基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管.pdf

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摘要
申请专利号:

CN201310132465.8

申请日:

2013.04.17

公开号:

CN103160431A

公开日:

2013.06.19

当前法律状态:

终止

有效性:

无权

法律详情:

未缴年费专利权终止IPC(主分类):C12M 1/24申请日:20130417授权公告日:20140723终止日期:20170417|||授权|||实质审查的生效IPC(主分类):C12M 1/24申请日:20130417|||公开

IPC分类号:

C12M1/24

主分类号:

C12M1/24

申请人:

东南大学

发明人:

刘全俊; 叶晓峰; 于静静; 侯传荣; 吴宏文; 刘丽萍; 刘航

地址:

210096 江苏省南京市四牌楼2号

优先权:

专利代理机构:

江苏永衡昭辉律师事务所 32250

代理人:

王剑

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内容摘要

本发明公开了一种基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,包括用于容纳PCR缓冲液的管身、用于容纳杂交缓冲液的储液池和密闭储液池上侧开口的管盖,储液池置入管身的上部,储液池的上端与管身的开口上端密闭连接,储液池的底面上设置有连通底面上下侧的连通管,连通管下端与底面连接。本发明不仅使PCR、基因杂交、基因检测能够在一个封闭体系中完成,避免了交叉污染,而且完全隔绝了PCR扩增体系和DNA杂交体系,避免了扩增体系中的缓冲液、酶等成分对杂交反应的影响,极大地提高了基因检测的准确性和重复性。本发明的封闭型PCR扩增管中的管盖使得加样更加简便,密封性更强,检测准确性更好。

权利要求书

权利要求书一种基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,其特征在于,包括用于容纳PCR缓冲液的管身(1)、用于容纳杂交缓冲液的储液池(2)和密闭所述储液池(2)上侧开口的管盖(3),所述储液池(2)置入管身(1)的上部,储液池(2)的上端与管身(1)的开口上端密闭连接,储液池(2)的底面上设置有连通底面上下侧的连通管(21),所述连通管(21)下端与底面连接。
根据权利要求1所述的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,其特征在于,所述储液池(2)和管盖(3)通过超声融合法组装在一起的,用于储存完整的杂交体系。
如权利要求1或2所述的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,其特征在于,所述储液池(2)采用暗色调的颜色。
如权利要求1或2所述的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,其特征在于,所述储液池(2)的底部外侧边缘设置有2个凸起(22),使得储液池(2)与管身(1)通过过盈配合的方式紧密结合。

