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本发明涉及一种磷酸胆碱壳聚糖衍生物的合成方法,包括:将壳聚糖粉末与不同比例的双取代胆碱膦酸酯,在碱、四氯化碳和仲醇的混合体系中,于040反应1224小时,再经碱液水解处理,制得具有不同偶联率的磷酸胆碱壳聚糖衍生物。本发明制备的磷酸胆碱壳聚糖衍生物在壳聚糖高分子骨架上引入仿生结构的磷酸胆碱基团,改善了其生物功能性和生物相容性。可作为生物医用材料在药物和基因载体、组织工程支架、生物医用膜、水凝胶、生物。