《一种可用作WNT信号途径激活剂的化合物及其制备与应用.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《一种可用作WNT信号途径激活剂的化合物及其制备与应用.pdf(23页珍藏版)》请在专利查询网上搜索。
1、(10)申请公布号 CN 104031055 A (43)申请公布日 2014.09.10 CN 104031055 A (21)申请号 201310073332.8 (22)申请日 2013.03.07 C07D 491/056(2006.01) C07D 519/00(2006.01) A61K 31/4741(2006.01) A61K 31/473(2006.01) A61P 25/28(2006.01) A61P 19/02(2006.01) A61P 29/00(2006.01) A61P 19/10(2006.01) A61P 7/00(2006.01) (71)申请人 中国科学。
2、院上海生命科学研究院 地址 200031 上海市徐汇区岳阳路 320 号 申请人 中国科学院昆明植物研究所 (72)发明人 李林 汪胜 郝小江 潘巍峻 尹俊林 聂芬 陈铎之 (74)专利代理机构 上海光华专利事务所 31219 代理人 许亦琳 余明伟 (54) 发明名称 一种可用作 Wnt 信号途径激活剂的化合物及 其制备与应用 (57) 摘要 本发明提供一种用作 Wnt 信号途径激活剂的 化合物及其制备与应用。本发明的化合物为式 (I) 或式 (II) 的化合物。本发明的化合物可用于 制备调节经典 Wnt 信号途径的药物并可用于研究 经典 Wnt 信号途径。本发明也为筛选调节 Wnt 信 号。
3、途径的药物、 预防和治疗经典 Wnt 信号途径相 关疾病的药物、 研究 Wnt 信号途径在干细胞中的 应用提供了新的思路。 (51)Int.Cl. 权利要求书 3 页 说明书 14 页 序列表 2 页 附图 3 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 权利要求书3页 说明书14页 序列表2页 附图3页 (10)申请公布号 CN 104031055 A CN 104031055 A 1/3 页 2 1. 一种化合物, 其结构式为 : 或 2. 化合物 I 的制备方法, 其制备路线为 : 3. 如权利要求 2 所述化合物 I 的制备方法, 包括下列步骤 : 1) 以石蒜碱 。
4、(Lycorine) 为起始原料经 N- 甲基化与霍夫曼降解制备中间体 III 并分离 产物 ; 2) 使中间体 III 氢化还原获得产物化合物 I。 4. 化合物 II 的制备方法, 其制备路线为 : 权 利 要 求 书 CN 104031055 A 2 2/3 页 3 5. 如权利要求 4 所述化合物 II 的制备方法, 包括下列步骤 : 1) 以石蒜碱 (Lycorine) 为起始原料经 N- 甲基化与霍夫曼降解制备中间体 III 并分离 产物 ; 2) 使中间体 III 氢化还原获得化合物 I 并分离产物 ; 3) 化合物 I 通过二氧亚甲基降解制备中间体 IV 并分离产物 ; 4) 。
5、使中间体 IV 与溴丙炔经烷基化反应制备中间体 V 并分离产物 ; 5) 将中间体 V 与化合物 VI 通过 Click 反应制备产物化合物 II。 6. 如权利要求 5 所述化合物 II 的制备方法, 其特征在于, 所述化合物 VI 的制备路线 为 : 7. 如权利要求 5 所述化合物 II 的制备方法, 其特征在于, 化合物 VI 的制备路线为 : 其中, 化合物 VIII 的制备路线为 : 8. 如权利要求 1 所述化合物在制备经典 Wnt 信号途径激动剂中的用途。 9. 如权利要求 8 所述的用途, 其特征在于, 所述经典 Wnt 信号途径激动剂能激活经典 权 利 要 求 书 CN 1。
6、04031055 A 3 3/3 页 4 Wnt 信号途径的报告基因或目的基因的表达活性。 10. 如权利要求 1 所述化合物在制备药物中的用途, 所述药物选自以下任一 : 1) 预防或治疗由经典 Wnt 信号途径异常失活所引起的疾病或失调的药物 ; 2) 需要特异性激活经典 Wnt 信号途径的疾病或失调的药物 ; 3) 干细胞数目扩增药物。 11. 如权利要求 10 所述化合物的用途, 其特征在于, 所述药物选自 : 老年痴呆症药物、 风湿性关节炎药物、 骨质疏松症药物、 造血干细胞移植药物、 干细胞数目扩增药物或斑马鱼 发育调控药物。 12. 一种用于预防或治疗由经典 Wnt 信号途径异常。
