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本发明属于生物制药领域,具体涉及一种抗凝溶栓双功能融合蛋白即水蛭素12肽和瑞替普酶融合蛋白包涵体的凝胶层析复性方法。该方法特征在于:先将变性蛋白进行一定时间氧化复性,然后采用Superdex75进行层析复性。层析复性时先在Superdex75柱内预设一段变性剂浓度梯度,融合蛋白在变性剂浓度梯度降低的过程中恢复其空间构象。同时在缓冲液中添加氧化还原体系和分子伴侣辅助蛋白构象转变。该方法得到的双功能融。