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利用了RNA干扰法的水稻矮缩病毒抵抗性稻的制作方法
技术领域
本发明涉及水稻矮缩病毒抵抗性稻的制作方法。更具体地，本发明涉及：使用了编码水稻矮缩病毒复制所必须的节段基因组(segmental genome)的核酸分子的、水稻矮缩病毒抵抗性稻的制作方法。
背景技术
1930年代已经证明水稻矮缩病毒由叶蝉转播、并且在成虫体内增殖(非专利文献1＝Fukishi，T：J，Fac.Hokkaido Imp.Univ.45，83-154(1940))。关于各种病毒，生物学上多种多样的传播形式逐渐被阐明。以昆虫为媒介的植物病毒按其传播方式大致分为4类(非专利文献2：上田一郎および玉田哲男「植物ウイルスと媒介生物の相互関係」細胞工学別冊  植物細胞工学シリ一ズ分子レベルからみた植物の耐病性-植物と病原菌の相互作用に迫る-156～165 1997年)。
稻矮缩病的防治通过对作为媒介昆虫的斐豹蛱蝶(Argyreus hyperbius)等叶蝉类进行药物处理来实施。一旦有稻矮缩病发生，则这种发生在数年间都不会结束。因此，若想通过药物处理来防治稻矮缩病，就必须使用大量的药物，其结果是引发环境污染。
作为水稻矮缩病毒防治的替代手段，可以认为抵抗性品种的利用是最有效的方法之一。目前为止，本发明人等使用稻品种中的基因破坏系统(突变体面板，Mutant panel)分离水稻矮缩病毒的感染/增殖相关的基因，并开发稻的病毒病抵抗性育种素材的制作方法。上述的稻基因破坏系统之一在对水稻矮缩病毒的敏感性方面发生变化，对本病毒显示出抵抗性。在使用上述基因进行上述基因破坏系统的转化时，对水稻矮缩病毒的感染性恢复到与野生型稻等同，结论为所得基因是与水稻矮缩病毒的增殖相关的基因。此外，在上述基因的破坏系统中，虽然对稻瘟病(いもち病)也显示获得了抵抗性，但在稻的生长方面，却仅有轻微劣化。
至今为止，有报道称：尝试了通过水稻矮缩病毒节段基因组S3或S8的有义链或反义链的重组来制作水稻矮缩病毒抵抗性稻(非专利文献4：育種学研究，2001，第3巻、別冊1号，第260页)、和通过水稻矮缩病毒节段基因组S8的转录后型基因沉默来制作水稻矮缩病毒抵抗性的稻(非专利文献3：Ma等，Acta Botanica Sinica，2004，46(3)：332-336)。
一般而言，病毒包膜蛋白质(envelope protein)对而言是病毒感染必须的，且在病毒粒子的构成上也是必须的。病毒抵抗性基因重组植物的开发中的主流是，以病毒包膜蛋白质和/或编码它们的节段基因组为靶标，将这些病毒包膜蛋白质基因导入植物。在RDV方面，也相似地进行了以编码形成病毒粒子内壳蛋白质第1层的蛋白质(P3)的S3(非专利文献4)或编码形成外壳蛋白质第2层的蛋白质(P8)的S8(非专利文献3和非专利文献4)为靶标的研究。其具体理由，有以下3点：
(1)如上述，RDV粒子由外壳和内壳这2层构成，如果没有P3和P8，则不能成为粒子，因此，以编码P3或P8的节段基因组(S3或S8)为靶标是重要的；
(2)一般而言，诸如RDV这样的植物病毒在侵入植物体后，会扩散至全身(转距离转移)，可以认为大部分的病毒以病毒粒子的形式转移，从这一点来看，以编码P3或P8的节段基因组(S3或S8)为靶标也是重要的；
(3)如果没有S3、S8所编码的蛋白质，则双链RNA基因组会暴露于感染细胞内，存在成为宿主的RNA干扰系统的靶标的可能性。因而，可以认为S3和S8所编码的蛋白质在保护病毒基因组方面也是必须的蛋白质，所以以编码这些蛋白质的节段基因组为靶标是重要的。
目前为止，可以认为：通过基于上述考虑制作的水稻矮缩病毒抵抗性稻获得了约90％的水稻矮缩病毒抵抗性集团(非专利文献3)。但是，尽管有这样的评价，这样的水稻矮缩病毒抵抗性稻尚未达到实用化。
发明内容
发明所要解决的问题
希望能够获得适于实用化的水稻矮缩病毒抵抗性稻的制作方法以及抵抗性型品种。
解决问题的方法
为了解决上述问题，本发明着眼于抵抗性的评价。而且，对于非专利文献3所示的水稻矮缩病毒抵抗性稻，采用新的评价方法重新进行了评价，可知：被水稻矮缩病毒感染的个体集团中、“完全抵抗性”稻和“发病延迟型抵抗性”稻的比例的“合计”仅为约80％(即，这只是约80％抵抗性集团)。并不希望拘泥于理论，但可以认为以如此程度包含敏感性植物，这正是非专利文献3的技术未达到实用化的原因。为了实现实用化，相对于水稻矮缩病毒感染植物体总计的“完全抵抗性”稻与“发病延迟型”稻的合计比例为接近100％(获得100％抵抗性集团)是重要的，获得如此之高的抵抗性比例，应该作为“水稻矮缩病毒抵抗性稻”来进行评价。以上述新标准来进行评价，则以S12为靶标、或以S4为靶标，“完全抵抗性”稻与“发病延迟型”稻的合计比例均为基本上100％，是100％抵抗性集团。
为了制作显示无病症水平更高的抵抗性、赋予了抑制或稳定抵抗性的抗水稻矮缩病毒型稻，以及实现水稻矮缩病毒抵抗性稻的实用化，本发明人等以评价公知的抵抗性稻的问题为目的，重新研究了以包膜蛋白质/编码它们的基因组为靶标制作的水稻矮缩病毒抵抗性稻的评价，结果判明：以前报导的抵抗性个体为集团的接近90％的集团中，完全抵抗性个体仅为60％左右。RNA干扰法并非100％抑制靶标基因表达(敲除)，虽然不是100％，但仍以高比率进行表达抑制(敲低)，因此，基于RNA干扰法的机理，明确地区别完全抵抗性个体与发病延迟型抵抗性个体，对于正确地进行评价而言是极其重要的。
本发明人等首次发现：当在传统的病毒包膜蛋白质/节段基因组以外，选择Pns12(S12)作为靶标来制作病毒抵抗性稻时，能够获得100％的完全抵抗性个体(没有1个个体确认到病症)。在以Pns4(S4)为靶标时，在稻矮缩病病毒感染稻植物体的集团中，获得的个体的比例是完全抵抗性个体为60％，发病延迟型抵抗性个体为40％。Pns12是被称作病毒原质体的作为病毒合成的锚地的蛋白质，而Pns4是在感染细胞中的RDV输送中起作用的蛋白质。因而，不希望拘泥于理论，但可以认为，与以感染所必须的蛋白质为靶标来防御感染本身相比，以感染后病毒增殖的任何过程相关的蛋白质为靶标来防御RDV增殖，结果可以获得基本上100％的水稻矮缩病毒抵抗性集团(即，100％抵抗性集团)。由此，应该可以实现水稻矮缩病毒抵抗性稻的实用化。
面向这样的水稻矮缩病毒抵抗性稻的开发，本发明提供：包含存在于水稻矮缩病毒基因组中的至少1种基因的表达抑制剂的、用于赋予对稻矮缩病的抵抗性的组合物。
此外，本发明还提供：生产赋予了对稻矮缩病的抗性、能够被水稻矮缩病毒感染的禾本科植物的方法。该方法提供包含：A)提供存在于水稻矮缩病毒基因组中的至少1种基因的表达抑制剂的步骤；B)将该表达抑制剂导入该植物的细胞的步骤；C)选择导入了该表达抑制剂的植物的细胞的步骤；和D)使该选择出的细胞再分化来制作转基因植物的步骤；的方法。对于这里所获得的转基因植物的“抵抗性”，采用新的评价方法，对“完全抵抗性”个体与“发病延迟型”个体的合计或者”完全抵抗性”个体进行分别评价。
在本发明的一个方面中，提供包含存在于水稻矮缩病毒基因组中的至少1种基因的表达抑制剂的、用于赋予对稻矮缩病的抵抗性的组合物。
在一个实施方式中，上述组合物相对于稻矮缩病病毒感染个体集团赋予100％抵抗性集团(相对于水稻矮缩病毒感染稻的总计，完全抵抗性稻与发病延迟型稻的合计比例为基本上100％)。在优选的实施方式中，上述组合物能够赋予70％完全抵抗性集团(相对于水稻矮缩病毒感染植物体的个体数总计，有约70％为完全抵抗性)。在更优选的实施方式中，上述组合物能够赋予100％完全抵抗性集团(相对于水稻矮缩病毒感染植物体的个体数总计，100％为完全抵抗性)。
在一个实施方式中，上述至少1种基因可以选自由S1(SEQ ID NO：1)、S3(SEQ ID NO：5)、S4(SEQ ID NO：7)、S5(SEQ ID NO：9)、S6(SEQ ID NO：11)、S7(SEQ ID NO：13)、S9(SEQ ID NO：17)、S11(SEQ ID NO：21)和S12(SEQID NO：23)、以及编码这些基因的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体组成的组。在优选的实施方式中，上述至少1种基因可以选自由S4(SEQ ID NO：7)、S6(SEQ ID NO：11)、S11(SEQ ID NO：21)和S12(SEQ ID NO：23)、以及编码这些基因的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体组成的组。而且，在优选实施方式中，上述基因可以选自由S6(SEQ ID NO：11)、S11(SEQ ID NO：21)和S12(SEQ ID NO：23)、以及编码这些基因的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体组成的组。
在其它优选实施方式中，上述至少1种基因可以是S12(SEQ ID NO：23)、以及编码这些基因的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体。
在更优选的实施方式中，上述表达抑制剂可以包含：
(a)由SEQ ID NO：52所示的核酸序列构成的泛素启动子；
(b)与(i)SEQ ID NO：25所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：25所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
互补的反义序列；
(c)由SEQ ID NO：46所示的核酸序列构成的修剪(trimming)序列；
(d)由(i)SEQ ID NO：25所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：25所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
构成的有义序列；以及
(e)终止子序列。
在其它优选实施方式中，上述表达抑制剂可以包含：
(a’)由SEQ ID NO：52所示的核酸序列构成的泛素启动子；
(b’)与(i)SEQ ID NO：26所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：26所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
互补的反义序列；
(c’)由SEQ ID NO：46所示的核酸序列构成的修剪序列；
(d’)由(i)SEQ ID NO：26所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：26所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
构成的有义序列；以及
(e’)终止子序列。
而且，在其它优选实施方式中，上述表达抑制剂可以包含：
(a”)由SEQ ID NO：52所示的核酸序列构成的泛素启动子；
(b”)与(i)SEQ ID NO：27所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：27所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
互补的反义序列；
(c”)由SEQ ID NO：46所示的核酸序列构成的修剪序列；
(d”)由(i)SEQ ID NO：27所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：27所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
构成的有义序列；以及
(e”)终止子序列。
而且，在另一个优选的实施方式中，上述表达抑制剂可以包含：
(a”’)由SEQ ID NO：52所示的核酸序列构成的泛素启动子；
(b”’)与(i)SEQ ID NO：28所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：28所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
互补的反义序列；
(c”’)由SEQ ID NO：46所示的核酸序列构成的修剪序列；
(d”’)由(i)SEQ ID NO：28所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：17所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
构成的有义序列；以及
(e”’)终止子序列。
在一个实施方式中，上述至少1种基因可以选自由S1(SEQ ID NO：1)、S3(SEQ ID NO：5)、S4(SEQ ID NO：7)、S5(SEQ ID NO：9)、S6(SEQ ID NO：11)、S7(SEQ ID NO：13)、S9(SEQ ID NO：17)、S11(SEQ ID NO：21)和S12(SEQID NO：23)、以及编码这些基因的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体组成的组。
在本发明的一个方面中，本发明可以提供一种表达盒，其包含与选自存在于水稻矮缩病毒基因组中的S1(SEQ ID NO：1)、S3(SEQ ID NO：5)、S4(SEQ ID NO：7)、S5(SEQ ID NO：9)、S6(SEQ ID NO：11)、S7(SEQ ID NO：13)、S9(SEQ ID NO：17)、S11(SEQ ID NO：21)和S12(SEQ ID NO：23)、以及编码这些基因的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体中的核酸序列的全部或一部分互补的反义序列、修剪序列、和与上述反义序列互补的有义序列。在优选的实施方式中，上述表达盒中的上述核酸序列可以选自由S6(SEQ ID NO：11)、S11(SEQ ID NO：21)和S12(SEQ ID NO：23)、以及编码这些基因的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体组成的组。在更优选的实施方式中，上述表达盒中的上述核酸序列可以是S12(SEQ ID NO：23)和编码该基因的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体。
在其它实施方式中，上述表达盒中的上述反义序列可以选自由SEQ IDNO：25的反义序列、SEQ ID NO：26的反义序列、SEQ ID NO：27的反义序列和SEQ ID NO：28的反义序列、以及在SEQ ID NO：25～28中的任一个所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体的反义序列组成的组，而上述修剪序列可以是SEQ ID NO：46。
在优选的实施方式中，上述表达盒可以包含：
(a)由SEQ ID NO：52所示的核酸序列构成的泛素启动子；
(b)与(i)SEQ ID NO：25所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：25所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体、
互补的反义序列；
(c)由SEQ ID NO：46所示的核酸序列构成的修剪序列；
(d)由(i)SEQ ID NO：25所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：25所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
构成的有义序列；以及
(e)终止子序列。
在其它优选的实施方式中，上述表达盒可以包含：
(a’)由SEQ ID NO：52所示的核酸序列构成的泛素启动子；
(b’)与(i)SEQ ID NO：26所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：26所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
互补的反义序列；
(c’)由SEQ ID NO：46所示的核酸序列构成的修剪序列；
(d’)由(i)SEQ ID NO：26所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：26所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
构成的有义序列；以及
(e’)终止子序列。
而且，在其它优选的实施方式中，上述表达盒可以包含：
(a”)由SEQ ID NO：52所示的核酸序列构成的泛素启动子；
(b”)与(i)SEQ ID NO：27所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：27所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
互补的反义序列；
(c”)由SEQ ID NO：46所示的核酸序列构成的修剪序列；
(d”)由(i)SEQ ID NO：27所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：27所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
构成的有义序列；以及
(e”)终止子序列。
而且，在其它优选的实施方式中，上述表达盒可以包含：
(a”’)由SEQ ID NO：52所示的核酸序列构成的泛素启动子；
(b”’)与(i)SEQ ID NO：28所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：28所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
互补的反义序列；
(c”’)由SEQ ID NO：46所示的核酸序列构成的修剪序列；
(d”’)由(i)SEQ ID NO：28所示的核酸序列、或者
(ii)在SEQ ID NO：17所示的核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体
构成的有义序列；以及
(e”’)终止子序列。
在进一步的方面中，本发明提供：包含上述表达盒的载体；包含上述载体的植物细胞；包含上述载体的植物体；包含上述载体的种子。
在一个实施方式中，上述植物体可以对水稻矮缩病毒显示完全抵抗性。
在一个方面中，本发明提供生产赋予了对稻矮缩病的抗性、能够被水稻矮缩病毒感染的禾本科植物的方法，上述方法可以包括以下步骤：
A)提供本发明的载体的步骤；
B)将本发明的载体导入上述植物的细胞的步骤；
C)选择导入了本发明的载体的植物的细胞的步骤；和
D)使上述选择出的细胞再分化来制作转基因植物的步骤。
在其它方面中，本发明提供生产赋予了对稻矮缩病的抗性、能够被水稻矮缩病毒感染的植物的种子的方法，上述方法可以包括以下步骤：
A)提供本发明的载体的步骤；
B)将本发明的载体导入上述植物的细胞的步骤；
C)选择导入了本发明的载体的植物的细胞的步骤；
D)使上述选择出的细胞再分化来制作转基因植物的步骤；和
E)从上述转基因植物获得种子的步骤。
而且，在其它方面中，本发明提供循环生产赋予了对稻矮缩病的抗性、能够被水稻矮缩病毒感染的植物的方法，上述方法可以包括以下步骤：
A)提供包含本发明的载体的种子的步骤；
B)使上述种子生长来获得成熟植物体的步骤；
C)从上述植物体获得种子的步骤。
如上述，通过包含以节段基因组(所述节段基因组编码作为传统靶标的水稻矮缩病毒包膜蛋白质以外的蛋白，优选为编码病毒原质体的节段基因组)为靶标的表达抑制剂的组合物，可以提供无病症水平更高的、即100％抵抗性集团(相对于水稻矮缩病毒感染植物体的个体数总计，完全抵抗性稻与发病延迟型稻的合计比例显示接近100％)、优选至少约70％完全抵抗性集团(相对于水稻矮缩病毒感染植物体的个体数总计，至少约70％显示完全抵抗性)、或更优选约100％完全抵抗性集团(相对于水稻矮缩病毒感染植物体的个体数总计，接近100％显示完全抵抗性)，并可以提供赋予了抑制或稳定抵抗性的抗水稻矮缩病毒型稻的制作方法和抵抗性品种。
附图说明
图1显示了在接种18小时后的RDV感染的叶蝉媒介单层细胞(VCM)中，RDV的Pns4蛋白质、Pns6蛋白质、Pns10蛋白质、Pns11蛋白质和Pns12蛋白质的细胞定位。Pns4、Pns6、Pns10和Pns11的免疫染色以绿色显示，Pns 12的免疫染色以红色显示。Pns6与Pns11的共定位以黄色显示。
图2显示了接种18小时后的RDV感染VCM中，具有RDV的Pns6(a)、Pns11(b)和Pns12(c)的高电子密度包涵体的免疫金标记。标尺(bar)表示300nm。
图3显示了病毒感染的VCM中，RDV的P1、P2、P3、P5、P7、P8、P9和Pns12的细胞定位。P1、P2、P3、P5、P7、P8和P9的免疫染色以绿色显示，Pns 12的免疫染色以红色显示。P1、P2、P3、P5、P7、P8和P9、与Pns12的共定位以黄色显示。
图4显示了接种18小时后的RDV感染的VCM中，高电子密度包涵体周边的RDV核心和内壳蛋白质P1、P3、P5和P7、或外壳蛋白质P2、P8和P9的免疫金标记。P7中的插图显示了P7定位于单个核心样粒子上。箭头表示核心样粒子。标尺表示300nm。
图5显示了接种48小时后的重组杆状病毒感染的Sf9细胞中，Pns12的细胞定位。(a)通过使用FITC结合Pns12特异性IgG进行Pns12的免疫荧光染色，明确了斑状包涵体的形成。(b)与高电子密度包涵体的Pns12聚集的免疫金标记。标尺表示300nm。
图6显示了在滤膜结合测定中显示出的RDV的Pns12的自聚集。(a)通过用考马斯亮蓝(CBB)进行染色，实现了膜上蛋白质的可视化。(b)使用MBP(麦芽糖结合蛋白质；对照)和RDV的MBP融合Pns12(MBP-Pns12)作为检测Pns12与Pns12本身结合的探针。
图7显示了接种后的各时间点病毒感染的VCM中，RDV的Pns12和P8的细胞定位。P8的免疫染色以绿色显示，Pns12的免疫染色以红色显示。在重叠图像中，Pns12和P8的共定位以黄色显示。
图8显示了在RDV感染的细胞中，RNA合成的位置。
图9显示了在体内RDV的Pns4的磷酸化。显示了感染N.cincticeps(黑尾叶蝉)细胞(+)和非感染N.cincticeps细胞(-)的分级免疫沉淀物的放射自显影结果。标志物为磷酸化酶B(97.4kDa)、牛血清白蛋白(66.0kDa)、卵清蛋白(45.0kDa)、碳酸酐酶(29.0kDa)和β-乳球蛋白(18.4kDa)。
图10显示了患病稻的叶和运输病毒的N.cincticeps的马氏管的细胞中，Pns4的位置。A：RDV感染的稻的叶中，无定形包涵体内的Pns4的免疫金标记。B：Pns4聚集成病毒媒介昆虫中的直径约10nm的微管结构的束。标尺表示300nm。
图11显示了在接种后的各时间点确定的、病毒感染的VCM中RDV的Pns4和Pns12的共定位。Pns4的免疫染色以绿色显示，Pns12的免疫染色以红色显示。接种后10小时的图片中的Pns4的环状结构以箭头示出。Pns4和Pns12的共定位以黄色显示。
图12为显示RDV感染的VCM中Pns4的分布的电子显微镜照片。A：Pns4定位于接种12小时后的病毒原质体的周边。B：Pns4在接种18小时后定位于纤维状物质(箭头)。C：接种36小时后的呈微管结构的Pns4(箭头)。D：从微管的横截面观察，可见闭合指环状的类晶体排列。E：Pns4存在于来自接种36小时后的感染VCM的浸渍制备物的各种长度的管中。条在A～D中表示300nm，在E中表示150nm。VP，病毒原质体；FM，纤维状物质；MnT，微管结构。
图13显示了接种48小时后的重组杆状病毒感染的Sf9细胞中，Pns4的细胞定位。A：Pns4的免疫荧光染色。B：Pns4的免疫金标记，显示出聚集在感染细胞的表面的Pns4。标尺表示300nm。
图14显示了接种18小时后的病毒感染的VCM中的管的电子显微镜照片。(A)被从细胞表面延伸并扩展的细胞膜包围起来的管。(B)管中的Pns10的免疫金标记。(C)管内的电子密集粒子中的病毒抗原。标尺表示300nm。
图15显示了病毒感染的VCM中，RDV的Pns10的细胞定位。(A)接种10小时后的细胞定位。(B)接种14小时后的细胞定位。(C)接种36小时后的细胞定位。标尺表示25μm。
图16显示了：转化体本代(T0)株中目的基因导入的确认(A)、以及通过切割导入的基因引起的T0株细胞中小分子RNA的蓄积(B)。Empty表示用于对照的、用无导入基因的载体转化的本代(T0)植物体。
图17显示Trigger12N导入转化体(Trigger12N)的接种测试的结果。图17A：左侧的钵为野生型株(Empty)(左为健全株(Mock)、右为RDV接种株(RDV))，右侧的钵为Trigger12N导入转化体(RDV接种株)。图17B：显示了Trigger12N导入转化体(Trigger12N)中的导入基因与感染抵抗性之间的关系。图中的简称含义如下。S：接种后3星期以内发病，D：发病延迟型抵抗性(接种后3-8周发病)，R：抵抗性(无病症接种后8星期)，RPS7：对照。
图18显示了Trigger4N导入转化体(Trigger4N)的接种测试的结果。图18A：左侧的钵为野生型株(Empty)(左为健全株(Mock)、右为RDV接种株(RDV))，右侧的钵为Trigger4N导入转化体(RDV接种株)。图18B：显示了Trigger4N导入转化体(Trigger4N)中的导入基因与感染抵抗性之间的关系。图中的简称含义如下。S：接种后3星期以内发病，D：发病延迟型抵抗性(接种后3-8周发病)，R：抵抗性(无病症接种后8星期)，RPS7：对照。
图19为本发明的转化稻的制作方法中使用的载体的模式图。
序列说明
SEQ ID NO：1：节段基因组S1的核酸序列
(GenBank登录号D90198)
SEQ ID NO：2：节段基因组S1所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：3：节段基因组S2的核酸序列
(GenBank登录号AB001580来源)
SEQ ID NO：4：节段基因组S2所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：5：节段基因组S3的核酸序列
(GenBank登录号D00693)
SEQ ID NO：6：节段基因组S3所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：7：节段基因组S4的核酸序列
(GenBank登录号X54622)
SEQ ID NO：8：节段基因组S4所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：9：节段基因组S5的核酸序列
(GenBank登录号D90033)
SEQ ID NO：10：节段基因组S5所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：11：节段基因组S6的核酸序列
(GenBank登录号M91653)
SEQ ID NO：12：节段基因组S6所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：13：节段基因组S7的核酸序列
(GenBank登录号D00639)
SEQ ID NO：14：节段基因组S7所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：15：节段基因组S8的核酸序列
(GenBank登录号D13773)
SEQ ID NO：16：节段基因组S8所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：17：节段基因组S9的核酸序列
(GenBank登录号D13404)
SEQ ID NO：18：节段基因组S9所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：19：节段基因组S10的核酸序列
(GenBank登录号D00241)
SEQ ID NO：20：节段基因组S10所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：21：节段基因组S11的核酸序列
(GenBank登录号D10249)
SEQ ID NO：22：节段基因组S11所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：23：节段基因组S12的核酸序列
(GenBank登录号S72085)
SEQ ID NO：24：节段基因组S12所编码的氨基酸序列
SEQ ID NO：25：Trigger(触发器)12N的核酸序列
SEQ ID NO：26：Trigger 12C的核酸序列
SEQ ID NO：27：Trigger 4N的核酸序列
SEQ ID NO：28：Trigger 4C的核酸序列
SEQ ID NO：29：Trigger 1(RDV S1部分序列)的核酸序列
SEQ ID NO：30：Trigger 2(RDV S2部分序列)的核酸序列
SEQ ID NO：31：Trigger 3(RDV S3部分序列)的核酸序列
SEQ ID NO：32：Trigger 5(RDV S5部分序列)的核酸序列
SEQ ID NO：33：Trigger 6(RDV S6部分序列)的核酸序列
SEQ ID NO：34：Trigger 7(RDV S7部分序列)的核酸序列
SEQ ID NO：35：Trigger 9(RDV S9部分序列)的核酸序列
SEQ ID NO：36：Trigger 10(RDV S10部分序列)的核酸序列
SEQ ID NO：37：Trigger 11(RDV S11部分序列)的核酸序列
SEQ ID NO：38：引物S12-GSF1
SEQ ID NO：39：引物S12-GSR1
SEQ ID NO：40：引物S12-GSF2
SEQ ID NO：41：引物S12-GSR2
SEQ ID NO：42：引物S04-GSF1
SEQ ID NO：43：引物S04-GSR1
SEQ ID NO：44：引物S04-GSF2
SEQ ID NO：45：引物S04-GSR2
SEQ ID NO：46：GUS序列
SEQ ID NO：47：引物S4S12-GSR1
SEQ ID NO：48：引物S12S04-GSF1
SEQ ID NO：49：Trigger 12N2
SEQ ID NO：52：Trigger 4N2
SEQ ID NO：51：Trigger 12N4N
SEQ ID NO：52：泛素启动子序列
(Genbank登录号AY452736来源)
SEQ ID NO：53：节段基因组S8的核酸序列
(GenBank登录号D00536)
SEQ ID NO：54：节段基因组S8所编码的氨基酸序列
以下，对本发明进行说明。本说明书的全部内容中，如无特殊提及，单数形式的表现应该理解为也包含复数形式的概念。因而，单数形的冠词或形容词(例如、英语中的“a”、“an”、“the”等)，如无特殊提及，应理解为也包含其复数形式的概念。此外，本说明书中使用的术语，如无特殊提及，应理解为用作本领域通常使用的含意味。因而，只要不另行定义，本说明书中使用的所有专门术语和科学技术术语具有与本发明所属领域的本领域技术人员一般理解的含义相同的含意。如有矛盾，以本说明书(包括定义)为准。
(术语的定义)
以下列举出本说明书中特别使用的术语的定义。
在本说明书中，“水稻矮缩病毒”也称RDV，是属于呼吸道肠道病毒属(Reovirus)的植物呼吸道肠道病毒的成员。已知该病毒的基因组是12节段的双链RNA。各RNA节段大体上编码1种蛋白质。壳体内部包含RNA聚合酶，与感染后立即进行病毒mRNA合成有关。该病毒具有构成粒子的7种结构蛋白质，并且具有因在聚丙烯酰胺凝胶中的电泳迁移率不同而被称为S1～S12的分成12个节段的双链RNA(dsRNA)作为基因。此外，该病毒是直径约70nm、分子量约7000万道尔顿的巨大球状病毒。该病毒分布于禾本科植物中。RDV为了逃避宿主的防御机制，而将基因组的复制在壳体内，只将新转录产生的mRNA释放到细胞质中。人们发现：为此，在其壳体内部具有由RNA依赖RNA聚合酶、加帽酶和核酸结合蛋白质构成的称作转录复合体的蛋白质复合体。此外还发现：RDV的壳体具有由P3蛋白质120分子构成的内壳、和由P8蛋白质780分子构成的外壳这样的双重壳结构，是直径约的球壳结构。此外，已经确认，RDV存在多个亚种系统和变种系统。因而，本领域技术人员容易理解的是，在本说明书中使用的术语“RDV”当然也指RDV的亚种系统和变种系统。作为典型的亚种系统和变种系统，可以列举出O株(本发明人等分离)、秋田株(秋田县立大学分离)、Chinese株(中国株，中国北京大学分离)、Kunming株(昆明株，中国科学院分离)、Yunnan株(云南株，中国科学院分离)，但不限于此。而且，在比较RDV的O株的S12的序列与Chinese株的S12(GenBank登录号U36569)时，确认有约60个核苷酸的取代。尽管存在这种程度的取代，但只要在其它亚种株或突变株间存在引起最低限度表达抑制的碱基长度即、24个核苷酸以上实质一致的部分碱基序列，那么包含某1种亚种株来源的节段基因组的本发明的表达抑制剂，在其它种的亚种株中也能够发挥其效果。另一方面，应该理解的是，无论使用RDV的哪个株来源的序列，本领域技术人员均能够基于本说明书的记载来生产队其它株有效果的siRNA等表达抑制剂。
典型的亚种株的基因组有关信息如下。
表A

  中央农研(大村)  秋田县立大学  北海道大学  中国北京大学(中国系统)  中科院(昆明系统)  中科院(云南系统)  S1  S2  S3  S4  S5  S6  S7  S8  S9  S10  S11  S12  AB001580  D00693  D00639  D13773 D00536  D13404  D00241  D90198  AB263418  X54620  X54622  D90033  M91653  D10218  D10219  D10220  D10221  D10249  S72085  D10222  D00607  D00608  D00465  M35118  S72083  NC_003773或U73201  NC_003774或U73202  NC_003772或U72757  NC_003761或U36562  NC_003762或U36563  NC_003763或U36564  NC_003760或U36402  NC_003764或U36565  NC_003765或U36566  NC_003766或U36567  NC_003767或U36568  NC_003768或U36569  AY302568  AY305383  AY340219  AY375453  AY340218  AY847464  AY589577  AY589576
在本说明书中病毒的“系统”和“株”可以用于指同一病毒种内的变异(variation)，应该理解的是，这些术语可以互换使用。
在本说明书中“S1”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：1所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S1的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S1编码的结构蛋白质(也称P1)是被RDV的内壳粒子内包的蛋白质，其起到RNA聚合酶的功能。此外，S1编码的结构蛋白质在RDV的RNA合成中起作用，可能与感染中期相关。
在本说明书中“S2”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：3所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S2的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S2编码的结构蛋白质(也称P2)构成RDV的外壳，在RDV感染时的昆虫受体识别中发挥作用。此外，S2编码的结构蛋白质在对昆虫细胞的侵入中发挥作用，但对于感染植物而言，其是非必须蛋白质。
在本说明书中“S3”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：5所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S3的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S3编码的结构蛋白质(也称P3)是构成RDV的内壳粒子的核心蛋白质，其作为RDV粒子的主要骨架发挥功能，可能与感染中期相关。
在本说明书中“S4”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：7所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S4的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S4编码的非结构蛋白质(也称Pns4)在RDV在感染的昆虫细胞中形成微管结构体、以及在感染细胞中输送RDV中发挥其作用，可能与感染后期相关。
在本说明书中“S5”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：9所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S5的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S5编码的结构蛋白质(也称P5)是构成内壳粒子的核心蛋白质。此外，P5作为帽化酶(鸟苷酸转移酶)发挥功能，起到活化mRNA的作用，可能与感染中期相关。
在本说明书中“S6”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：11所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S6的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S6编码的非结构蛋白质(也称Pns6)是构成RDV在感染的细胞中形成的、病作为毒合成工厂的病毒原质体的蛋白质，可能与感染初/中期相关。
在本说明书中“S7”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：13所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S7的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S7编码的结构蛋白质(也称P7)是构成RDV的内壳粒子的核心蛋白质。此外，P7作为非特异性核酸结合蛋白质发挥功能，在病毒粒子内的核酸收纳中发挥其作用，可能与感染中期相关。
在本说明书中“S8”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：15和SEQ ID NO：53所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S8的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S8编码的结构蛋白质(也称P8)构成RDV的外壳，并作为RDV粒子的主要骨架起作用，可能与感染中/后期相关。
在本说明书中“S9”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：17所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S9的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S9编码的结构蛋白质(也称P9)是外壳蛋白质，可能与感染后期相关。
在本说明书中“S10”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：19所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S10的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S10编码的非结构蛋白质(也称Pns10)发挥功能使得RDV在感染的昆虫细胞中形成管状结构体，并在昆虫细胞间输送中起作用，可能是植物感染的非必须蛋白质。
在本说明书中“S11”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：21所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S11的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S11编码的非结构蛋白质(也称Pns11)是构成RDV在感染的细胞中形成的、作为病毒合成工厂的病毒原质体的蛋白质，可能与感染初/中期相关。
在本说明书中“S12”是指分成12个节段的RDV双链RNA(dsRNA)基因组中的1个，其表示为(1)SEQ ID NO：23所示的核酸序列；(2)与上述核酸序列在中度或高度或任意程度的严格条件下杂交的核酸序列的互补序列；(3)在上述核酸序列中具有1个或数个取代、添加、插入和/或缺失的修饰体；(4)与上述核酸序列具有至少90％的同一性的修饰体；(5)与上述核酸序列具有至少80％以上的同源性的修饰体；(6)编码RDV的其它亚种株或变种株来源的S12的核酸序列。上述同一性或同源性是使用序列分析用工具BLAST采用默认参数计算出来的。严格条件依赖于序列而变化，这样的条件的确定在本领域技术人员的掌握之中。S12编码的非结构蛋白质(也称Pns12)是构成RDV在感染的细胞中形成的、作为病毒合成工厂的病毒原质体的蛋白质，可能是与感染的最初期病毒工厂的运营有关的蛋白质。
在本说明书中，“结构蛋白质”是指构成病毒粒子的蛋白质，就RDV而言，相当于P1(SEQ ID NO：2)、P2(SEQ ID NO：4)、P3(SEQ ID NO：6)、P5(SEQ ID NO：10)、P7(SEQ ID NO：14)、P8(SEQ ID NO：16)和P9(SEQ IDNO：18)。另一方面，由病毒基因组编码、但不构成粒子的蛋白质称为“非结构蛋白质”，相当于Pns6(SEQ ID NO：12)、Pns11(SEQ ID NO：22)、Pns12(SEQ ID NO：24)、Pns4(SEQ ID NO：8)和Pns10(SEQ ID NO：20)。一般而言，非结构蛋白质的合成早于结构蛋白质。
在本说明书中，“病毒原质体”是指：RDV中由3种非结构蛋白质(Pns6(SEQ ID NO：12)、Pns11(SEQ ID NO：22)、和Pns12(SEQ ID NO：24)；分别由节段基因组S6(SEQ ID NO：11)、S11(SEQ ID NO：21)和S12(SEQ IDNO：23)编码)形成的用于合成病毒粒子的工厂。这些非结构蛋白质是在RDV感染细胞的最初形成的、对病毒复制来说不可或缺的细胞内器官，在其内部合成病毒核酸。上述3种非结构蛋白质中，最早聚集的是Pns12(SEQ IDNO：24)，是在接种RDV约6小时后。因而，在理论上，可以认为抑制Pns12的表达就可以阻碍病毒复制的锚地的构建，进而可以阻碍病毒自身的复制。
在本说明书中，“稻矮缩病”是指一种植物病毒病，作为其原因的水稻矮缩病毒(RDV)是由昆虫转播的(例如，当体内保有RDV的斐豹蛱蝶、黑筋(クロスジ)斐豹蛱蝶或闪电(イナズマ)叶蝉等，为了吸取稻的汁液而将口器刺入稻中时，该水稻矮缩病毒就会感染稻)。被该植物病毒病感染的稻会出现斑纹，身材不再长高，产量剧烈减少。
在本说明书中，对病毒(例如水稻矮缩病毒)等的“抵抗性”或“抗性”是指：病毒等所要侵入的宿主生物体(本说明书中为植物)对病毒等的侵入具有抵抗力。在本说明书中，抵抗力除了指能够维持宿主生物体通常的生存/增殖这样的程度的性质之外，只要能够维持该宿主生物体的生存，就视为具有抵抗力。
在本说明书中，对病害(例如稻矮缩病)的“抗性”或“抵抗性”是指：宿主生物体(本说明书中为植物)对该病害有抵抗力。因而，即使允许病毒或菌体侵入，但只要能实现与这样的病毒或菌体共存，就可以说对病害有抗性。
在本说明书中，对病害的“完全抵抗性”是指：与未感染引发病害的原因因子(例如RDV)的植物体(非感染植物体)相比较，已被该原因因子感染的植物体(感染植物体)能够实现共存，而在该植物体的生长(例如分蘖、伸长)、目的物质的产量方面，比照非感染生物体没有任何变化。一般而言，当目的植物体的野生型集团被某病原体感染时，上述野生型集团中的各个植物体出现上述病原体引起的病症的时期是基本上相同的。因而，更狭义地讲，“完全抵抗性”是指下述情况：当目的植物体被某病原体感染时，超过了与该植物体同种的野生型植物体中出现病症的时期而未出现任何病症，甚至终生未出现任何病症。而且，“敏感性”是指下述情况：当上述目的植物体被上述病原体感染时，在与上述野生型感染植物体中出现病症的时期基本上相同的时期，发生了感染。但是，在上述感染植物体中，由于被赋予了某种“抵抗性”，有些个体中出现上述病症的时间是野生型感染个体的病症出现时期再推后所述一定期间。这种情况下，将在这样的个体中展现出的抵抗性称为“发病延迟型抵抗性”。“发病延迟型抵抗性”，从对病毒的侵入具有抵抗力、因而延迟发病这一点来看是“抵抗性”；但从结果会出现病症这一点来看，又与“完全抵抗性”含义不同。因而，可以理解的是，在进行评价时，应严格区分“发病延迟型抵抗性”个体和“完全抵抗性”个体来进行评价。因而，在本说明书中，为了正确地评价对病原体的抵抗性，就病原体感染的植物体总数而言，当在除去了感染失败的个体(即，虽然斐豹蛱蝶吸取了其汁液，但未达到发病的个体)的个体中，完全抵抗性个体为X％、延迟型抵抗性个体为Y％、敏感性个体为Z％(此处，X+Y+Z＝100(％)，优选Z接近0)时，将上述病原体感染的植物体的“集团”中的完全抵抗性评价为X％，而不是评价为(X+Y)％。此外，在本说明书中，将相对于感染植物体的集团有X％的个体被赋予“完全抵抗性”、Y％的个体被赋予“发病延迟型抵抗性”的植物体(例如稻)的个体集团称为“(X+Y)％抵抗性集团”或“X％完全抵抗性集团”。例如，当感染植物体的集团中的80％的个体被赋予“完全抵抗性”、15％的个体”被赋予“发病延迟型抵抗性”时，这样的集团称为“80％完全抵抗性集团”或”95％抵抗性集团”；而100％的个体被赋予“完全抵抗性”的集团称为“100％完全抵抗性集团”。
例如，对RDV而言，当其感染2～3叶期的稻植物体野生型集团时，大约3星期基本上全部个体均出现病症。因而，在本说明书中，目的稻植物体对RDV为“敏感性”是指下述情况：感染RDV后3个星期以内，上述稻植物体中出现其病症。此外，在感染2～3叶期的稻植物体野生型集团的情况下，当从感染起经过8个星期仍未出现病症时，此后也不会发病，因此，如果从感染稻植物体起至少8星期后未出现病症，则通常将上述稻植物体视为完全抵抗性。因而，目的稻植物体对RDV为“完全抵抗性”是指下述情况：在RDV感染上述稻植物体后，通常经过8个星期或终生，上述稻感染植物体中完全未出现病症，与非感染稻植物体相比没有任何变化。目的稻植物体对RDV为“发病延迟型抵抗性”是指：当上述稻植物体被RDV感染时，通常在感染后的3～8个星期之间出现其病症(因为野生型稻在感染后的3个星期基本上全部出现其病症)。此外，在RDV感染目的稻植物体的集团的情况下，当除去感染失败的个体、RDV感染个体集团的全部个体为完全抵抗性时，称之为“100％完全抵抗性集团”，是指上述集团中没有任何1个感染稻植物体个体显示病症。同样地，将RDV感染个体集团的全部个体中、有X％的个体被赋予“完全抵抗性”、Y％的个体被赋予“发病延迟型抵抗性”的集团称为“(X+Y)％抵抗性集团”或”X％完全抵抗性集团”，获得这样的集团是非常困难的。
在本说明书中，“稳定的抵抗性”是指可以在多代中保持的抵抗性。在多代中保持是指可以在优选3代、更优选5代、更优选7代中保持，最优选可以永久保持。
本说明书中，当特殊提及时，抵抗性是指对病毒或菌体的性质，而抗性是指对病害的性质，但应该理解的是两者可以互换使用。
在本说明书中，“植物”包含单子叶植物和双子叶植物。通常，在本说明书中是指RDV感染的植物。优选的植物是属于禾本科的单子叶植物，本发明中最优选的植物是稻。如无另行特别说明，植物是指植物体、植物器官、植物组织、植物细胞和种子中的任何一种或多种。作为植物器官的例子，可以列举出根、叶、茎和花等。作为植物组织的例子，可以列举出维管束组织(包括韧皮部组织、木质部组织等)、顶端分生组织、叶肉组织、厚角组织、薄壁组织等。作为植物细胞的例子，可以列举出胼胝体(callus)和悬浮培养细胞。
在本说明书中，“野生型”植物是指：未经采用转化等人工方法进行遗传上的修饰的天然存在的植物。
在本说明书中，生物的“器官”是指：生物个体的某种功能局限在个体内的特定部分行使、而且该部分具有形态上的独立性的结构体。可以列举出例如茎、根、叶、花、种子等，但不限于此。
在本说明书中，生物的“组织”是指细胞集团，且该集团中具有一定的相同作用。因而，组织可以是器官的一部分。在器官中，大多具有有着相同功能的细胞，但也会微妙地混有具有不同功能的细胞，因而，本说明书中组织可以混合具有各种细胞，只要其共有一定的特性即可。
在本说明书中，“多核苷酸”、“寡核苷酸”和“核酸”在本说明书中以相同含意使用，是指任意长度的核苷酸的聚合物。此外，该术语还包括“寡核苷酸衍生物”或“多核苷酸衍生物”。“寡核苷酸衍生物”或“多核苷酸衍生物”可以互换使用，是指：包含核苷酸的衍生物的、或核苷酸之间的键合与常规不同的寡核苷酸或多核苷酸。作为这样的寡核苷酸，具体地可以示例出例如：2’-O-甲基-核糖核苷酸、寡核苷酸中的磷酸二酯键被换成硫代磷酸酯键的寡核苷酸衍生物、寡核苷酸中的磷酸二酯键被换成N3’-P5’氨基磷酸酯(phosphoroamidate)键的寡核苷酸衍生物、寡核苷酸中的核糖与磷酸二酯键被换成肽核酸键的寡核苷酸衍生物、寡核苷酸中的尿嘧啶被C-5丙炔基尿嘧啶取代的寡核苷酸衍生物、寡核苷酸中的尿嘧啶被C-5噻唑尿嘧啶取代的寡核苷酸衍生物、寡核苷酸中的胞嘧啶被C-5丙炔基胞嘧啶取代的寡核苷酸衍生物、寡核苷酸中的胞嘧啶被吩噁嗪修饰胞嘧啶(phenoxazine-modified cytosine)取代的寡核苷酸衍生物、DNA中的核糖被2’-O-丙基核糖取代的寡核苷酸衍生物和寡核苷酸中的核糖被2’-甲氧基乙氧基核糖取代的寡核苷酸衍生物等。如无相反说明，特定的核酸序列除包含明示的序列外，应该理解为还包含其经过保守修饰而得到的修饰体(例如简并密码子取代体)和互补序列。具体地，简并密码子取代体可以通过制作1个或1个以上的选择出的(或全部的)密码子的第3位被混合碱基和/或脱氧肌苷残基取代的序列来实现(Batzer等，Nucleic Acid Res.19：5081(1991)；Ohtsuka等，J.Biol.Chem.260：2605-2608(1985)；Rossolini等，Mol.Cell.Probes8：91-98(1994))。
在本说明书中，“核酸分子”还可以与核酸、寡核苷酸和多核苷酸互换使用，包括cDNA、mRNA、基因组DNA、siRNA、shRNA，以及RNA与DNA的复合分子等。在本说明书中，术语“基因”的概念中包括核酸和核酸分子。
在本说明书中，“基因”是指决定遗传性状的因子。其通常在基因组上以一定的顺序排列。决定蛋白质的一级结构的基因称为结构基因，左右其表达的基因称为调节基因(例如启动子)。在本说明书中，如无特殊提及，基因包含结构基因和调节基因。因而，当提到基因时，通常包含本发明的基因的结构基因以及其启动子等转录和/或翻译的调节序列这两者。在本说明书中，“基因”有时指“多核苷酸”、“寡核苷酸”、“核酸”和“核酸分子”。在本说明书中，“基因产物”还包含基因所表达的“多核苷酸”、“寡核苷酸”、“核酸”和“核酸分子”。本领域技术人员能够根据具体情况理解何为基因产物。
在本说明书中，“氨基酸”只要能够满足本发明的目的即可，可以是天然的或非天然的。
在本说明书中，“核苷酸”可以是天然的或非天然的。在本说明书中，核苷酸的序列是指“核苷酸序列”或“碱基序列”。
在本说明书中，“核苷酸衍生物”或”核苷酸类似物”是指：与天然存在的核苷酸不同、但具有与原来的核苷酸相同的功能的物质。这样的核苷酸衍生物和核苷酸类似物在本领域是公知的。作为这样的核苷酸衍生物和核苷酸类似物的例子，包括但不限于此：硫代磷酸酯、氨基磷酸酯(phosphoramidate)、甲基膦酸酯、手性甲基膦酸酯、2-O-甲基核糖核苷酸、肽核酸(PNA)。应该理解的是，在本说明书中，核苷酸衍生物和核苷酸类似物可以替代核苷酸使用，只要其具有与核苷酸相同的生物学功能、特别是RNAi功能即可。
本说明书中提及氨基酸时，以通常公知的三字母符号或IUPAC-IUBBiochemical Nomenclature Commission推荐的单字母符号表示。相似地，在提及核苷酸时，以其通常为人知晓的单字母代码表示。
在本说明书中，氨基酸序列和碱基序列的相似性、同一性和同源性的比较，可以使用序列分析用工具BLAST采用默认参数来计算。同一性的检索可以使用例如NCBI的BLAST 2.2.9(2004.5.12发行)来进行。本说明书中的同一性值通常是使用上述BLAST、在默认条件进行比对时得到的值。但是，如果通过改变参数能够出现更高的值，则以最高值作为同一性值。当在多个区域评价同一性时，以其中的最高值为同一性值。
在本说明书中，“对应的”核苷酸是指：某核酸分子或多核苷酸分子中，与作为比较基准的核酸分子或多核苷酸中的指定核苷酸具有相同作用、或能够预测具有相同作用的核苷酸；就RNAi而言，是指在RNA干扰作用方面具有相同贡献的核苷酸。如果是反义分子，则可以是与该反义分子的一定部分对应的直系同源物(ortholog)中的相同部分。
在本说明书中，“对应的”基因是指：在某个种中，与作为比较基准的种中的指定基因具有相同作用、或能够预测具有相同作用的基因，当存在多个具有这种作用的基因时，是指在进化学上具有相同起源的基因。因而，与某基因(例如节段基因组S1～S12)对应的基因可以是该基因的直系同源物。因而，与病毒的基因对应的基因也可以在其它病毒(其它的呼吸道肠道病毒属的病毒等)中找到。这样的对应的基因可以采用本领域公知的技术来鉴定。因而，例如，某病毒中的对应的基因，可以通过使用作为对应的基因的基准的基因的序列作为提问序列、在该病毒(例如其它呼吸道肠道病毒)的序列数据库中进行检索，来寻找。
在本说明书中，“片段”是指：相对全长的多肽或多核苷酸(长度为n)，具有1～n-1的序列长度的多肽或多核苷酸。片段的长度可以根据其目的适宜地改变，例如，作为其长度的限，对多肽而言，可以列举出3、4、5、6、7、8、9、10、15，20、25、30、40、50、75、100、150、200、250及其以上的氨基酸，此外，以未在此处具体列举出的整数表示的长度(例如11等)作为下限也是合适的。此外，对于多核苷酸而言，可以列举出5、6、7、8、9、10、15，20、25、30、40、50、75、100、200、300、400、500及其以上的核苷酸，此外，以未在此处具体列举出的整数表示的长度(例如11等)作为下限也是合适的。在本说明书中，多肽和多核苷酸的长度可以如上述地，分别以氨基酸或核酸的个数来表示，但上述的个数并不是绝对的，应该理解的是，在具有相同功能的前提下，作为上限或下限的上述个数还包含在该个数的基础上上下浮动数个(或例如上下浮动10％)而得到的个数。为了体现这样的意图，在本说明书中，有时通过在个数之前加上“约”来体现。但是，在本说明书中，应该理解的是，“约”的有无不影响对该数值的解释。在本说明书中，有用的片段的长度，可以通过是否能够保持作为该片段的基准的全长蛋白质的功能中的至少1种功能来确定。
在本说明书中，“生物学功能”，当针对某基因或与其相关的核酸分子或多肽而言时，是指该基因、核酸分子或多肽在生物体内能够具有的特定功能，这其中可以列举出例如特异性抗体的生成、酶活性、抗性的赋予等，但不限于此。在本发明中，可以列举出例如：参与水稻矮缩病毒在植物中的增殖、参与对水稻矮缩病毒的抵抗性或敏感性、参与对稻矮缩病的抗性、与这些具体功能直接的间接相关的功能(例如与病毒蛋白质的结合等)等，但不限于此。在本说明书中，生物学功能通过“生物学活性”得以发挥。在本说明书中，“生物学活性”是指：某因子(例如多核苷酸、蛋白质等)在生物体内能够具有的活性，包含发挥各种功能(例如转录促进活性)的活性，例如还包含通过与某分子的相互作用来使其它分子活化或失活的活性。当2个因子相互作用时，其生物学活性，这二个分子之间的结合以及由此引起的生物学变化可以这样考虑，例如，当使用抗体是一个分子沉淀时，其它分子也发生共沉淀时，可以认为这2个分子结合。因而，作为判断方法之一，可以列举出观察这样的共沉淀。例如，当某因子是酶时，其生物学活性包含其酶活性。作为其它的例子，当某因子为配体时，包含该配体与对应的受体的结合。这样的生物学活性可以采用本领域公知的技术来测定。
因而，“活性”是指：显示结合(直接的或间接的)或使之明显；对应答产生影响(即，对于针对数种曝露或刺激的应答具有可测定的影响)、各种可测定的指标；可以列举出例如与本发明的多肽或多核苷酸直接结合的化合物的亲和性，或者例如数种刺激后或事件(事象)后的上游或下游的蛋白质的量或者其它类似的功能的尺度。
在本说明书中，对2种物质而言，“相互作用”是指：一种物质与另一种物质之间产生力(例如：分子间力(范德华力)、氢键、疏水相互作用等)的作用。通常，相互作的2种物质呈聚集或结合的状态。
本说明书中使用的术语“结合”是指：2种蛋白质或化合物或相关的蛋白质或化合物之间或者它们的组合之间的、物理相互作用或化学相互作用。结合包括离子键、非离子键、氢键、范德华结合、疏水性相互作用等。物理相互作用(结合)可以是直接的或间接的，间接结合起因于其它蛋白质或化合物的效果，或者需要该效果介导。直接结合是指：其发生不归因于其它蛋白质或化合物的效果、也不需要该效果介导的，不伴随其它实质性化学中间体的相互作用。
本说明书中使用的术语“调节(modulate)”或”修饰(modify)”是指：特定的活性、因子或蛋白质的量、质或效果的增加或减少或者维持。
在本说明书中，“反义(活性)”是指：能够特异性抑制或降低靶标基因的表达的活性。反义活性通常通过下述核酸序列来实现，所述核酸序列与目的基因的核酸序列的全部或一部分、或者与上述核酸序列具有至少90％同一性的核酸序列互补，并且长度为至少8个连续的核苷酸。这样的核酸序列优选可以是至少连续的9个核苷酸、更优选连续的10个核苷酸、更优选连续的11个核苷酸、连续的12个核苷酸、连续的13个核苷酸、连续的14个核苷酸、连续的15个核苷酸、连续的20个核苷酸、连续的25个核苷酸、连续的30个核苷酸、连续的40个核苷酸、连续的50个核苷酸长的核酸序列。具有这样的核酸序列的分子在本说明书中称为“反义分子”、“反义核酸分子”或“反义核酸”，它们可以互换使用。这样的核酸序列中还包括与上述序列至少70％同源、更优选く至少80％同源、更优选90％同源、最优选95％同源的核酸序列。这样的反义活性优选是与目的基因的核酸序列的5’末端的序列互补。这样的反义的核酸序列中还包括在上述序列中具有1个或数个或者1个以上的核苷酸的取代、添加、插入和/或缺失的序列。如果给出本说明书中公开的核酸序列(例如SEQ ID NO：1)，则本发明的反义核酸可以根据Watson和Crick碱基对形成法则或Hoogsteen碱基对形成法则来设计。反义核酸分子可以与信号传导因子的mRNA的整个编码区域互补，但更优选仅针对mRNA的编码区域或非编码区域的一部分为反义的寡核苷酸。例如，反义寡核苷酸可以与mRNA的翻译起始位点周围的区域互补。反义寡核苷酸可以是例如约5、约10、约15、约20、约25、约30、约35、约40、约45或约50个核苷酸长。在1个优选的实施方式中，本发明的表达抑制剂中使用的反义核酸的长度的下限可以是至少约100个核苷酸、至少约150个核苷酸、至少约200个核苷酸、至少约250个核苷酸、至少约300个核苷酸、至少约350个核苷酸、优选至少约400个核苷酸、更优选至少约450个核苷酸、最优选至少约500个核苷酸的长度，但并不限于这些长度，可以是约100个核苷酸～约500个核苷酸之间的任意长度；上述反义核酸的长度的上限可以是例如约1050个核苷酸以下、约1100个核苷酸以下、约1200个核苷酸以下、约1300个核苷酸以下、约1400个核苷酸以下、约1500个核苷酸以下、约2000个核苷酸以下、或约2500个核苷酸的长度，或者是对象核酸的全长，但不限于这些长度，可以是约500～全长之间的任意长度。不希望拘泥于理论，但可以认为：通过将靶标基因设计在上述范围(例如500个碱基左右)，可以在病毒系统间广泛地诱发基于反义现象的基因表达抑制效果。本发明的反义核酸可以采用本领域公知的程序，通过化学合成或酶连接反应来构建。例如，反义核酸(例如反义寡核苷酸)可以使用天然存在的核苷酸或各种修饰核苷酸(例如可以使用硫代磷酸酯衍生物和吖啶取代核苷酸)来化学合成，其中，所述修饰核苷酸被设计成能够增加该分子的生物学稳定性或增加反义核酸与有义核酸间形成的双链的物理稳定性。作为可用于生成反义核酸的修饰核苷酸的例子，可以列举出：5-氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、次黄嘌呤、黄嘌呤、4-乙酰胞嘧啶、5-(羧基羟基甲基)尿嘧啶、5-羧基甲基氨基甲基-2-硫尿苷、5-羧基甲基氨基甲基尿嘧啶、二氢尿嘧啶、β-D-半乳糖基辫苷(queosine)、肌苷、N6-异丙烯基腺嘌呤、1-甲基鸟嘌呤、1-甲基肌苷、2，2-二甲基鸟嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲基鸟嘌呤、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、N6-腺嘌呤、7-甲基鸟嘌呤、5-甲基氨基甲基尿嘧啶、5-甲氧基氨基甲基-2-硫尿嘧啶、β-D-甘露糖基辫苷、5’-甲氧基羧基甲基尿嘧啶、5-甲氧基尿嘧啶、2-甲硫基-N6-异丙烯基腺嘌呤、尿嘧啶-5-乙醇酸(oxyacetic acid)(v)、怀丁苷(wybutoxosine)、假尿嘧啶、辫苷、2-硫胞嘧啶、5-甲基-2-硫尿嘧啶、2-硫尿嘧啶、4-硫尿嘧啶、5-甲基尿嘧啶、尿嘧啶-5-乙醇酸甲基酯、尿嘧啶-5-乙醇酸(v)、5-甲基-2-硫尿嘧啶、3-(3-氨基-3-N-2-羧基丙基)尿嘧啶、3-(3-氨基-3-羧基丙基)尿嘧啶和2，6-二氨基嘌呤等，但不限于此。
在本说明书中，“RNAi(RNA interference，RNA干扰)”是指：通过由双链RNA(double stranded RNA：dsRNA)序列特异性地分解mRNA，使得向蛋白质的翻译受到阻碍、基因表达受到抑制的现象。关于作为基因表达抑制方法的植物RNAi的总论，可以列举出例如：三木等，“植物におけるRNAiの分子機構とその応用”(实验医学Vol.22No.4(3月号)2004)(本说明书中引入其作为参考)等。RNAi的优点之一是，因各个基因而异，能够取得从弱到强的各种水平的表达抑制。现在，RNAi作为简便且有效的基因表达抑制方法被加以利用。在优选的实施方式中，“RNAi”是指：通过将诸如双链RNA(也称dsRNA)这样的引起RNAi的因子导入细胞，来使同源mRNA特异性分解、抑制基因产物的合成的现象以及其中应用的技术。在本说明书中，视情况而定，RNAi还可以用作与引起RNAi的因子等同的含义。
在本说明书中，“引起RNAi的因子”是指：能够引起RNAi的任意因子。在本说明书中，对“基因”“引起RNAi的因子”是指：实现引起涉及该基因的RNAi，并实现RNAi带来的效果(例如该基因的表达抑制等)。作为这样的引起RNAi的因子，可以列举出例如：包含下述双链部分的RNA或其修饰体，但不限于此，所述双链部分包含下述序列且至少为10个核苷酸长，所述序列为：相对于靶标基因核酸序列的一部分、或者与上述核酸序列具有至少90％同一性的核酸序列，具有至少约70％、至少约80％、至少约90％、至少约95％或其以上的同源性的序列，或者在严格条件下与之杂交的序列。这里，该因子优选包含3’突出末端，更优选3’突出末端可以为2个核苷酸长以上的DNA(例如2～4个核苷酸长的DNA)。
在本说明书中，“修剪序列”是指：相当于有义序列和反义序列的序列、以及位于这两个序列之间的序列(称为间隔区、发夹、修剪序列等)。如果用导入具有诸如下述的结构：
有义序列-修剪序列-反义序列；或
反义序列-修剪序列-有义序列
的核酸分子而得到的载体转化细胞，则有义序列和反义序列形成双链RNA，从而形成其一部分包含环或发夹结构的单链部分的双链RNA(shRNA)，其中，位于有义序列和反义序列这两条链之间的部分被保留下来作为环或发夹部分。关于修剪序列的长度，只要在有义序列和反义序列形成双链RNA时、该修剪序列构成的单链部分能够形成环或发夹结构即可，可以是任意的长度。上述shRNA从核转移至细胞质，在其导入的细胞内被切丁酶(Dicer)切割而成为siRNA，引起RNA干扰。
在优选实施方式中，引起RNAi的因子中使用的有义序列或反义序列的长度的下限，可以为至少约100个核苷酸、至少约150个核苷酸、至少约200个核苷酸、至少约250个核苷酸、至少约300个核苷酸、至少约350个核苷酸，优选至少约400个核苷酸、更优选至少约450个核苷酸、最优选至少约500个核苷酸的长度，但不限于这些长度，可以是约100个核苷酸～约500个核苷酸之间的任何长度；上述有义序列或反义序列的长度的上限，可以是例如约1050个以下、约1100核苷酸个以下、约1200核苷酸个以下、约1300核苷酸个以下、约1400核苷酸个以下、约1500核苷酸个以下、约2000核苷酸个以下或约2500个核苷酸的长度，或者可以是对象核酸的全长，但不限于这些长度，可以是约500个～全长之间的任何长度。不希望拘泥于理论，但可以认为：通过将靶标基因设计在上述范围(例如500个碱基左右)，能够在病毒系统间广泛地诱发RNAi。
在本说明书中，第1物质或因子与第2物质或因子“特异性相互作用”是指：第1物质或因子相对于第2物质或因子，以高于相对于第2物质或因子以外的物质或因子(特别是包含第2物质或因子的样品中存在的其它物质或因子)的亲和性相互作用。作为物质或因子的特异性相互作用，可以列举出例如：核酸方面的杂交，蛋白质方面的抗原抗体反应、配体-受体反应、酶-底物反应等，与核酸和蛋白质这两者相关的转录因子与该转录因子的结合位点之间的反应等，蛋白质-脂质相互作用，核酸-脂质相互作用等，但不限于此。因而，当物质或因子均为核酸时，第1物质或因子与第2物质或因子“特异性相互作用”包括：第1物质或因子相对于第2物质或因子至少部分具有互补性。此外，例如当物质或因子均为蛋白质时，作为第1物质或因子与第2物质或因子“特异性相互作用”，可以列举出例如：基于抗原抗体反应的相互作用、基于受体-配体反应的相互作用、酶-底物相互作用等，但不限于此。当两种物质或因子包含蛋白质和核酸时，第1物质或因子与第2物质或因子“特异性相互作用”包括：转录因子与、作为该转录因子的对象的核酸分子的结合区域之间的相互作用。因而，在本说明书中，针对多核苷酸或多肽等生物学因子“特异性相互作用的因子”包含：对该多核苷酸或该多肽等生物学因子的亲和性，与对其它无关(特别是同一性小于30％的)多核苷酸或多肽的亲和性相比，典型地等同或更高、优选显著(例如统计学上的显著)高的因子。这样的亲和性可以通过例如杂交测定、结合测定等来测定。
在本说明书中，“表达抑制剂”广义地指：能够抑制基因在细胞内的表达、即基因组的复制、转录、翻译的所有因子。
在本说明书中，作为“因子”(agent)，只要能够实现期望的目的即可，可以是任何物质或其它要素(例如光、放射能、热、电等能量)。作为这样的物质，可以列举出例如：蛋白质、多肽、寡肽、肽、多核苷酸、寡核苷酸、核苷酸、核酸(包括例如诸如cDNA、基因组DNA的DNA，诸如mRNA的RNA)、多糖类、寡糖类、脂质、有机小分子(是指例如激素、配体、信息传导物质、有机小分子、采用组合化学合成的分子、可以作为医药品利用的小分子(例如小分子配体等)等，典型地其分子量为约10,000以下(例如约1,000以下)，但不限于此)、以及它们的复合分子，但不限于此。作为对多核苷酸特异性的因子，典型地可以列举出：对该多核苷酸的序列具有一定序列同源性(例如70％以上的序列同一性)、与该多核苷酸具有互补性的多核苷酸，诸如与启动子区域结合的转录因子的多肽等，但不限于此。作为对多肽特异性的因子，典型地可以列举出：特异性指向该多肽的抗体或其衍生物或者其类似物(例如单链抗体)，当该多肽为受体或配体时的特异性配体或受体，当该多肽为酶时的其底物等，但不限于此。
在本说明书中，“复合分子”是指：多肽、多核苷酸、脂质、糖、小分子等多种分子连接而成的分子。作为这样的复合分子，可以列举出例如RNA与DNA的复合分子、糖脂质、糖肽等，但不限于此。在本说明书中，只要是具有SEQ ID NO：2的氨基酸的多肽或其修饰体或片段、且具有与水稻矮缩病毒的增殖相关的生物学活性即可，也可以使用编码各自的修饰体或片段等的核酸分子。此外，还可以使用包含这样的核酸分子的复合分子。
在本说明书中，“分离的”生物学因子(例如细胞、核酸或蛋白质等)是指：从该生物学因子天然存在的生物体的细胞内的其它生物学因子(例如，对于核酸而言，为核酸以外的因子以及包含目的核酸以外的核酸序列的核酸；对于蛋白质而言，为蛋白质以外的因子以及包含目的蛋白质以外的氨基酸序列的蛋白质等)实质上被分离或纯化出来的生物学因子。“分离的”核酸和蛋白质中包括采用标准纯化方法纯化出来的核酸和蛋白质。因而，分离的核酸和蛋白质包含化学合成的核酸和蛋白质。
在本说明书中，“纯化的”生物学因子(例如细胞、核酸或蛋白质等)是指：除去了至少一部分天然伴随该生物学因子的因子而得到的生物学因子。因而，通常，纯化的生物学因中，该生物学因子的纯度高于该生物学因子通常存在的状态(即被浓缩)。
本说明书中使用的术语“纯化的”和“分离的”是指存在优选至少75重量％、更优选至少85重量％、更优选至少95重量％、最优选至少98重量％的同一类型的生物学因子，用于将其对象物与天然物相区别。
当在本说明书中使用时，“基因导入”是指：在生物体内或体外，向靶标细胞内导入天然、合成或重组的所希望的基因或基因片段，并使得被导入的基因能够维持其功能。本发明中导入的基因或基因片段包括：具有特定序列的DNA、RNA或它们的合成类似物核酸。此外，当在本说明书中使用时，基因导入、转化、转染(transfection，transfect)可以互换使用。
当在本说明书中使用时，“基因导入载体”和“基因载体”可以互换使用。“基因导入载体”和“基因载体”是指：能够将目的多核苷酸序列转移至目的细胞的载体。作为“基因导入载体”和“基因载体”，可以列举出质粒载体等，但不限于此。
当在本说明书中使用时，“基因导入活性”是指：归因于载体的“基因导入”的活性，可以以被导入了的基因的功能(例如，对于表达载体而言，可以是所编码的蛋白质的表达和/或该蛋白质的活性等)为指标来检测。
当在本说明书中使用时，“外源”核酸分子是指：包含于某对象核酸分子内的起源于该对象核酸分子以外的核酸分子等。该外源核酸分子与合适的调节序列(例如，转录所必需的启动子、增强子、终止子和多聚A添加信号，以及翻译所必需的核糖体结合位点、起始密码子、终止密码子等)可操作连接，以表达通过基因导入载体导入的基因。在本发明的其它方面中，外源基因不包括用于该外源基因的表达的调节序列。
基因导入载体内包含的外源核酸分子典型地可以是DNA或RNA的核酸分子，但导入的核酸分子还可以包含能够实现目的(例如RNA干扰)的核酸类似物分子。基因导入载体内包含的分子种类，可以是单一的基因分子种类，也可以是多种不同的基因分子种类。
因而，在本说明书中，基因、多核苷酸、多肽等的“表达”的“减少”或“抑制”可以互换使用，是指：当某因子(即表达抑制剂)发挥作用时，与不发挥作用时相比，表达的量显著减少。优选表达的减少包括多肽的表达量的减少。
在本说明书中，基因、多核苷酸、多肽等的“表达”的“增加”是指：当本发明的因子发挥作用时，与不发挥作用时相比，表达的量显著增加。优选表达的增加包括多肽的表达量的增加。在本说明书中，“表达”的“诱导”是指：某因子在某细胞中发挥作用，使其基因表达量增加。因而，表达的诱导包括：在完全观察不到该基因的表达时，使该基因表达；以及，在已经能够观察到该基因的表达时，增大该基因的表达。
在本说明书中，基因“特异性表达”是指：该基因在动物的特定的部位或时期中以异于(优选高于)其它部位或时期的水平表达。特异性表达，可以是仅在某部位(特异性部位)表达，也可以是也在其以外的部位表达。特异性表达优选是指：仅在某部位表达。
当在本说明书中使用时，“基因沉默”是指：基因表达受到抑制的现象。作为可称作“基因沉默”的现象，可以列举出：基因组印迹、X染色体失活、PEV(position effect variegation，位置效应花斑)、玉米的副突变(Paramutation)等。作为植物中的转基因(导入基因)失活的一种，有同源性依赖性基因沉默(Homology-dependent gene silencing；HDGS)，该HDGS样现象在植物内源性基因、植物以外的转基因中均可见，被认为是生物的某种基因调控机制。
当在本说明书中使用时，“同源性依赖性基因沉默”或“HDGS”是指：多个基因依赖于其碱基序列的同源性或其序列的相似性而引发的基因表达的抑制现象。特别是指下述现象：如果特定的被导入的基因(导入基因)过表达，则与该导入基因一起存在于原(本来)基因组中(即内源性的)的同一或同源的基因受到抑制。作为“HDGS”，可以列举出例如“PTGS”。
当在本说明书中使用时，“转录后型基因沉默”或“PTGS”是指：转录后发生的基因表达抑制现象。RNAi也是PTGS的一种。
当在说明书中使用时，“共同抑制(cosuppression)”和”共抑制”可以作为同义词使用。“共同抑制”是指：在包含导入基因的植物中，该导入基因以及与其具有同源序列的内源性基因(在该植物中，存在于该植物的基因组上、且与该导入基因同一或同源的基因)这两者的表达均受到抑制的现象。该现象是在对牵牛花的色素合成相关基因的表达机制进行研究的过程中发现的(Napoli，C.，Lemieux，C.&Jprgensen，R.：Plant Cell 2，291-299(1990)；以及van der Krol，R et al：Plant Cell 2，291-299(1990))。此后，不仅是在植物中，粗糙链孢霉(Neurospora crassa)、果蝇、线虫、哺乳动物细胞等中也发现了与上述相同的现象。将这样的“共同抑制”用于育种目的的例子见SCIENCE Vol.309 29 July 2005 p.741-745等。