7、失活引起的或用于需要特异性激活 经典 Wnt 信号途径的疾病或失调的药物组合物, 含有治疗有效量的权利要求 1 所述化合物 以及在药学上可接受的赋形剂。 权 利 要 求 书 CN 104031055 A 4 1/14 页 5 一种可用作 Wnt 信号途径激活剂的化合物及其制备与应用 技术领域 0001 本发明涉及可用作 Wnt 信号途径激活剂的化合物及其制备与应用。 背景技术 0002 Wnt 信号转导途径是一类在生物体进化过程中高度保守的信号转导途径 , 调节 控制着众多生命活动过程。在动物体早期发育中 ,Wnt 信号决定背腹轴的形成、 胚层建立、 体节分化、 组织或器官形成等一系列重要事件。
8、, 并直接控制着增殖、 分化、 极化、 凋亡与抗凋 亡等细胞的命运 Clevers,H.and R.Nusse,Wnt/beta-Catenin Signaling and Disease. Cell,2012.149(6):p.1192-205。Wnt 蛋白的十几个成员通过与细胞膜上不同的受体作用 参与了不同的信号转导途径。这些途径主要分为依赖于 -catenin/TCF 转录复合物的经 典 Wnt 信号转导途径 (Wnt/-catenin 途径) 及不依赖于 -catenin/TCF 转录复合物的非 经典 Wnt 信号转导途径 (Wnt/Ca2+途径和 Wnt/JNK 途径) Barker。
9、,N.and H.Clevers,Mining the Wnt pathway for cancer therapeutics.Nature reviews.Drug discovery,2006.5(1 2):p.997-1014。 0003 对于 Wnt/-catenin 信号转导途径的过程, 我们可以从两个状态来理解。当这条 途径没有被激活时, 细胞质内的转录激活子 -catenin 蛋白会被 “降解复合物” 所降解。在 这个 “降解复合物” 中, Axin和APC (adenomatous polyposis coli) 作为骨架蛋白, 它们结合 了能够对-catenin进行磷酸化修饰。
10、的激酶CK1 (casein-kinase1) 和GSK3 (glycogen synthase kinase3) Liu,C.,et al.,Control of beta-catenin phosphorylation/ degradation by a dual-kinase mechanism.Cell,2002.108(6):p.837-47。这两种激酶 依次对 -catenin 蛋白的 N 端的特定位点进行磷酸化修饰, 使得磷酸化的 -catenin 能 够被泛素化 E3 连接酶 -Trcp 识别, 并对其继续进行泛素化进而被蛋白酶体降解。这样细 胞质及核内的 -catenin 始。
11、终维持在一个较低的水平, 从而使得转录抑制因子结合转录 因子 Tcf/Lef(T-cell factor/lymphoid enhancer factor) , 阻碍了 Wnt/-catenin 信 号转导途径下游的目的基因的表达。当 Wnt/-catenin 信号转导途径被激活时, 即 Wnt 蛋 白结合了七次跨膜受体 Frizzled(Fz) 和它的共受体 LRP5/6(low-density lipoprotein receptor-related protein5/6) 。膜上 Wnt-Fz-LRP5/6 复合物的形成导致了骨架蛋白 Dishevelled(Dvl) 和七次跨膜受体 F。
12、z 的细胞膜内的区域结合进而促使了 LRP5/6 的磷 酸化。受体 LRP5/6 的磷酸化进一步招募了 Axin 所结合的复合物 (GSK3-Axin-CK1)和 其磷酸化的细胞膜内的区域结合 Zeng,X.,et al.,A dual-kinase mechanism for Wnt co-receptor phosphorylation and activation.Nature,2005.438(7069):p.873-7. Mao,J.,et al.,Low-density lipoprotein receptor-related protein-5binds to Axin and 。
