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1、10申请公布号CN104212802A43申请公布日20141217CN104212802A21申请号201410495099722申请日20140925C12N15/113201001C12N15/89200601C12N15/85200601C12N15/861200601A61K48/00200601A61P35/0020060171申请人中国人民解放军第二军医大学东方肝胆外科医院地址200438上海市杨浦区长海路225号申请人上海白泽生物科技有限公司72发明人钱其军金华君李振海吕赛群吴红平丁娜李林芳俞德超吴孟超74专利代理机构中国国际贸易促进委员会专利商标事务所11038代理人刘海罗5。
2、4发明名称一种肿瘤细胞广谱高活性启动子及其用途57摘要本发明属于分子生物学领域,涉及一种肿瘤细胞广谱高活性启动子及其用途。所述启动子能在肿瘤细胞内广谱高效表达外源基因,其在一系列肿瘤细胞中的表达活性高于现有的CAG启动子,且序列稳定不会在原核细胞及真核细胞转移过程中发生序列丢失。该启动子可适用于在肿瘤基因治疗过程中,驱动外源基因在肿瘤细胞内的高效表达。51INTCL权利要求书2页说明书15页序列表18页附图4页19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书2页说明书15页序列表18页附图4页10申请公布号CN104212802ACN104212802A1/2页21一种分离的多核苷酸。
3、,其包含如下元件HCMV增强子、ACTIN启动子和MCMV增强子;具体地,其还包含UBI增强子;更具体地,UBI增强子位于上述3种元件的下游;具体地,上述4种元件各自独立地为1个、2个、3个或3个以上;具体地,所述多核苷酸具有启动子功能。2根据权利要求1所述的多核苷酸,其依次包含HCMV增强子ACTIN启动子MCMV增强子,或者MCMV增强子HCMV增强子ACTIN启动子;优选地,其依次包含HCMV增强子ACTIN启动子MCMV增强子UBI增强子,或者MCMV增强子HCMV增强子ACTIN启动子UBI增强子。3根据权利要求1所述的多核苷酸,其中HCMV增强子的核苷酸序列如SEQIDNO17所示。
4、;ACTIN启动子的核苷酸序列如SEQIDNO18所示;MCMV增强子的核苷酸序列如SEQIDNO19或SEQIDNO20所示;优选为SEQIDNO20;UBI增强子的核苷酸序列如SEQIDNO21所示。4根据权利要求1至3中任一项所述的多核苷酸,其各个元件之间有或没有连接序列或者剪接位点;具体地,在MCMV增强子和/或HCMV增强子和/或UBI增强子的上游和下游分别有剪接供体和剪接受体;更具体地,所述剪接供体的核苷酸序列如SEQIDNO22所示;所述剪接受体的核苷酸序列如SEQIDNO23所示。5一种分离的多核苷酸,其包含或者为选自如下的AE中任意一组的多核苷酸ASEQIDNO1SEQIDN。
5、O4中任一序列所示的多核苷酸;B与SEQIDNO1SEQIDNO4中任一序列互补的多核苷酸;C在高等严紧条件下能够与上述A或B的多核苷酸杂交并具有启动子功能的多核苷酸;D对上述A或B所示多核苷酸进行一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰并具有启动子功能的多核苷酸;和E与上述A或B所示多核苷酸具有至少90同一性并具有启动子功能的多核苷酸;具体地,A或B中的多核苷酸具有启动子功能。6一种核酸构建体,包含权利要求1至5中任一项所述的多核苷酸,以及可操作地连接的外源基因;具体地,所述外源基因选自P53、GMCSF、IL2、IL12、IL24、TRAIL、P16、TK、IFN、TNF、RB、SIRP等中的。
