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1、10申请公布号CN104105489A43申请公布日20141015CN104105489A21申请号201280049450922申请日2012080861/521,29520110808US61/620,34820120404US61/620,33120120404US61/620,34320120404USA61K31/7052200601A61K31/70200601A61K31/404200601A61K31/35200601A61P29/00200601A61P37/0020060171申请人加州理工学院地址美国加利福尼亚州申请人博伊斯汤普生植物研究所72发明人安德烈乔伊保罗沃伦斯。
2、腾伯格弗兰克克莱门斯施罗德史蒂芬海恩里希凡罗伊斯74专利代理机构北京安信方达知识产权代理有限公司11262代理人王思琪郑霞54发明名称线虫小分子的应用57摘要本发明涉及使用某些调节剂化合物治疗免疫性疾患和/或炎症的方法。在一个实施方案中,本发明提供通过施用包含治疗有效剂量的蛔苷化合物、或蛔苷化合物的混合物、或含有至少一种蛔苷的化合物的混合物的组合物治疗免疫性和炎性疾患疾患的方法。30优先权数据85PCT国际申请进入国家阶段日2014040886PCT国际申请的申请数据PCT/US2012/0500312012080887PCT国际申请的公布数据WO2013/022996EN2013021451。
3、INTCL权利要求书3页说明书28页附图10页19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书3页说明书28页附图10页10申请公布号CN104105489ACN104105489A1/3页21一种缓解、治疗或预防受试者中的疾患的方法,所述方法包括提供包含下式的化合物(式I)、或其药学等同物、衍生物、类似物和/或盐的组合物;以及向所述受试者施用治疗有效剂量的所述组合物。2如权利要求1所述的方法,其中所述疾患为炎性和/或免疫性疾患。3如权利要求1所述的方法,其中R1为H、CR3、OR、NR2、卤素、烷基、卤代烷基、烯基或卤代烯基。4如权利要求1所述的方法,其中R1为不存在、H、CR3、。
4、OR、NR2、卤素、烷基、卤代烷基、烯基或卤代烯基。5如权利要求1所述的方法,其中R2为下式部分(式II)、或其药学等同物、衍生物、类似物和/或盐。6如权利要求1所述的方法,其中R3为H、CR6R7R8、COR8、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖、或连接至另一式I单元的R5的键。7如权利要求1所述的方法,其中R4为H、CR6R7R8、COR8、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖、或连接至另一式I单元的R5的键。8如权利要求1所述的方法。
5、,其中R5为H、OH、OR6、OCR6R7R8、CR6R7R8、NH2、NHR6、NR6R7、卤素、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖或连接至另一式I单元的R3或R4的键。9如权利要求1所述的方法,其中所述疾患为寻常痤疮、哮喘、自身免疫性疾病、乳糜泻、慢性前列腺炎、肾小球肾炎、超敏反应、炎性肠疾病、盆腔炎性疾病、再灌注损伤、类风湿性关节炎、结节病、移植排斥反应、血管炎、间质性膀胱炎、红斑狼疮、硬皮病、某些类型的溶血贫血、一型糖尿病、格雷夫斯病、多发性硬化、古德帕斯彻综合征、恶性贫血、一些类型的肌病、季节性过。
6、敏症、肥大细胞增多症、常年过敏、过敏反应、食物过敏、过敏性鼻炎、特应性权利要求书CN104105489A2/3页3皮炎和/或自闭症。10如权利要求1所述的方法,其中所述疾患为哮喘。11如权利要求1所述的方法,其中所述受试者为人。12如权利要求1所述的方法,其中所述受试者选自由以下组成的组中灵长类、人、马科动物、马、牛、奶牛、猪、绵羊、啮齿类动物、大鼠、宠物、猫、狗和豚鼠。13如权利要求1所述的方法,其中所述组合物包含选自由以下组成的组中的一种或多种化合物ASCR1、ASCR3、ASCR7、ASCR8、ASCR9和ASCR10。14一种减少受试者中炎症的方法,所述方法包括提供包含下式的化合物(式。
