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本发明公开了乙型脑炎病毒PrM/M蛋白B细胞抗原表位多肽,还公开了该抗原表位多肽在诊断乙型脑炎病毒中的应用,属于分子免疫学领域。本发明所述的抗原表位多肽的氨基酸序列分别为:SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:38、SEQID NO:39所示的任意一种氨基酸序列。本发明的B细胞抗原表位多肽,重复抗原表位多肽,抗原表位多肽与载体蛋白偶联物,抗原表位多肽融合表达物均能够作为检测乙型脑炎病毒抗体。