不需要拘泥于理论，作为关于RNAi作用机制的一种观点，如果将dsRNA这样的引起RNAi的分子导入细胞，则对于比较长的(例如40个碱基对以上)RNA，具有解旋酶结构域的称作切丁酶(Dicer)的RNaseIII样核酸酶在ATP存在下，从该分子的3’末端起依次切下约20个碱基对，产生短链dsRNA(称为siRNA)。在本说明书中，“siRNA”是short interfering RNA(小干扰RNA)的简称，是指人工化学合成的、或生物化学合成的、或在生物体内合成的、或约40个碱基以上的双链RNA在体内分解产生的、10个碱基对以上的短链双链RNA，通常具有5’-磷酸、3’-OH的结构，且3’末端有突出的约2个碱基。特异性蛋白质与该siRNA结合，从而形成RISC(RNA-induced-silencing-complex，RNA诱导沉默复合物)。该复合体识别与siRNA具有相同序列的mRNA并与之结合，由于RNaseIII样酶活性用siRNA的中央部切割mRNA。siRNA的序列与作为靶标切割的mRNA的序列之间的关系，优选100％一致。但是，在离开siRNA的中央的位置发生碱基突变，不会完全失去归因于RNAi的切割活性，而是残存部分活性。另一方面，siRNA中央部的碱基突变的影响大，会使RNAi对mRNA的切割活性极度降低。利用这样的性质，针对带有突变的mRNA，合成将该突变配置在中央的siRNA，通过将其导入细胞内，能够仅特异性地分解包含突变的mRNA。因而，在本发明中，可以将siRNA本身用作引起RNAi的因子，也可以将能够生成siRNA的因子(典型地例如约40个碱基以上的dsRNA)用作这样的因子。
此外，不希望拘泥于理论，通过不同于上述途径的其它途径，siRNA还可以以siRNA的反义链与mRNA结合并起到RNA依赖性RNA聚合酶(RdRP)的引物的作用，来合成dsRNA，该dsRNA再成为切丁酶的底物，产生新的siRNA，从而将作用放大。因而，在本发明中，siRNA本身以及产生siRNA的因子也是有用的。实际上，在昆虫等中，例如存在1,000拷贝以上的35分子的dsRNA分子的细胞内，mRNA基本上完全分解，从此可以理解siRNA本身以及产生siRNA的因子是有用的。
在本发明中，可以使用被称作siRNA的、约20个碱基左右(例如典型地为约21～23个碱基长)或小于该长度的双链RNA。这样的siRNA可以通过在细胞中表达来抑制基因表达，抑制作为该siRNA的靶标的病原基因的表达，因而可以在疾病的治疗、预防、预后等方面使用。
可在本发明中使用的siRNA，只要能够引起RNAi即可，可以是任何形态。
在其它实施方式中，本发明的引起RNAi的因子可以是3’末端具有突出部的短发夹结构(shRNA；short hairpin RNA，短发夹RNA)。在本说明书中，“shRNA”是指：通过以单链RNA形式部分地包含回文结构碱基序列，在分子内形成双链结构，呈发夹那样的结构的约20个碱基对以上的分子。这样的shRNA可以人工化学合成。或者，这样的shRNA可以通过将由有义链和反义链的DNA序列反向连接而成的发夹结构DNA用T7RNA聚合酶在体外合成RNA，来生成。不希望拘泥于理论，但应该理解的是：这样的shRNA在导入细胞内后，在细胞内被分解成约20个碱基(典型地例如21个碱基、22个碱基、23个碱基)的长度，能够像siRNA那样引起RNAi，具有本发明的处置效果。应该理解的是：这样的效果可以在昆虫、植物、动物(包括哺乳动物)等广泛的生物中发挥。这样，由于shRNA能够像siRNA那样引起RNAi，因而可以用作本发明的有效成分。此外，shRNA可以优选具有3’突出末端。对于双链部分的长度没有特殊限定，但可以优选约10个核苷酸长以上、更优选约20个核苷酸长以上。此处，3’突出末端可以优选是DNA，更优选是至少2个核苷酸长以上的DNA，更优选是2～4个核苷酸长的DNA。
可在本发明中使用的引起RNAi的因子可以使用人工合成的(例如化学合成的或生物化学合成的)，也可以使用天然存在的，这两者之间不会在本发明的效果上产生本质差异。化学合成的引起RNAi的因子优选用液相色谱等进行纯化。
可在本发明中使用的引起RNAi的因子可以在体外合成。在该合成体系中，使用T7RNA聚合酶和T7启动子由模板DNA来合成反义和有义的RNA。将它们在体外退火后导入细胞，则通过诸如上述的机制，可以引起RNAi，从而实现本发明的效果。这里，可以采用例如磷酸钙法将这样的RNA导入细胞内。
此外，作为本发明的引起RNAi的因子，还可以列举出诸如可与mRNA杂交的单链、或者全部这些的类似的核酸类似物这样的因子。此外，在本发明的方法和组合物中，这样的因子也是有用。
在本说明书中，编码具有SEQ ID NO：8(Pns4)、SEQ ID NO：12(Pns6)、SEQ ID NO：22(Pns11)或SEQ ID NO：24(Pns12)的氨基酸序列的多肽或其修饰体或片段等蛋白质的天然核酸，可以从具有包含例如SEQ ID NO：7(S4)、SEQ ID NO：11(S6)、SEQ ID NO：21(S11)或SEQ ID NO：23(S12)所示的核酸序列的一部分或其修饰体的PCR引物和杂交探针的cDNA文库中容易地分离出来。
在本说明书中，用于杂交的“严格条件”是指下述条件：在所述条件下，与靶标序列具有相似性或同源性的核苷酸链的互补链优先与靶标序列杂交，而不具有相似性或同源性的核苷酸链的互补链实质上不杂交。某核酸序列的“互补链”是指：基于核酸的碱基之间的氢键而配对的核酸序列(例如A对T、G对C)。严格条件依赖于序列，而且因各种情况而异。较长的序列在较高的温度下特异性杂交。一般而言，严格条件选择比规定离子强度和pH下的特定序列的热解链温度(Tm)低约5℃。T_m是指：在规定的离子强度、pH和核酸浓度下，与靶标序列互补的核苷酸中的50％以平衡状态与靶标序列杂交的温度。“严格条件”是序列依赖性的、而且因各种环境参数而异。核酸杂交的一般性指南可参见Tijssen(Tijssen(1993)、LaboratoryTechnniques In Biochemistry And MolecularBiology-Hybridization WithNucleic Acid Probes Part I、第2章”Overview ofprinciples of hybridization andthe strategy of nucleic acid probeassay”、Elsevier，New York)。
典型地，严格条件为盐浓度为小于约1.0M Na⁺，且典型地，在pH7.0～8.3的条件下为约0.01～1.0M的Na⁺浓度(或其它盐)，而且，在温度方面，对于短的核苷酸(例如10～50个核苷酸)为至少约30℃，而对于长的核苷酸(例如比50个核苷酸更长)为至少约60℃。此外，严格条件可以通过添加诸如甲酰胺的不稳定化剂来实现。作为本说明书中的严格条件，可以列举出50％的甲酰胺、1M的NaCl、1％的SDS(37℃)的缓冲溶液中的杂交，和用0.1×SSC于60℃进行的洗涤。
在本说明书中，“在严格条件下杂交的多核苷酸”是指本领域惯用的公知的条件。以从本发明的多核苷酸中选出的多核苷酸作为探针，采用菌落杂交法、蚀斑杂交法或者Southern印迹杂交法等，可以获得这样的多核苷酸。具体地是指：通过使用固定有菌落或者蚀斑来源的DNA的滤膜，在0.7～1.0M的NaCl存在下，于65℃进行杂交后，再使用0.1～2倍浓度的SSC(saline-sodium citrate)溶液(1倍浓度的SSC溶液的组成为150mM氯化钠、15mM柠檬酸钠)于65℃条件下洗涤滤膜，而能够鉴定的多核苷酸。杂交可以按照Molecular Cloning 2nd ed.，Current Protocols in MolecularBiology，Supplement 1～38、DNA Cloning 1：Core Techniques，A PracticalApproach，Second Edition，Oxford University Press(1995)等实验手册中记载的方法来进行。这里，优选从在严格条件下杂交的序列中将仅包含A序列或仅包含T序列的序列排除在外。“能够杂交的多核苷酸”是指：能够在上述杂交条件下与其它多核苷酸杂交的多核苷酸。作为能够杂交的多核苷酸，具体地可以列举出：与编码具有本发明具体所示的氨基酸序列的多肽的DNA的碱基序列具有至少60％以上的同源性的多核苷酸、优选具有80％以上的同源性的多核苷酸、具有90％以上的同源性的多核苷酸、更优选具有95％以上的同源性的多核苷酸。
在本说明书中，“高度严格条件”是指被设计成这样的条件：在所述条件下，在核酸序列方面具有高度互补性的DNA链能够杂交，而显著具有错配的DNA的杂交被排除在外。杂交的严格度主要由温度、离子强度和甲酰胺这样的变性剂的条件决定。这样的涉及杂交和洗涤的“高度严格条件”的例子例如：0.0015M氯化钠、0.0015M柠檬酸钠、65～68℃；或0.015M氯化钠、0.0015M柠檬酸钠和50％甲酰胺、42℃。关于这样的高度严格条件，可以参照Sambrook et al.，Molecular Cloning：A Laboratory Manual、第2版、Cold Spring Harbor Laboratory(Cold Spring Harbor，N，Y.1989)；和Andersonet al.、Nucleic Acid Hybridization：a Practical approach、IV、IRL PressLimited(Oxford，England).Limited，Oxford，England。如果必要，可以采用更严格的条件(例如更高的温度、更低的离子强度、更高的甲酰胺或其它变性剂)。杂交缓冲液和洗涤缓冲液可以包含其它试剂，来达到减少非特异性杂交和/或背景杂交的目的。作为这样的其它试剂的例子，有0.1％牛血清白蛋白、0.1％聚乙烯基吡咯烷酮、0.1％焦磷酸钠、0.1％十二烷基硫酸钠(NaDodSO₄或SDS)、Ficoll、Denhardt溶液、经超声波处理的鲑鱼精DNA(或其它的非互补性DNA)和硫酸葡聚糖，此外也可以使用其它合适的试剂。这些添加物的浓度和形式可以在实质上不影响杂交条件的严格度的情况下进行变更。杂交实验通常在pH6.8～7.4实施；在典型的离子强度条件下，杂交的速度基本上与pH无关。可以参照Anderson et al.、Nucleic AcidHybridization：a Practical Approach、第4章、IRL Press Limited(Oxford，England)。
作为对DNA双链的稳定性有影响的因子，可以列举出碱基的组成、长度以及碱基对匹配错误的程度。杂交条件可以由本领域技术人员来调整，适用这些变量，而且能够使得不同序列相关性的DNA形成杂合体。完全配对的DNA双链的融解温度可以通过下式大致计算出来。
T_m(℃)＝81.5+16.6(log[Na⁺])+0.41(％G+C)-600/N-0.72(％甲酰胺)
这里，N为形成的双链的长度，[Na⁺]为杂交溶液或洗涤溶液中的钠离子的摩尔浓度，％G+C为杂合体中的(鸟嘌呤+胞嘧啶)碱基的百分比。对于不完全匹配的杂合体，对于每1％的匹配错误(错配)，融解温度减少约1℃。
在本说明书中“中度严格条件”是指能够形成下述DNA双链的条件，所述DNA双链与能够在“高度严格条件”下形成的DNA双链相比，具有更高程度的碱基对匹配错误DNA双链。典型的“中度严格条件”的例子为0.015M氯化钠、0.0015M柠檬酸钠、50～65℃或0.015M氯化钠、0.0015M柠檬酸钠和20％甲酰胺、37～50℃。作为例子，0.015M钠离子中、50℃的“中度严格”条件允许有约21％的匹配错误。
本领域技术人员应该理解的是：在本说明书中，“高度”严格条件与“中程度”严格条件之间并不存在截然不同的区别。例如，在0.015M钠离子(无甲酰胺)中，完全匹配的长DNA的融解温度为约71℃。65℃(相同离子强度)下的洗涤中，其允许约6％的匹配错误。为了捕捉关联性更远的序列，本领域技术人员可以简单地降低温度或提高离子强度。
对于至多约20个核苷酸的寡核苷酸探针，其在1M NaCl中的融解温度可以通过下述适当估算：
Tm＝(A-T碱基对数×2℃)+(G-C碱基对数×4℃)。
而且，6×柠檬酸钠盐(SSC)中的钠离子浓度为1M(参考Suggs等，Developmental Biology Using Purified Genes、683页，Brown和Fox(编)(1981))。
编码具有SEQ ID NO：8(P4)或SEQ ID NO：24(Pns12)的氨基酸序列的多肽或其修饰体或片段等的核酸，在本质上包含1％牛血清白蛋白(BSA)、500mM磷酸钠(NaPO₄)、1mM EDTA、温度42℃的7％SDS的杂交缓冲液和本质上包含2×SSC(600mM NaCl；60mM柠檬酸钠)、50℃的0.1％SDS的洗涤缓冲液定义的低严格条件下、更优选本质上包含温度50℃的1％牛血清白蛋白(BSA)、500mM磷酸钠(NaPO₄)、15％甲酰胺、1mM EDTA、7％SDS的杂交缓冲液和本质上包含50℃的1×SSC(300mM NaCl；30mM柠檬酸钠)、1％SDS的洗涤缓冲液定义的低严格条件下、最优选本质上包含温度50℃的1％牛血清白蛋白(BSA)、200mM磷酸钠(NaPO₄)、15％甲酰胺、1mM EDTA、7％SDS的杂交缓冲液和本质上包含65℃的0.5×SSC(150mM NaCl；15mM柠檬酸钠)、0.1％SDS的洗涤缓冲液定义的低严格条件下，能够与SEQ IDNO：1或3所示的序列中的1个或其一部分杂交。
在本说明书中“同源性”是指：在2个以上的序列的比较中，这些序列在进化上具有共同祖先。2种基因是否具有同源性，可以通过对序列进行直接比较并基于相似性来判定，或可以通过严格条件下的杂交方法来考察对序列进行直接比较并基于相似性来判定时，作为其相似性测定过程的比对中的最单纯的解释，可以认为：排列上呈相同(或等价)文字序列(碱基、氨基酸残基等)的文字序列报名这些区域保持了祖先序列的状态、未发生变化，不相同的(或不等价)的文字序列则表明在其中的一个序列中发生过突变。可以认为比对中的空位(indel，插入、缺失)是其中的一个序列发生了插入或缺失而引起的。总之，应该理解的是：这些序列的同一性或相似性高，则强烈提示这些序列中的同源性。同源性可在表达抑制剂的设计中作为参照。
在本说明书中，“引物”是指：在高分子合成酶反应中，合成的高分子化合物的反应开始所必需的物质。核酸分子的合成反应中，可以使用与所需合成的高分子化合物的一部分的序列互补的核酸分子(例如DNA或RNA等)。
作为通常作为引物使用的核酸分子，可以列举出：具有与目的基因的核酸序列互补的、至少连续8个核苷酸长的核酸序列的核酸分子。这样的核酸序列可以是优选至少9个连续核苷酸长的、更优选至少10个连续核苷酸长的、更优选至少11个连续核苷酸长的、至少12个连续核苷酸长的、至少13个连续核苷酸长的、至少14个连续核苷酸长的、至少15个连续核苷酸长的、至少16个连续核苷酸长的、至少17个连续核苷酸长的、至少18个连续核苷酸长的、至少19个连续核苷酸长的、至少20个连续核苷酸长的、至少25个连续核苷酸长的、至少30个连续核苷酸长的、至少40个连续核苷酸长的、至少50个连续核苷酸长的核酸序列。可作为探针使用的核酸序列中包括与与上述序列至少70％同源、更优选至少80％同源、更优选至少90％同源、至少95％同源的核酸序列。作为引物的适合序列可以因意图合成(扩增)的序列的性质而变动，但本领域技术人员能够根据意图的序列来设计适宜引物。这样的引物的设计在本领域是众所周知的，可以手动进行，也可以使用计算机程序(例如LASERGENE，PrimerSelect，DNAStar)来进行。
在本说明书中，“修饰体”是指：对原来的多肽或多核苷酸等物质进行一部分变更而得到的物质。作为这样的修饰体，可以列举出取代修饰体、添加修饰体、插入修饰体、缺失修饰体、截短(truncated)修饰体、等位基因突变体等。作为这样的修饰体，可以列举出：在作为基准的核酸分子或多肽中包含1个或数个取代、添加、插入和/或缺失、或者包含1个以上的取代、添加、插入和/或缺失而得到的物质，但不限于此。“直系同源物(ortholog)”也称直向同源基因(orthologous gene)，是指两个基因来源于源自某共通祖先的种分化的基因。通常，直系同源物在其它的病毒株中能够起到与原来的病毒株相同的功能，因而，本发明直系同源物在本发明中也是有用的。
在本说明书中“保守(修饰而得的)修饰体”适用于氨基酸序列和核酸序列这两者。对于特定的核酸序列，保守修饰而得的修饰体是指编码同一或本质上同一的氨基酸序列的核酸，当核酸不编码氨基酸序列时，是指本质上同一的序列。作为这样的碱基序列的修饰方法，可以列举出：通过用限制酶等进行切割、再用DNA聚合酶、Klenow片段、DNA连接酶等进行处理等而进行的连接等处理，使用合成寡核苷酸等进行的定点碱基取代方法(特定部位指向突变法；Mark Zoller and Michael Smith，Methods inEnzymology，100，468-500(1983))；此外，也可以采用其它分子生物学领域通常采用的方法来进行修饰。
在本说明书中使用的核酸分子，只要能够抑制目的基因的表达即可，可以像上述那样地将该核酸的一部分序列缺失或用其它碱基取代，或者也可以部分插入其它核酸序列。或者，还可以在5’末端和/或3’末端结合其它核酸。此外，还可以是与编码多肽的基因在严格条件下杂交、并编码与多肽具有实质上相同的功能的多肽的核酸分子。这样的基因在本领域中是公知的，可以在本发明中利用。
这样的核酸可以采用众所周知的PCR法获得，也可以化学合成。这些的方法中还可以组合例如定点变位诱导法(部位特异性变位诱发法)、杂交法等。
在本说明书中，多肽或多核苷酸的“取代、添加、插入和/或缺失”是指：相对于原来的多肽或多核苷酸，各氨基酸或其替代物或核苷酸或其替代物被取代、被添加、被插入、或被剔除。这样的取代、添加、插入和/或缺失的技术在本领域是众所周知的，作为这样的技术的例子，可以列举出定点诱变技术等。作为基准的核酸分子或多肽中的这些变化可以出现在该核酸分子的5’末端或3’末端，或者可以出现在显示该多肽的氨基酸序列的氨基末端部位或羧基末端部位，或者可以出现在这些末端部位之间的任何部位，它们分散分布在基准序列中的残基之间。取代、添加或缺失可以是1个以上的任意数目，上述数目可以增加，只要该具有取代、添加或缺失的修饰体能够保持目的功能(例如激素、细胞因子的信息传导功能等)即可。例如，上述数目可以是1个或数个，而且优选可以是全体长度的20％以内、15％以内、10％以内、5％以内，或150个以下、100个以下、50个以下、25个以下等。
(一般技术)
可在本说明书中使用的分子生物学方法、生物化学方法、微生物学方法是本领域众所周知且惯用的，记载于例如Sambrook J.etal.(1989).Molecular Cloning：A Laboratory Manual，Cold Spring Harbor和その3rd Ed.(2001)；Ausubel，F.M.(1987).Current Protocols in Molecular Biology，Greene Pub.Associates and Wiley-Interscience；Ausubel，F.M.(1989).ShortProtocols in Molecular Biology：A Compendium of Methods from CurrentProtocols in Molecular Biology，Greene Pub.Associates andWiley-Interscience；Innis，M.A.(1990).PCR Protocols：A Guide to Methods andApplications，Academic Press；Ausubel，F.M.(1992).Short Protocols inMolecular Biology：A Compendium of Methods from Current Protocols inMolecular Biology，Greene Pub.Associates；Ausubel，F.M.(1995).ShortProtocols in Molecular Biology：A Compendium of Methods from CurrentProtocols in Molecular Biology，Greene Pub.Associates；Innis，M.A.etal.(1995).PCR Strategies，Academic Press；Ausubel，F.M.(1999).Short Protocolsin Molecular Biology：A Compendium of Methods from Current Protocols inMolecular Biology，Wiley，and annual updates；Sninsky，J.J.et al.(1999).PCRApplications：Protocols for Functional Genomics，Academic Press、別冊実験医学“遺伝子導入&発現解析実験法”，羊土社、1997等，本说明书引用其相关部分(可以是全部)作为参考。
关于用于制作人工合成基因的DNA合成技术和核酸化学，见例如Gait，M.J.(1985).Oligonucleotide Synthesis：A Practical Approach，IRLPress；Gait，M.J.(1990).Oligonucleotide Synthesis：A Practical Approach，IRL Press；Eckstein，F.(1991).Oligonucleotides and Analogues：A Practical Approac，IRLPress；Adams，R.L.et al.(1992).The Biochemistry of the Nucleic Acids，Chapman&Hall；Shabarova，Z.et al.(1994).Advanced Organic Chemistry ofNucleic Acids，Weinheim；Blackburn，G.M.et al.(1996).Nucleic Acids inChemistry and Biology，Oxford University Press；Hermanson，G.T.(I996).Bioconjugate Techniques，Academic Press等中的记载，本说明书中引用其相关部分作为参考。
(基因工程学)
可在本发明中使用的具有SEQ ID NO：2的氨基酸序列的多肽及其片段和修饰体，可以采用基因工程学技术来生产。
当在本说明书中相对于基因而提及时，“载体”或“重组载体”是指：能够使目的多核苷酸序列移入目的细胞的载体。作为这样的载体，可以示例出：能够在原核细胞、酵母、动物细胞、植物细胞、昆虫细胞、动物个体和植物个体等宿主细胞中自主复制或能够整合到染色体中的、在适于本发明的多核苷酸转录的位置含有启动子的载体。载体中适于克隆的载体称为“克隆载体”。这样的克隆载体通常包含含有多个限制酶部位的多克隆部位。这样的限制酶部位和多克隆部位在本领域是众所周知的，本领域技术人员能够根据目的适宜地选择使用。这样的技术记载于本说明书引用的文献(例如Sambrook等，同前)中。作为优选载体，可以列举出质粒、噬菌体、粘粒、附加体、病毒粒子或病毒和可重组的DNA片段(即可通过同源重组组合到宿主基因组中的片段)，但不限于此。
载体的1种类型是“质粒”，“质粒”进一步是指DNA片段连接而成的环状双链DNA环。作为其它类型的载体有病毒载体，这里其是DNA片段进一步连接在病毒基因组中而成的。特定的载体(例如具有细菌的复制起点的细菌载体和附加体哺乳动物载体)能够在它们所导入的宿主细胞中自主复制。其它载体(例如非附加体哺乳动物载体)能够在导入宿主细胞中时整合到宿主细胞的基因组中，并由此与宿主基因组一起复制。而且，特定的载体能够使与这些可操作连接的基因表达。这样的载体在本说明书中称作“表达载体”。
因而，在本说明书中“表达载体”或“表达质粒”是指：结构基因、调节其表达的启动子、以及各种调控元件以能够在宿主的细胞中发挥功能的状态连接而成的核酸序列。调控元件优选可以包含终止子、诸如药物抗性基因的选择标记和增强子。生物(例如植物)的表达载体类型和所使用的调控元件的种类可以根据宿主细胞而变化，这是本领域技术人员众所周知的事项。
作为可在本发明中使用的针对原核生物细胞的“重组载体”，可以示例出pcDNA3(+)、pBluescript-SK(+/-)、pGEM-T、pEF-BOS、pEGFP、pHAT、pUC 18、pFT-DEST^TM42GATEWAY、pENTR^TM/D-TOPO(Invitrogen)等。原核生物细胞可用于基因的扩增、修饰等。
作为可在本说明书中使用的针对植物细胞的“重组载体”，可以列举出pANDA(奈良先端大学院大学岛本教授转让)、pBE7133-GUS-Hygro(pE7ΩIGUS-Hygro)、pPZP2H-lac，但不限于此。
在本说明书中“终止子”是位于基因的编码蛋白质的区域的下游的、涉及DNA向mRNA转录时的转录终止以及多聚A序列的添加的序列。已知终止子赋予mRNA稳定性，而且还会影响基因的表达量。作为终止子的例子，可以列举出CaMV35S终止子和胭脂碱(nopaline)合成酶基因的终止子(Tnos)，但不限于此。
在本说明书中“启动子”是指决定基因的转录起始部位、或直接调节其频率的DNA上的区域，其是RNA聚合酶结合并开始转录的碱基序列。推定启动子区域因结构基因而有所变动，通常是在结构基因的上游，但并不限于此，也可以在结构基因的下游。
启动子可以是诱导性的，也可以是组成性的；可以是部位特异性的，也可以是时期特异性的；优选组成性启动子或诱导性启动子。作为启动子，对其没有限定，只要能够在例如哺乳动物细胞、大肠杆菌、酵母等宿主细胞中表达即可。
在本说明书中，当在基因的表达中使用时，一般地，“部位特异性”是指在植物的部位中其基因表达的特异性。“时期特异性”是指：与植物的发育阶段相应的其基因表达的特异性。这样的特异性可以通过选择合适的启动子而导入目标生物。通过使用部位特异性调控元件来表达核酸，能够使用重组植物表达载体优先在特定的细胞类型中表达核酸。部位特异性调控元件是本领域公知的。
在本说明书中，“部位特异性表达启动子”是指在器官(例如根、茎、叶、果实、种子以及其组合)、组织(例如表皮、韧皮部、薄壁组织、木质部、维管束以及其组合等)、发育阶段(例如发芽期、生长期、开花期、结实期(登期)以及其组合等)等中特异性的启动子。从原理上讲，可以通过分离个体中特异性表达的基因、并分离其启动子、表达调控顺式区域来获得。
在本说明书中，启动子的表达是“组成性的”是指：在生物的所有组织中，在该生物成长/增殖中的任何时期基本上均以一定量表达的性质。具体而言，如果进行Northern印迹分析时，例如在任意时间点(例如2个点以上(例如第5日和第15日))的同一或对应部位的任何一个中，均观察到基本同等程度的表达量，则根据本发明的定义，称为表达是组成性的。可以认为组成性启动子在维持通常生长环境中的生物的恒定性方面起作用。本发明的启动子的表达是“应答性”的是指：当给予生物体至少1种因子时，其表达量发生变化的性质。特别是，表达量增加的性质相对因子而言称为“诱导性”，表达量减少的性质相对因子而言称为“减少性”。“减少性”的表达是以在正常情况下能够观察到表达为前提的，因此，该概念与“组成性”表达有重复。这些性质可以通过从生物的任意部分抽提RNA、并采用Northern印迹分析分析表达量或采用Western印迹定量表达的蛋白质，来确定。将相对因子而言为诱导性的启动子与本发明的编码部位特异性重组诱导因子的核酸一起组导入载体，用该载体转化哺乳动物细胞或哺乳动物(特定的组织等)，对于该哺乳动物细胞或哺乳动物，通过使用具有该启动子的诱导活性的刺激因子，能够进行某些条件下的部位特异性重组序列的部位特异性重组。
本发明的多核苷酸可以直接或经过修饰后，采用本领域技术人员众所周知的方法与合适的植物表达载体连接，采用公知的基因重组技术导入植物细胞中。导入的基因可以整合到植物细胞中的DNA上而存在。而且，植物细胞中的DNA不仅包括染色体，还包括植物细胞中的各种细胞器(例如线粒体、叶绿体等)中的DNA。
在本说明书中，“植物表达载体”是指：调节本发明的基因的表达的启动子等各种调控元件在宿主植物的细胞中可操作连接的核酸序列。本申请说明书中使用的术语“调控序列”是指：具有功能性启动子和任意的关联转录要素(例如增强子、CCAAT盒、TATA盒、SPI部位等)的DNA序列。本申请说明书中使用的术语“可操作连接”是指：与基因表达相关的多核苷酸和调节其表达的启动子、增强子等各种调控元件在宿主细胞中以可发挥作用的状态连接，使得基因得以表达。植物表达载体适宜地可以包含植物基因、启动子、终止子、药物抗性基因和增强子。表达载体的类型和使用的调控元件的种类可以根据宿主细胞而改变，这是本领域技术人员众所周知的事项。用于本发明的植物表达载体还可以具有T-DNA区域。T-DNA区域特别是在使用土壤杆菌转化植物时，可以提高基因导入的效率。
在本说明书中，“植物基因启动子”是指：在植物中表达的启动子。可以采用在再生植物的所有组织中使本发明的多核苷酸的表达的植物启动子片段。作为用于组成性表达的启动子，可以使用例如胭脂碱合成酶基因的启动子(Langridge，1985，Plant Cell Rep.4，355)、产生花椰菜花叶病毒19S-RNA的启动子(Guilley，1982，Cell 30，763)、产生花椰菜花叶病毒35S-RNA的启动子(Odell，1985，Nature 313，810)、稻的肌动蛋白启动子(Zhang，1991，Plant Cell 3，1155)、玉米泛素启动子(Cornejo 1993，PlantMol.Biol.23，567)、启动子(Mitsuhara，1996，Plant Cell Physiol.37，49)等。
或者，植物启动子可以在特定组织中使本发明的多核苷酸表达，或者如果不是这样，可以处于更特异性的环境或发育的调控之下。这样的启动子在在本说明书中称为“可诱导”启动子。作为可诱导启动子，可以列举出已知因例如光、低温、高温、干燥、紫外线照射、特定化合物散布等外因而表达的启动子等。作为这样的启动子，可以列举出例如：因光照而表达的编码核酮糖-1，5-二磷酸羧化酶小亚基的基因的启动子(Fluhr，1986，Pro.Natl.Acad.Sci.USA 83，2358)、能够被低温诱导的稻的lip19基因的启动子(Aguan，1993，Mol.Gen.Genet.240，1)、能够被高温诱导的稻的hsp72、hsp80基因的启动子(Van Breusegem，1994，Planta 193，57)、能够被干燥诱导的拟南芥的rab16基因的启动子(Nundy，1990，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87，1406)、能够被紫外线照射诱导的玉米的醇脱氢酶基因的启动子(Schulze-Lefert，1989，EMBO J.8，651)等。此外，rab16基因的启动子还可以被作为植物激素的脱落酸的散布诱导。
在本说明书中“药物抗性基因”优选能够使转化植物的选择变得容易。适合使用用于赋予卡那霉素抗性的新霉素磷酸转移酶II(NPTII)基因和用于赋予潮霉素抗性的潮霉素磷酸转移酶基因等，但不限于此。在本发明中，这些药物抗性基因可以在筛选技术等中使用。
诸如上述的植物表达载体可以采用本领域技术人员众所周知的基因重组技术来制作。植物表达载体的构建中适合使用例如pBI系的载体或pUC系的载体，但不限于此。
作为用于DNA导入的植物材料，视导入方法等的不同，可以从叶、茎、根、块茎、原生质体、愈伤组织、花粉、种子胚、苗条原基(苗条原基)等中适当选择。“植物细胞”可以是任意的植物细胞。作为“植物细胞”的例子，可以列举出叶和根等植物器官的细胞、愈伤组织以及悬浮培养细胞。植物细胞可以是培养细胞、培养组织、培养器官、或植物体的任何形态。优选培养细胞、培养组织或培养器官，更优选培养细胞。
此外，一般地，在向植物培养细胞导入DNA时，使用原生质体作为材料，采用电穿孔法、聚乙二醇法等物理/化学方法进行DNA的导入；而在向植物组织导入DNA时，使用叶、茎、根、块茎、愈伤组织、花粉、种子胚、苗条原基等、优选使用叶、茎、愈伤组织作为材料，采用使用了病毒或土壤杆菌的生物学方法或粒子枪法等物理/化学方法进行DNA的导入。作为土壤杆菌介导的方法，可以采用例如Nagel等的方法(Microbiol.Lett.，67，325(1990))。该方法中，首先用植物表达载体(例如通过电穿孔)转化土壤杆菌，然后再采用叶盘法等众所周知的方法将转化的土壤杆菌导入植物组织。这些方法在本领域中是众所周知的，本领域技术人员能够适宜地选择适合于转化的植物的方法。
导入了植物表达载体的细胞，可以以例如卡那霉素抗性等药物抗性为基准选择出来。选择出的细胞可以采用常规方法再生成植物体。
为了使导入了本发明的多核苷酸的植物细胞再生成植物，将这样的植物细胞在再分化培养基、不含激素的MS培养基等中进行培养即可。通过将生根的幼小植物体移植到土壤中来进行栽培，可以得到植物体。再生(再分化)的方法因植物细胞的种类而异。各文献中记载了对稻(Fujimura，1995，Plant Tissue CultureLett.2，74)、玉米(Shillito，1989，Bio/Technol.7，581、Gorden-Kamm，1990，Plant Cell 2，603)、马铃薯(Visser，1989，Theor.Appl.Genet.78，594)、烟草(Nagata，1971，Planta 99，12)等各种植物进行再分化的方法。
在再生出的植物体中，可以采用本领域技术人员众所周知的方法来确认导入的本发明的基因的表达。该确认可以利用例如Northern印迹解析来进行。具体地，从植物的叶抽提总RNA，用变性琼脂糖进行电泳，然后印迹到合适的膜上。通过使该印迹和与导入基因的一部分互补的标记RNA探针进行杂交，可以检测本发明的基因的mRNA。
可使用本发明的多核苷酸进行转化的植物包括可进行基因导入的任何植物。
当使用大肠杆菌作为宿主细胞时，可以列举出：trp启动子(Ptrp)、lac启动子(Plac)、PL启动子、PR启动子、PSE启动子等大肠杆菌和噬菌体等来源的启动子，SPO1启动子，SPO2启动子，penP启动子等。此外，还可以使用将2个Ptrp串联而得到的启动子(Ptrp x2)、tac启动子、lacT7启动子、let I启动子这样的经人工设计修饰的启动子等。
在本说明书中，“复制起点”是指：DNA复制开始的染色体上的特定区域。复制起点可以通过以包含内源性起点的形式构建该载体来提供，或者也可以通过宿主细胞的染色体复制机制来提供。当该载体能够整合到宿主细胞染色体中时，采用后者就足够了。或者，与使用包含病毒复制起点的载体相比，本领域技术人员通过采用将选择标记与本发明的DNA同时转化的方法，能够转化哺乳动物细胞。合适的选择标记的例子是二氢叶酸还原酶(DHFR)或胸苷激酶(参照美国专利第4,399,216号)。
在本说明书中，“增强子”是指：用于提高目的基因的表达效率的序列。这样的增强子在本领域是众所周知的。例如，作为增强子，可以使用包含CaMV35S启动子内的上游侧的序列的增强子区域，但不限于此。增强子可以使用多个，也可以使用1个，也可以不使用。
在本发明中，“增强子”可以用于提高目的基因的表达效率。作为增强子，适合使用包含CaMV35S启动子内的上游侧的序列的增强子区域。相对于1个植物表达载体，可以使用多个增强子。
在本说明书中，“可操作连接”是指：将所希望的序列的表达(发挥作用)配置于某转录翻译调节序列(例如启动子、增强子等)或翻译调节序列的调控之下。为了使启动子与基因可操作连接，通常，在该基因的邻近上游配置启动子，但也并非一定要邻接配置。
在本说明书中，将核酸分子导入细胞的技术可以是任何技术，可以列举出例如转化、转导、转染等。这样的核酸分子导入技术在本领域是众所周知的，而且是惯用的，其记载于例如Ausubel F.A.等编(1988)、CurrentProtocols in Molecular Biology、Wiley、New York、NY；Sambrook J ら(1987)Molecular Cloning：A Laboratory Manual，2nd Ed.及其第三版，ColdSpring Harbor Laboratory Press，Cold Spring Harbor，NY；別冊実験医学“遺伝子導入&発現解析実験法”，1997等中。基因的导入可以采用Northern印迹、Western印迹分析这样的本说明书中记载的方法或其它众所周知的惯用技术来确认。
此外，作为载体的导入方法，可以采用将DNA导入细胞的诸如上述的方法中的任何方法，可以列举出例如：转染、转导、转化等(例如磷酸钙法、脂质体法、DEAE葡聚糖法、电穿孔法、使用粒子枪(基因枪)的方法等)。
在本说明书中，“转化体”是指：通过转化制备的细胞等生命体的全部或一部分。作为转化体，可以示例出原核细胞、酵母、动物细胞、植物细胞、昆虫细胞等。转化体视其对象而定也称作转化细胞、转化组织、转化宿主等。可在本发明中使用的细胞可以是转化体。
在本发明中，当在基因操作等中使用原核生物细胞时，作为原核生物细胞，可以示例出属于埃希氏菌属、沙雷菌属、芽胞杆菌属、短杆菌属、棒状杆菌属、微杆菌属、假单胞菌属等的原核生物细胞，例如大肠杆菌XL1-Blue、大肠杆菌XL2-Blue、大肠杆菌DH1。
当在本说明书中使用时，作为重组载体的导入方法，可以采用任何导入DNA的方法，可以列举出例如氯化钙法、电穿孔法[Methods.Enzymol.，194，182(1990)]、脂质转染法、原生质球法[Proc.Natl.Acad.Sci.USA，84，1929(1978)]、醋酸锂法等。
在本说明书中，基因表达(例如、mRNA表达、多肽表达)的“检测”或“定量”，可以采用例如包括mRNA的测定和免疫学测定方法的合适的方法来实现。作为分子生物学测定方法，可以示例出例如Northern印迹法、斑点印迹法或PCR法等。作为免疫学测定方法，例如，作为方法，可以示例出使用微滴定板的ELISA法、RIA法、荧光抗体法、Western印迹法、免疫组织染色法等。此外，作为定量方法，可以示例出ELISA法或RIA法等。也可以通过使用了阵列(例如DNA阵列、蛋白阵列)的基因解析方法来进行。关于DNA阵列，(秀润社编，細胞工学別冊“DNAマイクロアレイと最新PCR法”)中进行了广泛综述。关于蛋白阵列，在Nat Genet.2002 Dec；32 Suppl：526-32中有详细描述。作为基因表达的分析方法，除上述之外，还可以列举出RT-PCR、RACE法、SSCP法、免疫沉淀法、双杂交(two-hybrid)系统、体外翻译等，但不限于此。这样的更进一步的分析方法记载在例如ゲノム解析実験法·中村祐輔ラボ·マニユアル，中村祐辅编集  羊土社(2002)等中，在本说明书中引用全部这些记载作为参考。
(抵抗性的评价)
采用本发明的方法制作的基因重组植物是否具有对病原体的抵抗性，可以采用例如Methods for Isolation，Cultivation，Inoculation of PlantPathogens，JapanPlant Protection Association中记载的测试方法容易地确认。例如，当为稻矮缩病时，可以通过在温室中放养斐豹蛱蝶等传播RDV的昆虫，使病毒感染特定的稻品种，比较原品种或野生型与重组体之间的病斑形成或稻的高度，来进行测试，但不限于此。
在本说明书中，“表达量”是指：作为对象的细胞等中，表达出的多肽或mRNA的量。作为这样的表达量，可以列举出本发明多肽在蛋白质水平的表达量(可以使用本发明的抗体，通过包括ELISA法、RIA法、荧光抗体法、Western印迹法、免疫组织染色法等免疫学测定方法的任意合适方法来评价)，或者本发明的多肽在mRNA水平的表达量(可以包括通过Northern印迹法、斑点印迹法、PCR法等分子生物学测定方法的任意合适方法来评价)。“表达量的变化”是指：采用包括上述免疫学测定方法或分子生物学测定方法的任意合适方法评价的本发明的多肽在蛋白质水平或mRNA水平的表达量增加或者减少。
在本说明书中，术语“上游”是指：从特定的基准点看来朝向多核苷酸的5’末端的位置。
在本说明书中，术语“下游”是指：从特定的基准点看来朝向多核苷酸的3’末端的位置。
在本说明书中，术语“互补的”或“互补体”是指：在本说明书中，互补区域全体能够直接地与其它特定多核苷酸形成Watson-Crick碱基对的多核苷酸的序列。在本发明的目的中，当第1多核苷酸的各碱基与其互补碱基成对时，视为该第1多核苷酸与第2多核苷酸互补。互补碱基一般是A与T(或者A与U)、或C与G。在本申请说明书中，词语“互补”作为“互补多核苷酸”、“互补核酸”和“互补核苷酸序列”的同义词使用。这些术语适用于仅基于其序列成对的多核苷酸，但不适用于2个多核苷酸处于事实上的结合状态的特定组合。
(优选实施方式的说明)
以下对优选实施方式进行说明，但应该理解的是，该实施方式仅是对本发明的示例，本发明的范围不受这样的优选实施方式的限定。此外，还应该理解的是，本领域技术人员能够以诸如以下的优选实施例作为参考，容易地在本发明的范围内进行某些修饰、变更等。
本发明人等制作了针对RDV节段基因组S1～S12所编码的蛋白质的抗体，并观察了这些蛋白质在细胞内的行为。在跟踪RDV感染的昆虫细胞中这12种蛋白质的行为时，发现：首先由3种非结构蛋白质(Pns6、Pns11和Pns12)来建造称作病毒原质体的病毒合成工厂；然后，在于病毒原质体合成核酸的同时，构成内壳粒子的4种蛋白质(P1、P3、P5和P7)聚集形成内壳粒子；然后，3种外壳蛋白质(P2、P8和P9)结合在移动至病毒原质体周边的内壳粒子上，形成病毒粒子。还发现：余下的非结构蛋白质P4和P10分别构建涉及病毒的细胞内输送和昆虫细胞间输送的管状结构体。
考虑到这些蛋白质在细胞内的行为，选择靶标基因来制作表达抑制剂，尝试了RDV抵抗性稻的制作。
在一个方面中，本发明提供包含存在于水稻矮缩病毒基因组中的至少1种基因的表达抑制剂的、用于赋予对稻矮缩病的抗性的组合物。
在本发明的一个实施方式中，上述至少1种基因可以选自由S4(SEQ IDNO：7)、S6(SEQ ID NO：11)、S11(SEQ ID NO：21)和S12(SEQ ID NO：23)构成的组。在最优选的实施方式中，上述至少1种基因可以是S12，但同样也可以使用S1(SEQ ID NO：1)、S2(SEQ ID NO：3)、S3(SEQ ID NO：5)、S4(SEQ ID NO：7)、S5(SEQ ID NO：9)、S7(SEQ ID NO：13)、S9(SEQ ID NO：17)、S10(SEQ ID NO：19)。
在一个实施方式中，本发明的表达抑制剂可以使用与SEQ ID NO：33(Trigger 6)、SEQ ID NO：37(Trigger 11)、SEQ ID NO：25(Trigger 12N)和SEQ ID NO：26(Trigger 12C)的核酸序列互补的反义序列来制作。
在一个实施方式中，优选的反义序列可以是：与SEQ ID NO：25(Trigger12N)所示的核酸序列互补的序列、与SEQ ID NO：26(Trigger12C)所示的核酸序列互补的序列、与SEQ ID NO：27(Trigger 4N)所示的核酸序列互补的序列、与SEQ ID NO：28(Trigger 4C)所示的核酸序列互补的序列。
在一个实施方式中，修剪序列可以具有5～32个或其以上的核苷酸序列。作为优选的修剪序列可以列举出：GUS序列、丙酮酸正磷酸二激酶(pyruvateorthophosphate dikinase)内含子、Dof Affecting Germination(DAG1)内含子等，但不限于此。
在一个实施方式中，本发明的表达抑制剂可以使用与SEQ ID NO：29(Trigger 1)、SEQ ID NO：30(Trigger 2)、SEQ ID NO：31(Trigger 3)、SEQID NO：32(Trigger 5)、SEQ ID NO：34(Trigger 7)、SEQ ID NO：35(Trigger9)或SEQ ID NO：36(Trigger 10)的核酸序列互补的反义序列来制作。
本发明的启动子可以是诱导性的，也可以是组成性的；可以是部位特异性的，也可以是时期特异性的。作为优选的启动子，可以列举出组成性启动子或诱导性启动子。作为诱导性启动子，优选胁迫诱导性启动子(例如感染诱导性启动子)。作为恒定性启动子，可以列举出泛素启动子、肌动蛋白启动子，但不限于此。作为感染诱导性启动子，可以列举出WRKY转录因子启动子、PR1启动子、PBZ1基因启动子、过氧化物酶启动子、促细胞分裂剂激活启动子等，但不限于这些。
在本发明的一个方面中，提供一种表达盒，其包含：反义序列、修剪序列以及与该反义序列互补的有义序列，其中，所述反义序列与编码存在于水稻矮缩病毒基因组中的至少1种基因的核酸序列互补。
在优选实施方式中，上述至少1种基因可以选自由S4(SEQ ID NO：7)、S6(SEQ ID NO：11)、S11(SEQ ID NO：21)和S12(SEQ ID NO：23)构成的组。特别优选S12(SEQ ID NO：23)。但是，同样可以使用S1(SEQ ID NO：1)、S2(SEQ ID NO：3)、S3(SEQ ID NO：5)、S5(SEQ ID NO：9)、S7(SEQ ID NO：13)、S9(SEQ ID NO：17)和S10(SEQ ID NO：19)。
在其它优选实施方式中，可以使用的反义序列能够通过使用例如可在Invitrogen网站中利用的rnai_designer(http://www.invitrogen.co.jp/rnai/rnai_designer.shtml/)、可在Promega网站中利用的siRNADesigner(http://www.promega.com.siRNADesigner/)、可在Ambion网站中利用的siRNA Target Finder、Dharmacon的siDESIGN Center、GenScript的siRNA Target Finder和Gene specific siRNA selector(不限于这些方法)容易地设计。
在本发明的一个方面中，提供包含上述表达盒的载体。应该理解的是，在本发明中所使用的载体只要能够实现所希望的目的(表达、输送、插入、导入等)即可，可以使用任何载体。
为了确认本发明的载体是否导入目的细胞中，本发明的载体可以包含药物抗性基因。作为药物抗性基因，可以适合使用赋予卡那霉素抗性的新霉素磷酸转移酶II(NPTII)基因和赋予潮霉素抗性的潮霉素磷酸转移酶基因等，但不限于此。
在本发明的一个方面中，提供包含上述载体的植物细胞、植物体、种子。
作为这样的植物，可以是任何植物，但优选会罹患水稻矮缩病毒等呼吸道肠道病毒的植物，更优选禾本科植物(小麦、大麦、玉米、高粱(ソルガム)等)，更优选稻属植物，更优选稻(例如日本种或印第安(インデイカ)种)。
在一个实施方式中，本发明的植物体对水稻矮缩病毒显示完全抵抗性。
(抵抗性/抗性植物的制作)
本发明的一个方面中，提供：生产赋予了对稻矮缩病的抗性、能够被水稻矮缩病毒感染的禾本科植物的方法；生产赋予了对稻矮缩病的抗性、能够被水稻矮缩病毒感染的植物的种子的方法；和循环生产赋予了对稻矮缩病的抗性、能够被水稻矮缩病毒感染的植物的方法。
上述所示的方法包含将本发明的表达抑制剂导入禾本科植物的细胞的步骤。一般地，本发明的载体可以使用各种惯用的技术导入所希望的植物宿主(例如禾本科植物的细胞)的基因组。作为优选的导入方法，可以列举出土壤杆菌法、聚乙二醇法、电穿孔法、粒子枪法，但不限于此。上述方法还包含选择对稻矮缩病病毒具有抵抗性的植物的步骤。这样的选择只要能够选择具有抵抗性的转基因植物即可，可以采用任意方法，可以是细胞水平的选择，也可以是植物体水平的选择。
当本发明的载体中出于确认是否导入的目的而包含药物抗性基因(例如潮霉素磷酸转移酶基因)时，上述导入步骤后而得到的细胞可以通过在包含用于检测该药物抗性基因是否在细胞中表达的药物(例如潮霉素)的选择培养基中进行增殖而被选择。当然，这样的选择培养基中所含的药物可以依赖于上述载体中所含的药物抗性基因而变更。
对于如上述地被选择出的细胞，可以通过在本领域通常使用的再生培养基中进行培养直至例如能够确认根和新芽，而使其再分化。作为这样的再生培养基，可以列举出诸如以下实施例中记载的再分化培养基(MSRE)等的(本领域众所周知的)培养基，但不限于此。
对于如上述地通过再分化而得到的根和新芽，可以通过将其移摘到钵上，使其生长至适于测试的时期(例如9叶期)或成熟期，来制作转基因植物(T0)。
而且，这样获得的转基因植物中是否包含本发明的载体，可以通过从上述植物采集细胞并获得细胞总DNA、对整合在基因组中的药物抗性基因实施Southern印迹等，来确认所得的转基因植物中是否实际包含本发明的载体。此外，通过获得小分子RNA、并使用探针与Trigger区域进行Northern印迹，也能够确认转基因植物中是否实际诱发了RNAi。而且，通过实际地使所得转基因植物感染RDV，并将感染转基因植物与对照野生型植物进行比较，也可以检测是否包含本发明的载体。
而且，本发明的转基因植物也可以从来自T0植物获得的种子、以及后代的T1植物、T2植物、T3植物等获得。
(用途)
在其它方面中，本发明提供本发明的表达抑制剂在赋予对稻矮缩病病毒的抵抗性、对稻矮缩病的抗性中的用途，还提供本发明的表达抑制剂在生产用于赋予这样的抵抗性或抗性的农药中的用途。应该理解的是，这里使用的核酸分子和因子，可以是在本说明书中上述的任意核酸分子。
在本说明书中引用的科学文献、专利、专利申请等参考文献，全部全文并入本说明书中作为参考，其相当于在本说明书中进行了具体的记载。
以上，为了容易地理解本发明，示出了优选实施方式来对其进行说明。以下，基于实施例对本发明进行说明，但上述说明和以下实施例仅是出于示例的目的而提供，并不是出于限定本发明的目的而提供的。因而，本发明的范围不受本说明书中具体记载的实施方式和实施例的限定，而是由权利要求书限定的。
实施例
(材料和方法)
在以下所示的实施例中，如无特别说明，通常采用以下记载的材料和方法来进行实验。
1.稻的生长
作为实验系统，使用了稻(Oryza sativa cv.Nipponbare；水稻，日本晴)。将稻植物在温室(20℃～32℃)中栽培，使其生长至9叶期，然后用于以下的实验。在对稻的RDV接种测试中，各转化体系统和作为对照的野生型稻均生长至2～3叶期，然后使用。这是因为：可以在新展开的叶中可以观察到RDV的病症，即在稻的生长期中，2～3叶期对RDV的敏感性是最高的。
2.NC-24细胞的建立和病毒
NC-24细胞(Nephotettix cincticeps(以下称为NC)细胞系是由从NC的卵切下来的胚性片段建立的，其在以下的实验中使用。简明地讲，是按如下所示制作的(具体地，参照Kimura，I.&Omura，T.(1988).Leafhopper cellcultures as a means for phytoreovirus research.Adv Dis Vector Res 5，111-135；和Leafhopper cell culture for virus research.In Arthropod CellCulture Systems，pp.91-107.Edited by K.Maramorosch & A.H.McIntosh.Philadelphia，PA：CRC Press)。从胚运动期的Nephotettix cincticeps的卵切下胚片段，作为组织培养物的外植片使用。将各个从卵中取出的稚嫩胚在带凹陷的载玻片(hollow slide，凹载片)上于台氏液(Tyrode′s solution)中切割成数个片段。将片段用台氏液(pH7.5)中的0.25％胰蛋白酶于30℃处理10～20分钟。然后，通过将该片段缠绕在微型针的周围来将其转移到增殖培养基中。在包在可密闭的玻璃皿中的小塑料皿的中心，向少量的培养基(0.3～0.5ml)中一起放置约30个片段。另外将一些培养基配置在该塑料皿的内壁底部的四周，维持合适的蒸气压，防止包含上述片段的其它培养基干燥。将该培养物于25℃温育。将从Liu和Black的培养基衍生出的NC细胞用增殖培养基(参照以下的试剂和培养基一节)用于NC细胞系的培养。在原代培养物中，胚片段的大部分的外植片于数小时后贴附在培养容器的底部表面，温育开始48小时以内，该外植组织的周围开始出现细胞增殖。该细胞的数目开始增加，形成单层的细胞层，并且缓慢地扩张，逐渐将原来的组织外植片包裹起来。该原代培养物通过每1个星期更换1次培养基可以维持数月。当细胞增殖到基本上要铺满皿中时，将这些细胞转移到新的皿中。将这些传代培养细胞装入塑料培养瓶，来进行进一步传代培养。细胞单层由2种类型的上皮细胞构成。主要是纺锤状的细胞，有少数是圆球形的细胞。在NC细胞中，前者宽7～10μm、长15～60μm，后者为直径6～20μm。NC细胞的倍增时间为约96小时。最终建立了6个系统的NC细胞系，以4～6天的间隔传代约90～约165次。为了在不冻结的情况下保持NC细胞系，将细胞在15℃或20℃温育。培养培养基每1个月更换1次。此外，在这些温度下，培养细胞的增基本上停止，或者即使有增殖也很缓慢。将细胞于15℃保持14个月，于20℃保持6个月。已知该规程是细胞培养物短期保存的简便方法。在冻结NC细胞系、用于Agallia constricta(以下称AC)细胞储藏的类似方法(Phytopathology 59，1032(1969))中，能够在液氮中长期在聚丙烯瓶中保存。通过沉淀回收对数增殖期的助细胞单层，将该沉淀悬浮在含5％二甲基亚砜的培养基中。将含有该悬浮细胞的瓶子于-80℃温育一夜，将其装入-196℃的液氮中。通过将冻结的细胞加入37℃的水浴装置中迅速进行融化来进行回收，通过平均每1分钟添加1ml的培养基来稀释至10ml。通过低速离心分离来进行沉淀，将其悬浮在4ml的新的培养基中。将这些分散在25cm²的NUNC烧瓶中。对于这些细胞中的约20％，按该规程进行了回收。为了使用维持良好生存力的NC细胞系，使用的是以4年间隔复原细胞(recover)并进行冻结的NC细胞系。
在RDV接种方面，已知含0.01M MgCl₂的0.1M组氨酸溶液(His-Mg)(pH约6.0)是在助细胞单层中保存感染性的良好缓冲液。
将NC-24细胞在按Kimura和Omura(Adv Dis Vector Res 5，111-135(1988))的记载制备的增殖培养基中于25℃以单层培养物的形式保持。
在下述的所有实验中均使用RDV的O株，本领域技术人员容易理解的是，使用任何RDV亚种系统或者任何变种系统均能够获得相同的结果。RDV的O株是按Zhong等(Arch Virol 148，2275-2280(2003))的记载在不适用CCl₄的情况下从RDV感染稻植物纯化得到的。储备含RDV粒子的蔗糖梯度级分，于-70℃保存。
3.针对S1～S12所编码的蛋白质的抗体的制作
兔多克隆抗血清、针对具有RDV的各节段基因组片段S1～S12所编码的氨基酸序列的蛋白质的抗体按铃木等(Virology 202，41-48(1994)和铃木等Arch Virol 144，1371-1380(1999))Zhong等(Arch Virol 148，2275-2280(2003))的描述进行制备。S1～S12所编码的蛋白质特异性的IgG抗体是使用蛋白A-琼脂糖凝胶从所得的特异性多克隆抗血清中分离出来的。在这些分离出来的IgG抗体上采用公知方法直接结合荧光素-5-异硫氰酸酯或罗丹明(Molecular Probes，Eugene，Oregon，USA)。
4.S1～S12所编码的蛋白质在杆状病毒中的表达
按Miyazaki等(J Mol Biol 345，229-237(2005))描述的那样，将杆状病毒系统用于RDV蛋白质的表达。将S1～S12所编码的cDNA的编码区域克隆在pGADT7载体(Clontech)上，测定其全部序列，确认了扩增过程中未引入任何核苷酸错误。用合适的限制酶消化后，将该cDNA与pFastBac供体质粒(Invitrogen)连接。然后，将重组pFastBac导入大肠杆菌DH10Bac细胞(Invitrogen)，以将其更换为杆粒。分离重组杆粒，使用其在CellFECTIN(Invitrogen)的存在下按生产厂商的说明书转染Spodopterafrugiperda(Sf9)细胞。然后，在转染72小时后，收集Sf9细胞，使用对S1～S12所编码的各蛋白质特异性的抗体进行免疫印迹，来考察了蛋白质的表达。
在细胞学观察方面，在转染前日，将Sf9细胞以1.5×10⁴/cm²的密度播种在盖玻片(直径15mm)上。除去培养培养基，用重组杆状病毒感染细胞。将细胞于27℃温育12～72小时后，进行处理以用于免疫荧光显微镜。
5.各重组RDV蛋白质的表达和纯化
将编码各RDV蛋白质的cDNA的编码区域以EcoRI-XhoI片段的形式分别克隆到合适的载体(可以列举出例如pET-30a(Novagen)、pGADT7(Clontech))的EcoRI-XhoI部位，并通过DNA序列测定确认克隆了合适的片段。然后，将这些片段亚克隆到细菌表达载体pMAL-c2X(NewEngland Biolabs)的EcoRI-SalI部位，并在E.coli BL21(DE3)细胞(Novagen)中进行了表达。按New England Biolabs的说明书，以与麦芽糖结合蛋白质(MBP-Pns12)的融合蛋白质的形式，分别纯化了各蛋白质。
6.免疫染色
在双重染色实验方面，使用蛋白A-琼脂糖凝胶亲和柱，从特异性多克隆抗血清中分离出了IgG。对于洗脱下来的IgG，将其相对于PBS进行完全透析。按生产商的说明书，在这些IgG上直接结合荧光素(FITC)或罗丹明。在病毒接种后的各个时间点上，将盖玻片上增殖的叶蝉的媒介单层细胞(VCM)即NC-24的单层细胞或Sf9细胞用PBS进行洗涤，并于2％低聚甲醛中室温下固定30分钟。将该细胞用PBS洗涤，并在含有1％BSA和0.1％Triton X-100的PBS中进行渗透。固定后，将这些细胞用PBS洗涤。将细胞于37℃与直接结合的IgG的100倍稀释溶液一起温育1.0～1.5小时。将盖玻片用去离子水洗涤，用ProLong Antifade(Invitrogen)固载在载玻片上。将细胞在Zeiss 510共聚焦激光扫描显微镜(LSM)下进行可视化。对于具有假感染细胞的盖玻片，在各实验中与感染细胞同样进行处理，来作为对照。
数据获取使用663油浸镜来进行。绿色荧光色素(FITC)和红色荧光色素(罗丹明)的检测使用窄频带滤光片组和2条激光线(氩：488nm；和氦/氖：543nm)来进行。使用加载在显微镜上的多跟踪装置来收集数据，并避免串扰。包括细胞深度计算和尺度标尺(scale bar)在内，全部的测定值均是使用Zeiss LSM 510软件来计算的。
7.免疫电子显微镜
将盖玻片上的细胞在含有2％低聚甲醛和2％戊二醛的0.1M磷酸缓冲液(pH7.2)中于室温固定2小时。将固定后的样品通过一系列梯度的-20℃乙醇进行脱水，然后包埋在LR金树脂(Bioscience)中。聚合在-20℃进行72小时。将样品用具备金刚石刀的超薄切片机(LKB Nova)进行切片，然后按Li等(Adv Dis Vector Res 5，111-135(2004))的描述，与由兔抗血清、15nm金粒子结合而成的免疫金标记抗兔IgG山羊抗体(GAR 15；British BifocalsInternational)一起温育。将切片用2％醋酸双氧铀(uranyl acetate)和Reynolds溶液(硝酸铅1.33g、柠檬酸钠1.76g、1N氢氧化钠溶液8ml，用蒸馏水补齐(メスアツプ)至总计50ml)各染色5分钟，在电子显微镜(H-7000；Hitachi)下进行观察。
8.利用免疫荧光对体内新合成的RNA进行检测
RDV接种10小时后，为了在体内对RNA进行标记，将在盖玻片上增殖的VCM用His-Mg洗涤，再用10μg/ml的放线菌素D(Sigma-Aldrich)处理30分钟。然后，按Silvestri等(J Virol 78，7763-7774(2004))的记载，将VCM在10mM的溴尿苷5’-三磷酸(BrUTP；Sigma-Aldrich)和6％Cellfectin转染试剂(Invitrogen)的存在下进一步温育30分钟。将细胞在接种11小时后进行固定，为了进行免疫荧光分析，先用小鼠来源的单克隆抗溴脱氧尿苷(BrdU)(Sigma-Aldrich)(1∶50)进行处理，再用Alexa Fluor 594驴抗小鼠IgG(Invitrogen)或对各RDV蛋白质特异性的结合有FITC的IgG(1∶50)进行处理。
9.滤膜结合测定
滤膜结合测定按与Ueda等(J Gen Virol 78，3135-3140(1997))的描述类似的方法进行。将表达组氨酸标签化Pns12的E.coli(大肠杆菌)细胞抽提物用SDS-PAGE凝胶(12％聚丙烯酰胺)电泳进行分级，将蛋白质条带转印到Immobilon-P(Millipore)PVDF膜滤膜上。将滤膜于室温在含5％脱脂牛奶的PBS(137mM NaCl、8.1mM Na₂HPO₄、2.7mM KCl、1.5mM KH₂PO₄)中平稳搅拌来封闭1小时，然后，在含0.05％Tween 20的PBS中洗涤3次(每次10分钟)，将滤膜与1.25μg/ml的MBP或MBP-Pns12一起4℃温育一夜。将该滤膜如上述地进行洗涤，然后与在兔中制备的MBP特异性抗血清(用PBS进行1∶4000稀释；New England Biolabs)一起于室温温育1小时。然后，将该滤膜与针对兔IgG(H+L)在山羊中制备的碱性磷酸酶结合兔抗体(1∶10000稀释；Biosource International)一起于室温温育1小时。洗涤后，将该印迹于室温在AP缓冲液[100mM Tris/HCl(pH 9.5)、100mM NaCl、5mMMgCl₂]中用四唑氮蓝(nitroblue tetrazolium)和5-溴-4-氯-3-吲哚基磷酸酯生色。在刚刚能够观察到背景的颜色时，用蒸馏水洗涤滤膜来终止上述反应。
10.培养基和试剂
(0)N6-维生素(1.2L)
甘氨酸                   2g
烟酸                     0.5g
吡哆醇HCl                0.5g
硫胺HCl                  1g
肌醇                     100g
用蒸馏水调整至1.2L。
分装成1.2ml，直至使用时在-20℃保存。
(1)MS-维生素1.2L
烟酸                     0.5g
吡哆醇HCl                0.5g
硫胺HCl                  0.1g
肌醇                     100g
用蒸馏水调整至1.2L。
分装成1.2ml，直至使用时在-20℃保存。
(2)愈伤组织诱导培养基(N6D)1L
蔗糖                     30g
酪蛋白氨基酸             0.3g
Chu(N6)Basal Salt Mixture Powder(购自Sigma公司)3.981g
脯氨酸                   2.9g
N6-维生素                      1.2ml
2，4-D(0.1M KOH中1mg/ml)       2ml
用1N KOH调节至pH5.8，用蒸馏水调整至1L。
添加Gelrite(从假单胞菌分泌而来的一种琼脂的替代物)4g，高压灭菌器灭菌。
(3)共存培养培养基(N6CO)1L
蔗糖                           30g
葡萄糖                         10g
酪蛋白氨基酸                   0.3g
Chu(N6)Basal Salt Mixture Powder(购自Sigma公司)
                               3.981g
N6-维生素                      1.2ml
2，4-D(0.1M KOH中1mg/ml)       2ml
用1N KOH调节至pH5.2，用蒸馏水调整至1L。
添加Gelrite 4g，高压灭菌器灭菌。
等到温度下降到低于50℃后，加入乙酰丁香酮(50mg/ml)400μl。
(4)选择培养基(N6SE)1L
蔗糖                           30g
酪蛋白氨基酸                   0.3g
Chu(N6)Basal Salt Mixture Powder(购自Sigma公司)
                               3.981g
脯氨酸                         2.9g
N6-维生素                      1.2ml
2，4-D(0.1M KOH中1mg/ml)       2ml
用1N KOH调节至pH5.8，用蒸馏水调整至1L。
添加Gelrite 4g，高压灭菌器灭菌。
等温度下降到低于50℃后，添加羧苄西林(250mg/ml)2ml和潮霉素
(50mg/ml)0.5ml。
(5)再分化培养基(MSRE)1L
蔗糖                      30g
D-山梨糖醇                30g
酪蛋白氨基酸              2g
Murashige&Skoog植物培养基用混合盐类(购自和光纯药公司)4.4g
MS-维生素                 1.2ml
激动素(DMSO中10mg/ml)     0.2ml
α-萘乙酸(NAA)
(DMSO中1mg/ml)            0.2ml
用1N KOH调节至pH5.8，用蒸馏水调整至1L。
添加Gelrite 4g，高压灭菌器灭菌。
等温度下降到低于50℃后，添加羧苄西林(250mg/ml)1ml和潮霉素(50mg/ml)0.5ml。
(6)不含激素(HF)培养基(1L)
蔗糖                      30g
Murashige&Skoog植物培养基用混合盐类(购自和光纯药公司)4.4g
MS-维生素                 1.2ml
用1N KOH调节至pH5.8，用蒸馏水调整至1L。
添加Gelrite 4g，高压灭菌器灭菌。
等温度下降到低于50℃后，添加潮霉素(50mg/ml)0.5ml。
(7)YEP培养基(1L)
细菌蛋白胨                10g
细菌酵母抽提物            10g
NaCl                      5g
用蒸馏水调整制1L，高压灭菌器灭菌。
(8)AB培养基(1L)
K₂HPO₄                    3g
NaH₂PO₄                   1g
NH₄Cl                     1g
MgSO₄·7H₂O               0.3g
KCl                       0.15g
CaCl₂·2H₂O               0.012g
FeSO₄·7H₂O               0.0025g
葡萄糖                    5g
琼脂                      15g
用蒸馏水调整制1L，高压灭菌器灭菌。
(9)NC-24用增殖培养基
Schneider-Drosophila培养基(有改变)
(购自Invitrogen公司)      500ml
Medium 199(10×浓度)(购自Invitrogen公司)
(含Hank’s盐类和谷氨酰胺、不含碳酸氢钠)50ml
含谷氨酰胺的Medium CMRL 1066(购自Invitrogen公司)  25ml
灭火胎牛血清              150ml
0.05M组氨酸溶液           500ml
青霉素G钾                 120,000单位
硫酸链霉素                120mg
硫酸新霉素(10,000μg/ml)  6ml
两性霉素B(Fungizone)(250μg/ml)    4ml
合计                      约1,240ml
将培养基的pH用2N HCl调节至6.50～6.60。
实施例1：RDV编码12种蛋白质在感染细胞内的动态以及病毒复制
(1)RDV对叶蝉细胞的感染
RDV对叶蝉媒介单层细胞(Vector cells in monolayer；VCM)的同时感染按Kimura(J Gen Virol 67，2119-2124(1986))的记载进行。当各盖玻片(直径15mm)上的叶蝉细胞的培养单层至80％铺满时，将细胞用含0.01M MgCl₂的0.1M组氨酸溶液(pH6.2；His-Mg)洗涤2次，接种50μl的病毒制备物。各接种液由纯化病毒制备物的10倍梯度稀释液获得。将细胞于25℃温育2小时。然后，除去接种液，将各单层用His-Mg洗涤2次，将各盖玻片用0.12～0.2ml的培养基覆盖。将接种的单层温育不同的时间，然后进行固定。
(2)蛋白质在细胞内的动态
使用上述制作的各抗体，为了鉴定作为用于抑制RDV感染的靶标的RDV节段基因组，考察了各RDV节段基因组所编码的蛋白质在RDV感染细胞内的动态。
(2.1)非结构蛋白质Pns6、Pns11和Pns12是病毒包涵体的构成要素
为了确定RDV的非结构蛋白质是否在包涵体的形成中起重要作用，利用共聚焦免疫荧光显微镜考察了感染的VCM中的RDV非结构蛋白质的细胞定位。将感染的细胞在接种18小时后进行固定，以Pns4特异性抗体、Pns6特异性抗体、Pns10特异性抗体、Pns11特异性抗体或Pns12特异性抗体作为探针。在RDV-感染细胞中，Pns11和Pns12在独立的(別個の)斑状包涵体中被检出(图1)。Pns6在感染细胞的细胞质中呈扩散分布，并浓缩于斑状包涵体(图1)。在将各种图像重叠时，能够确认3种非结构蛋白质共同定位。这表明，这些非结构蛋白质即Pns6、Pns11和Pns12时病毒包涵体的构成要素(图1)。作为对照，Pns4和Pns10分别在纤维样结构和管状结构中被检出(图1)。
为了证实本发明人等的观察，使VCM感染RDV，在接种18小时后进行固定，用电子显微镜进行了考察。在考察RDV感染的VCM的超薄切片时，可以明确：在感染细胞的细胞质中，存在颗粒状的高电子密度包涵体(直径600～850nm)(图2)。为了确定在RDV的感染细胞中形成的该高电子密度包涵体的组成，用免疫电子显微镜考察了感染的VCM中的RDV的Pns6、Pns11和Pns12的细胞内定位。可知：这些包涵体的基质(matrix)是针对Pns6的抗体、针对Pns11的抗体和针对Pns12的抗体，其被密集且均匀地免疫标记(分别为图2a、b和c)，而且该标记与免疫荧光显微镜的结果一致。
(2.2)核心蛋白质P1、P5和P7以及核心壳体蛋白质P3定位在病毒包涵体内部
为了确定病毒包涵体的基质对RDV装配复合体的形成是否为必要，将感染细胞在接种18小时后进行固定，用FITC结合P3特异性IgG和罗丹明结合Pns12特异性IgG进行染色，然后，利用共聚焦荧光显微镜进行图像化。在感染细胞中，核心壳体蛋白质P3可作为独立的斑状包涵体被检出。此外，P3在细胞质整体中呈扩散分布(图3)；Pns12定位在独立的斑状包涵体中(图3)。在将这些图像重叠时，Pns12和P3在感染细胞中以斑状包涵体的形式共定位(图3)。类似的结果对于核心蛋白质P1、P5和P7也得到了确认(图3)。
为了证实本发明人等的观察，将感染细胞在接种18小时后进行固定，使用核心壳体蛋白质P3特异性抗体、核心蛋白质P1特异性抗体、P5特异性抗体和P7特异性抗体利用免疫电子显微镜进行了考察。如图4所示，核心壳体蛋白质P3与核心蛋白质P1、P5和P7一起，分布在高电子密度包涵体的基质和核心样粒子(参照箭头)中。而且，比较少量的核心壳体和核心蛋白质分布在高电子密度包涵体的周边。本发明人等的结果提示：RDV的核心蛋白质和核心样粒子能够在高电子密度包涵体的基质中蓄积。
(2.3)外壳蛋白质P2、P8和P9定位在病毒包涵体的周边
为了确定病毒包涵体的基质对病毒复制期间RDV外壳蛋白质的蓄积是否为必要，将感染细胞在接种18小时后进行固定，用FITC结合P8特异性IgG和罗丹明结合Pns12特异性IgG进行染色，用共聚焦荧光显微镜进行了图像化。在感染细胞中，Pns12分布在独立的斑状包涵体中；可见P8为环状结构，且其分散在细胞质中(图3)。在将图像重叠时，P8明确地定位在周边，而Pns12占据了各包涵体的中心区域。此外，在图3中，这2种蛋白质如黄色部分所示，一起定位在包涵体的周边。对于外壳蛋白质P2和P9也获得了类似的结果(图3)。
为了证实本发明人等的观察，将感染细胞在接种18小时后及逆行固定，分别使用外壳蛋白质P2特异性抗体、P8特异性抗体和P9特异性抗体，利用免疫电子显微镜进行了考察。如图4所示，这3种外壳蛋白质P2、P8和P9分布在病毒样粒子蓄积的高电子密度包涵体的周边。全部这些结果提示：外壳蛋白质和病毒粒子分布在包涵体周边，而这些核心蛋白质和核心粒子定位在非结构蛋白质Pns6、Pns11和Pns12高水平蓄积的高电子密度包涵体的基质内部。
在感染过程中，细胞质中的成熟病毒粒子数显著增加，结构蛋白质能够分布在这些病毒粒子中。
(2.4)Pns12能够在体内形成病毒包涵体样结构
RDV中的3种非结构蛋白质Pns6、Pns11和Pns12似乎是RDV感染细胞中病毒包涵体的肿瘤构成要素。为了鉴定主要担负病毒包涵体基质形成任务的蛋白质，在Sf9细胞中接种了表达Pns6、Pns11或Pns12的重组杆状病毒，并温育不同时间。采用SDS-PAGE和利用各种抗体的免疫印迹进行了分析，这3种蛋白质在接种24小时后首次被检出，并且其水平增大，在接种72小时后达到最大值。对于在盖玻片上增殖的Sf9细胞，进行了Pns12的免疫荧光染色，可知：接种48小时后，细胞内形成独立的斑状包涵体(图5a)。将这些细胞的薄切片用电子显微镜进行分析，在表达Pns12的Sf9细胞的细胞质中鉴定出了与RDV感染的VCM中的高电子密度包涵体类似的大颗粒状包涵体(图5b)。通过免疫金电子显微镜可以确定：Pns12特异性地存在于这些包涵体中(图5b)。另一方面：Pns6编码杆状病毒或Pns11编码杆状病毒的感染在整个细胞质中引起各种蛋白质的扩散分布，而不形成包涵体。本发明人等的结果明确提示：即使在没有病毒复制过程的情况下，仅凭Pns12的表达，对于Sf9细胞中病毒包涵体样结构的形成也是充分的。
(2.5)RDV Pns12在体外的自聚集