7、I)、或其药学等同物、衍生物、类似物和/或盐的组合物;以及向所述受试者施用有效剂量的所述组合物。15如权利要求14所述的方法,其中R1为H、CR3、OR、NR2、卤素、烷基、卤代烷基、烯基或卤代烯基。16如权利要求14所述的方法,其中R1为不存在、H、CR3、OR、NR2、卤素、烷基、卤代烷基、烯基或卤代烯基。17如权利要求14所述的方法,其中R2为下式部分(式II)、或其药学等同物、衍生物、类似物和/或盐。18如权利要求14所述的方法,其中R3为H、CR6R7R8、COR8、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖、或。
8、连接至另一式I单元的R5的键。19如权利要求14所述的方法,其中R4为H、CR6R7R8、COR8、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖、或连接至另一式I单元的R5的键。20如权利要求14所述的方法,其中R5为H、OH、OR6、OCR6R7R8、CR6R7R8、NH2、NHR6、NR6R7、卤素、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂环基、环烷基、环烯权利要求书CN104105489A3/3页4基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖或连接至另一式I单元的R3或R4的键。21如权利要求14所。
9、述的方法,所述方法还包括减少所述受试者中的嗜酸性粒细胞。22如权利要求14所述的方法,所述方法还包括减少所述受试者中的粘液产生。23如权利要求14所述的方法,其中所述受试者为人。24如权利要求14所述的方法,其中所述受试者选自由以下组成的组中灵长类、人、马科动物、马、牛、奶牛、猪、绵羊、啮齿类动物、大鼠、宠物、狗和豚鼠。25如权利要求14所述的方法,其中所述组合物包含选自由以下组成的组中的一种或多种化合物ASCR1、ASCR3、ASCR7、ASCR8、ASCR9和ASCR10。26如权利要求14所述的方法,其中所述组合物包含由线虫产生的天然存在的蛔苷。27如权利要求14所述的方法,其中所述组合。
10、物包含由巴西日圆线虫(NIPPOSTRONGYLUSBRASILIENSIS)产生的天然存在的蛔苷。28如权利要求14所述的方法,其中所述炎症与以下相关寻常痤疮、哮喘、自身免疫性疾病、乳糜泻、慢性前列腺炎、肾小球肾炎、超敏反应、炎性肠疾病、盆腔炎性疾病、再灌注损伤、类风湿性关节炎、结节病、移植排斥反应、血管炎、间质性膀胱炎、红斑狼疮、硬皮病、某些类型的溶血贫血、一型糖尿病、格雷夫斯病、多发性硬化、古德帕斯彻综合征、恶性贫血、一些类型的肌病、季节性过敏症、肥大细胞增多症、常年过敏、过敏反应、食物过敏、过敏性鼻炎、特应性皮炎和/或自闭症。权利要求书CN104105489A1/28页5线虫小分子的应。
11、用0001政府的权利0002本发明根据NIH协议号GM085285在美国政府支持下做出。美国政府在本发明中拥有一定的权利。发明领域0003本发明涉及生物技术领域,具体涉及免疫调节和线虫(NEMATODE)。0004发明背景0005本文中所有出版物以与犹如每个单独出版物或专利申请被具体和单独指明通过引用并入的相同程度通过引用并入。下面的描述包括可有助于理解本发明的信息。其不是对本部分所提供的任何信息是现有技术或与目前所要求保护的发明相关、或具体或含蓄地引用的任何出版物是现有技术的承认。0006线虫是世界上最丰富的动物,发现其栖息在硫磺沉积物、深海海沟、人淋巴结、猪的肠道、植物的根、鲸的胎盘、北极。
12、的冰、和许多其它的生态系统中,使其成为地球上最成功的动物群之一。已知许多种线虫物种寄生在人中;这一关系被认为已经存在了数千年。0007工业化世界中免疫性疾患的上升一直伴随特有寄生的下降,导致以下病原学理论人类正在创造不合适的免疫应答,而该免疫应答此前一直专注于克服寄生虫的抑制机制。线虫已被用于治疗一些免疫性疾患。在本领域中存在开发治疗、减轻和/或预防代替活生物体的不利免疫应答和/或疾患的新化合物和方法的需求。0008发明概述0009由线虫特定产生的小分子可模拟线虫的存在,并且因此可被用来促进健康。各种实施方案包括减轻、治疗或预防受试者中的疾患的方法,所述方法包括提供包含下式的化合物0010(式。
