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1、(10)申请公布号 CN 104004088 A (43)申请公布日 2014.08.27 CN 104004088 A (21)申请号 201410124303.4 (22)申请日 2008.09.26 0718832.9 2007.09.26 GB 0718834.5 2007.09.26 GB 200880113719.9 2008.09.26 C07K 16/00(2006.01) C12N 15/63(2006.01) C12N 1/21(2006.01) C12N 5/10(2006.01) A61K 39/395(2006.01) A61P 29/00(2006.01) A61P。
2、 37/02(2006.01) A61P 35/00(2006.01) (71)申请人 UCB 医药有限公司 地址 比利时布鲁塞尔 (72)发明人 DP胡姆皮雷斯 E达弗 (74)专利代理机构 中国国际贸易促进委员会专 利商标事务所 11038 代理人 傅宇昌 (54) 发明名称 双特异性抗体融合物 (57) 摘要 本发明提供了双特异性抗体融合蛋白, 其包 含具有对于目的抗原的特异性的抗体Fab或Fab 片段, 所述片段与至少一个具有对于第二目的抗 原的特异性的单结构域抗体相融合。 (30)优先权数据 (62)分案原申请数据 (51)Int.Cl. 权利要求书 2 页 说明书 26 页 序列表。
3、 26 页 附图 6 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 权利要求书2页 说明书26页 序列表26页 附图6页 (10)申请公布号 CN 104004088 A CN 104004088 A 1/2 页 2 1. 双特异性抗体融合蛋白, 其包含具有对于目的抗原的特异性的抗体 Fab 或 Fab 片 段, 所述片段与至少一个具有对于第二目的抗原的特异性的单结构域抗体相融合。 2. 根据权利要求 1 的融合蛋白, 其在所述 Fab 或 Fab 片段的重链或轻链的 N- 或 C- 末 端处包含单结构域抗体。 3. 根据权利要求 2 的融合蛋白, 其中所述单结构域抗体是 V。
4、H 或 VHH。 4. 根据权利要求 2 的融合蛋白, 其中所述单结构域抗体是 VL。 5. 根据权利要求 1 的融合蛋白, 其包含两个单结构域抗体, 其中一个单结构域抗体与 所述 Fab 或 Fab 片段的轻链的 C- 末端相融合, 而另一个单结构域抗体与所述 Fab 或 Fab 片段的重链的 C- 末端相融合。 6.根据权利要求5的融合蛋白, 其中每个单结构域抗体是具有相同的结合特异性的VH 结构域。 7.根据权利要求5的融合蛋白, 其中每个单结构域抗体是具有相同的结合特异性的VL 结构域。 8. 根据权利要求 5 的融合蛋白, 其中一个单结构域抗体是 VH 结构域, 而另一个单结构 域抗。
5、体是VL结构域, 并且所述VH和VL结构域是协作地结合所选择的抗原的互补VH/VL对。 9. 根据权利要求 8 的融合蛋白, 其中所述 VH 结构域与所述 Fab 或 Fab 片段的重链的 C- 末端相融合, 并且所述 VL 结构域与所述 Fab 或 Fab 片段的轻链的 C- 末端相融合。 10. 根据权利要求 1-9 中任一项的融合蛋白, 其中每个单结构域抗体是完全人的或人 源化的。 11. 根据权利要求 1-10 中任一项的融合蛋白, 其中所述 Fab 或 Fab 是完全人的或人源 化的。 12. 根据权利要求 1 至 11 中任一项的融合蛋白, 其中与所述抗体 Fab 或 Fab 片段。
6、相 融合的每个单结构域抗体是经由独立地选自下列的接头进行融合的 : 氨基酸序列 GS、 PPP、 SEQ ID NO:1、 SEQ ID NO:2、 SEQ ID NO:3、 SEQ ID NO:4、 SEQ ID NO:5、 SEQ ID NO:6、 SEQ ID NO:7、 SEQ ID NO:8、 SEQ ID NO:9、 SEQ ID NO:10、 SEQ ID NO:11、 SEQ ID NO:12、 SEQ ID NO:13、 SEQ ID NO:14、 SEQ ID NO:15、 SEQ ID NO:16、 SEQ ID NO:17、 SEQ ID NO:18、 SEQ ID N。
