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1、(10)申请公布号 CN 103160481 A (43)申请公布日 2013.06.19 CN 103160481 A *CN103160481A* (21)申请号 201210554971.1 (22)申请日 2012.12.19 2011-277193 2011.12.19 JP C12N 9/18(2006.01) C12N 15/55(2006.01) C12N 15/63(2006.01) C12N 1/21(2006.01) C12N 15/10(2006.01) C12R 1/19(2006.01) C12R 1/01(2006.01) (71)申请人 住友化学株式会社 地址 。
2、日本国东京都 (72)发明人 秋山敏彦 平田纪彦 宝来真志 (74)专利代理机构 中科专利商标代理有限责任 公司 11021 代理人 吴小明 (54) 发明名称 不对称水解酶及其基因 (57) 摘要 本发明涉及, 例如, - 取代的 - 氨基酸酯 衍生物不对称水解酶, 所述酶包括以下(a)或 (b) 的酶 : (a) 包含 SEQ ID NO : 1 的至少第 1 位至第 362位的氨基酸序列的酶, 其中SEQ ID NO : 1的第 277 位的酪氨酸被丙氨酸、 色氨酸、 异亮氨酸或组 氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 或 者 (b) 包含 SEQ ID NO : 1 的至少第 。
3、1 位至第 362 位的氨基酸序列的酶, 其中SEQ ID NO : 1的第277 位的酪氨酸被不同于酪氨酸的氨基酸取代, 并且 所述酶具有水解底物的能力。 (30)优先权数据 (51)Int.Cl. 权利要求书 1 页 说明书 15 页 序列表 6 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 权利要求书1页 说明书15页 序列表6页 (10)申请公布号 CN 103160481 A CN 103160481 A *CN103160481A* 1/1 页 2 1. 以下 (a) 或 (b) 的酶 : (a)包含SEQ ID NO : 1的至少第1位至第362位的氨基酸序列的。
4、酶, 其中SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被丙氨酸、 色氨酸、 异亮氨酸或组氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物 的能力 ; 或者 (b) 包含 SEQ ID NO : 1 的至少第 1 位至第 362 位的氨基酸序列的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被不同于酪氨酸的氨基酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力。 2. 一种多核苷酸, 所述多核苷酸包含编码根据权利要求 1 所述的酶的氨基酸序列的核 苷酸序列。 3. 一种载体, 所述载体包含根据权利要求 2 所述的多核苷酸。 4. 一种转化体, 在所述转化体中已经引入了根据权利要求 2 所述的多核。
5、苷酸。 5. 一种转化体, 所述转化体包含根据权利要求 3 所述的载体。 6. 一种生产酶的方法, 所述方法包括培养根据权利要求 4 或 5 所述的转化体。 7.一种修饰包含SEQ ID NO : 1的氨基酸序列的酶的方法, 所述方法包括将SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列中的第 277 位的酪氨酸用丙氨酸、 色氨酸、 异亮氨酸或组氨酸取代的步骤。 8. 一种修饰包含编码 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列的核苷酸序列的多核苷酸的方法, 所 述方法包括将编码SEQ ID NO : 1的氨基酸序列的核苷酸序列中第829至831位的编码酪氨 酸的密码子用编码丙氨酸、 色氨酸、 异亮氨酸。
6、或组氨酸的密码子取代的步骤。 权 利 要 求 书 CN 103160481 A 2 1/15 页 3 不对称水解酶及其基因 0001 本申请要求于 2011 年 12 月 19 日提交的日本专利申请号 2011-277193 的优先权 和利益, 所述日本专利申请号 2011-277193 的全部内容通过引用结合于此。 技术领域 0002 本发明涉及适用于 - 取代的 - 氨基酸酯衍生物的不对称水解的酶, 编码所述 酶的多核苷酸等。 背景技术 0003 旋光 - 取代的 - 氨基酸衍生物作为用于制备药物本体 (bulk) 化合物、 农业化 学品或生物活性物质的原料和中间体是有用的。例如, 专利文。
