新的短核苷酸串联重复序列位点及其应用.pdf

《新的短核苷酸串联重复序列位点及其应用.pdf》由会员分享，可在线阅读，更多相关《新的短核苷酸串联重复序列位点及其应用.pdf（27页珍藏版）》请在专利查询网上搜索。

1、10申请公布号CN104099324A43申请公布日20141015CN104099324A21申请号201310111810X22申请日20130402C12N15/11200601C12Q1/68200601C12N15/1020060171申请人天昊生物医药科技（苏州）有限公司地址215123江苏省苏州市工业园区星湖街218号生物纳米科技园A2楼428单元72发明人姜正文马瑞晓张希54发明名称新的短核苷酸串联重复序列位点及其应用57摘要本发明公开了一种新的短核苷酸串联重复序列位点及其应用，短串联重复序列基因座G15S0001，序列如SEQIDNO1所示，用于制备A用于遗传关系分析的试剂或。

2、试剂盒；B用于个体识别的试剂或试剂盒；C用于亲子鉴定或血缘分析的试剂或试剂盒；D用于检测抽提羊水中是否存在母血污染的试剂或试剂盒；和/或E用于检测骨髓移植后受体中的白细胞是否被供体细胞取代的试剂盒。短串联重复序列基因座G15S0001区分度高，能够有效地分析遗传关系。51INTCL权利要求书2页说明书12页序列表8页附图4页19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书2页说明书12页序列表8页附图4页10申请公布号CN104099324ACN104099324A1/2页21一种分离的短串联重复序列基因座G15S0001，其特征在于，所述基因座的序列如SEQIDNO1所示。2一种分。

3、离的核苷酸序列，其特征在于，所述核苷酸序列的结构如下X1X2X3式中，X1为SEQIDNO2中第1785位；X2为含有2个重复单元CTAT和/或CTAA和/或TCTA的遗传多态区；X3为SEQIDNO2中第8651664位。3如权利要求1所述的短串联重复序列基因座G15S0001的用途，其特征在于，用于制备A用于遗传关系分析的试剂或试剂盒；B用于个体识别的试剂或试剂盒；C用于亲子鉴定或血缘分析的试剂或试剂盒；D用于检测抽提羊水中是否存在母血污染的试剂或试剂盒；和/或E用于检测骨髓移植后受体中的白细胞是否被供体细胞取代的试剂盒。4如权利要求3所述的用途，其特征在于，所述的试剂包括I引物或引物对；。

4、II探针；III核酸芯片。5如权利要求4所述的用途，其特征在于，所述的引物对的序列如SEQIDNO3和SEQIDNO4所示。6一种特异性扩增短串联重复序列基因座G15S0001的引物对，其特征在于，所述的引物对的序列如SEQIDNO3和SEQIDNO4所示。7一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括A用于特异性扩增短串联重复序列基因座G15S0001的引物对；B使用说明书。8如权利要求7所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括C特异性扩增选自下组的一种或多种基因座的引物对D3S1358、VWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、。

5、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO。9一种扩增体系，其特征在于，所述扩增体系包括A用于特异性扩增短串联重复序列基因座G15S0001的引物对；和B任选的、特异性扩增选自下组的一种或多种基因座的引物对D3S1358、VWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO；并且所述引物对A和任选的引物对B位于同一扩增体系。10如权利要求9所述的扩增体系，其特征在于，所述的扩增体系为复合扩增体系，其中，所述。

6、的引物对B包括1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，或16对特异性引物对；和/或所述复合扩增体系为荧光标记的复合扩增体系，其中，所述荧光标记是指选用下组的一种或多种荧光标记试剂标记所述基因座的引物FAM、HEX、VIC、NED、PET、TAMRA、ROX、荧光素、FITC、IRD700/800、CY3、CY5、CY35、CY55、TET、TAMRA、JOE、BODIPYTMR、俄勒冈绿、权利要求书CN104099324A2/2页3罗丹明绿、罗丹明红、德克萨斯红或雅基马黄。11一种扩增方法，其特征在于，包括步骤在权利要求910中任一所述的扩增体系中，以待检测样本。

