识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体.pdf

上传人:n****g 文档编号:193025 上传时间:2018-02-01 格式:PDF 页数:142 大小:5.80MB
返回 下载 相关 举报
摘要
申请专利号:

CN02816001.0

申请日:

2002.06.17

公开号:

CN1543569A

公开日:

2004.11.03

当前法律状态:

终止

有效性:

无权

法律详情:

未缴年费专利权终止IPC(主分类):G01N 33/569申请日:20020617授权公告日:20080102终止日期:20130617|||授权|||实质审查的生效|||公开

IPC分类号:

G01N33/569; C12N5/06; C12N5/16; C07K16/00

主分类号:

G01N33/569; C12N5/06; C12N5/16; C07K16/00

申请人:

英希比泰克斯公司; 都柏林伊丽莎白女皇神学院; 帕维研究学院

发明人:

蒂莫西·J·福斯特; 菲奥那·罗切; 约瑟夫·M·帕蒂; 杰夫·T·哈钦斯; 皮特罗·斯皮兹利; 马克·帕伦

地址:

美国佐治亚州

优先权:

2001.06.15 US 60/298,098

专利代理机构:

永新专利商标代理有限公司

代理人:

过晓东

PDF下载: PDF下载
内容摘要

提供了与凝血酶阳性的葡萄球菌细菌,例如溶血葡萄球菌发生交叉反应的多克隆和单克隆抗体,所述的抗体能够识别凝固酶阳性的和凝固酶阴性的葡萄球菌细菌的表面蛋白质。从基于金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的葡萄球菌之间共有的特性分离的表面蛋白质可以制备抗体,这些重组表面蛋白质可用于制备本发明的抗体。还提供了利用这些蛋白质和抗体用于治疗或抵抗各种各样的葡萄球菌的感染的疫苗和方法。

权利要求书

1: 一种分离的抗体,其与葡萄球菌的表面蛋白质结合,所述蛋 白质选自于下列组:SEQ ID NOS.2、4、6、8、10、12、14、 16、17、18、19和21。
2: 根据权利要求1所述的抗体,其中抗体针对所述表面蛋白质 的A区域。
3: 根据权利要求1所述的抗体,其中抗体用于治疗或预防人类 或动物的金黄色葡萄球菌感染。
4: 根据权利要求1所述的抗体,其中抗体适用于人类或动物的 非肠道的,口部的,鼻内的,皮下的,aerosolized或静脉内 的给药。
5: 根据权利要求1所述的抗体,其中所述的抗体是单克隆抗体。
6: 根据权利要求1所述的抗体,其中所述的抗体是多克隆抗体。
7: 根据权利要求5所述的抗体,其中单克隆抗体是一种选自于下 列组的类型:鼠的,嵌合的,人性化的,和人的单克隆抗体。
8: 根据权利要求5所述的抗体,其中抗体是一种单链单克隆抗 体。
9: 根据权利要求1所述的抗体,它包括具有类似于一种抗体的 结合特异性的抗体片段,所述的抗体结合到具有选自于下列 组:SEQ ID NOS.2、4、6、8、10、12、14、16、17、18、 19和21的序列的葡萄球菌的表面蛋白质。
10: 根据权利要求1所述的抗体,它针对具有选自于下列组:SEQ ID NOS.2、4、6、8、10、12、14、16、17、18、19和21 的氨基酸序列的蛋白质。
11: 根据权利要求1所述的抗体,其中所述的表面蛋白质具有由 选自于下列组的核酸序列SEQ ID NOS.1、3、5、7、9、11、 13、15、20和编码Aap蛋白质的A区域或其简并序列的核 酸序列编码的一个氨基酸序列的核酸序列。
12: 含有权利要求1的抗体的分离的抗血清。
13: 一种诊断试剂盒,包括权利要求1的抗体和用于检测该抗体 引起的结合的工具。
14: 根据权利要求13所述的诊断试剂盒,其中所述的用于检测 结合的工具包括连接到所述的抗体的一种可检测标记物。
15: 一种用于诊断金黄色葡萄球菌感染的方法,包括将权利要求 1的抗体加入到被怀疑感染了金黄色葡萄球菌的样品中,测 定抗体是否已经结合到该样品。
16: 一种用于治疗或预防金黄色葡萄球菌感染的药物组合物,包 括有效量的权利要求1的抗体和药学的可接受的介质,载体 或赋形剂。
17: 一种治疗或预防金黄色葡萄球菌感染的方法,包括将有效量 的权利要求1的抗体给人或动物患者给药。
18: 一种诱导免疫应答的方法,包括以致免疫量的选自于下列 组:SEQ ID NOS.2、4、6、8、10、12、14、16、17、18、 19和21的氨基酸序列的分离的蛋白质给人类或动物给药。
19: 根据权利要求1所述的分离的抗体,它具有结合到由SEQ ID NOS.1、3、5、7、9、11、13、15、20的核酸序列和编码 Aap蛋白质的A区域的核酸序列或其简并序列编码的氨基酸 序列的能力。
20: 一种来自DsqA蛋白质的A区域的分离的活性片段。
21: 根据权利要求1所述的分离的抗体,进一步包括生理学上的 可接受的抗生素。
22: 一种用于治疗或预防金黄色葡萄球菌感染的疫苗,包括选自 于下列组SEQ ID NOS.2、4、6、8、10、12、14、16、17、 18、19和21的蛋白质序列,和一种药学的可接受的介质, 载体或赋形剂,所述的蛋白质的量可有效地激发免疫应答。

说明书


识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的 表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体

    相关申请

    本申请要求享受2001年6月15日递交的美国临时申请系列号60/298,098的利益。

    【发明领域】

    总的来说,本发明涉及来自金黄色葡萄球菌的表面蛋白质及其活性的区域例如它们的A功能域,它具有凝固酶阴性的葡萄球菌例如表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌上的同源蛋白质,以及识别上述的蛋白质的抗体,具体地说,涉及分离的单克隆和多克隆抗体,它们识别来自金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的葡萄球菌的特定的蛋白质,以及抗金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性地葡萄球菌的交叉反应,因此可用于疫苗,以及用于预防或治疗各种各样的由葡萄球菌的细菌引起的感染的方法。

    【发明背景】

    对于大多数引起动物和人类的传染病的微生物,在宿主中成功地形成集落是一个必需的过程。微生物的粘附是最后导致疾病的一系列事件的第一个重要步骤。借助细菌表面的特定的adhesins,通过粘附到宿主组织或血清限定的移植入的生物材料,例如导管,人工的关节,血管的移植片,病原微生物在宿主中形成集落。MSCRAMMs(识别粘附的基质分子的微生物表面成分)是细胞表面adhesins的一个家族,它们识别和特定地结合到宿主的细胞外的基质的不同的组分。一旦细菌成功地粘附并且在宿主组织中形成集落,他们的生理机能被急剧改变并且分泌受损害的成分例如毒素和水解蛋白质的酶。此外,粘连的细菌常常产生生物膜并且很快地变得对大多数的抗生素的杀戮效果更具抗性。

    金黄色葡萄球菌产生从皮肤上的损害例如伤口感染,脓疱病,疖到包括肺炎,脓毒性的关节炎,脓毒病,心内膜炎的威胁生命的状况以及生物材料相关的传染病的范围的感染谱。已知金黄色葡萄球菌表达不同的MSCRAMMs的全部技能,它们独立地或者协调地促进微生物的粘附到特定的宿主组织组分。另外,葡萄球菌细菌的另一个类型被识别为凝固酶阴性的细菌,包括例如已知同样地表示MSCRAMMs的表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌,也对各种各样的细菌的感染和有关的疾病负有责任。关于这一点,通常MSCRAMMs由抗体,多克隆和单克隆抗体,对免疫学的攻击提供出色的靶。

    然而,由于抗体本性非常特异的,就不同类型的葡萄球菌而言,例如一方面金黄色葡萄球菌(凝固酶阳性)和另一方面表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌(凝固酶-阴性的),研制显示不同的类型的细菌之间年的交叉反应性的抗体,仍然是值得注意的问题。这样的交叉的反应的抗体是特别令人想望的,因为他们具有使人类和动物患者致免疫的潜在性和提供抵抗由两种类型的葡萄球菌的细菌,即凝固酶阳性的细菌例如金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的细菌,例如表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌引起的感染潜在性。因此这样的抗体在预防或治疗各种各样的由葡萄球菌的细菌引起的感染中非常地有效。

    发明概述

    因此,本发明的目的之一提供识别来自凝固酶阳性的细菌例如金黄色葡萄球菌的MSCRAMMs以及来自凝固酶阴性的细菌,例如表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌的MSCRAMMs的单克隆抗体。

    本发明的还有一个目的是识别和分离来自葡萄球菌的细菌的MSCRAMMs,以及他们的活性的区域例如A区域,该区域可用于产生与凝固酶阳性的和凝固酶阴性的葡萄球菌发生交叉反应的单克隆和多克隆抗体。

    本发明的另一个目的提供可以识别来自凝固酶阴性的葡萄球菌的表面蛋白质例如DgsK蛋白质的A区域,同时识别来自金黄色葡萄球菌的表面蛋白质例如SasA蛋白质的分离的抗体。

    本发明的又一方面是利用本发明的分离的蛋白质,A区域和抗体生产用于治疗或预防葡萄球菌的感染的疫苗,以及提供了其中将本发明的疫苗和抗体可用于预防或治疗葡萄球菌的感染的方法。

    这些和其他的目的通过本发明实现,所述的发明包括识别和分离一种类型的葡萄球菌的细菌例如凝固酶阴性的或凝固酶阳性的葡萄球菌的表面蛋白质,它导致产生识别两种类型的葡萄球菌的表面蛋白质的交叉的反应性的抗体,并且因此将抗体用于治疗或预防各种各样葡萄球菌的感染的疫苗和方法。本发明还涉及从这些表面蛋白质产生多克隆和单克隆抗体,以及它们用于预防或治疗葡萄球菌的感染。

    对本领域内技术人员而言,根据阅读本说明书和/或在此处记载的参考文献,这些具体的实施方案和在公开的发明的精神和范围之内的其他的供替代的选择和改变是显而易见的,所有引用的文献都被并入本文。

    附图简述

    附图1是本发明的in silico预测的蛋白质的一级的结构图。

    附图2显示本发明的开放读框表达的N-末端His标记的纯化的重组的蛋白质的考马斯亮蓝染色凝胶。

    附图3A-3C显示分别用抗-KesK抗体(附图3A),抗-KnkA抗体(附图3B)和抗DsqA抗体(附图3C)探测时金黄色葡萄球菌的细胞壁提取物的Western印迹。

    附图4A-4B显示表达金黄色葡萄球菌的MSCRAMM称为KnkA(附图4A)和KesK(附图4B)的乳酸乳球菌的点印迹和Western免疫印迹。

    附图5A-5D代表用康复的人血清体内检测表达本发明重组LPXTG蛋白质,包括RrKn和RrKN2(附图5A),Kesk1和Kesk2A(附图5B),KnkA(附图5C)和DsqA2(附图5D)的探测情况。

    附图6显示证实抗金黄色葡萄球菌SasA的兔多克隆抗体与从表皮葡萄球菌HB细胞表面释放的蛋白质以及来自从表皮葡萄球菌克隆的DsgK的重组A-区域发生交叉反应的Western印迹分析结果。

    优选的实施方案的详细描述

    根据本发明,提供了来自凝固酶阳性的葡萄球菌的细菌例如金黄色葡萄球菌以及凝固酶阴性的葡萄球菌的细菌例如表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌,的特定的表面蛋白质,包括其活性片段例如这些蛋白质或可以产生识别完整的蛋白质的抗体的其他的表位区域的A区域。根据本发明,基于MSCRAMMs(识别粘附基质分子的微生物表面成分)的一些共有的特征实施候选肽序列和蛋白质的鉴定和分离,在大多数情况下,这些特征共价地固定到细胞壁肽葡聚糖。这些表面蛋白质具有下列的共有的特征可用于确定和分离本发明的序列,即:(i)Sec-依赖性分泌必需的N-末端信号肽(长度大约40个残基),(ii)一个富含脯氨酸和甘氨酸残基或由丝氨酸和门冬氨酸盐二肽重复组成点的跨壁功能域;(iii)蛋白质共价固定到肽葡聚糖中的五个甘氨酸交联桥必需的LPXTG基序,(iv)一个疏水的跨膜功能区,跟随其后的(v)几个带正电荷的残基。

    根据本发明,按照以上所述的特性,通过开发金黄色葡萄球菌的完整的基因组,识别了至少八个新的开放读框编码的蛋白质,具有分泌和固定象征MSCRAMMs的基序(即的携带N-末端信号肽和跟随疏水的功能区之后的C-末端LPXTG基序和一个带正电的尾部)。表1阐明所识别的蛋白质的一览表,包括在金黄色葡萄球菌基因组中的分布,蛋白质的大小和C-末端细胞壁排序序列。

                            表1名称 分布大小 C-末端EkeS ENCSJM2189aa LPNTGSEEMDLPLKELALITGAALL ARRRSKKEKESDsqA ENCSJM-1363-2283aa LPDTGDSIKQNGLLGGVMTLLVGL GLMKRKKKKDENDQDDSQAKesK ENCSJM-909aa LPKTGETTSSQSWWGLYALLGMLA LFIPKFRKESKKrkN2 ENCSJM-278aa LPKTGLTSVDNFISTVAFATLALLGS LSLLLFKRKESKKrkN ENCSJM-661aa LPQTGEESNKDMTLPLMALIALSSI VAFVLPRKRKNRkaS ENCSJM-801aa LPKTGTNQSSSPEAMFVLLAGIGLI ATVRRRKASRrkN NCSJM1629aa LPKTGLESTQKGLIFSSIIGIAGLML LARRRKNKnkA NCSJM629aa LPKAGETIKEHWLPISVIVGAMGVL MIWLSRRNKLKNKA

    缩写:eMRSA-16;N,8325;C,COL;S,MSSA;J,N315,M,Mu50。

    8个蛋白质中的6个存在于已经被测序的所有六个葡萄球菌的基因组中,剩余的2个存在于5/6的这些基因组中。

    根据本发明,获得上述的蛋白质的氨基酸和编码它的核酸序列,如下所述:Ekes MRSA-SEQ ID NO:1(DNA序列);EkeS~MRSA-SEQ ID NO:2(蛋白质序列);DsqA(8325)-SEQ IDNO:3(DNA序列);DsqA(8325)-SEQ ID NO:4(蛋白质序列);KesK1(8325)-SEQ ID NO:5(DNA序列);KesK1(8325)-SEQ IDNO:6(蛋白质序列);KrkN2(8325)--SEQ ID NO:7(DNA序列);KrkN2(8325)-SEQ ID NO:8(蛋白质序列);KrkN(8325)-SEQ IDNO:9(DNA序列);KrkN(8325)-SEQ ID NO:10(蛋白质序列);RkaS(COL)-SEQ ID NO:11(DNA序列);RkaS(COL)-SEQ IDNO:12(蛋白质序列);RrkN(8325)-SEQ ID NO:13(DNA序列);RrkN(8325)-SEQ ID NO:14(蛋白质序列);KnkA(8325)-SEQ IDNO:15(DNA序列);KnkA(8325)-SEQII7 NO:16(蛋白质序列)。

    根据本发明,可以从上述的蛋白质或他们的活性区域例如A区域产生分离的抗体以便能够识别上述的蛋白质和/或上述的功能区。这些抗体可以是单克隆的或多克隆的。如果需要多克隆抗体,可以本领域内熟知的许多常规方法的任何一种制备。一种典型的方法是,可以将需要的表面蛋白质或其活性的区域注射到合适的宿主动物,例如,小鼠或兔子,在合适的时间期间之后,可以从该宿主动物分离和回收想要的抗体。对于单克隆抗体,根据本发明,可以许多合适的方法包括例如熟知的Kohler和Milstein,Nature 256:495-497(1975)方法,本领域内已知的任何其他方法,例如美国专利Nos.6,331,415;5,981,216;5,807,715;和4,816,567;欧洲专利申请519,596;和PCT公开WO 00/71585公开的方法制备,所有这些专利文献都通过在此引述而合并于本文。这些方法包括其制备如以本领域内熟知的方式进行嵌合,人性化,或人的单克隆抗体。仍然进一步地,可以从一个单链,例如轻或重链制备,以及还可以从保持完整的抗体的结合特性(例如,特异性和/或亲合力)的抗体的活性的片段制备单克隆抗体。活性的片段是指具有与完全抗体相同的结合特异性的抗体片段,所述完全抗体结合到来自不同的类型的葡萄球菌细菌(即凝固酶阴性的,或凝固酶阳性的)的特定的表面蛋白质或其同系物。本文术语″抗体″包括所述的片段。另外,也可以利用本发明的单克隆或多克隆抗体制备抗血清,可以本领域内熟知的许多合适方式制备。

    如上所述,可以本领域内熟知的许多合适的方式制备本发明的抗分离的表面蛋白质和/或其活性的区域的抗体,例如上述所述的完全建立的Kohler和Milstein方法,可用于产生单克隆抗体。例如,在这样的一种方法的预备的步骤中使用,可以在长时间的时期用本发明的纯化的重组MSCRAMM或其活性的部分长期给小鼠每一周腹膜内注射一次,随后测试从免疫接种的老鼠获得的血液以测定与纯化的蛋白质的反应性。在识别老鼠与该蛋白质的反应性之后,将从小鼠脾脏分离的淋巴细胞与小鼠脊髓细胞融合以产生抗本发明的表面蛋白质的抗体阳性的杂交瘤,然后分离和培养,随后纯化和使之形成同位型。

    为了产生本发明的单克隆抗体,优选的是利用本发明的重组制备的MSCRAMM′s来制备,利用本领域内熟知的许多标准方法可以制备这些重组子并且分离。例如,一种这样的方法使用了大肠杆菌表达载体pQE-30作为克隆和表达重组蛋白质和肽的表达载体。在一个优选的方法中,利用PCR,从上面描述的序列扩增识别为DgsK或SasA的表面蛋白质的A区域,再克隆到大肠杆菌表达载体PQE-30(Qiagen),以允许表达一种含有六个组氨酸残基的重组融合蛋白质。  随后将该载体转化到大肠杆菌ATCC55151,在15-升发酵罐中生长到光密度(OD600)为0.7,用0.2mM异丙基-1β-D半乳糖苷(IPTG)诱导4小时。利用AGTechnologies中空纤维组件(孔大小0.45um)收集细胞,将细胞浆在-80C冷冻。利用2次穿过French Press,1100psi,将细胞在1×PBS(10mL缓冲液/1克的细胞浆)裂解。将裂解的细胞17,000rpm旋转30分钟以除去细胞碎片。将上清液经过装备了0.1M NiCI2的5-毫升Hi俘获Cheating(Pharmacia)柱。在上样之后,用5个柱体积的10mM Tris,pH 8.0,100mM NaCI(缓冲液A)洗涤柱子。利用超过30个柱体积的0-100%梯度的10mM Tris,pH 8.0,100mM NaCI,200mM咪唑(Buffer B)洗脱蛋白质。SdrGN1N2N3或SdrGN2N3在-13%Buffer B(~26mM咪唑)被洗脱。监测280nm处的吸光率。在1×PBS中透析含有SdrGN1 N2N3或SdrGN2N3的馏分。

    接著,然后将各个蛋白质经过一个内毒素除去方案。在该方案中所使用的缓冲液通过一个5-毫升Mono-Q琼脂糖(Pharmacia)柱而没有内毒素。将蛋白质平衡地分到4×15毫升试管中。各个试管的体积用缓冲液A加到9毫升。将1毫升的10%Triton X-114加入到各个试管中,在4℃旋转保温1小时。将试管置于37℃水浴中以使相位分离。将试管以2,000rpm旋转10分钟,收集各个试管的上面的含水的相,用去污剂反复提取。将2次提取的含水相合并,传递过带有0.1M NiCl2的5-mL IDAcheating(Sigma)柱,以除去剩余的洗涤剂。用9个柱体积的Buffer A洗涤该柱,然后用3个柱体积的Buffer B洗脱该蛋白质。将洗脱液通过5-毫升的Detoxigel(Sigma)柱,收集流出物,再上样到柱。收集第二次过柱的流出物,在1×PBS中透析。分析纯化的产物的浓度,纯度和内毒素水平,然后给小鼠给药。

    在该优选的方法,以下面的方式从上面识别的重组蛋白质可以制备本发明的单克隆抗体。在该方法中,将大肠杆菌表达的和纯化的重组SasA和DsgK蛋白质用于制备一组鼠的单克隆抗体,而将小鼠血清用作为多克隆抗体的来源。简单地说,一组Balb/C或SJL小鼠接收了一系列皮下的免疫接种1-10mg溶液蛋白质或与下面表2描述的佐剂混合的蛋白质。

                         表2免疫接种方案

    RIMMS

    注射        天数        数量(微克)        途径        佐剂

    #1          0           5                 皮下        FCA/RIBI

    #2          2           1                 皮下        FCA/RIBI

    #3          4           1                 皮下        FCA/RIBI

    #4          7           1                 皮下        FCA/RIBI

    #5          9           1                 皮下        FCA/RIBI

    常规注射    天数        数量(微克)        途径        佐剂

    原始        0           5                 皮下        FCA

    加强#1      14          1                 腹膜内      RIBI

    加强#2      28          1                 腹膜内      RIBI

    加强#3      42          1                 腹膜内      RIBI

    在杀死时(RIMMS)或加强后几天收集(常规的)血清,在ELISA测定中测定抗MSCRAMM蛋白质或对完整的细胞(表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌)的效价。在最后的加强之后3天,去除脾脏或淋巴结,挑开成单细胞悬浮液,收集淋巴细胞。然后将淋巴细胞与P3X63Ag8.653骨髓瘤细胞系(ATCC & CRL-1580)融合。根据Current Protocols in Immunology(第2章,第2单元)中的生产单克隆抗体的方案进行细胞融合,随后涂覆平板和喂养,所述文献都通过在此引述而合并于本文。

    然后利用标准的ELISA分析方法,从融合产生的任何克隆中筛选特异的抗-SasA抗体的产生。扩增阳性的克隆,进一步通过流式血细胞计数测试完整的细菌的细胞结合测定中的活性以及Biacore分析中SasA的结合。在整个Biacore分析中,流速保持在10毫升/分钟不变。在注射SasA或DgsK之前,借助于RAM-Fc结合,将测试抗体吸附到芯片。在时间0,将浓度为30mg/ml的SasA或DgsK注射过芯片3分钟,随后解离2分钟。对该阶段的分析测定Mab/SasA和DgsK相互作用的相对关系和解离常数。

    接著,对上面提到的抗体与完整细菌的结合情况进行测试。在该测试中,用兔子IgG(50mg/ml)封闭之后,收集,洗涤细菌的样品金黄色葡萄球菌Newman,金黄色葡萄球菌60,金黄色葡萄球菌397(Sal6),金黄色葡萄球菌Wood,金黄色葡萄球菌8325-4,甲氧苯青霉素抗性的金黄色葡萄球菌MRSA 16,表皮葡萄球菌ATCC 35984,表皮葡萄球菌HB,表皮葡萄球菌CN-899和溶血葡萄球菌ATCC 43253,用浓度为2pg/ml的Mab或仅用PBS(对照)保温。在用抗体保温之后,将用作为检测抗体的山羊-F(ab′)2-抗-小鼠-F(ab′)2-FITC用于孵育细菌的细胞。在抗体标记之后,用FACS管径流式细胞计数器抽吸细菌的细胞以分析荧光射出(刺激:488,发射:570)。对于各个细菌的菌株,收集和检测10,000个样品。这些资料显示抗金黄色SasA的抗体能够识别凝固酶阴性的葡萄球菌的表面的同源的蛋白质。该资料支持Western印迹分析,表明抗金黄色葡萄球菌SasA的兔子多克隆抗体与从表皮葡萄球菌HB细胞表面释放的蛋白质以及来自于从表皮葡萄球菌克隆的DsgK的重组A-区域发生交叉反应(参见附图6和下表3)。

                                         表3多克隆血清反应性    New    man  67-0  397  (SAL6) Wood 46  8325  -4 MRS A16 ATCC 3598 HB CN- 899 ATCC 4325 4 3常规小鼠血清    -    -  - -  - - - - -小鼠抗SasA    +    +  +/- -  + + + + + +

    虽然利用重组形式的本发明的表面蛋白质生产抗体是优选的,但是该抗体可以从这些蛋白质天然分离的和纯化形式或其活性区域例如A区域制备抗体,以类似于上面所述的方式利用这些蛋白质或活性的区域可以产生单克隆抗体或多克隆抗体以获得这样的抗体。仍然其他的常规的方法,利用重组或天然的纯化蛋白质或其活性区域,可用于产生本发明的抗体,正如本领域内技术人员可以识别的。

    正如本领域内技术人员可以认识到的,本发明的抗体也可以配制成可用于人或动物患者给药的合适的药学的组合物,以便治疗或预防葡萄球菌的细菌引起的感染。含有本发明的抗体的药物组合物,或其有效的片段,可以与本领域内常用的合适的药物介质,赋形剂或载体结合配制,包括例如盐水,葡萄糖,水,甘油,乙醇,其他的治疗化合物和其结合使用。本领域内技术人员应该认识到,所使用的特定的介质,赋形剂或载体将依据患者和患者的状况而改变,如本领域内技术人员将会认识到的各种各样的给药方式适用于本发明的组合物。在本申请中公开的以药物组合物给药的合适的方式包括,但不限于,局部的,口部的,肛门的,阴道的,静脉内的,腹膜内的,肌内的,皮下的,鼻内的和真皮内的给药。

    对于局部的给药,将组合物配制成软膏,乳膏,凝胶,洗液,滴剂(例如眼药水和耳朵滴剂),或溶液(例如漱口剂)。可以将组合物埋植于伤口或外科的敷料,缝合线和气溶胶。该组合物可以含有常规的添加剂。例如防腐剂,溶剂以促进渗透和润滑药。局部的制剂也可以含有常规的载体例如乳膏或油膏基底,乙醇或油酰醇。另外,通常也可以将抗体组合物,和涉及其他MSCRAMM的组合物,疫苗,方法和应用的其他的信息用于本发明,涉及前面提到的MSCRAMM和它们的活性的区域和其抗体,这些其它的MSCRAMM公开于例如美国专利5,175,096;5,320,951;5,416,021;5,440,014;5,571,514;5,652,217;5,707,702;5,789,549;5,840,846;5,980,908;6,086,895;6,008,341;6,177,084;5,851,794和6,288,214;所有这些专利都通过在此引述而合并于本文。

    本发明的抗体组合物也可以与其量可有效地加强致免疫的应答的合适的佐剂一起给药。例如,合适的佐剂可以包括广泛用于人的明矾(磷酸铝或氢氧化铝),和其他的佐剂例如皂甙和其纯化的组分Quil A,弗氏完全佐剂,RIBBI佐剂,和其它用于研究和兽医应用的佐剂,还有其他以化学方法定义的制剂例如muramyl二肽,一磷酰脂类A,磷脂轭合物例如Goodman-Snitkoff等人在J.Immunol.147:410-415(1991)描述的,该文献通过在此引述而合并于本文,蛋白脂质体内的偶合物的形成胶囊如Miller等人,J.Exp.Med.176:1739-1744(1992),该文献通过在此引述而合并于本文,脂类载体中蛋白质形成胶囊如NovasomeTM脂类载体(Micro Vescular System,Inc.,Nashua,NH)也可以使用。

    在任何情况下,本发明的识别蛋白质或如上文提出的它们的活性的区域的抗体组合物可用于预防或治疗葡萄球菌的感染的方法,可用于抑制葡萄球菌的细菌与宿主组织和/或细胞的结合。根据本发明,提供了预防或治疗葡萄球菌的感染的方法,包括以有效量的抗体给本文提出的表面蛋白或其活性的亚区域以便治疗或预防葡萄球菌的感染。另外,这些单克隆抗体可用于损害葡萄球菌的细菌与宿主细胞的结合。

    因此,根据本发明,将本发明的抗体以如上所述的任何常规的方法(例如,局部的,非肠道的,肌内的,等)给药,因此当将有效量的抗体组合物给人或动物患者给药时,提供了一种治疗或预防人类或动物患者的葡萄球菌的感染的非常地有用的方法。有效量是指足以阻止细菌粘合,抑制葡萄球菌的细菌结合到宿主细胞从而可用于治疗或阻止葡萄球菌的感染的使用水平,例如抗体效价的水平。如本领域内普通技术人员认识到的,有效地治疗或预防葡萄球菌的感染所必需的抗体效价的水平将依据患者的特性和健康状况,和/或预存在的葡萄球菌的感染的严重程度。

    除了用于治疗或预防葡萄球菌的感染的方法中,本发明的抗体也可用于葡萄球菌的蛋白质的特定的检测或作为研究工具。本文所述的术语″抗体″包括单克隆,多克隆,嵌合,单链,双特异性,simianize,和人性化的或灵长目化的抗体以及Fab片段,例如保持抗体与上面详细说明的表面蛋白质的抗体的结合特异性的那些片段,包括Fab免疫球蛋白表达文库的产物。因此,本发明涉及单链的使用例如抗体的可变的重和轻链。这些类型的抗体或抗体片段的制备是本领域内技术人员熟知的。在本发明中,抗表面蛋白质或上面所述的它们的活性的区域的抗体可以制备,分离和/或纯化,然后用于治疗或免受葡萄球菌的感染。

    上面描述的任何抗体可直接用可检测的标签进行标记以识别葡萄球菌细菌和对其定性。免疫测定中使用的标记物通常是本领域内技术人员已知的,并且包括酶,放射性同位素,荧光,发光的和产色的物质,包括有色的颗粒例如胶态的金或胶乳珠子。合适的免疫测定包括酶联免疫吸附(ELISA)。

    或者,通过与具有免疫球蛋白亲合力的标记的物质可以间接标记该抗体。该抗体可以与第二物质偶合,用已标记的第三物质进行检测,该第三物质与偶合到抗体的第二物质具有亲和力。例如,可以将抗体结合到生物素,利用标记的抗生物素蛋白或链生抗生物素蛋白可以检测抗体-生物素偶合物。类似地,可以将该抗体偶合到半肝素,利用标记的抗半肝素抗体检测抗体-半肝素偶合物。这些和其他标记抗体和分析偶合物的其他方法是本领域内技术人员熟知的。

    根据本发明,还提供了被设计为治疗或保护其抵抗葡萄球菌感染的主动或被动免疫接种疫苗,可以利用许多本领域内熟知的常规疫苗制备方法从以上提出的表面蛋白质或活性区域制备这些疫苗。对于典型的疫苗,将致免疫量的合适的表面蛋白或其活性片段与合适的药物学可接受载体,媒介物或赋形剂结合,合适的是可以以有效地免疫接种人或动物患者的疫苗的量给药。本领域技术人员认识到致免疫量是指能够在人或动物患者中产生免疫应答的蛋白质或活性片段或其亚片段的量。

    除了借助于将免疫量的本发明的蛋白质或活性片段导入或给药产生的抗体的活性疫苗以外,也可以将本发明的分离的抗体或活性片段用于研制抗钩环感染的被动免疫接种的疫苗。在这样的情况下,可以将如上所述的抗体组合物,即有效量的抗体和药物学可接受的载体,媒介物或赋形剂以适当方式给药到人或动物患者。

    因此,本发明的蛋白质或其活性片段可用作为活性疫苗,本发明的抗体可用作为被动疫苗,可用于提供合适的抗体以治疗或予防葡萄球菌感染。本领域内技术人员将会认识到,可以将一秒包装以适用于许多方式给药,例如非肠道的(即肌内的,透皮的或皮下的)给药或鼻咽的(即鼻内的)给药。一种这样的方式是将疫苗通过肌内注射到例如三角肌,但是,给药的特定方式将依赖于待治疗的细菌感染的特性和患者的状况。优选的是将该疫苗与药物学可接受的载体,媒介物或赋形剂结合以有助于给药,通常该载体是有或没有防腐剂的水,或缓冲盐水。该疫苗可以是在给药时重悬浮的冻干形式或溶液形式。

    另外,在某些情况下,如必要可以将本发明的抗体进行修饰,以对给药患者的致免疫性降低,例如,如果该患者是人。通过将杂交瘤衍生的抗体的complimentarity表位移植到如Jones等人,Nature 321:522-525(1986)或Tempest等人/Biotechnology 9:266-273(1991)描述的人单克隆抗体而将抗体“人性化”或通过将免疫球蛋白可变区中的表面接触的鼠骨架残基改变为模拟同源的人骨架配体如由Padlan,Molecular Imm.28:489-498(1991)描述而进行″胶合″,这些文献都通过在此引述而合并于本文。甚至于进一步地,如果需要,本发明的单克隆抗体可以与合适的抗生素结合给药以进一步加强所述组合物抗击细菌感染的能力。

    除了治疗人或动物患者以外,本发明的组合物也可以用于停止或予防医学装置或其他生物材料例如移植片的感染。待用抗体,蛋白质和活性片段包被的医学装置或聚合物生物材料包括,但不限于钩环,缝合线,复位心脏瓣膜,心脏的协助装置,硬的和软的接触透镜,眼内的透镜植入片(前的室或后的室),其他的植入片例如角膜的镶嵌物,kerato-修补物,血管的斯滕特氏印模,epikeratophalia装置,绿内障分流术,视网膜的钩环,巩膜的扣子,牙齿的修补物,thyroplastic装置,laryngoplastic装置,血管的移植片,软的和硬的组织修补物,包括但不限于,泵,电的装置包括刺激器和记录器,听觉的修复术,起搏器,人工的喉,牙齿的植入片,乳房的植入片,阴茎的植入片,cranio/脸的腱,人工的关节,腱,纽带,menisci,和磁盘,人工的骨骼,人工器官包括人工胰腺,人工心脏,人工的肢,和心脏瓣膜,斯滕特氏印模,金属丝,导向装置丝,静脉内的和中央的静脉的导管,激光和气球血管成形术装置,血管的和心脏装置(管子,导管,气球),室的协助,血透析组合物,血氧合器,尿道的/输尿管的/泌尿的装置(Foley导管,斯滕特氏印模,管和气球),导气管导管(气管内的和气管造口术管和胶管管头),肠内的喂养管(包括nasogastric,胃内的和空肠的管),伤口排水管,用于引流体腔的管例如胸膜的,腹膜的,颅侧的和心包的cavities,血袋,测试管,血收集管,vacutainers,注射器,针,吸移管,吸量管尖端,和血造管。

    本领域内技术人员将会明白,本文所用的术语″被包被″或″包被″是指将抗体或活性片段或其衍生的药物组合物应用到装置的表面,优选的是与葡萄球菌细菌感染接触的外表面。该装置的表面不必完全被蛋白质,抗体或活性片段所覆盖。

    本发明抗体给药的优选剂量是有效地抑制或治疗葡萄球菌感染的量,易于认识到该量将大大依赖于感染的特性和患者的状况。如上所述,用于本发明的抗体或药物制剂的“有效量”是指无毒但足以产生需要的予防或治疗效果的剂量。正如上文指出的,所需要的抗体或特定试剂的精确量将随患者而变化,取决于患者的种类,年龄,和总的状态,待治疗的状况的严重程度,所使用的特定的载体或赋形剂和给药方式等等。因此,特定抗体组合物的“有效量″将基于特定的环境而变化,普通技术人员利用唯一的常规试验可以测定各种应用情况下合适的有效量。可以将该剂量调节到适应于以该组合物给药的个体,并且随患者的年龄,重量,代谢而变化。该组合物还可以含有稳定剂或药物学可接受的防腐剂,例如硫汞撒(乙基(2-mercaptobenzoate-S)汞钠盐)(Sigma Chemical Company,St.Louis,MO)。

    当与合适的标记物或其他合适的可检测的生物分子或化学物质一起使用时,本文描述单克隆抗体可用于体内或体外诊断葡萄球菌感染或检测葡萄球菌细菌的目的。通过这样的抗体的使用也有助于试验室研究。各种类型的标记物和将标记物偶合到本发明的抗体的方法是本领域内技术人员熟知的,例如下面列出的一种方法。

    例如,可以将抗体偶合到(直接或通过螯合剂)放射性标记物例如,但不限于32P,3H,14C,35S,125I,或131I。通过例如闪烁计数,γ射线分光光度计放射自显影的方法可以检测标记物。也可以使用生物发光标记物,例如萤火虫荧光素衍生物。采用常规方法生物发光物质可以共价结合到该蛋白质,当酶例如荧光酶催化引起生物发光的与ATP的反应以散发光子时,可以检测标记物蛋白质。也可以将荧光团用于标记蛋白质。荧光团的例子包括荧光和衍生物,藻红蛋白,allo-藻蓝蛋白,藻蓝蛋白,硷性蕊香红,和德克萨斯红。通常荧光团可以通过荧光检测器进行检测。

    通过对如上所述的抗体进行标记和根据本领域内技术人员熟知的方法例如免疫荧光显微镜,利用如Warren等人(Mol.Cell.Biol.,7:1326-1337,1987)描述的程序,对标记物进行检测可以测定细胞中配体的定位。

    如上所述,本发明的单克隆抗体,或活性部分或其片段特别适用于干扰负责感染的葡萄球菌病原体和哺乳动物宿主之间的起始物理相互作用,这种对物理相互作用的干扰可用于治疗患者和in-dwelling医学装置予防或降低细菌感染以使它们在使用时更安全。

    在本发明的另一个实施例中,提供了一种可用于分离和识别葡萄球菌细菌感染的试剂盒,包括在单个容器中的合适形式,例如冻干的本发明的抗体,然后通过加入怀疑含有葡萄球菌细菌的含水的样品而变成活性。这样的试剂盒通常包括用于储存合适形式抗体和合适的免疫检测试剂的合适的容器,所述的免疫检测试剂允许识别结合到本发明的表面蛋白质或抗体的复合物。通常,这些试剂盒含有本发明的抗体和识别当来自患者的样品导入到该抗体时识别结合的抗体的工具。例如,合适的免疫检测试剂可以包括合适的可检测的信号或标记物,例如生物素或产生可检测的颜色的酶等,可以连接到抗体或用于其他合适的方式中标记物以便当抗体结合到抗原时提供可检测的结果。

