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一种制造半导体器件的方法,包括具有半导体层(12)的衬底(12),所述半导体层(12)具有用于非易失性存储器的第一部分(16)以及除了所述第一部分(16)之外的第二部分(18)。在半导体层上形成第一电介质层(14)。对该第一电介质层执行等离子体氮化。在第一部分上形成第一多个纳米团簇(20),以及在第二部分上形成第二多个纳米团簇(28)。去除第二多个纳米团簇。在半导体层上形成第二电介质层(38)。在。