7、O:19、 SEQ ID NO:20、 SEQ ID NO:21、 SEQ ID NO:22、 SEQ ID NO:23、 SEQ ID NO:24、 SEQ ID NO:25、 SEQ ID NO:26、 SEQ ID NO:27、 SEQ ID NO:28、 SEQ ID NO:129、 SEQ ID NO:30、 SEQ ID NO:31、 SEQ ID NO:32、 SEQ ID NO:33、 SEQ ID NO:34、 SEQ ID NO:35、 SEQ ID NO:36、 SEQ ID NO:37、 SEQ ID NO:38、 SEQ ID NO:39、 SEQ ID NO:40、。
8、 SEQ ID NO:41、 SEQ ID NO:42、 SEQ ID NO:43、 SEQ ID NO:44、 SEQ ID NO:45、 SEQ ID NO:46、 SEQ ID NO:47、 SEQ ID NO:48、 SEQ ID NO:49、 SEQ ID NO:50 和 SEQ ID NO:51。 13. 根据权利要求 12 的融合蛋白, 其中所述接头序列选自 SEQ ID NO:1、 SEQ ID NO:2、 SEQ ID NO:3 和 SEQ ID NO:45。 14. 根据权利要求 2 的融合蛋白, 其中所述单结构域抗体经由具有 SEQ ID NO:2 或 SEQ ID NO。
9、:45 中给出的序列的接头与所述 Fab 或 Fab 片段的重链的 C- 末端相连接。 15. 根据权利要求 2 的融合蛋白, 其中所述单结构域抗体经由具有 SEQ ID NO:1 或 SEQ ID NO:45 中给出的序列的接头与所述 Fab 或 Fab 片段的轻链的 C- 末端相连接。 16. 根据权利要求 9 的融合蛋白, 其中所述 VH 结构域经由具有 SEQ ID NO:2 或 SEQ ID NO:45 中给出的序列的接头与所述 Fab 或 Fab 片段的重链的 C- 末端相连接, 并且所述 VL 权 利 要 求 书 CN 104004088 A 2 2/2 页 3 结构域经由具有 。
10、SEQ ID NO:1 或 SEQ ID NO:45 中给出的序列的接头与所述 Fab 或 Fab 片段 的轻链的 C- 末端相连接。 17. 根据权利要求 1-16 中任一项的融合蛋白, 其中每个单结构域抗体具有对于血清载 体蛋白、 循环免疫球蛋白分子或 CD35/CR1 的特异性, 所述单结构域抗体通过与所述血清载 体蛋白、 循环免疫球蛋白分子或 CD35/CR1 结合而为具有对于所述目的抗原的特异性的所 述抗体 Fab 或 Fab 片段提供了延长的半衰期。 18. 根据权利要求 17 的融合蛋白, 其中每个单结构域抗体的特异性是对于血清载体蛋 白的。 19.根据权利要求17或权利要求18。
11、的融合蛋白, 其中所述血清载体蛋白是选自下列的 人血清载体蛋白 : 甲状腺素结合蛋白、 运甲状腺素蛋白、 1- 酸性糖蛋白、 转铁蛋白、 纤维 蛋白原和血清白蛋白。 20. 根据权利要求 19 的融合蛋白, 其中所述血清载体蛋白是人血清白蛋白。 21. 表达载体, 其包含关于权利要求 1 至 20 中任一项之中所定义的双特异性抗体融合 蛋白的密码。 22. 宿主细胞, 其包含权利要求 21 中所定义的载体。 23.权利要求1至20中任一项之中所定义的双特异性抗体融合蛋白在制备用于治疗疾 病或病症的药物中的用途。 24. 用于治疗疾病或病症的方法, 其包括施用治疗有效量的权利要求 1 至 20 。
12、中任一项 之中所定义的双特异性抗体融合蛋白。 权 利 要 求 书 CN 104004088 A 3 1/26 页 4 双特异性抗体融合物 0001 本申请是申请日为 2008 年 9 月 26 日、 申请号为 200880113719.9、 发明名称为 “双 特异性抗体融合物” 的发明专利申请的分案申请。 0002 本发明涉及新的双特异性抗体融合蛋白。 此类抗体包含针对目的抗原的第一特异 性, 和对于第二目的抗原的第二特异性, 所述第二目的抗原例如为血清载体蛋白, 其用于在 延长抗体的体内血清半衰期中使用。 还提供了用于产生此类分子的方法和包含它们的药物 组合物。 0003 抗体的高特异性和亲。