6、任意一种或多种;具体地,所述外源基因为SEQIDNO12所示P53和/或SEQIDNO4所示GMCSF。7一种重组载体,其含有权利要求1至5中任一项所述的多核苷酸或者权利要求6所述的核酸构建体;具体地,所述重组载体为重组病毒载体;具体地,所述重组载体为权利要求1至5中任一项所述的多核苷酸或者权利要求6所述的核酸构建体与PDC315质粒或SG655经重组得到的重组载体。8一种药用组合物,其包含权利要求1至5中任一项所述的多核苷酸或者权利要求6权利要求书CN104212802A2/2页3所述的核酸构建体或者权利要求7所述的重组载体,以及可选的药学上可接受的辅料。9选自如下的1或2的用途1权利要求1。
7、至5中任一项所述的多核苷酸或者权利要求6所述的核酸构建体或者权利要求7所述的重组载体在制备治疗和/或预防和/或辅助治疗癌症或者抗肿瘤的药物中的用途;具体地,所述癌症或者肿瘤为肺癌、肝细胞癌、淋巴瘤、结肠癌、大肠癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、胆管癌、胆囊癌、食管癌、肾癌、神经胶质瘤、黑色素瘤、胰腺癌或前列腺癌;2权利要求1至5中任一项所述的多核苷酸或者权利要求6所述的核酸构建体或者权利要求7所述的重组载体在制备抑制肿瘤细胞的药物或者试剂中的用途;具体地,所述肿瘤细胞为如下肿瘤的细胞肺癌、肝细胞癌、淋巴瘤、结肠癌、大肠癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、胆管癌、胆囊癌、食管癌、肾癌、神经胶质瘤、。
8、黑色素瘤、胰腺癌或前列腺癌;在具体的实施方案中,所述肿瘤细胞为选自HEP3B、HUH7、HEPG2、PLC/PRF/5、BEL7404、H460和H1299细胞中的任意一种。10一种在体内或体外抑制肿瘤细胞的方法,包括使用有效量的权利要求1至5中任一项所述的多核苷酸或者权利要求6所述的核酸构建体或者权利要求7所述的重组载体的步骤;具体地,所述肿瘤细胞为如下肿瘤的细胞肺癌、肝细胞癌、淋巴瘤、结肠癌、大肠癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、胆管癌、胆囊癌、食管癌、肾癌、神经胶质瘤、黑色素瘤、胰腺癌或前列腺癌;在具体的实施方案中,所述肿瘤细胞为选自HEP3B、HUH7、HEPG2、PLC/PRF/5、。
9、BEL7404、H460和H1299细胞中的任意一种。11权利要求1至5中任一项所述的多核苷酸在作为启动子中的用途。12一种分离的多核苷酸,其包含或者为SEQIDNO20所示的核苷酸序列或其互补序列。13权利要求12所述的多核苷酸在制备启动子中的用途;具体地,所述启动子为具有启动子功能的权利要求1至5中任一项所述的多核苷酸。权利要求书CN104212802A1/15页4一种肿瘤细胞广谱高活性启动子及其用途技术领域0001本发明属于分子生物学领域,涉及一种肿瘤细胞广谱高活性启动子及其用途。所述启动子为人工合成的嵌合启动子,该启动子在肿瘤细胞中具有广谱的高活性。本发明还涉及含有该启动子的重组载体、。
10、重组病毒、以及所述启动子控制治疗基因用于基因治疗的用途。背景技术0002启动子是基因的一个组成部分,通常位于结构基因5端上游,是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列。启动子能够指导全酶HOLOENZYME同模板正确结合,活化RNA聚合酶,启动基因转录,从而控制基因表达转录的起始时间和表达的程度。启动子是影响转基因表达效率的重要因素之一,选择高效率的启动子是高效率表达外源基因的关键。0003根据启动子的转录模式可将其分为3类组成型启动子、组织或器官特异性启动子和诱导型启动子。所谓组成型启动子是指在组成型启动子调控下,不同组织器官和发育阶段的基因表达没有明显差异,因而称之组成型启动子。。
11、0004哺乳动物中常用的组成型启动子包括病毒来源鼠或人巨细胞病毒CMV启动子分别简称MCMV与HCMV、猴空泡病毒SV40启动子;人基因组天然来源EF1启动子、泛素启动子UBIQUITIN,简称UBI、ACTIN启动子、PGK1启动子、ROSA26启动子、HSP70启动子、GAPDH启动子、EIF4A1启动子、EGR1启动子、FERH启动子、SM22启动子、ENDOTHELIN1启动子等。0005哺乳动物常用组织特异性启动子有B29启动子B细胞特异性、CD14启动子单个核细胞特异性、CD43启动子淋巴细胞及血小板特异性、CD45及INF启动子造血细胞特异性、CD68启动子巨噬细胞特异性、DES。
