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本发明提供一种筛选-聚赖氨酸高产菌的方法,其特征在于,在培养基中添加带电荷的指示剂,根据所述指示剂与-聚赖氨酸的特殊反应所形成的透明圈径或聚集圈径的大小,筛选-聚赖氨酸高产菌。本发明的筛选方法不但可高效直观地将-聚赖氨酸产生菌与其他微生物区分开来,而且可以取代繁琐的摇瓶发酵筛选方法,在平板上简单直观地筛选-聚赖氨酸产生菌的高产菌。本发明工艺简单、工作量小、周期短、筛选效率较高。。