13、和力使得它们成为理想的诊断和治疗剂, 特别是用于调节蛋 白质 : 蛋白质相互作用。在重组抗体技术领域中的进展已导致产生出抗体片段例如 Fv、 Fab、 Fab 和 F(ab )2片段及其他抗体片段。这些更小的分子保留了完整抗体的抗原结合 活性, 并且还可以展示出相比于完整免疫球蛋白分子而言经改善的组织渗透和药物代谢 动力学特性。事实上, 抗体片段被证明是多用途的治疗剂, 如通过产品例如和 的近期成功而可见的。尽管此类片段看起来展示出超过完整免疫球蛋白的 许多优点, 但它们还遭受了增加的从血清中的清除率, 因为它们缺乏赋予长的体内寿命的 Fc 结构域 (Medasan 等人 ,1997,J.Im。
14、munol.158:2211-2217) 。 0004 先前已描述了具有双特异性即与两种不同的抗原相结合的抗体 (关于综述, 参 见 Segal 等 人 ,1999,Curr.Opin.Immunol.11:558-562 ; Plckthun308:17-30 中)中, 所述表达载体包含编码人 -1CH1恒定区的DNA。 这产生了由下列组成的双顺反子基因 排列 : 经由接头与dAb相融合 的人源化轻链的基因, 随后为人源化重链 Fab 片段的基因, 两者都在 tac 启动子的控制下。 还编码了在 Gly4Ser 接头上游的独特的 BspE1 位点, 或在富含 Ala-Pro 的接头上游的 A。
15、scI 位点。 0159 为了 dAb 与重链 C- 末端的融合, 合成了编码人 CH1 片段 (具有 1 同种型) 以及随 后的接头编码序列和 dAb 的 DNA。将这作为 ApaI-EcoRI 限制片段亚克隆到 UCB-Celltech 内部的表达载体 pTTOD(Fab)(pTTO-1 的衍生物, 其描述在 Popplewell 等人 (上文) 中) 中, 所述表达载体包含编码人-1CH1恒定区的DNA。 这产生由下列组成的双顺反子基因排列 : 说 明 书 CN 104004088 A 21 19/26 页 22 人源化轻链的基因, 非编码性基因间序列, 随后为经由接头与 dAb 相融合。
16、的重链的基因, 这 两个基因都在 tac 启动子的控制下。将该重组表达质粒转化到大肠杆菌菌株 W3110 中, 在 其中通过添加 IPTG 来诱导表达。最初通过在大约 0.5 的 OD(600nm) 时添加 200uMIPTG 来 以小规模进行表达实验 (5ml 培养体积) , 在诱导后 2 小时收获细胞, 并且在 Tris/EDTA 中于 30提取过夜。将经澄清的提取物用于通过 Biacore 的亲和力分析。选择给出有前途的表 达产率和活性的构建体用于发酵。 0160 方法 0161 在下列实施例中, 将 dAb 所与之融合的抗体链命名为 CK 或 LC (对于 c 轻链) , 和 命名为 。
17、CH1 或 HC(对于重链恒定结构域 CH1) 。 0162 用于在大肠杆菌中表达的 FabA-dAb 融合物质粒的构建 0163 通过使 dAbL3 或 dAbH4 与 FabA 的轻链或重链恒定区的 C- 末端相融合来构建 Fab-dAb 融合蛋白。使用柔性接头 (SGGGGSE(SEQ ID NO:1) ) 或刚性接头 (G(APAPA)2(SEQ ID NO : 34) ) 来将 dAb 与 c 区 (SEQ ID NO:75) 相连接, 而使用接头 DKTHTS(SEQ ID NO:2) 来将 dAb 与 CHI 区 (SEQ ID NO:76) 相连接。作为片段合成地制备编码恒定区。
18、 -dAb 融 合物 的 DNA 序列, 以使得能够亚克隆到内部的 pTTOD 载体的 FabA 序列中。 0164 通过下列方式来构建轻链-dAb融合物 : 将合成的基因的SacI-ApaI片段亚克隆到 能够表达 FabA 的质粒的相应位点中, 所述合成的基因编码经由柔性接头 (SGGGGSE(SEQ ID NO:1) ) 或刚性接头 (G(APAPA)2(SEQ ID NO : 34) ) 与 dAbL3 或 dAbH4 相融合的 C- 末端 c。 0165 通过下列方式来构建重链 -dAb 融合物 : 将合成的基因的 ApaI-EcoRI 片段亚克隆 到能够表达 FabA 的质粒的相应位。
