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本发明公开了一种血栓切除系统,是通过机械取栓装置取出栓子,疏通血管,实现血管再通。取栓时会在栓塞部位近端放置一根球囊导引导管,临时阻塞血流,防止取栓过程产生的细小破碎栓子被血流冲向血管远端;同时,对于较大栓子,也可先用球囊导引导管抽吸一部分血栓,再用血栓切除器取出剩余血栓。本发明的血栓切除系统设有血栓切除器、球囊导引导管与输送微导管,其中,血栓切除器作为主要组件,设有切除弹簧,切除弹簧释放状态为锥。