    简单地说,识别和结合到本发明的表面蛋白质的本发明的抗体或其活性片段可用于治疗各种各样的人和动物患者的葡萄球菌感染,以及用于医疗或其他in-dwelling装置。根据本发明,由于这些蛋白质的特性,以及它们含有与其他类型的葡萄球菌细菌的蛋白质共有的表位,即来自凝血酶阴性葡萄球菌的蛋白质将产生识别来自金黄色葡萄球菌的同源蛋白的抗体或者相反,本发明的抗体将显示交叉反应性和应该有效地抗击广谱的葡萄球菌感染。因此,本发明提供了用于治疗或抵抗广谱葡萄球菌感染的方法和改善的方法中的组合物。

    实施例

    提供下面的实施例,举例说明本发明的优选的实施方式的各个方面。本领域内技术人员应该认识到实施例中公开的技术允许代表发明人发现的技术以实施本发明,因此可以认为构成了实施本发明的优选的方式。但是,本领域内技术人员应该认识到,在本发明公开的基础上,可以在公开的特定的实施方式中进行许多改变,仍然可获得类似的结构而不脱离本发明的精神和范围。

    实施例1.金黄色葡萄球菌的MSCRAMM′s的分离和测序

    已知金黄色葡萄球菌表达一类表面结合的蛋白质,所述的蛋白质通过允许细菌避免宿主防御和通过作为adhesins对致病性起重要作用。已知这些蛋白质是MSCRAMMs(识别粘附的基质的分子的微生物表面成分),在大多数情况下,可以共价结合到细胞壁肽葡聚糖。它们有几个共同的特征:(i)Sec-依赖性分秘所需要的N-末端信号肽(长度约40个残基),(ii)富含脯氨酸和甘氨酸残基或由丝氨酸和天冬酰胺二肽重复区组成的跨膜区,(iii)该蛋白质与肽葡聚糖中的五甘氨酸桥键共价结合需要的LPXTG基序,(iv)疏水的跨膜区,以及其后的(v)几个带正电荷的残基。

    通过开发金黄色葡萄球菌的整个基因组序列,鉴别8个编码具有分秘和锚基基序指示MSCRAMMs的蛋白质的新的开放读框(即携带N-末端的信号肽和C-末端LPXTG基序,随后跟随一个疏水的功能域和一个带正电荷的尾部)。下面的表说明了所识别的蛋白质名录,包括他们在基因组中的分布,他们的蛋白质大小,和挑选C-末端细胞壁的序列。 名称分布大小 C-末端 EkeS ENCSJM2189aa LPNTGSEEMDLPLKELALITGAALL ARRRSKKEKES DsqA ENCSJM-1363-2283aa LPDTGDSIKQNGLLGGVMTLLVGL GLMKRKKKKDENDQDDSQA KesK ENCSJM-909aa LPKTGETTSSQSWWGLYALLGMLA LFIPKFRKESK KrkN2 ENCSJM-278aa LPKTGLTSVDNFISTVAFATLALLGS LSLLLFKRKESK KrkN ENCSJM-661aa LPQTGEESNKDMTLPLMALIALSSI VAFVLPRKRKN RkaS ENCSJM-801aa LPKTGTNQSSSPEAMFVLLAGIGLI ATVRRRKAS RrkN NCSJM1629aa LPKTGLESTQKGLIFSSIIGIAGLML LARRRKN KnkA NCSJM629aa LPKAGETIKEHWLPISVIVGAMGVL MIWLSRRNKLKNKA

    缩写:eMRSA-16;N,8325;C,COL;S,MSSA;J,N315,M,Mu50。

    8个蛋白质中的6个存在于已经被测序的所有六个葡萄球菌的基因组中,剩余的2个存在于5/6的这些基因组中。

    下面是DNA和蛋白质序列的名录:

    Ekes MRSA(SEQ ID NO:1)

    acaacacagcagagaatagacaaccaggaggaaaacgaaatgaatttgttaaagaaaaataaatatagtattag

    aaaatataaagtagggatattctctactttaatcgggacagttttattactttcaaacccaaatggtgcacaagctttaac

    tacggatcataatgtgcaaggtggttcaaatcaagcattacctggcaactcacaaaatacaaatgccgatactaatc

    gagacatagtaaatgattcgcaaaatactcctaatgcacatgcaacagacaatacatcaacaaatcaagcattgac

    taatcatcaaaacgttgatgtggcaaatcaagtcgggcctgctccaatacagcctagcgcgtcgcctgcgcaaaata

    ataataattctaatgctaattcaacagcaacagagccagcggcgaatacaaataataatttagcatcaaataacaat

    acattaaacgtgcctaataatacagataacaatgattcagcgcgtcatctgactttaaaagaaattcaagaagatgtt

    cgtcattcgtctgataagccagagttagttgcgattgctgaagaagcatctaatagaccgaaaaagagaagcagac

    gtgctgcgccaacagatcctaatgcaacaccagcagatccaacggctacaccagcagatccaacggcaggaaat

    ggtagtgcaccagttgcaattacagcgccatacacgccaacaactgatcccaatgccaataatataggacaaaatg

    cacctaacgaagtgctttcatttgatgataacaacattagaccaagtacgaaccgttctgtgcctacagtaactgttgtt

    gataatttaccaggctacacactgattaatggtggtaaagtaggggtgtttagtcatgcaatggtaagaacgagcatgt

    ttgattcaggagatgccaagaactatcaagcgcaaggcaatgtaattgcattgggtcgtattagaggaaatgataca

    aatgatcatggcgattttaatggtatcgagaaaacattaacagtaaatccgaattctgaattaatctttgaatttaatact

    atgactactaaaaactatcaaggtatgacaaatttaatcattaaaaatgctgataacgatactgttattggtgaaaaag

    tagttgcttatggtccgatttggcgcttattaaaagtacctgaaaatgttagtcatctaaaaattcaatttgtacctaaaaat

    gacgcaataacagatgcacgtggtatttatcaattacgagatggatataaatactatgactttgtagactcaatcggtct

    tcattctgggtcacatgtctatgttgaaagacgtacaatggagccaacagcaacaaataataaagaatttacagttac

    aacgtcattaaagaataatggtaactttggcgcttcattcaatacagatgattttgtatataaaattcaattacctgaaggt

    gttgaatatgtaaataattcattgactaaagattttcctagcggtaattcaggtgttgatattaatgatatgaatgtgacgta

    tgacgcagcaaatcgaattattacaattaaaagtactggtggaggtacagggaattcgccggcacgactaatgcctg

    ataaaatattggatttgaagtataagctacgtgtgaacaatgtgccaacaccaagaacagtaacatttaacgatacat

    taacgtataaaacatattcacaagattttattaattcacctgctgaaagtcatactgtaagtacaaatccatatacaattg

    atatcatcatgaataaagacgcattgcaagccgaagtcgatagacgaattcaacaagcggattatacatttgcatcat

    tagatatttttaatgatcttaaaagacgcgcacaaacaattttagatgaaaaccgtaacaatgtacctttaaacaaaag

    agtttctcaagcagatatcgattcattagcaaatcagatgcaacatacgttaattcgcagtgttgacgctgaaaatgcc

    gttaatagaaaagttgatgacatggaagatttagttaaccaaaatgatgaactgacagatgaagaaaaacaagca

    gcgattcaagtcatcgaggaacataaaaatgaaattattgggaatattggtgaccaaacgactgatgatggcgttact

    agaattaaagatcaaggtatacagactttaagtggagacactgcaacaccagttgttaaaccaaatgctaaacaag

    ctatacgtgataaagcagcgaaacaaagagaaattatcaatcacacgccagatgctactcaagatgaaattcaag

    atgcattaaatcaattaacaacggatgaaacagatgctattgataatgttacgaatgctactaccaatgctgatgttga

    aacagctaaaaataatggtattaatacaattggtgcagttgcgccacaagtgacacacaaacaagctgcaagaga

    tgcaattaatcaagcgacagcaacgaaacgacaacaaataaatagcaatagagaagcaacacaagaagaga

    aaaatgcagcattgaatgaattaacgcaagccacgaaccacgcattagaacaaatcaatcaagcgacaaccaat

    gatgatgtagatactgccaaaggtgatggtctgaatgccattaatcctattgcgcctgtaactgttgtcaagcaagcag

    caagagatgccgtatcacatgatgcacaacagcatatcgcagagatcaatgcaaatcctgatgcgactcaagaag

    aaagacaagcagcaatagagaaagtaaatgctgctgtagctgttgcgaatactaatatattaaatgctaataccaat

    gctgatgttgagcaagtaaagacaaatgcaattcaaggtatacaagccattgaaccagctacaaaggttaaaaca

    gatgctaaaaacgctattgatcaaagtgcggaaacgcaacataatgcgatatttaataataatgatgcgaccttaga

    agagcaacaagcagcacaacaattgcttgatcaagctgtagccacagcgaagcaaaatattaatgcagcagata

    cgaatcaagaagttgcacaagcaaaagatcagggcacacaaaatatagttgtgattcaaccggcaacacaagtta

    aaacggatgcacgcaatgctgtaaatgaaaaagcgcgagaggcgataacaaatatcaatgctacacctggcgcg

    actcgagaagagaaacaagaagccgataaatcgtgtcaatacacttaaaaatagagcattaaatgatattggtgtga

    cgtctactactgcgatggtcaatagtattagagacgatgcagtcaatcaaatcggtgcagttcaaccgcatgtaacga

    agaaacaaactgctacaggtgtattaacggacttagcaactgcaaaaaaacaagaaattaatcaaaatacaaatg

    caaccactgaagaaaagcaagtagcattaaatcaagtagaccaagatttagcaacggcaattaataatataaatc

    aagctgatactaatgcagaagtagatcaagcacaacaattaggtacaaaagcaattaatgcgattcagccaaatat

    tgtaaaaaaacctgcagcattagcacaaaccaatcagcattatagtgctaaattagttgaaatcaatgctacaccag

    atgcaacagatgatgagaaaaatgctgcgatcaatactttaaatcaagacagacaacaagctattgaaagtattaa

    acaagcaaatacaaatgcggaagtagaccaagctgcgacagtggcagagaataatatcgatgctgttcaagttga

    cgttgtaaaaaaacaagcagcgcgagataaaatcactgctgaagtagcgaagcgtattgaagcggttaaacaaa

    cacctaatgcaactgacgaagaaaagcaggctgcagttaatcaaatcaatcaacttaaagatcaagcgtttaatca

    aattaatcaaaaccaaacaaatgatcaggtagacgcaactacaaatcaagcgattaatgctatagataatgttgaa

    gctgaagtagtaattaaaccaaaggcaattgcagatattgaaaaagctgttaaagaaaagcaacagcaaattgat

    aatagtcttgattcaacagataatgagaaagaagttgctttacaagcattagctaaagaaaaagaaaaagcacttg

    cagctattgaccaagctcaaacgaatagtcaggtgaatcaagcggcaacaaatggtgtatcagcgattaaaattatt

    caacctgaaacaaaaattaaaccagcagcacgtgaaaaaatcaatcaaaaagcgaatgaattacgtgcgcaaa

    ttaatcaagataaagaagcgacagcagaagaaagacaagcggcgttagataaaatcaatgatttagttgctaaag

    ctatgacaaatatcacgaatgatagaacaaatcagcaagttaatgactcaacaaatcaagcgcttgacgacattgc

    attagtgacgcctgaccatattgttagagcagctgctagagatgcagttaagcaacaatatgaagctaaaaagcac

    gaaattgagcaagcggaacatg cgactgatgaagaaaaacaagttgctttaaatcaattagcgaataatgaaaaa

    cgtgcattacaaaacattaatcaagcaatagcgaataatgatgtgaaacgtgttgaatcaaatggtattgctacgttaa

    aaggcgtagaaccgcacattgtggttaaacctgaagctcaagaagccataaaagcgagcgcagataaccaagta

    gaatctataaaagatacaccacatgctacgacagatgaattagatgaagcaaaccaacaaataaacgacacactt

    aaacaaggtcaacaagatatagacaatacgacacaagatgcagctgtcaatgatgttagaaaccaaacgattaa

    ggcaatcgaacaaattaaaccgaaagttagacgcaaacgtgcagcgttggataacattgatgaaagtaataataat

    caactcgatgcaatacgaaatacgctagatacaacgcaagatgaacgaaatgttgctattgctgcgttaaataaaat

    tgttaatgcaattaaaaatgatattgcacaaaacaaaacgaatgcagaagtggatcaaactgaggctgatggtaac

    aacaacatcaaagtgattttacctaaagttcaagttaaaccagcagcgcgtcaatctgtcagcgcaaaagctgaag

    ctcaaaatgcacttattgatcaaagtgatttatctaccgaagaagaaagattagctgctaaacatttagtagaacaag

    cacttaatcaagctattgatcagatcaatcacgcagataagactgcgcaagttaatcaaaatagtatcgatgctcaaa

    atattatttcaaaaattaaaccagcgacaacagttaaagcaacagcattacaacaaattcaaaatatcgctacaaat

    aaaattaatttaattaaagcaaataacgaagcgacagatgaagaacaaaatgctgcaatagtacaagttgaaaaa

    gagttaattaaagctaaacaacaaattgctggtgcagtgactaatgctgatgtggcatatttattgcatgatgggaaaa

    acgaaattcgtgaaatcgaacctgttattaataaaaaagcaactgcgcgagaacaattaacaacattattcaacgat

    aagaaacaagcaattgaagcgaatgttcaagcaacagtagaagaaagaaatagtattttagcacagttacaaaa

    catttatgacactgctattggacaaattgatcaagatcgtagcaatgcacaagttgataaaacagcaacattaaatct

    acaaacaatacatgatttagacgtacatcctattaaaaagccagatgctgaaaaaacgattaatgatgatcttgcac

    gtgttacacatttagtgcaaaattatcgaaaagtaagtgatcgtaataaggctgatgcattaaaagctataactgcatt

    aaaattacaaatggatgaagaattaaaaacagcacgcactaatgctgatgttgatgcagttttaaaacgatttaatgtt

    gcattaggcgatatagaagcagtaattactgaaaaagaaaatagcttactgcgcattgataacattgctcaacaaac

    atatgcgaaattcaaagcgatcgcaacaccagaacaattagctaaagtaaaagcattaattgatcaatatgttgcag

    atggcaatagaatggttgatgaagatgcgacattaaatgacatcaaaaaagatacgcaactcattattgatgaaattt

    tagcaattaaattacctgctgaagtgataaaagcgtcaccaaaagtggggcaacctgctccaaaagtttgtacgcct

    attaaaaaagaagataaacaagaagtgcgaaaagttgtaaaagaacttccaaatactggttctgaagaaatggatt

    taccattaaaagaattagcactaattacaggcgcagcattattagctagaagacgttctaaaaaagaaaaagaatc

    ataa

    EkeS_MRSA(SEQ ID NO:2)

    MNLLKKNKYSIRKYKVGIFSTLIGTVLLLSNPNGAQALTTDHNVQGGSNQALPGNS

    QNTNADTNRDIVNDSQNTPNAHATDNTSTNQALTNHQNVDVANQVGPAPIQPSA

    SPAQNNNNSNANSTATEPAANTNNNLASNNNTLNVPNNTDNNDSARHLTLKEIQE

    DVRHSSDKPELVAIAEEASNRPKKRSRRAAPTDPNATPADPTATPADPTAGNGSA

    PVAITAPYTPTTDPNANNIGQNAPNEVLSFDDNNIRPSTNRSVPTVTVVDNLPGYTL

    INGGKVGVFSHAMVRTSMFDSGDAKNYQAQGNVIALGRIRGNDTNDHGDFNGIEK

    TLTVNPNSELIFEFNTMTTKNYQGMTNLIIKNADNDTVIGEKVVAYGPIWRLLKVPE

    NVSHLKIQFVPKNDAITDARGIYQLRDGYKYYDFVDSIGLHSGSHVYVERRTMEPT

    ATNNKEFTVTTSLKNNGNFGASFNTDDFVYKIQLPEGVEYVNNSLTKDFPSGNSG

    VDINDMNVTYDAANRIITIKSTGGGTGNSPARLMPDKILDLKYKLRVNNVPTPRTVT

    FNDTLTYKTYSQDFINSPAESHTVSTNPYTIDIIMNKDALQAEVDRRIQQADYTFASL

    DIFNDLKRRAQTILDENRNNVPLNKRVSQADIDSLANQMQHTLIRSVDAENAVNRK

    VDDMEDLVNQNDELTDEEKQAAIQVIEEHKNEIIGNIGDQTTDDGVTRIKDQGIQTL

    SGDTATPVVKPNAKQAIRDKAAKQREIINHTPDATQDEIQDALNQLTTDETDAIDNV

    TNATTNADVETAKNNGINTIGAVAPQVTHKQAARDAINQATATKRQQINSNREATQ

    EEKNAALNELTQATNHALEQINQATTNDDVDTAKGDGLNAINPIAPVTVVKQAARD

    AVSHDAQQHIAEINANPDATQEERQAAIEKVYAAVAVANTNILNANTNADVEQVKT

    NAIQGIQAIEPATKVKTDAKNAIDQSAETQHNAIFNNNDATLEEQQAAQQLLDQAVA

    TAKQNINAADTNQEVAQAKDQGTQNIVVIQPATQVKTDARNAVNEKAREAITNINA

    TPGATREEKQEAINRVNTLKNRALNDIGVTSTTAMVNSIRDDAVNQIGAVQPHVTK

    KQTATGVLTDLATAKKQEINQNTNATTEEKQVALNQVDQDLATAINNINQADTNAE

    VDQAQQLGTKAINAIQPNIVKKPAALAQTNQHYSAKLVEINATPDATDDEKNAAINT

    LNQDRQQAIESIKQANTNAEVDQAATVAENNIDAVQVDVVKKQAARDKITAEVAKR

    IEAVKQTPNATDEEKQAAVNQINQLKDQAFNQINQNQTNDQVDATTNQAINAIDNV

    EAEVVIKPKAIADIEKAVKEKQQQIDNSLDSTDNEKEVALQALAKEKEKALAAIDQA

    QTNSQVNQAATNGVSAIKIIQPETKIKPAAREKINQKANELRAQINQDKEATAEERQ

    AALDKINDLVAKAMTNITNDRTNQQVNDSTNQALDDIALVTPDHIVRAAARDAVKQ

    QYEAKKHEIEQAEHATDEEKQVALNQLANNEKRALQNINQAIANNDVKRVESNGIA

    TLKGVEPHIVVKPEAQEAIKASADNQVESIKDTPHATTDELDEANQQINDTLKQGQ

    QDIDNTTQDAAVNDVRNQTIKAIEQIKPKVRRKRAALDNIDESNNNQLDAIRNTLDT

    TQDERNVAIAALNKIVNAIKNDIAQNKTNAEVDQTEADGNNNIKVILPKVQVKPAAR

    QSVSAKAEAQNALIDQSDLSTEEERLAAKHLVEQALNQAIDQINHADKTAQVNQNS

    IDAQNIISKIKPATTVKATALQQIQNIATNKINLIKANNEATDEEQNAAIVQVEKELIKA

    KQQIAGAVTNADVAYLLHDGKNEIREIEPVINKKATAREQLTTLFNDKKQAIEANVQ

    ATVEERNSILAQLQNIYDTAIGQIDQDRSNAQVDKTATLNLQTIHDLDVHPIKKPDAE

    KTINDDLARVTHLVQNYRKVSDRNKADALKAITALKLQMDEELKTARTNADVDAVL

    KRFNVALGDIEAVITEKENSLLRIDNIAQQTYAKFKAIATPEQLAKVKALIDQYVADG

    NRMVDEDATLNDIKKDTQLIIDEILAIKLPAEVIKASPKVGQPAPKVCTPIKKEDKQEV

    RKVVKELPNTGSEEMDLPLKELALITGAALLARRRSKKEKES

    DsqA(8325)(SEQ ID NO:3)

    tctaatgaatgtaaagataatacaaggagttattacatgagtaaaagacagaaagcatttcatgacagcttagcaaa

    cgaaaaaacaagagtaagactttataaatctggaaaaaattgggtaaaatccggaattaaagaaatagaaatgttc

    aaaattatggggctaccatttattagtcatagtttagtgagtcaagataatcaaagcattagtaaaaaaatgacgggat

    acggactgaaaactacggcggttattggtggtgcattcacggtaaatatgttgcatgaccagcaagcttttgcggcttct

    gatgcaccattaacttctgaattaaacacacaaagtgaaacagtaggtaatcaaaactcaacgacaatcgaagcat

    caacatcaacagccgattccacaagtgtaacgaaaaatagtagttcggtacaaacatcaaatagtgacacagtctc

    aagtgaaaagtctgaaaaggtcacttcgacaactaatagtacaagcaatcaacaagagaaattgacatctacatc

    agaatcaacatcctcaaagaatactacatcaagttctgatactaaatctgtagcttcaacttcaagtacagaacaacc

    aattaatacatcaacaaatcaaagtactgcatcaaataacacttcacaaagcacaacgccatcttcggtcaacttaa

    acaaaactagcacaacgtcaactagcaccgcaccagtaaaacttcgaactttcagtcgcttagctatgtcaacatttg

    cgtcagcagcgacgacaaccgcagtaactgctaatacaattacagttaataaagataacttaaaacaatatatgac

    aacgtcaggtaatgctacctatgatcaaagtaccggtattgtgacgttaacacaggatgcatacagccaaaaaggtg

    ctattacattaggaacacgtattgactctaataagagttttcatttttctggaaaagtaaatttaggtaacaaatatgaag

    ggcatggaaatggtggagatggtatcggttttgccttttcaccaggtgtattaggtgaaacagggttaaacggtgccgc

    agtaggtattggtggcttaagtaacgcatttggcttcaaattggatacgtatcacaatacatctaaaccaaattcagctg

    caaaggcgaatgctgacccatctaatgtagctggtggaggtgcgtttggtgcatttgtaacaacagatagttatggtgtt

    gcgacaacgtatacatcaagttcaacagctgataatgctgcgaagttaaatgttcaacctacaaataacacgttcca

    agattttgatattaactataatggtgatacaaaggttatgactgtcaaatatgcaggtcaaacatggacacgtaatattt

    cagattggattgcgaaaagtggtacgaccaacttttcattatcaatgacagcctcaacaggtggcgcgacaaatttac

    aacaagtacaatttggaacattcgaatatacagagtctgctgttacacaagtgagatacgttgatgtaacaacaggta

    aagatattattccaccaaaaacatattcaggaaatgttgatcaagtcgtgacaatcgataatcagcaatctgcattga

    ctgctaaaggatataactacacgtccgtcgatagttcatatgcgtcaacttataatgatacaaataaaactgtaaaaat

    gacgaatgctggacaatcagtgacatattattttactgatgtaaaagcaccaactgtaactgtaggcaatcaaaccat

    agaagtgggtaaaacaatgaatcctattgtattgactacaacggataatggtactgggactgtgacaaatacagttac

    aggattaccaagcggattaagttacgatagtgcaacgaattcaatcattgggacaccaacaaaaattggtcaatca

    acagtgacagttgtgtctactgaccaagcaaataacaaatcgacgacaacttttacaataaatgttgtggatacgaca

    gcaccaacagtgacaccaataggagatcaatcatcagaagtgtattcaccaatatccccgattaaaattgctacgca

    ag ataacagtggaaatgcggtgacgaatacagtgactggattgccatccggactaacatttgatagtacaaataata

    ctattagtggtacaccaacaaacattggtacaagtactatatcaatcgtttctacagatgcgagcggtaacaaaacga

    cgacaacttttaaatatgaagtaacaagaaatagcatgagtgattccgtatcaacatcaggaagtacacaacaatct

    caaagtgtgtcaacaagtaaagctgactcacaaagtgcatcaacgagtacatcaggatcgattgtggtatctacatc

    agctagtacctcgaaatcgacaagtgtaagcctatctgattctgtgagtgcatctaagtcattaagcacatctgaaagt

    aatagtgtatcaagctcaacaagcacaagtttagtgaattcacaaagtgtatcatcaagcatgtcggattcagctagt

    aaatcaacatcattaagcgattctatttcaaactctagcagtactgaaaaatccgaaagtctatcaacaagtacatctg

    attcattgcgtacatcaacatcactcagtgactcattaagtatgagtacatcaggaagcttgtctaagtcacaaagctta

    tcaacgagtatatcagggtcgtctagtacatcagcatcattaagtgacagtacatcgaatgcaattagtacatcaacat

    cattgagcgagtcagctagcacctcggactctatcagtatttcaaatagcatagccaactctcaaagtgcgtcaacaa

    gcaaatcagattcacaaagtacatcaatatcattaagtacaagtgattcaaaatcgatgagtacatcagaatcattga

    gcgattcgacgagcacaagtggttctgtttctggatcactaagcatagcagcatcacaaagtgtctcaacaagtacat

    cagactcgatgagtacttcagagatagtaagtgactctatcagtacaagtgggtcattatctgcatcagacagtaaatc

    aatgtccgtaagtagttcaatgagcacgtctcagtcaggtagtacatcagaatcattaagtgattcacaaagtacatct

    gattctgatagtaagtcattatcacaaagtactagtcaatcaggttcaacaagtacatcaacgtcgacaagtgcttcag

    tacgtacttcggaatcacaaagtacgtctggttcaatgagtgcaagtcaatccgattcaatgagcatatcaacgtcgttt

    agtgattcaacgagtgatagcaaatcagcatcaactgcatcaagtgaatcaatatcacaaagtgcttctacgagcac

    atctggttcggtaagtacttcgacatcgttaagtacaagtaattcagaacgtacatcaacatctatgagtgattccacaa

    gcttaagtacatcagagtctgattcaataagtgaatcaacgtcaacgagcgactctataagtgaagcaatatctgcttc

    agagagcacgtttatatcattaagtgaatcaaatagtactagcgattcagaatcacaaagtgcatctgcctttttaagtg

    aatcattaagtgaaagtacgtctgaatcaacatcagagtcagtgagtagttcgacaagtgagagtacgtcattatcag

    acagtacatcagaatctggtagcacatcaacatcattaagtaattcaacaagtggtagtacgtccatttcaacatcga

    caagtatcagtgaatcaacgtcaacgtttaagagcgagagtgtttcaacatcactgagtatgtcaacgagtacaagtt

    tgtctgactctacaagtttgtcaacatcattaagtgattccacaagtgatagtaagtctgattcattaagtacatcaatgtc

    gacaagtgattcaatcagtacaagtaaatctgattccattagtacatccacatcattaagtggttctacaagtgaaagt

    gaatccgactcaacatcatcaagtgaaagtaaatccgattcaacatcaatgagcataagtatgtctcaatcaacatc

    aggaagtacaagtacgtcaacgagtacaagtttgtctgactcaacgagtacatcattgtcactaagtgcctcaatgaa

    tcaaagcggagtagactcaaactcagcaagccaaagtgcctcaaactcaacaagtacaagcacgagcgaatcc

    gattcacaaagcacatcatcatatacaagtcagtcaacaagccaaagtgaatccacatcgacatcaacgtcactaa

    gcgattcaacaagtatatctaaaagtacgagtcaatcaggttcggtaagcacatcagcgtcattaagtggttcagag

    agtgaatctgattcacaaagtatctcaacaagtgcaagtgagtcaacatcagaaagtgcgtcaacatcactcagtga

    ctcaacaagtacaagtaactcaggatcagcaagtacgtcaacatcgctcagtaactcagcaagcgcaagtgaatc

    cgatttgtcgtcaacatctttaagtgattcaacatctgcgtcaatgcaaagcagtgaatccgattcacaaagcacatca

    gcatcattaagtgattcgctaagtacatcaacttcaaaccgcatgtcgaccattgcaagtttatctacatcggtaagtac

    atcagagtctggctcaacatcagaaagtacaagtgaatccgattcaacatcaacatcattaagcgattcacaaagc

    acatcaagaagtacaagtgcatcaggatcagcaagtacatcaacatcaacaagtgactctcgtagtacatcagctt

    caactagtacttcgatgcgtacaagtactagtgattcacaaagtatgtcgctttcgacaagtacatcaacaagtatgag

    tgattcaacgtcattatctgatagtgttagtgattcaacatcagactcaacaagtgcgagtacatctggttcgatgagtgt

    gtctatatcgttaagtgattcgacaagtacatcaacatcggctagtgaagtaatgagcgcaagcatatctgattcacaa

    agtatgtcagaatctgtaaatgattcagaaagtgtaagtgaatctaattctgaaagtgactctaaatcgatgagtggctc

    aacaagtgtcagtgattctggctcattgagcgtctcaacgtcattaagaaaatcagaaagtgtaagcgagtcaagttc

    attgagttgctcacaatcgatgagcgattcagtaagcacaagcgattcgtcatcattaagtgtatcgacgtcactaaga

    agttcagaaagcgtgagtgaatctgattcattaagtgattcaaaatcaacaagtggttcgacttcaacaagtacatctg

    gttcattgagtacctcaacatcattaagtggttcagaaagcgtaagcgagtctacctcgctaagtgattcaatatcaatg

    agtgattctactagtacaagtgactccgactcattaagtggatcaatatctttaagtggttccacaagtcttagcacttcg

    gattcattaagtgattcaaaatcattgagtagctcgcaaagtatgagtggatcagaatcaacgtcaacaagtgtgagc

    gattcgcagtcaagctcaacaagtaatagtcaatttgactctatgagcatcagtgcatcagaaagcgactcaatgtct

    acaagtgattcgtctagcatcagtggatcaaattcaacgagtacatcactttcaacatctgactcaatgagcggaagc

    gtatcagtttcaacatcgacaagtttaagtgactcaatatcaggttcaacaagtgtaagtgactcgagctcaacaagc

    acatctacatcattaagtgattcaatgtcacaaagccagtcaacaagtacaagtgcatctggttccttaagtacatcga

    tatcaacatcaatgtcaatgagtgctagtacatcgtcatcacaaagcacatcggtgtcgacatcattatcaacatcag

    acagtatcagtgattctacttcaataagtatcagtggttcacaaagtacagtagaatcagaatctacaagtgattcaac

    ttctatcagtgactcagaatcattgagtacatcagattcagactcgacatcgacaagtacatcggactcaacaagtgg

    ttcaacttcaacaagcatatctgaatcattaagtacgtctggttcaggttcaacgagcgtatctgactcaacatcaatga

    gtgaatctaattcatcgagtgtttcaatgtcacaagacaaatccgactcaacatcaattagtgactcagaatcagtgtc

    aacaagcacatcaacgtcattgagcacatccgattcgacaagcacatccgaatcactgagtacatctatgtctggttc

    acaaagcatttctgactcaacatcaacaagtatgtccggctcaacaagtacatctgaatctaactcaatgcatccgtc

    agactcaatgagtatgcatcatactcacagcacgagcacatctcgcttatcaagtgaagcaacaacgagcacgagt

    gaatctcagtctacattaagtgcaacatctgaagtgactaaacataatggcacaccagcacaaagtgaaaaaaga

    ttgccagatacaggtgactcaataaaacaaaatggattactaggtggcgttatgacattattagttggtttaggtttaatg

    aagagaaagaaaaagaaagatgaaaatgatcaagatgattctcaagcataa

    DsqA(8325)(SEQ ID NO:4)

    SNECKDNTRSYYMSKRQKAFHDSLANEKTRVRLYKSGKNWVKSGIKEIEMFKIMG

    LPFISHSLVSQDNQSISKKMTGYGLKTTAVIGGAFTVNMLHDQQAFAASDAPLTSE

    LNTQSETVGNQNSTTIEASTSTADSTSVTKNSSSVQTSNSDTVSSEKSEKVTSTTN

    STSNQQEKLTSTSESTSSKNTTSSSDTKSVASTSSTEQPINTSTNQSTASNNTSQS

    TTPSSVNLNKTSTTSTSTAPVKLRTFSRLAMSTFASAATTTAVTANTITVNKDNLKQ

    YMTTSGNATYDQSTGIVTLTQDAYSQKGAITLGTRIDSNKSFHFSGKVNLGNKYEG

    HGNGGDGIGFAFSPGVLGETGLNGAAVGIGGLSNAFGFKLDTYHNTSKPNSAAKA

    NADPSNVAGGGAFGAFVTTDSYGVATTYTSSSTADNAAKLNVQPTNNTFQDFDIN

    YNGDTKVMTVKYAGQTWTRNISDWIAKSGTTNFSLSMTASTGGATNLQQVQFGT

    FEYTESAVTQVRYVDVTTGKDIIPPKTYSGNVDQVVTIDNQQSALTAKGYNYTSVD

    SSYASTYNDTNKTVKMTNAGQSVTYYFTDVKAPTVTVGNQTIEVGKTMNPIVLTTT

    DNGTGTVTNTVTGLPSGLSYDSATNSIIGTPTKIGQSTVTVVSTDQANNKSTTTFTI

    NVVDTTAPTVTPIGDQSSEVYSPISPIKIATQDNSGNAVTNTVTGLPSGLTFDSTNN

    TISGTPTNIGTSTISIVSTDASGNKTTTTFKYEVTRNSMSDSVSTSGSTQQSQSVST

    SKADSQSASTSTSGSIVVSTSASTSKSTSVSLSDSVSASKSLSTSESNSVSSSTST

    SLVNSQSVSSSMSDSASKSTSLSDSISNSSSTEKSESLSTSTSDSLRTSTSLSDSL

    SMSTSGSLSKSQSLSTSISGSSSTSASLSDSTSNAISTSTSLSESASTSDSISISNSI

    ANSQSASTSKSDSQSTSISLSTSDSKSMSTSESLSDSTSTSGSVSGSLSIAASQSV

    STSTSDSMSTSEIVSDSISTSGSLSASDSKSMSVSSSMSTSQSGSTSESLSDSQST

    SDSDSKSLSQSTSQSGSTSTSTSTSASVRTSESQSTSGSMSASQSDSMSISTSFS

    DSTSDSKSASTASSESISQSASTSTSGSVSTSTSLSTSNSERTSTSMSDSTSLSTS

    ESDSISESTSTSDSISEAISASESTFISLSESNSTSDSESQSASAFLSESLSESTSES

    TSESVSSSTSESTSLSDSTSESGSTSTSLSNSTSGSTSISTSTSISESTSTFKSESV

    STSLSMSTSTSLSDSTSLSTSLSDSTSDSKSDSLSTSMSTSDSISTSKSDSISTSTS

    LSGSTSESESDSTSSSESKSDSTSMSISMSQSTSGSTSTSTSTSLSDSTSTSLSLS

    ASMNQSGVDSNSASQSASNSTSTSTSESDSQSTSSYTSQSTSQSESTSTSTSLS

    DSTSISKSTSQSGSVSTSASLSGSESESDSQSISTSASESTSESASTSLSDSTSTS

    NSGSASTSTSLSNSASASESDLSSTSLSDSTSASMQSSESDSQSTSASLSDSLST

    STSNRMSTIASLSTSVSTSESGSTSESTSESDSTSTSLSDSQSTSRSTSASGSAST

    STSTSDSRSTSASTSTSMRTSTSDSQSMSLSTSTSTSMSDSTSLSDSVSDSTSDS

    TSASTSGSMSVSISLSDSTSTSTSASEVMSASISDSQSMSESVNDSESVSESNSE

    SDSKSMSGSTSVSDSGSLSVSTSLRKSESVSESSSLSCSQSMSDSVSTSDSSSLS

    VSTSLRSSESVSESDSLSDSKSTSGSTSTSTSGSLSTSTSLSGSESVSESTSLSDS

    ISMSDSTSTSDSDSLSGSISLSGSTSLSTSDSLSDSKSLSSSQSMSGSESTSTSVS

    DSQSSSTSNSQFDSMSISASESDSMSTSDSSSISGSNSTSTSLSTSDSMSGSVSV

    STSTSLSDSISGSTSVSDSSSTSTSTSLSDSMSQSQSTSTSASGSLSTSISTSMSM

    SASTSSSQSTSVSTSLSTSDSISDSTSISISGSQSTVESESTSDSTSISDSESLSTSD

    SDSTSTSTSDSTSGSTSTSISESLSTSGSGSTSVSDSTSMSESNSSSVSMSQDKS

    DSTSISDSESVSTSTSTSLSTSDSTSTSESLSTSMSGSQSISDSTSTSMSGSTSTS

    ESNSMHPSDSMSMHHTHSTSTSRLSSEATTSTSESQSTLSATSEVTKHNGTPAQ

    SEKRLPDTGDSIKQNGLLGGVMTLLVGLGLMKRKKKKDENDQDDSQA

    KesK1(8325)(SEQ ID NO:5)

    ttattatcaattaaatataatcttataggagttgttaacaacatgaacaaacatcacccaaaattaaggtctttctattctat

    tagaaaatcaactctaggcgttgcatcggtcattgtcagtacactatttttaattacttctcaacatcaagcacaagcag

    cagaaaatacaaatacttcagataaaatctcggaaaatcaaaataataatgcaactacaactcagccacctaagg

    atacaaatcaaacacaacctgctacgcaaccagcaaacactgcgaaaaactatcctgcagcggatgaatcactta

    aagatgcaattaaagatcctgcattagaaaataaagaacatgatataggtccaagagaacaagtcaatttccagtta

    ttagataaaaacaatgaaacgcagtactatcactttttcagcatcaaagatccagcagatgtgtattacactaaaaag

    aaagcagaagttgaattagacatcaatactgcttcaacatggaagaagtttgaagtctatgaaaacaatcaaaaatt

    gccagtgagacttgtatcatatagtcctgtaccagaagaccatgcctatattcgattcccagtttcagatggcacacaa

    gaattgaaaattgtttcttcgactcaaattgatgatggagaagaaacaaattatgattatactaaattagtatttgctaaa

    cctatttataacgatccttcacttgtaaaatcagatacaaatgatgcagtagtaacgaatgatcaatcaagttcagtcgc

    aagtaatcaaacaaacacgaatacatctaatcaaaatatatcaacgatcaacaatgctaataatcaaccgcaggc

    aacgaccaatatgagtcaacctgcacaaccaaaatcgtcaacgaatgcagatcaagcgtcaagccaaccagctc

    atgaaacaaattctaatggtaatactaacgataaaacgaatgagtcaagtaatcagtcggatgttaatcaacagtatc

    caccagcagatgaatcactacaagatgcaattaaaaacccggctatcatcgataaagaacatacagctgataattg

    gcgaccaattgattttcaaatgaaaaatgataaaggtgaaagacagttctatcattatgctagtactgttgaaccagca

    actgtcatttttacaaaaacaggaccaataattgaattaggtttaaagacagcttcaacatggaagaaatttgaagttt

    atgaaggtgacaaaaagttaccagtcgaattagtatcatatgattctgataaagattatgcctatattcgtttcccagtat

    ctaatggtacgagagaagttaaaattgtgtcatctattgaatatggtgagaacatccatgaagactatgattatacgcta

    atggtctttgcacagcctattactaataacccagacgactatgtggatgaagaaacatacaatttacaaaaattattag

    ctccgtatcacaaagctaaaacgttagaaagacaagtttatgaattagaaaaattacaagagaaattgccagaa

    aaatataaggcggaatataaaaagaaattagatcaaactagagtagagttagctgatcaagttaaatcagcagtga

    cggaatttgaaaatgttacacctacaaatgatcaattaacagatttacaagaagcgcattttgttgtttttgaaagtgaa

    gaaaatagtgagtcagttatggacggctttgttgaacatccattctatacagcaactttaaatggtcaaaaatatgtagt

    gatgaaaacaaaggatgacagttactggaaagatttaattgtagaaggtaaacgtgtcactactgtttctaaagatcct

    aaaaataattctagaacgctgattttcccatatatacctgacaaagcagtttacaatgcgattgttaaagtcgttgtggc

    aaacattggttatgaaggtcaatatcatgtcagaattataaatcaggatatcaatacaaaagatgatgatacatcaca

    aaataacacgagtgaaccgctaaatgtacaaacaggacaagaaggtaaggttgctgatacagatgtagctgaaa

    atagcagcactgcaacaaatcctaaagatgcgtctgataaagcagatgtgatagaaccagagtctgacgtggttaa

    agatgctgataataatattgataaagatgtgcaacatgatgttgatcatttatccgatatgtcggataataatcacttcga

    taaatatgatttaaaagaaatggatactcaaattgccaaagatactgatagaaatgtggataaagatgccgataat

    agcgttggtatgtcatctaatgtcgatactgataaagactctaataaaaataaagacaaagtcatacagctgaatcat

    attgccgataaaaataatcatactggaaaagcagcaaagcttgacgtagtgaaacaaaattataataatacagaca

    aagttactgacaaaaaaacaactgaacatctgccgagtgatattcataaaactgtagataaaacagtgaaaacaa

    aagaaaaagccggcacaccatcgaaagaaaacaaacttagtcaatctaaaatgctaccaaaaactggagaa

    acaacttcaagccaatcatggtggggcttatatgcgttattaggtatgttagctttattcattcctaaattcagaaaagaat

    ctaaataa

    KesK1(8325)(SEQ ID NO:6)

