEK293细胞INVITROGEN公司产品,CATNOR75007;实验所需限制性内切酶分别购自TAKARA和BIOLABS公司;脂质体LIPOFECTAMIN2000购自INVITROGEN公司;PLATINUMPFXTAQASE购自INVITROGEN公司。0031实施例1、重组腺病毒VADE2E3的获得00321、含有目的基因PADTRACKE2E3的构建及鉴定0033根据东部马脑炎病毒EASTERNEQUINEENCEPHALOMYELITISVIRUSNC001547的基因组序列,突变序列中的多个位点,设计出序列表中。

13、的序列1,人工合成出序列1。0034设计引物扩增编码E2E3蛋白的基因,引物序列引物分别含有KPNI和HINDIII说明书CN101967185A3/8页5酶切位点见下0035E2E3F5ACGGGGTACCATGTCACTAGTGACCACCATGTGTCT30036E2E3R5ACCCAAGCTTACTAAAAAAGGCACGACACAG30037以人工合成出序列1的DNA为模板,利用E2E3F和E2E3R引物对进行PCR反应,得到的PCR产物经1的琼脂糖凝胶电泳鉴定,得到了预期大小一致的片段,约为15KB。0038经测序,该PCR产物具有序列表中的序列1自5末端第11589位核苷酸,将该。

14、PCR产物的基因命名E2E3,其OFR为序列1的自5末端第11589位核苷酸,该基因编码的蛋白命名为E2E3,该蛋白的氨基酸序列为序列表中的序列2,序列2由529个氨基酸残基组成。0039回收PCR产物,对PCR产物进行加“A”处理,处理后的PCR样品与PMD18T载体TAKARA公司产品,CODED101ALOTCK3201A相连,转化DH5A感受态细胞,挑取阳性菌落提取质粒后测序验证,结果为该质粒为将序列表中序列1的自5末端第11589位核苷酸插入PMD18T得到的,命名为PTE2E3。0040用KPNI和HINDIII双酶切重组质粒PTE2E3和质粒PSHUTTLECMVINVITROG。

15、EN公司产品,CATALOG240007,酶切产物分别用凝胶回收试剂盒切胶回收,并在T4DNA连接酶作用下于16连接过夜,连接产物转化大肠杆菌DH10BINVITROGEN公司产品,CATNO18290015后挑选阳性克隆,提取质粒进行测序,结果为该质粒为将序列表中序列1的自5末端第11589位核苷酸插入PSHUTTLECMV的KPNI和HINDIII酶切位点间得到的载体,命名为PADTRACKE2E3。00412、重组腺病毒载体的构建0042菌BJ5183购自上海杰美基因医药科技有限公司,货号为GMS122232。0043将腺病毒骨架质粒PADEASY1INVITROGEN公司产品,CATA。

16、LOG240005,含有GFP报告基因经过PACI购自BIOLABS公司,货号为R05647S酶切后,转入宿主菌BJ5183中,得到含有腺病毒骨架质粒PADEASY1的宿主菌BJ5183。0044将上述PADTRACKE2E3和穿梭质粒PSHUTTLECMV用PMEI购自BIOLABS公司,货号为R0560S经37充分消化,使用GELEXTRACTIONKIT试剂盒购自OMGEA公司,货号为D250001回收线性化的PADTRACKE2E3和PSHUTTLECMV。0045将线性化的质粒PADTRACKE2E3电转化到含有腺病毒骨架质粒PADEASY1的宿主菌BJ5183感受态细胞中,由于大肠。

17、杆菌BJ5183具有SM抗性,PADEASY1具有AMP抗性,而重组质粒PADTRACKE2E3和穿梭载体质粒PSHUTTLECMV具有KAN抗性,在重组过程中穿梭质粒上的KAN抗性取代了PADEASY1上的AMP抗性,因此根据KAN和SM双重抗性来筛选阳性克隆,得到的阳性克隆。0046提取转入线性化的质粒PADTRACKE2E3的阳性克隆的质粒进行PACI酶切鉴定,1DNA凝胶电泳结果见图1所示1PADTRACKE2E32阳性克隆质粒3PSHUTTLECMV4PADEASY15DL15000MARKER,从图中可以看出泳道1重组穿梭质粒PADTACKQE经过PACI酶切后,产生2个片段,其中。