13、I)或其药学等同物、衍生物、类似物和/或盐的组合物,以及向所述受试者施用治疗有效剂量的所述组合物。在另一实施方案中,所述疾患为炎性和/或免疫性疾患。在另一实施方案中,R1为H、CR3、OR、NR2、卤素、烷基、卤代烷基、烯基或卤代烯基。在另一实施方案中,R1为不存在、H、CR3、OR、NR2、卤素、烷基、卤代烷基、烯基或卤代烯基。在另一实施方案中,R2为下式部分说明书CN104105489A2/28页60011(式II)或其药学等同物、衍生物、类似物和/或盐。在另一实施方案中,R3为H、CR6R7R8、COR8、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸。
14、、核苷、具有5或6个碳原子的单糖、或连接至另一式I单元的R5的键。在另一实施方案中,R4为H、CR6R7R8、COR8、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖、或连接至另一式I单元的R5的键。在另一实施方案中,R5为H、OH、OR6、OCR6R7R8、CR6R7R8、NH2、NHR6、NR6R7、卤素、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖或连接至另一式I单元的R3或R4的键。在另一实施方案中,所述疾患为寻常痤疮、哮喘、自身免疫性疾病、。
15、乳糜泻、慢性前列腺炎、肾小球肾炎、超敏反应、炎性肠疾病、盆腔炎性疾病、再灌注损伤、类风湿性关节炎、结节病、移植排斥反应、血管炎、间质性膀胱炎、红斑狼疮、硬皮病、某些类型的溶血贫血、一型糖尿病、格雷夫斯病、多发性硬化、古德帕斯彻综合征、恶性贫血、一些类型的肌病、季节性过敏症、肥大细胞增多症、常年过敏、过敏反应、食物过敏、过敏性鼻炎、特应性皮炎和/或自闭症。在另一实施方案中,所述疾患为哮喘。在另一实施方案中,所述受试者为人。在另一实施方案中,所述受试者选自由以下组成的组中灵长类、人、马科动物、马、牛CATTLE、奶牛COW、猪、绵羊、啮齿类动物、大鼠、宠物、猫、狗和豚鼠。在另一实施方案中,所述组合。
16、物包含选自由以下组成的组中的一种或多种化合物ASCR1、ASCR3、ASCR7、ASCR8、ASCR9和ASCR10。0012其它实施方案包括减少受试者中的炎症的方法,所述方法包括提供包含下式的化合物0013(式I)或其药学等同物、衍生物、类似物和/或盐的组合物,以及向所述受试者施用治疗有效剂量的所述组合物。在另一实施方案中,R1为H、CR3、OR、NR2、卤素、烷基、卤代烷基、烯基或卤代烯基。在另一实施方案中,R1为不存在、H、CR3、OR、NR2、卤素、烷基、卤代烷基、烯基或卤代烯基。在另一实施方案中,R2为下式部分说明书CN104105489A3/28页70014(式II)或其药学等同物。
17、、衍生物、类似物和/或盐。在另一实施方案中,R3为H、CR6R7R8、COR8、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖、或连接至另一式I单元的R5的键。在另一实施方案中,R4为H、CR6R7R8、COR8、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、杂环基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖、或连接至另一式I单元的R5的键。在另一实施方案中,R5为H、OH、OR6、OCR6R7R8、CR6R7R8、NH2、NHR6、NR6R7、卤素、烷基、卤代烷基、烯基、卤代烯基、芳基、杂芳基、芳烷基、杂环。
18、基、环烷基、环烯基、酰基、氨基酸、核苷、具有5或6个碳原子的单糖或连接至另一式I单元的R3或R4的键。在另一实施方案中,还包括减少所述受试者中的嗜酸性粒细胞。在另一实施方案中,还包括减少所述受试者中的粘液产生。在另一实施方案中,所述受试者为人。在另一实施方案中,所述受试者选自由以下组成的组中灵长类、人、马科动物、马、牛、奶牛、猪、绵羊、啮齿类动物、大鼠、宠物、狗和豚鼠。在另一实施方案中,所述组合物包含选自由以下组成的组中的一种或多种化合物ASCR1、ASCR3、ASCR7、ASCR8、ASCR9和ASCR10。在另一实施方案中,所述组合物包含由线虫天然产生的蛔苷(ASCAROSIDE)。在另一。
19、实施方案中,所述组合物包含由巴西日圆线虫(NIPPOSTRONGYLUSBRASILIENSIS)天然产生的蛔苷。在另一实施方案中,所述炎症与以下相关寻常痤疮、哮喘、自身免疫性疾病、乳糜泻、慢性前列腺炎、肾小球肾炎、超敏反应、炎性肠疾病、盆腔炎性疾病、再灌注损伤、类风湿性关节炎、结节病、移植排斥反应、血管炎、间质性膀胱炎、红斑狼疮、硬皮病、某些类型的溶血贫血、一型糖尿病、格雷夫斯病、多发性硬化、古德帕斯彻综合征、恶性贫血、一些类型的肌病、季节性过敏症、肥大细胞增多症、常年过敏、过敏反应、食物过敏、过敏性鼻炎、特应性皮炎和/或自闭症。0015由下面的详述结合以举例方式说明本发明的各种实施方案的附。