    LLSIKYNLIGVVNNMNKHHPKLRSFYSIRKSTLGVASVIVSTLFLITSQHQAQAAENT

    NTSDKISENQNNNATTTQPPKDTNQTQPATQPANTAKNYPAADESLKDAIKDPALE

    NKEHDIGPREQVNFQLLDKNNETQYYHFFSIKDPADVYYTKKKAEVELDINTASTW

    KKFEVYENNQKLPVRLVSYSPVPEDHAYIRFPVSDGTQELKIVSSTQIDDGEETNY

    DYTKLVFAKPIYNDPSLVKSDTNDAVVTNDQSSSVASNQTNTNTSNQNISTINNAN

    NQPQATTNMSQPAQPKSSTNADQASSQPAHETNSNGNTNDKTNESSNQSDVNQ

    QYPPADESLQDAIKNPAIIDKEHTADNWRPIDFQMKNDKGERQFYHYASTVEPATV

    IFTKTGPIIELGLKTASTWKKFEVYEGDKKLPVELVSYDSDKDYAYIRFPVSNGTRE

    VKIVSSIEYGENIHEDYDYTLMVFAQPITNNPDDYVDEETYNLQKLLAPYHKAKTLE

    RQVYELEKLQEKLPEKYKAEYKKKLDQTRVELADQVKSAVTEFENVTPTNDQLTD

    LQEAHFVVFESEENSESVMDGFVEHPFYTATLNGQKYVVMKTKDDSYWKDLIVEG

    KRVTTVSKDPKNNSRTLIFPYIPDKAVYNAIVKVVVANIGYEGQYHVRIINQDINTKD

    DDTSQNNTSEPLNVQTGQEGKVADTDVAENSSTATNPKDASDKADVIEPESDVVK

    DADNNIDKDVQHDVDHLSDMSDNNHFDKYDLKEMDTQIAKDTDRNVDKDADNSV

    GMSSNVDTDKDSNKNKDKVIQLNHIADKNNHTGKAAKLDVVKQNYNNTDKVTDKK

    TTEHLPSDIHKTVDKTVKTKEKAGTPSKENKLSQSKMLPKTGETTSSQSWWGLYA

    LLGMLALFIPKFRKESK

    KrkN2(8325)(SEQ ID NO:7)

    gaggaaaacaacatgacaaaacattatttaaacagtaagtatcaatcagaacaacgttca

    tcagctatgaaaaagattacaatgggtacagcatctatcattttaggttcccttgtatac

    ataggcgcagacagccaacaagtcaatgcggcaacagaagctacgaacgcaactaataat

    caaagcacacaagtttctcaagcaacatcacaaccaattaatttccaagtgcaaaaagat

    ggctcttcagagaagtcacacatggatgactatatgcaacaccctggtaaagtaattaaa

    caaaataataaatattatttccaaaccgtgttaaacaatgcatcattctggaaagaatac

    aaattttacaatgcaaacaatcaagaattagcaacaactgttgttaacgataataaaaaa

    gcggatactagaacaatcaatgttgcagttgaacctggatataagagcttaactactaaa

    gtacatattgtcgtgccacaaattaattacaatcatagatatactacgcatttggaattt

    gaaaaagcaattcctacattagctgacgcagcaaaaccaaacaatgttaaaccggttcaa

    ccaaaaccagctcaacctaaaacacctactgagcaaactaaaccagttcaacctaaagtt

    gaaaaagttaaacctactgtaactacaacaagcaaagttgaagacaatcactctactaaa

    gttgtaagtactgacacaacaaaagatcaaactaaaacacaaactgctcatacagttaaa

    acagcacaaactgctcaagaacaaaataaagttcaaacacctgttaaagatgttgcaaca

    gcgaaatctgaaagcaacaatcaagctgtaagtgataataaatcacaacaaactaacaaa

    gttacaaaacataacgaaacgcctaaacaagcatctaaagctaaagaattaccaaaaact

    ggtttaacttcagttgataactttattagcacagttgccttcgcaacacttgccctttta

    ggttcattatctttattacttttcaaaagaaaagaatctaaataa

    KrkN2(8325)(SEQ ID NO:8)

    EENNMTKHYLNSKYQSEQRSSAMKKITMGTASIILGSLVYIGADSQQVNAATEATN

    ATNNQSTQVSQATSQPINFQVQKDGSSEKSHMDDYMQHPGKVIKQNNKYYFQTV

    LNNASFWKEYKFYNANNQELATTVVNDNKKADTRTINVAVEPGYKSLTTKVHIVVP

    QINYNHRYTTHLEFEKAIPTLADAAKPNNVKPVQPKPAQPKTPTEQTKPVQPKVEK

    VKPTVTTTSKVEDNHSTKVVSTDTTKDQTKTQTAHTVKTAQTAQEQNKVQTPVKD

    VATAKSESNNQAVSDNKSQQTNKVTKHNETPKQASKAKELPKTGLTSVDNFISTV

    AFATLALLGSLSLLLFKRKESK

    KrkN(8325)(SEQ ID NO:9)

    tatacaattaggagttgtttctacaacatgaacaaacagcaaaaagaatttaaatcattttattcaattagaaagtcatc

    actaggcgttgcatctgtagcaattagtacacttttattattaatgtcaaatggcgaagcacaagcagcagctgaaga

    aacaggtggtacaaatacagaagcacaaccaaaaactgaagcagttgcaagtccaacaacaacatctgaaaaa

    gctccagaaactaaaccagtagctaatgctgtctcagtatctaataaagaagttgaggcccctacttctgaaacaaa

    agaagctaaagaagttaaagaagttaaagcccctaaggaaacaaaagaagttaaaccagcagcaaaagccac

    taacaatacatatcctattttgaatcaggaacttagagaagcgattaaaaaccctgcaataaaagacaaagatcata

    gcgcaccaaactctcgtccaattgattttgaaatgaaaaagaaagatggaactcaacagttttatcattatgcaagttc

    tgttaaacctgctagagttattttcactgattcaaaaccagaaattgaattaggattacaatcaggtcaattttggagaaa

    atttgaagtttatgaaggtgacaaaaagttgccaattaaattagtatcatacgatactgttaaagattatgcttacattcg

    cttctctgtatcaaacggaacaaaagctgttaaaattgttagttcaacacacttcaataacaaagaagaaaaatacg

    attacacattaatggaattcgcacaaccaatttataacagtgcagataaattcaaaactgaagaagattataaagctg

    aaaaattattagcgccatataaaaaagcgaaaacactagaaagacaagtttatgaattaaataaaattcaagataa

    acttcctgaaaaattaaaggctgagtacaagaagaaattagaggatacaaagaaagctttagatgagcaagtgaa

    atcagctattactgaattccaaaatgtacaaccaacaaatgaaaaaatgactgatttacaagatacaaaatatgttgtt

    tatgaaagtgttgagaataacgaatctatgatggatacttttgttaaacaccctattaaaacaggtatgcttaacggcaa

    aaaatatatggtcatggaaactactaatgacgattactggaaagatttcatggttgaaggtcaacgtgttagaactata

    agcaaagatgctaaaaataatactagaacaattattttcccatatgttgaaggtaaaactctatatgatgctatcgttaa

    agttcacgtaaaaacgattgattatgatggacaataccatgtcagaatcgttgataaagaagcatttacaaaagcca

    ataccgataaatctaacaaaaaagaacaacaagataactcagctaagaaggaagctactccagctacgcctagc

    aaaccaacaccatcacctgttgaaaaagaatcacaaaaacaagacagccaaaaagatgacaataaacaattac

    caagtgttgaaaaagaaaatgacgcatctagtgagtcaggtaaagacaaaacgcctgctacaaaaccaactaaa

    ggtgaagtagaatcaagtagtacaactccaactaaggtagtatctacgactcaaaatgttgcaaaaccaacaactg

    cttcatcaaaaacaacaaaagatgttgttcaaacttcagcaggttctagcgaagcaaaagatagtgctccattacaa

    aaagcaaacattaaaaacacaaatgatggacacactcaaagccaaaacaataaaaatacacaagaaaataaa

    gcaaaatcattaccacaaactggtgaagaatcaaataaagatatgacattaccattaatggcattattagctttaagta

    gcatcgttgcattcgtattacctagaaaacgtaaaaactaa

    KrkN(8325)(SEQ ID NO:10)

    YTIRSCFYNMNKQQKEFKSFYSIRKSSLGVASVAISTLLLLMSNGEAQAAAEETGG

    TNTEAQPKTEAVASPTTTSEKAPETKPVANAVSVSNKEVEAPTSETKEAKEVKEV

    KAPKETKEVKPAAKATNNTYPILNQELREAIKNPAIKDKDHSAPNSRPIDFEMKKKD

    GTQQFYHYASSVKPARVIFTDSKPEIELGLQSGQFWRKFEVYEGDKKLPIKLVSYD

    TVKDYAYIRFSVSNGTKAVKIVSSTHFNNKEEKYDYTLMEFAQPIYNSADKFKTEED

    YKAEKLLAPYKKAKTLERQVYELNKIQDKLPEKLKAEYKKKLEDTKKALDEQVKSAI

    TEFQNVQPTNEKMTDLQDTKYWYESVENNESMMDTFVKHPIKTGMLNGKKYMV

    METTNDDYWKDFMVEGQRVRTISKDAKNNTRTIIFPYVEGKTLYDAIVKVHVKTIDY

    DGQYHVRIVDKEAFTKANTDKSNKKEQQDNSAKKEATPATPSKPTPSPVEKESQK

    QDSQKDDNKQLPSVEKENDASSESGKDKTPATKPTKGEVESSSTTPTKVVSTTQ

    NVAKPTTASSKTTKDVVQTSAGSSEAKDSAPLQKANIKNTNDGHTQSQNNKNTQE

    NKAKSLPQTGEESNKDMTLPLMALLALSSIVAFVLPRKRKN

    RkaS(COL)(SEQ ID NO:11)

    tttataaataatttacataaaatcaatcattttaatataaggattatgataatatattggtgtatgacagttaatggaggga

    acgaaatgaaagctttattacttaaaacaagtgtatggctcgttttgctttttagtgtaatgggattatggcaagtctcgaa

    cgcggctgagcagcatacaccaatgaaagcacatgcagtaacaacgatagacaaagcaacaacagataagca

    acaagtaccgccaacaaaggaagcggctcatcattctggcaaagaagcggcaaccaacgtatcagcatcagcg

    cagggaacagctgatgatacaaacagcaaagtaacatccaacgcaccatctaacaaaccatctacagtagtttca

    acaaaagtaaacgaaacacgcgacgtagatacacaacaagcctcaacacaaaaaccaactcacacagcaac

    gttcaaattatcaaatgctaaaacagcatcactttcaccacgaatgtttgctgctaatgcaccacaaacaacaacaca

    taaaatattacatacaaatgatatccatggccgactagccgaagaaaaagggcgtgtcatcggtatggctaaattaa

    aaacagtaaaagaacaagaaaagcctgatttaatgttagacgcaggagacgccttccaaggtttaccactttcaaa

    ccagtctaaaggtgaagaaatggctaaagcaatgaatgcagtaggttatgatgctatggcagtcggtaaccatgaat

    ttgactttggatacgatcagttgaaaaagttagagggtatgttagacttcccgatgctaagtactaacgtttataaagatg

    gaaaacgcgcgtttaagccttcaacgattgtaacaaaaaatggtattcgttatggaattattggtgtaacgacaccag

    aaacaaagacgaaaacaagacctgaaggcattaaaggcgttgaatttagagatccattacaaagtgtgacagcg

    gaaatgatgcgtatttataaagacgtagatacatttgttgttatatcacatttaggaattgatccttcaacacaagaaaca

    tggcgtggtgattacttagtgaaacaattaagtcaaaatccacaattgaagaaacgtattacagttattgatggtcattc

    acatacagtacttcaaaatggtcaaatttataacaatgatgcattggcacaaacaggtacagcacttgcgaatatcgg

    taagattacatttaattatcgcaatggagaggtatcgaatattaaaccgtcattgattaatgttaaagacgttgaaaatgt

    aacaccgaacaaagcattagctgaacaaattaatcaagctgatcaaacatttagagcacaaactgcagaggtaat

    tattccaaacaataccattgatttcaaaggagaaagagatgacgttagaacgcgtgaaacaaatttaggaaacgcg

    attgcagatgctatggaagcgtatggcgttaagaatttctctaaaaagactgactttgccgtgacaaatggtggaggta

    ttcgtgcctctatcgcaaaaggtaaggtgacacgctatgatttaatctcagtattaccatttggaaatacgattgcgcaa

    attgatgtaaaaggttcagacgtctggacggctttcgaacatagtttaggcgcaccaacaacacaaaaggacggta

    agacagtgttaacagcgaatggcggtttactacatatctctgattcaatccgtgtttactatgatataaataaaccgtctg

    gcaaacgaattaatgctattcaaattttaaataaagagacaggtaagtttgaaaatattgatttaaaacgtgtatatcac

    gtaacgatgaatgacttcacagcatcaggtggcgacggatatagtatgttcggtggtcctagagaagaaggtatttca

    ttagatcaagtactagcaagttatttaaaaacagctaacttagctaagtatgatacgacagaaccacaacgtatgttat

    taggtaaaccagcagtaagtgaacaaccagctaaaggacaacaaggtagcaaaggtagtaagtctggtaaagat

    acacaaccaattggtgacgacaaagtgatggatccagcgaaaaaaccagctccaggtaaagttgtattgttgctag

    cgcatagaggaactgttagtagcggtacagaaggttctggtcgcacaatagaaggagctactgtatcaagcaaga

    gtgggaaacaattggctagaatgtcagtgcctaaaggtagcgcgcatgagaaacagttaccaaaaactggaacta

    atcaaagttcaagcccagaagcgatgtttgtattattagcaggtataggtttaatcgcgactgtacgacgtagaaaag

    ctagctaa

    RkaS(COL)(SEQ ID NO:12)

    FINNLHKINHFNIRIMIIYWCMTVNGGNEMKALLLKTSVWLVLLFSVMGLWQVSNAA

    EQHTPMKAHAVTTIDKATTDKQQVPPTKEAAHHSGKEAATNVSASAQGTADDTN

    SKVTSNAPSNKPSTVVSTKVNETRDVDTQQASTQKPTHTATFKLSNAKTASLSPR

    MFAANAPQTTTHKILHTNDIHGRLAEEKGRVIGMAKLKTVKEQEKPDLMLDAGDAF

    QGLPLSNQSKGEEMAKAMNAVGYDAMAVGNHEFDFGYDQLKKLEGMLDFPMLS

    TNVYKDGKRAFKPSTIVTKNGIRYGIIGVTTPETKTKTRPEGIKGVEFRDPLQSVTA

    EMMRIYKDVDTFVVISHLGIDPSTQETWRGDYLVKQLSQNPQLKKRITVIDGHSHT

    VLQNGQIYNNDALAQTGTALANIGKITFNYRNGEVSNIKPSLINVKDVENVTPNKAL

    AEQINQADQTFRAQTAEVIIPNNTIDFKGERDDVRTRETNLGNAIADAMEAYGVKN

    FSKKTDFAVTNGGGIRASIAKGKVTRYDLISVLPFGNTIAQIDVKGSDVWTAFEHSL

    GAPTTQKDGKTVLTANGGLLHISDSIRVYYDINKPSGKRINAIQILNKETGKFENIDL

    KRVYHVTMNDFTASGGDGYSMFGGPREEGISLDQVLASYLKTANLAKYDTTEPQR

    MLLGKPAVSEQPAKGQQGSKGSKSGKDTQPIGDDKVMDPAKKPAPGKVVLLLAH

    RGTVSSGTEGSGRTIEGATVSSKSGKQLARMSVPKGSAHEKQLPKTGTNQSSSP

    EAMFVLLAGIGLIATVRRRKAS

    RrkN(8325)(SEQ ID NO:13)

    agtggaaaatatggaaaaaggagtatgcaaatgagagataagaaaggaccggtaaataaaagagtagattttct

    atcaaataaattgaataaatattcaataagaaaatttacagttggaacagcatctattttaattggctcactaatgtatttg

    ggaactcaacaagaggcagaagcagctgaaaacaatattgagaatccaactacattaaaagataatgtccaatc

    aaaagaagtgaagattgaagaagtaacaaacaaagacactgcaccacagggtgtagaagctaaatctgaagta

    acttcaaacaaagacacaatcgaacatgaaccatcagtaaaagctgaagatatatcaaaaaaggaggatacac

    caaaagaagtagctgatgttgctgaagttcagccgaaatcgtcagtcactcataacgcagagacacctaaggttag

    aaaagctcgttctgttgatgaaggctcttttgatattacaagagattctaaaaatgtagttgaatctaccccaattacaatt

    caaggtaaagaacattttgaaggttacggaagtgttgatatacaaaaaaaaccaacagatttaggggtatcagagg

    taaccaggtttaatgttggtaatgaaagtaatggtttgataggagctttacaattaaaaaataaaatagattttagtaag

    gatttcaattttaaagttagagtggcaaataaccatcaatcaaataccacaggtgctgatggttgggggttcttatttagt

    aaaggaaatgcagaagaatatttaactaatggtggaatccttggggataaaggtctggtaaattcaggcggatttaa

    aattgatactggatacatttatacaagttccatggacaaaactgaaaagcaagctggacaaggttatagaggatacg

    gagcttttgtgaaaaatgacagttctggtaattcacaaatggttggagaaaatattgataaatcaaaaactaattttttaa

    actatgcggacaattcaactaatacatcagatggaaagtttcatgggcaacgtttaaatgatgtcatcttaacttatgttg

    cttcaactggtaaaatgagagcagaatatgctggtaaaacttgggagacttcaataacagatttaggtttatctaaaaa

    tcaggcatataatttcttaattacatctagtcaaagatggggccttaatcaagggataaatgcaaatggctggatgaga

    actgacttgaaaggttcagagtttacttttacaccagaagcgccaaaaacaataacagaattagaaaaaaaagttg

    aagagattccattcaagaaagaacgtaaatttaatccggatttagcaccagggacagaaaaagtaacaagagaa

    ggacaaaaaggtgagaagacaataacgacaccaacactaaaaaatccattaactggagtaattattagtaaaggt

    gaaccaaaagaagagattacaaaagatccgattaatgaattaacagaatacggacctgaaacaatagcgccag

    gtcatcgagacgaatttgatccgaagttaccaacaggagagaaagaggaagttccaggtaaaccaggaattaag

    aatccagaaacaggagacgtagttagaccgccggtcgatagcgtaacaaaatatggacctgtaaaaggagactc

    gattgtagaaaaagaagagattccattcgagaaagaacgtaaatttaatcctgatttagcaccagggacagaaaaa

    gtaacaagagaaggacaaaaaggtgagaagacaataacgacgccaacactaaaaaatccattaactggagaa

    attattagtaaaggtgaatcgaaagaagaaatcacaaaagatccgattaatgaattaacagaatacggaccagaa

    acgataacaccaggtcatcgagacgaatttgatccgaagttaccaacaggagagaaagaggaagttccaggtaa

    accaggaattaagaatccagaaacaggagatgtagttagaccaccggtcgatagcgtaacaaaatatggacctgt

    aaaaggagactcgattgtagaaaaagaagagattccattcgagaaagaacgtaaatttaatcctgatttagcacca

    gggacagaaaaagtaacaagagaaggacaaaaaggtgagaagacaataacgacaccaacactaaaaaatc

    cattaactggagtaattattagtaaaggtgaaccaaaagaagaaatcacaaaagatccgattaatgaattaacaga

    atacggaccagaaacgataacaccaggtcatcgagacgaatttgatccgaagttaccaacaggagagaaagaa

    gaagttccaggtaaaccaggaattaagaatccagaaacaggagacgtagttagaccaccggtcgatagcgtaac

    aaaatatggacctgtaaaaggagactcgattgtagaaaaagaagagattccattcaagaaagaacgtaaatttaat

    ccggatttagcaccagggacagaaaaagtaacaagagaaggacaaaaaggtgagaagacaataacgacgcc

    aacactaaaaaatccattaactggagaaattattagtaaaggtgaatcgaaagaagaaatcacaaaagatccgat

    taatgaattaacagaatacggaccagaaacgataacaccaggtcatcgagacgaatttgatccgaagttaccaac

    aggagagaaagaggaagttccaggtaaaccaggaattaagaatccagaaacaggagatgtagttagaccaccg

    gtcgatagcgtaacaaaatatggacctgtaaaaggagactcgattgtagaaaaagaagagattccattcgagaaa

    gaacgtaaatttaatcctgatttagcaccagggacagaaaaagtaacaagagaaggacaaaaaggtgagaaga

    caataacgacgccaacactaaaaaatccattaactggagaaattattagtaaaggtgaatcgaaagaagaaatca

    caaaagatccgattaatgaattaacagaatacggaccagaaacgataacaccaggtcatcgagacgaatttgatc

    cgaagttaccaacaggagagaaagaggaagttccaggtaaaccaggaattaagaatccagaaacaggagacg

    tagttagaccaccggtcgatagcgtaacaaaatatggacctgtaaaaggagactcgattgtagaaaaagaagaaa

    ttccattcaagaaagaacgtaaatttaatcctgatttagcaccagggacagaaaaagtaacaagagaaggacaaa

    aaggtgagaagacaataacgacgccaacactaaaaaatccattaactggagaaattattagtaaaggtgaatcga

    aagaagaaatcacaaaagatccgattaatgaattaacagaatacggaccagaaacgataacaccaggtcatcg

    agacgaatttgatccgaagttaccaacaggagagaaagaggaagttccaggtaaaccaggaattaagaatccag

    aaacaggagatgtagttagaccaccggtcgatagcgtaacaaaatatggacctgtaaaaggagactcgattgtag

    aaaaagaagaaattccattcgagaaagaacgtaaatttaatcctgatttagcaccagggacagaaaaagtaacaa

    gagaaggacaaaaaggtgagaagacaataacgacgccaacactaaaaaatccattaactggagaaattattagt

    aaaggtgaatcgaaagaagaaatcacaaaagatccgattaatgaattaacagaatacggaccagaaacgataa

    caccaggtcatcgagacgaatttgatccgaagttaccaacaggagagaaagaggaagttccaggtaaaccagga

    attaagaatccagaaacaggagatgtagttagaccaccggtcgatagcgtaacaaaatatggacctgtaaaagga

    gactcgattgtagaaaaagaagaaattccattcgagaaagaacgtaaatttaatcctgatttagcaccagggacag

    aaaaagtaacaagagaaggacaaaaaggtgagaagacaataacgacgccaacactaaaaaatccattaactg

    gagaaattattagtaaaggtgaatcgaaagaagaaatcacaaaagatccagttaatgaattaacagaattcggtgg

    cgagaaaataccgcaaggtcataaagatatctttgatccaaacttaccaacagatcaaacggaaaaagtaccagg

    taaaccaggaatcaagaatccagacacaggaaaagtgatcgaagagccagtggatgatgtgattaaacacgga

    ccaaaaacgggtacaccagaaacaaaaacagtagagataccgtttgaaacaaaacgtgagtttaatccaaaatt

    acaacctggtgaagagcgagtgaaacaagaaggacaaccaggaagtaagacaatcacaacaccaatcacagt

    gaacccattaacaggtgaaaaagttggcgagggtcaaccaacagaagagatcacaaaacaaccagtagataa

    gattgtagagttcggtggagagaaaccaaaagatccaaaaggacctgaaaacccagagaagccgagcagacc

    aactcatccaagtggcccagtaaatcctaacaatccaggattatcgaaagacagagcaaaaccaaatggcccagt

    tcattcaatggataaaaatgataaagttaaaaaatctaaaattgctaaagaatcagtagctaatcaagagaaaaaa

    cgagcagaattaccaaaaacaggtttagaaagcacgcaaaaaggtttgatctttagtagtataattggaattgctgga

    ttaatgttattgg ctcgtagaagaaagaattaa

    RrkN(8325)(SEQ ID NO:14)

    SGKYGKRSMQMRDKKGPVNKRVDFLSNKLNKYSIRKFTVGTASILIGSLMYLGTQ

    QEAEAAENNIENPTTLKDNVQSKEVKIEEVTNKDTAPQGVEAKSEVTSNKDTIEHE

    PSVKAEDISKKEDTPKEVADVAEVQPKSSVTHNAETPKVRKARSVDEGSFDITRDS

    KNVVESTPITIQGKEHFEGYGSVDIQKKPTDLGVSEVTRFNVGNESNGLIGALQLK

    NKIDFSKDFNFKVRVANNHQSNTTGADGWGFLFSKGNAEEYLTNGGILGDKGLVN

    SGGFKIDTGYIYTSSMDKTEKQAGQGYRGYGAFVKNDSSGNSQMVGENIDKSKT

    NFLNYADNSTNTSDGKFHGQRLNDVILTYVASTGKMRAEYAGKTVVETSITDLGLS

    KNQAYNFLITSSQRWGLNQGINANGWMRTDLKGSEFTFTPEAPKTITELEKKVEEI

    PFKKERKFNPDLAPGTEKVTREGQKGEKTITTPTLKNPLTGVIISKGEPKEEITKDPI

    NELTEYGPETIAPGHRDEFDPKLPTGEKEEVPGKPGIKNPETGDVVRPPVDSVTKY

    GPVKGDSIVEKEEIPFEKERKFNPDLAPGTEKVTREGQKGEKTITTPTLKNPLTGEII

    SKGESKEEITKDPINELTEYGPETITPGHRDEFDPKLPTGEKEEVPGKPGIKNPETG

    DVVRPPVDSVTKYGPVKGDSIVEKEEIPFEKERKFNPDLAPGTEKVTREGQKGEK

    TITTPTLKNPLTGVIISKGEPKEEITKDPINELTEYGPETITPGHRDEFDPKLPTGEKE

    EVPGKPGIKNPETGDVVRPPVDSVTKYGPVKGDSIVEKEEIPFKKERKFNPDLAPG

    TEKVTREGQKGEKTITTPTLKNPLTGEIISKGESKEEITKDPINELTEYGPETITPGH

    RDEFDPKLPTGEKEEVPGKPGIKNPETGDVVRPPVDSVTKYGPVKGDSIVEKEEIP

    FEKERKFNPDLAPGTEKVTREGQKGEKTITTPTLKNPLTGEIISKGESKEEITKDPIN

    ELTEYGPETITPGH RDEFDPKLPTGEKEEVPGKPGIKNPETGDVVRPPVDSVTKYG

    PVKGDSIVEKEEIPFKKERKFNPDLAPGTEKVTREGQKGEKTITTPTLKNPLTGEIIS

    KGESKEEITKDPINELTEYGPETITPGHRDEFDPKLPTGEKEEVPGKPGIKNPETGD

    VVRPPVDSVTKYGPVKGDSIVEKEEIPFEKERKFNPDLAPGTEKVTREGQKGEKTI

    TTPTLKNPLTGEIISKGESKEEITKDPINELTEYGPETITPGHRDEFDPKLPTGEKEE

    VPGKPGIKNPETGDVVRPPVDSVTKYGPVKGDSIVEKEEIPFEKERKFNPDLAPGT

    EKVTREGQKGEKTITTPTLKNPLTGEIISKGESKEEITKDPVNELTEFGGEKIPQGH

    KDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPF

    ETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPV

    DKIVEFGGEKPKDPKGPENPEKPSRPTHPSGPVNPNNPGLSKDRAKPNGPVHSM

    DKNDKVKKSKIAKESVANQEKKRAELPKTGLESTQKGLIFSSIIGIAGLMLLARRRK

    N

    KnkA(8325)(SEQ ID NO:15)

    ggaaggagtatgttgatggctaaatatcgagggaaaccgtttcaattatatgtaaagttatcgtgttcgacaatgatggc

    gacaagtatcattttaacgaatatcttgccgtacgatgcccaagctgcatctgaaaaggatactgaaattacaaaaga

    gatattatctaagcaagatttattagacaaagttgacaaggcaattcgtcaaattgagcaattaaaacagttatcggctt

    catctaaagaacattataaagcacaactaaatgaagcgaaaacagcatcgcaaatagatgaaatcataaaacga

    gctaatgagttggatagcaaagacaataaaagttctcacactgaaatgaacggtcaaagtgatatagacagtaaatt

    agatcaattgcttaaagatttaaatgaggtttcttcaaatgttgataggggtcaacaaagtggcgaggacgatcttaat

    gcaatgaaaaatgatatgtcacaaacggctacaacaaaacatggagaaaaagatgataaaaatgatgaagca

    atggtaaataaggcgttagaagacctagaccatttgaatcagcaaatacacaaatcgaaagatgcatcgaaagat

    acatcggaagatccagcagtgtctacaacagataataatcatgaagtagctaaaacgccaaataatgatggttctg

    gacatgttgtgttaaataaattcctttcaaatgaagagaatcaaagccatagtaatcgactcactgataaattacaagg

    aagcgataaaattaatcatgctatgattgaaaaattagctaaaagtaatgcctcaacgcaacattacacatatcataa

    actgaatacgttacaatctttagatcaacgtattgcaaatacgcaacttcctaaaaatcaaaaatcagacttaatgagc

    gaagtaaataagacgaaagagcgtataaaaagtcaacgaaatattattttggaagaacttgcacgtactgatgata

    aaaagtatgctacacaaagcattttagaaagtatatttaataaagacgaggcagttaaaattctaaaagatatacgt

    gttgatggtaaaacagatcaacaaattgcagatcaaattactcgtcatattgatcaattatctctgacaacgagtgatg

    atttattaacgtcattgattgatcaatcacaagataagtcgctattgatttctcaaattttacaaacgaaattaggaaaag

    ctgaagcagataaattggctaaagattggacgaataaaggattatcaaatcgccaaatcgttgaccaattgaagaa

    acattttgcatcaactggcgacacgtcttcagatgatatattaaaagcaattttgaataatgccaaagataaaaaaca

    agcaattgaaacgattttagcaacacgtatagaaagacaaaaggcaaaattactggcagatttaattactaaaata

    gaaacagatcaaaataaaatttttaatttagttaaatcggcattgaatggtaaagcggatgatttattgaatttacaaaa

    gagactcaatcaaacgaaaaaagatatagattatattttatcaccaatagtaaatcgtccaagtttactagatcgattg

    aataaaaatgggaaaacgacagatttaaataagttagcaaatttaatgaatcaaggatcagatttattagacagtatt

    ccagatatacccacaccaaagccagaaaagacgttaacacttggtaaaggtaatggattgttaagtggattattaaa

    tgctgatggtaatgtatctttgcctaaagcgggggaaacgataaaagaacattggttgccgatatctgtaattgttggtg

    caatgggtgtactaatgatttggttatcacgacgcaataagttgaaaaataaagcataa

    KnkA(8325)(SEQ ID NO:16)

    GRSMLMAKYRGKPFQLYVKLSCSTMMATSIILTNILPYDAQAASEKDTEITKEILSK

    QDLLDKVDKAIRQIEQLKQLSASSKEHYKAQLNEAKTASQIDEIIKRANELDSKDNK

    SSHTEMNGQSDIDSKLDQLLKDLNEVSSNVDRGQQSGEDDLNAMKNDMSQTATT

    KHGEKDDKNDEAMVNKALEDLDHLNQQIHKSKDASKDTSEDPAVSTTDNNHEVA

    KTPNNDGSGHVVLNKFLSNEENQSHSNRLTDKLQGSDKINHAMIEKLAKSNASTQ

    HYTYHKLNTLQSLDQRIANTQLPKNQKSDLMSEVNKTKERIKSQRNIILEELARTDD

    KKYATQSILESIFNKDEAVKILKDIRVDGKTDQQIADQITRHIDQLSLTTSDDLLTSLID

    QSQDKSLLISQILQTKLGKAEADKLAKDWTNKGLSNRQIVDQLKKHFASTGDTSSD

    DILKAILNNAKDKKQAIETILATRIERQKAKLLADLITKIETDQNKIFNLVKSALNGKAD

    DLLNLQKRLNQTKKDIDYILSPIVNRPSLLDRLNKNGKTTDLNKLANLMNQGSDLLD

    SIPDIPTPKPEKTLTLGKGNGLLSGLLNADGNVSLPKAGETIKEHWLPISVIVGAMG

    VLMIWLSRRNKLKNKA

    一级结构分析:

    将生物信息方法(bioinformatic approach)用于一级结构和功能预测(附图1)。蛋白质RrkN和DsqA具有与先前描述的MSCRAMMs相似的结构组织。RrkN的结构类似于分别为金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌的Pls/Aap蛋白质。它在N-末端含有200个残基的区域显示与Pis和Aap有40%相同。该蛋白质的C-末端突出地由128个残基重复区域组成,菌株与菌株之间重复区的数量是变化的。这些重复也存在于Pis和Aap。推定的sar同源区和fnbpA和fnbpB正好位于基因组上RrkN的上游。

    DsqA的结构的组织相似于蛋白质的Sdr家族。它含有典型的A区域,其后跟随TYYFTDVK基序,该基序类似于在所有Sdr蛋白质中存在的保守的TYTFTVYVD基序。该基序的功能至今没有被测定。2个88个残基的重复区域居留在该蛋白质的中心,其后跟随类似于在所Sdr蛋白质中存在的SD-重复基序的C-末端SX-重复基序。该重复区的大小随菌株变化。在基因组上DsqA邻接secY和secA。DsqA同系物(>90%同一性)也存在于表皮葡萄球菌。

    KnkA的序列中不含有重复区域。次级的结构预测分析显示该蛋白质主要地由α-螺旋。

    RkaS的序列中不含有重复区域。BLAST分析显示它类似于5′核苷酸酶UDP-糖水解酶。编码RkaS的基因正好地位于fromoryx的上游,mec元件的插入位点。

    KesK在该蛋白质的N-末端含有二个140个残基的重复区域,有38%相同。水疗法绘制图分析(Kyte和Doolittle,1982)显示在该蛋白质的中心点有一个大的亲水的区域(残基500-560)。

    EkeS在该蛋白质的N-末端含有二个300个残基的重复区域,有38%相同。Blast分析显示该蛋白质的N-末端(残基1-1268,携带两种重复)与FmtB有49%等同,所述的FmtBan是具有17个串联的重复的LPXTG蛋白质。FmtB被推测间接参与甲氧苯青霉素抗性,因为fmt8的灭活去除了甲氧苯青霉素抗性。这似乎是由于通过增加细胞壁前体葡萄糖胺-1-磷酸盐的产生可以减轻对细胞壁组成的影响如甲氧苯青霉素敏感性(Komatsuzawa等人,2000)。

    KrkN和KrkN2在基因组上互相邻接。

    表达分析:

    由于与蛋白质数据库之序列没有同源性,不能预知这些蛋白质中每一个的推定的功能,因此以分子的近似值为依据。利用Qiagen pQE-30表达系统,四个开放读框的独特的区域可以在大肠杆菌中表达为重组his-标记的融合蛋白质。附图2表示纯化的N-末端his-标记的融合蛋白的考马斯亮蓝染色的SDS-PAGE凝胶。将重组蛋白质RrkN1,DsqA2,KesK1和KnkA用于在兔子中产生抗体。金黄色葡萄球菌细胞壁提取物的Western印迹分析显示KesK,KnkA和DsqA被表达并且细胞壁相关(附图3)。菌株eMRSA-16代表aknkA-阴性的菌株,因为它缺乏knkA基因。65kDa的免疫反应谱带与菌株8325-4的指数和静止的时期细胞的细胞壁提取物起反应(附图3,B)。菌株eMRSA-16中没有该谱带暗示它代表了knkA的基因产物。