13、regulates the canonical Wnt signaling pathway.Molecular cell,2001.7(4):p.801-9., 导致了 LRP5/6 被多重磷酸化从而会招募更多的细胞质内的 GSK3-Axin-CK1结合到受体LRP5/6细胞膜内的区域。 这样就使得细胞质中结合-catenin 的降解复合物的关键成员不断减少, 进而 -catenin 不被磷酸化也即不被泛素化降解。细 说 明 书 CN 104031055 A 5 2/14 页 6 胞质内的-catenin就会不断的累积并进一步运输到细胞核中与转录因子Tcf/Lef结合, 激活 Wnt/-cat。
14、enin 信号转导途径下游的目的基因的表达。 0004 由于 Wnt/-catenin 信号途径与众多的癌症和疾病有关系, 所以调节失控的 Wnt/-catenin 信号途径可以作为治疗与 Wnt/-catenin 信号途径相关疾病的一个很 好手段, 但是现阶段的研究还没有什么明显的进展。例如, 阿尔茨海默病的病变过程伴随 着 Wnt/-catenin 信号转导途径的异常失活。与阿尔茨海默病紧密相关的早老素蛋白 能够与 -catenin 和 GSK3 形成复合体 Kang,D.E.,et al.,Presenilin couples the paired phosphorylation of 。
15、beta-catenin independent of axin:implications for beta-catenin activation in tumorigenesis.Cell,2002.110(6):p.751-62。所以针对 该信号途径的分子靶向靶向治疗有望为与其相关疾病提供新的有效途径。另外, 在干细胞 中 Wnt 信号转导途径也起着维持干细胞多能性的作用, 所以调节该信号途径有望为干细胞 的应用提供新的有效方法。 发明内容 0005 本发明的目的在于提供新的 Wnt 信号途径激活剂及其制备与应用。 0006 本发明首先提供了一种化合物, 其结构式为 : 0007 0008。
16、 或 0009 0010 以下将结构式为 I 的化合物称为化合物 I, 结构式为 II 的化合物称为化合物 II, 说 明 书 CN 104031055 A 6 3/14 页 7 结构式为 III 的中间体称为中间体 III, 以此类推。 0011 本发明进一步提供了化合物 I 的制备方法, 其制备路线为 : 0012 0013 包括下列步骤 : 0014 1) 以石蒜碱 (Lycorine) 为起始原料经通过 N- 甲基化与霍夫曼降解制备中间体 III 并分离产物 ; 0015 2) 使中间体 III 氢化还原获得产物化合物 I。 0016 本发明进一步提供了化合物 II 的制备方法, 其制。
17、备路线为 : 0017 0018 包括下列步骤 : 0019 1) 以石蒜碱 (Lycorine) 为起始原料经 N- 甲基化与霍夫曼降解制备中间体 III 并 分离产物 ; 0020 2) 使中间体 III 氢化还原获得化合物 I 并分离产物 ; 0021 3) 化合物 I 通过降解二氧亚甲基制备中间体 IV 并分离产物 ; 0022 4) 使中间体 IV 与溴丙炔进行烷基化反应制备中间体 V 并分离产物 ; 0023 5) 将中间体 V 与化合物 VI 通过 Click 反应获得产物化合物 II。 说 明 书 CN 104031055 A 7 4/14 页 8 0024 其中, 化合物 V。
18、I 的制备路线为 : 0025 0026 包括下列步骤 : 0027 1) 以生物素 (Biotin) 为起始原料经缩合反应制备中间体 VII 并分离产物 ; 0028 2) 使中间体 VII 与化合物 VIII 类酯交换反应获得化合物 VI 并分离产物。 0029 其中, 化合物 VIII 的制备路线为 : 0030 0031 为以 2- 溴乙胺氢溴酸盐 (2-Bromoethylamine hydrobromide) 为起始原料与叠氮 钠 (sodium azide) 亲核取代制备化合物 VIII 并分离产物。 0032 本发明还提供了所述化合物 I 和化合物 II 在制备经典 Wnt 信。