7、为模板，利用聚合酶链式反应进行基因座的扩增，从而获得基因座扩增产物。12一种遗传关系分析方法，其特征在于，包括步骤1在权利要求910中任一所述的扩增体系中，以待检测样本为模板，利用聚合酶链式反应进行基因座的扩增，从而获得基因座扩增产物；和其中，所述待检测样本包括分别来自不同个体的核酸样本S1,S2,SI，式中I为2的正整数；2对来自不同核酸样本S1,S2,SI的基因座扩增产物进行检测，从而获得对应于不同核酸样本的检测结果；3对步骤2获得的检测结果进行比较，从而确定不同个体之间的遗传关系。权利要求书CN104099324A1/12页4新的短核苷酸串联重复序列位点及其应用0001技术领域0002本。

8、发明涉及一种短核苷酸串联重复序列位点及其应用。0003背景技术0004短串联重复序列SHORTTANDEMREPEATSTR，又称微卫星DNAMICROSATELLITEDNA，是一类重复单位26BP，重复次数1060，片段长度在400BP以下的DNA串联重复序列；其产生原因是DNA复制过程中滑动，或在复制和修复时滑动链与互补链碱基错配，导致一个或几个重复单位的缺失或插入。STR具有在基因组中分布广泛、等位基因多、杂合度高、分型结果稳定，STR遗传符合孟得尔遗传定律KORETH,J,ETAL1996MICROSATELLITESANDPCRGENOMICANALYSISJPATHOL17823。

9、9248等特点，并且多个STR基因座联合检测时，个体识别力和非父排除率高。因而STR以其遗传多态性等特征，已被作为第二代遗传标记广泛应用于医学个体识别、人类遗传图谱绘制、亲子鉴定、法医物证检验等领域,有效地推动了法医鉴定学从以往物证样本的个体排除向个体识别全面转换。0005目前，个体识别的技术主要采用STRPCR检测,对多个STR基因座联合分型，以确定亲权关系或个体识别等，在实验方法都相对成熟，但在STR基因座的选择上，没有统一标准。国内外生产商提供的检测试剂盒中所用的位点不尽相同。早期欧美选用10个STR基因座加1个性别决定基因EACOTTON,RFALLSOP,JFGUEST,RREFRA。

10、ZIER,PKOUMI,IPCALLOW,ASEAGER,RLSPARKES,VALIDATIONOFTHEAMPFLSTRSGMPLUSSYSTEMFORUSEINFORENSICCASEWORK,FORENSICSCIINT1122000151161。后来随着技术发展、数据库增多，比对信息难度加大，STR基因座的选择也在不断改进。现在比较有影响力的数据库CODISCOMBINEDDNAINDEXSYSTEM是由美国FBI基于13个STR基因座D3S1358，VWA，D16S539，D5S818，D7S820，CSF1PO，D13S317，TPOX，D8S1179，D21S11，D18S51。

11、，TH01，FGA构建,因而现在大多数STR检测试剂盒生产商也在这13个核心基因座的基础上增加或删减一些位点以提高检测效率及准确率DJFRENCH,RLHOWARD,NGALE,TBROWN,DGMCDOWELL,PGDEBENHAN,INTERROGATIONOFSHORTTANDEMREPEATSUSINGFLUORESCENTPROBESANDMELTINGCURVEANALYSISASTEPTOWARDSRAPIDDNAIDENTITYSCREENINGFORENSICSCIENCE2008333339。例如PROMEGA公司的POWERPLEX16SYSTEM试剂盒包括了13个核心基。

12、因座，并增加了PENTAD、PENTAE和AMELO三个基因座；美国ABI公司的AMPF/STRIDENTIFILERPCRAMPLIFICATIONKIT则是13个核心基因座加上D2S1338、D19S433和AMELO；其公司的另外两款试剂盒AMPFLSTRSGMPLUSPCRAMPLIFICATIONKIT和AMPFLSTRSINOFILERPCRAMPLIFICATIONKIT也做了相应基因座位点的增减。国内生产类似检测试剂盒的单位也有说明书CN104099324A2/12页5很多，例如公安部二所推广的DNATYPERTM15，中德美联生物技术有限公司的AGCUEX22STR荧光检测试。