20、图,本发明的其它特征和优势将变得明显。0016附图简述0017示例性实施方案以所引用的附图被说明。本文所公开的实施方案和附图意图被视为说明性的而非限制性的。0018图1描述,根据本文中的实施方案,揭示在全齿复活线虫(PANAGRELLUSREDIVIVUS)中的性别特异性配偶寻找(MATENDING)信号的趋化测定法(CHEMOATTRACTIONASSAY)。图1A描述趋化测定法。透明模板被附加在具有16MM细菌菌苔的5CM的板下面以勾画其中放置了06L实验样品和对照样品的两个评分区。10只全齿复活线虫雄虫被放置在距两个评分区距离相等的点上,并且板被记录持续20分钟(以1秒/帧的速率)。图1。
21、B描述对每个评分区使用计算虫(WORM)像素占总像素的比例的软件测量吸引(左图)。输出为用于两个评分区的虫占据率对时间的曲线图(右图)。所示的图表明实验样品对全齿复活线虫雄虫的强烈吸引。说明书CN104105489A4/28页80019图2描述,根据本文中的实施方案,全齿复活线虫中雌性性信息素的纯化。图2A描述,全齿复活线虫在混合性别液体培养物中生长,并且总上清使用C18固相萃取法、离子交换法和高效液相色谱法分级分离。雄性吸引通过吸引生物测定法来测量(见图1)。图2B描述,总虫水通过C18SPE使用50MEOH和90MEOH萃取分开,组合级分(总)与50MEOH级分二者均具有显著雄性吸引。图2。
22、C描述,50MEOH级分使用离子交换法细分,阳离子级分没有雄性吸引而在500MM与1M阴离子级分均有显著的吸引。图2D描述,500MM与1M阴离子级分使用HPLC进一步被细分。在10分钟时洗脱的化合物产生完全的雄性吸引,然后该化合物使用液相色谱质谱法(LCMS)和核磁共振法(NMR)被鉴定为ASCR1。图2E描述,然后ASCR1被合成和以不同的剂量测试,显示雄虫被在102FMOL与106FMOL之间的浓度的ASCR1吸引,而雌虫没有被在100FMOL与106FMOL之间的浓度的ASCR1吸引。误差棒,SDP值使用学生T检验(STUDENTSTTEST)确定。P005的任何结果。0023图6描述。
23、,根据本文中的实施方案,在线虫和细菌中信号分子类似装配。N酰基高丝氨酸内酯(AHL)在细菌群体感知(BACTERIALQUORUMSENSING)中发挥重要的作用,并且由许多革兰氏阴性细菌及一些革兰氏阳性细菌产生和感知。所有AHL均是基于高丝氨酸内酯和在N酰基链中体现物种特异性变化。蛔苷以非常类似的方式装配,基于双脱氧糖蛔糖作为不变支架,向其上连接可变脂质链。0024图7描述,根据本文中的实施方案,巴西日圆线虫中用OVA对照/明矾的致敏(N3)以及用OVANES/明矾的致敏(N3)。实验模型为卵清蛋白诱导的哮喘。图7还描述肺组织学,其显示当哮喘小鼠被给予总钩虫上清时显著减少的炎症,如通过降低的。
24、细胞浸润和降低的粘液过度产生所测量的。定量MRNA分析显示与粘液产生相关的基因的表达的减少。总钩虫水虫在培养基中培养,虫被滤出。没有向该哮喘模型引入虫,无论是活的或是死的。而且,蛋白通过在100C下变性持续25分钟、并通过10KDA的过滤器过滤来清除。图7描述用NES处理的小鼠的组织学。图7A显示肺切片的HE染色。进入到肺的以嗜酸性粒细胞为主的炎症细胞的强烈浸润在用对照OVA致敏的小鼠的细支气管和血管附近被观察到。当用NES连同OVA一起致敏小鼠时,进入到肺的细胞浸润显著减少。图7B和7C显示肺中的PAS(过碘酸希夫)染色,以及GOB5、MUC5A/C和MUC5B的MRNA表达测量,指示在用N。
25、ES连同OVA一起致敏的小鼠中粘液过度产生的减少。0025图8描述,根据本文中的实施方案,TH1/TH2细胞的体外分化。检查了NES对TH1/TH2细胞的分化的效应。就IL4/IFNG产生而言,似乎NES对TH1/TH2的分化没有直接效说明书CN104105489A5/28页9应。0026图9描述,根据本文中的实施方案,TH1/TH2细胞的体外分化。检查了抗生素的效应,其中NES显示对抗生素是有效应的,并且没有对小鼠肠道产生负面干扰。0027图10描述,根据本文中的实施方案,合成的ASCR显示嗜酸性粒细胞的减少。检查了蛔苷对过敏性气道炎症的效应。显示尤其ASCR7具有对过敏性气道炎症的抑制性效。
