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本发明提供一种重组载体、利用该载体制备的重组杆状病毒以及该病毒在疟疾疫苗制备中的应用。该重组载体由一段重组序列插入到pFastBacDual载体中构建而成,所述重组序列为根据CMV、Ph、SP、TM序列,在SP和TM间加入EcoR I酶切位点和Xho I酶切位点,CMV-F前加入KpnI酶切位点,TM-R后加入HindIII酶切位点形成。该重组杆状病毒由约氏疟原虫Pys25抗原基因插入到该重组载体。