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1、(10)申请公布号 CN 102928970 A (43)申请公布日 2013.02.13 CN 102928970 A *CN102928970A* (21)申请号 201210402820.4 (22)申请日 2012.10.19 G02B 21/00(2006.01) G02B 21/06(2006.01) G02B 21/36(2006.01) (71)申请人 华中科技大学 地址 430074 湖北省武汉市洪山区珞喻路 1037 号 (72)发明人 骆清铭 龚辉 许冬力 李安安 (74)专利代理机构 武汉开元知识产权代理有限 公司 42104 代理人 唐正玉 (54) 发明名称 一种大。
2、样本快速三维显微成像的方法和系统 (57) 摘要 本发明涉及一种大样本快速三维显微成像的 方法及系统, 本发明方法 :(1) 样本包埋在样本块 中固定在精密三维电动平移台上 ;(2) 数字微镜 阵列工作在二值调制的模式下, 对照明光进行二 值调制, 形成结构光条纹, 结构光显微镜采集样本 表层 1 100 微米深度内的图像 ;(3) 完成成像区 域内表层的成像后, 利用金刚石或硬质合金刀具, 去除样本块表层已成像部分 ;(4) 重复步骤 (2) 和 步骤 (3) , 直到完成数据获取任务。本发明的数字 微镜阵列工作在二值调制的模式下, 有效加快成 像速度 ; 通过数字微镜阵列与面阵相机的曝光同。
3、 步方法, 使得只有在面阵相机曝光时样本才会接 受到激发光的照射, 进一步降低样本的曝光量, 避 免光漂白效应对成像带来负面影响。 (51)Int.Cl. 权利要求书 2 页 说明书 5 页 附图 4 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 权利要求书 2 页 说明书 5 页 附图 4 页 1/2 页 2 1. 一种大样本快速三维显微成像的方法, 其特征在于包括以下步骤 : (1) 样本包埋在样本块中, 固定在精密三维电动平移台之上 ; (2) 数字微镜阵列工作在二值调制的模式下, 对照明光进行二值调制, 形成结构光条 纹, 结构光显微镜采集样本表层 1 100 微米深。
4、度内的图像 ; (3) 完成成像区域内表层的成像后, 利用金刚石或硬质合金刀具, 去除样本块表层已成 像部分 ; (4) 重复步骤 (2) 和步骤 (3) , 直到完成数据获取任务。 2. 根据权利要求 1 所述的大样本快速三维显微成像的方法, 其特征在于所述步骤 (2) 具体方法为 : (a) 数字微镜阵列工作在二值调制的模式下 : 指当面阵相机进行曝光时, 数字微镜阵列 中的每个微型反射镜都工作在稳定状态下, 不进行任何翻转, 出射光在物镜焦面只有亮和 暗两种状态, 分别对应微型反射镜固定在入射光出射和非出射两种角度的状态, 不存在灰 度的变化 ; (b) 当曝光完成后, 数字微镜阵列中的。
5、微镜进行翻转, 改变至下一相位图案, 同时触发 面阵相机进行再次曝光, 重复该过程直到完成结构光成像所需的 0、 2/3pi 和 4/3pi 三幅不 同相位图像的采集 ; (c) 步骤 (b) 完成后, 数字微镜阵列中的微镜统一翻转至入射光非出射的角度上, 阻挡 照明光照射到样本上 ; (d) 压电位移器带动物镜进行轴向移动, 使物镜焦面对准同一个成像子区域的更深层 样本进行成像 ; (e)采 集 得 到 的 图 像 存 储 在 计 算 机 硬 盘 或 者 内 存 中,利 用 公 式 获得层析图像, S 表示层析图像, I 表示面值相机 获取的三幅原始图像, 其下标表示三幅原始图像的相位。 3。