7、献 1 公开了被用作用于制备 抗菌剂的物质的旋光 - 取代的 - 氨基酸衍生物。此外, 非专利文献 1 和 2 公开了被用 作用于制备细胞毒性酯肽念珠草环肽 (cryptophycin) 的中间体的旋光 - 取代的 - 氨 基酸衍生物。 0004 水解酶具有水解底物的能力, 并且近年来, 已被用于制备例如用作药物或农业化 学品的活性成分的化合物或其中间体的有机合成反应。尤其, 水解酶已被用于制备旋光化 合物或其中间体的有机合成反应。例如, 具有 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列并且具有水解底 物的能力的酶已知作为水解酶 ( 参见例如, 专利文献 2)。 0005 理想的是, 这样的用于。
8、制备旋光化合物或其中间体等的可用于工业的水解酶, 具 有以下性质 : 产生具有高光学纯度的水解反应产物的能力 ; 高度识别底物的绝对构型的能 力 ; 对各种反应条件如温度, pH, 溶剂或压力的高度稳定性 ; 等等。尤其, 如果反应产物具有 高光学纯度 ( 即水解酶的光学选择性高 ), 则在酶反应后不需要纯化步骤以致于旋光化合 物可以以有利的产率被合成。 0006 引用列表 0007 专利文献 0008 专利文献 1 : WO 02/102790 0009 专利文献 2 : 日本专利号 3875283 0010 非专利文献 0011 非专利文献 1 : J.Am.Chem.Soc.1995, 。
9、117, 2479 0012 非专利文献 2 : J.Chem.Soc., Perkin Trans.1, 2000, 1461 发明内容 0013 为了减少反应步骤并提高生产率, 强烈需要开发具有高光学选择性的水解酶。 0014 本发明提供, 例如, 具有优异光学选择性的水解酶以及编码所述酶的多核苷酸。 0015 在示例性实施方案中, 本发明提供以下 1)-8) : 0016 1) 以下 (a) 或 (b) 的酶 ( 下文中, 有时被称为本发明的酶 ) : 0017 (a) 包含 SEQ ID NO : 1 的至少第 1 位至第 362 位的氨基酸序列的酶, 其中 SEQ ID 说 明 书 。
10、CN 103160481 A 3 2/15 页 4 NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被丙氨酸、 色氨酸、 异亮氨酸或组氨酸取代, 0018 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 或者 0019 (b) 包含 SEQ ID NO : 1 的至少第 1 位至第 362 位的氨基酸序列的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被不同于酪氨酸的氨基酸取代, 0020 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 0021 2)包含编码根据1)的酶的氨基酸序列的核苷酸序列的多核苷酸(下文中, 有时被 称为本发明的多核苷酸 ) ; 0022 3) 包含根据 2) 的多核苷酸的载体 ( 下文中。
11、, 有时被称为本发明的载体 ) ; 0023 4) 引入有根据 2) 的多核苷酸的转化体 ( 下文中, 有时被称为本发明的转化体 ) ; 0024 5) 包含根据 3) 的载体的转化体 ; 0025 6) 一种生产酶的方法, 所述方法包括培养根据 4) 或 5) 的转化体 ; 0026 7) 一种修饰包含 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列的酶的方法, 所述方法包括以下步 骤 : 将 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列中的第 277 位的酪氨酸用丙氨酸、 色氨酸、 异亮氨酸或组 氨酸取代 ( 下文中, 有时被称为本发明的酶修饰方法 ) ; 以及 0027 8) 一种修饰包含编码 S。
12、EQ ID NO : 1 的氨基酸序列的核苷酸序列的多核苷酸的方 法, 所述方法包括以下步骤 : 将编码 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列的核苷酸序列中第 829 至 831 位的编码酪氨酸的密码子用编码丙氨酸、 色氨酸、 异亮氨酸或组氨酸的密码子取代 ( 下 文中, 有时被称为本发明的多核苷酸修饰方法 )。 0028 根据本发明, 可以提供具有优异光学选择性等的水解酶, 所述水解酶可用于制备 旋光化合物或所述旋光化合物的中间体、 如旋光 - 取代的 - 氨基酸衍生物的有机合成 反应, 所述旋光化合物可用作药物或农业化学品中的活性成分。 具体实施方式 0029 下文中, 更具体地说明本。
