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1、(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201611235545.6 (22)申请日 2016.12.28 (71)申请人 苏州旷世骏弛生物科技有限公司 地址 215500 江苏省苏州市常熟经济技术 开发区四海路11号 (72)发明人 刘喜朋 (51)Int.Cl. C07D 401/04(2006.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 一种聚合酶抑制剂的制备方法 (57)摘要 本发明公开了一种聚合酶抑制剂的制备方 法, 包括1) 制备4-(3-甲氧基羰基-2-硝基-苯亚 甲基)-氨基-哌啶。
2、-1-甲酸叔丁酯; 2) 制备2-(1- 叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲 酯; 3) 制备2-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H- 吲唑-7-甲酸甲酯; 4) 制备4-(7-甲酰胺基-3-甲 基-吲唑-2-基)哌啶-1-甲酸叔丁酯; 5) 制备3-甲 基-2(哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酰胺。 本发明一 种聚合酶抑制剂的制备方法制备出的聚合酶抑 制剂对于多数的DNA和RNA聚合酶的聚合都有着 良好的抑制作用。 权利要求书1页 说明书3页 CN 107353280 A 2017.11.17 CN 107353280 A 1.一种聚合酶抑制剂的制备方法, 其特征在。
3、于, 包括如下步骤: 1) 3- 醛基-2-硝基苯甲酸甲酯和4-氨基-哌啶-1-甲酸叔丁酯的混合物溶解到乙醇中, 在氮气保护下回流搅拌2小时, 直至TLC显示反应完成 (己烷/EtOAc=75:25) ; 蒸发除去溶剂, 得到白色固体, 即4-(3- 甲氧基羰基-2-硝基-苯亚甲基)-氨基-哌啶-1-甲酸叔丁酯; 2) 4-(3-甲氧基羰基-2-硝基-苯亚甲基)-氨基-哌啶-1-甲酸叔丁酯和NaN3溶于无水 DMF, 在氮气保护和90温度下搅拌过夜; 所得粗产品真空浓缩, 残留物经硅胶 (silica) 快 速制备色谱纯化, 用10:9040:60 的EtOAc/ 石油醚梯度洗脱, 获得棕色油。
4、状物, 即2-(1-叔 丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲酯; 3) 将2-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲酯溶于四氢呋喃 (THF) 中, 在 温度-78下, 向所得溶液中加入的二异丙基氨基锂THF/ 正庚烷/ 乙苯溶液; 所得暗橙色 溶液在0 5温度下搅拌15分钟后, 在-78温度下再次淬冷15分钟; 加入碘甲烷, 上述 橙色溶液缓慢升温至室温, 然后搅拌17个小时以上; 加入水, 用乙醚萃取; 有机层用饱和食 盐水溶液洗, MgSO4干燥, 浓缩, 得到橙色固体; 过柱提纯 (0-50%EtOAc/正己烷) 制得沾有黄 色的白色固体, 即2-(1。
5、-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲酯; 4) 在封管中中, 将2-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-3-甲基-2H-吲唑-7甲酸甲酯在THF 和32%aq.NH3溶液的混合物中加热过夜, 加热温度为70; 所得溶液真空浓缩, 残留物经硅 胶 (silica) 快速制备色谱纯化, 用30:7050:50 的EtOAc/石油醚梯度洗脱, 获得白色固体, 即: 4-(7-甲酰胺基-3-甲基-吲唑-2-基)哌啶-1-甲酸叔丁酯; 5) 4-(7-甲酰胺基-3-甲基-吲唑-2-基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的三氟乙酸 (TFA) /二氯甲 烷 (DCM) 1:1 (0.1M) 溶液, 。
6、室温下搅拌20分钟; 真空条件下蒸干溶剂后, 乙醚 (Et2O) 处理, 分 离得到淡黄色固体, 即: 3-甲基-2(哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酰胺。 权利要求书 1/1 页 2 CN 107353280 A 2 一种聚合酶抑制剂的制备方法 技术领域 0001 本发明涉及一种聚合酶抑制剂的制备方法。 背景技术 0002 多聚 (ADP- 核糖) 聚合酶 (poly(ADP-ribose)polymerase, PARP) 是存在于真核细 胞中催化聚ADP 核糖化的细胞核酶, 它参与的聚ADP 核糖化是真核细胞中蛋白质翻译后的 重要修饰方式之一。 PARP 发现40 多年来, 其在DNA。
