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1、(10)申请公布号 CN 103172744 A (43)申请公布日 2013.06.26 CN 103172744 A *CN103172744A* (21)申请号 201210367604.0 (22)申请日 2012.09.28 CCTCC NO: C201283 2012.06.18 CCTCC NO: C201284 2012.06.18 CCTCC NO: C201285 2012.06.18 CCTCC NO: C2012112 2012.08.24 CCTCC NO: C2012122 2012.08.24 C07K 16/40(2006.01) C12N 5/20(2006.。
2、01) C12N 15/13(2006.01) C12N 15/63(2006.01) C12N 1/15(2006.01) C12N 1/19(2006.01) C12N 1/21(2006.01) C12N 5/10(2006.01) C12P 21/08(2006.01) A61K 39/395(2006.01) A61P 35/00(2006.01) G01N 33/577(2006.01) C12R 1/91(2006.01)(71)申请人 武汉纽斯特生物技术有限公司 地址 430075 湖北省武汉市东湖高新技术开 发区光谷生物城 B3-3#3 (72)发明人 黄新云 (74)专利代。
3、理机构 北京市德权律师事务所 11302 代理人 刘丽君 (54) 发明名称 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体、 制备方法及其应用 (57) 摘要 本发明公开了特异性识别 B-Raf 突变蛋白的 单克隆抗体、 制备方法及其应用, 属于生物科学 和药物载体领域。利用本发明的方法制备出的 三种单克隆抗体分别可以特异性识别三种 B-Raf N581S, B-Raf V600E 和 B-RafV600K 突变蛋白。这 三种单克隆抗体可以用于检测动物或者人体组织 中的 B-Raf 蛋白是否含有 N581S、 V600E 和 V800K 突变, 能为临床上皮肤癌等多种癌症的诊断和治 疗提供依据。
4、。 (83)生物保藏信息 (51)Int.Cl. 权利要求书 2 页 说明书 13 页 序列表 4 页 附图 4 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 权利要求书2页 说明书13页 序列表4页 附图4页 (10)申请公布号 CN 103172744 A CN 103172744 A *CN103172744A* 1/2 页 2 1. 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体 , 其特征在于, 不能识别 B-Raf 野生型蛋 白的单克隆抗体, 或者抗原结合蛋白, 该单克隆抗体特异性识别的 B-Raf 突变蛋白包括 : 第 581 位的天冬酰胺 (Asparagine。
5、, N) 突变为丝氨酸 (Serine, S) 的突变蛋白 (B-Raf N581S) ; 第 600 位的缬氨酸 (Valine, V)突变为谷氨酸 (Glutamic Acid, E)的突变蛋白 (B-Raf V600E) ; 或者第 600 位的缬氨酸 (Valine, V) 突变为赖氨酸 (Lysine, K) 的突变蛋白 (B-Raf V600K) 。 2. 根据权利要求 1 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的制备方法, 其特 征在于, 特异性结合于含有多肽序列 SEQ ID NO:3 的 B-Raf 蛋白。 3. 根据权利要求 1 所述的特异性识别 B-Raf 突。
6、变蛋白的单克隆抗体的制备方法, 其特 征在于, 特异性结合于含有多肽序列 SEQ ID NO:1 的 B-Raf 蛋白。 4. 根据权利要求 1 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的制备方法, 其特 征在于, 特异性结合于含有多肽序列 SEQ ID NO:2 的 B-Raf 蛋白。 5. 根据权利要求 1 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的制备方法, 其 特征在于, 包括抗原结合部位, 由一条重链和一条轻链组成 ; 重链和轻链的 CDR1、 CDR2 以及 CDR3 的氨基酸序列分别是由中国典型培养物保藏中心 (CCTCC) 保藏号为 CCTCC C20121。