    在指数和静止期的培养物中,利用抗-KesK抗体进行的菌株8325-4的细胞壁成分的Western免疫印迹识别了150kDa免疫反应谱带。表达质粒(pKS80)上全长KesK的表达获得的从乳酸乳球菌的细胞壁成分释放的类似大小的免疫反应蛋白质暗示该150kDa谱带代表kesK基因产物(数据未显示)。需要金黄色葡萄球菌的kesK敲出突变体来证实细胞壁释放的KesK蛋白质的大小。

    利用抗-DsqA抗体,金黄色葡萄球菌菌株MSSA和eMRSA-16的细胞壁成分的Western免疫印迹结果识别了一个130kDa免疫反应谱带。在静止期细胞中表达水平更高。

    在乳酸乳球菌中异源表达:

    以前已经将金黄色葡萄球菌的的表面蛋白质在乳酸乳球菌(L.lactis)中的异源表达用作为研究蛋白质功能的工具(Sinha等人,2000)。在该研究中,也将该替代系统用于在乳酸乳球菌表面表达各个in silico-预知的MSCRAMMs以查出功能。已经将KesK和KnkA克隆到乳酸乳球菌,并且通过点印迹显示是在表面表达的(附图4)。阴性的对照中没有观察到交叉反应(pKS80质粒没有插入物),显示这是一个特异反应。通过用溶菌酶和mutanolysin消化产生了携带pKS-KnkA和pKS-KesK的乳酸乳球菌的细胞壁和原生质体成分,并且用于分别利用抗-KnkA和抗-KesK的抗体进行的Western印迹研究。与在金黄色葡萄球菌中观察到的不同,在乳酸乳球菌细胞壁成分中没有检测到KnkA,但是发现与原生质体成分相关。KnkA的固定用基序不同于一致LPXTG序列,其中含有一个丙氨酸残基而不是苏氨酸(即LPKAG)(表1)。最近已经公开了金黄色葡萄球菌含有二个sortase基因,srtA和srtB(Pallen,2001)。由第二个sortase基因加工LPXTG基序的变异形式是可能的,乳酸乳球菌中没有该基因。这也可以解释在原生质体成分中观察到的KnkA蛋白质大小的轻微的增加,而细胞壁分类拣选信号没有被裂解。

    在乳酸乳球菌的细胞壁成分中探测到KesK,但是迁移的分子量小于从金黄色葡萄球菌细胞壁释放的KesK蛋白质。在乳酸乳球菌表面表达的大多数MSCRAMMs被证明在细胞壁提取程序中发生蛋白水解(Louise O′Brien,个人通讯)。因此,从乳酸乳球菌表面释放KesK蛋白质表示截短形式的KesK是可能的。已经证明用溶菌酶和mutanolysin缩短消化时间以限制蛋白水解的程度。

    in silico-预测的MSCRAMMs体内表达:

    在ELISA分析中对来自金黄色葡萄球菌感染痊愈的33个患者的康复的人-时期血清进行测试,以检测其识别纯化的N-末端his-标记的融合蛋白质的能力。将从儿童和健康的供血者采掘的血清用作为阴性的对照。将阳性的反应其值作为等同于或高于阴性的对照的二倍。附图5A-5D阐明在27-42%患者中识别了所有的蛋白质,这暗示这些蛋白质在体内表达并且在宿主感染期间是致免疫的。

    引证文献

    Komatsuzawa,H.,Ohta,K.,Sugai,M.,Fujiwara,T.,Glanzmann,P.,Berger-Bachi,B.,Suginaka,H.(2000)编码细胞壁相关的蛋白质的fmt B基因的Tn551-介导的插入失活消除了金黄色葡萄球菌的甲氧苯青霉素抗性。J.Antimicrob.Chemother.45:421-31。

    Sinha,B.,Francois,P.,Que,Y.A.,Hussain,M.,Heilmann,C.,Moreillon,P.,Lew,D.,Krause,K.H.,Peters,G.,Herrmann,M.(2000)异源表达的金黄色葡萄球菌粘连蛋白结合蛋白质足以侵入宿主细胞Infect.Immun.68:6871-6878。

    Pallen,M.J.,Lam,A.C.,Antonio,M.,Dunbar,K.(2000)sortases的阻碍-一种丰富的反应物?Trends.Microbiol.9:97-101。

                       实施例2

    从金黄色葡萄球菌和从凝固酶阴性的葡萄球菌分离交叉反应的蛋白质并且进行测序

    最近已经证明表皮葡萄球菌含有结构上与金黄色葡萄球菌MSCRAMM蛋白质相关的表面蛋白质(US09/386,962)。从金黄色葡萄球菌中分离一个蛋白质特别有利,因为它与表皮葡萄球菌紧密同源。该蛋白质被称为DsqA或SasA(金黄色葡萄球菌)和DgsK(表皮葡萄球菌)。它们的特征是包括一个大约500个氨基酸残基的典型的″A″区域,其后跟随约有40%相同有,各为88个残基的二个B重复区,和一个独特的SXSX二肽重复区,该区域的长度随菌株而变化。金黄色葡萄球菌的DsqA/SasA的A区域内含有一个180残基的区域,该区域与金黄色葡萄球菌蛋白质的RrkN,Pls和表皮葡萄球菌蛋白质Aap的A区域内的一个相似的大小的区域有40%一致性。DsqA/SasA和DgsK蛋白质的A区域在氨基酸水平上有46%的一致性,BB重复区是50%一致性。所包括的主动和被动免疫接种策略;疫苗,识别金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的葡萄球菌的蛋白质的多克隆抗体和单克隆抗体是本发明的主题。

    与凝固酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌发生交叉反应的抗体的特异性例子:

    凝固酶阴性的葡萄球菌DgsK A-区域:

    氨基酸序列(SEQID NO:17)

    ASETPITSEISSNSETVANQNSTTIKNSQKETVNSTSLESNHSNS

    TNKQMSSEVTNTAQSSEKAGISQQSSETSNQSSKLNTYASTDH

    VESTTINNDNTAQQDQNKSSNVTSKSTQSNTSSSEKNISSNLTQ

    SIETKATDSLATSEARTSTNQISNLTSTSTSNQSSPTSFANLRTFS

    RFTVLNTMAAPTTTSTTTTSSLTSNSVWNKDNFNEHMNLSGS

    ATYDPKTGIATLTPDAYSQKGAISLNTRLDSNRSFRFIGKVNLG

    NRYEGYSPDGVAGGDGIGFAFSPGPLGQIGKEGAAVGIGGLNN

    AFGFKLDTYHNTSTPRSDAKAKADPRNVGGGGAFGAFVSTD

    RNGMATTEESTAAKLNVQPTDNSFQDFVIDYNGDTKVMTVTY

    AGQTFTRNLTDWIKNSGGTTFSLSMTASTGGAKNLQQVQFGT

    FEYTESAVAKVRYVDANTGKDIIPPPKTIAGEVDGTVNIDKQL

    NNFKNLGYSYVGTDALKAPNYTETSGTPTLKLTNSSQTVIYKF

    KDVQ

    金黄色葡萄球菌SasA A-区域:

    氨基酸序列(SEQ ID NO:18)

    ASDAPLTSELNTQSETVGNQNSTTIEASTSTADSTSVTKNSSSV

    QTSNSDTVSSEKSEKVTSTTNSTSNQQEKLTSTSESTSSKNTTS

    SSDTKSVASTSSTEQPINTSTNQSTASNNTSQSTTPSSVNLNKTS

    TTSTSTAPVKLRTFSRLAMSTFASAATTTAVTANTITVNKDNLK

    QYMTTSGNATYDQSTGIVTLTQDAYSQKGAITLGTRIDSNKSF

    HFSGKVNLGNKYEGHGNGGDGIGFAFSPGVLGETGLNGAAVG

    IGGLSNAFGFKLDTYHNTSKPNSAAKANADPSNVAGGGAFGA

    FVTTDSYGVATTYTSSSTADNAAKLNVQPTNNTFQDFDINYNG

    DTKVMTVKYAGQTWTRNISDWIAKSGTTNFSLSMTASTGGAT

    NLQQVQFGTFEYTESAVTQVRYVDVTTGKDIIPPKTYSGNVDQ

    VVTIDNQQSALTAKGYNYTSVDSSYASTYNDTNKTVKMTNA

    GQSVTYYFTDW

    Aap蛋白质的完整序列和它的编码DNA(指示有A区域存在)显示如下:

    表皮葡萄球菌Aap蛋白质(加下划线的为A-区域)(SEQ IDNO:19)

    MGKRRQGPINKKVDFLPNKLNKYSIRKFTVGTASILLGSTLIFGSSSHEAKAAEEKQ

    VDPITQANQNDSSERSLENTNQPTVNNEAPQMSSTLQAEEGSNAEAPQSEPTKA

    EEGGNAEAAQSEPTKAEEGGNAEAPQSEPTKAEEGGNAEAAQSEPTKTEEGSNV

    KAAQSEPTKAEEGSNAEAPQSEPTKTEEGSNAKAAQSEPTKAEEGGNAEAAQSE

    PTKTEEGSNAEAPQSEPTKAEEGGNAEAPQSEPTKTEEGGNAEAPNVPTIKANSD

    NDTQTQFSEAPTRNDLARKEDIPAVSKNEELQSSQPNTDSKIEPTTSEPVNLNYSS

    PFMSLLSMPADSSSNNTKNTIDIPPTTVKGRDNYDFYGRVDIESNPTDLNATNLTR

    YNYGQPPGTTTAGAVQFKNQVSFDKDFDFNIRVANNRQSNTTGADGWGFMFSK

    KDGDDFLKNGGILREKGTPSAAGFRIDTGYYNNDPLDKIQKQAGQGYRGYGTFVK

    NDSQGNTSKVGSGTPSTDFLNYADNTTNDLDGKFHGQKLNNVNLKYNASNQTFT

    ATYAGKTWTATLSELGLSPTDSYNFLVTSSQYGNGNSGTYASGVMRADLDGATL

    TYTPKAVDGDPIISTKEIPFNKKREFDPNLAPGTEKVVQKGEPGIETTTTPTYVNPN

    TGEKVGEGEPTEKITKQPVDEIVHYGGEEIKPGHKDEFDPNAPKGSQTTQPGKPG

    VKNPDTGEVVTPPVDDVTKYGPVDGDPITSTEEIPFDKKREFNPDLKPGEERVKQ

    KGEPGTKTITTPTTKNPLTGEKVGEGEPTEKITKQPVDEITEYGGEEIKPGHKDEFD

    PNAPKGSQEDVPGKPGVKNPGTGEVVTPPVDDVTKYGPVDGDPITSTEEIPFDKK

    REFNPDLKPGEERVKQKGEPGTKTITTPTTKNPLTGEKVGEGEPTEKITKQPVDEI

    VHYGGEQIPQGHKDEFDPNAPVDSKTEVPGKPGVKNPDTGEVVTPPVDDVTKYG

    PVDGDSITSTEEIPFDKKREFDPNLAPGTEKVVQKGEPGTKTITTPTTKNPLTGEKV

    GEGKSTEKVTKQPVDEIVEYGPTKAEPGKPAEPGKPAEPGKPAEPGTPAEPGKPA

    EPGTPAEPGKPAEPGKPAEPGKPAEPGKPAEPGTPAEPGTPAEPGKPAEPGTPA

    EPGKPAEPGTPAEPGKPAESGKPVEPGTPAQSGAPEQPNRSMHSTDNKNQLPD

    TGENRQANEGTLVGSLLAIVGSLFIFGRRKKGNEK

    表皮葡萄球菌aap DNA(SEQ ID NO:20)

    atgggcaaac gtagacaagg tcctattaat aaaaaagtgg

    attttttacc taacaaatta aacaagtatt ctataagaaa attcactgtt ggtacggcct

    caatattact tggttcgaca cttatttttg gaagtagtag ccatgaagcg aaagctgcag

    aagaaaaaca agttgatcca attacacaag ctaatcaaaa tgatagtagt gaaagatcac

    ttgaaaacac aaatcaacct actgtaaaca atgaagcacc acagatgtct tctacattgc

    aagcagaaga aggaagcaat gcagaagcac ctcaatctga gccaacgaag gcagaagaag

    gaggcaatgc agaagcagct caatctgagc caacgaaggc agaagaagga ggcaatgcag

    aagcacctca atctgagcca acgaaggcag aagaaggagg caatgcagaa gcagctcaat

    ctgagccaac gaagacagaa gaaggaagca acgtaaaagc agctcaatct gagccaacga

    aggcagaaga aggaagcaat gcagaagcac ctcaatctga gccaacgaag acagaagaag

    gaagcaacgc aaaagcagct caatctgagc caacgaaggc agaagaagga ggcaatgcag

    aagcagctca atctgagcca acgaagacag aagaaggaag caatgcagaa gcacctcaat

    ctgagccaac gaaggcagaa gaaggaggca atgcagaagc acctcaatct gagccaacga

    agacagaaga aggaggcaat gcagaagcac cgaatgttcc aactatcaaa gctaattcag

    ataatgatac acaaacacaa ttttcagaag cccctacaag aaatgaccta gctagaaaag

    aagatatccc tgctgtttct aaaaacgagg aattacaatc atcacaacca aacactgaca

    gtaaaataga acctacaact tcagaacctg tgaatttaaa ttatagttct ccgtttatgt

    ccttattaag catgcctgct gatagttcat ccaataacac taaaaataca atagatatac

    cgccaactac ggttaaaggt agagataatt acgattttta cggtagagta gatatcgaaa

    gtaatcctac agatttaaat gcgacaaatt taacgagata taattatgga cagccacctg

    gtacaacaac agctggtgca gttcaattta aaaatcaagt tagttttgat aaagatttcg

    actttaacat tagagtagca aacaatcgtc aaagtaatac aactggtgca gatggttggg

    gctttatgtt cagcaagaaa gatggggatg atttcctaaa aaacggtggt atcttacgtg

    aaaaaggtac acctagtgca gctggtttca gaattgatac aggatattat aataacgatc

    cattagataa aatacagaaa caagctggtc aaggctatag agggtatggg acatttgtta

    aaaatgactc ccaaggtaat acttctaaag taggatcagg tactccatca acagattttc

    ttaactacgc agataatact actaatgatt tagatggtaa attccatggt caaaaattaa

    ataatgttaa tttgaaatat aatgcttcaa atcaaacttt tacagctact tatgctggta

    aaacttggac ggctacgtta tctgaattag gattgagtcc aactgatagt tacaattttt

    tagttacatc aagtcaatat ggaaatggta atagtggtac atacgcaagt ggcgttatga

    gagctgattt agatggtgca acattgacat acactcctaa agcagtcgat ggagatccaa

    ttatatcaac taaggaaata ccatttaata agaaacgtga atttgatcca aacttagccc

    caggtacaga aaaagtagtc caaaaaggtg aaccaggaat tgaaacaaca acaacaccaa

    cttatgtcaa tcctaataca ggagaaaaag ttggcgaagg tgaaccaaca gaaaaaataa

    caaaacaacc agtggatgaa atcgttcatt atggtggcga agaaatcaag ccaggccata

    aggatgaatt tgatccaaat gcaccgaaag gtagtcaaac aacgcaacca ggtaagccgg

    gggttaaaaa tcctgataca ggcgaagtag ttactccacc tgtggatgat gtgacaaaat

    atggtccagt tgatggagat ccgatcacgt caacggaaga aattccattc gacaagaaac

    gtgaattcaa tcctgattta aaaccaggtg aagagcgtgt taaacaaaaa ggtgaaccag

    gaacaaaaac aattacaaca ccaacaacta agaacccatt aacaggggaa aaagttggcg

    aaggtgaacc aacagaaaaa ataacaaaac aaccagtaga tgaaatcaca gaatatggtg

    gcgaagaaat caagccaggc cataaggatg aatttgatcc aaatgcaccg aaaggtagcc

    aagaggacgt tccaggtaaa ccaggagtta aaaaccctgg aacaggcgaa gtagtcacac

    caccagtgga tgatgtgaca aaatatggtc cagttgatgg agatccgatc acgtcaacgg

    aagaaattcc attcgacaag aaacgtgaat tcaatcctga tttaaaacca ggtgaagagc

    gcgttaaaca gaaaggtgaa ccaggaacaa aaacaattac aacgccaaca actaagaacc

    cattaacagg agaaaaagtt ggcgaaggtg aaccaacaga aaaaataaca aaacaaccag

    tggatgagat tgttcattat ggtggtgaac aaataccaca aggtcataaa gatgaatttg

    atccaaatgc acctgtagat agtaaaactg aagttccagg taaaccagga gttaaaaatc

    ctgatacagg tgaagttgtt accccaccag tggatgatgt gacaaaatat ggtccagttg

    atggagattc gattacgtca acggaagaaa ttccgtttga taaaaaacgc gaatttgatc

    caaacttagc gccaggtaca gagaaagtcg ttcaaaaagg tgaaccagga acaaaaacaa

    ttacaacgcc aacaactaag aacccattaa caggagaaaa agttggcgaa ggtaaatcaa

    cagaaaaagt cactaaacaa cctgttgacg aaattgttga gtatggtcca acaaaagcag

    aaccaggtaa accagcggaa ccaggtaaac cagcggaacc aggtaaacca gcggaaccag

    gtacgccagc agaaccaggt aaaccagcgg aaccaggtac gccagcagaa ccaggtaaac

    cagcggaacc aggtaaacca gcggaaccag gtaaaccagc ggaaccaggt aaaccagcgg

    aaccaggtac gccagcagaa ccaggtacgc cagcagaacc aggtaaacca gcggaaccag

    gtacgccagc agaaccaggt aaaccagcgg aaccaggtac gccagcagaa ccaggtaaac

    cagcggaatc aggtaaacca gtggaaccag gtacgccagc acaatcaggt gcaccagaac

    aaccaaatag atcaatgcat tcaacagata ataaaaatca attacctgat acaggtgaaa

    atcgtcaagc taatgaggga actttagtcg gatctctatt agcaattgtc ggatcattgt

    tcatatttgg tcgtcgtaaa aaaggtaatg aaaaataatt tcatataaaa actttctgcc

    attaa

    从A-区域到表皮葡萄球菌Aap(氨基酸55-600)(SEQ IDNO:21)

    55EKQVDPITQANQNDSSERSLENTNQPTVNNEAPQMSSTLQAEEGSNAEAPQSE

    PTKAEEGGNAEAAQSEPTKAEEGGNAEAPQSEPTKAEEGGNAEAAQSEPTKTEE

    GSNVKAAQSEPTKAEEGSNAEAPQSEPTKTEEGSNAKAAQSEPTKAEEGGNAEA

    AQSEPTKTEEGSNAEAPQSEPTKAEEGGNAEAPQSEPTKTEEGGNAEAPNVPTIK

    ANSDNDTQTQFSEAPTRNDLARKEDIPAVSKNEELQSSQPNTDSKIEPTTSEPVNL

    NYSSPFMSLLSMPADSSSNNTKNTIDIPPTTVKGRDNYDFYGRVDIESNPTDLNAT

    NLTRYNYGQPPGTTTAGAVQFKNQVSFDKDFDFNIRVANNRQSNTTGADGWGF

    MFSKKDGDDFLKNGGILREKGTPSAAGFRIDTGYYNNDPLDKIQKQAGQGYRGYG

    TFVKNDSQGNTSKVGSGTPSTDFLNYADNTTNDLDGKFHGQKLNNVNLKYNASN

    QTFTATYAGKTWTATLSELGLSPTDSYNFLVTSSQYGNGNSGTYASGVMRADLD

    GA600

    蛋白质的生产和纯化

    利用PCR,从上面描述的序列扩增识别为DgsK或SasA的表面蛋白质的A区域,再克隆到大肠杆菌表达载体PQE-30(Qiagen),以允许表达一种含有六个组氨酸残基的重组融合蛋白质。随后将该载体转化到大肠杆菌ATCC 55151,在15-升发酵罐中生长到光密度(OD600)为0.7,用0.2mM异丙基-1β-D半乳糖苷(IPTG)诱导4小时。利用AG Technologies中空纤维组件(孔大小0.45um)收集细胞,将细胞浆在-80C冷冻。利用2次穿过French Press,1100psi,将细胞在1×PBS(10mL缓冲液/1克的细胞浆)裂解。将裂解的细胞17,000rpm旋转30分钟以除去细胞碎片。将上清液经过装备了0.1M NiCI2的5-mL Hi俘获Cheating(Pharmacia)柱。在上样之后,用5个柱体积的10mM Tris,pH 8.0,100mM NaCI(缓冲液A)洗涤柱子。利用超过30个柱体积的0-100%梯度的10mM Tris,pH 8.0,100mM NaCI,200mM咪唑(Buffer B)洗脱蛋白质。SdrGN1N2N3或SdrGN2N3在~13%Buffer B(~26mM咪唑)被洗脱。监测280nm处的吸光率。在1×PBS中透析含有SdrGN1N2N3或SdrGN2N3的馏分。

    然后将各个蛋白质经过一个内毒素除去方案。在该方案中所使用的缓冲液通过一个5-mL Mono-Q琼脂糖(Pharmacia)柱而没有内毒素。将蛋白质平衡地分到4×15毫升试管中。各个试管的体积用缓冲液A加到9毫升。将1毫升的10%Triton X-114加入到各个试管中,在4℃旋转保温1小时。将试管置于37℃水浴中以使相位分离。将试管以2,000rpm旋转10分钟,收集各个试管的上面的含水的相,用去污剂反复提取。将2次提取的含水相合并,传递过带有0.1M NiCl2的5-毫升IDA cheating(Sigma)柱,以除去剩余的洗涤剂。用9个柱体积的Buffer A洗涤该柱,然后用3个柱体积的Buffer B洗脱该蛋白质。将洗脱液通过5-毫升的Detoxigel(Sigma)柱,收集流出物,再上样到柱。收集第二次过柱的流出物,在1×PBS中透析。分析纯化的产物的浓度,纯度和内毒素水平,然后给小鼠给药。

    单克隆抗体的生产

    将大肠杆菌表达的和纯化的重组SasA和DsgK蛋白质用于制备一组鼠的单克隆抗体,而将小鼠血清用作为多克隆抗体的来源。简单地说,一组Balb/C或SJL小鼠接收了一系列皮下的免疫接种1-10mg溶液蛋白质或与下面表描述的佐剂混合的蛋白质。

    免疫接种方案

    RIMMS

    注射        天数        数量(微克)        途径        佐剂

    #1          0           5                 皮下        FCA/RIBI

    #2          2           1                 皮下        FCA/RIBI

    #3          4           1                 皮下        FCA/RIBI

    #4          7           1                 皮下        FCA/RIBI

    #5          9           1                 皮下        FCA/RIBI

    常规注射      天数        数量(微克)        途径        佐剂

    原始          0           5                 皮下        FCA

    加强#1        14          1                 腹膜内      RIBI

    加强#2        28          1                 腹膜内      RIBI

    加强#3        42          1                 腹膜内      RIBI

    在杀死时(RIMMS)或加强后几天收集(常规的)血清,在ELISA测定中测定抗MSCRAMM蛋白质或对完整的细胞(表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌)的效价。在最后的加强之后3天,去除脾脏或淋巴结,挑开成单细胞悬浮液,收集淋巴细胞。然后将淋巴细胞与P3X63Ag8.653骨髓瘤细胞系(ATCC &CRL-1580)融合。根据Current Protocols in Immunology(第2章,第2单元)中的生产单克隆抗体的方案进行细胞融合,随后涂覆平板和喂养。

    然后利用标准的ELISA分析方法,从融合产生的任何克隆中筛选特异的抗-SasA抗体的产生。扩增阳性的克隆,进一步通过流式血细胞计数测试完整的细菌的细胞结合测定中的活性以及Biacore分析中SasA的结合。

    Biacore分析

    在整个分析中,流速保持在10毫升/分钟不变。在注射SasA或DgsK之前,借助于RAM-Fc结合,将测试抗体吸附到芯片。在时间0,将浓度为30mg/ml的SasA或DgsK注射过芯片3分钟,随后解离2分钟。该阶段的分析测定了Mab/SasA或DgsK相互作用的相对关系和分离动力学。

    与完整细菌的结合

    用兔子IgG(50mg/ml)封闭之后,收集,洗涤细菌的样品金黄色葡萄球菌Newman,金黄色葡萄球菌60,金黄色葡萄球菌397(Sal6),金黄色葡萄球菌Wood,金黄色葡萄球菌8325-4,甲氧苯青霉素抗性的金黄色葡萄球菌MRSA 16,表皮葡萄球菌ATCC 35984,表皮葡萄球菌HB,表皮葡萄球菌CN-899和溶血葡萄球菌ATCC 43253,用浓度为2pg/ml的Mab或仅用PBS(对照)保温。在用抗体保温之后,将用作为检测抗体的山羊-F(ab′)2-抗-小鼠-F(ab′)2-FITC用于孵育细菌的细胞。在抗体标记之后,用FACS caliber流式细胞计数器抽吸细菌的细胞以分析荧光射出(刺激:488,发射:570)。对于各个细菌的菌株,收集和检测10,000个样品。这些资料显示抗金黄色SasA的抗体能够识别凝固酶阴性的葡萄球菌的表面的同源的蛋白质。该资料支持Western印迹分析,表明抗金黄色葡萄球菌SasA的兔子多克隆抗体与从表皮葡萄球菌HB细胞表面释放的蛋白质以及来自于从表皮葡萄球菌克隆的DsgK的重组A-区域发生交叉反应(参见附图6和下表)。

                                         多克隆血清反应性   New   man  67-0  397  (SAL6) Wood 46  8325  -4  MRS  A16  ATCC  3598  HB  CN-  899  ATCC  4325  4  3常规小鼠血清   -  -  - -  -  -  -  -  -  -小鼠抗SasA   +  +  +/- -  +  +  +  +  +  +