13、发明。 0030 当在本文中使用时, 本发明的酶可以被描述为 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列中的位 置号与表示氨基酸的字母表的一个字母的组合。例如, 277I表示这样的酶, 所述酶包 含相当于SEQ ID NO : 1的氨基酸序列的氨基酸序列, 不同之处在于它具有氨基酸突变, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被异亮氨酸取代。 0031 关于本发明的酶,水解底物的能力 ( 下文中, 有时被称为水解酶活性 ) 可以 例如通过以下方法确定 : 在水的存在下将所述酶与其底物如 - 取代的 - 氨基酸酯衍生 物 ( 具体地, 例如, 2- 正丁基 -3-(N- 苄氧基。
14、 -N- 甲酰基 ) 氨基 丙酸乙酯 ) 混合, 随后将 该混合物在 25孵育, 并且然后通过高效液相色谱定量 - 取代的 - 氨基酸衍生物 ( 具 体地, 例如, 2- 正丁基 -3-(N- 苄氧基 -N- 甲酰基 ) 氨基 丙酸 ) 在获得的反应溶液中的光 学纯度和化学纯度。 0032 本发明的酶是通过以下 (a) 或 (b) 表征的酶 : 0033 (a) 包含 SEQ ID NO : 1 的至少第 1 位至第 362 位的氨基酸序列的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被丙氨酸、 色氨酸、 异亮氨酸或组氨酸取代, 0034 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 。
15、或者 0035 (b) 包含 SEQ ID NO : 1 的至少第 1 位至第 362 位的氨基酸序列的酶, 其中 SEQ ID 说 明 书 CN 103160481 A 4 3/15 页 5 NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被不同于酪氨酸的氨基酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能 力。 0036 具有SEQ ID NO : 1的氨基酸序列的酶(下文中被称为野生型水解酶)是本领域中 已知的来源于色杆菌 (Chromobacterium)SC-YM-1 菌株 (FERMBP-6703) 的水解酶。当在重 组大肠杆菌 (E.coli) 中生产该野生型水解酶时, 除了全长水解酶以外, 还产生缺。
16、少全长水 解酶的八个 C 端氨基酸的截短的水解酶。该截短的水解酶具有水解活性, 并且其 C 端氨基 酸是 Glu, 对应于 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列中的第 362 位的 Glu。因此, 本发明的酶可以 具有对应于 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列的至少第 1 位至第 362 位的氨基酸序列。 0037 上述不同于酪氨酸的氨基酸是指构成蛋白质的 20 种氨基酸中除酪氨酸之外 的任何氨基酸, 包括甘氨酸、 丙氨酸、 缬氨酸、 亮氨酸、 异亮氨酸、 丝氨酸、 苏氨酸、 半胱氨酸、 甲硫氨酸、 天冬氨酸、 谷氨酸、 天冬酰胺、 谷氨酰胺、 赖氨酸、 精氨酸、 组氨酸、 脯氨酸、。
17、 苯丙氨 酸或色氨酸。优选地, 上述不同于酪氨酸的氨基酸是指丙氨酸、 色氨酸、 异亮氨酸或组 氨酸。 0038 本发明的酶的具体实例包括以下酶 : 0039 基本上由 SEQ ID NO : 1 的第 1 位至第 362 位的氨基酸序列组成的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被丙氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 0040 包含 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被 丙氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 0041 基本上由 SEQ ID NO : 1 的第 1 位至第 36。