7、12、 CCTCC C201283/CCTCCC201284/CCTCC/C201285 以及 CCTCC C2012122 的杂交瘤细胞产生的 单克隆抗体的 CDR1、 CDR2 以及 CDR3 的氨基酸序列决定。 6. 根据权利要求 5 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的制备方法, 其特 征在于, 包括抗原结合部位, 所述杂交瘤细胞所产生的单克隆抗体重链和轻链的组成分别 包含重链和轻链的可变区域。 7. 根据权利要求 5 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的制备方法, 其特 征在于, 包括抗原结合部位, 包含有所述的杂交瘤细胞所产生的单克隆抗体的重链和轻链。
8、 氨基酸序列。 8.根据权利要求1所述的特异性识别B-Raf突变蛋白的单克隆抗体, 其特征在于, 包括 抗原结合部位, 是一种人源化或者嵌合型抗体。 9.根据权利要求2至6及8任一项所述的特异性识别B-Raf突变蛋白的单克隆抗体的 制备方法, 其特征在于, 所述单克隆抗体是一种 IgG。 10. 根据权利要求 1 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体, 其特征在于, 保 存在中国典型培养物保藏中心 (CCTCC) 的保藏号为 CCTCCC2012112、 CCTCC C201283/CCTCC C201284/CCTCC C201285 以及 CCTCCC2012122 的三株杂。
9、交瘤细胞。 11. 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征在于, 该单克隆抗体或者 抗原结合部位的药物, 以及可以药用的载体。 12. 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征在于, 一种诊断 B-Raf 突 变的诊断试剂盒, 其组成含有权利要求 1 至 7 所述的任意一种单克隆抗体或者抗原结合部 位。 13. 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征在于, 一种诊断肿瘤的方 法, 其特征在于, 包括以下步骤 : (1) 用权利要求 1 至 7 所述的任意一种单克隆抗体或者抗原结合部位接触需要检测的 生物样本 ; 权 利 要 求 书。
10、 CN 103172744 A 2 2/2 页 3 (2) 检测单克隆抗体或者抗原结合部位是否与样本发生结合, 而结合指示样本存在癌 症或者发展成癌症的风险。 14. 根据权利要求 13 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征 在于, 所述诊断方法中, 常见的癌症类型包括 : 直肠癌, 乳头状甲状腺癌, 胰腺癌, 食道癌, 前 列腺癌, 卵巢癌, 肺癌。 15. 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征在于, 一种治疗癌症病人 的方法, 其特征在于 : (1) 检测来自于病人的生物学样品中是否含有 B-Raf N581S, V600E 或者 V6。
11、00K 突变, 并且 (2) 如果存在上述突变, 对该病人给予 B-Raf 蛋白抑制剂的治疗。 16. 根据权利要求 15 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特 征在于, 所述治疗方法中, B-Raf 蛋白抑制剂包括 : 反义 RNA(antisense RNA) , 小干涉 RNA (siRNA) , 微小 RNA(miRNA)药物, 抗 B-Raf 单克隆抗体药物, 帕尼单抗 (panitumumab) , 威罗菲尼 (vemurafenib) , 索拉非尼 (Sorafenib) , 西妥昔单抗 (Cetuximab) , Raf-265, PLX-4032,。
