腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法.pdf

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摘要
申请专利号:

CN201010214774.6

申请日:

2010.06.30

公开号:

CN101935671A

公开日:

2011.01.05

当前法律状态:

终止

有效性:

无权

法律详情:

未缴年费专利权终止IPC(主分类):C12N 15/65申请日:20100630授权公告日:20120111终止日期:20120630|||授权|||实质审查的生效IPC(主分类):C12N 15/65申请日:20100630|||公开

IPC分类号:

C12N15/65; C12N15/861; C12N7/00

主分类号:

C12N15/65

申请人:

陕西师范大学

发明人:

夏海滨; 赵俊丽

地址:

710062 陕西省西安市长安南路199号

优先权:

专利代理机构:

西安永生专利代理有限责任公司 61201

代理人:

申忠才

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内容摘要

一种腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法,由构建向腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3’端引入一个酶切位点的穿梭载体、引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体、构建标记基因标记核心蛋白穿梭载体、构建标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体、标记基因标记核心蛋白腺病毒的包装及纯化组成。本发明采用一种新的标记腺病毒核心蛋白的方法,该方法实现了对腺病毒核心蛋白真正意义的遗传水平上的荧光标记,这种标记方法删除了腺病毒基因组中的原有的核心蛋白基因,因此采用本发明的方法标记腺病毒核心蛋白,可以获得的100%被荧光蛋白标记的病毒颗粒。

权利要求书

1: 一种腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法, 其特征在于它是由下述步骤组成 : (1) 构建向腺病毒基因组核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入一个酶切位点的穿梭载体 采用酶切连接的方式将合成的 DNA 片段连入 pUC19 质粒载体, 获得的阳性克隆命名为 pUC19M, 采用聚合酶链式反应扩增核心蛋白 DNA 序列上下游序列, 将获得的核心蛋白上下 游 DNA 片段连入 pUC19M 载体 ; 将含有一个酶切位点的筛选基因连入含有核心蛋白上下游序 列的 pUC19M 载体, 获得向腺病毒基因组核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入一个酶切位点的穿梭 载体 ; (2) 引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体 将步骤 (1) 中获得的腺病毒基因组核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入一个酶切位点的穿梭 载体经双酶切回收后与重组腺病毒载体质粒共转化 Bj5183 感受态细胞, 经过鉴定后获得 引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体 ; (3) 构建标记基因标记核心蛋白穿梭载体 采用聚合酶链式反应获得标记基因的 DNA 序列, 将标记基因序列连入含有核心蛋白上 下游序列的 pUC19M 载体, 经过鉴定获得标记基因标记核心蛋白的穿梭载体 ; (4) 构建标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体 将步骤 (3) 中获得的标记基因标记核心蛋白的穿梭载体经双酶切回收后与经过线性 化的引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体共转化 Bj5183 感受态细胞, 经过鉴定后获得标 记基因标记核心蛋白的腺病毒质粒载体 ; (5) 标记基因标记核心蛋白腺病毒的包装及纯化 将线性化的标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体转染 HEK293 细胞, 扩增、 分离、 纯 化, 得到标记基因标记核心蛋白的腺病毒, 在冰箱内 -80℃保存。
2: 按照权利要求 1 所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法, 其特征在于 : 所 说的穿梭载体为任何含有核心蛋白开放阅读框上下游 800bp ~ 10kb DNA 序列的任何载体。
3: 按照权利要求 1 所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法, 其特征在于 : 所 说的筛选基因包括抗性基因或 β- 半乳糖苷酶基因。
4: 按照权利要求 1 所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法, 其特征在于 : 所 说的标记基因包括荧光蛋白基因或荧光素酶基因。
5: 按照权利要求 1 所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法, 其特征在于 : 所 说的核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入的酶切位点为重组腺病毒载体本身所不含有的任何酶切 位点。
6: 按照权利要求 1 所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法, 其特征在于 : 所 说的重组腺病毒载体为下列载体中的任意一种 : (1) 用数均分子量为 4000 ~ 8000 的聚乙二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体 ; (2) 腺病毒载体衣壳蛋白的遗传修饰或不修饰的重组腺病毒载体 ; (3) 条件复制型重组腺病毒载体 ; (4) 携带至少一个治疗基因或小干扰 RNA 的条件复制型的重组腺病毒载体 ; (5) 携带至少一个治疗基因或小干扰 RNA 的非复制型的重组腺病毒载体。
7: 按照权利要求 1 或 2 所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法, 其特征在于 : 所说的核心蛋白为腺病毒的核心蛋白Ⅶ或核心蛋白Ⅴ或核心蛋白Ⅹ。