19、点中, 所述合成的基因编码经由 DKTHTS 接头与 dAbL3 或 dAbH4 相融合的 C- 末端 CHI。 0166 Fab A 源自 IL-1 结合抗体, 其重链和轻链序列分别提供在图 7 中所示的 SEQ ID NO:74 和 75 中。在其中轻链具有附着的 dAb 的 Fab A 中, 将重链的铰链改变为 DKTHTS, 即 使当无 dAb 与重链 (SEQ ID NO:76) 相附着时。 0167 FabA包含相同的轻链序列 (SEQ ID NO:75) 和在链间半胱氨酸处终止的截短的重链 序列 (SEQ ID NO:77) 。 0168 dAbL3 和 dAbH4 分别为结合人。
20、血清白蛋白的轻链和重链结构域抗体。 0169 用于在大肠杆菌中表达的 FabA-didAb 融合物质粒的构建 0170 通过将编码 CH1-dAb 融合物的 ApaI-EcoRI 片段亚克隆到现有的 Fab-dAb 质粒 (其 中 dAb 经由柔性接头与轻链相融合) 中来构建在轻链和重链上均具有 dAbL3 或 dAbH4 的 FabA-didAb。 0171 用于在哺乳动物细胞中表达的 FabB-dAb 融合物质粒的构建 0172 FabB-dAbs、 FabB-dAbH1(CH1-G4Sx2) 、 FabB-dAbH2(CH1-G4Sx2) 、 FabB-dAbL1 (CH1-G4Sx2)。
21、 、 FabB-dAbL2(CH1-G4Sx2) 都通过 PCR 进行装配, 然后克隆到哺乳动物表达载 体中从而在 HCMV-MIE 启动子和 SV40E polyA 序列的控制下。这些与包含 FabB 轻链的相似 载体相配对以用于在哺乳动物细胞中表达 (参见下文) 。 0173 FabB 源自结合细胞表面共刺激分子的抗体。 0174 如实施例 3 中所描的, 获得 dAbH1、 dAbH2、 dAbL1 和 dAbL2。 0175 用于在哺乳动物细胞中表达的 FabB-dAb 融合质粒的构建 说 明 书 CN 104004088 A 22 20/26 页 23 0176 FabB-dAbs、。
22、 FabB-dAbH1(CH1-G4Sx2) 、 FabB-dAbH2(CH1-G4Sx2) 、 FabB-dAbL1 (CK-G4Sx2) 、 FabB-dAbL2(CK-G4Sx2) 都通过 PCR 进行装配, 然后克隆到哺乳动物表达载体 中从而在 HCMV-MIE 启动子和 SV40E polyA 序列的控制下。 0177 FabB-dAbs 和 didAbs 的哺乳动物表达 0178 根据制造商的说明书, 使用 Invitrogen 的 293fectin 转染试剂, 用重链和轻链质 粒转染 HEK293 细胞。简而言之, 使 2g 重链质粒 2g 轻链质粒与 10l293fectin。
23、 340l Optimem介质一起在RT下温育20分钟。 然后, 将该混合物添加至处于悬浮的5106 个 HEK293 细胞, 并且于 37在摇动下温育 4 天。 0179 Biacore 0180 使 用 CM5 传 感 器 芯 片 和 HBS-EP(10mM HEPES(pH7.4),150mM NaCl,3mM EDTA,0.05%v/v 表面活性剂 P20) 运行缓冲液, 通过在 Biacore T100 上进行的表面等离子 共振 (SPR) 来测定关于 Fab-dAb 构建体的相互作用的结合亲和力和动力学参数。使用人 F(ab )2- 特异性山羊 Fab(Jackson Immuno。
24、Research, 109-006-097) 或内部产生的抗人 CH1 单克隆抗体来将 Fab-dAb 样品捕获至传感器芯片表面。通过标准的胺偶联化学来达到捕获 抗体的共价固定。 0181 每个试验循环由下述组成 : 首先采用 1 分钟注射来捕获 Fab-dAb, 随后为由 3 分钟 的抗原注射组成的缔合阶段, 在这之后监控解离 5 分钟。在每个循环后, 采用下列方式来使 捕获表面再生 : 21 分钟的 40mM HCl 注射, 随后为 30 秒的 5mM NaOH。所使用的流速对于捕 获来说为10l/分钟, 对于缔合和解离阶段来说为30l/分钟, 和对于再生来说为10l/ 分钟。 0182 。