18、2 位的氨基酸序列组成的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被色氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 0042 包含 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被 色氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 0043 基本上由 SEQ ID NO : 1 的第 1 位至第 362 位的氨基酸序列组成的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被异亮氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 0044 包含 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列的酶, 其中 SEQ 。
19、ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被 异亮氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 0045 基本上由 SEQ ID NO : 1 的第 1 位至第 362 位的氨基酸序列组成的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被组氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力 ; 以及 0046 包含 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列的酶, 其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被 组氨酸取代, 并且所述酶具有水解底物的能力。 0047 为获得包含编码本发明的酶的氨基酸序列的核苷酸序列的多核苷酸, 例如, 可以 使用以下方法。 0048 首先。
20、, 获得包含编码野生型水解酶的氨基酸序列的核苷酸序列的多核苷酸 ( 下文 中, 有时被称为野生型多核苷酸 )。编码 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列的核苷酸序列的实例 包括 SEQ ID NO : 10 或 SEQ ID NO : 11 的核苷酸序列。 0049 野生型多核苷酸可以根据常规遗传工程技术获自色杆菌 SC-YM-1 菌株 ( 根 据布达佩斯条约, 在 1999 年 4 月 15 日保藏于国际专利生物保藏中心 (International Patent Organism Depositary)(IPOD), 国家技术和评估研究所 (National Institute of 。
21、Technology and Evaluation)(NITE), Tsukuba Central6, 1-1-1, Higashi, Tsukuba, 说 明 书 CN 103160481 A 5 4/15 页 6 Ibaraki 305-8566, 日本, 保藏编号为 FERMBP-6703), 所述遗传工程技术描述于, 例如, J.Sambrook, E.F.Fritsch, T.Maniatis ; Molecular Cloning( 第 二 版 ), Cold Spring Harbor Laboratory, 1989 中。具体地, 根据常规方法从色杆菌 SC-YM-1 菌株抽提。
22、基因组 DNA。例如, 通过常规方法如超声波均化作用将细菌细胞破碎, 之后是蛋白酶处理等并且随 后抽提基因组DNA。 将获得的基因组DNA用适当的限制酶切割, 并使用连接酶将其插入到例 如噬菌体载体 gt11 或质粒载体 pUC19 中, 从而由此制备基因组 DNA 文库。可以通过筛选 方法从获得的基因组 DNA 文库获得野生型多核苷酸, 所述筛选方法例如使用针对野生型水 解酶的抗体的免疫学方法, 使用对应于野生型水解酶的部分氨基酸序列的合成的 DNA 探针 的杂交方法, 或测定野生型水解酶活性的方法。 备选地, 野生型多核苷酸也可以通过以下方 法来制备 : 使用合适的引物进行PCR, 由此扩。
23、增包含编码SEQ ID NO : 1的氨基酸序列的核苷 酸序列的多核苷酸。 0050 可以通过如下所示的位点定向诱变来突变获得的野生型多核苷酸, 由此制备本发 明的多核苷酸。位点定向诱变方法是这样的方法, 其中使用整合有原始的多核苷酸 ( 即野 生型多核苷酸)的质粒的单链DNA作为模板以及包含要被突变的核苷酸序列的合成的寡核 苷酸作为引物来合成变体多核苷酸(即本发明的多核苷酸)。 在本发明中, 可以制备用于诱 变的引物以通过 PCR 方法进行扩增, 以使 SEQ ID NO : 1 的氨基酸序列中第 277 位的氨基酸 可以被不同于酪氨酸的氨基酸取代。优选的是第 277 位的氨基酸被丙氨酸、 。
