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一种整体化微球透镜的光纤对准元件结构。包括一基板,于基板上蚀刻出复数个阵列式V型沟槽或形成复数个阵列式光波导,经由涂覆一第一聚合层与高透光率的第三聚合层于该基板表面上,经微影制作过程与加热处理,于该阵列式排列的相对V型沟槽或光波导间形成至少一基座与球状的微球透镜;于该V型沟槽内可配设光纤,再于该微球透镜、沟槽与该光纤或光波导上覆盖一上盖;借助该微球透镜与该沟槽或光波导的适当配置,使配设于该微球透镜。