12、MIN及MYOGLOBIN启动子肌肉细胞特异性、CD105及CD102启动子内皮细胞特异性、GFAP启动子星形胶质细胞特异性、GPIIB启动子巨核细胞特异性、SURFACTANTPROTEINB启动子肺特异性、NSE启动子成熟神经元细胞特异性、ALB启动子肝特异性等。0006常用肿瘤特异性启动子有AFP启动子肝癌特异性、CCKAR启动子胰腺癌特异性、PSA启动子前列腺癌特异性、TYR启动子黑色素瘤特异性、HTERT启动子/CEA启动子/SURVIVIN启动子/CXCR4启动子/COX2/LPLASTIN启动子/EPIDIDYMISPROTEIN4启动子/E2F1启动子肿瘤广谱特异性等。0007。
13、常用诱导型启动子有基于四环素TET系统的诱导型启动子包括TETON或TETOFF、脱皮激素类诱导系统的诱导型启动子、FK506调控系统的诱导型启动子、纳巴霉素诱导系统的诱导型启动子、RU486诱导系统的诱导型启动子等。0008在肿瘤基因治疗中,维持外源基因的高效稳定表达非常重要。然而,一些病毒来源的组成型启动子尽管瞬时表达活性较高如CMV启动子,但容易因表观遗传修饰而被关闭表达;而一些人源天然组成型启动子或肿瘤特异性启动子虽然表达稳定,但表达活性相说明书CN104212802A2/15页5对较弱,难以满足基因治疗需求。因而,研究人员又设计构建了一系列人工嵌合启动子,它们包含了一些顺式调控元件,。
14、主要包括能发挥稳定表达作用的启动子核心序列,以及能增强表达效率的上游增强子或下游内含子,代表者是嵌合启动子CAG包含人CMV增强子鸡ACTIN启动子兔GLOBIN内含子,广泛应用于外源基因的表达。0009尚需要开发适合在肿瘤细胞内广谱高效表达外源基因的启动子,其在一系列肿瘤细胞中的表达活性高于CAG启动子,且序列稳定不会在原核细胞及真核细胞转移过程中发生序列丢失,并能够适用于驱动外源基因在肿瘤细胞内的高效表达。发明内容0010本发明人经过大量的试验和创造性的劳动,设计构建了一系列新型嵌合启动子,并从中筛选获得一个能在肿瘤细胞内广谱高效表达外源基因的启动子。本发明人惊奇地发现,该启动子序列稳定,。
15、不会随着其在原核细胞或真核细胞内的转移而发生序列丢失现象,并且能够稳定地表达驱动外源基因的表达。由此提供了下述发明0011本发明的一个方面涉及一种分离的多核苷酸,其包含如下元件0012HCMV增强子、ACTIN启动子和MCMV增强子;0013具体地,其还包含UBI增强子;更具体地,UBI增强子位于上述3种元件的下游;0014具体地,上述4种元件各自独立地为1个、2个、3个或3个以上;0015具体地,所述多核苷酸具有启动子功能。0016根据本发明任一项所述的多核苷酸,其依次包含0017HCMV增强子ACTIN启动子MCMV增强子,或者0018MCMV增强子HCMV增强子ACTIN启动子;0019。
16、优选地,其依次包含0020HCMV增强子ACTIN启动子MCMV增强子UBI增强子,或者0021MCMV增强子HCMV增强子ACTIN启动子UBI增强子。0022根据本发明任一项所述的多核苷酸,其中0023HCMV增强子的核苷酸序列如SEQIDNO17所示;0024ACTIN启动子的核苷酸序列如SEQIDNO18所示;0025MCMV增强子的核苷酸序列如SEQIDNO19或SEQIDNO20所示;优选为SEQIDNO20;0026UBI增强子的核苷酸序列如SEQIDNO21所示。0027根据本发明任一项任一项所述的多核苷酸,其各个元件之间有或没有连接序列或者剪接位点;具体地,在MCMV增强子和。