26、应。本发明人显示巴西日圆线虫产生ASCR1、3、7和10,并且然后单独测试了所合成的化合物。当给予非常小量的ASCR7(紫色)时,嗜酸性粒细胞的减少被显著降低,与总钩虫上清(黑色棒)的效应相当。ASCR1和ASCR3也表现出一定的效应。0028详述0029本文中引用的所有文献通过引用整体并入,如同完全阐述。除非另有定义,本文中所用的技术和科学术语具有与由本发明所属领域的普通技术人员通常所理解的相同含义。SINGLETON等人,DICTIONARYOFMICROBIOLOGYANDMOLECULARBIOLOGY第3版,JWILEYMARCH,ADVANCEDORGANICCHEMISTRYRE。
27、ACTIONS,MECHANISMSANDSTRUCTURE第5版,JWILEY以及SAMBROOK和RUSSEL,MOLECULARCLONINGALABORATORYMANUAL第3版,COLDSPRINGHARBORLABORATORYPRESSCOLDSPRINGHARBOR,NY2001,为本领域技术人员提供本申请中所用的许多术语的一般指导。0030本领域技术人员将认识到与本文中所描述的那些方法和材料类似或等同的许多方法和材料,其可在本发明的实践中被使用。实际上,本发明不以任何方式限制到所描述的方法和材料。对于本发明的目的而言,下述术语定义如下。0031如本文所用,下列术语,除非另有。
28、说明,否则应理解为具有下述含义。如果本文中没有另外定义,本文所用的所有技术和科学术语具有与由本发明所属领域的普通技术人员通常所理解的含义的相同含义。倘若存在多个用于本文中术语的定义,以在本节中的定义为准,除非另有说明。0032术语“烷基(ALKYL)”是指脂肪族烃基团,其可为直链、支链或环状烃结构或其组合。代表性的烷基基团是具有24个或更少的碳原子的那些,例如,甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、异戊基、正己基等。低级烷基是指链中具有约1至约6个碳原子的烷基基团。支链烷基含义是一个或多个低级烷基基团诸如甲基、乙基或丙基被连接到直链烷基链。0033烷基旨在包含直链、支链或。
29、环状烃结构及其组合的陈述,其含义是“烷基”基团还包括以下的组合直链和环状结构单元(以及类似组合)。0034“烯基(ALKENYL)”意指在相邻碳原子之间含有至少一个双键的如上所定义的烷基。烯基包括顺式与反式两种异构体。支链烯基含义是一个或多个低级烷基基团诸如甲基、乙基或丙基被连接到直链烯基链。代表性的直链和支链的烯基是在链中具有约2至约6个碳原子的那些,例如,乙烯基、丙烯基、1丁烯基、2丁烯基、异丁烯基、1戊烯基、2戊烯基、3甲基1丁烯基、2甲基2丁烯基、2,3二甲基2丁烯基等。0035术语“卤素”是指氟、氯、溴和碘。说明书CN104105489A6/28页100036术语“卤代烷基”是指被一。
30、个或多个卤素取代的如上所描述的支链或直链烷基。0037术语“卤代烯基”是指被一个或多个卤素取代的如上所描述的支链或直链烯基。0038术语“芳基”意指具有6至约19个碳原子(例如,约6至约10个碳原子)的芳香族单环或多环(MULTICYCLIC)(多环(POLYCYCLIC)的环系统,并包括芳烷基基团。代表性的芳基基团包括,但不限于,诸如苯基、萘基、薁基、菲基、蒽基、芴基、芘基、苯并9,10菲基(TRIPHENYLENYL)、草屈基(CHRYSENYL)和萘并萘基(NAPHTHACENYL)的基团。0039术语“芳烷基”意指连接到芳环的烷基残基。实例是苄基、苯乙基等。0040术语“杂芳基”意指其。
31、中环系统中的一个或多个原子是除碳以外的元素(例如,氮、氧和/或硫等)的、具有约5至约19个环原子(例如,约5至约10个环原子)的芳香族单环或多环的环系统。如本领域技术人员熟知的,杂芳基环具有比其全碳对应物(COUNTERPART)低的芳香族特性。因此,用于本发明的目的,“杂芳基”基团只需要具有一定程度的芳香族特性。例如,在多环的环系统的情况下,对于被定义为“杂芳基”的环系统,其中仅一个环需要是芳香族的。示例性的杂芳基含有约5至6个环原子。杂芳基前的前缀氮杂(AZA)、氧杂(OXA)、硫杂(THIA)或硫代(THIO)意指至少一个氮、氧或硫原子分别作为环原子存在。杂芳基环中的氮、碳或硫原子可任选。