                                  序列表

    <110>蒂莫西·J·福斯特等人

    <120>识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体

    <130>P07263US01/BAS

    <140>US 10/172,502

    <141>2002-06-17

    <150>US 60/298,098

    <151>2001-06-15

    <160>29

    <170>Patent In version 3.1

    <210>1

    <211>6609

    <212>DNA

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>1

    acaacacagc agagaataga caaccaggag gaaaacgaaa tgaatttgtt aaagaaaaat     60

    aaatatagta ttagaaaata taaagtaggg atattctcta ctttaatcgg gacagtttta    120

    ttactttcaa acccaaatgg tgcacaagct ttaactacgg atcataatgt gcaaggtggt    180

    tcaaatcaag cattacctgg caactcacaa aatacaaatg ccgatactaa tcgagacata    240

    gtaaatgatt cgcaaaatac tcctaatgca catgcaacag acaatacatc aacaaatcaa    300

    gcattgacta atcatcaaaa cgttgatgtg gcaaatcaag tcgggcctgc tccaatacag    360

    cctagcgcgt cgcctgcgca aaataataat aattctaatg ctaattcaac agcaacagag    420

    ccagcggcga atacaaataa taatttagca tcaaataaca atacattaaa cgtgcctaat    480

    aatacagata acaatgattc agcgcgtcat ctgactttaa aagaaattca agaagatgtt    540

    cgtcattcgt ctgataagcc agagttagtt gcgattgctg aagaagcatc taatagaccg    600

    aaaaagagaa gcagacgtgc tgcgccaaca gatcctaatg caacaccagc agatccaacg    660

    gctacaccag cagatccaac ggcaggaaat ggtagtgcac cagttgcaat tacagcgcca    720

    tacacgccaa caactgatcc caatgccaat aatataggac aaaatgcacc taacgaagtg    780

    ctttcatttg atgataacaa cattagacca agtacgaacc gttctgtgcc tacagtaact    840

    gttgttgata atttaccagg ctacacactg attaatggtg gtaaagtagg ggtgtttagt    900

    catgcaatgg taagaacgag catgtttgat tcaggagatg ccaagaacta tcaagcgcaa    960

    ggcaatgtaa ttgcattggg tcgtattaga ggaaatgata caaatgatca tggcgatttt   1020

    aatggtatcg agaaaacatt aacagtaaat ccgaattctg aattaatctt tgaatttaat   1080

    actatgacta ctaaaaacta tcaaggtatg acaaatttaa tcattaaaaa tgctgataac   1140

    gatactgtta ttggtgaaaa agtagttgct tatggtccga tttggcgctt attaaaagta   1200

    cctgaaaatg ttagtcatct aaaaattcaa tttgtaccta aaaatgacgc aataacagat   1260

    gcacgtggta tttatcaatt acgagatgga tataaatact atgactttgt agactcaatc   1320

    ggtcttcatt ctgggtcaca tgtctatgtt gaaagacgta caatggagcc aacagcaaca   1380

    aataataaag aatttacagt tacaacgtca ttaaagaata atggtaactt tggcgcttca   1440

    ttcaatacag atgattttgt atataaaatt caattacctg aaggtgttga atatgtaaat   1500

    aattcattga ctaaagattt tcctagcggt aattcaggtg ttgatattaa tgatatgaat   1560

    gtgacgtatg acgcagcaaa tcgaattatt acaattaaaa gtactggtgg aggtacaggg   1620

    aattcgccgg cacgactaat gcctgataaa atattggatt tgaagtataa gctacgtgtg   1680

    aacaatgtgc caacaccaag aacagtaaca tttaacgata cattaacgta taaaacatat   1740

    tcacaagatt ttattaattc acctgctgaa agtcatactg taagtacaaa tccatataca   1800

    attgatatca tcatgaataa agacgcattg caagccgaag tcgatagacg aattcaacaa   1860

    gcggattata catttgcatc attagatatt tttaatgatc ttaaaagacg cgcacaaaca   1920

    attttagatg aaaaccgtaa caatgtacct ttaaacaaaa gagtttctca agcagatatc   1980

    gattcattag caaatcagat gcaacatacg ttaattcgca gtgttgacgc tgaaaatgcc   2040

    gttaatagaa aagttgatga catggaagat ttagttaacc aaaatgatga actgacagat   2100

    gaagaaaaac aagcagcgat tcaagtcatc gaggaacata aaaatgaaat tattgggaat   2160

    attggtgacc aaacgactga tgatggcgtt actagaatta aagatcaagg tatacagact   2220

    ttaagtggag acactgcaac accagttgtt aaaccaaatg ctaaacaagc tatacgtgat   2280

    aaagcagcga aacaaagaga aattatcaat cacacgccag atgctactca agatgaaatt   2340

    caagatgcat taaatcaatt aacaacggat gaaacagatg ctattgataa tgttacgaat   2400

    gctactacca atgctgatgt tgaaacagct aaaaataatg gtattaatac aattggtgca   2460

    gttgcgccac aagtgacaca caaacaagct gcaagagatg caattaatca agcgacagca   2520

    acgaaacgac aacaaataaa tagcaataga gaagcaacac aagaagagaa aaatgcagca   2580

    ttgaatgaat taacgcaagc cacgaaccac gcattagaac aaatcaatca agcgacaacc   2640

    aatgatgatg tagatactgc caaaggtgat ggtctgaatg ccattaatcc tattgcgcct   2700

    gtaactgttg tcaagcaagc agcaagagat gccgtatcac atgatgcaca acagcatatc   2760

    gcagagatca atgcaaatcc tgatgcgact caagaagaaa gacaagcagc aatagagaaa   2820

    gtaaatgctg ctgtagctgt tgcgaatact aatatattaa atgctaatac caatgctgat   2880

    gttgagcaag taaagacaaa tgcaattcaa ggtatacaag ccattgaacc agctacaaag   2940

    gttaaaacag atgctaaaaa cgctattgat caaagtgcgg aaacgcaaca taatgcgata   3000

    tttaataata atgatgcgac cttagaagag caacaagcag cacaacaatt gcttgatcaa   3060

    gctgtagcca cagcgaagca aaatattaat gcagcagata cgaatcaaga agttgcacaa   3120

    gcaaaagatc agggcacaca aaatatagtt gtgattcaac cggcaacaca agttaaaacg   3180

    gatgcacgca atgctgtaaa tgaaaaagcg cgagaggcga taacaaatat caatgctaca   3240

    cctggcgcga ctcgagaaga gaaacaagaa gcgataaatc gtgtcaatac acttaaaaat   3300

    agagcattaa atgatattgg tgtgacgtct actactgcga tggtcaatag tattagagac   3360

    gatgcagtca atcaaatcgg tgcagttcaa ccgcatgtaa cgaagaaaca aactgctaca   3420

    ggtgtattaa cggacttagc aactgcaaaa aaacaagaaa ttaatcaaaa tacaaatgca   3480

    accactgaag aaaagcaagt agcattaaat caagtagacc aagatttagc aacggcaatt   3540

    aataatataa atcaagctga tactaatgca gaagtagatc aagcacaaca attaggtaca   3600

    aaagcaatta atgcgattca gccaaatatt gtaaaaaaac ctgcagcatt agcacaaacc   3660

    aatcagcatt atagtgctaa attagttgaa atcaatgcta caccagatgc aacagatgat   3720

    gagaaaaatg ctgcgatcaa tactttaaat caagacagac aacaagctat tgaaagtatt   3780

    aaacaagcaa atacaaatgc ggaagtagac caagctgcga cagtggcaga gaataatatc   3840

    gatgctgttc aagttgacgt tgtaaaaaaa caagcagcgc gagataaaat cactgctgaa   3900

    gtagcgaagc gtattgaagc ggttaaacaa acacctaatg caactgacga agaaaagcag   3960

    gctgcagtta atcaaatcaa tcaacttaaa gatcaagcgt ttaatcaaat taatcaaaac   4020

    caaacaaatg atcaggtaga cgcaactaca aatcaagcga ttaatgctat agataatgtt   4080

    gaagctgaag tagtaattaa accaaaggca attgcagata ttgaaaaagc tgttaaagaa   4140

    aagcaacagc aaattgataa tagtcttgat tcaacagata atgagaaaga agttgcttta   4200

    caagcattag ctaaagaaaa agaaaaagca cttgcagcta ttgaccaagc tcaaacgaat   4260

    agtcaggtga atcaagcggc aacaaatggt gtatcagcga ttaaaattat tcaacctgaa   4320

    acaaaaatta aaccagcagc acgtgaaaaa atcaatcaaa aagcgaatga attacgtgcg   4380

    caaattaatc aagataaaga agcgacagca gaagaaagac aagcggcgtt agataaaatc   4440

    aatgatttag ttgctaaagc tatgacaaat atcacgaatg atagaacaaa tcagcaagtt   4500

    aatgactcaa caaatcaagc gcttgacgac attgcattag tgacgcctga ccatattgtt   4560

    agagcagctg ctagagatgc agttaagcaa caatatgaag ctaaaaagca cgaaattgag   4620

    caagcggaac atgcgactga tgaagaaaaa caagttgctt taaatcaatt agcgaataat   4680

    gaaaaacgtg cattacaaaa cattaatcaa gcaatagcga ataatgatgt gaaacgtgtt   4740

    gaatcaaatg gtattgctac gttaaaaggc gtagaaccgc acattgtggt taaacctgaa   4800

    gctcaagaag ccataaaagc gagcgcagat aaccaagtag aatctataaa agatacacca   4860

    catgctacga cagatgaatt agatgaagca aaccaacaaa taaacgacac acttaaacaa   4920

    ggtcaacaag atatagacaa tacgacacaa gatgcagctg tcaatgatgt tagaaaccaa   4980

    acgattaagg caatcgaaca aattaaaccg aaagttagac gcaaacgtgc agcgttggat   5040

    aacattgatg aaagtaataa taatcaactc gatgcaatac gaaatacgct agatacaacg   5100

    caagatgaac gaaatgttgc tattgctgcg ttaaataaaa ttgttaatgc aattaaaaat   5160

    gatattgcac aaaacaaaac gaatgcagaa gtggatcaaa ctgaggctga tggtaacaac   5220

    aacatcaaag tgattttacc taaagttcaa gttaaaccag cagcgcgtca atctgtcagc   5280

    gcaaaagctg aagctcaaaa tgcacttatt gatcaaagtg atttatctac cgaagaagaa   5340

    agattagctg ctaaacattt agtagaacaa gcacttaatc aagctattga tcagatcaat   5400

    cacgcagata agactgcgca agttaatcaa aatagtatcg atgctcaaaa tattatttca   5460

    aaaattaaac cagcgacaac agttaaagca acagcattac aacaaattca aaatatcgct   5520

    acaaataaaa ttaatttaat taaagcaaat aacgaagcga cagatgaaga acaaaatgct   5580

    gcaatagtac aagttgaaaa agagttaatt aaagctaaac aacaaattgc tggtgcagtg   5640

    actaatgctg atgtggcata tttattgcat gatgggaaaa acgaaattcg tgaaatcgaa   5700

    cctgttatta ataaaaaagc aactgcgcga gaacaattaa caacattatt caacgataag   5760

    aaacaagcaa ttgaagcgaa tgttcaagca acagtagaag aaagaaatag tattttagca   5820

    cagttacaaa acatttatga cactgctatt ggacaaattg atcaagatcg tagcaatgca   5880

    caagttgata aaacagcaac attaaatcta caaacaatac atgatttaga cgtacatcct   5940

    attaaaaagc cagatgctga aaaaacgatt aatgatgatc ttgcacgtgt tacacattta   6000

    gtgcaaaatt atcgaaaagt aagtgatcgt aataaggctg atgcattaaa agctataact   6060

    gcattaaaat tacaaatgga tgaagaatta aaaacagcac gcactaatgc tgatgttgat   6120

    gcagttttaa aacgatttaa tgttgcatta ggcgatatag aagcagtaat tactgaaaaa   6180

    gaaaatagct tactgcgcat tgataacatt gctcaacaaa catatgcgaa attcaaagcg   6240

    atcgcaacac cagaacaatt agctaaagta aaagcattaa ttgatcaata tgttgcagat   6300

    ggcaatagaa tggttgatga agatgcgaca ttaaatgaca tcaaaaaaga tacgcaactc   6360

    attattgatg aaattttagc aattaattta cctgctgaag tgataaaagc gtcaccaaaa   6420

    gtggggcaac ctgctccaaa agtttgtacg cctattaaaa aagaagataa acaagaagtg   6480

    cgaaaagttg taaaagaact tccaaatact ggttctgaag aaatggattt accattaaaa   6540

    gaattagcac taattacagg cgcagcatta ttagctagaa gacgttctaa aaaagaaaaa   6600

    gaatcataa                                                           6609

    <210>2

    <211>2189

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>2

    Met Asn Leu Leu Lys Lys Asn Lys Tyr Ser Ile Arg Lys Tyr Lys Val

    1                 5                         10                    15

    Gly Ile Phe Ser Thr Leu Ile Gly Thr Val Leu Leu Leu Ser Asn Pro

                 20                         25                    30

    Asn Gly Ala Gln Ala Leu Thr Thr Asp His Asn Val Gln Gly Gly Ser

             35                      40                     45

    Asn Gln Ala Leu Pro Gly Asn Ser Gln Asn Thr Asn Ala Asp Thr Asn

        50                      55                     60

    Arg Asp Ile Val Asn Asp Ser Gln Asn Thr Pro Asn Ala His Ala Thr

    65                      70                     75                  80

    Asp Asn Thr Ser Thr Asn Gln Ala Leu Thr Asn His Gln Asn Val Asp

                      85                     90                    95

    Val Ala Asn Gln Val Gly Pro Ala Pro Ile Gln Pro Ser Ala Ser Pro

                  100                      105                     110

    Ala Gln Asn Asn Asn Asn Ser Asn Ala Asn Ser Thr Ala Thr Glu Pro

             115                    120                     125

    Ala Ala Asn Thr Asn Asn Asn Leu Ala Ser Asn Asn Asn Thr Leu Asn

        130                    135                     140

    Val Pro Asn Asn Thr Asp Asn Asn Asp Ser Ala Arg His Leu Thr Leu

    145                    150                    155                   160

    Lys Glu Ile Gln Glu Asp Val Arg His Ser Ser Asp Lys Pro Glu Leu

                        165                     170                 175

    Val Ala Ile Ala Glu Glu Ala Ser Asn Arg Pro Lys Lys Arg Ser Arg

                    180                    185                     190

    Arg Ala Ala Pro Thr Asp Pro Asn Ala Thr Pro Ala Asp Pro Thr Ala

             195                     200                     205

    Thr Pro Ala Asp Pro Thr Ala Gly Asn Gly Ser Ala Pro Val Ala Ile

         210                    215                     220

    Thr Ala Pro Tyr Thr Pro Thr Thr Asp Pro Asn Ala Asn Asn Ile Gly

    225                     230                    235                 240

    Gln Asn Ala Pro Asn Glu Val Leu Ser Phe Asp Asp Asn Asn Ile Arg

                      245                     250                    255

    Pro Ser Thr Asn Arg Ser Val Pro Thr Val Thr Val Val Asp Asn Leu

                  260                     265                     270

    Pro Gly Tyr Thr Leu Ile Asn Gly Gly Lys Val Gly Val Phe Ser His

             275                     280                      285

    Ala Met Val Arg Thr Ser Met Phe Asp Ser Gly Asp Ala Lys Asn Tyr

         290                    295                    300

    Gln Ala Gln Gly Asn Val Ile Ala Leu Gly Arg Ile Arg Gly Asn Asp

    305                     310                      315                320

    Thr Asn Asp His Gly Asp Phe Asn Gly Ile Glu Lys Thr Leu Thr Val

                      325                     330                    335

    Asn Pro Asn Ser Glu Leu Ile Phe Glu Phe Asn Thr Met Thr Thr Lys

                 340                      345                    350

    Asn Tyr Gln Gly Met Thr Asn Leu Ile Ile Lys Asn Ala Asp Asn Asp

             355                     360                      365

    Thr Val Ile Gly Glu Lys Val Val Ala Tyr Gly Pro Ile Trp Arg Leu

        370                       375                     380

    Leu Lys Val Pro Glu Asn Val Ser His Leu Lys Ile Gln Phe Val Pro

    385                     390                      395                 400

    Lys Asn Asp Ala Ile Thr Asp Ala Arg Gly Ile Tyr Gln Leu Arg Asp

                        405                     410                  415

    Gly Tyr Lys Tyr Tyr Asp Phe Val Asp Ser Ile Gly Leu His Ser Gly

                  420                      425                    430

    Ser His Val Tyr Val Glu Arg Arg Thr Met Glu Pro Thr Ala Thr Asn

              435                     440                    445

    Asn Lys Glu Phe Thr Val Thr Thr Ser Leu Lys Asn Asn Gly Asn Phe

        450                      455                     460

    Gly Ala Ser Phe Asn Thr Asp Asp Phe Val Tyr Lys Ile Gln Leu Pro

    465                     470                    475                   480

    Glu Gly Val Glu Tyr Val Asn Asn Ser Leu Thr Lys Asp Phe Pro Ser

                       485                    490                    495

    Gly Asn Ser Gly Val Asp Ile Asn Asp Met Asn Val Thr Tyr Asp Ala

                  500                      505                     510

    Ala Asn Arg Ile Ile Thr Ile Lys Ser Thr Gly Gly Gly Thr Gly Asn

             515                        520                   525

    Ser Pro Ala Arg Leu Met Pro Asp Lys Ile Leu Asp Leu Lys Tyr Lys

         530                     535                    540

    Leu Arg Val Asn Asn Val Pro Thr Pro Arg Thr Val Thr Phe Asn Asp

    545                    550                    555                   560

    Thr Leu Thr Tyr Lys Thr Tyr Ser Gln Asp Phe Ile Asn Ser Pro Ala

                      565                     570                    575

    Glu Ser His Thr Val Ser Thr Asn Pro Tyr Thr Ile Asp Ile Ile Met

                 580                      585                      590

    Asn Lys Asp Ala Leu Gln Ala Glu Val Asp Arg Arg Ile Gln Gln Ala

            595                     600                      605

    Asp Tyr Thr Phe Ala Ser Leu Asp Ile Phe Asn Asp Leu Lys Arg Arg

        610                     615                     620

    Ala Gln Thr Ile Leu Asp Glu Asn Arg Asn Asn Val Pro Leu Asn Lys

    625                     630                    635                  640

    Arg Val Ser Gln Ala Asp Ile Asp Ser Leu Ala Asn Gln Met Gln His

                      645                      650                   655

    Thr Leu Ile Arg Ser Val Asp Ala Glu Asn Ala Val Asn Arg Lys Val

                  660                     665                     670

    Asp Asp Met Glu Asp Leu Val Asn Gln Asn Asp Glu Leu Thr Asp Glu

            675                       680                  685

    Glu Lys Gln Ala Ala Ile Gln Val Ile Glu Glu His Lys Asn Glu Ile

        690                      695                     700

    Ile Gly Asn Ile Gly Asp Gln Thr Thr Asp Asp Gly Val Thr Arg Ile

    705                     710                     715                 720

    Lys Asp Gln Gly Ile Gln Thr Leu Ser Gly Asp Thr Ala Thr Pro Val

                       725                    730                    735

    Val Lys Pro Asn Ala Lys Gln Ala Ile Arg Asp Lys Ala Ala Lys Gln

                  740                     745                      750

    Arg Glu Ile Ile Asn His Thr Pro Asp Ala Thr Gln Asp Glu Ile Gln

             755                      760                     765

    Asp Ala Leu Asn Gln Leu Thr Thr Asp Glu Thr Asp Ala Ile Asp Asn

        770                    775                    780

    Val Thr Asn Ala Thr Thr Asn Ala Asp Val Glu Thr Ala Lys Asn Asn

    785                     790                    795                   800

    Gly Ile Asn Thr Ile Gly Ala Val Ala Pro Gln Val Thr His Lys Gln

                        805                     810                   815

    Ala Ala Arg Asp Ala Ile Asn Gln Ala Thr Ala Thr Lys Arg Gln Gln

                  820                      825                    830

    Ile Asn Ser Asn Arg Glu Ala Thr Gln Glu Glu Lys Asn Ala Ala Leu

             835                      840                     845

    Asn Glu Leu Thr Gln Ala Thr Asn His Ala Leu Glu Gln Ile Asn Gln

        850                     855                    860

    Ala Thr Thr Asn Asp Asp Val Asp Thr Ala Lys Gly Asp Gly Leu Asn

    865                    870                     875                     880

    Ala Ile Asn Pro Ile Ala Pro Val Thr Val Val Lys Gln Ala Ala Arg

                        885                      890                   895

    Asp Ala Val Ser His Asp Ala Gln Gln His Ile Ala Glu Ile Asn Ala

                  900                     905                     910

    Asn Pro Asp Ala Thr Gln Glu Glu Arg Gln Ala Ala Ile Glu Lys Val

            915                     920                      925

    Tyr Ala Ala Val Ala Val Ala Asn Thr Asn Ile Leu Asn Ala Asn Thr

         930                     935                     940

    Asn Ala Asp Val Glu Gln Val Lys Thr Asn Ala Ile Gln Gly Ile Gln

    945                    950                      955                960

    Ala Ile Glu Pro Ala Thr Lys Val Lys Thr Asp Ala Lys Asn Ala Ile

                        965                     970                 975

    Asp Gln Ser Ala Glu Thr Gln His Asn Ala Ile Phe Asn Asn Asn Asp

                 980                     985                     990

    Ala Thr Leu Glu Glu Gln Gln Ala Ala Gln Gln Leu Leu Asp Gln Ala

             995               1000                   1005

    Val Ala Thr Ala Lys Gln Asn Ile Asn Ala Ala Asp Thr Asn Gln

         1010                  1015                   1020

    Glu Val Ala Gln Ala Lys Asp Gln Gly Thr Gln Asn Ile Val Val

         1025                  1030                   1035

    Ile Gln Pro Ala Thr Gln Val Lys Thr Asp Ala Arg Asn Ala Val

         1040                  1045                   1050

    Asn Glu Lys Ala Arg Glu Ala Ile Thr Asn Ile Asn Ala Thr Pro

         1055                  1060                   1065

    Gly Ala Thr Arg Glu Glu Lys Gln Glu Ala Ile Asn Arg Val Asn

         1070                  1075                   1080

    Thr Leu Lys Asn Arg Ala Leu Asn Asp Ile Gly Val Thr Ser Thr

         1085                  1090                   1095

    Thr Ala Met Val Asn Ser Ile Arg Asp Asp Ala Val Asn Gln Ile

         1100                  1105                   1110

    Gly Ala Val Gln Pro His Val Thr Lys Lys Gln Thr Ala Thr Gly

         1115                  1120                   1125

    Val Leu Thr Asp Leu Ala Thr Ala Lys Lys Gln Glu Ile Asn Gln

         1130                  1135                   1140

    Asn Thr Asn Ala Thr Thr Glu Glu Lys Gln Val Ala Leu Asn Gln

         1145                  1150                   1155

    Val Asp Gln Asp Leu Ala Thr Ala Ile Asn Asn Ile Asn Gln Ala

         1160                  1165                   1170

    Asp Thr Asn Ala Glu Val Asp Gln Ala Gln Gln Leu Gly Thr Lys

         1175                  1180                   1185

    Ala Ile Asn Ala Ile Gln Pro Asn Ile Val Lys Lys Pro Ala Ala

         1190                  1195                   1200

    Leu Ala Gln Thr Asn Gln His Tyr Ser Ala Lys Leu Val Glu Ile

         1205                 1210                  1215

    Asn Ala Thr Pro Asp Ala Thr Asp Asp Glu Lys Asn Ala Ala Ile

         1220                 1225                  1230

    Asn Thr Leu Asn Gln Asp Arg Gln Gln Ala Ile Glu Ser Ile Lys

         1235                 1240                  1245

    Gln Ala Asn Thr Asn Ala Glu Val Asp Gln Ala Ala Thr Val Ala

         1250                 1255                  1260

    Glu Asn Asn Ile Asp Ala Val Gln Val Asp Val Val Lys Lys Gln

         1265                 1270                  1275

    Ala Ala Arg Asp Lys Ile Thr Ala Glu Val Ala Lys Arg Ile Glu

         1280                 1285                  1290

    Ala Val Lys Gln Thr Pro Asn Ala Thr Asp Glu Glu Lys Gln Ala

         1295                 1300                  1305

    Ala Val Asn Gln Ile Asn Gln Leu Lys Asp Gln Ala Phe Asn Gln

         1310                 1315                  1320

    Ile Asn Gln Asn Gln Thr Asn Asp Gln Val Asp Ala Thr Thr Asn

         1325                 1330                  1335

    Gln Ala Ile Asn Ala Ile Asp Asn Val Glu Ala Glu Val Val Ile

         1340                 1345                  1350

    Lys Pro Lys Ala Ile Ala Asp Ile Glu Lys Ala Val Lys Glu Lys

         1355                 1360                  1365

    Gln Gln Gln Ile Asp Asn Ser Leu Asp Ser Thr Asp Asn Glu Lys

         1370                 1375                  1380

    Glu Val Ala Leu Gln Ala Leu Ala Lys Glu Lys Glu Lys Ala Leu

         1385                 1390                  1395

    Ala Ala Ile Asp Gln Ala Gln Thr Asn Ser Gln Val Asn Gln Ala

         1400                  1405                 1410

    Ala Thr Asn Gly Val Ser Ala Ile Lys Ile Ile Gln Pro Glu Thr

         1415                  1420                    1425

    Lys Ile Lys Pro Ala Ala Arg Glu Lys Ile Asn Gln Lys Ala Asn

         1430                  1435                    1440

    Glu Leu Arg Ala Gln Ile Asn Gln Asp Lys Glu Ala Thr Ala Glu

         1445                  1450                    1455

    Glu Arg Gln Ala Ala Leu Asp Lys Ile Asn Asp Leu Val Ala Lys

         1460                  1465                    1470

    Ala Met Thr Asn Ile Thr Asn Asp Arg Thr Asn Gln Gln Val Asn

         1475                  1480                    1485

    Asp Ser Thr Asn Gln Ala Leu Asp Asp Ile Ala Leu Val Thr Pro

         1490                  1495                    1500

    Asp His Ile Val Arg Ala Ala Ala Arg Asp Ala Val Lys Gln Gln

        1505                   1510                    1515

    Tyr Glu Ala Lys Lys His Glu Ile Glu Gln Ala Glu His Ala Thr

         1520                  1525                    1530

    Asp Glu Glu Lys Gln Val Ala Leu Asn Gln Leu Ala Asn Asn Glu

         1535                  1540                    1545

    Lys Arg Ala Leu Gln Asn Ile Asn Gln Ala Ile Ala Asn Asn Asp

         1550                  1555                    1560

    Val Lys Arg Val Glu Ser Asn Gly Ile Ala Thr Leu Lys Gly Val

         1565                  1570                    1575

    Glu Pro His Ile Val Val Lys Pro Glu Ala Gln Glu Ala Ile Lys

         1580                  1585                    1590

    Ala Ser Ala Asp Asn Gln Val Glu Ser Ile Lys Asp Thr Pro His

         1595                  1600                    1605

    Ala Thr Thr Asp Glu Leu Asp Glu Ala Asn Gln Gln Ile Asn Asp

         1610                  1615                    1620

    Thr Leu Lys Gln Gly Gln Gln Asp Ile Asp Asn Thr Thr Gln Asp

         1625                 1630                  1635

    Ala Ala Val Asn Asp Val Arg Asn Gln Thr Ile Lys Ala Ile Glu

         1640                 1645                  1650

    Gln Ile Lys Pro Lys Val Arg Arg Lys Arg Ala Ala Leu Asp Asn

         1655                 1660                  1665

    Ile Asp Glu Ser Asn Asn Asn Gln Leu Asp Ala Ile Arg Asn Thr

         1670                 1675                  1680

    Leu Asp Thr Thr Gln Asp Glu Arg Asn Val Ala Ile Ala Ala Leu

         1685                 1690                  1695

    Asn Lys Ile Val Asn Ala Ile Lys Asn Asp Ile Ala Gln Asn Lys

         1700                 1705                  1710

    Thr Asn Ala Glu Val Asp Gln Thr Glu Ala Asp Gly Asn Asn Asn

         1715                 1720                  1725

    Ile Lys Val Ile Leu Pro Lys Val Gln Val Lys Pro Ala Ala Arg

         1730                 1735                  1740

    Gln Ser Val Ser Ala Lys Ala Glu Ala Gln Asn Ala Leu Ile Asp

         1745                  1750                 1755

    Gln Ser Asp Leu Ser Thr Glu Glu Glu Arg Leu Ala Ala Lys His

         1760                 1765                  1770

    Leu Val Glu Gln Ala Leu Asn Gln Ala Ile Asp Gln Ile Asn His

        1775                  1780                   1785

    Ala Asp Lys Thr Ala Gln Val Asn Gln Asn Ser Ile Asp Ala Gln

         1790                 1795                  1800

    Asn Ile Ile Ser Lys Ile Lys Pro Ala Thr Thr Val Lys Ala Thr

         1805                 1810                   1815

    Ala Leu Gln Gln Ile Gln Asn Ile Ala Thr Asn Lys Ile Asn Leu

         1820                 1825                   1830

    Ile Lys Ala Asn Asn Glu Ala Thr Asp Glu Glu Gln Asn Ala Ala

         1835                  1840                   1845

    Ile Val Gln Val Glu Lys Glu Leu Ile Lys Ala Lys Gln Gln Ile

         1850                  1855                   1860

    Ala Gly Ala Val Thr Asn Ala Asp Val Ala Tyr Leu Leu His Asp

         1865                  1870                   1875

    Gly Lys Asn Glu Ile Arg Glu Ile Glu Pro Val Ile Asn Lys Lys

         1880                  1885                   1890

    Ala Thr Ala Arg Glu Gln Leu Thr Thr Leu Phe Asn Asp Lys Lys

         1895                  1900                   1905

    Gln Ala Ile Glu Ala Asn Val Gln Ala Thr Val Glu Glu Arg Asn

         1910                  1915                   1920

    Ser Ile Leu Ala Gln Leu Gln Asn Ile Tyr Asp Thr Ala Ile Gly

         1925                  1930                   1935

    Gln Ile Asp Gln Asp Arg Ser Asn Ala Gln Val Asp Lys Thr Ala

         1940                  1945                   1950

    Thr Leu Asn Leu Gln Thr Ile His Asp Leu Asp Val His Pro Ile

         1955                  1960                   1965

    Lys Lys Pro Asp Ala Glu Lys Thr Ile Asn Asp Asp Leu Ala Arg

         1970                  1975                   1980

    Val Thr His Leu Val Gln Asn Tyr Arg Lys Val Ser Asp Arg Asn

         1985                  1990                   1995

    Lys Ala Asp Ala Leu Lys Ala Ile Thr Ala Leu Lys Leu Gln Met

         2000                  2005                   2010

    Asp Glu Glu Leu Lys Thr Ala Arg Thr Asn Ala Asp Val Asp Ala

         2015                  2020                   2025

    Val Leu Lys Arg Phe Asn Val Ala Leu Gly Asp Ile Glu Ala Val

         2030                  2035                   2040

    Ile Thr Glu Lys Glu Asn Ser Leu Leu Arg Ile Asp Asn Ile Ala

         2045                  2050                    2055

    Gln Gln Thr Tyr Ala Lys Phe Lys Ala Ile Ala Thr Pro Glu Gln

         2060                  2065                    2070

    Leu Ala Lys Val Lys Ala Leu Ile Asp Gln Tyr Val Ala Asp Gly

         2075                  2080                    2085

    Asn Arg Met Val Asp Glu Asp Ala Thr Leu Asn Asp Ile Lys Lys

         2090                  2095                    2100

    Asp Thr Gln Leu Ile Ile Asp Glu Ile Leu Ala Ile Lys Leu Pro

        2105                   2110                    2115

    Ala Glu Val Ile Lys Ala Ser Pro Lys Val Gly Gln Pro Ala Pro

         2120                  2125                    2130

    Lys Val Cys Thr Pro Ile Lys Lys Glu Asp Lys Gln Glu Val Arg

         2135                  2140                    2145

    Lys Val Val Lys Glu Leu Pro Asn Thr Gly Ser Glu Glu Met Asp

         2150                  2155                    2160

    Leu Pro Leu Lys Glu Leu Ala Leu Ile Thr Gly Ala Ala Leu Leu

         2165                  2170                    2175

    Ala Arg Arg Arg Ser Lys Lys Glu Lys Glu Ser

         2180                  2185

    <210>3

    <211>6852

    <212>DNA

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>3

    tctaatgaat gtaaagataa tacaaggagt tattacatga gtaaaagaca gaaagcattt     60

    catgacagct tagcaaacga aaaaacaaga gtaagacttt ataaatctgg aaaaaattgg    120

    gtaaaatccg gaattaaaga aatagaaatg ttcaaaatta tggggctacc atttattagt    180

    catagtttag tgagtcaaga taatcaaagc attagtaaaa aaatgacggg atacggactg    240

    aaaactacgg cggttattgg tggtgcattc acggtaaata tgttgcatga ccagcaagct    300

    tttgcggctt ctgatgcacc attaacttct gaattaaaca cacaaagtga aacagtaggt    360

    aatcaaaact caacgacaat cgaagcatca acatcaacag ccgattccac aagtgtaacg    420

    aaaaatagta gttcggtaca aacatcaaat agtgacacag tctcaagtga aaagtctgaa    480

    aaggtcactt cgacaactaa tagtacaagc aatcaacaag agaaattgac atctacatca    540

    gaatcaacat cctcaaagaa tactacatca agttctgata ctaaatctgt agcttcaact    600

    tcaagtacag aacaaccaat taatacatca acaaatcaaa gtactgcatc aaataacact    660

    tcacaaagca caacgccatc ttcggtcaac ttaaacaaaa ctagcacaac gtcaactagc    720

    accgcaccag taaaacttcg aactttcagt cgcttagcta tgtcaacatt tgcgtcagca    780

    gcgacgacaa ccgcagtaac tgctaataca attacagtta ataaagataa cttaaaacaa    840

    tatatgacaa cgtcaggtaa tgctacctat gatcaaagta ccggtattgt gacgttaaca    900

    caggatgcat acagccaaaa aggtgctatt acattaggaa cacgtattga ctctaataag    960

    agttttcatt tttctggaaa agtaaattta ggtaacaaat atgaagggca tggaaatggt   1020

    ggagatggta tcggttttgc cttttcacca ggtgtattag gtgaaacagg gttaaacggt   1080

    gccgcagtag gtattggtgg cttaagtaac gcatttggct tcaaattgga tacgtatcac   1140

    aatacatcta aaccaaattc agctgcaaag gcgaatgctg acccatctaa tgtagctggt   1200

    ggaggtgcgt ttggtgcatt tgtaacaaca gatagttatg gtgttgcgac aacgtataca   1260

    tcaagttcaa cagctgataa tgctgcgaag ttaaatgttc aacctacaaa taacacgttc   1320

    caagattttg atattaacta taatggtgat acaaaggtta tgactgtcaa atatgcaggt   1380

    caaacatgga cacgtaatat ttcagattgg attgcgaaaa gtggtacgac caacttttca   1440

    ttatcaatga cagcctcaac aggtggcgcg acaaatttac aacaagtaca atttggaaca   1500

    ttcgaatata cagagtctgc tgttacacaa gtgagatacg ttgatgtaac aacaggtaaa   1560

    gatattattc caccaaaaac atattcagga aatgttgatc aagtcgtgac aatcgataat   1620

    cagcaatctg cattgactgc taaaggatat aactacacgt ccgtcgatag ttcatatgcg   1680

    tcaacttata atgatacaaa taaaactgta aaaatgacga atgctggaca atcagtgaca   1740

    tattatttta ctgatgtaaa agcaccaact gtaactgtag gcaatcaaac catagaagtg   1800

    ggtaaaacaa tgaatcctat tgtattgact acaacggata atggtactgg gactgtgaca   1860

    aatacagtta caggattacc aagcggatta agttacgata gtgcaacgaa ttcaatcatt   1920

    gggacaccaa caaaaattgg tcaatcaaca gtgacagttg tgtctactga ccaagcaaat   1980

    aacaaatcga cgacaacttt tacaataaat gttgtggata cgacagcacc aacagtgaca   2040

    ccaataggag atcaatcatc agaagtgtat tcaccaatat ccccgattaa aattgctacg   2100

    caagataaca gtggaaatgc ggtgacgaat acagtgactg gattgccatc cggactaaca   2160

    tttgatagta caaataatac tattagtggt acaccaacaa acattggtac aagtactata   2220

    tcaatcgttt ctacagatgc gagcggtaac aaaacgacga caacttttaa atatgaagta   2280

    acaagaaata gcatgagtga ttccgtatca acatcaggaa gtacacaaca atctcaaagt   2340

    gtgtcaacaa gtaaagctga ctcacaaagt gcatcaacga gtacatcagg atcgattgtg   2400

    gtatctacat cagctagtac ctcgaaatcg acaagtgtaa gcctatctga ttctgtgagt   2460

    gcatctaagt cattaagcac atctgaaagt aatagtgtat caagctcaac aagcacaagt   2520

    ttagtgaatt cacaaagtgt atcatcaagc atgtcggatt cagctagtaa atcaacatca   2580

    ttaagcgatt ctatttcaaa ctctagcagt actgaaaaat ccgaaagtct atcaacaagt   2640

    acatctgatt cattgcgtac atcaacatca ctcagtgact cattaagtat gagtacatca   2700

    ggaagcttgt ctaagtcaca aagcttatca acgagtatat cagggtcgtc tagtacatca   2760

    gcatcattaa gtgacagtac atcgaatgca attagtacat caacatcatt gagcgagtca   2820

    gctagcacct cggactctat cagtatttca aatagcatag ccaactctca aagtgcgtca   2880

    acaagcaaat cagattcaca aagtacatca atatcattaa gtacaagtga ttcaaaatcg   2940

    atgagtacat cagaatcatt gagcgattcg acgagcacaa gtggttctgt ttctggatca   3000

    ctaagcatag cagcatcaca aagtgtctca acaagtacat cagactcgat gagtacttca   3060

    gagatagtaa gtgactctat cagtacaagt gggtcattat ctgcatcaga cagtaaatca   3120

    atgtccgtaa gtagttcaat gagcacgtct cagtcaggta gtacatcaga atcattaagt   3180

    gattcacaaa gtacatctga ttctgatagt aagtcattat cacaaagtac tagtcaatca   3240

    ggttcaacaa gtacatcaac gtcgacaagt gcttcagtac gtacttcgga atcacaaagt   3300

    acgtctggtt caatgagtgc aagtcaatcc gattcaatga gcatatcaac gtcgtttagt   3360

    gattcaacga gtgatagcaa atcagcatca actgcatcaa gtgaatcaat atcacaaagt   3420

    gcttctacga gcacatctgg ttcggtaagt acttcgacat cgttaagtac aagtaattca   3480

    gaacgtacat caacatctat gagtgattcc acaagcttaa gtacatcaga gtctgattca   3540

    ataagtgaat caacgtcaac gagcgactct ataagtgaag caatatctgc ttcagagagc   3600

    acgtttatat cattaagtga atcaaatagt actagcgatt cagaatcaca aagtgcatct   3660

    gcctttttaa gtgaatcatt aagtgaaagt acgtctgaat caacatcaga gtcagtgagt   3720

    agttcgacaa gtgagagtac gtcattatca gacagtacat cagaatctgg tagcacatca   3780

    acatcattaa gtaattcaac aagtggtagt acgtccattt caacatcgac aagtatcagt   3840

    gaatcaacgt caacgtttaa gagcgagagt gtttcaacat cactgagtat gtcaacgagt   3900

    acaagtttgt ctgactctac aagtttgtca acatcattaa gtgattccac aagtgatagt   3960

    aagtctgatt cattaagtac atcaatgtcg acaagtgatt caatcagtac aagtaaatct   4020

    gattccatta gtacatccac atcattaagt ggttctacaa gtgaaagtga atccgactca   4080

    acatcatcaa gtgaaagtaa atccgattca acatcaatga gcataagtat gtctcaatca   4140

    acatcaggaa gtacaagtac gtcaacgagt acaagtttgt ctgactcaac gagtacatca   4200

    ttgtcactaa gtgcctcaat gaatcaaagc ggagtagact caaactcagc aagccaaagt   4260

    gcctcaaact caacaagtac aagcacgagc gaatccgatt cacaaagcac atcatcatat   4320

    acaagtcagt caacaagcca aagtgaatcc acatcgacat caacgtcact aagcgattca   4380

    acaagtatat ctaaaagtac gagtcaatca ggttcggtaa gcacatcagc gtcattaagt   4440

    ggttcagaga gtgaatctga ttcacaaagt atctcaacaa gtgcaagtga gtcaacatca   4500

    gaaagtgcgt caacatcact cagtgactca acaagtacaa gtaactcagg atcagcaagt   4560

    acgtcaacat cgctcagtaa ctcagcaagc gcaagtgaat ccgatttgtc gtcaacatct   4620

    ttaagtgatt caacatctgc gtcaatgcaa agcagtgaat ccgattcaca aagcacatca   4680

    gcatcattaa gtgattcgct aagtacatca acttcaaacc gcatgtcgac cattgcaagt   4740

    ttatctacat cggtaagtac atcagagtct ggctcaacat cagaaagtac aagtgaatcc   4800

    gattcaacat caacatcatt aagcgattca caaagcacat caagaagtac aagtgcatca   4860

    ggatcagcaa gtacatcaac atcaacaagt gactctcgta gtacatcagc ttcaactagt   4920

    acttcgatgc gtacaagtac tagtgattca caaagtatgt cgctttcgac aagtacatca   4980

    acaagtatga gtgattcaac gtcattatct gatagtgtta gtgattcaac atcagactca   5040

    acaagtgcga gtacatctgg ttcgatgagt gtgtctatat cgttaagtga ttcgacaagt   5100

    acatcaacat cggctagtga agtaatgagc gcaagcatat ctgattcaca aagtatgtca   5160

    gaatctgtaa atgattcaga aagtgtaagt gaatctaatt ctgaaagtga ctctaaatcg   5220

    atgagtggct caacaagtgt cagtgattct ggctcattga gcgtctcaac gtcattaaga   5280

    aaatcagaaa gtgtaagcga gtcaagttca ttgagttgct cacaatcgat gagcgattca   5340

    gtaagcacaa gcgattcgtc atcattaagt gtatcgacgt cactaagaag ttcagaaagc   5400

    gtgagtgaat ctgattcatt aagtgattca aaatcaacaa gtggttcgac ttcaacaagt   5460

    acatctggtt cattgagtac ctcaacatca ttaagtggtt cagaaagcgt aagcgagtct   5520

    acctcgctaa gtgattcaat atcaatgagt gattctacta gtacaagtga ctccgactca   5580

    ttaagtggat caatatcttt aagtggttcc acaagtctta gcacttcgga ttcattaagt   5640

    gattcaaaat cattgagtag ctcgcaaagt atgagtggat cagaatcaac gtcaacaagt   5700

    gtgagcgatt cgcagtcaag ctcaacaagt aatagtcaat ttgactctat gagcatcagt   5760

    gcatcagaaa gcgactcaat gtctacaagt gattcgtcta gcatcagtgg atcaaattca   5820

    acgagtacat cactttcaac atctgactca atgagcggaa gcgtatcagt ttcaacatcg   5880

    acaagtttaa gtgactcaat atcaggttca acaagtgtaa gtgactcgag ctcaacaagc   5940

    acatctacat cattaagtga ttcaatgtca caaagccagt caacaagtac aagtgcatct   6000

    ggttccttaa gtacatcgat atcaacatca atgtcaatga gtgctagtac atcgtcatca   6060

    caaagcacat cggtgtcgac atcattatca acatcagaca gtatcagtga ttctacttca   6120

    ataagtatca gtggttcaca aagtacagta gaatcagaat ctacaagtga ttcaacttct   6180

    atcagtgact cagaatcatt gagtacatca gattcagact cgacatcgac aagtacatcg   6240

    gactcaacaa gtggttcaac ttcaacaagc atatctgaat cattaagtac gtctggttca   6300

    ggttcaacga gcgtatctga ctcaacatca atgagtgaat ctaattcatc gagtgtttca   6360

    atgtcacaag acaaatccga ctcaacatca attagtgact cagaatcagt gtcaacaagc   6420

    acatcaacgt cattgagcac atccgattcg acaagcacat ccgaatcact gagtacatct   6480

    atgtctggtt cacaaagcat ttctgactca acatcaacaa gtatgtccgg ctcaacaagt   6540

    acatctgaat ctaactcaat gcatccgtca gactcaatga gtatgcatca tactcacagc   6600

    acgagcacat ctcgcttatc aagtgaagca acaacgagca cgagtgaatc tcagtctaca   6660

    ttaagtgcaa catctgaagt gactaaacat aatggcacac cagcacaaag tgaaaaaaga   6720

    ttgccagata caggtgactc aataaaacaa aatggattac taggtggcgt tatgacatta   6780

    ttagttggtt taggtttaat gaagagaaag aaaaagaaag atgaaaatga tcaagatgat   6840

    tctcaagcat aa                                                       6852

    <210>4

    <211>2283

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>4

    Ser Asn Glu Cys Lys Asp Asn Thr Arg Ser Tyr Tyr Met Ser Lys Arg

    1                 5                   10                         15

    Gln Lys Ala Phe His Asp Ser Leu Ala Asn Glu Lys Thr Arg Val Arg

                  20                      25                     30

    Leu Tyr Lys Ser Gly Lys Asn Trp Val Lys Ser Gly Ile Lys Glu Ile

             35                      40                       45

    Glu Met Phe Lys Ile Met Gly Leu Pro Phe Ile Ser His Ser Leu Val

        50                      55                       60

    Ser Gln Asp Asn Gln Ser Ile Ser Lys Lys Met Thr Gly Tyr Gly Leu

    65                      70                      75                     80

    Lys Thr Thr Ala Val Ile Gly Gly Ala Phe Thr Val Asn Met Leu His

                        85                      90                   95

    Asp Gln Gln Ala Phe Ala Ala Ser Asp Ala Pro Leu Thr Ser Glu Leu

                 100                     105                     110

    Asn Thr Gln Ser Glu Thr Val Gly Asn Gln Asn Ser Thr Thr Ile Glu

             115                     120                    125

    Ala Ser Thr Ser Thr Ala Asp Ser Thr Ser Val Thr Lys Asn Ser Ser

         130                     135                     140

    Ser Val Gln Thr Ser Asn Ser Asp Thr Val Ser Ser Glu Lys Ser Glu

    145                     150                     155                  160

    Lys Val Thr Ser Thr Thr Asn Ser Thr Ser Asn Gln Gln Glu Lys Leu

                        165                    170                    175

    Thr Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ser Ser Lys Asn Thr Thr Ser Ser Ser

                  180                      185                     190

    Asp Thr Lys Ser Val Ala Ser Thr Ser Ser Thr Glu Gln Pro Ile Asn

             195                      200                      205

    Thr Ser Thr Asn Gln Ser Thr Ala Ser Asn Asn Thr Ser Gln Ser Thr

         210                    215                     220

    Thr Pro Ser Ser Val Asn Leu Asn Lys Thr Ser Thr Thr Ser Thr Ser

    225                     230                     235                   240

    Thr Ala Pro Val Lys Leu Arg Thr Phe Ser Arg Leu Ala Met Ser Thr

                        245                    250                    255

    Phe Ala Ser Ala Ala Thr Thr Thr Ala Val Thr Ala Asn Thr Ile Thr

                  260                     265                      270

    Val Asn Lys Asp Asn Leu Lys Gln Tyr Met Thr Thr Ser Gly Asn Ala

             275                     280                     285

    Thr Tyr Asp Gln Ser Thr Gly Ile Val Thr Leu Thr Gln Asp Ala Tyr

         290                     295                     300

    Ser Gln Lys Gly Ala Ile Thr Leu Gly Thr Arg Ile Asp Ser Asn Lys

    305                      310                     315                  320

    Ser Phe His Phe Ser Gly Lys Val Asn Leu Gly Asn Lys Tyr Glu Gly

                       325                    330                     335

    His Gly Asn Gly Gly Asp Gly Ile Gly Phe Ala Phe Ser Pro Gly Val

                  340                     345                     350

    Leu Gly Glu Thr Gly Leu Asn Gly Ala Ala Val Gly Ile Gly Gly Leu

             355                    360                      365

    Ser Asn Ala Phe Gly Phe Lys Leu Asp Thr Tyr His Asn Thr Ser Lys

         370                    375                     380

    Pro Asn Ser Ala Ala Lys Ala Asn Ala Asp Pro Ser Asn Val Ala Gly

    385                     390                     395                   400

    Gly Gly Ala Phe Gly Ala Phe Val Thr Thr Asp Ser Tyr Gly Val Ala

                      405                     410                     415

    Thr Thr Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Ala Asp Asn Ala Ala Lys Leu Asn