24、色氨酸、 异亮氨 酸或组氨酸取代的特定突变。 0051 在本文的上下中,位点定向诱变方法的实例可以包括 Olfert Landt 等的 方 法 (Gene 96, 125-128, 1990), Smith 等 的 方 法 (Genetic Engineering 3, 1, Setlow, J. 和 Hollaender, A, Plenum : New York), Vlasuk 等的方法 (Experimental Manipulation of Gene Expression, Inouye, M. : Academic Press, New York), 以 及 Hos.N.Hunt。
25、 等 的 方法 (Gene 77, 51, 1989), 以及使用市售试剂盒如 Mutan-Express Km( 由 Takara Shuzo Co., Ltd. 生产 ), TaKaRa LaPCR 体外诱变试剂盒 ( 由 Takara Shuzo Co., Ltd. 生产 ), 和 QuikChange II 位点定向诱变试剂盒 ( 由 Stratagene Corp. 生产 )。 0052 具体地, 为制备编码包含SEQ ID NO : 1的至少第1位至第362位的氨基酸序列(其 中使用例如 Olfert Landt 等的方法 (Gene 96, 125-128, 1990) 用不同于。
26、酪氨酸的氨基酸 取代 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸 ) 的水解酶的多核苷酸, 首先根据例如以下文献中 所述的方法制备整合了野生型基因的载体 (DNA) : J.Sambrook, E.F.Fritsch, T.Maniatis ; Molecular Cloning 第二版, Cold Spring Harbor Laboratory, 1989。 0053 随后, 将所获得的载体 (DNA) 用作模板从而通过 PCR 方法扩增 DNA 片段, 所述 PCR 方法使用, 例如, 包含编码其中 SEQ ID NO : 1 的第 277 位的酪氨酸被丙氨酸、 色氨酸、 异亮。
27、 氨酸或组氨酸取代的氨基酸序列的核苷酸序列的寡核苷酸 ( 例如, 包含 SEQ ID NO : 2 的核 苷酸序列的寡核苷酸)作为正义引物和包含与正义引物互补的核苷酸序列的寡核苷酸(例 如, 包含 SEQ ID NO : 3 的核苷酸序列的寡核苷酸 ) 作为反义引物。在本文中, PCR 反应的 条件的实例可以包括以下条件 : 在 95孵育 1 分钟 ; 并且随后是 95孵育处理 50 秒、 然后 55 1 分钟以及 68 5 分钟进行 12 个循环 ; 并且最后在 4孵育。将 DpnI 限制酶加入到 含扩增的DNA片段的PCR反应溶液中, 并且然后在37孵育1小时, 之后用所得的溶液转化 大肠。
28、杆菌。可以从所获得的转化体中纯化载体, 由此获得所需的本发明的多核苷酸。 说 明 书 CN 103160481 A 6 5/15 页 7 0054 也可以基于本发明的多核苷酸的核苷酸序列, 根据常规方法如亚磷酸三酯法 (Hunkapiller, M. 等, Nature, 310, 105, 1984), 通过化学合成包含所需核苷酸序列的核酸来 制备本发明的多核苷酸。 0055 为了获得本发明的酶, 制备允许本发明的多核苷酸在宿主细胞如微生物中表达的 载体, 并且将所述载体引入到宿主细胞中以制备转化体。 随后, 可以根据常规细胞培养方法 来培养所制备的转化体。以此方式, 可以大量制备并获得本发。
29、明的酶。 0056 本发明的载体包含本发明的多核苷酸。 0057 本发明的载体可以通过以下方法构建 : 根据常规遗传工程技术将本发明的多核苷 酸整合到载体中, 所述载体可以用于要引入本发明的多核苷酸的宿主细胞中, 例如, 所述载 体包含在宿主细胞中可复制的遗传信息, 可以自主增殖, 可以从宿主细胞分离和纯化, 并且 具有可检测的标记物 ( 下文中, 有时被称为基本载体 )。 0058 在本文中, 在将大肠杆菌用作宿主细胞的情况中,基本载体的实例包括 : 载 体 pUC119( 由 Takara Shuzo Co., Ltd. 生产 ) 和噬菌粒 pBluescript II( 由 Strata。