6、. 一种大样本快速三维显微成像系统, 包括 : 光源、 光导、 一块激发滤光片、 一块发射 滤光片、 三块透镜、 数字微镜阵列、 二块反射镜、 一块二向色镜、 压电位移器、 物镜、 精密三维 电动平移台、 面阵相机、 数字微镜阵列驱动板、 压电位移驱动器、 平台控制器、 图像采集卡、 计算机、 金刚石或硬质合金刀具, 其特征在于 : 计算机分别与数字微镜阵列驱动板、 压电位 移驱动器、 平台控制器、 图像采集卡相连, 数字微镜阵列与数字微镜阵列驱动板相连, 压电 位移器与压电位移驱动器相连, 精密三维电动平移台与平台控制器相连, 面阵相机与图像 采集卡相连, 面阵相机受数字微 镜阵列驱动板输出。
7、的触发脉冲信号控制采集时刻 ; 由光源 出射的光耦合入光导中, 均匀化后经由激发滤光片、 第一透镜进行准直, 第一反射镜将光束 反射至数字微镜阵列中, 当数字微镜阵列中的微镜处于 12 状态时, 被微镜反射的光线经 由第二反射镜被第二透镜收集, 经过二向色镜反射后进入固定在压电位移器上的物镜中 ; 样本固定在精密三维电动平移台之上, 样本接受激发光后发出的光经物镜、 二向色镜, 第三 透镜和发射滤光片, 最后在面阵相机上成像 ; 金刚石或硬质合金刀具固定在钢制刀架上。 4. 根据权利要求 3 所述的大样本快速三维显微成像系统, 其特征在于 : 所述的光源为 LED、 卤素灯或汞灯。 5. 根据。
8、权利要求 3 所述的大样本快速三维显微成像系统, 其特征在于 : 所述的光导为 权 利 要 求 书 CN 102928970 A 2 2/2 页 3 光纤或液态光导。 6. 根据权利要求 3 所述的大样本快速三维显微成像系统, 其特征在于 : 所述的面阵相 机为电荷耦合元件 CCD 相机或互补金属氧化物半导体 CMOS 相机。 权 利 要 求 书 CN 102928970 A 3 1/5 页 4 一种大样本快速三维显微成像的方法和系统 技术领域 0001 本发明涉及显微成像方法及系统, 具体地说是指一种适用于大样本的, 基于结构 光三维层析的显微光学成像方法及系统。 背景技术 0002 在光学。
9、显微镜领域, 人们一直追求能在更大的成像区域内对获取样本的三维细节 信息。 但这一目标受到三方面的因素的制约, 一是散射光的存在会导致背景光的产生, 导致 传统显微镜成像除了得到物镜焦面上的信息, 还会叠加上来自其它区域的模糊背景, 无法 获得样本的三维层析图像 ; 二是受限于显微物镜的视场和成像速度, 对于厘米级大样本的 显微成像通常需要数十天, 这不仅是对成像系统稳定性和寿命本身是一个很大的挑战, 成 像样本也很难在成像环境下长时间保持性状不变 ; 三是标记样本的成像信号强度会由于蛋 白的光漂白效应而在整个成像过程中不断下降, 成像时间越长, 曝光量越大, 光漂白对成像 的负面影响越大。 。
10、0003 美国专利 US6376818 中描述结构光显微成像作为一种具有获得光学断层成像数 据的成像技术, 基于面扫探测方式使其具有对样本进行快速成像的潜力。目前的结构光显 微镜的大都基于光栅作为光源的调制器, 使用压电位移的方式实现对结构照明光的相移, 这使得结构光显微镜的成像速度严重受限于光栅机械位移的速度, 一般情况只有 1 赫兹左 右。 另一类基于数字微镜阵列的结构光显微镜中(例如中国专利, 申请号200810071628.5, 201110448980.8), 探测器进行曝光期间, 数字微镜驱动版通过产生一系列的脉宽调制信号 (PWM) 控制每个微镜开关状态的占空比, 数字微镜时刻在。
11、翻转, 在不同的两个状态下不停切 换, 产生 256 级不同亮度灰度图案。虽然数字微镜阵列中单个微镜的切换速度可达数万赫 兹, 但这种灰度调制方式将其有效调制速度限制在数十赫兹的水平上。且微型反射镜不断 的翻转, 使得即使在最亮的灰度级数下, 灰度调制的微镜阵列也无法将照明光全部反射至, 照明光的利用率较低, 降低了结构光照明图案的调制深度, 影响了成像速度和成像效果。 0004 综上所述, 现存的针对大样本的三维显微成像方法和系统存在以下不足 :(1) 成 像速度慢, 对于结构光显微镜, 其成像速度主要受限于调制器的有效调制频率 ;(2) 光漂白 影响成像质量。这些问题在实际应用中限制了此类。