为了确定Pns12是否能够自聚集形成病毒包涵体，进行了滤膜结合测定。将表达His-Pns12的E.coli细胞的裂解液用SDS-PAGE进行分级，将其蛋白质条带转印到滤膜上，将该滤膜与MBP或MBP-Pns12一起温育。如图6所示，MBP-Pns12与His-Pns12特异性结合，但不与任何E.coli来源的蛋白质结合。作为ie对照，MBP不与His-Pns12结合。因而，Pns12的分子具有相互结合的固有能力，且Pns12能够凝集来形成病毒包涵体。
(2.6)Pns12在病毒包涵体中的定位比P8更先发生
为了考察Pns12是否是在病毒包涵体定位的初期蛋白质，在RDV感染的细胞中按感染的时间经过考察了P8和Pns12在这些结构中的定位。将RDV接种于VCM，以2小时的间隔对细胞进行了固定。将细胞用FITC结合P8特异性IgG和罗丹明结合Pns12特异性IgG抗体进行染色，并用共聚焦荧光显微镜进行了考察。当Pns12在细胞质整体中分散分布在独立的斑状包涵体中时，其在接种6小时开始能够检出(图7)。P8在接种6小时后，在细胞质中呈扩散地分散分布。接种后的初期时间点上，包涵体非常多且小，但随时间推移，这些包涵体数量减少、大小增加。P8作为独立的斑状包涵体被观察到，在接种8小时后在细胞质整体中呈扩散分布。而且，P8和Pns12一起定位在斑状包涵体中。然后，在接种14小时后之前，Pns12能股在更大的包涵体中被观察到，而与此相对，P8定位在小的环状结构中，在细胞质中扩散地分散分布。将这些图像重叠，可以在包涵体的周边确认到P8。随着感染的进展，能够观察到更大的包涵体，P8集中在周边，而Pns12集中在这些包涵体的中心区域。根据这些结果，下述假设得到了证实：Pns12在病毒包涵体中的定位比P8更先发生，Pns12涉及后代病毒蓄积的病毒包涵体的凝集。
(2.7)病毒包涵体是合成病毒RNA的部位
为了确定病毒包涵体是否是合成病毒RNA的部位，将RDV感染的细胞用放线菌素D进行处理，来抑制宿主复制和转录，然后在接种10.5小时后、最初的30分钟用BrUTP进行了处理。将细胞固定后，使用抗BrdU抗体确定新合成的RNA的位置，使用Pns12特异性IgG确定病毒包涵体的位置。该分析显示：BrU标记RNA在与BrUTP一起温育30分钟的期间分布在独立的斑状包涵体(Pns12与病毒包涵体一起定位)中(图8)。该事实提示：这些包涵体是合成病毒RNA的部位。
(2.8)Pns4在RDV感染的叶蝉细胞中被磷酸化
为了确定Pns4是否能够在宿主细胞中被磷酸化，本发明人等使RDV感染叶蝉细胞，在用[³²P]-正磷酸标记后进行了免疫沉淀。如图9所示，对RDV感染的叶蝉细胞进行分析，针对Pns4的抗血清与84kDa的多肽(这是Pns4的分子量)发生了免疫反应，但在非感染细胞中没有发生(参照图9，泳道Pns4(+、-))。当本发明人等使用免疫前血清时，非标记产物在RDV感染的昆虫细胞或非感染昆虫细胞中被检出(参照泳道Pi(+、-))。而且，当本发明人等使用P9特异性抗血清作为阴性对照时，未检测到任何免疫反应(参照泳道P9)。这些结果显示：Pns4在RDV感染的叶蝉细胞中被磷酸化。
(2.9)感染的宿主植物和媒介昆虫的细胞中Pns4的表达
为了表征宿主细胞中Pns4的产生，本发明人等利用免疫电子显微镜考察了患病植物和运送病毒的叶蝉的薄切片中Pns4的位置。在RDV感染的稻植物中，Pns4位于细胞质中的各种大小和形状的无定形的高电子密度包涵体中(图10A)。作为对照，在运送病毒的叶蝉中，Pns4形成直径约10nm的微管状结构的束(图10B)。在与Pns4特异性IgG一起温育后的非感染细胞中，在与免疫前兔血清一起温育后的感染细胞中，均未检测到非特异性结合。
(2.10)非结构蛋白质Pns4是微管状结构的构成成分，聚集在病毒原质体的周边。
稻植物在接种后约14日显示出感染症状。另一方面，媒介昆虫并不显示症状，而是在获取病毒约20日开始转播病毒。因而，本发明人等的细胞学观察应该对应于病毒复制的第1阶段。因而，本发明人等使用VCM，调查了病毒复制的初期阶段的事件。本发明人等将RDV接种于VCM，以2小时的间隔固定细胞，用FITC结合Pns4特异性IgG和罗丹明结合Pns12特异性IgG进行染色，通过共聚焦荧光显微镜获得了图像(图11)。与FITC结合Pns4特异性IgG或罗丹明结合Pns12特异性IgG中的任何一个一起温育后的非感染细胞中(图11的最上部分)、与免疫前兔血清一起温育后的感染细胞中，均未检测出非特异性荧光。在感染细胞中，Pns12在接种6小时左右以独立的斑状包涵体的形式在细胞质整体中分散存在。Pns4能够以环状结构(用箭头表示)首次被检出，接种10小时后在细胞质整体中呈扩散分布；Pns12在此时间点上能够在大的包涵体中被观察到。将这些图像重叠，Pns4在包涵体的周边被发现；黄色部分为Pns4和Pns12共同定位的位置。随着感染的进展，接种14小时后，Pns4在细胞质中非常丰富，在细胞质中能够形成包围Pns12的更大包涵体的周围或定位于该包涵体周边的管状结构的束。而且然后，在接种36小时后，Pns4继续形成了在细胞质中包围Pns12的包涵体的周围、并与该包涵体相连的管状结构的束。
为了确认本发明人等的所见，本发明人等使用免疫电子显微镜考察了感染中Pns4在细胞内的部位。通过免疫电子显微镜可知：接种10～14小时后，Pns4分布在病毒原质体的周边，在感染细胞的细胞质中扩散分布(图12A)。随着感染的进展，接种14～28小时后，Pns4定位于无定形结构和管状结构的丰富的束，这些结构在病毒原质体的周边密集聚集(图12B)。该阶段中管状结构的束的出现类似于在感染的植物宿主中确认到的Pns 4的包涵体。然后，在感染28～36小时后，Pns4形成了直径约10nm的微管状结构的束(图12C)。该微管状结构的大小和外观与在RDV感染的叶蝉中观察到的相似。该微管明确地由多列电子密集微管构成(图12C)。考察微管的横断方向的切片，确认到了规则性高的结晶排列，虽然其并不完全(图12D)。本发明人等通过免疫荧光显微镜所观察到的管状结构与管状结构以及这种成束的微管状结构一致。在非感染细胞中通过与Pns4特异性IgG一起温育来与细胞结构体进行反应，在感染细胞中通过与免疫前兔血清一起温育来与病毒结构体进行反应，均未确认到。
为了详细地理解Pns4微管的外观，本发明人等将接种36小时后的感染VCM吸附于碳包覆网(炭素被覆グリツド)，将该网与Pns4特异性抗体一起温育。该抗体与各种长度的管特异性反应，这些管由规则重复的亚单位构成(图12E)，经表征其与细胞内标记实验中确认到的具有相似的直径。
(2.11)Pns4能够在体内单独形成包涵体
为了考察Pns4是否具有形成微管结构的固有能力，在Sf9细胞中接种重组杆状病毒，温育各种时间。通过用Pns4特异性抗体进行免疫印迹来对细胞进行试验，Pns4在接种24小时后首次被检出，其水平随时间而增加，在接种72小时后达到最大值。将在盖玻片上增殖的细胞进行免疫荧光染色，接种48小时后，在细胞膜的最内侧确认到Pns4的厚层，在细胞质中确认到数个Pns4基质(图13A)。
在进行免疫金电子显微镜观察时，发现：细胞质中各种形状和大小的、许多高电子密度包涵体的部位中，Pns4的更具体的位置被查明，聚集成感染细胞的表面(图13B)。形态学上，该包涵体与在RDV感染宿主细胞中观察到的无定形包涵体(图10A)相似。上述结果提示：即使在没有病毒增殖的情况下，Pns4本身的表达对Sf9细胞中包涵体簇的形成也是充分的。
(2.12)RDV的非结构蛋白质Pns10是管状结构的构成成分
在初期阶段的研究中，通过免疫荧光显微镜检测到了作为管状结构的非结构蛋白质Pns10。为了正式这种观察，对VCM接种RDV(MOI＝10)，在接种18小时后进行固定，并用电子显微镜进行了观察。本发明人等观察到了直径约85nm的管，其被从叶蝉细胞的表面突出、并扩张的细胞膜包围(图14A)。这些管包含与病毒粒子的大小相对应的直径70nm的电子密集粒子。为了鉴定该管的嗜蓝成分，本发明人等通过免疫电子显微镜观察了感染的VCM中RDV的Pns10的细胞内定位。如图14B所示，该管被抗Pns10的抗体均匀地免疫标记。管中的电子密集粒子与抗病毒粒子的抗体发生了反应(图14C)。在与Pns10特异性IgG或病毒特异性IgG一起温育后的非感染细胞中，以及在与免疫前兔血清一起温育后的感染细胞中，均未检测到非特异性标记。
(2.13)在体内为了形成管而进行的Pns10的凝集
为了考察Pns10是否具有形成管的固有能力，本发明人等对Sf9细胞接种编码Pns10的重组杆状病毒，在各种期间进行了温育。通过使用Pns10特异性抗体进行的免疫印迹来分析细胞抽提液，Pns10在接种24小时后首次被检测到，蛋白质水平在接种72小时后达到最大。在盖玻片上培养的Sf9细胞中进行Pns10的免疫荧光染色，确认到了Pns10的蓄积，可以明确在接种24小时后，细胞内形成了许多管状结构(数据未示出。参照图15A)。然后，在接种48小时后，该含有Pns10的管状结构的轮郭更加清晰，有数个管从这些非宿主昆虫细胞的表面突出(数据未示出。参照图15B)。再然后，在接种72小时后，许多管状结构从细胞表面伸出直至相当远的位置(数据未示出。参照图15C)。
在用免疫电子显微镜进行观察时，更具体地查明了Sf9细胞细胞质中的管结构中Pns10的位置(数据未示出。参照图14B)。这些管在其直径和长度的分布方面，与在野生型RDV感染的VCM中生成的管相似。因而，即使在没有病毒增殖的情况下，Pns10单独表达对Sf9细胞中管的形成也是充分的。在非感染细胞中与Pns10特异性IgG一起温育没有确认到与细胞结构之间的反应，在感染细胞中与免疫前兔血清一起温育，没有确认到与病毒结构之间的反应。
鉴于上述获得的、各RDV节段基因组所编码的蛋白质在细胞内的行为，本发明人等以RDV感染后最早发生聚集、且作为病毒合成工厂的病毒原质体的肿瘤基质——Pns12蛋白质的mRNA作为第1靶标基因，尝试了通过抑制该蛋白质的表达来制作RDV抵抗性稻。另一方面，Pns4是微管状结构的构成成分、且聚集成病毒原质体的周边，因而以Pns4mRNA为第2靶标基因，尝试了RDV抵抗性稻的制作。
实施例2：使用S4基因和S12基因来构建RNAi诱发载体
(1)S4基因和S12基因使用特异性引物组来扩增：
从RDV感染稻的叶中，按常规方法提取了总RNA。总RNA的提取使用RNeasyPlantMiniKit(Qiagen)，按附带的说明书进行。使用总RNA 1μg，按SuperScriptIII(Invitrogen)的规程说明进行逆转录反应，合成了cDNA，使用以下引物组：
对pANDA的引物组1：
引物S12-GSF1：CACCATGTTCAAGAGCGGGTCCG(SEQ ID NO：38)，和
引物S12-GSR1：TAGTGTTGTTCAACTCCGTCA(SEQ ID NO：39)；
对trigger12C的引物组2：
引物S12-GSF2：CACCATGCTAGCGGCAACGATCTC(SEQ ID NO：40)，和
引物S12-GSR2：TCACCGTTCAAGAGAAAAGGT(SEQ ID NO：41)；
对trigger 4N的引物组3：
引物S04-GSF1：CACCATGAACCAATCTCGAAGCTTTG(SEQ ID NO：42)，和
引物S04-GSR1：GTCTCCGAGTCAGACAAATTC(SEQ ID NO：43)；以及
对trigger 4C的引物组4：
引物S04-GSF2：CACCGGAACATCCTAACTTGTTCAC(SEQ ID NO：44)，和
引物S04-GSR2：CGCTTTCTCACTACCTGTCG(SEQ ID NO：45)；
分别进行PCR，得到了目的区域：pANDA(SEQ ID NO：25)、trigger12C(SEQ ID NO：26)、trigger 4N(SEQ ID NO：27)和trigger 4C(SEQ ID NO：28)的各扩增产物。
(2)使用限制酶或Gateway(Invitrogen)系统等来制作转化用RNAi二元载体：
对于上述(1)所得的各扩增产物，使用pENTR^TM/D-TOPO(注册商标)克隆试剂盒(Invitrogen cat.K2435-20)，按着生产商的说明书将其克隆到pENTR/D-TOPO(Invitrogen)中，得到了导入载体(entry vector)pENTR/trigger12N、pENTR/trigger 12C、pENTR/trigger 4N和pENTR/trigger 4C。
用该克隆载体转化试剂盒附带的E.coli菌株，同样按照生产商的说明书，在合适的条件下在含50μg/ml卡那霉素的LB平板上对转化E.coli进行选择。分离出单菌落，将其接种在含50μg/ml卡那霉素的1～2ml的LB培养基中，按常规方法使该含克隆载体的转化E.coli进行增殖。按常规方法，从转化体分离出质粒DNA，通过序列测定确认克隆了目的区域。
(3)将引起RNAi的因子克隆至转化载体中：
对于如上述地获得的质粒DNA，使用Gateway(Invitrogen)系统的LR克隆酶(克隆酶)反应系统，将其克隆到pANDA载体(奈良先端大学院大学岛本教授提供)中。简明地说，添加2μl LR反应缓冲液(5×)、100～300ng上述导入载体、300ng pANDA载体和TE，使得总容积为8μl。添加2μl的LR克隆酶酶混合物(Invitrogen cat.11791-019)并进行搅拌，25℃温育一晚。然后，添加蛋白酶K溶液1μl，37℃温育10分钟。用所得载体转化E.coli DH5α，在含50μg/ml卡那霉素和50μg/ml潮霉素的培养基中进行增殖。
实施例3：使用S1、S2、S3、S5、S6、S7、S9、S10和S11构建RNAi诱发载体
(1)S1、S2、S3、S5、S6、S7、S9、S10和S11使用特异性引物组来扩增：
从RDV感染稻的叶中，按常规方法提取了总RNA。总RNA的提取使用RNeasyPlantMiniKit(Qiagen)，按附带的说明书进行。使用总RNA 1μg，按SuperScriptIII(Invitrogen)的规程说明进行逆转录反应，设计RDV基因组S1、S2、S3、S5、S6、S7、S9、S10和S11特异性引物组，分别进行PCR，得到了trigger 1SEQ ID NO：29)、trigger 2(SEQ ID NO：30)、trigger 3(SEQ IDNO：31)、trigger 5(SEQ ID NO：32)、trigger 6(SEQ ID NO：33)、trigger 7(SEQID NO：34)、trigger 9(SEQ ID NO：35)、trigger 10(SEQ ID NO：36)和trigger11(SEQ ID NO：37)各区域。
(2)使用限制酶或Gateway(Invitrogen)系统等来制作转化用RNAi二元载体：
对于上述(1)中得到的各扩增产物，使用pENTR^TM/D-TOPO(注册商标)克隆试剂盒(Invitrogen cat.K2435-20)，按生产商的说明书将其克隆至pENTR/D-TOPO(Invitrogen)，得到了导入载体pENTR/trigger 1、pENTR/trigger 2、pENTR/trigger 3、pENTR/trigger 5、pENTR/trigger 6、pENTR/trigger 7、pENTR/trigger 9、pENTR/trigger 10和pENTR/trigger 11。
用该克隆载体转化试剂盒附带的E.coli菌株，同样按照生产商的说明书，在合适的条件下，在含50μg/ml卡那霉素的LB平板上对转化E.coli进行选择。分离出单菌落，将其接种在含50μg/ml卡那霉素的1～2ml的LB培养基中，按常规方法对该含克隆载体的转化E.coli进行增殖。按常规方法从转化体中分离质粒DNA，通过序列测定确认克隆了目的触发器(trigger)区域。
(3)将引起RNAi的因子克隆至转化载体：
对于如上述地得到的质粒DNA，使用Gateway(Invitrogen)系统的LR克隆酶反应系统，将其克隆至pANDA载体(奈良先端大学院大学岛本教授提供)。简明地说，添加2μl LR反应缓冲液(5×)、100～300ng上述导入载体、300ng pANDA载体和TE，使得总容积为8μl。添加2μl的LR克隆酶酶混合物(Invitrogen cat.11791-019)并进行搅拌，25℃温育一晚。然后，添加蛋白酶K溶液1μl，37℃温育10分钟。用所得载体转化E.coli DH5α，在含50μg/ml卡那霉素和50μg/ml潮霉素的培养基中进行增殖。
实施例4：RDV抵抗性稻的制作
(1)将上述载体通过电穿孔法等导入土壤杆菌：
使用GenePulser(BioRad)通过电穿孔法将上述各载体，按照生产商的说明书导入土壤杆菌。土壤杆菌系统使用的是EHA101(Hood，1986，J.Bacteriol.168，1291)。用实施例2中构建的表达载体通过电穿孔法转化土壤杆菌EHA101。电穿孔装置使用的是GENE PULSER(注册商标)II(BIO-RAD)，导入条件设定为200Ω、25μF、2.5kV、0.2cm电转化杯。将经过电穿孔的土壤杆菌悬浮于SOC培养基中，28℃振荡培养2小时。将该培养液涂布在含20mg/l卡那霉素、100mg/l大观霉素的LB平板培养基(10g/l胰蛋白胨、5g/l酵母抽提物、10g/l氯化钠)上，选择出增殖的转化个体。将增殖的转化土壤杆菌播种在YEP培养基上，温育一晚，在该培养液中加入等量的甘油，用旋涡混合器充分混合，以保存液溶液的形式在-80℃保存直至使用时。
(2)通过PCR等确认载体被导入土壤杆菌中；
采用碱-SDS法(参照Molecular Cloning第3版)抽提出质粒后，通过PCR确认了载体被导入土壤杆菌中。
(3)用土壤杆菌感染愈伤组织化的稻，并在确认了感染后进行再分化，来制作RDV抵抗性稻；
为了制作RDV抵抗性稻，制作了愈伤组织化的稻。简明地说，使用小型去壳机除去稻的完全成熟种子的稻壳，将100～150粒所得的种子装入50ml的一次性离心管中。将70％乙醇加入到离心管中，对种子进行数秒的灭菌，用灭菌水清洗种子。吸除灭菌水后，将40ml的2.5％次氯酸钠溶液加入到上述离心管中，用振荡机150rpm振荡20分钟来进行灭菌。除去灭菌水，用蒸馏水洗涤3次。用小镊子以25个种子/平皿将种子安置在愈伤组织诱导培养基(N6D培养基)上，将平皿周围用带子封起来。在60μmol/m²s、24小时明亮期的条件下，于30～33℃培养18～21天，从而进行了愈伤组织诱导。在愈伤组织诱导期间，每7～10日更换一次新的N6D培养基。
对于诱导3星期后的种子，用手术刀切取或用小镊子摘取其胚乳和新芽部分，仅将胚盘来源愈伤组织以16个愈伤组织/平皿安置在新的愈伤组织诱导培养基N6D培养基上，将平皿周围用带子封起来，在24小时明亮期的条件下，于25℃对愈伤组织进行3天的前培养。在开始愈伤组织的前培养的同时，从上述(1)得到的土壤杆菌保存液溶液中用灭菌的牙签采集菌体，涂布在AB培养基上。将涂布的菌体用灭菌的铂金接种环散布到整个培养基上，于28℃、遮光提条件进行3天的前培养。
用灭菌的小药匙刮取AB培养基上增殖的土壤杆菌，在10ml水中加入10mg/ml的乙酰丁香酮5μl，在该溶液中悬浮土壤杆菌，使得OD600＝0.01。将悬浮液装入灭菌平皿中。将1个平皿量的前培养好的愈伤组织装入一端用网布包覆的筒状玻璃管中，不时轻轻震荡，连同带网布的玻璃管一起在上述悬浮液中浸渍1.5～2分钟。浸渍后，将带网布的玻璃管放置在灭菌纸毛巾(ぺ一パ一タオル)上，除去多余的水分。以16个愈伤组织/平皿安置在N6CO培养基上，将平皿用带子封起来，于30～33℃遮光培养3天。
培养后，将全部愈伤组织以9个愈伤组织/平皿移植到N6SE培养基上，于30～33℃，在24小时明亮期的条件下培养14天。这期间，将愈伤组织转移到新平皿上1次。将选择出得愈伤组织转移至RE培养基，于30～33℃培养至再分化。这期间，每7～10天将愈伤组织转移到装入了新培养基的平皿上。将再分化出的新芽和根转移至HF培养基，培养2～3星期后，将其置于钵。
(4)转化体本代(T0)株中导入基因的确认
为了确认上述(3)中制作的转化体本代(T0)株中是否导入了目的基因，将从T0株采用CTAB法制备的DNA用HindIII消化后，使转化载体内的药物选择标记(潮霉素抗性)基因与探针进行了Southern杂交。T0株中的归因于导入基因转录产物的片段化的siRNA的检测，是这样进行的：抽提小分子RNA(基本上按照Hamilton，1999，Science.286，950)后，以PANDA(SEQ IDNO：25)、Trigger12N(SEQ ID NO：25)、Trigger 12C(SEQ ID NO：26)、Trigger4N(SEQ ID NO：27)、Trigger 4C(SEQ ID NO：28)为探针进行Northern杂交。如图16所示可知：目的基因导入T0株中，并且导入序列受到了切割。同样地，当以trigger 1SEQ ID NO：29)、trigger 2(SEQ ID NO：30)、trigger 3(SEQID NO：31)、trigger 5(SEQ ID NO：32)、trigger 6(SEQ ID NO：33)、trigger7(SEQ ID NO：34)、trigger 9(SEQ ID NO：35)、trigger10(SEQ ID NO：36)和trigger11(SEQ ID NO：37)作为探针进行Northern杂交时，也可以认为目的基因导入了T0株、并且导入序列受到了切割。
实施例5：转化体T1中有无导入基因与RDV感染之间的联系
(1)针对用Trigger12N(SEQ ID NO：25)、Trigger 12C(SEQ ID NO：26)、Trigger 4N(SEQ ID NO：27)、Trigger 4C(SEQ ID NO：28)转化的T1植物的RDV感染；
所得的每种T0稻各取1株，从各株回收全部的T1种子。针对稻的RDV接种如下进行：对于生长至2～3叶期的各转化体系统，相对于T1稻约10株放养约80％保存RDV病毒的斐豹蛱蝶成虫，并使得平均1株健全稻有5只以上的斐豹蛱蝶成虫，在26℃左右的温室下吸取稻的汁液约1天。图17和图18是RDV接种50日后的比较。在图17中，左侧的钵显示野生型株(左为健全株，右为RDV接种株)，右侧的钵显示Trigger12N导入转化体(RDV接种株)。图17明确显示：Trigger12N导入转化体对RDV具有抵抗性，其对RDV被赋予了抗性。在图18中，左侧的钵显示野生型株(左为健全株，右为RDV接种株)，右侧的钵显示Trigger4N导入转化体(RDV接种株)。图18明确显示：Trigger4N导入转化体对RDV具有抵抗性，其对RDV被赋予了抗性。
(2)针对用trigger 1SEQ ID NO：29)、trigger 2(SEQ ID NO：30)、trigger3(SEQ ID NO：31)、trigger 5(SEQ ID NO：32)、trigger 6(SEQ ID NO：33)、trigger 7(SEQ ID NO：34)、trigger 9(SEQ ID NO：35)、trigger 10(SEQ ID NO：36)和trigger 11(SEQ ID NO：37)转化的T1植物的RDV感染；
所得的每种T0稻各取1株，从各株回收全部的T1种子。针对稻的RDV接种如下进行：对于生长至2～3叶期的各转化体系统，相对于T1稻约10株放养约80％保存RDV病毒的斐豹蛱蝶成虫，并使得平均1株健全稻有5只以上的斐豹蛱蝶成虫，在26℃左右的温室下吸取稻的汁液约1天。比较分别用trigger 1SEQ ID NO：29)、trigger 2(SEQ ID NO：30)、trigger 3(SEQ IDNO：31)、trigger 5(SEQ ID NO：32)、trigger 6(SEQ ID NO：33)、trigger 7(SEQID NO：34)、trigger 9(SEQ ID NO：35)、trigger 10(SEQ ID NO：36)、和trigger11(SEQ ID NO：37)转化的T1植物与野生型株，结果显示：各T1植物对RDV具有抵抗性，其对RDV被赋予了抗性。
(3)感染后的用Trigger12N(SEQ ID NO：25)、Trigger12C(SEQ ID NO：26)、Trigger 4N(SEQ ID NO：27)、Trigger 4C(SEQ ID NO：28)转化的T1植物的接种测试；
用Trigger12N(SEQ ID NO：25)、Trigger 12C(SEQ ID NO：26)、Trigger4N(SEQ ID NO：27)、Trigger 4C(SEQ ID NO：28)中的任何一种转化的T1植物的抵抗性测试是如下地进行的：对(1)中接种的植物的全部植株进行评价，其中，接种后3周以内发病的个体为敏感性，接种3～8周后发病的个体为发病延迟型抵抗性，接种8周以后、甚至终生都未出现病症的个体为完全型抵抗性。其结果如以下的表1和表2以及图17B和图18B。
表1：以Pns4和Pns12为靶标的转化稻的自交子一代(T1)株的RDV接种测试

^a各取10株用于接种测试，非重组体排除在外。
表中的数值为确认为敏感性的植株的总数。
表2：以S4和S12节段基因组为靶标的转化稻的自交子一代(T1)株的RDV接种测试
  系统  总数 S(3w) D(8w)  R  trigger 4N  #04  10  0  4  6  #36  10  0  2  8  #37  10  0  3  7  #G37  10  0  4  6  trigger 4C  #22  10  0  4  6  #25  10  0  4  6  #37  10  0  5  5  #38  10  0  6  4  trigger 12N  #13  10  0  0  10  #27  10  0  0  10  #45  10  0  0  10  #61  10  0  0  10  trigger 12C  #30  10  0  0  10  #11  10  0  0  10  #40  10  0  0  10  #50  10  0  0  10  对照  #02  10  10  0  0  (空载体)  #05  10  10  0  0  #14  10  10  0  0  #29  10  10  0  0  野生型  10  10  0  0  (日本晴)
S：敏感性(接种后3星期以内发病)
D：发病延迟型抵抗性(接种后3～8周发病；D(8w)表示接种8星期后进行观察时为发病)
R：抵抗性(无病症接种后8星期)
以Pns4为靶标的转化稻获得了发病延迟型抵抗性(即，感染出现延迟)。与此相对，以Pns12为靶标的转化稻全部为RDV抵抗性(即得到了“100％完全抵抗性集团”)。在作为对照提供的野生型稻(日本晴)中，总共68株中的4株感染失败，余下的64株全部被RDV感染，病症的表达恒定(通常不到3个星期就会出现病症)，没有延迟。
以Pns4为靶标的转化稻约60％左右显示出抵抗性，约40％左右显示出发病延迟型抵抗性(即得了100％“抵抗性集团”或“60％完全抵抗性集团”)。Pns4是可能与感染后期相关的蛋白质，因而可以认为：随着病毒的复制，Pns4 mRNA被大量转录，由此，Pns4的表达抑制效果减弱，结果是得到了显示延迟型抵抗性的植株。
以Pns12为靶标的转化稻，100％的感染个体集团显示出完全抵抗性。Pns12可能是与感染的最初期病毒工厂的设置运营相关的蛋白质，因而可以认为：抑制Pns12的表达，则阻碍了病毒复制的锚地的构建，进而阻碍了病毒自身的复制，其结果是得到了显示完全型抵抗性的植株。
(4)感染后的用trigger 1SEQ ID NO：29)、trigger 2(SEQ ID NO：30)、trigger3(SEQ ID NO：31)、trigger 5(SEQ ID NO：32)、trigger 6(SEQ ID NO：33)、trigger 7(SEQ ID NO：34)、trigger 9(SEQ ID NO：35)、trigger 10(SEQ ID NO：36)和trigger11(SEQ ID NO：37)转化的T1植物的接种测试；
用trigger 1SEQ ID NO：29)、trigger 2(SEQ ID NO：30)、trigger 3(SEQ IDNO：31)、trigger 5(SEQ ID NO：32)、trigger 6(SEQ ID NO：33)、trigger 7(SEQID NO：34)、trigger 9(SEQ ID NO：35)、trigger 10(SEQ ID NO：36)和trigger11(SEQ ID NO：37)中的任意一种转化的T1植物的抵抗性测试是如下地进行的：对(1)中接种的植物的全部植株进行评价，其中，接种后3周以内发病的个体为敏感性，接种3～8周后发病的个体为发病延迟型抵抗性，接种8周以后、甚至终生都未出现病症的个体为完全型抵抗性。可以预想的结果如以下的表1.1和表2.1所示。
表1.1：以P1、P2、P3、P5、Pns6、P7、P8、P9、P10和Pns11为靶标的转化稻自交子一代(T1)株的RDV接种测试

^a各取10株用于接种测试，非重组体排除在外。
表中的数值为确认为敏感性的植株的总数。
表2.1：以各节段基因组为靶标的转化稻自交子一代(T1)株的RDV接种测试
  系统  总数 S(3w) D(8w)  R  trigger 1  10  0  2  8  trigger 2  10  10  0  0  trigger 3  10  0  2  8  trigger 5  10  0  4  6  trigger 6  10  0  3  7  trigger 7  10  0  2  8  trigger 8  10  0  4  6
  trigger 9  10  0  4  6  trigger 10  10  10  0  0  trigger 11  10  0  2  8  对照 #02  10  10  0  0  (空载体) #05  10  10  0  0 #14  10  10  0  0 #29  10  10  0  0  野生型  10  10  0  0  (日本晴)
S：敏感性(接种后3星期以内发病)
D：发病延迟型抵抗性(接种后3-8周发病；D(8w)表示接种8星期后进行观察时为发病)
R：抵抗性(无病症接种后8星期)
以P1为靶标的转化稻获得了发病延迟型抵抗性(即感染延迟)。以P2为靶标的转化稻获得了敏感性(即，全部感染)。以P3为靶标的转化稻获得了发病延迟型抵抗性(即感染延迟)。以P5为靶标的转化稻获得了发病延迟型抵抗性(即感染延迟)。以Pns6为靶标的转化稻获得了发病延迟型抵抗性(即感染延迟)。以P7为靶标的转化稻获得了发病延迟型抵抗性(即感染延迟)。以P8为靶标的转化稻获得了发病延迟型抵抗性(即感染延迟)。以P9为靶标的转化稻获得了发病延迟型抵抗性(即感染延迟)。以Pns10为靶标的转化稻获得了敏感性(即，全部感染)。以Pns11为靶标的转化稻获得了发病延迟型抵抗性(即感染延迟)。
可以认为以P1为靶标的转化稻会有约80％左右显示抵抗性，约20％左右显示发病延迟型抵抗性。P1是可能与感染中期相关的蛋白质，随着病毒复制的进行，P1mRNA被大量转录。可以认为：由此，P1的表达抑制效果减弱，其结果是，会得到显示发病延迟型抵抗性的植株。可以认为以P2为靶标的转化稻会显示100％敏感性。P2可能是植物中感染所并非必需的蛋白质，可以认为：由此，P2的表达抑制效果不影响病毒复制，其结果是，完全不会得到显示抵抗性的植株。可以认为以P3为靶标的转化稻会有约80％左右显示出抵抗性，约20％左右显示出发病延迟型抵抗性。P3是可能与感染中期相关的蛋白质，随着病毒复制的进行，P3mRNA被大量转录，可以认为：由此，P3的表达抑制效果减弱，其结果是，会会得到显示发病延迟型抵抗性的植株。可以认为以P5为靶标的转化稻会有约60％左右显示抵抗性，约40％左右显示发病延迟型抵抗性。P5是可能与感染中期相关的蛋白质，随着病毒复制的进行，P5mRNA被大量转录，可以认为：由此，P5的表达抑制效果减弱，其结果是，会得到显示发病延迟型型抵抗性的植株。可以认为以Pns6为靶标的转化稻会有约70％左右显示出抵抗性，约30％左右显示出发病延迟型抵抗性。Pns6是可能与感染初/中期相关的蛋白质，随着病毒复制的进行，Pns6mRNA被大量转录，可以认为：由此，Pns6的表达抑制效果减弱，其结果是，会得到显示发病延迟型抵抗性的植株。可以认为以P7为靶标的转化稻会有约80％左右显示出抵抗性，约20％左右显示出发病延迟型抵抗性。P7是可能与感染中期相关的蛋白质，随着病毒复制的进行，P7mRNA被大量转录。可以认为：由此，P7的表达抑制效果减弱，其结果是，会得到显示发病延迟型抵抗性的植株。可以认为以P8为靶标的转化稻会有约60％左右显示出抵抗性，约40％左右显示出发病延迟型抵抗性。P8是可能与感染中/后期相关的蛋白质，随着病毒复制的进行，P8mRNA被大量转录。可以认为：由此，P8的表达抑制效果减弱，其结果是，会得到显示发病延迟型抵抗性的植株。可以认为以P9为靶标的转化稻会有约60％左右显示出抵抗性，约40％左右显示出发病延迟型抵抗性。P9是可能与感染后期相关的蛋白质，随着病毒复制的进行，P9mRNA被大量转录。可以认为：由此，P9的表达抑制效果减弱，其结果是，会得到显示发病延迟型抵抗性的植株。可以认为以Pns10为靶标的转化稻会显示100％敏感性。Pns10可能是植物中感染所并非必需的蛋白质，因而可以认为：Pns10的表达抑制效果不影响病毒复制，其结果是，完全不会得到显示抵抗性的植株。可以认为以Pns11为靶标的转化稻会有约80％左右显示出抵抗性，约20％左右显示出发病延迟型抵抗性。Pns11是可能与感染初/中期相关的蛋白质，随着病毒复制的进行，Pns11mRNA被大量转录。可以认为：由此，Pns11的表达抑制效果减弱，其结果是，会得到显示发病延迟型抵抗性的植株。
(5)S4和S12导入基因的有无与RDV抵抗性之间的联系；
关于T1植物抵抗性的有无与导入基因的有无之间的联系，采用CTAB法从T1植物制备DNA，以该DNA为模板，以植物转化载体内的GUS序列为引物，进行了PCR。图17B和图18B可知，对于存在导入基因的株，确认到了抵抗性和发病延迟型抵抗性，而不存在导入基因的株，全部为敏感性。
由上述结果可知：本发明的转化稻显示出针对RDV的发病延迟型抵抗性或抵抗性。
(6)S1、S2、S3、S5、S6、S7、S8、S9、S10和S11导入基因的有无与RDV抵抗性之间的联系；
关于T1植物抵抗性的有无与各导入基因的有无之间的联系，采用CTAB法从T1植物制备DNA，以该DNA为模板，以植物转化载体内的GUS序列为引物，进行PCR。可以认为：对于存在导入基因的株，会确认到抵抗性和发病延迟型抵抗性，而不存在导入基因的株，会全部为敏感性。
(7)制作的RDV抵抗性稻的后代T3植物中的接种测试；
为了确认后代植物中是否还会继续有RDV抵抗性，从T1植物获得T2种子，并使T2植物生长。从T2植物获得T3种子，使之生长至9叶期，得到测试用T3植物。对于所得T3植物，像上述(3)那样，对于各转化体系统，相对于T1稻约10株放养约80％保存RDV病毒的斐豹蛱蝶成虫，并使得平均1株健全稻有5只以上的斐豹蛱蝶成虫，在26℃左右的温室下吸取稻的汁液约1天。如果像上述(3)那样进行接种测试，则能够确认：在T3植物中，RDV抵抗性或发病延迟型抵抗性得到延续。
由上述结果可知：本发明的转化稻显示对RDV的发病延迟型抵抗性或抵抗性。
(8)制作的RDV抵抗性稻的后代T3植物中的接种测试；
为了确认后代植物中是否会延续RDV抵抗性，从T1植物获得T2种子，并使T2植物生长。从T2植物获得T3种子，使之生长至9叶期，得到测试用T3植物。对于所得T3植物，像上述(3)那样，对于各转化体系统，相对于T1稻约10株放养约80％保存RDV病毒的斐豹蛱蝶成虫，并使得平均1株健全稻有5只以上的斐豹蛱蝶成虫，在26℃左右的温室下吸取稻的汁液约1天。如果像上述(3)那样进行接种测试，则能够确认：在T3植物中，RDV抵抗性或发病延迟型抵抗性得到延续。
实施例6：RDV的多蛋白质(Pns4和Pns12)表达抑制稻的制作
(1)RNAi诱发载体的构建；
以上述实施例2(1)中所得的PCR扩增产物trigger 12N和trigger 4N作为模板，使用以下的引物组：
对于trigger12N2的引物组5：
引物S12-GSF1：CACCATGTTCAAGAGCGGGTCCG(SEQ ID NO：38)，和
引物S4S12-GSR1：CAAAGCTTCGAGATTGGTTCATTAGTGTTGTTCAACTCCGTCA(SEQ IDNO：47)；和
对于trigger 4N2的引物组6：
引物S12S04-GSF1：TGACGGAGTTGAACAACACTAATGAACCAATCTCGAAGCTTTG(SEQID NO：48)，和
引物S04-GSR1：GTCTCCGAGTCAGACAAATTC(SEQ ID NO：43)分别进行PCR，得到trigger 12N2(SEQ ID NO：49)、trigger 4N2(SEQ ID NO：50)。将这些PCR产物混合，使用上述引物S12-GSF1(SEQ ID NO：38)和引物S04-GSR1(SEQ ID NO：43)进行融合PCR，得到trigger 12N4N(SEQ IDNO：51)的扩增产物。
(2)使用限制酶或Gateway(Invitrogen)系统等来制作转化用RNAi二元载体；
对于(1)中所得的扩增产物，像上述实施例2(2)记载的那样，使用pENTR^TM/D-TOPO(注册商标)克隆试剂盒(Invitrogen cat.K2435-20)，按生产商的说明书将其克隆到pENTR/D-TOPO(Invitrogen)中，得到导入载体pENTR/trigger 12N4N。
(3)将引起RNAi的因子克隆至转化载体；
对于(2)中制作的引起RNAi的各因子(trigger 12N4N)，像上述实施例2(3)所记载的那样，使用Gateway系统的LR克隆酶反应系(Invitrogen)，将其克隆至pANDA载体(奈良先端大学院大学岛本教授提供)。
(4)将上述载体通过电穿孔法等导入土壤杆菌；
对于上述各载体，像上述实施例4(1)所示的那样，采用电穿孔法，使用GenePulser(BioRad)，按照生产商的说明书将其导入土壤杆菌。像上述实施例4(2)记载的那样，采用碱SDS法(参照Molecular Cloning第3版)抽提质粒后，通过PCR确认了载体导入土壤杆菌中。
(5)用土壤杆菌感染愈伤组织化的稻，确认感染后，进行再分化，来制作RDV抵抗性稻；
为了制作RDV抵抗性稻，像实施例4(3)的记载那样，制作愈伤组织化的稻。开始愈伤组织的前培养，与此同时从上述(4)中所得的土壤杆菌的保存液溶液用灭菌牙签采集菌体，进行前培养。
对于前培养的愈伤组织，将其浸渍在前培养的上述土壤杆菌的悬浮液中，并进行感染。然后，将愈伤组织以16个愈伤组织/平皿安置在N6CO培养基上，将平皿用带子密封，于30～33℃遮光培养3天。培养后，将全部愈伤组织以9个愈伤组织/平皿移植到N6SE培养基上，于30～33℃，在24小时明亮期的条件下，培养14天，将选择出得愈伤组织转移至RE培养基上，于30～33℃培养至再分化。将再分化的新芽和根转移至HF培养基上，培养2～3星期后，转移到钵上。
(6)转化体本代(T0)株中导入基因的确认
将从T0株采用CTAB法制备的DNA用HindIII消化后，使转化载体内的药物选择标记(潮霉素抗性)基因与探针进行Southern杂交。T0株中的归因于导入基因转录产物的片段化的siRNA的检测，可以这样进行：抽提小分子RNA(基本上按照Hamilton，1999，Science.286，950)后，以Trigger 12N4N为探针进行Northern杂交。
实施例7：转化体T1中其它RDV株感染与RNAi诱导的确认
(1)针对T1植物的RDV秋田株感染；
使用实施例2所得的载体，像实施例4记载的那样制作RDV抵抗性稻，对于各种T0稻，各取1株。从各株回收全部的T1种子。针对稻的RDV秋田株、Chinese株、Kunming株和Yunnan株的接种是如下进行：对于各转化体系统，相对于T1稻约10株放养约80％保存RDV秋田株的斐豹蛱蝶成虫，并使得平均1株健全稻有5只以上的斐豹蛱蝶成虫，在26℃左右的温室下吸取稻的汁液约1天。通过进行这些实验，能够确认：基于O株的表达抑制剂不仅能够赋予针对RDV的O株感染的抵抗性，也能够赋予针对O株以外的RDV株的感染的抵抗性。
实施例8：O株以外的RDV的蛋白质(Pns12)的表达抑制稻的制作和RNAi诱导的确认
(秋田株)
从RDV秋田株感染稻的叶中，按实施例2所记载的那样，使用登录号S72085(SEQ ID NO：23)作为序列信息，按照常规方法抽提总RNA，进行逆转录反应，合成cDNA，使用目的区域(Trigger12N(Akita))特异性引物组进行PCR，得到目的区域的扩增产物。
像上述实施例2(2)所记载的那样，对于上述得到的扩增产物，使用pENTR^TM/D-TOPO(注册商标)克隆试剂盒(Invitrogen cat.K2435-20)，按照生产商的说明书，将其克隆到pENTR/D-TOPO(Invitrogen)，得到导入载体pENTR/trigger 12N(Akita)。
对于该克隆载体，同样地，像上述实施例2(2)所记载的那样，用其转化E.coli株，将转化E.coli在含50μg/ml卡那霉素的LB平板上进行选择。按照常规方法分离出单菌落，对该含克隆载体的转化E.coli进行增殖。从转化体分离质粒DNA，通过序列测定确认目的区域被克隆。
对上述所得的质粒DNA，像上述实施例2所记载的那样，使用Gateway系统的LR克隆酶反应系(Invitrogen)，将其克隆至pANDA载体(奈良先端大学院大学岛本教授提供)。
像实施例4记载的那样制作RDV抵抗性稻，对于各种T0稻，各取1株。从各株回收全部的T1种子。针对稻的O株、RDV秋田株、Chinese株、Kunming株和Yunnan株的接种如下进行：对于各转化体系统，相对于T1稻约10株放养约80％保存RDV秋田株的斐豹蛱蝶成虫，并使得平均1株健全稻有5只以上的斐豹蛱蝶成虫，在26℃左右的温室下吸取稻的汁液约1天。通过进行这些实验，能够确认：包含基于秋田株的信息设计的Trigger12N(Akita)的表达抑制剂，不仅能够赋予针对RDV的秋田株感染的抵抗性，也能够赋予针对秋田株以外的RDV株的感染的抵抗性。
(其它株)
对于Chinese株、Kunming株和Yunnan株，进行与基于秋田株的上述实验相同的实验，(对于Chinese株参考登录号NC_003768和登录号U36569、对于Kunming株参考登录号AY340238、对于Yunnan株参考登录号AY589576，来制作)。通过进行这些实验，能够确认：包含基于Chinese株、Kunming株和Yunnan株的信息设计的Trigger 12N的表达抑制剂，不仅能够赋予对各种RDV所来源的株的感染的抵抗性，还能够赋予对各种RDV所来源的株以外的株的感染的抵抗性。
如以上所述，使用本发明的优选实施方式示例出了本发明，但应该理解的是：本发明的范围只能用权利要求书来解释。在本说明书中引用的专利、专利申请和文献，与本身具体地记载在本说明书中的内容一样，其内容全部引用作为本说明书的参考。
工业实用性
通过发明，可以提供显示更高无病症水平的高抵抗性、赋予了抑制或稳定的抵抗性的抗水稻矮缩病毒型稻的制作方法和抵抗性品种。
序列表
<110>独立行政法人  农业·食品产业技术总和研究机构(Incorporated Administrative Agency National
Agriculture and Food Research Organization)
<120>利用了RNA干扰法的水稻矮缩病毒抵抗性稻的制作方法
<130>NG007-1PCT
<150>PCT/JP2007/065972
<151>2007-08-06
<160>54
<170>PatentIn version 3.4
<210>1
<211>4423
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒(Rice dwarf virus)
<220>
<221>CDS
<222>(36)..(4370)
<400>1
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Asn Ile Gln Lys Val Ser Glu Ala Tyr Asp Leu Glu Leu Lys Ile Met
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                555                 560                 565
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Tyr Lys Val Arg Thr Thr Ser Lys Ser Ala Phe Val Asn Ala Met Gly
            570                 575                 580
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Ser Gly Ile Leu Asp Val Asn Pro Val Ser Asn Glu Pro Met Met Leu
        585                 590                 595
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Thr Asp Tyr Leu Leu Thr Gln Thr Pro Glu Thr Arg Ala Asn Leu Glu
    600                 605                 610
gcg gct ata gat agc gga tct ata tcc gac tct gag tta atg cgc ata    1925
Ala Ala Ile Asp Ser Gly Ser Ile Ser Asp Ser Glu Leu Met Arg Ile
615                 620                 625                 630
tta ggg cag aac agc atc ggc tca cgt tct acc aca gct tgg aga ccg    1973
Leu Gly Gln Asn Ser Ile Gly Ser Arg Ser Thr Thr Ala Trp Arg Pro
                635                 640                 645
gta cga ccg att tac ata aat gtg tta caa gca cat ttg gcg cag gcc    2021
Val Arg Pro Ile Tyr Ile Asn Val Leu Gln Ala His Leu Ala Gln Ala
            650                 655                 660
ttc atc atc ggg cct cac ata aat gca act gtc aat cag cat gaa tcc    2069
Phe Ile Ile Gly Pro His Ile Asn Ala Thr Val Asn Gln His Glu Ser
        665                 670                 675
caa cct aca tcc ctt tgg ttc act ggg gat gat ttg ggg gtt ggt ttc    2117
Gln Pro Thr Ser Leu Trp Phe Thr Gly Asp Asp Leu Gly Val Gly Phe
    680                 685                 690
gct aca ctg tat caa aac gga acc gcg gat ata atc gct cca gct atc    2165
Ala Thr Leu Tyr Gln Asn Gly Thr Ala Asp Ile Ile Ala Pro Ala Ile
695                 700                 705                 710
gaa gcg tca tct act ggt aaa gcg ctc agt gtt ctc gct gat tgc tca    2213
Glu Ala Ser Ser Thr Gly Lys Ala Leu Ser Val Leu Ala Asp Cys Ser
                715                 720                 725
tcc tgg gat cag acg ttt cta aca gcg acg att att ccg tac tac aat    2261
Ser Trp Asp Gln Thr Phe Leu Thr Ala Thr Ile Ile Pro Tyr Tyr Asn
            730                 735                 740
gga ata aaa aaa gct ttg cta gaa tat caa caa gcg gat atg cgc aac    2309
Gly Ile Lys Lys Ala Leu Leu Glu Tyr Gln Gln Ala Asp Met Arg Asn
        745                 750                 755
ttc tat atg ata gat agt agc aga act ggc gtg cca ggg atg aaa ctg    2357
Phe Tyr Met Ile Asp Ser Ser Arg Thr Gly Val Pro Gly Met Lys Leu
    760                 765                 770
tct gaa ata gta gat tgg ttt aac agt ttt caa acc aag cgg ata ttc    2405
Ser Glu Ile Val Asp Trp Phe Asn Ser Phe Gln Thr Lys Arg Ile Phe
775                 780                 785                 790
aat gcc tcc tat ttg aaa gaa agg cat tca ttt gtg gtt aaa tat atg    2453
Asn Ala Ser Tyr Leu Lys Glu Arg His Ser Phe Val Val Lys Tyr Met
                795                 800                 805
tgg tcg gga cga ctg gac act ttc ttt atg aat tct gtt cag aat gca    2501
Trp Ser Gly Arg Leu Asp Thr Phe Phe Met Asn Ser Val Gln Asn Ala
            810                 815                 820
ttg atc acg agg aga ata gct gaa gaa gta tcc ttg aag gtg tca aac    2549
Leu Ile Thr Arg Arg Ile Ala Glu Glu Val Ser Leu Lys Val Ser Asn
        825                 830                 835
act ggt ttg tcc tgg ttt cag gtt gct ggc gat gac gca atc atg gta    2597
Thr Gly Leu Ser Trp Phe Gln Val Ala Gly Asp Asp Ala Ile Met Val
    840                 845                 850
tat gat gga tca tca atc tcc aca act gag caa gtg acc aga gtt aat    2645
Tyr Asp Gly Ser Ser Ile Ser Thr Thr Glu Gln Val Thr Arg Val Asn
855                 860                 865                 870
gaa atc aca gtt cgt aat tat gag gag tcg aat cac ata att aat ccg    2693
Glu Ile Thr Val Arg Asn Tyr Glu Glu Ser Asn His Ile Ile Asn Pro
                875                 880                 885
caa aaa aca gtg att tca cat att tct ggt gaa tat gct aaa ata tat    2741
Gln Lys Thr Val Ile Ser His Ile Ser Gly Glu Tyr Ala Lys Ile Tyr
            890                 895                 900
tat tat gca gga atg cat ttt cgc gat cct tca att cag ctg cat gaa    2789
Tyr Tyr Ala Gly Met His Phe Arg Asp Pro Ser Ile Gln Leu His Glu
        905                 910                 915
tcc gaa aag gat tct gga gca agt gac gtc acc gag tct cta cgg ggg    2837
Ser Glu Lys Asp Ser Gly Ala Ser Asp Val Thr Glu Ser Leu Arg Gly
    920                 925                 930
ttc ggt cag gtc ata tat gaa tat aac aaa aga gcg att ggt acc cta    2885
Phe Gly Gln Val Ile Tyr Glu Tyr Asn Lys Arg Ala Ile Gly Thr Leu
935                 940                 945                 950
cgc gtg aac gct tta tat ggc agg cta ata gcc ggg cta gcg tat agt    2933
Arg Val Asn Ala Leu Tyr Gly Arg Leu Ile Ala Gly Leu Ala Tyr Ser
                955                 960                 965
gta aac gtc cgc agg tat gac gct tca aaa aga aca tat gcg aat atg    2981
Val Asn Val Arg Arg Tyr Asp Ala Ser Lys Arg Thr Tyr Ala Asn Met
            970                 975                 980
aaa tac tat ccg cca cca acc tca gta att gct cca gcc gca ttt aag    3029
Lys Tyr Tyr Pro Pro Pro Thr Ser Val Ile Ala Pro Ala Ala Phe Lys
        985                 990                 995
gga gga  ttg gga ttg tca ttt  act ggg tta tcg ctg  aat gag gtg     3074
Gly Gly  Leu Gly Leu Ser Phe  Thr Gly Leu Ser Leu  Asn Glu Val
    1000                 1005                 1010
cta ttt  att aaa atg cat ctc  cac gag gcg gta tct  cag ggt ctt     3119
Leu Phe  Ile Lys Met His Leu  His Glu Ala Val Ser  Gln Gly Leu
    1015                 1020                 1025
cac gtg  att tca atg att tca  ttt gaa gcc aac gaa  gtc gtt tcg     3164
His Val  Ile Ser Met Ile Ser  Phe Glu Ala Asn Glu  Val Val Ser
    1030                 1035                 1040
aac tct  ctg tcc gcg tat tat  ctt aag gac cag aaa  gat tta ctg    3209
Asn Ser  Leu Ser Ala Tyr Tyr  Leu Lys Asp Gln Lys  Asp Leu Leu
    1045                 1050                 1055
cgt gac  atg aag tta ggc aag  cat ctt gaa aaa gtc  aaa ggt ata    3254
Arg Asp  Met Lys Leu Gly Lys  His Leu Glu Lys Val  Lys Gly Ile
    1060                 1065                 1070
tcc ttt  aag tcc tct gat tta  gcc ttt tcg ggt agt  gat ttc tcg    3299
Ser Phe  Lys Ser Ser Asp Leu  Ala Phe Ser Gly Ser  Asp Phe Ser
    1075                 1080                 1085
caa ggg  ctg aac cta aag agg  gaa tct att gat aaa  gtg aag ctc    3344
Gln Gly  Leu Asn Leu Lys Arg  Glu Ser Ile Asp Lys  Val Lys Leu
    1090                 1095                 1100
gaa gtg  tct cgt aaa tct atc  cgt gat ttg cgc tct  tcg ggt att    3389
Glu Val  Ser Arg Lys Ser Ile  Arg Asp Leu Arg Ser  Ser Gly Ile
    1105                 1110                 1115
agt gtg  cca tca acg cat gca  tat gaa aat ttg cca  tat gca tca    3434
Ser Val  Pro Ser Thr His Ala  Tyr Glu Asn Leu Pro  Tyr Ala Ser
    1120                 1125                 1130
ttg cat  cag tct ttc aaa agt  cta aaa gtg gat aga  gac act tca    3479
Leu His  Gln Ser Phe Lys Ser  Leu Lys Val Asp Arg  Asp Thr Ser
    1135                 1140                 1145
aaa ttt  acg aat gaa cgg tta  ctg gtt tca ctc ctc  gag tat aaa    3524
Lys Phe  Thr Asn Glu Arg Leu  Leu Val Ser Leu Leu  Glu Tyr Lys
    1150                 1155                 1160
tca gac  att ccg aga gta agt  gtc acc tcg cag tat  cca gtt tat    3569
Ser Asp  Ile Pro Arg Val Ser  Val Thr Ser Gln Tyr  Pro Val Tyr
    1165                 1170                 1175
gac ttg  atc aac atc tca aaa  gtt gat gag tta aat  gtc aga tct    3614
Asp Leu  Ile Asn Ile Ser Lys  Val Asp Glu Leu Asn  Val Arg Ser
    1180                 1185                 1190
ggt gga  cca gtc agg ttc atc  tct act cca ata gaa  ggc aaa cta    3659
Gly Gly  Pro Val Arg Phe Ile  Ser Thr Pro Ile Glu  Gly Lys Leu
    1195                 1200                 1205
ttg gaa  gaa aat att ggt acc  cgt caa ggg gtt cag  ttt aaa aat    3704
Leu Glu  Glu Asn Ile Gly Thr  Arg Gln Gly Val Gln  Phe Lys Asn
    1210                 1215                 1220
cga ggg  tac gga gga tct cag  gaa gta tta cac ttc  ata aga tct    3749
Arg Gly  Tyr Gly Gly Ser Gln  Glu Val Leu His Phe  Ile Arg Ser
    1225                 1230                 1235
aac ggc  ttg gtg ata act gaa  caa gct ctg att gac  tta atc atc    3794
Asn Gly  Leu Val Ile Thr Glu  Gln Ala Leu Ile Asp  Leu Ile Ile
    1240                 1245                 1250
aag tca  gga gta ctg tta atg  ata aat cca caa cgt  ggg ttg atc    3839
Lys Ser  Gly Val Leu Leu Met  Ile Asn Pro Gln Arg  Gly Leu Ile
    1255                 1260                 1265
gac ctt  ttt cag tct ctt tct  gga gat acc gct tca  tct atg cat    3884
Asp Leu  Phe Gln Ser Leu Ser  Gly Asp Thr Ala Ser  Ser Met His
    1270                 1275                 1280
cta gcg  aac ttc ttc atg gct  gaa aaa ccg cac tgg  gaa gat aac    3929
Leu Ala  Asn Phe Phe Met Ala  Glu Lys Pro His Trp  Glu Asp Asn
    1285                 1290                 1295
gcc ata  tct ctc acc att gcg  gga tcg ttg ctt gag  aac tgc gat    3974
Ala Ile  Ser Leu Thr Ile Ala  Gly Ser Leu Leu Glu  Asn Cys Asp
    1300                 1305                 1310
agt aga  att gag aac gta aag  aat ttt gtt agt gtc  ctt gct act 4019
Ser Arg  Ile Glu Asn Val Lys  Asn Phe Val Ser Val  Leu Ala Thr
    1315                 1320                 1325
ggc atg  caa aaa gac cta caa  aga atg ttc tat tac  gtc gga ttt 4064
Gly Met  Gln Lys Asp Leu Gln  Arg Met Phe Tyr Tyr  Val Gly Phe
    1330                 1335                 1340
gtc tac  tat gca cag aga ctt  ata tgg tct ggt ggc  cac tcc agt 4109
Val Tyr  Tyr Ala Gln Arg Leu  Ile Trp Ser Gly Gly  His Ser Ser
    1345                 1350                 1355
aaa ata  ttc gtc tct att gat  gag gat aag ctc gct  gac ttc ctt 4154
Lys Ile  Phe Val Ser Ile Asp  Glu Asp Lys Leu Ala  Asp Phe Leu
    1360                 1365                 1370
aga gga  tct aaa cca atc act  cgg agg agg aaa gcc  atg gct gga 4199
Arg Gly  Ser Lys Pro Ile Thr  Arg Arg Arg Lys Ala  Met Ala Gly
    1375                 1380                 1385
act aag  cgt gaa ccg atc aat  tta agc gct aat ttc  agt tat gaa 4244
Thr Lys  Arg Glu Pro Ile Asn  Leu Ser Ala Asn Phe  Ser Tyr Glu
    1390                 1395                 1400
ata tct  gaa ccg gat agg gag  att agt gag tac gac  ccg cta gtc 4289
Ile Ser  Glu Pro Asp Arg Glu  Ile Ser Glu Tyr Asp  Pro Leu Val
    1405                 1410                 1415
tta tgt  cat ccc cta tca atg  cca ttt ttt ggt aat  tgg cag gag 4334
Leu Cys  His Pro Leu Ser Met  Pro Phe Phe Gly Asn  Trp Gln Glu
    1420                 1425                 1430
aaa tac  tct gtg atg cag agc  gac gag caa atg tga ttgatccgcc   4380
Lys Tyr  Ser Val Met Gln Ser  Asp Glu Gln Met
    1435                 1440
aggctatccg ttgggatagg ttaatcagcc gatcatatat gat                4423
<210>2
<211>1444
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>2
Met Asp Leu Ala Arg Ser Asp Ile Ile Pro His Leu Leu Cys Leu Phe
1               5                   10                  15
Gln Glu Ile Ile Gln Ala Asn Ile Gln Lys Val Ser Glu Ala Tyr Asp
            20                  25                  30
Leu Glu Leu Lys Ile Met Asn Ile Leu Thr Leu Trp Arg Asn Gly Ser
        35                  40                  45
Asp Asn Leu Ile Ser Asp Asn Asp Asp Tyr Met Lys Lys Gly Leu Phe
    50                  55                  60
Phe Ser Arg Ser Asn Asp Pro Leu Ala Leu Gln Ala Arg Tyr Ala Gln
65                  70                  75                  80
Met Tyr Asp Asp Leu Phe Lys Leu Asn Asn Tyr Lys Val Pro Asp Asp
                85                  90                  95
Val Val Arg Lys His Asp Thr Lys Ile Leu Asp Ile Ile Leu Lys Glu
            100                 105                 110
Ser Ser Val Pro Phe Trp Tyr Asp Ile Ser Asp Asp Glu Ala His Glu
        115                 120                 125
Ser Met Leu Pro Glu Phe Arg Leu Gln Asp Ile His Glu Phe Arg Leu
    130                 135                 140
Asn Leu Lys Arg Val Ala Val Val Pro Asp Glu Ser Glu Glu Ile Gln
145                 150                 155                 160
Met Asp Glu Ser Gln Ser Asp Lys Arg Arg Arg Lys Lys Arg Met Glu
                165                 170                 175
Lys Ser Arg Pro Val Trp Leu Ser Gly Ser Glu Asn Asp Arg Arg Ile
            180                 185                 190
Glu Leu Asn Asp Ser Leu Lys Pro Ser Gln Lys Phe Glu Thr Lys Leu
        195                 200                 205
Ser Ser Tyr Leu Leu Asn Arg Leu Met Asn Glu Met Asn Pro His Tyr
    210                 215                 220
Cys Gly His Pro Leu Pro Ala Leu Phe Val Thr Leu Ile Met Leu Lys
225                 230                 235                 240
Ala Tyr Ser Leu Lys Asn Lys Phe Phe Ser Tyr Gly Ile Arg Tyr Met
                245                 250                 255
Glu Leu Val Cys Asn Glu Ile Gly Gly Pro Asp Leu Asn Thr Arg Thr
            260                 265                 270
Phe Pro Val Leu Phe Gly Ser Asp Gly Ser Phe Val Gly Thr Arg Val
        275                 280                 285
Tyr Ser His Tyr Pro Ile Lys Leu Arg Met Ile Leu Asn Asp Leu Thr
    290                 295                 300