7、 损伤修复和维持基因组稳定性方面的 重要作用引起广大学者的关注, 尤其是近年来对PARP 与肿瘤发生的关系及利用调节PARP 来提高肿瘤治疗效果的研究取得了令人鼓舞的成绩。 0003 目前研究发现, PARP 家族至少有: PARP-1, PARP-2, PARP-3, PARP-4/VPARP, 端锚聚 合酶 (Tankyrases, TANK-1, TANK-2 和TANK-3) 等亚型。 在人类基因组中共有16 个不同基因 编码PARP 超家族成员这些成员都具有高度保守的由50 个氨基酸残基组成的PARP 催化活 性区, 除此之外, 它们具有不同的一级结构、 细胞内定位和特异底物。 这说。
8、明聚ADP 核糖是 一类具有不同生物功能的转录后调节蛋白。 0004 PARP-1 是由1014 个氨基酸残基组成的一条多肽链, 分子量为113kDa, 等电点在 8.0 9.8 之间。 它是PARP 家族中最早被发现, 而且特性被了解得最清楚的成员。 PARP-1 肽链中有3 个功能性结构域。 DNA 结合结构域 (DNAbinding domain, DBD, 46kDa) , 位于 N - 末 端 第 1 3 7 2 氨 基 酸 残 基 之 间 , 包 含 一 个 核 定 位 序 列(n u c l e a r localizationsequence, NLS) 和两个锌指结构 (Zn。
9、 fnger) 。 这两个锌指结构参与识别DNA 缺口, 其中第1 个锌指结构识别DNA 单链和双链断裂, 它的突变会大大降低PARP 的激活; 第2 个锌指结构只参与DNA单链断裂的识别。 自我修饰结构域 (automodifeationdomain, 22kDa) , 位于第374-525 氨基酸残基之间。 PARP-1 通过该结构域与ADP 糖基结合, 发生 PARP-1 自身糖基化, 并且该结构域还可以使PARP-1 形成二聚体。 C- 末端第524-1,014 氨基酸残基之间为催化结构域 (catalytic domain, 54kDa) 。 该结构域是把NAD 转化为ADP 核糖的。
10、基础, 此序列高度保守。 尤其第859-908 氨基酸残基区段在脊椎动物中的保守性达 100。 催化结构域由两部分组成, 其中靠近N- 末端部分的氨基酸残基第662-784 位形成 A、 B、 C、 D、 E、 F 六个- 螺旋, 此结构是PARP 特有的, 螺旋区通过F- 螺旋与活性区, 即NAD 结 合位点结合, 可能与激活信号的转递有关。 另外, 有研究发现PARP 还具有亮氨酸拉链结构, 推测可能在PARP 与其它蛋白质或PARP 自身形成二聚体时发挥作用。 0005 PARP-1 参与DNA 缺口的识别, 识别DNA 缺口后活化的PARP-1 形成同型二聚体并 催化NAD+ 分解成尼。
11、克酰胺和ADP 核糖, 利用后者为原料使核受体蛋白聚ADP 核糖化, PARP-1的激活与DNA 的损伤程度呈正相关, 并且在DNA 损伤诱发的聚ADP 糖基化反应中, PARP-1 可通过自身修复作用对PARP-1 活性进行负反馈调节, 形成DNA 损伤激发的PARP-1 活性循环。 PARP-1 的抑制研究或基因缺陷小鼠的研究可以肯定PARP-1 在维持基因组稳定 性方面起着关键的作用。 说明书 1/3 页 3 CN 107353280 A 3 发明内容 0006 本发明的目的在于提供一种聚合酶抑制剂的制备方法, 该方法制备的聚合酶抑制 剂, 其结构式为, 能够解决上述问题中的一种或几种。。
12、 0007 为了实现上述目的, 本发明的技术方案是设计一种聚合酶抑制剂的制备方法, 包 括如下步骤: 1) 3- 醛基-2- 硝基苯甲酸甲酯和4- 氨基- 哌啶-1- 甲酸叔丁酯的混合物溶解到乙 醇中, 在氮气保护下回流搅拌2小时, 直至TLC显示反应完成 (己烷/EtOAc=75:25) 。 蒸发除去 溶剂, 得到白色固体, 即4-(3- 甲氧基羰基-2- 硝基- 苯亚甲基)- 氨基- 哌啶-1- 甲酸 叔丁酯; 2) 4-(3-甲氧基羰基-2-硝基-苯亚甲基)-氨基-哌啶-1-甲酸叔丁酯和NaN3溶于无水 DMF, 在氮气保护和90温度下搅拌过夜。 所得粗产品真空浓缩, 残留物经硅胶 (s。
13、ilica) 快 速制备色谱纯化, 用10:9040:60 的EtOAc/ 石油醚梯度洗脱, 获得棕色油状物, 即2-(1-叔 丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲酯; 3) 将2-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲酯溶于四氢呋喃 (THF) 中, 在 温度-78下, 向所得溶液中加入的二异丙基氨基锂THF/ 正庚烷/ 乙苯溶液。 所得暗橙色 溶液在0 5温度下搅拌15分钟后, 在-78温度下再次淬冷15分钟。 加入碘甲烷, 上述 橙色溶液缓慢升温至室温, 然后搅拌17个小时以上。 加入水, 用乙醚萃取。 有机层用饱和食 盐水溶液洗, MgSO4干燥, 浓。