12、 GDC-0879。 17. 根据权利要求 15 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征 在于, 所述治疗癌症病人的方法, 给予病人含有权利要求 11 的组成成分的药物。 18.根据权利要求15或17所述的特异性识别B-Raf突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其 特征在于, 所述治疗癌症病人的方法中, 常见的癌症类型包括 : 直肠癌, 乳头状甲状腺癌, 胰 腺癌, 食道癌, 前列腺癌, 卵巢癌, 肺癌。 19. 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征在于, 将权利要求 1 至 8 的单克隆抗体或者抗原结合部位用于癌症治疗药物的生产过程, 常见的癌症。
13、种类包括 : 黑 色素癌, 直肠癌, 甲状腺癌, 胰腺癌, 食道癌, 前列腺癌, 卵巢癌, 乳腺癌, 肺癌, 或者造血组织 癌。 20. 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征在于, 一种纯化的核酸分 子, 包含能够编码权利要求1至8所述单克隆抗体的重链或者其一个抗原结合部位, 或者能 够编码轻链或者其一个抗原结合部位, 或者能够同时编码二者的核酸序列。 21. 根据权利要求 20 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征 在于, 一种载体分子, 含有可以联系到该核酸分子的表达调控序列。 22.根据权利要求20的特异性识别B-Raf突变蛋白的单克。
14、隆抗体的应用, 其特征在于, 一种宿主细胞, 含有该核酸分子。 23. 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征在于, 包含权利要求 1 至 7 的一种细胞株, 其含有所述的单克隆抗体或者其抗原结合部位。 24. 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体的应用, 其特征在于, 一种生产单克隆 抗体或者其抗原结合部位的方法, 所生产的抗体或者抗原结合部位特异性结合人类突变的 B-Raf 蛋白, 而不结合人类野生型的 B-Raf 蛋白。其步骤包括 : (1) 根据权利要求 22, 在适当的条件下培养该宿主细胞, 或者根据权利要求 23, 在释放 的条件下培养该细胞株 ; (。
15、2) 提纯所述的抗体部分。 权 利 要 求 书 CN 103172744 A 3 1/13 页 4 特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体、 制备方法及其 应用 技术领域 0001 本发明属于生物科学和诊断试剂领域, 特别涉及特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单 克隆抗体、 制备方法及其作为诊断和治疗试剂的应用。 背景技术 0002 B-Raf 蛋白 ( 也称为 v-raf murine sarcoma viral oncogene homolog B1) 是 Raf/Mil 丝氨酸 / 苏氨酸蛋白激酶家族的成员之一。该蛋白在调控细胞增殖的 Ras/Raf/ MEK/ERK/MAP 级联。
16、信号通路中期重要作用。B-Raf 蛋白的突变在多种人类癌症, 例如黑 色素癌、 甲状腺乳头状癌、 直肠癌、 卵巢癌中都存在 (Garnett and Marais,Cancer Cell, 6:313-319(2004)) 。这些突变导致 B-Raf 蛋白的持续激活, 进而促进细胞的增殖转化和 癌细胞生长。V600E 突变蛋白 (第 600 位的缬氨酸 (Valine, V)突变为谷氨酸 (Glutamic Acid, E) 的突变蛋白) 在黑色素癌和甲状腺乳头状癌中存在十分普遍 (Capper et al.,Acta Neuropathol, 122(1):11-19(2011)) 。其他的。
17、 B-Raf 突变包括 N581S 和 V600K 等。 0003 针 对 V600E 突 变 蛋 白 的 抑 制 剂 正 在 研 发 中 (Chapman et al.,N Eng J Med,364(26):2507-2516(2011)) 。在这种抑制剂的使用过程中, 需要一种能够特异性结合 突变的 B-Raf 蛋白但是不结合野生型 B-Raf 蛋白的抗体。这种抗体可以被用来快速检测少 量的取自病人的样品, 用于诊断癌症。能够特异性结合 B-Raf 突变蛋白的抗体也是治疗癌 症所迫切需要的。 0004 发明简介 0005 本发明的目的是为解决上述问题而提供了分别特异性地识别 B-Raf 。