说明书

说明书基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管
技术领域
本发明涉及一种封闭型的PCR扩增管,可以用于一体式检测基因信息,即在同一个封闭的空间内依次完成基因扩增、杂交、检测等相应功能。
背景技术
目前,在分子生物学、基因检测、疾病的检测与诊断等各种涉及核酸分子的检测及研究过程中,聚合酶链式反应都是不可或缺的技术之一。众所周知,PCR(聚合酶链式反应,Polymerase Chain Reaction),扩增方法灵敏度极高,可以将原本浓度很低的待测基因扩增到数万至数百万倍的浓度,其扩增产物一般可以使用电泳的方法来检测。正因为PCR扩增的高灵敏度,在扩增过程中很容易发生交叉污染,而且该污染很容易被放大,出现“假阳性”的现象。其次,一次PCR反应一般情况下只能检测一个基因的信息,不能实现对多个基因的高通量检测,因此,还无法满足人们对于多基因同时检测的需求。
基因芯片的出现,实现了同时检测多个基因的想法,使得高通量检测基因成为了可能。一般情况下,将大量事先设计的特异性核酸探针,通过原位合成法或点样法等方法固定在玻片等基因芯片载体上,构建出基因芯片;将标记了荧光分子的待测基因,与基因芯片上的核酸分子进行杂交,利用芯片荧光扫描仪对基因芯片上的杂交信号进行检测与分析。尽管利用基因芯片可以高通量地获得基因的信息,同时检测多个基因,但是其待测基因的扩增、扩增产物转移以及杂交都是在不同的体系中完成,每个过程的衔接中难免都增大了污染的可能性,从而降低了实验检测的可靠性。 
发明内容
技术问题:本发明提供了一种能有效地避免PCR缓冲液对杂交过程的影响,提高杂交检测的准确性和可靠性的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管。
技术方案:本发明的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,包括用于容纳PCR缓冲液的管身、用于容纳杂交缓冲液的储液池和密闭储液池上侧开口的管盖,储液池置入管身的上部,储液池的上端与管身的开口上端密闭连接,储液池的底面上设置有连通底面上下侧的连通管,连通管下端与底面连接。
本发明中,储液池和管盖通过超声融合法组装在一起的,用于储存完整的杂交体系。
本发明中,储液池采用暗色调的颜色。
本发明中,储液池的底部外侧边缘设置有2个凸起,使得储液池与管身通过过盈配合的方式紧密结合。
有益效果:本发明与现有技术相比,具有以下优点:      
本发明提供了一种基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,有效地结合了PCR反应以及基因芯片的优势,弥补了其缺陷,在实现高通量检测多个基因信息的同时,有效地避免了扩增、扩增产物转移、杂交反应以及检测过程中可能出现的污染。PCR扩增、杂交反应以及荧光检测整个过程在一个封闭的PCR扩增管中完成,整个基因检测过程中避免与外界空气的接触以及产物转移可能带来的污染,极大地提高了基因检测的可靠性以及准确性。
由于本发明将特异性的核酸探针固定于管盖之内,并与管身构成一个相对封闭的空间,使得该发明可以被应用于一体式检测基因,能在上述相对封闭的空间内完成:(A)在管盖上固定上特异性核酸探针,在储液池中加入杂交反应体系,管盖与储液池通过超声融合组装在一起,用于储存完整的杂交体系;(B)将制备好的待检测基因提取物、扩增体系(包括相应的酶和引物等)加入到扩增管的管身之中,将管盖与储液池组装在一起并扣在管身上,使得管盖与管身形成一个封闭的空间;(C)将扩增管置于基因扩增仪中扩增,基因扩增仪可以使用各种成熟的仪器,也可以是通过改进的专用扩增杂交和检测一体化仪器;(D)基因扩增完成后,将扩增管倒置,管身内的扩增产物经过储液池底部上的连通管进入储液池中,并与管盖上的特异性核酸探针发生特异性的杂交反应;(E)检测核酸探针上的荧光信号,从而获得基因信息。本发明可以使基因扩增、杂交及检测在一个相对封闭的空间内完成,避免交叉污染,实现了基因扩增、杂交及检测的一体化。
管盖与储液池的组装是通过超声融合的方式实现的,该方法组装的优点在于密封性极高;储液池的颜色为黑色或其他暗色调,这种设计可以极大降低背景的荧光信号;储液池敞口较大,便于加样,操作简便,提高了实验的可操作性;储液池与管身通过过盈配合的方式紧密的结合在一起,使得扩增管倒置之后不会有溶液溢出。
管盖与储液池构成完整的杂交体系,包括核酸探针、杂交液等,该杂交体系与管身内的PCR体系完全隔绝,互不影响;在扩增管倒置之后,仅使少量的扩增产物通过储液池底部上的连通管进入储液池中,在杂交体系中与管盖上固定的核酸探针发生特异性的杂交反应,增强了杂交实验的准确性与可靠性。
附图说明
图1是现有专利中的PCR扩增管的结构示意图。
图2是本发明实施例1的结构示意图。
图3是储液池的详细结构示意图。  
图中有:管身1、储液池2、连通管21、凸起22、管盖3。 
具体实施方式
实施例1:
本发明的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,包括用于容纳PCR缓冲液的管身1、用于容纳杂交缓冲液的储液池2和密闭储液池2上侧开口的管盖3,储液池2置入管身1的上部,储液池2的上端与管身1的开口上端密闭连接,储液池2的底面上设置有连通底面上下侧的连通管21,连通管21下端与底面连接。储液池2和管盖3通过超声融合法组装在一起的,用于储存完整的杂交体系。其中,储液池2采用暗色调的颜色,储液池2的底部外侧边缘设置有2个凸起22,使得储液池2与管身1通过过盈配合的方式紧密结合。 
本发明的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,其使用方法如下:
(1)芯片的制备
管盖经清洗、等离子处理、化学修饰后在管盖3上得到活性基团,设计特异性的核酸探针使其一段带有相应的活性基团,通过点样仪将核酸探针按照一定的阵列固定到化学处理之后的管盖3上,制备出管盖芯片。
(2)基因扩增
扩增管管身1内事先加入相应的PCR扩增体系,包括所需的引物、酶以及缓冲液,储液池2中事先加入杂交缓冲液,在管身1内加入待检测基因后,盖好储液池2与管盖3,将扩增管置于PCR扩增仪上扩增。
(3)杂交
扩增结束之后,将扩增管倒置,使得扩增之后的溶液通过储液池2上的连通管进入管盖,与管盖3上固定的核酸探针发生杂交反应
(4)芯片检测
将管盖芯片置于荧光显微镜下,逐个扫描,检查杂交结果。
实施例2:
本发明的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管,包括可自由组装的管盖和管身,用于检测转基因大豆。管盖3上通过点样仪固定上转基因大豆转入基因的特异性探针,储液池2和管身1分别用来储存杂交体系和扩增体系。设计特异性的引物,并与待测基因一起加入到管身1,扩增之后,倒置扩增管,使得扩增产物进入管盖内,在杂交体系中与管盖3上的特异性核酸探针发生杂交反应。荧光扫描,若出现荧光,则基因被扩增,待测基因中含有转入基因,该样品来源于转基因大豆。

