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本发明公开了一种采用不对称方波调制方法测量干涉式光纤陀螺本征频率,该方法通过控制模块FPGA控制DDS产生不同频率下的不对称方波对Y波导进行相位调制;并由信号处理模块DSP实时解算出A/D采样时间T内的累加和的差值绝对值Pd,并对所述差值绝对值Pd进行极小值判断,当差值绝对值Pd趋近于零时,则有光纤陀螺本征频率fe等于调制频率fd。此种测量方法测得的本征频率fe精度高,频率跟踪调整速度快,实时性高。