说明书


腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法

    【技术领域】
     本发明属于生物技术领域, 具体涉及到一种腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法。 背景技术 腺病毒有三种核心蛋白, 分别为 pVII、 pV 和 mu。 这些核心蛋白与腺病毒基因组 DNA 结合, 在腺病毒感染细胞后, 核心蛋白会随着病毒基因组 DNA 进入细胞核。因此, 如果对腺 病毒的核心蛋白进行荧光蛋白的标记则可以观察到病毒感染细胞的整个过程。
     由于腺病毒基因组 DNA 核心蛋白基因区域没有合适的限制性内切酶的位点, 因此 通过同源重组的方法对腺病毒核心蛋白进行成功的彻底的遗传标记非常困难。 目前研究报 道标记核心蛋白的方法是在不删除腺病毒基因组原有的核心蛋白基因的前提下, 在腺病毒 基因组 E3 区域插入 CMV 启动子启动的核心蛋白 - 荧光蛋白基因表达元件, 通过这种方法研 究获得了荧光标记核心蛋白的腺病毒。 经过该方法标记的腺病毒基因组同时编码野生型核 心蛋白和荧光标记的核心蛋白, 这两种蛋白要竞争结合到腺病毒基因组 DNA 上, 荧光标记 后的核心蛋白由于分子量和蛋白体积变大, 很难与野生型核心蛋白竞争, 因此荧光蛋白标 记的核心蛋白结合到病毒基因组 DNA 上的效率很低, 这样得到病毒大部分是未经标记或部 分标记的病毒颗粒。
     发明内容
     本发明所要解决技术问题在于克服上述荧光蛋白标记的核心蛋白结合到病毒基 因组 DNA 上效率很低的缺点, 提供一种能快速、 腺病毒核心蛋白完全能够标记的腺病毒核 心蛋白遗传标记载体的构建方法。
     解决上述技术问题采用的技术方案它是由下述步骤组成 :
     1、 构建向腺病毒基因组核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入一个酶切位点的穿梭载体
     采用酶切连接的方式将合成的 DNA 片段连入 pUC19 质粒载体, pUC19 质粒载体为 市场上销售的商品, 由英国 NEB 公司生产, 获得的阳性克隆命名为 pUG19M, 采用聚合酶链式 反应扩增核心蛋白 DNA 序列上下游序列, 将获得的核心蛋白上下游 DNA 片段连入 pUC19M 载 体; 将含有一个酶切位点的筛选基因连入含有核心蛋白上下游序列的 pUC19M 载体, 获得向 腺病毒基因组核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入一个酶切位点的穿梭载体。
     2、 引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体
     将步骤 1 中获得的腺病毒基因组核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入一个酶切位点的穿 梭载体经双酶切回收后与重组腺病毒载体质粒共转化 Bj5183 感受态细胞, 经过鉴定后获 得引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体。
     3、 构建标记基因标记核心蛋白穿梭载体
     采用聚合酶链式反应获得标记基因的 DNA 序列, 将标记基因序列连入含有核心蛋 白上下游序列的 pUC19M 载体, 经过鉴定获得标记基因标记核心蛋白的穿梭载体 ;4、 构建标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体
     将步骤 3 中获得的标记基因标记核心蛋白的穿梭载体经双酶切回收后与经过线 性化的引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体共转化 Bj5183 感受态细胞, 经过鉴定后获得 标记基因标记核心蛋白的腺病毒质粒载体。
     5、 标记基因标记核心蛋白腺病毒的包装及纯化
     将线性化的标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体转染 HEK293 细胞, 扩增、 分 离、 纯化, 得到标记基因标记核心蛋白的腺病毒, 在冰箱内 -80℃保存。
     本发明的穿梭载体为任何含有核心蛋白开放阅读框上下游 800bp ~ 10kb DNA 序 列的任何载体。
     本发明的筛选基因包括抗性基因或 β- 半乳糖苷酶基因。
     本发明的标记基因包括荧光蛋白基因或荧光素酶基因。
     本发明的核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入的酶切位点为重组腺病毒载体本身所不含 有的任何酶切位点。
     本发明的重组腺病毒载体为下列载体中的任意一种 :
     (1) 用数均分子量为 4000 ~ 8000 的聚乙二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载 体; (2) 腺病毒载体衣壳蛋白的遗传修饰或不修饰的重组腺病毒载体 ;
     (3) 条件复制型重组腺病毒载体 ;
     (4) 携带至少一个治疗基因或小干扰 RNA 的条件复制型的重组腺病毒载体 ;
     (5) 携带至少一个治疗基因或小干扰 RNA 的非复制型的重组腺病毒载体 ;
     本发明的核心蛋白为腺病毒的核心蛋白Ⅶ或核心蛋白Ⅴ或核心蛋白Ⅹ。
     本发明采用一种新的标记腺病毒核心蛋白的方法, 该方法实现了对腺病毒核心蛋 白真正意义的遗传水平上的荧光标记, 这种标记方法删除了腺病毒基因组中的原有的核心 蛋白基因, 因此采用本发明的方法标记腺病毒核心蛋白, 可以获得的 100%被荧光蛋白标记 的病毒颗粒。
     附图说明
     图 1 是用于组装核心蛋白 pVII 上下游同源臂的穿梭质粒载体示意图。
     图 2 是核心蛋白 pVII 上下游同源臂连入穿梭质粒载体后的结构示意图。
     图 3 是通过同源重组获得的引入特异 SfuI 酶切位点的腺病毒骨架载体结构示意 图。
     图 4 是核心蛋白 pVII 被红色荧光蛋白 mCherry 标记后的腺病毒载体的结构示意 图。
     图 5 是核心蛋白 pVII 被绿色荧光蛋白 eGFP 标记后的腺病毒载体的结构示意图。
     图 6 是核心蛋白 pVII 被荧光素酶 Luciferase 标记后的腺病毒载体的结构示意 图。 具体实施方式
     下面结合附图和实施例对本发明进一步详细说明, 但本发明并不限于这些实施例。 实施例 1
     以红色荧光蛋白 (mCherry) 标记核心蛋白 pVII 腺病毒载体的构建过程为例其构 建方法步骤如下 :
     1、 构建向腺病毒基因组核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入单一酶切位点的穿梭载体
     通过酶切连接方式将合成的 DNA 序列连入 pUC19 质粒载体, pUC19 质粒载体为市 场上销售的商品, 由英国 NEB 公司生产, 通过质粒提取酶切鉴定以及测序获得阳性克隆, 将 阳性克隆命名为 pUC19M, 载体结构如图 1 所示, 由图 1 可见, 合成的 DNA 序列包含以下酶切 位点 : XbaI-BamHI-SfuI-XhoI-ClaI。
     以腺病毒基因组 DNA 为模板设计两对引物分别用来扩增用于同源重组的核心蛋 白 DNA 序列上下游 1500bp 的 DNA 序列, 上游 DNA 序列包含腺病毒的核心蛋白Ⅶ本身的 DNA 序列。P1-P4 为两对引物的序列 :
     P1 : ATCTAGACATTCCCGCACTGTTGGATGTGGACGCCTA
     P2 : TGGATCCACCTCCACCTCCGTTGCGCGGGGGGCGGGTGCG
     P3 : ACTCGAGATTGCAAGAAAAAACTACTTAGACTC
     P4 : TATCGATTGCGCCTGCAAGGCCACGGATGCAATT
     聚合酶链式反应的条件是 : 94℃ 30 秒, 98℃ 10 秒 55℃ 5 秒 72℃ 2 分钟, 30 个循 环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为 1%的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的 聚合酶链式反应产物与 pGEMT-easy 载体连接。连接条件为 : pGEMT-easy 载体 0.5μl, 聚合 酶链式反应回收产物 4μl, 2×T4DNA 快速连接酶缓冲液 5μl, T4DNA 快速连接酶 0.5μl, 25℃反应 1 个小时后转化感受态的 DH5α 细胞, 并涂布于含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 平板中。挑取菌落接种到含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 培养液中, 14 ~ 16 小时 后, 经碱性裂解法提取质粒 DNA, 通过酶切及测序鉴定获得阳性克隆。将所获得的阳性克隆 分别命名为 pGEMT/pVII no stop up 和 pGEMT/pVII HRdown。将 pVII no stop up 片段从 pGEMT/pVII no stop up 载体上经 XbaI 和 BamHI 双酶切下来, 经 1%的琼脂糖凝胶电泳回收 后连入同样经 XbaI 和 BamHI 酶切过的穿梭载体中。连接条件是 : 4μl 酶切纯化片段, 5μl 2×T4DNA 连接酶缓冲液, 0.5μl 酶切载体, 0.5μl T4 DNA 连接酶。 连接产物采用同样的方 法转化、 提取质粒 DNA、 酶切鉴定获得阳性克隆, 命名为 pUC19M pVII up shuttle。将 pVII HR down 片段从 pGEMT/pVII HR down 载体上经 XhoI 和 ClaI 双酶切下来, 经 1%琼脂糖凝 胶电泳回收后连入同样经 XhoI 和 ClaI 双酶切的 pUC19M pVII up shuttle 载体中。连接 条件是 : 4μl 酶切纯化片段, 5μl 2×T4DNA 连接酶缓冲液, 0.5μl 酶切载体, 0.5μl T4 DNA 连接酶。连接产物采用同样的方法转化、 提取质粒 DNA、 酶切鉴定获得阳性克隆, 命名为 pUC19M pVII up down shuttle, 该载体的结构如图 2 所示, 由图 2 可见, 核心蛋白 pVII 基 因及其上下游基因序列连入 pUC19M 载体中。