18、N581S, B-Raf V600E 和 B-Raf V600K 突变体蛋白的三种单克隆抗体、 制 备方法及其应用。利用本发明 的方法制备出的单克隆抗体能够分别特异性地识别 B-Raf N581S, B-Raf V600E 和 B-Raf V600K 突变体蛋白, 而不识别野生型 B-Raf 蛋白。 0006 在一些操作实例中, 所述的特异性识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体或者抗原结 合部位, 其特征在于, 由一条重链和一条轻链组成 ; 重链和轻链的 CDR1、 CDR2 以及 CDR3 的 氨基酸序列分别是由中国典型培养物保藏中心 (CCTCC) 保藏号为 CCTCC C201283/。
19、CCTCC C201284/CCTCC C201285、 CCTCC C2012122 以及 CCTCC C2012112 的杂交瘤细胞产生的单克 隆抗体的 CDR1、 CDR2 以及 CDR3 的氨基酸序列决定。在进一步的操作实例中, 所述的特异性 识别 B-Raf 突变蛋白的单克隆抗体或者抗原结合部位, 其特征在于, 由分别包含所述杂交 瘤细胞所产生的单克隆抗体的重链和轻链的可变区域的氨基酸序列的一条重链和一条轻 链组成。在更进一步的操作实例中, 抗体或者抗原结合部位包含上述杂交瘤细胞所产生的 单克隆抗体的重链和轻链可变区的氨基酸序列。 0007 本发明的单克隆抗体可以是一种人源化的或者嵌。
20、合型的抗体。在某些操作实例 中, 这种单克隆抗体是 IgG。 0008 在一方面, 本发明包括保存在中国典型培养物保藏中心 (CCTCC) 保藏号为 CCTCC 说 明 书 CN 103172744 A 4 2/13 页 5 C201283/CCTCC C201284/CCTCC C201285、 CCTCC C2012122 以及 CCTCC C2012112 的杂交 瘤细胞。CCTCC C201283 的分类命名为 : 杂交瘤细胞株 M43#-1, 保藏日期为 : 2012 年 6 月 18 日 ; CCTCC C201284 的分类命名为 : 杂交瘤细胞株 M43#-2, 保藏日期为 :。
21、 2012 年 6 月 18 日 ; CCTCC C201285 的分类命名为 : 杂交瘤细胞株 M43-3, 保藏日期为 : 2012 年 6 月 18 日 ; CCTCC C201283的分类命名为 : 杂交瘤细胞株M43#-1, 保藏日期为 : 2012年6月18日 ; CCTCC C2012122 的分类命名为 : 杂交瘤细胞株 M60-28, 保藏日期为 : 2012 年 8 月 24 日 ; CCTCC C2012112 的分类命名为 : 杂交瘤细胞株 M73-48, 保藏日期为 : 2012 年 8 月 24 日 . 0009 本发明包括一种含有所述单克隆抗体或者抗原结合部位的药。
22、物或者可用于药物 的载体。 本发明还包括一种含有本发明中提到的单克隆抗体或者其抗原结合部位诊断试剂 盒。 0010 在一些应用实例中, 本发明能够提供一种癌症诊断的方法 (例如, 黑色素癌、 甲状 腺癌、 胰腺癌、 食道癌、 结肠癌、 前列腺癌、 卵巢癌、 乳腺癌、 肺癌以及肝癌) , 其主要步骤包 括 : 用本发明所述的单克隆抗体接触来自于检测目标的生物学样本 ; 检测抗体或者其部分 与样本是否结合 ; 如 果抗体与样本存在结合则表明被检测对象是癌症, 或者存在发展成癌 症的风险。 0011 在另外的应用实例中, 本发明提供一种治疗肿瘤病人的方法, 包括 : 检测 V600E、 N581S 。
23、或者 V600K 突变形式的 B-Raf 蛋白是否存在于来自于病人的样本中 ; 如果其中一个 突变存在, 则使用一种 B-Raf 抑制剂 (例如 GDC-0879) 进行治疗。本发明还提供一种治疗癌 症病人 (例如, 黑色素癌、 甲状腺癌、 胰腺癌、 食道癌、 结肠癌、 前列腺癌、 卵巢癌、 乳腺癌、 肺 癌以及肝癌病人) 的方法。该治疗方法包括给予病人一种组成成分中含有本发明的单克隆 抗体或者其抗原结合部分的药物。 本发明进一步提供一种使用本发明所述单克隆抗体或者 其抗原结合部位作为药剂治疗黑色素癌、 甲状腺癌、 胰腺癌、 食道癌、 结肠癌、 前列腺癌、 卵 巢癌、 乳腺癌、 肺癌以及肝癌。。
24、 0012 本发明包括一种纯化的核酸分子, 其组成为能够编码本发明中的特异性结合突变 B-Raf 蛋白的的单克隆抗体的重链或者轻链或者抗原结合部分的核酸序列。进一步本发明 包括含有该核酸序列的载体 ; 该载体优化为含有包括可以联系到该核酸分子的表达调控序 列。在一种应用实例中, 本发明提供一种含有该核酸分子的宿主细胞。在另一个应用实例 中, 本发明提供一种能够产生所述的单克隆抗体或者抗原结合部位的细胞株。本发明还包 括一种生产特异性结合突变型而不结合野生型 B-Raf 蛋白的单克隆抗体或者抗原结合部 位的方法。其步骤包括 : 在适当的条件下培养宿主细胞或者本发明中提到的细胞株 ; 纯化 所述的。