13、剂盒,所检测基因座增至22个。0006以上试剂盒选择的STR基因座的优点在于,以13个得到公认的核心基因座为基础，附加一些其它位点以丰富所检测得到的信息量，能较全面的反应出个体间的差异性，进而完成个体识别、父权判定等工作。但是所用的这些基因座中并非都是最优选择，例如FGA基因座存在序列长度过长、重复单元多但跨度不连续，从而影响了与其它位点的兼容性，不利于与多个基因座联合检测的多重体系运用；D19S433基因座则位于基因组中高度重复序列区，扩增引物设计存在较大麻烦，并且该位点的稳定性不高，应用于个体识别时所提供的可用信息质量和区分度都不高；再如D21S11基因座除了存在位于基因组中高度重复序列区。

14、域的问题之外，还发现在该基因座所在区域中可能存在CNV基因拷贝数变异的情况；在遇到基因拷贝数非正常的样本检测时，会降低该位点STR分型的准确度，在个人识别中采用该基因座的效果也会大打折扣。随着人类基因组图谱的建立及测序技术的发展，以较低的成本，在较快的时间内对个人全基因组重测序成为可能，进而能在较大的信息量下筛选出区分度更高的STR基因座，推动了应用于个体识别等研究中的STR基因座的选择与更新。0007因此，为克服兼容性差、存在CNV或位于高度重复序列区域等缺陷，本领域尚需一种新型的具有高区分度的短串联重复序列。0008发明内容0009本发明的目的在于提供一种新型的短串联重复序列基因座，不存在。

15、CNV，且不位于高度重复序列区域，具有高区分度。0010本发明的第一方面，提供一种分离的短串联重复序列基因座G15S0001，序列如SEQIDNO1所示。0011本发明的第二方面，提供一种分离的核苷酸序列，所述核苷酸序列的结构如下X1X2X3式中，X1为SEQIDNO2中第1785位；X2为含有2个重复单元CTAT和/或CTAA和/或TCTA的遗传多态区；X3为SEQIDNO2中第8651664位。0012本发明的第三方面，提供第一方面所述的短串联重复序列基因座G15S0001的用途，用于制备A用于遗传关系分析的试剂或试剂盒；B用于个体识别的试剂或试剂盒；C用于亲子鉴定或血缘分析的试剂或试剂盒。

16、；D用于检测抽提羊水中是否存在母血污染的试剂或试剂盒；和/或E用于检测骨髓移植后受体中的白细胞是否被供体细胞取代的试剂盒。0013在另一优选例中，所述的试剂包括I引物或引物对；II探针；III核酸芯说明书CN104099324A3/12页6片。0014在另一优选例中，所述的引物对的序列如SEQIDNO3和SEQIDNO4所示。0015本发明的第四方面，提供一种特异性扩增短串联重复序列基因座G15S0001的引物对，所述的引物对的序列如SEQIDNO3和SEQIDNO4所示。0016在另一优选例中，所述短串联重复序列基因座G15S0001如第一方面所述。0017本发明的第五方面，提供一种试剂盒，。

17、包括A用于特异性扩增短串联重复序列基因座G15S0001的引物对；B使用说明书。0018在另一优选例中，所述短串联重复序列基因座G15S0001如第一方面所述。0019在另一优选例中，所述试剂盒还包括C特异性扩增选自下组的一种或多种基因座的引物对D3S1358、VWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO。0020本发明的第六方面，提供一种扩增体系，包括A用于特异性扩增短串联重复序列基因座G15S0001的引物对；和B任选的、特异性扩增选自下组。

18、的一种或多种基因座的引物对D3S1358、VWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO；并且所述引物对A和任选的引物对B位于同一扩增体系。0021在另一优选例中，所述短串联重复序列基因座G15S0001如第一方面所述。0022在另一优选例中，所述的扩增体系为复合扩增体系，其中，所述的引物对B包括1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，或16对特异性引物对；和/或所述复合扩增体系为荧光标记的复合扩增体系，其中，所述。