14、缩, 得到橙色固体。 过柱提纯 (0-50%EtOAc/正己烷) 制得沾有黄 色的白色固体, 即2-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲酯; 4) 在封管中中, 将2-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-3-甲基-2H-吲唑-7甲酸甲酯在THF 和32%aq.NH3溶液的混合物中加热过夜, 加热温度为70。 所得溶液真空浓缩, 残留物经硅 胶 (silica) 快速制备色谱纯化, 用30:7050:50 的EtOAc/石油醚梯度洗脱, 获得白色固体, 即: 4-(7-甲酰胺基-3-甲基-吲唑-2-基)哌啶-1-甲酸叔丁酯; 5) 4-(7-甲酰胺基-3-甲基-吲唑-2-基。
15、)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的三氟乙酸 (TFA) /二氯甲 烷 (DCM) 1:1 (0.1M) 溶液, 室温下搅拌20分钟。 真空条件下蒸干溶剂后, 乙醚 (Et2O) 处理, 分 离得到淡黄色固体, 即: 3-甲基-2(哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酰胺。 0008 本发明的优点和有益效果在于: 本发明一种聚合酶抑制剂的制备方法制备出的聚 合酶抑制剂对于多数的DNA和RNA聚合酶的聚合都有着良好的抑制作用。 具体实施方式 0009 下面结合实施例, 对本发明的具体实施方式作进一步描述。 以下实施例仅用于更 加清楚地说明本发明的技术方案, 而不能以此来限制本发明的保护范围。 0010 实施。
16、例: 一种聚合酶抑制剂的制备方法, 包括如下步骤: 说明书 2/3 页 4 CN 107353280 A 4 1) 3- 醛基-2- 硝基苯甲酸甲酯和4- 氨基- 哌啶-1- 甲酸叔丁酯的混合物溶解到乙 醇中, 在氮气保护下回流搅拌2小时, 直至TLC显示反应完成 (己烷/EtOAc=75:25) 。 蒸发除去 溶剂, 得到白色固体, 即4-(3- 甲氧基羰基-2- 硝基- 苯亚甲基)- 氨基- 哌啶-1- 甲酸 叔丁酯; 2) 4-(3-甲氧基羰基-2-硝基-苯亚甲基)-氨基-哌啶-1-甲酸叔丁酯和NaN3溶于无水 DMF, 在氮气保护和90温度下搅拌过夜。 所得粗产品真空浓缩, 残留物经硅。
17、胶 (silica) 快 速制备色谱纯化, 用10:9040:60 的EtOAc/ 石油醚梯度洗脱, 获得棕色油状物, 即2-(1-叔 丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲酯; 3) 将2-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲酯溶于四氢呋喃 (THF) 中, 在 温度-78下, 向所得溶液中加入的二异丙基氨基锂THF/ 正庚烷/ 乙苯溶液。 所得暗橙色 溶液在0 5温度下搅拌15分钟后, 在-78温度下再次淬冷15分钟。 加入碘甲烷, 上述 橙色溶液缓慢升温至室温, 然后搅拌17个小时以上。 加入水, 用乙醚萃取。 有机层用饱和食 盐水溶液洗, MgSO4干。
18、燥, 浓缩, 得到橙色固体。 过柱提纯 (0-50%EtOAc/正己烷) 制得沾有黄 色的白色固体, 即2-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酸甲酯; 4) 在封管中中, 将2-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-3-甲基-2H-吲唑-7甲酸甲酯在THF 和32%aq.NH3溶液的混合物中加热过夜, 加热温度为70。 所得溶液真空浓缩, 残留物经硅 胶 (silica) 快速制备色谱纯化, 用30:7050:50 的EtOAc/石油醚梯度洗脱, 获得白色固体, 即: 4-(7-甲酰胺基-3-甲基-吲唑-2-基)哌啶-1-甲酸叔丁酯; 5) 4-(7-甲酰胺基-3-甲基-吲唑-2-基)-哌啶-1-甲酸叔丁酯的三氟乙酸 (TFA) /二氯甲 烷 (DCM) 1:1 (0.1M) 溶液, 室温下搅拌20分钟。 真空条件下蒸干溶剂后, 乙醚 (Et2O) 处理, 分 离得到淡黄色固体, 即: 3-甲基-2(哌啶-4-基)-2H-吲唑-7-甲酰胺。 0011 以上所述仅是本发明的优选实施方式, 应当指出, 对于本技术领域的普通技术人 员来说, 在不脱离本发明技术原理的前提下, 还可以做出若干改进和润饰, 这些改进和润饰 也应视为本发明的保护范围。 说明书 3/3 页 5 CN 107353280 A 5 。