18、一个含有目的基因E2E3约7KB,另一个片段含有穿梭质粒PSHUTTLECMV上的复制子和卡那霉素抗性基因大小约3KB,泳道2经过PACI酶切后,产生2个片段,所产生的小片段的大小为45KB,含有复制子和卡那霉素抗性基因,大片度为含有目的基因的E2E3的病毒骨架大小约为35KB病毒骨架大小约335KB而目的基因说明书CN101967185A4/8页6E2E315KB。将该重组质粒命名为重组质粒PADE2E3。0047提取转入线性化的质粒PADTRACKE2E3的阳性克隆的质粒进行PCR鉴定,引物为E2E3F、E2E3R,结果见图2所示,1PSHUTTLECMV2PADTRACKE2E33PAD。

19、E2E34PADEASY15DL15000MARKER,可以看出,重组质粒PADE2E3可扩增出与预期的目的片度15KB,进一步说明说明已经成功构建携带有目的基因E2E3的重组腺病毒骨架质粒PADE2E3。00483、组装成重组腺病毒0049将HEK293细胞接种到6孔板中,37培养,细胞生长至6070,用脂质体LIPOFECTAMIN2000购自INVITROGEN公司介导重组腺病毒骨架质粒PADE2E3转染入细胞中,转染完成710天后,收集细胞,经3轮反复冻融,离心收集上清液,即为含有目的基因的重组腺病毒VADE2E3。转染实验按照说明书进行,培养710天,定期在荧光显微镜下检测是否产生荧。

20、光,判断转染是否成功,由于该重组病毒上含有绿色荧光蛋白GFP的报告基因。00504、重组腺病毒VADE2E3的扩增及目的蛋白的表达00511重组腺病毒VADE2E3的扩增0052将上述3获得的转染完成710天后,收集细胞,经3轮反复冻融,离心收集上清液,即为重组腺病毒VADE2E3,进行下一代扩增,连续扩增3代,第二次收集上清液,比第一次数量增多。00532目的蛋白的表达0054取200UL上述获得的第二次收集的上清液重组腺病毒VADE2E3,病毒的浓度为LGTCID50/02ML80感染5X106的HEK293细胞,4天后,收集细胞。细胞经处理后进行SDSPAGE电泳。结果为经SDS电泳,得。

21、到大小为110KD的蛋白E2E3蛋白,与预期蛋白的大小一致。说明重组腺病毒有效的介导E2E3在细胞中表达。0055采用同样的方法将上述线性化的PSHUTTLECMV和PADEASY1共同转入宿主菌BJ5183感受态细胞中,得到重组腺病毒载体,记作PADGFP;将PADGFP转染HEK293细胞,获得阴性对照腺病毒VADGFP。对照腺病毒VADGFP中无E2E3蛋白表达。0056实施例2、重组腺病毒VADE2E3的滴鼻接种中和抗体测定005767周龄的BALB/C小鼠随机分为3组,分别为VADGFP对照组和VADE2E3免疫组,每组20只小鼠。0058VADGFP对照组拭鼻方式感染20UL由实施。

22、例1获得对照腺病毒VADGFP108PFU。0059VADE2E3免疫组拭鼻方式感染20UL由实施例1获得的重组腺病毒VADE2E3108PFU。0060PBS对照组拭鼻方式感染20ULPBS溶液001M/LPH720061一、血清和淋巴细胞检测0062将3个小组在第一次免疫后的第4周加强免疫一次。在免疫后每间隔一周时间通过尾静脉采集小鼠血液,离心后分别收集血清和淋巴细胞沉淀。00631、间接免疫荧光试验测定免疫小鼠血清中病毒的抗体反应0064用东部马脑炎病毒EASTERNEQUINEENCEPHALOMYELITISVIRUS感染的HEK293说明书CN101967185A5/8页7制备抗原。

23、片,制备的方法如下所述0065实验前准备把抗原片摆放在抗原架上,每个架上排放2排,1排4个,完毕后用罩子盖上防止灰尘的进入。之后按照下面步骤进行00661待75CM2方瓶的HEK293细胞生长至80左右的时候,用东部马脑炎病毒2ML感染细胞1小时后,吸出吸附液,补加新鲜的细胞维持液,放入培养箱中培养;00672当细胞出现细胞病变的时候约2550,按照细胞传代的方法消化细胞,用适量体积的培养液含有10胎牛血清的DMEM细胞生长液,具体配方向500MLDMEM液体中加入50ML胎牛血清、100XANTIBIOTICANTIMYCOTIC、100XNEAA、100ULHEPES,之后用实验室配制的经。