19、荧光标记是指选用下组的一种或多种荧光标记试剂标记所述基因座的引物FAM、HEX、VIC、NED、PET、TAMRA、ROX、荧光素、FITC、IRD700/800、CY3、CY5、CY35、CY55、TET、TAMRA、JOE、BODIPYTMR、俄勒冈绿、罗丹明绿、罗丹明红、德克萨斯红或雅基马黄。0023本发明的第七方面，提供一种扩增方法，包括步骤在第六方面所述的扩增体系中，以待检测样本为模板，利用聚合酶链式反应进行基因座的扩增，从而获得基因座扩增产物。0024在另一优选例中，所述方法还包括对所述基因座扩增产物进行检测的步骤。0025在另一优选例中，所述的检测选自下组毛细管电泳、测序、杂交。。

20、0026在另一优选例中，所述待测样品选自下组血液、唾液、精液、汗液、羊水、骨骼、或毛发。0027本发明的第八方面，提供一种遗传关系分析方法，包括步骤说明书CN104099324A4/12页7在第六方面所述的扩增体系中，以待检测样本为模板，利用聚合酶链式反应进行基因座的扩增，从而获得基因座扩增产物；和其中，所述待检测样本包括分别来自不同个体的核酸样本S1,S2,SI，式中I为2的正整数；2对来自不同核酸样本S1,S2,SI的基因座扩增产物进行检测，从而获得对应于不同核酸样本的检测结果；3对步骤2获得的检测结果进行比较，从而确定不同个体之间的遗传关系。0028在另一优选例中，所述遗传关系分析包括个。

21、体识别分析、亲子鉴定分析、血缘关系分析。0029本发明提供了一种新型的STR基因座，不存在CNV，且不位于高度重复序列区域、杂合度高，分辨率高、兼容性高，能与已有的大多数位点在同一体系内使用，能够有效区分随机人群的遗传关系。0030应理解，在本发明范围内中，本发明的上述各技术特征和在下文如实施例中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合，从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅，在此不再一一累述。0031附图说明0032图1为父本多个STR位点的检测峰图。0033图2为母本多个STR位点的检测峰图。0034图3为子代多个STR位点的检测峰图。0035图4为无亲缘关系样本多个STR位点的检测峰图。0。

22、036具体实施方式0037本发明人经过广泛而深入的研究，通过大量筛选，首次筛选出一种新型的短串联重复序列基因座G15S0001，含有2个重复单元CTAT和/或CTAA和/或TCTA的遗传多态区。该短串联重复序列基因座区分度达到08052以上，与少量常规的STR基因座联用，可有效区分遗传关系，区分度高达099以上。在此基础上，完成了本发明。0038短串联重复序列基因座本发明通过大量筛选，分离出一种新的短串联重复序列基因座，STR位点信息如表1所示。0039表1STR的基本信息位点名称重复数重复单元等位基因数染色体位置起始结束G15S000120CTAT和/或CTAA和/或TCTA10155350。

23、232453502387本发明提供的一种分离的短串联重复序列基因座，命名为G15S0001，序列如SEQID说明书CN104099324A5/12页8NO1所示。0040重复数20，即20个重复单元。0041G15S0001位点存在重复单元的多样性，即重复单元可能由CTAT、CTAA和TCTA中的一种或多种单元组合而成。0042等位基因数，即为实验结果统计所得的等位基因数。0043本发明提供的分离的核苷酸序列，结构如下X1X2X3式中，X1为SEQIDNO2中第1785位；X2为含有2个重复单元CTAT和/或CTAA和/或TCTA的遗传多态区；X3为SEQIDNO2中第8651664位。004。

24、4在另一优选例中，所述的X2的长度为50150BP，较佳地60130BP或70120BP，更佳地80110BP。0045在另一优选例中，所述的X2为含有10个重复单元CTAT和/或CTAA和/或TCTA的遗传多态区。0046在另一优选例中，所述的X2为含有20个重复单元CTAT和/或CTAA和/或TCTA的遗传多态区。0047在另一优选例中，X2为SEQIDNO1所示的多核苷酸或其片段包括在5端、3端和/或中间区域因缺失一个或多个碱基所形成的片段。0048本发明的短串联重复序列基因座G15S0001，能够用于A制备用于遗传关系分析的试剂或试剂盒；B制备用于个体识别的试剂或试剂盒；C制备用于亲子。

