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本发明涉及一种生成碳纳米管(CNT)纳米芯片的方法,其包含下述步骤:在基底上生成超分子薄膜,其中基底上沉积有CNR合成所用的金属催化剂,通过退火来诱导超分子的自组装从而形成规则结构,利用金属化合物对所形成的规则结构进行选择性着色,然后蚀刻金属化合物着色的薄膜以形成纳米尺度或者更小尺度的图形,采用所形成的金属化合物对超分子进行染色,利用染色后的超分子纳米图形来形成金属催化剂的纳米图形,并在所形成的金。