                  420                      425                    430

    Val Gln Pro Thr Asn Asn Thr Phe Gln Asp Phe Asp Ile Asn Tyr Asn

             435                    440                     445

    Gly Asp Thr Lys Val Met Thr Val Lys Tyr Ala Gly Gln Thr Trp Thr

         450                    455                     460

    Arg Asn Ile Ser Asp Trp Ile Ala Lys Ser Gly Thr Thr Asn Phe Ser

    465                     470                      475                  480

    Leu Ser Met Thr Ala Ser Thr Gly Gly Ala Thr Asn Leu Gln Gln Val

                       485                     490                     495

    Gln Phe Gly Thr Phe Glu Tyr Thr Glu Ser Ala Val Thr Gln Val Arg

                 500                     505                      510

    Tyr Val Asp Val Thr Thr Gly Lys Asp Ile Ile Pro Pro Lys Thr Tyr

              515                     520                       525

    Ser Gly Asn Val Asp Gln Val Val Thr Ile Asp Asn Gln Gln Ser Ala

         530                    535                      540

    Leu Thr Ala Lys Gly Tyr Asn Tyr Thr Ser Val Asp Ser Ser Tyr Ala

    545                     550                     555                   560

    Ser Thr Tyr Asn Asp Thr Asn Lys Thr Val Lys Met Thr Asn Ala Gly

                       565                    570                      575

    Gln Ser Val Thr Tyr Tyr Phe Thr Asp Val Lys Ala Pro Thr Val Thr

                  580                     585                      590

    Val Gly Asn Gln Thr Ile Glu Val Gly Lys Thr Met Asn Pro Ile Val

              595                     600                    605

    Leu Thr Thr Thr Asp Asn Gly Thr Gly Thr Val Thr Asn Thr Val Thr

        610                     615                     620

    Gly Leu Pro Ser Gly Leu Ser Tyr Asp Ser Ala Thr Asn Ser Ile Ile

    625                     630                     635                   640

    Gly Thr Pro Thr Lys Ile Gly Gln Ser Thr Val Thr Val Val Ser Thr

                        645                     650                   655

    Asp Gln Ala Asn Asn Lys Ser Thr Thr Thr Phe Thr Ile Asn Val Val

                     660                 665                      670

    Asp Thr Thr Ala Pro Thr Val Thr Pro Ile Gly Asp Gln Ser Ser Glu

             675                     680                      685

    Val Tyr Ser Pro Ile Ser Pro Ile Lys Ile Ala Thr Gln Asp Asn Ser

         690                        695                   700

    Gly Asn Ala Val Thr Asn Thr Val Thr Gly Leu Pro Ser Gly Leu Thr

    705                     710                     715                   720

    Phe Asp Ser Thr Asn Asn Thr Ile Ser Gly Thr Pro Thr Asn IIe Gly

                      725                      730                     735

    Thr Ser Thr Ile Ser Ile Val Ser Thr Asp Ala Ser Gly Asn Lys Thr

                    740                     745                    750

    Thr Thr Thr Phe Lys Tyr Glu Val Thr Arg Asn Ser Met Ser Asp Ser

             755                     760                     765

    Val Ser Thr Ser Gly Ser Thr Gln Gln Ser Gln Ser Val Ser Thr Ser

         770                     775                     780

    Lys Ala Asp Ser Gln Ser Ala Ser Thr Ser Thr Ser Gly Ser Ile Val

    785                     790                     795                   800

    Val Ser Thr Ser Ala Ser Thr Ser Lys Ser Thr Ser Val Ser Leu Ser

                        805                     810                    815

    Asp Ser Val Ser Ala Ser Lys Ser Leu Ser Thr Ser Glu Ser Asn Ser

                   820                     825                     830

    Val Ser Ser Ser Thr Ser Thr Ser Leu Val Asn Ser Gln Ser Val Ser

              835                     840                     845

    Ser Ser Met Ser Asp Ser Ala Ser Lys Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser

         850                     855                     860

    Ile Ser Asn Ser Ser Ser Thr Glu Lys Ser Glu Ser Leu Ser Thr Ser

    865                      870                     875                  880

    Thr Ser Asp Ser Leu Arg Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Leu Ser

                      885                     890                      895

    Met Ser Thr Ser Gly Ser Leu Ser Lys Ser Gln Ser Leu Ser Thr Ser

                  900                     905                     910

    Ile Ser Gly Ser Ser Ser Thr Ser Ala Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser

              915                       920                   925

    Asn Ala Ile Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Glu Ser Ala Ser Thr Ser

        930                      935                     940

    Asp Ser Ile Ser Ile Ser Asn Ser Ile Ala Asn Ser Gln Ser Ala Ser

    945                      950                      955                 960

    Thr Ser Lys Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Ile Ser Leu Ser Thr Ser

                       965                       970                   975

    Asp Ser Lys Ser Met Ser Thr Ser Glu Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser

                  980                     985                     990

    Thr Ser Gly Ser Val Ser Gly Ser Leu Ser Ile Ala Ala Ser Gln Ser

             995                    1000                     1005

    Val Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Met Ser Thr Ser Glu Ile Val

         1010                  1015                   1020

    Ser Asp Ser Ile Ser Thr Ser Gly Ser Leu Ser Ala Ser Asp Ser

         1025                  1030                   1035

    Lys Ser Met Ser Val Ser Ser Ser Met Ser Thr Ser Gln Ser Gly

         1040                  1045                   1050

    Ser Thr Ser Glu Ser Leu Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Asp Ser

         1055                  1060                   1065

    Asp Ser Lys Ser Leu Ser Gln Ser Thr Ser Gln Ser Gly Ser Thr

         1070                  1075                   1080

    Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Ala Ser Val Arg Thr Ser Glu Ser

         1085                  1090                    1095

    Gln Ser Thr Ser Gly Ser Met Ser Ala Ser Gln Ser Asp Ser Met

         1100                  1105                    1110

    Ser Ile Ser Thr Ser Phe Ser Asp Ser Thr Ser Asp Ser Lys Ser

         1115                  1120                    1125

    Ala Ser Thr Ala Ser Ser Glu Ser Ile Ser Gln Ser Ala Ser Thr

         1130                  1135                    1140

    Ser Thr Ser Gly Ser Val Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Thr Ser

         1145                  1150                    1155

    Asn Ser Glu Arg Thr Ser Thr Ser Met Ser Asp Ser Thr Ser Leu

         1160                  1165                    1170

    Ser Thr Ser Glu Ser Asp Ser Ile Ser Glu Ser Thr Ser Thr Ser

         1175                  1180                    1185

    Asp Ser Ile Ser Glu Ala Ile Ser Ala Ser Glu Ser Thr Phe Ile

         1190                  1195                    1200

    Ser Leu Ser Glu Ser Asn Ser Thr Ser Asp Ser Glu Ser Gln Ser

         1205                  1210                    1215

    Ala Ser Ala Phe Leu Ser Glu Ser Leu Ser Glu Ser Thr Ser Glu

         1220                  1225                    1230

    Ser Thr Ser Glu Ser Val Ser Ser Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ser

         1235                  1240                    1245

    Leu Ser Asp Ser Thr Ser Glu Ser Gly Ser Thr Ser Thr Ser Leu

         1250                  1255                    1260

    Ser Asn Ser Thr Ser Gly Ser Thr Ser Ile Ser Thr Ser Thr Ser

         1265                  1270                    1275

    Ile Ser Glu Ser Thr Ser Thr Phe Lys Ser Glu Ser Val Ser Thr

         1280                  1285                    1290

    Ser Leu Ser Met Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser

         1295                  1300                    1305

    Leu Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser Asp Ser Lys Ser Asp

         1310                  1315                    1320

    Ser Leu Ser Thr Ser Met Ser Thr Ser Asp Ser Ile Ser Thr Ser

         1325                  1330                    1335

    Lys Ser Asp Ser Ile Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Gly Ser Thr

         1340                  1345                    1350

    Ser Glu Ser Glu Ser Asp Ser Thr Ser Ser Ser Glu Ser Lys Ser

         1355                  1360                    1365

    Asp Ser Thr Ser Met Ser Ile Ser Met Ser Gln Ser Thr Ser Gly

         1370                  1375                    1380

    Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser

         1385                  1390                    1395

    Thr Ser Leu Ser Leu Ser Ala Ser Met Asn Gln Ser Gly Val Asp

         1400                  1405                    1410

    Ser Asn Ser Ala Ser Gln Ser Ala Ser Asn Ser Thr Ser Thr Ser

         1415                  1420                    1425

    Thr Ser Glu Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Ser Tyr Thr Ser Gln

         1430                  1435                    1440

    Ser Thr Ser Gln Ser Glu Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser

         1445                  1450                    1455

    Asp Ser Thr Ser Ile Ser Lys Ser Thr Ser Gln Ser Gly Ser Val

         1460                  1465                    1470

    Ser Thr Ser Ala Ser Leu Ser Gly Ser Glu Ser Glu Ser Asp Ser

         1475                  1480                    1485

    Gln Ser Ile Ser Thr Ser Ala Ser Glu Ser Thr Ser Glu Ser Ala

         1490                  1495                    1500

    Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Asn Ser Gly Ser

         1505                  1510                    1515

    Ala Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asn Ser Ala Ser Ala Ser Glu

         1520                  1525                   1530

    Ser Asp Leu Ser Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser Ala Ser

         1535                  1540                   1545

    Met Gln Ser Ser Glu Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Ala Ser Leu

         1550                  1555                   1560

    Ser Asp Ser Leu Ser Thr Ser Thr Ser Asn Arg Met Ser Thr Ile

         1565                  1570                   1575

    Ala Ser Leu Ser Thr Ser Val Ser Thr Ser Glu Ser Gly Ser Thr

         1580                  1585                   1590

    Ser Glu Ser Thr Ser Glu Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser

         1595                  1600                   1605

    Asp Ser Gln Ser Thr Ser Arg Ser Thr Ser Ala Ser Gly Ser Ala

         1610                  1615                   1620

    Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Arg Ser Thr Ser Ala Ser

         1625                  1630                   1635

    Thr Ser Thr Ser Met Arg Thr Ser Thr Ser Asp Ser Gln Ser Met

         1640                  1645                   1650

    Ser Leu Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Met Ser Asp Ser Thr Ser

         1655                  1660                   1665

    Leu Ser Asp Ser Val Ser Asp Ser Thr Ser Asp Ser Thr Ser Ala

         1670                  1675                   1680

    Ser Thr Ser Gly Ser Met Ser Val Ser Ile Ser Leu Ser Asp Ser

         1685                  1690                   1695

    Thr Ser Thr Ser Thr Ser Ala Ser Glu Val Met Ser Ala Ser Ile

         1700                  1705                   1710

    Ser Asp Ser Gln Ser Met Ser Glu Ser Val Asn Asp Ser Glu Ser

         1715                  1720                   1725

    Val Ser Glu Ser Asn Ser Glu Ser Asp Ser Lys Ser Met Ser Gly

         1730                  1735                    1740

    Ser Thr Ser Val Ser Asp Ser Gly Ser Leu Ser Val Ser Thr Ser

         1745                  1750                    1755

    Leu Arg Lys Ser Glu Ser Val Ser Glu Ser Ser Ser Leu Ser Cys

         1760                  1765                    1770

    Ser Gln Ser Met Ser Asp Ser Val Ser Thr Ser Asp Ser Ser Ser

         1775                  1780                    1785

    Leu Ser Val Ser Thr Ser Leu Arg Ser Ser Glu Ser Val Ser Glu

         1790                  1795                    1800

    Ser Asp Ser Leu Ser Asp Ser Lys Ser Thr Ser Gly Ser Thr Ser

         1805                  1810                    1815

    Thr Ser Thr Ser Gly Ser Leu Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Gly

         1820                  1825                    1830

    Ser Glu Ser Val Ser Glu Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Ile Ser

         1835                  1840                    1845

    Met Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Asp Ser Leu Ser Gly

         1850                  1855                    1860

    Ser Ile Ser Leu Ser Gly Ser Thr Ser Leu Ser Thr Ser Asp Ser

          1865                  1870                   1875

    Leu Ser Asp Ser Lys Ser Leu Ser Ser Ser Gln Ser Met Ser Gly

         1880                  1885                    1890

    Ser Glu Ser Thr Ser Thr Ser Val Ser Asp Ser Gln Ser Ser Ser

         1895                  1900                    1905

    Thr Ser Asn Ser Gln Phe Asp Ser Met Ser Ile Ser Ala Ser Glu

         1910                  1915                    1920

    Ser Asp Ser Met Ser Thr Ser Asp Ser Ser Ser Ile Ser Gly Ser

         1925                  1930                    1935

    Asn Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Thr Ser Asp Ser Met Ser Gly

         1940                  1945                   1950

    Ser Val Ser Val Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Ile Ser

         1955                  1960                   1965

    Gly Ser Thr Ser Val Ser Asp Ser Ser Ser Thr Ser Thr Ser Thr

         1970                  1975                   1980

    Ser Leu Ser Asp Ser Met Ser Gln Ser Gln Ser Th  Ser Thr Ser

         1985                  1990                   1995

    Ala Ser Gly Ser Leu Ser Thr Ser Ile Ser Thr Ser Met Ser Met

         2000                  2005                   2010

    Ser Ala Ser Thr Ser Ser Ser Gln Ser Thr Ser Val Ser Thr Ser

         2015                  2020                   2025

    Leu Ser Thr Ser Asp Ser Ile Ser Asp Ser Thr Ser Ile Ser Ile

         2030                  2035                   2040

    Ser Gly Ser Gln Ser Thr Val Glu Ser Glu Ser Thr Ser Asp Ser

         2045                  2050                    2055

    Thr Ser Ile Ser Asp Ser Glu Ser Leu Ser Thr Ser Asp Ser Asp

         2060                  2065                    2070

    Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Thr Ser Gly Ser Thr Ser

         2075                  2080                    2085

    Thr Ser Ile Ser Glu Ser Leu Ser Thr Ser Gly Ser Gly Ser Thr

         2090                   2095                    2100

    Ser Val Ser Asp Ser Thr Ser Met Ser Glu Ser Asn Ser Ser Ser

         2105                  2110                     2115

    Val Ser Met Ser Gln Asp Lys Ser Asp Ser Thr Ser Ile Ser Asp

         2120                  2125                     2130

    Ser Glu Ser Val Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Thr Ser

         2135                  2140                     2145

    Asp Ser Thr Ser Thr Ser Glu Ser Leu Ser Thr Ser Met Ser Gly

         2150                  2155                   2160

    Ser Gln Ser Ile Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Met Ser Gly Ser