25、抗体。 0013 本发明基于单克隆抗体特异性结合突变型的 B-Raf 蛋白的发现。我们发现这些 抗体能够非常好地优先结合突变的 B-Raf 蛋白 (例如带有 N581S、 V600E 或者 V600K 突变的 B-Raf 蛋白) 。这些抗体能够有效地诊断或者治疗癌症等疾病。这些抗体特别能够有效地检 测生物样品中微量的 B-Raf 蛋白。 0014 B-Raf 0015 本专利所描述的 B-Raf 是指鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌性同源体 B1(v-raf murine sarcoma viral oncogene homolog B1,B-RAF) 的基因或者蛋白 (Sithanandam et a。
26、l.,Oncogene, 5(12):1775-1780(1990)。该基因或者蛋白也被称为 B-Raf, BRAF, RAFB1, 说 明 书 CN 103172744 A 5 3/13 页 6 p94, NS7 或者 B-Raf 原癌基因丝氨酸 / 苏氨酸蛋白激酶 (p94) 。野生型的 B-Raf 蛋白序列 包括 SEQID NO:4, 野生型 B-Raf 蛋白的编码 mRNA 序列包括 SEQ ID NO:5。 0016 B-Raf 是 ral/mil 家族的的丝氨酸 / 苏氨酸蛋白激酶家族成员。B-Raf 蛋白参与 调控 RAS/RAF/MEK/ERK/MAP 级联信号通路。 001。
27、7 B-Raf 蛋白的突变型式包括的一个或者多个氨基酸的插入、 删除、 替换等。本专利 所描述的B-Raf N581S突变指的是第581位的天冬氨酸 (N) 被丝氨酸 (S) 替换的突变 ; B-Raf V600E 指的是第 600 位的缬氨酸 (V) 被谷氨酸 (E) 替换的突变 ; B-Raf V600K 指的是第 600 位的缬氨酸 (V) 被赖氨酸 (K) 替换的突变。 0018 抗体与抗原结合部位 0019 本发明包括特异性结合突变型 B-Raf 蛋白但是不结合野生型 B-Raf 蛋白的单克 隆抗体。 “抗体” 或者 “免疫求蛋白 Ig” 指的是由重链 (H, 大约 50-70kDa。
28、) 和轻链 (L, 大约 25kDa) 通过二硫键链接成的四聚体。轻链可以是 轻链或者 轻链。重链可以分为 、 、 、 、 , 不同重链和轻链的组合共同决定抗体的类型分别是 IgM、 IgD、 IgG、 IgA 或者 IgE(Fundamental Immunology Ch.7, Paul,W.,ed.,2nd ed.Raven Press,N.Y.(1989)) 。 0020 每条重链 (有时称为 H 链, 或者 HC) 都含有一个重链可变区 (也叫 VH) 和一个重链恒 定区 (也叫CH) 。 重链恒定区由三个结构与组成, 分别 为CH1、 CH2和CH3。 每条轻链 (有时也成 为L链。
29、, 或者LC) 也有一个轻链可变区 (也叫VL) 和轻链恒定区 (CL) 。 轻链恒定区只含有一个 结构与 CL, 在轻链和重链内部, 可变区和恒定区通过一个大约 12 个氨基酸左右的 “J” 形状 的结构链接起来。 在重链内部还有一个3个氨基酸左右的 “D” 形区域。 重链可变区和轻链可 变区可以进一步被分为超可变区, 也叫互补决定区 (CDR) 以及穿插中间的略微保守的框架 区域 (FR) 。这些区域以此从 N 端往 C 端排列为 FR1、 CDR1、 FR2、 CDR2、 FR3、 CDR3、 FR4。每个结 构区域的氨基酸序列排序是根据 Kabat (Proteins of Immun。
30、ological Interest,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1987and 1991)) 和 ChothiaChothia et al.,Nature 342:878-883(1989) 的研究结果 分类的。 0021 本发明的内容之一是特异性结合突变型 B-Raf 蛋白的的单克隆抗体的抗原结合 部位。 “抗原结合部位” 是指抗体上使其具有特异性识别并结合抗原 (例如 B-Raf 蛋白上一 段含有特定突变的多肽片段) 的功能的一段抗体片段。目前认为, 抗体的抗原结合功能可以 通过全长抗体的部分片段来实现。抗体的 “抗原结合部位” 的特。