     将两端酶切位点为 BamHI 和 SfuI 位点的 β- 半乳糖苷酶基因 (LacZa) 表达元件 连入经过 BamHI 和 SfuI 双酶切的 pUC19M-pVII up down shuttle 载体, 该 β- 半乳糖苷酶 基因 (LacZa) 表达元件也可采用氨苄青霉素、 卡那霉素、 氯霉素等筛选基因中的任意一种 替换。连接条件是 : 4μl 酶切纯化片段, 5μl 2×T4DNA 连接酶缓冲液, 0.5μl 酶切载体, 0.5μl T4 DNA 连接酶。连接产物采用同样的方法转化、 提取质粒 DNA、 酶切鉴定获得阳性
     克隆, 命名为 pUC19M-pVII up down/LacZa shuttle。
     2、 引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体
     将 pUC19M-pVII up down/LacZa shuttle 经 XbaI 和 ClaI 双酶切, 经 1%琼脂糖 凝胶电泳回收大片段后与用数均分子量为 4000 ~ 8000 的聚乙二醇化学修饰的重组腺病 毒质粒载体 pAd5EB214 共转化 Bj5183 感受态细胞, 也可用不经数均分子量为 4000 ~ 8000 的聚乙二醇化学修饰的重组腺病毒载体, 涂布于含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 平板并 加入 50μl 的 40mg/ml 的 X-gal 进行蓝白斑筛选。经摇菌、 提取质粒 DNA、 酶切鉴定获得阳 性克隆, 命名为 pAd5EB214/LacZa, 该腺病毒骨架质粒载体中被引入单一 SfuI 的酶切位点, 该载体的结构如图 3 所示, 上述的单一 SfuI 的酶切位点, 也可采用 PacI、 SwaI 中的任意一 个。由图 3 可见 : 穿梭载体的 pVII up down/LacZaDNA 序列与腺病毒骨架质粒同源重组后 将 SfuI 位点引入腺病毒骨架质粒载体中。
     3、 构建红色荧光蛋白 (mCherry) 标记核心蛋白 pVII 穿梭载体
     根据 mCherry 基因序列设计一对引物扩增 mCherry 基因, P1-P2 为 mCherry 基因 扩增引物 :
     P1 : AAGATCTGGAGGTGGCGGAATGGTGAGCAAGGGCGAG P2 : TGTCGACTTACTTGTACAGCTCGTCCAT
     聚合酶链式反应的条件是 : 94℃ 30 秒, 98℃ 10 秒 55℃ 5 秒 72℃ 2 分钟, 30 个循 环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为 1%的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的 聚合酶链式反应产物与 pGEMT-easy 载体连接。连接条件为 : pGEMT-easy 载体 0.5μl, 聚合 酶链式反应回收产物 4μl, 2×T4DNA 快速连接酶缓冲液 5μl, T4DNA 快速连接酶 0.5μl, 25℃反应 1 个小时后转化感受态的 DH5α 细胞, 并涂布于含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 平板中。挑取菌落接种到含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 培养液中, 14 ~ 16 小时 后, 经碱性裂解法提取质粒 DNA, 通过酶切及测序鉴定阳性克隆。将所获得阳性克隆命名为 pGEMT/mCherry。
     将 mCherry 基因片段从 pGEMT/mCherry 载体上经 BglII 和 SalI 双酶切回收后连 入经 BamHI 和 XhoI 双酶切的 pUC19M pVII up down shuttle 载体中。 连接条件是 : 4μl 酶 切纯化片段, 5μl 2×T4DNA 连接酶缓冲液, 0.5μl 酶切载体, 0.5μl T4DNA 连接酶。连接 产物采用同样的方法转化、 提取质粒 DNA、 酶切鉴定获得阳性克隆, 命名为 pUC19M pVII up down/mCherry shuttle。
     4、 构建红色荧光蛋白 mCherry 标记核心蛋白 pVII 腺病毒质粒载体
     将 pUC19M-pVII up down/mCherry shuttle 质粒载体经 ClaI 和 XbaI 双酶切, 经 1 %琼脂糖凝胶电泳大片段后与经 SfuI 线性化的腺病毒骨架载体 pAd5 EB214/LacZa 共转化 Bj5183, 涂布于含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 平板并加入 50μl 的 40mg/ml 的 X-gal 用来蓝白斑筛选。经摇菌、 提取质粒 DNA、 酶切鉴定获得阳性克隆, 命名为 pAd5 EB214/mCherry, 此载体即为红色荧光标记核心蛋白 pVII 腺病毒质粒载体, 该载体的结构 如图 4 所示, 由图 4 可见, 红色荧光蛋白基因 mCherry 插入在核心蛋白 pVII 下游, 形成 pVII-mCherry 融合蛋白。
     5、 红色荧光蛋白 mCherry 标记核心蛋白 pVII 腺病毒的包装及纯化
     将 PacI 线性化的荧光标记核心蛋白 pVII 腺病毒质粒载体 pAd5 EB214/mCherry
     转染 HEK293 细胞, 7-10 天后收获病毒, 经过 HEK293 细胞大量扩增后采用氯化铯密度梯度离 心纯化病毒, 获得 mCHerry 标记核心蛋白的腺病毒 Ad5/pVII-mCherry, 在冰箱内 -80℃内保 存。
     实施例 2
     以绿色荧光蛋白 (eGFP) 标记核心蛋白 pVII 腺病毒载体的构建过程为例其构建方 法步骤如下 :
     1、 腺病毒基因组核心蛋白 DNA 序列 3’ 端引入单一的酶切位点的穿梭载体
     以腺病毒基因组 DNA 为模板设计两对引物分别用来扩增用于同源重组的核心蛋 白 DNA 序列上下游 800bp 的 DNA 序列, 上游 DNA 序列包含腺病毒的核心蛋白Ⅶ本身的 DNA 序列。P1-P4 为两对引物的序列 :
     P1 : ATCTAGACGCGCCCGCCAGCCCCCACCATCACCACCG
     P2 : TGGATCCACCTCCACCTCCGTTGCGCGGGGGGCGGGTGCG
     P3 : ACTCGAGATTGCAAGAAAAAACTACTTAGACTC
     P4 : TATCGATGAGGCAACCGGGGACGTTTGTGTCTCC
     聚合酶链式反应的条件是 : 94℃ 30 秒, 98℃ 10 秒 55℃ 5 秒 72℃ 1 分钟, 30 个循 环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为 1%的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的 聚合酶链式反应产物与 pGEMT-easy 载体连接。 该步骤中的其他步骤与实施例 1 相同
     2、 引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体
     引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体的构建过程与实施例 1 相同, 获得成功引 入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体 pAd5EB214/LacZa。
     3、 构建绿色荧光蛋白 eGFP 标记核心蛋白 pVII 穿梭载体
     以绿色荧光蛋白 eGFP 基因序列为模板设计引物扩增 eGFP 基因, P1-P2 为 eGFP 基 因扩增引物 :
     P1 : AAGATCTGGAGGTGGCGGAATGGTGAGCAAGGGCGAGGAG
     P2 : TGTCGACTTACTTGTACAGCTCGTCCATGC
     聚合酶链式反应的条件是 : 94℃ 30 秒, 98℃ 10 秒 55℃ 5 秒 72℃ 2 分钟, 30 个循 环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为 1%的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的 聚合酶链式反应产物与 pGEMT-easy 载体连接。连接条件为 : pGEMT-easy 载体 0.5μl, 聚合 酶链式反应回收产物 4μl, 2×T4DNA 快速连接酶缓冲液 5μl, T4DNA 快速连接酶 0.5μl, 25℃反应 1 个小时后转化感受态的 DH5α 细胞, 并涂布于含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 平板中。挑取菌落接种到含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 培养液中, 14 ~ 16 小时 后, 经碱性裂解法提取质粒 DNA, 通过酶切及测序鉴定阳性克隆。将所获得阳性克隆命名为 pGEMT/eGFP。
     将 eGFP 基因片段从 pGEMT/eGFP 载体上经 BgIII 和 SalI 双酶切回收后连入经 BamHI 和 XhoI 双酶切的 pUC19M pVII up down shuttle 载体中。 连接条件是 : 4μl 酶切纯化 片段, 5μl 2×T4DNA 连接酶缓冲液, 0.5μl 酶切载体, 0.5μl T4DNA 连接酶。连接产物采 用同样的方法转化、 提取质粒 DNA、 酶切鉴定获得阳性克隆, 命名为 pUC19M-pVII up down/ eGFP shuttle。
     4、 构建绿色荧光蛋白 eGFP 标记核心蛋白 pVII 腺病毒质粒载体
     绿色荧光蛋白 eGFP 标记核心蛋白 pVII 腺病毒质粒载体的构建过程与实施例 1 相 同, 获得 eGFP 标记核心蛋白 pVII 腺病毒质粒载体 : pAd5EB214/eGFP, 该载体的结构如图 5 所示, 由图 5 可见, 绿色荧光蛋白基因 eGFP 插入在核心蛋白 pVII 下游, 形成 pVII-eGFP 融 合蛋白。
     5、 绿色荧光蛋白 eGFP 标记核心蛋白 pVII 腺病毒的包装及纯化
     绿色荧光蛋白 eGFP 标记核心蛋白 pVII 腺病毒的包装及纯化与实施例 1 相同, 最 终获得 eGFP 标记核心蛋白 pVII 的腺病毒 Ad5/pVII-eGFP。