25、关于动力学试验, 执行抗原滴定法 (对于人血清白蛋白通常为 62.5nM-2M, 对于 IL-1 为 1.25-40nM) , 将空白流动池 (flow-cell) 用于参照扣除, 并且包括了缓冲液空白 注射以扣除仪器噪声和偏移。 0183 使用 Biacore T100 评价软件, 通过所得到的传感图 (sensorgram) 与标准 1:1 结合 模型的同时总体配合 (simultaneous global-fi tting) 来测定动力学参数。 0184 为了测试同时的结合, 在被捕获的 Fab-dAb 上注射分开的 5MHSA 或 100nM IL-1, 或者 5M HSA 和 100。
26、nM IL-1 的混合溶液的 3 分钟注射。 0185 从大肠杆菌中纯化 Fab-dAb 0186 周质提取 0187 将在周质内包含 Fab-dAbs 的大肠杆菌粒状沉淀重悬浮在具有 100mM Tris/ HCl,10mM EDTA pH7.4 的原始培养体积中。然后, 使这些悬浮液于 4在 250rpm 下温育 16 小时。使重悬浮的粒状沉淀于 4以 10000xg 离心 1 小时。去除上清液, 并且进行 0.45m 过滤。 0188 G 蛋白捕获 0189 通过 G 蛋白色谱法从经过滤的上清液中捕获 Fab-dAbs。简而言之, 以 20 分钟 的停留时间将上清液施加至在 20mM 磷。
27、酸盐 ,150mM NaCl pH7.1 中平衡的 Gammabind Plus Sepharose (GE Healthcare) 柱。用 20mM 磷酸盐 ,150mM NaCl pH7.1 洗涤该柱, 并且用 0.1M 甘氨酸 /HCl pH2.8 洗脱下结合的材料。收集洗脱峰, 并且用 1M 乙酸钠将 pH 调整至 pH5。 将 pH 经调整的洗出液浓缩, 并且使用 10k MWCO 膜而渗滤到 50mM 乙酸钠 pH4.5 中。 说 明 书 CN 104004088 A 23 21/26 页 24 0190 离子交换 0191 用 NaCl 洗脱梯度, 在 pH4.5 下, 通过阳离。
28、子交换色谱法来进一步 纯化 Fab-dAbs。 简而言之, 将经渗滤的 G 蛋白洗出液施加至在 50mM 乙酸钠 pH4.5 中平衡的 Source15S(GE Healthcare) 柱。用 50mM 乙酸钠 pH4.5 洗涤该柱, 并且用 20 柱体积的在 50mM 乙酸钠 pH4.5 中0至1M NaCl的线性梯度来洗脱下结合的材料。 在该梯度自始至终收集第三柱体积级分。 通过 A280 和 SDS-PAGE 来分析所述级分, 并且汇集相关级分。 0192 凝胶过滤 0193 如果需要, 通过凝胶过滤来进一步纯化 Fab-dAbs。简而言之, 将 FabA-dAbL3 (CK-SG4SE。
29、)汇集的离子交换洗脱级分施加至在 50mM 乙酸钠 ,125mM NaCl pH5.0 中平衡 的 Superdex200(GE Healthcare) 柱, 并且用 50mM 乙酸钠 ,125mM NaCl pH5.0 的等度梯度 (isocratic gradient) 来进行洗脱。在该梯度自始至终收集 1/120 柱体积级分。通过 A280 和 SDS-PAGE 来分析所述级分, 并且汇集相关级分。 0194 对于未经历凝胶过滤的Fab-dAbs, 将汇集的离子交换洗脱级分浓缩, 并且使用10k MWCO 膜而渗滤到 50mM 乙酸钠 ,125mM NaCl pH5.0 中。 0195 。
30、SDS-PAGE 0196 当需要时用水稀释样品, 然后向 10l 中添加 10L2X 样品走样缓冲液。对于非 还原的样品, 在这一点上添加 2L100mM NEM, 而对于还原的样品, 添加 2L10X 还原剂。使 样品涡旋振荡, 于 85温育 5 分钟, 冷却, 并且在 12500rpm 下离心 30 秒。将准备好的样品 加载到 4-20% 丙烯酰胺 Tris/ 甘氨酸 SDS 凝胶上, 并且在 125V 下走样 100 分钟。将凝胶转 移到 PVDF 膜上以用于 Western 印迹法, 或者用考马斯蓝蛋白质染料进行染色。 0197 Western 印迹法 0198 在 150mA 下,。