31、征在于包含 :(1) 一个 Fab 片段, 一个包含 VL、 VH、 CL、 CH1 结构域的单价片段 ;(2) 一个 F(ab)2片段, 一个含有通过铰链 区的的二硫键连接起来的 Fab 片段的二价片段 ;(3) 一个包含 VH和 CH1 结构域的 Fd 片段 ; (4) 抗体单臂包含一个 VL、 VH结构域的 Fv 片段 ;(5) 一个由 VH结构域组成的 dAb 片段 (Ward et al.,(1989)Nature 341:544-546) ;(6) 一个独立的互补决定区 (CDR) 。更进一步地, 尽 管 FV片段的两个结构域 VH和 VL是由不同的独立基因编码的, 但是可以用基因。
32、重组的方式 通过合成一个链接区域将它们连接起来, 形成由单链蛋白内部的 VH和 VL配对成单价分子, 也称为单链 FV(scFV) (Bird et al.Science 242:423-426(1988)and Huston et al.Proc. Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883(1988)) 。 这种单链抗体也包括在 “抗原结合部位” 的范 围内。抗体的一部分, 比如 Fab 和 F(ab)2片段, 可以从全长的抗体通过常规的技术, 比如 木瓜酶 (papain) 或者胃蛋白酶 (Pepsin) 酶消化的方法获得。它们也可以通过下面描述的 说 明 书 CN 1。
33、03172744 A 6 4/13 页 7 标准的 DNA 重组技术获得。 0022 抗 B-Raf 抗体及其抗原结合部位 0023 本发明的抗体可以用来自于人类 B-Raf 突变蛋白的抗原免疫非人类的动物 (例 如, 小鼠、 兔子、 大鼠或者仓鼠) 来制备。这些抗体也可以通过噬菌体展示技术或者其它的已 知的抗体制备技术获得。抗原可以是纯化的多聚多肽或者多肽, 也可以是在细胞内表达的 多聚多肽或者多肽。 0024 特定疾病相关的突变的B-Raf蛋白包括B-Raf V600E, B-Raf N581S, B-Raf V600K。 本发明中特异性结合 B-Raf V600E 蛋白的抗体可以通过多肽。
34、 KIGDFGLATEKSRWSGS(SEQ IDNO:1) 免疫小鼠来获得。本发明中的通过该多肽免疫获得的杂交瘤细胞已经保藏 在符合布达佩斯协议的中国典型培养物保藏中心, 保藏号为 CCTCC C201283,CCTCC C201284 和 CCTCC C201285。本发明中特异性结合 B-Raf V600K 蛋白的抗体可以通过 多肽 KIGDFGLATKKSRWSGS(SEQ ID NO:2) 免疫小鼠来获得。本发明中的通过该多肽免 疫获得的杂交瘤细胞已经保藏在符合布达佩斯协议的中国典型培养物保藏中心, 保藏 号为 CCTCC C2012122。本发明中特异性结合 B-Raf N581S。
35、 蛋白的抗体可以通过多肽 SIIHRDLKSNSIFLHED(SEQ ID NO:3) 免疫小鼠来获得。本发明中的通过该多肽免疫获得的 杂交瘤细胞已经保藏在符合布达佩斯协议的中国典型培养物保藏中心, 保藏号为 CCTCC C2012112。 0025 本发明进一步包含一种单克隆抗体或者其抗原结合部位, 它们包括由保藏号为 CCTCC C201283/CCTCC C201284/CCTCC C201285、 CCTCC C2012122、 CCTCC C2012112 的杂 交瘤细胞所产生的单克隆抗体的重链氨基酸序列和轻链氨基酸序列。在一些操作实例 中, 本发明中的单克隆抗体或许只包含由保藏号为。
36、 CCTCC C201283/CCTCC C201284/CCTCC C201285、 CCTCC C2012122、 CCTCC C2012112 的杂交瘤细胞所产生的单克隆抗体的重链氨基 酸序列或者轻链氨基酸序列。 0026 在某些操作实例中, 本发明的抗 B-Raf 抗体或者抗原结合部位包含一条或者多 条由保藏号为 CCTCC C201283/CCTCC C201284/CCTCC C201285、 CCTCC C2012122、 CCTCC C2012112 的杂交瘤细胞所产生的单克隆抗体的重链或者轻链或者 CDR 的氨基酸序列。在 某些操作实例中, 抗体或者抗原结合部位包括由保藏号为。
37、 CCTCC C201283/CCTCC C201284/ CCTCC C201285、 CCTCC C2012122、 CCTCC C2012112 的杂交瘤细胞所产生的单克隆抗体的重 链和轻链的所有 CDR1、 CDR2 以及 CDR3 的氨基酸序列。 0027 在某些操作实例中, 本发明的抗 B-Raf 抗体或者抗原结合部位包含由保藏号为 CCTCC C201283/CCTCC C201284/CCTCC C201285、 CCTCC C2012122、 CCTCC C2012112 的杂 交瘤细胞所产生的单克隆抗体的重链或者轻链可变区的氨基酸序列。在特定的操作实例 中, 抗体或者抗原结。