25、鉴定或血缘分析的试剂或试剂盒；D制备用于检测抽提羊水中是否存在母血污染的试剂或试剂盒；和/或E制备用于检测骨髓移植后受体中的白细胞是否被供体细胞取代的试剂盒。0049所述的试剂还包括I引物或引物对；II探针；III核酸芯片。较佳地，所述的引物对的序列如SEQIDNO3和SEQIDNO4所示。0050本发明还提供一种特异性扩增短串联重复序列基因座G15S0001的引物对，序列如SEQIDNO3和SEQIDNO4所示。0051所述的引物对中的一个或两个引物带有可检测标记物。0052所述的可检测标记物包括荧光标记物或量子点标记物。0053所述荧光标记包括但不限于FAM、HEX、VIC、NED、PET。

26、、TAMRA、ROX、荧光素、FITC、IRD700/800、CY3、CY5、CY35、CY55、TET、TAMRA、JOE、BODIPYTMR、俄勒冈绿、罗丹明绿、罗丹明红、德克萨斯红或雅基马黄。上述荧光标记物为本领域已知的标记物，均有市售商品，可通过购买获得。0054试剂盒本发明提供的试剂盒，包括A用于特异性扩增短串联重复序列基因座G15S0001的引物对；说明书CN104099324A6/12页9B使用说明书。0055较佳地，所述的引物对的序列如SEQIDNO3和SEQIDNO4所示。0056所述试剂盒还包括C特异性扩增选自下组的一种或多种基因座的引物对D3S1358、VWA、D16S5。

27、39、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO。0057在所述试剂盒中，所述的各特异性引物对位于同一或不同的容器中。0058在另一优选例中，所述的试剂盒还包括一种或多种以下试剂D用于PCR扩增的试剂；E用于电泳的试剂；F用于抽提DNA的试剂；G标准品。0059扩增体系及扩增方法本发明提供的扩增体系，包括A用于特异性扩增短串联重复序列基因座G15S0001的引物对；和B任选的、特异性扩增选自下组的一种或多种基因座的引物对D3S1358、VWA、D16S539、D5S。

28、818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO；并且所述引物对A和任选的引物对B位于同一扩增体系。0060较佳地，所述的引物对的序列如SEQIDNO3和SEQIDNO4所示。0061在另一优选例中，所述的扩增体系是聚合酶链式反应PCR扩增体系。0062在另一优选例中，所述的扩增体系为液相。0063在另一优选例中，所述的扩增体系含有聚合酶、DNTP等用于PCR聚合的试剂。0064优选地，所述的扩增体系为复合扩增体系，其中，所述的引物对B包括1，2，3，4，5，6，7，8，9，1。

29、0，11，12，13，14，15，或16对特异性引物对。0065较佳地，所述复合扩增体系为荧光标记的复合扩增体系，其中，所述荧光标记是指选用下组的一种或多种荧光标记试剂标记所述基因座的引物FAM、HEX、VIC、NED、PET、TAMRA、ROX、荧光素、FITC、IRD700/800、CY3、CY5、CY35、CY55、TET、TAMRA、JOE、BODIPYTMR、俄勒冈绿、罗丹明绿、罗丹明红、德克萨斯红或雅基马黄。0066在另一优选例中，所述各对引物中的一个引物的5端带有荧光标记。0067本发明的扩增方法，包括步骤在上述扩增体系中，以待检测样本为模板，利用聚合酶链式反应进行基因座的扩增，。

30、从而获得基因座扩增产物。0068所述方法还包括对所述基因座扩增产物进行检测的步骤。较佳地，所述的检测采用选自下组的方法毛细管电泳、测序、杂交。0069所述待测样品选自下组血液、唾液、精液、汗液、羊水、骨骼、或毛发。0070在另一优选例中，所述样品来自于人。0071遗传关系分析方法说明书CN104099324A7/12页10本发明提供一种遗传关系分析方法，包括步骤1在上述扩增体系中，以待检测样本为模板，利用聚合酶链式反应进行基因座的扩增，从而获得基因座扩增产物；和其中，所述待检测样本包括分别来自不同个体的核酸样本S1,S2,SI，式中I为2的正整数；2对来自不同核酸样本S1,S2,SI的基因座扩。

