技术领域
本发明涉及基因检测方法,尤其是涉及BAFF基因实时荧光PCR检测方法 及其相关试剂盒。
背景技术
BAFF(B cell activation factor),B细胞激活因子,肿瘤坏死因子家族成员,属于 Ⅱ跨膜蛋白,与同属于同一家族的APRIL有高度的同源性,在结构上两者是通过 不同的D-E环结合它们共同受体,从而导致不同亲和。经蛋白酶水解形成可溶性 [16],可溶性BAFF在血清中主要是以三聚体的形式存在[M.Cao,P.Cao,H.Yanet al.,Appl BiochemBiotechnol,2009,157(3):562-574],是由免疫细胞分泌,包括 肥大细胞,嗜中性粒细胞,DC细胞及B和T细胞等。BAFF促进B细胞及T细胞的 增殖及分化,对成熟B细胞产生及维持有重要的作用,基因扰乱BAFF基因会导 致成熟B2细胞和MZ B细胞明显的缺陷[Y.Laabi,A.Strasser,Science,2000,289 (5481):883-884]。BAFF可以结合TNFR家族的三种受体:TACI(transmembrane activator,calcium modulator,and cyclophilin ligand interactor),BCMA(B cell maturation Ag)和BAFF-R(BAFF-receptor)。TACI和BCMA也可以结合APRIL, BCMA和TACI对B细胞的成熟及发育是必不可少,另外有研究表明TACI是BAFF 负调节受体,引起B细胞的凋亡,调节B细胞的稳定。B细胞增殖主要是通过是由 BAFF的第三受体BAFF-R进行诱导。
BAFF也参与自身免疫性疾病的发展。在自身免疫性疾病,如SLE,RA, 病人血清中发现BAFF明显高于正常人,在BAFF的转基因小鼠中出现了严重的 淋巴细胞紊乱和自身免疫性疾病的症状。BAFF的过量表达会促进低亲和性的自 身反应B细胞的聚集,也会促进T细胞的过度活化,分化为效应T细胞,及抗 凋亡因子Bcl2的表达和Th1细胞因子的分泌,从而引起自身免疫系统的紊乱; 目前对于BAFF过量表达主要是通过血清浓度的直接检测,检测周期长,并且没 有在国内医院系统内大范围的使用。
发明内容
为了解决上述现有技术的不足,本发明目的在于提供一种方便和快捷检测 BAFF基因表达的引物和试剂盒。
本发明所采用的技术方案如下:
BAFF基因实时荧光PCR检测引物:
正向引物(SEQ ID NO.1):GATGACT CCACAGAAAG
反向引物(SEQ ID NO.2):ACAGCAGTTTCAAGC;
并利用上述引物对进行荧光PCR检测的试剂盒,试剂盒包括一种检测溶液, 其检测溶液含有含SYBR Premix Ex Taq(2×)、正向引物10μM、反向引物10μM、 Rox Dye(50×);
其中所述正向引物和方向引物为上诉的引物对。
利用本试剂盒进行检测的步骤如下:
1)提取待检测样品的RNA,并反转录DNA溶液。
2)反应体系:取2ul步骤1)中所得的DNA溶液,并与上述试剂盒中的检 测溶液14ul进行混合,并加入无菌超纯水至反应体积20ul;加入到实时荧光反 应管中,进行离心;
3)将步骤2)的反应体系按照下述条件进行实时荧光PCR检测:
预变性94℃/30s,1次循环;变性95℃/5s,延伸66℃/100s,40次循环。
本发明采用SYBR Green I实时荧光PCR检测方法,对BAFF基因进行鉴定, 具有检测实时性和高效性,并可以对早期BAFF基因表达进行检测,用于早期判 断自身免疫性疾病,另外可以对病人进行个性诊断和治疗过程中,BAFF的基因 表达情况的检测,并判断病人复发和加重病情的可能性。
附图说明
图1是本发明实施例1检测试剂实时荧光PCR检测特异性扩增曲线;
图2是实施例1中PCR扩增数值对比;
图3是阴性对照和检测样品ELISA检测对比。
具体实施方式
根据实施例和附图对本发明作进一步的说明。
实施例1所示:
1.设计BAFF基因实时荧光检测引物,针对BAFF cDNA的胞外区进行设计 引物:
正向引物:GATGACT CCACAGAAAG
反向引物:ACAGCAGTTTCAAGC;
2.构建利用上述引物对进行荧光PCR检测的试剂盒,试剂盒包括一种检测 溶液,其检测溶液含有含SYBR Premix Ex Taq(2×)、正向引物10μM、反向引物 10μM、Rox Dye(50×);
3.检验样品的制备
离心待检测样品和阴性对照血液,提取下层细胞的RNA,并反转录cDNA 溶液,低温保存备用;其中检测样品取自系统性红斑狼疮病人血液(1-6)作为 检测对象,取6份正常人血清阴性对照。
4.PCR反应
取2ul步骤3)中所得的cDNA溶液,并与上述试剂盒中的检测溶液14ul 进行混合,并加入无菌超纯水至反应体积20ul;加入到实时荧光反应管中,进行 离心;
预变性94℃/30s,1次循环;变性95℃/5s,延伸66℃/100s,40次循环。
4.结果判断和分析。
如图1所示的PCR扩增曲线,附图2对阴性对照和病人进行荧光性比对分 析。图1所示的扩增曲线表相本引物对具有良好的特异性,如附图2所示,检测 样品1-6具有较阴性对照具有较高的BAFF基因表达情况。
5.对病人样品中的血清利用BAFF抗体进行ELISA验证检测,所述的BAFF 抗体购自BioVision公司。如附图3所示,其中“***”表示p<0.001,具有明显 性差异,其中样品6没有显著性差异;如样品6外,ELISA检测结果与实时荧光 PCR检测的趋势相符。
其中,利用实时荧光PCR检测BAFF基因表达后,分析检测样品1-6相对 于阴性对照具有显著的差异,利用ELISA验证时,确定病人1-5血清中BAFF 的浓度较高,进而判断为BAFF依赖性系统自身免疫性疾病,针对BAFF进行药 物使用;对病人6再进行其他方面的分析。
上述实验表明,本发明所述的引物对具有良好的特异性,可用于BAFF基因 表达检测,用于区别病人自身免疫性疾病的病因。