     本实施例中用于标记核心蛋白 pVII 的绿色荧光蛋白基因 eGFP 也可用黄色荧光蛋 白基因 YFP、 蓝色荧光蛋白基因 EBFP、 青色荧光蛋白基因 ECFP 等荧光蛋白基因替换。
     实施例 3
     以荧光素酶 luciferase 标记核心蛋白 pVII 腺病毒载体的构建过程为例其构建方 法步骤如下 :
     1、 构建腺病毒基因组核心蛋白 DNA 序列 3` 端引入单一的酶切位点的穿梭载体
     以腺病毒基因组 DNA 为模板设计两对引物分别用来扩增用于同源重组的核心蛋 白 DNA 序列上下游 10kb 的 DNA 序列, 上游 DNA 序列包含腺病毒的核心蛋白Ⅶ本身的 DNA 序 列。P1-P4 为两对引物的序列 : P1 : ATCTAGAAAGGTCAACGCTGGTGGCTACCTCTCCGCG
     P2 : TGGATCCACCTCCACCTCCGTTGCGCGGGGGGCGGGTGCG
     P3 : ACTCGAGATTGCAAGAAAAAACTACTTAGACTC
     P4 : TATCGATTCGGCGAACGGGCAGTGCCGGCGGCGC
     聚合酶链式反应的条件是 : 94℃ 30 秒, 98℃ 10 秒 55℃ 5 秒 72℃ 10 分钟, 30 个循 环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为 1%的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的 聚合酶链式反应产物与 pGEMT-easy 载体连接。
     该步骤中的其他步骤与实施例 1 相同。
     2、 引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体
     引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体的构建过程与实施例 1 相同, 获得成功引 入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体 pAd5EB214/LacZa。
     3、 构建荧光素酶 luciferase 标记核心蛋白 pVII 穿梭载体
     以荧光素酶 luciferase 基因序列为模板设计引物扩增 luciferase 基因, P1-P2 为 luciferase 基因扩增引物 :
     P1 : AAGATCTATGGAAGACGCCAAAAACATAAAGAAAGG
     P2 : TTCTAGATTACACGGCGATCTTTCCGCCCTTCTTGG
     聚合酶链式反应的条件是 : 94℃ 30 秒, 98℃ 10 秒 55℃ 5 秒 72℃ 2 分钟, 30 个循 环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为 1%的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的 聚合酶链式反应产物与 pGEMT-easy 载体连接。连接条件为 : pGEMT-easy 载体 0.5μl, 聚合 酶链式反应回收产物 4μl, 2×T4DNA 快速连接酶缓冲液 5μl, T4DNA 快速连接酶 0.5μl, 25℃反应 1 个小时后转化感受态的 DH5α 细胞, 并涂布于含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 平板中。挑取菌落接种到含有 100μg/ml 的氨苄青霉素的 LB 培养液中, 14 ~ 16 小时
     后, 经碱性裂解法提取质粒 DNA, 通过酶切及测序鉴定阳性克隆。将所获得阳性克隆命名为 pGEMT/luciferase。
     将 luciferase 基因片段从 pGEMT/luciferase 载体上经 BglII 和 XbaI 双酶切回 收后连入经 BamHI 和 XhaI 双酶切的 pUC19M pVII up down shuttle 载体中。连接条件是 : 4μl 酶切纯化片段, 5μl 2×T4DNA 连接酶缓冲液, 0.5μl 酶切载体, 0.5μl T4DNA 连接 酶。连接产物采用同样的方法转化、 提取质粒 DNA、 酶切鉴定获得阳性克隆, 命名为 pUC19M pVII up down/luciferase shuttle。
     4、 构建荧光素酶 luciferase 标记核心蛋白 pVII 腺病毒质粒载体
     荧光素酶 luciferase 标记核心蛋白 pVII 腺病毒质粒载体的构建过程与实施例 1 相同, 获得 luciferase 标记核心蛋白 pVII 腺病毒质粒载体 : pAd5EB214/luciferase, 该载 体的结构如图 6 所示, 由图 6 可见, 荧光素酶基因 luciferasw 插入在核心蛋白 pVII 下游, 形成 pVII-luciferase 融合蛋白。
     5、 荧光素酶 luciferase 标记核心蛋白 pVII 腺病毒的包装及纯化
     荧光素酶 luciferase 标记核心蛋白 pVII 腺病毒的包装及纯化与实施例 1 相同, 获得 luciferase 标记核心蛋白 pVII 的腺病毒 Ad5/pVII-luciferase。
     实施例 4
     在以上的实施例 1 ~ 3 的步骤 1 中, 所用的 pVII no stop up 片段用 pVno stop up 片段替换, pVIIHR down 片段用 pV HR down 片段替换, pGEMT/pVII HR down 载体用 pGEMT/pV HR down 载体替换, 该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。 在步骤 2 中, 所用的 pUC19M-pVII up down/LacZashuttle 用 pUC19M-pV up down/LacZa shuttle 替换, 该步骤 的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤 3 中, 所用的 pUC19MpVII up down shuttle 载体 用 pUC19M-pV up down shuttle 载体替换, 该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。 在步骤 4 中, 所用的 pUC 19M-pVII up down/mCherry shuttle 质粒载体用 pUC 19M-pV up down/ mCherry shuttle 质粒载体替换, 该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤 5 中, 所 用的 pVII 腺病毒质粒载体用 pV 腺病毒质粒载体替换, 该步骤的其他步骤与相应的实施例 相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。
     实施例 5
     在以上的实施例 1 ~ 3 的步骤 1 中, 所用的 pVIIno stop up 片段用 pXno stop up 片段替换, pVIIHR down 片段用 pX HR down 片段替换, pGEMT/pVII HR down 载体用 pGEMT/pX HR down 载体替换, 该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。 在步骤 2 中, 所用的 pUC19M-pVII up down/LacZa
     shuttle 用 pUC 19M-pX up down/LacZa shuttle 替换, 该步骤的其他步骤与相应 的实施例相同。在步骤 3 中, 所用的 pUC19M-pVII up down shuttle 载体用 pUC19M-pX up down shuttle 载体替换, 该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤 4 中, 所用的 pUC 19M-pVII up down/mCherry shuttle 质粒载体用 pUC19M-pX up down/mCherry shuttle 质 粒载体替换, 该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤 5 中, 所用的 pVII 腺病毒质 粒载体用 pX 腺病毒质粒载体替换, 该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。构建成腺病毒 核心蛋白遗传标记载体。
     实施例 6在以上的实施例 1 ~ 5 的步骤 2 中, 所用的经数均分子量为 4000 ~ 8000 的聚乙 二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体用腺病毒载体衣壳蛋白的遗传修饰或不修饰的 重组腺病毒载体替换。其他步骤与相应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载 体。
     实施例 7
     在以上的实施例 1 ~ 5 的步骤 2 中, 所用的经数均分子量为 4000 ~ 8000 的聚乙 二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体用条件复制型重组腺病毒载体替换。 其他步骤与 相应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。
     实施例 8
     在以上的实施例 1 ~ 5 的步骤 2 中, 所用的经数均分子量为 4000 ~ 8000 的聚乙 二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体用携带 2 个治疗基因的条件复制型重组腺病毒 载体替换, 也可用携带 1 个小干扰 RNA 的条件复制型的重组腺病毒载体替换。其他步骤与 相应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。
     实施例 9
     在以上的实施例 1 ~ 5 的步骤 2 中, 所用的经数均分子量为 4000 ~ 8000 的聚乙 二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体用携带 1 个治疗基因的非复制型重组腺病毒载 体替换, 也可用携带 2 个小干扰 RNA 的条件复制型的重组腺病毒载体替换。其他步骤与相 应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。