19、号途径激动剂中的 用途。 0033 进一步的, 所述经典 Wnt 信号途径激动剂能激活经典 Wnt 信号途径的报告基因或 目的基因的表达活性。 0034 本发明还提供了所述化合物I和化合物II在制备药物中的应用, 所述药物选自以 下任一 : 0035 1) 预防或治疗由经典 Wnt 信号途径异常失活所引起的疾病或失调的药物 ; 0036 2) 需要特异性激活经典 Wnt 信号途径的疾病或失调的药物 ; 0037 3) 干细胞数目扩增药物。 0038 此处的 “疾病或失调” 包括任何可从本发明的处理获益的病症。其包括但不局限 于各种慢性和急性失调或疾病。 在一个较佳的实施方案中, 所述疾病或失调。
20、是老年痴呆症、 风湿性关节炎或骨质疏松症。在另一个较佳的实施方案中, 所述疾病或失调包括造血干细 胞移植。 0039 进一步的, 所述药物选自以下任一 : 老年痴呆症药物、 风湿性关节炎药物、 骨质疏 松症药物、 造血干细胞移植药物、 干细胞多能性维持药物或斑马鱼发育调控药物。 0040 本发明进一步提供了一种用于预防或治疗由经典 Wnt 信号途径异常失活引起的 或用于需要特异性激活经典 Wnt 信号途径的疾病或失调的药物组合物 : 含有治疗有效量的 化合物 I 或化合物 II 以及在药学上可接受的赋形剂。 0041 术语 “包含” 指 “含有” 和 “由构成” , 例如 “包含” X 的组合。
21、物可以完全由 X 构成, 或者可以含有 X 之外的物质, 例如 X-Y。本文所用的术语 “治疗有效量” 指治疗剂治疗、 缓解 或预防目标疾病或状况的量, 或是表现出可检测的治疗或预防效果的量。该效果例如可通 过化学标记或抗原水平来检测。治疗效果也包括生理性症状的减轻。对于某一对象的精确 有效剂量取决于该对象的体型和健康状况, 病症的性质或程度、 以及选择给予的治疗剂和 / 或治疗剂的组合。因此, 预先指定准确的有效量是没用的。然而, 对于某给定的症状而言, 说 明 书 CN 104031055 A 8 5/14 页 9 可以用常规实验来确定该有效量, 临床医师是能够判断出来的。 0042 所述。
22、药学上可接受的赋形剂 (或运载体) 指用于治疗剂给药的赋形剂, 其本身及其 用量不应诱导接受该组合物的个体产生有害的抗体, 且给药后没有过分的毒性。药学上可 接受的赋形剂通常包括无毒的固体、 半固体或液体填充剂、 稀释剂、 包裹材料或任何常规类 型的制剂辅助物。合适的赋形剂包括但不仅限于水、 葡萄糖、 甘油、 盐水、 乙醇或其组合。所 述赋形剂还包含有其他试剂如湿润剂或乳化剂、 pH 缓冲剂或增强制剂效力的佐剂。其他材 料如抗氧化剂、 保湿剂、 粘度稳定剂和类似试剂可根据需要添加。 脂质体也包括在药学上可 接受的赋形剂的定义中。 0043 通常, 可将药物组合物制成可注射剂, 例如液体溶液或悬。
23、浮液 ; 还可制成在注射前 适合配入溶液或悬液中、 液体载体的固体形式。 0044 本发明的化合物可用于制备调节经典 Wnt 信号途径的药物并可用于研究经典 Wnt 信号途径。本发明也为筛选调节 Wnt 信号途径的药物、 预防和治疗经典 Wnt 信号途径相关 疾病的药物、 研究 Wnt 信号途径在干细胞中的应用提供了新的思路。 附图说明 0045 图 1 : 化合物 I 对经典 Wnt 信号途径报告基因 TOPFlash 的活性的影响结果 : 0046 HLY78 : 化合物 I 0047 DMSO : 二甲基亚砜 0048 在 HEK293T 细胞中转染 TOPFlash 报告基因 18 小。
24、时后加入特定浓度的 HLY78 和溶 剂对照 DMSO 的 Wnt 条件培养基或对照培养基。6 小时后收集细胞检测报告基因活性。 0049 结果表明 : 通过哺乳动物细胞实验报告基因筛选系统发现化合物 I(图中表示为 HLY78) 能够以一种依赖于受体的形式去激活经典Wnt信号途径报告基因TOPFlash的活性。 0050 图 2 : 化合物 I 对经典 Wnt 信号途径靶基因 mRNA 水平的影响结果 : 0051 HLY78 : 化合物 I 0052 DMSO : 二甲基亚砜 0053 AXIN2/GAPDH : 看家基因 GAPDH 的 mRNA 水平表达量标准化 AXIN2 的 mRN。