31、增产物进行检测，从而获得对应于不同核酸样本的检测结果；3对步骤2获得的检测结果进行比较，从而确定不同个体之间的遗传关系。0072在另一优选例中，所述遗传关系分析包括个体识别分析、亲子鉴定分析、血缘关系分析。0073在另一优选例中，所述的不同个体来自同一家族。0074本发明提到的上述特征，或实施例提到的特征可以任意组合。本案说明书所揭示的所有特征可与任何组合物形式并用，说明书中所揭示的各个特征，可以任何提供相同、均等或相似目的的替代性特征取代。因此除有特别说明，所揭示的特征仅为均等或相似特征的一般性例子。0075本发明的有益之处在于1提供了一种新型的STR基因座，不存在CNV，且不位于高度重复序。

32、列区域。00762新STR基因座的杂合度高，分辨率高。00773新STR基因座兼容性高，能与已有的大多数位点在同一体系内使用。00784新STR基因座或与已知STR基因座结合，能够有效区分随机人群的遗传关系。0079下面结合具体实施例，进一步阐述本发明。应理解，这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件，例如SAMBROOK等人，分子克隆实验室手册NEWYORKCOLDSPRINGHARBORLABORATORYPRESS,1989中所述的条件，或按照制造厂商所建议的条件。除非另外说明，否则百分比和份数是重量百分比和重量份数。00。

33、80除非另行定义，文中所使用的所有专业与科学用语与本领域熟练人员所熟悉的意义相同。此外，任何与所记载内容相似或均等的方法及材料皆可应用于本发明方法中。文中所述的较佳实施方法与材料仅作示范之用。0081实施例1将本发明新的STR基因座G15S0001与10个常用基因座位点VWA，D16S539，D5S818，D7S820，D13S317，D8S1179，D18S51，TH01，D2S1338，AMELO组合，采用多重荧光PCR技术检查样本，所用4个样本分别为有亲缘关系的一家三口样本，和1个无亲缘关系的对照样本。G15S0001和10个常用基因座引物序列如表2所示。0082表2引物序列说明书CN1。

34、04099324A108/12页11注PET、VIC、NED、FAM四种荧光染料APPLIEDBIOSYSTEMS,USA公司。0083具体实验操作步骤如下1DNA样本准备对4个选取的样本个体采集血液；通过DNA提取试剂盒抽提得到DNA样本并各取1L，1AGAROSE电泳对其样本进行质量检查以及浓度估计，然后根据估计的浓度将样本稀释到工作浓度510NG/L。00842PCR反应各取1UL样本，进行PCR反应。0085PCR反应体系总体积为10微升1L10PCR缓冲液QIAGEN公司、02L25MMOL氯化镁、1L检测多个STR基因座的混合引物、08L25MMOLDNTP、004LHOTSTAR。

35、PLUSTAQ酶QIAGEN公司、596LDDH2O。0086PCR反应条件设置如下9510分钟；7个循环的TOUCHDOWN程序9420秒，651/循环40秒和722MIN，28个循环扩增9420秒，6330秒和722MIN，在72延伸2分钟，在60延伸60分钟，4保存；PCR反应完成后，将PCR扩增产物稀释20倍，取出1UL加入89ULHIDI（高度去离子甲酰胺）和01ULLIZ（ABI公司专利染料，被用来标记分子量内标），混匀后955MIN，毛细管电泳上样；因所用STR位点检测引物带有荧光，通过毛细管电泳检测不同颜色荧光及说明书CN104099324A119/12页12不同大小的扩增片断。

36、，以荧光检测系统分析结果得出STR分型信息，结果如图14和表3所示。008711个基因座的基因分型结果如表3所示；样本1表示父本，样本2表示母本，样本3表示子代，样本4表示对照样本。0088表3基因分型结果说明书CN104099324A1210/12页13注表格中X与Y表示性染色体，数字则表示样本等位基因中重复单元的相对重复数值。0089结果表明，采用新筛选得到的G15S0001位点明显可以验证出样本1与样本2、样本3之间存在亲缘关系，与样本4排除亲缘关系，新筛选得到的G15S0001位点在结果上表现出了较高的区分度，应用到STR分型、亲权鉴定、个体识别等生物医学检测中，能有效提高分型识别效率。