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1、10申请公布号CN101935671A43申请公布日20110105CN101935671ACN101935671A21申请号201010214774622申请日20100630C12N15/65200601C12N15/861200601C12N7/0020060171申请人陕西师范大学地址710062陕西省西安市长安南路199号72发明人夏海滨赵俊丽74专利代理机构西安永生专利代理有限责任公司61201代理人申忠才54发明名称腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法57摘要一种腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法,由构建向腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3端引入一个酶切位点的穿梭载体、引入一个酶。

2、切位点的腺病毒骨架载体、构建标记基因标记核心蛋白穿梭载体、构建标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体、标记基因标记核心蛋白腺病毒的包装及纯化组成。本发明采用一种新的标记腺病毒核心蛋白的方法,该方法实现了对腺病毒核心蛋白真正意义的遗传水平上的荧光标记,这种标记方法删除了腺病毒基因组中的原有的核心蛋白基因,因此采用本发明的方法标记腺病毒核心蛋白,可以获得的100被荧光蛋白标记的病毒颗粒。51INTCL19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书1页说明书8页附图2页CN101935671A1/1页21一种腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法,其特征在于它是由下述步骤组成1构建向腺病毒基因。

3、组核心蛋白DNA序列3端引入一个酶切位点的穿梭载体采用酶切连接的方式将合成的DNA片段连入PUC19质粒载体,获得的阳性克隆命名为PUC19M,采用聚合酶链式反应扩增核心蛋白DNA序列上下游序列,将获得的核心蛋白上下游DNA片段连入PUC19M载体;将含有一个酶切位点的筛选基因连入含有核心蛋白上下游序列的PUC19M载体,获得向腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3端引入一个酶切位点的穿梭载体;2引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体将步骤1中获得的腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3端引入一个酶切位点的穿梭载体经双酶切回收后与重组腺病毒载体质粒共转化BJ5183感受态细胞,经过鉴定后获得引入一个酶切位点的腺。

4、病毒骨架载体;3构建标记基因标记核心蛋白穿梭载体采用聚合酶链式反应获得标记基因的DNA序列,将标记基因序列连入含有核心蛋白上下游序列的PUC19M载体,经过鉴定获得标记基因标记核心蛋白的穿梭载体;4构建标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体将步骤3中获得的标记基因标记核心蛋白的穿梭载体经双酶切回收后与经过线性化的引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体共转化BJ5183感受态细胞,经过鉴定后获得标记基因标记核心蛋白的腺病毒质粒载体;5标记基因标记核心蛋白腺病毒的包装及纯化将线性化的标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体转染HEK293细胞,扩增、分离、纯化,得到标记基因标记核心蛋白的腺病毒,在冰箱内80保存。。

5、2按照权利要求1所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法,其特征在于所说的穿梭载体为任何含有核心蛋白开放阅读框上下游800BP10KBDNA序列的任何载体。3按照权利要求1所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法,其特征在于所说的筛选基因包括抗性基因或半乳糖苷酶基因。4按照权利要求1所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法,其特征在于所说的标记基因包括荧光蛋白基因或荧光素酶基因。5按照权利要求1所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法,其特征在于所说的核心蛋白DNA序列3端引入的酶切位点为重组腺病毒载体本身所不含有的任何酶切位点。6按照权利要求1所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方。

6、法,其特征在于所说的重组腺病毒载体为下列载体中的任意一种1用数均分子量为40008000的聚乙二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体;2腺病毒载体衣壳蛋白的遗传修饰或不修饰的重组腺病毒载体;3条件复制型重组腺病毒载体;4携带至少一个治疗基因或小干扰RNA的条件复制型的重组腺病毒载体;5携带至少一个治疗基因或小干扰RNA的非复制型的重组腺病毒载体。7按照权利要求1或2所述的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法,其特征在于所说的核心蛋白为腺病毒的核心蛋白或核心蛋白或核心蛋白。权利要求书CN101935671A1/8页3腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法技术领域0001本发明属于生物技术领域,具体涉。

7、及到一种腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法。背景技术0002腺病毒有三种核心蛋白,分别为PVII、PV和MU。这些核心蛋白与腺病毒基因组DNA结合,在腺病毒感染细胞后,核心蛋白会随着病毒基因组DNA进入细胞核。因此,如果对腺病毒的核心蛋白进行荧光蛋白的标记则可以观察到病毒感染细胞的整个过程。0003由于腺病毒基因组DNA核心蛋白基因区域没有合适的限制性内切酶的位点,因此通过同源重组的方法对腺病毒核心蛋白进行成功的彻底的遗传标记非常困难。目前研究报道标记核心蛋白的方法是在不删除腺病毒基因组原有的核心蛋白基因的前提下,在腺病毒基因组E3区域插入CMV启动子启动的核心蛋白荧光蛋白基因表达元件,通过。

8、这种方法研究获得了荧光标记核心蛋白的腺病毒。经过该方法标记的腺病毒基因组同时编码野生型核心蛋白和荧光标记的核心蛋白,这两种蛋白要竞争结合到腺病毒基因组DNA上,荧光标记后的核心蛋白由于分子量和蛋白体积变大,很难与野生型核心蛋白竞争,因此荧光蛋白标记的核心蛋白结合到病毒基因组DNA上的效率很低,这样得到病毒大部分是未经标记或部分标记的病毒颗粒。发明内容0004本发明所要解决技术问题在于克服上述荧光蛋白标记的核心蛋白结合到病毒基因组DNA上效率很低的缺点,提供一种能快速、腺病毒核心蛋白完全能够标记的腺病毒核心蛋白遗传标记载体的构建方法。0005解决上述技术问题采用的技术方案它是由下述步骤组成000。

9、61、构建向腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3端引入一个酶切位点的穿梭载体0007采用酶切连接的方式将合成的DNA片段连入PUC19质粒载体,PUC19质粒载体为市场上销售的商品,由英国NEB公司生产,获得的阳性克隆命名为PUG19M,采用聚合酶链式反应扩增核心蛋白DNA序列上下游序列,将获得的核心蛋白上下游DNA片段连入PUC19M载体;将含有一个酶切位点的筛选基因连入含有核心蛋白上下游序列的PUC19M载体,获得向腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3端引入一个酶切位点的穿梭载体。00082、引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体0009将步骤1中获得的腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3端引入一个酶切位点。