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1、(10)申请公布号 CN 103160431 A (43)申请公布日 2013.06.19 CN 103160431 A *CN103160431A* (21)申请号 201310132465.8 (22)申请日 2013.04.17 C12M 1/24(2006.01) (71)申请人 东南大学 地址 210096 江苏省南京市四牌楼 2 号 (72)发明人 刘全俊 叶晓峰 于静静 侯传荣 吴宏文 刘丽萍 刘航 (74)专利代理机构 江苏永衡昭辉律师事务所 32250 代理人 王剑 (54) 发明名称 基因检测一体完成的封闭型 PCR 扩增管 (57) 摘要 本发明公开了一种基因检测一体完成。

2、的封闭 型 PCR 扩增管, 包括用于容纳 PCR 缓冲液的管身、 用于容纳杂交缓冲液的储液池和密闭储液池上侧 开口的管盖, 储液池置入管身的上部, 储液池的上 端与管身的开口上端密闭连接, 储液池的底面上 设置有连通底面上下侧的连通管, 连通管下端与 底面连接。本发明不仅使 PCR、 基因杂交、 基因检 测能够在一个封闭体系中完成, 避免了交叉污染, 而且完全隔绝了PCR扩增体系和DNA杂交体系, 避 免了扩增体系中的缓冲液、 酶等成分对杂交反应 的影响, 极大地提高了基因检测的准确性和重复 性。本发明的封闭型 PCR 扩增管中的管盖使得加 样更加简便, 密封性更强, 检测准确性更好。 (5。

3、1)Int.Cl. 权利要求书 1 页 说明书 3 页 附图 1 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 权利要求书1页 说明书3页 附图1页 (10)申请公布号 CN 103160431 A CN 103160431 A *CN103160431A* 1/1 页 2 1.一种基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管, 其特征在于, 包括用于容纳PCR缓冲液 的管身 (1) 、 用于容纳杂交缓冲液的储液池 (2) 和密闭所述储液池 (2) 上侧开口的管盖 (3) , 所述储液池 (2) 置入管身 (1) 的上部, 储液池 (2) 的上端与管身 (1) 的开口上端密闭连接, 。

4、储液池 (2) 的底面上设置有连通底面上下侧的连通管 (21) , 所述连通管 (21) 下端与底面连 接。 2.根据权利要求1所述的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管, 其特征在于, 所述储 液池 (2) 和管盖 (3) 通过超声融合法组装在一起的, 用于储存完整的杂交体系。 3.如权利要求1或2所述的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管, 其特征在于, 所述 储液池 (2) 采用暗色调的颜色。 4.如权利要求1或2所述的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管, 其特征在于, 所述 储液池 (2) 的底部外侧边缘设置有 2 个凸起 (22) , 使得储液池 (2) 与管身 (1) 通过过盈配。

5、合 的方式紧密结合。 权 利 要 求 书 CN 103160431 A 2 1/3 页 3 基因检测一体完成的封闭型 PCR 扩增管 技术领域 0001 本发明涉及一种封闭型的 PCR 扩增管, 可以用于一体式检测基因信息, 即在同一 个封闭的空间内依次完成基因扩增、 杂交、 检测等相应功能。 背景技术 0002 目前, 在分子生物学、 基因检测、 疾病的检测与诊断等各种涉及核酸分子的检测及 研究过程中, 聚合酶链式反应都是不可或缺的技术之一。众所周知, PCR(聚合酶链式反应, Polymerase Chain Reaction) , 扩增方法灵敏度极高, 可以将原本浓度很低的待测基因扩 增。