Tyr Leu Leu Thr Tyr Ser Asp Leu His Lys Phe Gln Glu Phe Glu Leu
305                 310                 315                 320
Asp Val Asn Asp Glu Val Leu Leu His Met Leu His Ser Pro Asn Asp
                325                 330                 335
Gly Arg Gln Leu Lys Lys Ala Val Thr Arg Leu Asn Leu Tyr Tyr Gly
            340                 345                 350
Leu Lys Phe Asn Pro Lys Thr Thr Asp Cys Gly Val Val Asn Gly Met
        355                 360                 365
Asp Phe Thr His Lys His Pro Ile Thr Lys Thr Ala Asp Phe Thr Ser
    370                 375                 380
Pro Val Leu Pro Met Thr Asn Ser Phe Asn Lys Ala Glu Ile Cys Tyr
385                 390                 395                 400
Gly His Ser Ser Lys Ile Leu Asn Arg Ala Val Phe Thr Asp Thr Val
                405                 410                 415
Arg Gly Tyr Ile Arg Glu Asp Leu Lys Asn Val Ala Asp Leu Asp Leu
            420                 425                 430
Pro Lys Leu His Glu His Val Ser Lys Leu Val Asp Met Arg Val Asn
        435                 440                 445
Tyr Thr Ile Ile Tyr Asp Leu Met Phe Leu Arg Val Met Leu Asn Leu
    450                 455                 460
Gly Gly Tyr Ser Arg Ser Asn Gln Ile Thr Asp Phe Arg Lys Thr Ile
465                 470                 475                 480
Asp Glu Ile Thr Lys Met Asn Glu Asp Phe Leu Ser Gly Ala Asp Pro
                485                 490                 495
Glu Lys Asn Ile Asp Ile Leu Asn Ala Trp Met Ala Pro Thr Met Glu
            500                 505                 510
Asp Cys Gly Tyr Arg Leu Thr Lys Ser Ile Leu Phe Gly Lys Phe Arg
        515                 520                 525
Lys Ala Lys Tyr Pro Ser Asp Leu Glu Ala Lys Ser Asn Ile Asp Tyr
    530                 535                 540
Tyr Val Thr Ala Arg Ser Ala Gly Ile Gly Asn Leu Arg Ile Ser Ile
545                 550                 555                 560
Glu Thr Asp Lys Arg Lys Tyr Lys Val Arg Thr Thr Ser Lys Ser Ala
                565                 570                 575
Phe Val Asn Ala Met Gly Ser Gly Ile Leu Asp Val Asn Pro Val Ser
            580                 585                 590
Asn Glu Pro Met Met Leu Thr Asp Tyr Leu Leu Thr Gln Thr Pro Glu
        595                 600                 605
Thr Arg Ala Asn Leu Glu Ala Ala Ile Asp Ser Gly Ser Ile Ser Asp
    610                 615                 620
Ser Glu Leu Met Arg Ile Leu Gly Gln Asn Ser Ile Gly Ser Arg Ser
625                 630                 635                 640
Thr Thr Ala Trp Arg Pro Val Arg Pro Ile Tyr Ile Asn Val Leu Gln
                645                 650                 655
Ala His Leu Ala Gln Ala Phe Ile Ile Gly Pro His Ile Asn Ala Thr
            660                 665                 670
Val Asn Gln His Glu Ser Gln Pro Thr Ser Leu Trp Phe Thr Gly Asp
        675                 680                 685
Asp Leu Gly Val Gly Phe Ala Thr Leu Tyr Gln Asn Gly Thr Ala Asp
    690                 695                 700
Ile Ile Ala Pro Ala Ile Glu Ala Ser Ser Thr Gly Lys Ala Leu Ser
705                 710                 715                 720
Val Leu Ala Asp Cys Ser Ser Trp Asp Gln Thr Phe Leu Thr Ala Thr
                725                 730                 735
Ile Ile Pro Tyr Tyr Asn Gly Ile Lys Lys Ala Leu Leu Glu Tyr Gln
            740                 745                 750
Gln Ala Asp Met Arg Asn Phe Tyr Met Ile Asp Ser Ser Arg Thr Gly
        755                 760                 765
Val Pro Gly Met Lys Leu Ser Glu Ile Val Asp Trp Phe Asn Ser Phe
    770                 775                 780
Gln Thr Lys Arg Ile Phe Asn Ala Ser Tyr Leu Lys Glu Arg His Ser
785                 790                 795                 800
Phe Val Val Lys Tyr Met Trp Ser Gly Arg Leu Asp Thr Phe Phe Met
                805                 810                 815
Asn Ser Val Gln Asn Ala Leu Ile Thr Arg Arg Ile Ala Glu Glu Val
            820                 825                 830
Ser Leu Lys Val Ser Asn Thr Gly Leu Ser Trp Phe Gln Val Ala Gly
        835                 840                 845
Asp Asp Ala Ile Met Val Tyr Asp Gly Ser Ser Ile Ser Thr Thr Glu
    850                 855                 860
Gln Val Thr Arg Val Asn Glu Ile Thr Val Arg Asn Tyr Glu Glu Ser
865                 870                 875                 880
Asn His Ile Ile Asn Pro Gln Lys Thr Val Ile Ser His Ile Ser Gly
                885                 890                 895
Glu Tyr Ala Lys Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Met His Phe Arg Asp Pro
            900                 905                 910
Ser Ile Gln Leu His Glu Ser Glu Lys Asp Ser Gly Ala Ser Asp Val
        915                 920                 925
Thr Glu Ser Leu Arg Gly Phe Gly Gln Val Ile Tyr Glu Tyr Asn Lys
    930                 935                 940
Arg Ala Ile Gly Thr Leu Arg Val Asn Ala Leu Tyr Gly Arg Leu Ile
945                 950                 955                 960
Ala Gly Leu Ala Tyr Ser Val Asn Val Arg Arg Tyr Asp Ala Ser Lys
                965                 970                 975
Arg Thr Tyr Ala Asn Met Lys Tyr Tyr Pro Pro Pro Thr Ser Val Ile
            980                 985                 990
Ala Pro Ala Ala Phe Lys Gly Gly  Leu Gly Leu Ser Phe  Thr Gly Leu
        995                 1000                 1005
Ser Leu  Asn Glu Val Leu Phe  Ile Lys Met His Leu  His Glu Ala
    1010                 1015                 1020
Val Ser  Gln Gly Leu His Val  Ile Ser Met Ile Ser  Phe Glu Ala
    1025                 1030                 1035
Asn Glu  Val Val Ser Asn Ser  Leu Ser Ala Tyr Tyr  Leu Lys Asp
    1040                 1045                 1050
Gln Lys  Asp Leu Leu Arg Asp  Met Lys Leu Gly Lys  His Leu Glu
    1055                 1060                 1065
Lys Val  Lys Gly Ile Ser Phe  Lys Ser Ser Asp Leu  Ala Phe Ser
    1070                 1075                 1080
Gly Ser  Asp Phe Ser Gln Gly  Leu Asn Leu Lys Arg  Glu Ser Ile
    1085                 1090                 1095
Asp Lys  Val Lys Leu Glu Val  Ser Arg Lys Ser Ile  Arg Asp Leu
    1100                 1105                 1110
Arg Ser  Ser Gly Ile Ser Val  Pro Ser Thr His Ala  Tyr Glu Asn
    1115                 1120                 1125
Leu Pro  Tyr Ala Ser Leu His  Gln Ser Phe Lys Ser  Leu Lys Val
    1130                 1135                 1140
Asp Arg  Asp Thr Ser Lys Phe  Thr Asn Glu Arg Leu  Leu Val Ser
    1145                 1150                 1155
Leu Leu  Glu Tyr Lys Ser Asp  Ile Pro Arg Val Ser  Val Thr Ser
    1160                 1165                 1170
Gln Tyr  Pro Val Tyr Asp Leu  Ile Asn Ile Ser Lys  Val Asp Glu
    1175                 1180                 1185
Leu Asn  Val Arg Ser Gly Gly  Pro Val Arg Phe Ile  Ser Thr Pro
    1190                 1195                 1200
Ile Glu  Gly Lys Leu Leu Glu  Glu Asn Ile Gly Thr  Arg Gln Gly
    1205                 1210                 1215
Val Gln  Phe Lys Asn Arg Gly  Tyr Gly Gly Ser Gln  Glu Val Leu
    1220                 1225                 1230
His Phe  Ile Arg Ser Asn Gly  Leu Val Ile Thr Glu  Gln Ala Leu
    1235                 1240                 1245
Ile Asp  Leu Ile Ile Lys Ser  Gly Val Leu Leu Met  Ile Asn Pro
    1250                 1255                 1260
Gln Arg  Gly Leu Ile Asp Leu  Phe Gln Ser Leu Ser  Gly Asp Thr
    1265                 1270                 1275
Ala Ser  Ser Met His Leu Ala  Asn Phe Phe Met Ala  Glu Lys Pro
    1280                 1285                 1290
His Trp  Glu Asp Asn Ala Ile  Ser Leu Thr Ile Ala  Gly Ser Leu
    1295                 1300                 1305
Leu Glu  Asn Cys Asp Ser Arg  Ile Glu Asn Val Lys  Asn Phe Val
    1310                 1315                 1320
Ser Val  Leu Ala Thr Gly Met  Gln Lys Asp Leu Gln  Arg Met Phe
    1325                 1330                 1335
Tyr Tyr  Val Gly Phe Val Tyr  Tyr Ala Gln Arg Leu  Ile Trp Ser
    1340                 1345                 1350
Gly Gly  His Ser Ser Lys Ile  Phe Val Ser Ile Asp  Glu Asp Lys
    1355                 1360                 1365
Leu Ala  Asp Phe Leu Arg Gly  Ser Lys Pro Ile Thr  Arg Arg Arg
    1370                 1375                 1380
Lys Ala  Met Ala Gly Thr Lys  Arg Glu Pro Ile Asn  Leu Ser Ala
    1385                 1390                 1395
Asn Phe  Ser Tyr Glu Ile Ser  Glu Pro Asp Arg Glu  Ile Ser Glu
    1400                 1405                 1410
Tyr Asp  Pro Leu Val Leu Cys  His Pro Leu Ser Met  Pro Phe Phe
    1415                 1420                 1425
Gly Asn  Trp Gln Glu Lys Tyr  Ser Val Met Gln Ser  Asp Glu Gln
    1430                 1435                 1440
Met
<210>3
<211>3511
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(15)..(3458)
<400>3
ggcaaaacct ggcg atg gct tat cct aac gac gtc aga aat gtt tgg gat     50
                Met Ala Tyr Pro Asn Asp Val Arg Asn Val Trp Asp
                1               5                   10
gtg tac aac gtg ttc cgg gac gtg cca aac cgt gaa cat ttg att cga     98
Val Tyr Asn Val Phe Arg Asp Val Pro Asn Arg Glu His Leu Ile Arg
        15                  20                  25
gat atc cgc aat ggg ctg gtt acg gtc cgg aat ctc aca aat atg ctt    146
Asp Ile Arg Asn Gly Leu Val Thr Val Arg Asn Leu Thr Asn Met Leu
    30                  35                  40
act aat atg gag cgc gat gat caa ttg atc att gct caa cta tcc aat    194
Thr Asn Met Glu Arg Asp Asp Gln Leu Ile Ile Ala Gln Leu Ser Asn
45                  50                  55                  60
atg atg aaa tca cta tct att gga gtt gag aag gct caa aat gaa ctt    242
Met Met Lys Ser Leu Ser Ile Gly Val Glu Lys Ala Gln Asn Glu Leu
                65                  70                  75
agc aaa ttg aag act acg gat gcc gac cgt gcc gca gtc tta gca gct    290
Ser Lys Leu Lys Thr Thr Asp Ala Asp Arg Ala Ala Val Leu Ala Ala
            80                  85                  90
tac caa act tcg gtc ctt aac ata gag cga aac act atg tta ttg act    338
Tyr Gln Thr Ser Val Leu Asn Ile Glu Arg Asn Thr Met Leu Leu Thr
         95                 100                 105
ggg tac ttc aag cag tta gtc tta gac tta act ggc tat gta ggt gcc    386
Gly Tyr Phe Lys Gln Leu Val Leu Asp Leu Thr Gly Tyr Val Gly Ala
    110                 115                 120
agt gta tat cct atc tta cct ttc atg att acg ggg gat cag tct atg    434
Ser Val Tyr Pro Ile Leu Pro Phe Met Ile Thr Gly Asp Gln Ser Met
125                 130                 135                 140
atg gtt gat tcc gtt aag gtt aac atg aaa aat gta ttt gat gat aag    482
Met Val Asp Ser Val Lys Val Asn Met Lys Asn Val Phe Asp Asp Lys
                145                 150                 155
cat gag cag gag ata gtc cta cct att cat cct gct tgc ttt gtg tcg    530
His Glu Gln Glu Ile Val Leu Pro Ile His Pro Ala Cys Phe Val Ser
            160                 165                 170
acc atc act gag gac act tct tcc gta gta tac gcc gac gga gat gaa    578
Thr Ile Thr Glu Asp Thr Ser Ser Val Val Tyr Ala Asp Gly Asp Glu
        175                 180                 185
ctg tat tca gtg cac gtt agg cac gca acc atg act atg tat gtc aat    626
Leu Tyr Ser Val His Val Arg His Ala Thr Met Thr Met Tyr Val Asn
    190                 195                 200
gtg ctt ggt gag acc gtc gag acc agg cag ctg tct atg ata ggc gaa    674
Val Leu Gly Glu Thr Val Glu Thr Arg Gln Leu Ser Met Ile Gly Glu
205                 210                 215                 220
tcc atc gtt cct gat gat ttc gcg cct tcc ttg ctg ata ttg aga ttt    722
Ser Ile Val Pro Asp Asp Phe Ala Pro Ser Leu Leu Ile Leu Arg Phe
                225                 230                 235
agt caa gat tca gtc gga gag gtt ttc tat ctt agt cat ggc aat atg    770
Ser Gln Asp Ser Val Gly Glu Val Phe Tyr Leu Ser His Gly Asn Met
            240                 245                 250
aaa aag ttt cta ggc tac agc ctt gaa tat act gac aag tgc agt ata    818
Lys Lys Phe Leu Gly Tyr Ser Leu Glu Tyr Thr Asp Lys Cys Ser Ile
        255                 260                 265
ttc gac gta gcc aga cgc gta tct acg acg cgt aat acg ata cct aat    866
Phe Asp Val Ala Arg Arg Val Ser Thr Thr Arg Asn Thr Ile Pro Asn
    270                 275                 280
gga ttc tgc tct gtt gat ggc gtg ccg tac ctt gat gga cgg ttc att     914
Gly Phe Cys Ser Val Asp Gly Val Pro Tyr Leu Asp Gly Arg Phe Ile
285                 290                 295                 300
tat caa ccg agc gga gtt agt gca gat agt aat atc tgt gct ata tac     962
Tyr Gln Pro Ser Gly Val Ser Ala Asp Ser Asn Ile Cys Ala Ile Tyr
                305                 310                 315
aat tca tat gtt tta gac acg ctt aga tat att act gag tgt gaa gtt    1010
Asn Ser Tyr Val Leu Asp Thr Leu Arg Tyr Ile Thr Glu Cys Glu Val
            320                 325                 330
gat acg tta agg tcg gtg tac gat caa act tcg tca act tca ttc tca    1058
Asp Thr Leu Arg Ser Val Tyr Asp Gln Thr Ser Ser Thr Ser Phe Ser
        335                 340                 345
aag acc gat gtc ttg aca tcg agt ctg cta acc atg caa agt aac att    1106
Lys Thr Asp Val Leu Thr Ser Ser Leu Leu Thr Met Gln Ser Asn Ile
    350                 355                 360
tca gct tta tct gcc gct acc cct caa tta gcg aat gac gta atc aca    1154
Ser Ala Leu Ser Ala Ala Thr Pro Gln Leu Ala Asn Asp Val Ile Thr
365                 370                 375                 380
ttc gat tct acc gat cta ctt tct ctc ggg aca gta ttg acc gta tcg    1202
Phe Asp Ser Thr Asp Leu Leu Ser Leu Gly Thr Val Leu Thr Val Ser
                385                 390                 395
aat gag ttt aca gct gat gat aca ata tta agc act agt ctt gca ggt    1250
Asn Glu Phe Thr Ala Asp Asp Thr Ile Leu Ser Thr Ser Leu Ala Gly
            400                 405                 410
cac tgc caa gtt gat tac agc gag gga tcg cct caa gac aag agt atg    1298
His Cys Gln Val Asp Tyr Ser Glu Gly Ser Pro Gln Asp Lys Ser Met
        415                 420                 425
agt ata tct gta agc tgc gat tcg tcg cag ctt gtg tca tct act gtc    1346
Ser Ile Ser Val Ser Cys Asp Ser Ser Gln Leu Val Ser Ser Thr Val
    430                 435                 440
cat tct tac tca gct gac ata ctg ggg cat gga ctc aaa ggt gac cga    1394
His Ser Tyr Ser Ala Asp Ile Leu Gly His Gly Leu Lys Gly Asp Arg
445                 450                 455                 460
act atg aac tta atg ata aat gta cct gga ctt atg aac ccc cag aaa    1442
Thr Met Asn Leu Met Ile Asn Val Pro Gly Leu Met Asn Pro Gln Lys
                465                 470                 475
gta acg gtt gac tat gtc tat tcg gat ggt tac aaa ctg aac ttt gct    1490
Val Thr Val Asp Tyr Val Tyr Ser Asp Gly Tyr Lys Leu Asn Phe Ala
            480                 485                 490
tca gtg gtt gcc ccc ggc gcg cct ttc tgg att aac gca act ctg cag    1538
Ser Val Val Ala Pro Gly Ala Pro Phe Trp Ile Asn Ala Thr Leu Gln
        495                 500                 505
ctt agt gtg tca cct tcg gcg cat aat atg ctg agt aag tta aca cca    1586
Leu Ser Val Ser Pro Ser Ala His Asn Met Leu Ser Lys Leu Thr Pro
    510                 515                 520
ctg gat aat gat gca tgc cct ggg ctt aaa gcg cag gca aac acg ccc    1634
Leu Asp Asn Asp Ala Cys Pro Gly Leu Lys Ala Gln Ala Asn Thr Pro
525                 530                 535                 540
ata ctc gta tcc atg acc atc aat ctt gat gac gcc act cct gct ttg    1682
Ile Leu Val Ser Met Thr Ile Asn Leu Asp Asp Ala Thr Pro Ala Leu
                545                 550                 555
gga ggg gag gtg att caa aac tgt gtg ttc aag ata cac cac ggc gat    1730
Gly Gly Glu Val Ile Gln Asn Cys Val Phe Lys Ile His His Gly Asp
            560                 565                 570
gat gtg tat agc ttc gtc acc gac ttt gat gtc gtt agt tat acc tca    1778
Asp Val Tyr Ser Phe Val Thr Asp Phe Asp Val Val Ser Tyr Thr Ser
        575                 580                 585
acg tcc ggg acc aat tgt ttg aag ctt ata tca agc gtg gat atc acc    1826
Thr Ser Gly Thr Asn Cys Leu Lys Leu Ile Ser Ser Val Asp Ile Thr
    590                 595                 600
agt cag ctt ccc tct gac atg gtg atc tac gtt atg aat ggg tcg ccc    1874
Ser Gln Leu Pro Ser Asp Met Val Ile Tyr Val Met Asn Gly Ser Pro
605                 610                 615                 620
gat gct gct ttt aca tct ggt gat tcc gtt aat atg tca tca gtg gac    1922
Asp Ala Ala Phe Thr Ser Gly Asp Ser Val Asn Met Ser Ser Val Asp
                625                 630                 635
tgg cac cag tcc aca agc cag act gtg ggg aat tat gtc tat acc acg    1970
Trp His Gln Ser Thr Ser Gln Thr Val Gly Asn Tyr Val Tyr Thr Thr
            640                 645                 650
atg aag gct tat tgg aat gta acg tcg tat gat gtt gag gct cgt cct    2018
Met Lys Ala Tyr Trp Asn Val Thr Ser Tyr Asp Val Glu Ala Arg Pro
        655                 660                 665
tac acc acg tac gta cct gga aag gtt aac ttt aca gcc gta gag cac    2066
Tyr Thr Thr Tyr Val Pro Gly Lys Val Asn Phe Thr Ala Val Glu His
    670                 675                 680
gct gat gtt ttt gta gat gac tac aac act ggc gtt aac tcg tat gtg    2114
Ala Asp Val Phe Val Asp Asp Tyr Asn Thr Gly Val Asn Ser Tyr Val
685                 690                 695                 700
att gta aat agt aga ata tat tat aag gga acc cct cta tat att gag    2162
Ile Val Asn Ser Arg Ile Tyr Tyr Lys Gly Thr Pro Leu Tyr Ile Glu
                705                 710                 715
gta cca agt ggt tca ttc atc aag gtg agc tac ttc aca agc cct ttg    2210
Val Pro Ser Gly Ser Phe Ile Lys Val Ser Tyr Phe Thr Ser Pro Leu
            720                 725                 730
aag aat cct act gtg gac act tat aac gct gaa atc tct cgc aat tca    2258
Lys Asn Pro Thr Val Asp Thr Tyr Asn Ala Glu Ile Ser Arg Asn Ser
        735                 740                 745
gcg tac cta att aaa gca aat gct tca tta gat tca gtg gcc aca atg    2306
Ala Tyr Leu Ile Lys Ala Asn Ala Ser Leu Asp Ser Val Ala Thr Met
    750                 755                 760
ctc aat aat ata tcg aat cga att gat gca atg gaa cgc ttg atg gag    2354
Leu Asn Asn Ile Ser Asn Arg Ile Asp Ala Met Glu Arg Leu Met Glu
765                 770                 775                 780
ccc aca cgt gcg cag cag att gca gga gta gtc tca agc ata ggt gga    2402
Pro Thr Arg Ala Gln Gln Ile Ala Gly Val Val Ser Ser Ile Gly Gly
                785                 790                 795
gtc atc tca ctc ggt atg cca ttg ctc gga gcg atc gtg gta acc atc    2450
Val Ile Ser Leu Gly Met Pro Leu Leu Gly Ala Ile Val Val Thr Ile
            800                 805                 810
ggt act att atc tcc att gct gac cca gac aaa cag ggc att gat tac    2498
Gly Thr Ile Ile Ser Ile Ala Asp Pro Asp Lys Gln Gly Ile Asp Tyr
        815                 820                 825
cac tcg gtg gct aat gcc ttt atg tcc tgg tgc cag tat gcg gcg gtc    2546
His Ser Val Ala Asn Ala Phe Met Ser Trp Cys Gln Tyr Ala Ala Val
    830                 835                 840
tgt agg tat gaa tat gga ctt ctg aag cgt gga gat gag aaa cta gat    2594
Cys Arg Tyr Glu Tyr Gly Leu Leu Lys Arg Gly Asp Glu Lys Leu Asp
845                 850                 855                 860
gtg ttg tca ttt atg ccg aag cgt gtc gtg tcg gat ttc aaa aat aaa    2642
Val Leu Ser Phe Met Pro Lys Arg Val Val Ser Asp Phe Lys Asn Lys
                865                 870                 875
ccc gac gtt att agt ctc cca gaa tta ggt gaa tca gta cta cgt gga    2690
Pro Asp Val Ile Ser Leu Pro Glu Leu Gly Glu Ser Val Leu Arg Gly
            880                 885                 890
tca agc act gac tat cta gac acg ggg att aat atc att tat aat gat    2738
Ser Ser Thr Asp Tyr Leu Asp Thr Gly Ile Asn Ile Ile Tyr Asn Asp
        895                 900                 905
atg caa ttg ctt gga caa ggc aaa ctc tct ggc tgg ctc aac aaa act    2786
Met Gln Leu Leu Gly Gln Gly Lys Leu Ser Gly Trp Leu Asn Lys Thr
    910                 915                 920
gtg agc aag gtg gag aat aat gct gcc aac ttc ttt gag agg aat ttg    2834
Val Ser Lys Val Glu Asn Asn Ala Ala Asn Phe Phe Glu Arg Asn Leu
925                 930                 935                 940
gtt aaa agt ctt gcg aat aag gaa gtc cta cca atg cat gct cga gtt    2882
Val Lys Ser Leu Ala Asn Lys Glu Val Leu Pro Met His Ala Arg Val
                945                 950                 955
gag att act caa acc gag aaa att ggt gat gtg tat agg act acg atc    2930
Glu Ile Thr Gln Thr Glu Lys Ile Gly Asp Val Tyr Arg Thr Thr Ile
            960                 965                 970
cta tat aca ggg ata aat gaa gga tca tat ttg ggt ggg gat gtc ttt    2978
Leu Tyr Thr Gly Ile Asn Glu Gly Ser Tyr Leu Gly Gly Asp Val Phe
        975                 980                 985
gct tcg cgg ttg ggg gac aaa aac atc ttg cgt atg  aat gga ttt gaa   3026
Ala Ser Arg Leu Gly Asp Lys Asn Ile Leu Arg Met  Asn Gly Phe Glu
    990                 995                 1000
agc  gga cca gga agg ttc  aaa gct atc gtc gaa  tca act act gaa     3071
Ser  Gly Pro Gly Arg Phe  Lys Ala Ile Val Glu  Ser Thr Thr Glu
1005                 1010                 1015
gta  ggc aac ttt cgt gta  gtt gat tgg acg gtg  tct gga atg tcc     3116
Val  Gly Asn Phe Arg Val  Val Asp Trp Thr Val  Ser Gly Met Ser
1020                 1025                 1030
agg  tac gag att tat gcc  gct gcc ggt gaa ata  tat ccg agc aaa     3161
Arg  Tyr Glu Ile Tyr Ala  Ala Ala Gly Glu Ile  Tyr Pro Ser Lys
1035                 1040                 1045
gac  ccc tct cat gct gat  gta cag ctg cta tac  gaa agc ata gtt     3206
Asp  Pro Ser His Ala Asp  Val Gln Leu Leu Tyr  Glu Ser Ile Val
1050                 1055                 1060
cgg  gat cta acc act cgg  gat ggt agc ttc gtt  ctg aag cat cat     3251
Arg  Asp Leu Thr Thr Arg  Asp Gly Ser Phe Val  Leu Lys His His
1065                 1070                 1075
gat  gtc ctg ctt ctg cct  ggg caa ctt gac gct  ttt gag gag cta     3296
Asp  Val Leu Leu Leu Pro  Gly Gln Leu Asp Ala  Phe Glu Glu Leu
1080                 1085                 1090
atc  ata aga aat gcc tca  aat tac caa tat gcg  ttt att ggt tca     3341
Ile  Ile Arg Asn Ala Ser  Asn Tyr Gln Tyr Ala  Phe Ile Gly Ser
1095                 1100                 1105
aac  tgt caa aat tat gcg  cat gat gtg gtc gat  atc ttg act aag     3386
Asn  Cys Gln Asn Tyr Ala  His Asp Val Val Asp  Ile Leu Thr Lys
1110                 1115                 1120
ttc  aag cga cca caa agg  tgg att aaa gat gat  gac ttc aag ttg     3431
Phe  Lys Arg Pro Gln Arg  Trp Ile Lys Asp Asp  Asp Phe Lys Leu
1125                 1130                 1135
tac  atc caa tct atc tat gat gca ttg tgatatgtac cagccagggc    3478
Tyr  Ile Gln Ser Ile Tyr Asp Ala Leu
1140                 1145
tcagatgtat gcgtacttct gagttaaaat gat                          3511
<210>4
<211>1148
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>4
Met Ala Tyr Pro Asn Asp Val Arg Asn Val Trp Asp Val Tyr Asn Val
1               5                   10                  15
Phe Arg Asp Val Pro Asn Arg Glu His Leu Ile Arg Asp Ile Arg Asn
            20                  25                  30
Gly Leu Val Thr Val Arg Asn Leu Thr Asn Met Leu Thr Asn Met Glu
        35                  40                  45
Arg Asp Asp Gln Leu Ile Ile Ala Gln Leu Ser Asn Met Met Lys Ser
    50                  55                  60
Leu Ser Ile Gly Val Glu Lys Ala Gln Asn Glu Leu Ser Lys Leu Lys
65                  70                  75                  80
Thr Thr Asp Ala Asp Arg Ala Ala Val Leu Ala Ala Tyr Gln Thr Ser
                85                  90                  95
Val Leu Asn Ile Glu Arg Asn Thr Met Leu Leu Thr Gly Tyr Phe Lys
            100                 105                 110
Gln Leu Val Leu Asp Leu Thr Gly Tyr Val Gly Ala Ser Val Tyr Pro
        115                 120                 125
Ile Leu Pro Phe Met Ile Thr Gly Asp Gln Ser Met Met Val Asp Ser
    130                 135                 140
Val Lys Val Asn Met Lys Asn Val Phe Asp Asp Lys His Glu Gln Glu
145                 150                 155                 160
Ile Val Leu Pro Ile His Pro Ala Cys Phe Val Ser Thr Ile Thr Glu
                165                 170                 175
Asp Thr Ser Ser Val Val Tyr Ala Asp Gly Asp Glu Leu Tyr Ser Val
            180                 185                 190
His Val Arg His Ala Thr Met Thr Met Tyr Val Asn Val Leu Gly Glu
        195                 200                 205
Thr Val Glu Thr Arg Gln Leu Ser Met Ile Gly Glu Ser Ile Val Pro
    210                 215                 220
Asp Asp Phe Ala Pro Ser Leu Leu Ile Leu Arg Phe Ser Gln Asp Ser
225                 230                 235                 240
Val Gly Glu Val Phe Tyr Leu Ser His Gly Asn Met Lys Lys Phe Leu
                245                 250                 255
Gly Tyr Ser Leu Glu Tyr Thr Asp Lys Cys Ser Ile Phe Asp Val Ala
            260                 265                 270
Arg Arg Val Ser Thr Thr Arg Asn Thr Ile Pro Asn Gly Phe Cys Ser
        275                 280                 285
Val Asp Gly Val Pro Tyr Leu Asp Gly Arg Phe Ile Tyr Gln Pro Ser
    290                 295                 300
Gly Val Ser Ala Asp Ser Asn Ile Cys Ala Ile Tyr Asn Ser Tyr Val
305                 310                 315                 320
Leu Asp Thr Leu Arg Tyr Ile Thr Glu Cys Glu Val Asp Thr Leu Arg
                325                 330                 335
Ser Val Tyr Asp Gln Thr Ser Ser Thr Ser Phe Ser Lys Thr Asp Val
            340                 345                 350
Leu Thr Ser Ser Leu Leu Thr Met Gln Ser Asn Ile Ser Ala Leu Ser
        355                 360                 365
Ala Ala Thr Pro Gln Leu Ala Asn Asp Val Ile Thr Phe Asp Ser Thr
    370                 375                 380
Asp Leu Leu Ser Leu Gly Thr Val Leu Thr Val Ser Asn Glu Phe Thr
385                 390                 395                 400
Ala Asp Asp Thr Ile Leu Ser Thr Ser Leu Ala Gly His Cys Gln Val
                405                 410                 415
Asp Tyr Ser Glu Gly Ser Pro Gln Asp Lys Ser Met Ser Ile Ser Val
            420                 425                 430
Ser Cys Asp Ser Ser Gln Leu Val Ser Ser Thr Val His Ser Tyr Ser
        435                 440                 445
Ala Asp Ile Leu Gly His Gly Leu Lys Gly Asp Arg Thr Met Asn Leu
    450                 455                 460
Met Ile Asn Val Pro Gly Leu Met Asn Pro Gln Lys Val Thr Val Asp
465                 470                 475                 480
Tyr Val Tyr Ser Asp Gly Tyr Lys Leu Asn Phe Ala Ser Val Val Ala
                485                 490                 495
Pro Gly Ala Pro Phe Trp Ile Asn Ala Thr Leu Gln Leu Ser Val Ser
            500                 505                 510
Pro Ser Ala His Asn Met Leu Ser Lys Leu Thr Pro Leu Asp Asn Asp
        515                 520                 525
Ala Cys Pro Gly Leu Lys Ala Gln Ala Asn Thr Pro Ile Leu Val Ser
    530                 535                 540
Met Thr Ile Asn Leu Asp Asp Ala Thr Pro Ala Leu Gly Gly Glu Val
545                 550                 555                 560
Ile Gln Asn Cys Val Phe Lys Ile His His Gly Asp Asp Val Tyr Ser
                565                 570                 575
Phe Val Thr Asp Phe Asp Val Val Ser Tyr Thr Ser Thr Ser Gly Thr
            580                 585                 590
Asn Cys Leu Lys Leu Ile Ser Ser Val Asp Ile Thr Ser Gln Leu Pro
        595                 600                 605
Ser Asp Met Val Ile Tyr Val Met Asn Gly Ser Pro Asp Ala Ala Phe
    610                 615                 620
Thr Ser Gly Asp Ser Val Asn Met Ser Ser Val Asp Trp His Gln Ser
625                 630                 635                 640
Thr Ser Gln Thr Val Gly Asn Tyr Val Tyr Thr Thr Met Lys Ala Tyr
                645                 650                 655
Trp Asn Val Thr Ser Tyr Asp Val Glu Ala Arg Pro Tyr Thr Thr Tyr
            660                 665                 670
Val Pro Gly Lys Val Asn Phe Thr Ala Val Glu His Ala Asp Val Phe
        675                 680                 685
Val Asp Asp Tyr Asn Thr Gly Val Asn Ser Tyr Val Ile Val Asn Ser
    690                 695                 700
Arg Ile Tyr Tyr Lys Gly Thr Pro Leu Tyr Ile Glu Val Pro Ser Gly
705                 710                 715                 720
Ser Phe Ile Lys Val Ser Tyr Phe Thr Ser Pro Leu Lys Asn Pro Thr
                725                 730                 735
Val Asp Thr Tyr Asn Ala Glu Ile Ser Arg Asn Ser Ala Tyr Leu Ile
            740                 745                 750
Lys Ala Asn Ala Ser Leu Asp Ser Val Ala Thr Met Leu Asn Asn Ile
        755                 760                 765
Ser Asn Arg Ile Asp Ala Met Glu Arg Leu Met Glu Pro Thr Arg Ala
    770                 775                 780
Gln Gln Ile Ala Gly Val Val Ser Ser Ile Gly Gly Val Ile Ser Leu
785                 790                 795                 800
Gly Met Pro Leu Leu Gly Ala Ile Val Val Thr Ile Gly Thr Ile Ile
                805                 810                 815
Ser Ile Ala Asp Pro Asp Lys Gln Gly Ile Asp Tyr His Ser Val Ala
            820                 825                 830
Asn Ala Phe Met Ser Trp Cys Gln Tyr Ala Ala Val Cys Arg Tyr Glu
        835                 840                 845
Tyr Gly Leu Leu Lys Arg Gly Asp Glu Lys Leu Asp Val Leu Ser Phe
    850                 855                 860
Met Pro Lys Arg Val Val Ser Asp Phe Lys Asn Lys Pro Asp Val Ile
865                 870                 875                 880
Ser Leu Pro Glu Leu Gly Glu Ser Val Leu Arg Gly Ser Ser Thr Asp
                885                 890                 895
Tyr Leu Asp Thr Gly Ile Asn Ile Ile Tyr Asn Asp Met Gln Leu Leu
            900                 905                 910
Gly Gln Gly Lys Leu Ser Gly Trp Leu Asn Lys Thr Val Ser Lys Val
        915                 920                 925
Glu Asn Asn Ala Ala Asn Phe Phe Glu Arg Asn Leu Val Lys Ser Leu
    930                 935                 940
Ala Asn Lys Glu Val Leu Pro Met His Ala Arg Val Glu Ile Thr Gln
945                 950                 955                 960
Thr Glu Lys Ile Gly Asp Val Tyr Arg Thr Thr Ile Leu Tyr Thr Gly
                965                 970                 975
Ile Asn Glu Gly Ser Tyr Leu Gly Gly Asp Val Phe Ala Ser Arg Leu
            980                 985                 990
Gly Asp Lys Asn Ile Leu Arg Met  Asn Gly Phe Glu Ser  Gly Pro Gly
        995                 1000                 1005
Arg Phe  Lys Ala Ile Val Glu  Ser Thr Thr Glu Val  Gly Asn Phe
    1010                 1015                 1020
Arg Val  Val Asp Trp Thr Val  Ser Gly Met Ser Arg  Tyr Glu Ile
    1025                 1030                 1035
Tyr Ala  Ala Ala Gly Glu Ile  Tyr Pro Ser Lys Asp  Pro Ser His
    1040                 1045                 1050
Ala Asp  Val Gln Leu Leu Tyr  Glu Ser Ile Val Arg  Asp Leu Thr
    1055                 1060                 1065
Thr Arg  Asp Gly Ser Phe Val  Leu Lys His His Asp  Val Leu Leu
    1070                 1075                 1080
Leu Pro  Gly Gln Leu Asp Ala  Phe Glu Glu Leu Ile  Ile Arg Asn
    1085                 1090                 1095
Ala Ser  Asn Tyr Gln Tyr Ala  Phe Ile Gly Ser Asn  Cys Gln Asn
    1100                 1105                 1110
Tyr Ala  His Asp Val Val Asp  Ile Leu Thr Lys Phe  Lys Arg Pro
    1115                 1120                 1125
Gln Arg  Trp Ile Lys Asp Asp  Asp Phe Lys Leu Tyr  Ile Gln Ser
    1130                 1135                 1140
Ile Tyr  Asp Ala Leu
    1145
<210>5
<211>3195
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(39)..(3095)
<400>5
ggcaaaatcg agcgaacaat cctttatcct cgtgagct atg gac agt acc ggc cga   56
                                          Met Asp Ser Thr Gly Arg
                                          1               5
gca tat gac ggt gcg tct gaa ttc aaa agt gtc ctt gtt acc gag ggt    104
Ala Tyr Asp Gly Ala Ser Glu Phe Lys Ser Val Leu Val Thr Glu Gly
            10                  15                  20
act tca cac tac aca cca gtg gaa gta tat aac atc ctc gat gaa ttg    152
Thr Ser His Tyr Thr Pro Val Glu Val Tyr Asn Ile Leu Asp Glu Leu
        25                  30                  35
aaa acc att aaa ata acg tct acc ata gct gag caa tct gtg gtg tca    200
Lys Thr Ile Lys Ile Thr Ser Thr Ile Ala Glu Gln Ser Val Val Ser
    40                  45                  50
cgt act cca att cct ctc tca aaa att ggt tta caa gat gtt aag aaa    248
Arg Thr Pro Ile Pro Leu Ser Lys Ile Gly Leu Gln Asp Val Lys Lys
55                  60                  65                  70
ttg ttt gac att aat gtc ata aaa tgt ggc tca tct ttg cgg ata gtg    296