31、 在 12mM Tris,96mM 甘氨酸 pH8.3 中, 将凝胶转移至 PVDF 膜, 共 16 小 时。用在 PBS 0.1%Tween20 中的 2%MarvelTM (封闭缓冲液) 使 PVDF 膜封闭 1 小时。 0199 抗 - 轻链 0200 HRP- 兔抗人 轻链, 在封闭缓冲液中的 1/5000 稀释度, 共 1 小时。 0201 抗 - 重链 0202 小鼠抗人重链, 在封闭缓冲液中的 1/7000 稀释度, 共 1 小时。随后为 HRP- 山羊抗 小鼠, 在封闭缓冲液中的 1/2000 稀释度, 共 1 小时。 0203 抗 -His 标签 0204 兔抗 His6, 。
32、在封闭缓冲液中的 1/1000 稀释度, 共 1 小时。随后为 HRP- 山羊抗兔 IgG, 在封闭缓冲液中的 1/1000 稀释度, 共 1 小时。 0205 所有印迹用 100ml PBS 0.1%Tween20 洗涤 6 次, 每次洗涤 10 分钟。印迹用下列 方式进行显现 : 用 ECL 试剂 1 分钟, 随后暴露于 Amersham Hyperfi lm ; 或者用金属增强的 DAB 试剂 20-30 分钟, 随后为水。 0206 高温反相 HPLC 0207 样品 (2g) 于 80在 2.1mm C8Poroshell 柱上进行分析, 其中使用 2ml/ 分钟的 流速和 18-3。
33、8%B 的梯度, 经过 4 分钟。 0208 A=0.1%TFA, 在 H2O 中 0209 B=0.065%TFA, 在 80:20IPA:MeOH 中 说 明 书 CN 104004088 A 24 22/26 页 25 0210 通过在 214nm 处的吸收来进行检测。 0211 ELISA 0212 使用夹心 ELISA 来测量 Fab-dAb 的产率。简而言之, 用抗 -CH1 抗体来捕获 Fab-dAb, 随后用抗 -HRP 来揭示。 0213 实施例 3 : 0214 产生抗白蛋白抗体 0215 用重组的chromapure人血清白蛋白 (购自Jackson) 对1/2垂耳 兔进。
34、行免疫接种。 兔以皮下方式接受 100ug HSA 蛋白的 3 次免疫接种, 第一次免疫接种在完全弗氏佐剂中, 而 后续的免疫接种在不完全弗氏佐剂中。使用 WO04/051268 中描述的方法来分离出结合人、 小鼠和大鼠血清白蛋白的抗体 1 和 2。分离出抗体 1 和 2 的重链可变结构域 (VH) 和轻链可 变结构域 (VL) 的基因, 并进行测序, 在经由反转录 PCR 进行克隆后。 0216 将所嫁接的轻链序列亚克隆到兔轻链表达载体 pVRbcK 中, 所述表达载体包含编 码兔 C- 恒定区的 DNA。将所嫁接的重链序列亚克隆到兔重链表达载体 pVRbHFab 中, 所 述表达载体包含编。
35、码兔 Fab 重链恒定区的 DNA。将质粒共转染到 CHO 细胞中, 并且就白蛋 白结合和亲和力来筛选所产生的抗体 (表 1) 。根据制造商的说明书 (InVitrogen, 目录号 11668) , 使用 LipofectamineTM2000 操作程序来进行 CHO 细胞的转染。 0217 产生人源化的结构域抗体 dAbL1、 dAbH1、 dAbL2 和 dAbH2 0218 通过使用人 V- 区接纳体构架和供体残基 (在构架区中) 来设计人源化的 VL 和 VH 区。对于抗体 1 和 2 中的每一种, 设计一个所嫁接的 VL 区 (L1(SEQ ID NO:53) 和 L2(SEQ I。
36、D NO:55) ) 和一个 VH 区 (H1(SEQ ID NO:52) 和 H2(SEQ ID NO:54) ) , 并且通过寡核苷酸装 配和 PCR 诱变来构建基因。所嫁接的结构域抗体及其 CDRs 显示在图 5 中。 0219 表 1 : 抗白蛋白抗体的亲和力 0220 0221 实施例 4 : 在哺乳动物细胞中表达的 FabB-dAbs 的分析 0222 如在 “方法” 中所描述的, 产生 FabB-dAb 构建体, 并且在 BIAcore 中直接测试包含 FabB-dAbs 的来自经转染的 HEK293 细胞的上清液。 0223 进行动力学分析以评估HSA与FabB-dAb构建体的。
37、相互作用。 这些构建体由与FabB 的 CH1 的 C- 末端相融合的 dAbL1、 dAbH2 或 dAbL3 组成 (参见图 6) 。FabB-dAbL1 对于 HSA (KD=170nM) 具有比 FabB-dAbL3(KD=392nM) 更高的亲和力。FabB-dAbH2 显示出具有最差的 针对 HSA 的亲和力 (KD=1074nM) , 参见表 2。 0224 表 2 0225 说 明 书 CN 104004088 A 25 23/26 页 26 0226 关于 HSA 与融合至 dAbL1、 dAbH2 或 dAbL3 的 FabBs 的结合而测定的亲和力和动 力学参数。所显示的。