17、/或HCMV增强子和/或UBI增强子的上游和下游分别有剪接供体和剪接受体;更具体地,所述剪接供体的核苷酸序列如SEQIDNO22所示;所述剪接受体的核苷酸序列如SEQIDNO23所示。0028剪接供体SPLICEDONOR,SDAAAACAGGTAAGTCCSEQIDNO220029剪接受体SPLICEACCEPTOR,SAGCCTCTACTAACCATGTTCATGTTTTCTTTTTTTTTCTACAGGTCCTGGGTGACGAACAGSEQIDNO230030在本发明的一个实施方案中,不拘于理论的限制,启动子后面的增强子序列两端含有剪切位点,保证在转录后,位于启动子下游的增强子序列能被。
18、准确剪切掉,不影响目的说明书CN104212802A3/15页6蛋白的翻译;其余元件直接连接。0031本发明的另一方面涉及一种分离的多核苷酸,其包含或者为选自如下的AE中任意一组的多核苷酸0032ASEQIDNO1SEQIDNO4中任一序列所示的多核苷酸;0033B与SEQIDNO1SEQIDNO4中任一序列互补的多核苷酸;0034C在高等严紧条件下能够与上述A或B的多核苷酸杂交并具有启动子功能的多核苷酸;0035D对上述A或B所示多核苷酸进行一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰并具有启动子功能的多核苷酸;和0036E与上述A或B所示多核苷酸具有至少90同一性并具有启动子功能的多核苷酸;003。
19、7具体地,A或B中的多核苷酸具有启动子功能。0038本发明的上述多核苷酸为启动子;具体地,是嵌合启动子。0039SEQIDNO1SEQIDNO4的具体序列如下0040CAC启动子含HCMV增强子ACTIN启动子MCMV增强子0041GGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCAT。
20、ATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGC。
21、GGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGCGCTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTAAAACAGGTAAGTCCCTGAGTCATTAGGGACTTTCCAATGGGTTTTGCCCAGTACATAAGGTCAATAGGGGTGAATCAACAGGAAAGTCCCATTGGAGCCAAGTACA。
22、CTGAGTCAATAGGGACTTTCCATTGGGTTTTGCCCAGTACAAAAGGTCAATAGGGGGTGAGTCAATGGGTTTTTCCCATTATTGGCACGTACATAAGGTCAATAGGGGTGAGTCATTGGGTTTTTCCAGCCAATTTAATTAAAACGCCATGTACTTTCCCACCATTGACGTCAATGGGCTATTGAAACTAATGCAACGTGACCTTTAAACGGTACTTTCCCATAGCTGATTAATGGGAAAGTACCGTTCGCCTCTACTAACCATGTTCATGTTTTCTTTTTTTTTCTACAGGTCCTGGGT。
23、GACGAACAGSEQIDNO10042CACU启动子含HCMV增强子ACTIN启动子MCMV增强子UBI增强子0043GGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATT。
24、ATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTAT。
25、GGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGCGCTG说明书CN104212802A4/15页7CCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTAAAACAGGTAAGTCCCTGAGTCATTAGGGACTTTCCAATGGGTTTTGCCCAGTACATAAGGTCAATAGGGGTGAATCAACAGGAAAGTCCCATTGGAGCCAAGTACACTGAGTCAATAGGGACTTTCCATTGGGTTTTGCC。