Leu Phe Asp Ile Asn Val Ile Lys Cys Gly Ser Ser Leu Arg Ile Val
                75                  80                  85
gac gaa cct caa gtt acg ttc att gta tcg tat gca aag gat atc tat    344
Asp Glu Pro Gln Val Thr Phe Ile Val Ser Tyr Ala Lys Asp Ile Tyr
            90                  95                  100
gat aaa ttc atg tgc att gaa cat gac tcc gcc tac gag ccg agt cta    392
Asp Lys Phe Met Cys Ile Glu His Asp Ser Ala Tyr Glu Pro Ser Leu
        105                 110                 115
acg atg cat aga gtg cga gtt att tac tcg atg ctc aat gac tat tgt    440
Thr Met His Arg Val Arg Val Ile Tyr Ser Met Leu Asn Asp Tyr Cys
    120                 125                 130
gca aaa atg att tcg gag gta ccc tac gaa agt agc ttt gta ggg gag    488
Ala Lys Met Ile Ser Glu Val Pro Tyr Glu Ser Ser Phe Val Gly Glu
135                 140                 145                 150
ctc cct gtc aag tca gtg act cta aat aaa ctg ggt gac aga aat atg    536
Leu Pro Val Lys Ser Val Thr Leu Asn Lys Leu Gly Asp Arg Asn Met
                155                 160                 165
gat gct tta gct gaa cat ctc ttg ttt gag cac gac gtt gtg aat gcg    584
Asp Ala Leu Ala Glu His Leu Leu Phe Glu His Asp Val Val Asn Ala
            170                 175                 180
cag cga gag aac cgg att ttc tat caa aga aag tcc gcg cct gct gtg    632
Gln Arg Glu Asn Arg Ile Phe Tyr Gln Arg Lys Ser Ala Pro Ala Val
        185                 190                 195
cca gtc ata ttt gga gat gac ctg gag ccg gct gtt cgt gaa aga gct    680
Pro Val Ile Phe Gly Asp Asp Leu Glu Pro Ala Val Arg Glu Arg Ala
    200                 205                 210
aac ctc tat cat cga tat tcg gtt ccg tat cac caa atc gag ctg gca    728
Asn Leu Tyr His Arg Tyr Ser Val Pro Tyr His Gln Ile Glu Leu Ala
215                 220                 225                 230
ttg cat gca ttg gca aat gat tta cta tca ata cag tac tgt cac ccg    776
Leu His Ala Leu Ala Asn Asp Leu Leu Ser Ile Gln Tyr Cys His Pro
                235                 240                 245
acg gta gtg tat aac tat ttg agt tcc aga gct cca aac ttt cta agg    824
Thr Val Val Tyr Asn Tyr Leu Ser Ser Arg Ala Pro Asn Phe Leu Arg
            250                 255                 260
ttg gat gat caa gta tcg ctg aaa cta aca tcc gct ggg ata ggt act    872
Leu Asp Asp Gln Val Ser Leu Lys Leu Thr Ser Ala Gly Ile Gly Thr
        265                 270                 275
ctt atg cct aga cct gtg gta cag ctg ctt gat tat gat cta gtc tat    920
Leu Met Pro Arg Pro Val Val Gln Leu Leu Asp Tyr Asp Leu Val Tyr
    280                 285                 290
atg tca ccg cta gcc ctg aac aat ttg gcc tcc cga ttg ttg aga aag    968
Met Ser Pro Leu Ala Leu Asn Asn Leu Ala Ser Arg Leu Leu Arg Lys
295                 300                 305                 310
ata tct tta cac tta gta atg caa atg gtt act gca gtg caa caa gat   1016
Ile Ser Leu His Leu Val Met Gln Met Val Thr Ala Val Gln Gln Asp
                315                 320                 325
ctg ggc gaa gtg gtg agt gtg tcc tcc aac gtt acc aat ccc gcc agc   1064
Leu Gly Glu Val Val Ser Val Ser Ser Asn Val Thr Asn Pro Ala Ser
            330                 335                 340
gct tgc ctg gta agg atg aac gtt cag ggg gtc caa act ttg gct gta   1112
Ala Cys Leu Val Arg Met Asn Val Gln Gly Val Gln Thr Leu Ala Val
        345                 350                 355
ttc ata gcc cag tcc atg ttg aat cca aac ata tct tat ggt atg ata   1160
Phe Ile Ala Gln Ser Met Leu Asn Pro Asn Ile Ser Tyr Gly Met Ile
    360                 365                 370
tct gga tta acg ctt gac tgt ttt tcg aac ttc att tac ggc gca tgt   1208
Ser Gly Leu Thr Leu Asp Cys Phe Ser Asn Phe Ile Tyr Gly Ala Cys
375                 380                 385                 390
ctg atg tta ttt caa gcc ctc att ccc ccc agt gct ttg acg gct aga   1256
Leu Met Leu Phe Gln Ala Leu Ile Pro Pro Ser Ala Leu Thr Ala Arg
                395                 400                 405
cag aga tta gac ata aat aac cgt ttt gca tac ttt cta att aag tgt   1304
Gln Arg Leu Asp Ile Asn Asn Arg Phe Ala Tyr Phe Leu Ile Lys Cys
            410                 415                 420
cat gct act caa gca acg aca gct agg ctt gtc gcg aat cag gtc att   1352
His Ala Thr Gln Ala Thr Thr Ala Arg Leu Val Ala Asn Gln Val Ile
        425                 430                 435
tac cca gtg gat gca att gat cag tgg cag tct aat gga aga gac gtt   1400
Tyr Pro Val Asp Ala Ile Asp Gln Trp Gln Ser Asn Gly Arg Asp Val
    440                 445                 450
ctg gtt gca att tat aat aat ttg cta cca ggt gag ttg gta tta acc    1448
Leu Val Ala Ile Tyr Asn Asn Leu Leu Pro Gly Glu Leu Val Leu Thr
455                 460                 465                 470
aat tta ata cag act tac ttt agg ggt aac act gca cag caa gcg gct    1496
Asn Leu Ile Gln Thr Tyr Phe Arg Gly Asn Thr Ala Gln Gln Ala Ala
                475                 480                 485
gaa ata ttg att cct gcg gac cag act tct tat ggc gcc aat gag act    1544
Glu Ile Leu Ile Pro Ala Asp Gln Thr Ser Tyr Gly Ala Asn Glu Thr
            490                 495                 500
cgt gct cta tcg gca ccg tat ctg ttt gga gct cca atc aat atg ctc    1592
Arg Ala Leu Ser Ala Pro Tyr Leu Phe Gly Ala Pro Ile Asn Met Leu
        505                 510                 515
gcc cca gat gct aga ttg tca acg tat aaa cgc gat ctt gct ttg cct    1640
Ala Pro Asp Ala Arg Leu Ser Thr Tyr Lys Arg Asp Leu Ala Leu Pro
    520                 525                 530
gac cgc tcc cca ata ctg atc acg aca gta gag ggg caa aac tcg atc    1688
Asp Arg Ser Pro Ile Leu Ile Thr Thr Val Glu Gly Gln Asn Ser Ile
535                 540                 545                 550
tcc att gaa aat ttg agg cat aag acg ggc ctg ata cgt gcc atg tat    1736
Ser Ile Glu Asn Leu Arg His Lys Thr Gly Leu Ile Arg Ala Met Tyr
                555                 560                 565
cta aat ggc ttc gtc acg caa cct ccg gcg tgg att cgt aat gca aat    1784
Leu Asn Gly Phe Val Thr Gln Pro Pro Ala Trp Ile Arg Asn Ala Asn
            570                 575                 580
tcg aat act gcg ctg ctt tca cga ttc ctt gat gct acg ccg aac tta    1832
Ser Asn Thr Ala Leu Leu Ser Arg Phe Leu Asp Ala Thr Pro Asn Leu
        585                 590                 595
tta ggt att tac gaa gct att tta gct aat acg tat gcc aat gcg gta    1880
Leu Gly Ile Tyr Glu Ala Ile Leu Ala Asn Thr Tyr Ala Asn Ala Val
    600                 605                 610
aac gtt tat tgc gat tcc gtc tac cgg gca gat ata cct att gaa tgg    1928
Asn Val Tyr Cys Asp Ser Val Tyr Arg Ala Asp Ile Pro Ile Glu Trp
615                 620                 625                 630
aag ctg cac caa tca gta gat cct cag gat ttg ttg ttt ggt gtg ttt    1976
Lys Leu His Gln Ser Val Asp Pro Gln Asp Leu Leu Phe Gly Val Phe
                635                 640                 645
ggt att gtt cca caa tat caa att ctg aat gaa gcg gtt ccg gat ttc    2024
Gly Ile Val Pro Gln Tyr Gln Ile Leu Asn Glu Ala Val Pro Asp Phe
            650                 655                 660
ttc gct ggg ggt gag gat atc cta ata cta cag ctc att cga gct gtg    2072
Phe Ala Gly Gly Glu Asp Ile Leu Ile Leu Gln Leu Ile Arg Ala Val
        665                 670                 675
tat gat act ttg tca aat aag ctt ggg agg aat ccc gct gac ata ttt    2120
Tyr Asp Thr Leu Ser Asn Lys Leu Gly Arg Asn Pro Ala Asp Ile Phe
    680                 685                 690
cat ctt gaa gag gtc ttt aag gtt ata gaa gaa ata gtg tcg gtc tta    2168
His Leu Glu Glu Val Phe Lys Val Ile Glu Glu Ile Val Ser Val Leu
695                 700                 705                 710
gtt caa caa aag att gac gtc aga aag tat ttc act gaa agt atg aga    2216
Val Gln Gln Lys Ile Asp Val Arg Lys Tyr Phe Thr Glu Ser Met Arg
                715                 720                 725
agt ggc tca ttc tca aaa ccc aga tgg gat aac ttt cta agg cgt cca    2264
Ser Gly Ser Phe Ser Lys Pro Arg Trp Asp Asn Phe Leu Arg Arg Pro
            730                 735                 740
gtc gct cag cga cta ccg aac tta tac agc gtc atc atg acg cag gca    2312
Val Ala Gln Arg Leu Pro Asn Leu Tyr Ser Val Ile Met Thr Gln Ala
        745                 750                 755
gat cat gtg tac aac tac atg act cag ctt acc cat ata ata cca att    2360
Asp His Val Tyr Asn Tyr Met Thr Gln Leu Thr His Ile Ile Pro Ile
    760                 765                 770
act gat tgt ttc tat ata gta aag aat tca gga ttc gtc gat cga ggc    2408
Thr Asp Cys Phe Tyr Ile Val Lys Asn Ser Gly Phe Val Asp Arg Gly
775                 780                 785                 790
tcg act ggt cct gtg att gca tcc tca tca gtc tat gaa aac gtg ctt    2456
Ser Thr Gly Pro Val Ile Ala Ser Ser Ser Val Tyr Glu Asn Val Leu
                795                 800                 805
aag gtc gtt cat acc ata gct gat ttt gat gca gct aat gct tta cgc    2504
Lys Val Val His Thr Ile Ala Asp Phe Asp Ala Ala Asn Ala Leu Arg
            810                 815                 820
ctg cag agg aga cgt gta gac aat acg tct tac act gac tct ctt tct    2552
Leu Gln Arg Arg Arg Val Asp Asn Thr Ser Tyr Thr Asp Ser Leu Ser
        825                 830                 835
gac atg ttc aat ggg tta cgg tct atc agt tct agt gaa ttc gtt aga    2600
Asp Met Phe Asn Gly Leu Arg Ser Ile Ser Ser Ser Glu Phe Val Arg
    840                 845                 850
tcc gtc aat ggt cgc tca gtg ttt act gaa gga cgc att gat gca atc    2648
Ser Val Asn Gly Arg Ser Val Phe Thr Glu Gly Arg Ile Asp Ala Ile
855                 860                 865                 870
aaa gtg aat atg cga gcg aaa ttc gat ttg cag ttt atc act gag gag    2696
Lys Val Asn Met Arg Ala Lys Phe Asp Leu Gln Phe Ile Thr Glu Glu
                875                 880                 885
ggc ggc tac tca aaa cct cca aat gtg aag aag ctt atg ttt tcg gac    2744
Gly Gly Tyr Ser Lys Pro Pro Asn Val Lys Lys Leu Met Phe Ser Asp
            890                 895                 900
ttt ctg agt ttc tta gat agt cat aag agc gat tac agg cca cca ttg    2792
Phe Leu Ser Phe Leu Asp Ser His Lys Ser Asp Tyr Arg Pro Pro Leu
        905                 910                 915
ctt act gtg cca atc acc ata gga tta aat aac ctg ggt gaa act aat    2840
Leu Thr Val Pro Ile Thr Ile Gly Leu Asn Asn Leu Gly Glu Thr Asn
    920                 925                 930
tcg aac aca ctg cgt atg cgt tcg gag gcg att gat gaa tat ttt tca    2888
Ser Asn Thr Leu Arg Met Arg Ser Glu Ala Ile Asp Glu Tyr Phe Ser
935                 940                 945                 950
agt tac gtc ggt gcg caa att ttg gta ccg att aac gtc gta gac act    2936
Ser Tyr Val Gly Ala Gln Ile Leu Val Pro Ile Asn Val Val Asp Thr
                955                 960                 965
cga gtc tat act gaa ttc agt gag cta cga aat ttc ttt act ggt gat    2984
Arg Val Tyr Thr Glu Phe Ser Glu Leu Arg Asn Phe Phe Thr Gly Asp
            970                 975                 980
gtg gtc att cga gat gac cca ttt gac gtc tgg gat ggc gtc aag gca    3032
Val Val Ile Arg Asp Asp Pro Phe Asp Val Trp Asp Gly Val Lys Ala
        985                 990                 995
acc tac  atc ccg att ggt gtg  cat gga gtc cgc ttg  gat ccg aat     3077
Thr Tyr  Ile Pro Ile Gly Val  His Gly Val Arg Leu  Asp Pro Asn
    1000                 1005                 1010
gga gat  cag ccg cct cta  tgagcgcccg gatggcatag ctctgcgacg         3125
Gly Asp  Gln Pro Pro Leu
    1015
tgcgatgcag cgcaaacgag gactaggctc ccgagggggc tgaagtggat tgttttgctt  3185
ggttcctgat                                                         3195
<210>6
<211>1019
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>6
Met Asp Ser Thr Gly Arg Ala Tyr Asp Gly Ala Ser Glu Phe Lys Ser
1               5                   10                  15
Val Leu Val Thr Glu Gly Thr Ser His Tyr Thr Pro Val Glu Val Tyr
            20                  25                  30
Asn Ile Leu Asp Glu Leu Lys Thr Ile Lys Ile Thr Ser Thr Ile Ala
        35                  40                  45
Glu Gln Ser Val Val Ser Arg Thr Pro Ile Pro Leu Ser Lys Ile Gly
    50                  55                  60
Leu Gln Asp Val Lys Lys Leu Phe Asp Ile Asn Val Ile Lys Cys Gly
65                  70                  75                  80
Ser Ser Leu Arg Ile Val Asp Glu Pro Gln Val Thr Phe Ile Val Ser
                85                  90                  95
Tyr Ala Lys Asp Ile Tyr Asp Lys Phe Met Cys Ile Glu His Asp Ser
            100                 105                 110
Ala Tyr Glu Pro Ser Leu Thr Met His Arg Val Arg Val Ile Tyr Ser
        115                 120                 125
Met Leu Asn Asp Tyr Cys Ala Lys Met Ile Ser Glu Val Pro Tyr Glu
    130                 135                 140
Ser Ser Phe Val Gly Glu Leu Pro Val Lys Ser Val Thr Leu Asn Lys
145                 150                 155                 160
Leu Gly Asp Arg Asn Met Asp Ala Leu Ala Glu His Leu Leu Phe Glu
                165                 170                 175
His Asp Val Val Asn Ala Gln Arg Glu Asn Arg Ile Phe Tyr Gln Arg
            180                 185                 190
Lys Ser Ala Pro Ala Val Pro Val Ile Phe Gly Asp Asp Leu Glu Pro
        195                 200                 205
Ala Val Arg Glu Arg Ala Asn Leu Tyr His Arg Tyr Ser Val Pro Tyr
    210                 215                 220
His Gln Ile Glu Leu Ala Leu His Ala Leu Ala Asn Asp Leu Leu Ser
225                 230                 235                 240
Ile Gln Tyr Cys His Pro Thr Val Val Tyr Asn Tyr Leu Ser Ser Arg
                245                 250                 255
Ala Pro Asn Phe Leu Arg Leu Asp Asp Gln Val Ser Leu Lys Leu Thr
            260                 265                 270
Ser Ala Gly Ile Gly Thr Leu Met Pro Arg Pro Val Val Gln Leu Leu
        275                 280                 285
Asp Tyr Asp Leu Val Tyr Met Ser Pro Leu Ala Leu Asn Asn Leu Ala
    290                 295                 300
Ser Arg Leu Leu Arg Lys Ile Ser Leu His Leu Val Met Gln Met Val
305                 310                 315                 320
Thr Ala Val Gln Gln Asp Leu Gly Glu Val Val Ser Val Ser Ser Asn
                325                 330                 335
Val Thr Asn Pro Ala Ser Ala Cys Leu Val Arg Met Asn Val Gln Gly
            340                 345                 350
Val Gln Thr Leu Ala Val Phe Ile Ala Gln Ser Met Leu Asn Pro Asn
        355                 360                 365
Ile Ser Tyr Gly Met Ile Ser Gly Leu Thr Leu Asp Cys Phe Ser Asn
    370                 375                 380
Phe Ile Tyr Gly Ala Cys Leu Met Leu Phe Gln Ala Leu Ile Pro Pro
385                 390                 395                 400
Ser Ala Leu Thr Ala Arg Gln Arg Leu Asp Ile Asn Asn Arg Phe Ala
                405                 410                 415
Tyr Phe Leu Ile Lys Cys His Ala Thr Gln Ala Thr Thr Ala Arg Leu
            420                 425                 430
Val Ala Asn Gln Val Ile Tyr Pro Val Asp Ala Ile Asp Gln Trp Gln
        435                 440                 445
Ser Asn Gly Arg Asp Val Leu Val Ala Ile Tyr Asn Asn Leu Leu Pro
    450                 455                 460
Gly Glu Leu Val Leu Thr Asn Leu Ile Gln Thr Tyr Phe Arg Gly Asn
465                 470                 475                 480
Thr Ala Gln Gln Ala Ala Glu Ile Leu Ile Pro Ala Asp Gln Thr Ser
                485                 490                 495
Tyr Gly Ala Asn Glu Thr Arg Ala Leu Ser Ala Pro Tyr Leu Phe Gly
            500                 505                 510
Ala Pro Ile Asn Met Leu Ala Pro Asp Ala Arg Leu Ser Thr Tyr Lys
        515                 520                 525
Arg Asp Leu Ala Leu Pro Asp Arg Ser Pro Ile Leu Ile Thr Thr Val
    530                 535                 540
Glu Gly Gln Asn Ser Ile Ser Ile Glu Asn Leu Arg His Lys Thr Gly
545                 550                 555                 560
Leu Ile Arg Ala Met Tyr Leu Asn Gly Phe Val Thr Gln Pro Pro Ala
                565                 570                 575
Trp Ile Arg Asn Ala Asn Ser Asn Thr Ala Leu Leu Ser Arg Phe Leu
            580                 585                 590
Asp Ala Thr Pro Asn Leu Leu Gly Ile Tyr Glu Ala Ile Leu Ala Asn
        595                 600                 605
Thr Tyr Ala Asn Ala Val Asn Val Tyr Cys Asp Ser Val Tyr Arg Ala
    610                 615                 620
Asp Ile Pro Ile Glu Trp Lys Leu His Gln Ser Val Asp Pro Gln Asp
625                 630                 635                 640
Leu Leu Phe Gly Val Phe Gly Ile Val Pro Gln Tyr Gln Ile Leu Asn
                645                 650                 655
Glu Ala Val Pro Asp Phe Phe Ala Gly Gly Glu Asp Ile Leu Ile Leu
            660                 665                 670
Gln Leu Ile Arg Ala Val Tyr Asp Thr Leu Ser Asn Lys Leu Gly Arg
        675                 680                 685
Asn Pro Ala Asp Ile Phe His Leu Glu Glu Val Phe Lys Val Ile Glu
    690                 695                 700
Glu Ile Val Ser Val Leu Val Gln Gln Lys Ile Asp Val Arg Lys Tyr
705                 710                 715                 720
Phe Thr Glu Ser Met Arg Ser Gly Ser Phe Ser Lys Pro Arg Trp Asp
                725                 730                 735
Asn Phe Leu Arg Arg Pro Val Ala Gln Arg Leu Pro Asn Leu Tyr Ser
            740                 745                 750
Val Ile Met Thr Gln Ala Asp His Val Tyr Asn Tyr Met Thr Gln Leu
        755                 760                 765
Thr His Ile Ile Pro Ile Thr Asp Cys Phe Tyr Ile Val Lys Asn Ser
    770                 775                 780
Gly Phe Val Asp Arg Gly Ser Thr Gly Pro Val Ile Ala Ser Ser Ser
785                 790                 795                 800
Val Tyr Glu Asn Val Leu Lys Val Val His Thr Ile Ala Asp Phe Asp
                805                 810                 815
Ala Ala Asn Ala Leu Arg Leu Gln Arg Arg Arg Val Asp Asn Thr Ser
            820                 825                 830
Tyr Thr Asp Ser Leu Ser Asp Met Phe Asn Gly Leu Arg Ser Ile Ser
        835                 840                 845
Ser Ser Glu Phe Val Arg Ser Val Asn Gly Arg Ser Val Phe Thr Glu
    850                 855                 860
Gly Arg Ile Asp Ala Ile Lys Val Asn Met Arg Ala Lys Phe Asp Leu
865                 870                 875                 880
Gln Phe Ile Thr Glu Glu Gly Gly Tyr Ser Lys Pro Pro Asn yal Lys
                885                 890                 895
Lys Leu Met Phe Ser Asp Phe Leu Ser Phe Leu Asp Ser His Lys Ser
            900                 905                 910
Asp Tyr Arg Pro Pro Leu Leu Thr Val Pro Ile Thr Ile Gly Leu Asn
        915                 920                 925
Asn Leu Gly Glu Thr Asn Ser Asn Thr Leu Arg Met Arg Ser Glu Ala
    930                 935                 940
Ile Asp Glu Tyr Phe Ser Ser Tyr Val Gly Ala Gln Ile Leu Val Pro
945                 950                 955                 960
Ile Asn Val Val Asp Thr Arg Val Tyr Thr Glu Phe Ser Glu Leu Arg
                965                 970                 975
Asn Phe Phe Thr Gly Asp Val Val Ile Arg Asp Asp Pro Phe Asp Val
            980                 985                 990
Trp Asp Gly Val Lys Ala Thr Tyr  Ile Pro Ile Gly Val  His Gly Val
        995                 1000                 1005
Arg Leu  Asp Pro Asn Gly Asp  Gln Pro Pro Leu
    1010                 1015
<210>7
<211>2468
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(64)..(2247)
<400>7
ggtaaattgc tgccgttgct gtcaaccaac gtaaaaccag cgattaacta cagtgtattc    60
agg atg aac caa tct cga agc ttt gtt acg ggg aga gga cgc gac ttg     108
    Met Asn Gln Ser Arg Ser Phe Val Thr Gly Arg Gly Arg Asp Leu
    1               5                   10                  15
tct cgg act cct tcg gct tta agc tcg aat tcg gaa act cca gga tca     156
Ser Arg Thr Pro Ser Ala Leu Ser Ser Asn Ser Glu Thr Pro Gly Ser
                20                  25                  30
atg agt tca cca tct gaa ggg aag acg aac gct tgg gtt aac tcg gcg    204
Met Ser Ser Pro Ser Glu Gly Lys Thr Asn Ala Trp Val Asn Ser Ala
            35                  40                  45
tac gtc agc aac ttt cct gcg ttg ggc caa tcg cag ggg ttg cca tcc    252
Tyr Val Ser Asn Phe Pro Ala Leu Gly Gln Ser Gln Gly Leu Pro Ser
        50                  55                  60
cat aaa tgt tca gct ttg gct ctg cgt agt tca cag act acg tac atc    300
His Lys Cys Ser Ala Leu Ala Leu Arg Ser Ser Gln Thr Thr Tyr Ile
    65                  70                  75
ata aac ttt cca cgc cag cac tgg aac atc atg act ttt cca aat cag    348
Ile Asn Phe Pro Arg Gln His Trp Asn Ile Met Thr Phe Pro Asn Gln
80                  85                  90                  95
tct gag gcg att ctg gct aat gtt gct tca tac gca aaa gac ctt gac    396
Ser Glu Ala Ile Leu Ala Asn Val Ala Ser Tyr Ala Lys Asp Leu Asp
                100                 105                 110
gga aag aac tcc ttc gcc gta tcc gat acg ctc aag ata gcc ttg gtc    444
Gly Lys Asn Ser Phe Ala Val Ser Asp Thr Leu Lys Ile Ala Leu Val
            115                 120                 125
ctg tcg cct acg gag aag aga ctg ttc cgg aat gat act tta agc cac    492
Leu Ser Pro Thr Glu Lys Arg Leu Phe Arg Asn Asp Thr Leu Ser His
        130                 135                 140
ctc gct gat gtt cac atg tac gtg ttg gat cca gct gag gcg gaa ggg    540
Leu Ala Asp Val His Met Tyr Val Leu Asp Pro Ala Glu Ala Glu Gly
    145                 150                 155
aag aat ttg tct gac tcg gag act gtt tac gtc tac gtg acc cca ccc    588
Lys Asn Leu Ser Asp Ser Glu Thr Val Tyr Val Tyr Val Thr Pro Pro
160                 165                 170                 175
aat ttg act gat gtg aag ccg acg acc gtt gtg ctg act gag tgt gcc    636
Asn Leu Thr Asp Val Lys Pro Thr Thr Val Val Leu Thr Glu Cys Ala
                180                 185                 190
gct aac gct aag tca gca aat gat ctg agg caa tac atc gtc acc caa    684
Ala Asn Ala Lys Ser Ala Asn Asp Leu Arg Gln Tyr Ile Val Thr Gln
            195                 200                 205
cta agg aag atg ccc tcc ctt cca ttt ggg tgt act act tat gct cca    732
Leu Arg Lys Met Pro Ser Leu Pro Phe Gly Cys Thr Thr Tyr Ala Pro
        210                 215                 220
ggt ttt ctg tcc gac ggt gtg tgc aag gaa cat cct aac ttg ttc act    780
Gly Phe Leu Ser Asp Gly Val Cys Lys Glu His Pro Asn Leu Phe Thr
    225                 230                 235
tct gag gag ctg ggc gcc aaa atc aag gtg ctc acg aaa ttg ctc att    828
Ser Glu Glu Leu Gly Ala Lys Ile Lys Val Leu Thr Lys Leu Leu Ile
240                 245                 250                 255
cgc tgt gcc act tcc atg tct cag gac gga tct aac gca ttc tgt cct    876
Arg Cys Ala Thr Ser Met Ser Gln Asp Gly Ser Asn Ala Phe Cys Pro
                260                 265                 270
aag cat ccc aaa gtg aag atc gtg cac gaa tcg aac gcc aca tcc tac    924
Lys His Pro Lys Val Lys Ile Val His Glu Ser Asn Ala Thr Ser Tyr
            275                 280                 285
gtc ctg ttc aat cgt ccg aac ggg atg gtg gct acg aat cta att ctc    972
Val Leu Phe Asn Arg Pro Asn Gly Met Val Ala Thr Asn Leu Ile Leu
        290                 295                 300
tca gat ttg ccc gat gat gat tgt cca acg tgc tgg ata ctt aag tta   1020
Ser Asp Leu Pro Asp Asp Asp Cys Pro Thr Cys Trp Ile Leu Lys Leu
    305                 310                 315
gca att agc gaa gct agg ttc tat gct ctt gac ggt cat cac cgc tgt    1068
Ala Ile Ser Glu Ala Arg Phe Tyr Ala Leu Asp Gly His His Arg Cys
320                 325                 330                 335
cgc tct gga ata ata aca tcc agt gtc ttc aga tat ctc gct tcc ata    1116
Arg Ser Gly Ile Ile Thr Ser Ser Val Phe Arg Tyr Leu Ala Ser Ile
                340                 345                 350
gtt att aga gtg agg atg gat tcc gtg ctc gct ccc tct gac gcg tca    1164
Val Ile Arg Val Arg Met Asp Ser Val Leu Ala Pro Ser Asp Ala Ser
            355                 360                 365
tca act gat cac gcc gct ctc gtc aat atg atg tgc ggc att atc caa    1212
Ser Thr Asp His Ala Ala Leu Val Asn Met Met Cys Gly Ile Ile Gln
        370                 375                 380
aac aca cct gcg atg cga cag ctc ggc ata tcg aca ggt agt gag aaa    1260
Asn Thr Pro Ala Met Arg Gln Leu Gly Ile Ser Thr Gly Ser Glu Lys
    385                 390                 395
gtg aac aac aga agc atg aga gtc att atc atg caa gag aat gcc gac    1308
Val Asn Asn Arg Ser Met Arg Val Ile Ile Met Gln Glu Asn Ala Asp
400                 405                 410                 415
agg ctg acg caa atg gca gct ctg tat cat ttg ttt ctg gac tac ttt    1356
Arg Leu Thr Gln Met Ala Ala Leu Tyr His Leu Phe Leu Asp Tyr Phe
                420                 425                 430
gga gcc ctt aat ggt tgg ggg ttc tac ttc tgc tcg ctg acg tct ctc    1404
Gly Ala Leu Asn Gly Trp Gly Phe Tyr Phe Cys Ser Leu Thr Ser Leu
            435                 440                 445
tat ggt gaa ttc cat ggt ttc agc gtc gga ttt agc gga gaa ata act    1452
Tyr Gly Glu Phe His Gly Phe Ser Val Gly Phe Ser Gly Glu Ile Thr
        450                 455                 460
cat gtg aac gtt gcg agc gtg att gcc aaa aat tgg gac acg cag tct    1500
His Val Asn Val Ala Ser Val Ile Ala Lys Asn Trp Asp Thr Gln Ser
    465                 470                 475
ggc atc gac aac att ttg gaa ttt aag act atc act att ccc gtt cac    1548
Gly Ile Asp Asn Ile Leu Glu Phe Lys Thr Ile Thr Ile Pro Val His
480                 485                 490                 495
aac gag gac ata gtg tgt atg gtt gag cgc act ttg gct gaa tca ttc    1596
Asn Glu Asp Ile Val Cys Met Val Glu Arg Thr Leu Ala Glu Ser Phe
                500                 505                 510
gaa gtc gta atg aat gag cac ttt aac ggt gct agc acc ata aaa gtg    1644
Glu Val Val Met Asn Glu His Phe Asn Gly Ala Ser Thr Ile Lys Val
            515                 520                 525
cgt agg aat ggt gga gat tca cga ttc aac ttc acc atc tcc aat cct    1692
Arg Arg Asn Gly Gly Asp Ser Arg Phe Asn Phe Thr Ile Ser Asn Pro
        530                 535                 540
cgt gac gcc ttc tta ctg ctg caa aag gct gtg gct gat gga ggc att    1740
Arg Asp Ala Phe Leu Leu Leu Gln Lys Ala Val Ala Asp Gly Gly Ile
    545                 550                 555
ttg caa aag att ttg tgc agg gct atg ctt aag gct atc act agc cat    1788
Leu Gln Lys Ile Leu Cys Arg Ala Met Leu Lys Ala Ile Thr Ser His
560                 565                 570                 575
gct cta cga gct gac agg gag gta cag gat gtt tcc ttc agc ttc gta    1836
Ala Leu Arg Ala Asp Arg Glu Val Gln Asp Val Ser Phe Ser Phe Val
                580                 585                 590
tta aaa atg aga ctg aac ccg gtt aac aag agc gac tcg aag tcg tca    1884
Leu Lys Met Arg Leu Asn Pro Val Asn Lys Ser Asp Ser Lys Ser Ser
            595                 600                 605
gaa ctg gcg cac acg gct cag atg aat tcc cta ccc gtg ttt cta gct    1932
Glu Leu Ala His Thr Ala Gln Met Asn Ser Leu Pro Val Phe Leu Ala
        610                 615                 620
tcg acg ccc ttt acc atg cag cta ggc act ctt cga gat gcc ttg ctg    1980
Ser Thr Pro Phe Thr Met Gln Leu Gly Thr Leu Arg Asp Ala Leu Leu
    625                 630                 635
aaa aag act gaa aat gtc acg gtc atc aac atg gcc cga act act gaa    2028
Lys Lys Thr Glu Asn Val Thr Val Ile Asn Met Ala Arg Thr Thr Glu
640                 645                 650                 655
gag gtg tcg aag gac gcc ctt caa gaa ata ttg aaa agt atc ggg ggt    2076
Glu Val Ser Lys Asp Ala Leu Gln Glu Ile Leu Lys Ser Ile Gly Gly
                660                 665                 670
agc tcc atg acc ctc gaa gac aca gct gaa cca gta tcg gac gct gag    2124
Ser Ser Met Thr Leu Glu Asp Thr Ala Glu Pro Val Ser Asp Ala Glu
            675                 680                 685
tca atc cct gat cca cct cct aga tcc tgg gcc tct gaa gat gaa gct    2172
Ser Ile Pro Asp Pro Pro Pro Arg Ser Trp Ala Ser Glu Asp Glu Ala
        690                 695                 700
gta aac tca cca cag att tac agt agc aga agg aag gcc agg aag gct    2220
Val Asn Ser Pro Gln Ile Tyr Ser Ser Arg Arg Lys Ala Arg Lys Ala
    705                 710                 715
agg gca gct agc aag ctg tca aag taa ttatctgctc ctatatttag          2267
Arg Ala Ala Ser Lys Leu Ser Lys
720                 725
tagttgttaa tgtcgtagac ttagtaacta gtgctgtata ttatgctttt tgtgtttaaa  2327
atcagatctg ctcccctggc gaagcaccca aggtgatggc agacgcgcga agataacaaa  2387
tgccattccg tctcgaacct ataccgagtt agaggtaaga gtacctgatc cgtagtggat  2447
cgtcagggca gcatatctga t                                            2468
<210>8
<211>727
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>8
Met Asn Gln Ser Arg Ser Phe Val Thr Gly Arg Gly Arg Asp Leu Ser
1               5                   10                  15
Arg Thr Pro Ser Ala Leu Ser Ser Asn Ser Glu Thr Pro Gly Ser Met
            20                  25                  30
Ser Ser Pro Ser Glu Gly Lys Thr Asn Ala Trp Val Asn Ser Ala Tyr
        35                  40                  45
Val Ser Asn Phe Pro Ala Leu Gly Gln Ser Gln Gly Leu Pro Ser His
    50                  55                  60
Lys Cys Ser Ala Leu Ala Leu Arg Ser Ser Gln Thr Thr Tyr Ile Ile
65                  70                  75                  80
Asn Phe Pro Arg Gln His Trp Asn Ile Met Thr Phe Pro Asn Gln Ser
                85                  90                  95
Glu Ala Ile Leu Ala Asn Val Ala Ser Tyr Ala Lys Asp Leu Asp Gly
            100                 105                 110
Lys Asn Ser Phe Ala Val Ser Asp Thr Leu Lys Ile Ala Leu Val Leu
        115                 120                 125
Ser Pro Thr Glu Lys Arg Leu Phe Arg Asn Asp Thr Leu Ser His Leu
    130                 135                 140
Ala Asp Val His Met Tyr Val Leu Asp Pro Ala Glu Ala Glu Gly Lys
145                 150                 155                 160
Asn Leu Ser Asp Ser Glu Thr Val Tyr Val Tyr Val Thr Pro Pro Asn
                165                 170                 175
Leu Thr Asp Val Lys Pro Thr Thr Val Val Leu Thr Glu Cys Ala Ala
            180                 185                 190
Asn Ala Lys Ser Ala Asn Asp Leu Arg Gln Tyr Ile Val Thr Gln Leu
        195                 200                 205
Arg Lys Met Pro Ser Leu Pro Phe Gly Cys Thr Thr Tyr Ala Pro Gly
    210                 215                 220
Phe Leu Ser Asp Gly Val Cys Lys Glu His Pro Asn Leu Phe Thr Ser
225                 230                 235                 240
Glu Glu Leu Gly Ala Lys Ile Lys Val Leu Thr Lys Leu Leu Ile Arg
                245                 250                 255
Cys Ala Thr Ser Met Ser Gln Asp Gly Ser Asn Ala Phe Cys Pro Lys
            260                 265                 270
His Pro Lys Val Lys Ile Val His Glu Ser Asn Ala Thr Ser Tyr Val
        275                 280                 285
Leu Phe Asn Arg Pro Asn Gly Met Val Ala Thr Asn Leu Ile Leu Ser
    290                 295                 300
Asp Leu Pro Asp Asp Asp Cys Pro Thr Cys Trp Ile Leu Lys Leu Ala
305                 310                 315                 320
Ile Ser Glu Ala Arg Phe Tyr Ala Leu Asp Gly His His Arg Cys Arg
                325                 330                 335
Ser Gly Ile Ile Thr Ser Ser Val Phe Arg Tyr Leu Ala Ser Ile Val
            340                 345                 350
Ile Arg Val Arg Met Asp Ser Val Leu Ala Pro Ser Asp Ala Ser Ser
        355                 360                 365
Thr Asp His Ala Ala Leu Val Asn Met Met Cys Gly Ile Ile Gln Asn
    370                 375                 380
Thr Pro Ala Met Arg Gln Leu Gly Ile Ser Thr Gly Ser Glu Lys Val
385                 390                 395                 400
Asn Asn Arg Ser Met Arg Val Ile Ile Met Gln Glu Asn Ala Asp Arg
                405                 410                 415
Leu Thr Gln Met Ala Ala Leu Tyr His Leu Phe Leu Asp Tyr Phe Gly
            420                 425                 430
Ala Leu Asn Gly Trp Gly Phe Tyr Phe Cys Ser Leu Thr Ser Leu Tyr
        435                 440                 445
Gly Glu Phe His Gly Phe Ser Val Gly Phe Ser Gly Glu Ile Thr His
    450                 455                 460
Val Asn Val Ala Ser Val Ile Ala Lys Asn Trp Asp Thr Gln Ser Gly
465                 470                 475                 480
Ile Asp Asn Ile Leu Glu Phe Lys Thr Ile Thr Ile Pro Val His Asn
                485                 490                 495
Glu Asp Ile Val Cys Met Val Glu Arg Thr Leu Ala Glu Ser Phe Glu
            500                 505                 510
Val Val Met Asn Glu His Phe Asn Gly Ala Ser Thr Ile Lys Val Arg
        515                 520                 525
Arg Asn Gly Gly Asp Ser Arg Phe Asn Phe Thr Ile Ser Asn Pro Arg