37、和准确性，并且G15S0001基因座位点具有很好的兼容性，能和绝大部分已有的STR基因座位点组合使用，有很强的实用性。0090实施例2随机选取20组具有亲缘关系和无亲缘关系的样本，采用实施例1的方法进行检测，不同之处在于，仅采用本发明新的STR基因座G15S0001。0091经检测，在确定父本样本后，再确定剩下19组样本中与父本有亲缘关系的子代样本，本发明新的STR基因座G15S0001可以准确排除其中13组无亲缘关系的样本，表现出了较高的区分度。0092采用实施例1的方法，将本发明新的STR基因座G15S0001与6个常用基因座位点VWA，D16S539，D18S51，TH01，D2S133。

38、8，AMELO组合，对剩余的6组样本进行检测，准确鉴定了其亲缘关系。0093表4随机20个无亲缘关系和有亲缘关系的样本的基因分型结果说明书CN104099324A1311/12页14注样本1表示父本，样本2表示母本，样本3表示子代，其它样本无亲缘关系；为确定性别加入AMELO；表格中X与Y表示性染色体，数字则表示样本等位基因中重复单元的相对重复数值。0094结果表明，仅通过本发明STR基因座G15S0001，就可提供极有价值的分型信息。当然，说明书CN104099324A1412/12页15G15S0001与其他已知的位点结合可以提供更准确的分型信息，例如，G15S0001外加两个位点D2S1。

39、338和D16S539，就可以准确排除剩余6组中无亲缘关系的样本，外加更多的位点，准确度更高。可见在现有常用的位点组合中，加入了G15S0001，可以大大提高个体识别的准确度。0095在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考，就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解，在阅读了本发明的上述讲授内容之后，本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改，这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。说明书CN104099324A151/8页16天昊生物医药科技（苏州）有限公司新的短核苷酸串联重复序列位点及其应用CN13020624PATENTINVERSION35180DNA智人。

40、HOMOSAPIENS1CTATCTATCTATCTAATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA60TCTATCTATCTATCTATCTA8021664DNA智人HOMOSAPIENS2GTAAAATGGAGAAATGAAGTCACTCGCTTCATTTCAGGCTCAAATTTTGAGTCCAAGGAG60TAACATTAATTTGTGTATATCTTATTATCATTAACTTAGATAATCGGATAAACAGCAACT120GTGTCATAGGACAAATGATATTCTTATGACGAGGTTTCAAAAATATCCTCGTGGCCA。

41、GAT180TTTAAAATAACTGAGTGAAGCGTCATCATTTTTTCCAGATTAGTTCAAACAAAGTCCCTG240TCTTTCTTTCCTCTGAGCAGTGAGAAAATGCTCCTCTTCCAAGAAGACTTCTTTGATCCA300TTGGAGTTAAGGGAAGGATTTCCTCCTCTTTAGGCATAAAAACCAATTGTTTTCAGGCAA360序列表CN104099324A162/8页17CAGGGATGAATCTAACAGAAAAAATTGAATAATAAACAATAAACAATGTAAAATTTAAAA420GGAAAATAATACAGAACTT。

42、CTTTACTTACGTATATTTACTGGCTGCTTCCTATAAGTATG480CGTCACTCTCCTGTTTATAACTCATGAATAGTAATTCTTTTGAGAGAGAAAAACTGCGGC540AACGAAACCACAAAACACGTTGTTAGGGCAAATGCATTTGGTAATAATGAGAGCTTTGTT600TTCCACTTTTCTTTAAAAGTGGAACTTTTTCTCCCTTTATACTAATCCACTTATTTCACT660CTTTTCTGTTTTGTCTATCCCTCTATGTATATATGTGTCTATCTATCTACTATTTGCCAT720CTGT。

43、CTACCAATCTATTTATTTATCTACCTACCATCTCTCTATCCTCTATCTATCCATCT780ATCTACTATCTATCTATCTAATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT840ATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCACCTATCTATTTCTAGTTCCAGCCCCACTGAGA900AGTCTGGCACTGAGGTCTTTTCTCTCCCAGCCATATTATAAGCACAATCCTAGGGCCTTA960TAAGCAAAAGCATCCAGCTCTAAATAAAAAGTCTAAGAACACTGGATGCAAT。