38、数据为平均值 SEM。 (对于 FabB-dAbL1 和 FabB-dAbH2, n=4。对于 FabB-dAbL3, n=2) 。 0227 FabB-dAb蛋白质的SDS-PAGE和Western印迹法证实了, 所产生的FabB-dAbs具有 预期的大小。 0228 实施例 5 : 在哺乳动物细胞中表达的 FabB-didAbs 的分析 0229 如在 “方法” 中所描述的, 产生 FabB-didAb 构建体, 并且在 BIAcore 中直接测试包 含 didAbs 的来自经转染的 HEK293 细胞的上清液。 0230 使用其中将单 dAbs 与 Fab 的重链和轻链 C- 末端两者相。
39、融合的 didAb 构建体来进 行进一步的分析。与单独的单 dAb 相比较而言, 其中 didAb 源自天然重链和轻链可变结构 域配对的构建体显示出亲和力 的显著改善 (表2和3) 。 由两个等同的dAbL1s组成的didAb 融合物未显示出超过对于单个 dAbL1 所看到的那种的在亲和力方面的改善 (数据未显示) 。 0231 表 3 0232 0233 关于 HSA 与融合至 dAbL1&dAbH1 或 dAbL2&dAbH2 的 FabBs 的结合而测定的亲和力 和动力学参数。 0234 FabB-didAb蛋白质的SDS-PAGE证实了, 所述FabB-didAbs良好地表达并且具有预。
40、 期的大小 (参见图 4a) 。注意 : 该 SDS PAGE 凝胶为由细胞所表达的总蛋白质。 0235 实施例 6 : 经纯化的 FabA-dAbs 的分析 0236 如在 “方法” 中所描述的, 构建出用于在大肠杆菌中表达 Fab-dAbs, Fab A-dAbL3 (CK-SG4SE) Fab A-dAbL3(CK-GAPAPA2) 的质粒。如在 “方法” 中所描述的, 将 Fab-dAbs 表达到大肠杆菌的周质中, 并且纯化至均质。通过高温反相 HPLC、 SDS-PAGE 和 Western 印 迹法来评估 Fab-dAbs 的纯度。还通过 Biacore 就抗原结合来对 Fab-d。
41、Abs 进行评估。 0237 高温反相 HPLC 0238 如在 “方法” 中所描述的来施行的高温反相 HPLC 给出了在 FabA-dAbL3 (CK-SG4SE) 和 FabA-dAbL3(CK-GAPAPA2) 中所包含的所有种类的定量分析。所存在的每种种类的百 分比显示在表 4 中。 0239 表 4 : 在 Fab-dAb 批次中存在的种类的定量 说 明 书 CN 104004088 A 26 24/26 页 27 0240 种类Fab A-dAbL3(CK-SG4SE)Fab A-dAbL3(CK-GAPAPA2) 10.6%1.8% 20.6%0.0% 31.0%0.3% 40.。
42、9%0.8% Fab-dAb85.5%92.9% Di Fab-dAb11.5%4.2% 0241 SDS-PAGE 0242 如在 “方法” 中所描述的, 在非还原和还原条件下准备 Fab-dAb 样品, 并且在凝胶 上走样。对凝胶进行考马斯染色。Fab A-dAbL3 (CK-SG4SE) 和 Fab A-dAbL3 (CK-GAPAPA2) 这两种 Fab-dAb 样品的条带图谱与通过高温反相 HPLC 所观察到的图谱良好地相符合 (图 3) 。 0243 Western 印迹 0244 如在 “方法” 中所描述的, 对 Fab-dAb 样品实施非还原 SDS-PAGE, 随后为用抗 -。
43、 轻 链和抗 - 重链抗体进行的 Western 印迹分析。这证实了, dAb 在 Fab 的轻链上, 并且重链在 两种样品中均是未修饰的 (图 4) 。还证明了, 通过经考马斯染色的非还原 SDS PAGE 而检测 出的所有条带都是 Fab-dAb 相关产物。 0245 Biacore 0246 将如在 “方法”中所描述的通过 SPR 的动力学分析用于评估人血清白蛋白与 Fab A-dAbL3(CK-SG4SE) 和 Fab A-dAbL3(CK-GAPAPA2) 的结合。表 5 中的结果证明, 这两种构建体均能够以大约 1M 的相似的亲和力 (KD) 结合人血清白蛋白。 0247 表 5 。