24、过022UM滤膜过滤除菌的75质量百分含量NAHCO3调节溶液的PH值至7072,上述液体均为GIBCO公司产品;3ML悬浮细胞,每个抗原孔加入40UL细胞悬液,盖上盖子后放入培养箱中继续培养8小时;00683取一烧杯内盛PBS溶液001MOL/LPH72,将吸附后的抗原片缓缓放入溶液中,浸泡1MIN左右,取出放在工作台内晾干,约需30MIN;00694将抗原片放入盛有丙酮国药集团化学试剂有限公司分析纯浓度995的烧杯中,2030MIN或者过夜;00705取出晾干后保存于低温40以下冰箱中备用。0071间接免疫荧光法采集小鼠全血后放置于37培养箱孵育30MIN,经800RPM离心15MIN后吸。

25、取上清得到血清。之后将血清按照实验要求进行稀释后进行间接免疫荧光实验,具体实验步骤如下00721从冰箱中取出抗原片,肉眼观察上面的细胞是否脱落,如果有脱落孔,放弃不用;00732在抗原片上用蜡笔在吸附有抗原的画圈周围划一圈,防止所加样品溢流;00743根据实验的需要稀释所检测的血清后加样,每孔2025UL,一般需要做复孔,故需要50UL,根据需要做倍比稀释;0075首浓度按照110,故需要加入10UL血清90UL抗体稀释液,在漩涡混合器上充分混匀后取出50UL110稀释液50UL血清稀释液120,依此稀释下去,一般稀释至1160;00764把已经加样的抗原片放入铺有塑料板的饭盒中,放入37、5。

26、CO2培养箱中孵育30MIN;00775取出抗原片,放入洗板槽内,向里面加入洗涤液0005MPBS002体积百分含量TWEEN20,在水平振荡器上洗涤5MIN,重复3次;00786待抗原片完全风干后,加入150稀释的荧光抗体25UL/孔,放入饭盒后在37、5CO2培养箱中孵育30MIN;0079荧光抗体的稀释取出针对所加入血清来源的适量荧光抗体,用002质量百分含量伊文斯兰溶液按照150稀释抗体,该实验所使用的抗体为FITCCONJUGATEGOATANTIHUMANIGG购自SIGMA公司。00807重复步骤5;00818风干后,滴加无菌水在荧光显微镜下观察荧光情况并记录结果。0082利用间。

27、接免疫荧光试验测,结果显示在首次免疫2周后小鼠血清抗体水平开始升说明书CN101967185A6/8页8高,效价达至180,3周后降至较低水平;血清效价为130。加强免疫后,抗体水平再次迅速升高,升高幅度比首次免疫整体要高。加免后1周达至达到1160,并持续至4周左右,而对照组VADGFP和PBS始终未检测出特异性抗体。00832、流式分析淋巴细胞中CD4、CD8数0084流式分析淋巴细胞中CD4、CD8数,结果如下0085免疫小鼠中,VADE2E3免疫1周后CD4淋巴细胞占总淋巴细胞的8,2周以后恢复至正常水平约占5,加强免疫后,VADE2E3免疫组CD4淋巴细胞开始持续升高,由占总淋巴细胞。

28、的5上升至25,而PBS对照组以及VADGFP组CD4淋巴细胞一直占总淋巴细胞的5,无明显的改变。0086免疫组小鼠中,VADE2E3免疫1周后达至高峰,CD8淋巴细胞占总淋巴细胞的17,随后恢复至正常水平约占2,在首免后3周CD8淋巴细胞数量再次升高占总淋巴细胞的3;加强免疫后,VADE2E3免疫组CD8淋巴细胞开始持续升高,在免疫2周后达至峰值约占总淋巴细胞的12,3周后下降至正常水平2,4周后又缓慢升至较高水平约占8,而PBS对照组以及VADGFP组CD8淋巴细胞一直占总淋巴细胞的7。0087二、利用酶联免疫斑点试验ELISPOT对细胞因子生成细胞进行定量0088加强免疫4周后,每组随机。