12、方法的发展和应用, 因此发展一种适用 于大样本的快速三维显微成像方法和系统很有必要。 发明内容 0005 本发明的提供一种大样本快速三维显微成像的方法和系统, 目的在于克服现有技 术中成像速度慢, 对样本光漂白严重, 机械加工对样本形态的影响的缺点。 0006 一种大样本快速三维显微成像的方法, 其特征在于包括以下步骤 : 0007 (1) 样本包埋在样本块中, 固定在精密三维电动平移台之上 ; 0008 (2) 数字微镜阵列工作在二值调制的模式下, 作为结构光显微镜中的空间光调制 器, 对于照明光进行二值调制, 形成结构光条纹, 结构光显微镜采集样本表层 1 100 微米 说 明 书 CN 。
13、102928970 A 4 2/5 页 5 的深度内的图像 ; 0009 (3) 完成成像区域内表层的成像后, 利用金刚石或硬质合金刀具, 去除样本块表层 已成像部分 ; 0010 (4) 重复步骤 (2) 和步骤 (3) , 直到完成数据获取任务。 0011 所述步骤 (2) 具体方法为 : 0012 (a) 数字微镜阵列工作在二值调制的模式下 : 指当面阵相机进行曝光时, 数字微镜 阵列中的每个微型反射镜都工作在稳定状态下, 不进行任何翻转, 出射光在物镜焦面只有 亮和暗两种状态, 分别对应微型反射镜固定在入射光出射和非出射两种角度的状态, 不存 在灰度的变化 ; 0013 (b) 当曝光。
14、完成后, 数字微镜阵列的微镜进行翻转, 改变至下一相位图案, 同时触 发面阵相机进行再次曝光, 重复该过程直到完成结构光成像所需的 0、 2/3pi 和 4/3pi 三幅 不同相位图像的采集 ; 0014 (c) 步骤 (b) 完成后, 数字微镜阵列中的微镜统一翻转至入射光非出射的角度上, 阻挡照明光照射到样本上 ; 0015 (d) 压电位移器带动物镜进行轴向移动, 使物镜焦面对准同一个成像子区域的更 深层样本进行成像。 0016 (e)采 集 得 到 的 图 像 存 储 在 计 算 机 硬 盘 或 者 内 存 中,利 用 公 式 获得层析图像, S 表示层析图像, I 表示面值相机 获取的。
15、三幅原始图像, 其下标表示三幅原始图像的相位 ; 0017 一种大样本快速三维显微成像系统, 包括 : 光源、 光导、 一块激发滤光片、 一块发射 滤光片、 三块透镜、 数字微镜阵列、 二块反射镜、 一块二向色镜、 压电位移器、 物镜、 精密三维 电动平移台、 面阵相机、 数字微镜阵列驱动板、 压电位移驱动器、 平台控制器、 图像采集卡、 计算机、 金刚石或硬质合金刀具, 其特征在于 : 计算机分别与数字微镜阵列驱动板、 压电位 移驱动器、 平台控制器、 图像采集卡相连, 数字微镜阵列与数字微镜阵列驱动板相连, 压电 位移器与压电位移驱动器相连, 精密三维电动平移台与平台控制器相连, 面阵相机。
16、与图像 采集卡相连, 面阵相机受数字微镜阵列驱动板输出的触发脉冲信号控制采集时刻 ; 由光源 出射的光耦合入光导中, 均匀化后经由激发滤光片、 第一透镜进行准直, 第一反射镜将光束 反射至数字微镜阵列中, 当数字微镜阵列中的微镜处于 12 状态时, 被微镜反射的光线经 由第二反射镜被第二透镜收集, 经过二向色镜反射后进入固定在压电位移器上的物镜中 ; 样本固定在精密三维电动平移台之上, 样本接受激发光后发出的光经物镜、 二向色镜, 第三 透镜和发射滤光片, 最后在面阵相机上成像 ; 金刚石或硬质合金刀具固定在钢制刀架上。 0018 所述的光源为 LED、 卤素灯或汞灯。 0019 所述的光导为。
17、光纤或液态光导。 0020 所述的面阵相机可以是电荷耦合元件 CCD 相机或互补金属氧化物半导体 CMOS 相 机。 0021 计算机用于控制成像的进行, 存储采集的图像数据与平台的移动 ; 0022 平台控制器连接至计算机并受计算机控制, 驱动控制精密三维电动平移台的移 动, 样本由精密三维电动平移台带动移动 ; 0023 光源出射光线耦合入光导均匀化后, 经过激发滤光片和第一透镜进行准直后被第 说 明 书 CN 102928970 A 5 3/5 页 6 一反射镜反射至数字微镜阵列中 ; 0024 数字微镜阵列作为空间光调制器产生结构光条纹 ; 0025 压电位移驱动器驱动压电位移器, 压。