25、A 水平 0054 DKK1/GAPDH : 看家基因 GAPDH 的 mRNA 水平表达量标准化 DKK1 的 mRNA 水平 0055 HEK293T细胞加入特定浓度的HLY78和溶剂对照DMSO的Wnt条件培养基或对照培 养基。6 小时后收集细胞作 RT-PCR 检测靶基因 mRNA 水平。 0056 结果说明 : 化合物 I 能够以一种依赖于受体的形式去激活经典 Wnt 信号途径靶基 因 mRNA 水平。 0057 图 3 : 化合物 I 对 -catenin 的蛋白水平的影响结果 0058 HLY78 : 化合物 I 0059 DMSO : 二甲基亚砜 0060 Ctr : 对照 0。
26、061 -catenin : 用 -catenin 的特异性抗体检测蛋白 ; 0062 -Actin : 用 -Actin 的特异性抗体检测蛋白 ; 0063 -SP1 : 用 SP1 的特异性抗体检测蛋白 ; 0064 HEK293T 细胞加入特定浓度的 HLY78 和溶剂对照 DMSO。1 小时后加入含有相同药 说 明 书 CN 104031055 A 9 6/14 页 10 物浓度的 Wnt 条件培养液或对照条件培养液。6 小时后收集细胞分离细胞质和细胞核检测 -catenin 的蛋白水平。其中 -actin 作为细胞质标记物, SP1 作为细胞核标记物。 0065 结果表明 : 化合物。
27、 I 能够以一种依赖于受体的形式去影响 -catenin 的蛋白水 平。 0066 图 4 : 药物对经典 Wnt 信号途径报告基因 TOPFlash 的活性的影响结果 0067 HLY78 : 化合物 I 0068 HLY179 : 化合物 II 0069 DMSO : 二甲基亚砜 0070 在 HEK293T 细胞中转染 TOPFlash 报告基因 17 小时后加入 10M 的 HLY179, 生物 素 ,HLY78 和溶剂对照 DMSO 的 Wnt 条件培养基或对照培养基。6 小时后收集细胞检测报告 基因活性。结果表明 : 化合物 I 和 II 能够以一种依赖于受体的形式去激活经典 Wn。
28、t 信号途 径报告基因 TOPFlash 的活性。 0071 图5 : 化合物I作用斑马鱼造血干细胞后, 对表现造血干细胞的标记物runx1/cmyb 的 mRNA 水平表达的原位染色试验结果图。 0072 40/45 : 总数 45 条鱼中有 40 条如图示 ; 0073 23/32 : 总数 32 条鱼中有 23 条如图示 ; 0074 在斑马鱼三体节时加入 80M 的 HLY78 和溶剂对照 DMSO。24 小时后收集斑马鱼 胚胎做原位染色实验, 检测造血干细胞的标记物 runx1/cmyb 的 mRNA 水平表达。 0075 结果表明 : 化合物 I 增强斑马鱼造血干细胞的发育。 具体。
29、实施方式 0076 发明人经过深入研究, 首次发现化合物I和化合物II能够以一种依赖于受体的形 式去激活经典 Wnt 信号途径。由于经典 Wnt 信号途径与多种疾病, 例如老年痴呆症 , 风湿 性关节炎、 骨质疏松症以及调控造血干细胞的发育有关, 因此发现化合物 I 和化合物 II 能 够以一种依赖于受体的形式去激活经典 Wnt 信号途径为开发新的药物来治疗这些疾病提 供了新的思路。 0077 下面结合本发明实施例来进一步说明本发明的实质性内容, 但不以此来限定本发 明。应理解, 这些实施例仅为了说明本发明而非限制本发明的范围。实施例所采用的具体 实验方法和实验条件是本领域常规方法和条件, 或。
30、制造厂商所推荐的方法和条件。除非另 有定义, 文中所用的专业与科学用语与本领域技术人员所知的相同。 0078 以下化合物和中间体通过液相色谱 - 质谱 (LC-MS) 和核磁共振 (NMR) 表征, 在制备 所述化合物中使用的起始物质和试剂可以从供应商购得或者通过本领域技术人员已知的 方法制备。以下一般性的合成路线仅仅举例说明了通过其可合成本发明化合物的方法, 并 且对于已经参考本发明公开内容的本领域技术人员, 所述合成路线的多种修改是可以做出 来的并且是得到启示的。 0079 除非另外说明, 本发明中所公开的实验方法、 检测方法、 制备方法均采用本技术领 域常规的分子生物学、 生物化学、 染。