         2165                  2170                   2175

    Thr Ser Thr Ser Glu Ser Asn Ser Met His Pro Ser Asp Ser Met

         2180                  2185                   2190

    Ser Met His His Thr His Ser Thr Ser Thr Ser Arg Leu Ser Ser

         2195                  2200                   2205

    Glu Ala Thr Thr Ser Thr Ser Glu Ser Gln Ser Thr Leu Ser Ala

         2210                  2215                   2220

    Thr Ser Glu Val Thr Lys His Asn Gly Thr Pro Ala Gln Ser Glu

         2225                  2230                   2235

    Lys Arg Leu Pro Asp Thr Gly Asp Ser Ile Lys Gln Asn Gly Leu

         2240                  2245                   2250

    Leu Gly Gly Val Met Thr Leu Leu Val Gly Leu Gly Leu Met Lys

         2255                 2260                    2265

    Arg Lys Lys Lys Lys Asp Glu Asn Asp Gln Asp Asp Ser Gln Ala

         2270                 2275                    2280

    <210>5

    <211>2730

    <212>DNA

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>5

    ttattatcaa ttaaatataa tcttatagga gttgttaaca acatgaacaa acatcaccca     60

    aaattaaggt ctttctattc tattagaaaa tcaactctag gcgttgcatc ggtcattgtc    120

    agtacactat ttttaattac ttctcaacat caagcacaag cagcagaaaa tacaaatact    180

    tcagataaaa tctcggaaaa tcaaaataat aatgcaacta caactcagcc acctaaggat    240

    acaaatcaaa cacaacctgc tacgcaacca gcaaacactg cgaaaaacta tcctgcagcg    300

    gatgaatcac ttaaagatgc aattaaagat cctgcattag aaaataaaga acatgatata    360

    ggtccaagag aacaagtcaa tttccagtta ttagataaaa acaatgaaac gcagtactat    420

    cactttttca gcatcaaaga tccagcagat gtgtattaca ctaaaaagaa agcagaagtt    480

    gaattagaca tcaatactgc ttcaacatgg aagaagtttg aagtctatga aaacaatcaa    540

    aaattgccag tgagacttgt atcatatagt cctgtaccag aagaccatgc ctatattcga    600

    ttcccagttt cagatggcac acaagaattg aaaattgttt cttcgactca aattgatgat    660

    ggagaagaaa caaattatga ttatactaaa ttagtatttg ctaaacctat ttataacgat    720

    ccttcacttg taaaatcaga tacaaatgat gcagtagtaa cgaatgatca atcaagttca    780

    gtcgcaagta atcaaacaaa cacgaataca tctaatcaaa atatatcaac gatcaacaat    840

    gctaataatc aaccgcaggc aacgaccaat atgagtcaac ctgcacaacc aaaatcgtca    900

    acgaatgcag atcaagcgtc aagccaacca gctcatgaaa caaattctaa tggtaatact    960

    aacgataaaa cgaatgagtc aagtaatcag tcggatgtta atcaacagta tccaccagca   1020

    gatgaatcac tacaagatgc aattaaaaac ccggctatca tcgataaaga acatacagct   1080

    gataattggc gaccaattga ttttcaaatg aaaaatgata aaggtgaaag acagttctat   1140

    cattatgcta gtactgttga accagcaact gtcattttta caaaaacagg accaataatt   1200

    gaattaggtt taaagacagc ttcaacatgg aagaaatttg aagtttatga aggtgacaaa   1260

    aagttaccag tcgaattagt atcatatgat tctgataaag attatgccta tattcgtttc   1320

    ccagtatcta atggtacgag agaagttaaa attgtgtcat ctattgaata tggtgagaac   1380

    atccatgaag actatgatta tacgctaatg gtctttgcac agcctattac taataaccca   1440

    gacgactatg tggatgaaga aacatacaat ttacaaaaat tattagctcc gtatcacaaa   1500

    gctaaaacgt tagaaagaca agtttatgaa ttagaaaaat tacaagagaa attgccagaa   1560

    aaatataagg cggaatataa aaagaaatta gatcaaacta gagtagagtt agctgatcaa   1620

    gttaaatcag cagtgacgga atttgaaaat gttacaccta caaatgatca attaacagat   1680

    ttacaagaag cgcattttgt tgtttttgaa agtgaagaaa atagtgagtc agttatggac   1740

    ggctttgttg aacatccatt ctatacagca actttaaatg gtcaaaa ta tgtagtgatg   1800

    aaaacaaagg atgacagtta ctggaaagat ttaattgtag aaggtaaacg tgtcactact   1860

    gtttctaaag atcctaaaaa taattctaga acgctgattt tcccatatat acctgacaaa   1920

    gcagtttaca atgcgattgt taaagtcgtt gtggcaaaca ttggttatga aggtcaatat   1980

    catgtcagaa ttataaatca ggatatcaat acaaaagatg atgatacatc acaaaataac   2040

    acgagtgaac cgctaaatgt acaaacagga caagaaggta aggttgctga tacagatgta   2100

    gctgaaaata gcagcactgc aacaaatcct aaagatgcgt ctgataaagc agatgtgata   2160

    gaaccagagt ctgacgtggt taaagatgct gataataata ttgataaaga tgtgcaacat   2220

    gatgttgatc atttatccga tatgtcggat aataatcact tcgataaata tgatttaaaa   2280

    gaaatggata ctcaaattgc caaagatact gatagaaatg tggataaaga tgccgataat   2340

    agcgttggta tgtcatctaa tgtcgatact gataaagact ctaataaaaa taaagacaaa   2400

    gtcatacagc tgaatcatat tgccgataaa aataatcata ctggaaaagc agcaaagctt   2460

    gacgtagtga aacaaaatta taataataca gacaaagtta ctgacaaaaa aacaactgaa   2520

    catctgccga gtgatattca taaaactgta gataaaacag tgaaaacaaa agaaaaagcc   2580

    ggcacaccat cgaaagaaaa caaacttagt caatctaaaa tgctaccaaa aactggagaa   2640

    acaacttcaa gccaatcatg gtggggctta tatgcgttat taggtatgtt agctttattc   2700

    attcctaaat tcagaaaaga atctaaataa                                    2730

    <210>6

    <211>909

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>6

    Leu Leu Ser Ile Lys Tyr Asn Leu Ile Gly Val Val Asn Asn Met Asn

    1                   5                    10                          15

    Lys His His Pro Lys Leu Arg Ser Phe Tyr Ser Ile Arg Lys Ser Thr

                   20                     25                       30

    Leu Gly Val Ala Ser Val Ile Val Ser Thr Leu Phe Leu Ile Thr Ser

             35                        40                      45

    Gln His Gln Ala Gln Ala Ala Glu Asn Thr Asn Thr Ser Asp Lys Ile

         50                     55                      60

    Ser Glu Asn Gln Asn Asn Asn Ala Thr Thr Thr Gln Pro Pro Lys Asp

    65                     70                     75                    80

    Thr Asn Gln Thr Gln Pro Ala Thr Gln Pro Ala Asn Thr Ala Lys Asn

                      85                      90                     95

    Tyr Pro Ala Ala Asp Glu Ser Leu Lys Asp Ala Ile Lys Asp Pro Ala

                   100                    105                    110

    Leu Glu Asn Lys Glu His Asp Ile Gly Pro Arg Glu Gln Val Asn Phe

             115                     120                    125

    Gln Leu Leu Asp Lys Asn Asn Glu Thr Gln Tyr Tyr His Phe Phe Ser

        130                   135                      140

    Ile Lys Asp Pro Ala Asp Val Tyr Tyr Thr Lys Lys Lys Ala Glu Val

    145                     150                      155                  160

    Glu Leu Asp Ile Asn Thr Ala Ser Thr Trp Lys Lys Phe Glu Val Tyr

                       165                     170                   175

    Glu Asn Asn Gln Lys Leu Pro Val Arg Leu Val Ser Tyr Ser Pro Val

                 180                     185                      190

    Pro Glu Asp His Ala Tyr Ile Arg Phe Pro Val Ser Asp Gly Thr Gln

             195                      200                     205

    Glu Leu Lys Ile Val Ser Ser Thr Gln Ile Asp Asp Gly Glu Glu Thr

         210                      215                     220

    Asn Tyr Asp Tyr Thr Lys Leu Val Phe Ala Lys Pro Ile Tyr Asn Asp

    225                    230                     235                   240

    Pro Ser Leu Val Lys Ser Asp Thr Asn Asp Ala Val Val Thr Asn Asp

                        245                    250                    255

    Gln Ser Ser Ser Val Ala Ser Asn Gln Thr Asn Thr Asn Thr Ser Asn

                   260                     265                    270

    Gln Asn Ile Ser Thr Ile Asn Asn Ala Asn Asn Gln Pro Gln Ala Thr

              275                      280                    285

    Thr Asn Met Ser Gln Pro Ala Gln Pro Lys Ser Ser Thr Asn Ala Asp

         290                    295                     300

    Gln Ala Ser Ser Gln Pro Ala His Glu Thr Asn Ser Asn Gly Asn Thr

    305                     310                     315                  320

    Asn Asp Lys Thr Asn Glu Ser Ser Asn Gln Ser Asp Val Asn Gln Gln

                      325                     330                    335

    Tyr Pro Pro Ala Asp Glu Ser Leu Gln Asp Ala Ile Lys Asn Pro Ala

                  340                     345                     350

    Ile Ile Asp Lys Glu His Thr Ala Asp Asn Trp Arg Pro Ile Asp Phe

               355                     360                     365

    Gln Met Lys Asn Asp Lys Gly Glu Arg Gln Phe Tyr His Tyr Ala Ser

         370                   375                     380

    Thr Val Glu Pro Ala Thr Val Ile Phe Thr Lys Thr Gly Pro Ile Ile

    385                     390                     395                   400

    Glu Leu Gly Leu Lys Thr Ala Ser Thr Trp Lys Lys Phe Glu Val Tyr

                       405                     410                   415

    Glu Gly Asp Lys Lys Leu Pro Val Glu Leu Val Ser Tyr Asp Ser Asp

                  420                     425                    430

    Lys Asp Tyr Ala Tyr Ile Arg Phe Pro Val Ser Asn Gly Thr Arg Glu

             435                      440                     445

    Val Lys Ile Val Ser Ser Ile Glu Tyr Gly Glu Asn Ile His Glu Asp

         450                       455                      460

    Tyr Asp Tyr Thr Leu Met Val Phe Ala Gln Pro Ile Thr Asn Asn Pro

    465                    470                      475                  480

    Asp Asp Tyr Val Asp Glu Glu Thr Tyr Asn Leu Gln Lys Leu Leu Ala

                      485                     490                   495

    Pro Tyr His Lys Ala Lys Thr Leu Glu Arg Gln Val Tyr Glu Leu Glu

                  500                     505                     510

    Lys Leu Gln Glu Lys Leu Pro Glu Lys Tyr Lys Ala Glu Tyr Lys Lys

             515                     520                     525

    Lys Leu Asp Gln Thr Arg Val Glu Leu Ala Asp Gln Val Lys Ser Ala

         530                     535                   540

    Val Thr Glu Phe Glu Asn Val Thr Pro Thr Asn Asp Gln Leu Thr Asp

    545                    550                     555                    560

    Leu Gln Glu Ala His Phe Val Val Phe Glu Ser Glu Glu Asn Ser Glu

                      565                     570                      575

    Ser Val Met Asp Gly Phe Val Glu His Pro Phe Tyr Thr Ala Thr Leu

                  580                     585                    590

    Asn Gly Gln Lys Tyr Val Val Met Lys Thr Lys Asp Asp Ser Tyr Trp

             595                     600                     605

    Lys Asp Leu Ile Val Glu Gly Lys Arg Val Thr Thr Val Ser Lys Asp

        610                      615                     620

    Pro Lys Asn Asn Ser Arg Thr Leu Ile Phe Pro Tyr Ile Pro Asp Lys

    625                    630                      635                   640

    Ala Val Tyr Asn Ala Ile Val Lys Val Val Val Ala Asn Ile Gly Tyr

                       645                       650                  655

    Glu Gly Gln Tyr His Val Arg Ile Ile Asn Gln Asp Ile Asn Thr Lys

                  660                      665                      670

    Asp Asp Asp Thr Ser Gln Asn Asn Thr Ser Glu Pro Leu Asn Val Gln

              675                  680                     685

    Thr Gly Gln Glu Gly Lys Val Ala Asp Thr Asp Val Ala Glu Asn Ser

         690                    695                     700

    Ser Thr Ala Thr Asn Pro Lys Asp Ala Ser Asp Lys Ala Asp Val Ile

    705                     710                     715                   720

    Glu Pro Glu Ser Asp Val Val Lys Asp Ala Asp Asn Asn Ile Asp Lys

                      725                     730                     735

    Asp Val Gln His Asp Val Asp His Leu Ser Asp Met Ser Asp Asn Asn

                  740                     745                   750

    His Phe Asp Lys Tyr Asp Leu Lys Glu Met Asp Thr Gln Ile Ala Lys

             755                     760                    765

    Asp Thr Asp Arg Asn Val Asp Lys Asp Ala Asp Asn Ser Val Gly Met

        770                     775                    780

    Ser Ser Asn Val Asp Thr Asp Lys Asp Ser Asn Lys Asn Lys Asp Lys

    785                     790                    795                    800

    Val Ile Gln Leu Asn His Ile Ala Asp Lys Asn Asn His Thr Gly Lys

                        805                 810                       815

    Ala Ala Lys Leu Asp Val Val Lys Gln Asn Tyr Asn Asn Thr Asp Lys

                  820                     825                    830

    Val Thr Asp Lys Lys Thr Thr Glu His Leu Pro Ser Asp Ile His Lys

              835                    840                     845

    Thr Val Asp Lys Thr Val Lys Thr Lys Glu Lys Ala Gly Thr Pro Ser

         850                     855                     860

    Lys Glu Asn Lys Leu Ser Gln Ser Lys Met Leu Pro Lys Thr Gly Glu

    865                    870                    875                     880

    Thr Thr Ser Ser Gln Ser Trp Trp Gly Leu Tyr Ala Leu Leu Gly Met

                        885                   890                   895

    Leu Ala Leu Phe Ile Pro Lys Phe Arg Lys Glu Ser Lys

                 900                      905

    <210>7

    <211>1065

    <212>DNA

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>7

    gaggaaaaca acatgacaaa acattattta aacagtaagt atcaatcaga acaacgttca     60

    tcagctatga aaaagattac aatgggtaca gcatctatca ttttaggttc ccttgtatac    120

    ataggcgcag acagccaaca agtcaatgcg gcaacagaag ctacgaacgc aactaataat    180

    caaagcacac aagtttctca agcaacatca caaccaatta atttccaagt gcaaaaagat    240

    ggctcttcag agaagtcaca catggatgac tatatgcaac accctggtaa agtaattaaa    300

    caaaataata aatattattt ccaaaccgtg ttaaacaatg catcattctg gaaagaatac    360

    aaattttaca atgcaaacaa tcaagaatta gcaacaactg ttgttaacga taataaaaaa    420

    gcggatacta gaacaatcaa tgttgcagtt gaacctggat ataagagctt aactactaaa    480

    gtacatattg tcgtgccaca aattaattac aatcatagat atactacgca tttggaattt    540

    gaaaaagcaa ttcctacatt agctgacgca gcaaaaccaa acaatgttaa accggttcaa    600

    ccaaaaccag ctcaacctaa aacacctact gagcaaacta aaccagttca acctaaagtt    660

    gaaaaagtta aacctactgt aactacaaca agcaaagttg aagacaatca ctctactaaa    720

    gttgtaagta ctgacacaac aaaagatcaa actaaaacac aaactgctca tacagttaaa    780

    acagcacaaa ctgctcaaga acaaaataaa gttcaaacac ctgttaaaga tgttgcaaca    840

    gcgaaatctg aaagcaacaa tcaagctgta agtgataata aatcacaaca aactaacaaa    900

    gttacaaaac ataacgaaac gcctaaacaa gcatctaaag ctaaagaatt accaaaaact    960

    ggtttaactt cagttgataa ctttattagc acagttgcct tcgcaacact tgccctttta    1020

    ggttcattat ctttattact tttcaaaaga aaagaatcta aataa                    1065

    <210>8

    <211>354

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>8

    Glu Glu Asn Asn Met Thr Lys His Tyr Leu Asn Ser Lys Tyr Gln Ser

    1                5                       10                      15

    Glu Gln Arg Ser Ser Ala Met Lys Lys Ile Thr Met Gly Thr Ala Ser

                  20                      25                      30

    Ile Ile Leu Gly Ser Leu Val Tyr Ile Gly Ala Asp Ser Gln Gln Val

              35                        40                     45

    Asn Ala Ala Thr Glu Ala Thr Asn Ala Thr Asn Asn Gln Ser Thr Gln

        50                      55                     60

    Val Ser Gln Ala Thr Ser Gln Pro Ile Asn Phe Gln Val Gln Lys Asp

    65                      70                      75                     80

    Gly Ser Ser Glu Lys Ser His Met Asp Asp Tyr Met Gln His Pro Gly

                       85                     90                      95

    Lys Val Ile Lys Gln Asn Asn Lys Tyr Tyr Phe Gln Thr Val Leu Asn

                    100                    105                    110

    Asn Ala Ser Phe Trp Lys Glu Tyr Lys Phe Tyr Asn Ala Asn Asn Gln

             115                     120                     125

    Glu Leu Ala Thr Thr Val Val Asn Asp Asn Lys Lys Ala Asp Thr Arg

         130                     135                    140

    Thr Ile Asn Val Ala Val Glu Pro Gly Tyr Lys Ser Leu Thr Thr Lys

    145                      150                     155                  160

    Val His Ile Val Val Pro Gln Ile Asn Tyr Asn His Arg Tyr Thr Thr

                         165                     170                  175

    His Leu Glu Phe Glu Lys Ala Ile Pro Thr Leu Ala Asp Ala Ala Lys

                 180                      185                     190

    Pro Asn Asn Val Lys Pro Val Gln Pro Lys Pro Ala Gln Pro Lys Thr

             195                     200                     205

    Pro Thr Glu Gln Thr Lys Pro Val Gln Pro Lys Val Glu Lys Val Lys

         210                     215                     220

    Pro Thr Val Thr Thr Thr Ser Lys Val Glu Asp Asn His Ser Thr Lys

    225                     230                     235                   240

    Val Val Ser Thr Asp Thr Thr Lys Asp Gln Thr Lys Thr Gln Thr Ala

                        245                    250                    255

    His Thr Val Lys Thr Ala Gln Thr Ala Gln Glu Gln Asn Lys Val Gln

                   260                    265                     270

    Thr Pro Val Lys Asp Val Ala Thr Ala Lys Ser Glu Ser Asn Asn Gln

             275                      280                     285

    Ala Val Ser Asp Asn Lys Ser Gln Gln Thr Asn Lys Val Thr Lys His

         290                    295                     300

    Asn Glu Thr Pro Lys Gln Ala Ser Lys Ala Lys Glu Leu Pro Lys Thr

    305                    310                     315                    320

    Gly Leu Thr Ser Val Asp Asn Phe Ile Ser Thr Val Ala Phe Ala Thr

                       325                      330                  335

    Leu Ala Leu Leu Gly Ser Leu Ser Leu Leu Leu Phe Lys Arg Lys Glu

                 340                     345                    350

    Ser Lys

    <210>9

    <211>1965

    <212>DNA

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>9

    tatacaatta ggagttgttt ctacaacatg aacaaacagc aaaaagaatt taaatcattt     60

    tattcaatta gaaagtcatc actaggcgtt gcatctgtag caattagtac acttttatta    120

    ttaatgtcaa atggcgaagc acaagcagca gctgaagaaa caggtggtac aaatacagaa    180

    gcacaaccaa aaactgaagc agttgcaagt ccaacaacaa catctgaaaa agctccagaa    240

    actaaaccag tagctaatgc tgtctcagta tctaataaag aagttgaggc ccctacttct    300

    gaaacaaaag aagctaaaga agttaaagaa gttaaagccc ctaaggaaac aaaagaagtt    360

    aaaccagcag caaaagccac taacaataca tatcctattt tgaatcagga acttagagaa    420

    gcgattaaaa accctgcaat aaaagacaaa gatcatagcg caccaaactc tcgtccaatt    480

    gattttgaaa tgaaaaagaa agatggaact caacagtttt atcattatgc aagttctgtt    540

    aaacctgcta gagttatttt cactgattca aaaccagaaa ttgaattagg attacaatca    600

    ggtcaatttt ggagaaaatt tgaagtttat gaaggtgaca aaaagttgcc aattaaatta    660

    gtatcatacg atactgttaa agattatgct tacattcgct tctctgtatc aaacggaaca    720

    aaagctgtta aaattgttag ttcaacacac ttcaataaca aagaagaaaa atacgattac    780

    acattaatgg aattcgcaca accaatttat aacagtgcag ataaattcaa aactgaagaa    840

    gattataaag ctgaaaaatt attagcgcca tataaaaaag cgaaaacact agaaagacaa    900

    gtttatgaat taaataaaat tcaagataaa cttcctgaaa aattaaaggc tgagtacaag    960

    aagaaattag aggatacaaa gaaagcttta gatgagcaag tgaaatcagc tattactgaa   1020

    ttcc aaatg tacaaccaac aaatgaaaaa atgactgatt tacaagatac aaaatatgtt   1080

    gtttatgaaa gtgttgagaa taacgaatct atgatggata cttttgttaa acaccctatt   1140

    aaaacaggta tgcttaacgg caaaaaatat atggtcatgg aaactactaa tgacgattac   1200

    tggaaagatt tcatggttga aggtcaacgt gttagaacta taagcaaaga tgctaaaaat   1260

    aatactagaa caattatttt cccatatgtt gaaggtaaaa ctctatatga tgctatcgtt   1320

    aaagttcacg taaaaacgat tgattatgat ggacaatacc atgtcagaat cgttgataaa   1380

    gaagcattta caaaagccaa taccgataaa tctaacaaaa aagaacaaca agataactca   1440

    gctaagaagg aagctactcc agctacgcct agcaaaccaa caccatcacc tgttgaaaaa   1500

    gaatcacaaa aacaagacag ccaaaaagat gacaataaac aattaccaag tgttgaaaaa   1560

    gaaaatgacg catctagtga gtcaggtaaa gacaaaacgc ctgctacaaa accaactaaa   1620

    ggtgaagtag aatcaagtag tacaactcca actaaggtag tatctacgac tcaaaatgtt   1680

    gcaaaaccaa caactgcttc atcaaaaaca acaaaagatg ttgttcaaac ttcagcaggt   1740

    tctagcgaag caaaagatag tgctccatta caaaaagcaa acattaaaaa cacaaatgat   1800

    ggacacactc aaagccaaaa caataaaaat acacaagaaa ataaagcaaa atcattacca   1860

    caaactggtg aagaatcaaa taaagatatg acattaccat taatggcatt attagcttta   1920

    agtagcatcg ttgcattcgt attacctaga aaacgtaaaa actaa                   1965

    <210>10

    <211>654

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>10

    Tyr Thr Ile Arg Ser Cys Phe Tyr Asn Met Asn Lys Gln Gln Lys Glu

    1                   5                     10                      15

    Phe Lys Ser Phe Tyr Ser Ile Arg Lys Ser Ser Leu Gly Val Ala Ser

                  20                       25                      30

    Val Ala Ile Ser Thr Leu Leu Leu Leu Met Ser Asn Gly Glu Ala Gln

              35                      40                     45

    Ala Ala Ala Glu Glu Thr Gly Gly Thr Asn Thr Glu Ala Gln Pro Lys

         50                     55                      60

    Thr Glu Ala Val Ala Ser Pro Thr Thr Thr Ser Glu Lys Ala Pro Glu

    65                      70                      75                  80

    Thr Lys Pro Val Ala Asn Ala Val Ser Val Ser Asn Lys Glu Val Glu

                        85                      90                    95

    Ala Pro Thr Ser Glu Thr Lys Glu Ala Lys Glu Val Lys Glu Val Lys

                  100                     105                     110

    Ala Pro Lys Glu Thr Lys Glu Val Lys Pro Ala Ala Lys Ala Thr Asn

             115                     120                     125

    Asn Thr Tyr Pro Ile Leu Asn Gln Glu Leu Arg Glu Ala Ile Lys Asn

        130                     135                     140

    Pro Ala Ile Lys Asp Lys Asp His Ser Ala Pro Asn Ser Arg Pro Ile

    145                      150                     155                  160

    Asp Phe Glu Met Lys Lys Lys Asp Gly Thr Gln Gln Phe Tyr His Tyr

                         165                     170                  175

    Ala Ser Ser Val Lys Pro Ala Arg Val Ile Phe Thr Asp Ser Lys Pro

                   180                      185                    190

    Glu Ile Glu Leu Gly Leu Gln Ser Gly Gln Phe Trp Arg Lys Phe Glu

              195                    200                     205

    Val Tyr Glu Gly Asp Lys Lys Leu Pro Ile Lys Leu Val Ser Tyr Asp

         210                    215                      220

    Thr Val Lys Asp Tyr Ala Tyr Ile Arg Phe Ser Val Ser Asn Gly Thr

    225                     230                      235                  240

    Lys Ala Val Lys Ile Val Ser Ser Thr His Phe Asn Asn Lys Glu Glu

                        245                      250                  255

    Lys Tyr Asp Tyr Thr Leu Met Glu Phe Ala Gln Pro Ile Tyr Asn Ser

                  260                    265                      270

    Ala Asp Lys Phe Lys Thr Glu Glu Asp Tyr Lys Ala Glu Lys Leu Leu

             275                     280                    285

    Ala Pro Tyr Lys Lys Ala Lys Thr Leu Glu Arg Gln Val Tyr Glu Leu

         290                     295                     300

    Asn Lys Ile Gln Asp Lys Leu Pro Glu Lys Leu Lys Ala Glu Tyr Lys

    305                     310                     315                   320

    Lys Lys Leu Glu Asp Thr Lys Lys Ala Leu Asp Glu Gln Val Lys Ser

                      325                     330                     335

    Ala Ile Thr Glu Phe Gln Asn Val Gln Pro Thr Asn Glu Lys Met Thr

                   340                    345                    350

    Asp Leu Gln Asp Thr Lys Tyr Val Val Tyr Glu Ser Val Glu Asn Asn

             355                     360                     365

    Glu Ser Met Met Asp Thr Phe Val Lys His Pro Ile Lys Thr Gly Met

         370                   375                       380

    Leu Asn Gly Lys Lys Tyr Met Val Met Glu Thr Thr Asn Asp Asp Tyr

    385                    390                    395                     400

    Trp Lys Asp Phe Met Val Glu Gly Gln Arg Val Arg Thr Ile Ser Lys

                      405                     410                     415

    Asp Ala Lys Asn Asn Thr Arg Thr Ile Ile Phe Pro Tyr Val Glu Gly

                 420                       425                     430

    Lys Thr Leu Tyr Asp Ala Ile Val Lys Val His Val Lys Thr Ile Asp

             435                      440                       445

    Tyr Asp Gly Gln Tyr His Val Arg Ile Val Asp Lys Glu Ala Phe Thr

         450                     455                     460

    Lys Ala Asn Thr Asp Lys Ser Asn Lys Lys Glu Gln Gln Asp Asn Ser

    465                     470                       475                 480

    Ala Lys Lys Glu Ala Thr Pro Ala Thr Pro Ser Lys Pro Thr Pro Ser

                       485                      490                   495

    Pro Val Glu Lys Glu Ser Gln Lys Gln Asp Ser Gln Lys Asp Asp Asn

                  500                     505                    510

    Lys Gln Leu Pro Ser Val Glu Lys Glu Asn Asp Ala Ser Ser Glu Ser

             515                     520                     525

    Gly Lys Asp Lys Thr Pro Ala Thr Lys Pro Thr Lys Gly Glu Val Glu

         530                    535                     540

    Ser Ser Ser Thr Thr Pro Thr Lys Val Val Ser Thr Thr Gln Asn Val

    545                     550                      555                  560

    Ala Lys Pro Thr Thr Ala Ser Ser Lys Thr Thr Lys Asp Val Val Gln

                        565                     570                   575

    Thr Ser Ala Gly Ser Ser Glu Ala Lys Asp Ser Ala Pro Leu Gln Lys

                   580                    585                     590

    Ala Asn Ile Lys Asn Thr Asn Asp Gly His Thr Gln Ser Gln Asn Asn

              595                    600                     605

    Lys Asn Thr Gln Glu Asn Lys Ala Lys Ser Leu Pro Gln Thr Gly Glu

         610                    615                     620

    Glu Ser Asn Lys Asp Met Thr Leu Pro Leu Met Ala Leu Leu Ala Leu

    625                     630                   635                      640

    Ser Ser Ile Val Ala Phe Val Leu Pro Arg Lys Arg Lys Asn

                        645                     650

    <210>11

    <211>2406

    <212>DNA

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>11

    tttataaata atttacataa aatcaatcat tttaatataa ggattatgat aatatattgg     60

    tgtatgacag ttaatggagg gaacgaaatg aaagctttat tacttaaaac aagtgtatgg    120

    ctcgttttgc tttttagtgt aatgggatta tggcaagtct cgaacgcggc tgagcagcat    180

    acaccaatga aagcacatgc agtaacaacg atagacaaag caacaacaga taagcaacaa    240

    gtaccgccaa caaaggaagc ggctcatcat tctggcaaag aagcggcaac caacgtatca    300

    gcatcagcgc agggaacagc tgatgataca aacagcaaag taacatccaa cgcaccatct    360

    aacaaaccat ctacagtagt ttcaacaaaa gtaaacgaaa cacgcgacgt agatacacaa    420

    caagcctcaa cacaaaaacc aactcacaca gcaacgttca aattatcaaa tgctaaaaca    480

    gcatcacttt caccacgaat gtttgctgct aatgcaccac aaacaacaac acataaaata    540

    ttacatacaa atgatatcca tggccgacta gccgaagaaa aagggcgtgt catcggtatg    600

    gctaaattaa aaacagtaaa agaacaagaa aagcctgatt taatgttaga cgcaggagac    660

    gccttccaag gtttaccact ttcaaaccag tctaaaggtg aagaaatggc taaagcaatg    720

    aatgcagtag gttatgatgc tatggcagtc ggtaaccatg aatttgactt tggatacgat    780

    cagttgaaaa agttagaggg tatgttagac ttcccgatgc taagtactaa cgtttataaa    840

    gatggaaaac gcgcgtttaa gccttcaacg attgtaacaa aaaatggtat tcgttatgga    900

    attattggtg taacgacacc agaaacaaag acgaaaacaa gacctgaagg cattaaaggc    960

    gttgaattta gagatccatt acaaagtgtg acagcggaaa tgatgcgtat ttataaagac   1020

    gtagatacat ttgttgttat atcacattta ggaattgatc cttcaacaca agaaacatgg   1080

    cgtggtgatt acttagtgaa acaattaagt caaaatccac aattgaagaa acgtattaca   1140

    gttattgatg gtcattcaca tacagtactt caaaatggtc aaatttataa caatgatgca   1200

    ttggcacaaa caggtacagc acttgcgaat atcggtaaga ttacatttaa ttatcgcaat   1260

    ggagaggtat cgaatattaa accgtcattg attaatgtta aagacgttga aaatgtaaca   1320

    ccgaacaaag cattagctga acaaattaat caagctgatc aaacatttag agcacaaact   1380

    gcagaggtaa ttattccaaa caataccatt gatttcaaag gagaaagaga tgacgttaga   1440

    acgcgtgaaa caaatttagg aaacgcgatt gcagatgcta tggaagcgta tggcgttaag   1500

    aatttctcta aaaagactga ctttgccgtg acaaatggtg gaggtattcg tgcctctatc   1560

    gcaaaaggta aggtgacacg ctatgattta atctcagtat taccatttgg aaatacgatt   1620

    gcgcaaattg atgtaaaagg ttcagacgtc tggacggctt tcgaacatag tttaggcgca   1680

    ccaacaacac aaaaggacgg taagacagtg ttaacagcga atggcggttt actacatatc   1740

    tctgattcaa tccgtgttta ctatgatata aataaaccgt ctggcaaacg aattaatgct   1800

    attcaaattt taaataaaga gacaggtaag tttgaaaata ttgatttaaa acgtgtatat   1860

    cacgtaacga tgaatgactt cacagcatca ggtggcgacg gatatagtat gttcggtggt   1920

    cctagagaag aaggtatttc attagatcaa gtactagcaa gttatttaaa aacagctaac   1980

    ttagctaagt atgatacgac agaaccacaa cgtatgttat taggtaaacc agcagtaagt   2040

    gaacaaccag ctaaaggaca acaaggtagc aaaggtagta agtctggtaa agatacacaa   2100

    ccaattggtg acgacaaagt gatggatcca gcgaaaaaac cagctccagg taaagttgta   2160

    ttgttgctag cgcatagagg aactgttagt agcggtacag aaggttctgg tcgcacaata   2220

    gaaggagcta ctgtatcaag caagagtggg aaacaattgg ctagaatgtc agtgcctaaa   2280

    ggtagcgcgc atgagaaaca gttaccaaaa actggaacta atcaaagttc aagcccagaa   2340

    gcgatgtttg tattattagc aggtataggt ttaatcgcga ctgtacgacg tagaaaagct   2400

    agctaa                                                              2406

    <210>12

    <211>801

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>12

    Phe Ile Asn Asn Leu His Lys Ile Asn His Phe Asn Ile Arg Ile Met

    1                 5                         10                     15

    Ile Ile Tyr Trp Cys Met Thr Val Asn Gly Gly Asn Glu Met Lys Ala

                    20                      25                    30

    Leu Leu Leu Lys Thr Ser Val Trp Leu Val Leu Leu Phe Ser Val Met

             35                      40                      45

    Gly Leu Trp Gln Val Ser Asn Ala Ala Glu Gln His Thr Pro Met Lys

         50                     55                      60

    Ala His Ala Val Thr Thr Ile Asp Lys Ala Thr Thr Asp Lys Gln Gln

    65                       70                      75                    80

    Val Pro Pro Thr Lys Glu Ala Ala His His Ser Gly Lys Glu Ala Ala

                        85                      90                    95

    Thr Asn Val Ser Ala Ser Ala Gln Gly Thr Ala Asp Asp Thr Asn Ser

                  100                     105                    110

    Lys Val Thr Ser Asn Ala Pro Ser Asn Lys Pro Ser Thr Val Val Ser

             115                      120                     125

    Thr Lys Val Asn Glu Thr Arg Asp Val Asp Thr Gln Gln Ala Ser Thr

         130                    135                     140

    Gln Lys Pro Thr His Thr Ala Thr Phe Lys Leu Ser Asn Ala Lys Thr

    145                     150                     155                   160

    Ala Ser Leu Ser Pro Arg Met Phe Ala Ala Asn Ala Pro Gln Thr Thr

                        165                   170                     175

    Thr His Lys Ile Leu His Thr Asn Asp Ile His Gly Arg Leu Ala Glu

                    180                     185                   190

    Glu Lys Gly Arg Val Ile Gly Met Ala Lys Leu Lys Thr Val Lys Glu

             195                      200                     205

    Gln Glu Lys Pro Asp Leu Met Leu Asp Ala Gly Asp Ala Phe Gln Gly

        210                     215                    220

    Leu Pro Leu Ser Asn Gln Ser Lys Gly Glu Glu Met Ala Lys Ala Met

    225                    230                    235                     240

    Asn Ala Val Gly Tyr Asp Ala Met Ala Val Gly Asn His Glu Phe Asp

                       245                    250                     255

    Phe Gly Tyr Asp Gln Leu Lys Lys Leu Glu Gly Met Leu Asp Phe Pro

                  260                    265                    270

    Met Leu Ser Thr Asn Val Tyr Lys Asp Gly Lys Arg Ala Phe Lys Pro

             275                     280                     285

    Ser Thr Ile Val Thr Lys Asn Gly Ile Arg Tyr Gly Ile Ile Gly Val

         290                     295                        300

    Thr Thr Pro Glu Thr Lys Thr Lys Thr Arg Pro Glu Gly Ile Lys Gly

    305                     310                     315                   320

    Val Glu Phe Arg Asp Pro Leu Gln Ser Val Thr Ala Glu Met Met Arg

                      325                     330                     335

    Ile Tyr Lys Asp Val Asp Thr Phe Val Val Ile Ser His Leu Gly Ile

                   340                      345                    350

    Asp Pro Ser Thr Gln Glu Thr Trp Arg Gly Asp Tyr Leu Val Lys Gln

             355                     360                     365

    Leu Ser Gln Asn Pro Gln Leu Lys Lys Arg Ile Thr Val Ile Asp Gly

         370                    375                      380

    His Ser His Thr Val Leu Gln Asn Gly Gln Ile Tyr Asn Asn Asp Ala

    385                     390                     395                   400

    Leu Ala Gln Thr Gly Thr Ala Leu Ala Asn Ile Gly Lys Ile Thr Phe

                      405                      410                    415

    Asn Tyr Arg Asn Gly Glu Val Ser Asn Ile Lys Pro Ser Leu Ile Asn

                 420                      425                      430

    Val Lys Asp Val Glu Asn Val Thr Pro Asn Lys Ala Leu Ala Glu Gln

             435                     440                     445

    Ile Asn Gln Ala Asp Gln Thr Phe Arg Ala Gln Thr Ala Glu Val Ile

         450                    455                     460

    Ile Pro Asn Asn Thr Ile Asp Phe Lys Gly Glu Arg Asp Asp Val Arg

    465                      470                   475                   480

    Thr Arg Glu Thr Asn Leu Gly Asn Ala Ile Ala Asp Ala Met Glu Ala

                      485                     490                    495

    Tyr Gly Val Lys Asn Phe Ser Lys Lys Thr Asp Phe Ala Val Thr Asn

                  500                     505                     510

    Gly Gly Gly Ile Arg Ala Ser Ile Ala Lys Gly Lys Val Thr Arg Tyr

             515                       520                     525

    Asp Leu Ile Ser Val Leu Pro Phe Gly Asn Thr Ile Ala Gln Ile Asp

        530                      535                     540

    Val Lys Gly Ser Asp Val Trp Thr Ala Phe Glu His Ser Leu Gly Ala

    545                     550                     555                   560

    Pro Thr Thr Gln Lys Asp Gly Lys Thr Val Leu Thr Ala Asn Gly Gly

                       565                    570                     575

    Leu Leu His Ile Ser Asp Ser Ile Arg Val Tyr Tyr Asp Ile Asn Lys

                   580                      585                    590

    Pro Ser Gly Lys Arg Ile Asn Ala Ile Gln Ile Leu Asn Lys Glu Thr

             595                       600                     605

    Gly Lys Phe Glu Asn Ile Asp Leu Lys Arg Val Tyr His Val Thr Met

        610                     615                     620

    Asn Asp Phe Thr Ala Ser Gly Gly Asp Gly Tyr Ser Met Phe Gly Gly

    625                    630                     635                    640

    Pro Arg Glu Glu Gly Ile Ser Leu Asp Gln Val Leu Ala Ser Tyr Leu

                       645                     650                   655

    Lys Thr Ala Asn Leu Ala Lys Tyr Asp Thr Thr Glu Pro Gln Arg Met

                  660                     665                    670

    Leu Leu Gly Lys Pro Ala Val Ser Glu Gln Pro Ala Lys Gly Gln Gln

             675                     680                     685

    Gly Ser Lys Gly Ser Lys Ser Gly Lys Asp Thr Gln Pro Ile Gly Asp

         690                     695                     700

    Asp Lys Val Met Asp Pro Ala Lys Lys Pro Ala Pro Gly Lys Val Val

    705                     710                    715                    720

    Leu Leu Leu Ala His Arg Gly Thr Val Ser Ser Gly Thr Glu Gly Ser

                       725                     730                     735

    Gly Arg Thr Ile Glu Gly Ala Thr Val Ser Ser Lys Ser Gly Lys Gln

                   740                     745                     750

    Leu Ala Arg Met Ser Val Pro Lys Gly Ser Ala His Glu Lys Gln Leu

             755                     760                     765

    Pro Lys Thr Gly Thr Asn Gln Ser Ser Ser Pro Glu Ala Met Phe Val

         770                    775                     780

    Leu Leu Ala Gly Ile Gly Leu Ile Ala Thr Val Arg Arg Arg Lys Ala

    785                     790                  795                      800

    Ser

    <210>13

    <211>4914

    <212>DNA

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>13

    agtggaaaat atggaaaaag gagtatgcaa atgagagata agaaaggacc ggtaaataaa     60

    agagtagatt ttctatcaaa taaattgaat aaatattcaa taagaaaatt tacagttgga    120

    acagcatcta ttttaattgg ctcactaatg tatttgggaa ctcaacaaga ggcagaagca    180

    gctgaaaaca atattgagaa tccaactaca ttaaaagata atgtccaatc aaaagaagtg    240

    aagattgaag aagtaacaaa caaagacact gcaccacagg gtgtagaagc taaatctgaa    300

    gtaacttcaa acaaagacac aatcgaacat gaaccatcag taaaagctga agatatatca    360

    aaaaaggagg atacaccaaa agaagtagct gatgttgctg aagttcagcc gaaatcgtca    420

    gtcactcata acgcagagac acctaaggtt agaaaagctc gttctgttga tgaaggctct    480

    tttgatatta caagagattc taaaaatgta gttgaatcta ccccaattac aattcaaggt    540

    aaagaacatt ttgaaggtta cggaagtgtt gatatacaaa aaaaaccaac agatttaggg    600

    gtatcagagg taaccaggtt taatgttggt aatgaaagta atggtttgat aggagcttta    660

    caattaaaaa ataaaataga ttttagtaag gatttcaatt ttaaagttag agtggcaaat    720

    aaccatcaat caaataccac aggtgctgat ggttgggggt tcttatttag taaaggaaat    780

    gcagaagaat atttaactaa tggtggaatc cttggggata aaggtctggt aaattcaggc    840

    ggatttaaaa ttgatactgg atacatttat acaagttcca tggacaaaac tgaaaagcaa    900

    gctggacaag gttatagagg atacggagct tttgtgtaaa atgacagttc tggtaattca    960

    caaatggttg gagaaaatat tgataaatca aaaactaatt ttttaaacta tgcggacaat   1020

    tcaactaata catcagatgg aaagtttcat gggcaacgtt taaatgatgt catcttaact   1080

    tatgttgctt caactggtaa aatgagagca gaatatgctg gtaaaacttg ggagacttca   1140

    ataacagatt taggtttatc taaaaatcag gcatataatt tcttaattac atctagtcaa   1200

    agatggggcc ttaatcaagg gataaatgca aatggctgga tgagaactga cttgaaaggt   1260

    tcagagttta cttttacacc agaagcgcca aaaacaataa cagaattaga aaaaaaagtt   1320

    gaagagattc cattcaagaa agaacgtaaa tttaatccgg atttagcacc agggacagaa   1380

    aaagtaacaa gagaaggaca aaaaggtgag aagacaataa cgacaccaac actaaaaaat   1440

    ccattaactg gagtaattat tagtaaaggt gaaccaaaag aagagattac aaaagatccg   1500

    attaatgaat taacagaata cggacctgaa acaatagcgc caggtcatcg agacgaattt   1560

    gatccgaagt taccaacagg agagaaagag gaagttccag gtaaaccagg aattaagaat   1620

    ccagaaacag gagacgtagt tagaccgccg gtcgatagcg taacaaaata tggacctgta   1680

    aaaggagact cgattgtaga aaaagaagag attccattcg agaaagaacg taaatttaat   1740

    cctgatttag caccagggac agaaaaagta acaagagaag gacaaaaagg tgagaagaca   1800

    ataacgacgc caacactaaa aaatccatta actggagaaa ttattagtaa aggtgaatcg   1860

    aaagaagaaa tcacaaaaga tccgattaat gaattaacag aatacggacc agaaacgata   1920

    acaccaggtc atcgagacga atttgatccg aagttaccaa caggagagaa agaggaagtt   1980

    ccaggtaaac caggaattaa gaatccagaa acaggagatg tagttagacc accggtcgat   2040

    agcgtaacaa aatatggacc tgtaaaagga gactcgattg tagaaaaaga agagattcca   2100

    ttcgagaaag aacgtaaatt taatcctgat ttagcaccag ggacagaaaa agtaacaaga   2160

    gaaggacaaa aaggtgagaa gacaataacg acaccaacac taaaaaatcc attaactgga   2220

    gtaattatta gtaaaggtga accaaaagaa gaaatcacaa aagatccgat taatgaatta   2280

    acagaatacg gaccagaaac gataacacca ggtcatcgag acgaatttga tccgaagtta   2340

    ccaacaggag agaaagaaga agttccaggt aaaccaggaa ttaagaatcc agaaacagga   2400

    gacgtagtta gaccaccggt cgatagcgta acaaaatatg gacctgtaaa aggagactcg   2460

    attgtagaaa aagaagagat tccattcaag aaagaacgta aatttaatcc ggatttagca   2520

    ccagggacag aaaaagtaac aagagaagga caaaaaggtg agaagacaat aacgacgcca   2580

    acactaaaaa atccattaac tggagaaatt attagtaaag gtgaatcgaa agaagaaatc   2640

    acaaaagatc cgattaatga attaacagaa tacggaccag aaacgataac accaggtcat   2700

    cgagacgaat ttgatccgaa gttaccaaca ggagagaaag aggaagttcc aggtaaacca   2760

    ggaattaaga atccagaaac aggagatgta gttagaccac cggtcgatag cgtaacaaaa   2820

    tatggacctg taaaaggaga ctcgattgta gaaaaagaag agattccatt cgagaaagaa   2880

    cgtaaattta atcctgattt agcaccaggg acagaaaaag taacaagaga aggacaaaaa   2940

    ggtgagaaga caataacgac gccaacacta aaaaatccat taactggaga aattattagt   3000

    aaaggtgaat cgaaagaaga aatcacaaaa gatccgatta atgaattaac agaatacgga   3060

    ccagaaacga taacaccagg tcatcgagac gaatttgatc cgaagttacc aacaggagag   3120

    aaagaggaag ttccaggtaa accaggaatt aagaatccag aaacaggaga cgtagttaga   3180

    ccaccggtcg atagcgtaac aaaatatgga cctgtaaaag gagactcgat tgtagaaaaa   3240

    gaagaaattc cattcaagaa agaacgtaaa tttaatcctg atttagcacc agggacagaa   3300

    aaagtaacaa gagaaggaca aaaaggtgag aagacaataa cgacgccaac actaaaaaat   3360

    ccattaactg gagaaattat tagtaaaggt gaatcgaaag aagaaatcac aaaagatccg   3420

    attaatgaat taacagaata cggaccagaa acgataacac caggtcatcg agacgaattt   3480

    gatccgaagt taccaacagg agagaaagag gaagttccag gtaaaccagg aattaagaat   3540

    ccagaaacag gagatgtagt tagaccaccg gtcgatagcg taacaaaata tggacctgta   3600

    aaaggagact cgattgtaga aaaagaagaa attccattcg agaaagaacg taaatttaat   3660

    cctgatttag caccagggac agaaaaagta acaagagaag gacaaaaagg tgagaagaca   3720

    ataacgacgc caacactaaa aaatccatta actggagaaa ttattagtaa aggtgaatcg   3780

    aaagaagaaa tcacaaaaga tccgattaat gaattaacag aatacggacc agaaacgata   3840

    acaccaggtc atcgagacga atttgatccg aagttaccaa caggagagaa agaggaagtt   3900

    ccaggtaaac caggaattaa gaatccagaa acaggagatg tagttagacc accggtcgat   3960

    agcgtaacaa aatatggacc tgtaaaagga gactcgattg tagaaaaaga agaaattcca   4020

    ttcgagaaag aacgtaaatt taatcctgat ttagcaccag ggacagaaaa agtaacaaga   4080

    gaaggacaaa aaggtgagaa gacaataacg acgccaacac taaaaaatcc attaactgga   4140

    gaaattatta gtaaaggtga atcgaaagaa gaaatcacaa aagatccagt taatgaatta   4200

    acagaattcg gtggcgagaa aataccgcaa ggtcataaag atatctttga tccaaactta   4260

    ccaacagatc aaacggaaaa agtaccaggt aaaccaggaa tcaagaatcc agacacagga   4320

    aaagtgatcg aagagccagt ggatgatgtg attaaacacg gaccaaaaac gggtacacca   4380

    gaaacaaaaa cagtagagat accgtttgaa acaaaacgtg agtttaatcc aaaattacaa   4440

    cctggtgaag agcgagtgaa acaagaagga caaccaggaa gtaagacaat cacaacacca   4500

    atcacagtga acccattaac aggtgaaaaa gttggcgagg gtcaaccaac agaagagatc   4560

    acaaaacaac cagtagataa gattgtagag ttcggtggag agaaaccaaa agatccaaaa   4620

    ggacctgaaa acccagagaa gccgagcaga ccaactcatc caagtggccc agtaaatcct   4680

    aacaatccag gattatcgaa agacagagca aaaccaaatg gcccagttca ttcaatggat   4740

    aaaaatgata aagttaaaaa atctaaaatt gctaaagaat cagtagctaa tcaagagaaa   4800

    aaacgagcag aattaccaaa aacaggttta gaaagcacgc aaaaaggttt gatctttagt   4860

    agtataattg gaattgctgg attaatgtta ttggctcgta gaagaaagaa ttaa         4914

    <210>14

    <211>1637

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>14

    Ser Gly Lys Tyr Gly Lys Arg Ser Met Gln Met Arg Asp Lys Lys Gly

    1                  5                      10                     15

    Pro Val Asn Lys Arg Val Asp Phe Leu Ser Asn Lys Leu Asn Lys Tyr

                  20                      25                     30

    Ser Ile Arg Lys Phe Thr Val Gly Thr Ala Ser Ile Leu Ile Gly Ser

              35                      40                        45

    Leu Met Tyr Leu Gly Thr Gln Gln Glu Ala Glu Ala Ala Glu Asn Asn

        50                      55                     60

    Ile Glu Asn Pro Thr Thr Leu Lys Asp Asn Val Gln Ser Lys Glu Val

    65                      70                      75                     80

    Lys Ile Glu Glu Val Thr Asn Lys Asp Thr Ala Pro Gln Gly Val Glu

                        85                      90                     95

    Ala Lys Ser Glu Val Thr Ser Asn Lys Asp Thr Ile Glu His Glu Pro

                  100                     105                     110

    Ser Val Lys Ala Glu Asp Ile Ser Lys Lys Glu Asp Thr Pro Lys Glu

              115                     120                     125

    Val Ala Asp Val Ala Glu Val Gln Pro Lys Ser Ser Val Thr His Asn

         130                     135                     140

    Ala Glu Thr Pro Lys Val Arg Lys Ala Arg Ser Val Asp Glu Gly Ser

    145                     150                     155                   160

    Phe Asp Ile Thr Arg Asp Ser Lys Asn Val Val Glu Ser Thr Pro Ile

                        165                     170                    175

    Thr Ile Gln Gly Lys Glu His Phe Glu Gly Tyr Gly Ser Val Asp Ile

                   180                    185                      190

    Gln Lys Lys Pro Thr Asp Leu Gly Val Ser Glu Val Thr Arg Phe Asn

             195                     200                     205

    Val Gly Asn Glu Ser Asn Gly Leu Ile Gly Ala Leu Gln Leu Lys Asn

         210                    215                     220

    Lys Ile Asp Phe Ser Lys Asp Phe Asn Phe Lys Val Arg Val Ala Asn

    225                     230                    235                    240

    Asn His Gln Ser Asn Thr Thr Gly Ala Asp Gly Trp Gly Phe Leu Phe

                      245                     250                    255

    Ser Lys Gly Asn Ala Glu Glu Tyr Leu Thr Asn Gly Gly Ile Leu Gly

                  260                    265                     270

    Asp Lys Gly Leu Val Asn Ser Gly Gly Phe Lys Ile Asp Thr Gly Tyr

             275                     280                     285

    Ile Tyr Thr Ser Ser Met Asp Lys Thr Glu Lys Gln Ala Gly Gln Gly

         290                     295                     300

    Tyr Arg Gly Tyr Gly Ala Phe Val Lys Asn Asp Ser Ser Gly Asn Ser

    305                     310                     315                   320

    Gln Met Val Gly Glu Asn Ile Asp Lys Ser Lys Thr Asn Phe Leu Asn

                      325                      330                    335

    Tyr Ala Asp Asn Ser Thr Asn Thr Ser Asp Gly Lys Phe His Gly Gln

                  340                     345                    350

    Arg Leu Asn Asp Val Ile Leu Thr Tyr Val Ala Ser Thr Gly Lys Met

             355                     360                     365

    Arg Ala Glu Tyr Ala Gly Lys Thr Trp Glu Thr Ser Ile Thr Asp Leu

         370                     375                     380

    Gly Leu Ser Lys Asn Gln Ala Tyr Asn Phe Leu Ile Thr Ser Ser Gln

    385                    390                      395                   400

    Arg Trp Gly Leu Asn Gln Gly Ile Asn Ala Asn Gly Trp Met Arg Thr

                      405                     410                    415

    Asp Leu Lys Gly Ser Glu Phe Thr Phe Thr Pro Glu Ala Pro Lys Thr

                 420                     425                     430

    Ile Thr Glu Leu Glu Lys Lys Val Glu Glu Ile Pro Phe Lys Lys Glu

              435                     440                     445

    Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

         450                   455                     460

    Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

    465                    470                      475                   480

    Pro Leu Thr Gly Val Ile Ile Ser Lys Gly Glu Pro Lys Glu Glu Ile

                        485                      490                    495

    Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile

                 500                      505                     510

    Ala Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu

             515                     520                    525

    Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly

         530                     535                     540

    Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val

    545                     550                     555                   560

    Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Glu Lys Glu

                        565                      570                  575

    Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

                 580                     585                     590

    Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

             595                     600                     605

    Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile

         610                      615                     620

    Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile

    625                     630                     635                   640

    Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu

                       645                    650                     655

    Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly

                  660                      665                    670

    Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val

             675                     680                      685

    Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Glu Lys Glu

         690                     695                     700

    Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

    705                    710                     715                    720

    Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

                      725                      730                    735

    Pro Leu Thr Gly Val Ile Ile Ser Lys Gly Glu Pro Lys Glu Glu Ile

                  740                      745                     750

    Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile

             755                     760                     765

    Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu

         770                    775                     780

    Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly

    785                     790                     795                   800

    Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val

                       805                      810                   815

    Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Lys Lys Glu

                  820                     825                      830

    Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

             835                    840                     845

    Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

        850                     855                      860

    Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile

    865                     870                      875                  880

    Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile

                        885                    890                    895

    Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu

                  900                    905                     910

    Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly

             915                     920                     925

    Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val

        930                      935                     940

    Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Glu Lys Glu

    945                      950                     955                  960

    Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

                      965                    970                      975

    Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

                 980                      985                    990

    Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile

             995                     1000                   1005

    Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr

         1010                  1015                  1020

    Ile Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr

         1025                  1030                  1035

    Gly Glu Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro

         1040                  1045                  1050

    Glu Thr Gly Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys

         1055                  1060                  1065

    Tyr Gly Pro Val Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile

         1070                  1075                  1080

    Pro Phe Lys Lys Glu Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly

         1085                  1090                  1095

    Thr Glu Lys Val Thr Arg Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile

         1100                  1105                  1110

    Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser

         1115                  1120                  1125

    Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu

         1130                  1135                  1140

    Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile Thr Pro Gly His Arg Asp

        1145                  1150                   1155

    Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu Lys Glu Glu Val Pro

        1160                  1165                   1170

    Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly Asp Val Val Arg

        1175                  1180                   1185

    Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val Lys Gly Asp

        1190                  1195                   1200

    Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Glu Lys Glu Arg Lys

        1205                  1210                   1215

    Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg Glu

        1220                  1225                   1230

    Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

        1235                  1240                   1245

    Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu

        1250                  1255                   1260

    Ile Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu

        1265                  1270                   1275

    Thr Ile Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro

        1280                  1285                   1290

    Thr Gly Glu Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn

        1295                  1300                   1305

    Pro Glu Thr Gly Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr

        1310                  1315                   1320

    Lys Tyr Gly Pro Val Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu

        1325                  1330                   1335

    Ile Pro Phe Glu Lys Glu Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro

        1340                  1345                   1350

    Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr

         1355                  1360                  1365

    Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile

         1370                  1375                  1380

    Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile Thr Lys Asp Pro Val Asn

         1385                  1390                  1395

    Glu Leu Thr Glu Phe Gly Gly Glu Lys Ile Pro Gln Gly His Lys

         1400                  1405                  1410

    Asp Ile Phe Asp Pro Asn Leu Pro Thr Asp Gln Thr Glu Lys Val

         1415                  1420                  1425

    Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Asp Thr Gly Lys Val Ile

         1430                  1435                  1440

    Glu Glu Pro Val Asp Asp Val Ile Lys His Gly Pro Lys Thr Gly

         1445                  1450                  1455

    Thr Pro Glu Thr Lys Thr Val Glu Ile Pro Phe Glu Thr Lys Arg

         1460                  1465                  1470

    Glu Phe Asn Pro Lys Leu Gln Pro Gly Glu Glu Arg Val Lys Gln

         1475                  1480                  1485

    Glu Gly Gln Pro Gly Ser Lys Thr Ile Thr Thr Pro Ile Thr Val

         1490                  1495                  1500

    Asn Pro Leu Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Gln Pro Thr Glu

         1505                  1510                  1515

    Glu Ile Thr Lys Gln Pro Val Asp Lys Ile Val Glu Phe Gly Gly

         1520                  1525                  1530

    Glu Lys Pro Lys Asp Pro Lys Gly Pro Glu Asn Pro Glu Lys Pro

         1535                  1540                  1545

    Ser Arg Pro Thr His Pro Ser Gly Pro Val Asn Pro Asn Asn Pro

         1550                  1555                  1560

    Gly Leu Ser Lys Asp Arg Ala Lys Pro Asn Gly Pro Val His Ser

        1565                  1570                   1575

    Met Asp Lys Asn Asp Lys Val Lys Lys Ser Lys Ile Ala Lys Glu

        1580                  1585                   1590

    Ser Val Ala Asn Gln Glu Lys Lys Arg Ala Glu Leu Pro Lys Thr

        1595                  1600                   1605

    Gly Leu Glu Ser Thr Gln Lys Gly Leu Ile Phe Ser Ser Ile Ile

        1610                  1615                   1620

    Gly Ile Ala Gly Leu Met Leu Leu Ala Arg Arg Arg Lys Asn

        1625                  1630                   1635

    <210>15

    <211>1923

    <212>DNA

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>15

    ggaaggagta tgttgatggc taaatatcga gggaaaccgt ttcaattata tgtaaagtta     60

    tcgtgttcga caatgatggc gacaagtatc attttaacga atatcttgcc gtacgatgcc    120

    caagctgcat ctgaaaagga tactgaaatt acaaaagaga tattatctaa gcaagattta    180

    ttagacaaag ttgacaaggc aattcgtcaa attgagcaat taaaacagtt atcggcttca    240

    tctaaagaac attataaagc acaactaaat gaagcgaaaa cagcatcgca aatagatgaa    300

    atcataaaac gagctaatga gttggatagc aaagacaata aaagttctca cactgaaatg    360

    aacggtcaaa gtgatataga cagtaaatta gatcaattgc ttaaagattt aaatgaggtt    420

    tcttcaaatg ttgatagggg tcaacaaagt ggcgaggacg atcttaatgc aatgaaaaat    480

    gatatgtcac aaacggctac aacaaaacat ggagaaaaag atgataaaaa tgatgaagca    540

    atggtaaata aggcgttaga agacctagac catttgaatc agcaaataca caaatcgaaa    600

    gatgcatcga aagatacatc ggaagatcca gcagtgtcta caacagataa taatcatgaa    660

    gtagctaaaa cgccaaataa tgatggttct ggacatgttg tgttaaataa attcctttca    720

    aatgaagaga atcaaagcca tagtaatcga ctcactgata aattacaagg aagcgataaa    780

    attaatcatg ctatgattga aaaattagct aaaagtaatg cctcaacgca acattacaca    840

    tatcataaac tgaatacgtt acaatcttta gatcaacgta ttgcaaatac gcaacttcct    900

    aaaaatcaaa aatcagactt aatgagcgaa gtaaataaga cgaaagagcg tataaaaagt    960

    caacgaaata ttattttgga agaacttgca cgtactgatg ataaaaagta tgctacacaa   1020

    agcattttag aaagtatatt taataaagac gaggcagtta aaattctaaa agatatacgt   1080

    gttgatggta aaacagatca acaaattgca gatcaaatta ctcgtcatat tgatcaatta   1140

    tctctgacaa cgagtgatga tttattaacg tcattgattg atcaatcaca agataagtcg   1200

    ctattgattt ctcaaatttt acaaacgaaa ttaggaaaag ctgaagcaga taaattggct   1260

    aaagattgga cgaataaagg attatcaaat cgccaaatcg ttgaccaatt gaagaaacat   1320

    tttgcatcaa ctggcgacac gtcttcagat gatatattaa aagcaatttt gaataatgcc   1380

    aaagataaaa aacaagcaat tgaaacgatt ttagcaacac gtatagaaag acaaaaggca   1440

    aaattactgg cagatttaat tactaaaata gaaacagatc aaaataaaat ttttaattta   1500

    gttaaatcgg cattgaatgg taaagcggat gatttattga atttacaaaa gagactcaat   1560

    caaacgaaaa aagatataga ttatatttta tcaccaatag taaatcgtcc aagtttacta   1620

    gatcgattga ataaaaatgg gaaaacgaca gatttaaata agttagcaaa tttaatgaat   1680

    caaggatcag atttattaga cagtattcca gatataccca caccaaagcc agaaaagacg   1740

    ttaacacttg gtaaaggtaa tggattgtta agtggattat taaatgctga tggtaatgta   1800

    tctttgccta aagcggggga aacgataaaa gaacattggt tgccgatatc tgtaattgtt   1860

    ggtgcaatgg gtgtactaat gatttggtta tcacgacgca ataagttgaa aaataaagca   1920

    taa                                                                 1923

    <210>16

    <211>640

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>16

    Gly Arg Ser Met Leu Met Ala Lys Tyr Arg Gly Lys Pro Phe Gln Leu

    1                 5                       10                      15

    Tyr Val Lys Leu Ser Cys Ser Thr Met Met Ala Thr Ser Ile Ile Leu

                   20                    25                        30

    Thr Asn Ile Leu Pro Tyr Asp Ala Gln Ala Ala Ser Glu Lys Asp Thr

              35                     40                      45

    Glu Ile Thr Lys Glu Ile Leu Ser Lys Gln Asp Leu Leu Asp Lys Val

         50                       55                     60

    Asp Lys Ala Ile Arg Gln Ile Glu Gln Leu Lys Gln Leu Ser Ala Ser

    65                      70                      75                     80

    Ser Lys Glu His Tyr Lys Ala Gln Leu Asn Glu Ala Lys Thr Ala Ser

                        85                    90                      95

    Gln Ile Asp Glu Ile Ile Lys Arg Ala Asn Glu Leu Asp Ser Lys Asp

                  100                       105                    110

    Asn Lys Ser Ser His Thr Glu Met Asn Gly Gln Ser Asp Ile Asp Ser

             115                     120                     125

    Lys Leu Asp Gln Leu Leu Lys Asp Leu Asn Glu Val Ser Ser Asn Val

         130                    135                    140

    Asp Arg Gly Gln Gln Ser Gly Glu Asp Asp Leu Asn Ala Met Lys Asn

    145                    150                   155                      160

    Asp Met Ser Gln Thr Ala Thr Thr Lys His Gly Glu Lys Asp Asp Lys

                      165                     170                    175

    Asn Asp Glu Ala Met Val Asn Lys Ala Leu Glu Asp Leu Asp His Leu

                 180                     185                    190

    Asn Gln Gln Ile His Lys Ser Lys Asp Ala Ser Lys Asp Thr Ser Glu

             195                     200                     205

    Asp Pro Ala Val Ser Thr Thr Asp Asn Asn His Glu Val Ala Lys Thr

         210                     215                    220

    Pro Asn Asn Asp Gly Ser Gly His Val Val Leu Asn Lys Phe Leu Ser

    225                    230                     235                    240

    Asn Glu Glu Asn Gln Ser His Ser Asn Arg Leu Thr Asp Lys Leu Gln

                     245                     250                     255

    Gly Ser Asp Lys Ile Asn His Ala Met Ile Glu Lys Leu Ala Lys Ser

                 260                       265                    270

    Asn Ala Ser Thr Gln His Tyr Thr Tyr His Lys Leu Asn Thr Leu Gln

             275                     280                     285

    Ser Leu Asp Gln Arg Ile Ala Asn Thr Gln Leu Pro Lys Asn Gln Lys

         290                    295                     300

    Ser Asp Leu Met Ser Glu Val Asn Lys Thr Lys Glu Arg Ile Lys Ser

    305                    310                    315                     320

    Gln Arg Asn Ile Ile Leu Glu Glu Leu Ala Arg Thr Asp Asp Lys Lys

                        325                     330                   335

    Tyr Ala Thr Gln Ser Ile Leu Glu Ser Ile Phe Asn Lys Asp Glu Ala

                  340                       345                    350

    Val Lys Ile Leu Lys Asp Ile Arg Val Asp Gly Lys Thr Asp Gln Gln

               355                     360                    365

    Ile Ala Asp Gln Ile Thr Arg His Ile Asp Gln Leu Ser Leu Thr Thr

         370                     375                      380

    Ser Asp Asp Leu Leu Thr Ser Leu Ile Asp Gln Ser Gln Asp Lys Ser

    385                    390                      395                   400

    Leu Leu Ile Ser Gln Ile Leu Gln Thr Lys Leu Gly Lys Ala Glu Ala

                        405                    410                   415

    Asp Lys Leu Ala Lys Asp Trp Thr Asn Lys Gly Leu Ser Asn Arg Gln

                  420                     425                    430

    Ile Val Asp Gln Leu Lys Lys His Phe Ala Ser Thr Gly Asp Thr Ser

              435                     440                     445

    Ser Asp Asp Ile Leu Lys Ala Ile Leu Asn Asn Ala Lys Asp Lys Lys

         450                     455                     460

    Gln Ala Ile Glu Thr Ile Leu Ala Thr Arg Ile Glu Arg Gln Lys Ala

    465                     470                     475                 480

    Lys Leu Leu Ala Asp Leu Ile Thr Lys Ile Glu Thr Asp Gln Asn Lys

                      485                       490                  495

    Ile Phe Asn Leu Val Lys Ser Ala Leu Asn Gly Lys Ala Asp Asp Leu

                  500                     505                    510

    Leu Asn Leu Gln Lys Arg Leu Asn Gln Thr Lys Lys Asp Ile Asp Tyr

             515                    520                     525

    Ile Leu Ser Pro Ile Val Asn Arg Pro Ser Leu Leu Asp Arg Leu Asn

         530                      535                     540

    Lys Asn Gly Lys Thr Thr Asp Leu Asn Lys Leu Ala Asn Leu Met Asn

    545                     550                   555                     560

    Gln Gly Ser Asp Leu Leu Asp Ser Ile Pro Asp Ile Pro Thr Pro Lys

                      565                     570                     575

    Pro Glu Lys Thr Leu Thr Leu Gly Lys Gly Asn Gly Leu Leu Ser Gly

                  580                     585                    590

    Leu Leu Asn Ala Asp Gly Asn Val Ser Leu Pro Lys Ala Gly Glu Thr

             595                    600                     605

    Ile Lys Glu His Trp Leu Pro Ile Ser Val Ile Val Gly Ala Met Gly

         610                      615                       620

    Val Leu Met Ile Trp Leu Ser Arg Arg Asn Lys Leu Lys Asn Lys Ala

    625                     630                     635                   640

    <210>17

    <211>522

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>17

    Ala Ser Glu Thr Pro Ile Thr Ser Glu Ile Ser Ser Asn Ser Glu Thr

    1                  5                     10                       15

    Val Ala Asn Gln Asn Ser Thr Thr Ile Lys Asn Ser Gln Lys Glu Thr

                  20                      25                      30

    Val Asn Ser Thr Ser Leu Glu Ser Asn His Ser Asn Ser Thr Asn Lys

              35                      40                     45

    Gln Met Ser Ser Glu Val Thr Asn Thr Ala Gln Ser Ser Glu Lys Ala

         50                      55                      60

    Gly Ile Ser Gln Gln Ser Ser Glu Thr Ser Asn Gln Ser Ser Lys Leu

    65                       70                      75                    80

    Asn Thr Tyr Ala Ser Thr Asp His Val Glu Ser Thr Thr Ile Asn Asn

                      85                      90                      95

    Asp Asn Thr Ala Gln Gln Asp Gln Asn Lys Ser Ser Asn Val Thr Ser

                 100                    105                      110

    Lys Ser Thr Gln Ser Asn Thr Ser Ser Ser Glu Lys Asn Ile Ser Ser

             115                     120                      125

    Asn Leu Thr Gln Ser Ile Glu Thr Lys Ala Thr Asp Ser Leu Ala Thr

        130                      135                     140

    Ser Glu Ala Arg Thr Ser Thr Asn Gln Ile Ser Asn Leu Thr Ser Thr

    145                     150                     155                   160

    Ser Thr Ser Asn Gln Ser Ser Pro Thr Ser Phe Ala Asn Leu Arg Thr

                      165                       170                  175

    Phe Ser Arg Phe Thr Val Leu Asn Thr Met Ala Ala Pro Thr Thr Thr

                  180                    185                     190

    Ser Thr Thr Thr Thr Ser Ser Leu Thr Ser Asn Ser Val Val Val Asn

             195                      200                     205

    Lys Asp Asn Phe Asn Glu His Met Asn Leu Ser Gly Ser Ala Thr Tyr

         210                    215                    220

    Asp Pro Lys Thr Gly Ile Ala Thr Leu Thr Pro Asp Ala Tyr Ser Gln

    225                     230                     235                   240

    Lys Gly Ala Ile Ser Leu Asn Thr Arg Leu Asp Ser Asn Arg Ser Phe

                        245                    250                   255

    Arg Phe Ile Gly Lys Val Asn Leu Gly Asn Arg Tyr Glu Gly Tyr Ser

                  260                     265                   270

    Pro Asp Gly Val Ala Gly Gly Asp Gly Ile Gly Phe Ala Phe Ser Pro

             275                     280                     285

    Gly Pro Leu Gly Gln Ile Gly Lys Glu Gly Ala Ala Val Gly Ile Gly

         290                     295                     300

    Gly Leu Asn Asn Ala Phe Gly Phe Lys Leu Asp Thr Tyr His Asn Thr

    305                    310                     315                     320

    Ser Thr Pro Arg Ser Asp Ala Lys Ala Lys Ala Asp Pro Arg Asn Val

                       325                     330                   335

    Gly Gly Gly Gly Ala Phe Gly Ala Phe Val Ser Thr Asp Arg Asn Gly

                  340                     345                    350

    Met Ala Thr Thr Glu Glu Ser Thr Ala Ala Lys Leu Asn Val Gln Pro

             355                     360                     365

    Thr Asp Asn Ser Phe Gln Asp Phe Val Ile Asp Tyr Asn Gly Asp Thr

        370                     375                     380

    Lys Val Met Thr Val Thr Tyr Ala Gly Gln Thr Phe Thr Arg Asn Leu

    385                     390                     395                   400

    Thr Asp Trp Ile Lys Asn Ser Gly Gly Thr Thr Phe Ser Leu Ser Met

                        405                     410                   415

    Thr Ala Ser Thr Gly Gly Ala Lys Asn Leu Gln Gln Val Gln Phe Gly

                   420                    425                    430

    Thr Phe Glu Tyr Thr Glu Ser Ala Val Ala Lys Val Arg Tyr Val Asp

             435                     440                      445

    Ala Asn Thr Gly Lys Asp Ile Ile Pro Pro Lys Thr Ile Ala Gly Glu

         450                      455                      460

    Val Asp Gly Thr Val Asn Ile Asp Lys Gln Leu Asn Asn Phe Lys Asn

    465                     470                     475                   480

    Leu Gly Tyr Ser Tyr Val Gly Thr Asp Ala Leu Lys Ala Pro Asn Tyr

                        485                    490                    495

    Thr Glu Thr Ser Gly Thr Pro Thr Leu Lys Leu Thr Asn Ser Ser Gln

                  500                     505                     510

    Thr Val Ile Tyr Lys Phe Lys Asp Val Gln

              515                     520

    <210>18

    <211>485

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>18

    Ala Ser Asp Ala Pro Leu Thr Ser Glu Leu Asn Thr Gln Ser Glu Thr

    1                  5                      10                      15

    Val Gly Asn Gln Asn Ser Thr Thr Ile Glu Ala Ser Thr Ser Thr Ala

                  20                      25                       30

    Asp Ser Thr Ser Val Thr Lys Asn Ser Ser Ser Val Gln Thr Ser Asn

             35                      40                       45

    Ser Asp Thr Val Ser Ser Glu Lys Ser Glu Lys Val Thr Ser Thr Thr

         50                      55                      60

    Asn Ser Thr Ser Asn Gln Gln Glu Lys Leu Thr Ser Thr Ser Glu Ser

    65                  70                        75                  80

    Thr Ser Ser Lys Asn Thr Thr Ser Ser Ser Asp Thr Lys Ser Val Ala

                       85                      90                   95

    Ser Thr Ser Ser Thr Glu Gln Pro Ile Asn Thr Ser Thr Asn Gln Ser

                   100                     105                    110

    Thr Ala Ser Asn Asn Thr Ser Gln Ser Thr Thr Pro Ser Ser Val Asn

             115                     120                     125

    Leu Asn Lys Thr Ser Thr Thr Ser Thr Ser Thr Ala Pro Val Lys Leu

         130                     135                     140

    Arg Thr Phe Ser Arg Leu Ala Met Ser Thr Phe Ala Ser Ala Ala Thr

    145                    150                     155                    160

    Thr Thr Ala Val Thr Ala Asn Thr Ile Thr Val Asn Lys Asp Asn Leu

                        165                     170                   175

    Lys Gln Tyr Met Thr Thr Ser Gly Asn Ala Thr Tyr Asp Gln Ser Thr

                  180                     185                    190

    Gly Ile Val Thr Leu Thr Gln Asp Ala Tyr Ser Gln Lys Gly Ala Ile

              195                     200                     205

    Thr Leu Gly Thr Arg Ile Asp Ser Asn Lys Ser Phe His Phe Ser Gly

        210                      215                     220

    Lys Val Asn Leu Gly Asn Lys Tyr Glu Gly His Gly Asn Gly Gly Asp

    225                    230                     235                    240

    Gly Ile Gly Phe Ala Phe Ser Pro Gly Val Leu Gly Glu Thr Gly Leu

                        245                     250                  255

    Asn Gly Ala Ala Val Gly Ile Gly Gly Leu Ser Asn Ala Phe Gly Phe

                  260                     265                    270

    Lys Leu Asp Thr Tyr His Asn Thr Ser Lys Pro Asn Ser Ala Ala Lys

             275                     280                     285

    Ala Asn Ala Asp Pro Ser Asn Val Ala Gly Gly Gly Ala Phe Gly Ala

         290                    295                     300

    Phe Val Thr Thr Asp Ser Tyr Gly Val Ala Thr Thr Tyr Thr Ser Ser

    305                     310                     315                   320

    Ser Thr Ala Asp Asn Ala Ala Lys Leu Asn Val Gln Pro Thr Asn Asn

                       325                    330                     335

    Thr Phe Gln Asp Phe Asp Ile Asn Tyr Asn Gly Asp Thr Lys Val Met

                  340                    345                     350

    Thr Val Lys Tyr Ala Gly Gln Thr Trp Thr Arg Asn Ile Ser Asp Trp

              355                    360                     365

    Ile Ala Lys Ser Gly Thr Thr Asn Phe Ser Leu Ser Met Thr Ala Ser

         370                    375                     380

    Thr Gly Gly Ala Thr Asn Leu Gln Gln Val Gln Phe Gly Thr Phe Glu

    385                    390                     395                    400

    Tyr Thr Glu Ser Ala Val Thr Gln Val Arg Tyr Val Asp Val Thr Thr

                        405                     410                   415

    Gly Lys Asp Ile Ile Pro Pro Lys Thr Tyr Ser Gly Asn Val Asp Gln

                    420                     425                    430

    Val Val Thr Ile Asp Asn Gln Gln Ser Ala Leu Thr Ala Lys Gly Tyr

               435                     440                    445

    Asn Tyr Thr Ser Val Asp Ser Ser Tyr Ala Ser Thr Tyr Asn Asp Thr

        450                      455                     460

    Asn Lys Thr Val Lys Met Thr Asn Ala Gly Gln Ser Val Thr Tyr Tyr

    465                     470                    475                    480

    Phe Thr Asp Val Val

                      485

    <210>19

    <211>1245

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>19

    Met Gly Lys Arg Arg Gln Gly Pro Ile Asn Lys Lys Val Asp Phe Leu

    1                 5                       10                      15

    Pro Asn Lys Leu Asn Lys Tyr Ser Ile Arg Lys Phe Thr Val Gly Thr

                  20                      25                      30

    Ala Ser Ile Leu Leu Gly Ser Thr Leu Ile Phe Gly Ser Ser Ser His

              35                      40                       45

    Glu Ala Lys Ala Ala Glu Glu Lys Gln Val Asp Pro Ile Thr Gln Ala

         50                      55                      60

    Asn Gln Asn Asp Ser Ser Glu Arg Ser Leu Glu Asn Thr Asn Gln Pro

    65                    70                      75                   80

    Thr Val Asn Asn Glu Ala Pro Gln Met Ser Ser Thr Leu Gln Ala Glu

                      85                      90                      95

    Glu Gly Ser Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

                  100                     105                     110

    Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

             115                     120                     125

    Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

        130                     135                     140

    Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu

    145                    150                     155                    160

    Glu Gly Ser Asn Val Lys Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

                       165                     170                    175

    Glu Gly Ser Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu

                  180                     185                     190

    Glu Gly Ser Asn Ala Lys Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

             195                     200                     205

    Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu

         210                    215                     220

    Glu Gly Ser Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

    225                     230                     235                   240

    Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu

                      245                     250                    255

    Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Pro Asn Val Pro Thr Ile Lys Ala Asn

                 260                     265                      270

    Ser Asp Asn Asp Thr Gln Thr Gln Phe Ser Glu Ala Pro Thr Arg Asn

             275                    280                     285

    Asp Leu Ala Arg Lys Glu Asp Ile Pro Ala Val Ser Lys Asn Glu Glu

        290                     295                      300

    Leu Gln Ser Ser Gln Pro Asn Thr Asp Ser Lys Ile Glu Pro Thr Thr

    305                     310                     315                   320

    Ser Glu Pro Val Asn Leu Asn Tyr Ser Ser Pro Phe Met Ser Leu Leu

                       325                     330                     335

    Ser Met Pro Ala Asp Ser Ser Ser Asn Asn Thr Lys Asn Thr Ile Asp

                  340                     345                     350

    Ile Pro Pro Thr Thr Val Lys Gly Arg Asp Asn Tyr Asp Phe Tyr Gly

              355                     360                     365

    Arg Val Asp Ile Glu Ser Asn Pro Thr Asp Leu Asn Ala Thr Asn Leu

        370                      375                    380

    Thr Arg Tyr Asn Tyr Gly Gln Pro Pro Gly Thr Thr Thr Ala Gly Ala

    385                     390                     395                   400

    Val Gln Phe Lys Asn Gln Val Ser Phe Asp Lys Asp Phe Asp Phe Asn

                      405                     410                    415

    Ile Arg Val Ala Asn Asn Arg Gln Ser Asn Thr Thr Gly Ala Asp Gly

                    420                   425                    430

    Trp Gly Phe Met Phe Ser Lys Lys Asp Gly Asp Asp Phe Leu Lys Asn

             435                     440                   445

    Gly Gly Ile Leu Arg Glu Lys Gly Thr Pro Ser Ala Ala Gly Phe Arg

         450                     455                     460

    Ile Asp Thr Gly Tyr Tyr Asn Asn Asp Pro Leu Asp Lys Ile Gln Lys

    465                      470                   475                    480

    Gln Ala Gly Gln Gly Tyr Arg Gly Tyr Gly Thr Phe Val Lys Asn Asp

                      485                     490                    495

    Ser Gln Gly Asn Thr Ser Lys Val Gly Ser Gly Thr Pro Ser Thr Asp

                  500                     505                     510

    Phe Leu Asn Tyr Ala Asp Asn Thr Thr Asn Asp Leu Asp Gly Lys Phe

             515                    520                   525

    His Gly Gln Lys Leu Asn Asn Val Asn Leu Lys Tyr Asn Ala Ser Asn

        530                     535                     540

    Gln Thr Phe Thr Ala Thr Tyr Ala Gly Lys Thr Trp Thr Ala Thr Leu

    545                     550                     555                   560

    Ser Glu Leu Gly Leu Ser Pro Thr Asp Ser Tyr Asn Phe Leu Val Thr

                       565                     570                    575

    Ser Ser Gln Tyr Gly Asn Gly Asn Ser Gly Thr Tyr Ala Ser Gly Val

                  580                     585                     590

    Met Arg Ala Asp Leu Asp Gly Ala Thr Leu Thr Tyr Thr Pro Lys Ala

             595                    600                     605

    Val Asp Gly Asp Pro Ile Ile Ser Thr Lys Glu Ile Pro Phe Asn Lys

         610                      615                      620

    Lys Arg Glu Phe Asp Pro Asn Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Val

    625                    630                    635                   640

    Gln Lys Gly Glu Pro Gly Ile Glu Thr Thr Thr Thr Pro Thr Tyr Val

                      645                     650                    655

    Asn Pro Asn Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Glu Pro Thr Glu Lys

                 660                     665                     670

    Ile Thr Lys Gln Pro Val Asp Glu Ile Val His Tyr Gly Gly Glu Glu

              675                     680                     685

    Ile Lys Pro Gly His Lys Asp Glu Phe Asp Pro Asn Ala Pro Lys Gly

         690                     695                     700

    Ser Gln Thr Thr Gln Pro Gly Lys Pro Gly Val Lys Asn Pro Asp Thr

    705                     710                     715                   720

    Gly Glu Val Val Thr Pro Pro Val Asp Asp Val Thr Lys Tyr Gly Pro

                       725                     730                    735

    Val Asp Gly Asp Pro Ile Thr Ser Thr Glu Glu Ile Pro Phe Asp Lys

                  740                      745                    750

    Lys Arg Glu Phe Asn Pro Asp Leu Lys Pro Gly Glu Glu Arg Val Lys

             755                     760                   765

    Gln Lys Gly Glu Pro Gly Thr Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Thr Lys

        770                     775                      780

    Asn Pro Leu Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Glu Pro Thr Glu Lys

    785                    790                    795                     800

    Ile Thr Lys Gln Pro Val Asp Glu Ile Thr Glu Tyr Gly Gly Glu Glu

                        805                     810                  815

    Ile Lys Pro Gly His Lys Asp Glu Phe Asp Pro Asn Ala Pro Lys Gly

                   820                    825                    830

    Ser Gln Glu Asp Val Pro Gly Lys Pro Gly Val Lys Asn Pro Gly Thr

             835                     840                     845

    Gly Glu Val Val Thr Pro Pro Val Asp Asp Val Thr Lys Tyr Gly Pro

         850                     855                     860

    Val Asp Gly Asp Pro Ile Thr Ser Thr Glu Glu Ile Pro Phe Asp Lys

    865                     870                     875                   880

    Lys Arg Glu Phe Asn Pro Asp Leu Lys Pro Gly Glu Glu Arg Val Lys

                      885                    890                     895

    Gln Lys Gly Glu Pro Gly Thr Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Thr Lys

                  900                     905                     910

    Asn Pro Leu Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Glu Pro Thr Glu Lys

             915                     920                    925

    Ile Thr Lys Gln Pro Val Asp Glu Ile Val His Tyr Gly Gly Glu Gln

         930                     935                      940

    Ile Pro Gln Gly His Lys Asp Glu Phe Asp Pro Asn Ala Pro Val Asp

    945                      950                   955                 960

    Ser Lys Thr Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Val Lys Asn Pro Asp Thr

                        965                     970                 975

    Gly Glu Val Val Thr Pro Pro Val Asp Asp Val Thr Lys Tyr Gly Pro

                  980                     985                     990

    Val Asp Gly Asp Ser Ile Thr Ser Thr Glu Glu Ile Pro Phe Asp Lys

             995                    1000                    1005

    Lys Arg Glu Phe Asp Pro Asn Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val

         1010                 1015                  1020

    Val Gln Lys Gly Glu Pro Gly Thr Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr

         1025                 1030                  1035

    Thr Lys Asn Pro Leu Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Lys Ser

         1040                 1045                  1050

    Thr Glu Lys Val Thr Lys Gln Pro Val Asp Glu Ile Val Glu Tyr

         1055                 1060                  1065

    Gly Pro Thr Lys Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Lys

         1070                 1075                  1080

    Pro Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu

         1085                 1090                  1095

    Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu Pro Gly Lys

         1100                 1105                  1110

    Pro Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu

         1115                 1120                  1125

    Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu Pro Gly Thr

         1130                 1135                  1140

    Pro Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu

         1145                  1150                 1155

    Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu Pro Gly Lys

         1160                  1165                 1170

    Pro Ala Glu Ser Gly Lys Pro Val Glu Pro Gly Thr Pro Ala Gln

         1175                  1180                 1185

    Ser Gly Ala Pro Glu Gln Pro Asn Arg Ser Met His Ser Thr Asp

         1190                 1195                  1200

    Asn Lys Asn Gln Leu Pro Asp Thr Gly Glu Asn Arg Gln Ala Asn

         1205                 1210                  1215

    Glu Gly Thr Leu Val Gly Ser Leu Leu Ala Ile Val Gly Ser Leu

        1220                  1225                  1230

    Phe Ile Phe Gly Arg Arg Lys Lys Gly Asn Glu Lys

        1235                  1240                  1245

    <210>20

    <211>3765

    <212>DNA

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>20

    atgggcaaac gtagacaagg tcctattaat aaaaaagtgg attttttacc taacaaatta     60

    aacaagtatt ctataagaaa attcactgtt ggtacggcct caatattact tggttcgaca    120

    cttatttttg gaagtagtag ccatgaagcg aaagctgcag aagaaaaaca agttgatcca    180

    attacacaag ctaatcaaaa tgatagtagt gaaagatcac ttgaaaacac aaatcaacct    240

    actgtaaaca atgaagcacc acagatgtct tctacattgc aagcagaaga aggaagcaat    300

    gcagaagcac ctcaatctga gccaacgaag gcagaagaag gaggcaatgc agaagcagct    360

    caatctgagc caacgaaggc agaagaagga ggcaatgcag aagcacctca atctgagcca    420

    acgaaggcag aagaaggagg caatgcagaa gcagctcaat ctgagccaac gaagacagaa    480

    gaaggaagca acgtaaaagc agctcaatct gagccaacga aggcagaaga aggaagcaat    540

    gcagaagcac ctcaatctga gccaacgaag acagaagaag gaagcaacgc aaaagcagct    600

    caatctgagc caacgaaggc agaagaagga ggcaatgcag aagcagctca atctgagcca    660

    acgaagacag aagaaggaag caatgcagaa gcacctcaat ctgagccaac gaaggcagaa    720

    gaaggaggca atgcagaagc acctcaatct gagccaacga agacagaaga aggaggcaat    780

    gcagaagcac cgaatgttcc aactatcaaa gctaattcag ataatgatac acaaacacaa    840

    ttttcagaag cccctacaag aaatgaccta gctagaaaag aagatatccc tgctgtttct    900

    aaaaacgagg aattacaatc atcacaacca aacactgaca gtaaaataga acctacaact    960

    tcagaacctg tgaatttaaa ttatagttct ccgtttatgt ccttattaag catgcctgct   1020

    gatagttcat ccaataacac taaaaataca atagatatac cgccaactac ggttaaaggt   1080

    agagataatt acgattttta cggtagagta gatatcgaaa gtaatcctac agatttaaat   1140

    gcgacaaatt taacgagata taattatgga cagccacctg gtacaacaac agctggtgca   1200

    gttcaattta aaaatcaagt tagttttgat aaagatttcg actttaacat tagagtagca   1260

    aacaatcgtc aaagtaatac aactggtgca gatggttggg gctttatgtt cagcaagaaa   1320

    gatggggatg atttcctaaa aaacggtggt atcttacgtg aaaaaggtac acctagtgca   1380

    gctggtttca gaattgatac aggatattat aataacgatc cattagataa aatacagaaa   1440

    caagctggtc aaggctatag agggtatggg acatttgtta aaaatgactc ccaaggtaat   1500

    acttctaaag taggatcagg tactccatca acagattttc ttaactacgc agataatact   1560

    actaatgatt tagatggtaa attccatggt caaaaattaa ataatgttaa tttgaaatat   1620

    aatgcttcaa atcaaacttt tacagctact tatgctggta aaacttggac ggctacgtta   1680

    tctgaattag gattgagtcc aactgatagt tacaattttt tagttacatc aagtcaatat   1740

    ggaaatggta atagtggtac atacgcaagt ggcgttatga gagctgattt agatggtgca   1800

    acattgacat acactcctaa agcagtcgat ggagatccaa ttatatcaac taaggaaata   1860

    ccatttaata agaaacgtga atttgatcca aacttagccc caggtacaga aaaagtagtc   1920

    caaaaaggtg aaccaggaat tgaaacaaca acaacaccaa cttatgtcaa tcctaataca   1980

    ggagaaaaag ttggcgaagg tgaaccaaca gaaaaaataa caaaacaacc agtggatgaa   2040

    atcgttcatt atggtggcga agaaatcaag ccaggccata aggatgaatt tgatccaaat   2100

    gcaccgaaag gtagtcaaac aacgcaacca ggtaagccgg gggttaaaaa tcctgataca   2160

    ggcgaagtag ttactccacc tgtggatgat gtgacaaaat atggtccagt tgatggagat   2220

    ccgatcacgt caacggaaga aattccattc gacaagaaac gtgaattcaa tcctgattta   2280

    aaaccaggtg aagagcgtgt taaacaaaaa ggtgaaccag gaacaaaaac aattacaaca   2340

    ccaacaacta agaacccatt aacaggggaa aaagttggcg aaggtgaacc aacagaaaaa   2400

    ataacaaaac aaccagtaga tgaaatcaca gaatatggtg gcgaagaaat caagccaggc   2460

    cataaggatg aatttgatcc aaatgcaccg aaaggtagcc aagaggacgt tccaggtaaa   2520

    ccaggagtta aaaaccctgg aacaggcgaa gtagtcacac caccagtgga tgatgtgaca   2580

    aaatatggtc cagttgatgg agatccgatc acgtcaacgg aagaaattcc attcgacaag   2640

    aaacgtgaat tcaatcctga tttaaaacca ggtgaagagc gcgttaaaca gaaaggtgaa   2700

    ccaggaacaa aaacaattac aacgccaaca actaagaacc cattaacagg agaaaaagtt   2760

    ggcgaaggtg aaccaacaga aaaaataaca aaacaaccag tggatgagat tgttcattat   2820

    ggtggtgaac aaataccaca aggtcataaa gatgaatttg atccaaatgc acctgtagat   2880

    agtaaaactg aagttccagg taaaccagga gttaaaaatc ctgatacagg tgaagttgtt   2940

    accccaccag tggatgatgt gacaaaatat ggtccagttg atggagattc gattacgtca   3000

    acggaagaaa ttccgtttga taaaaaacgc gaatttgatc caaacttagc gccaggtaca   3060

    gagaaagtcg ttcaaaaagg tgaaccagga acaaaaacaa ttacaacgcc aacaactaag   3120

    aacccattaa caggagaaaa agttggcgaa ggtaaatcaa cagaaaaagt cactaaacaa   3180

    cctgttgacg aaattgttga gtatggtcca acaaaagcag aaccaggtaa accagcggaa   3240

    ccaggtaaac cagcggaacc aggtaaacca gcggaaccag gtacgccagc agaaccaggt   3300

    aaaccagcgg aaccaggtac gccagcagaa ccaggtaaac cagcggaacc aggtaaacca   3360

    gcggaaccag gtaaaccagc ggaaccaggt aaaccagcgg aaccaggtac gccagcagaa   3420

    ccaggtacgc cagcagaacc aggtaaacca gcggaaccag gtacgccagc agaaccaggt   3480

    aaaccagcgg aaccaggtac gccagcagaa ccaggtaaac cagcggaatc aggtaaacca   3540

    gtggaaccag gtacgccagc acaatcaggt gcaccagaac aaccaaatag atcaatgcat   3600

    tcaacagata ataaaaatca attacctgat acaggtgaaa atcgtcaagc taatgaggga   3660

    actttagtcg gatctctatt agcaattgtc ggatcattgt tcatatttgg tcgtcgtaaa   3720

    aaaggtaatg aaaaataatt tcatataaaa actttctgcc attaa                   3765

    <210>21

    <211>546

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus epidermidis

    <400>21

    Glu Lys Gln Val Asp Pro Ile Thr Gln Ala Asn Gln Asn Asp Ser Ser

    1                  5                       10                      15

    Glu Arg Ser Leu Glu Asn Thr Asn Gln Pro Thr Val Asn Asn Glu Ala

                  20                     25                     30

    Pro Gln Met Ser Ser Thr Leu Gln Ala Glu Glu Gly Ser Asn Ala Glu

             35                      40                     45

    Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

         50                      55                     60

    Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

    65                      70                     75                      80

    Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

                       85                      90                      95

    Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu Glu Gly Ser Asn Val Lys

                  100                     105                    110

    Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Ser Asn Ala Glu

             115                     120                     125

    Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu Glu Gly Ser Asn Ala Lys

         130                     135                    140

    Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

    145                     150                     155                    160

    Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu Glu Gly Ser Asn Ala Glu

                        165                    170                     175

    Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

                  180                     185                    190

    Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

             195                     200                    205

    Ala Pro Asn Val Pro Thr Ile Lys Ala Asn Ser Asp Asn Asp Thr Gln

         210                     215                     220

    Thr Gln Phe Ser Glu Ala Pro Thr Arg Asn Asp Leu Ala Arg Lys Glu

    225                     230                   235                      240

    Asp Ile Pro Ala Val Ser Lys Asn Glu Glu Leu Gln Ser Ser Gln Pro

                        245                    250                     255

    Asn Thr Asp Ser Lys Ile Glu Pro Thr Thr Ser Glu Pro Val Asn Leu

                  260                      265                    270

    Asn Tyr Ser Ser Pro Phe Met Ser Leu Leu Ser Met Pro Ala Asp Ser

             275                     280                     285

    Ser Ser Asn Asn Thr Lys Asn Thr Ile Asp Ile Pro Pro Thr Thr Val

         290                    295                      300

    Lys Gly Arg Asp Asn Tyr Asp Phe Tyr Gly Arg Val Asp Ile Glu Ser

    305                    310                    315                      320

    Asn Pro Thr Asp Leu Asn Ala Thr Asn Leu Thr Arg Tyr Asn Tyr Gly

                      325                    330                       335

    Gln Pro Pro Gly Thr Thr Thr Ala Gly Ala Val Gln Phe Lys Asn Gln

                  340                     345                    350

    Val Ser Phe Asp Lys Asp Phe Asp Phe Asn Ile Arg Val Ala Asn Asn

              355                    360                     365

    Arg Gln Ser Asn Thr Thr Gly Ala Asp Gly Trp Gly Phe Met Phe Ser

        370                     375                    380

    Lys Lys Asp Gly Asp Asp Phe Leu Lys Asn Gly Gly Ile Leu Arg Glu

    385                    390                    395                  400

    Lys Gly Thr Pro Ser Ala Ala Gly Phe Arg Ile Asp Thr Gly Tyr Tyr

                      405                       410                 415

    Asn Asn Asp Pro Leu Asp Lys Ile Gln Lys Gln Ala Gly Gln Gly Tyr

                 420                     425                     430

    Arg Gly Tyr Gly Thr Phe Val Lys Asn Asp Ser Gln Gly Asn Thr Ser

             435                     440                    445

    Lys Val Gly Ser Gly Thr Pro Ser Thr Asp Phe Leu Asn Tyr Ala Asp

         450                     455                     460

    Asn Thr Thr Asn Asp Leu Asp Gly Lys Phe His Gly Gln Lys Leu Asn

    465                   470                     475                      480

    Asn Val Asn Leu Lys Tyr Asn Ala Ser Asn Gln Thr Phe Thr Ala Thr

                      485                     490                   495

    Tyr Ala Gly Lys Thr Trp Thr Ala Thr Leu Ser Glu Leu Gly Leu Ser

                  500                     505                    510

    Pro Thr Asp Ser Tyr Asn Phe Leu Val Thr Ser Ser Gln Tyr Gly Asn

             515                     520                     525

    Gly Asn Ser Gly Thr Tyr Ala Ser Gly Val Met Arg Ala Asp Leu Asp

         530                     535                     540

    Gly Ala

    545

    <210>22

    <211>36

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus aureus

    <400>22

    Leu Pro Asn Thr Gly Ser Glu Glu Met Asp Leu Pro Leu Lys Glu Leu

    1                 5                      10                      15

    Ala Leu IIe Thr Gly Ala Ala Leu Leu Ala Arg Arg Arg Ser Lys Lys

                  20                      25                      30

    Glu Lys Glu Ser

             35

    <210>23

    <211>43

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus aureus

    <400>23

    Leu Pro Asp Thr Gly Asp Ser Ile Lys Gln Asn Gly Leu Leu Gly Gly

    1                 5                       10                      15

    Val Met Thr Leu Leu Val Gly Leu Gly Leu Met Lys Arg Lys Lys Lys

                 20                      25                      30

    Lys Asp Glu Asn Asp Gln Asp Asp Ser Gln Ala

             35                     40

    <210>24

    <211>35

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus aureus

    <400>24

    Leu Pro Lys Thr Gly Glu Thr Thr Ser Ser Gln Ser Trp Trp Gly Leu

    1                  5                      10                     15

    Tyr Ala Leu Leu Gly Met Leu Ala Leu Phe Ile Pro Lys Phe Arg Lys

                  20                     25                      30

    Glu Ser Lys

             35

    <210>25

    <211>38

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus aureus

    <400>25

    Leu Pro Lys Thr Gly Leu Thr Ser Val Asp Asn Phe Ile Ser Thr Val

    1                  5                      10                      15

    Ala Phe Ala Thr Leu Ala Leu Leu Gly Ser Leu Ser Leu Leu Leu Phe

                  20                     25                      30

    Lys Arg Lys Glu Ser Lys

             35

    <210>26

    <211>36

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus aureus

    <400>26

    Leu Pro Gln Thr Gly Glu Glu Ser Asn Lys Asp Met Thr Leu Pro Leu

    1                 5                       10                     15

    Met Ala Leu Ile Ala Leu Ser Ser Ile Val Ala Phe Val Leu Pro Arg

                  20                        25                    30

    Lys Arg Lys Asn

             35

    <210>27

    <211>34

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus aureus

    <400>27

    Leu Pro Lys Thr Gly Thr Asn Gln Ser Ser Ser Pro Glu Ala Met Phe

    1                  5                      10                     15

    Val Leu Leu Ala Gly Ile Gly Leu Ile Ala Thr Val Arg Arg Arg Lys

                  20                       25                     30

    Ala Ser

    <210>28

    <211>33

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus aureus

    <400>28

    Leu Pro Lys Thr Gly Leu Glu Ser Thr Gln Lys Gly Leu Ile Phe Ser

    1                  5                      10                      15

    Ser Ile Ile Gly Ile Ala Gly Leu Met Leu Leu Ala Arg Arg Arg Lys

                    20                      25                     30

    Asn

    <210>29

    <211>39

    <212>PRT

    <213>Staphylococcus aureus

    <400>29

    Leu Pro Lys Ala Gly Glu Thr Ile Lys Glu His Trp Leu Pro Ile Ser

    1                  5                        10                       15

    Val Ile Val Gly Ala Met Gly Val Leu Met Ile Trp Leu Ser Arg Arg

                    20                     25                      30

    Asn Lys Leu Lys Asn Lys Ala

             35

识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体.pdf_第1页
第1页 / 共142页
识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体.pdf_第2页
第2页 / 共142页
识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体.pdf_第3页
第3页 / 共142页
点击查看更多>>
资源描述

《识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体.pdf》由会员分享,可在线阅读,更多相关《识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体.pdf(142页珍藏版)》请在专利查询网上搜索。

提供了与凝血酶阳性的葡萄球菌细菌,例如溶血葡萄球菌发生交叉反应的多克隆和单克隆抗体,所述的抗体能够识别凝固酶阳性的和凝固酶阴性的葡萄球菌细菌的表面蛋白质。从基于金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的葡萄球菌之间共有的特性分离的表面蛋白质可以制备抗体,这些重组表面蛋白质可用于制备本发明的抗体。还提供了利用这些蛋白质和抗体用于治疗或抵抗各种各样的葡萄球菌的感染的疫苗和方法。。

展开阅读全文
相关资源
猜你喜欢
相关搜索

当前位置:首页 > 物理 > 测量;测试


copyright@ 2017-2020 zhuanlichaxun.net网站版权所有
经营许可证编号:粤ICP备2021068784号-1