一种快速提取鱼类DNA进行聚合酶链式反应的方法 【技术领域】
本发明涉及到DNA的制备,特别是涉及到鱼类DNA的制备。
背景技术 提取鱼类DNA进行聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)是鱼类分子生物学研究的一种基础手段,近年来研究人员发明了多种用蛋白酶K提取鱼类DNA的方法,用这种方法提取鱼类DNA的时间一般需要4小时以上,提取的时间较长,增加了大规模PCR扩增的难度,降低了大规模扩增遗传图谱的建立、种质资源的鉴定、遗传进化分析等的效率。
发明内容 本发明的目的在于克服上述技术的不足,提供一种快速提取鱼类DNA进行PCR扩增的方法,它是一种在20‑30分钟提取鱼类DNA进行PCR扩增的方法。
本发明需要的主要材料包括有:酒精保存的鱼类的鳍条、氢氧化钠、Tris‑HCl、β‑巯基乙醇、聚乙烯吡咯烷酮。
本发明提取鱼类DNA用以PCR扩展保存的方法如下:
(1)将0.05‑0.15g酒精保存的鱼鳍条放入1.5ml离心管中,加入200‑400微升0.3‑0.6mol/L氢氧化钠溶液、2‑4微升β‑巯基乙醇、1‑4微克聚乙烯吡咯烷酮,然后将离心管在65‑85℃水中水浴10‑15分钟;
(2)再加入200‑400微升0.3‑0.6mol/LTris‑HCl,摇晃2分钟,然后在高速离心泵上离心10‑15分钟;
(3)将离心后的离心管中的上清液取200微升,转至新的离心管中,用以进行PCR扩增;
(4)若要长期保存鱼类DNA,可将上述装有200微升上清液的离心管中加入200微升95%酒精、10‑24微克的醋酸钠,摇晃离心管让其混匀,然后在‑20℃环境中放置20分钟;
(5)将在‑20℃环境中放置20分钟后的离心管,在高速离心泵离心15分钟,将离心管倒置于滤纸上去掉上清液;
(6)再将去掉上清液的离心管中加入80%酒精300‑600微升,放置5‑10分钟后,高速离心泵离心5分钟,将离心管倒置于滤纸上去掉上清液;
(7)将去掉上清液的离心管在40‑50℃下放置5‑10分钟以干燥DNA;
(8)再将离心管中加入10‑50微升Tris‑EDTA,以溶解干燥的DNA,‑20℃环境冷冻保存。
本发明的有益效果为:
1、本发明能在20‑30分钟内就可以获得用于PCR扩增质量的鱼类DNA样品,比原来需要4小时以上提取鱼类DNA的方法大大的缩短了时间,提高了工作效率;
2、本发明成本低、价格廉,其稳定性、快速性、准确性优于原来提取鱼类DNA的方法;
3、本发明提取的鱼类DNA后既可以进行PCR扩增,还可以冷冻保存备用。
【具体实施方式】
下面结合实施例进一步说明本发明。
实施例1
1、取0.1g酒精保存的白鲢鳍条放入1.5ml离心管中,加入200微升0.5摩尔氢氧化钠溶液,2微升β‑巯基乙醇,2微克聚乙烯吡咯烷酮,然后将离心管在75℃水中水浴12分钟;
2、再将离心管中加入200微升0.5mol/LTris‑HCl,摇晃2分钟,然后在13000rpm高速离心泵上离心10分钟;
3、再将上述离心管中取出200微升上清液,倒入另一支1.5ml离心管中进行PCR扩增;
为了保证提取的白鲢鳍条DNA质量,还要对其进行质量检测。
DNA质量检验:
用1%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量,DNA纯度用紫外分光光度计的A260/A280位来确定。
SSR及线粒体的PCR扩增:
PCR扩增反应在扩增仪上进行,反应条件如下:94℃预变性5分钟,共32个循环;94℃变性45秒,还原45秒,72℃延伸45秒,最后72℃延伸10分钟。
SSR扩增产物通过12%的非交性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染后分析。另外,线粒体DNA的扩增产物用1%琼脂糖凝胶电泳检测。
实施例2
1、取0.1g酒精保存的白鲢鳍条按上述1‑3步骤操作后,得到1.5ml离心管中装有200微升的上清液;
2、在上述离心管中加入200微升95%的酒精,0.1摩尔的醋酸钠溶液5微升,摇晃离心管,使其混匀,在‑20℃环境中放置10分钟;
3、将离心管在12000rpm高速离心泵上离心15分钟,将离心管倒置于滤纸上去掉上清液;
4、在离心管中加入80%酒精500微升,室温下放置6分钟,12000rpm离心5分钟,倒置于滤纸上去掉上清液;
5、将离心管放置50℃的环境中干燥10分钟;
6、在离心管中加入10微升Tris‑EDTA,以溶解其干燥的DNA,然后在‑20℃环境中冷冻保存。