38、合部位同时包含由保藏号为 CCTCC C201283/CCTCC C201284/CCTCC C201285、 CCTCCC2012122、 CCTCC C2012112 的杂交瘤细胞所产生的单克隆抗体的重链或者 轻链可变区的氨基酸序列。 0028 B-Raf 的结合特异性 0029 本发明的抗体或者抗原结合部位能够分别特异性地结合突变型的 B-Raf V600E、 B-Raf V600K、 B-Raf N581S 蛋白, 但是不结合野生型的 B-Raf 蛋白 (完全不结合或者在某种 程度上不结合) 。换言之, 该抗体或者抗原结合部位能够区分突变型和野生型的人类 B-Raf 说 明 书 CN 。
39、103172744 A 7 5/13 页 8 蛋白。该结合的特异性可以用已知的常用检测手段进行确认, 例如免疫印迹实验 (Western blot) , 酶联免疫吸附实验 (ELISA) , 流式细胞分选, 免疫共沉淀, 免疫荧光, 免疫组织化学染 色, 表面离子共振 (例如 BIACORETM) 或者放射免疫实验等方法。 0030 在一些操作实例中, 该抗体能够特异性地优先结合突变型的 B-Raf 蛋白, 对于突 变型 B-Raf 蛋白的结合能力至少 10 倍, 至少 20 倍, 至少 50 倍, 至少 100 倍, 至少 250 倍, 或 者至少 500 倍强于其对野生型 B-Raf 蛋白。
40、的结合能力。在某些操作实例中, 本发明中的抗 体或者抗原结合部位特异性结合突变型 B-Raf 蛋白的解离平衡常数 KD至少 10 倍, 至少 20 倍, 至少 50 倍, 至少 100 倍, 至少 250 倍, 至少 500 倍, 或者至少 1000 倍强于对野生型 B-Raf 蛋白的结合的解离平衡常数 (KD) 。解离平衡常数 (KD) 可以通过表面离子共振或者流式细胞 计数测得。 0031 本发明的抗体或者抗原结合部位或许只能结合一种 B-Raf 突变蛋白而不能结合 其他的 B-Raf 突变蛋白 (例如 B-Raf V600E、 B-Raf V600K、 B-Raf N581S 中的一种)。
41、 。举例来 说, 该抗体特异性地结合 B-Raf V600K 蛋白的能力或许至少 10 倍, 至少 20 倍, 至少 50 倍, 至少 100 倍, 至少 250 倍, 或者至少 500 倍强于其对其它任何一种突变 B-Raf 蛋白的结合能 力。 0032 在一些操作实例中, 该抗体或许只能结合 B-Raf V600K 蛋白而不结合其他突变型 的 B-Raf 蛋白 (例如 B-Raf V600E、 B-Raf N581S 蛋白) 。举例来说, 该抗体特异性地结合 B-Raf V600K 蛋白的能力或许至少 10 倍, 至少 20 倍, 至少 50 倍, 至少 100 倍, 至少 250 倍, 。
42、或者至少 500 倍强于其对其它任何一种突变 B-Raf 蛋白 (例如 B-Raf V600E、 B-Raf N581S 蛋白) 的结合能力。 0033 在另一些操作实例中, 该抗体或许只能结合 B-Raf N581S 蛋白而不结合其他突变 型的 B-Raf 蛋白 (例如 B-Raf V600E、 B-Raf V600K 蛋白) 。举例来说, 该抗体特异性地结合 B-Raf N581S 蛋白的能力或许至少 10 倍, 至少 20 倍, 至少 50 倍, 至少 100 倍, 至少 250 倍, 或者至少 500 倍强于其对其它任何一种突变 B-Raf 蛋白 (例如 B-Raf V600E、 B-。
43、Raf V600K 蛋白) 的结合能力。 0034 在一些操作实例中, 本发明中的抗体或者抗原结合部位能够特异性结合含有 SEQ ID NO:1, 2, 或者 3 的 B-Raf 多肽。在一些操作实例中, 本发明的抗体或者抗原结合部位特 异性结合保藏号为 CCTCC C201283/CCTCCC201284/CCTCC C201285, CCTCC C2012122, 或者 CCTCC C2012112的杂交瘤细胞所产生的单克隆抗体的抗原表位或者与其重合的抗原表位。 0035 生产抗体的重组方法 0036 本发明包括编码能够特异性结合人类突变型的 B-Raf 蛋白但是不能结合野生型 B-Raf。