32、地被氧化;氮可任选地被季铵化。代表性的杂芳基包括,但不限于,嘌呤基、吡啶基、2氧代吡啶基、嘧啶基、哒嗪基、吡嗪基、三嗪基、呋喃基、吡咯基、噻吩基、吡唑基、咪唑基、噁唑基、异噁唑基、噻唑基、异噻唑基、三唑基、噁二唑基、噻二唑基、四唑基、吲哚基、异吲哚基、苯并呋喃基、苯并噻吩基、二氢吲哚基、2氧代二氢吲哚基、二氢苯并呋喃基、二氢苯并噻吩基、吲唑基、苯并咪唑基、苯并噁唑基、苯并噻唑基、苯并异噁唑基、苯并异噻唑、苯并三唑基、喹啉基、异喹啉基、喹唑啉基、噌啉基、酞嗪、喹喔啉基等。0041术语“环烷基”和“环烯基”是指具有约3至约8个碳原子,例如,约5至约7个碳原子的非芳香族的、饱和的(环烷基)或不饱和的。
33、(环烯基)单环或多环的环系统。示例性的环烷基和环烯基基团包括,但不限于,环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、降冰片基(NORBORNYL)、环丙烯基、环丁烯基、环戊烯基、环己烯基、环苯基、反式二环丙烷(ANTIBICYCLOPROPANE)、顺式三环丙烷(SYNTRICYCLOPROPANE)等。0042如本文所用,“杂环”或“杂环基”是指饱和的、不饱和的或芳香族的并且由碳原子和一至五个选自由氮、氧和硫组成的组中的杂原子组成的稳定的3至18元环(基)。用于本发明的目的,所述杂环可以是单环、双环或多环的环系统,其可包括稠环、桥环或螺环系统,上述系统包括其中任何上述杂环与苯环稠合的双环。杂环中。
34、的氮、碳或硫原子可任选地被氧化;氮原子可任选地被季铵化;并且环可是部分或完全饱和的。杂环可通过任何杂原子或碳原子连接。杂环包括如下文所定义的杂芳基。此类杂环的实例包括,但不限于,吗啉基、吡咯烷酮基、吡咯烷基、哌啶基、哌嗪基、乙内酰脲基(HYDANTOINYL)、戊内酰胺基、环氧乙烷基、氧杂环丁烷基、四氢呋喃基、四氢吡喃基、四氢吡啶基、四氢嘧啶基、四氢噻吩基、四氢噻喃基、四氢嘧啶基、四氢噻吩基、四氢噻喃基等。更多的杂环和杂芳基被描述于KATRITZKY等人编著,COMPREHENSIVEHETEROCYCLICCHEMISTRYTHESTRUCTURE,REACTIONS,SYNTHESISAN。
35、DUSEOFHETEROCYCLICCOMPOUNDS,卷18,PERGAMONPRESS,NY(1984)中,其在此通过引用整体并入本文。0043术语“酰基”是指通过羰基官能团连接到母体结构的直链、支链或环状构型的、饱说明书CN104105489A107/28页11和的、不饱和的或芳香族的以及其组合的具有从1至8个碳原子的基团。只要与母体连接的点保持在羰基上,酰基残基中的一个或多个碳可被氮、氧或硫代替(REPLACE)。实例包括乙酰基(AC)、苯甲酰基、丙酰基、异丁酰基、叔丁氧羰基、苄氧羰基等。0044术语“氨基酸”是指通过氨基酸的羧基基团与另一个分子的氨基基团的反应形成酰胺键后保留的氨基酸。
36、的片段。氨基酸可以是D构型或L构型。合适的氨基酸包括氨基酸、氨基酸、氨基酸、氨基酸和氨基酸,并且不仅包括天然氨基酸(即,在生物系统中所发现的氨基酸,包括在天然蛋白质中所发现的20种氨基酸),还包括此类氨基酸的天然存在的变体,以及本领域技术人员已知的合成的氨基酸和它们的类似物。示例性的氨基酸包括20种天然氨基酸、4羟基脯氨酸、羟基赖氨酸、锁链素(DEMOSINE)、异锁链素(ISODEMOSINE)、3甲基组氨酸、正缬氨酸、丙氨酸,氨基丁酸、瓜氨酸、高半胱氨酸、高丝氨酸、鸟氨酸和蛋氨酸砜。0045术语“嘧啶”是指含有2个碳原子被2个氮原子代替的苯环(二氮杂苯)的杂芳香族化合物。例如,位置1和3上。
37、的碳原子被氮原子所代替的以下部分被认为是嘧啶此术语,如其在本文所定义的,还包括其二氮杂苯异构体形式,诸如,在位置1和2中具有氮原子的哒嗪;以及在位置1和4中具有氮原子的吡嗪。术语“嘧啶”通常也包括其类似物和衍生物。例如,天然的核碱基,胞嘧啶(C)、胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U),是嘧啶衍生物。术语“嘌呤”是指含有稠合到咪唑环的嘧啶环的杂芳香族化合物。术语“嘌呤”通常也包括其类似物和衍生物。例如,天然的核碱基腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G)。天然存在的嘌呤衍生物的其它实例是次黄嘌呤、黄嘌呤、可可碱、咖啡因、尿酸和异鸟嘌呤。示例性的嘌呤和嘧啶包括公开于以下中的那些美国专利号3,687,808;CONCIS。