30、gene Corp. 生产 )。此外, 在将芽殖酵母用作宿主细胞的情况中, 基本载体的实例可以包括 载体 pGBT9, pGAD424, 和 pACT2( 由 ClontechLaboratories, Inc. 生产 )。此外, 在将哺乳 动物细胞用作宿主细胞的情况中,基本载体的实例可以包括载体如 pRc/RSV 和 pRc/ CMV( 由 InvitrogenCorp. 生产 ), 包含来源于病毒的自主复制起点的载体如牛乳头瘤病毒 (bovine papilloma virus) 载体 pBPV( 由 Amersham Pharmacia Biotech Inc. 生产 ) 和 EB 病毒。
31、载体 pCEP4( 由 Invitrogen Corp. 生产 ), 以及病毒如牛痘病毒。此外, 在将昆虫细 胞用作宿主细胞的情况中,基本载体的实例可以包括昆虫病毒如杆状病毒。 0059 当使用含自主复制起点的载体 ( 具体地, 例如, 用于酵母的载体 pACT2, 牛乳头瘤 病毒载体 pBPV, 或 EB 病毒载体 pCEP4) 构建本发明的载体时, 在被引入到宿主细胞后, 该载 体在细胞内保持为附加体。 0060 可以通过以下方法转化宿主细胞 : 向其中引入允许本发明的多核苷酸在宿主细胞 如微生物中表达的载体, 由此制备转化体。可以根据常规细胞培养方法培养所制备的转化 体, 由此大量生产并。
32、获得本发明的酶。 0061 允许本发明的多核苷酸在宿主细胞如微生物中表达的载体可以通过以下方法制 备 : 将在宿主细胞如微生物中可操作的 (operable) 启动子可操作地连接到本发明的多核 苷酸的上游, 并将此整合到上述基本载体中。 0062 在本文中, 短语可操作地连接或可操作连接的是指连接启动子和本发明的多 核苷酸以使本发明的多核苷酸在引入有本发明的多核苷酸的宿主细胞如微生物中在启动 子的控制下表达。 0063 在宿主细胞中可操作的启动子的实例可以包括在转移有本发明的多核苷酸的宿 主细胞中显示启动子活性的DNA。 在宿主细胞是大肠杆菌的情况中, 在宿主细胞中可操作的 启动子的实例可以包。
33、括大肠杆菌乳糖操纵子启动子 (lacP), 色氨酸操纵子启动子 (trpP), 精氨酸操纵子启动子 (argP), 半乳糖操纵子启动子 (galP), tac 启动子, T7 启动子, T3 启 动子, 和 噬菌体启动子 (-pL 和 -pR)。此外, 在宿主细胞是动物细胞或裂殖酵母 的情况中, 在宿主细胞中可操作的启动子的实例可以包括劳斯肉瘤 (Rous sarcoma) 病毒 (RSV) 启动子, 巨细胞病毒 (CMV) 启动子, 猿病毒 (SV40) 早期或晚期启动子, 和鼠乳瘤病毒 说 明 书 CN 103160481 A 7 6/15 页 8 (mouse mammary tumor。
34、 virus, MMTV)启动子。 此外, 在宿主细胞是芽殖酵母的情况中, 在宿 主细胞中可操作的启动子的实例可以包括 ADH1 启动子 (ADH1 启动子可以通过常规遗传工 程方法从例如携带有 ADH1 启动子和 ADH1 终止子的酵母表达载体 pAAH5 可从 Washington Research Foundation 获得 ; Ammerer 等, Method in Enzymology, 101 部分 (p.192-201) 制备 )。 0064 在使用本来就携带有在宿主细胞中可操作的启动子的基本载体的情况中, 本发明 的多核苷酸可以被插入到该启动子的下游以使该启动子可操作地连接到。
35、本发明的多核苷 酸。 在例如pRc/RSV或pRc/CMV的情况中, 将克隆位点设置于在动物细胞中可操作的启动子 的下游。通过将本发明的多核苷酸插入到克隆位点获得的载体可以被引入到动物细胞中, 由此允许本发明的多核苷酸在动物细胞中表达。因为这些载体原本就携带有 SV40 自主复 制起点 (ori), 所以当所述载体被引入到转化有 ori 缺失型 SV40 基因组的培养的细胞 ( 例 如, COS 细胞 ) 中时, 该载体的拷贝数在细胞内大量增加, 并且因此, 已经整合到该载体中的 本发明的多核苷酸可以大量表达。 此外, 用于酵母的载体pACT2具有ADH1启动子, 并且本发 明的多核苷酸可以被。
36、插入到该载体或其衍生物中的 ADH1 启动子的下游, 由此构建允许本 发明的多核苷酸在芽殖酵母(例如, CG1945(由Clontech Laboratories, Inc.生产)中大 量表达的载体。将本发明的多核苷酸连接到核糖体结合位点可以获得更高的表达。虽然关 于核糖体结合位点已知 Guarente.L 等的报道 (Cell 20, p.543(1980) 以及 Taniguchi 等 的报道 (Genetics of IndustrialMicroorganisms( 工业微生物的遗传学 ), p.202(1982), Kodansha Ltd.), 但是可以根据需要设计并合成适合于本发。