    530                 535                 540
Asp Ala Phe Leu Leu Leu Gln Lys Ala Val Ala Asp Gly Gly Ile Leu
545                 550                 555                 560
Gln Lys Ile Leu Cys Arg Ala Met Leu Lys Ala Ile Thr Ser His Ala
                565                 570                 575
Leu Arg Ala Asp Arg Glu Val Gln Asp Val Ser Phe Ser Phe Val Leu
            580                 585                 590
Lys Met Arg Leu Asn Pro Val Asn Lys Ser Asp Ser Lys Ser Ser Glu
        595                 600                 605
Leu Ala His Thr Ala Gln Met Asn Ser Leu Pro Val Phe Leu Ala Ser
    610                 615                 620
Thr Pro Phe Thr Met Gln Leu Gly Thr Leu Arg Asp Ala Leu Leu Lys
625                 630                 635                 640
Lys Thr Glu Asn Val Thr Val Ile Asn Met Ala Arg Thr Thr Glu Glu
                645                 650                 655
Val Ser Lys Asp Ala Leu Gln Glu Ile Leu Lys Ser Ile Gly Gly Ser
            660                 665                 670
Ser Met Thr Leu Glu Asp Thr Ala Glu Pro Val Ser Asp Ala Glu Ser
        675                 680                 685
Ile Pro Asp Pro Pro Pro Arg Ser Trp Ala Ser Glu Asp Glu Ala Val
    690                 695                 700
Asn Ser Pro Gln Ile Tyr Ser Ser Arg Arg Lys Ala Arg Lys Ala Arg
705                 710                 715                 720
Ala Ala Ser Lys Leu Ser Lys
                725
<210>9
<211>2570
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(27)..(2429)
<400>9
ggcaaaagct ccgaaggcga cgaaaa atg tcg aac ccg gac tat tgc ata cct    53
                             Met Ser Asn Pro Asp Tyr Cys Ile Pro
                             1               5
aat ttc tct caa acg gtg aat gag aga acg ata att gat ata ttt acg    101
Asn Phe Ser Gln Thr Val Asn Glu Arg Thr Ile Ile Asp Ile Phe Thr
10                  15                  20                  25
att tgc agg tac cgt tca cct cta gtg gta ttc tgc ctt agc cac aat    149
Ile Cys Arg Tyr Arg Ser Pro Leu Val Val Phe Cys Leu Ser His Asn
                30                  35                  40
gaa ctg gct aag aaa tat gct caa gat gtt tcc atg agt agt gga act    197
Glu Leu Ala Lys Lys Tyr Ala Gln Asp Val Ser Met Ser Ser Gly Thr
            45                  50                  55
cac gtc cat atc att gat gga agt gtg gaa att act gct tct tta tat    245
His Val His Ile Ile Asp Gly Ser Val Glu Ile Thr Ala Ser Leu Tyr
        60                  65                  70
agg aca ttt cgt act att gca acc caa ctg ctt gga agg atg caa ata    293
Arg Thr Phe Arg Thr Ile Ala Thr Gln Leu Leu Gly Arg Met Gln Ile
    75                  80                  85
gtc gta ttt gtc acc gtg gat aag tct gtc gta tcc acg caa gta atg    341
Val Val Phe Val Thr Val Asp Lys Ser Val Val Ser Thr Gln Val Met
90                  95                  100                 105
aaa agt att gcc tgg gct ttt cgg ggc tca ttt gtc gaa ctc cgg aat    389
Lys Ser Ile Ala Trp Ala Phe Arg Gly Ser Phe Val Glu Leu Arg Asn
                110                 115                 120
cag tcg gtt gat tcg tca acc ttg gta agt aag ctt gag aac ttg gta    437
Gln Ser Val Asp Ser Ser Thr Leu Val Ser Lys Leu Glu Asn Leu Val
            125                 130                 135
tcg ttt gct cct ttg tat aac gtg ccc aaa tgt ggt cca gat tat tat    485
Ser Phe Ala Pro Leu Tyr Asn Val Pro Lys Cys Gly Pro Asp Tyr Tyr
        140                 145                 150
ggt ccc act gta tac tct gaa cta tta tcc ttg gct aca aat gct cgc    533
Gly Pro Thr Val Tyr Ser Glu Leu Leu Ser Leu Ala Thr Asn Ala Arg
    155                 160                 165
act cat tgg tat gcc acc att gat tat tct atg ttt acc agg tct gtt     581
Thr His Trp Tyr Ala Thr Ile Asp Tyr Ser Met Phe Thr Arg Ser Val
170                 175                 180                 185
tta act ggt ttc ata gct aaa tat ttc aat gaa gaa gct gta ccc ata     629
Leu Thr Gly Phe Ile Ala Lys Tyr Phe Asn Glu Glu Ala Val Pro Ile
                190                 195                 200
gat aaa agg att gtg tca att gtt ggc tac aat ccg cct tat gtc tgg     677
Asp Lys Arg Ile Val Ser Ile Val Gly Tyr Asn Pro Pro Tyr Val Trp
            205                 210                 215
acg tgt cta cgc cac gga att cgt cca aca tat att gag aaa tcg ctc     725
Thr Cys Leu Arg His Gly Ile Arg Pro Thr Tyr Ile Glu Lys Ser Leu
        220                 225                 230
ccg aat ccg ggt gga aaa ggt ccc ttt gga ctt atc tta ccc gta atc     773
Pro Asn Pro Gly Gly Lys Gly Pro Phe Gly Leu Ile Leu Pro Val Ile
    235                 240                 245
aac gag ctg gtg tta aag agt aag gtg aag tat gta atg cat aat ccc     821
Asn Glu Leu Val Leu Lys Ser Lys Val Lys Tyr Val Met His Asn Pro
250                 255                 260                 265
caa atc aag ctt ttg tgt ttg gat aca ttt atg ctg tct act tcg atg     869
Gln Ile Lys Leu Leu Cys Leu Asp Thr Phe Met Leu Ser Thr Ser Met
                270                 275                 280
aat att tta tac att ggt gcc tat cca gct act cat cta tta agc tta     917
Asn Ile Leu Tyr Ile Gly Ala Tyr Pro Ala Thr His Leu Leu Ser Leu
            285                 290                 295
cag ctt aat ggg tgg acg att ctg gcg ttt gat cct aag ata act agc     965
Gln Leu Asn Gly Trp Thr Ile Leu Ala Phe Asp Pro Lys Ile Thr Ser
        300                 305                 310
gat tgg act gat gcc atg gcg aaa gct aca ggt gct aag gtg att ggc    1013
Asp Trp Thr Asp Ala Met Ala Lys Ala Thr Gly Ala Lys Val Ile Gly
    315                 320                 325
gtg aac aaa gaa ttt gat ttt aag tct ttc tct gtt caa gct aac caa    1061
Val Asn Lys Glu Phe Asp Phe Lys Ser Phe Ser Val Gln Ala Asn Gln
330                 335                 340                 345
ctg aat atg ttt cag aat tcg aag tta tca gtt att gat gac aca tgg    1109
Leu Asn Met Phe Gln Asn Ser Lys Leu Ser Val Ile Asp Asp Thr Trp
                350                 355                 360
gtt gag acg gac tat gag aag ttt caa gcc gag aag caa gct tat ttt    1157
Val Glu Thr Asp Tyr Glu Lys Phe Gln Ala Glu Lys Gln Ala Tyr Phe
            365                 370                 375
gaa tgg cta att gat agg acg tca atc gac gtt cgt tta att tct atg    1205
Glu Trp Leu Ile Asp Arg Thr Ser Ile Asp Val Arg Leu Ile Ser Met
        380                 385                 390
aag tgg aac agg agt aaa gat act tcg gtg tct cat ctt ctt gca ctt    1253
Lys Trp Asn Arg Ser Lys Asp Thr Ser Val Ser His Leu Leu Ala Leu
    395                 400                 405
ctc cca cag cct tac ggt gct agt atc cgt gag atg agg gca ttc ttt    1301
Leu Pro Gln Pro Tyr Gly Ala Ser Ile Arg Glu Met Arg Ala Phe Phe
410                 415                 420                 425
cac aag aaa gga gcc agc gat ata aaa att ctg gct gct gag acg gaa    1349
His Lys Lys Gly Ala Ser Asp Ile Lys Ile Leu Ala Ala Glu Thr Glu
                430                 435                 440
aaa tac atg gac gat ttt acg gct atg tct gtt tcg gat cag atc aat    1397
Lys Tyr Met Asp Asp Phe Thr Ala Met Ser Val Ser Asp Gln Ile Asn
            445                 450                 455
acg caa aaa ttt atg cat tgc atg atc act acg gtt ggc gat gct ttg    1445
Thr Gln Lys Phe Met His Cys Met Ile Thr Thr Val Gly Asp Ala Leu
        460                 465                 470
aaa atg gat ttg gat ggt ggc aga gct gtc att gca tcc tat tca tta    1493
Lys Met Asp Leu Asp Gly Gly Arg Ala Val Ile Ala Ser Tyr Ser Leu
    475                 480                 485
tca aat tct tca aac ccg aaa gaa cgc gtg ctt aag ttt tta agt gac    1541
Ser Asn Ser Ser Asn Pro Lys Glu Arg Val Leu Lys Phe Leu Ser Asp
490                 495                 500                 505
gct aat aag gct aaa gcc atg gtg gta ttt ggg gca cct aat acg cat    1589
Ala Asn Lys Ala Lys Ala Met Val Val Phe Gly Ala Pro Asn Thr His
                510                 515                 520
cgg ctg gcc tat gct aaa aag gtt ggt tta gtc tta gac agt gcg att    1637
Arg Leu Ala Tyr Ala Lys Lys Val Gly Leu Val Leu Asp Ser Ala Ile
            525                 530                 535
aaa atg tct aag gac cta atc acc ttt tca aat cca acg ggg cgt cgt    1685
Lys Met Ser Lys Asp Leu Ile Thr Phe Ser Asn Pro Thr Gly Arg Arg
        540                 545                 550
tgg agg gac tac gga tat agt caa tca gag ttg tat gac gct gga tat    1733
Trp Arg Asp Tyr Gly Tyr Ser Gln Ser Glu Leu Tyr Asp Ala Gly Tyr
    555                 560                 565
gtt gag ata acc att gat caa atg gtt gct tac tct tca gat gtt tac    1781
Val Glu Ile Thr Ile Asp Gln Met Val Ala Tyr Ser Ser Asp Val Tyr
570                 575                 580                 585
aac ggg gtt ggt tat ttc gct aat tca act tat aat gat tta ttc tca    1829
Asn Gly Val Gly Tyr Phe Ala Asn Ser Thr Tyr Asn Asp Leu Phe Ser
                590                 595                 600
tgg tac att cct aaa tgg tat gtg cac aag agg atg ctg atg cag gac    1877
Trp Tyr Ile Pro Lys Trp Tyr Val His Lys Arg Met Leu Met Gln Asp
            605                 610                 615
att cgt ctt tca cca gcc gca tta gtt aaa tgc ttc act act cta ata    1925
Ile Arg Leu Ser Pro Ala Ala Leu Val Lys Cys Phe Thr Thr Leu Ile
        620                 625                 630
cgt aat ata tgt tac gta cca cac gaa aca tat tat cgt ttt aga ggg    1973
Arg Asn Ile Cys Tyr Val Pro His Glu Thr Tyr Tyr Arg Phe Arg Gly
    635                 640                 645
ata ctt gtt gac aag tat cta aga tct aag aat gtt gat cca tct caa    2021
Ile Leu Val Asp Lys Tyr Leu Arg Ser Lys Asn Val Asp Pro Ser Gln
650                 655                 660                 665
tac tct atc gtt ggg agt gga tca aag act ttc aca gtg ctc aat cac    2069
Tyr Ser Ile Val Gly Ser Gly Ser Lys Thr Phe Thr Val Leu Asn His
                670                 675                 680
ttt gaa gtc cct cat gaa tgt ggg cca ttg gta ttt gag gcg tct act    2117
Phe Glu Val Pro His Glu Cys Gly Pro Leu Val Phe Glu Ala Ser Thr
            685                 690                 695
gac gtg aac ata tca ggg cat cta ctt tcg ttg gcc att gct gct cac    2165
Asp Val Asn Ile Ser Gly His Leu Leu Ser Leu Ala Ile Ala Ala His
        700                 705                 710
ttt gtc gca tca ccc atg att ctg tgg gct gaa cag atg aag tat atg    2213
Phe Val Ala Ser Pro Met Ile Leu Trp Ala Glu Gln Met Lys Tyr Met
    715                 720                 725
gct gtt gat cgt atg ttg ccg ccc aat ctt gac aaa tct ctt ttc ttc    2261
Ala Val Asp Arg Met Leu Pro Pro Asn Leu Asp Lys Ser Leu Phe Phe
730                 735                 740                 745
gac aat aag gtt acg cct tcc ggt gct ctt cag agg tgg cac tct cgc    2309
Asp Asn Lys Val Thr Pro Ser Gly Ala Leu Gln Arg Trp His Ser Arg
                750                 755                 760
gag gag gtc tta ttg gca gcg gag ata tgc gag tct tat gcg gcc atg    2357
Glu Glu Val Leu Leu Ala Ala Glu Ile Cys Glu Ser Tyr Ala Ala Met
            765                 770                 775
atg ttg aat aac aag cat tca cct gac atc att ggt acg ctt aag tca    2405
Met Leu Asn Asn Lys His Ser Pro Asp Ile Ile Gly Thr Leu Lys Ser
        780                 785                 790
gct ata aat ttg gta ttc aaa atc tgatgttctg cagctatgga tctggtatac   2459
Ala Ile Asn Leu Val Phe Lys Ile
    795                 800
atgcccgagg agtcggccgc actcatgatt cccttgtgtc tgtgtgagta ggttcgtggg  2519
cctctgccag taccatatgg ggtagtcgcc ttcccagaag cttgaactga t           2570
<210>10
<211>801
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>10
Met Ser Asn Pro Asp Tyr Cys Ile Pro Asn Phe Ser Gln Thr Val Asn
1               5                   10                  15
Glu Arg Thr Ile Ile Asp Ile Phe Thr Ile Cys Arg Tyr Arg Ser Pro
            20                  25                  30
Leu Val Val Phe Cys Leu Ser His Asn Glu Leu Ala Lys Lys Tyr Ala
        35                  40                  45
Gln Asp Val Ser Met Ser Ser Gly Thr His Val His Ile Ile Asp Gly
    50                  55                  60
Ser Val Glu Ile Thr Ala Ser Leu Tyr Arg Thr Phe Arg Thr Ile Ala
65                  70                  75                  80
Thr Gln Leu Leu Gly Arg Met Gln Ile Val Val Phe Val Thr Val Asp
                85                  90                  95
Lys Ser Val Val Ser Thr Gln Val Met Lys Ser Ile Ala Trp Ala Phe
            100                 105                 110
Arg Gly Ser Phe Val Glu Leu Arg Asn Gln Ser Val Asp Ser Ser Thr
        115                 120                 125
Leu Val Ser Lys Leu Glu Asn Leu Val Ser Phe Ala Pro Leu Tyr Asn
    130                 135                 140
Val Pro Lys Cys Gly Pro Asp Tyr Tyr Gly Pro Thr Val Tyr Ser Glu
145                 150                 155                 160
Leu Leu Ser Leu Ala Thr Asn Ala Arg Thr His Trp Tyr Ala Thr Ile
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Asp Tyr Ser Met Phe Thr Arg Ser Val Leu Thr Gly Phe Ile Ala Lys
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Tyr Phe Asn Glu Glu Ala Val Pro Ile Asp Lys Arg Ile Val Ser Ile
        195                 200                 205
Val Gly Tyr Asn Pro Pro Tyr Val Trp Thr Cys Leu Arg His Gly Ile
    210                 215                 220
Arg Pro Thr Tyr Ile Glu Lys Ser Leu Pro Asn Pro Gly Gly Lys Gly
225                 230                 235                 240
Pro Phe Gly Leu Ile Leu Pro Val Ile Asn Glu Leu Val Leu Lys Ser
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Lys Val Lys Tyr Val Met His Asn Pro Gln Ile Lys Leu Leu Cys Leu
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Asp Thr Phe Met Leu Ser Thr Ser Met Asn Ile Leu Tyr Ile Gly Ala
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Tyr Pro Ala Thr His Leu Leu Ser Leu Gln Leu Asn Gly Trp Thr Ile
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Leu Ala Phe Asp Pro Lys Ile Thr Ser Asp Trp Thr Asp Ala Met Ala
305                 310                 315                 320
Lys Ala Thr Gly Ala Lys Val Ile Gly Val Asn Lys Glu Phe Asp Phe
                325                 330                 335
Lys Ser Phe Ser Val Gln Ala Asn Gln Leu Asn Met Phe Gln Asn Ser
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Lys Leu Ser Val Ile Asp Asp Thr Trp Val Glu Thr Asp Tyr Glu Lys
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Phe Gln Ala Glu Lys Gln Ala Tyr Phe Glu Trp Leu Ile Asp Arg Thr
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Ser Ile Asp Val Arg Leu Ile Ser Met Lys Trp Asn Arg Ser Lys Asp
385                 390                 395                 400
Thr Ser Val Ser His Leu Leu Ala Leu Leu Pro Gln Pro Tyr Gly Ala
                405                 410                 415
Ser Ile Arg Glu Met Arg Ala Phe Phe His Lys Lys Gly Ala Ser Asp
            420                 425                 430
Ile Lys Ile Leu Ala Ala Glu Thr Glu Lys Tyr Met Asp Asp Phe Thr
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Ala Met Ser Val Ser Asp Gln Ile Asn Thr Gln Lys Phe Met His Cys
    450                 455                 460
Met Ile Thr Thr Val Gly Asp Ala Leu Lys Met Asp Leu Asp Gly Gly
465                 470                 475                 480
Arg Ala Val Ile Ala Ser Tyr Ser Leu Ser Asn Ser Ser Asn Pro Lys
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Glu Arg Val Leu Lys Phe Leu Ser Asp Ala Asn Lys Ala Lys Ala Met
            500                 505                 510
Val Val Phe Gly Ala Pro Asn Thr His Arg Leu Ala Tyr Ala Lys Lys
        515                 520                 525
Val Gly Leu Val Leu Asp Ser Ala Ile Lys Met Ser Lys Asp Leu Ile
    530                 535                 540
Thr Phe Ser Asn Pro Thr Gly Arg Arg Trp Arg Asp Tyr Gly Tyr Ser
545                 550                 555                 560
Gln Ser Glu Leu Tyr Asp Ala Gly Tyr Val Glu Ile Thr Ile Asp Gln
                565                 570                 575
Met Val Ala Tyr Ser Ser Asp Val Tyr Asn Gly Val Gly Tyr Phe Ala
            580                 585                 590
Asn Ser Thr Tyr Asn Asp Leu Phe Ser Trp Tyr Ile Pro Lys Trp Tyr
        595                 600                 605
Val His Lys Arg Met Leu Met Gln Asp Ile Arg Leu Ser Pro Ala Ala
    610                 615                 620
Leu Val Lys Cys Phe Thr Thr Leu Ile Arg Asn Ile Cys Tyr Val Pro
625                 630                 635                 640
His Glu Thr Tyr Tyr Arg Phe Arg Gly Ile Leu Val Asp Lys Tyr Leu
                645                 650                 655
Arg Ser Lys Asn Val Asp Pro Ser Gln Tyr Ser Ile Val Gly Ser Gly
            660                 665                 670
Ser Lys Thr Phe Thr Val Leu Asn His Phe Glu Val Pro His Glu Cys
        675                 680                 685
Gly Pro Leu Val Phe Glu Ala Ser Thr Asp Val Asn Ile Ser Gly His
    690                 695                 700
Leu Leu Ser Leu Ala Ile Ala Ala His Phe Val Ala Ser Pro Met Ile
705                 710                 715                 720
Leu Trp Ala Glu Gln Met Lys Tyr Met Ala Val Asp Arg Met Leu Pro
                725                 730                 735
Pro Asn Leu Asp Lys Ser Leu Phe Phe Asp Asn Lys Val Thr Pro Ser
            740                 745                 750
Gly Ala Leu Gln Arg Trp His Ser Arg Glu Glu Val Leu Leu Ala Ala
        755                 760                 765
Glu Ile Cys Glu Ser Tyr Ala Ala Met Met Leu Asn Asn Lys His Ser
    770                 775                 780
Pro Asp Ile Ile Gly Thr Leu Lys Ser Ala Ile Asn Leu Val Phe Lys
785                 790                 795                 800
Ile
<210>11
<211>1699
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(49)..(1575)
<400>11
ggcaaaaaac gcctgaaatt actgtgaatc ataggtcggg atatcacc atg gac aca    57
                                                     Met Asp Thr
                                                     1
gaa act ctt tgc ctc att aca gct gac tcc gga aag gtg tat ggc att    105
Glu Thr Leu Cys Leu Ile Thr Ala Asp Ser Gly Lys Val Tyr Gly Ile
    5                   10                  15
ttg aaa gct att ttc gga gat gag tcc gaa att gtt aaa aaa ctc atc    153
Leu Lys Ala Ile Phe Gly Asp Glu Ser Glu Ile Val Lys Lys Leu Ile
20                  25                  30                  35
gat ttt gat gta agc ata aga gtg gtt cct ctt aac tta ggg cta ctt    201
Asp Phe Asp Val Ser Ile Arg Val Val Pro Leu Asn Leu Gly Leu Leu
                40                  45                  50
aat atc ttt cgg gat aat gct gct gat tta gat aac gcg gat ctt atg    249
Asn Ile Phe Arg Asp Asn Ala Ala Asp Leu Asp Asn Ala Asp Leu Met
            55                  60                  65
aaa cgc agg ttc ggt aat aca atg ggc tcg cgc att gtt gaa gct tac    297
Lys Arg Arg Phe Gly Asn Thr Met Gly Ser Arg Ile Val Glu Ala Tyr
        70                  75                  80
cga cgt tca caa gat tcg aag tac aaa cgc aac gtt tgt aag acc act    345
Arg Arg Ser Gln Asp Ser Lys Tyr Lys Arg Asn Val Cys Lys Thr Thr
    85                  90                  95
gga ttg ttg gtt tgc tta ttt ggt gga gga ctt ggg ctg tcc cgc gaa    393
Gly Leu Leu Val Cys Leu Phe Gly Gly Gly Leu Gly Leu Ser Arg Glu
100                 105                 110                 115
gcc gat aag cac aaa aag ttt gtt gag ggt aaa tct cac aac ata ctt    441
Ala Asp Lys His Lys Lys Phe Val Glu Gly Lys Ser His Asn Ile Leu
                120                 125                 130
tct gtc gag atg ctc aag cgt gcg ctt agt ata ggt ggt caa aat gtc    489
Ser Val Glu Met Leu Lys Arg Ala Leu Ser Ile Gly Gly Gln Asn Val
            135                 140                 145
gat gct aat aag ata tcg tca ttt tgg ttc gct act tac act att ttc    537
Asp Ala Asn Lys Ile Ser Ser Phe Trp Phe Ala Thr Tyr Thr Ile Phe
        150                 155                 160
aca act gtc tac tct cct aga ctg aga tat cag gct gga tcg tct aag     585
Thr Thr Val Tyr Ser Pro Arg Leu Arg Tyr Gln Ala Gly Ser Ser Lys
    165                 170                 175
aga atc att gct tta tct gaa agt aga aac cag tat aga agt aat cta     633
Arg Ile Ile Ala Leu Ser Glu Ser Arg Asn Gln Tyr Arg Ser Asn Leu
180                 185                 190                 195
ttc tgg gat ctg agg gat gat agt agt cat gaa gtc atg tcc atg gtg     681
Phe Trp Asp Leu Arg Asp Asp Ser Ser His Glu Val Met Ser Met Val
                200                 205                 210
cat gta ctt tcg gct cta ttt gcc tct gcc ttg acg gct tat att tct     729
His Val Leu Ser Ala Leu Phe Ala Ser Ala Leu Thr Ala Tyr Ile Ser
            215                 220                 225
aca cgc gta gct cat gaa ctt act caa ggg aat gat gaa cgc gag tct     777
Thr Arg Val Ala His Glu Leu Thr Gln Gly Asn Asp Glu Arg Glu Ser
        230                 235                 240
ttg aat aac gtc ctt gtg tgg ttg aag act ctt acc ttt gag cca tca     825
Leu Asn Asn Val Leu Val Trp Leu Lys Thr Leu Thr Phe Glu Pro Ser
    245                 250                 255
acc att gct ctg atc gct tat ata tgg cta gtc agt cca acg gac gcc     873
Thr Ile Ala Leu Ile Ala Tyr Ile Trp Leu Val Ser Pro Thr Asp Ala
260                 265                 270                 275
caa gcc act ata acg ata gga agc gtc atg gag agt gag tct tct gac     921
Gln Ala Thr Ile Thr Ile Gly Ser Val Met Glu Ser Glu Ser Ser Asp
                280                 285                 290
gat ttc cct gat atc gtt aag atc ctc tca tat aca tct aac act atg     969
Asp Phe Pro Asp Ile Val Lys Ile Leu Ser Tyr Thr Ser Asn Thr Met
            295                 300                 305
cta cct gtt cag ctg tta gag gat ggg cgt act gct tat tgt tct gtc    1017
Leu Pro Val Gln Leu Leu Glu Asp Gly Arg Thr Ala Tyr Cys Ser Val
        310                 315                 320
gct gac gga tac act acg cac acg acc gcc cta acg cta att act gat    1065
Ala Asp Gly Tyr Thr Thr His Thr Thr Ala Leu Thr Leu Ile Thr Asp
    325                 330                 335
tat aac agc tca cac atg agc gac aag ttc ggt gtt ctt att aac ata    1113
Tyr Asn Ser Ser His Met Ser Asp Lys Phe Gly Val Leu Ile Asn Ile
340                 345                 350                 355
gtt aag ttt gaa cac gct tac gca ttg cat tat gta cac cat aag cct    1161
Val Lys Phe Glu His Ala Tyr Ala Leu His Tyr Val His His Lys Pro
                360                 365                 370
agg gat gga aag gag atg acc att acc agc cca tca tcc gag atg atg    1209
Arg Asp Gly Lys Glu Met Thr Ile Thr Ser Pro Ser Ser Glu Met Met
            375                 380                 385
ttt acg tcg gtc gtc gta acg cct ttg tca tcg tat cca ctc att cac    1257
Phe Thr Ser Val Val Val Thr Pro Leu Ser Ser Tyr Pro Leu Ile His
        390                 395                 400
gcc agg aat gct gtg att gat tgg ctt cga act ttt gtc cac atg ttt    1305
Ala Arg Asn Ala Val Ile Asp Trp Leu Arg Thr Phe Val His Met Phe
    405                 410                 415
cca gac agt gga tca tta gtc ata cct gct gat agt tat act tgg ata    1353
Pro Asp Ser Gly Ser Leu Val Ile Pro Ala Asp Ser Tyr Thr Trp Ile
420                 425                 430                 435
cat aac ctt gcc caa gat atg ttt cca tgg gtg cga tta tcc acc act    1401
His Asn Leu Ala Gln Asp Met Phe Pro Trp Val Arg Leu Ser Thr Thr
                440                 445                 450
cta gat ata agg gat gat cat tac ttc caa gtg ttg tgt gat tgt ctg    1449
Leu Asp Ile Arg Asp Asp His Tyr Phe Gln Val Leu Cys Asp Cys Leu
            455                 460                 465
agc ctg gag cat gat tct cgg aat cat act aag gtt gaa aaa ttg att    1497
Ser Leu Glu His Asp Ser Arg Asn His Thr Lys Val Glu Lys Leu Ile
        470                 475                 480
aag tat atg aag gct tcg gtg tac aac ttt aca tcc gag gct cgc ggc    1545
Lys Tyr Met Lys Ala Ser Val Tyr Asn Phe Thr Ser Glu Ala Arg Gly
    485                 490                 495
aat atg cta ctt gct att acc gtg tac aaa taagctttta aatgcgcgct      1595
Asn Met Leu Leu Ala Ile Thr Val Tyr Lys
500                 505
tttactgggt ctagtaatgg gcagtttccc tcgagtggac atgtccggct ggaatggtag  1655
tagctaaatg accccccgcc ggggtcaggg gcgttttatc tgat                   1699
<210>12
<211>509
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>12
Met Asp Thr Glu Thr Leu Cys Leu Ile Thr Ala Asp Ser Gly Lys Val
1               5                   10                  15
Tyr Gly Ile Leu Lys Ala Ile Phe Gly Asp Glu Ser Glu Ile Val Lys
            20                  25                  30
Lys Leu Ile Asp Phe Asp Val Ser Ile Arg Val Val Pro Leu Asn Leu
        35                  40                  45
Gly Leu Leu Asn Ile Phe Arg Asp Asn Ala Ala Asp Leu Asp Asn Ala
    50                  55                  60
Asp Leu Met Lys Arg Arg Phe Gly Asn Thr Met Gly Ser Arg Ile Val
65                  70                  75                  80
Glu Ala Tyr Arg Arg Ser Gln Asp Ser Lys Tyr Lys Arg Asn Val Cys
                85                  90                  95
Lys Thr Thr Gly Leu Leu Val Cys Leu Phe Gly Gly Gly Leu Gly Leu
            100                 105                 110
Ser Arg Glu Ala Asp Lys His Lys Lys Phe Val Glu Gly Lys Ser His
        115                 120                 125
Asn Ile Leu Ser Val Glu Met Leu Lys Arg Ala Leu Ser Ile Gly Gly
    130                 135                 140
Gln Asn Val Asp Ala Asn Lys Ile Ser Ser Phe Trp Phe Ala Thr Tyr
145                 150                 155                 160
Thr Ile Phe Thr Thr Val Tyr Ser Pro Arg Leu Arg Tyr Gln Ala Gly
                165                 170                 175
Ser Ser Lys Arg Ile Ile Ala Leu Ser Glu Ser Arg Asn Gln Tyr Arg
            180                 185                 190
Ser Asn Leu Phe Trp Asp Leu Arg Asp Asp Ser Ser His Glu Val Met
        195                 200                 205
Ser Met Val His Val Leu Ser Ala Leu Phe Ala Ser Ala Leu Thr Ala
    210                 215                 220
Tyr Ile Ser Thr Arg Val Ala His Glu Leu Thr Gln Gly Asn Asp Glu
225                 230                 235                 240
Arg Glu Ser Leu Asn Asn Val Leu Val Trp Leu Lys Thr Leu Thr Phe
                245                 250                 255
Glu Pro Ser Thr Ile Ala Leu Ile Ala Tyr Ile Trp Leu Val Ser Pro
            260                 265                 270
Thr Asp Ala Gln Ala Thr Ile Thr Ile Gly Ser Val Met Glu Ser Glu
        275                 280                 285
Ser Ser Asp Asp Phe Pro Asp Ile Val Lys Ile Leu Ser Tyr Thr Ser
    290                 295                 300
Asn Thr Met Leu Pro Val Gln Leu Leu Glu Asp Gly Arg Thr Ala Tyr
305                 310                 315                 320
Cys Ser Val Ala Asp Gly Tyr Thr Thr His Thr Thr Ala Leu Thr Leu
                325                 330                 335
Ile Thr Asp Tyr Asn Ser Ser His Met Ser Asp Lys Phe Gly Val Leu
            340                 345                 350
Ile Asn Ile Val Lys Phe Glu His Ala Tyr Ala Leu His Tyr Val His
        355                 360                 365
His Lys Pro Arg Asp Gly Lys Glu Met Thr Ile Thr Ser Pro Ser Ser
    370                 375                 380
Glu Met Met Phe Thr Ser Val Val Val Thr Pro Leu Ser Ser Tyr Pro
385                 390                 395                 400
Leu Ile His Ala Arg Asn Ala Val Ile Asp Trp Leu Arg Thr Phe Val
                405                 410                 415
His Met Phe Pro Asp Ser Gly Ser Leu Val Ile Pro Ala Asp Ser Tyr
            420                 425                 430
Thr Trp Ile His Asn Leu Ala Gln Asp Met Phe Pro Trp Val Arg Leu
        435                 440                 445
Ser Thr Thr Leu Asp Ile Arg Asp Asp His Tyr Phe Gln Val Leu Cys
    450                 455                 460
Asp Cys Leu Ser Leu Glu His Asp Ser Arg Asn His Thr Lys Val Glu
465                 470                 475                 480
Lys Leu Ile Lys Tyr Met Lys Ala Ser Val Tyr Asn Phe Thr Ser Glu
                485                 490                 495
Ala Arg Gly Asn Met Leu Leu Ala Ile Thr Val Tyr Lys
            500                 505
<210>13
<211>1696
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(26)..(1543)
<400>13
ggcaaaaagc tcattggcgc ccgac atg tct gcg att gta ggc ctc tgc ctc     52
                            Met Ser Ala Ile Val Gly Leu Cys Leu
                            1               5
cta tcg gaa aaa gtc gtt tta tct aga agc ctg aca gac gag gtt tct    100
Leu Ser Glu Lys Val Val Leu Ser Arg Ser Leu Thr Asp Glu Val Ser
10                  15                  20                  25
aaa ttg tat aaa ttg aat cgg ggc aac gtc aaa gaa ccc cga aag tat    148
Lys Leu Tyr Lys Leu Asn Arg Gly Asn Val Lys Glu Pro Arg Lys Tyr
                30                  35                  40
gct act gaa cgt atg tcg acg cag tct aaa cct gtg gcg ttg cag gtt    196
Ala Thr Glu Arg Met Ser Thr Gln Ser Lys Pro Val Ala Leu Gln Val
            45                  50                  55
cct gtc tcg aca ata gtt cta gac tat aaa gat gag gat ttt ata aaa    244
Pro Val Ser Thr Ile Val Leu Asp Tyr Lys Asp Glu Asp Phe Ile Lys
        60                  65                  70
caa aac cca act tat agt gcc atg gat ata att gga agc cct agt aat    292
Gln Asn Pro Thr Tyr Ser Ala Met Asp Ile Ile Gly Ser Pro Ser Asn
    75                  80                  85
acg gct ccg caa acg gca ttt caa agt ata atg ccg tct cta tct gcg    340
Thr Ala Pro Gln Thr Ala Phe Gln Ser Ile Met Pro Ser Leu Ser Ala
90                  95                  100                 105
cta ttt aat acc cct ttc atc caa ggg gca ttc cgg cac cgg atc ata    388
Leu Phe Asn Thr Pro Phe Ile Gln Gly Ala Phe Arg His Arg Ile Ile
                110                 115                 120
tca agt atg gga ccc gaa att tca tac tta gtt atg gtt atc gga ccg    436
Ser Ser Met Gly Pro Glu Ile Ser Tyr Leu Val Met Val Ile Gly Pro
            125                 130                 135
cca agt ggt ttt atg gat acg ccg aat gta tcg tca gct cag tca tct    484
Pro Ser Gly Phe Met Asp Thr Pro Asn Val Ser Ser Ala Gln Ser Ser
        140                 145                 150
gtc cat act gtg tca aat gct gat gtt gac ttg aat gat att atc gcc    532
Val His Thr Val Ser Asn Ala Asp Val Asp Leu Asn Asp Ile Ile Ala
    155                 160                 165
att aac tcg acg atg gct aag agc acg aag ctg gtg tct gct tca act    580
Ile Asn Ser Thr Met Ala Lys Ser Thr Lys Leu Val Ser Ala Ser Thr
170                 175                 180                 185
ctt cag gcc atg ttg gtt aat gac gtt tat gat aga tgt atg gat ttg    628
Leu Gln Ala Met Leu Val Asn Asp Val Tyr Asp Arg Cys Met Asp Leu
                190                 195                 200
gat ggg att tta tta tct caa gct ctt cca ttc ttc aga aat tat gtc     676
Asp Gly Ile Leu Leu Ser Gln Ala Leu Pro Phe Phe Arg Asn Tyr Val
            205                 210                 215
aat gtg caa tcg aag gga tca ctc ccc ccg gct gtg gct gcg tgc ttg     724
Asn Val Gln Ser Lys Gly Ser Leu Pro Pro Ala Val Ala Ala Cys Leu
        220                 225                 230
aat act ccc atc aag gaa tta ttc tcg atg ggc tct ggt aag cgt gag     772
Asn Thr Pro Ile Lys Glu Leu Phe Ser Met Gly Ser Gly Lys Arg Glu
    235                 240                 245
cca ttg aca ttg gaa ttt aga aag gat aat gaa ggt caa tgc ctt ggc     820
Pro Leu Thr Leu Glu Phe Arg Lys Asp Asn Glu Gly Gln Cys Leu Gly
250                 255                 260                 265
att gtc ctt ccc aaa ggg cat gag gga gat acc cta tca tcc cgc tat     868
Ile Val Leu Pro Lys Gly His Glu Gly Asp Thr Leu Ser Ser Arg Tyr
                270                 275                 280
cct gct gtt ttc att aat gaa agt gaa ccg ttt tct gat aaa gag cgt     916
Pro Ala Val Phe Ile Asn Glu Ser Glu Pro Phe Ser Asp Lys Glu Arg
            285                 290                 295
tcc gag ctg tcc gaa ctc aaa cga acg gac tcg gat gca tat gag aag     964
Ser Glu Leu Ser Glu Leu Lys Arg Thr Asp Ser Asp Ala Tyr Glu Lys
        300                 305                 310
ctg tat tcc gaa acg att tct aag cac gtc tct gac gga tcg tac ggg    1012
Leu Tyr Ser Glu Thr Ile Ser Lys His Val Ser Asp Gly Ser Tyr Gly
    315                 320                 325
aat agg gta atc att tct cat aag atg tca aga ttg tca aat ggg gga    1060
Asn Arg Val Ile Ile Ser His Lys Met Ser Arg Leu Ser Asn Gly Gly
330                 335                 340                 345
gtt aag ata att gga aga ttc aag ata tct gac ttc aat act gtg aag    1108
Val Lys Ile Ile Gly Arg Phe Lys Ile Ser Asp Phe Asn Thr Val Lys
                350                 355                 360
aag aat tta tcc tcg cga tct ggt gag gta gat tca gca aag gag caa    1156