29、挑选4只小鼠,处死后立即无菌采取脾脏,加入10ML含有10胎牛血清的1640培养液含有10胎牛血清的1640培养液向500MLRPMIMEDIUM1640液体中加入50ML胎牛血清、100XANTIBIOTICANTIMYCOTIC、100XNEAA、100ULHEPES,之后用实验室配置的经过过滤除菌的75NAHCO3质量百分比调节溶液的PH值为7072;上述RPMIMEDIUM1640、胎牛血清、100XANTIBIOTICANTIMYCOTIC、100XNEAA、HEPES均为GIBCO公司产品;RPMIMEDIUM1640GIBC0公司产品,LOT8109086,将脾组织通过200目铜。

30、网制成细胞悬液,收集到无菌的离心管中,15000RPM/MIN离心5MIN,弃上清液后用1640培养基离心洗涤细胞两次,最后将脾细胞稀释成2107个/ML,制成细胞悬液备用。以细胞培养的东部马脑炎病毒作为特异刺激因子将2107个/ML个脾细胞108PFU的东部马脑炎病毒混合,共同孵育48小时,按照ELISPOT实验的操作,脾细胞与特异的刺激因子要分别加入到孔中,之后在孔内反应,不能在孔外混合后加入其内,利用酶联免疫斑点试验ELISPOT对细胞因子生成细胞进行定量。0089具体的实验步骤00901COATINGANTIBODY包被抗体无菌条件下进行0091用COATINGBUFFER1PBSPH。

31、72稀释CAPTURE抗体200倍,终浓度5UG/ML包被板子,每孔加100UL稀释的CAPTURE抗体4过夜。00922BLOCKING封闭无菌条件下进行0093吸干孔中包被液,洗板子,每孔加入200ULBLOCKING溶液,洗孔一次。在灭菌吸水纸上扣干00943CELLACTIVATION刺激细胞无菌条件下进行009531弃BLOCKING溶液,准备刺激用的抗原,用组织完全培养基稀释适宜浓度50UG/ML,每孔加入100UL;不要拍板子009632准备1106个脾细胞悬液,每孔加入100UL;注避免震动009733盖上盖子,板子放置37,5CO2,99湿度的培养箱根据细胞情况培养48小说明。

32、书CN101967185A7/8页9时。0098注时刻避免碰撞00994DETECTIONANTIBODY检测抗体010041在无菌条件下吸去细胞悬液,用去离子水冰冷的去离子水,低渗法裂解细胞洗2遍,每遍浸泡35MIN,以下实验操作可以拿到超净工作台外进行;010142每孔用200ULWASHBUFFER洗3遍,弃WASHBUFFER最后一遍后拍干010243稀释DETECTION抗体,用稀释BUFFER1PBS10FBS250倍稀释,终浓度2UG/ML。每孔加入100UL;010344盖上盖子,室温培养2小时。01045加入酶连抗体010551弃DETECTION抗体溶液,每孔用200ULW。

33、ASHBUFFER洗3遍。最后一遍拍干;010652用稀释BUFFER稀释STREPTAVIDINHRP用稀释BUFFER1PBS10FBS稀释100倍。现用现配,用完多余的弃之每孔加100UL;010753盖上盖子,室温培养1小时。01086结果检测010961弃STREPTAVIDINHRP溶液,每孔用200ULWASHBUFFER洗4遍;011062每孔用200ULWASHBUFFER洗2遍最后一遍拍干;011163加入底物AEC,每孔加100UL注意避光。控制斑点形成约需要15MIN;011264用去离子水洗2遍终止底物反应;011365室温避光空气吹干板子2小时过夜,至板子全干,避光。

34、保存板子待检测。注不要将板子放到烤箱中,防止膜发脆、破裂。0114结果ELISPOT的结果是通过最后的板子出斑的数目来确定,通过肉眼看到VADE2E3免疫组出斑数目明显增加,说明经东部马脑炎病毒的刺激后,VADE2E3免疫组小鼠脾细胞分泌IFN活性明显增高,抗原刺激后VADQE免疫组小鼠脾细胞分泌IFN活性是对照VADGFP组的4倍,是PBS对照组的11倍根据出斑数目来统计倍数。0115三、攻毒实验01161、发病和存活状况0117加强免疫4周后,VADGFP对照组、VADE2E3免疫组和PBS对照组的每组处死后剩余的小鼠在BSL3实验室进行攻毒实验,再将8只小鼠为一组,分为两组0118VAD。