38、EENCYCLOPEDIAOFPOLYMERSCIENCEANDENGINEERING,858859页KROSCHWITZ,JI,编著JOHNWILEY以及ENGLISCH等人,ANGEWANDTECHEMIE,INTERNATIONALEDITION,1991,30,613,其中的每一个在此通过引用整体并入。0046术语“核碱基”包括所有天然和合成的核碱基以及通用核碱基。典型的天然核碱基包括腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶和胸腺嘧啶。合成的核碱基通常包括肌苷、黄嘌呤、次黄嘌呤、NUBULARINE、异鸟嘌呤核苷(ISOGUANISINE)或杀结核菌素(TUBERCIDINE)。如本文所用,通用。
39、核碱基为可代替1种以上的天然核碱基的任何修饰的、未修饰的、天然存在的或非天然存在的核碱基。通用碱基通常含有可含有或可不含有氮原子的芳环部分,且通常使用芳环堆叠以稳定寡核苷酸双链体。一些通用碱基可被共价连接至戊糖的C1碳上以形成通用核苷酸。一些通用碱基不与另一个核碱基特异性氢键键合(HYDROGENBOND)。一些通用碱基与所有的天然存在的核碱基进行碱基配对。一些通用碱基可通过疏水性堆叠与相同核酸链上的相邻核苷酸碱基相互作用。示例性通用核碱基包括,但不限于,2,4二氟甲苯、硝基吡咯基(NITROPYRROLYL)、硝基吲哚基(NITROINDOLYL)、8氮杂7脱氮腺嘌呤8AZA7DEAZAAD。
40、ENINE、4氟6甲基苯并咪唑4FLUORO6METHYLBENZIMIDAZLE)、4甲基苯并咪唑、3甲基异喹诺酮基3METHYLISOCARBOSTYRILYL、5甲基异喹诺酮基、3甲基7丙炔基异喹诺酮基(3METHYL7PROPYNYLISOCARBOSTYRILYL)、7氮杂说明书CN104105489A118/28页12吲哚基、6甲基7氮杂吲哚基、咪唑并吡啶基(IMIDIZOPYRIDINYL)、9甲基咪唑并吡啶基(IMIDIZOPYRIDINYL)、PYRROLOPYRIZINYL、异喹诺酮基、7丙炔基异喹诺酮基、丙炔基7氮杂吲哚基、2,4,5三甲基苯基、4甲基吲哚基、4,6二甲基。
41、吲哚基、苯基、萘基、蒽基、苯蒽基(PHENANTHRACENYL)、芘基、STILBENZYL、并四苯基(TETRACENYL)、并五苯基(PENTACENYL)以及其结构衍生物。0047适合的核碱基包括,但不限于,2氨基腺嘌呤、腺嘌呤和鸟嘌呤的6甲基及其它烷基衍生物、腺嘌呤和鸟嘌呤的2丙基和其它烷基衍生物、5卤代尿嘧啶和胞嘧啶、5丙炔基尿嘧啶和胞嘧啶、6偶氮尿嘧啶、胞嘧啶和胸腺嘧啶、5尿嘧啶(假尿嘧啶)、4硫尿嘧啶、5卤代尿嘧啶、5(2氨基丙基)尿嘧啶、5氨基烯丙基尿嘧啶、8卤素、氨基、巯基、硫代烷基、羟基和其它8取代的腺嘌呤和鸟嘌呤、5三氟甲基和其它5取代的尿嘧啶和胞嘧啶、7甲基鸟嘌呤、5。
42、取代的嘧啶、6氮杂嘧啶和N2、N6和O6取代的嘌呤、包括2氨基丙基腺嘌呤、5丙炔基尿嘧啶和5丙炔基胞嘧啶、二氢尿嘧啶、3脱氮5氮杂胞嘧啶、2氨基嘌呤、5烷基尿嘧啶(5ALKYLURACIL)、7烷基鸟嘌呤、5烷基胞嘧啶、7脱氮腺嘌呤、N6,N6二甲基腺嘌呤、2,6二氨基嘌呤、5氨基烯丙基尿嘧啶、N3甲基尿嘧啶、取代的1,2,4三唑、2吡啶酮、5硝基吲哚、3硝基吡咯、5甲氧基尿嘧啶、尿嘧啶5氧基乙酸、5甲氧羰基甲尿嘧啶(5METHOXYCARBONYLMETHYLURACIL)、5甲基2硫尿嘧啶、5甲氧羰基甲基2硫尿嘧啶、5甲氨基甲基2硫尿嘧啶、3(3氨基3羧丙基)尿嘧啶、3甲基胞嘧啶、5甲基胞。
43、嘧啶、N4乙酰基胞嘧啶、2硫胞嘧啶(2THIOCYTOSINE)、N6甲基腺嘌呤、N6异戊基腺嘌呤(N6ISOPENTYLADENINE)、2甲硫基N6异戊烯基腺嘌呤、N甲基鸟嘌呤(NMETHYLGUANINES)和O烷基化的碱基。更多的嘌呤和嘧啶包括公开于以下中的那些美国专利号3,687,808CONCISEENCYCLOPEDIAOFPOLYMERSCIENCEANDENGINEERING,858859页KROSCHWITZ,JI,编著JOHNWILEY以及ENGLISCH等人,ANGEWANDTECHEMIE,INTERNATIONALEDITION,1991,30,613,其中的每个在。
44、此通过引用整体并入。0048术语“核苷”是指包含连接到戊糖的1位置上的如本文所定义的核碱基的化合物。当核碱基是嘌呤衍生物或类似物时,戊糖通常在嘌呤衍生物或类似物的9位置上连接到核碱基上。当核碱基为嘧啶衍生物或类似物时,戊糖通常在嘧啶的1位置上连接到核碱基上(例如,KORNBERG和BAKER,DNAREPLICATION,第2版,FREEMAN,SANFRANCISCO,1992,在此通过引用将其整体并入)。当核苷存在于本文中的R3、R4或R5时,核苷可以通过核碱基或戊糖上的任何原子连接至相邻的原子。0049术语“脂肪酸”通常是指具有脂肪族尾部(链)的羧酸。脂肪族链的长度可为在约2至约36个之。