31、色质结构和分析、 分析化学、 细胞培养、 重组 DNA 技术及 相关领域的常规技术。这些技术在现有文献中已有完善说明, 具体可参见 Sambrook 等 0080 MOLECULAR CLONING : A LABORATORY MANUAL, Second edition, Cold Spring 说 明 书 CN 104031055 A 10 7/14 页 11 Harbor Laboratory Press, 1989and Third edition, 2001 ; Ausubel等, CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, John Wiley。
32、13C NMR(100MHz,CDCl3):147.4(C), 145.1(C),133.4(CH),133.2(C),129.2(C),126.4(C),125.8(C),124.9(CH),124.3(CH),1 22.7(CH),114.3(CH2),107.1(CH),103.6(CH),100.9(CH2),54.8(CH2),41.5(CH),EIMS m/ z:266M+H+. 0099 b.从中间体III进一步出发制备化合物I : N-甲基-4-乙基-5, 6-二氢-8, 9-二氧 亚甲基 - 菲啶 (4-ethyl-5-methyl-5,6-dihydro-1,3dioxol。
33、o4,5-jphenanthridine) 0100 在氮气保护条件下, 中间体 III(26.5mg,0.1mmol)溶解在四氢呋喃 (THF) /H2O (5mL, 4:1) 中, 然后加入对甲苯磺酰肼 (TsNHNH2) (37.2mg,0.2mmol) 回流反应 4h, 冷却至 室温然后加入醋酸钠 (NaOAc) (73.8mg,0.3mmol) 反应结束后加入氯化铵溶液, 然后加入 乙醚萃取 2 次 (210ml) , 接着用氯化铵液洗涤 2 次 (210ml) , 用饱含食盐水洗涤 2 次 (210ml) , 有机层用饱和食盐水洗后用无水硫酸镁干燥, 减压移除易挥发的溶剂后用硅 胶。
34、色谱柱纯化 (乙酸乙酯 / 石油醚 200:1, Rf=0.21) , 得到化合物 I。黄色固体 26.8mg, 得率 95%。产物 m.p.(熔点) 179-180 C。 0101 NMR、 MS 分析确认产物 : 0102 1H NMR(400MHz,MeOD):7.51(t,J=8.4Hz,1H),7.28(d,J=6.4Hz,2H),7.20(t ,J=7.9Hz,2H),6.75(s,1H),6.01(s,1H),4.01(s,2H),2.83(q,J=7.5Hz,2H),2.50(s,3H ),1.32(dd,J=15.7,8.2Hz,3H) ; 13C NMR(100MHz,CD。
35、Cl 3):147.3(C),147.1(C),145.4( C),139.4(C),129.3(C),127.7(CH),126.6(C),126.3(C),124.6(CH),121.0(CH),107.2 (CH),103.7(CH),100.9(CH2),55.2(CH2),41.02(CH),23.1(CH2),14.8(CH3),HREIMS m/ z217.1261M+(calcd for C17H17NO2,267.1259). 0103 c.从化合物I出发制备中间体IV:4-ethyl-5-methyl-5,6-dihydrophenanthridi ne-8,9-diol 。
36、0104 -78条件下, 在化合物 I(26.7mg,0.1mmol) 溶解到二氯甲烷 (CH2Cl2) (2mL) 中, 加入三溴化硼 (BBr3) (49.4mg,0.2mmol) 反应 2h, 反应结束后加入碳酸氢钠溶液, 然后加入 乙醚萃取2次 (210ml) , 接着用碳酸氢钠溶液洗涤2次 (210ml) , 用饱和食盐水洗涤2次 (210ml) , 有机层用饱和食盐水洗后用无水硫酸镁干燥, 减压移除易挥发的溶剂后用硅胶 色谱柱纯化 (乙酸乙酯 / 石油醚 1:1, Rf=0.22) , 得到中间体 IV, 黄色固体 17.9mg, 得率 70%。 0105 NMR、 MS 分析确认。
37、产物 : 0106 1H NMR(400MHz,CDCl 3):7.46(d,J=7.1Hz,1H),7.27(d,J=2.7Hz,1H),7.17-7.11 (m,2H),6.75(s,1H),3.96(s,2H),2.79(q,J=7.5Hz,2H),2.47(s,3H),1.28(dd,J=14.7,7.1 Hz,3H) ; 13C NMR(100MHz,CDCl 3):143.8(C),143.0(C),139.4(C),129.0(C),127.6(CH),1 25.7(C),125.5(C),124.7(CH),120.9(CH),113.8(CH),113.4(C),110.4(。