Lys Asn Leu Ser Ser Arg Ser Gly Glu Val Asp Ser Ala Lys Glu Gln
            365                 370                 375
tgg gaa gct ctg tct ggt aat ggc ttg gtg aca gac agt aat att tcc    1204
Trp Glu Ala Leu Ser Gly Asn Gly Leu Val Thr Asp Ser Asn Ile Ser
        380                 385                 390
atg ctc cac gac aag ata cta gac act atc acc tct aat aaa cca ggt    1252
Met Leu His Asp Lys Ile Leu Asp Thr Ile Thr Ser Asn Lys Pro Gly
    395                 400                 405
gtg gta ctt aga gat ggt aac aaa aaa tct gaa aat ata gtg gtt tgc    1300
Val Val Leu Arg Asp Gly Asn Lys Lys Ser Glu Asn Ile Val Val Cys
410                 415                 420                 425
ttc aaa aat ggt ttt cca aac aag aag cat tcc tta ctg cag ttg act    1348
Phe Lys Asn Gly Phe Pro Asn Lys Lys His Ser Leu Leu Gln Leu Thr
                430                 435                 440
aaa aat gga ata tca gtt gtc agt ttg gat gaa ttg act gat gct ggt    1396
Lys Asn Gly Ile Ser Val Val Ser Leu Asp Glu Leu Thr Asp Ala Gly
            445                 450                 455
atc ctc gtg gaa tct aca gga cca gac agg gtt cgt aga tcc ccg aaa    1444
Ile Leu Val Glu Ser Thr Gly Pro Asp Arg Val Arg Arg Ser Pro Lys
        460                 465                 470
gct ttg gca aat aag ctt tcc tcc ttc aag gga cgg aag gta act ctt    1492
Ala Leu Ala Asn Lys Leu Ser Ser Phe Lys Gly Arg Lys Val Thr Leu
    475                 480                 485
gat gtt gac aat atg tca aca gaa gct ctc ata caa aag ctg tca gct    1540
Asp Val Asp Asn Met Ser Thr Glu Ala Leu Ile Gln Lys Leu Ser Ala
490                 495                 500                 505
tta tgactagctt ttggtcatta cgaccgccat ctgcaccgaa acatttatat         1593
Leu
ggttcgggtt tcgcggaacc taacaaaacg acgattgaag ttagttaggg actagtgaac  1653
tttcaccagg tgtggccgtc attaggaaat gagctttaat gat                    1696
<210>14
<211>506
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>14
Met Ser Ala Ile Val Gly Leu Cys Leu Leu Ser Glu Lys Val Val Leu
1               5                   10                  15
Ser Arg Ser Leu Thr Asp Glu Val Ser Lys Leu Tyr Lys Leu Asn Arg
            20                  25                  30
Gly Asn Val Lys Glu Pro Arg Lys Tyr Ala Thr Glu Arg Met Ser Thr
        35                  40                  45
Gln Ser Lys Pro Val Ala Leu Gln Val Pro Val Ser Thr Ile Val Leu
    50                  55                  60
Asp Tyr Lys Asp Glu Asp Phe Ile Lys Gln Asn Pro Thr Tyr Ser Ala
65                  70                  75                  80
Met Asp Ile Ile Gly Ser Pro Ser Asn Thr Ala Pro Gln Thr Ala Phe
                85                  90                  95
Gln Ser Ile Met Pro Ser Leu Ser Ala Leu Phe Asn Thr Pro Phe Ile
            100                 105                 110
Gln Gly Ala Phe Arg His Arg Ile Ile Ser Ser Met Gly Pro Glu Ile
        115                 120                 125
Ser Tyr Leu Val Met Val Ile Gly Pro Pro Ser Gly Phe Met Asp Thr
    130                 135                 140
Pro Asn Val Ser Ser Ala Gln Ser Ser Val His Thr Val Ser Asn Ala
145                 150                 155                 160
Asp Val Asp Leu Asn Asp Ile Ile Ala Ile Asn Ser Thr Met Ala Lys
                165                 170                 175
Ser Thr Lys Leu Val Ser Ala Ser Thr Leu Gln Ala Met Leu Val Asn
            180                 185                 190
Asp Val Tyr Asp Arg Cys Met Asp Leu Asp Gly Ile Leu Leu Ser Gln
        195                 200                 205
Ala Leu Pro Phe Phe Arg Asn Tyr Val Asn Val Gln Ser Lys Gly Ser
    210                 215                 220
Leu Pro Pro Ala Val Ala Ala Cys Leu Asn Thr Pro Ile Lys Glu Leu
225                 230                 235                 240
Phe Ser Met Gly Ser Gly Lys Arg Glu Pro Leu Thr Leu Glu Phe Arg
                245                 250                 255
Lys Asp Asn Glu Gly Gln Cys Leu Gly Ile Val Leu Pro Lys Gly His
            260                 265                 270
Glu Gly Asp Thr Leu Ser Ser Arg Tyr Pro Ala Val Phe Ile Asn Glu
        275                 280                 285
Ser Glu Pro Phe Ser Asp Lys Glu Arg Ser Glu Leu Ser Glu Leu Lys
    290                 295                 300
Arg Thr Asp Ser Asp Ala Tyr Glu Lys Leu Tyr Ser Glu Thr Ile Ser
305                 310                 315                 320
Lys His Val Ser Asp Gly Ser Tyr Gly Asn Arg Val Ile Ile Ser His
                325                 330                 335
Lys Met Ser Arg Leu Ser Asn Gly Gly Val Lys Ile Ile Gly Arg Phe
            340                 345                 350
Lys Ile Ser Asp Phe Asn Thr Val Lys Lys Asn Leu Ser Ser Arg Ser
        355                 360                 365
Gly Glu Val Asp Ser Ala Lys Glu Gln Trp Glu Ala Leu Ser Gly Asn
    370                 375                 380
Gly Leu Val Thr Asp Ser Asn Ile Ser Met Leu His Asp Lys Ile Leu
385                 390                 395                 400
Asp Thr Ile Thr Ser Asn Lys Pro Gly Val Val Leu Arg Asp Gly Asn
                405                 410                 415
Lys Lys Ser Glu Asn Ile Val Val Cys Phe Lys Asn Gly Phe Pro Asn
            420                 425                 430
Lys Lys His Ser Leu Leu Gln Leu Thr Lys Asn Gly Ile Ser Val Val
        435                 440                 445
Ser Leu Asp Glu Leu Thr Asp Ala Gly Ile Leu Val Glu Ser Thr Gly
    450                 455                 460
Pro Asp Arg Val Arg Arg Ser Pro Lys Ala Leu Ala Asn Lys Leu Ser
465                 470                 475                 480
Ser Phe Lys Gly Arg Lys Val Thr Leu Asp Val Asp Asn Met Ser Thr
                485                 490                 495
Glu Ala Leu Ile Gln Lys Leu Ser Ala Leu
            500                 505
<210>15
<211>1427
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(24)..(1289)
<400>15
ggcaaaaatc gccacctgcc act atg tca cgc cag atg tgg tta gac aca agt   53
                          Met Ser Arg Gln Met Trp Leu Asp Thr Ser
                          1               5                   10
gct ctc ctt gaa gcc att tcc gaa tat gtc gtt cgg tgc aac gga gat    101
Ala Leu Leu Glu Ala Ile Ser Glu Tyr Val Val Arg Cys Asn Gly Asp
                15                  20                  25
act ttc tcc ggg ctc aca aca ggt gat ttt aat gca ctc tcg aac atg    149
Thr Phe Ser Gly Leu Thr Thr Gly Asp Phe Asn Ala Leu Ser Asn Met
            30                  35                  40
ttc aca cag ctc tca gtt tcg agc gct gga tat gtt agt gat ccg aga    197
Phe Thr Gln Leu Ser Val Ser Ser Ala Gly Tyr Val Ser Asp Pro Arg
        45                  50                  55
gta ccc ttg caa act atg tca aat atg ttt gta tcc ttt atc acg tcg    245
Val Pro Leu Gln Thr Met Ser Asn Met Phe Val Ser Phe Ile Thr Ser
    60                  65                  70
aca gac cgt tgt gga tac atg ctt agg aag act tgg ttc aat agt gat    293
Thr Asp Arg Cys Gly Tyr Met Leu Arg Lys Thr Trp Phe Asn Ser Asp
75                  80                  85                  90
acc aag cct acc gtt tca gat gat ttt att act acg tac att agg cca    341
Thr Lys Pro Thr Val Ser Asp Asp Phe Ile Thr Thr Tyr Ile Arg Pro
                95                  100                 105
cgt tta caa gtg cca atg tcc gat acc gtc aga caa ttg aat aat ttg    389
Arg Leu Gln Val Pro Met Ser Asp Thr Val Arg Gln Leu Asn Asn Leu
            110                 115                 120
tcg tta cag cca tca gct aag cca aag ctg tat gag cgc caa aat gca    437
Ser Leu Gln Pro Ser Ala Lys Pro Lys Leu Tyr Glu Arg Gln Asn Ala
        125                 130                 135
att atg aag ggt tta gat ata cct tat tct gaa ccc att gaa cca tgt    485
Ile Met Lys Gly Leu Asp Ile Pro Tyr Ser Glu Pro Ile Glu Pro Cys
    140                 145                 150
aaa ttg ttt cgg tct gtt gcg ggg cag act ggg aac ata ccg atg atg    533
Lys Leu Phe Arg Ser Val Ala Gly Gln Thr Gly Asn Ile Pro Met Met
155                 160                 165                 170
ggt ata ctc gcc acg ccc cct gct gct cag cag cag ccc ttc ttt gtc    581
Gly Ile Leu Ala Thr Pro Pro Ala Ala Gln Gln Gln Pro Phe Phe Val
                175                 180                 185
gcc gaa aga agg aga att ttg ttt gga atc cgc tcc aat gcg gct att    629
Ala Glu Arg Arg Arg Ile Leu Phe Gly Ile Arg Ser Asn Ala Ala Ile
            190                 195                 200
cca gcc ggg gca tat caa ttt gtt gtt cct gcc tgg gca tca gtg cta    677
Pro Ala Gly Ala Tyr Gln Phe Val Val Pro Ala Trp Ala Ser Val Leu
        205                 210                 215
agt gtc act ggt gca tat gtc tat ttt aca aac tcg ttc ttt gga acg     725
Ser Val Thr Gly Ala Tyr Val Tyr Phe Thr Asn Ser Phe Phe Gly Thr
    220                 225                 230
aca ata gct ggc gtt acg gct act gca act gcc gca gac gct gct act     773
Thr Ile Ala Gly Val Thr Ala Thr Ala Thr Ala Ala Asp Ala Ala Thr
235                 240                 245                 250
aca ttt act gtt cca act gac gcg aac aac ctc cct gtc caa acg gat     821
Thr Phe Thr Val Pro Thr Asp Ala Asn Asn Leu Pro Val Gln Thr Asp
                255                 260                 265
tca cgt ttg tcg ttc tca ctt ggt ggt ggg aac atc aac ctg gaa ctg     869
Ser Arg Leu Ser Phe Ser Leu Gly Gly Gly Asn Ile Asn Leu Glu Leu
            270                 275                 280
ggt gtg gct aaa acg ggt ttt tgt gtc gca att gaa ggc gaa ttt acg     917
Gly Val Ala Lys Thr Gly Phe Cys Val Ala Ile Glu Gly Glu Phe Thr
        285                 290                 295
ata ttg gca aat cgt agt caa gcc tac tac aca ttg aat tcg ata act     965
Ile Leu Ala Asn Arg Ser Gln Ala Tyr Tyr Thr Leu Asn Ser Ile Thr
    300                 305                 310
cag acc ccg acg tca att gac gat ttc gat gtg tct gac ttt ttg acg    1013
Gln Thr Pro Thr Ser Ile Asp Asp Phe Asp Val Ser Asp Phe Leu Thr
315                 320                 325                 330
act ttt ctg tcg cag ctt cga gct tgt gga cag tat gaa att ttc agt    1061
Thr Phe Leu Ser Gln Leu Arg Ala Cys Gly Gln Tyr Glu Ile Phe Ser
                335                 340                 345
gat gct atg gac cag ctg act aat agt ttg atc acg aac tat atg gat    1109
Asp Ala Met Asp Gln Leu Thr Asn Ser Leu Ile Thr Asn Tyr Met Asp
            350                 355                 360
ccg ccg gcc ata cct gca ggt ttg gca ttc act tca cca tgg ttt cga    1157
Pro Pro Ala Ile Pro Ala Gly Leu Ala Phe Thr Ser Pro Trp Phe Arg
        365                 370                 375
ttc tct gag agg gca aga act att ctt gcg ctt cag aat gtc gat ttg    1205
Phe Ser Glu Arg Ala Arg Thr Ile Leu Ala Leu Gln Asn Val Asp Leu
    380                 385                 390
aat ata aga aag ctg ata gta cgg cat ctt tgg gtc atc act tcc tta    1253
Asn Ile Arg Lys Leu Ile Val Arg His Leu Trp Val Ile Thr Ser Leu
395                 400                 405                 410
att gcc gta ttt gga aga tac tat cga cca aat tag tgatatcata         1299
Ile Ala Val Phe Gly Arg Tyr Tyr Arg Pro Asn
                415                 420
taaggaatct gctggtgcgc atacgtgtgt aaccgcggag gctgggtcaa ccagataggg  1359
gtagccgtgg aggaaatgcc cggtcctgaa tctggaacgc tcgtagtcag gtggacggtt  1419
tatatgat    1427
<210>16
<211>421
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>16
Met Ser Arg Gln Met Trp Leu Asp Thr Ser Ala Leu Leu Glu Ala Ile
1               5                   10                  15
Ser Glu Tyr Val Val Arg Cys Asn Gly Asp Thr Phe Ser Gly Leu Thr
            20                  25                  30
Thr Gly Asp Phe Asn Ala Leu Ser Asn Met Phe Thr Gln Leu Ser Val
        35                  40                  45
Ser Ser Ala Gly Tyr Val Ser Asp Pro Arg Val Pro Leu Gln Thr Met
    50                  55                  60
Ser Asn Met Phe Val Ser Phe Ile Thr Ser Thr Asp Arg Cys Gly Tyr
65                  70                  75                  80
Met Leu Arg Lys Thr Trp Phe Asn Ser Asp Thr Lys Pro Thr Val Ser
                85                  90                  95
Asp Asp Phe Ile Thr Thr Tyr Ile Arg Pro Arg Leu Gln Val Pro Met
            100                 105                 110
Ser Asp Thr Val Arg Gln Leu Asn Asn Leu Ser Leu Gln Pro Ser Ala
        115                 120                 125
Lys Pro Lys Leu Tyr Glu Arg Gln Asn Ala Ile Met Lys Gly Leu Asp
    130                 135                 140
Ile Pro Tyr Ser Glu Pro Ile Glu Pro Cys Lys Leu Phe Arg Ser Val
145                 150                 155                 160
Ala Gly Gln Thr Gly Asn Ile Pro Met Met Gly Ile Leu Ala Thr Pro
                165                 170                 175
Pro Ala Ala Gln Gln Gln Pro Phe Phe Val Ala Glu Arg Arg Arg Ile
            180                 185                 190
Leu Phe Gly Ile Arg Ser Asn Ala Ala Ile Pro Ala Gly Ala Tyr Gln
        195                 200                 205
Phe Val Val Pro Ala Trp Ala Ser Val Leu Ser Val Thr Gly Ala Tyr
    210                 215                 220
Val Tyr Phe Thr Asn Ser Phe Phe Gly Thr Thr Ile Ala Gly Val Thr
225                 230                 235                 240
Ala Thr Ala Thr Ala Ala Asp Ala Ala Thr Thr Phe Thr Val Pro Thr
                245                 250                 255
Asp Ala Asn Asn Leu Pro Val Gln Thr Asp Ser Arg Leu Ser Phe Ser
            260                 265                 270
Leu Gly Gly Gly Asn Ile Asn Leu Glu Leu Gly Val Ala Lys Thr Gly
        275                 280                 285
Phe Cys Val Ala Ile Glu Gly Glu Phe Thr Ile Leu Ala Asn Arg Ser
    290                 295                 300
Gln Ala Tyr Tyr Thr Leu Asn Ser Ile Thr Gln Thr Pro Thr Ser Ile
305                 310                 315                 320
Asp Asp Phe Asp Val Ser Asp Phe Leu Thr Thr Phe Leu Ser Gln Leu
                325                 330                 335
Arg Ala Cys Gly Gln Tyr Glu Ile Phe Ser Asp Ala Met Asp Gln Leu
            340                 345                 350
Thr Asn Ser Leu Ile Thr Asn Tyr Met Asp Pro Pro Ala Ile Pro Ala
        355                 360                 365
Gly Leu Ala Phe Thr Ser Pro Trp Phe Arg Phe Ser Glu Arg Ala Arg
    370                 375                 380
Thr Ile Leu Ala Leu Gln Asn Val Asp Leu Asn Ile Arg Lys Leu Ile
385                 390                 395                 400
Val Arg His Leu Trp Val Ile Thr Ser Leu Ile Ala Val Phe Gly Arg
                405                 410                 415
Tyr Tyr Arg Pro Asn
            420
<210>17
<211>1305
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(25)..(1077)
<400>17
ggtaaaaatc gtgtgtcctc cgtg atg ggt aag ctc caa gat gga atc gcc      51
                           Met Gly Lys Leu Gln Asp Gly Ile Ala
                           1               5
atc aag cgg atc aac gac gcg att acc act ttc aaa aat tac aag ctt     99
Ile Lys Arg Ile Asn Asp Ala Ile Thr Thr Phe Lys Asn Tyr Lys Leu
10                  15                  20                  25
ggt gaa ctg gaa cag ggc ggc tca atg gcc atc aac aca ttg agt aac    147
Gly Glu Leu Glu Gln Gly Gly Ser Met Ala Ile Asn Thr Leu Ser Asn
                30                  35                  40
gtc cgt gcc cat gtt ggg ctg gct tgg ccg gcc atc ttg cga aat tgt    195
Val Arg Ala His Val Gly Leu Ala Trp Pro Ala Ile Leu Arg Asn Cys
            45                  50                  55
tta ata cac act tca tcc cat ctt ggg ttc atg aag ttt atg att gat    243
Leu Ile His Thr Ser Ser His Leu Gly Phe Met Lys Phe Met Ile Asp
        60                  65                  70
att gct act acc tgg aaa gtt ggt gct ttc act ctt ctg ggt agc gtt    291
Ile Ala Thr Thr Trp Lys Val Gly Ala Phe Thr Leu Leu Gly Ser Val
    75                  80                  85
ggt gac gaa gat ccc ttc act gac gtt gat ttg att tac act aag acc    339
Gly Asp Glu Asp Pro Phe Thr Asp Val Asp Leu Ile Tyr Thr Lys Thr
90                  95                  100                 105
tgc ttg cat ttg ggt ctt aag gac aat gat ttt ctg caa ttc ccg gaa    387
Cys Leu His Leu Gly Leu Lys Asp Asn Asp Phe Leu Gln Phe Pro Glu
                110                 115                 120
gaa ttt gct tat gag gcg aat tcg ttc cta gaa gcg cag tcg atg aat    435
Glu Phe Ala Tyr Glu Ala Asn Ser Phe Leu Glu Ala Gln Ser Met Asn
            125                 130                 135
gct agg gtg gac atg ctc act ggt gtc cac aat att gaa gac aaa tac    483
Ala Arg Val Asp Met Leu Thr Gly Val His Asn Ile Glu Asp Lys Tyr
        140                 145                 150
gtt ttc agg atg cag tct ata tct aag ttt ttg aag gct tac tat act    531
Val Phe Arg Met Gln Ser Ile Ser Lys Phe Leu Lys Ala Tyr Tyr Thr
    155                 160                 165
gct tca gaa gac gtt gct tat ctg acc gga ttc ata aag cct gac gac    579
Ala Ser Glu Asp Val Ala Tyr Leu Thr Gly Phe Ile Lys Pro Asp Asp
170                 175                 180                 185
tcc aag gac tca atc ttg agt gcc gaa ctc ttg aaa gcg cag gtt aca    627
Ser Lys Asp Ser Ile Leu Ser Ala Glu Leu Leu Lys Ala Gln Val Thr
                190                 195                 200
tcc gag gtg cta cgt gtg cgt aat tta att acc acc aaa att cag aag    675
Ser Glu Val Leu Arg Val Arg Asn Leu Ile Thr Thr Lys Ile Gln Lys
            205                 210                 215
tac att aat ttg tac gaa gat tca cag tta ccg cat ttt cgg cag gcg    723
Tyr Ile Asn Leu Tyr Glu Asp Ser Gln Leu Pro His Phe Arg Gln Ala
        220                 225                 230
gct ttg tcc tac act cag gat tgg gat gtc gat ggc ggt gtg ccc gct    771
Ala Leu Ser Tyr Thr Gln Asp Trp Asp Val Asp Gly Gly Val Pro Ala
    235                 240                 245
gca ctt cca cag cct gat aca act gac gac gaa aat ccc gtc gct aat    819
Ala Leu Pro Gln Pro Asp Thr Thr Asp Asp Glu Asn Pro Val Ala Asn
250                 255                 260                 265
cct ggc cct agc gca cca aca gtg agt aaa ggt gct gat cag cca gaa    867
Pro Gly Pro Ser Ala Pro Thr Val Ser Lys Gly Ala Asp Gln Pro Glu
                270                 275                 280
gac gag gag atg ata cgc aaa aag gtg gag act tcg aaa gat ggt cca    915
Asp Glu Glu Met Ile Arg Lys Lys Val Glu Thr Ser Lys Asp Gly Pro
            285                 290                 295
cct aag gcg gtt cct tct gga aat gta agc gcc aga ggc ttt cct gcc    963
Pro Lys Ala Val Pro Ser Gly Asn Val Ser Ala Arg Gly Phe Pro Ala
        300                 305                 310
ttt ttg gaa gat gat atg agt gaa atg gat gcg cct gat ggc ttc cat   1011
Phe Leu Glu Asp Asp Met Ser Glu Met Asp Ala Pro Asp Gly Phe His
    315                 320                 325
gat tac tta acg agg gag cat gag aac aac ttc gac ttg acg cag ttg   1059
Asp Tyr Leu Thr Arg Glu His Glu Asn Asn Phe Asp Leu Thr Gln Leu
330                 335                 340                 345
ggg ctc gca ccc tca gtt tgactttttg ctggagtaga cgaatgcctc          1107
Gly Leu Ala Pro Ser Val
                350
accaacattt gtcactccat aatggtgtta tcatgtctgc atggattctt cagaatgttg 1167
attcgtgtac taggtagctt gtaaacaacg gagtggtggt cgttagatcc gtctggcgtg 1227
gaagttttga cagcgaacct gtgtcctaac gcggatgcgg gagagtcatt aacttccatg 1287
tcacacgatt tatacgat                                               1305
<210>18
<211>351
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>18
Met Gly Lys Leu Gln Asp Gly Ile Ala Ile Lys Arg Ile Asn Asp Ala
1               5                   10                  15
Ile Thr Thr Phe Lys Asn Tyr Lys Leu Gly Glu Leu Glu Gln Gly Gly
            20                  25                  30
Ser Met Ala Ile Asn Thr Leu Ser Asn Val Arg Ala His Val Gly Leu
        35                  40                  45
Ala Trp Pro Ala Ile Leu Arg Asn Cys Leu Ile His Thr Ser Ser His
    50                  55                  60
Leu Gly Phe Met Lys Phe Met Ile Asp Ile Ala Thr Thr Trp Lys Val
65                  70                  75                  80
Gly Ala Phe Thr Leu Leu Gly Ser Val Gly Asp Glu Asp Pro Phe Thr
                85                  90                  95
Asp Val Asp Leu Ile Tyr Thr Lys Thr Cys Leu His Leu Gly Leu Lys
            100                 105                 110
Asp Asn Asp Phe Leu Gln Phe Pro Glu Glu Phe Ala Tyr Glu Ala Asn
        115                 120                 125
Ser Phe Leu Glu Ala Gln Ser Met Asn Ala Arg Val Asp Met Leu Thr
    130                 135                 140
Gly Val His Asn Ile Glu Asp Lys Tyr Val Phe Arg Met Gln Ser Ile
145                 150                 155                 160
Ser Lys Phe Leu Lys Ala Tyr Tyr Thr Ala Ser Glu Asp Val Ala Tyr
                165                 170                 175
Leu Thr Gly Phe Ile Lys Pro Asp Asp Ser Lys Asp Ser Ile Leu Ser
            180                 185                 190
Ala Glu Leu Leu Lys Ala Gln Val Thr Ser Glu Val Leu Arg Val Arg
        195                 200                 205
Asn Leu Ile Thr Thr Lys Ile Gln Lys Tyr Ile Asn Leu Tyr Glu Asp
    210                 215                 220
Ser Gln Leu Pro His Phe Arg Gln Ala Ala Leu Ser Tyr Thr Gln Asp
225                 230                 235                 240
Trp Asp Val Asp Gly Gly Val Pro Ala Ala Leu Pro Gln Pro Asp Thr
                245                 250                 255
Thr Asp Asp Glu Asn Pro Val Ala Asn Pro Gly Pro Ser Ala Pro Thr
            260                 265                 270
Val Ser Lys Gly Ala Asp Gln Pro Glu Asp Glu Glu Met Ile Arg Lys
        275                 280                 285
Lys Val Glu Thr Ser Lys Asp Gly Pro Pro Lys Ala Val Pro Ser Gly
    290                 295                 300
Asn Val Ser Ala Arg Gly Phe Pro Ala Phe Leu Glu Asp Asp Met Ser
305                 310                 315                 320
Glu Met Asp Ala Pro Asp Gly Phe His Asp Tyr Leu Thr Arg Glu His
                325                 330                 335
Glu Asn Asn Phe Asp Leu Thr Gln Leu Gly Leu Ala Pro Ser Val
            340                 345                 350
<210>19
<211>1321
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(27)..(1085)
<400>19
ggtaaacttg cgcctttctg acgaac atg gaa gta gac act gct acg ttt gtt    53
                             Met Glu Val Asp Thr Ala Thr Phe Val
                             1               5
cgg ctt cat cat gag ctc ctt tgc gct cac gaa gga cca agt att att    101
Arg Leu His His Glu Leu Leu Cys Ala His Glu Gly Pro Ser Ile Ile
10                  15                  20                  25
tcc aag ttt gat gca att aaa aaa gtc aag ctt ggt aca ctt gct aat    149
Ser Lys Phe Asp Ala Ile Lys Lys Val Lys Leu Gly Thr Leu Ala Asn
                30                  35                  40
caa tct ggt ggt gtt aat aac atc acc gaa gct ttc ttg gct aag ctt    197
Gln Ser Gly Gly Val Asn Asn Ile Thr Glu Ala Phe Leu Ala Lys Leu
            45                  50                  55
cga aat ttt gaa aga aag tcc gaa gcc tat ctg gca tca gac tta gct    245
Arg Asn Phe Glu Arg Lys Ser Glu Ala Tyr Leu Ala Ser Asp Leu Ala
        60                  65                  70
gaa cgt gaa ttg act agg gat acg cac aag gcc att gtg ttt gta acc    293
Glu Arg Glu Leu Thr Arg Asp Thr His Lys Ala Ile Val Phe Val Thr
    75                  80                  85
aag tcc gta ttg tta gga ggg aaa agt ttg aaa gac ttg cta cct tat    341
Lys Ser Val Leu Leu Gly Gly Lys Ser Leu Lys Asp Leu Leu Pro Tyr
90                  95                  100                 105
gga gtg ata gtg tgt gct ttt atc ttt atc cct gaa act gct tct gtc    389
Gly Val Ile Val Cys Ala Phe Ile Phe Ile Pro Glu Thr Ala Ser Val
                110                 115                 120
ttg gac aat gtc cct gtc atg atc ggg aac caa aaa cga cca ttg aca    437
Leu Asp Asn Val Pro Val Met Ile Gly Asn Gln Lys Arg Pro Leu Thr
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gta gct ttg ata aaa tac atc gct aaa tct ttg aat tgc gat tta gtt    485
Val Ala Leu Ile Lys Tyr Ile Ala Lys Ser Leu Asn Cys Asp Leu Val
        140                 145                 150
ggt gac tca tat gat act ttt tat tat tgc aat tca tct gct tat ggt    533
Gly Asp Ser Tyr Asp Thr Phe Tyr Tyr Cys Asn Ser Ser Ala Tyr Gly
    155                 160                 165
aag aat ctg att tca gta tca gat aat gat ttc tct aat ccc caa agg    581
Lys Asn Leu Ile Ser Val Ser Asp Asn Asp Phe Ser Asn Pro Gln Arg
170                 175                 180                 185
gct ctc ctc tca gtg gga gat tta tgt tat caa gca gcg cgt tca ctc    629
Ala Leu Leu Ser Val Gly Asp Leu Cys Tyr Gln Ala Ala Arg Ser Leu
                190                 195                 200
cac gtt gca gca gct aat tat ata agg ata ttt gac cgc atg cct cct    677
His Val Ala Ala Ala Asn Tyr Ile Arg Ile Phe Asp Arg Met Pro Pro
            205                 210                 215
ggc ttt cag ccg tca aaa cac ctt ttc cgt att ata ggt gtg cta gat    725
Gly Phe Gln Pro Ser Lys His Leu Phe Arg Ile Ile Gly Val Leu Asp
        220                 225                 230
atg gaa act ttg aag act atg gtg aca tca aac atc gct cgt gag cca    773
Met Glu Thr Leu Lys Thr Met Val Thr Ser Asn Ile Ala Arg Glu Pro
    235                 240                 245
ggc atg ttt tgt cat gat aat gtt aaa gat gta ctg cac cgt ata ggt    821
Gly Met Phe Cys His Asp Asn Val Lys Asp Val Leu His Arg Ile Gly
250                 255                 260                 265
gtt tat tct cca aac cac cac ttt tcc gca gtc atc ttg tgg aaa ggg    869
Val Tyr Ser Pro Asn His His Phe Ser Ala Val Ile Leu Trp Lys Gly
                270                 275                 280
tgg gct tcc acg tat gca tat atg ttt aac caa gaa caa tta aat atg    917
Trp Ala Ser Thr Tyr Ala Tyr Met Phe Asn Gln Glu Gln Leu Asn Met
            285                 290                 295
cta tca gga aca tct ggt tta gct gga gac ttt ggc aag tac aaa ctg    965
Leu Ser Gly Thr Ser Gly Leu Ala Gly Asp Phe Gly Lys Tyr Lys Leu
        300                 305                 310
aca tat gga tcc act ttc gat gaa ggc gtt att cat gtg cag tat caa   1013
Thr Tyr Gly Ser Thr Phe Asp Glu Gly Val Ile His Val Gln Tyr Gln
    315                 320                 325
ttt gtt act cca gaa gtc gtc cgt aag cga aat ata tac ccg gat ctg   1061
Phe Val Thr Pro Glu Val Val Arg Lys Arg Asn Ile Tyr Pro Asp Leu
330                 335                 340                 345
tct gct ctt aaa ggc ggc ggt tcc taattgcact gatgatagtg cttcttgttt  1115
Ser Ala Leu Lys Gly Gly Gly Ser
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atcaaaatat tacggtggga tcatcaccat cgtgtaatac gttgacggat tgggtgaatt 1175
atccgtcttg caattgctga acaacctaac cagttgatct ccatgttcta aaactgcccg 1235
agcttcccat agggtgggtt agagtcgtgt gcgtacgcca cttagttcga ctaatgcgtg 1295
cccccacact gcgcagggat tctgat                                      1321
<210>20
<211>353
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>20
Met Glu Val Asp Thr Ala Thr Phe Val Arg Leu His His Glu Leu Leu
1               5                   10                  15
Cys Ala His Glu Gly Pro Ser Ile Ile Ser Lys Phe Asp Ala Ile Lys
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Lys Val Lys Leu Gly Thr Leu Ala Asn Gln Ser Gly Gly Val Asn Asn
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Ile Thr Glu Ala Phe Leu Ala Lys Leu Arg Asn Phe Glu Arg Lys Ser
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Glu Ala Tyr Leu Ala Ser Asp Leu Ala Glu Arg Glu Leu Thr Arg Asp
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Thr His Lys Ala Ile Val Phe Val Thr Lys Ser Val Leu Leu Gly Gly
                85                  90                  95
Lys Ser Leu Lys Asp Leu Leu Pro Tyr Gly Val Ile Val Cys Ala Phe
            100                 105                 110
Ile Phe Ile Pro Glu Thr Ala Ser Val Leu Asp Asn Val Pro Val Met
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    130                 135                 140
Ala Lys Ser Leu Asn Cys Asp Leu Val Gly Asp Ser Tyr Asp Thr Phe
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Asp Asn Asp Phe Ser Asn Pro Gln Arg Ala Leu Leu Ser Val Gly Asp
            180                 185                 190
Leu Cys Tyr Gln Ala Ala Arg Ser Leu His Val Ala Ala Ala Asn Tyr
        195                 200                 205
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Leu Phe Arg Ile Ile Gly Val Leu Asp Met Glu Thr Leu Lys Thr Met
225                 230                 235                 240
Val Thr Ser Asn Ile Ala Arg Glu Pro Gly Met Phe Cys His Asp Asn
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Val Lys Asp Val Leu His Arg Ile Gly Val Tyr Ser Pro Asn His His
            260                 265                 270
Phe Ser Ala Val Ile Leu Trp Lys Gly Trp Ala Ser Thr Tyr Ala Tyr
        275                 280                 285
Met Phe Asn Gln Glu Gln Leu Asn Met Leu Ser Gly Thr Ser Gly Leu
    290                 295                 300
Ala Gly Asp Phe Gly Lys Tyr Lys Leu Thr Tyr Gly Ser Thr Phe Asp
305                 310                 315                 320
Glu Gly Val Ile His Val Gln Tyr Gln Phe Val Thr Pro Glu Val Val
                325                 330                 335
Arg Lys Arg Asn Ile Tyr Pro Asp Leu Ser Ala Leu Lys Gly Gly Gly
            340                 345                 350
Ser
<210>21
<211>1067
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(30)..(572)
<400>21
ggtaaatgag tggaacatta cccttggct atg acg gcg agt gag tca ttc gtt     53
                                Met Thr Ala Ser Glu Ser Phe Val
                                1               5
ggc atg caa gtt ttg gct caa gac aaa gaa gtc aaa gcg acc ttt att    101
Gly Met Gln Val Leu Ala Gln Asp Lys Glu Val Lys Ala Thr Phe Ile
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gct cta gac agg aaa tta cct gcc aat ttg aaa gta cca tac atg aaa    149
Ala Leu Asp Arg Lys Leu Pro Ala Asn Leu Lys Val Pro Tyr Met Lys
25                  30                  35                  40
aat gct aaa tat aga act tgt att tgt cca agt tca aac cat tta gta    197
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Asp Asp Cys Val Cys Glu Asp Val Ile Ile Ala Tyr Thr Ala His Arg
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aat aat gcg gta gct gcc ctt ttg tat agt gac gga aac gtc ata cac    293
Asn Asn Ala Val Ala Ala Leu Leu Tyr Ser Asp Gly Asn Val Ile His
        75                  80                  85
agg agc ggt acg ttg aaa ccc aaa tcc caa aat cgg ttt gat cta cgt    341
Arg Ser Gly Thr Leu Lys Pro Lys Ser Gln Asn Arg Phe Asp Leu Arg
    90                  95                  100
ggt ttt tta acc agt gtt aac cca ggg gaa agt tca aga aat gaa gcc    389
Gly Phe Leu Thr Ser Val Asn Pro Gly Glu Ser Ser Arg Asn Glu Ala
105                 110                 115                 120
ggc gcc tcg aaa tca acg caa aaa acg tat gat aga aag gat aag tcc    437
Gly Ala Ser Lys Ser Thr Gln Lys Thr Tyr Asp Arg Lys Asp Lys Ser
                125                 130                 135
cct tct aaa agc aga aat tca aag aaa ggt gct aaa aaa tct tca tcc    485
Pro Ser Lys Ser Arg Asn Ser Lys Lys Gly Ala Lys Lys Ser Ser Ser
            140                 145                 150
gca aga aag aag aaa gaa tat tct tca aat tct gaa acg gat tta agt    533
Ala Arg Lys Lys Lys Glu Tyr Ser Ser Asn Ser Glu Thr Asp Leu Ser
        155                 160                 165
tct gac agc gac gcc aac act cgc aaa tca aaa cgc aag taaggcgtac       582
Ser Asp Ser Asp Ala Asn Thr Arg Lys Ser Lys Arg Lys
    170                 175                 180
tacatttaga gctcatattc tgtgagttct tcaccatgct tcaaatgaca aatacgatgc    642
taatcccttt gcggatttgt atcttgctgt ttgatcacgt agcttcgtac tctttctagt    702
atgaagatgg atttaattat ccaattgagt tgaggtgacg attcttacct cagttgatta    762
catccccttc ttgattataa gatctcatct cgtatgcgtc atgagtgtat cttgcaatca    822
aatttaaaat atgagctagt gaattgactt catcactatc ctcattatcg aatgctgaat    882
tatgcttgtt tcgaagtcat tcagtcgtcg gtaggcatcg gcactgtggg tcagtcgagt    942
tagccggtcc cggaagggtg caacccccac ctgaaagggc gtcaaccgga gccttccccc   1002
atgggcgaat atgtctggtg atgttgggca agtgacgaag ccaaaaacac ccactcatat   1062
atgat                                                               1067
<210>22
<211>181
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>22
Met Thr Ala Ser Glu Ser Phe Val Gly Met Gln Val Leu Ala Gln Asp
1               5                   10                  15
Lys Glu Val Lys Ala Thr Phe Ile Ala Leu Asp Arg Lys Leu Pro Ala
            20                  25                  30
Asn Leu Lys Val Pro Tyr Met Lys Asn Ala Lys Tyr Arg Thr Cys Ile
        35                  40                  45
Cys Pro Ser Ser Asn His Leu Val Asp Asp Cys Val Cys Glu Asp Val
    50                  55                  60
Ile Ile Ala Tyr Thr Ala His Arg Asn Asn Ala Val Ala Ala Leu Leu