26、CAGTACAAAAGGTCAATAGGGGGTGAGTCAATGGGTTTTTCCCATTATTGGCACGTACATAAGGTCAATAGGGGTGAGTCATTGGGTTTTTCCAGCCAATTTAATTAAAACGCCATGTACTTTCCCACCATTGACGTCAATGGGCTATTGAAACTAATGCAACGTGACCTTTAAACGGTACTTTCCCATAGCTGATTAATGGGAAAGTACCGTTCGGCCTCCGCGCCGGGTTTTGGCGCCTCCCGCGGGCGCCCCCCTCCTCACGGCGAGCGCTGCCACGTCAGACGAAGGGCGCAGCGA。
27、GCGTCCTGATCCTTCCGCCCGGACGCTCAGGACAGCGGCCCGCTGCTCATAAGACTCGGCCTTAGAACCCCAGTATCAGCAGAAGGACATTTTAGGACGGGACTTGGGTGACTCTAGGGCACTGGTTTTCTTTCCAGAGAGCGGAACAGGCGAGGAAAAGTAGTCCCTTCTCGGCGATTCTGCGGAGGGATCTCCGTGGGGCGGTGAACGCCGATGATGCCTCTACTAACCATGTTCATGTTTTCTTTTTTTTTCTACAGGTCCTGGGTGACGAACAGSEQIDNO20044CCAU启动子含MC。
28、MV增强子HCMV增强子ACTIN启动子UBI增强子0045ACTGAGTCATTAGGGACTTTCCATTGGGTTTTGCCCAGTACAAAAGGTCAATAGGGGGTGAGTCAATGGGTTTTTCCCATTATTGGCACGTACATAAGGTCAATAGGGGTGAGTCATTGGGTTTTTCCAGCCAATTTAATTAAAACGCCATGTACTTTCCCACCATTGACGTCAATGGGCTATTGAAACTAATGCAACGTGACCTTTAAACGGTACTTTCCCATAGCTGATTAATGGGAAAGTACCGTTCGGAGTTCCGCGTTACATAAC。
29、TTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGG。
30、TGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGGCGGGCGGGAGTCGCTGCGCGCTGCCTTCGCCCCGT。
31、GCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTAAAACAGGTAAGTCCGGCCTCCGCGCCGGGTTTTGGCGCCTCCCGCGGGCGCCCCCCTCCTCACGGCGAGCGCTGCCACGTCAGACGAAGGGCGCAGCGAGCGTCCTGATCCTTCCGCCCGGACGCTCAGGACAGCGGCCCGCTGCTCATAAGACTCGGCCTTAGAACCCCAGTATCAGCAGAAGGACATTTTAGGACGGGACTTGGGTGACTCTAGGGCACTGGTTTTCTTTCCAGAGAGCG。
32、GAACAGGCGAGGAAAAGTAGTCCCTTCTCGGCGATTCTGCGGAGGGATCTCCGTGGGGCGGTGAACGCCGATGATGCCTCTACTAACCATGTTCATGTTTTCTTTTTTTTTCTACAGGTCCTGGGTGACGAACAGSEQIDNO300464CAU启动子含MCMV增强子HCMV增强子MCMV增强子HCMV增强子ACTIN启动子UBI增强子0047CTGAGTCATTAGGGACTTTCCAATGGGTTTTGCCCAGTACATAAGGTCAATAGGGGTGAATCAACAGGAAAGTCCCATTGGAGCCAAGTACACTGAGTC。
