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本发明实施方式大致关于提供一种用来在基板处理装置中形成改良薄膜单一或多结太阳能电池的方法与设备。实施方式之一提供一种系统,其中包含至少一处理腔室,其适以沉积一或多层用以形成一部分的太阳能电池。在一实施方式中,通过在沉积该一或多层于该基板上之前,在该处理腔室内表面执行清洁处理,来减少可在该处理区中进行处理的基板上的污染物量。此清洁处理包括沉积可捕捉在处理腔室中发现的污染物的层(如,干燥层或钝化层)。。