37、明的多核苷酸的表达的核糖体 结合位点。 0065 宿主细胞的实例可以包括微生物, 例如, 真核生物和原核生物。 其优选的实例可以 包括大肠杆菌。 上述载体可以通过常规遗传工程方法被引入到宿主细胞中由此转化该宿主 细胞。 0066 适于宿主细胞的常规转染方法可以用于将本发明的载体引入到宿主细胞中的方 法。在将大肠杆菌用作宿主细胞的情况中, 转染方法的实例可以包括常规方法如氯化钙法 以及电穿孔法, 所述方法描述于, 例如, J.Sambrook, E.F.Frisch, T.Maniatis ; Molecular Cloning(分子克隆)第二版, Cold Spring Harbor Labo。
38、ratory, 1989。 此外, 在将哺乳动物 细胞或昆虫细胞用作宿主细胞的情况中, 转染方法的实例可以包括常规基因转移方法如磷 酸钙方法、 DEAE葡聚糖法、 电穿孔法和脂质转染法。 此外, 在将酵母用作宿主细胞的情况中, 转染方法的实例可以包括常规方法如锂方法, 所述方法用于, 例如, Yeast transformation kit( 酵母转化试剂盒 )( 由 ClontechLaboratories, Inc. 生产 )。在使用病毒作为载体的 情况中, 可以通过如上所述的常规基因转移方法将病毒的基因组引入到宿主细胞中。 此外, 也可以通过用病毒颗粒感染宿主细胞而将病毒的基因组引入到宿。
39、主细胞中, 所述病毒颗粒 含有插入了本发明的多核苷酸的病毒的基因组。 0067 对于本发明的转化体的选择, 例如, 可以将其中标记基因与本发明的载体一起被 引入的宿主细胞通过适合于标记基因的性质的方法培养。 在标记基因是例如赋予针对选择 试剂的药物抗性的基因的情况中, 引入有本发明的载体的宿主细胞可以使用补充有该选择 试剂的培养基培养, 所述选择试剂显示对宿主细胞的致死活性。赋予药物抗性的基因和选 择试剂的组合的实例可以包括赋予新霉素抗性的基因和新霉素的组合, 赋予潮霉素抗性的 说 明 书 CN 103160481 A 8 7/15 页 9 基因和潮霉素的组合, 以及赋予杀稻瘟菌素 S(Bla。
40、sticidin S) 抗性的基因和杀稻瘟菌素 S 的组合。在标记基因是互补宿主细胞的营养缺陷型的基因的情况中, 引入有本发明的载体 的宿主细胞可以使用不含对应于该营养缺陷型的营养物的基本培养基进行培养。此外, 在 引入允许本发明的多核苷酸在宿主细胞中表达的本发明的载体的情况中, 可以使用基于本 发明的酶的酶活性的检测方法。 0068 为了获得其中本发明的多核苷酸位于宿主细胞的染色体中的本发明的转化体, 例 如, 本发明的载体和具有标记基因的载体首先通过用限制酶等消化来线性化, 并且然后通 过上述方法将这些引入到宿主细胞中。随后, 通常将细胞培养数周。然后, 可以通过基于所 引入的标记基因的表。
41、达水平的选择来获得目标转化体。 备选地, 例如, 首先通过上述方法将 本发明的载体引入到宿主细胞中, 所述载体具有作为标记基因的如上所述的赋予对选择试 剂的抗性的基因。随后, 将细胞在补充有选择试剂的培养基中传代培养数周或更长。然后, 已经以集落形式存活的抗选择试剂的克隆也可以被培养以用于纯化, 由此选择并获得其中 本发明的多核苷酸被引入到宿主细胞的染色体中的本发明的转化体。 为确认引入的本发明 的多核苷酸被成功地整合在宿主细胞的染色体中, 根据常规遗传工程方法制备细胞的基因 组 DNA, 并且可以使用以下方法, 如 PCR 或 DNA 杂交 (Southernhybridization), 。
42、利用包含引 入的本发明的多核苷酸的部分核苷酸序列的 DNA 作为引物或探针, 从制备的基因组 DNA 检 测本发明的多核苷酸的存在。 因为转化体可以冷冻保存并且如有必要的话可以在复苏后使 用, 可以节约每个实验的转化体制备的时间和精力, 并且可以使用其性质或操作条件已被 提前确认的转化体来进行测试。 0069 含本发明的多核苷酸或本发明的载体的转化体 ( 即, 本发明的转化体 ) 的培养可 以通过常规细胞培养方法进行。 0070 在本发明的转化体是微生物的情况中, 例如, 转化体可以使用适当地含有碳源、 氮 源、 有机或无机盐等的用于常规微生物的常规培养的各种培养基培养。 0071 碳源的实例。