10、的穿梭载体经双酶切回收后与重组腺病毒载体质粒共转化BJ5183感受态细胞,经过鉴定后获得引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体。00103、构建标记基因标记核心蛋白穿梭载体0011采用聚合酶链式反应获得标记基因的DNA序列,将标记基因序列连入含有核心蛋白上下游序列的PUC19M载体,经过鉴定获得标记基因标记核心蛋白的穿梭载体;说明书CN101935671A2/8页400124、构建标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体0013将步骤3中获得的标记基因标记核心蛋白的穿梭载体经双酶切回收后与经过线性化的引入一个酶切位点的腺病毒骨架载体共转化BJ5183感受态细胞,经过鉴定后获得标记基因标记核心蛋白的腺病毒质。

11、粒载体。00145、标记基因标记核心蛋白腺病毒的包装及纯化0015将线性化的标记基因标记核心蛋白腺病毒质粒载体转染HEK293细胞,扩增、分离、纯化,得到标记基因标记核心蛋白的腺病毒,在冰箱内80保存。0016本发明的穿梭载体为任何含有核心蛋白开放阅读框上下游800BP10KBDNA序列的任何载体。0017本发明的筛选基因包括抗性基因或半乳糖苷酶基因。0018本发明的标记基因包括荧光蛋白基因或荧光素酶基因。0019本发明的核心蛋白DNA序列3端引入的酶切位点为重组腺病毒载体本身所不含有的任何酶切位点。0020本发明的重组腺病毒载体为下列载体中的任意一种00211用数均分子量为40008000的。

12、聚乙二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体;00222腺病毒载体衣壳蛋白的遗传修饰或不修饰的重组腺病毒载体;00233条件复制型重组腺病毒载体;00244携带至少一个治疗基因或小干扰RNA的条件复制型的重组腺病毒载体;00255携带至少一个治疗基因或小干扰RNA的非复制型的重组腺病毒载体;0026本发明的核心蛋白为腺病毒的核心蛋白或核心蛋白或核心蛋白。0027本发明采用一种新的标记腺病毒核心蛋白的方法,该方法实现了对腺病毒核心蛋白真正意义的遗传水平上的荧光标记,这种标记方法删除了腺病毒基因组中的原有的核心蛋白基因,因此采用本发明的方法标记腺病毒核心蛋白,可以获得的100被荧光蛋白标记的病毒颗粒。。

13、附图说明0028图1是用于组装核心蛋白PVII上下游同源臂的穿梭质粒载体示意图。0029图2是核心蛋白PVII上下游同源臂连入穿梭质粒载体后的结构示意图。0030图3是通过同源重组获得的引入特异SFUI酶切位点的腺病毒骨架载体结构示意图。0031图4是核心蛋白PVII被红色荧光蛋白MCHERRY标记后的腺病毒载体的结构示意图。0032图5是核心蛋白PVII被绿色荧光蛋白EGFP标记后的腺病毒载体的结构示意图。0033图6是核心蛋白PVII被荧光素酶LUCIFERASE标记后的腺病毒载体的结构示意图。具体实施方式0034下面结合附图和实施例对本发明进一步详细说明,但本发明并不限于这些实施说明书C。

14、N101935671A3/8页5例。0035实施例10036以红色荧光蛋白MCHERRY标记核心蛋白PVII腺病毒载体的构建过程为例其构建方法步骤如下00371、构建向腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3端引入单一酶切位点的穿梭载体0038通过酶切连接方式将合成的DNA序列连入PUC19质粒载体,PUC19质粒载体为市场上销售的商品,由英国NEB公司生产,通过质粒提取酶切鉴定以及测序获得阳性克隆,将阳性克隆命名为PUC19M,载体结构如图1所示,由图1可见,合成的DNA序列包含以下酶切位点XBAIBAMHISFUIXHOICLAI。0039以腺病毒基因组DNA为模板设计两对引物分别用来扩增用于同源。

15、重组的核心蛋白DNA序列上下游1500BP的DNA序列,上游DNA序列包含腺病毒的核心蛋白本身的DNA序列。P1P4为两对引物的序列0040P1ATCTAGACATTCCCGCACTGTTGGATGTGGACGCCTA0041P2TGGATCCACCTCCACCTCCGTTGCGCGGGGGGCGGGTGCG0042P3ACTCGAGATTGCAAGAAAAAACTACTTAGACTC0043P4TATCGATTGCGCCTGCAAGGCCACGGATGCAATT0044聚合酶链式反应的条件是9430秒,9810秒555秒722分钟,30个循环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为1的琼脂糖凝胶。

16、电泳后回收片段。将回收的聚合酶链式反应产物与PGEMTEASY载体连接。连接条件为PGEMTEASY载体05L,聚合酶链式反应回收产物4L,2T4DNA快速连接酶缓冲液5L,T4DNA快速连接酶05L,25反应1个小时后转化感受态的DH5细胞,并涂布于含有100G/ML的氨苄青霉素的LB平板中。挑取菌落接种到含有100G/ML的氨苄青霉素的LB培养液中,1416小时后,经碱性裂解法提取质粒DNA,通过酶切及测序鉴定获得阳性克隆。将所获得的阳性克隆分别命名为PGEMT/PVIINOSTOPUP和PGEMT/PVIIHRDOWN。将PVIINOSTOPUP片段从PGEMT/PVIINOSTOPUP。

17、载体上经XBAI和BAMHI双酶切下来,经1的琼脂糖凝胶电泳回收后连入同样经XBAI和BAMHI酶切过的穿梭载体中。连接条件是4L酶切纯化片段,5L2T4DNA连接酶缓冲液,05L酶切载体,05LT4DNA连接酶。连接产物采用同样的方法转化、提取质粒DNA、酶切鉴定获得阳性克隆,命名为PUC19MPVIIUPSHUTTLE。将PVIIHRDOWN片段从PGEMT/PVIIHRDOWN载体上经XHOI和CLAI双酶切下来,经1琼脂糖凝胶电泳回收后连入同样经XHOI和CLAI双酶切的PUC19MPVIIUPSHUTTLE载体中。连接条件是4L酶切纯化片段,5L2T4DNA连接酶缓冲液,05L酶切载。

18、体,05LT4DNA连接酶。连接产物采用同样的方法转化、提取质粒DNA、酶切鉴定获得阳性克隆,命名为PUC19MPVIIUPDOWNSHUTTLE,该载体的结构如图2所示,由图2可见,核心蛋白PVII基因及其上下游基因序列连入PUC19M载体中。0045将两端酶切位点为BAMHI和SFUI位点的半乳糖苷酶基因LACZA表达元件连入经过BAMHI和SFUI双酶切的PUC19MPVIIUPDOWNSHUTTLE载体,该半乳糖苷酶基因LACZA表达元件也可采用氨苄青霉素、卡那霉素、氯霉素等筛选基因中的任意一种替换。连接条件是4L酶切纯化片段,5L2T4DNA连接酶缓冲液,05L酶切载体,05LT4D。

19、NA连接酶。连接产物采用同样的方法转化、提取质粒DNA、酶切鉴定获得阳性说明书CN101935671A4/8页6克隆,命名为PUC19MPVIIUPDOWN/LACZASHUTTLE。00462、引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体0047将PUC19MPVIIUPDOWN/LACZASHUTTLE经XBAI和CLAI双酶切,经1琼脂糖凝胶电泳回收大片段后与用数均分子量为40008000的聚乙二醇化学修饰的重组腺病毒质粒载体PAD5EB214共转化BJ5183感受态细胞,也可用不经数均分子量为40008000的聚乙二醇化学修饰的重组腺病毒载体,涂布于含有100G/ML的氨苄青霉素的LB平板并加入。

