猪瘟病毒特征免疫学表位及其应用 【技术领域】
本发明涉及病毒的免疫学表位及其应用，特别是猪瘟病毒的免疫学表位及其应用。
背景技术
猪瘟(classical swine fever，CSF)是由猪瘟病毒(classical swine fever virus，CSFV)引发的的恶性传染性疾病，一旦爆发往往在短时间内带来巨大的经济损失。20世纪50年代中国研制出的猪瘟兔化弱毒疫苗(C-strain，C株)是一种减毒后的猪瘟活病毒疫苗，它能够在猪体内诱导免疫防护，有效地控制猪瘟的大规模流行和散发。但是由于疫苗株C株免疫与野毒株在猪体内的感染不能通过血清学方法鉴定与区分，从而给疫情监测和计划免疫带来了很大不便，大大限制了疫苗株C株的广泛推广和应用。尤其在对于猪瘟施行扑灭政策(stamping-out policy)的国家，包括C株在内的弱化毒疫苗也已被禁止使用。
【发明内容】
本发明的目的是提供一组能有效鉴别和诊断猪瘟病毒毒株的特征免疫学表位。
本发明所提供的猪瘟病毒特征免疫学表位，选自由序列表中序列1-19及其变异表位所组成的免疫学表位家族。
其中，序列表中的序列1-13及其变异表位是猪瘟病毒强毒株特征免疫学表位，中国猪瘟病毒标准强毒株石门株、国外猪瘟病毒标准强毒株Brescia、ALD、Glentorf、Alfort/T和CAP均具有这些特征免疫学表位。序列表中的序列14-19及其变异表位是猪瘟病毒疫苗株C株特征免疫学表位。
本发明的发明人通过对已知猪瘟强毒株和疫苗株C株序列的比对，进行了大量深入细致的分析和总结，得到了猪瘟病毒特征免疫学表位，具有重要地理论及现实意义，在猪瘟病毒强毒株(如中国猪瘟病毒标准强毒株石门株和国外猪瘟病毒标准强毒株Brescia以及其他几种强毒株)与疫苗株C株的鉴别和诊断以及表位特异性单克隆抗体的研制中将有广泛应用。
【具体实施方式】
实施例1、多种猪瘟病毒特征免疫学表位比对
比对了包括中国猪瘟病毒标准强毒株石门株和国外猪瘟病毒标准强毒株Brescia在内的6个猪瘟病毒强毒株和疫苗株C株的六个免疫学表位HLATDVE(aa311-317)、NWHNID(aa350-355)、TVIESP(aa426-421)、QPHDEP(aa580-585)、VIRTEG(aa936-941)和KNRYYE(aa992-997)aa：amino acid，结果如表1所示：
表1病毒株 aa311-317 aa350-355 aa426-421 aa580-585 aa936-941 aa992-997C-株 HLATDVE NWHNID TVIESP QPHDEP VIRTEG KNRYYE石门株 Y----T- --Y--- -I--G- -SYE-- --SA-- --K---Brescia Y----T- --Y--- ----G- -S-E-- --S--- R----- ALD Y----T- --Y--- ----G- -S-E-- --S--- --K---Glentorf -----T- --Y--- -I--G- -S-E-- --S-D- --K---Alfort/T -----T- --Y--- ----G- ------ --S--- R-K--- CAP -----T- --Y--- -I--G- -S-E-- --S-D- --K---
从表1中可以看出，猪瘟病毒强毒株和疫苗株C株在六个免疫学表位上存在显著的序列差异，因此，这些特征免疫学表位能够被应用于猪瘟病毒强毒(如中国猪瘟病毒标准强毒株石门株和国外猪瘟病毒标准强毒株Brescia以及其他几种强毒株)与疫苗株C株的鉴别和诊断以及表位特异性单克隆抗体的研制。
序列表
<160>19
<210>1
<211>7
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>1
Tyr Leu Ala Thr Asp Thr Glu
1 5 7
<210>2
<211>7
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>2
His Leu Ala Thr Asp Thr Glu
1 5 7
<210>3
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>3
Asn Trp Tyr Asn Ile Asp
1 5 6
<210>4
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>4
Thr Ile Ile Glu Gly Pro
1 5 6
<210>5
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>5
Thr Val Ile Glu Gly Pro
1 5 6
<210>6
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>6
Gln Ser Tyr Glu Glu Pro
1 5 6
<210>7
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>7
Gln Ser His Glu Glu Pro
1 5 6
<210>8
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>8
Val Ile Ser Ala Glu Gly
1 5 6
<210>9
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>9
Val Ile Ser Thr Asp Gly
1 5 6
<210>10
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>10
Val Ile Ser Thr Glu Gly
1 5 6
<210>11
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>11
Lys Asn Lys Tyr Tyr Glu
1 5 6
<210>12
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>12
Arg Asn Arg Tyr Tyr Glu
1 5 6
<210>13
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>13
Arg Asn Lys Tyr Tyr Glu
1 5 6
<210>14
<211>7
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>14
His Leu Ala Thr Asp Val Glu
1 5 7
<210>15
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>15
Asn Trp His Asn Ile Asp
1 5 6
<210>16
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>16
Thr Val Ile Glu Ser Pro
1 5 6
<210>17
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>17
Gln Pro His Asp Glu Pro
1 5 6
<210>18
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>18
Val Ile Arg Thr Glu Gly
1 5 6
<210>19
<211>6
<212>PRT
<213>瘟病毒属猪瘟病毒(Pestivirus Flaviviridae)
<400>19
Lys Asn Arg Tyr Tyr Glu
1 5 6