6、到数万至数百万倍的浓度, 其扩增产物一般可以使用电泳的方法来检测。正因为 PCR 扩 增的高灵敏度, 在扩增过程中很容易发生交叉污染, 而且该污染很容易被放大, 出现 “假阳 性” 的现象。其次, 一次 PCR 反应一般情况下只能检测一个基因的信息, 不能实现对多个基 因的高通量检测, 因此, 还无法满足人们对于多基因同时检测的需求。 0003 基因芯片的出现, 实现了同时检测多个基因的想法, 使得高通量检测基因成为了 可能。 一般情况下, 将大量事先设计的特异性核酸探针, 通过原位合成法或点样法等方法固 定在玻片等基因芯片载体上, 构建出基因芯片 ; 将标记了荧光分子的待测基因, 与基因芯片。

7、 上的核酸分子进行杂交, 利用芯片荧光扫描仪对基因芯片上的杂交信号进行检测与分析。 尽管利用基因芯片可以高通量地获得基因的信息, 同时检测多个基因, 但是其待测基因的 扩增、 扩增产物转移以及杂交都是在不同的体系中完成, 每个过程的衔接中难免都增大了 污染的可能性, 从而降低了实验检测的可靠性。 发明内容 0004 技术问题 : 本发明提供了一种能有效地避免 PCR 缓冲液对杂交过程的影响, 提高 杂交检测的准确性和可靠性的基因检测一体完成的封闭型 PCR 扩增管。 0005 技术方案 : 本发明的基因检测一体完成的封闭型PCR扩增管, 包括用于容纳PCR缓 冲液的管身、 用于容纳杂交缓冲液的。

8、储液池和密闭储液池上侧开口的管盖, 储液池置入管 身的上部, 储液池的上端与管身的开口上端密闭连接, 储液池的底面上设置有连通底面上 下侧的连通管, 连通管下端与底面连接。 0006 本发明中, 储液池和管盖通过超声融合法组装在一起的, 用于储存完整的杂交体 系。 0007 本发明中, 储液池采用暗色调的颜色。 0008 本发明中, 储液池的底部外侧边缘设置有 2 个凸起, 使得储液池与管身通过过盈 配合的方式紧密结合。 0009 有益效果 : 本发明与现有技术相比, 具有以下优点 : 本发明提供了一种基因检测一体完成的封闭型 PCR 扩增管, 有效地结合了 PCR 反应以 及基因芯片的优势,。

9、 弥补了其缺陷, 在实现高通量检测多个基因信息的同时, 有效地避免了 扩增、 扩增产物转移、 杂交反应以及检测过程中可能出现的污染。 PCR扩增、 杂交反应以及荧 说 明 书 CN 103160431 A 3 2/3 页 4 光检测整个过程在一个封闭的 PCR 扩增管中完成, 整个基因检测过程中避免与外界空气的 接触以及产物转移可能带来的污染, 极大地提高了基因检测的可靠性以及准确性。 0010 由于本发明将特异性的核酸探针固定于管盖之内, 并与管身构成一个相对封闭的 空间, 使得该发明可以被应用于一体式检测基因, 能在上述相对封闭的空间内完成 :(A) 在 管盖上固定上特异性核酸探针, 在储。

10、液池中加入杂交反应体系, 管盖与储液池通过超声融 合组装在一起, 用于储存完整的杂交体系 ;(B) 将制备好的待检测基因提取物、 扩增体系 (包括相应的酶和引物等) 加入到扩增管的管身之中, 将管盖与储液池组装在一起并扣在 管身上, 使得管盖与管身形成一个封闭的空间 ;(C) 将扩增管置于基因扩增仪中扩增, 基因 扩增仪可以使用各种成熟的仪器, 也可以是通过改进的专用扩增杂交和检测一体化仪器 ; (D) 基因扩增完成后, 将扩增管倒置, 管身内的扩增产物经过储液池底部上的连通管进入储 液池中, 并与管盖上的特异性核酸探针发生特异性的杂交反应 ;(E) 检测核酸探针上的荧 光信号, 从而获得基因。