20、50L的40MG/ML的XGAL进行蓝白斑筛选。经摇菌、提取质粒DNA、酶切鉴定获得阳性克隆,命名为PAD5EB214/LACZA,该腺病毒骨架质粒载体中被引入单一SFUI的酶切位点,该载体的结构如图3所示,上述的单一SFUI的酶切位点,也可采用PACI、SWAI中的任意一个。由图3可见穿梭载体的PVIIUPDOWN/LACZADNA序列与腺病毒骨架质粒同源重组后将SFUI位点引入腺病毒骨架质粒载体中。00483、构建红色荧光蛋白MCHERRY标记核心蛋白PVII穿梭载体0049根据MCHERRY基因序列设计一对引物扩增MCHERRY基因,P1P2为MCHERRY基因扩增引物0050P1AAG。

21、ATCTGGAGGTGGCGGAATGGTGAGCAAGGGCGAG0051P2TGTCGACTTACTTGTACAGCTCGTCCAT0052聚合酶链式反应的条件是9430秒,9810秒555秒722分钟,30个循环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为1的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的聚合酶链式反应产物与PGEMTEASY载体连接。连接条件为PGEMTEASY载体05L,聚合酶链式反应回收产物4L,2T4DNA快速连接酶缓冲液5L,T4DNA快速连接酶05L,25反应1个小时后转化感受态的DH5细胞,并涂布于含有100G/ML的氨苄青霉素的LB平板中。挑取菌落接种到含有100G/ML的氨。

22、苄青霉素的LB培养液中,1416小时后,经碱性裂解法提取质粒DNA,通过酶切及测序鉴定阳性克隆。将所获得阳性克隆命名为PGEMT/MCHERRY。0053将MCHERRY基因片段从PGEMT/MCHERRY载体上经BGLII和SALI双酶切回收后连入经BAMHI和XHOI双酶切的PUC19MPVIIUPDOWNSHUTTLE载体中。连接条件是4L酶切纯化片段,5L2T4DNA连接酶缓冲液,05L酶切载体,05LT4DNA连接酶。连接产物采用同样的方法转化、提取质粒DNA、酶切鉴定获得阳性克隆,命名为PUC19MPVIIUPDOWN/MCHERRYSHUTTLE。00544、构建红色荧光蛋白MC。

23、HERRY标记核心蛋白PVII腺病毒质粒载体0055将PUC19MPVIIUPDOWN/MCHERRYSHUTTLE质粒载体经CLAI和XBAI双酶切,经1琼脂糖凝胶电泳大片段后与经SFUI线性化的腺病毒骨架载体PAD5EB214/LACZA共转化BJ5183,涂布于含有100G/ML的氨苄青霉素的LB平板并加入50L的40MG/ML的XGAL用来蓝白斑筛选。经摇菌、提取质粒DNA、酶切鉴定获得阳性克隆,命名为PAD5EB214/MCHERRY,此载体即为红色荧光标记核心蛋白PVII腺病毒质粒载体,该载体的结构如图4所示,由图4可见,红色荧光蛋白基因MCHERRY插入在核心蛋白PVII下游,形。

24、成PVIIMCHERRY融合蛋白。00565、红色荧光蛋白MCHERRY标记核心蛋白PVII腺病毒的包装及纯化0057将PACI线性化的荧光标记核心蛋白PVII腺病毒质粒载体PAD5EB214/MCHERRY说明书CN101935671A5/8页7转染HEK293细胞,710天后收获病毒,经过HEK293细胞大量扩增后采用氯化铯密度梯度离心纯化病毒,获得MCHERRY标记核心蛋白的腺病毒AD5/PVIIMCHERRY,在冰箱内80内保存。0058实施例20059以绿色荧光蛋白EGFP标记核心蛋白PVII腺病毒载体的构建过程为例其构建方法步骤如下00601、腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3端引入。

25、单一的酶切位点的穿梭载体0061以腺病毒基因组DNA为模板设计两对引物分别用来扩增用于同源重组的核心蛋白DNA序列上下游800BP的DNA序列,上游DNA序列包含腺病毒的核心蛋白本身的DNA序列。P1P4为两对引物的序列0062P1ATCTAGACGCGCCCGCCAGCCCCCACCATCACCACCG0063P2TGGATCCACCTCCACCTCCGTTGCGCGGGGGGCGGGTGCG0064P3ACTCGAGATTGCAAGAAAAAACTACTTAGACTC0065P4TATCGATGAGGCAACCGGGGACGTTTGTGTCTCC0066聚合酶链式反应的条件是9430秒,9。

26、810秒555秒721分钟,30个循环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为1的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的聚合酶链式反应产物与PGEMTEASY载体连接。0067该步骤中的其他步骤与实施例1相同00682、引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体0069引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体的构建过程与实施例1相同,获得成功引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体PAD5EB214/LACZA。00703、构建绿色荧光蛋白EGFP标记核心蛋白PVII穿梭载体0071以绿色荧光蛋白EGFP基因序列为模板设计引物扩增EGFP基因,P1P2为EGFP基因扩增引物0072P1AAGATCTGGAGGTGGCGG。

27、AATGGTGAGCAAGGGCGAGGAG0073P2TGTCGACTTACTTGTACAGCTCGTCCATGC0074聚合酶链式反应的条件是9430秒,9810秒555秒722分钟,30个循环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为1的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的聚合酶链式反应产物与PGEMTEASY载体连接。连接条件为PGEMTEASY载体05L,聚合酶链式反应回收产物4L,2T4DNA快速连接酶缓冲液5L,T4DNA快速连接酶05L,25反应1个小时后转化感受态的DH5细胞,并涂布于含有100G/ML的氨苄青霉素的LB平板中。挑取菌落接种到含有100G/ML的氨苄青霉素的LB培养液。

28、中,1416小时后,经碱性裂解法提取质粒DNA,通过酶切及测序鉴定阳性克隆。将所获得阳性克隆命名为PGEMT/EGFP。0075将EGFP基因片段从PGEMT/EGFP载体上经BGIII和SALI双酶切回收后连入经BAMHI和XHOI双酶切的PUC19MPVIIUPDOWNSHUTTLE载体中。连接条件是4L酶切纯化片段,5L2T4DNA连接酶缓冲液,05L酶切载体,05LT4DNA连接酶。连接产物采用同样的方法转化、提取质粒DNA、酶切鉴定获得阳性克隆,命名为PUC19MPVIIUPDOWN/EGFPSHUTTLE。说明书CN101935671A6/8页800764、构建绿色荧光蛋白EGFP。

29、标记核心蛋白PVII腺病毒质粒载体0077绿色荧光蛋白EGFP标记核心蛋白PVII腺病毒质粒载体的构建过程与实施例1相同,获得EGFP标记核心蛋白PVII腺病毒质粒载体PAD5EB214/EGFP,该载体的结构如图5所示,由图5可见,绿色荧光蛋白基因EGFP插入在核心蛋白PVII下游,形成PVIIEGFP融合蛋白。00785、绿色荧光蛋白EGFP标记核心蛋白PVII腺病毒的包装及纯化0079绿色荧光蛋白EGFP标记核心蛋白PVII腺病毒的包装及纯化与实施例1相同,最终获得EGFP标记核心蛋白PVII的腺病毒AD5/PVIIEGFP。0080本实施例中用于标记核心蛋白PVII的绿色荧光蛋白基因E。