38、CH),54.6(CH2),4 1.2(CH3),23.1(CH2),14.8(CH3);EIMS m/z:256M+H+. 0107 d.从中间体IV出发制备中间体V:4-ethyl-5-methyl-8,9-bis(prop-2-ynyloxy) -5,6-dihydrophenanthridine 0108 在氮气保护条件下, 中间体 IV(25.5mg,0.1mmol) 溶解在 THF(5mL) 中, 然后加入 说 明 书 CN 104031055 A 13 10/14 页 14 氢化钠 (NaH) (180mg,0.3mmol,40%) 和丙炔溴 (14mg,0.3mmol,80%)。
39、, 室温下反应 8 小时, 反 应结束后加入氯化铵溶液, 然后加入乙醚萃取 2 次 (210ml) , 接着用氯化铵溶液洗涤 2 次 (210ml) , 用饱和食盐水洗涤 2 次 (210ml) , 有机层用饱和食盐水洗后用无水硫酸镁干 燥, 减压移除易挥发的溶剂后用硅胶色谱柱纯化 (乙酸乙酯 / 石油醚 200:1, Rf=0.21) , 得到 中间体 V, 黄色固体 26.4mg, 得率 80%。 0109 NMR、 MS 分析确认产物 : 0110 1 H N M R ( 4 0 0 M H z , C D C l 3) 1 H N M R ( 4 0 0 M H z , C D C l。
40、 3) 7.54(d,J=6.9Hz,1H),7.46(s,1H),7.237.12(m,2H),6.91(s,1H),4.83(s,2H),4.80 (s,2H),4.02(s,2H),3.092.99(m,2H),2.862.74(m,2H),2.47(s,3H),1.291.17(m- ,3H); ; 13C NMR(100MHz,CDCl 3):147.4(C),146.8(C),145.6(C),139.5(C),128.9(C),127 .9(CH),126.8(C),126.3(C),124.6(CH),121.0(CH),113.1(CH),110.5(CH),78.6(C),。
41、78.4 (C),75.9(CH),75.8(CH),57.2(CH2),56.9(CH2),54.8(CH2),41.31(CH3),23.1(CH2),14.8(C H3);ESIMS m/z:330M-H-. 0111 e. 制备化合物 VIII:2-Azidoethylamine 0112 2- 溴乙胺氢溴酸盐 (2-Bromoethylamine hydrobromide) (500mg,2.44mmol) 和叠 氮钠 (sodium azide) (475.9mg,7.32mmol)溶解到H2O(2mL)中, 75C下搅拌反应21h然后 冷却至 0 C, 加入氢氧化钾 (KOH) 。
42、(800mg) 和 Et2O(2mL), 水层用乙醚萃取 2 次 (210ml) , 有机层用饱和食盐水洗后用无水硫酸镁干燥, 减压移除易挥发的溶剂后用硅胶色谱柱纯化 (氯仿 / 甲醇 20:1, Rf=0.21) , 得到化合物 VIII, 黄色液体 171mg,1.99mmol, 得率 82%。 0113 NMR、 MS 分析确认产物 : 0114 1H NMR(400MHz,CDCl 3):1.27(s,2H,NH2),2.802.84(m,2H,CH2N3),3.30(t,J=5 .7Hz,2H,CH2NH2) ; 13C NMR(100MHz,CDCl3):41.2(CH 2NH2)。
43、,54.6(CH2N3)。 0115 f. 制备中间体 VII : 2,5-dioxopyrrolidin-1-yl5-(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahyd ro-1H-thieno3,4-dimidazol-4-yl)pentanoate 0116 Biotin(24.4mg,0.1mmol) 溶解至 N, N- 二甲基甲酰胺 (DMF) (10mL) 中 , 加入吡 啶 (Py) (2mL) 和 N,N- 二环己基碳酰亚胺 (DCC) (41.2mg,0.2mmol) , 反应半小时后加入 N-羟基琥珀酰亚胺 (N-Hydroxysuccinimide) (13.8mg,0.。