45、间的碳原子。脂肪酸可以是饱和的、不饱和的或多不饱和的。脂肪族链可以是直链或支链。术语“脂肪酸”可以在本文中用来指“脂肪酸衍生物”,其可以包括一种或多种不同的脂肪酸衍生物或脂肪酸衍生物的混合物。示例性的脂肪酸包括不饱和脂肪酸、饱和脂肪酸以及二元酸;具有羧酸官能团的蛔苷的单甘油酯、二甘油酯和三甘油酯;羟基酸、羟基酸、1羟基酸、二羟基脂肪酸(如,为或1羟基化的二羟基脂肪酸,以及或羟基化的脂肪酸)。0050术语“糖”是指或本身为由一个或多个单糖单元组成的碳水化合物的化合物,所述单糖单元具有至少5个碳原子(其可以是直链、支链或环状),每个碳原子键合了氧、氮或硫说明书CN104105489A129/28页。
46、13原子;或为具有由一个或多个单糖单元组成的碳水化合物部分作为组成其部分的化合物,所述单糖单元各自具有至少5个碳原子(其可以是直链、支链或环状),每个碳原子键合了氧、氮或硫原子。代表性糖包括单糖、二糖、三糖和含有从约49个单糖单元的低聚糖以及多糖诸如淀粉、糖原、纤维素和多糖树胶。示例性的单糖包括C5和更高(例如,C5C8或C5C6)的糖;二糖和三糖包括具有两个或三个单糖单元(例如,C5C8或C5C8)的糖。0051术语“单糖”意指处于醛(醛糖)或酮(酮糖)形式的具有310个碳原子的链的糖分子。适合的单糖既包括天然存在的单糖又包括合成的单糖。适合的单糖包括丙糖,诸如甘油糖和二羟基丙酮;丁糖(TE。
47、XTROSE)诸如赤藓糖和赤藓酮糖;戊糖,诸如木糖、阿拉伯糖、核糖、木酮糖核酮糖;甲基戊糖(6脱氧己糖),诸如鼠李糖和岩藻糖;己糖,诸如蛔糖、葡萄糖、甘露糖、半乳糖、果糖、和山梨糖;以及庚糖,诸如葡庚糖、半乳甘露庚糖、景天庚酮糖和甘露庚酮糖。示例性的单糖涵盖阿洛糖、阿卓糖、阿拉伯糖、克拉定糖、赤藓糖、赤藓酮糖、果糖、D岩藻糖醇、L岩藻糖醇、岩藻糖胺、岩藻糖、墨角藻糖(FUCULOSE)、半乳糖胺、D半乳糖胺醇(DGALACTOSAMINITOL)、N乙酰基半乳糖胺、半乳糖、葡糖胺、N乙酰基葡糖胺、葡糖胺醇(GLUCOSAMINITOL)、葡萄糖、葡萄糖6磷酸、古洛糖甘油醛、L甘油D曼诺庚糖、甘。
48、油、甘油酮、古洛糖、艾杜糖、来苏糖、甘露糖胺、甘露糖、甘露糖6磷酸、阿洛酮糖、奎诺糖、QUINOVASAMINE、鼠李糖醇、鼠李聚糖、鼠李糖、核糖、核酮糖、景天庚酮糖、山梨糖、塔格糖、塔罗糖、酒石酸、苏糖、木糖和木酮糖的基团。单糖可以是D构型或L构型。本文所用的典型的单糖是己糖。0052单糖可还为脱氧糖(由氢代替醇羟基基团)、氨基糖(由氨基基团代替醇羟基基团)、硫代糖(由巯基代替醇羟基基团,或由CS代替CO,或由硫代替环状形式的环氧)、硒糖、碲糖、氮杂糖(由氮代替环碳)、亚氨基糖(由氮代替环氧)、磷酸基糖(PHOSPHANOSUGAR)(由磷代替环氧)、磷杂糖(PHOSPHASUGAR)(由磷。
49、代替环碳)、C取代的单糖(由碳代替非末端碳原子上的氢)、不饱和单糖、糖醇(由CHOH基团代替羰基)、醛糖酸(醛基被羧基代替)、酮醛糖酸(KETOALDONICACID)、糖醛酸、醛糖二酸,等等。氨基糖类包括氨基单糖,诸如半乳糖胺、葡糖胺、甘露糖胺、岩藻糖胺、QUINOVASAMINE、神经氨酸、胞壁酸、乳糖二胺(LACTOSEDIAMINE)、ACOSAMINE、BACILLOSAMINE、柔红糖胺、去氧糖胺(DESOSAMINE)、福乐糖胺(FOROSAMINE)、加拉糖胺(GAROSAMINE)、卡那霉素胺(KANOSAMINE)、KANSOSAMINE、碳霉糖、海藻糖胺、PEROSAMINE、PNEUMOSAMINE、PURPUROSAMINE、紫红霉胺(RHODOSAMINE)。应当理解,单糖等可被进一步取代。0053术语“二糖”、“三糖”和“多糖”涵盖以下的基团阿比可糖、阿卡波糖ACRABOSE、阿米西糖(AMICETOSE)、支链淀粉、直链淀粉、芹菜糖、碳霉氨糖(ARCANOSE、蛔糖、抗坏血酸、波伊文糖、纤维二糖、纤维三糖、纤维素、马铃薯三糖、查耳糖、几丁质、可立糖、环糊精、磁麻糖、糊精、2脱氧核糖、2脱氧葡萄糖、地芰糖(DIGINOSE)、毛地黄糖、洋地黄糖(DIGITOXOSE)、EVALOSE、EVEMITROSE、。