65                  70                  75                  80
Tyr Ser Asp Gly Asn Val Ile His Arg Ser Gly Thr Leu Lys Pro Lys
                85                  90                  95
Ser Gln Asn Arg Phe Asp Leu Arg Gly Phe Leu Thr Ser Val Asn Pro
            100                 105                 110
Gly Glu Ser Ser Arg Asn Glu Ala Gly Ala Ser Lys Ser Thr Gln Lys
        115                 120                 125
Thr Tyr Asp Arg Lys Asp Lys Ser Pro Ser Lys Ser Arg Asn Ser Lys
    130                 135                 140
Lys Gly Ala Lys Lys Ser Ser Ser Ala Arg Lys Lys Lys Glu Tyr Ser
145                 150                 155                 160
Ser Asn Ser Glu Thr Asp Leu Ser Ser Asp Ser Asp Ala Asn Thr Arg
                165                 170                 175
Lys Ser Lys Arg Lys
            180
<210>23
<211>1066
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(42)..(980)
<400>23
ggtaaattga gcagtatttc aacattgttg ttggagttat a atg ttc aag agc ggg   56
                                              Met Phe Lys Ser Gly
                                              1               5
tcc ggt tct ttg aag cga agc ggg tcc att tca agt gtt aaa tca ttt    104
Ser Gly Ser Leu Lys Arg Ser Gly Ser Ile Ser Ser Val Lys Ser Phe
                10                  15                  20
tct ggc gat agt gaa aaa gga cta cca cct att tcc cga ggt agt gtg    152
Ser Gly Asp Ser Glu Lys Gly Leu Pro Pro Ile Ser Arg Gly Ser Val
            25                  30                  35
tcc ata tct agt cag aac tct gaa cca tta att gtt ccc gca agt agt    200
Ser Ile Ser Ser Gln Asn Ser Glu Pro Leu Ile Val Pro Ala Ser Ser
        40                  45                  50
tct tct ttt gcg gcg acc tct gac ttt gta cct gaa aag aca aag tcc    248
Ser Ser Phe Ala Ala Thr Ser Asp Phe Val Pro Glu Lys Thr Lys Ser
    55                  60                  65
gaa ggg aat ttg aaa aat aag tct tcc gtc ata acc gga aac ttt ggg    296
Glu Gly Asn Leu Lys Asn Lys Ser Ser Val Ile Thr Gly Asn Phe Gly
70                  75                  80                  85
tcc tcc gga cca act aat gct cat tac aat cag aac gct aat ggc gat    344
Ser Ser Gly Pro Thr Asn Ala His Tyr Asn Gln Asn Ala Asn Gly Asp
                90                  95                  100
cga ttg gct gaa aat ctt ttg ctt aag gaa tcg tcc aaa gga cga gga    392
Arg Leu Ala Glu Asn Leu Leu Leu Lys Glu Ser Ser Lys Gly Arg Gly
            105                 110                 115
tca agc aca cct gat gct aga cat act gcc aca gac tct cga ctc agt    440
Ser Ser Thr Pro Asp Ala Arg His Thr Ala Thr Asp Ser Arg Leu Ser
        120                 125                 130
caa gaa gtc aag cag ccg ttt tcc gag gaa aat gct agc ggc aac gat    488
Gln Glu Val Lys Gln Pro Phe Ser Glu Glu Asn Ala Ser Gly Asn Asp
    135                 140                 145
ctc aat act gga aga gga agt cac gga act ggt gac gga gtt gaa caa    536
Leu Asn Thr Gly Arg Gly Ser His Gly Thr Gly Asp Gly Val Glu Gln
150                 155                 160                 165
cac tac aaa ttt gac tgt gaa gaa gga atg tcc gcg tat cac aaa cgc    584
His Tyr Lys Phe Asp Cys Glu Glu Gly Met Ser Ala Tyr His Lys Arg
                170                 175                 180
gtt gta gat aca ttc ttt aaa tat ttt gaa tat ccg gct gaa gat ggg    632
Val Val Asp Thr Phe Phe Lys Tyr Phe Glu Tyr Pro Ala Glu Asp Gly
            185                 190                 195
cat tcc acc cta tat tcg gac gtt atg ttt tta tct ggt ggt ggc gat    680
His Ser Thr Leu Tyr Ser Asp Val Met Phe Leu Ser Gly Gly Gly Asp
        200                 205                 210
ctt ggt cta cta gtt atg agt aga tat caa gaa gtc atg acc tta cgg    728
Leu Gly Leu Leu Val Met Ser Arg Tyr Gln Glu Val Met Thr Leu Arg
    215                 220                 225
ttg cga agt gcc att tat ggc ata ttt tgc tac cta caa gcc tta acc    776
Leu Arg Ser Ala Ile Tyr Gly Ile Phe Cys Tyr Leu Gln Ala Leu Thr
230                 235                 240                 245
gcc tac cta acc tat ttc gat gtt aaa gta ggt caa gct gtt atg ttg    824
Ala Tyr Leu Thr Tyr Phe Asp Val Lys Val Gly Gln Ala Val Met Leu
                250                 255                 260
gat gag gag ttg gag aaa tac gaa atc cga ctc gat gtc gca caa gac    872
Asp Glu Glu Leu Glu Lys Tyr Glu Ile Arg Leu Asp Val Ala Gln Asp
            265                 270                 275
gac gat cca att gta ttt caa atc acg acg ggt gta ttc aca tcg gga    920
Asp Asp Pro Ile Val Phe Gln Ile Thr Thr Gly Val Phe Thr Ser Gly
        280                 285                 290
gta gct cac gat ctg cgt aaa ctt aca cag ata ctt gag gcc ttt tct    968
Val Ala His Asp Leu Arg Lys Leu Thr Gln Ile Leu Glu Ala Phe Ser
    295                 300                 305
ctt gaa cgg tga tatccagtct gggagtaatg aacccacgct ggggactcag       1020
Leu Glu Arg
310
ttatatctct tcgggagtga tataccgagt actgctcata actgat                1066
<210>24
<211>312
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>24
Met Phe Lys Ser Gly Ser Gly Ser Leu Lys Arg Ser Gly Ser Ile Ser
1               5                   10                  15
Ser Val Lys Ser Phe Ser Gly Asp Ser Glu Lys Gly Leu Pro Pro Ile
            20                  25                  30
Ser Arg Gly Ser Val Ser Ile Ser Ser Gln Asn Ser Glu Pro Leu Ile
        35                  40                  45
Val Pro Ala Ser Ser Ser Ser Phe Ala Ala Thr Ser Asp Phe Val Pro
    50                  55                  60
Glu Lys Thr Lys Ser Glu Gly Asn Leu Lys Asn Lys Ser Ser Val Ile
65                  70                  75                  80
Thr Gly Asn Phe Gly Ser Ser Gly Pro Thr Asn Ala His Tyr Asn Gln
                85                  90                  95
Asn Ala Asn Gly Asp Arg Leu Ala Glu Asn Leu Leu Leu Lys Glu Ser
            100                 105                 110
Ser Lys Gly Arg Gly Ser Ser Thr Pro Asp Ala Arg His Thr Ala Thr
        115                 120                 125
Asp Ser Arg Leu Ser Gln Glu Val Lys Gln Pro Phe Ser Glu Glu Asn
    130                 135                 140
Ala Ser Gly Asn Asp Leu Asn Thr Gly Arg Gly Ser His Gly Thr Gly
145                 150                 155                 160
Asp Gly Val Glu Gln His Tyr Lys Phe Asp Cys Glu Glu Gly Met Ser
                165                 170                 175
Ala Tyr His Lys Arg Val Val Asp Thr Phe Phe Lys Tyr Phe Glu Tyr
            180                 185                 190
Pro Ala Glu Asp Gly His Ser Thr Leu Tyr Ser Asp Val Met Phe Leu
        195                 200                 205
Ser Gly Gly Gly Asp Leu Gly Leu Leu Val Met Ser Arg Tyr Gln Glu
    210                 215                 220
Val Met Thr Leu Arg Leu Arg Ser Ala Ile Tyr Gly Ile Phe Cys Tyr
225                 230                 235                 240
Leu Gln Ala Leu Thr Ala Tyr Leu Thr Tyr Phe Asp Val Lys Val Gly
                245                 250                 255
Gln Ala Val Met Leu Asp Glu Glu Leu Glu Lys Tyr Glu Ile Arg Leu
            260                 265                 270
Asp Val Ala Gln Asp Asp Asp Pro Ile Val Phe Gln Ile Thr Thr Gly
        275                 280                 285
Val Phe Thr Ser Gly Val Ala His Asp Leu Arg Lys Leu Thr Gln Ile
    290                 295                 300
Leu Glu Ala Phe Ser Leu Glu Arg
305                 310
<210>25
<211>500
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(500)
<223>Trigger 12N
<400>25
atgttcaaga gcgggtccgg ttctttgaag cgaagcgggt ccatttcaag tgttaaatca    60
ttttctggcg atagtgaaaa aggactacca cctatttccc gaggtagtgt gtccatatct   120
agtcagaact ctgaaccatt aattgttccc gcaagtagtt cttcttttgc ggcgacctct   180
gactttgtac ctgaaaagac aaagtccgaa gggaatttga aaaataagtc ttccgtcata   240
accggaaact ttgggtcctc cggaccaact aatgctcatt acaatcagaa cgctaatggc   300
gatcgattgg ctgaaaatct tttgcttaag gaatcgtcca aaggacgagg atcaagcaca   360
cctgatgcta gacatactgc cacagactct cgactcagtc aagaagtcaa gcagccgttt   420
tccgaggaaa atgctagcgg caacgatctc aatactggaa gaggaagtca cggaactggt   480
gacggagttg aacaacacta                                               500
<210>26
<211>509
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(509)
<223>Trigger 12C
<400>26
atgctagcgg caacgatctc aatactggaa gaggaagtca cggaactggt gacggagttg    60
aacaacacta caaatttgac tgtgaagaag gaatgtccgc gtatcacaaa cgcgttgtag   120
atacattctt taaatatttt gaatatccgg ctgaagatgg gcattccacc ctatattcgg   180
acgttatgtt tttatctggt ggtggcgatc ttggtctact agttatgagt agatatcaag   240
aagtcatgac cttacggttg cgaagtgcca tttatggcat attttgctac ctacaagcct   300
taaccgccta cctaacctat ttcgatgtta aagtaggtca agctgttatg ttggatgagg   360
agttggagaa atacgaaatc cgactcgatg tcgcacaaga cgacgatcca attgtatttc   420
aaatcacgac gggtgtattc acatcgggag tagctcacga tctgcgtaaa cttacacaga   480
tacttgaggc cttttctctt gaacggtga                                     509
<210>27
<211>500
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(500)
<223>Trigger 4N
<400>27
atgaaccaat ctcgaagctt tgttacgggg agaggacgcg acttgtctcg gactccttcg    60
gctttaagct cgaattcgga aactccagga tcaatgagtt caccatctga agggaagacg   120
aacgcttggg ttaactcggc gtacgtcagc aactttcctg cgttgggcca atcgcagggg   180
ttgccatccc ataaatgttc agctttggct ctgcgtagtt cacagactac gtacatcata   240
aactttccac gccagcactg gaacatcatg acttttccaa atcagtctga ggcgattctg   300
gctaatgttg cttcatacgc aaaagacctt gacggaaaga actccttcgc cgtatccgat   360
acgctcaaga tagccttggt cctgtcgcct acggagaaga gactgttccg gaatgatact   420
ttaagccacc tcgctgatgt tcacatgtac gtgttggatc cagctgaggc ggaagggaag   480
aatttgtctg actcggagac                                               500
<210>28
<211>505
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(505)
<223>Trigger 4C
<400>28
ggaacatcct aacttgttca cttctgagga gctgggcgcc aaaatcaagg tgctcacgaa    60
attgctcatt cgctgtgcca cttccatgtc tcaggacgga tctaacgcat tctgtcctaa   120
gcatcccaaa gtgaagatcg tgcacgaatc gaacgccaca tcctacgtcc tgttcaatcg   180
tccgaacggg atggtggcta cgaatctaat tctctcagat ttgcccgatg atgattgtcc   240
aacgtgctgg atacttaagt tagcaattag cgaagctagg ttctatgctc ttgacggtca   300
tcaccgctgt cgctctggaa taataacatc cagtgtcttc agatatctcg cttccatagt   360
tattagagtg aggatggatt ccgtgctcgc tccctctgac gcgtcatcaa ctgatcacgc   420
cgctctcgtc aatatgatgt gcggcattat ccaaaacaca cctgcgatgc gacagctcgg   480
catatcgaca ggtagtgaga aagtg                                         505
<210>29
<211>500
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(500)
<223>Trigger 1
<400>29
atggatcttg cgaggtcgga tatcattccg catttgctat gcctcttcca agagataatc    60
caagccaaca tccaaaaagt atctgaggcg tacgatttgg agttgaaaat aatgaacatt   120
ttgacgttgt ggcgaaacgg atctgacaat ctgatttcag acaacgatga ttacatgaag   180
aagggactat tcttcagtcg gagtaatgat cccttagctt tacaggctcg ttatgcccaa   240
atgtatgatg atctgtttaa gctaaacaac tataaagtgc cagatgatgt tgtgcgcaag   300
catgacacca agatcttgga cataatatta aaagagtctt ccgtgccatt ttggtatgac   360
atatcggatg acgaagctca tgaatcgatg ctgcctgaat tcagactgca agacattcat   420
gagttcagat tgaacttgaa gcgcgtagct gtagtacctg acgagtctga agagattcag   480
atggatgaaa gtcagagtga                                               500
<210>30
<211>500
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(500)
<223>Trigger 2
<400>30
atggcttatc ctaacgacgt cagaaatgtt tgggatgtgt acaacgtgtt ccgggacgtg    60
ccaaaccgtg aacatttgat tcgagatatc cgcaatgggc tggttacggt ccggaatctc   120
acaaatatgc ttactaatat ggagcgcgat gatcaattga tcattgctca actatccaat   180
atgatgaaat cactatctat tggagttgag aaggctcaaa atgaacttag caaattgaag   240
actacggatg ccgaccgtgc cgcagtctta gcagcttacc aaacttcggt ccttaacata   300
gagcgaaaca ctatgttatt gactgggtac ttcaagcagt tagtcttaga cttaactggc   360
tatgtaggtg ccagtgtata tcctatctta cctttcatga ttacggggga tcagtctatg   420
atggttgatt ccgttaaggt taacatgaaa aatgtatttg atgataagca tgagcaggag   480
atagtcctac ctattcatcc                                               500
<210>31
<211>500
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(500)
<223>Trigger 3
<400>31
atggacagta ccggccgagc atatgacggt gcgtctgaat tcaaaagtgt ccttgttacc    60
gagggtactt cacactacac accagtggaa gtatataaca tcctcgatga attgaaaacc   120
attaaaataa cgtctaccat agctgagcaa tctgtggtgt cacgtactcc aattcctctc   180
tcaaaaattg gtttacaaga tgttaagaaa ttgtttgaca ttaatgtcat aaaatgtggc   240
tcatctttgc ggatagtgga cgaacctcaa gttacgttca ttgtatcgta tgcaaaggat   300
atctatgata aattcatgtg cattgaacat gactccgcct acgagccgag tctaacgatg   360
catagagtgc gagttattta ctcgatgctc aatgactatt gtgcaaaaat gatttcggag   420
gtaccctacg aaagtagctt tgtaggggag ctccctgtca agtcagtgac tctaaataaa   480
ctgggtgaca gaaatatgga                                               500
<210>32
<211>520
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(520)
<223>Trigger 5
<400>32
atgtcgaacc cggactattg catacctaat ttctctcaaa cggtgaatga gagaacgata    60
attgatatat ttacgatttg caggtaccgt tcacctctag tggtattctg ccttagccac   120
aatgaactgg ctaagaaata tgctcaagat gtttccatga gtagtggaac tcacgtccat   180
atcattgatg gaagtgtgga aattactgct tctttatata ggacatttcg tactattgca   240
acccaactgc ttggaaggat gcaaatagtc gtatttgtca ccgtggataa gtctgtcgta   300
tccacgcaag taatgaaaag tattgcctgg gcttttcggg gctcatttgt cgaactccgg   360
aatcagtcgg ttgattcgtc aaccttggta agtaagcttg agaacttggt atcgtttgct  420
cctttgtata acgtgcccaa atgtggtcca gattattatg gtcccactgt atactctgaa  480
ctattatcct tggctacaaa tgctcgcact cattggtatg                        520
<210>33
<211>530
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(530)
<223>Trigger 6
<400>33
atggacacag aaactctttg cctcattaca gctgactccg gaaaggtgta tggcattttg   60
aaagctattt tcggagatga gtccgaaatt gttaaaaaac tcatcgattt tgatgtaagc  120
ataagagtgg ttcctcttaa cttagggcta cttaatatct ttcgggataa tgctgctgat  180
ttagataacg cggatcttat gaaacgcagg ttcggtaata caatgggctc gcgcattgtt  240
gaagcttacc gacgttcaca agattcgaag tacaaacgca acgtttgtaa gaccactgga  300
ttgttggttt gcttatttgg tggaggactt gggctgtccc gcgaagccga taagcacaaa  360
aagtttgttg agggtaaatc tcacaacata ctttctgtcg agatgctcaa gcgtgcgctt  420
agtataggtg gtcaaaatgt cgatgctaat aagatatcgt cattttggtt cgctacttac  480
actattttca caactgtcta ctctcctaga ctgagatatc aggctggatc             530
<210>34
<211>530
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(530)
<223>Trigger 7
<400>34
atgtctgcga ttgtaggcct ctgcctccta tcggaaaaag tcgttttatc tagaagcctg   60
acagacgagg tttctaaatt gtataaattg aatcggggca acgtcaaaga accccgaaag  120
tatgctactg aacgtatgtc gacgcagtct aaacctgtgg cgttgcaggt tcctgtctcg  180
acaatagttc tagactataa agatgaggat tttataaaac aaaacccaac ttatagtgcc  240
atggatataa ttggaagccc tagtaatacg gctccgcaaa cggcatttca aagtataatg  300
ccgtctctat ctgcgctatt taatacccct ttcatccaag gggcattccg gcaccggatc  360
atatcaagta tgggacccga aatttcatac ttagttatgg ttatcggacc gccaagtggt  420
tttatggata cgccgaatgt atcgtcagct cagtcatctg tccatactgt gtcaaatgct  480
gatgttgact tgaatgatat tatcgccatt aactcgacga tggctaagag             530
<210>35
<211>524
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(524)
<223>Trigger 9
<400>35
atgggtaagc tccaagatgg aatcgccatc aagcggatca acgacgcgat taccactttc   60
aaaaattaca agcttggtga actggaacag ggcggctcaa tggccatcaa cacattgagt  120
aacgtccgtg cccatgttgg gctggcttgg ccggccatct tgcgaaattg tttaatacac  180
acttcatccc atcttgggtt catgaagttt atgattgata ttgctactac ctggaaagtt  240
ggtgctttca ctcttctggg tagcgttggt gacgaagatc ccttcactga cgttgatttg  300
atttacacta agacctgctt gcatttgggt cttaaggaca atgattttct gcaattcccg  360
gaagaatttg cttatgaggc gaattcgttc ctagaagcgc agtcgatgaa tgctagggtg  420
gacatgctca ctggtgtcca caatattgaa gacaaatacg ttttcaggat gcagtctata  480
tctaagtttt tgaaggctta ctatactgct tcagaagacg ttgc                   524
<210>36
<211>560
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(560)
<223>Trigger 10
<400>36
atggaagtag acactgctac gtttgttcgg cttcatcatg agctcctttg cgctcacgaa   60
ggaccaagta ttatttccaa gtttgatgca attaaaaaag tcaagcttgg tacacttgct  120
aatcaatctg gtggtgttaa taacatcacc gaagctttct tggctaagct tcgaaatttt  180
gaaagaaagt ccgaagccta tctggcatca gacttagctg aacgtgaatt gactagggat  240
acgcacaagg ccattgtgtt tgtaaccaag tccgtattgt taggagggaa aagtttgaaa  300
gacttgctac cttatggagt gatagtgtgt gcttttatct ttatccctga aactgcttct  360
gtcttggaca atgtccctgt catgatcggg aaccaaaaac gaccattgac agtagctttg  420
ataaaataca tcgctaaatc tttgaattgc gatttagttg gtgactcata tgatactttt  480
tattattgca attcatctgc ttatggtaag aatctgattt cagtatcaga taatgatttc  540
tctaatcccc aaagggctct                                              560
<210>37
<211>520
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(520)
<223>Trigger 11
<400>37
atgacggcga gtgagtcatt cgttggcatg caagttttgg ctcaagacaa agaagtcaaa     60
gcgaccttta ttgctctaga caggaaatta cctgccaatt tgaaagtacc atacatgaaa    120
aatgctaaat atagaacttg tatttgtcca agttcaaacc atttagtaga tgattgtgta    180
tgcgaagatg tgattattgc ttataccgca catagaaata atgcggtagc tgcccttttg    240
tatagtgacg gaaacgtcat acacaggagc ggtacgttga aacccaaatc ccaaaatcgg    300
tttgatctac gtggtttttt aaccagtgtt aacccagggg aaagttcaag aaatgaagcc    360
ggcgcctcga aatcaacgca aaaaacgtat gatagaaagg ataagtcccc ttctaaaagc    420
agaaattcaa agaaaggtgc taaaaaatct tcatccgcaa gaaagaagaa agaatattct    480
tcaaattctg aaacggattt aagttctgac agcgacgcca                          520
<210>38
<211>23
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>38
caccatgttc aagagcgggt ccg                                             23
<210>39
<211>21
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>39
tagtgttgtt caactccgtc a                                               21
<210>40
<211>24
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>40
caccatgcta gcggcaacga tctc                                            24
<210>41
<211>21
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>41
tcaccgttca agagaaaagg t                                               21
<210>42
<211>26
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>42
caccatgaac caatctcgaa gctttg                                        26
<210>43
<211>21
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>43
gtctccgagt cagacaaatt c                                             21
<210>44
<211>25
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>44
caccggaaca tcctaacttg ttcac                                         25
<210>45
<211>20
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>45
cgctttctca ctacctgtcg                                               20
<210>46
<211>926
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>修剪序列
<400>46
atctacccgc ttcgcgtcgg catccggtca gtggcagtga agggcgaaca gttcctgatt   60
aaccacaaac cgttctactt tactggcttt ggtcgtcatg aagatgcgga cttacgtggc  120
aaaggattcg ataacgtgct gatggtgcac gaccacgcat taatggactg gattggggcc  180
aactcctacc gtacctcgca ttacccttac gctgaagaga tgctcgactg ggcagatgaa  240
catggcatcg tggtgattga tgaaactgct gctgtcggct ttaacctctc tttaggcatt  300
ggtttcgaag cgggcaacaa gccgaaagaa ctgtacagcg aagaggcagt caacggggaa  360
actcagcaag cgcacttaca ggcgattaaa gagctgatag cgcgtgacaa aaaccaccca  420
agcgtggtga tgtggagtat tgccaacgaa ccggataccc gtccgcaagt gcacgggaat  480
atttcgccac tggcggaagc aacgcgtaaa ctcgacccga cgcgtccgat cacctgcgtc  540
aatgtaatgt tctgcgacgc tcacaccgat accatcagcg atctctttga tgtgctgtgc  600
ctgaaccgtt attacggatg gtatgtccaa agcggcgatt tggaaacggc agagaaggta  660
ctggaaaaag aacttctggc ctggcaggag aaactgcatc agccgattat catcaccgaa  720
tacggcgtgg atacgttagc cgggctgcac tcaatgtaca ccgacatgtg gagtgaagag  780
tatcagtgtg catggctgga tatgtatcac cgcgtctttg atcgcgtcag cgccgtcgtc  840
ggtgaacagg tatggaattt cgccgatttt gcgacctcgc aaggcatatt gcgcgttggc  900
ggtaacaaga aagggatctt cactcg                                       926
<210>47
<211>43
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>47
caaagcttcg agattggttc attagtgttg ttcaactccg tca                     43
<210>48
<211>43
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>引物
<400>48
tgacggagtt gaacaacact aatgaaccaa tctcgaagct ttg                     43
<210>49
<211>522
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>full sequence of Trigger 12N+entire sequence of Trigger 4N
<400>49
atgttcaaga gcgggtccgg ttctttgaag cgaagcgggt ccatttcaag tgttaaatca   60
ttttctggcg atagtgaaaa aggactacca cctatttccc gaggtagtgt gtccatatct  120
agtcagaact ctgaaccatt aattgttccc gcaagtagtt cttcttttgc ggcgacctct  180
gactttgtac ctgaaaagac aaagtccgaa gggaatttga aaaataagtc ttccgtcata  240
accggaaact ttgggtcctc cggaccaact aatgctcatt acaatcagaa cgctaatggc  300
gatcgattgg ctgaaaatct tttgcttaag gaatcgtcca aaggacgagg atcaagcaca  360
cctgatgcta gacatactgc cacagactct cgactcagtc aagaagtcaa gcagccgttt  420
tccgaggaaa atgctagcgg caacgatctc aatactggaa gaggaagtca cggaactggt  480
gacggagttg aacaacacta atgaaccaat ctcgaagctt tg                     522
<210>50
<211>521
<212>DNA
<213>人工的
<223>partial sequence of Trigger 12N+entire sequence of Trigger 4N
<400>50
tgacggagtt gaacaacact aatgaaccaa tctcgaagct ttgttacggg gagaggacgc   60
gacttgtctc ggactccttc ggctttaagc tcgaattcgg aaactccagg atcaatgagt  120
tcaccatctg aagggaagac gaacgcttgg gttaactcgg cgtacgtcag caactttcct  180
gcgttgggcc aatcgcaggg gttgccatcc cataaatgtt cagctttggc tctgcgtagt  240
tcacagacta cgtacatcat aaactttcca cgccagcact ggaacatcat gacttttcca  300
aatcagtctg aggcgattct gactaatgtt gcctcatacg caaaagacct tgacgggaag  360
aactccttcg ccatatccga tacgctcaag atagccttgg tcctgtcgcc tacggagaag  420
agactgttcc ggaatgatac gttaagtcac ctcgctgatg ttcacatgta cgtgttagac  480
ccagctgagg cggaagggaa gaatttgtct gactcggaga c                      521
<210>51
<211>1000
<212>DNA
<213>人工的
<220>
<223>entire sequence of Trigger 12N+entire sequence of Trigger 4N
<400>51
atgttcaaga gcgggtccgg ttctttgaag cgaagcgggt ccatttcaag tgttaaatca   60
ttttctggcg atagtgaaaa aggactacca cctatttccc gaggtagtgt gtccatatct  120
agtcagaact ctgaaccatt aattgttccc gcaagtagtt cttcttttgc ggcgacctct  180
gactttgtac ctgaaaagac aaagtccgaa gggaatttga aaaataagtc ttccgtcata  240
accggaaact ttgggtcctc cggaccaact aatgctcatt acaatcagaa cgctaatggc  300
gatcgattgg ctgaaaatct tttgcttaag gaatcgtcca aaggacgagg atcaagcaca  360
cctgatgcta gacatactgc cacagactct cgactcagtc aagaagtcaa gcagccgttt  420
tccgaggaaa atgctagcgg caacgatctc aatactggaa gaggaagtca cggaactggt  480
gacggagttg aacaacacta atgaaccaat ctcgaagctt tgttacgggg agaggacgcg  540
acttgtctcg gactccttcg gctttaagct cgaattcgga aactccagga tcaatgagtt  600
caccatctga agggaagacg aacgcttggg ttaactcggc gtacgtcagc aactttcctg  660
cgttgggcca atcgcagggg ttgccatccc ataaatgttc agctttggct ctgcgtagtt  720
cacagactac gtacatcata aactttccac gccagcactg gaacatcatg acttttccaa  780
atcagtctga ggcgattctg actaatgttg cctcatacgc aaaagacctt gacgggaaga  840
actccttcgc catatccgat acgctcaaga tagccttggt cctgtcgcct acggagaaga  900
gactgttccg gaatgatacg ttaagtcacc tcgctgatgt tcacatgtac gtgttagacc  960
cagctgaggc ggaagggaag aatttgtctg actcggagac                       1000
<210>52
<211>976
<212>DNA
<213>玉蜀黍(Zea mays)
<220>
<221>启动子
<222>(1)..(976)
<400>52
gtgcagcgtg acccggtcgt gcccctctct agagataatg agcattgcat gtctaagtta    60
taaaaaatta ccacatattt tttttgtcac acttgtttga agtgcagttt atctatcttt    120
atacatatat ttaaacttta ctctacgaat aatataatct atagtactac aataatatca    180
gtgttttaga gaatcatata aatgaacagt tagacatggt ctaaaggaca attgagtatt    240
ttgacaacag gactctacag ttttatcttt ttagtgtgca tgtgttctcc tttttttttg    300
caaatagctt cacctatata atacttcatc cattttatta gtacatccat ttagggttta    360
gggttaatgg tttttataga ctaatttttt tagtacatct attttattct attttagcct    420
ctaaattaag aaaactaaaa ctctatttta gtttttttat ttaataattt agatataaaa    480
tagaataaaa taaagtgact aaaaattaaa caaataccct ttaagaaatt aaaaaaacta    540
aggaaacatt tttcttgttt cgagtagata atgccagcct gttaaacgcc gtcgacgagt    600
ctaacggaca ccaaccagcg aaccagcagc gtcgcgtcgg gccaagcgaa gcagacggca    660
cggcatctct gtcgctgcct ctggacccct ctcgagagtt ccgctccacc gttggacttg    720
ctccgctgtc ggcatccaga aattgcgtgg cggagcggca gacgtgagcc ggcacggcag    780
gcggcctcct cctcctctca cggcacggca gctacggggg attcctttcc caccgctcct    840
tcgctttccc ttcctcgccc gccgtaataa atagacaccc cctccacacc ctctttcccc    900
aacctcgtgt tgttcggagc gcacacacac acaaccagat ctcccccaaa tccacccgtc    960
ggcacctccg cttcaa                                                    976
<210>53
<211>1424
<212>DNA
<213>水稻矮缩病毒
<220>
<221>CDS
<222>(24)..(1286)
<400>53
ggcaaaaatc gccacctgcc act atg tca cgc cag atg tgg tta gac aca agt    53
                          Met Ser Arg Gln Met Trp Leu Asp Thr Ser
                          1               5                   10
gct ctc ctt gaa gcc att tcc gaa tat gtc gtt cgg tgc aac gga gat     101
Ala Leu Leu Glu Ala Ile Ser Glu Tyr Val Val Arg Cys Asn Gly Asp
                15                  20                  25
act ttc tcc ggg ctc aca aca ggt gat ttt aat gca ctc tcg aac atg     149
Thr Phe Ser Gly Leu Thr Thr Gly Asp Phe Asn Ala Leu Ser Asn Met
            30                  35                  40
ttc aca cag ctc tca gtt tcg agc gct gga tat gtt agt gat ccg aga     197
Phe Thr Gln Leu Ser Val Ser Ser Ala Gly Tyr Val Ser Asp Pro Arg
        45                  50                  55
gta cct ttg caa act atg tca aat atg ttt gta tcc ttt atc acg tcg     245
Val Pro Leu Gln Thr Met Ser Asn Met Phe Val Ser Phe Ile Thr Ser
    60                  65                  70
aca gac cgc tgt gga tac atg ctt agg aag act tgg ttc aat agc gat    293
Thr Asp Arg Cys Gly Tyr Met Leu Arg Lys Thr Trp Phe Asn Ser Asp
75                  80                  85                  90
acc aag cct acc gtt tca gat gat ttt atc act acg tac att agg cca    341
Thr Lys Pro Thr Val Ser Asp Asp Phe Ile Thr Thr Tyr Ile Arg Pro
                95                  100                 105
cgt cta caa gtg cca atg tcc gat acc gtc aga caa tta aat aat ctg    389
Arg Leu Gln Val Pro Met Ser Asp Thr Val Arg Gln Leu Asn Asn Leu
            110                 115                 120
tcg tta cag cca tca gct aag cca aag ctg tat gag cgc caa aat gca    437
Ser Leu Gln Pro Ser Ala Lys Pro Lys Leu Tyr Glu Arg Gln Asn Ala
        125                 130                 135
atc atg aag ggt tta gat ata cct tat tct gaa ccc att gaa cca tgc    485
Ile Met Lys Gly Leu Asp Ile Pro Tyr Ser Glu Pro Ile Glu Pro Cys
    140                 145                 150
aaa ttg ttt cgg tct gtt gcg ggg cag act ggg aac ata ccg atg atg    533
Lys Leu Phe Arg Ser Val Ala Gly Gln Thr Gly Asn Ile Pro Met Met
155                 160                 165                 170
ggt ata ctc gct acg ccc cct gct cag cag cag ccc ttc ttc gtc gcc    581
Gly Ile Leu Ala Thr Pro Pro Ala Gln Gln Gln Pro Phe Phe Val Ala
                175                 180                 185
gaa aga agg aga att ttg ttt gga atc cgc tca aat gcg gct att cca    629
Glu Arg Arg Arg Ile Leu Phe Gly Ile Arg Ser Asn Ala Ala Ile Pro
            190                 195                 200
gcc ggg gca tat caa ttt gtt gtt cct gct tgg gca tca gtg cta agt    677
Ala Gly Ala Tyr Gln Phe Val Val Pro Ala Trp Ala Ser Val Leu Ser
        205                 210                 215
gtc act ggt gca tat gtc tat ttt aca aac tcg ttc ttt gga acg ata    725
Val Thr Gly Ala Tyr Val Tyr Phe Thr Asn Ser Phe Phe Gly Thr Ile
    220                 225                 230
ata gct ggc gtt acg gcc act gca act gcc gcg gac gct gct act aca    773
Ile Ala Gly Val Thr Ala Thr Ala Thr Ala Ala Asp Ala Ala Thr Thr
235                 240                 245                 250
ttt act gtt ccg act gac gcg aac aac ctc cct gtc caa acg gat tca    821
Phe Thr Val Pro Thr Asp Ala Asn Asn Leu Pro Val Gln Thr Asp Ser
                255                 260                 265
cgt ttg tcg ttc tca ctt ggt ggt ggg aac atc aac ctg gaa ctg ggt    869
Arg Leu Ser Phe Ser Leu Gly Gly Gly Asn Ile Asn Leu Glu Leu Gly
            270                 275                 280
gtg gct aaa acg gga ttt tgt gtc gca att gaa ggc gag ttt acg ata    917
Val Ala Lys Thr Gly Phe Cys Val Ala Ile Glu Gly Glu Phe Thr Ile
        285                 290                 295
ttg gca aat cgt agt caa gcc tac tat acg ttg aat tcg ata act cag    965
Leu Ala Asn Arg Ser Gln Ala Tyr Tyr Thr Leu Asn Ser Ile Thr Gln
    300                 305                 310
act ccg aca tca att gat gat ttc gat gtg tct gac ttt ttg acg act   1013
Thr Pro Thr Ser Ile Asp Asp Phe Asp Val Ser Asp Phe Leu Thr Thr
315                 320                 325                 330
ttt ctg tcg cag ctc cga gct tgt gga cag tat gaa att ttc agt gat   1061
Phe Leu Ser Gln Leu Arg Ala Cys Gly Gln Tyr Glu Ile Phe Ser Asp
                335                 340                 345
gct atg gac cag ctg act aat agt ttg atc acg aac tat atg gat ccg   1109
Ala Met Asp Gln Leu Thr Asn Ser Leu Ile Thr Asn Tyr Met Asp Pro
            350                 355                 360
ccg gcc ata cct gca ggt ttg gca ttc act tca cca tgg ttt cga ttc    1157
Pro Ala Ile Pro Ala Gly Leu Ala Phe Thr Ser Pro Trp Phe Arg Phe
        365                 370                 375
tct gaa agg gca aga act att ctt gcg ctt cag aat gtc gat ttg aat    1205
Ser Glu Arg Ala Arg Thr Ile Leu Ala Leu Gln Asn Val Asp Leu Asn
    380                 385                 390
ata aga aag ctg ata gta cgg cat ctt tgg gtc atc act tcc tta att    1253
Ile Arg Lys Leu Ile Val Arg His Leu Trp Val Ile Thr Ser Leu Ile
395                 400                 405                 410
gcc gta ttt gga aga tac tat cga cca aat tag tgatatcata taaggaatct  1306
Ala Val Phe Gly Arg Tyr Tyr Arg Pro Asn
                415                 420
gctggtgcgc atacgtgtgt aaccgcggag gctgggtcaa ccagataggg gtagccgtgg  1366
aggaaatgcc cggtcctgaa tctggaacgc tcgtagtcag gtggacggtt tatatgat    1424
<210>54
<211>420
<212>PRT
<213>水稻矮缩病毒
<400>54
Met Ser Arg Gln Met Trp Leu Asp Thr Ser Ala Leu Leu Glu Ala Ile
1               5                   10                  15
Ser Glu Tyr Val Val Arg Cys Asn Gly Asp Thr Phe Ser Gly Leu Thr
            20                  25                  30
Thr Gly Asp Phe Asn Ala Leu Ser Asn Met Phe Thr Gln Leu Ser Val
        35                  40                  45
Ser Ser Ala Gly Tyr Val Ser Asp Pro Arg Val Pro Leu Gln Thr Met
    50                  55                  60
Ser Asn Met Phe Val Ser Phe Ile Thr Ser Thr Asp Arg Cys Gly Tyr
65                  70                  75                  80
Met Leu Arg Lys Thr Trp Phe Asn Ser Asp Thr Lys Pro Thr Val Ser
                85                  90                  95
Asp Asp Phe Ile Thr Thr Tyr Ile Arg Pro Arg Leu Gln Val Pro Met
            100                 105                 110
Ser Asp Thr Val Arg Gln Leu Asn Asn Leu Ser Leu Gln Pro Ser Ala
        115                 120                 125
Lys Pro Lys Leu Tyr Glu Arg Gln Asn Ala Ile Met Lys Gly Leu Asp
    130                 135                 140
Ile Pro Tyr Ser Glu Pro Ile Glu Pro Cys Lys Leu Phe Arg Ser Val
145                 150                 155                 160
Ala Gly Gln Thr Gly Asn Ile Pro Met Met Gly Ile Leu Ala Thr Pro
                165                 170                 175
Pro Ala Gln Gln Gln Pro Phe Phe Val Ala Glu Arg Arg Arg Ile Leu
            180                 185                 190
Phe Gly Ile Arg Ser Asn Ala Ala Ile Pro Ala Gly Ala Tyr Gln Phe
        195                 200                 205
Val Val Pro Ala Trp Ala Ser Val Leu Ser Val Thr Gly Ala Tyr Val
    210                 215                 220
Tyr Phe Thr Asn Ser Phe Phe Gly Thr Ile Ile Ala Gly Val Thr Ala
225                 230                 235                 240
Thr Ala Thr Ala Ala Asp Ala Ala Thr Thr Phe Thr Val Pro Thr Asp
                245                 250                 255
Ala Asn Asn Leu Pro Val Gln Thr Asp Ser Arg Leu Ser Phe Ser Leu
            260                 265                 270
Gly Gly Gly Asn Ile Asn Leu Glu Leu Gly Val Ala Lys Thr Gly Phe
        275                 280                 285
Cys Val Ala Ile Glu Gly Glu Phe Thr Ile Leu Ala Asn Arg Ser Gln
    290                 295                 300
Ala Tyr Tyr Thr Leu Asn Ser Ile Thr Gln Thr Pro Thr Ser Ile Asp
305                 310                 315                 320
Asp Phe Asp Val Ser Asp Phe Leu Thr Thr Phe Leu Ser Gln Leu Arg
                325                 330                 335
Ala Cys Gly Gln Tyr Glu Ile Phe Ser Asp Ala Met Asp Gln Leu Thr
            340                 345                 350
Asn Ser Leu Ile Thr Asn Tyr Met Asp Pro Pro Ala Ile Pro Ala Gly
        355                 360                 365
Leu Ala Phe Thr Ser Pro Trp Phe Arg Phe Ser Glu Arg Ala Arg Thr
    370                 375                 380
Ile Leu Ala Leu Gln Asn Val Asp Leu Asn Ile Arg Lys Leu Ile Val
385                 390                 395                 400
Arg His Leu Trp Val Ile Thr Ser Leu Ile Ala Val Phe Gly Arg Tyr
                405                 410                 415
Tyr Arg Pro Asn
            420