11、信息。 本发明可以使基因扩增、 杂交及检测在一个相对封闭的空间内 完成, 避免交叉污染, 实现了基因扩增、 杂交及检测的一体化。 0011 管盖与储液池的组装是通过超声融合的方式实现的, 该方法组装的优点在于密封 性极高 ; 储液池的颜色为黑色或其他暗色调, 这种设计可以极大降低背景的荧光信号 ; 储 液池敞口较大, 便于加样, 操作简便, 提高了实验的可操作性 ; 储液池与管身通过过盈配合 的方式紧密的结合在一起, 使得扩增管倒置之后不会有溶液溢出。 0012 管盖与储液池构成完整的杂交体系, 包括核酸探针、 杂交液等, 该杂交体系与管身 内的 PCR 体系完全隔绝, 互不影响 ; 在扩增管。

12、倒置之后, 仅使少量的扩增产物通过储液池底 部上的连通管进入储液池中, 在杂交体系中与管盖上固定的核酸探针发生特异性的杂交反 应, 增强了杂交实验的准确性与可靠性。 附图说明 0013 图 1 是现有专利中的 PCR 扩增管的结构示意图。 0014 图 2 是本发明实施例 1 的结构示意图。 0015 图 3 是储液池的详细结构示意图。 图中有 : 管身 1、 储液池 2、 连通管 21、 凸起 22、 管盖 3。 具体实施方式 0016 实施例 1 : 本发明的基因检测一体完成的封闭型 PCR 扩增管, 包括用于容纳 PCR 缓冲液的管身 1、 用于容纳杂交缓冲液的储液池2和密闭储液池2上侧。

13、开口的管盖3, 储液池2置入管身1的 上部, 储液池 2 的上端与管身 1 的开口上端密闭连接, 储液池 2 的底面上设置有连通底面上 下侧的连通管 21, 连通管 21 下端与底面连接。储液池 2 和管盖 3 通过超声融合法组装在一 起的, 用于储存完整的杂交体系。其中, 储液池 2 采用暗色调的颜色, 储液池 2 的底部外侧 边缘设置有 2 个凸起 22, 使得储液池 2 与管身 1 通过过盈配合的方式紧密结合。 0017 本发明的基因检测一体完成的封闭型 PCR 扩增管, 其使用方法如下 : (1) 芯片的制备 管盖经清洗、 等离子处理、 化学修饰后在管盖 3 上得到活性基团, 设计特异。

14、性的核酸探 说 明 书 CN 103160431 A 4 3/3 页 5 针使其一段带有相应的活性基团, 通过点样仪将核酸探针按照一定的阵列固定到化学处理 之后的管盖 3 上, 制备出管盖芯片。 0018 (2) 基因扩增 扩增管管身 1 内事先加入相应的 PCR 扩增体系, 包括所需的引物、 酶以及缓冲液, 储液 池2中事先加入杂交缓冲液, 在管身1内加入待检测基因后, 盖好储液池2与管盖3, 将扩增 管置于 PCR 扩增仪上扩增。 0019 (3) 杂交 扩增结束之后, 将扩增管倒置, 使得扩增之后的溶液通过储液池 2 上的连通管进入管 盖, 与管盖 3 上固定的核酸探针发生杂交反应 (4。

15、) 芯片检测 将管盖芯片置于荧光显微镜下, 逐个扫描, 检查杂交结果。 0020 实施例 2 : 本发明的基因检测一体完成的封闭型 PCR 扩增管, 包括可自由组装的管盖和管身, 用 于检测转基因大豆。管盖 3 上通过点样仪固定上转基因大豆转入基因的特异性探针, 储液 池 2 和管身 1 分别用来储存杂交体系和扩增体系。设计特异性的引物, 并与待测基因一起 加入到管身 1, 扩增之后, 倒置扩增管, 使得扩增产物进入管盖内, 在杂交体系中与管盖 3 上 的特异性核酸探针发生杂交反应。荧光扫描, 若出现荧光, 则基因被扩增, 待测基因中含有 转入基因, 该样品来源于转基因大豆。 说 明 书 CN 103160431 A 5 1/1 页 6 图 1 图 2 图 3 说 明 书 附 图 CN 103160431 A 6 。

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