43、包括 : 糖类如葡萄糖、 糊精和蔗糖 ; 糖醇如甘油 ; 有机酸如富马酸、 柠 檬酸和丙酮酸 ; 以及动物油、 植物油和糖蜜。 被添加到培养基中的碳源的量通常为培养液的 大约 0.1 至 30 (w/v)。 0072 氮源的实例包括 : 天然有机氮源如肉膏、 蛋白胨、 酵母抽提物、 麦芽提取物、 大豆 粉、 玉米浆、 棉籽粉、 干酵母和酪蛋白氨基酸 ; 氨基酸 ; 无机酸的钠盐如硝酸钠 ; 无机酸的铵 盐如氯化铵、 硫酸铵和磷酸铵 ; 有机酸的铵盐如富马酸铵和柠檬酸铵 ; 和尿素。在这些中, 有机酸的铵盐、 天然有机氮源、 氨基酸等在很多情况中也可以用作碳源。 被添加到培养基中 的氮源的量通常。
44、为培养液的大约 0.1 至 30 (w/v)。 0073 有机盐或无机盐的实例可以包括钾、 钠、 镁、 铁、 锰、 钴、 锌、 铜等的氯化物、 硫酸盐、 乙酸盐、 碳酸盐和磷酸盐。具体地, 其实例包括氯化钠、 氯化钾、 硫酸镁、 硫酸亚铁、 硫酸锰、 氯化钴、 硫酸锌、 硫酸铜、 乙酸钠、 碳酸钙、 磷酸二氢钾和磷酸氢二钾。被添加到培养基中的 有机盐和 / 或无机盐的量通常为培养液的大约 0.0001 至 5 (w/v)。 0074 此外, 在其中引入有基因的转化体的情况中, 例如, 可以将少量的异丙基硫 代 -D- 半乳糖苷 (IPTG) 作为诱导剂加入到培养基中以用于诱导本发明的酶的产生,。
45、 所 述基因是通过将异乳糖可诱导型启动子如 tac 启动子、 trc 启动子和 lac 启动子可操作地 连接到本发明的多核苷酸而制备的。 说 明 书 CN 103160481 A 9 8/15 页 10 0075 本发明的转化体的培养可以根据通常用于培养宿主细胞如微生物的方法来进行。 所述方法的实例包括液体培养和固体培养, 如试管振荡培养、 往复式 (reciprocal) 振荡培 养、 发酵罐培养和槽培养 (tank culture)。 0076 培养温度可以在可使转化体存活的范围内适当变化, 并且通常是约 15至约 40。培养基的 pH 优选为约 6 至约 8。培养时间取决于培养条件而不同。
46、并且通常优选为约 1 天至约 5 天。 0077 在常规蛋白质纯化中使用的方法可以应用于从本发明的转化体的培养物纯化本 发明的酶的方法。例如, 可以使用如下显示的方法。 0078 首先, 通过离心等从转化体的培养物收集细胞, 并且然后将这些细胞通过例如以 下方法均化 : 物理均质法如超声波处理、 Dyno-mill 处理或弗氏压碎 (French press) 处理, 或化学均质法, 其使用表面活性剂, 或裂解酶如溶菌酶。可以通过离心、 通过薄膜过滤器过 滤等将杂质从所获得的匀浆溶液中除去, 由此制备不含细胞的提取物溶液, 然后可以适当 地使用诸如以下的分离和纯化方法将该提取物溶液分级 : 阳。
47、离子交换色谱, 阴离子交换色 谱, 疏水色谱, 凝胶过滤色谱, 或金属螯合色谱, 由此纯化本发明的酶。 0079 用于色谱的载体的实例包括不可溶的聚合物载体如纤维素、 糊精或琼脂糖, 其 中引入有羧甲基 (CM), 二乙氨基乙基 (DEAE), 苯基, 或丁基。可以使用市售的装填有载 体 (carrier-packed) 的柱。市售的装填有载体的柱的实例包括 Q-Sepharose FF 和苯 基 -Sepharose HP( 商品名 ; 都由 GEHealthcare Japan 生产 ), 以及 TSK-gel G3000SW( 商 品名 ; 由 Tosoh Corp. 生产 )。 008。
48、0 为选择包含本发明的酶的级分, 例如, 可以基于根据本发明的水解酶活性的出现 或不出现或其出现的程度进行所述选择。可以通过以下方法进行该选择 : 测定不对称水解 底物 - 取代的 - 氨基酸酯衍生物 ( 具体地, 例如, 2- 正丁基 -3-(N- 苄氧基 -N- 甲酰 基 ) 氨基 丙酸乙酯 ) 从而优先产生相应的羧酸的能力。 0081 用本发明的酶或本发明的转化体或其加工产物处理-取代的-氨基酸酯衍生 物从而优先产生相应的旋光羧酸。 0082 与 - 取代的 - 氨基酸酯衍生物的 位的碳原子结合的取代基 ( 下文中, 简称 为 - 取代基 ) 是具有 1 至 20 个碳原子的烃基。所述烃。
49、基可以是以下任一 : 脂族烃基、 脂 环族烃基和芳族烃基以及它们的组合。 对于作为-取代基的烃基, 其碳原子数目优选为1 至 7, 更优选为 3 至 6。脂族烃基典型地是烷基。其实例包括甲基、 乙基、 丙基、 丁基、 戊基、 己基、 辛基、 癸基、 十二烷基、 十四烷基、 十六烷基、 十八烷基和二十烷基 (icosyl group), 所 述基团可以是直链的或支链的。 脂环族烃基的实例包括环丁基、 环戊基、 环己基、 环辛基、 环 癸基、 降莰烷基 (norbornyl) 和金刚烷基。芳族烃基典型地是芳基。芳基的实例包括苯基、 萘基、 蒽基和联苯基。作为 - 取代基的这些烃基也可以被取代。取代基的实例包括烷基、 烷氧基、 芳基、 芳氧基、 芳烷氧基、 卤素原子、 硝基和氰基。 0083 - 取代的 。