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本发明提供一种玉米新型高效无选择标记转基因载体系统构建方法及应用,采用PCR克隆技术从玉米高活性的Mu品系中获得Mu转座子的相关片段,以双元质粒载体pCAMBIA1300为骨架,分别构建新型高效的双元质粒载体pMuE和pMuDR,通过农杆菌介导的遗传转化方法转化玉米鲁元92自交系,从后代中筛选出无选择标记基因的转基因植株。本发明能够提高转基因的转化效率,该载体系统的获得将为今后直接获得无标记基因、。