33、AATAGGGACTTTCCATTGGGTTTTGCCCAGTACAAAAGGTCAATAGGGGGTGAGTCAATGGGTTTTTCCCATTATTGGCACGTACATAAGGTCAATAGGGGTGAGTCATTGGGTTTTTCCAGCCAATTTAATTAAAACGCCATGTACTTTCCCACCATTGACGTCAATGGGCTATTGAAACTAATGCAACGTGACCTTTAAACGGTACTTTCCCATAGCTGATTAATGGGAAAGTACCGTTCGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGAC。
34、CCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCA说明书CN104212802A5/15页8AGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCACTGAGTCATTAGGGACTTTCCAATGG。
35、GTTTTGCCCAGTACATAAGGTCAATAGGGGTGAATCAACAGGAAAGTCCCATTGGAGCCAAGTACACTGAGTCAATAGGGACTTTCCATTGGGTTTTGCCCAGTACAAAAGGTCAATAGGGGGTGAGTCAATGGGTTTTTCCCATTATTGGCACGTACATAAGGTCAATAGGGGTGAGTCATTGGGTTTTTCCAGCCAATTTAATTAAAACGCCATGTACTTTCCCACCATTGACGTCAATGGGCTATTGAAACTAATGCAACGTGACCTTTAAACGGTACTTTCCCATAGCTGATTAAT。
36、GGGAAAGTACCGTTCGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACAT。
37、CTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATGGTCGAGGTGAGCCCCACGTTCTGCTTCACTCTCCCCATCTCCCCCCCCTCCCCACCCCCAATTTTGTATTTATTTATTTTTTAATTATTTTGTGCAGCGATGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGGCGCGCGCCAGGCGGGGCGGGGCGGGGCGAGGGGCGGGGCGGGGCGAGGCGGAGAGGTGCGGCGGCAGCCAATCAGAGCGGCGCGCTCCGAAAGTTTCCTTTTATGGCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCCTATAAAAAGCGAAGCGCGCGG。
38、CGGGCGGGAGTCGCTGCGCGCTGCCTTCGCCCCGTGCCCCGCTCCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGCCCCGGCTCTGACTGACCGCGTTACTAAAACAGGTAAGTCCGGCCTCCGCGCCGGGTTTTGGCGCCTCCCGCGGGCGCCCCCCTCCTCACGGCGAGCGCTGCCACGTCAGACGAAGGGCGCAGCGAGCGTCCTGATCCTTCCGCCCGGACGCTCAGGACAGCGGCCCGCTGCTCATAAGACTCGGCCTTAGAACCCCAGTATCAGCAGAAGGACATTTTAGGACGGGACTTGGG。
39、TGACTCTAGGGCACTGGTTTTCTTTCCAGAGAGCGGAACAGGCGAGGAAAAGTAGTCCCTTCTCGGCGATTCTGCGGAGGGATCTCCGTGGGGCGGTGAACGCCGATGATGCCTCTACTAACCATGTTCATGTTTTCTTTTTTTTTCTACAGGTCCTGGGTGACGAACAGSEQIDNO40048典型地,“杂交条件”根据测量杂交时所用条件的“严紧性”程度来分类。严紧性程度可以以例如核酸结合复合物或探针的解链温度TM为依据。例如,“最大严紧性”典型地发生在约TM5低于探针TM5;“高等严紧性”发生在TM以下约510;“中等严紧性”。