44、TAAATATT1020CAAGTTCTGTAAGTTTCAGCTTTATTTGAGCCTGAAAAGTATAGAACCGAGAGAAGGTTG1080TTTGCTTGTCTTTATGTTTTGATGTGCCTGATCATTCACAGAGTTTAGTCAGTTCACAGA1140AAAATCCCACCTTGAAATTCTCTTTTAATTATTATCTCTTTTACAGCTCAAGATTCCTGG1200CATCTCCTTTGGTGACTACCACCCCTCACTCCACACACAAACACACATGTGCAGAGAACA1260AATATACCTCCAATACACCTTTATCAAAAATA。

45、TAGAGTAAATAAAAAATCAAGACATGAA1320GAATGTACCTGCTGGAAATGACTGTTTTTTTTTTATCCTGAATTTCCAAAAGAAACTGCT1380GATCAATTGTGAAGAATGTGGTTGCAATAAAAGTGAATATTAAGTGGAGGTGCAGTGGGG1440GCAGGGAGTGAAGACCAACTAAACCACAGTACCTGGTGAGGGTGCAGTTTGGGGCCTCTC1500序列表CN104099324A173/8页18TTGGTGGCTGCCCAGTACCCTTTGAAGTGCATATGCTGCATGGATGCATGGGT。

46、GCCTGGA1560GCTCAGCTAGAATGCCAAATCCATTCTCTCCTCTCTCTCCCTTTCTGTTGCAGAGACAGA1620GGCAAGGGCAAAAATCGTTGCAGCTCTCGTATTATGAACCAGGA1664334DNA人工序列3GTTTCTTTGCATTTGGTAATAATGAGAGCTTTGT34424DNA人工序列4GGTGGGATTTTTCTGTGAACTGAC24525DNA人工序列5GCCCTGGGCTCTGTAAAGAATAGTG25628DNA人工序列序列表CN104099324A184/8页196GTTTCTTGAGGCCAACCATCA。

47、GAGCTTA28723DNA人工序列7AAACAAAGGCAGATCCCAAGCTC23832DNA人工序列8GTTTCTTTTAGCGTTTGTGTGTGCATCTGTAA32936DNA人工序列9GTTTCTTGGACAGATGATAAATACATAGGATGGATG361024DNA人工序列10CCGGGCACTTTGCCCTTATTATTT24序列表CN104099324A195/8页201132DNA人工序列11GTTTCTTCAAGTGATTCCAATCATAGCCACAG321224DNA人工序列12TACACAACACGCCTTTCCTCTGAA241327DNA人工序列13。

48、ACGATTCCACATTTATCCTCATTGACA271433DNA人工序列14GTTTCTTTGGTCAGGCTGACTATGGAGTTATTT331533序列表CN104099324A206/8页21DNA人工序列15GTTTCTTGACTCTCTGGACTCTGACCCATCTAA331624DNA人工序列16TCCTTCAACTTGGGTTGAGCCATA241724DNA人工序列17TGTGACCACACGGCCAAGTAGAAG241833DNA人工序列18GTTTCTTCCTGTAGATTATTTTCACTGTGGGGA331929DNA人工序列序列表CN104099324A。

49、217/8页2219AAAATACTAACAATAGGCCAAGCGTGATG292031DNA人工序列20GTTTCTTTTCTCTGGTGTGTGGAGATGTCTT312130DNA人工序列21GTTTCTTGCAGGTCACAGGGAACACAGACT302224DNA人工序列22GGCAAATAGGGGGCAAAATTCAAA242329DNA人工序列23GTTTCTTGCCTCCTCTGATCACCCCATTA29序列表CN104099324A228/8页232424DNA人工序列24GGAGCCAGTGGATTTGGAAACAGA24序列表CN104099324A231/4页24图1说明书附图CN104099324A242/4页25图2说明书附图CN104099324A253/4页26图3说明书附图CN104099324A264/4页27图4说明书附图CN104099324A27。