35、GFP对照组A腹腔注射215个LD50半数致死剂量东部马脑炎病毒0119VADGFP对照组B腹腔注射21个LD50东部马脑炎病毒0120VADE2E3免疫组A腹腔注射215个LD50半数致死剂量东部马脑炎病毒0121VADE2E3免疫组B腹腔注射21个LD50东部马脑炎病毒0122PBS对照组A腹腔注射215个LD50半数致死剂量东部马脑炎病毒0123PBS对照组B腹腔注射21个LD50东部马脑炎病毒0124持续4周观察小鼠发病和存活状况。0125结果为加强免疫4周后,215个LD50的东部马脑炎病毒攻击后,VADE2E3免疫组A的保护效率为08只小鼠都死亡;21个LD50东部马脑炎病毒攻击时。

36、,VADE2E3免疫组说明书CN101967185A8/8页10B的保护率仅为258只小鼠死亡6只;对照组VADGFP对照组A、VADGFP对照组B、PBS对照组A、PBS对照组B均无保护作用8只小鼠都死亡。保护率是最后存活小鼠的数量与其攻毒前小鼠的数量比值。01262、利用BHK细胞单层测定小鼠血清中和抗体0127收集上述攻毒后的各组小鼠的血清,利用BHK细胞INVITROGEN公司产品,CATNOR76007单层测定小鼠血清中和抗体。先将免疫小鼠血清适当稀释后,置56水浴中处理30MIN,破坏其中的补体和其他不耐热的非特异性毒性因子,然后以维持液含有2体积百分比胎牛血清的细胞维持液的配置方。

37、法向500MLDMEM液体中加入10ML胎牛血清、100XANTIBIOTICANTIMYCOTIC、100XNEAA、100ULHEPES,之后用实验室配置的经过过滤除菌的75NAHCO3质量百分比调节溶液的PH值为7072;上述DMEM、胎牛血清、100XANTIBIOTICANTIMYCOTIC、100XNEAA、HEPES均为GIBCO公司产品在无菌离心管中进行2倍连续稀释。取100个TCID50东部马脑炎病毒病毒液和等体积不同稀释度的血清,充分混匀后置37孵育1H,中间上下颠倒离心管混匀液体12次,1小时后取出96孔板,其内的BHK细胞已铺满单层,吸去细胞单层上的培养基,加入作用过的。

38、病毒抗体混合液即上述孵育过的混匀液体,请核实,培养板上同时设阳性和阴性对照孔阳性对照为用细胞维持液稀释为100个TCID50的东部马脑炎病毒病毒液,阴性对照为用细胞维持液稀释的不同浓度的血清,空白对照为细胞维持液。放入含有5CO2的37培养箱中培养,每天观察和记录细胞病变的情况。0128中和实验检测血清效价,具体方法为通过显微镜观察细胞的病变情况病变时细胞膨大变圆聚集,当孔内细胞病变达到90以上记为,细胞病变达到75以上记为,细胞病变达到50以上记为,细胞病变达到25以上记为,无细胞病变记为一,最后用REEDMUENCH法计算血清的中和指数。0129结果接种病毒前VADE2E3免疫组A和VAD。

39、E2E3免疫组B小鼠血清效价均为180,攻毒4周后,接种21个LD50的东部马脑炎病毒攻击后的VADE2E3免疫组B存活小鼠的血清效价为1300,215个LD50东部马脑炎病毒攻击后的VADE2E3免疫组A的存活小鼠血清效价则为130。而对照组VADGFP对照组A、VADGFP对照组B、PBS对照组A、PBS对照组B均无特异性抗体的产生。0130结果表明,所构建的重组腺病毒VADE2E3产生了较好体液免疫反应,为进一步开展免疫保护实验提供了重要的数据支持。说明书CN101967185A1/8页1100010002序列表CN101967185A2/8页120003序列表CN101967185A3/8页130004序列表CN101967185A4/8页140005序列表CN101967185A5/8页150006序列表CN101967185A6/8页160007序列表CN101967185A7/8页170008序列表CN101967185A8/8页18序列表CN101967185A1/1页19图1图2说明书附图。

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