40、发生在探针TM以下约1020;“低严紧性”发生在TM以下约2025。作为替代,或者进一步地,杂交条件可以以杂交的盐或离子强度条件和/或一或多次的严紧性洗涤为依据。例如,6SSC极低严紧性;3SSC低至中等严紧性;1SSC中等严紧性;05SSC高等严紧性。从功能上说,可以采用最大严紧性条件确定与杂交探针严紧同一或近严紧同一的核酸序列;而采用高等严紧性条件确定与该探针有约80或更多序列同一性的核酸序列。0049对于要求高选择性的应用,典型地期望采用相对严紧的条件来形成杂交体,例如,选择相对低的盐和/或高温度条件。SAMBROOK等SAMBROOK,J等1989分子克隆,实验室手册,COLDSPRI。
41、NGHARBORPRESS,PLAINVIEW,NY提供了包括中等严紧性和高等严紧性在内的杂交条件。0050为便于说明,用于检测本发明的多核苷酸与其它多核苷酸杂交的合适的中度严紧条件包括用5SSC、05SDS、10MMEDTAPH80溶液预洗;在5065下在5SSC中杂交过夜;随后用含01SDS的2、05和02SSC在65下各洗涤两次20分钟。本领域技术人员应当理解,能容易地操作杂交严紧性,如改变杂交溶液的含盐量和/或杂交温度。例如,在另一个实施方案中,合适的高度严紧杂交条件包括上述条件,不同之处在于杂交温度升高到例如6065或6570。说明书CN104212802A6/15页90051在本发。
42、明中,所述在高等严紧条件下与SEQIDNO1SEQIDNO4所示的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,其具有与SEQIDNO1SEQIDNO4所示的核苷酸序列相同或相似的启动子活性。0052在本发明中,所述对SEQIDNO1SEQIDNO4所示的核苷酸序列进行一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰的核苷酸序列,是指分别或同时在所述核苷酸序列的5端和/或3端,和/或序列内部进行例如不超过245个,或者不超过230个,或者不超过320个,或者不超过415个,或者不超过510个,或者不超过68个的分别用逐个连续整数表示的碱基的取代、缺失、添加修饰。0053在本发明中,所述对SEQIDNO1SEQIDNO4所示。
43、的核苷酸序列进行如上述一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰的核苷酸序列具有与SEQIDNO1SEQIDNO4所示的核苷酸序列相同或相似的启动子活性。0054通过一种多核苷酸进行说明,其所具有的核苷酸序列例如与SEQIDNO1SEQIDNO4的参考核苷酸序列至少具95的“同一性”是指在SEQIDNO1SEQIDNO4的参考核苷酸序列之每100个核苷酸中,该多核苷酸的核苷酸序列除了含有多达5个核苷酸的不同外,该多核苷酸之核苷酸序列与参考序列相同。换句话说,为了获得核苷酸序列与参考核苷酸序列至少95相同的多核苷酸,参考序列中多达5的核苷酸可被删除或被另一核苷酸替代;或可将一些核苷酸插入参考序列中,其。
44、中插入的核苷酸可多达参考序列之总核苷酸的5;或在一些核苷酸中,存在删除、插入和替换的组合,其中所述核苷酸多达参考序列之总核苷酸的5。参考序列的这些突变可发生在参考核苷酸序列的5或3末端位置,或在这些末端位置之间的任意地方,它们或单独散在于参考序列的核苷酸中,或以一个或多个邻近的组存在于参考序列中。0055在本发明中,用于确定序列同一性和序列相似性百分数的算法是例如BLAST和BLAST20算法,它们分别描述在ALTSCHUL等1977NUCLACIDRES2533893402和ALTSCHUL等1990JMOLBIOL215403410。采用例如文献中所述或者默认参数,BLAST和BLAST2。
