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本发明公开了生物认证系统和生物认证方法。提供了一种生物认证系统,包括被划分为第一组和第二组的多个信息处理设备,第一组用于基于与生物信息相关联的用户的生物图案所独有的特征量信息来执行初次认证并且指定被指派给用户的标识号,第二组用于基于标识号和预先登记的登记生物信息来对在初次认证中成功的生物信息执行二次认证。输入的生物信息被发送到属于第一组的所有信息处理设备,在初次认证中成功的生物信息作为排队信息被添。