44、0248 0249 进一步的动力学分析证明, 所有融合构建体保留了原始 FabA 针对 IL-1 的相互 作用特征 (表 6) , 其中在动力学和亲和力参数方面仅可见很小的差异。 0250 表 6 0251 0252 通过将每种构建体捕获至传感器芯片表面来评估每种构建体同时与人血清白蛋 白和IL-1抗原两者相结合的潜力, 然后施行分开的3分钟的5M人血清白蛋白或100nM 说 明 书 CN 104004088 A 27 25/26 页 28 IL-1 注射, 或者 5M 人血清白蛋白和 100nM IL-1 两者的混合溶液注射。对于每种 Fab-dAb 构建体, 对于组合的 HSA/IL-1 。
45、溶液所看到的应答与独立注射的应答之和几乎等 同, 参见表7。 这显示, 所述Fab-dAbs能够同时与IL-1和人血清白蛋白两者相结合, 并且 IL-1 或人血清白蛋白的结合不抑制另一个的相互作用。原始 FabA 仅与 IL-1 结合, 并 且有着可忽略的与人血清白蛋白的结合。 0253 表 7 0254 0255 上表显示了在分开注射 HSA 或 IL-1, 或者注射预混合的 HSA 和 IL-1 后, 对于 每种构建体所看到的结合应答 (RU) 。在每种情况下, 终浓度对于 HSA 来说为 5M, 和对于 IL-1 来说为 100nM。独个的 HSA 和 IL-1 应答之和显示在括号中。 。
46、0256 实施例 7 : FabA didAbs 0257 FabA-didAbs 在大肠杆菌中的表达 0258 在大肠杆菌中表达以 C- 末端 HIS6 标签终止的 FabA-dAbs 和 FabA-didAb 融合物。 在周质提取后, 经由 C- 末端 His6 标签来纯化 dAb 融合蛋白。通过用抗 -CH1 和抗 -c 抗 体来进行的非还原凝胶的 Western 印迹法来分析 Fab 表达。将 FabA-dAb 和 FabA-didAb 表 达为全长蛋白质, 并且显示出与所述两种抗体检测试剂反应。 0259 在大肠杆菌中表达的 FabA-didAbs 的分析 0260 进行进一步的分析。
47、以表征 HSA 与已向其融合了一个或多个 dAbs 的 FabA 构建体的 结合。对于其中 dAbL3 或 dAbH4 与 FabA 的轻链或重链相融合的各种构建体进行结合试验 (关于构建体的细节和结合数据的概括参见表 8) 。尽管看到仅在轻链或重链上携带 dAbH4 的构建体 以相当差的亲和力 (分别 9M 和 3M) 结合 HSA, 但对于携带 dAbL3(作为单一 融合物 (在轻链或重链上) 或者与在相对链上的第二个 dAb(dAbL3 或 dAbH4) 搭档) 的构建 体观察到较高亲和力结合。 0261 表 8 0262 说 明 书 CN 104004088 A 28 26/26 页 。
48、29 0263 关于 HSA 与在轻链 (LC) 或重链 (HC) 或两者上携带 dAbL3 或 dAbH4 的 FabAs(如 所示的) 的结合而测定的亲和力和动力学参数。未检测到 HSA 与原始 FabA 的结合 (nb) 。关 于 HSA 与具有 (在 HC 上的 dAbH4) 或 (在 LC 上的 dAbH4) 的 FabA 的结合的相互作用动力学 太快而无法测定, 因此由稳态结合来测定亲和力 (KD) 。 说 明 书 CN 104004088 A 29 1/26 页 30 0001 0002 序 列 表 CN 104004088 A 30 2/26 页 31 0003 序 列 表 CN 104004088 A 31 3/26 页 32 0004 序 列 表 CN 104004088 A 32 4/26 页 33 0005 序 列 表 CN 104004088 A 33 5/26 页 34 0006 序 列 表 CN 104004088 A 34 6/26 页 35 0007 序 列 表 CN 104004088 A 35 7/26 页 36 0008 序 列 表 CN 104004088 A 36 8/26 页 37 0009 序 列 表 CN 104004088 A 37 9/。