45、0可以用于确定本发明的核苷酸序列同一性百分数。执行BLAST分析的软件可以通过国立生物技术信息中心NCBI为公众所获得。0056在本发明中,所述与SEQIDNO1SEQIDNO4所示的核苷酸序列具有至少90的序列同一性的核苷酸序列包括与SEQIDNO1SEQIDNO4所公开序列基本同一的多核苷酸序列,例如当采用本文所述方法例如采用标准参数的BLAST分析时,与本发明多核苷酸序列相比含有至少90序列同一性、优选至少91、92、93、94、95、96、97、98或99或更高的序列同一性的那些序列。0057在本发明中,所述与SEQIDNO1SEQIDNO4所示的核苷酸序列具有至少90的序列同一性的核。
46、苷酸序列具有与SEQIDNO1SEQIDNO4所示的核苷酸序列相同或相似的启动子活性。0058本发明的再一方面涉及一种核酸构建体,包含本发明中任一项所述的多核苷酸,以及可操作地连接的外源基因;具体地,所述外源基因选自P53、GMCSF、IL2、IL12、IL24、TRAIL、P16、TK、IFN、TNF、RB、SIRP等中的任意一种或多种;具体地,所述外源基因为SEQIDNO12所示P53和/或SEQIDNO4所示GMCSF。0059本发明的再一方面涉及一种重组载体,其含有本发明中任一项所述的多核苷酸或说明书CN104212802A7/15页10者本发明的核酸构建体;具体地,所述重组载体为重组。
47、病毒载体;具体地,所述重组载体为本发明中任一项所述的多核苷酸或者本发明的核酸构建体与PDC315质粒或SG655经重组得到的重组载体。0060适于构建本发明所述重组载体的克隆载体包括但不限于,例如PUC18、PUC19、PMD18T、PMD19T、PGMT载体、PDC315系列载体等。0061适于构建本发明所述的表达载体包括但不限于,真核表达质粒、重组病毒载体等。0062所述真核表达质粒包括但不限于,例如PCDNA3系列载体、PCDNA4系列载体、PCDNA5系列载体、PCDNA6系列载体、PRL系列载体、PDC315系列载体等。在本发明的一个实施方案中,所述真核表达质粒为PDC315载体。0。
48、063所述重组病毒载体包括但不限于,例如重组腺病毒载体、重组腺相关病毒载体、重组逆转录病毒载体、重组单纯疱疹病毒载体、重组痘苗病毒载体等。在本发明的一个实施方案中,所述重组病毒载体为重组腺病毒载体。0064本发明的又一方面还涉及一种含有本发明的启动子或本发明的核酸构建体或本发明的载体的重组细胞。具体地,所述细胞为哺乳动物细胞。在本发明的一个实施方案中,所述哺乳动物细胞为肿瘤细胞。所述肿瘤细胞包括但不限于,例如原代肝癌细胞、肝癌细胞株HUH7、HEP3B、HEPG2、PLC/PRF/5、SMMC7721、BEL7404、BEL7402、BEL7405、L2215、MHCC97L、MHCC97H、。
49、QGY7701、HCCLM3、SKHEP1;原代肺癌细胞、肺癌细胞株A549、NCIH460、NCIH446、NCIH1299、NCIH292、NCIH23;原代胃癌细胞、胃癌细胞株SGC7901、BGC823、HGC27;原代结肠癌细胞、结肠癌细胞株HT29、COLO205、SW620;原代乳腺癌细胞、乳腺癌细胞株MCF7、MDAMB453、MDAMB468、HTB122、HTB133、SKBR3、T47D;原代宫颈癌细胞、宫颈癌细胞株SKOV3、HO8910、HELA;原代黑色素瘤细胞、黑色素瘤细胞株A375、A431;原代胶质瘤细胞、胶质瘤细胞株A172、U251;原代骨肉瘤细胞、骨肉瘤细胞株U2OS;原代淋巴瘤细胞、淋巴瘤细胞株RAJI、JURKAT、K562;原代胰腺癌细胞、胰腺癌细胞株PANC1、BXPC3、SU8686;原代前列腺癌细胞、前列腺癌细胞株PC3、DU145;原代膀胱癌细胞、膀胱癌细胞株T24;原代鼻咽癌细胞、鼻咽癌细胞株CNE1等。0065本发明的再一方面涉及将本发明的多核苷酸启动子或本发明的核酸构建体或本发明的重组载体导入哺乳动物细胞的方法;所述方法包括病毒介导的转化、显微注射、粒子。