44、 蛋白的单克隆抗体及其抗原结合部位的核酸序列。人类突变的 B-Raf 蛋白包括 : V600E, V600K 以及 N581S。在一些操作实例当中, 该核酸分子只编码单克隆抗体或者抗原 结合部位的重链或者轻链。在另外一些操作实例当中, 该核酸分子同时编码单克隆抗体 及其抗原结合部位的重链和轻链。在一些操作实例中, 该核酸分子编码保藏号为 CCTCC C201283/CCTCC C201284/CCTCC C201285, CCTCC C2012122, 或者CCTCC C2012112的杂交瘤 细胞所产生的单克隆抗体的重链、 轻链、 重链可变区或者轻链可变区。 核算可以是纯化的核 酸分子。 0。
45、037 编码本发明抗体的核酸分子可以从任何能够产生该抗体的来源中获得。例如, 核 说 明 书 CN 103172744 A 8 6/13 页 9 酸可以从保藏号为 CCTCC C201283/CCTCC C201284/CCTCC C201285, CCTCC C2012122, 或者 CCTCC C2012112的杂交瘤细胞中获得。 分离纯化编码抗体的核酸的方法是一种已知的常见 的技术。具体方法可以参见书籍 : 美 J. 莎姆布鲁克 D.W. 拉塞尔著, 黄培堂等译,分子 克隆实验指南 , 科学出版社, 第三版, 2002 年。 0038 在一些操作实例中, 编码本发明中的单克隆抗体的重链的。
46、核酸序列可以是由编码 本发明抗体的 VH结构域的核酸序列与一条编码任意其它来源抗体的重链恒定区的组成的 同框编码序列。类似地, 一条编码本发明的抗 B-Raf 蛋白的轻链的核酸分子也可以是由编 码本发明抗体的 VL结构域的核 酸序列与一条编码任意其它来源的抗体的轻链恒定区的组 成的同框编码序列。 0039 在进一步的操作实例中, 编码重链可变区 (VH) 和 / 或者轻链可变区 (VL) 的核酸分 子被转化为全长的抗体编码基因。在一些操作实例中, 编码 VH或者 VL结构域的核酸序列 被分别通过插入到已经含有重链恒定区 (CH) 或者轻链恒定区 (CL) 的表达载体中去的方法 构建为一个全长抗。
47、体基因。这样构建的全长抗体基因的 CH的片段与 CL的片段在载体内部 相连接, 并且 / 或者编码 VH的片段与编码 VL的片段在载体内部相连接。在另外的操作实 例中, 编码 VH以及 / 或者 VL结构域的核酸序列分别通过核酸重组技术被连接到一个编码 CH的片段和 / 或者编码 CL的片段上面。编码人类免疫球蛋白重链和轻链的恒定结构域的 基因是已知的。具体参见著作 Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th ed.,NIH Publ.No.91-3242,1991。编码全长重链和 / 或者轻链的核酸分子 可。
48、以在被引入和纯化 B-Raf 抗体的细胞株中表达。 0040 可以使用核酸分子实现重组表达大量的 B-Raf 抗体。也可以用核酸分子来生产嵌 合抗体, 双特异性结合抗体, 单链抗体, 免疫粘附剂, 双头抗体, 突变抗体以及抗体衍生物。 如果该核酸分子来自于非人类、 非转基因动物, 该核酸分子也可能被用来实现抗体的人源 化。 0041 本发明还包括插入有编码抗体重链、 轻链或者同时编码本发明的 B-Raf 抗体或者 其抗原结合部位的核酸分子。 该载体可能适合于在原核宿主细胞, 例如酵母细胞、 昆虫细胞 或者哺乳动物细胞中表达本发明中的抗体或者其抗原结合部位。 0042 常见的哺乳动物细胞包括很多。
49、永生细胞系都可以用来作为表达宿主。 这些细胞系 包括但不限于 : 中国仓鼠卵巢细胞 (CHO) , NS0 细胞, SP2 细胞, HEK293T 细胞, 293Freestyle (Invitrogen 公司) , NIH3T3 细胞, HeLa 细胞, 幼仓鼠肾细胞 (BHK) , 非洲绿猴肾细胞, 人类 肝癌细胞 (如 HepG2) , 以及 A549 细胞。其它可以用于表达的细胞有昆虫细胞, 包括 sf9 和 sf21 细胞。植物宿主细胞包括 : 烟草, 拟南芥, 浮萍, 玉米, 小麦, 番茄, 水稻来源的细胞。细 菌宿主细胞包括大肠杆菌和放线菌。酵母宿主包括裂殖酵母, 酿酒酵母, 毕赤酵母。 0043 利用不同的细胞系在不同的培养条件下, 或者利用转基因动物表达的抗体能够有 不同的糖基化模式。但是不论其糖基化模式是怎样的, 所有由所述的核酸或者含有所述核 酸的序列编码的抗体都是本发明的内容。 0044 嵌合与人源化抗体 0045 这里所说的嵌合抗体, 其特征在于有来自于两种或者更多种不同的抗体的结构域 组成的抗体。 例如, 嵌合抗体的可变区结构域可能是来自于保。