44、12mmol),反应24h后停止反应, 过 滤后滤液减压蒸馏移除 DMF, 接着用热异丙醇溶剂溶解, 然后过滤, 滤液在 4冰箱中沉淀 2 天, 最后过滤得到白色固体沉淀 10.2mg, 得率 30%。 0117 NMR、 MS 分析确认产物 : 0118 1H NMR(400MHz,D6DMSO):6.42(s,1H,3-NH),6.36(s,1H,1-NH),4.27 4.32(m,1H,6a-H),4.114.16(m,1H,3a-H),3.063.12(m,1H,SCH),2.782.85(m,5H,C H2CH2(succinyl),SCH2),2.66(t,J=7.3Hz,2H,2。
45、-H),2.57(d,J=11.4Hz,1H,SCH2),1.58 1.68(m,3H,3-H,5H),1.351.54(m,3H,4-H,5-H);13C NMR(100MHz,D6DMSO):170 .3(N(CO)2),168.9(CO2),162.7(HN)2CO),61.0(C-3a),59.2(C-6a),55.2(SCH),39.9(SCH 2),30.0(C-2),27.8(C-4),27.6(C-5),25.4(CH2CH2(succinyl),24.3(C-3);EIMS m/ z:342M+H+。 0119 g. 制备化合物 VI : N-(2-azidoethyl)-5。
46、-(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-th ieno3,4-dimidazol-4-yl)pentanamide 说 明 书 CN 104031055 A 14 11/14 页 15 0120 中间体 VII (34.1mg,0.1mmol) 溶解至 DMF(2mL) 中, 加入 Et3N (12.0mg,1.2mmol) , 然后加入化合物 VIII(17.2mg,0.2mmol) 在室温下反应 24h, 减压蒸馏移除 DMF 后用硅胶 色谱柱纯化 (氯仿 / 甲醇 20:1, Rf=0.23) , 得到化合物 VI, 黄色固体 21.8mg, 得率 70%。 01。
47、21 NMR、 MS 分析确认产物 : 0122 1H NMR(400MHz,D6DMSO):8.03(t,J=5.3Hz,1H,CONH),6.42(s,1H,3- NH),6.35(s,1H,1-NH),4.264.32(m,1H,6a-H),4.084.14(m,1H,3a-H),3.31(d ,J=7.6Hz,2H,CH2N3),3.193.24(m,2H,CH2CH2N3),3.053.11(m,1H,SCH),2.80(d d,J=12.4,5.1Hz,1H,SCH2),2.56(d,J=12.9Hz,1H,SCH2),2.06(t,J=7.3Hz,2H,2- H),1.551.6。
48、5(m,1H,5-H),1.391.55(m,3H,3-H,5-H),1.201.38(m,2H,4-H);13C NMR(100MHz,D6DMSO):172.4(CONH),162.7(HN)2CO),61.0(C-3a),59.2(C-6a),55.4( SCH),50.0(CH2N3),39.9(SCH2),38.1(CH2CH2N3),35.1(C-2),28.2(C-4),28.0(C-5),25. 2(C-3);HRESI+MS:m/z313.14419M+H+(calcd for C12H20N6O2S+H,313.14412). 0123 h. 制备化合物 II : (R,S,S)-N,N-(2,2-(4,4-(4-ethyl-5-me thyl-5,6-dihydrophenanthridine-8,9-diyl)bis(oxy)bis(methylene) bis(1H-1,2,3-triazole-4,1-diyl)bis(ethane-2,1-diyl)bis(5-(3aS,4S,6aR)-2-ox ohexahydro-1H-thieno3,4-dimidazol-4-yl)pentanamide) 0124 中间体 V。