18、电位移器带动物镜移动, 用于物镜对样本进 行轴向扫描, 压电位移驱动器受计算机控制 ; 0026 金刚石或硬质合金刀具用于切削已成像的样本表层, 计算机通过平台自动控制精 密三维电动平移台, 带动样本移动, 利用刀具与样本间的相对位移完成切削。 0027 综上所述, 本发明较现有技术具有下列优点 : 0028 (1) 数字微镜阵列工作在二值调制的模式下, 其最高有效调制频率即为数字微镜 的切换速率, 可达数万赫兹以上, 将有效加快成像速度。 0029 (2) 通过数字微镜阵列与面阵相机的曝光进行同步的方法, 使得只有在面阵相机 的曝光时样本才会接受到激发光的照射, 进一步降低样本的曝光量, 避。
19、免光漂白效应对成 像带来负面影响。 附图说明 0030 图 1 为本发明大样本快速三维显微成像方法的流程图。 0031 图 2 为本发明的成像区域划分示意图。 0032 图 3 为本发明的系统结构示意图。 0033 图 4 为本发明的控制结构图。 具体实施方式 0034 下面结合附图和实施方式对本发明作进一步详细的说明。 0035 图 1 为一种大样本快速三维显微成像方法的流程图。在步骤 S101 : 计算机确定样 本的成像区域, 包括成像的深度, 计算机根据区域的大小自动确定成像的子区域 ; 接下来执 行步骤 S102 : 计算机控制平台控制器, 移动精密三维电动平移台, 使物镜对准第一个成。
20、像 子区域 ; 步骤 S103 : 精密三维电动平移台停稳 ; 步骤 S104 : 计算机控制压电位移驱动器, 驱 动压电位移器带动物镜做轴向位移, 使显微物镜的焦面对准样本的设定深度, 开始采集 ; 步 骤 S105 : 数字微镜阵列产生结构光显微成像所需的相应的周期照明条纹 ; 步骤 S106 : 光学 传感器也就是面阵相机进行数据采集 ; 步骤 S105 和 S106 反复进行直到完成结构光成像所 需的三幅相位分别为 0、 2/3pi 和 4/3pi 的图象 ; 步骤 S107 : 判断是否完成三幅不同相位结 构光图像的采集, 如是不是回到步骤 S105, 如是进行步骤 S108 : 将。
21、数字微镜阵列的所有微 镜置于-12的状态, 阻挡照明光进入物镜后孔径中 ; 计算机执行步骤S109 : 对采集的三幅 图像使用结构光成像的计算公式, S 表示层析图 像, I 表示面值相机获取的三幅原始图像, 其下标表示三幅原始图像的相位 ; 获得该子区域 中第一层光学断层图像, 并存储在计算机的存储设备中 ; 步骤 S110 : 确认该子区域是否完 成设定深度方向上的成像, 若没有则重复S104至S109的步骤直至完成 ; 若完成则执行步骤 S111 : 检测是否已经完成表层成像区域内的采集, 若没有, 执行步骤 S112 : 精密三维电动平 移台移动带动样本移动到下一成像子区域, 返回到步。
22、骤 S103 ; 若完成, 则执行步骤 S113 : 检 测是否已经完成设定的深度采集, 若没有则执行步骤 S114 : 使用金刚石刀具切除已成像的 表层区域, 然后返回到步骤 S112 ; 若已完成, 则停止采集 (即步骤 S115) 。 说 明 书 CN 102928970 A 6 4/5 页 7 0036 图 2 为一种大样本快速三维显微成像方法的成像区域划分示意图, 成像区域包含 样本块中的感兴趣区域。成像区域进一步划分成较小的成像子区域, 该子区域比显微镜一 次成像的视场略小, 且相邻的子区域间具有少部分的重叠区域。 0037 图 3 为一种大样本快速三维显微成像系统的结构简图, 由。