30、GFP也可用黄色荧光蛋白基因YFP、蓝色荧光蛋白基因EBFP、青色荧光蛋白基因ECFP等荧光蛋白基因替换。0081实施例30082以荧光素酶LUCIFERASE标记核心蛋白PVII腺病毒载体的构建过程为例其构建方法步骤如下00831、构建腺病毒基因组核心蛋白DNA序列3端引入单一的酶切位点的穿梭载体0084以腺病毒基因组DNA为模板设计两对引物分别用来扩增用于同源重组的核心蛋白DNA序列上下游10KB的DNA序列,上游DNA序列包含腺病毒的核心蛋白本身的DNA序列。P1P4为两对引物的序列0085P1ATCTAGAAAGGTCAACGCTGGTGGCTACCTCTCCGCG0086P2TGGA。

31、TCCACCTCCACCTCCGTTGCGCGGGGGGCGGGTGCG0087P3ACTCGAGATTGCAAGAAAAAACTACTTAGACTC0088P4TATCGATTCGGCGAACGGGCAGTGCCGGCGGCGC0089聚合酶链式反应的条件是9430秒,9810秒555秒7210分钟,30个循环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为1的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的聚合酶链式反应产物与PGEMTEASY载体连接。0090该步骤中的其他步骤与实施例1相同。00912、引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体0092引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体的构建过程与实施例1相同,获得成功。

32、引入单一的酶切位点的腺病毒骨架载体PAD5EB214/LACZA。00933、构建荧光素酶LUCIFERASE标记核心蛋白PVII穿梭载体0094以荧光素酶LUCIFERASE基因序列为模板设计引物扩增LUCIFERASE基因,P1P2为LUCIFERASE基因扩增引物0095P1AAGATCTATGGAAGACGCCAAAAACATAAAGAAAGG0096P2TTCTAGATTACACGGCGATCTTTCCGCCCTTCTTGG0097聚合酶链式反应的条件是9430秒,9810秒555秒722分钟,30个循环。聚合酶链式反应扩增产物经质量浓度为1的琼脂糖凝胶电泳后回收片段。将回收的聚合酶。

33、链式反应产物与PGEMTEASY载体连接。连接条件为PGEMTEASY载体05L,聚合酶链式反应回收产物4L,2T4DNA快速连接酶缓冲液5L,T4DNA快速连接酶05L,25反应1个小时后转化感受态的DH5细胞,并涂布于含有100G/ML的氨苄青霉素的LB平板中。挑取菌落接种到含有100G/ML的氨苄青霉素的LB培养液中,1416小时说明书CN101935671A7/8页9后,经碱性裂解法提取质粒DNA,通过酶切及测序鉴定阳性克隆。将所获得阳性克隆命名为PGEMT/LUCIFERASE。0098将LUCIFERASE基因片段从PGEMT/LUCIFERASE载体上经BGLII和XBAI双酶切。

34、回收后连入经BAMHI和XHAI双酶切的PUC19MPVIIUPDOWNSHUTTLE载体中。连接条件是4L酶切纯化片段,5L2T4DNA连接酶缓冲液,05L酶切载体,05LT4DNA连接酶。连接产物采用同样的方法转化、提取质粒DNA、酶切鉴定获得阳性克隆,命名为PUC19MPVIIUPDOWN/LUCIFERASESHUTTLE。00994、构建荧光素酶LUCIFERASE标记核心蛋白PVII腺病毒质粒载体0100荧光素酶LUCIFERASE标记核心蛋白PVII腺病毒质粒载体的构建过程与实施例1相同,获得LUCIFERASE标记核心蛋白PVII腺病毒质粒载体PAD5EB214/LUCIFER。

35、ASE,该载体的结构如图6所示,由图6可见,荧光素酶基因LUCIFERASW插入在核心蛋白PVII下游,形成PVIILUCIFERASE融合蛋白。01015、荧光素酶LUCIFERASE标记核心蛋白PVII腺病毒的包装及纯化0102荧光素酶LUCIFERASE标记核心蛋白PVII腺病毒的包装及纯化与实施例1相同,获得LUCIFERASE标记核心蛋白PVII的腺病毒AD5/PVIILUCIFERASE。0103实施例40104在以上的实施例13的步骤1中,所用的PVIINOSTOPUP片段用PVNOSTOPUP片段替换,PVIIHRDOWN片段用PVHRDOWN片段替换,PGEMT/PVIIHR。

36、DOWN载体用PGEMT/PVHRDOWN载体替换,该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤2中,所用的PUC19MPVIIUPDOWN/LACZASHUTTLE用PUC19MPVUPDOWN/LACZASHUTTLE替换,该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤3中,所用的PUC19MPVIIUPDOWNSHUTTLE载体用PUC19MPVUPDOWNSHUTTLE载体替换,该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤4中,所用的PUC19MPVIIUPDOWN/MCHERRYSHUTTLE质粒载体用PUC19MPVUPDOWN/MCHERRYSHUTTLE质粒载体替换,该步骤的其他步骤与。

37、相应的实施例相同。在步骤5中,所用的PVII腺病毒质粒载体用PV腺病毒质粒载体替换,该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。0105实施例50106在以上的实施例13的步骤1中,所用的PVIINOSTOPUP片段用PXNOSTOPUP片段替换,PVIIHRDOWN片段用PXHRDOWN片段替换,PGEMT/PVIIHRDOWN载体用PGEMT/PXHRDOWN载体替换,该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤2中,所用的PUC19MPVIIUPDOWN/LACZA0107SHUTTLE用PUC19MPXUPDOWN/LACZASHUTTLE替换,该步骤的其他步骤。

38、与相应的实施例相同。在步骤3中,所用的PUC19MPVIIUPDOWNSHUTTLE载体用PUC19MPXUPDOWNSHUTTLE载体替换,该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤4中,所用的PUC19MPVIIUPDOWN/MCHERRYSHUTTLE质粒载体用PUC19MPXUPDOWN/MCHERRYSHUTTLE质粒载体替换,该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。在步骤5中,所用的PVII腺病毒质粒载体用PX腺病毒质粒载体替换,该步骤的其他步骤与相应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。0108实施例6说明书CN101935671A8/8页100109在以上的实施例15的步。

39、骤2中,所用的经数均分子量为40008000的聚乙二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体用腺病毒载体衣壳蛋白的遗传修饰或不修饰的重组腺病毒载体替换。其他步骤与相应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。0110实施例70111在以上的实施例15的步骤2中,所用的经数均分子量为40008000的聚乙二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体用条件复制型重组腺病毒载体替换。其他步骤与相应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。0112实施例80113在以上的实施例15的步骤2中,所用的经数均分子量为40008000的聚乙二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体用携带2个治疗基因的条件复制型重组腺病毒载体替换,也可用携带1个小干扰RNA的条件复制型的重组腺病毒载体替换。其他步骤与相应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。0114实施例90115在以上的实施例15的步骤2中,所用的经数均分子量为40008000的聚乙二醇化学修饰或不修饰的重组腺病毒载体用携带1个治疗基因的非复制型重组腺病毒载体替换,也可用携带2个小干扰RNA的条件复制型的重组腺病毒载体替换。其他步骤与相应的实施例相同。构建成腺病毒核心蛋白遗传标记载体。说明书CN101935671A1/2页11图1图2图3图4图5说明书附图CN101935671A2/2页12图6说明书附图。

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