23、光源 1(可以是 LED、 卤 素灯或汞灯等非相干光源) 出射的光耦合入光导 2(可以是光纤或者液态光导) 中, 均匀化 后经由激发滤光片3、 第一透镜4进行准直, 第一反射镜5将光束反射至数字微镜阵列6中, 当数字微镜阵列中的微镜处于 12 状态时, 准直光束被微镜反射至第二反射镜 7, 并由第 二透镜 8 收集, 经过二向色镜 9 反射后进入固定在压电位移器 10 上的物镜 11 中 ; 样本 12 固定在精密三维电动平移台13之上, 样本接受激发光后发出的光经物镜11、 二向色镜9、 第 三透镜 14 和发射滤光片 15, 最后在面阵相机 16(可以是 CCD 相机或者 CMOS 相机)。
24、 上成像, 刀具 17 用于对已成像的样本表面进行切削加工。 0038 图 4 为一种大样本快速三维显微成像的系统控制结构, 计算机 18 通过驱动板 19 驱动数字微镜阵列6进行翻转 ; 通过压电位移驱动器20控制及驱动压电位移器10 ; 通过平 台控制器 21 控制精密三维电动平移台 13 ; 通过图像采集卡 22 控制面阵相机 16, 并传输采 集的图像至计算机。 实施例 0039 光源采用 Lumen Dynamics 公司生产的 X-cite 120 金属卤化物光源, 该光源自带 输出光纤。数字微镜阵列的规格为 0.7 XGA, 微镜具有 +12 和 -12 两种工作状态。精密 三维。
25、电动平移台采用美国 Aerotech 公司的产品, 精密三维电动平移台置于大理石平台上, 定位精度为亚微米级别, 以满足精密切削和成像的需求。金刚石刀具采用电镜科学中常用 的直线刃金刚石刀具, 刀刃角度为 35, 宽度 3 毫米, 刀具连同刀托固定在钢制刀架上。 0040 成像物镜采用日本 Olympus 的 40x 消色差物镜。压电位移器使用德国 PI 公司产 品, 其定位精度可达 5 纳米。激发滤光片的中心波长为 500 纳米, 二向色镜的透射 / 反射转 换波长为 520 纳米, 发射滤光片的中心波长为 542 纳米。面阵相机采用 Andor 公司科研级 CCD 相机, 像素规格为 20。
26、48x2048。 0041 金刚石刀具一次切片宽度为2000微米, 厚度为20微米, 多次切削将样本块的顶部 表面加工平整后, 开始数据的采集工作。精密三维电动平移台带动样本移动到第一个子区 域, 设定每个成像子区域的大小为 500x500 微米, 相邻子区域间的重叠区域宽度为 5 微米。 面阵相机完成一次曝光和数据传输的时间为 10 毫秒, 由于数字微镜阵列工作在二值状态 下翻转时间在十微秒量级, 相比可以忽略, 采集三幅图像耗时 30 毫秒。压电位移器带动物 镜在轴向以 1 微米的间隔采集 20 微米厚深度的图像, 每次轴向移动需要 30 毫秒的时间, 采 集一个子区域的表层图像共需要 1。
27、.2 秒的时间。假设数字微镜阵列工作在灰度状态下 (即 镜片不断翻转) , 其调制速度限制在 60 赫兹, 微镜需要 17 毫秒完成一次调制, 而采集一个子 区域的表层图像共需要 2.22 秒, 对比本发明的方法要多出 85% 的时间。完成一个子区域表 层的采集后, 精密三维电动平移台带动样本移动至下一子区域, 需时约 300 毫秒, 重复成像 的步骤直到该表层完成采集。可以估算若是对一个成像区域为 1 平方厘米的样本表层进行 成像, 使用本发明的方法需要 600 秒, 而常规方法需要 1008 秒的时间。再考虑样本曝光量, 由于精密三维电动平移台带动样本移动时, 样本不进行曝光, 实际接受的曝光时间为 480 说 明 书 CN 102928970 A 7 5/5 页 8 秒, 对比常规方法减少 52% 以上的曝光量, 减轻了样本光漂白的效应。 说 明 书 CN 102928970 A 8 1/4 页 9 图 1 说 明 书 附 图 CN 102928970 A 9 2/4 页 10 图 2 说 明 书 附 图 CN 102928970 A 10 3/4 页 11 图 3 说 明 书 附 图 CN 102928970 A 11 4/4 页 12 图 4 说 明 书 附 图 CN 102928970 A 12 。